DaliLite: Structural Neighbours

Query: 2OCEA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA5201;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  2OCE-A 41.5  0.0  321   321  100   HYPOTHETICAL PROTEIN PA5201;                               "         
   2:  2O6Y-A  4.0  7.0   95   515    6   PUTATIVE HISTIDINE AMMONIA-LYASE;                          "         
   3:  1X4Q-A  3.8  4.3   68    92   12   U4/U6 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN PRP3;                "         
   4:  2GSM-A  3.4  5.4  104   535    3   CYTOCHROME C OXIDASE SUBUNIT 1;                            "         
   5:  2F76-X  3.3  4.1   62   100   10   CORE PROTEIN P10;                                          "         
   6:  2A1D-D  3.3  5.3   74   282    7   THROMBIN;                                                  "         
   7:  2DGJ-A  3.0  5.0   63   246    8   HYPOTHETICAL PROTEIN EBHA;                                 "         
   8:  2BNL-A  2.9  5.0   68   129    9   MODULATOR PROTEIN RSBR;                                    "         
   9:  1D8B-A  2.9  3.5   60    81   13   SGS1 RECQ HELICASE;                                        "         
  10:  1B8D-B  2.8  4.5   71   177    4   PROTEIN (RHODOPHYTAN PHYCOERYTHRIN (ALPHA CHAIN)           "         
  11:  1NXH-A  2.7  5.5   72   124    8   MTH396 PROTEIN;                                            "         
  12:  1I1S-A  2.7  3.4   62    96   10   MOTA;                                                      "         
  13:  1ALL-A  2.7  3.5   63   160   11   ALLOPHYCOCYANIN;                                           "         
  14:  1IZM-A  2.6  3.3   52   170   12   HYPOTHETICAL PROTEIN HI0817;                               "         
  15:  2DGZ-A  2.4  4.9   63   113    8   WERNER SYNDROME PROTEIN VARIANT;                           "         
  16:  2BV8-A  2.4  3.5   58   162    5   C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;                               "         
  17:  1O5H-A  2.3  6.0   69   200    1   FORMIMINOTETRAHYDROFOLATE CYCLODEAMINASE;                  "         
  18:  1MP1-A  2.3  3.9   65   111    9   SER/ARG-RELATED NUCLEAR MATRIX PROTEIN;                    "         
  19:  1R5I-D  2.2 12.1   79   214    6   HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN, DR                "         
  20:  2DLA-A  2.1  4.2   72   222    6   397AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;                           "         
  21:  2IJ5-A  2.0  6.3   96   392    3   CYTOCHROME P450 121;                                       "         
  22:  1CG5-B  2.0  4.7   63   141   13   PROTEIN (HEMOGLOBIN);                                      "         
-

No 1: 2OCEA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA5201;                               

DSSP  LLHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHLHHHHLLLLHHHHHHHH
Query DSINTRIAEELSALPSGRVQPQQVAAAVALLDEGSTVPFIARYRKEVTGSLDDTQLRMLE   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DSINTRIAEELSALPSGRVQPQQVAAAVALLDEGSTVPFIARYRKEVTGSLDDTQLRMLE   60
DSSP  LLHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHLHHHHLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHH
Query ERLRYLRELEERRGAILASIEEQGKLTPELARDIKLADTKTRLEDLYLPYKQKRRTKGQI  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ERLRYLRELEERRGAILASIEEQGKLTPELARDIKLADTKTRLEDLYLPYKQKRRTKGQI  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHH


DSSP  HHHLLLHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHLLLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
Query ALEAGLGALADALFDDPTLVPESEAARFVDAEKGFADVKAVLEGAKYILMERFAEDATLL  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ALEAGLGALADALFDDPTLVPESEAARFVDAEKGFADVKAVLEGAKYILMERFAEDATLL  180
DSSP  HHHLLLHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHLLLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLEEEEEELLLHHHHLHHHLLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEE
Query DKLRVFMKNEATLTARVVPGKEQEGAKFSDYFEHDEPLKSAPSHRALAIFRGRNEGVLSA  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DKLRVFMKNEATLTARVVPGKEQEGAKFSDYFEHDEPLKSAPSHRALAIFRGRNEGVLSA  240
DSSP  HHHHHHHHHLLEEEEEELLLHHHHLHHHLLLLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHLLEEE


DSSP  EEELLLLLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHH
Query SLKVGEEAPGTLHPCEVMIAERFGLSNQGRAADKWLAEVVRWTWKVKLYTHLETDLFGEL  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SLKVGEEAPGTLHPCEVMIAERFGLSNQGRAADKWLAEVVRWTWKVKLYTHLETDLFGEL  300
DSSP  EEELLLLLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query RDGAEDEAISVFARNLHDLLL  321
ident |||||||||||||||||||||
Sbjct RDGAEDEAISVFARNLHDLLL  321
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


No 2: 2O6YA  MOLECULE: PUTATIVE HISTIDINE AMMONIA-LYASE;                          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pkpaveldrhidldqahavasggarivlappardrcrasearlgavirearhvyglttgf   60
DSSP  llleeeelllllhhhhhhhhlllleeeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gplanrlisgenvrtlqanlvhhlasgvgpvldwttaramvlarlvsiaqgasgasegti  120
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhh


DSSP  ......llhhhhhhhhhLLLL..LLLL.................................
Query ......dsintriaeelSALP..SGRV.................................   19
ident                                                             
Sbjct arlidllnselapavpsRGTVgxDLTPlahmvlclqgrgdfldrdgtrldgaeglrrgrl  180
DSSP  hhhhhhhlllleelleeELLLllLHHHhhhhhhhhllllleellllleelhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   19
ident                                                             
Sbjct qpldlshrdalalvngtsamtgialvnahacrhlgnwavaltallaeclrgrteawaaal  240
DSSP  lllllllllhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   19
ident                                                             
Sbjct sdlrphpgqkdaaarlrarvdgsarvvrhviaerrldagdigtepeagqdayslrcapqv  300
DSSP  hhhlllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhllllhhhlllllllllllhhhhlhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhlllLLHHHHhhhLHHH.............hLLLLhhHHHHHHHHHHHH
Query qpqqvaaavalldegSTVPFIaryRKEV.............tGSLDdtQLRMLEERLRYL   66
ident                                           |                 
Sbjct lgagfdtlawhdrvlTIELNA...VTDNpvfppdgsvpalhgGNFM..GQHVALTSDALA  355
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhHHHHLL...LLLLllllllllllllllLLLL..LHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLL........................llLHHHHHHHHHL.....
Query RELEERRGAILASIEEQG........................klTPELARDIKLA.....   97
ident        |     |                                              
Sbjct TAVTVLAGLAERQIARLTderlnrglppflhrgpaglnsgfmgaQVTATALLAEMratgp  415
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllhhhlllllllllllhhhHHHHHHHHHHHhllll


DSSP  ...........................LLHHHHHHHHLLLL..................l
Query ...........................DTKTRLEDLYLPYK..................q  112
ident                                |                            
Sbjct asihsistnaanqdvvslgtiaarlcrEKIDRWAEILAILAlclaqaaelrcgsgldgvs  475
DSSP  lhhhllllllllllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  lLLLHhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhHHHH
Query kRRTKgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyiLMER  172
ident     |                                                       
Sbjct pAGKK..............................................lvqalREQF  489
DSSP  hHHHH..............................................hhhhhHLLL


DSSP  H........llLHHHHhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhh
Query F........aeDATLLdklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapsh  224
ident                |                                            
Sbjct PpletdrplgqEIAAL............................................  505
DSSP  LllllllllhhHHHHH............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtw  284
ident                                                             
Sbjct ............................................................  505
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query kvklytHLETdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                      
Sbjct .athllQQSP..........................v  515
DSSP  .hhhhlLLLL..........................l


No 3: 1X4QA  MOLECULE: U4/U6 SMALL NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN PRP3;                

DSSP  ...............LLHHHHHHHHHLLLLLLLLL..HHHHHHHHHHHlllLLHHHHHHh
Query ...............DSINTRIAEELSALPSGRVQ..PQQVAAAVALLdegSTVPFIARy   43
ident                |     |                      |            |  
Sbjct gssgssgmalskrelDELKPWIEKTVKRVLGFSEPtvVTAALNCVGKG...MDKKKAAD.   56
DSSP  lllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHhhHHHHHHHHHLL...LLHHHHHH.


DSSP  lhhHHLL.lLHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhhHHHHhhlllllhhhhhhhhhlllhhh
Query rkeVTGS.lDDTQLRMLEERLRYLREleERRGaiLASIeeqgkltpelardikladtktr  102
ident                 | |     |    |                              
Sbjct hlkPFLDdsTLRFVDKLFEAVEEGRS..SRHS..SGPS......................   90
DSSP  hhlLLLHhhLHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL..LLLL......................


DSSP  hhhhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhh
Query ledlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavl  162
ident                                                             
Sbjct ............................................................   90
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllll
Query egakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksap  222
ident                                                             
Sbjct ............................................................   90
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhh
Query shralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrw  282
ident                                                             
Sbjct ............................................................   90
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query twkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                        
Sbjct .....................................sg   92
DSSP  .....................................ll


No 4: 2GSMA  MOLECULE: CYTOCHROME C OXIDASE SUBUNIT 1;                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ftrwfmstnhkdigvlylftgglvglisvaftvymrmelmapgvqfmcaehlesglvkgf   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fqslwpsavenctpnghlwnvmitghgilmmffvvipalfggfgnyfmplhigapdmafp  120
DSSP  hhllllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhlllhhhhhhhhhhlllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rmnnlsywlyvagtslavaslfapggngqlgsgigwvlypplstsesgystdlaifavhl  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhlllllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ....................................LLHHHHhhhhhlllllllllhhhh
Query ....................................DSINTRiaeelsalpsgrvqpqqv   24
ident                                                             
Sbjct sgassilgainmittflnmrapgmtmhkvplfawsiFVTAWL..................  222
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhHHHHHH..................


DSSP  hhhHHHHlllLLHHHHhHHLHH...........hhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query aaaVALLdegSTVPFIaRYRKE...........vtgslDDTQLRMLEERLRYLRELEERR   73
ident                                                             
Sbjct illALPV..lAGAITM.LLTDRnfgttffqpsgggdpvLYQHILWFFGHPEVYIIVLPAF  279
DSSP  hhhHHHH..hHHHHHH.HHHHHhlllllllhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHH..LLLLlhhHHHHHHHLL.................................
Query GAILASIEE..QGKLtpeLARDIKLAD.................................   98
ident |     |                  |                                  
Sbjct GIVSHVIATfaKKPI..fGYLPMVYAMvaigvlgfvvwahhmytaglsltqqsyfmmatm  337
DSSP  HHHHHHHHHhhLLLL..lLHHHHHHHHhhhhhhllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ....LHHHHHHHHLLLLLLlllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhl
Query ....TKTRLEDLYLPYKQKrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekg  154
ident                                                             
Sbjct viavPTGIKIFSWIATMWG.........................................  356
DSSP  hlhhHHHHHHHHHHHHHLL.........................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllle
Query fadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfeh  214
ident                                                             
Sbjct ............................................................  356
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhh
Query deplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadk  274
ident                                                             
Sbjct ...........................................................g  357
DSSP  ...........................................................l


DSSP  hhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHH....................
Query wlaevvrwtwkvklythleTDLFGELRDGAE.DEAISVFA....................  313
ident                                                             
Sbjct sielktpmlwalgflflftVGGVTGIVLSQAsVDRYYHDTyyvvahfhyvmslgavfgif  417
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHLHhHHHHHLLLhhhhhhhhhhhlllhhhhhh


DSSP  ............................................hhHHHH..........
Query ............................................rnLHDL..........  319
ident                                                             
Sbjct agiyfwigkmsgrqypewagklhfwmmfvganltffpqhflgrqgmPRRYidypeafatw  477
DSSP  hhhhhhhhhhhleellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLllllhhhhhh


DSSP  ........................................................hl
Query ........................................................ll  321
ident                                                           
Sbjct nfvsslgaflsfasflfflgvifytltrgarvtannywnehadtlewtltspppehtf  535
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhleelllllllllllllhhhhllllllllll


No 5: 2F76X  MOLECULE: CORE PROTEIN P10;                                          

DSSP  .....LLHHHHHHHHHLLL..LLLLLLHHHHHHHHHHHLLLL.............LHHHH
Query .....DSINTRIAEELSAL..PSGRVQPQQVAAAVALLDEGS.............TVPFI   40
ident                  ||      |                                  
Sbjct mgqelSQHERYVEQLKQALktRGVKVKYADLLKFFDFVKDTCpwfpqegtidikrWRRVG   60
DSSP  lllllLHHHHHHHHHHHHHhlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLlllllllllhhhhHHHHH


DSSP  HHHL.......hHHHLL.LLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh
Query ARYR.......kEVTGS.LDDTQlrmleerlrylreleerrgailasieeqgkltpelar   92
ident             |                                               
Sbjct DCFQdyyntfgpEKVPVtAFSYW.....................................   83
DSSP  HHHHhhhhhhllLLLLLhHHHHH.....................................


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhh
Query dikladtktrledlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdae  152
ident                                                             
Sbjct ............................................................   83
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllll
Query kgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyf  212
ident                                                             
Sbjct ............................................................   83
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhh
Query ehdeplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraa  272
ident                                                             
Sbjct ............................................................   83
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhHHHHhhhhhhl
Query dkwlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgaeDEAIsVFARnlhdlll  321
ident                                  |    |          
Sbjct ..........................nlikeliDKKE.VNPQ.....vm  100
DSSP  ..........................hhhhhhhHHHL.LLLL.....ll


No 6: 2A1DD  MOLECULE: THROMBIN;                                                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mivtkdyskesrvnenskygtlisdwylkgrltslesqfinaldiletyhygekeykdak   60
DSSP  llllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dklmtrilgedqyllerkkvqyeeykklyqkykeenptsklklktfdqytiedltmreyn  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllhhhhh


DSSP  ...llhhhhhhhhhllLLLL..LLLHhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlhhhhllllhhh
Query ...dsintriaeelsaLPSG..RVQPqqvaaavalldegstvpfiaryrkevtgslddtq   55
ident                                                             
Sbjct elteslksavkdfekdVEKIenQHHD................................lk  148
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhLLHH................................hl


DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......LLLHhHHHHHHHLL..........
Query lrMLEERLRYLRELEERRGAILASIEEQG.......KLTPeLARDIKLAD..........   98
ident     |                                    |     |            
Sbjct pfTDEMEEKATSRVDDLANKAYSVYFAFVrdtqhktEALE.LKAKVDLVLgdedkphris  207
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhHHHH.HHHHHHHHHllllllllll


DSSP  .......LHHHHHHHHLLLL........................................
Query .......TKTRLEDLYLPYK........................................  111
ident            ||                                               
Sbjct neriekeMIKDLESIIEDFFietglnkpgnitsydsskhhyknhsegfealvketreava  267
DSSP  lhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lLLLLhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhH
Query qKRRTkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyilmE  171
ident                                                             
Sbjct nADES......................................................W  273
DSSP  hLLLL......................................................H


DSSP  HHLLlHHHHhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhhh
Query RFAEdATLLdklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaifr  231
ident                                                             
Sbjct KTKT.VKKY...................................................  281
DSSP  HHLL.LLLL...................................................


DSSP  hhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query grnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvklyth  291
ident                                                             
Sbjct ............................................................  281
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query letdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                               
Sbjct .............................g  282
DSSP  .............................l


No 7: 2DGJA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN EBHA;                                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct axgqlqhgiddenatkqtqkyrdaeqskktaydqavaaakailnkqdkaavdralqqvts   60
DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhhhlhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................llhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhlllllhh
Query ......................dsintriaeelsalpsgrvqpqqvaaavalldegstvp   38
ident                                                             
Sbjct tkdalngdaklaeakaaarqnlgtlnhitnaqrtalegqinqattvdgvntvktnantld  120
DSSP  hhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhlhHHHLLLLHHHHHHHH......................................
Query fiaryrkEVTGSLDDTQLRMLE......................................   60
ident              | |                                            
Sbjct gaxnslqGAINDKDATLRNQNYldadeskrnaytqavtaaegilnkqtggntskadvdna  180
DSSP  hhhhhhhHHLLLHHHHHHLHHHhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhh


DSSP  ...........HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLLHHHHHHHHHL......LLHHHH
Query ...........ERLRYLRELEERRGAILASIeeQGKLTPELARDIKLA......DTKTRL  103
ident                 ||                                          
Sbjct lnavtrakaalNGAENLRNAKTSATNTINGL..PNLTQLQKDNLKHQVeqaqnvVGVNGV  238
DSSP  hhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHH


DSSP  HHHHLLLllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhh
Query EDLYLPYkqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavle  163
ident  |                                                          
Sbjct KDKGNLE.....................................................  245
DSSP  HHHHHHL.....................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllh
Query gakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksaps  223
ident                                                             
Sbjct ............................................................  245
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhh
Query hralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwt  283
ident                                                             
Sbjct ............................................................  245
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query wkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                       
Sbjct .....................................h  246
DSSP  .....................................l


No 8: 2BNLA  MOLECULE: MODULATOR PROTEIN RSBR;                                    

DSSP  .............LLHHHHHHHHHLLL.....LLLL..lLHHHHHHHHHHHLLL.llhhh
Query .............DSINTRIAEELSAL.....PSGR..vQPQQVAAAVALLDEG.stvpf   39
ident                        |  |                       |         
Sbjct snqtvyqfiaenqNELLQLWTDTLKELseqesYQLTdqvYENISKEYIDILLLSvkdena   60
DSSP  llhhhhhhhhhlhHHHHHHHHHHHHHHhllllLLLLhhhHHHHHHHHHHHHHLLllllll


DSSP  hhhhLHHHHLL.....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllhhhhhhh
Query iaryRKEVTGS.....LDDTQLRMLEERLRYLRELEERRGailasieeqgkltpelardi   94
ident       |         |    |                                      
Sbjct aesqISELALRavqigLSXKFLATALAEFWKRLYTKXNDK....................  100
DSSP  lhhhHHHHHHHhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....................


DSSP  hhlllhhHHHHhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhl
Query kladtktRLEDlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekg  154
ident                                                             
Sbjct .......ESTE.................................................  104
DSSP  .......LHHH.................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllle
Query fadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfeh  214
ident                                                             
Sbjct ............................................................  104
DSSP  ............................................................


DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhh
Query deplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadk  274
ident                                                             
Sbjct ............................................................  104
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query wlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                                
Sbjct ......................liwqidrffspinteifnqysiswe  129
DSSP  ......................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 9: 1D8BA  MOLECULE: SGS1 RECQ HELICASE;                                        

DSSP  .....LLHHHHHHHHHLLL......LLLL.LLHHHHHHH...hhhHLLLLLhhhhhhHLH
Query .....DSINTRIAEELSAL......PSGR.VQPQQVAAA...valLDEGSTvpfiarYRK   45
ident           |  |    |      | |                  |             
Sbjct elnnlRMTYERLRELSLNLgnrmvpPVGNfMPDSILKKMaailpmNDSAFA....tlGTV   56
DSSP  lllhhHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLLLlLLHHHHHHHhhhlllLHHHHH....hhLLL


DSSP  HhhlLLLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllhhhhhh
Query EvtgSLDDTqLRMLEERLRYLRELEERRgailasieeqgkltpelardikladtktrled  105
ident |                   |                                       
Sbjct E..dKYRRR.FKYFKATIADLSKKRSSE................................   81
DSSP  L..hHHHHH.HHHLHHHHHHHHHHLLLL................................


DSSP  hhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhh
Query lylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlega  165
ident                                                             
Sbjct ............................................................   81
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhh
Query kyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshr  225
ident                                                             
Sbjct ............................................................   81
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query alaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwk  285
ident                                                             
Sbjct ............................................................   81
DSSP  ............................................................


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query vklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                     
Sbjct ....................................   81
DSSP  ....................................


No 10: 1B8DB  MOLECULE: PROTEIN (RHODOPHYTAN PHYCOERYTHRIN (ALPHA CHAIN)           

DSSP  ................................................LLHHHHHHHHHL
Query ................................................DSINTRIAEELS   12
ident                                                   |         
Sbjct mldafsrvvvtsdakaayvggsdlqslksfindgnkrldavnyivsnaSCIVSDAVSGMI   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlhHHHHHHHHHHHH


DSSP  L.LLLL.............llLHHHHHHHHHHHLLL..........llhhhhHHHLHhhh
Query A.LPSG.............rvQPQQVAAAVALLDEG..........stvpfiARYRKevt   48
ident    |                                                        
Sbjct CeNPGLiapggxcytnrrmaaCLRDGEIILRYVSYAllagdssvlddrclngLKETY.ia  119
DSSP  HhLHHHhllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhllllHHHHH.hh


DSSP  lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhLLLHhhhhhHHL
Query gSLDDTQLRMLEERLRYLRELEERRGailasieeqgkltpelardiklADTKtrledLYL  108
ident                                                    |        
Sbjct lGVPTASSSRAVSIMKATATAFITNT.....................aSGRK....vEVA  154
DSSP  hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....................lLLLL....lLLL


DSSP  LLllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhh
Query PYkqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyi  168
ident                                                             
Sbjct AG..........................................................  156
DSSP  LL..........................................................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhh
Query lmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshrala  228
ident                                                             
Sbjct ............................................................  156
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query ifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvkl  288
ident                                                             
Sbjct ............................................................  156
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                  
Sbjct ............dcqalqaeaasyfdkvgssid  177
DSSP  ............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 11: 1NXHA  MOLECULE: MTH396 PROTEIN;                                            

DSSP  llhhhhhhhhhllllLLLLlhhhhhhhhhhhLLLL....LHHHHHHHLH.HHHLlllhhh
Query dsintriaeelsalpSGRVqpqqvaaavallDEGS....TVPFIARYRK.EVTGslddtq   55
ident                | |                                          
Sbjct .egelxrlxkrrileSYRW..qedvvkplsrELEIdveeFQDILXDKLDxSSLE..alhp   55
DSSP  .llhhhhhhhhhhhlLHHH..hhhlllllllLHHHlhhhHHHHHHHHLLhHHHH..hhhh


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHH.HLLLLLHHHHHHHHHLL............LHHH
Query lrmleERLRYLRELEERRGaiLASIE.EQGKLTPELARDIKLAD............TKTR  102
ident              |       |              |   |                   
Sbjct rfesaRPRCIREKLHSDLQ..LCWLVdVXEIISVDDAEALKDEItelvlagreyseALSE  113
DSSP  hhhllHHHHHHHHHHHHLL..HHHHLlLLLLLLHHHHHHHHHHHhhhhhllllhhhHHHH


DSSP  HHHHHL.LLLLllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhh
Query LEDLYL.PYKQkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkav  161
ident                                                             
Sbjct GRRRLHeILRS.................................................  124
DSSP  HHHHHHhHHLL.................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeellll
Query legakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksa  221
ident                                                             
Sbjct ............................................................  124
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhh
Query pshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvr  281
ident                                                             
Sbjct ............................................................  124
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query wtwkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                         
Sbjct ........................................  124
DSSP  ........................................


No 12: 1I1SA  MOLECULE: MOTA;                                                      

DSSP  LLHHHHHHHHHLlllllLLLHHHHHHHHHHHLLLLL.........hhhhhhhLHHHHLLL
Query DSINTRIAEELSalpsgRVQPQQVAAAVALLDEGST.........vpfiaryRKEVTGSL   51
ident  |  | |                                                  | |
Sbjct MSKVTYIIKASN....dVLNEKTATILITIAKKDFItaaevrevhpdlgnavVNSNIGVL   56
DSSP  LLLHHHHHHHHL....lLLLHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhhhhhlllllhhhHHHHHHHH


DSSP  ..............lHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHHHHHhhhhhhhlllllhhhhhhhh
Query ..............dDTQLRMLEERLRYLREL..EERRGAilasieeqgkltpelardik   95
ident                             |                               
Sbjct ikkglveksgdgliiTGEAQDIISNAATLYAQenAPELLK....................   96
DSSP  hhhllleeelleeelLHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLLL....................


DSSP  hlllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhll
Query ladtktrledlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgf  155
ident                                                             
Sbjct ............................................................   96
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhlllllee
Query advkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehd  215
ident                                                             
Sbjct ............................................................   96
DSSP  ............................................................


DSSP  eelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhh
Query eplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkw  275
ident                                                             
Sbjct ............................................................   96
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query laevvrwtwkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                               
Sbjct ..............................................   96
DSSP  ..............................................


No 13: 1ALLA  MOLECULE: ALLOPHYCOCYANIN;                                           

DSSP  ..............................................LLHHHHHHHHHLL.
Query ..............................................DSINTRIAEELSA.   13
ident                                                 |       |   
Sbjct sivtksivnadaearylspgeldriksfvtsgerrvriaetmtgarERIIKQAGDQLFGk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlhHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  .LLLL............llLHHHHHHHHHHHLLL..........llhhhhHHHLHhhhlL
Query .LPSG............rvQPQQVAAAVALLDEG..........stvpfiARYRKevtgS   50
ident                              |   |                 |        
Sbjct rPDVVspggnaygadmtatCLRDLDYYLRLITYGivagdvtpieeigvvgVREMY.kslG  119
DSSP  lHHHLllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhhlllHHHHH.hhhL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlll
Query LDDTQLRMLEERLRYLRELEErRGAIlasieeqgkltpelardikladtktrledlylpy  110
ident                        ||                                   
Sbjct TPIEAIAEGVRAMKSVATSLL.SGAD..................................  144
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LHHH..................................


DSSP  llllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhh
Query kqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyilm  170
ident                                                             
Sbjct ............................................................  144
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhh
Query erfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaif  230
ident                                                             
Sbjct ............................................................  144
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhh
Query rgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvklyt  290
ident                                                             
Sbjct ............................................................  144
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query hletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                
Sbjct ...............aaeagsyfdyligams  160
DSSP  ...............hhhhhhhhhhhhhhhl


No 14: 1IZMA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN HI0817;                               

DSSP  .............................llhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhh
Query .............................dsintriaeelsalpsgrvqpqqvaaavall   31
ident                                                             
Sbjct lishsdxnqqlksagigfnatelhgflsgllcgglkdqswlpllyqfsndnhayptglvq   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhllllllllllhh


DSSP  lllllhhhhhhhlhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......
Query degstvpfiaryrkevtgslddtqlrmLEERLRYLRELEERRGAILASIEEQG.......   84
ident                             |        |       |  |           
Sbjct pvtelyeqisqtlsdvegftfelglteDENVFTQADSLSDWANQFLLGIGLAQpelakek  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhll


DSSP  llLHHHHHHHHHL...................lLHHHHHHHHLLLLLLlllhhhhhhhll
Query klTPELARDIKLA...................dTKTRLEDLYLPYKQKrrtkgqialeag  125
ident     |   |                                                   
Sbjct geIGEAVDDLQDIcqlgydeddneeelaealeeIIEYVRTIAXLFYSH............  168
DSSP  hhHHHHHHHHHHHlllllllllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH............


DSSP  lhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query lgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrv  185
ident                                                             
Sbjct ............................................................  168
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeell
Query fmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaifrgrnegvlsaslkvg  245
ident                                                             
Sbjct ............................................................  168
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query eeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgae  305
ident                                                             
Sbjct ............................................................  168
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhl
Query deaisvfarnlhdlll  321
ident                 
Sbjct ..............fn  170
DSSP  ..............hl


No 15: 2DGZA  MOLECULE: WERNER SYNDROME PROTEIN VARIANT;                           

DSSP  .....................LLHHHHHHHHHLLL.....LLLL..LLHHHHHHHHHH.h
Query .....................DSINTRIAEELSAL.....PSGR..VQPQQVAAAVAL.l   31
ident                              |                              
Sbjct gssgssgssqpvisaqeqetqIVLYGKLVEARQKHankmdVPPAilATNKILVDMAKMrp   60
DSSP  llllllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLHHhhLLHHHHHHHHHHll


DSSP  lllLLHHHH..HHHLhhhhlllLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllhh
Query degSTVPFI..ARYRkevtgslDDTQlRMLEERLRYLRELEErrgailasieeqgkltpe   89
ident      |  |                    | |                            
Sbjct ttvENVKRIdgVSEG......kAAML.APLWEVIKHFCQTNS..................   95
DSSP  llhHHHHHLllLLLL......hHHHH.HHHHHHHHHHHHLLL..................


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhlll
Query lardikladtktrledlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfv  149
ident                                                             
Sbjct ............................................................   95
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhl
Query daekgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfs  209
ident                                                             
Sbjct ............................................................   95
DSSP  ............................................................


DSSP  lllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhllllllll
Query dyfehdeplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqg  269
ident                                                             
Sbjct ............................................................   95
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHL
Query raadkwlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhDLLL  321
ident                                                     
Sbjct ..................................vqtdlfsstkpqsgPSSG  113
DSSP  ..................................llllllllllllllLLLL


No 16: 2BV8A  MOLECULE: C-PHYCOCYANIN ALPHA SUBUNIT;                               

DSSP  ................................................LLHHHHHHHHHL
Query ................................................DSINTRIAEELS   12
ident                                                        |    
Sbjct mktpiteaiasadsqgrflsngelqsingryqratasleaarsltsnaERLISGAAQSVY   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHHHHHHHHH


DSSP  L.LLLL...............llLHHHHHHHHHHHLLL.......llhhhHHHHL..hhh
Query A.LPSG...............rvQPQQVAAAVALLDEG.......stvpfIARYR..kev   47
ident    |                                                        
Sbjct SkFPYTtqmqgpnyaadatgkakCARDIGYYLRMVTYClvvgatgpmdeyLIAGLseinr  120
DSSP  HhLHHHhhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhLLLLHhhhhh


DSSP  hlllLHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhh
Query tgslDDTQLRMLEERLRYLREleERRGailasieeqgkltpelardikladtktrledly  107
ident              |                                              
Sbjct sfelSPSWYIEALEYIKDSHA..LSGQ.................................  145
DSSP  hlllLHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHH.................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhh
Query lpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegaky  167
ident                                                             
Sbjct ............................................................  145
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhh
Query ilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshral  227
ident                                                             
Sbjct ............................................................  145
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvk  287
ident                                                             
Sbjct ............................................................  145
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query lythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                   
Sbjct .................aaneantyldyainals  162
DSSP  .................hhhhhhhhhhhhhhhll


No 17: 1O5HA  MOLECULE: FORMIMINOTETRAHYDROFOLATE CYCLODEAMINASE;                  

DSSP  ........LLHHhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlhhhhllll
Query ........DSINtriaeelsalpsgrvqpqqvaaavalldegstvpfiaryrkevtgsld   52
ident                                                             
Sbjct everlslkEFCD................................................   12
DSSP  llllllhhHHHH................................................


DSSP  hhhhhhHHHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................LLLH
Query dtqlrmLEERLryLRELEERRGAILASIEEQG........................KLTP   88
ident                                                             
Sbjct ...xvaERKPT..PGGGAVGSVVGAXACALAExvanftrkkkgyedvepexeriveAXEE   67
DSSP  ...hhhLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhHHHH


DSSP  hHHHHHHHL..............................lLHHHHHHHHLLLLL....lL
Query eLARDIKLA..............................dTKTRLEDLYLPYKQ....kR  114
ident                                                             
Sbjct .ARLKLFDLakkdxeafekvxkaykssegelqnalkeaasVPXDVIRVXKDLAHeleklA  126
DSSP  .HHHHHHHHhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhH


DSSP  LLHhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query RTKgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyilmerfa  174
ident                                                             
Sbjct EFG.........................................................  129
DSSP  HHL.........................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhhhhhh
Query edatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaifrgrn  234
ident                                                             
Sbjct ............................................................  129
DSSP  ............................................................


DSSP  hlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query egvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvklythlet  294
ident                                                             
Sbjct ...................................nknlasdtlnaadlchavfqvekvn  154
DSSP  ...................................lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  HHHHHHHhHHHH....................hhhhhhhhhhhhhhl
Query DLFGELRdGAED....................eaisvfarnlhdlll  321
ident  |                                             
Sbjct VLINLKE.ISDEtfrknxleeleeqeaqiegcyqrvkkxlegivwss  200
DSSP  HHHHHLL.LLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 18: 1MP1A  MOLECULE: SER/ARG-RELATED NUCLEAR MATRIX PROTEIN;                    

DSSP  ......................LLHHHHHHHHHLLLlLLLL..LHHHHHHHH....HHHL
Query ......................DSINTRIAEELSALpSGRV..QPQQVAAAV....ALLD   32
ident                         |   |                               
Sbjct shmqlkfaeclekkvdmskvnlEVIKPWITKRVTEIlGFEDdvVIEFIFNQLevknPDSK   60
DSSP  lllllllllhhhhlllllllllHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhHHHHHHHHLllllLLHH


DSSP  LlllhhhhhhhlhhhhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllhhhhh
Query EgstvpfiaryrkevtgSLDDTQLRMLEERLRYLRELEERRGailasieeqgkltpelar   92
ident                   |     |     |  |                          
Sbjct M.........mqinltgFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENI..................   93
DSSP  H.........hhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..................


DSSP  hhhhLLLHHHHHhhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhh
Query diklADTKTRLEdlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddptlvpeseaarfvdae  152
ident                                                             
Sbjct agipSAFLELKK................................................  105
DSSP  llllHHHHLLLL................................................


DSSP  hllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllll
Query kgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyf  212
ident                                                             
Sbjct ............................................................  105
DSSP  ............................................................


DSSP  leeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhhhhhhlllllllllhh
Query ehdeplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraa  272
ident                                                             
Sbjct ............................................................  105
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query dkwlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
ident                                                  
Sbjct ...........................................eeikqr  111
DSSP  ...........................................llllll


No 19: 1R5ID  MOLECULE: HLA CLASS II HISTOCOMPATIBILITY ANTIGEN, DR                

DSSP  ............................LLHHHHhHHHHlllllllllhhhhhhhhhhhl
Query ............................DSINTRiAEELsalpsgrvqpqqvaaavalld   32
ident                                                             
Sbjct smklrvenpkkaqkhfvqnlnnvvftnkELEDIY.NLSN.....................   38
DSSP  llllllllllllllllllllllllllhhHHHHHH.LLLL.....................


DSSP  llllhhhhhhhlhhhhllllhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......l
Query egstvpfiaryrkevtgslddtQLRMlEERLRYLRELEERRGAILASIEEQG.......k   85
ident                             | |                |            
Sbjct ......................KEET.KEVLKLFKLKVNQFYRHAFGIVNDYnglleyke   75
DSSP  ......................LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhh


DSSP  lLHHHHHHHHHL................LLHHHHHHHHL.LLLLL...LLLHhhhhhhll
Query lTPELARDIKLA................DTKTRLEDLYL.PYKQK...RRTKgqialeag  125
ident                                   |                |        
Sbjct iFNMMFLKLSVVfdtqrkeannveqikrNIAILDEIMAKaDNDLSyfiSQNK........  127
DSSP  hHHHHHHHHHHHhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHhHHHHHhhhHLLH........


DSSP  lhhhhhhhhhlllllhhhHHHLLLLHHhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query lgaladalfddptlvpesEAARFVDAEkgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrv  185
ident                                                             
Sbjct .nfqelwdkavkltkemkIKLKGQKLD.................................  153
DSSP  .hhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLLLL.................................


DSSP  hhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeell
Query fmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaifrgrnegvlsaslkvg  245
ident                                                             
Sbjct ............................................................  153
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query eeapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgae  305
ident                                                             
Sbjct ...............lrdgevainkvrelfgsdknvkelwwfrsllvkgvylikryyegd  198
DSSP  ...............lllllhhhhhhhhhllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhl
Query deaisvfarnlhdlll  321
ident                 
Sbjct ielkttsdfakavfed  214
DSSP  llhhhllhhhhhhlll


No 20: 2DLAA  MOLECULE: 397AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;                           

DSSP  llhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlhhhhllllhhhhhhhh
Query dsintriaeelsalpsgrvqpqqvaaavalldegstvpfiaryrkevtgslddtqlrmle   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllLLLL.HHH
Query erlrylreleerrgailasieeqgkltpelardikladtktrledlylpykqKRRT.KGQ  119
ident                                                             
Sbjct .................................mmimldpfsekakellkgfGSINdFMD   27
DSSP  .................................lllllllllhhhhhhllllLLHHhHHH


DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHL.....lLLLHHHhhhllllhhhllllHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query IALEAGLGALADALFDD.....pTLVPESeaarfvdaekgfadVKAVLEGAKYILMERFA  174
ident                                                     | |     
Sbjct AIPKIVSVDDVIERIRVvkneklIDKFLD.............qDNVMDLAQFYALLGALS   74
DSSP  HHHHLLLHHHHHHHHHHhllhhhLHHHHL.............lLHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhhhhhh
Query EDatlldklrvfmkneatltarvvpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaifrgrn  234
ident                                                             
Sbjct YS..........................................................   76
DSSP  LL..........................................................


DSSP  hlleeeeeellllllllllhhhhhHHHLLLL..llllLHHH...................
Query egvlsaslkvgeeapgtlhpcevmIAERFGL..snqgRAAD...................  273
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Sbjct ........................PYGIELElvkkanLIIYserlkrkkeikpeeisidv  112
DSSP  ........................LLLHHHHhhhhhhHHHHhhhhlllllllllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  273
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Sbjct staiefptedvrkiervygkipeytmkisdfldlvpdeklanyyiyegrvylkredliri  172
DSSP  eelllllhhhhhhhhhhhllllleeeehhhhhhhlllllhhhleeelleeeelhhhhhhh


DSSP  ...hhhhHHHHHHHhHLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ...kwlaEVVRWTWkVKLYThletdlfgelrdgaedeaisvfarnlhdlll  321
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Sbjct wskaferNVERGVN.MLYEIrdelpefyrkvlgeiqafaeeefgrkfgeiq  222
DSSP  hhhhhhhHHHHHHH.HLLLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 21: 2IJ5A  MOLECULE: CYTOCHROME P450 121;                                       

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct vllevpfsargdripdavaelrtrepirkvrtitgaeawlvssyalctqvledrrfsmke   60
DSSP  lleelllllllllllhhhhhhhhhlleeeeellllleeeeellhhhhhhhhhllleelhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct taaagaprlnaltvppevvnnmgniadaglrkavmkaitpkapgleqflrdtanslldnl  120
DSSP  hhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............LLHHHHHHHHHLllllllLLHHHHHHHHHHHLLL...........
Query ...............DSINTRIAEELSalpsgrVQPQQVAAAVALLDEG...........   34
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Sbjct itegapadlrndfadPLATALHCKVLG......IPQEDGPKLFRSLSIAfmssadpipaa  174
DSSP  hhhllleelllllhhHHHHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHLHHHHllllllllhhh


DSSP  .lLHHHHHH...........................hlhhhhllllHHHHHHHHHHHHHH
Query .sTVPFIAR...........................yrkevtgsldDTQLRMLEERLRYL   66
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Sbjct kiNWDRDIEymagilenpnittglmgelsrlrkdpayshvsdelfaTIGVTFFGAGVIST  234
DSSP  hhHHHHHHHhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLHHHhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhlll
Query RELEERRGAILASIEeqGKLTPELardikladtktrledlylpykqkrrtkgqialeagl  126
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Sbjct GSFLTTALISLIQRP..QLRNLLH....................................  256
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLH..HHHHHHH....................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhh
Query galadalfddptlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvf  186
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Sbjct ......................................................ekpeli  262
DSSP  ......................................................hlhhhh


DSSP  hhhlleeeeeelllhhhhlhhHLLLlLEEEelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelll
Query mkneatltarvvpgkeqegakFSDYfEHDEplksapshralaifrgrnegvlsaslkvge  246
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Sbjct pagveellrinlsfadglprlATAD.IQVG..............................  291
DSSP  hhhhhhhhhlllllllleeeeELLL.EEEL..............................


DSSP  lllllllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHH.........hhHHHH
Query eapgtlhpcevmiaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvKLYTH.........leTDLF  297
ident                                                             
Sbjct .....................dvlvrkgelvlvlleganfDPEHFpnpgsieldrpNPTS  330
DSSP  .....................leeelllleeeelhhhhhlLLLLLlllllllllllLLLL


DSSP  HHhhHHHHHH......................................hhhhhhhhhhhh
Query GElrDGAEDE......................................aisvfarnlhdl  319
ident                                                             
Sbjct HLafGRGQHFcpgsalgrrhaqigieallkkmpgvdlavpidqlvwrtrfqrriperlpv  390
DSSP  LLllLLHHHLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleelllhhhlllllllllllllllee


DSSP  hl
Query ll  321
ident   
Sbjct lw  392
DSSP  el


No 22: 1CG5B  MOLECULE: PROTEIN (HEMOGLOBIN);                                      

DSSP  ....................LLHHHHHHHHHLL..LLLL..............llLHHHH
Query ....................DSINTRIAEELSA..LPSG..............rvQPQQV   24
ident                       |     |                            |  
Sbjct vklsedqehyikgvwkdvdhKQITAKALERVFVvyPWTTrlfsklqglfsandigVQQHA   60
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhllhHHHHHHHHHHHHHhlHHHHlllhhhllllllllhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLL.......llhhhhhHHLHhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
Query AAAVALLDEG.......stvpfiaRYRKevtgslDDTQLRMLEERLRYLRELEERRGail   77
ident       | |                         |      |         |        
Sbjct DKVQRALGEAiddlkkveinfqnlSGKH.qeigvDTQNFKLLGQTFMVELALHYKKT...  116
DSSP  HHHHHHHHHHhhllllhhhhlhhhHHHH.hhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...


DSSP  hhhhhlllllhhhhhhhhhlllHHHHhhhhlllllllllhhhhhhhlllhhhhhhhhhll
Query asieeqgkltpelardikladtKTRLedlylpykqkrrtkgqialeaglgaladalfddp  137
ident                                                             
Sbjct .....................fRPKE..................................  121
DSSP  .....................lLHHH..................................


DSSP  lllhhhhhhllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhlleeeeee
Query tlvpeseaarfvdaekgfadvkavlegakyilmerfaedatlldklrvfmkneatltarv  197
ident                                                             
Sbjct ............................................................  121
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhlhhhllllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellllllllllhhhh
Query vpgkeqegakfsdyfehdeplksapshralaifrgrnegvlsaslkvgeeapgtlhpcev  257
ident                                                             
Sbjct ............................................................  121
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query miaerfglsnqgraadkwlaevvrwtwkvklythletdlfgelrdgaedeaisvfarnlh  317
ident                                                             
Sbjct ............................................haaaykffrlvaeals  137
DSSP  ............................................hhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhl
Query dlll  321
ident     
Sbjct snyh  141
DSSP  llll