DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1T3UB MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1T3U-A 10.6  5.7   91    92  100   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   2:  2CTK-A  3.5  3.2   46   104    7   VIGILIN;                                                   "         
   3:  1YBX-A  3.4  3.2   42    91   12   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   4:  2CTE-A  3.1  3.1   45    94   16   VIGILIN;                                                   "         
   5:  2PFD-A  3.0  9.1   59   540    8   FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     "         
   6:  2OAU-A  3.0 11.0   47   254    4   SMALL-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL;                "         
   7:  2D9X-A  2.9  2.5   41   120   22   OXYSTEROL BINDING PROTEIN-RELATED PROTEIN 11;              "         
   8:  2CUW-A  2.9  2.3   37    83   16   PURS;                                                      "         
   9:  1MKM-A  2.9  2.4   40   246    0   ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                            "         
  10:  2CTF-A  2.8  3.1   43   102    7   VIGILIN;                                                   "         
  11:  1U7U-A  2.8  2.1   39   198   10   COENZYME A BIOSYNTHESIS BIFUNCTIONAL PROTEIN               "         
  12:  2BX2-L  2.7 18.3   65   500    6   RNA (5'-R(*UP*UP*UP*AP*CP*AP*GP*UP*AP*UP*UP*               "         
  13:  1NW3-A  2.6  9.4   67   328    4   HISTONE METHYLTRANSFERASE DOT1L;                           "         
  14:  2ANN-A  2.5  6.8   47   148   11   NEURO-ONCOLOGICAL VENTRAL ANTIGEN 1;                       "         
  15:  1WE8-A  2.5  3.6   45   104   11   TUDOR AND KH DOMAIN CONTAINING PROTEIN;                    "         
  16:  1GG4-A  2.5  8.8   41   439   20   UDP-N-ACETYLMURAMOYLALANYL-D-GLUTAMYL-2,6-                 "         
  17:  1BB8-A  2.4  1.5   35    71    0   INTEGRASE;                                                 "         
  18:  2AJ4-A  2.3  2.9   40   509    8   GALACTOKINASE;                                             "         
  19:  2GEZ-A  2.2  5.6   55   158   11   L-ASPARAGINASE ALPHA SUBUNIT;                              "         
  20:  1FNT-J  2.2  2.0   39   204   10   PROTEASOME COMPONENT C7-ALPHA;                             "         
  21:  1EC6-A  2.2  2.6   39    87    8   RNA-BINDING PROTEIN NOVA-2;                                "         
  22:  2OTJ-E  2.1  2.5   59   172    8   23S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  23:  2FH5-A  2.1  3.4   55   124    5   SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RECEPTOR ALPHA                 "         
  24:  1Q8K-A  2.1  2.2   40   300   13   EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2                 "         
  25:  1J5K-A  2.1  2.1   37    76   22   HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN K;                 "         
  26:  1GHH-A  2.1  3.9   52    81    8   DNA-DAMAGE-INDUCIBLE PROTEIN I;                            "         
  27:  2B7N-A  2.0  9.6   58   273   14   PROBABLE NICOTINATE-NUCLEOTIDE PYROPHOSPHORYLASE;          "         
  28:  1W63-Q  2.0  2.7   53   148    6   ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1                  "         
-

No 1: 1T3UA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  leEEEEEELLEEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query snTLTVQILDKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIGADRVAVXAALNIT   60
ident   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ..TLTVQILDKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIGADRVAVXAALNIT   58
DSSP  ..LEEEEELLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.
Query HDLLHRKERLDQESSSTRERVRELLDRVDRALA.   93
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct HDLLHRKERLDQESSSTRERVRELLDRVDRALAn   92
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHl


No 2: 2CTKA  MOLECULE: VIGILIN;                                                   

DSSP  ...............LEEEEEEELL..................................E
Query ...............SNTLTVQILD..................................K   11
ident                  |  |                                       
Sbjct gssgssgkealealvPVTIEVEVPFdlhryvigqkgsgirkmmdefevnihvpapelqsD   60
DSSP  lllllllllllllllLEEEEEELLHhhhhhhhllllhhhhhhhhhllleeellllllllL


DSSP  EEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query EYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIgadrvavxaalnithdllhrkerld   71
ident    |                                                        
Sbjct IIAITGLAANLDRAKAGLLERVKELQAEQEDRALR.........................   95
DSSP  EEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query qessstrervrelldrvdrala   93
ident                       
Sbjct .............sfksgpssg  104
DSSP  .............lllllllll


No 3: 1YBXA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  .................................lEEEEEEELL..eEEEEE.........
Query .................................sNTLTVQILD..kEYCIN.........   16
ident                                       |                     
Sbjct innlvkqaqkxqrdxervqeelkektveasagggAVTVVATGRkdiKEITIkpevvdpdd   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllLEEEEEELLlleEEEEElhhhlllll


DSSP  ..eLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..cPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVigadrvavxaalnithdllhrkerldqes   74
ident      |        |      |     |                                
Sbjct vexLQDLILAAVNEALRKADEXVTAEISKIT.............................   91
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.............................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllll
Query sstrervrelldrvdrala   93
ident                    
Sbjct ...................   91
DSSP  ...................


No 4: 2CTEA  MOLECULE: VIGILIN;                                                   

DSSP  ...............LEEEEEEELL..................................E
Query ...............SNTLTVQILD..................................K   11
ident                    || |                                     
Sbjct gssgssgdivarlqtQASATVAIPKehhrfvigkngeklqdlelktatkiqiprpddpsN   60
DSSP  lllllllllllllllLEEEEEELLLllhhhhhlllllhhhhhhhhllllllllllllllL


DSSP  EEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query EYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIrsSGKVIGadrvavxaalnithdllhrkerld   71
ident    |                          ||   |                        
Sbjct QIKITGTKEGIEKARHEVLLISAEQDKR..SGPSSG........................   94
DSSP  EEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLLL........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query qessstrervrelldrvdrala   93
ident                       
Sbjct ......................   94
DSSP  ......................


No 5: 2PFDA  MOLECULE: FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sqlvecvpnfsegnnqevidaisqaisqtpgcvlldvdagpstnrtvytfvgqpecvveg   60
DSSP  lleeeelleelllllhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelllleeeeeeeelhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alsaartasqlidxrkhkgehprxgaldvcpfipvrgvsxdecvlcakafgqrlaeelnv  120
DSSP  hhhhhhhhhllllhhhlllllllllllleeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pvylygeaaqxpsrqtlpairageyealpeklkqaewvpdfgpssfvpswgatvtgarkf  180
DSSP  leeeeellllllllllhhhhlllllllhhhhllllllllllllllllllllleeeeelll


DSSP  LEEEEEEELL........................................EEEEEEELHH
Query SNTLTVQILD........................................KEYCINCPDD   20
ident         |                                              |  | 
Sbjct LIAFNINLLStkeqahrialnlreqgrgkdqpgrlkkvqgigwyleeknlAQVSTNLLDF  240
DSSP  LEEEEEEELLlhhhhhhhhhhhllllllllllllllleeeeeeeelllleEEEEEEELLL


DSSP  ...HHHHHHHHHHHHHHHHH........................................
Query ...ERANLESAARYLDGKXR........................................   37
ident            ||                                               
Sbjct evtALHTVYEEARREAQELNlpvvgsqlvglvplkalldaaafycdkeklfvleeehrir  300
DSSP  lllLHHHHHHHHHHHHHLLLlleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   37
ident                                                             
Sbjct lvvnrlgldslapfdpkeriieylvpdsgpeqslldaslrafvrevgarsaapgggsvaa  360
DSSP  hhhhlllllllllllhhhhlhhhhlllllllllhhhllhhhhhhhhlllllllllhhhhh


DSSP  ..hhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHH......................
Query ..eirssgkvigadrvavxaalnithdllhrkeRLDQE......................   73
ident                                                             
Sbjct avaalgaalasxvgqxtygrrqfdhldstxrrlIPPFHaasaqltslvdadarafaaclg  420
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhHHHHHhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   73
ident                                                             
Sbjct aiklpkntpeerdrrtcalqeglrqavavplklaetvsqlwpalqelaqcgnlsclsdlq  480
DSSP  hhllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh


DSSP  hhhHHHHHHHHHHHLLLLLL........................................
Query sssTRERVRELLDRVDRALA........................................   93
ident                                                             
Sbjct vaaKALETGVFGAYFNVLINlkdxtddvfkektrhrissllqeaktqaalvlgslearke  540
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 6: 2OAUA  MOLECULE: SMALL-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL;                

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yavnivaalaiiivgliiarmisnavnrlmisrkidatvadflsalvrygiiaftliaal   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct grvgvqtasviavlgaaglavglalqgslsnlaagvllvmfrpfrageyvdlggvagtvl  120
DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeelllleeeee


DSSP  ....................................LEEEEEEE................
Query ....................................SNTLTVQI................    8
ident                                            |                
Sbjct svqifsttmrtadgkiivipngkiiagniinfsrepVRRNEFIIgvaydsdidqvkqilt  180
DSSP  eellleeeeeelllleeeeehhhhhhlleeelllllEEEEEEEEeelllllhhhhhhhhh


DSSP  ..........................llEEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLl
Query ..........................ldKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSs   42
ident                                          |                  
Sbjct niiqsedrilkdremtvrlnelgassinFVVRVWSNSGDLQNVYWDVLERIKREFDAAG.  239
DSSP  hhhhhllllllllleeeeeeellllleeEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  llllLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhllllll
Query gkviGADRvavxaalnithdllhrkerldqesssTRERvrelldrvdrala   93
ident                                                    
Sbjct ...iSFPY....................pqmdvnFKRV.............  254
DSSP  ...lLLLL....................leeeeeEELL.............


No 7: 2D9XA  MOLECULE: OXYSTEROL BINDING PROTEIN-RELATED PROTEIN 11;              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gssgssgenvygylmkytnlvtgwqyrffvlnneaglleyfvneqsrnqkprgtlqlaga   60
DSSP  lllllllllleeeeeeeeellleeeeeeeeellllleeeeellhhhlllllleeeellll


DSSP  ........LEEEEEE.elLEEEEEEE.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlllhhh
Query ........SNTLTVQ.ilDKEYCINC.PDDERANLESAARYLDGKXREIrSSGKvigadr   50
ident         | | ||       |        ||    |          |            
Sbjct vispsdedSHTFTVNaasGEQYKLRAtDAKERQHWVSRLQICTQHHTEA.IGKN......  113
DSSP  leelllllLLLEEELlllLLLEEELLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLL......


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                            
Sbjct ....................................nsgpssg  120
DSSP  ....................................lllllll


No 8: 2CUWA  MOLECULE: PURS;                                                      

DSSP  .LEEEEEEEL.............................LEEEEEEELH....HHHHHHH
Query .SNTLTVQIL.............................DKEYCINCPD....DERANLE   26
ident      |  |                               |   |  |            
Sbjct pRYQATLLIElkkgildpqgravegvlkdlghpveevrvGKVLEIVFPAenllEAEEKAK   60
DSSP  lEEEEEEEEEellllllhhhhhhhhhhhhllllllllllLEEEEEEEELllhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHhhHHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SAARYLDgkXREIrssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelld   86
ident      |                                                      
Sbjct AXGALLA..NPVX..........................................evyal   76
DSSP  HHHHHHL..LLLL..........................................eeeee


DSSP  hllllll
Query rvdrala   93
ident        
Sbjct ealkelp   83
DSSP  eeeeell


No 9: 1MKMA  MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mntlkkafeildfivknpgdvsvseiaekfnmsvsnaykymvvleekgfvlrkkdkryvp   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhllleeellllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gyklieygsfvlrrfnirdiahdhlvdimkrtgetvhlilkdgfegvyidkvegeqsipm  120
DSSP  llhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeellleeeeeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrlgmkvdlystasgksilafvpekelkeylkivelkpktpntitnprvlkrelekirk  180
DSSP  lllllleeellllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............lEEEEEEEL........LEEEEEE....ELHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ............sNTLTVQIL........DKEYCIN....CPDDERANLESAARYLDGKX   36
ident                                                             
Sbjct rgyavdneeneigIMCVGVPIfdhngypvAGVSISGvarkFTEEKIEEYSDVLKEKAEEI  240
DSSP  hlleeeellllllEEEEEEEEellllleeEEEEEEEehhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query REIRSsgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                                          
Sbjct SRKLG...................................................y  246
DSSP  HHHLL...................................................l


No 10: 2CTFA  MOLECULE: VIGILIN;                                                   

DSSP  .........................LEEEEEEELL.........................
Query .........................SNTLTVQILD.........................   10
ident                               |                             
Sbjct gssgssgepeklgqaltevyakansFTVSSVAAPSwlhrfiigkkgqnlakitqqmpkvh   60
DSSP  lllllllllllllllllllllllllLEEEEEELLLllhhhhhlllllhhhhhhhhlllle


DSSP  .......EEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .......KEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIrSSGKvigadrvavxaalnithdl   63
ident               |                      |                      
Sbjct ieftegeDKITLEGPTEDVSVAQEQIEGMVKDLINR.SGPS...................  100
DSSP  eeellllLEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLL...................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query lhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                               
Sbjct ............................sg  102
DSSP  ............................ll


No 11: 1U7UA  MOLECULE: COENZYME A BIOSYNTHESIS BIFUNCTIONAL PROTEIN               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pvndlkhlnimitagptrepldpvryisdhssgkmgfaiaaaaarrganvtlvsgpvslp   60
DSSP  lllllllleeeeeelllleeeelleeellllllhhhhhhhhhhhlllleeeeeellllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tppfvkrvdvmtalemeaavnasvqqqnifigcaavadyraaltikmvknpdivagvaal  120
DSSP  llllleeeelllhhhhhhhhhhhhhhlleeeellllllllllllllllllllhhhhhhll


DSSP  ......................................LEEEEEEELLEEEEEEELH.HH
Query ......................................SNTLTVQILDKEYCINCPD.DE   21
ident                                        | |     |            
Sbjct kdhrpyvvgfaaetnnveeyarqkrirknldlicansdNNALHLFWQDGDKVLPLERkEL  180
DSSP  llllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhlllleeeelllEEEEEEEELLEEEEEEEEEhHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query RANLESAARYLDGKXREIrssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrerv   81
ident    |                                                        
Sbjct LGQLLLDEIVTRYDEKNR..........................................  198
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHL..........................................


DSSP  hhhhhhllllll
Query relldrvdrala   93
ident             
Sbjct ............  198
DSSP  ............


No 12: 2BX2L  MOLECULE: RNA (5'-R(*UP*UP*UP*AP*CP*AP*GP*UP*AP*UP*UP*               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ahiegrhmkrmlinatqqeelrvalvdgqrlydldiespgheqkkaniykgkitriepsl   60
DSSP  lllllllleeeeeelllllleeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eaafvdygaerhgflplkeiareyfprpnikdvlregqevivqidkeergnkgaalttfi  120
DSSP  leeeeelllllleeeehhhllhhhlllllhhhlllllleeeeeeeelllllllleeelll


DSSP  ...leEEEEEELL........................EEEEEE.....eLHHHHHHHHHH
Query ...snTLTVQILD........................KEYCIN.....cPDDERANLESA   28
ident       |                                                   | 
Sbjct slagsYLVLMPNNpraggisrrielkealaslelpegMGLIVRtagvgkSAEALQWDLSF  180
DSSP  leellLEEEELLLlllleelllllhhhhhllllllllLEEEELhhhhhlLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLhhHHHH...........hhhhhhhhhhhhhhHHHH......
Query ARYLDGKXREIRSSGKVIGadRVAV...........xaalnithdllhrkERLD......   71
ident              |                                      |       
Sbjct RLKHWEAIKKAAESRPAPF..LIHQesnvivrafrdylrqdigeilidnpKVLElarqhi  238
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLE..EEELlllhhhhhhhhhlllleeeeeellhHHHHhhhhhh


DSSP  .............hhhhhhHHHHHHHH.................................
Query .............qessstRERVRELL.................................   85
ident                                                             
Sbjct aalgrpdfsskiklytgeiPLFSHYQIesqiesafqrevrlpsggsividstealtaidi  298
DSSP  hhlllhhhhlleeelllllLHHHHLLLhhhhhhlllleeellllleeeeeelllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   85
ident                                                             
Sbjct nsargdieetafntnleaadeiarqlrlrdlgglividfidmtpvrhqravenrlreavr  358
DSSP  elllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   85
ident                                                             
Sbjct qdrariqishisrfgllemsrqrlspslgesshhvcprcsgtgtvrdneslslsilrlie  418
DSSP  llllleeeeeelllleeeeeellllllhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .hhlLLLLL...................................................
Query .drvDRALA...................................................   93
ident                                                             
Sbjct eealKENTQevhaivpvpiasyllnekrsavnaietrqdgvrcvivpndqmetphyhvlr  478
DSSP  hhhhLLLEEeeeeeelhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllllleeee


DSSP  ......................
Query ......................   93
ident                       
Sbjct vrkgeetptlsymlpklheeam  500
DSSP  eellllllllhhhhhhhhllll


No 13: 1NW3A  MOLECULE: HISTONE METHYLTRANSFERASE DOT1L;                           

DSSP  lEEEEEEE..LLEEEEEE..........................................
Query sNTLTVQI..LDKEYCIN..........................................   16
ident    |                                                        
Sbjct .LELRLKSpvGAEPAVYPwplpvydkhhdaaheiietirwvceeipdlklamenyvlidy   59
DSSP  .LEEEELLllLLLLEEEElllleeelleehhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  ...eLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH.....
Query ...cPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIGadrvavxaalnithdllHRKE.....   68
ident                 |  |                                        
Sbjct dtksFESMQRLCDKYNRAIDSIHQLWKGTTQPMK..........lntrpstGLLRhilqq  109
DSSP  llllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL..........llllllhHHHHhhhhh


DSSP  .........................hhHHHHHHHHHHHH.....................
Query .........................rlDQESSSTRERVR.....................   82
ident                                                             
Sbjct vynhsvtdpeklnnyepfspevygetsFDLVAQMIDEIKmtdddlfvdlgsgvgqvvlqv  169
DSSP  hhhhhlllhhhhhllllllllllllllHHHHHHHHHHLLllllleeeeelllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   82
ident                                                             
Sbjct aaatnckhhygvekadipakyaetmdrefrkwmkwygkkhaeytlergdflseewreria  229
DSSP  hhhlllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   82
ident                                                             
Sbjct ntsvifvnnfafgpevdhqlkerfanmkeggrivsskpfaplnfrinsrnlsdigtimrv  289
DSSP  hlleeeellllllhhhhhhhhhhhllllllleeeellllllllllllllllllhhhheee


DSSP  ................hhhhhLLLLLL............
Query ................elldrVDRALA............   93
ident                                        
Sbjct velsplkgsvswtgkpvsyylHTIDRTilenyfsslknp  328
DSSP  eellllllllllllllllleeEEELLHhhhhhhhhhhll


No 14: 2ANNA  MOLECULE: NEURO-ONCOLOGICAL VENTRAL ANTIGEN 1;                       

DSSP  ..LEEEEEEEL.......................................LEEEEEEELH
Query ..SNTLTVQIL.......................................DKEYCINCPD   19
ident      | | |                                             |    
Sbjct gsQYFLKVLIPsyaagsiigkggqtivqlqketgatiklskskdfypgttERVCLIQGTI   60
DSSP  llLEEEEEEEEhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllllllllEEEEEEEELH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhlllllllhHHHHH..........................
Query DERANLESAARYLDgKXREirssgkvigaDRVAV..........................   53
ident                                 |                           
Sbjct EALNAVHGFIAEKI.REMP..........PDRANqvkiivpnstagliigkggatvkaim  109
DSSP  HHHHHHHHHHHHHH.LLLL..........LHHHHeeeeeeehhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  ...............hhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ...............xaaLNITHdllhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                                        
Sbjct eqsgawvqlsqnrvvtvsGEPEQ................nrkaveliiqkiqedp  148
DSSP  hhhlleeeelleeeeeeeLLHHH................hhhhhhhhhhhhhhll


No 15: 1WE8A  MOLECULE: TUDOR AND KH DOMAIN CONTAINING PROTEIN;                    

DSSP  .............LEEEEEEELL.....................................
Query .............SNTLTVQILD.....................................   10
ident                                                             
Sbjct gssgssgiltentPVFEQLSVPQrsvgriigrggetirsickasgakitcdkesegtlll   60
DSSP  lllllllllllllEEEEEEEEELllhhhhhllllhhhhhhhhhhlleeeellllllllll


DSSP  .EEEEEeELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .KEYCInCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIgadrvavxaalnithdllhrker   69
ident      |     | |              | |                             
Sbjct sRLIKIsGTQKEVAAAKHLILEKVSEDEELRKRIAHS.......................   97
DSSP  eEEEEEeEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                         
Sbjct .................asgpssg  104
DSSP  .................lllllll


No 16: 1GG4A  MOLECULE: UDP-N-ACETYLMURAMOYLALANYL-D-GLUTAMYL-2,6-                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xisvtlsqltdilngelqgaditldavttdtrkltpgclfvalkgerfdahdfadqakag   60
DSSP  llleehhhhhhhlleeeelllleelleellhhhllllleeellllllllllllhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gagallvsrpldidlpqlivkdtrlafgelaawvrqqvparvvaltgssgktsvkextaa  120
DSSP  llleeeellllllllleeeellhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ilsqcgntlytagnlnndigvpxtllrltpeydyavielganhqgeiawtvsltrpeaal  180
DSSP  hhllllleeelllllllllhhhhhhlllllllleeeeelllllllhhhhhhhhhllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vnnlaslagvakakgeifsglpengiaixnadnndwlnwqsvigsrkvwrfspnaansdf  240
DSSP  elllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllhhhhhhhhllleeeeelllllllll


DSSP  ..........LEEEEEEELLEEEEEEEL...HHHHHHHHHHHHHHHHHH...........
Query ..........SNTLTVQILDKEYCINCP...DDERANLESAARYLDGKX...........   36
ident               | |          |       ||   ||                  
Sbjct tatnihvtshGTEFTLQTPTGSVDVLLPlpgRHNIANALAAAALSXSVGatldaikagla  300
DSSP  eeeeeeelllLEEEEEEELLEEEEEEELlllLHHHHHHHHHHHHHHHLLllhhhhhhhhl


DSSP  ....................hhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHH
Query ....................reirssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqeSSS   76
ident                                                            |
Sbjct nlkavpgrlfpiqlaenqlllddsynanvgsxtaavqvlaexpgyrvlvvgdxaelgAES  360
DSSP  llllllllleeeeeelleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllllLHH


DSSP  HH..........................................................
Query TR..........................................................   78
ident                                                             
Sbjct EAchvqvgeaakaagidrvlsvgkqshaistasgvgehfadktalitrlklliaeqqvit  420
DSSP  HHhhhhhhhhhhhhllleeeeellllhhhhhhlllleeellhhhhhhhhhhhhhhlllee


DSSP  ....hhhhhhhhhllllll
Query ....ervrelldrvdrala   93
ident                    
Sbjct ilvkgsrsaaxeevvralq  439
DSSP  eeeellhhhllhhhhhhhl


No 17: 1BB8A  MOLECULE: INTEGRASE;                                                 

DSSP  .....................LEEEEEEEL.LEEEEEEELHH..............HHHH
Query .....................SNTLTVQIL.DKEYCINCPDD..............ERAN   24
ident                                                             
Sbjct ekrrdnrgrilktgesqrkdgRYLYKYIDSfGEPQFVYSWKLvatdrvpagkrdciSLRE   60
DSSP  llllllllllllllleellllLEEEEEELLlLLEEEEEELLLllllllllllllllLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query LESAARYLDGKxreirssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrel   84
ident                                                             
Sbjct KIAELQKDIHD.................................................   71
DSSP  HHHHHHHHLLL.................................................


DSSP  hhhllllll
Query ldrvdrala   93
ident          
Sbjct .........   71
DSSP  .........


No 18: 2AJ4A  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vivpefnssaelprplaekcpsiikkfisaydakpdfvarspgrvnligehidycdfsvl   60
DSSP  lllleelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeellllhhhlllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct plaidfdmlcavkvlneknpsitlinadpkfaqrkfdlpldgsyvtidpsvsdwsnyfkc  120
DSSP  eeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeellllllleeeellllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct glhvahsflkklaperfasaplaglqvfcegdvptgsglsssaaficavalavvkanmgp  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhlhhhhlllllleeeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gyhmskqnlmritvvaehyvgvnnggmdqaasvcgeedhalyvefkpqlkatpfkfpqlk  240
DSSP  lllllhhhhhhhhllhhhhhllllllhhhhhhhhllllleeeeellllleeeeellllll


DSSP  ...LEEEEEEELL...............................................
Query ...SNTLTVQILD...............................................   10
ident            |                                                
Sbjct nheISFVIANTLVvsnkfetaptnynlrvvevttaanvlaatygvvllnkgnlrdfmnvy  300
DSSP  lleEEEEEEELLLlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct yaryhnistpwngdiesgierltkmlvlveeslankkqgfsvddvaqslncsreeftrdy  360
DSSP  hhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhlllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct lttspvrfqvlklyqrakhvyseslrvlkavklmttftadedffkqfgalmnesqascdk  420
DSSP  hlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ................................EEEEEEELH...HHHHHHHHHHHH.HHH
Query ................................KEYCINCPD...DERANLESAARY.LDG   34
ident                                        |            |       
Sbjct lyecscpeidkicsialsngsygsrltgagwgGCTVHLVPGgpnGNIEKVKEALANeFYK  480
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhlllleeeellllllLEEEEEEEElllLLHHHHHHHHHHhLHH


DSSP  HHHHHHlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query KXREIRssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                                            
Sbjct VKYPKI..............................tdaelenaiivskpalgsclyel  509
DSSP  HHLLLL..............................lhhhhhhheeeelllllleeeel


No 19: 2GEZA  MOLECULE: L-ASPARAGINASE ALPHA SUBUNIT;                              

DSSP  leeeeeeeLLEEEEEE.....eLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllLLHHHHHHHH
Query sntltvqiLDKEYCIN.....cPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGkvIGADRVAVXA   55
ident                       |   |   |   |       |            |    
Sbjct ....ggwsIALHGGAGdipfslPPERRKPREEGLRHCLQIGVEALKAQ..KPPLDVVELV   54
DSSP  ....llleEEEEEEEEllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHH......................................................
Query ALNITH......................................................   61
ident                                                             
Sbjct VRELENiehfnagigsvltnsgtvemeasimdgntmkcgavsglstvlnpislarlvmdk  114
DSSP  HHHHHHllllllllllllllllllleeeeeeelllleeeeeeeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ................hhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ................dllhrKERLDqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                                 
Sbjct tphiylafqgaqdfakqqgveTVDSS....hlitaenverlklaiean  158
DSSP  lllleeehhhhhhhhhhhlllLLLHH....hhllhhhhhhhhhhhhhl


No 20: 1FNTJ  MOLECULE: PROTEASOME COMPONENT C7-ALPHA;                             

DSSP  .....................................leEEEEEELLEEEEEEELHHHHH
Query .....................................snTLTVQILDKEYCINCPDDERA   23
ident                                                    |        
Sbjct sdpssinggivvamtgkdcvaiacdlrlgsqslgvsnkfEKIFHYGHVFLGITGLATDVT   60
DSSP  lllhhhhlleeeeeeelleeeeeeeleeeelleeeeellLLEEEELLEEEEEEELHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHL..........................................
Query NLESAARYLDGKXREIRS..........................................   41
ident  |    ||                                                    
Sbjct TLNEMFRYKTNLYKLKEEraiepetftqlvssslyerrfgpyfvgpvvaginsksgkpfi  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeeelllllleee


DSSP  ................................llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ................................sgkvigadrvavxaalnithdllhrker   69
ident                                                             
Sbjct agfdligcideakdfivsgtasdqlfgmceslyepnlepedlfetisqallnaadrdals  180
DSSP  eeellllleeellleeeeellhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                         
Sbjct gwgavvyiikkdevvkrylkmrqd  204
DSSP  llleeeeeelllleeeeeelllll


No 21: 1EC6A  MOLECULE: RNA-BINDING PROTEIN NOVA-2;                                

DSSP  ...LEEEEEE...................................elleEEEEEE.....
Query ...SNTLTVQ...................................ildkEYCINC.....   17
ident         |                                                   
Sbjct mkeLVEIAVPenlvgailgkggktlveyqeltgariqiskkgeflpgtrNRRVTItgspa   60
DSSP  lllEEEEEEEhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllllllllEEEEEEellhh


DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .PDDERANLESAARYLDGKXREIrSSGKvigadrvavxaalnithdllhrkerldqesss   76
ident               |  |                                          
Sbjct aTQAAQYLISQRVTYEQGVRASN.PQKV................................   87
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllll
Query trervrelldrvdrala   93
ident                  
Sbjct .................   87
DSSP  .................


No 22: 2OTJE  MOLECULE: 23S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  lEEEEEEELL...................................EEEEEE......eLH
Query sNTLTVQILD...................................KEYCIN......cPD   19
ident        |                                         |          
Sbjct .PRVELEIPEdvdaeqdhlditvegdngsvtrrlwypdidvsvdgDTVVIEsdednakTM   59
DSSP  .LEEEEELLLlleeeeelleeeeeelleeeeeellllleeeeeelLEEEEEellllhhHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......................................h
Query DERANLESAARYLDGKXREI.......................................r   40
ident        |          |                                         
Sbjct STIGTFQSHIENMFHGVTEGweygmevfyshfpmqvnvegdevvienflgekaprrttih  119
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLeeeeeeeelllllleeeellleeeeelhhhlllleeeell


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHH..hhhhhhllllll
Query ssgkvigadrvavxaalNITHDLLHRKERLDQESssTRERV..relldrvdrala   93
ident                   |                                    
Sbjct gdtdveidgeeltvsgpDIEAVGQTAADIEQLTR..INDKDvrvfqdgvyitrkp  172
DSSP  llleeeeelleeeeeelLHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLLlllllleeeeeell


No 23: 2FH5A  MOLECULE: SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RECEPTOR ALPHA                 

DSSP  ..............................................LEEEEEE..elLEE
Query ..............................................SNTLTVQ..ilDKE   12
ident                                                             
Sbjct hsmvdfftifskgglvlwcfqgvsdsctgpvnalirsvllqetheaLTLKYKLdnqfELV   60
DSSP  llllleeeeeelllleeeeelllllllllhhhhhhhhlhhhlllllLEEEEEEelllLEE


DSSP  EEEEEL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.........llLLHHhhHHHHHHHHHHh
Query YCINCP.DDERANLESAARYLDGKXREIRSSG.........kvIGADrvAVXAALNITHd   62
ident                          |                    |       |     
Sbjct FVVGFQkILTLTYVDKLIDDVHRLFRDKYRTEiqqqsalsllnGTFD..FQNDFLRLLR.  117
DSSP  EEEEELlHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhllllhhhhlLLLL..LHHHHHHHHH.


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query llhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                
Sbjct ........................eaeessk  124
DSSP  ........................hhhhhll


No 24: 1Q8KA  MOLECULE: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mscrfyqhkfpevedvvmvnvrsiqemgayvslleynniegmihlselsrrrirsinkli   60
DSSP  llllllllllllllleeeeeeeeeelleeeeelllllllleeelhhhlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rigrnecvkvirvdkekgyidlskrrvspeeaikcedkftksktvysilrhvaevleytk  120
DSSP  lllleeeeeeeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct deqleslfqrtawvfddkykrpgygaydafkhavsdpsildsldlnederevlinninrr  180
DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .....LEEEEEEEL...................................LEEEEEEELH.
Query .....SNTLTVQIL...................................DKEYCINCPD.   19
ident                                                             
Sbjct ltpqaVKIRADIEVacygyegidavkealraglncstenmpikinliapPRYVMTTTTLe  240
DSSP  lllllLEEEELLLEellllllhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeelLEEEEEEELLl


DSSP  ..HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..DERANLESAARYLDGKXREIRssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessst   77
ident        |  |      |  | |                                     
Sbjct rtEGLSVLSQAMAVIKEKIEEKR................gvfnvqmepkvvtdtdetela  284
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL................leelllllleellllhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhllllll
Query rervrelldrvdrala   93
ident                 
Sbjct rqmerlerenaevdgd  300
DSSP  hhlllhhhllllllll


No 25: 1J5KA  MOLECULE: HETEROGENEOUS NUCLEAR RIBONUCLEOPROTEIN K;                 

DSSP  ...LEEEEEEEL....................................LEEEEEEELHHH
Query ...SNTLTVQIL....................................DKEYCINCPDDE   21
ident      |  | |                                     |    |    | 
Sbjct ggpIITTQVTIPkdlagsiigkggqrikqirhesgasikideplegseDRIITITGTQDQ   60
DSSP  lllEEEEEEEEEhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllleeeellllllllEEEEEEEEEHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhHHHHHhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query RANLESAARYLdGKXREirssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrerv   81
ident   |          |                                              
Sbjct IQNAQYLLQNS.VKQYS...........................................   76
DSSP  HHHHHHHHHHH.HHHHL...........................................


DSSP  hhhhhhllllll
Query relldrvdrala   93
ident             
Sbjct ............   76
DSSP  ............


No 26: 1GHHA  MOLECULE: DNA-DAMAGE-INDUCIBLE PROTEIN I;                            

DSSP  leeeeeeelLEEEEEEELHHH.hHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL................
Query sntltvqilDKEYCINCPDDE.rANLESAARYLDGKXREIRSSG................   43
ident            |  |              |  |                           
Sbjct ........mRIEVTIAKTSPLpaGAIDALAGELSRRIQYAFPDNeghvsvryaaannlsv   52
DSSP  ........lEEEEEEELLLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlleeeeeeellleeee


DSSP  ..lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ..kviGADRVAVXAALNITHDLLHrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                                     
Sbjct igatkEDKQRISEILQETWESADD.......................wfvse   81
DSSP  elllhHHHHHHHHHHHHHHHLHHH.......................hllll


No 27: 2B7NA  MOLECULE: PROBABLE NICOTINATE-NUCLEOTIDE PYROPHOSPHORYLASE;          

DSSP  .............................LEEEEEE........................
Query .............................SNTLTVQ........................    7
ident                                |  |                         
Sbjct meirtfleralkedlghgdlfervlekdfKATAFVRakqegvfsgekyalellemtgiec   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhlllllEEEEEEEellleelllhhhhhhhhhhlllee


DSSP  ...........ellEEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL............
Query ...........ildKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGK............   44
ident                   |          |     |      |                 
Sbjct vqtikdkerfkpkdALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSrfvealnshkvr  120
DSSP  eeellllleellllEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllllle


DSSP  ...........lllHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhHHHH......
Query ...........vigADRVavxaalnithdllhrkerldqESSSTRERVreLLDR......   87
ident                                             |      |        
Sbjct lldtrktrpllrifEKYS..vlnggasnhrlglddalmlKDTHLRHVK..DLKSflthar  176
DSSP  eelllllllllhhhHHHH..hhlllllllllllllleeeLHHHHLLLL..LHHHhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   87
ident                                                             
Sbjct knlpftakieiecesfeeaknamnagadivmcdnlsvletkeiaayrdahypfvlleasg  236
DSSP  hhlllllleeeeellhhhhhhhhhhllleeeeelllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeel


DSSP  ...............................llllll
Query ...............................vdrala   93
ident                                      
Sbjct nislesinayaksgvdaisvgalihqatfidmhmkma  273
DSSP  llllllhhhhhllllleeellhhhhlllllleeeell


No 28: 1W63Q  MOLECULE: ADAPTER-RELATED PROTEIN COMPLEX 1 GAMMA 1                  

DSSP  ......................................................LEEEEE
Query ......................................................SNTLTV    6
ident                                                             
Sbjct mmrfmllfsrqgklrlqkwylatsdkerkkmvrelmqvvlarkpkmcsflewrdLKVVYK   60
DSSP  leeeeeeellllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeellEEEEEE


DSSP  EelLEEEEEEELH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...lllllLHHHHHHHHHHHHHhh
Query QilDKEYCINCPD.DERANLESAARYLDGKXREIRS...sgkviGADRVAVXAALNIThd   62
ident        |      |                                  |          
Sbjct RyaSLYFCCAIEGqDNELITLELIHRYVELLDKYFGsvceldiiFNFEKAYFILDEFL..  118
DSSP  EelLEEEEEEELLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllhhhhhHHHHHHHHHHHLLE..


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query llhrkerldqessstrervrelldrvdrala   93
ident                                
Sbjct .mggdvqdtskksvlkaieqadllqeedesp  148
DSSP  .elleellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll