DaliLite: Structural Neighbours

Query: 2NWUB MOLECULE: UPF0201 PROTEIN SSO1042;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  2NWU-A 25.7  0.5  130   131  100   UPF0201 PROTEIN SSO1042;                                   "         
   2:  2PZZ-A 18.9  1.4  124   133   34   UPF0201 PROTEIN MJ1564;                                    "         
   3:  2OGK-A 12.0  2.3  111   133   26   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
   4:  2NRQ-A 11.3  2.4  112   137   21   HYPOTHETICAL PROTEIN ORF-C20_032;                          "         
   5:  2NZC-A  4.5  3.1   63    80   16   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
   6:  2HZA-A  4.5  3.2   65   131    3   NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                               "         
   7:  2CZ8-A  4.5  2.3   49    67    8   TT0972 PROTEIN;                                            "         
   8:  2FGC-A  4.2  3.9   66   161   11   ACETOLACTATE SYNTHASE, SMALL SUBUNIT;                      "         
   9:  2F06-A  4.2  4.6   68   144   10   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  10:  2DTJ-A  4.0  5.1   66   164    8   ASPARTOKINASE;                                             "         
  11:  2A10-A  4.0  4.5   65   104    9   CARBON DIOXIDE CONCENTRATING MECHANISM PROTEIN             "         
  12:  2CA9-A  3.8  3.4   69   132    3   PUTATIVE NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                      "         
  13:  2BJ1-A  3.8  3.0   63   132   10   NICKEL RESPONSIVE REGULATOR;                               "         
  14:  1XHO-A  3.8  2.7   52   112   10   CHORISMATE MUTASE;                                         "         
  15:  1WY7-A  3.8  2.1   45   196   18   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1948;                               "         
  16:  2J5A-A  3.7  3.7   67   106    9   30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  "         
  17:  2CC6-A  3.7  2.8   49    64    4   VNG1446H;                                                  "         
  18:  1VMB-A  3.7  4.6   70   107    7   30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  "         
  19:  1U8S-A  3.6  3.0   64   171    9   GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL                    "         
  20:  1PHZ-A  3.6  8.6   69   403    6   PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       "         
  21:  2EWH-A  3.5  4.5   64    92    8   MAJOR CARBOXYSOME SHELL PROTEIN 1A;                        "         
  22:  2DVK-A  3.5  3.3   56   166    9   UPF0130 PROTEIN APE0816;                                   "         
  23:  2F1F-A  3.4  2.8   60   163    5   ACETOLACTATE SYNTHASE ISOZYME III SMALL SUBUNIT;           "         
  24:  2PEB-A  3.3  4.4   67   115    7   PUTATIVE DIOXYGENASE;                                      "         
  25:  2NYI-A  3.3  3.7   67   171    9   UNKNOWN PROTEIN;                                           "         
  26:  2DGW-A  3.3  2.9   64    91    5   PROBABLE RNA-BINDING PROTEIN 19;                           "         
  27:  2BZ2-A  3.3  3.1   59    79    7   NEGATIVE ELONGATION FACTOR E;                              "         
  28:  2B8K-G  3.3  4.1   58   171    7   DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II LARGEST SUBUNIT;            "         
  29:  1XRS-B  3.3 10.2   51   212    6   D-LYSINE 5,6-AMINOMUTASE ALPHA SUBUNIT;                    "         
  30:  2HGJ-G  3.2  3.3   88   182   11   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  31:  2DHS-A  3.2  6.3   69   187    9   CUG TRIPLET REPEAT RNA-BINDING PROTEIN 1;                  "         
  32:  1QDL-A  3.2  5.9   71   415    8   PROTEIN (ANTHRANILATE SYNTHASE (TRPE-SUBUNIT));            "         
  33:  1HL6-A  3.2  3.3   63   119    6   CG8781 PROTEIN;                                            "         
  34:  2J8A-A  3.1  2.7   58   114    2   HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE, H3 LYSINE-4            "         
  35:  1O51-A  3.1  3.0   58    89    2   HYPOTHETICAL PROTEIN TM0021;                               "         
  36:  1JW3-A  3.1  4.5   56   140   13   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN MTH1598;                    "         
  37:  1F0X-A  3.1  3.2   62   502    6   D-LACTATE DEHYDROGENASE;                                   "         
  38:  1ZPV-A  3.0  3.3   61    85   11   ACT DOMAIN PROTEIN;                                        "         
  39:  2Q3V-A  2.9  4.0   53    93   11   PROTEIN AT2G34160;                                         "         
  40:  2PFD-A  2.9  5.0   73   540   11   FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     "         
  41:  2CZ4-A  2.9  2.8   58   100    5   HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0516;                             "         
  42:  1ZG3-A  2.9  2.0   42   358    7   ISOFLAVANONE 4'-O-METHYLTRANSFERASE;                       "         
  43:  1VHS-A  2.9  2.4   43   165   12   SIMILAR TO PHOSPHINOTHRICIN ACETYLTRANSFERASE;             "         
  44:  1R6V-A  2.9  4.0   64   671    8   SUBTILISIN-LIKE SERINE PROTEASE;                           "         
  45:  2FY1-A  2.8  4.6   66   108    3   RNA-BINDING MOTIF PROTEIN, Y CHROMOSOME, FAMILY            "         
  46:  2FL4-A  2.8  2.6   38   147    5   SPERMINE/SPERMIDINE ACETYLTRANSFERASE;                     "         
  47:  2F9D-A  2.8  4.4   66   114    3   PRE-MRNA BRANCH SITE PROTEIN P14;                          "         
  48:  2D9O-A  2.8  4.6   71   100    8   DNAJ (HSP40) HOMOLOG, SUBFAMILY C, MEMBER 17;              "         
  49:  2CJK-A  2.8  3.5   66   167    5   5'-R(*UP*AP*UP*AP*UP*AP*UP*AP)-3';                         "         
  50:  1SJR-A  2.8  3.2   63   108   10   POLYPYRIMIDINE TRACT-BINDING PROTEIN 1;                    "         
  51:  1JSX-A  2.8  2.7   43   193    9   GLUCOSE-INHIBITED DIVISION PROTEIN B;                      "         
  52:  1DBD-A  2.8  4.4   64   100    9   REGULATORY PROTEIN E2;                                     "         
  53:  2QEC-A  2.7  4.9   45   181    7   HISTONE ACETYLTRANSFERASE HPA2 AND RELATED                 "         
  54:  2DGX-A  2.7  3.7   68    96    7   KIAA0430 PROTEIN;                                          "         
  55:  1TLJ-A  2.7  3.3   56   189    5   HYPOTHETICAL UPF0130 PROTEIN SSO0622;                      "         
  56:  1P1T-A  2.7  2.8   61   104    5   CLEAVAGE STIMULATION FACTOR, 64 KDA SUBUNIT;               "         
  57:  2UUU-A  2.6  3.2   53   550    6   ALKYLDIHYDROXYACETONEPHOSPHATE SYNTHASE;                   "         
  58:  2FTR-A  2.6  4.1   67   103   10   BH0200;                                                    "         
  59:  2CQP-A  2.6  3.4   69    98    4   RNA-BINDING PROTEIN 12;                                    "         
  60:  1Z1Z-A  2.6  2.5   48   129    8   MINOR TAIL PROTEIN U;                                      "         
  61:  1NH7-A  2.6  2.9   56   274    7   ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE;                             "         
  62:  1JVA-A  2.6  3.6   61   427    8   VMA1-DERIVED HOMING ENDONUCLEASE X10SSS;                   "         
  63:  2OD6-A  2.5  5.5   64   110    6   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  64:  2HGJ-W  2.5  3.2   52    94   10   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  65:  1XQI-A  2.5  3.3   54   182    9   NUCLEOSIDE DIPHOSPHATE KINASE;                             "         
  66:  1JMT-A  2.5  3.2   62    98    8   SPLICING FACTOR U2AF 35 KDA SUBUNIT;                       "         
  67:  2PJD-A  2.4  5.1   61   334    5   RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE C;           "         
  68:  2JNA-A  2.4  4.9   53   103   13   PUTATIVE SECRETED PROTEIN;                                 "         
  69:  2E5G-A  2.4  6.7   67    94    9   U6 SNRNA-SPECIFIC TERMINAL URIDYLYLTRANSFERASE 1;          "         
  70:  2DNY-A  2.4  3.5   63   119   13   FUSE-BINDING PROTEIN-INTERACTING REPRESSOR,                "         
  71:  1U7L-A  2.4  3.2   56   364    4   VACUOLAR ATP SYNTHASE SUBUNIT C;                           "         
  72:  1QHT-A  2.4  6.2   73   710    8   PROTEIN (DNA POLYMERASE);                                  "         
  73:  2OTJ-R  2.3  2.8   48   150   10   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  74:  2OKQ-A  2.3  3.9   66   127    5   HYPOTHETICAL PROTEIN YBAA;                                 "         
  75:  2NUH-A  2.3  5.5   63   104    6   PERIPLASMIC DIVALENT CATION TOLERANCE PROTEIN;             "         
  76:  2JOQ-A  2.3  3.2   53    91    4   HYPOTHETICAL PROTEIN HP_0495;                              "         
  77:  2GUM-A  2.3  8.0   57   576    9   GLYCOPROTEIN B;                                            "         
  78:  1WHV-A  2.3  3.3   56   100    7   POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE;                             "         
  79:  1SQE-A  2.3  4.8   61   101    8   HYPOTHETICAL PROTEIN PG130;                                "         
  80:  2QG3-A  2.2  3.9   59   195    8   UPF0130 PROTEIN AF_2059;                                   "         
  81:  2AN3-A  2.2  3.0   47   258    4   PHENYLETHANOLAMINE N-METHYLTRANSFERASE;                    "         
  82:  1PZX-A  2.2  3.2   46   277    4   HYPOTHETICAL PROTEIN APC36103;                             "         
  83:  1GH8-A  2.2  3.2   65    89    9   TRANSLATION ELONGATION FACTOR 1BETA;                       "         
  84:  2PE8-A  2.1  3.5   58   101   12   SPLICING FACTOR 45;                                        "         
  85:  2OTJ-D  2.1  3.3   75   140    8   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  86:  2F3J-A  2.1  3.5   60   158    5   RNA AND EXPORT FACTOR BINDING PROTEIN 2;                   "         
  87:  1RWU-A  2.1  3.0   49    87    0   HYPOTHETICAL UPF0250 PROTEIN YBED;                         "         
  88:  2AD9-A  2.0  3.2   55    98   11   POLYPYRIMIDINE TRACT-BINDING PROTEIN 1;                    "         
-

No 1: 2NWUA  MOLECULE: UPF0201 PROTEIN SSO1042;                                   

DSSP  LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEeeeLLEEEEEEEELLHHHHHHHHHHHH
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTrkeGIIDILVLEARTLKSLLKFHRVLR   60
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNT...GIIDILVLEARTLKSLLKFHRVLR   57
DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEL...LLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHLLLE
Query NERILDSARKYLXKGIEGNTIAFXIHKQAAAVGVLSFVAIKFYIEYQNPKEIVDWLAPKT  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct NERILDSARKYLXKGIEGNTIAFXIHKQAAAVGVLSFVAIKFYIEYQNPKEIVDWLAPKT  117
DSSP  HLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHLLLE


DSSP  ELLEELLLLLLLL.
Query AHGVPLWDNPVPP.  133
ident ||||||||||||| 
Sbjct AHGVPLWDNPVPPd  131
DSSP  ELLEELLLLLLLLl


No 2: 2PZZA  MOLECULE: UPF0201 PROTEIN MJ1564;                                    

DSSP  LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEELlhhHHHHHHHHH
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEG.IIDILVLEARtlkSLLKFHRVL   59
ident   |   | | | ||  ||  || | |   |                     |  |    |
Sbjct LEVIIKAKVKPTEDKYKVKKAILNIFPKAKLTFIEKDnEFGEWEGKTK...SVEKLKELL   57
DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLlLLEEEEEEEL...LLHHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLL.....LEEEEEEL...LLHHH
Query RNERILDSARKYLXKGIEGNTIAFXIHKQAAAVGVLSFV.....AIKFYIEY...QNPKE  111
ident |   ||| ||  | ||   |   |   |||| ||   |       |   |          
Sbjct RSQSILDAARXVLEKGXTENATKFYLNKQAAYVGAVNFDidthgGIFVKILAdenEDIXK  117
DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLlllllLEEEEEELlllLLHHH


DSSP  HHHHHLLLEELLEELLllllll
Query IVDWLAPKTAHGVPLWdnpvpp  133
ident |    || |  ||         
Sbjct IIKDIAPRTKGGVIIN......  133
DSSP  HHHHHLLLLLLLLLLL......


No 3: 2OGKA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  ...LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLL.llLEEEEEEellEEEEEEEEL....LHHHH
Query ...DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFF.dfEKXNTRKegiIDILVLEAR....TLKSL   52
ident      | | | |   ||  ||  |||  |         |      |  |        |  
Sbjct gkiEWVRVSAVVHSTEDREKVGEAISTLFpfeFEIAVSK...MEYLEVELTksseIKKFW   57
DSSP  leeEEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLlllLLLEEEL...LEEEEEEELlhhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHLLL.LLEEEEEELHHHHHLLLLLLL....LEEEEEELL
Query LKFHRVLRneRILDSARKYLXKGIE.GNTIAFXIHKQAAAVGVLSFV....AIKFYIEYQ  107
ident       |            |   |   |     | || |  |  |       |       
Sbjct KNLLELLG..EQAEEILSTLEDRIDeQNVLHIRIDKQKAYLGEVSLTsggdPIAVKLRLV  115
DSSP  HHHHHHHH..HHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLllllLEEEEEEEE


DSSP  L.......HHHHHHHHLLleelleellllllll
Query N.......PKEIVDWLAPktahgvplwdnpvpp  133
ident           |    |                 
Sbjct TypskrekVIEFARELCT...............  133
DSSP  LllllhhhHHHHHHHHLL...............


No 4: 2NRQA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN ORF-C20_032;                          

DSSP  LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLL....lLEEEEEEEL.....LEEEEEEEEL...L
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFD....fEKXNTRKEG.....IIDILVLEAR...T   48
ident             || ||    |  ||       | |           | ||         
Sbjct NQAIISVFIHETEDYNKIVNTIESFFSplisnSKKNVTTAQghygnKIIILEYRFDrksG   60
DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLlhhhhLEEEEEEEElllllEEEEEEEEELhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhllLHHHHHHH.hHHLLLLLEEEEEELHHHHHL.LLLLLL....LEEE
Query LKSLLKFHRVLrnerILDSARKY.lXKGIEGNTIAFXIHKQAAAV.GVLSFV....AIKF  102
ident                             | |        ||       |        || 
Sbjct EQFFKIILEKI....ETSELXLIltTSHIDGSKLYLRFDKQYLIAeHRLVLKegddVIKC  116
DSSP  HHHHHHHHLLL....LHHHHHHHhlLLLEELLEEEEEELHHHHHHhLLLLLLllllLEEE


DSSP  EEEL..LLHHHHHHhhLLLEelleellllllll
Query YIEY..QNPKEIVDwlAPKTahgvplwdnpvpp  133
ident  |     | ||                      
Sbjct IISFntSNIKEEIK.kLVNS...........ri  137
DSSP  EEELllLLHHHHHH.hHHHH...........hl


No 5: 2NZCA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  ..LLEEEEEEELLLL.LHHHHHHHHHLLL.LLLEEEEEEEL..LEEEEEEEELLHHhhhh
Query ..DKVXVVAEVRPSE.DVNKVLSAISNFF.DFEKXNTRKEG..IIDILVLEARTLKsllk   54
ident           |   |     |     ||  |               |  |   |      
Sbjct ekRFYILTIVVEDREkAYRQVNELLHNFSeDILLRVGYPVReeNXAIIFLVLKTDN....   56
DSSP  llEEEEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLHhHEEEEEEEEEHhhLEEEEEEEEEELH....


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEELllhhhhhh
Query fhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYqnpkeivd  114
ident                                               |             
Sbjct .......................dtigalsGKLGQ.....isgvRVKTVPLK........   80
DSSP  .......................hhhhhhhHHHHL.....llleEEEEEELL........


DSSP  hhllleelleellllllll
Query wlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                    
Sbjct ...................   80
DSSP  ...................


No 6: 2HZAA  MOLECULE: NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                               

DSSP  ...................................................LLEEEEEEE
Query ...................................................DKVXVVAEV    9
ident                                                             
Sbjct xqrvtitldddlletldslsqrrgynnrseairdilrsalaqeatqqhgtqGFAVLSYVY   60
DSSP  leeeeeeelhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleEEEEEEEEE


DSSP  LLLL..LHHHHHHHHHLL.lLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEELLH..HHHHhhhhhhhhll
Query RPSE..DVNKVLSAISNF.fDFEKXNTRKEG.IIDILVLEARTL..KSLLkfhrvlrner   63
ident             |                                               
Sbjct EHEKrdLASRIVSTQHHHhdLSVATLHVHINhDDCLEIAVLKGDxgDVQH..........  110
DSSP  ELLLllHHHHHHHHHHHLllLEEEEEEEELLlLEEEEEEEEEEEhhHHHH..........


DSSP  lhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEELLlhhhhhhhhllleell
Query ildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEYQnpkeivdwlapktahg  123
ident                      |                                      
Sbjct ................faddvIAQR.......gvrHGHLQCLPK................  131
DSSP  ................hhhhhHHLL.......leeEEEEEEEEL................


DSSP  eellllllll
Query vplwdnpvpp  133
ident           
Sbjct ..........  131
DSSP  ..........


No 7: 2CZ8A  MOLECULE: TT0972 PROTEIN;                                            

DSSP  ..LLEEEEEEELLL....LLHHHHHHHHHLLLL.LLEEEEEEELL..........EEEEE
Query ..DKVXVVAEVRPS....EDVNKVLSAISNFFD.FEKXNTRKEGI..........IDILV   43
ident       |                 |                                 | 
Sbjct gkVYKKVELVGTSEegleAAIQAALARARKTLRhLDWFEVKEIRGtigeagvkeyQVVLE   60
DSSP  llEEEEEEEEEEELllhhHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEEEEEEEeeelleeeeeEEEEE


DSSP  EEELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeee
Query LEARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfy  103
ident    |                                                        
Sbjct VGFRLE......................................................   66
DSSP  EEEELL......................................................


DSSP  eelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query ieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                               
Sbjct .............................e   67
DSSP  .............................l


No 8: 2FGCA  MOLECULE: ACETOLACTATE SYNTHASE, SMALL SUBUNIT;                      

DSSP  .LLEEEEEEELLL.lLHHHHHHHHH.LLLLLLEEEEEE..ELLEEEEEEEELLHHhhhhh
Query .DKVXVVAEVRPS.eDVNKVLSAIS.NFFDFEKXNTRK..EGIIDILVLEARTLKsllkf   55
ident      |   |        ||        |                 ||            
Sbjct iREHLVSXLVHNKpgVXRKVANLFArRGFNISSITVGEseTPGLSRLVIXVKGDD.....   55
DSSP  lEEEEEEEEEELLllHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEEEEllLLLEEEEEEEEEELL.....


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHhhlllllllLEEEEEELLLH......
Query hrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYQNP......  109
ident                                                             
Sbjct ......................ktieqiEKQAYK....lvevvKVTPIDPLPENrverex   89
DSSP  ......................lhhhhhHHHHLL....llleeEEEELLLLHHHeeeeee


DSSP  ................................................hhhhhhhlllee
Query ................................................keivdwlapkta  121
ident                                                             
Sbjct alikvrfdedkqeifqlveifrgkiidvsregaiieitgarskveafinllpqkqveeia  149
DSSP  eeeeeellllhhhhhhhhhhllleeeeellleeeeeeeelhhhhhhhhhhllhhheeeee


DSSP  lleellllllll
Query hgvplwdnpvpp  133
ident             
Sbjct rtgivaxnrwnv  161
DSSP  ellleeeellll


No 9: 2F06A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  ....LLEEEEEEELL.LLLHHHHHHHHHL.lLLLLEEEEEEELLEEEEEEEellhhHHHH
Query ....DKVXVVAEVRP.SEDVNKVLSAISN.fFDFEKXNTRKEGIIDILVLEartlkSLLK   54
ident                 |     |                       ||        |   
Sbjct snaxVAKQLSIFLENkSGRLTEVTEVLAKenINLSALCIAENADFGILRGI....vSDPD   56
DSSP  llllEEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHHHllLLEEEEEEEELLLLEEEEEE....eLLHH


DSSP  HhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHHHlllllllLEEEEEEL........
Query FhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAAAvgvlsfvAIKFYIEY........  106
ident                                             |               
Sbjct K...........................ayKALKDNH......fAVNITDVVgiscpnvp   83
DSSP  H...........................hhHHHHHLL......lLEEEEEEEeeeeelll


DSSP  ...................................lLHHHhhhhhllleelleellllll
Query ...................................qNPKEivdwlapktahgvplwdnpv  131
ident                                     |                       
Sbjct galakvlgflsaegvfieyxysfannnvanvvirpsNXDK.cievlkekkvdllaasdly  142
DSSP  lhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeelleeeeeeeelLHHH.hhhhhhhllleeelhhhhl


DSSP  ll
Query pp  133
ident   
Sbjct kl  144
DSSP  ll


No 10: 2DTJA  MOLECULE: ASPARTOKINASE;                                             

DSSP  ..........LLEEEEEE.ELLL.lLHHHHHHHHHLL.LLLLEEEEEEEL...LEEEEEE
Query ..........DKVXVVAE.VRPS.eDVNKVLSAISNF.FDFEKXNTRKEG...IIDILVL   44
ident               |             ||  |                           
Sbjct avltgvatdkSEAKVTVLgISDKpgEAAKVFRALADAeINIDMVLQNVSSvedGTTDITF   60
DSSP  leeeeeeeelLEEEEEEEeEELLllHHHHHHHHHHHLlLLLLEEEELLLLlllLEEEEEE


DSSP  EELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEE
Query EARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYI  104
ident                                            |                
Sbjct TCPRS..........................dgrrameilKKLQV....qgnwtNVLYDD   90
DSSP  EEEHH..........................hhhhhhhhhHLLLL....lllllEEEEEL


DSSP  E...............................................LLLHHHhhhhhl
Query E...............................................YQNPKEivdwla  117
ident                                                             
Sbjct QvgkvslvgagmkshpgvtaefmealrdvnvnielistseirisvlirEDDLDA..aara  148
DSSP  LeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeeeHHHHHH..hhhh


DSSP  lleelleellllllll
Query pktahgvplwdnpvpp  133
ident                 
Sbjct lheqfqlggedeavvy  164
DSSP  hhhhhlllllllleel


No 11: 2A10A  MOLECULE: CARBON DIOXIDE CONCENTRATING MECHANISM PROTEIN             

DSSP  LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEElLHHHhhhhhhhh
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEG.IIDILVLEArTLKSllkfhrvl   59
ident        |            |               |     |                 
Sbjct QSAVGSIETIGFPGILAAADAMVKAGRITIVGYIRAGsARFTLNIRG.DVQE........   51
DSSP  LLEEEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEEElLEEEEEEEE.LHHH........


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelHHHH..hlllllllLEEEEEE.LLLHhhhhhhh
Query rnerildsarkylxkgiegntiafxihKQAA..avgvlsfvAIKFYIE.YQNPkeivdwl  116
ident                               |                    |        
Sbjct ....................vktamaaGIDAinrtegadvkTWVIIPRpHENV....vav   87
DSSP  ....................hhhhhhhHHHHhhlllllleeEEEEELLlLHHH....hhh


DSSP  llleelleellllllll
Query apktahgvplwdnpvpp  133
ident                  
Sbjct lpidfspevepfreaae  104
DSSP  llllllhhhhhhhhhhl


No 12: 2CA9A  MOLECULE: PUTATIVE NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                      

DSSP  .................................................LLEEEEEEELL
Query .................................................DKVXVVAEVRP   11
ident                                                       |     
Sbjct dsiirfsvslqqnlldeldnriikngyssrselvrdmireklvnpndesKIAVLVVIYDH   60
DSSP  lleeeeeeeeehhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllllllEEEEEEEEEEL


DSSP  LL..LHHHHHHHHHLL.lLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEELLHhhHHHHhhhhhhlllhhh
Query SE..DVNKVLSAISNF.fDFEKXNTRKEG.IIDILVLEARTLksLLKFhrvlrnerilds   67
ident                                                             
Sbjct HQreLNQRMIDIQHASgtHVLCTTHIHMDeHNCLETIILQGN..SFEI............  106
DSSP  LLllHHHHHHHHHHHHllEEEEEEEEELLlLEEEEEEEEEEL..HHHH............


DSSP  hhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEELLLHHhhhhhhllleelleell
Query arkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYQNPKeivdwlapktahgvplw  127
ident                                  |                          
Sbjct .............qrlqLEIGG....lrgvkFAKLTKASSFEY.................  132
DSSP  .............hhhhHHHHL....llleeEEEEEEELLLLL.................


DSSP  llllll
Query dnpvpp  133
ident       
Sbjct ......  132
DSSP  ......


No 13: 2BJ1A  MOLECULE: NICKEL RESPONSIVE REGULATOR;                               

DSSP  .....................................................LLEEEEE
Query .....................................................DKVXVVA    7
ident                                                             
Sbjct melirfsisipskllekfdqiieeigyenrseairdlirdfiirhewevgneeVAGTITI   60
DSSP  lleeeeeeeeehhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleEEEEEEE


DSSP  EELLLL..LHHHHHHHHHL.llLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEELLH..HHHHhhhhhhhh
Query EVRPSE..DVNKVLSAISN.ffDFEKXNTRKEG.IIDILVLEARTL..KSLLkfhrvlrn   61
ident      |   |   |                         |        |           
Sbjct VYNHDEgdVVKALLDLQHEyldEIISSLHVHMDeHNCLEVIVVKGEakKIKM........  112
DSSP  EEELLLllHHHHHHHHHHHhllLEEEEEEEELLlLEEEEEEEEEEEhhHHHH........


DSSP  lllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEELllhhhhhhhhlllee
Query erildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEYqnpkeivdwlapkta  121
ident                                        |                    
Sbjct ..................iadklLSLK.......gvkHGKLVMTS...............  132
DSSP  ..................hhhhhHLLL.......lllLLLEEEEL...............


DSSP  lleellllllll
Query hgvplwdnpvpp  133
ident             
Sbjct ............  132
DSSP  ............


No 14: 1XHOA  MOLECULE: CHORISMATE MUTASE;                                         

DSSP  lLEEEEEEELLL........LLHHHHHHHHHLLL.....lLLEEEEEEE...........
Query dKVXVVAEVRPS........EDVNKVLSAISNFF.....dFEKXNTRKE...........   36
ident            |            | |                                 
Sbjct .VWAIRGATTVSdntadeivAETQKLLKEXAEKNgleeddIISIIFTVTkdldaafpaia   59
DSSP  .LEEEEEEEELLlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHLlllhhhEEEEEEEELllllllllhhh


DSSP  .......................LLEEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query .......................GIIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylx   73
ident                                   | |                       
Sbjct arnxgwtstalxcxneidvpgslEKCIRVXXHVNTDK.......................   96
DSSP  hhhlllllleeeeeellllllllLLEEEEEEEELLLL.......................


DSSP  hlllllEEEEeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query kgiegnTIAFxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                             
Sbjct ......DKKD......................................ikhvylngakvl  112
DSSP  ......LHHH......................................llleelhhhhhl


No 15: 1WY7A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1948;                               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rkkelaialsklkgfknpkvwleqyrtpgnaasellwlayslgdiegkvvadlgagtgvl   60
DSSP  llhhhhhhhhlllllllllhhhllllllhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeelllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sygalllgakevicvevdkeavdvlienlgefkgkfkvfigdvsefnsrvdivixnppfg  120
DSSP  hhhhhhlllleeeeeellhhhhhhhhhhlhhhllleeeeellhhhlllllleeeelllll


DSSP  ..................LLEEEEEEElllllHHHHHHHHHLLL.....LLLEEEEEEEL
Query ..................DKVXVVAEVrpsedVNKVLSAISNFF.....DFEKXNTRKEG   37
ident                   | |              |   |  |            | |  
Sbjct sqrkhadrpfllkafeisDVVYSIHLA.....KPEVRRFIEKFSwehgfVVTHRLTTKIE  175
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhlLEEEEEEEL.....LHHHHHHHHHHHhhlleEEEEEEEEEEE


DSSP  ........LEEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhh
Query ........IIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqa   89
ident          |                                                  
Sbjct iphrkkleRITVDIYRFSKVI.......................................  196
DSSP  elllllleEEEEEEEEEEELL.......................................


DSSP  hhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query aavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                             
Sbjct ............................................  196
DSSP  ............................................


No 16: 2J5AA  MOLECULE: 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  

DSSP  .....LLEEEEEEELLLL...LHHHHHHHHHLLLL.....LLEEEE.EEEL.........
Query .....DKVXVVAEVRPSE...DVNKVLSAISNFFD.....FEKXNT.RKEG.........   37
ident           |  | |        |       |                           
Sbjct hyktlRYYETVFAVKPTLseeEMKKKFEQVKEFIKqkggeILYEEDwGMRQlaypiqkfn   60
DSSP  lllllEEEEEEEEELLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHhlleeEEEEEEeEEEElllllllll


DSSP  LEEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHHhllllll
Query IIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsf   97
ident           |                                                 
Sbjct NARYFLVQFKTEN..........................pqlpnelDFQLKID....edv   90
DSSP  EEEEEEEEEEELL..........................llhhhhhHHHHHHL....lle


DSSP  lLEEEEEELLLhhhhhhhhllleelleellllllll
Query vAIKFYIEYQNpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                     
Sbjct iRWLNIQIKES....................evkkn  106
DSSP  eEEEEEEELHH....................hllll


No 17: 2CC6A  MOLECULE: VNG1446H;                                                  

DSSP  LLEEEEEEELLL....LLHHHHHHHHHLLLL.LLEEEE.EEELL.........EEEEEEE
Query DKVXVVAEVRPS....EDVNKVLSAISNFFD.FEKXNT.RKEGI.........IDILVLE   45
ident     |                         |                             
Sbjct VFKKVLLTGTSEesftAAADDAIDRAEDTLDnVVWAEVvDQGVEigaveertyQTEVQVA   60
DSSP  LEEEEEEEEEELllhhHHHHHHHHHHHHHLLlEEEEEEeEEEEEllllllleeEEEEEEE


DSSP  ELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeee
Query ARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyie  105
ident                                                             
Sbjct FELD........................................................   64
DSSP  EELL........................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query yqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                             
Sbjct ............................   64
DSSP  ............................


No 18: 1VMBA  MOLECULE: 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  

DSSP  ..LLEEEEEEELLLL...LHHHHHHHHHLLLL......LLEEEE.EEEL.........LE
Query ..DKVXVVAEVRPSE...DVNKVLSAISNFFD......FEKXNT.RKEG.........II   39
ident             |                           |                   
Sbjct keRIYESMFIIAPNVpeeERENLVERVKKIIEervkgkIDKVERmGMRKfayeikkfnEG   60
DSSP  llEEEEEEEEELLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHhlllleEEEEEEeEEEEeeeeelleeEE


DSSP  EEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHHhlllllllL
Query DILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsfvA   99
ident |  |   |                                                    
Sbjct DYTVIYFRCDG...........................qnlqelENFYRVT....peiiR   89
DSSP  EEEEEEEEELL...........................lllhhhHHHHHLL....lleeE


DSSP  EEEEEELL..LHHHhhhhhllleelleellllllll
Query IKFYIEYQ..NPKEivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                     
Sbjct WQTFRRFDleKKER..................kaqr  107
DSSP  EEEEELHHhhHHHH..................hhhl


No 19: 1U8SA  MOLECULE: GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL                    

DSSP  ...lLEEEEEEE.LLLLLHHHHHHHHH.LLLLLLEEEEEEELLEEEEEEEEllhhHHHHH
Query ...dKVXVVAEV.RPSEDVNKVLSAIS.NFFDFEKXNTRKEGIIDILVLEArtlkSLLKF   55
ident          |         | |                   |    |        |    
Sbjct sltqHLVITAVGtDRPGICNEVVRLVTqAGCNIIDSRIAMFGKEFTLLMLI....SGSPS   56
DSSP  llleEEEEEEEEeLLLLHHHHHHHHHHhLLLEEEEEEEEEELLEEEEEEEE....EELHH


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHHhlllllllLEEEEEEL.........
Query hrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAAavgvlsfvAIKFYIEY.........  106
ident                                                             
Sbjct .......................nitrveTTLPLL..gqqhdlITMMKRTSphdhqthay   91
DSSP  .......................hhhhhhHHHHHH..hhhhllEEEEEEELlllllllle


DSSP  .....................................................llhhhhh
Query .....................................................qnpkeiv  113
ident                                                             
Sbjct tvevyvesddklgltekftqffaqrqigmaslsaqtisnqfhiaisarvdsgcnlmqlqe  151
DSSP  eeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeelleeeeeeeeeelllllhhhhhh


DSSP  hhhllleelleellllllll
Query dwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                     
Sbjct efdalctaldvqgslnfikn  171
DSSP  hhhhhhhhhlleeeeeeeel


No 20: 1PHZA  MOLECULE: PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       

DSSP  ..............LLEEEEEEELLL.lLHHHHHHHHHLL.lllLEEEEEEE...LLEEE
Query ..............DKVXVVAEVRPS.eDVNKVLSAISNF.fdfEKXNTRKE...GIIDI   41
ident                                |||               |          
Sbjct gqetsyiednsnqnGAISLIFSLKEEvgALAKVLRLFEENdinlTHIESRPSrlnKDEYE   60
DSSP  llllllllllllllLLEEEEEEEELLllHHHHHHHHHHLLllllLLEEEEELlllLLEEE


DSSP  EEEEELlHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEE
Query LVLEARtLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIK  101
ident                                                             
Sbjct FFTYLD.KRTKPV.........................lgsiiKSLRN.....digaTVH   89
DSSP  EEELLL.HHHHHH.........................hhhhhHHHHH.....llllLEE


DSSP  EEEELLLH....................................................
Query FYIEYQNP....................................................  109
ident                                                             
Sbjct ELSRDKEKntvpwfprtiqeldrfanqildadhpgfkdpvyrarrkqfadiaynyrhgqp  149
DSSP  EEELLLLLlleelllllhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct iprveyteeekqtwgtvfrtlkalykthacyehnhifpllekycgfrednipqledvsqf  209
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct lqtctgfrlrpvagllssrdflgglafrvfhctqyirhgskpmytpepdichellghvpl  269
DSSP  hhhhhlleeeellllllhhhhhhhhllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhlhhh


DSSP  ..................hhhhhhhllLEEL.............................
Query ..................keivdwlapKTAH.............................  122
ident                                                             
Sbjct fsdrsfaqfsqeiglaslgapdeyiekLATIywftvefglckegdsikaygagllssfge  329
DSSP  hllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHhhlllllleeeelleeeellhhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct lqyclsdkpkllplelektacqeysvtefqplyyvaesfsdakekvrtfaatiprpfsvr  389
DSSP  hhhhllllleeeellhhhhlllllllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllllleee


DSSP  ...leellllllll
Query ...gvplwdnpvpp  133
ident               
Sbjct ydpytqrvevldnt  403
DSSP  eelllleeeeelll


No 21: 2EWHA  MOLECULE: MAJOR CARBOXYSOME SHELL PROTEIN 1A;                        

DSSP  lLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEElLHHHhhhhhhhh
Query dKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEG.IIDILVLEArTLKSllkfhrvl   59
ident        | |          |               |                       
Sbjct gIALGMIETRGLVPAIEAADAMTKAAEVRLVGRQFVGgGYVTVLVRG.ETGA........   51
DSSP  lLEEEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEEEElLEEEEEEEE.LHHH........


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeeLHHHhhlllllllLEEEEEE.LLLHhhhhhhhll
Query rnerildsarkylxkgiegntiafxiHKQAaavgvlsfvAIKFYIE.YQNPkeivdwlap  118
ident                                        |                    
Sbjct .................vnaavragaDACE..rvgdglvAAHIIARvHSEV.........   83
DSSP  .................hhhhhhhhhHHHL..llllleeEEEEELLlLHHH.........


DSSP  leelleellllllll
Query ktahgvplwdnpvpp  133
ident                
Sbjct ......enilpkapq   92
DSSP  ......hllllllll


No 22: 2DVKA  MOLECULE: UPF0130 PROTEIN APE0816;                                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dpgaekvlarinrpskivstssctgritliegeahwlrvaykthhpisrsevervlrrgf   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeeeellllllleeeeelllllhhhhhhhhllll


DSSP  .......LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLlLLLLEEE.EEEE.LLEEEEEEEE.....
Query .......DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNfFDFEKXN.TRKE.GIIDILVLEA.....   46
ident                |         | |      |                         
Sbjct tnlwlkvTGPILHLRVEGWQCAKSLLEAARR.NGFKHSGvISIAeDSRLVIEIMSsqsms  119
DSSP  lleeeeeELLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHH.LLLLEEEeEEELlLLLEEEEEELlleee


DSSP  ............................lLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllll
Query ............................rTLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgieg   78
ident                                  |                          
Sbjct vplvmegarivgddaldmliekantilveSRIGLDT........................  155
DSSP  eeeeelleelllhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHH........................


DSSP  leeeeeELHHhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query ntiafxIHKQaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                        
Sbjct .fsrevEELV...........................................ec  166
DSSP  .hhhhhHHLL...........................................ll


No 23: 2F1FA  MOLECULE: ACETOLACTATE SYNTHASE ISOZYME III SMALL SUBUNIT;           

DSSP  lLEEEEEEELLL.lLHHHHHHHHHL.llLLLEEEEEEEL..LEEEEEEEELLHhhHHHHh
Query dKVXVVAEVRPS.eDVNKVLSAISN.ffDFEKXNTRKEG..IIDILVLEARTLksLLKFh   56
ident                   |    |      |                             
Sbjct aRRILSVLLENEsgALSRVIGLFSQrgyNIESLTVAPTDdpTLSRMTIQTVGD..EKVL.   57
DSSP  lEEEEEEEEELLllHHHHHHHHHHLlllLLLEEEEEELLllLEEEEEEEEELL..HHHH.


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEE............
Query rvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYI............  104
ident                                                             
Sbjct ........................eqieKQLHK....lvdvlRVSELGqgahvereimlv   89
DSSP  ........................hhhhHHHHH....llleeEEEEHHhlleeeeeeeee


DSSP  .............................................elllhhhhhhhhlll
Query .............................................eyqnpkeivdwlapk  119
ident                                                             
Sbjct kiqasgygrdevkrnteifrgqiidvtpslytvqlagtsgkldaflasirdvakivevar  149
DSSP  eeelllhhhhhhhhhhhhllleeeeellleeeeeeeelhhhhhhhhhhhlllleeeeeee


DSSP  eelleellllllll
Query tahgvplwdnpvpp  133
ident               
Sbjct sgvvglsrgdkimr  163
DSSP  llleeeelllllll


No 24: 2PEBA  MOLECULE: PUTATIVE DIOXYGENASE;                                      

DSSP  .......LLEEEEEEELLLL..LHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEEL....lEEEEEEEEL
Query .......DKVXVVAEVRPSE..DVNKVLSAISNfFDFEKXNTRKEG....iIDILVLEAR   47
ident                           |       |                         
Sbjct kedtieiAGFHAHVYFDAASrdVAARVREGLGArFEVQLGRWFDKPigphpKGXYQVAFL   60
DSSP  lllhhhlLEEEEEEEELHHHhhHHHHHHHHHHHhLLLEEEEEELLLlllllLEEEEEEEL


DSSP  lHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeeLHHHhhlllllllLEEEEEELL
Query tLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxiHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYQ  107
ident       |                                             |    |  
Sbjct .PNQFDK........................vvpwlxlNREG........lDILVHPETG   87
DSSP  .HHHHHH........................hhhhhhhHLLL........lLEEEEEELL


DSSP  LHH..hhhhhhllleelleellllllll
Query NPK..eivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                             
Sbjct DAVsdhavyslwlgaalalnieflrqls  115
DSSP  LHHhhhhllleeelllllllhhhhhhll


No 25: 2NYIA  MOLECULE: UNKNOWN PROTEIN;                                           

DSSP  ..LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLL..LLLLEEEEEEELLEEEEEEEELLHHhhhhhh
Query ..DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNF..FDFEKXNTRKEGIIDILVLEARTLKsllkfh   56
ident       |              |          |       |                   
Sbjct etQSFVVSVAGSDRVGIVHDFSWALKNisANVESSRXACLGGDFAXIVLVSLNA......   54
DSSP  llEEEEEEEEEELLLLHHHHHHHHHHHllLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEELL......


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHHhlllllllLEEEEEELLL........
Query rvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsfvAIKFYIEYQN........  108
ident                                  |         |                
Sbjct .....................kdgkliQSALESA....lpgfQISTRRASSVvspdtrey   89
DSSP  .....................lllhhhHHHHHHH....llllEEEEEELLLLlllleeee


DSSP  .........................................................hhh
Query .........................................................pke  111
ident                                                             
Sbjct elyvegpdsegiveavtavlakkganiveletetlpapfagftlfrxgsrvafpfplyqe  149
DSSP  eeeeeeellllhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeeehhhhhh


DSSP  hhhhhllleelleellllllll
Query ivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                       
Sbjct vvtalsrveeefgvdidleevv  171
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeeell


No 26: 2DGWA  MOLECULE: PROBABLE RNA-BINDING PROTEIN 19;                           

DSSP  ........LLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEE..LLEE.EEEEEELL
Query ........DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNfFDFEKXNTRKE..GIID.ILVLEART   48
ident             |             |                    |            
Sbjct gssgssgtTCHTVKLRgAPFNVTEKNVMEFLAP.LKPVAIRIVRNahGNKTgYIFVDFSN   59
DSSP  llllllllLLLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHLL.LLLLEEEEEELllLLEEeEEEEELLL


DSSP  HHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEElll
Query LKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEyqn  108
ident                                                             
Sbjct EEEVKQ..........................alkcNREY....mggryiEVFREKS...   86
DSSP  HHHHHH..........................hhhlLLEE....elleeeEEEEELL...


DSSP  hhhhhhhhllleelleellllllll
Query pkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                          
Sbjct ....................gpssg   91
DSSP  ....................lllll


No 27: 2BZ2A  MOLECULE: NEGATIVE ELONGATION FACTOR E;                              

DSSP  ...LLEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEllEEEEEEEELLHHHhhhhhh
Query ...DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEgiIDILVLEARTLKSllkfhr   57
ident                        | | |                         |      
Sbjct aprKGNTLYVYGED.MTPTLLRGAFSPFGNIIDLSMDPP..RNCAFVTYEKMES......   51
DSSP  lllLLLEEEEELLL.LLHHHHHHHHLLLLLLLLEEEELL..LLEEEEELLLHHH......


DSSP  hhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHhhlllllllLEEEEeelllhhhhhhhhl
Query vlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKFYieyqnpkeivdwla  117
ident                                                             
Sbjct .....................adqavAELNGT..qvesvqlKVNIA..............   74
DSSP  .....................hhhhhHHHLLL..lllllllEEEEL..............


DSSP  lleelleellllllll
Query pktahgvplwdnpvpp  133
ident                 
Sbjct ...........rkqpm   79
DSSP  ...........lllll


No 28: 2B8KG  MOLECULE: DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II LARGEST SUBUNIT;            

DSSP  ....LLEEEEEEELLLL....LHHHHHHHHHLLLL.................lLEEE.EE
Query ....DKVXVVAEVRPSE....DVNKVLSAISNFFD.................fEKXN.TR   34
ident               ||                                           |
Sbjct mffiKDLSLNITLHPSFfgprMKQYLKTKLLEEVEgsctgkfgyilcvldydnIDIQrGR   60
DSSP  leeeELLEEEEEELHHHllllHHHHHHHHHHHLLLlleellleeeeeelllllLLLLlEE


DSSP  EEL..LEEEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhl
Query KEG..IIDILVLEARtlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaav   92
ident               |                                             
Sbjct ILPtdGSAEFNVKYR.............................................   75
DSSP  ELLllLLEEEEEELL.............................................


DSSP  llllllleeeeeelllhhhHHHH..hllLEEL.........LEEL...............
Query gvlsfvaikfyieyqnpkeIVDW..lapKTAH.........GVPL...............  126
ident                                                             
Sbjct ................avvFKPFkgevvDGTVvscsqhgfeVQVGpmkvfvtkhlmpqdl  119
DSSP  ................eeeELLLlleeeEEEEeeeelleeeEELLlleeeeehhhlllll


DSSP  .............................................lllllll
Query .............................................wdnpvpp  133
ident                                                     
Sbjct tfnagsnppsyqssedvitiksrirvkiegcisqvssihaigsikedylgai  171
DSSP  llllllllleeelllleeellleeeeeeeeeeeelleeeeeeelllllleel


No 29: 1XRSB  MOLECULE: D-LYSINE 5,6-AMINOMUTASE ALPHA SUBUNIT;                    

DSSP  lLEEEEEEELL...llLHHHHHHHHHL..LLLLleEEEEEEL.LEEEEEEEE........
Query dKVXVVAEVRP...seDVNKVLSAISN..FFDFekXNTRKEG.IIDILVLEA........   46
ident  ||                                             |           
Sbjct .KVQLSFTLPLknnerSAEAAKQIALKmgLEEPsvVMQQSLDeEFTFFVVYGneilsmee   59
DSSP  .LEEEEEEELLlllhhHHHHHHHHHHLllLLLLeeEEEEEEElLEEEEEEEElllllhhh


DSSP  ............................................llhhhhhhhhhhhhhl
Query ............................................rtlksllkfhrvlrne   62
ident                                                             
Sbjct tdeyikenigrkivvvgastgtdahtvgidaimnmkgyaghygleryemidaynlgsqva  119
DSSP  hhhhhhhhlllleeeeeeelllllllhhhhhhhllllllllllhhhllleeeeellllll


DSSP  llhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllLEEL
Query rildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapKTAH  122
ident                                                             
Sbjct nedfikkaveleadvllvsqtvtqknvhiqnmthlielleaeglrdrfvllcggprINNE  179
DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhleeeeelllLLHH


DSSP  ........LEELLL..............lllll
Query ........GVPLWD..............npvpp  133
ident                                  
Sbjct iakelgydAGFGPGrfaddvatfavktlndrmn  212
DSSP  hhhlllllEEELLLllhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 30: 2HGJG  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  ..................................LLEEEEEEELLLL....LHHHHHHHH
Query ..................................DKVXVVAEVRPSE....DVNKVLSAI   22
ident                                    ||                 |     
Sbjct mpldvalkrkyyeevrpelirrfgyqnvwevprlEKVVINQGLGEAKedarILEKAAQEL   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleELLLEEELLLLLLllhhHHHHHHHHH


DSSP  H.lllllleeeeeEELL.........eEEEEE.EELL..HHHHHHH.HHHHhhlllhhHH
Query S.nffdfekxntrKEGI.........iDILVL.EART..LKSLLKF.HRVLrnerildSA   68
ident              |  |            |     |      | |     |         
Sbjct AlitgqkpavtraKKSIsnfklrkgmpIGLRVtLRRDrmWIFLEKLlNVAL.prirdfRG  119
DSSP  HhhhlllllllllLLLLllllllllllLLLEElLLLHhhHHHHHHHhHHHL.llllllLL


DSSP  HHhhhHLLL.LLEEEEEELHhhhhLLLL.......lllLEEEEEELL.....LHHH.HHH
Query RKylxKGIE.GNTIAFXIHKqaaaVGVL.......sfvAIKFYIEYQ.....NPKE.IVD  114
ident                                                             
Sbjct LN..pNSFDgRGNYNLGLRE..qlIFPEitydmvdalrGMDIAVVTTaetdeEARAlLEL  175
DSSP  LL..lLLLLlLLLLLLLLLL..llLLLLllllllllllLEEELLEELlllhhHHHHhHHH


DSSP  HHLlleelleellllllll
Query WLApktahgvplwdnpvpp  133
ident                    
Sbjct LGF............pfrk  182
DSSP  HHL............llll


No 31: 2DHSA  MOLECULE: CUG TRIPLET REPEAT RNA-BINDING PROTEIN 1;                  

DSSP  .............LLEEEEE.eellLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEE......LLEE
Query .............DKVXVVA.evrpSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKE......GIID   40
ident              |                               |              
Sbjct mngtldhpdqpdlDAIKMFVgqvprTWSEKDLRELFEQYGAVYEINVLRDrsqnppQSKG   60
DSSP  lllllllllllllLLLEEEEellllLLLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLllllllLLLL


DSSP  EEEEEELLHHHHHHHHHhhhhlllhhhhhhhhhhllllleEEEEelhhhhhlllllllle
Query ILVLEARTLKSLLKFHRvlrnerildsarkylxkgiegntIAFXihkqaaavgvlsfvai  100
ident        | |  |                                               
Sbjct CCFVTFYTRKAALEAQN.....................alHNMK......vlpgmhhpiq   93
DSSP  EEEEEELLHHHHHHHHH.....................hlLLLL......llllllllle


DSSP  EEEE.ellLHHHhhhhhllLEEL.....................................
Query KFYI.eyqNPKEivdwlapKTAH.....................................  122
ident         |                                                   
Sbjct MKPAdsekNNAV...edrkLFIGmiskkctendirvmfssfgqieecrilrgpdglsrgc  150
DSSP  EEELhhhlLLHH...hhllEEELlllllllhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellleeeee


DSSP  ..........................leellllllll
Query ..........................gvplwdnpvpp  133
ident                                      
Sbjct afvtfttramaqtaikamhqaqtmegcsspmvvkfad  187
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeell


No 32: 1QDLA  MOLECULE: PROTEIN (ANTHRANILATE SYNTHASE (TRPE-SUBUNIT));            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct amevhpisefaspfevfkcierdfkvagllesirysviawstngylkihddpvnilngyl   60
DSSP  leeeeehhhlllhhhhhhhhhhhlleeeeeellleeeeeellllleeelllhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kdlkladipglfkggmigyisydavrfwekirdlkpaaedwpyaefftpdniiiydhneg  120
DSSP  lllllllllllllleeeeeelhhhhhhlllllllllllllllleeeellleeeeeehhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kvyvnadlssvggcgdigefkvsfydeslnknsyerivsesleyirsgyifqvvlsrfyr  180
DSSP  eeeeelllllllllllllleeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeee


DSSP  ..............................................LLEEEEEEELL...
Query ..............................................DKVXVVAEVRP...   11
ident                                                 |           
Sbjct yifsgdplriyynlrrinpspymfylkfdekyligsspellfrvqdNIVETYPIAGTrpr  240
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeeeeelleeeeeelLEEEELLEEEEeel


DSSP  ....................lLLHHHHHHHHHLLLL......lLEEE..EEEEL....LE
Query ....................sEDVNKVLSAISNFFD......fEKXN..TRKEG....II   39
ident                                 |           |       |       
Sbjct gadqeedlklelelmnsekdkAEHLMLVDLARNDLGkvcvpgtVKVPelMYVEKyshvQH  300
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHlllllllLEEEeeEEEEEllleEE


DSSP  EEEEEEELLH.....hhHHHHhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHH.HHHLL
Query DILVLEARTL.....ksLLKFhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQ.AAAVG   93
ident                   |                                      |  
Sbjct IVSKVIGTLKkkynalnVLSA...........................tfPAGTvSGAPK  333
DSSP  EEEEEEEELLllllhhhHHHH...........................hlLLHHhLEELH


DSSP  L..........llllleeeeeelLLHHHH.....hhhhllLEEL................
Query V..........lsfvaikfyieyQNPKEI.....vdwlapKTAH................  122
ident                                                             
Sbjct PmamniietleeykrgpyagavgFISADGnaefaiairtaFLNKellrihagagivydsn  393
DSSP  HhhhhhhhhhllllllllleeeeEEELLLleeeeeelleeEEELleeeeeeeeeelllll


DSSP  ...........leellllllll
Query ...........gvplwdnpvpp  133
ident                       
Sbjct peseyfetehklkalktaigvr  415
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 33: 1HL6A  MOLECULE: CG8781 PROTEIN;                                            

DSSP  .....................................LLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHH
Query .....................................DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAI   22
ident                                                             
Sbjct aeefevdedgdqgivrlkekakhrkgrgfgpgpqrsvEGWILFVTsIHEEAQEDEIQEKF   60
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeelhhhllllllllLLEEEEEElLLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HLLLLLLEEEEEEEL....lEEEEEEEELLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllll
Query SNFFDFEKXNTRKEG....iIDILVLEARTLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgieg   78
ident                           |  | |  |                         
Sbjct CDYGEIKNIHLNLDRrtgfsKGYALVEYETHKQALA........................   96
DSSP  HLLLLEEEEELLLLLlllllLLLEEEEELLHHHHHH........................


DSSP  leeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query ntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIeyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                        
Sbjct .akealNGAE....imgqtiQVDWCF...........................vk  119
DSSP  .hhhhhLLLE....elleelEEEELE...........................el


No 34: 2J8AA  MOLECULE: HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE, H3 LYSINE-4            

DSSP  lLEEEEE.....eelLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEE...LLEE.EEEEEEllHHH
Query dKVXVVA.....evrPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKE...GIID.ILVLEArtLKS   51
ident      |                                                      
Sbjct .SCEIVVypaqdsttTNIQDISIKNYFKKYGEISHFEAFNDpnsALPLhVYLIKY.aNDA   58
DSSP  .LLEEEEeellllllLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEELlllLLEEeEEEEEL.lLLH


DSSP  HHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllLLLL..........LEE
Query LLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvLSFV..........AIK  101
ident                                                             
Sbjct AKA..................................afsavrKHESsgcfimgfkfEVI   84
DSSP  HHH..................................hhhhhhHLLLlleeelleeeEEE


DSSP  EEEelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query FYIeyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                 
Sbjct LNK..hsilnniiskfveinvkklqklqenlk  114
DSSP  ELL..llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 35: 1O51A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM0021;                               

DSSP  .LLEEEEEEELLLL......LHHHHHHHhhllllLLEEEEEEEL.......LEEEEEEEE
Query .DKVXVVAEVRPSE......DVNKVLSAisnffdFEKXNTRKEG.......IIDILVLEA   46
ident                                                        |    
Sbjct hHXKLLKIYLGEKDkhsgkpLFEYLVKR.ayelgXKGVTVYRGIxgfghpdLPIVLEIVD   59
DSSP  lEEEEEEEEEELLLeelleeHHHHHHHH.hhhllLLLLEEEELLlllllllLEEEEEEEE


DSSP  LlHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhHHHLLlllllLEEEEEEL
Query RtLKSLlkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqAAAVGvlsfvAIKFYIEY  106
ident                                                             
Sbjct E.EERI...............................nlflkEIDNI.dfdgLVFTADVN   86
DSSP  L.HHHH...............................hhhhhHHHLL.llllEEEEEEEE


DSSP  llhhhhhhhhllleelleellllllll
Query qnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                            
Sbjct ........................vvk   89
DSSP  ........................lll


No 36: 1JW3A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN MTH1598;                    

DSSP  ..............................................LLEEEEEEELLLLL
Query ..............................................DKVXVVAEVRPSED   14
ident                                                   |         
Sbjct mkgfeffdvtadagfwayghdleevfenaalamfevmtdtslveaaEERRVEITSEDRVS   60
DSSP  llleeellllleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLEEEEEEEELLLHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLL........lLEEEEEEELLEEEEEEEELLHhhhhhhhhhHHHLllhh
Query VNKVLSAISNFFD........fEKXNTRKEGIIDILVLEARTLksllkfhrvLRNErild   66
ident           |            |           |   |             | |    
Sbjct LLYDWLDELLFIHdtefilfskFKVKIDEKDDGLHLTGTAMGE..eikegheRRDE....  114
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhlllllllLEEEEEELLLLEEEEEEEELL..lllllllLLLL....


DSSP  hhhhhhhhllllleeeeeelhhhhHLLLllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleel
Query sarkylxkgiegntiafxihkqaaAVGVlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvpl  126
ident                                                             
Sbjct ...vkavtfhmmeildedglikarVILD................................  139
DSSP  ...llllllllleeeeelleeeeeEEEE................................


DSSP  lllllll
Query wdnpvpp  133
ident        
Sbjct ......l  140
DSSP  ......l


No 37: 1F0XA  MOLECULE: D-LACTATE DEHYDROGENASE;                                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nkaflnelarlvgsshlltdpaktaryrkgfrsgqgdalavvfpgsllelwrvlkacvta   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhlhhheellhhhhhhhhllllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dkiilmqaantgltegstpngndydrdvviistlrldklhvlgkgeqvlaypgttlysle  120
DSSP  lleeeeelllllllllllllllllllleeeeelllllleeeelllleeeelllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kalkplgrephsvigsscigasviggicnnsggslvqrgpaytemslfarinedgkltlv  180
DSSP  hhhhhhleelllllhhhhhlllhhhhhhllllllllllllllllleeeeeellllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nhlgidlgetpeqilskldddrikdddvrhdgrhahdydyvhrvrdieadtparynadpd  240
DSSP  elllllllllhhhhhhhhhlllllhhhllllllllllllhhhhhhlllllllllllllhh


DSSP  ..........................LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHL..llLLLEEE
Query ..........................DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISN..ffDFEKXN   32
ident                                       |        |            
Sbjct rlfessgcagklavfavrldtfeaekNQQVFYIGTNQPEVLTEIRRHILAnfenLPVAGE  300
DSSP  hllllllllllleeeeeeeeleelllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEE


DSSP  EEEEL.................lEEEEEEEELLhHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhl
Query TRKEG.................iIDILVLEARTlKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkg   75
ident                           | |                               
Sbjct YMHRDiydiaelpprmknwrdkyEHHLLLKMAG.DGVGE.....................  338
DSSP  EEEHHhhhhhlllhhhhhhhhhlLEEEEEEELL.LHHHH.....................


DSSP  lllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEE..............................
Query iegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIE..............................  105
ident                                                             
Sbjct ....akswlVDYFK.....qaegDFFVCTPeegskaflhrfaaagaairyqavhsdeved  389
DSSP  ....hhhhhHHHHH.....hlllEEEELLHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  105
ident                                                             
Sbjct ilaldialrrndtewyehlppeidsqlvhklyyghfmcyvfhqdyivkkgvdvhalkeqm  449
DSSP  eeeeeeelllllllllllllhhhhlleeeeeeeeelllleeeeeeeeellllhhhhhhhh


DSSP  .........................lllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query .........................yqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                      
Sbjct lellqqrgaqypaehnvghlykapetlqkfyrendptnsmnpgigktskrknw  502
DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllllll


No 38: 1ZPVA  MOLECULE: ACT DOMAIN PROTEIN;                                        

DSSP  lLEEEEEEELLL...lLHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEEL....LEEEEEEEELLHhhhh
Query dKVXVVAEVRPS...eDVNKVLSAISNfFDFEKXNTRKEG....IIDILVLEARTLksll   53
ident         |        |  |   |                        |          
Sbjct nAXKAIITVVGKdksgIVAGVSGKIAE.LGLNIDDISQTVldeyFTXXAVVSSDEK....   55
DSSP  lLEEEEEEEEELllllHHHHHHHHHHH.LLLEEEEEEEEEelleEEEEEEEEELLL....


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHHHLllllllLEEEEEelllhhhhh
Query kfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAAVgvlsfvAIKFYIeyqnpkeiv  113
ident                                    |          |             
Sbjct ........................qdftylRNEFEAFGQtlnvkiNIQSAA.........   82
DSSP  ........................llhhhhHHHHHHHHHhhleeeEEEEHH.........


DSSP  hhhllleelleellllllll
Query dwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                     
Sbjct .................ife   85
DSSP  .................hll


No 39: 2Q3VA  MOLECULE: PROTEIN AT2G34160;                                         

DSSP  ............................LLEEEEEEElllLLHHHHHHHHHLLL.....L
Query ............................DKVXVVAEVrpsEDVNKVLSAISNFF.....D   27
ident                               |   |          |              
Sbjct kknriqvsntkkplffyvnlakryxqqyNDVELSALG...XAIATVVTVTEILKnngfaV   57
DSSP  llleeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhLEEEEEEEH...HHHHHHHHHHHHHHhllleE


DSSP  LLEEEEEEEL....LEEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeee
Query FEKXNTRKEG....IIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiaf   83
ident   |  |                                                      
Sbjct EKKIXTSIVDikpvQKAKIEITLVKSE.................................   84
DSSP  EEEEEEEEEEelleEEEEEEEEEEELL.................................


DSSP  eelhhhhhlllllllleeeeeelllhhHHHHHHllleelleellllllll
Query xihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkEIVDWLapktahgvplwdnpvpp  133
ident                            |                      
Sbjct ........................kfdELXAAA.................   93
DSSP  ........................lhhHHHHHL.................


No 40: 2PFDA  MOLECULE: FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     

DSSP  ...LLEEEEEEElllllHHHHHHHHHLLLL......LLEEEEEEEllEEEEEEEEL....
Query ...DKVXVVAEVrpsedVNKVLSAISNFFD......FEKXNTRKEgiIDILVLEAR....   47
ident                     |  |||                         |        
Sbjct sqlVECVPNFSE...gnNQEVIDAISQAISqtpgcvLLDVDAGPS..TNRTVYTFVgqpe   55
DSSP  lleEEELLEELL...llLHHHHHHHHHHLLlllleeEEEEEEELL..LLEEEEEEEelhh


DSSP  .LHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHH....hhhlllllllleEE
Query .TLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQ....aaavgvlsfvaiKF  102
ident       |                                                     
Sbjct cVVEGALS.........................aartaSQLIdxrkhkgehprxgaldVC   90
DSSP  hHHHHHHH.........................hhhhhHLLLlhhhllllllllllllEE


DSSP  EEEL.........LLHHHH.HHHHL...................................
Query YIEY.........QNPKEI.VDWLA...................................  117
ident                        ||                                   
Sbjct PFIPvrgvsxdecVLCAKAfGQRLAeelnvpvylygeaaqxpsrqtlpairageyealpe  150
DSSP  EEEEeelllhhhhHHHHHHhHHHHHhhhllleeeeellllllllllhhhhlllllllhhh


DSSP  ..........LLEEL.............................................
Query ..........PKTAH.............................................  122
ident                                                             
Sbjct klkqaewvpdFGPSSfvpswgatvtgarkfliafninllstkeqahrialnlreqgrgkd  210
DSSP  hlllllllllLLLLLllllllleeeeelllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct qpgrlkkvqgigwyleeknlaqvstnlldfevtalhtvyeearreaqelnlpvvgsqlvg  270
DSSP  llllllleeeeeeeelllleeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct lvplkalldaaafycdkeklfvleeehrirlvvnrlgldslapfdpkeriieylvpdsgp  330
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhlhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct eqslldaslrafvrevgarsaapgggsvaaavaalgaalasxvgqxtygrrqfdhldstx  390
DSSP  lllhhhllhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct rrlippfhaasaqltslvdadarafaaclgaiklpkntpeerdrrtcalqeglrqavavp  450
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct lklaetvsqlwpalqelaqcgnlsclsdlqvaakaletgvfgayfnvlinlkdxtddvfk  510
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh


DSSP  ...................leellllllll
Query ...................gvplwdnpvpp  133
ident                               
Sbjct ektrhrissllqeaktqaalvlgslearke  540
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 41: 2CZ4A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0516;                             

DSSP  ....LLEEEEEEELllLLHHHHHHHHHLLLLLlEEEEEEEL..............LEEEE
Query ....DKVXVVAEVRpsEDVNKVLSAISNFFDFeKXNTRKEG..............IIDIL   42
ident         |                                                  |
Sbjct xdlvPLKLVTIVAE.sLLEKRLVEEVKRLGAK.GYTITPARgegsrgirsvdwegQNIRL   58
DSSP  lleeEEEEEEEEEE.hHHHHHHHHHHHHLLLL.LLEEEEELllllllllllllllLEEEE


DSSP  EEEELlhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHHhllllllllEEE
Query VLEARtlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsfvaIKF  102
ident                                              |              
Sbjct ETIVS.............................eevalriLQRLQEE.yfphyaviAYV   88
DSSP  EEEEL.............................hhhhhhhHHHHHHH.llllllleEEE


DSSP  EEELllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query YIEYqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                
Sbjct ENVW...................vvrgekyv  100
DSSP  EEEE...................eelhhhhl


No 42: 1ZG3A  MOLECULE: ISOFLAVANONE 4'-O-METHYLTRANSFERASE;                       

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gseeselyhaqihlykhvynfvssmalksamelgiadaihnhgkpmtlselasslklhps   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllleehhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kvnilhrflrllthngffaktivkgkegdeeeeiaysltppskllisgkptclssivkga  120
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllllllleeeeeelhhhhllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lhpssldmwssskkwfnedkeqtlfecatgesfwdflnkdsesstlsmfqdamasdsrmf  180
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct klvlqenkrvfegleslvdvgggtggvtkliheifphlkctvfdqpqvvgnltgnenlnf  240
DSSP  hhhhhhlhhhhhllleeeeelllllhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhlllllllleee


DSSP  ............................................lLEEEEEEEL......
Query ............................................dKVXVVAEVR......   10
ident                                                 |           
Sbjct vggdmfksipsadavllkwvlhdwndeqslkilknskeaishkgkDGKVIIIDIsidets  300
DSSP  eellllllllllleeeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHLEEEEEELeellll


DSSP  ......................llLLHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEEl
Query ......................psEDVNKVLSAISNfFDFEKXNTRKEG.IIDILVLEAr   47
ident                                  |     |                    
Sbjct ddrgltelqldydlvmltmflgkeRTKQEWEKLIYD.AGFSSYKITPISgFKSLIEVYP.  358
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllEEHHHHHHHHHH.LLLLEEEEEEELlLEEEEEEEL.


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeell
Query tlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyq  107
ident                                                             
Sbjct ............................................................  358
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhllleelleellllllll
Query npkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                           
Sbjct ..........................  358
DSSP  ..........................


No 43: 1VHSA  MOLECULE: SIMILAR TO PHOSPHINOTHRICIN ACETYLTRANSFERASE;             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sltlrlaehrdleavvaiynstiasrxvtadtepvtpedrxewfsghtesrplyvaeden   60
DSSP  lleeeellhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhllllllleeeeelll


DSSP  ......................................................LLEEEE
Query ......................................................DKVXVV    6
ident                                                          |  
Sbjct gnvaawisfetfygrpaynktaevsiyideacrgkgvgsyllqealriapnlgiRSLXAF  120
DSSP  lleeeeeeeeellllhhhlleeeeeeeelhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLEEEEE


DSSP  EEElllllHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEEL......LEEEEEEEELLHhhhhhhhhhhh
Query AEVrpsedVNKVLSAISNfFDFEKXNTRKEG......IIDILVLEARTLksllkfhrvlr   60
ident             |        |                 |   |                
Sbjct IFG....hNKPSLKLFEK.HGFAEWGLFPGIaexdgkRYDLKILGRELS...........  164
DSSP  EEL....lLHHHHHHHHH.LLLEEEEEEEEEeeelleEEEEEEEEEELL...........


DSSP  hlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllle
Query nerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapkt  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................  164
DSSP  ............................................................


DSSP  elleellllllll
Query ahgvplwdnpvpp  133
ident              
Sbjct ............e  165
DSSP  ............l


No 44: 1R6VA  MOLECULE: SUBTILISIN-LIKE SERINE PROTEASE;                           

DSSP  .............................lLEEEEEEElllLLHHHhHHHHHLLLLLLeE
Query .............................dKVXVVAEVrpsEDVNKvLSAISNFFDFEkX   31
ident                                           |       |         
Sbjct skakdlaslpeiksqgyhilfgelrdgeytEGKILVGY...NDRSE.VDKIVKAVNGKvV   56
DSSP  llllllllllllllllllllllllllllllLLEEEEEE...LLHHH.HHHHHHHHLLEeE


DSSP  EEEEEllEEEEEEEELLHHhhHHHHhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhh
Query NTRKEgiIDILVLEARTLKslLKFHrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaa   91
ident        |                                                    
Sbjct LELPQ..IKVVSIKLNGMTvkQAYD..................................k   80
DSSP  EEEHH..HLEEEEELLLLLhhHHHH..................................h


DSSP  lLLLL...llLEEEE.............................................
Query vGVLS...fvAIKFY.............................................  103
ident    |                                                        
Sbjct iKALAlkgirYVEPSykrelikptvvkpnpdmykirkpglnstardygeelsnelwglea  140
DSSP  hLLLLllleeEEELLllleellleellllllllllllllllllllllllllhhhlhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  103
ident                                                             
Sbjct igvtqqlweeasgtniivavvdtgvdgthpdlegqviagyrpafdeelpagtdssyggsa  200
DSSP  llllhhhhhhlllllleeeeeelllllllhhhlllllleeehhhleeelllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  103
ident                                                             
Sbjct gthvagtiaakkdgkgivgvapgakimpivifddpalvggngyvgddyvaagiiwatdhg  260
DSSP  hhhhhhhhhllllllllllllllleeeeeellllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  103
ident                                                             
Sbjct akvmnhswggwgysytmkeafdyamehgvvmvvsagnntsdshhqypagypgviqvaald  320
DSSP  lleeeeleelllllhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllllllllllllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  103
ident                                                             
Sbjct yyggtfrvagfssrsdgvsvgapgvtilstvpgedsigyeghnenvpatnggtydyyqgt  380
DSSP  eelleeeellllllllleeeeeellleeeellllllllllllllllllllllleeeeelh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  103
ident                                                             
Sbjct smaaphvtgvvavllqkfpnakpwqirkllentafdfngngwdhdtgyglvkldaalqgp  440
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  103
ident                                                             
Sbjct lptqggveefqvvvtdakgnfgvptvfvsmmrdngscyyaktgpdgiarfphidsgtydi  500
DSSP  llllleeeeeeeeeelllllllllleeeeeelllllleeeellllleeeeeeeeleeeee


DSSP  .........eelllhhhhhHHHL.....................................
Query .........ieyqnpkeivDWLA.....................................  117
ident                                                             
Sbjct fvggpdhwdralapydgesIPGGyaialrmaeerqasfvgfgvspdatqlnvnfnstlqv  560
DSSP  eeeeellllllllllllllLLLLllllllhhhlleeeeeeeeellllleeeeelllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  117
ident                                                             
Sbjct kfstnlstlkdpqfvvvdpllrgvygrvayarnqtydlsllsgqisfgiqtllpaatdit  620
DSSP  eelllllllllleeeeelllllleeeeeellllleeelllleeeeeeeeellllllllee


DSSP  ..........................lleELLEE.........llllllll
Query ..........................pktAHGVP.........lwdnpvpp  133
ident                                |                   
Sbjct iqgtvtlngedipvygvlkagttwtiiddFGGLNlgtdsqpiyvwwtifgq  671
DSSP  eeeeeeelleeeeeeeeellllleeeellLLLLLllllllllllleeeell


No 45: 2FY1A  MOLECULE: RNA-BINDING MOTIF PROTEIN, Y CHROMOSOME, FAMILY            

DSSP  .....LLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEE...LLEEEEEEEELLHHH
Query .....DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKE...GIIDILVLEARTLKS   51
ident                                         |                   
Sbjct mveadHPGKLFIGgLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDrtsKSRGFAFITFENPAD   60
DSSP  lllllLLLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLlllLLLLEEEEELLLHHH


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEE.....eel
Query llkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFY.....iey  106
ident                                    |                        
Sbjct .........................aknaakdmNGKSL....hgkaiKVEQAkkpsfqsg   91
DSSP  .........................hhhhhhhlLLLLL....lllllEEEELllllllll


DSSP  LLHHHhhhhhllleelleellllllll
Query QNPKEivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                            
Sbjct GRRRP..........passrnrspsgs  108
DSSP  LLLLL..........llllllllllll


No 46: 2FL4A  MOLECULE: SPERMINE/SPERMIDINE ACETYLTRANSFERASE;                     

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gmeihfekvtsdnrkavenlqvfaeqqafiesmaenlkesdqfpewesagiydgnqligy   60
DSSP  lllllllllllllhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeelleeeee


DSSP  ...........................................LLEEEEEEELLLL..LH
Query ...........................................DKVXVVAEVRPSE..DV   15
ident                                                    |        
Sbjct amygrwqdgrvwldrflidqrfqgqgygkaacrllmlkliekyQTNKLYLSVYDTNssAI  120
DSSP  eeeeellllleeeeeeeelhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLEEEEEELLLLhhHH


DSSP  HHHHHHHhlllllleeEEEEE.LLEEEEEEEELlhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhh
Query NKVLSAIsnffdfekxNTRKE.GIIDILVLEARtlksllkfhrvlrnerildsarkylxk   74
ident                 |                                           
Sbjct RLYQQLG......fvfNGELDtNGERVMEWTHQ...........................  147
DSSP  HHHHHLL......leeEEEELlLLLEEEEEELL...........................


DSSP  llllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query giegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                            
Sbjct ...........................................................  147
DSSP  ...........................................................


No 47: 2F9DA  MOLECULE: PRE-MRNA BRANCH SITE PROTEIN P14;                          

DSSP  .....lLEEEEE..EELLlLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELL.EEEEEEEELLHHHH
Query .....dKVXVVA..EVRPsEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEGI.IDILVLEARTLKSL   52
ident                                                             
Sbjct rlppevNRILYIrnLPYK.ITAEEMYDIFGKYGPIRQIRVGNTPEtRGTAYVVYEDIFDA   59
DSSP  llllllLLEEEEelLLLL.LLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLlLLEEEEEELLHHHH


DSSP  HHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHhhhlllllllLEEEE.........
Query LKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQaaavgvlsfvAIKFY.........  103
ident                                                   |         
Sbjct KN........................acdhlSGFNV......cnryLVVLYynanrafqk   89
DSSP  HH........................hhhhhLLLEE......lleeLEEEEllhhhhlll


DSSP  ...............eelLLHHhhhhhhllleelleellllllll
Query ...............ieyQNPKeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                    |                         
Sbjct mdtkkkeeqlkllkekygINTD....................ppk  114
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhlLLLL....................lll


No 48: 2D9OA  MOLECULE: DNAJ (HSP40) HOMOLOG, SUBFAMILY C, MEMBER 17;              

DSSP  ........LLEEEEEEEL.......LLLLH.HHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELlEEEEEE
Query ........DKVXVVAEVR.......PSEDV.NKVLSAISNFFDFEKXNTRKEGiIDILVL   44
ident                                   |                       | 
Sbjct gssgssgqGTPKLKLKWKckkedesKGGYSkDVLLRLLQKYGEVLNLVLSSKK.PGTAVV   59
DSSP  llllllllLLLEEEEELLlllllllLLLLLhHHHHHHHHLLLLEEEEEEELLL.LLEEEE


DSSP  EELLHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHhhlllllllLEEE.E
Query EARTLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKF.Y  103
ident |  | |                                                 |    
Sbjct EFATVKA...........................aelavQNEVGL....vdnplKISWlE   88
DSSP  EELLHHH...........................hhhhhHLLLLL....lllllEEELlL


DSSP  EELllhhhhhhhHLLLEELleellllllll
Query IEYqnpkeivdwLAPKTAHgvplwdnpvpp  133
ident                               
Sbjct GQP.........QDASGPS.........sg  100
DSSP  LLL.........LLLLLLL.........ll


No 49: 2CJKA  MOLECULE: 5'-R(*UP*AP*UP*AP*UP*AP*UP*AP)-3';                         

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kesckmfigglnwdttednlreyfgkygtvtdlkimkdpatgrsrgfgflsfekpssvde   60
DSSP  lhhheeeellllllllhhhhhhhhllllleeeeellllllllllllleeeeelllhhhhh


DSSP  .........................LLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEE
Query .........................DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTR   34
ident                                     |           |           
Sbjct vvktqhildgkvidpkraiprdeqdKTGKIFVGgIGPDVRPKEFEEFFSQWGTIIDAQLM  120
DSSP  hhhllleelleellleelllhhhhhHLEEEEEEeELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEELL


DSSP  E..ELLEE..EEEEEELLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeEEELHHHh
Query K..EGIID..ILVLEARTLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiaFXIHKQAa   90
ident                                                       |     
Sbjct LdkDTGQSrgFGFVTYDSADAVDR........................vcqnKFIDFKD.  155
DSSP  LllLLLLLleEEEEEELLHHHHHH........................hhhlLEELLLL.


DSSP  hlllllllLEEEEeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query avgvlsfvAIKFYieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                            
Sbjct ......rkIEIKR.........................aeprh  167
DSSP  ......llEEEEE.........................lllll


No 50: 1SJRA  MOLECULE: POLYPYRIMIDINE TRACT-BINDING PROTEIN 1;                    

DSSP  ...LLEEEEEE...elLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELLEEEEEEEELLHHHHHH
Query ...DKVXVVAE...vrPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEGIIDILVLEARTLKSLLK   54
ident                             | |    |  |          |      |   
Sbjct magQSPVLRIIvenlfYPVTLDVLHQIFSKFGTVLKIITFTKNNQFQALLQYADPVSAQH   60
DSSP  lllLLLEEEEEellllLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEELLHHHHHH


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHhhlllllllLEEEEeelllhhhhhh
Query fhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKFYieyqnpkeivd  114
ident                                                             
Sbjct ........................aklslDGQNIY....nacctLRIDF...skltslnv   89
DSSP  ........................hhhhlLLLLLL....lllllEEEEE...llllllll


DSSP  hhllleelleellllllll
Query wlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                    
Sbjct kynndksrdytrpdlpsgd  108
DSSP  lllllleeellllllllll


No 51: 1JSXA  MOLECULE: GLUCOSE-INHIBITED DIVISION PROTEIN B;                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mlnklslllkdagisltdhqknqliayvnmlhkwnemlvrhildsivvapylqgerfidv   60
DSSP  lhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gtgpglpgiplsivrpeahftlldslgkrvrflrqvqhelkleniepvqsrveefpsepp  120
DSSP  lllllllhhhhhhhlllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllllll


DSSP  ........................LLEEEEEEELLlllHHHHHHHHhlLLLLLeEEEEEE
Query ........................DKVXVVAEVRPsedVNKVLSAIsnFFDFEkXNTRKE   36
ident                               |                           | 
Sbjct fdgvisrafaslndmvswchhlpgEQGRFYALKGQ..mPEDEIALL..PEEYQvESVVKL  176
DSSP  eeeeellllllhhhhhhhhllleeEEEEEEEEELL..lLHHHHHLL..LLLEEeEEEEEE


DSSP  L....LEEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhl
Query G....IIDILVLEARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaav   92
ident           |  |                                              
Sbjct QvpdgERHLVVIKANKI...........................................  193
DSSP  EllllEEEEEEEEELLL...........................................


DSSP  llllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query gvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                          
Sbjct .........................................  193
DSSP  .........................................


No 52: 1DBDA  MOLECULE: REGULATORY PROTEIN E2;                                     

DSSP  ..............LLEEEEEEELllLLHHHHHH..hhhlllLLLEEE.EEEE.......
Query ..............DKVXVVAEVRpsEDVNKVLS..aisnffDFEKXN.TRKE.......   36
ident                             |               |    |          
Sbjct rrttndgfhllkagGSCFALISGT.aNQVKCYRFrvkknhrhRYENCTtTWFTvadngae   59
DSSP  llllllllllllllLLEEEEEEEL.hHHHHHHHHhhhhhhhhHLLEELlLLLLlllllll


DSSP  .LLEEEEEEEELLHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhHHLLll
Query .GIIDILVLEARTLKSLLKFHRVlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaAAVGvl   95
ident                    |                                     |  
Sbjct rQGQAQILITFGSPSQRQDFLKH.............................vpLPPG..   88
DSSP  lLLLEEEEEEELLHHHHHLHHHH.............................llLLLL..


DSSP  lllLEEEEEELLLhhhhhhhhllleelleellllllll
Query sfvAIKFYIEYQNpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident     |                                 
Sbjct ..mNISGFTASLD........................f  100
DSSP  ..lLEEEEEEEEL........................l


No 53: 2QECA  MOLECULE: HISTONE ACETYLTRANSFERASE HPA2 AND RELATED                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xsptvlpatqadfpkivdvlveafandptflrwipqpdpgsaklralfelqiekqyavag   60
DSSP  llleeeellhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhe


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nidvardsegeivgvalwdrpdprlvsifgkaaarfhpkfphwylytvatsssargtgvg  120
DSSP  eeeeeellllleeeeeeeelllllhhhhhllllllllllllleeeeeeeelhhhllllhh


DSSP  .............LLEEEEEEelllllHHHHHHHHHLlLLLLEEEEEEE..LLEEEEEEE
Query .............DKVXVVAEvrpsedVNKVLSAISNfFDFEKXNTRKE..GIIDILVLE   45
ident                    |                    |               |   
Sbjct sallnhgiaragdEAIYLEAT......STRAAQLYNR.LGFVPLGYIPSddDGTPELAXW  173
DSSP  hhhhhhhhhhhllLLEEEEEL......LHHHHHHHHH.LLLEEEEEELLllLLLLEEEEE


DSSP  ELLhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeee
Query ARTlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyie  105
ident                                                             
Sbjct KPP.........................................................  176
DSSP  ELL.........................................................


DSSP  lLLHHhhhhhhllleelleellllllll
Query yQNPKeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                             
Sbjct aXPTV.......................  181
DSSP  lLLLL.......................


No 54: 2DGXA  MOLECULE: KIAA0430 PROTEIN;                                          

DSSP  .......LLEEEEEE.ELLLL....LHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELL.EEEEEEEEL
Query .......DKVXVVAE.VRPSE....DVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEGI.IDILVLEAR   47
ident            |                    |                      |    
Sbjct gssgssgNGADVQVSnIDYRLsrkeLQQLLQEAFARHGKVKSVELSPHTDyQLKAVVQME   60
DSSP  lllllllLLEEEEEElLLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLLLLlLLLEEEEEL


DSSP  LHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEeelL
Query TLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYieyQ  107
ident  |                                                          
Sbjct NLQDAIG.........................avnslHRYK....igskkiLVSLAtgaS   91
DSSP  LHHHHHH.........................hhhhhLLEE....elleeeEEEELlllL


DSSP  LHHHhhhhhllleelleellllllll
Query NPKEivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident  |                        
Sbjct GPSS.....................g   96
DSSP  LLLL.....................l


No 55: 1TLJA  MOLECULE: HYPOTHETICAL UPF0130 PROTEIN SSO0622;                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lvweelrekalnkiyhdkeigyldpdilgfllafyrnrndvytqsscsgritivdaempw   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeeeeellll


DSSP  ....................................LLEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHL
Query ....................................DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISN   24
ident                                                 |     |     
Sbjct drknstiifknhlriteqdledvlsknqvrrlwlivQGPIIHIYAKNiETGWDILKIARE  120
DSSP  llllleeeeeelllllhhhhhhhhhllllleeeeeeELLEEEEEELLhHHHHHHHHHHHH


DSSP  LLLLLEEEEEEELLEEEEEEEELL.................................HHH
Query FFDFEKXNTRKEGIIDILVLEART.................................LKS   51
ident                    |                                        
Sbjct AGFKHSGILATNQKGVLVELRTGIrmvhllresntervdkdkiktlvnvcnevlargKQK  180
DSSP  HLLLLLEEEEEELLEEEEEELLLLeeeeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHH


DSSP  HHHHHHhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhh
Query LLKFHRvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpke  111
ident                                                             
Sbjct MNLLKD......................................................  186
DSSP  HHHHHH......................................................


DSSP  hhhhhllleelleellllllll
Query ivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                       
Sbjct ...................lls  189
DSSP  ...................hhl


No 56: 1P1TA  MOLECULE: CLEAVAGE STIMULATION FACTOR, 64 KDA SUBUNIT;               

DSSP  ......lLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEE....LLEEEEEEEELLH
Query ......dKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKE....GIIDILVLEARTL   49
ident           |                  |                         |    
Sbjct dpavdrsLRSVFVGnIPYEATEEQLKDIFSEVGPVVSFRLVYDretgKPKGYGFCEYQDQ   60
DSSP  llllhhhHLLEEEElLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEllllEEEEEEEEELLLH


DSSP  HHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEelllh
Query KSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIeyqnp  109
ident                                                             
Sbjct ET.........................alsamrnlNGREF....sgralRVDNAA.....   86
DSSP  HH.........................hhhhhhhlLLLLL....lllllEEEELL.....


DSSP  hhhhhhhllleelleellllllll
Query keivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                         
Sbjct ......seknkeelkslgtgapvi  104
DSSP  ......lllhhhhhhhhlllllll


No 57: 2UUUA  MOLECULE: ALKYLDIHYDROXYACETONEPHOSPHATE SYNTHASE;                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mgspkehidlyqqikwngwgdtrkflhqlkpsgtiamttpevssvplpslrgfikkeltk   60
DSSP  lllllllllhhhhllllllllllleeeelllllleeeelllllleelllhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pfvldetpalqienihvdppkqypefvrelkafflpdqlkddklarithtfgkslrdlir  120
DSSP  lllllllllllhhhlllllllllhhhhhhhhllllhhheellhhhhhhllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vrigqvknapdlivlphsheeverlvqlahkynvviipmgggsnivgaiepvsnerftvs  180
DSSP  hhllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllllllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct idmrrmnkvlwvdrremtaciqvgimgpelekqlhkqgvslghdpdsfefstlggwlatc  240
DSSP  eelllllleeeeelllleeeeellllhhhhhhhhhhlleelllllllhhhllhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ssghqsdkygdiedmavsfrtvtptgtlelrginykhiilgsegtlgiiteavmkvhavp  300
DSSP  lllllhhhhllhhhheeeeeeeelleeelllllllhhhhlllllllleeeeeeeeleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qaveyygflfptfahavsalqqirsseviptmirvydpeetqlsfawkpskgavseftsa  360
DSSP  leeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhhhhhhhlllllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mvkkylhyirsfdfknvclsiigfegpkkvvdfhrtsvfdilsknaafglgsapgktwae  420
DSSP  hhhhhhhhllllllllleeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllhhhh


DSSP  .................LLEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHLLLL..........lLEEEE
Query .................DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISNFFD..........fEKXNT   33
ident                          |                |                 
Sbjct krydlpyirdflldhnmWVDVAETTVSY.ANLQTLWKDAKQTFVkhfkdqgipawICAHI  479
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleEEEEEEEEEEH.HHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllleeEEEEE


DSSP  E.EELLEEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhl
Query R.KEGIIDILVLEARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaav   92
ident          |                                                  
Sbjct ShTYTNGVCLYFIFASK...........................................  496
DSSP  EeEELLEEEEEEEEEEE...........................................


DSSP  llllllleeeeeelLLHHHH........................hhhhllleelleelll
Query gvlsfvaikfyieyQNPKEI........................vdwlapktahgvplwd  128
ident                                                             
Sbjct ...........qneNKDMAQyieakklmtdiifkyggslsrgwinvyrslketidpkdic  545
DSSP  ...........lllLLLLHHhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  lllll
Query npvpp  133
ident      
Sbjct nprkl  550
DSSP  lllll


No 58: 2FTRA  MOLECULE: BH0200;                                                    

DSSP  ..LLEEEEEE.......elLLLLHH.HHHHHHHLllLLLEEEEEEEL........lEEEE
Query ..DKVXVVAE.......vrPSEDVN.KVLSAISNffDFEKXNTRKEG........iIDIL   42
ident     |   |            |                  |                   
Sbjct enXXVKLIALyeqpedkqaFDEHYFnTHAPLTRKipGLRDXKVTRIVgspxgeskfYLXC   60
DSSP  llEEEEEEEEeellllhhhHHHHHHhLHHHHHLLllLLLEEEEEEEEellllllleEEEE


DSSP  EEEELLHHH.HHHHHHHhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhHHHHL.llllllLE
Query VLEARTLKS.LLKFHRVlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkQAAAV.gvlsfvAI  100
ident         |                                        |          
Sbjct EXYYDDHESlQQAXRTD........................egkasGKDAXkfagkllTL   96
DSSP  EEEELLHHHhHHHHHLH........................hhhhhHHHHHhhlhhheEE


DSSP  EEEEELLlhhhhhhhhllleelleellllllll
Query KFYIEYQnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident     |                            
Sbjct XIGEEXD..........................  103
DSSP  EEEEEEL..........................


No 59: 2CQPA  MOLECULE: RNA-BINDING PROTEIN 12;                                    

DSSP  ..............lLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLlLLLL..EEEEEEE..LLEE.E
Query ..............dKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNfFDFE..KXNTRKE..GIID.I   41
ident                    |            |                     |     
Sbjct gssgssgassgkpgpTIIKVQNMPFTVSIDEILDFFYG.YQVIpgSVCLKYNekGMPTgE   59
DSSP  lllllllllllllllEEEEEELLLLLLLHHHHHHHLLL.LLLLllLLEEEELllLLEEeE


DSSP  EEEEELLHHHHHHHhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllLEE
Query LVLEARTLKSLLKFhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIK  101
ident                                                             
Sbjct AMVAFESRDEATAA.........................vidlNDRP.....igsrkVKL   89
DSSP  EEEEELLHHHHHHH.........................hhhlLLLE.....elleeLEE


DSSP  EEEELLLHHhhhhhhllleelleellllllll
Query FYIEYQNPKeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                 
Sbjct VLGSGPSSG.......................   98
DSSP  EELLLLLLL.......................


No 60: 1Z1ZA  MOLECULE: MINOR TAIL PROTEIN U;                                      

DSSP  ..........................................................LL
Query ..........................................................DK    2
ident                                                             
Sbjct khtelraavldalekhdtgatffdgrpavfdeadfpavavyltgaeytgeeldsdtwqAE   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllleellllllllhhhlleeeeeellllllllllllllllLE


DSSP  EEEEEEELLLL...LHHHHHHH.HHLLL.............llLEEEEEEE...LLEEEE
Query VXVVAEVRPSE...DVNKVLSA.ISNFF.............dfEKXNTRKE...GIIDIL   42
ident                        |                        |     |     
Sbjct LHIEVFLPAQVpdsELDAWMESrIYPVMsdipalsdlitsmvaSGYDYRRDddaGLWSSA  120
DSSP  EEEEEEELLLLlhhHHHHHHHHhHHHHHhhlhhhhhhllllllLLEEEELLlllLLLEEE


DSSP  EEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleee
Query VLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikf  102
ident  |                                                          
Sbjct DLTYVITY....................................................  128
DSSP  EEEEELLL....................................................


DSSP  eeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query yieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                
Sbjct ..............................e  129
DSSP  ..............................l


No 61: 1NH7A  MOLECULE: ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE;                             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mlrvavpnkgalsepateilaeagyrrrtdskdltvidpvnnveffflrpkdiaiyvgsg   60
DSSP  leeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllllleeeelllleeeeeelhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eldfgitgrdlvcdsgaqvrerlalgfgsssfryaapagrnwttadlagmriataypnlv  120
DSSP  llleeeeehhhhhhhlllleeeeelllllleeeeeeellllllhhhhllleeeellhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rkdlatkgieatvirldgaveisvqlgvadaiadvvgsgrtlsqhdlvafgeplcdseav  180
DSSP  hhhhhhhlllleeeellllhhhhhhhlllleeeeeelllhhhhllleeeeeeeeeellee


DSSP  .....................lLEEEEEEELllLLHHHHHHHHhllllLLEEEEEEELL.
Query .....................dKVXVVAEVRpsEDVNKVLSAIsnffdFEKXNTRKEGI.   38
ident                                      |                      
Sbjct liereardqlvarvqgvvfgqqYLMLDYDCP.rSALKKATAIT....pGLSPTIAPLADp  235
DSSP  eeellhhhhhhhhhhhhhhhhhEEEEEEEEE.lLLHHHHHHHL....lLLLLEEEELLLl


DSSP  .EEEEEEEellhhHHHHHhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhllllll
Query .IDILVLEartlkSLLKFhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsf   97
ident                                                    |        
Sbjct dWVAIRAL....vPRRDV.........................ngimDELAA.....iga  261
DSSP  lEEEEEEE....eEHHHH.........................hhhhHHHHH.....lll


DSSP  lLEEEEEELLlhhhhhhhhllleelleellllllll
Query vAIKFYIEYQnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident  ||                                 
Sbjct kAILASDIRF.......................crf  274
DSSP  eEEEEELLLL.......................lll


No 62: 1JVAA  MOLECULE: VMA1-DERIVED HOMING ENDONUCLEASE X10SSS;                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vgsfakgtnvlmadgsiecienievgnkvmgkdgrpreviklprgretmysvvqksevpe   60
DSSP  llleellleeellllleeehhhllllleeellllleeellllleeeeeeeeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct llkftcnatnelvvrtprsvrrlsrtikgveyfevitfemgqkkapdgrivelvkevsks  120
DSSP  lleeeeellleeeeeeelleeeeeeeelleeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ypisegperanelvesyrkasnkayfewtieardlsllgshvrkatyqtyapilyendhf  180
DSSP  eehhhllhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeehhhhhhllhhhhhhlleeellllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fdymqkskfhltiegpkvlayllglwigdglsdratfsvdsrdtslmervteyaeklnlc  240
DSSP  hhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aeykdrkepqvaktvnlyskvenplwdaivglgflkdgvknipsflstdnigtretflag  300
DSSP  eellllllllleeeeeeelllllhhhhhhhhllleelleelllhhhhhllhhhhhhhhhh


DSSP  ............LLEEEEEEELllLLHHHHHHHHHLLLLLlEEEEEEElLEEEEEEEELL
Query ............DKVXVVAEVRpsEDVNKVLSAISNFFDFeKXNTRKEgIIDILVLEART   48
ident                                |                  |         
Sbjct lidsdgyvtdehGIKATIKTIH.tSVRDGLVSLARSLGLV.VSVNAEP.KISYAIYMSGG  357
DSSP  hhhhheeeelllLLEEEEEELL.hHHHHHHHHHHHHHLLE.EEEEEEL.LLEEEEEEELL


DSSP  HHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhHHHLllllEEEEeelhhhhhlllllllleeeeeelll
Query LKSLLkfhrvlrnerildsarkyLXKGiegnTIAFxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqn  108
ident    |                      |       |                         
Sbjct DVLLN...............vlsKCAG....SKKF.........................  373
DSSP  HHHHH...............hhlLLLL....LLLL.........................


DSSP  hhhhhhhhllleelleelllLLLL....................................
Query pkeivdwlapktahgvplwdNPVP....................................  132
ident                                                             
Sbjct ................rpapAAAFarecrgfyfelqelkeddyygitlsddsdhqfllan  417
DSSP  ................llllLLLLlllleeeleeeeeeeeeeeelllllllllleeelll


DSSP  .........l
Query .........p  133
ident           
Sbjct qvvvhssger  427
DSSP  lleeelllll


No 63: 2OD6A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  ....LLEEEEEEELLL......lLHHH......hhhhhhlllLLLEEEEEEEL.....LE
Query ....DKVXVVAEVRPS......eDVNK......vlsaisnffDFEKXNTRKEG.....II   39
ident      |                                       |              
Sbjct gxaePKFTSFTTADFIndvdxelFIDAvektapvwvkexksrGLLKFSXNRVWnkgevFR   60
DSSP  llllLLEEEEEEEEELlhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhllLEEEEEEEEELlllllEE


DSSP  EEEEEEELLHHH.HHHHHHHHHH.LLLHhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhllllll
Query DILVLEARTLKS.LLKFHRVLRN.ERILdsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsf   97
ident      |     |                                                
Sbjct VVXTYEYKDRASfEANIAYLEDTfGKNP......................vflqlvttak   98
DSSP  EEEEEEELLHHHhHHHHHHHHHHlLLLL......................lhhhhlllle


DSSP  lLEEEEEELLlhhhhhhhhllleelleellllllll
Query vAIKFYIEYQnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                     
Sbjct fTTSRCLVVX........................ev  110
DSSP  eEEEEEEEEE........................el


No 64: 2HGJW  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  ...................LLEEEEEEELllLLHH.HHHHHHHL..LLLLLEEEEEEEL.
Query ...................DKVXVVAEVRpsEDVN.KVLSAISN..FFDFEKXNTRKEG.   37
ident                            |            |          | ||     
Sbjct taydvilapvlsekayagfAEGKYTFWVH.pKATKtEIKNAVETafKVKVVKVNTLHVRg   59
DSSP  lllllleeelllhhhhhhhHHLEEEEEEL.lLLLHhHHHHHHHHhhLLLLEEEEEEEEEl


DSSP  .............LEEEEEEEEllHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhlllllEEEEe
Query .............IIDILVLEArtLKSLlkfhrvlrnerildsarkylxkgiegnTIAFx   84
ident                                                             
Sbjct kkkrlgrylgkrpDRKKAIVQV.aPGQK..........................iEALE.   91
DSSP  lleeelleeelllEEEEEEEEL.lLLLL..........................lHHHH.


DSSP  elhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query ihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                  
Sbjct ..............................................gli   94
DSSP  ..............................................hhl


No 65: 1XQIA  MOLECULE: NUCLEOSIDE DIPHOSPHATE KINASE;                             

DSSP  LLEEEEEEELLLL....LHHHHHHHHHLLLLLleEEEEEEL...................
Query DKVXVVAEVRPSE....DVNKVLSAISNFFDFekXNTRKEG...................   37
ident           |       |    |                                    
Sbjct PVEKTLLILKPDAvargLVDEIISRFKKAGLK.iVALKXVKaspeeierfypsseewlqs   59
DSSP  LLLEEEEEELHHHhhllLHHHHHHHHHHHLLE.eEEEEEELllhhhhhhhllllhhhhhh


DSSP  ...........................................LEEEEEEEELLhhhhhh
Query ...........................................IIDILVLEARTlksllk   54
ident                                                 ||          
Sbjct agqkllkayqelgidprakigtddpvevgriikrnlvkyxtsgPNVVXVLKGNR......  113
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllLEEEEEEELLL......


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELH..........hHHHL....llllllle
Query fhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHK..........qAAAV....gvlsfvai  100
ident                                                             
Sbjct ........................aveivRKLVgptsphsappgTIRGdysidspdlaae  149
DSSP  ........................hhhhhHHHHllllhhhllllLHHHhhllllhhhhhh


DSSP  eeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query kfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                  
Sbjct egrvvfnlvhasdspseaereirfwfreeevle  182
DSSP  lllllllleeelllhhhhhhhhhhhllhhhlll


No 66: 1JMTA  MOLECULE: SPLICING FACTOR U2AF 35 KDA SUBUNIT;                       

DSSP  lLEEEEE..EELLLL..................LHHHHHHHHH.LLLLLLEEEEEEEL..
Query dKVXVVA..EVRPSE..................DVNKVLSAIS.NFFDFEKXNTRKEG..   37
ident            |                         |           |  |       
Sbjct .SQTIALlnIYRNPQdglrsavsdvemqehydeFFEEVFTEMEeKYGEVEEMNVCDNLgd   59
DSSP  .LLEEEEeeEEELLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHhHLLLEEEEEELLLLll


DSSP  .LEEEEEEEELLHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHhhhlllll
Query .IIDILVLEARTLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQaaavgvls   96
ident           |                                                 
Sbjct hLVGNVYVKFRREED........................aekavidlNNRWF......ng   89
DSSP  lLEEEEEEEELLHHH........................hhhhhhhhLLLEE......ll


DSSP  llLEEEEEElllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query fvAIKFYIEyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                      
Sbjct qpIHAELSP............................   98
DSSP  eeLLEEELL............................


No 67: 2PJDA  MOLECULE: RIBOSOMAL RNA SMALL SUBUNIT METHYLTRANSFERASE C;           

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aftpasevllrhsddfeqsrilfagdlqddlparldtaasrahtqqfhhwqvlsrqxgdn   60
DSSP  lllhhhhhhhllhhhhllleeeeeelllllhhhhlllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................................lLEEEEEEELLLLLHHHHH
Query .........................................dKVXVVAEVRPSEDVNKVL   19
ident                                                        |    
Sbjct arfslvataddvadcdtliyywpknkpeaqfqlxnllsllpvGTDIFVVGENRSGVRSAE  120
DSSP  eeelllllhhhhlllleeeeellllhhhhhhhhhhhhlllllLLEEEEEEEHHHLHHHHH


DSSP  HHHHlllLLLEEEEEEELL.EEEEEEEELLhhHHHHhhhHHHHLLL..............
Query SAISnffDFEKXNTRKEGI.IDILVLEARTlkSLLKfhrVLRNERI..............   64
ident        |    |                                               
Sbjct QXLA...DYAPLNKVDSARrCGLYFGRLEK..QPVF...DAEKFWGeysvdgltvktlpg  172
DSSP  HHHL...LLLLLEEELLLLlEEEEEEELLL..LLLL...LHHHHLEeeeelleeeeelll


DSSP  .....hhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllL
Query .....ldsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapK  119
ident                                                             
Sbjct vfsrdgldvgsqlllstltphtkgkvldvgcgagvlsvafarhspkirltlcdvsapavE  232
DSSP  llllllllhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhlllllleeeellhhhhH


DSSP  EELLE.......................................................
Query TAHGV.......................................................  124
ident                                                             
Sbjct ASRATlaangvegevfasnvfsevkgrfdxiisnppfhdgmqtsldaaqtlirgavrhln  292
DSSP  HHHHHhhhllllleeeelllllllllleeeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhee


DSSP  .................................ellllllll
Query .................................plwdnpvpp  133
ident                                           
Sbjct sggelrivanaflpypdvldetfgfheviaqtgrfkvyraix  334
DSSP  eeeeeeeeeellllhhhhhhhhhllleeeeellleeeeeeel


No 68: 2JNAA  MOLECULE: PUTATIVE SECRETED PROTEIN;                                 

DSSP  ....................................lLEEEEEEELLLL.....LHHHHH
Query ....................................dKVXVVAEVRPSE.....DVNKVL   19
ident                                                       |    |
Sbjct mkkriiaaallatvasfstlaaeqvskqeishfklvkVGTINVSQSGGQisspsDLREKL   60
DSSP  llllllllllllllllllllllllllhhhhhhhlleeEEEEEEEEELLLlllhhHHHHHH


DSSP  HHHHLLL...LLLEEEEEEELLEEEEEEEEllhhhhhhhHHHHhhLLLHhhhhhhhhhll
Query SAISNFF...DFEKXNTRKEGIIDILVLEArtlksllkfHRVLrnERILdsarkylxkgi   76
ident |                |  |     | |                               
Sbjct SELADAKggkYYHIIAAREHGPNFEAVAEV....yndatKLEH..HHHH...........  103
DSSP  HHHHHHHlllEEEEEEEEEELLEEEEEEEE....eelllLLLL..LLLL...........


DSSP  llleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query egntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                          
Sbjct .........................................................  103
DSSP  .........................................................


No 69: 2E5GA  MOLECULE: U6 SNRNA-SPECIFIC TERMINAL URIDYLYLTRANSFERASE 1;          

DSSP  ......LLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEELlEEEEEEEELLHHHHH
Query ......DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEGiIDILVLEARTLKSLL   53
ident           |         |          |         |         |        
Sbjct gssgssGLRSVFVSgFPRGVDSAQLSEYFLAFGPVASVVMDKDK.GVFAIVEMGDVGARE   59
DSSP  llllllLLLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLLL.LLEEEEEELLHHHHH


DSSP  HHhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEeelllhhhhh
Query KFhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYieyqnpkeiv  113
ident                                                             
Sbjct AV........................lsqsqHSLG......ghrlRVRPR.........e   80
DSSP  HH........................hllllLEEL......leelLLLLL.........l


DSSP  hhhllLEELleellllllll
Query dwlapKTAHgvplwdnpvpp  133
ident        |            
Sbjct qkefqSPAS......kspkg   94
DSSP  lllllLLLL......lllll


No 70: 2DNYA  MOLECULE: FUSE-BINDING PROTEIN-INTERACTING REPRESSOR,                

DSSP  .............LLEEEEEE...eLLLL...LHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEL....
Query .............DKVXVVAE...vRPSE...DVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEG....   37
ident                   |                 |      |          |     
Sbjct gssgssgkllrkqESTVMVLRnmvdPKDIdddLEGEVTEECGKFGAVNRVIIYQEKqgee   60
DSSP  lllllllllllllLLLEEEEEllllLLLLlhhHHHHHHHHHLLLLLEEEEEEEEEEllll


DSSP  ....LEEEEEEEELLHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHhhhll
Query ....IIDILVLEARTLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQaaavg   93
ident     ||     |                                                
Sbjct edaeIIVKIFVEFSIASE.........................thkaiqaLNGRW....f   91
DSSP  llllEEEEEEEEELLHHH.........................hhhhhhhHLLLE....e


DSSP  lllllLEEEEEELllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query vlsfvAIKFYIEYqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident          |                              
Sbjct agrkvVAEVYDQE............rfdnsdlsasgpssg  119
DSSP  lleelEEEELLHH............hhlllllllllllll


No 71: 1U7LA  MOLECULE: VACUOLAR ATP SYNTHASE SUBUNIT C;                           

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lytandfilislpqnaqpvtapgsktdswfnetliggrafvsdfkipefkigsldtlive   60
DSSP  llllleeeeeeeellllllllllllhhhhhhhlhhhhlleeeellllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct seelskvdnqigasigkiieilqglnetstnayrtlpinnmpvpeylenfqwqtrkfkld  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ksikdlitlisnessqldadvratyanynsaktnlaaaerkktgdlsvrslhdivkpedf  180
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhl


DSSP  .....LLEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHLL..LLLL.EEEE.EEELLEEEEEEEELLHHh
Query .....DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISNF..FDFE.KXNT.RKEGIIDILVLEARTLKs   51
ident          |   |                                              
Sbjct vlnseHLTTVLVAVPK.SLKSDFEKSYETLskNVVPaSASViAEDAEYVLFNVHLFKKN.  238
DSSP  lllllLEEEEEEEEEH.HHHHHHHHHHHHLllLLLLlLLEEeEELLLEEEEEEEEEHHH.


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHH.....................
Query llkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAA.....................   90
ident                                                             
Sbjct ............................vqefTTAAREKkfiprefnyseelidqlkkeh  270
DSSP  ............................hhhhHHHHHHLlleeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................................................hllllllll
Query ...................................................avgvlsfva   99
ident                                                             
Sbjct dsaasleqslrvqlvrlaktayvdvfinwfhikalrvyvesvlryglpphfnikiiavpp  330
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeell


DSSP  eeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query ikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                   
Sbjct knlskckselidafgflggnafmyepfvmyiinl  364
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeel


No 72: 1QHTA  MOLECULE: PROTEIN (DNA POLYMERASE);                                  

DSSP  .................................LLEEEEEEElllLLHHHhHHHHHLL..
Query .................................DKVXVVAEVrpsEDVNKvLSAISNF..   25
ident                                        |      |             
Sbjct mildtdyitengkpvirvfkkengefkieydrtFEPYFYALL...KDDSA.IEDVKKVta   56
DSSP  leeeeeeeeelleeeeeeeeeelleeeeeeellLLLEEEEEE...LLHHH.HHHHLLLee


DSSP  ......lLLLEEEEEEEL....LEEEEEEEELLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhl
Query ......fDFEKXNTRKEG....IIDILVLEARTLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkg   75
ident                        |    |                               
Sbjct krhgtvvKVKRAEKVQKKflgrPIEVWKLYFNHPQDVPA.....................   95
DSSP  eelleeeELLEEEEEEEEelleEEEEEEEELLLLLHHHH.....................


DSSP  lllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEE....eeLLLH......................
Query iegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFY....ieYQNP......................  109
ident                         |  |                                
Sbjct ....irdriRAHP.......avvDIYEYdipfakRYLIdkglipmegdeeltmlafaiat  144
DSSP  ....hhhhhHLLL.......leeEEELLlllhhhHHHHhllllllllllllleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  109
ident                                                             
Sbjct lyhegeefgtgpilmisyadgsearvitwkkidlpyvdvvstekemikrflrvvrekdpd  204
DSSP  lllllllllllleeeeeeelllleeeeelllllllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................hhhhhhhlLLEELLEELLL.............
Query ............................keivdwlaPKTAHGVPLWD.............  128
ident                                                             
Sbjct vlityngdnfdfaylkkrceelgikftlgrdgsepkIQRMGDRFAVEvkgrihfdlypvi  264
DSSP  eeeellllllhhhhhhhhhhhlllllllllllllleEEEELLEEEEElllleeeehhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct rrtinlptytleavyeavfgkpkekvyaeeiaqawesgeglervarysmedakvtyelgr  324
DSSP  hhhlllllllhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct effpmeaqlsrligqslwdvsrsstgnlvewfllrkaykrnelapnkpderelarrrggy  384
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct aggyvkeperglwdnivyldfrslypsiiithnvspdtlnregckeydvapevghkfckd  444
DSSP  lllllllllllleeeeeeeelllhhhhhhhhllllllllllllllleeelllllleeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct fpgfipsllgdlleerqkikrkmkatvdplekklldyrqraikilansfygyygyakarw  504
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct yckecaesvtawgreyiemvireleekfgfkvlyadtdglhatipgadaetvkkkakefl  564
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct kyinleleyegfyvrgffvtkkkyavideegkittrgleivrrdwseiaketqarvleai  624
DSSP  hhhlllleeeeeeeeeeeeelleeeeelllllleeellllllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  128
ident                                                             
Sbjct lkhgdveeavrivkevtlviheqiatgphvavakrlaargvkirpgtvisyivlkgdrai  684
DSSP  hhhllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhllllllllllllleeelllllee


DSSP  .....................lllll
Query .....................npvpp  133
ident                           
Sbjct padefeyyienqvlpaverilkafgy  710
DSSP  elllllhhhhllhhhhlhhhhhllll


No 73: 2OTJR  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  ...........LLEEEEEE.ELLL....................................
Query ...........DKVXVVAE.VRPS....................................   12
ident                        |                                    
Sbjct gisysveadpdTTAKAMLReRQMSfkhskaiareikgktageavdyleaviegdqpvpfk   60
DSSP  lllllllllhhHEEEEEEEeEELLhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllleell


DSSP  .....................lLHHHHHHHHHLLLL..............LLEEEEEEEL
Query .....................eDVNKVLSAISNFFD..............FEKXNTRKEG   37
ident                          |                               | |
Sbjct qhnsgvghkskvdgwdagrypeKASKAFLDLLENAVgnadhqgfdgeamtIKHVAAHKVG  120
DSSP  llllllllllllllllleellhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllllleEEEEEEEEEE


DSSP  L..................EEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhlllll
Query I..................IDILVLEARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegn   79
ident                         |                                   
Sbjct EqqgrkpramgrasawnspQVDVELILEEP..............................  150
DSSP  EelleeelhhhleeelleeEEEEEEEEELL..............................


DSSP  eeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query tiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                       
Sbjct ......................................................  150
DSSP  ......................................................


No 74: 2OKQA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YBAA;                                 

DSSP  ............LLEEEEEEELLLL..LHHHHHH.....hhhlllllLEEEEE.......
Query ............DKVXVVAEVRPSE..DVNKVLS.....aisnffdfEKXNTR.......   34
ident                  |  |                                       
Sbjct tenlyfqsnamkYVDGFVVAVPADKkdAYREMAAkaaplfkefgalrIVECWAsdvpdgk   60
DSSP  lllhhhhhhlllEEEEEEEEEEHHHhhHHHHHHHhhhhhhhhlllleEEEEEEeelllll


DSSP  .........eELLEEEEEEEELL...hHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhhhhhllllleee
Query .........kEGIIDILVLEART...lKSLLKFHRVLRNErildsarkylxkgiegntia   82
ident           |                                                 
Sbjct vtdfrmavkaEENEEVVFSWIEYpskeVRDAANQKMMSDP....................  100
DSSP  lllhhhhlllLLLEEEEEEEEEEllhhHHHHHHHHHHLLH....................


DSSP  eeelhhHHHLllllllLEEEEEELLLhhhhhhhhllleelleellllllll
Query fxihkqAAAVgvlsfvAIKFYIEYQNpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                    
Sbjct ..rmkeFGESmpfdgkRMIYGGFESI......................ide  127
DSSP  ..hhhhLLLLllllllLLEEEEEEEE......................eel


No 75: 2NUHA  MOLECULE: PERIPLASMIC DIVALENT CATION TOLERANCE PROTEIN;             

DSSP  .LLEEEEEEELllLLHHHHHHHHH.LLLLLleEEEEEE.............LLEEEEEEE
Query .DKVXVVAEVRpsEDVNKVLSAIS.NFFDFekXNTRKE.............GIIDILVLE   45
ident  |                                                      |   
Sbjct sDVYLIFSTCPdlPSAEIISRVLVqERLAA.cVTQLPGavstyrwqgkietTQEIQLLIK   59
DSSP  lLEEEEEEEELlhHHHHHHHHHHHhLLLLL.eEEEEEEeeeeeelllleeeEEEEEEEEE


DSSP  ellHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEE
Query artLKSLlkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIE  105
ident                                            |                
Sbjct .tnAVHV............................naaiTRLCA..lhpyrlpEAIAVQV   88
DSSP  .eeHHHH............................hhhhHHHHH..hllllllLLEEEEL


DSSP  LLLHHHhhhhhllleelleellllllll
Query YQNPKEivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident      |                      
Sbjct SVGLPE............yltwinteid  104
DSSP  LLLLHH............hhhhhhhhhl


No 76: 2JOQA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN HP_0495;                              

DSSP  ................lLEEEEEEELLllLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEE...LLEEE
Query ................dKVXVVAEVRPseDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKE...GIIDI   41
ident                              |               |              
Sbjct qghmpsdskkptiiypcLWDYRVIMTT.kDTSTLKELLETYQRPFKLEFKNTsknAKFYS   59
DSSP  lllllllllllllllleEEEEEEEELL.lLLLHHHHHHHLLLLLEEEEEEEElllLLLEE


DSSP  EEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHhhllllllllee
Query LVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvaik  101
ident                                                             
Sbjct FNVSMEVSN..........................eserneiFQKISQ............   81
DSSP  EEEEEEELL..........................hhhhhhhHHHHLL............


DSSP  eeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query fyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                 
Sbjct ......................ldkvvqtlgs   91
DSSP  ......................llleeeeell


No 77: 2GUMA  MOLECULE: GLYCOPROTEIN B;                                            

DSSP  ...............................LLEEEEEEELLL.................
Query ...............................DKVXVVAEVRPS.................   12
ident                                                             
Sbjct anfyvcppptgatvvqfeqprrcptrpegqnYTEGIAVVFKENiapykfkatmyykdvtv   60
DSSP  lleeelllllllleeeellllllllllllllLLLEEEEEEEELllleeeeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct sqvwfghrysqfmgifedrapvpfeevidkinakgvcrstakyvrnnlettafhrddhet  120
DSSP  eeeeelllleeeeeeeeeeeellhhhhhllhhhhleeeleeeeelllleeeeehhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct dmelkpanaatrtsrgwhttdlkynpsrveafhrygttvnciveevdarsvypydefvla  180
DSSP  eeeleellllllllleeelllllllllllllleeeeeeeeeeeeeeeeeelllllleeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct tgdfvymspfygyregshtehttyaadrfkqvdgfyardlapttrnllttpkftvawdwv  240
DSSP  llleelllllllllllhhhllllllhhheeeeeeellllllleeeeeeelllleeeeell


DSSP  ......................................................lLHHHH
Query ......................................................eDVNKV   18
ident                                                             
Sbjct pkrpsvctmtkwqevdemlrseyggsfrfssdaisttfttnlteyplsrvdlgdcIGKDA  300
DSSP  lllllllleeeeeeelleeeeeelleeeeeelllleeeeeelllllhhhllllhhHHHHH


DSSP  HHHHHLLL........LLLE.EEEEEE.LLEEEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query LSAISNFF........DFEK.XNTRKE.GIIDILVLEARTlksllkfhrvlrnerildsa   68
ident   |    |                    |   |                           
Sbjct RDAMDRIFarrynathIKVGqPQYYQAnGGFLIAYQPLLS...ntverikttssiefarl  357
DSSP  HHHHHHHHhhhlllllLLLLlLEEEEElLLEEEEEEELLL...llllllllllllhhhhh


DSSP  hhHHHHllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllLEELLE....
Query rkYLXKgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapKTAHGV....  124
ident                                                        |    
Sbjct qfTYNH......................................iqrhvnDMLGRVaiaw  379
DSSP  hhHHHH......................................hhhhhhHHHHHHhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct celqnheltlwnearklnpnaiasvtvgrrvsarmlgdvmavstcvpvaadnvivqnsmr  439
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhllleeeeelllleeeeeleeelhhheeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct issrpgacysrplvsfryedqgplvegqlgennelrltrdaiepctvghrryftfgggyv  499
DSSP  lllllleeellleeeelllllllleeeeelllleeellllleeellllleeeeeelleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct yfeeyayshqlsradittvstfidlnitmledhefvplevytrheikdsglldytevqrr  559
DSSP  eeelleeeeeeehhhleeelllllllllllllllllllllllhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  ........ellllllll
Query ........plwdnpvpp  133
ident                  
Sbjct nqlhdlrfadidtviha  576
DSSP  hllhhhhhlllllllll


No 78: 1WHVA  MOLECULE: POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE;                             

DSSP  ..............lLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLlllLEEEEEEellEEEEEEEE
Query ..............dKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFfdfEKXNTRKegiIDILVLEA   46
ident                                     | |                     
Sbjct gssgssggpdlqpkrDHVLHVTFPKEWKTSDLYQLFSAF.gnIQISWID...DTSAFVSL   56
DSSP  lllllllllllllllLLEEEEELLLLLLHHHHHHHHLLL.llLLLEEEE...LLEEEEEL


DSSP  LLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllLLLL..LEEEEe
Query RTLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvLSFV..AIKFYi  104
ident                                                        |  | 
Sbjct SQPEQVQI...................................avntsKYAEsyRIQTY.   80
DSSP  LLHHHHHH...................................hhhhhHHLLllEEEEH.


DSSP  elllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query eyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                              
Sbjct .........aeyvgkkqkgkqvksgpssg  100
DSSP  .........hhhhhhhlllllllllllll


No 79: 1SQEA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PG130;                                

DSSP  LLEEEEEEELLL.....lLHHHH..hhhhhlllLLLEEEEEEEL.....LEEEEEEEELL
Query DKVXVVAEVRPS.....eDVNKV..lsaisnffDFEKXNTRKEG.....IIDILVLEART   48
ident                                   |      |                  
Sbjct HMFMAENRLQLQkgsaeeTIERFynrqgietieGFQQMFVTKTLntedtDEVKILTIWES   60
DSSP  LLEEEEEEEEELlllhhhHHHHHhllllhhhllLEEEEEEEEELlllllEEEEEEEEELL


DSSP  HHH.HHHHHH.HHHHlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllLEEEEEEL
Query LKS.LLKFHR.VLRNerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvAIKFYIEY  106
ident   |        |                                            |   
Sbjct EDSfNNWLNSdVFKE........................ahddgqqspilsnKVFKYDIG   96
DSSP  HHHhHHHHLLhHHHH........................llllllllleeeeEEEEEEEE


DSSP  Llhhhhhhhhllleelleellllllll
Query Qnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                            
Sbjct Y......................hyqk  101
DSSP  E......................eeel


No 80: 2QG3A  MOLECULE: UPF0130 PROTEIN AF_2059;                                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xweqfkkeklrgyleaknqrkvdfdivelldlinsfddfvtlsscsgriavvdlekpgdk   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeelleeeeeeelllllh


DSSP  .................................LLEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLlL
Query .................................DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFfD   27
ident                                           |          |      
Sbjct asslflgkwhegvevsevaeaalrsrkvawliqYPPIIHVACRNIGAAKLLXNAANTA.G  119
DSSP  hhleeeeeelllllhhhhhhhhllllleeeeeeELLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHH.L


DSSP  LLEEE.EEEEllEEEEEEEEL..............................LHHHHH.hH
Query FEKXN.TRKEgiIDILVLEAR..............................TLKSLL.kF   55
ident |                                                   ||      
Sbjct FRRSGvISLS..NYVVEIASLerielpvaekglxlvddaylsyvvrwanekLLKGKEklG  177
DSSP  LLLLEeEELL..LLEEEELLLlleeeeeeelleelllhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHhhH


DSSP  HHHhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhllLLLLLleeeeeelllhhhhhhh
Query HRVlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgVLSFVaikfyieyqnpkeivdw  115
ident                                                             
Sbjct RLQ................................ealESLQR.................  188
DSSP  HHH................................hhhHHHHL.................


DSSP  hllleelleellllllll
Query lapktahgvplwdnpvpp  133
ident                   
Sbjct ...........enaycsd  195
DSSP  ...........lllllll


No 81: 2AN3A  MOLECULE: PHENYLETHANOLAMINE N-METHYLTRANSFERASE;                    

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vasayqrfepraylrnnyapprgdlcnpngvgpwklrclaqtfatgevsgrtlidigsgp   60
DSSP  lllhhhhllhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tvyqllsacshfeditmtdflevnrqelgrwlqeepgafnwsmysqhacliegkgecwqd  120
DSSP  llhhhllhhhhlleeeeeellhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhlllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kerqlrarvkrvlpidvhqpqplgagspaplpadalvsafcleavspdlasfqraldhit  180
DSSP  hhhhhhhheeeeeelllllllllllllllllleeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  .....LLEEEEEEELL..............LLLHHHHHHHHHLLLLLlEEEEEEEL....
Query .....DKVXVVAEVRP..............SEDVNKVLSAISNFFDFeKXNTRKEG....   37
ident                                     |  |                    
Sbjct tllrpGGHLLLIGALEeswylagearltvvPVSEEEVREALVRSGYKvRDLRTYIMpahl  240
DSSP  lleeeEEEEEEEEEELlleeeelleeeellLLLHHHHHHHHHHLLEEeEEEEEEELlhhh


DSSP  .......LEEEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhh
Query .......IIDILVLEARTlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaa   90
ident                                                             
Sbjct qtgvddvKGVFFAWAQKV..........................................  258
DSSP  lllllllLEEEEEEEEEL..........................................


DSSP  hlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query avgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                            
Sbjct ...........................................  258
DSSP  ...........................................


No 82: 1PZXA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN APC36103;                             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mpieiitdsgadlpqsyirehriaflplvvhwngqdykdgitiepkqvydamrqghtvkt   60
DSSP  llleeeeehhhlllhhhhhhllleeelleeeelleeeellllllhhhhhhhhllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aqpsplamkelflpyakenrpclyiafssklsgtyqtamavrselldeypefrltiidsk  120
DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeell


DSSP  .................................lLEEEEEEELLL...............
Query .................................dKVXVVAEVRPS...............   12
ident                                                             
Sbjct caslgqglavmkavelakqntpynllcetiesycRHMEHIFTVDNldylarggrisnikp  180
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhHLEEEEEELLLhhhhhhhllllleee


DSSP  ...................lLHHHHHHHHHLLLL...lLEEEEEEEL.............
Query ...................eDVNKVLSAISNFFD...fEKXNTRKEG.............   37
ident                                  |                          
Sbjct llhvedgaliplekwrgrkkVLKRMVELMGERGDdlqkQTIGISHADdeetalelkqmie  240
DSSP  eeeeelleeeeeeeeelhhhHHHHHHHHHHHHLLlhhhLEEEEEELLlhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......................LEEEEEEE.ELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query .......................IIDILVLE.ARTLksllkfhrvlrnerildsarkylx   73
ident                            |                                
Sbjct ethgctrfflsdigsaigahagpGTIALFFLnKYIE........................  276
DSSP  hhlllleeeeeellhhhhhhhllLLEEEEEElLLLL........................


DSSP  hllllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query kgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                                             
Sbjct ...........................................................i  277
DSSP  ...........................................................l


No 83: 1GH8A  MOLECULE: TRANSLATION ELONGATION FACTOR 1BETA;                       

DSSP  ..LLEEEEEEELLL.....lLHHHHHHHHHLL.lLLLEEEEEEEL.LEEEEEEEELLHHh
Query ..DKVXVVAEVRPS.....eDVNKVLSAISNF.fDFEKXNTRKEG.IIDILVLEARTLKs   51
ident   | |        |         |             |            |         
Sbjct mgDVVATIKVMPESpdvdleALKKEIQERIPEgtELHKIDEEPIAfGLVALNVMVVVGD.   59
DSSP  llLEEEEEEEEELLllllhhHHHHHHHHHLLLllEELLLLEEELLlLLEEEEEEEEELL.


DSSP  hHHHHhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeeLHHHHhllllllllEEEEEELLlhhh
Query lLKFHrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxiHKQAAavgvlsfvaIKFYIEYQnpke  111
ident                                                             
Sbjct .AEGG.......................teaaeeSLSGI..egvsnieVTDVRRLM....   89
DSSP  .LLHH.......................hhhhhhHHLLL..llleeeeEEEEEELL....


DSSP  hhhhhllleelleellllllll
Query ivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                       
Sbjct ......................   89
DSSP  ......................


No 84: 2PE8A  MOLECULE: SPLICING FACTOR 45;                                        

DSSP  .....lLEEEEEE...elLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEEEEEL.....lEEEEEEEEL
Query .....dKVXVVAE...vrPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTRKEG.....iIDILVLEAR   47
ident          |                           |                  ||  
Sbjct amgkcpTKVVLLRnmvgaGEVLEVETKEECEKYGKVGKCVIFEIPgapddeAVRIFLEFE   60
DSSP  lhhhllLLEEEEElllllLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEEEEELLllllllLEEEEEEEL


DSSP  LHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeEEELhhhhhlllllllLEEEEEEll
Query TLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiaFXIHkqaaavgvlsfvAIKFYIEyq  107
ident    |                                                  ||    
Sbjct RVES..........................aikavVDLN...gryfggrvvKACFYNL..   89
DSSP  LHHH..........................hhhhhHHHL...lleelleelEEEELLH..


DSSP  lhhhhhhhhllleelleellllllll
Query npkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                           
Sbjct ..............dkfrvldlaeqv  101
DSSP  ..............hhhhllllllll


No 85: 2OTJD  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  .......LLEEEEEE..ellLLLHHHHHHHHHlllllleeeEEEEL..............
Query .......DKVXVVAE..vrpSEDVNKVLSAISnffdfekxnTRKEG..............   37
ident            ||                                               
Sbjct fhemrepRIEKVVVHmgighANAEDILGEITG.......qmPVRTKakrtvgefdiregd   53
DSSP  lhhhlllEEEEEEEEeelllLLLHHHHHHHHL.......llLEEELllllllllllllll


DSSP  .LEEEEEEEE.llhhhHHHHHhhhhhlllhhhhhHHHHHLLLLLEEEEEELhhhhhllll
Query .IIDILVLEA.rtlksLLKFHrvlrnerildsarKYLXKGIEGNTIAFXIHkqaaavgvl   95
ident  |     |        |                                           
Sbjct pIGAKVTLRDemaeefLQTAL..........plaELATSQFDDTGNFSFGL.........   94
DSSP  lLEEEEEELLhhhhhhHHHHH..........hhlLLLLLLLLLLLLEEELL.........


DSSP  lllLEEEEEE.......................lLLHHH.HHHHHLLleelleellllll
Query sfvAIKFYIE.......................yQNPKE.IVDWLAPktahgvplwdnpv  131
ident                                         |                   
Sbjct ...DVTVNLVrpgyrvakrdkasrsiptkhrlnpADAVAfIESTYDV.............  138
DSSP  ...EEEEEEEllllhhhhlllllllllhhhlllhHHHHHhHHLLLLL.............


DSSP  ll
Query pp  133
ident   
Sbjct ev  140
DSSP  ll


No 86: 2F3JA  MOLECULE: RNA AND EXPORT FACTOR BINDING PROTEIN 2;                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct madkmdmslddiiklnrnqrrvnrgggprrnrpaiarggrnrpapysrpkplpdkwqhdl   60
DSSP  llllllllhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............LLEEEEEEELL.lllhhhhHHHHHLllLLLEEEEEEE...LLEEEEEE
Query ............DKVXVVAEVRP.sedvnkvLSAISNffDFEKXNTRKE...GIIDILVL   44
ident                                           |                 
Sbjct fdsgcgggegveTGAKLLVSNLDfgvsdadiQELFAEfgTLKKAAVDYDrsgRSLGTADV  120
DSSP  llllllllllllLLEEEEEELLLllllhhhhHHHHHHllLLLEEEELLLlllLLLLLEEE


DSSP  EELLHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeEELHHHhhlllllllLEEEE.
Query EARTLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKFY.  103
ident                                           |            |    
Sbjct HFERRAD...........................alkamKQYKGV..pldgrpmDIQLVa  151
DSSP  EELLHHH...........................hhhhhHHLLLL..lllllllEEEEEl


DSSP  EELLLHHhhhhhhllleelleellllllll
Query IEYQNPKeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                               
Sbjct SQIDLEH.......................  158
DSSP  LHHHHLL.......................


No 87: 1RWUA  MOLECULE: HYPOTHETICAL UPF0250 PROTEIN YBED;                         

DSSP  ............LLEEEEEEELllllHHHHHHHHHLLLL.....lLEEEEEEELL..EEE
Query ............DKVXVVAEVRpsedVNKVLSAISNFFD.....fEKXNTRKEGI..IDI   41
ident                                                             
Sbjct mktklnellefpTPFTYKVMGQ...aLPELVDQVVEVVQrhapgdYTPTVKPSSKgnYHS   57
DSSP  llllllllllllLLEEEEEEEE...lLLLHHHHHHHHHHhhllllLLEEEEELLLllEEE


DSSP  EEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeelhhhhhlllllllLEE
Query LVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvAIK  101
ident                                                             
Sbjct VSITINATH...............................ieqvetlyeelgkidivRMV   86
DSSP  EEEEELLLL...............................hhhhhhhhhhhllllllEEE


DSSP  Eeeelllhhhhhhhhllleelleellllllll
Query Fyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                                 
Sbjct L...............................   87
DSSP  L...............................


No 88: 2AD9A  MOLECULE: POLYPYRIMIDINE TRACT-BINDING PROTEIN 1;                    

DSSP  ........LLEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLlLLLEEEEEEEllEEEEEEEELLHHH
Query ........DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFfDFEKXNTRKEgiIDILVLEARTLKS   51
ident                           | |    |         |         |  |   
Sbjct gdsrsagvPSRVIHIRkLPIDVTEGEVISLGLPFgKVTNLLMLKG..KNQAFIEMNTEEA   58
DSSP  llllllllLLLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHLLLlLLLEEEEEHH..HLEEEEELLLHHH


DSSP  HHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllleeeeeELHHhhhlllllllleeeeeelllhhh
Query LLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvaikfyieyqnpke  111
ident                                                             
Sbjct ANT.......................mvnyytsVTPV...................lrgq   76
DSSP  HHH.......................hhhhhhhHLLL...................llll


DSSP  hhhhhllleelleellllllll
Query ivdwlapktahgvplwdnpvpp  133
ident                       
Sbjct piyiqfsnhkelktdsspnqar   98
DSSP  lleeeellllllllllllllll