DaliLite: Structural Neighbours

Query: 2NWUA MOLECULE: UPF0201 PROTEIN SSO1042;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  2NWU-A 28.7  0.0  131   131  100   UPF0201 PROTEIN SSO1042;                                   "         
   2:  2PZZ-A 18.0  1.5  121   133   35   UPF0201 PROTEIN MJ1564;                                    "         
   3:  2OGK-A 11.3  2.5  109   133   24   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
   4:  2NRQ-A 11.0  2.7  115   137   20   HYPOTHETICAL PROTEIN ORF-C20_032;                          "         
   5:  2F06-A  3.9  7.3   68   144    9   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   6:  2DTJ-A  3.8 11.5   65   164    8   ASPARTOKINASE;                                             "         
   7:  2FGC-A  3.7  4.0   63   161   11   ACETOLACTATE SYNTHASE, SMALL SUBUNIT;                      "         
   8:  2B7B-B  3.6  3.1   61    90    5   ELONGATION FACTOR 1-ALPHA;                                 "         
   9:  1GH8-A  3.4  3.3   63    89   10   TRANSLATION ELONGATION FACTOR 1BETA;                       "         
  10:  2CA9-A  3.3  3.5   64   132    3   PUTATIVE NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                      "         
  11:  2J5A-A  3.2  3.8   64   106    9   30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  "         
  12:  2HGJ-G  3.2  3.0   84   182   12   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  13:  1VMB-A  3.2  4.7   67   107    7   30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  "         
  14:  2HZA-A  3.1  3.5   62   131    3   NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                               "         
  15:  1ZPV-A  3.0  2.7   61    85   10   ACT DOMAIN PROTEIN;                                        "         
  16:  1U8S-A  3.0  2.7   59   171    8   GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL                    "         
  17:  2NXC-A  2.9  4.2   48   249    4   RIBOSOMAL PROTEIN L11 METHYLTRANSFERASE;                   "         
  18:  2NYI-A  2.8  3.5   63   171   13   UNKNOWN PROTEIN;                                           "         
  19:  2BJ1-A  2.8  3.2   59   132    8   NICKEL RESPONSIVE REGULATOR;                               "         
  20:  1Z1Z-A  2.8  1.9   44   129    5   MINOR TAIL PROTEIN U;                                      "         
  21:  1O51-A  2.8  3.4   59    89    2   HYPOTHETICAL PROTEIN TM0021;                               "         
  22:  2NZC-A  2.7  3.2   61    80    5   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  23:  2GO5-4  2.7  2.8   50    81   18   SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 19 KDA PROTEIN                 "         
  24:  2E5J-A  2.7  2.6   58    97    7   METHENYLTETRAHYDROFOLATE SYNTHETASE DOMAIN                 "         
  25:  2DGW-A  2.7  2.9   61    91    5   PROBABLE RNA-BINDING PROTEIN 19;                           "         
  26:  1JW3-A  2.7  4.3   48   140   15   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN MTH1598;                    "         
  27:  2BUJ-A  2.6  4.6   62   291    8   SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 16;                        "         
  28:  1VI7-A  2.6  3.0   53   206    6   HYPOTHETICAL PROTEIN YIGZ;                                 "         
  29:  1PHZ-A  2.6  9.1   70   403    7   PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       "         
  30:  1HL6-A  2.6  2.9   56   119    5   CG8781 PROTEIN;                                            "         
  31:  2I6C-A  2.5  2.7   41   160    2   PUTATIVE ACETYLTRANSFERASE;                                "         
  32:  2G4B-A  2.5  3.1   57   172    9   SPLICING FACTOR U2AF 65 KDA SUBUNIT;                       "         
  33:  2AYB-A  2.5  3.9   60    87    7   REGULATORY PROTEIN E2;                                     "         
  34:  3SXL-A  2.4  5.4   69   157    3   PROTEIN (SEX-LETHAL);                                      "         
  35:  2OTJ-D  2.4  3.1   78   140    6   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  36:  2DGX-A  2.4  3.5   63    96    8   KIAA0430 PROTEIN;                                          "         
  37:  2CQP-A  2.4  3.3   64    98    2   RNA-BINDING PROTEIN 12;                                    "         
  38:  2CG8-A  2.4  3.6   68   240    9   DIHYDRONEOPTERIN ALDOLASE 6-HYDROXYMETHYL-7,8-             "         
  39:  2CC6-A  2.4  2.0   36    64    6   VNG1446H;                                                  "         
  40:  2ARH-A  2.4  4.4   48   198    6   HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1966;                              "         
  41:  2UUU-A  2.3  9.9   61   550    7   ALKYLDIHYDROXYACETONEPHOSPHATE SYNTHASE;                   "         
  42:  2FKL-A  2.3  2.6   41    64    7   AMYLOID BETA A4 PROTEIN PRECURSOR;                         "         
  43:  2FB0-A  2.3  3.6   59    94   14   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  44:  1J4W-A  2.3  3.6   50   145    8   FUSE BINDING PROTEIN;                                      "         
  45:  2OKQ-A  2.2  3.7   65   127    5   HYPOTHETICAL PROTEIN YBAA;                                 "         
  46:  2HGN-A  2.2  3.1   57    81   11   HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN F;                 "         
  47:  2CZ4-A  2.2  3.1   58   100    5   HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0516;                             "         
  48:  1F0X-A  2.2  3.3   58   502    7   D-LACTATE DEHYDROGENASE;                                   "         
  49:  2OF3-A  2.1  3.8   66   266    6   ZYG-9;                                                     "         
  50:  2CJK-A  2.1  7.5   61   167    3   5'-R(*UP*AP*UP*AP*UP*AP*UP*AP)-3';                         "         
  51:  2A10-A  2.1  5.5   63   104    6   CARBON DIOXIDE CONCENTRATING MECHANISM PROTEIN             "         
  52:  1VQS-A  2.1  4.3   60   110    8   HYPOTHETICAL PROTEIN AGR_L_1239;                           "         
  53:  1KWM-A  2.1 10.5   69   402    9   PROCARBOXYPEPTIDASE B;                                     "         
  54:  1CVJ-A  2.1  6.3   61   169    5   POLYDENYLATE BINDING PROTEIN 1;                            "         
  55:  2GAG-C  2.0 11.9   63   190    5   HETEROTETRAMERIC SARCOSINE OXIDASE ALPHA-SUBUNIT;          "         
  56:  2DNL-A  2.0  6.0   76   114    9   CYTOPLASMIC POLYADENYLATION ELEMENT BINDING                "         
  57:  1CBK-A  2.0  4.1   63   160   11   PROTEIN (7,8-DIHYDRO-6-HYDROXYMETHYLPTERIN-                "         
-

No 1: 2NWUA  MOLECULE: UPF0201 PROTEIN SSO1042;                                   

DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLL
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTGIIDILVLEARTLKSLLKFHRVLRNER   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNTGIIDILVLEARTLKSLLKFHRVLRNER   60
DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEELLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHLLLEELL
Query ILDSARKYLXKGIEGNTIAFXIHKQAAAVGVLSFVAIKFYIEYQNPKEIVDWLAPKTAHG  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ILDSARKYLXKGIEGNTIAFXIHKQAAAVGVLSFVAIKFYIEYQNPKEIVDWLAPKTAHG  120
DSSP  LHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLLEEEEEELLLHHHHHHHHLLLEELL


DSSP  EELLLLLLLLL
Query VPLWDNPVPPD  131
ident |||||||||||
Sbjct VPLWDNPVPPD  131
DSSP  EELLLLLLLLL


No 2: 2PZZA  MOLECULE: UPF0201 PROTEIN MJ1564;                                    

DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEL....LLLEEEEEEELlhhHHHHHHHHH
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNT....GIIDILVLEARtlkSLLKFHRVL   56
ident   |   | | | ||  ||  || | |   |                     |  |    |
Sbjct LEVIIKAKVKPTEDKYKVKKAILNIFPKAKLTFiekdNEFGEWEGKTK...SVEKLKELL   57
DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEeellLLLEEEEEEEL...LLHHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLL.....LEEEEEEL...LLHHH
Query RNERILDSARKYLXKGIEGNTIAFXIHKQAAAVGVLSFV.....AIKFYIEY...QNPKE  108
ident |   ||| ||  | ||   |   |   |||| ||   |       |   |          
Sbjct RSQSILDAARXVLEKGXTENATKFYLNKQAAYVGAVNFDidthgGIFVKILAdenEDIXK  117
DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHLLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLlllllLEEEEEELlllLLHHH


DSSP  HHHHHLLLEELLEELLlllllll
Query IVDWLAPKTAHGVPLWdnpvppd  131
ident |    || |  ||          
Sbjct IIKDIAPRTKGGVIIN.......  133
DSSP  HHHHHLLLLLLLLLLL.......


No 3: 2OGKA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  ...LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLL.llLEEELLLLEEEEEEEL....LHHHHHHH
Query ...DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFF.dfEKXNTGIIDILVLEAR....TLKSLLKF   52
ident      | | | |   ||  ||  |||  |             |  |        |     
Sbjct gkiEWVRVSAVVHSTEDREKVGEAISTLFpfeFEIAVSKMEYLEVELTksseIKKFWKNL   60
DSSP  leeEEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLlllLLLEEELLEEEEEEELlhhhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHhlLLHHHHHHHHHHHLL.LLEEEEEELHHHHHLLLLLLL....LEEEEEELLL..
Query HRVLRneRILDSARKYLXKGIE.GNTIAFXIHKQAAAVGVLSFV....AIKFYIEYQN..  105
ident    |            |   |   |     | || |  |  |       |          
Sbjct LELLG..EQAEEILSTLEDRIDeQNVLHIRIDKQKAYLGEVSLTsggdPIAVKLRLVTyp  118
DSSP  HHHHH..HHHHHHHHHHHHHLLlLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLllllLEEEEEEEELll


DSSP  ......hHHHHHHHLlleelleelllllllll
Query ......pKEIVDWLApktahgvplwdnpvppd  131
ident                                 
Sbjct skrekviEFARELCT.................  133
DSSP  llhhhhhHHHHHHLL.................


No 4: 2NRQA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN ORF-C20_032;                          

DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLL....lLEEEL........LLLEEEEEEEL...L
Query DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFD....fEKXNT........GIIDILVLEAR...T   45
ident             || ||    |  ||       | |           | ||         
Sbjct NQAIISVFIHETEDYNKIVNTIESFFSplisnSKKNVttaqghygNKIIILEYRFDrksG   60
DSSP  LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLlhhhhLEEEEeeeellllLEEEEEEEEELhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHhLLLHHHHHHHhhHHLLLLEEEEEELHHHHHL.LLLLLL....LEEEE
Query LKSLLKFHRVLRnERILDSARKYlxKGIEGNTIAFXIHKQAAAV.GVLSFV....AIKFY  100
ident                 |          | |        ||       |        ||  
Sbjct EQFFKIILEKIE.TSELXLILTT..SHIDGSKLYLRFDKQYLIAeHRLVLKegddVIKCI  117
DSSP  HHHHHHHHLLLL.HHHHHHHHLL..LLEELLEEEEEELHHHHHHhLLLLLLllllLEEEE


DSSP  EELLLHhHHHHHhLLLEelleELLLllllll
Query IEYQNPkEIVDWlAPKTahgvPLWDnpvppd  131
ident |       |      |               
Sbjct ISFNTS.NIKEE.IKKL....VNSR.....i  137
DSSP  EELLLL.LHHHH.HHHH....HHHH.....l


No 5: 2F06A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  ....LEEEEEEEELL.LLLHHHHHHHHHLL.LLLLEEEL...LLLEEEEEEEllhhhhhh
Query ....DKVXVVAEVRP.SEDVNKVLSAISNF.FDFEKXNT...GIIDILVLEArtlksllk   51
ident                 |     |                       ||            
Sbjct snaxVAKQLSIFLENkSGRLTEVTEVLAKEnINLSALCIaenADFGILRGIV........   52
DSSP  llllEEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHHHLlLLEEEEEEeelLLLEEEEEEE........


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHHHhlllllllLEEEEEE.........
Query fhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAAavgvlsfvAIKFYIE.........  102
ident                                             |               
Sbjct .......................sdpdkayKALKDN......hfAVNITDVvgiscpnvp   83
DSSP  .......................llhhhhhHHHHHL......llLEEEEEEeeeeeelll


DSSP  ..................................lLLHHhhhhhhllleelleeLLLLLL
Query ..................................yQNPKeivdwlapktahgvpLWDNPV  128
ident                                     |                       
Sbjct galakvlgflsaegvfieyxysfannnvanvvirpSNXD........kcievlkEKKVDL  135
DSSP  lhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeelleeeeeeeeLLHH........hhhhhhhHLLLEE


DSSP  LL......l
Query PP......d  131
ident          
Sbjct LAasdlykl  144
DSSP  ELhhhhlll


No 6: 2DTJA  MOLECULE: ASPARTOKINASE;                                             

DSSP  ..........LEEEEEEE.ELLL.lLHHHHHHHHH.LLLLLLEEEL......LLLEEEEE
Query ..........DKVXVVAE.VRPS.eDVNKVLSAIS.NFFDFEKXNT......GIIDILVL   41
ident               |             ||  |                           
Sbjct avltgvatdkSEAKVTVLgISDKpgEAAKVFRALAdAEINIDMVLQnvssveDGTTDITF   60
DSSP  leeeeeeeelLEEEEEEEeEELLllHHHHHHHHHHhLLLLLLEEEEllllllLLEEEEEE


DSSP  EELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEE
Query EARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYI  101
ident                                            |                
Sbjct TCPRS..........................dgrrameilKKLQ....vqgnwtNVLYDD   90
DSSP  EEEHH..........................hhhhhhhhhHLLL....llllllEEEEEL


DSSP  E............................................llLHHHH..hhhhll
Query E............................................yqNPKEI..vdwlap  115
ident                                                             
Sbjct QvgkvslvgagmkshpgvtaefmealrdvnvnielistseirisvliREDDLdaaaralh  150
DSSP  LeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelleeeeeeEHHHHhhhhhhhh


DSSP  lEELLeelllllllll
Query kTAHGvplwdnpvppd  131
ident                 
Sbjct eQFQL..ggedeavvy  164
DSSP  hHHLL..lllllleel


No 7: 2FGCA  MOLECULE: ACETOLACTATE SYNTHASE, SMALL SUBUNIT;                      

DSSP  .LEEEEEEEELLL.lLHHHHHHHHH.LLLLLLEEEL.....LLLEEEEEEELLHHhhhhh
Query .DKVXVVAEVRPS.eDVNKVLSAIS.NFFDFEKXNT.....GIIDILVLEARTLKsllkf   52
ident      |   |        ||        |                 ||            
Sbjct iREHLVSXLVHNKpgVXRKVANLFArRGFNISSITVgesetPGLSRLVIXVKGDD.....   55
DSSP  lEEEEEEEEEELLllHHHHHHHHHHlLLLEEEEEEEeelllLLEEEEEEEEEELL.....


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHhhlllllllLEEEEEELLLH......
Query hrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYQNP......  106
ident                                                             
Sbjct ......................ktieqiEKQAYK....lvevvKVTPIDPLPENrverex   89
DSSP  ......................lhhhhhHHHHLL....llleeEEEELLLLHHHeeeeee


DSSP  ...............................................hhhhhhhllleel
Query ...............................................keivdwlapktah  119
ident                                                             
Sbjct alikvrfdedkqeifqlveifrgkiidvsregaiieitgarskveafinllpqkqveeia  149
DSSP  eeeeeellllhhhhhhhhhhllleeeeellleeeeeeeelhhhhhhhhhhllhhheeeee


DSSP  leelllllllll
Query gvplwdnpvppd  131
ident             
Sbjct rtgivaxnrwnv  161
DSSP  ellleeeellll


No 8: 2B7BB  MOLECULE: ELONGATION FACTOR 1-ALPHA;                                 

DSSP  ....LEEEEEEEE.LLLLLHHHHHHHHHLL....llLLEEEL....LLLEEEEEEELLHH
Query ....DKVXVVAEV.RPSEDVNKVLSAISNF....fdFEKXNT....GIIDILVLEARTLK   47
ident       |                                         |  |        
Sbjct paakSIVTLDVKPwDDETNLEEMVANVKAIemegltWGAHQFipigFGIKKLQINCVVED   60
DSSP  llleEEEEEEEELlLLLLLHHHHHHHHHLLlllleeEEEEEEeeeeLLEEEEEEEEEEEL


DSSP  hhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHHhlllllllLEEE.EEELLlh
Query sllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsfvAIKF.YIEYQnp  106
ident                                                             
Sbjct .........................dkvslddlQQSIEED...edhvqSTDIaAMQAL..   90
DSSP  .........................llllhhhhHHHHLLL...lllllEEEEeEEEEL..


DSSP  hhhhhhhllleelleelllllllll
Query keivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                          
Sbjct .........................   90
DSSP  .........................


No 9: 1GH8A  MOLECULE: TRANSLATION ELONGATION FACTOR 1BETA;                       

DSSP  ...LEEEEEEEE.LLLLLHHHHHHHHHLLL....lLLEEEL....LLLEEEEEEELL...
Query ...DKVXVVAEV.RPSEDVNKVLSAISNFF....dFEKXNT....GIIDILVLEART...   45
ident               |  |       |           |            |         
Sbjct mgdVVATIKVMPeSPDVDLEALKKEIQERIpegteLHKIDEepiaFGLVALNVMVVVgda   60
DSSP  lllEEEEEEEEElLLLLLHHHHHHHHHHHLlllleELLLLEeellLLLEEEEEEEEElll


DSSP  hhhHHHHHhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEE.EEELL
Query lksLLKFHrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKF.YIEYQ  104
ident                                                    |        
Sbjct eggTEAAE........................eslsGIEG........vsNIEVtDVRRL   88
DSSP  lhhHHHHH........................hhhlLLLL........leEEEEeEEEEL


DSSP  Lhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query Npkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                            
Sbjct M..........................   89
DSSP  L..........................


No 10: 2CA9A  MOLECULE: PUTATIVE NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                      

DSSP  .................................................LEEEEEEEELL
Query .................................................DKVXVVAEVRP   11
ident                                                       |     
Sbjct dsiirfsvslqqnlldeldnriikngyssrselvrdmireklvnpndesKIAVLVVIYDH   60
DSSP  lleeeeeeeeehhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhlllllllEEEEEEEEEEL


DSSP  LL..LHHHHHHHHHLL.LLLLEEEL....LLLEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhh
Query SE..DVNKVLSAISNF.FDFEKXNT....GIIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerilds   64
ident                                                             
Sbjct HQreLNQRMIDIQHASgTHVLCTTHihmdEHNCLETIILQGNS.................  103
DSSP  LLllHHHHHHHHHHHHlLEEEEEEEeellLLEEEEEEEEEELH.................


DSSP  hhhhhhhhlllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEELLLHHhhhhhhllleelleell
Query arkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYQNPKeivdwlapktahgvplw  124
ident                                  |                          
Sbjct ..........feiqrlqLEIGG....lrgvkFAKLTKASSFEY.................  132
DSSP  ..........hhhhhhhHHHHL....llleeEEEEEEELLLLL.................


DSSP  lllllll
Query dnpvppd  131
ident        
Sbjct .......  132
DSSP  .......


No 11: 2J5AA  MOLECULE: 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  

DSSP  .....LEEEEEEEELLLL...LHHHHHHHHHLLLL.....LLEEEL.............L
Query .....DKVXVVAEVRPSE...DVNKVLSAISNFFD.....FEKXNT.............G   34
ident           |  | |        |       |                           
Sbjct hyktlRYYETVFAVKPTLseeEMKKKFEQVKEFIKqkggeILYEEDwgmrqlaypiqkfN   60
DSSP  lllllEEEEEEEEELLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHhlleeEEEEEEeeeeellllllllL


DSSP  LLEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHHhllllll
Query IIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsf   94
ident           |                                                 
Sbjct NARYFLVQFKTEN..........................pqlpnelDFQLKID....edv   90
DSSP  EEEEEEEEEEELL..........................llhhhhhHHHHHHL....lle


DSSP  lLEEEEEELLLhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query vAIKFYIEYQNpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                      
Sbjct iRWLNIQIKES.....................evkkn  106
DSSP  eEEEEEEELHH.....................hllll


No 12: 2HGJG  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  ..................................LEEEEEEEEL.....LLLL..HHHHH
Query ..................................DKVXVVAEVR.....PSED..VNKVL   19
ident                                    ||                      |
Sbjct mpldvalkrkyyeevrpelirrfgyqnvwevprlEKVVINQGLGeakedARILekAAQEL   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleELLLEEELLLlllllHHHHhhHHHHH


DSSP  HHHH..........lllllleeellllEEEEE.EELL..HHHHHHH.HHHHhhlllhhhh
Query SAIS..........nffdfekxntgiiDILVL.EART..LKSLLKF.HRVLrnerildsa   65
ident   |                          |     |      | |     |         
Sbjct ALITgqkpavtrakksisnfklrkgmpIGLRVtLRRDrmWIFLEKLlNVAL...prirdf  117
DSSP  HHHHlllllllllllllllllllllllLLLEElLLLHhhHHHHHHHhHHHL...llllll


DSSP  hhhhhHHLL.LLEEEEEELHhhHHLLL.......llllLEEEEEELLL.....HHHHHH.
Query rkylxKGIE.GNTIAFXIHKqaAAVGV.......lsfvAIKFYIEYQN.....PKEIVD.  111
ident                                                             
Sbjct rglnpNSFDgRGNYNLGLRE..QLIFPeitydmvdalrGMDIAVVTTAetdeeARALLEl  175
DSSP  lllllLLLLlLLLLLLLLLL..LLLLLlllllllllllLEEELLEELLllhhhHHHHHHh


DSSP  HHLLLEelleelllllllll
Query WLAPKTahgvplwdnpvppd  131
ident    |                
Sbjct LGFPFR.............k  182
DSSP  HHLLLL.............l


No 13: 1VMBA  MOLECULE: 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6;                                  

DSSP  ..LEEEEEEEELLLL...LHHHHHHHHHLLLL......LLEEEL.............LLL
Query ..DKVXVVAEVRPSE...DVNKVLSAISNFFD......FEKXNT.............GII   36
ident             |                           |                   
Sbjct keRIYESMFIIAPNVpeeERENLVERVKKIIEervkgkIDKVERmgmrkfayeikkfNEG   60
DSSP  llEEEEEEEEELLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHhlllleEEEEEEeeeeeeeeeelleEEE


DSSP  EEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHHhlllllllL
Query DILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAavgvlsfvA   96
ident |  |   |                                                    
Sbjct DYTVIYFRCDG...........................qnlqelENFYRVT....peiiR   89
DSSP  EEEEEEEEELL...........................lllhhhHHHHHLL....lleeE


DSSP  EEEEEELL..LHHHhhhhhllleelleelllllllll
Query IKFYIEYQ..NPKEivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                      
Sbjct WQTFRRFDleKKER...................kaqr  107
DSSP  EEEEELHHhhHHHH...................hhhl


No 14: 2HZAA  MOLECULE: NICKEL-RESPONSIVE REGULATOR;                               

DSSP  ...................................................LEEEEEEEE
Query ...................................................DKVXVVAEV    9
ident                                                             
Sbjct xqrvtitldddlletldslsqrrgynnrseairdilrsalaqeatqqhgtqGFAVLSYVY   60
DSSP  leeeeeeelhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleEEEEEEEEE


DSSP  LLL..LLHHHHHHHHHL.llLLLEEEL....LLLEEEEEEELLH..HHHHhhhhhhhhll
Query RPS..EDVNKVLSAISN.ffDFEKXNT....GIIDILVLEARTL..KSLLkfhrvlrner   60
ident             |                                               
Sbjct EHEkrDLASRIVSTQHHhhdLSVATLHvhinHDDCLEIAVLKGDxgDVQH..........  110
DSSP  ELLllLHHHHHHHHHHHlllLEEEEEEeellLLEEEEEEEEEEEhhHHHH..........


DSSP  lhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEELLlhhhhhhhhllleell
Query ildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYQnpkeivdwlapktahg  120
ident                      |                                      
Sbjct ................faddvIAQRG.......vrHGHLQCLPK................  131
DSSP  ................hhhhhHHLLL.......eeEEEEEEEEL................


DSSP  eelllllllll
Query vplwdnpvppd  131
ident            
Sbjct ...........  131
DSSP  ...........


No 15: 1ZPVA  MOLECULE: ACT DOMAIN PROTEIN;                                        

DSSP  ..LEEEEEEEELLLLL.HHHHHHHHHLL.LLLLEEEL...LLLEEEEEEELLHHhhhhhh
Query ..DKVXVVAEVRPSED.VNKVLSAISNF.FDFEKXNT...GIIDILVLEARTLKsllkfh   53
ident    |             |  |   |                                   
Sbjct naXKAIITVVGKDKSGiVAGVSGKIAELgLNIDDISQtvlDEYFTXXAVVSSDE......   54
DSSP  llEEEEEEEEELLLLLhHHHHHHHHHHLlLEEEEEEEeeeLLEEEEEEEEEELL......


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHhhlllllllLEEEEEELllhhhhhhhh
Query rvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYqnpkeivdwl  113
ident                                |           |                
Sbjct ................kqdftylrnefEAFGQT......lnvKINIQSAA..........   82
DSSP  ................lllhhhhhhhhHHHHHH......hleEEEEEEHH..........


DSSP  llleelleelllllllll
Query apktahgvplwdnpvppd  131
ident                   
Sbjct ...............ife   85
DSSP  ...............hll


No 16: 1U8SA  MOLECULE: GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL                    

DSSP  ...lEEEEEEEE.LLLLLHHHHHHHHHLL.LLLLEEEL...LLLEEEEEEEllhhhhHHH
Query ...dKVXVVAEV.RPSEDVNKVLSAISNF.FDFEKXNT...GIIDILVLEArtlkslLKF   52
ident          |         | |                   |    |             
Sbjct sltqHLVITAVGtDRPGICNEVVRLVTQAgCNIIDSRIamfGKEFTLLMLI..sgspSNI   58
DSSP  llleEEEEEEEEeLLLLHHHHHHHHHHHLlLEEEEEEEeeeLLEEEEEEEE..eelhHHH


DSSP  HhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEEL.........
Query HrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEY.........  103
ident                                                             
Sbjct T......................rvettlPLLGQ.....qhdlITMMKRTSphdhqthay   91
DSSP  H......................hhhhhhHHHHH.....hhllEEEEEEELlllllllle


DSSP  ....................................................llhhhhhh
Query ....................................................qnpkeivd  111
ident                                                             
Sbjct tvevyvesddklgltekftqffaqrqigmaslsaqtisnqfhiaisarvdsgcnlmqlqe  151
DSSP  eeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeelleeeeeeeeeelllllhhhhhh


DSSP  hhllleelleelllllllll
Query wlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                     
Sbjct efdalctaldvqgslnfikn  171
DSSP  hhhhhhhhhlleeeeeeeel


No 17: 2NXCA  MOLECULE: RIBOSOMAL PROTEIN L11 METHYLTRANSFERASE;                   

DSSP  lEEEEEEEElllLLHHHHHHHHHLlLLLLEEELllLEEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhll
Query dKVXVVAEVrpsEDVNKVLSAISNfFDFEKXNTgiIDILVLEARTlksllkfhrvlrner   60
ident             |     |                                         
Sbjct .MWVYRLKG.tlEALDPILPGLFD.GGARGLWE.rEGEVWAFFPA...............   41
DSSP  .LEEEEEEL.lhHHHHHHHHHHHH.LLLLEEEE.eLLEEEEEELL...............


DSSP  lhhhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhlllllllLEEEEEELLL...............
Query ildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvAIKFYIEYQN...............  105
ident                                                             
Sbjct .............................pvdlpyEGVWEEVGDEdwleawrrdlkpala   72
DSSP  .............................llllllLLEEEELLHHhhhhhhhhhllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  105
ident                                                             
Sbjct ppfvvlapwhtwegaeiplviepgghhettrlalkalarhlrpgdkvldlgtgsgvlaia  132
DSSP  lleeeelllllllllleeeelllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  105
ident                                                             
Sbjct aeklggkalgvdidpmvlpqaeanakrngvrprflegsleaalpfgpfdllvanlyaelh  192
DSSP  hhhllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhllllleeeellhhhhhhhlleeeeeeellhhhh


DSSP  ...............................hhhhhhhhllleelleelllllllll
Query ...............................pkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                                          
Sbjct aalapryrealvpggralltgilkdraplvreamagagfrpleeaaegewvllaygr  249
DSSP  hhhhhhhhhheeeeeeeeeeeeehhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeelleeeeeeel


No 18: 2NYIA  MOLECULE: UNKNOWN PROTEIN;                                           

DSSP  ..lEEEEEEE.eLLLLLHHHHHHHHHLL.LLLLEEEL...LLLEEEEEEELLHHhhhhhh
Query ..dKVXVVAE.vRPSEDVNKVLSAISNF.FDFEKXNT...GIIDILVLEARTLKsllkfh   53
ident       |          |     |  |     |       |                   
Sbjct etqSFVVSVAgsDRVGIVHDFSWALKNIsANVESSRXaclGGDFAXIVLVSLNA......   54
DSSP  lleEEEEEEEeeLLLLHHHHHHHHHHHLlLEEEEEEEeeeLLEEEEEEEEEELL......


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHHHlllllllLEEEEEELLL........
Query rvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQAAAvgvlsfvAIKFYIEYQN........  105
ident                                  |         |                
Sbjct .....................kdgkliQSALESAL....pgfQISTRRASSVvspdtrey   89
DSSP  .....................lllhhhHHHHHHHL....lllEEEEEELLLLlllleeee


DSSP  ........................................................hhhh
Query ........................................................pkei  109
ident                                                             
Sbjct elyvegpdsegiveavtavlakkganiveletetlpapfagftlfrxgsrvafpfplyqe  149
DSSP  eeeeeeellllhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeeehhhhhh


DSSP  hhhhllleelleelllllllll
Query vdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                       
Sbjct vvtalsrveeefgvdidleevv  171
DSSP  hhhhhhhhhhhhlleeeeeell


No 19: 2BJ1A  MOLECULE: NICKEL RESPONSIVE REGULATOR;                               

DSSP  .....................................................LEEEEEE
Query .....................................................DKVXVVA    7
ident                                                             
Sbjct melirfsisipskllekfdqiieeigyenrseairdlirdfiirhewevgneeVAGTITI   60
DSSP  lleeeeeeeeehhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleEEEEEEE


DSSP  EELLL..lLHHHHHHHHHL.llLLLEEEL....LLLEEEEEEELLH..HHHHhhhhhhhh
Query EVRPS..eDVNKVLSAISN.ffDFEKXNT....GIIDILVLEARTL..KSLLkfhrvlrn   58
ident          |   |                         |        |           
Sbjct VYNHDegdVVKALLDLQHEyldEIISSLHvhmdEHNCLEVIVVKGEakKIKM........  112
DSSP  EEELLlllHHHHHHHHHHHhllLEEEEEEeellLLEEEEEEEEEEEhhHHHH........


DSSP  lllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEELllhhhhhhhhlllee
Query erildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEYqnpkeivdwlapkta  118
ident                                        |                    
Sbjct ..................iadklLSLK.......gvkHGKLVMTS...............  132
DSSP  ..................hhhhhHLLL.......lllLLLEEEEL...............


DSSP  lleelllllllll
Query hgvplwdnpvppd  131
ident              
Sbjct .............  132
DSSP  .............


No 20: 1Z1ZA  MOLECULE: MINOR TAIL PROTEIN U;                                      

DSSP  ..........................................................LE
Query ..........................................................DK    2
ident                                                             
Sbjct khtelraavldalekhdtgatffdgrpavfdeadfpavavyltgaeytgeeldsdtwqAE   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllleellllllllhhhlleeeeeellllllllllllllllLE


DSSP  EEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLLLL.................lLEEEL......LLLEEE
Query VXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNFFD.................fEKXNT......GIIDIL   39
ident                                                       |     
Sbjct LHIEVFLPAQVPDSELDAWMESRIYpvmsdipalsdlitsmvaSGYDYrrdddaGLWSSA  120
DSSP  EEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhlhhhhhhllllllLLEEEelllllLLLEEE


DSSP  EEEELLhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhlllllllleee
Query VLEARTlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikf   99
ident  |                                                          
Sbjct DLTYVI......................................................  126
DSSP  EEEEEL......................................................


DSSP  eeelllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query yieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                 
Sbjct .............................tye  129
DSSP  .............................lll


No 21: 1O51A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM0021;                               

DSSP  .LEEEEEEEELLLL......LHHHHHHHHHLllLLLEEEL..........lLLEEEEEEE
Query .DKVXVVAEVRPSE......DVNKVLSAISNffDFEKXNT..........gIIDILVLEA   43
ident                                                        |    
Sbjct hHXKLLKIYLGEKDkhsgkpLFEYLVKRAYE.lGXKGVTVyrgixgfghpdLPIVLEIVD   59
DSSP  lEEEEEEEEEELLLeelleeHHHHHHHHHHH.lLLLLLEEeelllllllllLEEEEEEEE


DSSP  LlHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeelHHHHhlllllllLEEEEEEL
Query RtLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihKQAAavgvlsfvAIKFYIEY  103
ident                                                             
Sbjct E.EERINL............................flkeIDNI....dfdgLVFTADVN   86
DSSP  L.HHHHHH............................hhhhHHLL....llllEEEEEEEE


DSSP  llhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query qnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                             
Sbjct .........................vvk   89
DSSP  .........................lll


No 22: 2NZCA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  ...LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLL..lllLEEEL...LLLEEEEEEELLHHhhHHH
Query ...DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNF..fdfEKXNT...GIIDILVLEARTLKslLKF   52
ident                     |     ||                                
Sbjct ekrFYILTIVVEDREKAYRQVNELLHNFsedilLRVGYpvrEENXAIIFLVLKTDndTIG   60
DSSP  lleEEEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLhhheeEEEEEeehHHLEEEEEEEEEELhhHHH


DSSP  HhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEELLlhhhhhhh
Query HrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEYQnpkeivdw  112
ident                                                             
Sbjct A.......................lsgklGQIS.........gVRVKTVPLK........   80
DSSP  H.......................hhhhhHLLL.........lEEEEEEELL........


DSSP  hllleelleelllllllll
Query lapktahgvplwdnpvppd  131
ident                    
Sbjct ...................   80
DSSP  ...................


No 23: 2GO54  MOLECULE: SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 19 KDA PROTEIN                 

DSSP  ...................LEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHL..LLLLLEEEL....LL
Query ...................DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISN..FFDFEKXNT....GI   35
ident                    |    |  |    |  |   |          | ||      
Sbjct qyqilkyplttesamkkieDNNTLVFIVDLkADKKKIKAAVKKmyDIQAKKVNTlirpDG   60
DSSP  lllleeeelllhhhhhhhhHLLEEEEEELLlLLLHHHHHHHHHhhLLLEEEEEEelllLL


DSSP  LEEEEEEEllHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleEEEEelhhhhhlllllll
Query IDILVLEArtLKSLlkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntIAFXihkqaaavgvlsfv   95
ident                                                             
Sbjct KKKAYVKL.tPDYD........................aldvANKI..............   81
DSSP  LEEEEEEE.lLLLL........................lhhhHHLL..............


DSSP  leeeeeelllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query aikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                     
Sbjct ....................................   81
DSSP  ....................................


No 24: 2E5JA  MOLECULE: METHENYLTETRAHYDROFOLATE SYNTHETASE DOMAIN                 

DSSP  .................LEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHH.LLLLLLEEEL.lLLEEEE
Query .................DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAIS.NFFDFEKXNT.gIIDILV   40
ident                      |          |     |                     
Sbjct gssgssgpgsppgegapLAADVYVGnLPRDARVSDLKRALReLGSVPLRLTWqgPRRRAF   60
DSSP  lllllllllllllllllLLLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHHhLLLLLLEEEEelLLLEEE


DSSP  EEELL.HHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEE
Query LEART.LKSLLkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKF   99
ident |                                                           
Sbjct LHYPDsAAAQQ..........................avsclQGLR....lgtdtlRVAL   90
DSSP  EELLLhHHHHH..........................hhhhhLLLL....llllllEEEE


DSSP  Eeelllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query Yieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                 
Sbjct A.........................rqqrdk   97
DSSP  L.........................llllll


No 25: 2DGWA  MOLECULE: PROBABLE RNA-BINDING PROTEIN 19;                           

DSSP  ........LEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLlLLLLEEEL.....LLLE.EEEEEELL
Query ........DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNfFDFEKXNT.....GIID.ILVLEART   45
ident             |             |                    |            
Sbjct gssgssgtTCHTVKLRgAPFNVTEKNVMEFLAP.LKPVAIRIvrnahGNKTgYIFVDFSN   59
DSSP  llllllllLLLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHLL.LLLLEEEEeelllLLEEeEEEEELLL


DSSP  HHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEElll
Query LKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEyqn  105
ident                                                             
Sbjct EEEVKQ..........................alkcNREY....mggryiEVFREKS...   86
DSSP  HHHHHH..........................hhhlLLEE....elleeeEEEEELL...


DSSP  hhhhhhhhllleelleelllllllll
Query pkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                           
Sbjct .....................gpssg   91
DSSP  .....................lllll


No 26: 1JW3A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN MTH1598;                    

DSSP  ..............................................LEEEEEEEELLlLL
Query ..............................................DKVXVVAEVRPsED   14
ident                                                   |         
Sbjct mkgfeffdvtadagfwayghdleevfenaalamfevmtdtslveaaEERRVEITSEDrVS   60
DSSP  llleeellllleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLEEEEEEEELLlHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLL........lLEEEL...LLLEEEEEEELLHhhhhhhhhhHHHLllhh
Query VNKVLSAISNFFD........fEKXNT...GIIDILVLEARTLksllkfhrvLRNErild   63
ident           |            |           |   |             | |    
Sbjct LLYDWLDELLFIHdtefilfskFKVKIdekDDGLHLTGTAMGE..eikegheRRDE....  114
DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhlllllllLEEEEeelLLLEEEEEEEELL..lllllllLLLL....


DSSP  hhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleel
Query sarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvpl  123
ident                                                             
Sbjct ..........................................vkavtfhmmeildedgli  132
DSSP  ..........................................llllllllleeeeellee


DSSP  llllllll
Query wdnpvppd  131
ident         
Sbjct karvildl  140
DSSP  eeeeeeel


No 27: 2BUJA  MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 16;                        

DSSP  ......................................LEEEEEEEElLLLL.HHHHHHH
Query ......................................DKVXVVAEVrPSED.VNKVLSA   21
ident                                                             
Sbjct nlyfqghmviidnkhylfiqklgefsyvdlveglhdghFYALKRILC.HEQQdREEAQRE   59
DSSP  llleeeeeeeelleeeeeeeeeelleeeeeeeelllllEEEEEEEEE.LLHHhHHHHHHH


DSSP  HHLL........llLLEEEL...LLLEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh
Query ISNF........fdFEKXNT...GIIDILVLEARTLksllkfhrvlrnerildsarkylx   70
ident                        |      |                             
Sbjct ADMHrlfnhpnilrLVAYCLrerGAKHEAWLLLPFF........................   95
DSSP  HHHHhlllllllllLLEEEEeeeLLEEEEEEEEELL........................


DSSP  hhlllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhHHHHhHLLL..EELLEEL.....
Query kgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkEIVDwLAPK..TAHGVPL.....  123
ident                                                    |  |     
Sbjct ....................................kRGTLwNEIErlKDKGNFLtedqi  119
DSSP  ....................................lLLLHhHHHHhhHLLLLLLlhhhh


DSSP  ...............................lllLLLL......................
Query ...............................wdnPVPP......................  130
ident                                     |                       
Sbjct lwlllgicrgleaihakgyahrdlkptnillgdeGQPVlmdlgsmnqacihvegsrqalt  179
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllhhheeelllLLEEelllllleelleeeelhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  130
ident                                                             
Sbjct lqdwaaqrctisyrapelfsvqshcvidertdvwslgcvlyammfgegpydmvfqkgdsv  239
DSSP  hhhhhhhhllhhhllhhhllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhllllh


DSSP  ...................................................l
Query ...................................................d  131
ident                                                     
Sbjct alavqnqipqsprhssalwqllnsmmtvdphqrphiplllsqlealqppapg  291
DSSP  hhhhhllllllllllhhhhhhhhhhllllhhhlllhhhhhhhhhhlllllll


No 28: 1VI7A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YIGZ;                                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lmeswlipaapvtvveeikksrfitmlahtdgveaakafvesvraehpdarhhcvawvag   60
DSSP  lllleeeellleeeeeeelleeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct apddsqqlgfsddgepagtagkpmlaqlmgsgvgeitavvvryyggillgtgglvkaygg  120
DSSP  lllllllleeellllllllllhhhhhhhhhhlllleeeelleelllllllhhhhhhhhhh


DSSP  ...............LEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHLLLLLlEEEL..LLLEEEEEEe
Query ...............DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISNFFDFeKXNT..GIIDILVLEa   43
ident                                               |        |    
Sbjct gvnqalrqlttqrktPLTEYTLQCEY.HQLTGIEALLGQCDGK.IINSdyQAFVLLRVA.  177
DSSP  hhhhhhlllleeeelLLEEEEEEELL.LLHHHHHHHHHHLLLE.EEEEeeLLLEEEEEE.


DSSP  llhhHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeLHHHhhlllllllLEEEEeel
Query rtlkSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxiHKQAaavgvlsfvAIKFYiey  103
ident        |                                                    
Sbjct ...lPAAK.........................vaefsaKLAD...fsrgslQLLAI...  203
DSSP  ...eLLLL.........................hhhhhhHHHH...hhllllLLEEL...


DSSP  llhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query qnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                             
Sbjct .........................eee  206
DSSP  .........................lll


No 29: 1PHZA  MOLECULE: PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       

DSSP  ...............LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLL..lllLEEEL....LLLEEE
Query ...............DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNF..fdfEKXNT....GIIDIL   39
ident                                |||                          
Sbjct gqetsyiednsnqngAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENdinltHIESRpsrlNKDEYE   60
DSSP  lllllllllllllllLEEEEEEEELLLLHHHHHHHHHHLLlllllLEEEEelllLLLEEE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEE
Query VLEARTLKSLLKFHrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKF   99
ident                                                         |   
Sbjct FFTYLDKRTKPVLG......................siikslRNDI.........gATVH   89
DSSP  EEELLLHHHHHHHH......................hhhhhhHHLL.........lLLEE


DSSP  EEELLLHH....................................................
Query YIEYQNPK....................................................  107
ident        |                                                    
Sbjct ELSRDKEKntvpwfprtiqeldrfanqildadhpgfkdpvyrarrkqfadiaynyrhgqp  149
DSSP  EEELLLLLlleelllllhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  107
ident                                                             
Sbjct iprveyteeekqtwgtvfrtlkalykthacyehnhifpllekycgfrednipqledvsqf  209
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  107
ident                                                             
Sbjct lqtctgfrlrpvagllssrdflgglafrvfhctqyirhgskpmytpepdichellghvpl  269
DSSP  hhhhhlleeeellllllhhhhhhhhllleeeelllllllllllllllllhhhhhhhlhhh


DSSP  ...................hhhhhhlllEELL............................
Query ...................eivdwlapkTAHG............................  120
ident                                                             
Sbjct fsdrsfaqfsqeiglaslgapdeyieklATIYwftvefglckegdsikaygagllssfge  329
DSSP  hllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhHHHHhlllllleeeelleeeellhhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  120
ident                                                             
Sbjct lqyclsdkpkllplelektacqeysvtefqplyyvaesfsdakekvrtfaatiprpfsvr  389
DSSP  hhhhllllleeeellhhhhlllllllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllllleee


DSSP  ...eelllllllll
Query ...vplwdnpvppd  131
ident               
Sbjct ydpytqrvevldnt  403
DSSP  eelllleeeeelll


No 30: 1HL6A  MOLECULE: CG8781 PROTEIN;                                            

DSSP  .....................................LEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHH
Query .....................................DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAI   22
ident                                                             
Sbjct aeefevdedgdqgivrlkekakhrkgrgfgpgpqrsvEGWILFVTsIHEEAQEDEIQEKF   60
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhllleeelhhhllllllllLLEEEEEElLLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HLLLLLLEEEL.......llLEEEEEEELLHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlll
Query SNFFDFEKXNT.......giIDILVLEARTLKSLlkfhrvlrnerildsarkylxkgieg   75
ident                           |  | |                            
Sbjct CDYGEIKNIHLnldrrtgfsKGYALVEYETHKQA.........................l   95
DSSP  HLLLLEEEEELlllllllllLLLEEEEELLHHHH.........................h


DSSP  leeeeeELHHhhhlllllllLEEEEeelllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query ntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                                         
Sbjct aakealNGAE....imgqtiQVDWC............................fvk  119
DSSP  hhhhhhLLLE....elleelEEEEL............................eel


No 31: 2I6CA  MOLECULE: PUTATIVE ACETYLTRANSFERASE;                                

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xqlshrpaetgdletvagfpqdrdelfycypkaiwpfsvaqlaaaiaerrgstvavhdgq   60
DSSP  llleeeellhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhleeeeeeeelle


DSSP  ..................................................LEEEEEEEEl
Query ..................................................DKVXVVAEVr   10
ident                                                             
Sbjct vlgfanfyqwqhgdfcalgnxxvapaarglgvaryligvxenlareqykaRLXKISCFN.  119
DSSP  eeeeeeeeeeellleeeeeeeeelhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllLEEEEEEEL.


DSSP  lllLHHHHHHHHHLLLLLlEEEL........LLLEEEEEEELLHhhhhhhhhhhhhlllh
Query pseDVNKVLSAISNFFDFeKXNT........GIIDILVLEARTLksllkfhrvlrneril   62
ident         |                                                   
Sbjct ...ANAAGLLLYTQLGYQ.PRAIaerhdpdgRRVALIQXDKPLE................  159
DSSP  ...LLHHHHHHHHHLLLE.EEEEeeeellllLEEEEEEEEEELL................


DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleellee
Query dsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvp  122
ident                                                             
Sbjct ............................................................  159
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllll
Query lwdnpvppd  131
ident          
Sbjct ........p  160
DSSP  ........l


No 32: 2G4BA  MOLECULE: SPLICING FACTOR U2AF 65 KDA SUBUNIT;                       

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lgsarrlyvgnipfgiteeammdffnaqmrlggltqapgnpvlavqinqdknfaflefrs   60
DSSP  llhhheeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeelllleeeeeell


DSSP  ................................lEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLL
Query ................................dKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFD   27
ident                                                   |      |  
Sbjct vdettqamafdgiifqgqslkirrphdyqplpgAHKLFIGgLPNYLNDDQVKELLTSFGP  120
DSSP  hhhhhhhhhhllleelleeleeellllllllllLLLEEEElLLLLLLHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LLEEEL.......llLEEEEEEELLHHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeee
Query FEKXNT.......giIDILVLEARTLKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiaf   80
ident     |                |                                      
Sbjct LKAFNLvkdsatglsKGYAFCEYVDINVTDQ.........................aiag  155
DSSP  EEEEEEeelllllleEEEEEEEELLLLHHHH.........................hhhh


DSSP  eELHHhhhlllllllLEEEEeelllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query xIHKQaaavgvlsfvAIKFYieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident     |                                              
Sbjct lNGMQ.....lgdkkLLVQR.............................as  172
DSSP  hLLLE.....elleeLEEEE.............................ll


No 33: 2AYBA  MOLECULE: REGULATORY PROTEIN E2;                                     

DSSP  ..LEEEEEEEELllLLHHHHHHHH..hlllLLLEEEL..........LLLEEEEEEELLH
Query ..DKVXVVAEVRpsEDVNKVLSAI..snffDFEKXNT..........GIIDILVLEARTL   46
ident       |                        |                   |        
Sbjct ssATPIVQFQGE.sNCLKCFRYRLndkhrhLFDLISStwhwaspkapHKHAIVTVTYHSE   59
DSSP  llEEEEEEEEEL.hHHHHHHHHHHhhhlhhHLLLLLLllllllllllLLLEEEEEELLLH


DSSP  HH.HHHHHHhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeLHHHhhlllllllLEEEEEELll
Query KS.LLKFHRvlrnerildsarkylxkgiegntiafxiHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYqn  105
ident                                                     |       
Sbjct EQrQQFLNV...........................vKIPP.......tiRHKLGFMS..   83
DSSP  HHhHHHHHH...........................lLLLL.......llEEEEEEEE..


DSSP  hhhhhhhhllleelleelllllllll
Query pkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                           
Sbjct ......................mhll   87
DSSP  ......................hhhl


No 34: 3SXLA  MOLECULE: PROTEIN (SEX-LETHAL);                                      

DSSP  lEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEL.......LLLEEEEEEELLHHHhhhh
Query dKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNT.......GIIDILVLEARTLKSllkf   52
ident                                                             
Sbjct .NTNLIVNyLPQDXTDRELYALFRAIGPINTCRIxrdyktgYSFGYAFVDFTSEXD....   55
DSSP  .LLEEEEElLLLLLLHHHHHHHHHLLLLEEEEEEeelllllLEEEEEEEEELLHHH....


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeEELHHhhhlllllllLEEEEEE..........
Query hrvlrnerildsarkylxkgiegntiafXIHKQaaavgvlsfvAIKFYIE..........  102
ident                                                |            
Sbjct ....................sqraikvlNGITV......rnkrLKVSYARpesikdtnly   89
DSSP  ....................hhhhhhhhLLLEE......lleeLEEEELLllllllllee


DSSP  ............lllhhhhhhhhLLLEEL..........LEEL.................
Query ............yqnpkeivdwlAPKTAH..........GVPL.................  123
ident                          |                                  
Sbjct vtnlprtitddqldtifgkygsiVQKNILrdkltgrprgVAFVrynkreeaqeaisalnn  149
DSSP  eelllllllhhhhhhhhhhhlllLEEEEEelllllleeeEEEEelllhhhhhhhhhhhll


DSSP  llllllll
Query wdnpvppd  131
ident         
Sbjct vplsvrla  157
DSSP  llleeeel


No 35: 2OTJD  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  ........lEEEEEEE.elLLLLHHHHHHHHH..........lllllleeelLLLEEEEE
Query ........dKVXVVAE.vrPSEDVNKVLSAIS..........nffdfekxntGIIDILVL   41
ident             ||                                        |   | 
Sbjct fhemrepriEKVVVHMgigHANAEDILGEITGqmpvrtkakrtvgefdiregDPIGAKVT   60
DSSP  lhhhllleeEEEEEEEellLLLLHHHHHHHHLllleeellllllllllllllLLLEEEEE


DSSP  EEllhhHHHHHHHHHHhlllhhHHHHhhHHHLLLLEEEEEElhhhhhlllllllLEEEEE
Query EArtlkSLLKFHRVLRnerildSARKylXKGIEGNTIAFXIhkqaaavgvlsfvAIKFYI  101
ident               |                                             
Sbjct LR.demAEEFLQTALP.....lAELA..TSQFDDTGNFSFG.............LDVTVN   99
DSSP  EL.lhhHHHHHHHHHH.....hLLLL..LLLLLLLLLEEEL.............LEEEEE


DSSP  ELL........................LHHHHHHHHLLLeelleelllllllll
Query EYQ........................NPKEIVDWLAPKtahgvplwdnpvppd  131
ident                                                       
Sbjct LVRpgyrvakrdkasrsiptkhrlnpaDAVAFIESTYDV.............ev  140
DSSP  EELlllhhhhlllllllllhhhlllhhHHHHHHHLLLLL.............ll


No 36: 2DGXA  MOLECULE: KIAA0430 PROTEIN;                                          

DSSP  .......LEEEEEEE.ELLLL....LHHHHHHHHHLLLLLLEEEL....LLLEEEEEEEL
Query .......DKVXVVAE.VRPSE....DVNKVLSAISNFFDFEKXNT....GIIDILVLEAR   44
ident            |                    |                      |    
Sbjct gssgssgNGADVQVSnIDYRLsrkeLQQLLQEAFARHGKVKSVELsphtDYQLKAVVQME   60
DSSP  lllllllLLEEEEEElLLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHLLEEEEEEllllLLLLLEEEEEL


DSSP  LHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEEEelL
Query TLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFYIeyQ  104
ident  |                                                          
Sbjct NLQD.........................aigavnslHRYK....igskkiLVSLATgaS   91
DSSP  LHHH.........................hhhhhhhhLLEE....elleeeEEEELLllL


DSSP  LHHHhhhhhllleelleelllllllll
Query NPKEivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident  |                         
Sbjct GPSS......................g   96
DSSP  LLLL......................l


No 37: 2CQPA  MOLECULE: RNA-BINDING PROTEIN 12;                                    

DSSP  .............LEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLlLLLL..EEEL......LLLEE
Query .............DKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNfFDFE..KXNT......GIIDI   38
ident                                 |                           
Sbjct gssgssgassgkpGPTIIKVQnMPFTVSIDEILDFFYG.YQVIpgSVCLkynekgMPTGE   59
DSSP  lllllllllllllLLEEEEEElLLLLLLHHHHHHHLLL.LLLLllLLEEeellllLEEEE


DSSP  EEEEELLHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEE
Query LVLEARTLKSLlkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIK   98
ident                                                             
Sbjct AMVAFESRDEA.........................taavidlNDRP.....igsrkVKL   89
DSSP  EEEEELLHHHH.........................hhhhhhlLLLE.....elleeLEE


DSSP  EEEELLLHHhhhhhhllleelleelllllllll
Query FYIEYQNPKeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                  
Sbjct VLGSGPSSG........................   98
DSSP  EELLLLLLL........................


No 38: 2CG8A  MOLECULE: DIHYDRONEOPTERIN ALDOLASE 6-HYDROXYMETHYL-7,8-             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mdqlqikdlemfayhglfpsekelgqkfivsailsydmtkaatvhygelcqqwttwfqet   60
DSSP  leeeeeeeeeeeelllllhhhhhhleeeeeeeeeeellhhhhlllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ....................................................lEEEEEEE
Query ....................................................dKVXVVAE    8
ident                                                             
Sbjct sedlietvayklvertfesyplvqemklelkkpwapvhlsldtcsvtihrrkqRAFIALG  120
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeellllllllllleeeeeeeeleEEEEEEE


DSSP  ELLL...LLHHHHHHHHH.LLLLLLEEEL..LLLEEEEEEEllhhHHHHhhhhhhhlllh
Query VRPS...EDVNKVLSAIS.NFFDFEKXNT..GIIDILVLEArtlkSLLKfhrvlrneril   62
ident                          |           | |                    
Sbjct SNMGdkqANLKQAIDKLRaRGIHILKESSvlASFANQVVEV....ETWL...........  165
DSSP  ELLLlhhHHHHHHHHHHHhLLLEEEEELLllLLLEEEEEEE....EELL...........


DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeeEELHHHHHLLlllllLEEEE.EELLLHH..............
Query dsarkylxkgiegntiafXIHKQAAAVGvlsfvAIKFY.IEYQNPK..............  107
ident                        |                | |                 
Sbjct .............paqdlLETLLAIESE.lgriDLDLLfVEDQILYtddlilphpyiaer  211
DSSP  .............lhhhhHHHHHHHHHH.llllEEEEEeELLLLLLllllllllllhhhl


DSSP  .....hhhhhhllleelleelllllllll
Query .....eivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                              
Sbjct lfvleslqeiaphfihpilkqpirnlyda  240
DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhll


No 39: 2CC6A  MOLECULE: VNG1446H;                                                  

DSSP  LEEEEEEEELLL....llhhhHHHHHHLLLL.LLEEEL.............llLEEEEEE
Query DKVXVVAEVRPS....edvnkVLSAISNFFD.FEKXNT.............giIDILVLE   42
ident     |                         |                             
Sbjct VFKKVLLTGTSEesftaaaddAIDRAEDTLDnVVWAEVvdqgveigaveertyQTEVQVA   60
DSSP  LEEEEEEEEEELllhhhhhhhHHHHHHHHLLlEEEEEEeeeeeellllllleeEEEEEEE


DSSP  Ellhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeee
Query Artlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyie  102
ident                                                             
Sbjct F...........................................................   61
DSSP  E...........................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query yqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                              
Sbjct ..........................eld   64
DSSP  ..........................ell


No 40: 2ARHA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1966;                              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct daxvkyeellktlenginseegeirlvrksqgrfkeefnfdlslgskplltlkvflgrkp   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeellllleeeeeeeelleeeeeeeeelllll


DSSP  ..................................leEEEEEEELL.LLLH..........
Query ..................................dkVXVVAEVRP.SEDV..........   15
ident                                          |     |            
Sbjct ywqpwvevfgvnpnlrnvffgseaerklyeflsehfGRIFVEYFEdKETTyelqkgvppa  120
DSSP  lllleeeeelllhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllLEEEEELLLlHHHHhhhhllllhh


DSSP  .HHHHHHHHLlLLLLEEEL........LLLEEEEEEELLHHhhhhhhhhhhhlllhhhhh
Query .NKVLSAISNfFDFEKXNT........GIIDILVLEARTLKsllkfhrvlrnerildsar   66
ident                                    |                        
Sbjct lSRLGFELLK.LGYTYFRDwfipeglxEGGHKIQAEKPKTE.........eakkrhlenl  170
DSSP  hLHHHHHHHL.LLLLEEEEllllllllLLLLEEEEELLLLH.........hhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhlllleeeeeelhhhhhLLLLlllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleellll
Query kylxkgiegntiafxihkqaaaVGVLsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdn  126
ident                                                             
Sbjct kkefeefigkcedeglikkvkeRYNF..................................  196
DSSP  hhhhhhhhlllllhhhhhhhhhHHHH..................................


DSSP  lllll
Query pvppd  131
ident      
Sbjct ...le  198
DSSP  ...ll


No 41: 2UUUA  MOLECULE: ALKYLDIHYDROXYACETONEPHOSPHATE SYNTHASE;                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mgspkehidlyqqikwngwgdtrkflhqlkpsgtiamttpevssvplpslrgfikkeltk   60
DSSP  lllllllllhhhhllllllllllleeeelllllleeeelllllleelllhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pfvldetpalqienihvdppkqypefvrelkafflpdqlkddklarithtfgkslrdlir  120
DSSP  lllllllllllhhhlllllllllhhhhhhhhllllhhheellhhhhhhllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vrigqvknapdlivlphsheeverlvqlahkynvviipmgggsnivgaiepvsnerftvs  180
DSSP  hhllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllllllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct idmrrmnkvlwvdrremtaciqvgimgpelekqlhkqgvslghdpdsfefstlggwlatc  240
DSSP  eelllllleeeeelllleeeeellllhhhhhhhhhhlleelllllllhhhllhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ssghqsdkygdiedmavsfrtvtptgtlelrginykhiilgsegtlgiiteavmkvhavp  300
DSSP  lllllhhhhllhhhheeeeeeeelleeelllllllhhhhlllllllleeeeeeeeleell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qaveyygflfptfahavsalqqirsseviptmirvydpeetqlsfawkpskgavseftsa  360
DSSP  leeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhhhhhhhlllllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mvkkylhyirsfdfknvclsiigfegpkkvvdfhrtsvfdilsknaafglgsapgktwae  420
DSSP  hhhhhhhhllllllllleeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllhhhh


DSSP  .................LEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHLLLL..........lLEEEL
Query .................DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISNFFD..........fEKXNT   33
ident                          |                |                 
Sbjct krydlpyirdflldhnmWVDVAETTVSY.ANLQTLWKDAKQTFVkhfkdqgipawICAHI  479
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleEEEEEEEEEEH.HHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllleeEEEEE


DSSP  ....LLLEEEEEEELLhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlLLLEEE....eEELHH
Query ....GIIDILVLEARTlksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiEGNTIA....fXIHKQ   85
ident          |                                      |           
Sbjct shtyTNGVCLYFIFAS.....................kqnenkdMAQYIEakklmTDIIF  518
DSSP  eeeeLLEEEEEEEEEE.....................ellllllLHHHHHhhhhhHHHHH


DSSP  HhhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleeLLEELLlllllll
Query AaavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktaHGVPLWdnpvppd  131
ident                                               
Sbjct K.......yggslsrgwinvyrslketidpkdiCNPRKL.......  550
DSSP  H.......llllllllhhhhhhhhhhhhlllllLLLLLL.......


No 42: 2FKLA  MOLECULE: AMYLOID BETA A4 PROTEIN PRECURSOR;                         

DSSP  ......LEEEEEEE.elLLLLHHHHHHHHHLLLL.....LLEEEL......lllEEEEEE
Query ......DKVXVVAE.vrPSEDVNKVLSAISNFFD.....FEKXNT......giiDILVLE   42
ident              |     |                                        
Sbjct allvpdKCKFLHQErmdVCETHLHWHTVAKETCSekstnLHDYGMllpcgidkfRGVEFV   60
DSSP  llleelLLEEEEEElllLLEEHHHHHHHHHHHHHhlleeEEEEEEeeelllleeEEEEEE


DSSP  ELLHhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeelhhhhhlllllllleeeeee
Query ARTLksllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihkqaaavgvlsfvaikfyie  102
ident    |                                                        
Sbjct CCPL........................................................   64
DSSP  EEEL........................................................


DSSP  lllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query yqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                              
Sbjct .............................   64
DSSP  .............................


No 43: 2FB0A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  ....LEEEEEEEELLlLLHHHHHHH.........hhlllllLEEEL..LLLEEEEEEELL
Query ....DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSA.........isnffdfEKXNT..GIIDILVLEART   45
ident         |   |       |   |                          |        
Sbjct ansxIRLNVFVRVNE.TNREKAIEAakeltacslkeegciaYDTFEssTRRDVFXICETW   59
DSSP  llllEEEEEEEELLL.LLHHHHHHHhhhhhhhhllllleeeEEEEEllLLLLEEEEEEEE


DSSP  ..hhhHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEEL
Query ..lksLLKFHRVLrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEY  103
ident      |                                   |            |     
Sbjct qnaevLAAHEKTA...................hfaqyvGIIQE.......laEXKLEKFE   93
DSSP  llhhhHHHHLLLH...................hhhhhhHHHHH.......hlEEEEEEEE


DSSP  Llhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query Qnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                             
Sbjct F...........................   94
DSSP  L...........................


No 44: 1J4WA  MOLECULE: FUSE BINDING PROTEIN;                                      

DSSP  LEEEEEEEELLlLLHHHHHH....HHHLLL..LLLEEEL......LLLEEEEEEELLHhh
Query DKVXVVAEVRPsEDVNKVLS....AISNFF..DFEKXNT......GIIDILVLEARTLks   48
ident               |  |       |                       |          
Sbjct GSHMIDVPIPR.FAVGIVIGrngeMIKKIQndAGVRIQFkpddgtTPERIAQITGPPD..   57
DSSP  LLEEEEEEEEH.HHHHHHHLhhhhHHHHHHhhHLLEEEEelllllLLEEEEEEEELHH..


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHH......................
Query llkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQA......................   86
ident                                                             
Sbjct .......................raqhaaeiitDLLRSvqqefnfivptgktgliigkgg   94
DSSP  .......................hhhhhhhhhhHHHHHhlleeeeeeelllhhhhhlhhh


DSSP  ......hhlllllllleeeeeelllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query ......aavgvlsfvaikfyieyqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                                    
Sbjct etiksisqqsgarielqrnpppnadpnmklftirgtpqqidyarqlieeki  145
DSSP  hhhhhhhhhhlleeeeelllllllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl


No 45: 2OKQA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YBAA;                                 

DSSP  ............LEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHL........llllLEEEL.......
Query ............DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISN........ffdfEKXNT.......   33
ident                  |  |                                       
Sbjct tenlyfqsnamkYVDGFVVAVPA.DKKDAYREMAAKaaplfkefgalrIVECWasdvpdg   59
DSSP  lllhhhhhhlllEEEEEEEEEEH.HHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllleEEEEEeeellll


DSSP  ............LLLEEEEEEELL...hhhhHHHHHHHHHLllhhhhhhhhhhhllllee
Query ............GIIDILVLEART...lkslLKFHRVLRNErildsarkylxkgiegnti   78
ident                                                             
Sbjct kvtdfrmavkaeENEEVVFSWIEYpskevrdAANQKMMSDP...................  100
DSSP  llllhhhhllllLLEEEEEEEEEEllhhhhhHHHHHHHLLH...................


DSSP  eeeelhhhhhLLLL...llLLEEEEEELLLhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query afxihkqaaaVGVL...sfVAIKFYIEYQNpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident            |                                            
Sbjct ......rmkeFGESmpfdgKRMIYGGFESI.......................ide  127
DSSP  ......hhhhLLLLlllllLLLEEEEEEEE.......................eel


No 46: 2HGNA  MOLECULE: HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN F;                 

DSSP  lEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLlLLLLEEEL......lLLEEEEEEELLHHHhhhhh
Query dKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNfFDFEKXNT......gIIDILVLEARTLKSllkfh   53
ident     |           |      |                        |  |        
Sbjct tGHCVHMRgLPYKATENDIYNFFSP.LNPVRVHIeigpdgrVTGEADVEFATHEE.....   54
DSSP  lLLLEELLlLLLLLLHHHHHHHHLL.LLLLEEELlllllllLLLLLEEELLHHHH.....


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEElllhhhhhhhh
Query rvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIEyqnpkeivdwl  113
ident                                 |                           
Sbjct .......................avaamSKDRA..nmqhryiELFLNST...........   78
DSSP  .......................hhhhlLLLLL..lllllllLLEELLL...........


DSSP  llleelleelllllllll
Query apktahgvplwdnpvppd  131
ident                   
Sbjct ...............tga   81
DSSP  ...............lll


No 47: 2CZ4A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0516;                             

DSSP  ....LEEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHLLlLLLEEEL.................llLEEE
Query ....DKVXVVAEVRPsEDVNKVLSAISNFfDFEKXNT.................giIDIL   39
ident         |                                                  |
Sbjct xdlvPLKLVTIVAES.LLEKRLVEEVKRL.GAKGYTItpargegsrgirsvdwegqNIRL   58
DSSP  lleeEEEEEEEEEEH.HHHHHHHHHHHHL.LLLLLEEeeellllllllllllllllEEEE


DSSP  EEEElLHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHHHHlllllllLEEE
Query VLEArTLKSllkfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQAAAvgvlsfvAIKF   99
ident                                              |              
Sbjct ETIV.SEEV............................alrilQRLQEEY.fphyavIAYV   88
DSSP  EEEE.LHHH............................hhhhhHHHHHHL.llllllEEEE


DSSP  EEELllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query YIEYqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                 
Sbjct ENVW....................vvrgekyv  100
DSSP  EEEE....................eelhhhhl


No 48: 1F0XA  MOLECULE: D-LACTATE DEHYDROGENASE;                                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nkaflnelarlvgsshlltdpaktaryrkgfrsgqgdalavvfpgsllelwrvlkacvta   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhlhhheellhhhhhhhhllllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dkiilmqaantgltegstpngndydrdvviistlrldklhvlgkgeqvlaypgttlysle  120
DSSP  lleeeeelllllllllllllllllllleeeeelllllleeeelllleeeelllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kalkplgrephsvigsscigasviggicnnsggslvqrgpaytemslfarinedgkltlv  180
DSSP  hhhhhhleelllllhhhhhlllhhhhhhllllllllllllllllleeeeeellllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nhlgidlgetpeqilskldddrikdddvrhdgrhahdydyvhrvrdieadtparynadpd  240
DSSP  elllllllllhhhhhhhhhlllllhhhllllllllllllhhhhhhlllllllllllllhh


DSSP  ..........................LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHL..llLLLEEE
Query ..........................DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISN..ffDFEKXN   32
ident                                       |        |            
Sbjct rlfessgcagklavfavrldtfeaekNQQVFYIGTNQPEVLTEIRRHILAnfenLPVAGE  300
DSSP  hllllllllllleeeeeeeeleelllLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHhlllLLLEEE


DSSP  L....................llLEEEEEEELLhHHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhh
Query T....................giIDILVLEARTlKSLLKfhrvlrnerildsarkylxkg   72
ident                           | |                               
Sbjct YmhrdiydiaelpprmknwrdkyEHHLLLKMAG.DGVGE.....................  338
DSSP  EeehhhhhhhlllhhhhhhhhhlLEEEEEEELL.LHHHH.....................


DSSP  lllleeeeeELHHHhhlllllllLEEEEEE..............................
Query iegntiafxIHKQAaavgvlsfvAIKFYIE..............................  102
ident                                                             
Sbjct ....akswlVDYFK.....qaegDFFVCTPeegskaflhrfaaagaairyqavhsdeved  389
DSSP  ....hhhhhHHHHH.....hlllEEEELLHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  102
ident                                                             
Sbjct ilaldialrrndtewyehlppeidsqlvhklyyghfmcyvfhqdyivkkgvdvhalkeqm  449
DSSP  eeeeeeelllllllllllllhhhhlleeeeeeeeelllleeeeeeeeellllhhhhhhhh


DSSP  ........................lllhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query ........................yqnpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident                                                      
Sbjct lellqqrgaqypaehnvghlykapetlqkfyrendptnsmnpgigktskrknw  502
DSSP  hhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllllll


No 49: 2OF3A  MOLECULE: ZYG-9;                                                     

DSSP  ...............................................leeeeeeeeLLLL
Query ...............................................dkvxvvaevRPSE   13
ident                                                             
Sbjct aelllsdnedkkqrikeekqlklvkwnfqaptdehisqlqtllgnqakvslmsqlfHKDF   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlLLLH


DSSP  ..LHHHH......................................HHHHHLL........
Query ..DVNKV......................................LSAISNF........   25
ident                                                             
Sbjct kqHLAALdslvrladtsprsllsnsdlllkwctlrffetnpaaliKVLELCKvivelird  120
DSSP  hhHHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhHHHHHHHhhhhhhhh


DSSP  ........lllleeelllleeeeeEELLHHH.HHHHHHHHHhLLLHHHHHHHHHHHL.LL
Query ........fdfekxntgiidilvlEARTLKS.LLKFHRVLRnERILDSARKYLXKGI.EG   75
ident                               |                     |       
Sbjct tetpmsqeevsafvpylllktgeaKDNMRTSvRDIVNVLSD.VVGPLKMTPMLLDALkSK  179
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHhHHHHHHHHH.HHLHHHHHHHHHHHHhLL


DSSP  LEeeeeelhhhhhlllllllleeeeeELLLHHHHHHHhllleellEELL...........
Query NTiafxihkqaaavgvlsfvaikfyiEYQNPKEIVDWlapktahgVPLW...........  124
ident |                                 |                         
Sbjct NA........................RQRSECLLVIE....yyitNAGIsplkslsvekt  211
DSSP  LH........................HHHHHHHHHHH....hhhhHHLLhhhhhhlhhhh


DSSP  ................................................lllllll
Query ................................................dnpvppd  131
ident                                                        
Sbjct vapfvgdkdvnvrnaainvlvacfkfegdqmwkaagrmadkdkslveerikrtgv  266
DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhll


No 50: 2CJKA  MOLECULE: 5'-R(*UP*AP*UP*AP*UP*AP*UP*AP)-3';                         

DSSP  .lEEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEL.......LLLEEEEEEEllhhHHHH
Query .dKVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNT.......GIIDILVLEArtlkSLLK   51
ident                                                  |          
Sbjct keSCKMFIGgLNWDTTEDNLREYFGKYGTVTDLKImkdpatgRSRGFGFLSF...eKPSS   57
DSSP  lhHHEEEELlLLLLLLHHHHHHHHLLLLLEEEEELlllllllLLLLLEEEEE...lLLHH


DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeEEELHHhhhlllllllLEEEE.eelllhhhhh
Query fhrvlrnerildsarkylxkgiegntiaFXIHKQaaavgvlsfvAIKFY.ieyqnpkeiv  110
ident                                               |             
Sbjct ........................vdevVKTQHI....ldgkviDPKRAiprdeqdktgk   89
DSSP  ........................hhhhHHLLLE....elleelLLEELllhhhhhhlee


DSSP  hhhlllEELL..................................................
Query dwlapkTAHG..................................................  120
ident                                                             
Sbjct ifvggiGPDVrpkefeeffsqwgtiidaqlmldkdtgqsrgfgfvtydsadavdrvcqnk  149
DSSP  eeeeeeLLLLlhhhhhhhhhlllllleeellllllllllleeeeeeellhhhhhhhhhll


DSSP  .......eelllllllll
Query .......vplwdnpvppd  131
ident                   
Sbjct fidfkdrkieikraeprh  167
DSSP  eelllllleeeeelllll


No 51: 2A10A  MOLECULE: CARBON DIOXIDE CONCENTRATING MECHANISM PROTEIN             

DSSP  .LEEEEEEEELllLLHHHHHHHHHLLL.LLLEEEL..LLLEEEEEEELLHHHHhhhhhhh
Query .DKVXVVAEVRpsEDVNKVLSAISNFF.DFEKXNT..GIIDILVLEARTLKSLlkfhrvl   56
ident    |                 |               |                      
Sbjct qSAVGSIETIG.fPGILAAADAMVKAGrITIVGYIraGSARFTLNIRGDVQEV.......   52
DSSP  lLEEEEEEEEL.hHHHHHHHHHHHHHLlLEEEEEEeeELLEEEEEEEELHHHH.......


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeeLHHHhhlllllllLEEEEEELllHHHHhhhhlll
Query rnerildsarkylxkgiegntiafxiHKQAaavgvlsfvAIKFYIEYqnPKEIvdwlapk  116
ident                                             |               
Sbjct .................ktamaagidAINR...tegadvKTWVIIPR.pHENV..vavlp   89
DSSP  .................hhhhhhhhhHHHL...llllleEEEEEELL.lLHHH..hhhll


DSSP  eelleelllllllll
Query tahgvplwdnpvppd  131
ident                
Sbjct idfspevepfreaae  104
DSSP  llllhhhhhhhhhhl


No 52: 1VQSA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN AGR_L_1239;                           

DSSP  .......LEEEEEEEELLLL..LHHH......hhhhhhllllLLEEEL...llLEEEEEE
Query .......DKVXVVAEVRPSE..DVNK......vlsaisnffdFEKXNT...giIDILVLE   42
ident                          |                           |   |  
Sbjct hhhhhhxFYEIRTYRLKNGAipAYLKvvedegieiqkshlgeLVGYFFseigpINEIVHI   60
DSSP  lllllllEEEEEEEEELLLLhhHHHHhhhhlhhhhhhhhhllEEEEEEeeellLLEEEEE


DSSP  ELL...hHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhhhhhhlllleeeeeelhhHHHLllllllLEEE
Query ART...lKSLLKFHRVLRNErildsarkylxkgiegntiafxihkqAAAVgvlsfvAIKF   99
ident               |                                             
Sbjct WAFssldDRAERRARLXADP......................rwlsFLPKirdlieVAEN   98
DSSP  EEEllhhHHHHHHHHHHHLH......................hhhhHLHHhhlleeEEEE


DSSP  EEELLLhhhhhhhhllleelleelllllllll
Query YIEYQNpkeivdwlapktahgvplwdnpvppd  131
ident  |                              
Sbjct KIXKPA....................rfsplx  110
DSSP  EEEEEL....................llllll


No 53: 1KWMA  MOLECULE: PROCARBOXYPEPTIDASE B;                                     

DSSP  ........LEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHLllLLLEEEL......llLEEEEEEElLH
Query ........DKVXVVAEVRPSEDVNKVLSAISNffDFEKXNT......giIDILVLEArTL   46
ident                 |      |      |                             
Sbjct hhggehfeGEKVFRVNVEDENHINIIRELAST.tQIDFWKPdsvtqikpHSTVDFRV.KA   58
DSSP  lllhhhhlLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHH.lLEEEEELllhhhlllLEEEEEEE.LH


DSSP  HHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeelHHHHhlllllllLEEE.EEELLL
Query KSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxihKQAAavgvlsfvAIKF.YIEYQN  105
ident                                                    |       |
Sbjct EDTVT............................venvLKQN......elQYKVlISNLRN   84
DSSP  HHHHH............................hhhhHHHL......llLEEEeELLHHH


DSSP  HHHhhhhhlLLEELL.............................................
Query PKEivdwlaPKTAHG.............................................  120
ident   |                                                         
Sbjct VVE...aqfDSRVRAtghsyekynkwetieawtqqvatenpalisrsvigttfegraiyl  141
DSSP  HHH...hllLLLLLLllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  120
ident                                                             
Sbjct lkvgkagqnkpaifmdcgfharewispafcqwfvreavrtygreiqvtellnkldfyvlp  201
DSSP  eeelllllllleeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  120
ident                                                             
Sbjct vlnidgyiytwtksrfwrktrsthtgsscigtdpnrnfdagwceigasrnpcdetycgpa  261
DSSP  lllhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  120
ident                                                             
Sbjct aeseketkaladfirnklssikayltihsysqmmiypysyayklgennaelnalakatvk  321
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  120
ident                                                             
Sbjct elaslhgtkytygpgattiypaaggsddwaydqgirysftfelrdtgrygfllpesqira  381
DSSP  hhhhhhlllleeeehhhhlllllllhhhhhhhlllleeeeeeellllllhhhllhhhhhh


DSSP  ..........eelllllllll
Query ..........vplwdnpvppd  131
ident                      
Sbjct tceetflaikyvasyvlehly  402
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 54: 1CVJA  MOLECULE: POLYDENYLATE BINDING PROTEIN 1;                            

DSSP  leEEEEEE.ELLLLLHHHHHHHHHLLLLLLEEEL.......LLLEEEEEEELLHHHhhhh
Query dkVXVVAE.VRPSEDVNKVLSAISNFFDFEKXNT.......GIIDILVLEARTLKSllkf   52
ident            |           |                                    
Sbjct ..ASLYVGdLHPDVTEAMLYEKFSPAGPILSIRVcrdmitrRSLGYAYVNFQQPAD....   54
DSSP  ..LEEEEElLLLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEEEEeelllllLEEEEEEEEELLHHH....


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHhhhlllllllLEEEE............
Query hrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQaaavgvlsfvAIKFY............  100
ident                                             |               
Sbjct .....................aeraldtmNFDV....ikgkpvRIMWSqrdpslrksgvg   89
DSSP  .....................hhhhhlllLLLE....elleelEEEELllllhhhhllll


DSSP  .......................................eelllhhhhhhhhllLEELLE
Query .......................................ieyqnpkeivdwlapKTAHGV  121
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Sbjct nifiknldksidnkalydtfsafgnilsckvvcdengskgygfvhfetqeaaerAIEKMN  149
DSSP  eeeeelllllllhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllleeeeellhhhhhhHLLLLL


DSSP  ..........elllllllll
Query ..........plwdnpvppd  131
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Sbjct gmllndrkvfvgrfksrker  169
DSSP  eeeelleeeeeeelllllll


No 55: 2GAGC  MOLECULE: HETEROTETRAMERIC SARCOSINE OXIDASE ALPHA-SUBUNIT;          

DSSP  ..............................LEEEEEEEELLLL.LHHHHHHHHH......
Query ..............................DKVXVVAEVRPSE.DVNKVLSAIS......   23
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Sbjct tplrhspaehldtvmdaasvagrvelreiaFTTQISLRCAPGTqAHAALAAATGaglpak   60
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhlllllleeeellLLEEEEEELLLLLhHHHHHHHHHLllllll


DSSP  .....lllllLEEELLlLEEEEEEELlhHHHHhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllllee
Query .....nffdfEKXNTGiIDILVLEARtlKSLLkfhrvlrnerildsarkylxkgiegnti   78
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Sbjct vgevageaqgTAVLWLaPDEFLATSA..ENTE.........................lgg   93
DSSP  lllleellllLEEEEEeLLEEEEEEL..LLLL.........................hhh


DSSP  eeeeLHHHhhlllllllLEEEEEE....................................
Query afxiHKQAaavgvlsfvAIKFYIE....................................  102
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Sbjct vlsaALGD......apgQVVDLSAnrsvleltgpdaplvlrkscpadlhprafavnqaiv  147
DSSP  hhhhHHLL......lllEEEELLLlllleeeelllhhhhhllllllllllllllllleee


DSSP  ....................llLHHHhhhhhllLEELLEelllllllll
Query ....................yqNPKEivdwlapKTAHGVplwdnpvppd  131
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Sbjct tsvanipvllwrtgeqawrimpRASFtehtvhwLVDAMS......efas  190
DSSP  eeelleeeeeeeeelleeeeeeLHHHhhhhhhhHHHHHH......hhhl


No 56: 2DNLA  MOLECULE: CYTOPLASMIC POLYADENYLATION ELEMENT BINDING                

DSSP  ......LEEEEEE.EELLLLLHHHHHHHHHLLLLLlEEELL..........lLEEEEEEE
Query ......DKVXVVA.EVRPSEDVNKVLSAISNFFDFeKXNTG..........iIDILVLEA   43
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Sbjct gssgssGSRKVFVgGLPPDIDEDEITASFRRFGPL.VVDWPhkaesksyfppKGYAFLLF   59
DSSP  llllllLLLLEEEeLLLLLLLHHHHHHHLLLLLLL.LEELLlllllllllllLLEEEELL


DSSP  LLHHHHHHHhhhhhhlllhhhhhhHHHHHlllleeeEEELHHhhhlllllllLEEEEEEl
Query RTLKSLLKFhrvlrnerildsarkYLXKGiegntiaFXIHKQaaavgvlsfvAIKFYIEy  103
ident     |                                                       
Sbjct QEESSVQAL..........idaclEEDGK.......LYLCVS..sptikdkpVQIRPWN.   99
DSSP  LLHHHHHHH..........hhhleEELLE.......EEEEEL..lllllleeEEEELLL.


DSSP  llhhhhhhhhllleelLEELLLLLllll
Query qnpkeivdwlapktahGVPLWDNPvppd  131
ident                        |    
Sbjct ............lsdsDFVMDSGP.ssg  114
DSSP  ............llllLLLLLLLL.lll


No 57: 1CBKA  MOLECULE: PROTEIN (7,8-DIHYDRO-6-HYDROXYMETHYLPTERIN-                

DSSP  .lEEEEEEEELLL...LLHHHHHHHHHLL..lLLLEEEL............LLLEEEEEE
Query .dKVXVVAEVRPS...EDVNKVLSAISNF..fDFEKXNT............GIIDILVLE   42
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Sbjct miTAYIALGSNLNtpvEQLHAALKAISQLsntHLVTTSSfykskplgpqdqPDYVNAVAK   60
DSSP  leEEEEEEEELLLlhhHHHHHHHHHHHLLlleEEEEELLleeellllllllLLEEEEEEE


DSSP  EllhhHHHHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllleeeeeELHHH......hhlllllllL
Query ArtlkSLLKfhrvlrnerildsarkylxkgiegntiafxIHKQA......aavgvlsfvA   96
ident                                                             
Sbjct I....ETEL.....................splklldelQRIENeqgrvrlrrwgertlD   95
DSSP  E....EELL.....................lhhhhhhhhHHHHHhllllllllllllllE


DSSP  EEE.EEEL................................LLHHHhhhhhllleelleel
Query IKF.YIEY................................QNPKEivdwlapktahgvpl  123
ident                                           |                 
Sbjct LDIlLYGNeiiqnerltiphydmhnrefvivplfeiasdlVLPNS...qiitelvkqfad  152
DSSP  EEEeEELLlleelllleellhhhhhlhhhhhhhhhhllllLLLLL...llhhhhhhhhll


DSSP  llllllll
Query wdnpvppd  131
ident         
Sbjct hkmiklnp  160
DSSP  llleelll