DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1TLQA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YPJQ;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1TLQ-A 34.4  0.0  161   161  100   HYPOTHETICAL PROTEIN YPJQ;                                 "         
   2:  2NRK-A  4.1  3.5   69   165   13   HYPOTHETICAL PROTEIN GRPB;                                 "         
   3:  1H3L-A  3.8  3.6   75    75    7   RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR;                               "         
   4:  1Q9C-A  3.2  4.0   93   164    6   SON OF SEVENLESS PROTEIN;                                  "         
   5:  2O7G-A  2.8  3.1   70    88   14   PROBABLE RNA POLYMERASE SIGMA-C FACTOR;                    "         
   6:  2G8L-A  2.6  3.3   59   284   12   287AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;                           "         
   7:  1VLU-A  2.6  6.1   82   395   10   GAMMA-GLUTAMYL PHOSPHATE REDUCTASE;                        "         
   8:  2G3Q-A  2.5  1.8   42    43   10   PROTEIN YBL047C;                                           "         
   9:  1A6Q-A  2.5  3.6   63   363   11   PHOSPHATASE 2C;                                            "         
  10:  2P5T-B  2.4  3.2   65   244    5   FRAGMENT OF PEZA HELIX-TURN-HELIX MOTIF;                   "         
  11:  1XM5-A  2.4  4.3   70   152    7   HYPOTHETICAL UPF0054 PROTEIN YBEY;                         "         
  12:  1T72-A  2.4  6.2   88   215   11   PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG;           "         
  13:  1G5A-A  2.4  4.3   73   628    7   AMYLOSUCRASE;                                              "         
  14:  1AIP-C  2.4  1.9   45   195    4   ELONGATION FACTOR TU;                                      "         
  15:  2EGH-A  2.3  4.3   69   400    9   1-DEOXY-D-XYLULOSE 5-PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE;           "         
  16:  1I9Y-A  2.3  6.2   56   336   11   PHOSPHATIDYLINOSITOL PHOSPHATE PHOSPHATASE;                "         
  17:  2E4O-A  2.2  2.7   60   295    8   ARISTOLOCHENE SYNTHASE;                                    "         
  18:  1WR1-B  2.2  3.6   50    58    8   UBIQUITIN;                                                 "         
  19:  2JOL-A  2.1  4.1   85   184    9   PUTATIVE G-NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR;                     "         
  20:  1B0U-A  2.1  3.4   52   257   17   HISTIDINE PERMEASE;                                        "         
  21:  2OOA-A  2.0  2.2   41    42    7   E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE CBL-B;                         "         
  22:  2H8A-A  2.0  3.5   64   121    8   MICROSOMAL GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 1;                    "         
  23:  1EFU-B  2.0  2.0   45   282    7   ELONGATION FACTOR TU;                                      "         
-

No 1: 1TLQA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YPJQ;                                 

DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH
Query YTXNEXVDITKDXLNKRGVXIEDIARIVQKLQEKYNPNLPLSVCXENVEKVLNKREIIHA   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct YTXNEXVDITKDXLNKRGVXIEDIARIVQKLQEKYNPNLPLSVCXENVEKVLNKREIIHA   60
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLLLLLLHHHHLLHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHLL
Query VLTGLALDQLAEQKLLPEPLQHLVETDEPLYGIDEIIPLSIVNVYGSIGLTNFGYLDKEK  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct VLTGLALDQLAEQKLLPEPLQHLVETDEPLYGIDEIIPLSIVNVYGSIGLTNFGYLDKEK  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLLLLLLHHHHLLHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLHHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHL
Query IGIIKELDESPDGIHTFLDDIVAALAAAAASRIAHTHQDLQ  161
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct IGIIKELDESPDGIHTFLDDIVAALAAAAASRIAHTHQDLQ  161
DSSP  LLHHHHLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHL


No 2: 2NRKA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN GRPB;                                 

DSSP  ................................llhhhhHHHHhhHHHH............
Query ................................ytxnexVDITkdXLNK............   16
ident                                       |                     
Sbjct ivteyqpawveqfeeeaqalkqilkenclkvehigstsVPNL..AAKPiidflviveeie   58
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeeeeelhhhLLLL..LLLLleeeeeeelllh


DSSP  ........................llllhhhhhhhhhhhllllLLLLLHHHHHHHHHHHL
Query ........................rgvxiediarivqklqekyNPNLPLSVCXENVEKVL   52
ident                                              |             |
Sbjct kvdllqweferigyeyxgefglsgrrylrkgpikrthhvhiyqFDNTQEILRHLAFRNYL  118
DSSP  hhhhhhhhhhhllleelllllllleeeeeelllllleeeeeeeLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhh
Query N.KREIIHAVLTGLALDQLAEQKllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsiglt  111
ident      |     |       |                                        
Sbjct ReNPAIATTYGTLKKQLAQAHPD.....................................  141
DSSP  HhLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.....................................


DSSP  hhhhhhhllllhhhhlllllLLLLllHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhl
Query nfgyldkekigiikeldespDGIHtfLDDIVAALAAAAASRIAHthqdlq  161
ident                     |      |         |            
Sbjct ..................siDKYX..KDAFIKKIEKEALKKYWE......  165
DSSP  ..................lhHHHL..LHHHHHHHHHHHHHHHLL......


No 3: 1H3LA  MOLECULE: RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR;                               

DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHhllLLHHHHHHHHHHHLLlllLLLLHHHHHHHHHHHLLLhhHHHH
Query yTXNEXVDITKDXLNkrgVXIEDIARIVQKLQEkynPNLPLSVCXENVEKVLNKreIIHA   60
ident     |                                                     | 
Sbjct .STAERSARFERDAL...EFLDQMYSAALRMTR...NPADAEDLVQETYAKAYA..SFHQ   51
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHH...HLHHHHHHHHHHHHL...LHHHHHHHHHHHHHHHHH..HHHH


DSSP  HHHHHhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
Query VLTGLaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkek  120
ident    |                                                        
Sbjct FREGT.......................................................   56
DSSP  LLLLL.......................................................


DSSP  llhhhhlllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhl
Query igiikeldespdgihtfldDIVAALAAAAASRIAHTHQdlq  161
ident                       | |                
Sbjct ...................NLKAWLYRILTNTFINSYR...   75
DSSP  ...................LHHHHHHHHHHHHHHHLLL...


No 4: 1Q9CA  MOLECULE: SON OF SEVENLESS PROTEIN;                                  

DSSP  ..LLHHH..hhHHHHhhhhhlllLHHHHHHHHHHHLLllllLLLHHhhHHHHHHHLLLhh
Query ..YTXNE..xvDITKdxlnkrgvXIEDIARIVQKLQEkynpNLPLSvcXENVEKVLNKre   56
ident   |                                       |           |     
Sbjct lpYEFFSeenaPKWR......glLVPALKKVQGQVHP....TLESN..DDALQYVEEL..   46
DSSP  llLLLLLlllhHHHL......llLHHHHHHHHHHHLL....LLLLL..HHHHHHHHHH..


DSSP  HHHHHHHHhhhhhhhhlllllllhhhhHHHLLllLLHHhhllhhhhhllhhhhhhhhhHH
Query IIHAVLTGlaldqlaeqkllpeplqhlVETDEplYGIDeiiplsivnvygsigltnfgYL  116
ident |                                                           
Sbjct ILQLLNXL...............cqaqPRSASdvEERV..........qksfphpidkWA   81
DSSP  HHHHHHHH...............hlllLLLLLhhHHHH..........hhlllllhhhHH


DSSP  HHllllhhhHLLL..................lLLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH
Query DKekigiikELDE..................sPDGI.HTFLDDIVAALAAAAASRIAHTH  157
ident             |                                   |           
Sbjct IA....daqSAIEslpvekihpllkevlgykiDHQVsVYIVAVLEYISADILKLAGNYVR  137
DSSP  HH....hhhHHHLlllhhhhhhhhhhhhllllLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHH.......................l
Query QDL.......................q  161
ident                            
Sbjct NIRhyeitkqdikvaxcadkvlxdxfh  164
DSSP  HHLlllllhhhhhhhhhllhhhhhhll


No 5: 2O7GA  MOLECULE: PROBABLE RNA POLYMERASE SIGMA-C FACTOR;                    

DSSP  ..........llhhhhHHHHhHHHHhllLLHHHHHHHHHHHLL.lLLLLLLHHHHHHHHH
Query ..........ytxnexVDITkDXLNkrgVXIEDIARIVQKLQE.kYNPNLPLSVCXENVE   49
ident                        |      |      |                  |   
Sbjct tasddeavtalalsaaKGNG.RALE...AFIKATQQDVWRFVAylSDVGSADDLTQETFL   56
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhLLLH.HHHH...HHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhLLHHhhhllhhhh
Query KVLNKreIIHAvltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiIPLSivnvygsig  109
ident        |                                          |         
Sbjct RAIGA..IPRF....................................SARS.........   69
DSSP  HHHHH..HHHL....................................LLLL.........


DSSP  hhhhhhhhhllllhhhhlllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhl
Query ltnfgyldkekigiikeldespdgihtfldDIVAALAAAAASRIAHTHQdlq  161
ident                                    | | |    |       
Sbjct ..............................SARTWLLAIARHVVADHIR...   88
DSSP  ..............................LHHHHHHHHHHHHHHHHLL...


No 6: 2G8LA  MOLECULE: 287AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;                           

DSSP  llhhhhhhhhhHHHHhllLLHHHHHHHhHHHLlllLLLL.LHHHHHHHHHHHLLLhhhhh
Query ytxnexvditkDXLNkrgVXIEDIARIvQKLQekyNPNL.PLSVCXENVEKVLNKreiih   59
ident                    |     ||                  |    | | |     
Sbjct .......xkvqYECL..tCXANQCQRI.VEXA...TQDXdIRRRAXILAAKLLAK.....   42
DSSP  .......llllLLHH..hHHHHHHHHH.HHHH...LLLHhHHHHHHHHHHHHHHH.....


DSSP  hHHHHHhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhl
Query aVLTGLaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldke  119
ident                                                             
Sbjct eYNENA......................................................   48
DSSP  hLLLLL......................................................


DSSP  lllhhhhllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................
Query kigiikeldespdgihtFLDDIVAALAAAAASRIA.........................  154
ident                                                             
Sbjct .................IPAIAGSLIFLELYKFLGnddpfieyklkseexarkvadiikr   91
DSSP  .................LHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  154
ident                                                             
Sbjct klkldfelavklaiignvidfsvgfspedleeevekxlkdklyiddskelfeevkraeni  151
DSSP  hllllhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllleelhhhhhhhhhhllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  154
ident                                                             
Sbjct lyitdnvgehyfdailiekireisnaevyiagkegpiindatvedlkragleklgkvist  211
DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllllllllhhhhhhllhhhlleeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  154
ident                                                             
Sbjct gtrivgvplklvsrefxeafnkadviiakgqgnfetlseindsriffllkakcpavarel  271
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhlleeeeehhhhhhhhllllllleeeeeelllhhhhhhh


DSSP  ......lhhhhhl
Query ......hthqdlq  161
ident              
Sbjct kvpkgalvcxrnk  284
DSSP  lllllleeeeell


No 7: 1VLUA  MOLECULE: GAMMA-GLUTAMYL PHOSPHATE REDUCTASE;                        

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlLLLLLLL...LHHHHHHHHHHHLLLhhH
Query ytxnexvditkdxlnkrgvxiediarivqklqEKYNPNL...PLSVCXENVEKVLNKreI   57
ident                                             |         |     
Sbjct .................hxsssqqiaknarkaGNILKTIsneGRSDILYKIHDALKA..N   41
DSSP  .................lllhhhhhhhhhhhhHHHHLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHH..L


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLL.lLLLHHHHH................hhllllllhhhhllhh
Query IHAVLTGLALDQLAEQKL.lPEPLQHLV................etdeplygideiipls  100
ident  ||       |            |                                    
Sbjct AHAIEEANKIDLAVAKETglADSLLKRLdlfkgdkfevxlqgikdvaeledpvgkvkxar  101
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLllLHHHHHHHllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeee


DSSP  hhhllhhhhhhhhhhhhHLLL....................lhhHHLLllllLLLLLHHH
Query ivnvygsigltnfgyldKEKI....................giiKELDespdGIHTFLDD  140
ident                     |                                       
Sbjct elddgltlyqvtapvgvLLVIfesrpevianitalsiksgnaaiLKGG....KESVNTFR  157
DSSP  eeelleeeeeeeeelleEEEEellllhhhhhhhhhhhhhlleeeEELL....HHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLHH...........................................
Query IVAALAAAAASRIAHTH...........................................  157
ident   |                                                         
Sbjct EXAKIVNDTIAQFQSETgvpvgsvqlietrvsdlldqdeyidlvvprgsnalvrkikdtt  217
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHlllllleeelllllhhhhhlllllleeeeellhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  157
ident                                                             
Sbjct kipvlghadgicsiyldedadlikakrisldaktncnaxetllinpkfskwwevlenltl  277
DSSP  llllllllllleeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  157
ident                                                             
Sbjct eggvtihatkdlktayfdklnelgklteaiqcktvsldlaakfvtstesaiqhinthssr  337
DSSP  hhlllleelhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllleeeelllhhhhhhhhllllll


DSSP  ......................................................hhhl
Query ......................................................qdlq  161
ident                                                           
Sbjct htdaivtenkanaekfxkgvdssgvywnastrfadvgldglvsyqyqirgdgqvasdy  395
DSSP  leeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhlllllhhheeeeeeeelllllllll


No 8: 2G3QA  MOLECULE: PROTEIN YBL047C;                                           

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHLllllllLLHHHHHHHHHHHLllhhhhhh
Query ytxnexvditkdxlnkrGVXIEDIARIVQKLQekynpnLPLSVCXENVEKVLnkreiiha   60
ident                                                 ||          
Sbjct .................TTPKSLAVEELSGMG......FTEEEAHNALEKCN........   29
DSSP  .................LLHHHHHHHHHHLLL......LLHHHHHHHHHHHL........


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
Query vltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkek  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................   29
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHLHHhhhl
Query igiikeldespdgihtflddivaaLAAAAASRIAHTHqdlq  161
ident                            ||            
Sbjct .......................wDLEAATNFLLDSA....   43
DSSP  .......................lLHHHHHHHHHLLL....


No 9: 1A6QA  MOLECULE: PHOSPHATASE 2C;                                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gafldkpkmekhnaqgqgnglryglssmqgwrvemedahtaviglpsgleswsffavydg   60
DSSP  llllllleeeeeeeeeeelleeeeeeeeeelllllleeeeeeeeellleeeeeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hagsqvakyccehlldhitnnqdfkgsagapsvenvkngirtgfleidehmrvmsekkhg  120
DSSP  elllhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct adrsgstavgvlispqhtyfincgdsrgllcrnrkvhfftqdhkpsnplekeriqnaggs  180
DSSP  lllleeleeeeeellleeeeeeellleeeeeelleeeeellllllllhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vmiqrvngslavsralgdfdykcvhgkgpteqlvspepevhdierseeddqfiilacdgi  240
DSSP  eelleellllllllleelhhhlllllllhhhllllllleeeeeellllleeeeeeelhhh


DSSP  ..................llHHHHHHHH..........................hhhhhh
Query ..................ytXNEXVDIT..........................kdxlnk   16
ident                                                             
Sbjct wdvmgneelcdfvrsrlevtDDLEKVCNevvdtclykgsrdnmsvilicfpnapkvspea  300
DSSP  hllllhhhhhhhhhhhhlllLLHHHHHHhhhhhhhhlllllleeeeeeellllllllhhh


DSSP  llLLHHHHHHHHHHHLLlllllllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query rgVXIEDIARIVQKLQEkynpnlplsvcxenvekvlnkreiihavltglaldqlaeqkll   76
ident      |          |                                           
Sbjct vkKEAELDKYLECRVEE...........................................  317
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHH...........................................


DSSP  lllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhHHHHHHHHHHHHLLllhHHHLlllllllLL
Query peplqhlvetdeplygideiiplsivnvygSIGLTNFGYLDKEKigiIKELdespdgiHT  136
ident                                        |  |    |  |         
Sbjct .........................iikgvPDLVHVMRTLASEN...IPSL......pPG  343
DSSP  .........................hllllLLHHHHHHHHHHLL...LLLL......lLL


DSSP  LHHHHHhHHHHHHHHHHHLHHhhhl
Query FLDDIVaALAAAAASRIAHTHqdlq  161
ident             |            
Sbjct GELASK.RNVIEAVYNRLNPY....  363
DSSP  LHHHHH.HHHHHHHHHHHLLL....


No 10: 2P5TB  MOLECULE: FRAGMENT OF PEZA HELIX-TURN-HELIX MOTIF;                   

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhHLLLLHHHHHHHHHHHLLLLLLlllhhhhhhhhhhhlllhhhhhh
Query ytxnexvditkdxlnKRGVXIEDIARIVQKLQEKYNPnlplsvcxenvekvlnkreiiha   60
ident                                                             
Sbjct ...............IQDYTDSEFKHALARNLRSLTR.......................   22
DSSP  ...............LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhHHHHHHHhll
Query vltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsiglTNFGYLDkek  120
ident                                                             
Sbjct ............gkksskqpiaillggqsgagkttihrikqkefqgniviIDGDSFR...   67
DSSP  ............lllllllleeeeeellhhhllhhhhhhhhhhllllleeELHHHHH...


DSSP  llHHHHLLL..LLLL.LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHH...................
Query igIIKELDE..SPDG.IHTFLDDIVAALAAAAASRIAHTHQ...................  158
ident         |     |          |                                  
Sbjct .sQHPHYLElqQEYGkDSVEYTKDFAGKMVESLVTKLSSLGynlliegtlrtvdvpkkta  126
DSSP  .lLLLLHHHhhLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlleeeellllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  158
ident                                                             
Sbjct qllknkgyevqlaliatkpelsylstliryeelyiinpnqhhdfivnhlvdntrkleela  186
DSSP  hhhhhllleeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  .......................................................hhl
Query .......................................................dlq  161
ident                                                           
Sbjct iferiqiyqrdrscvydskenttsaadvlqelffgewsqvekemlqvgekrlnellek  244
DSSP  llleeeeellllleeeelllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 11: 1XM5A  MOLECULE: HYPOTHETICAL UPF0054 PROTEIN YBEY;                         

DSSP  ......llhhHHHHhhHHHHhhllLLHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHhhhhhhhhhLLL
Query ......ytxnEXVDitKDXLnkrgVXIEDIARIVQKLQEKYNPNLPLSvcxenvekvLNK   54
ident              |     |                                        
Sbjct msqvildlqlACED..NSGL....PEESQFQTWLNAVIPQFQEESEVT.......irVVD   47
DSSP  lleeeeeeeeLLLL..LLLL....LLHHHHHHHHHLLLHHHHLEEEEE.......eeEEL


DSSP  H.......................................hhHHHHHHHHHHHHhhhlll
Query R.......................................eiIHAVLTGLALDQlaeqkl   75
ident                                              |              
Sbjct TaeshslnltyrgkdkptnvlsfpfevppgmemsllgdlvicRQVVEKEAQEQG......  101
DSSP  HhhhhhhhhhhhllllllleeeeelllllllllleeeeeeeeHHHHHHHHHHLL......


DSSP  llllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllll
Query lpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkekigiikeldespdgih  135
ident                                                             
Sbjct ............................................................  101
DSSP  ............................................................


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH.........................hhhl
Query TFLDDIVAALAAAAASRIAHTH.........................qdlq  161
ident   |    |                                           
Sbjct KPLEAHWAHMVVHGSLHLLGYDhieddeaeemealeteimlalgyedpyia  152
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllll


No 12: 1T72A  MOLECULE: PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG;           

DSSP  .............lLHHHHHHHHHHHHHHL......................lllhhhhh
Query .............yTXNEXVDITKDXLNKR......................gvxiedia   25
ident                  | |                                        
Sbjct ggggggxklfkeleETKEQVIKXAKLVQEAidkatealnkqnvelaeevikgddtidlle   60
DSSP  llllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhlllllllllhhhhhhhhHHHLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL...lhhh
Query rivqklqekynpnlplsvcxenvEKVLNKreIIHAVLTGLALDQLAEQKLLPE...plqh   82
ident                             |  |                            
Sbjct vdierrcirxialyqpeagdlrxIXGIYK..IVSDLERXGDEAENIAERAILLaeepplk  118
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhHHHHHH..HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllll


DSSP  hhhHLLLlllhhhhllhhhhhllhhhhHHHHHHHHhlllLHHHHLLL.............
Query lveTDEPlygideiiplsivnvygsigLTNFGYLDkekiGIIKELDE.............  129
ident                                              ||             
Sbjct pyvNINFxseivkexvndsvisfiqqdTLLAKKVI....EKDDTVDElyhqlerelxtyv  174
DSSP  llhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhlllHHHHHHHH....HHHHHHHHhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............lllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhl
Query ..............spdGIHTFLDDIVAALAAAAASRIAHThqdlq  161
ident                         |     | ||            
Sbjct ledprnikraxhlsfvaRHYERIADHAENVAEAAIYLSEGE.....  215
DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....


No 13: 1G5AA  MOLECULE: AMYLOSUCRASE;                                              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHHHHHHHHHLLL.LLLLLL.hhhHHHHHHHHLLlhhHH
Query ytxnexvditkdxlnkrGVXIEDIARIVQKLQEK.YNPNLP.lsvCXENVEKVLNkreII   58
ident                                                             
Sbjct .................SPNSQYLKTRILDIYTPeQRAGIEksedWRQFSRRMDT..hFP   41
DSSP  .................LLLHHHHHHHHHHHLLHhHHHHHHhlhhHHHHHHHHHH..hHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query HAVLTGLALDQlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldk  118
ident                                                             
Sbjct KLMNELDSVYG.................................................   52
DSSP  HHHHHHHHHHL.................................................


DSSP  llllhhhhllllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhHHHL.................
Query ekigiikeldespdGIHTFLDDIVAALAAAAASRIAHthQDLQ.................  161
ident                    |      || |  |                           
Sbjct ..............NNEALLPMLEMLLAQAWQSYSQR..NSSLkdidiarennpdwilsn   96
DSSP  ..............LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LHHHhhhhhhhhllhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct kqvggvcyvdlfagdlkglkdkipyfqelgltylhlmplfkcpegksdggyavssyrdvn  156
DSSP  llleeeelhhhhhllhhhhhllhhhhhhhllleeeellllllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct palgtigdlreviaalheagisavvdfifnhtsnehewaqrcaagdplfdnfyyifpdrr  216
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellleeelllhhhhhhhlllhhhllllleelllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct mpdqydrtlreifpdqhpggfsqledgrwvwttfnsfqwdlnysnpwvframagemlfla  276
DSSP  hhhhhllllllllllllllleeellllleeelllllleeelllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct nlgvdilrmdavafiwkqmgtscenlpqahalirafnavmriaapavffkseaivhpdqv  336
DSSP  llllleeeellhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct vqyigqdecqigynplqmallwntlatrevnllhqaltyrhnlpehtawvnyvrshddig  396
DSSP  hhhllllllleeelhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllllleeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct wtfadedaaylgisgydhrqflnrffvnrfdgsfargvpfqynpstgdcrvsgtaaalvg  456
DSSP  llllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllllllleeellllllllleeellhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct laqddphavdrikllysialstgglpliylgdevgtlndddwsqdsnksddsrwahrpry  516
DSSP  hhhllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhlllllllhhhlllllllhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct nealyaqrndpstaagqiyqdlrhmiavrqsnprfdggrlvtfntnnkhiigyirnnall  576
DSSP  lhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhllllleellllllleeeeeelllee


DSSP  ....................................................
Query ....................................................  161
ident                                                     
Sbjct afgnfseypqtvtahtlqampfkahdliggktvslnqdltlqpyqvmwleia  628
DSSP  eeeellllleeelllllllllleeeellllleeelllleeelllleeeeell


No 14: 1AIPC  MOLECULE: ELONGATION FACTOR TU;                                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHLLlllllLLHHHHHHHHHHHLllhhhhhh
Query ytxnexvditkdxlnkrgvXIEDIARIVQKLQEkynpnLPLSVCXENVEKVLnkreiiha   60
ident                                                 |           
Sbjct ...................SQMELIKKLREATG.....AGMMDVKRALEDAG........   28
DSSP  ...................LHHHHHHHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHLL........


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
Query vltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkek  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................   28
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHLHHHHHL...................
Query igiikeldespdgihtflddivaaLAAAAASRIAHTHQDLQ...................  161
ident                             |                               
Sbjct .......................wDEEKAVQLLRERGAMKAakkadrearegiighyihh   65
DSSP  .......................lLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllleeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct nqrvgvlvelncetdfvarnelfqnlakdlamhiammnpryvsaeeipaeelekerqiyi  125
DSSP  llleeeeeeeelllhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct qaalnegkpqqiaekiaegrlkkyleevvlleqpfvkddkvkvkeliqqaiakigenivv  185
DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhllllee


DSSP  ..........
Query ..........  161
ident           
Sbjct rrfcrfelga  195
DSSP  eeeeeeelll


No 15: 2EGHA  MOLECULE: 1-DEOXY-D-XYLULOSE 5-PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE;           

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gkqltilgstgsigcstldvvrhnpehfrvvalvagknvtrmveqclefspryavmddea   60
DSSP  leeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeelllhhhhhhhhhhhllleeeellhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sakllktmlqqqgsrtevlsgqqaacdmaaledvdqvmaaivgaagllptlaairagkti  120
DSSP  hhhhhhhhhhhllllleeeelhhhhhhhhlllllleeeelllllllhhhhhhhhhlllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct llankeslvtcgrlfmdavkqskaqllpvdsehnaifqslpqpiqhnlgyadleqngvvs  180
DSSP  eelllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeellhhhhhhhhlllhhhhllllllllhhhleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct illtgsggpfretplrdlatmtpdqacrhpnwsmgrkisvdsatmmnkgleyiearwlfn  240
DSSP  eeeeelllllllllhhhhhhllhhhhlllllllllhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct asasqmevlihpqsvihsmvryqdgsvlaqlgepdmrtpiahtmawpnrvnsgvkpldfc  300
DSSP  llhhheeeeellllleeeeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhlllllllllllllhh


DSSP  .............llhhhhhhHHHHHhHHLL..LLHHHHHHHHHHHLLLLL.LLLLHHHH
Query .............ytxnexvdITKDXlNKRG..VXIEDIARIVQKLQEKYN.PNLPLSVC   44
ident                                          |                  
Sbjct klsaltfaapdydrypclklaMEAFE.QGQAatTALNAANEITVAAFLAQQiRFTDIAAL  359
DSSP  hllllllllllllllhhhhhhHHHHH.HLHHhhHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhl
Query XENVEKVLnkreiihavltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnv  104
ident    |                                                        
Sbjct NLSVLEKM....................................................  367
DSSP  HHHHHHHL....................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhl
Query ygsigltnfgyldkekigiikeldespDGIH..TFLDDIVAALAAAAASRIAHTHqdlq  161
ident                                     |      |     | |       
Sbjct ......................dmrepQCVDdvLSVDANAREVARKEVMRLASSA....  400
DSSP  ......................lllllLLHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....


No 16: 1I9YA  MOLECULE: PHOSPHATIDYLINOSITOL PHOSPHATE PHOSPHATASE;                

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHLLLhhHHHH
Query ytxnexvditkdxlnkrgvxiediarivqklqekynpnlplSVCXENVEKVLNKreIIHA   60
ident                                              | |   | |      
Sbjct ........................................yDPIHEYVNHELRK..RENE   18
DSSP  ........................................lLHHHHHHHHHHLL..LHHH


DSSP  HHH.........................................................
Query VLT.........................................................   63
ident                                                             
Sbjct FSEhknvkifvasynlngcsattklenwlfpentpladiyvvgfqeivqltsadpakrre   78
DSSP  LEEeeeeeeeeeeeellllllllllhhhhllllllllleeeeeeelllllllllhhhhhh


DSSP  ................................hhhhhhhhHLLLLLL.............
Query ................................glaldqlaEQKLLPE.............   78
ident                                                             
Sbjct wescvkrllngkctsgpgyvqlrsgqlvgtalmifckescLPSIKNVegtvkktglgnkg  138
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeeelleeeeeeeehhhHHHEEEEeeeeeelllllle


DSSP  ....LHHH....................................................
Query ....PLQH....................................................   82
ident                                                             
Sbjct avaiRFDYedtglcfitshlaagytnyderdhdyrtiasglrfrrgrsifnhdyvvwfgd  198
DSSP  eeeeEEEElleeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhllllllleeeeeee


DSSP  ...........................................................h
Query ...........................................................l   83
ident                                                             
Sbjct fnyrisltyeevvpciaqgklsylfeydqlnkqmltgkvfpffselpitfpptykfdigt  258
DSSP  llllllllhhhhhhhhhlllhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllll


DSSP  hhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllllllLHHHHHH
Query vetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkekigiikeldespdgihtFLDDIVA  143
ident                                                             
Sbjct diydtsdkhrvpawtdrilyrgelvphsyqsvplyysdhrpiyatyeanivkvDREKKKI  318
DSSP  llllllllllllllleeeeeellleeeeeeelllllllllleeeeeeeeeeeeLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLHHHHHL
Query ALAAAAASRIAHTHQDLQ  161
ident         |        |
Sbjct LFEELYNQRKQEVRDASQ  336
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLL


No 17: 2E4OA  MOLECULE: ARISTOLOCHENE SYNTHASE;                                    

DSSP  .....llhHHHHhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHLLLLL.......lllLHHHhhHHH
Query .....ytxNEXVditkdxlnkrgVXIEDIARIVQKLQEKYN.......pnlPLSVcxENV   48
ident                           |     |                           
Sbjct slepppstFQPL.........chPLVEEVSKEVDGYFLQHWnfpnekarkkFVAA..GFS   49
DSSP  llllllllLLLL.........llLLHHHHHHHHHHHHHHHLllllhhhhhhHHHH..LHH


DSSP  HHHLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhh
Query EKVLNKreIIHAvltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsi  108
ident            |                                                
Sbjct RVTCLY..FPKA................................................   59
DSSP  HHHHHH..LLLL................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllhhhhlllllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHL.......
Query gltnfgyldkekigiikeldespdgihtflddIVAALAAAAASRIAHTHQDLQ.......  161
ident                                        |          |         
Sbjct ................................LDDRIHFACRLLTVLFLIDDLleymsfe   87
DSSP  ................................LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct egsayneklipisrgdvlpdrsipveyiiydlwesmrahdremadeilepvflfmraqtd  147
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct rtrarpmglggyleyrerdvgkellaalmrfsmglklspselqrvreidancskhlsvvn  207
DSSP  llllllllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct diysyekelytlctsvqilaqeadvtaeaakrvlfvmcrewelrhqllvarlsaegletp  267
DSSP  hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllh


DSSP  ............................
Query ............................  161
ident                             
Sbjct glaayvegleyqmsgnelwsqttlrysv  295
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhll


No 18: 1WR1B  MOLECULE: UBIQUITIN;                                                 

DSSP  LLHHHhhhhhhHHHHhllLLHHHHHHHHHHHLllllllLLHHHHHHHHHHHLllhhhhhh
Query YTXNExvditkDXLNkrgVXIEDIARIVQKLQekynpnLPLSVCXENVEKVLnkreiiha   60
ident              |       |   |                                  
Sbjct PGISG...gggGILD.peERYEHQLRQLNDMG.....fFDFDRNVAALRRSG........   43
DSSP  LLLLL...lllHHHL.hhHHLHHHHHHHHHHL.....lLLHHHHHHHHHHHL........


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
Query vltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkek  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................   43
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHLHHhhhl
Query igiikeldespdgihtflddivaaLAAAAASRIAHTHqdlq  161
ident                             |            
Sbjct .......................gSVQGALDSLLNGD...v   58
DSSP  .......................lLHHHHHHHHHHLL...l


No 19: 2JOLA  MOLECULE: PUTATIVE G-NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR;                     

DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhlllhhhh
Query ..YTXNEXVDITKDXlnkrgvxiediarivqklqekynpnlplsvcxenvekvlnkreii   58
ident                                                             
Sbjct tgDAKQAIRHFVDEA.............................................   15
DSSP  llLLLLHHHHHHHHH.............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhLLLL..LLLHHHHHhhllllLLHHHHLLH.HHHHLLH.........
Query havltglaldqlaeQKLL..PEPLQHLVetdeplYGIDEIIPL.SIVNVYG.........  106
ident                            |      |                         
Sbjct ......vkqvaharTPEIrqDAEFGRQV......YEATLCAIFsEAKDRFCmdpatragn   63
DSSP  ......hhhhhhhhHHHHhhLLLHHHHH......HHHHHHHHHhHHHHHHHhlhhhllll


DSSP  ..HHHHHHHHHHHHL.............................................
Query ..SIGLTNFGYLDKE.............................................  119
ident          |                                                  
Sbjct vrPAFIEALGDAARAtglpgadkqgvftpsgagtnplyteirlradtlmgaelaarpeyr  123
DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHllllleeelleeellllllllhhhhhhhhhhhhhllhhhhllhhh


DSSP  .......lllhhhhllllLLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHL..........
Query .......kigiikeldesPDGI.HTFLDDIVAALAAAAASRIAHTHQDLQ..........  161
ident                   |     |            |  | |                 
Sbjct elqpyarqqaidlvanalPAERsNTLVEFRQTVQTLEATYRRAAQDASRDekgatnaadg  183
DSSP  hllhhhhhhhhhhhhhllLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlhhhhhlll


DSSP  .
Query .  161
ident  
Sbjct a  184
DSSP  l


No 20: 1B0UA  MOLECULE: HISTIDINE PERMEASE;                                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nklhvidlhkrygghevlkgvslqaragdvisiigssgsgkstflrcinflekpsegaii   60
DSSP  lleeeeeeeeeelleeeeeeeeeeelllleeeeellllllhhhhhhhhllllllleeeee


DSSP  .........................llhhhhhhhhhhhhhhLLLL.HHHHHHHHHHHLLl
Query .........................ytxnexvditkdxlnkRGVX.IEDIARIVQKLQEk   34
ident                                                |            
Sbjct vngqninlvrdkdgqlkvadknqlrllrtrltmvfqhfnlwSHMTvLENVMEAPIQVLG.  119
DSSP  elleelleeellllleeellhhhhhhhhhheeeelllllllLLLLhHHHHHHHHHHLLL.


DSSP  llllLLHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhh
Query ynpnLPLSVCXENVEKVLNKreiihavltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygid   94
ident     |      |   | | |                                        
Sbjct ....LSKHDARERALKYLAK........................................  135
DSSP  ....LLHHHHHHHHHHHHHH........................................


DSSP  hhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHH.
Query eiiplsivnvygsigltnfgyldkekigiikeldespdgIHTF.LDDIVAALAAAAASR.  152
ident                                                 |    | |    
Sbjct ..........................vgideraqgkypvHLSGgQQQRVSIARALAMEPd  169
DSSP  ..........................llllhhhhlllhhHLLHhHHHHHHHHHHHHLLLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct vllfdeptsaldpelvgevlrimqqlaeegktmvvvthemgfarhvsshviflhqgkiee  229
DSSP  eeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllhhhhhhhlleeeeeelleeee


DSSP  ...................hhlhhhhhl
Query ...................iahthqdlq  161
ident                             
Sbjct egdpeqvfgnpqsprlqqflkgslkkle  257
DSSP  eelhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhlll


No 21: 2OOAA  MOLECULE: E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE CBL-B;                         

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHLllllllLLHHHHHHHHHHHLllhhhhhh
Query ytxnexvditkdxlnkrgvxIEDIARIVQKLQekynpnLPLSVCXENVEKVLnkreiiha   60
ident                                                 |           
Sbjct ....................VDAKIAKLXGEG......YAFEEVKRALEIAQ........   26
DSSP  ....................LHHHHHHHHHLL......LLHHHHHHHHHHLL........


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
Query vltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkek  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................   26
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHLHHHHhl
Query igiikeldespdgihtflddivaaLAAAAASRIAHTHQDlq  161
ident                             | |          
Sbjct .......................nNVEVARSILREFAFP..   42
DSSP  .......................lLHHHHHHHHHHHLLL..


No 22: 2H8AA  MOLECULE: MICROSOMAL GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 1;                    

DSSP  lLHHHHHHHHHH.......................................hhhhLLLLh
Query yTXNEXVDITKD.......................................xlnkRGVXi   21
ident                                                          |  
Sbjct .NEVLMAFTSYAtiilakmmflssatafqrltnkvflrtdekvervrrahlndleNIVP.   58
DSSP  .LHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHH.


DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhHHHH....hllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlll
Query ediarivqklqekynpnlplsvcxeNVEK....vlnKREIIHAVLTGLALDQLAEQKllp   77
ident                                                      |      
Sbjct ...................flgiglLYSLsgpdlstALIHFRIFVGARIYHTIAYLT...   96
DSSP  ...................hhhhhhHLLLlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...


DSSP  llhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhlllLLLLLLLL
Query eplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldkekigiikeldeSPDGIHTF  137
ident                                                      |      
Sbjct ...................................................pLPQPNRGL  105
DSSP  ...................................................lLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhlhhhhhl
Query LDDIVAALAAAAASRIahthqdlq  161
ident             | |         
Sbjct AFFVGYGVTLSMAYRL........  121
DSSP  HHHHHLHHHHHHHHLL........


No 23: 1EFUB  MOLECULE: ELONGATION FACTOR TU;                                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhlllLHHH.HHHHHHHHLLlllllLLHHHHHHHHHHHLllhhhhh
Query ytxnexvditkdxlnkrgvXIED.IARIVQKLQEkynpnLPLSVCXENVEKVLnkreiih   59
ident                     |                       |               
Sbjct ..................aEITAsLVKELRERTG.....AGMMDCKKALTEAN.......   30
DSSP  ..................lLLLHhHHHHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHLL.......


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllllllhhhhllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhl
Query avltglaldqlaeqkllpeplqhlvetdeplygideiiplsivnvygsigltnfgyldke  119
ident                                                             
Sbjct ............................................................   30
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHLHHHHHL..................
Query kigiikeldespdgihtflddivaaLAAAAASRIAHTHQDLQ..................  161
ident                              |                              
Sbjct ........................gDIELAIENMRKSGAIKAakkagnvaadgviktkid   66
DSSP  ........................lLHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllleeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct gnygiilevncqtdfvakdagfqafadkvldaavagkitdvevlkaqfeeervalvakig  126
DSSP  lleeeeeeeeellhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct eninirrvaalegdvlgsyqhgarigvlvaakgadeelvkhiamhvaaskpefikpedvs  186
DSSP  llleeeeeeeeelleeeeeeellleeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  161
ident                                                             
Sbjct aevvekeyqvqldiamqsgkpkeiaekmvegrmkkftgevsltgqpfvmepsktvgqllk  246
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleelleeeeehhhhhh


DSSP  ....................................
Query ....................................  161
ident                                     
Sbjct ehnaevtgfirfevgegiekvetdfaaevaamskqs  282
DSSP  lllleeeeeeeeelllllllllllhhhhhhhhllll