DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1T3UA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1T3U-A 14.5  0.0   92    92  100   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   2:  1YBX-A  3.4  3.2   42    91   14   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   3:  2CTK-A  3.3  3.2   44   104    7   VIGILIN;                                                   "         
   4:  1EC6-A  3.0  2.1   42    87    7   RNA-BINDING PROTEIN NOVA-2;                                "         
   5:  2OAU-A  2.8  5.0   41   254    5   SMALL-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL;                "         
   6:  1NW3-A  2.8  9.0   56   328   11   HISTONE METHYLTRANSFERASE DOT1L;                           "         
   7:  2PFD-A  2.7  7.1   63   540   13   FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     "         
   8:  1K6Y-A  2.7  3.3   58   192   14   POL POLYPROTEIN;                                           "         
   9:  2CUW-A  2.6  2.3   35    83   17   PURS;                                                      "         
  10:  1WE8-A  2.6  3.5   44   104   11   TUDOR AND KH DOMAIN CONTAINING PROTEIN;                    "         
  11:  2CTJ-A  2.5  2.8   39    95   18   VIGILIN;                                                   "         
  12:  2BBF-A  2.5  4.0   45   367   11   TRNA GUANINE TRANSGLYCOSYLASE;                             "         
  13:  2ANN-A  2.3  6.9   45   148   11   NEURO-ONCOLOGICAL VENTRAL ANTIGEN 1;                       "         
  14:  2DMW-A  2.2  3.8   61   131    7   SYNAPTOBREVIN-LIKE 1 VARIANT;                              "         
  15:  2HN1-A  2.1  4.2   74   246   12   MAGNESIUM AND COBALT TRANSPORTER;                          "         
  16:  2HF6-A  2.1  3.3   56   149   13   COATOMER SUBUNIT ZETA-1;                                   "         
  17:  1YK0-A  2.1  3.4   61   394    7   ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE CLEARANCE RECEPTOR;             "         
  18:  1Q8K-A  2.1  2.6   40   300   13   EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2                 "         
  19:  1MKM-A  2.1  2.4   39   246    8   ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                            "         
  20:  1K3E-A  2.1  3.6   45   141    4   CEST;                                                      "         
  21:  2D9X-A  2.0  2.3   33   120    3   OXYSTEROL BINDING PROTEIN-RELATED PROTEIN 11;              "         
-

No 1: 1T3UA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  LEEEEELLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query TLTVQILDKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIGADRVAVXAALNITHD   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct TLTVQILDKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIGADRVAVXAALNITHD   60
DSSP  LEEEEELLEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query LLHRKERLDQESSSTRERVRELLDRVDRALAN   92
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LLHRKERLDQESSSTRERVRELLDRVDRALAN   92
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


No 2: 1YBXA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  ...................................LEEEEELL.EEEEEL..........
Query ...................................TLTVQILD.KEYCIN..........   14
ident                                       |         |           
Sbjct innlvkqaqkxqrdxervqeelkektveasagggaVTVVATGRkDIKEITikpevvdpdd   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeellllEEEEEELLlLEEEEEelhhhlllll


DSSP  ..lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..cPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVigadrvavxaalnithdllhrkerldqes   72
ident      |        |      |     |                                
Sbjct vexLQDLILAAVNEALRKADEXVTAEISKIT.............................   91
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.............................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query sstrervrelldrvdralan   92
ident                     
Sbjct ....................   91
DSSP  ....................


No 3: 2CTKA  MOLECULE: VIGILIN;                                                   

DSSP  .................LEEEEELL..................................E
Query .................TLTVQILD..................................K    9
ident                  |  |                                       
Sbjct gssgssgkealealvpvTIEVEVPFdlhryvigqkgsgirkmmdefevnihvpapelqsD   60
DSSP  lllllllllllllllleEEEEELLHhhhhhhhllllhhhhhhhhhllleeellllllllL


DSSP  EEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query EYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIgadrvavxaalnithdllhrkerld   69
ident    |                                                        
Sbjct IIAITGLAANLDRAKAGLLERVKELQAEQEDRALR.........................   95
DSSP  EEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query qessstrervrelldrvdralan   92
ident                        
Sbjct ..............sfksgpssg  104
DSSP  ..............lllllllll


No 4: 1EC6A  MOLECULE: RNA-BINDING PROTEIN NOVA-2;                                

DSSP  ...LEEEEE.......................................llEEEEELLLLL
Query ...TLTVQI.......................................ldKEYCINCPDD   18
ident                                                       |     
Sbjct mkeLVEIAVpenlvgailgkggktlveyqeltgariqiskkgeflpgtrnRRVTITGSPA   60
DSSP  lllEEEEEEehhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlleeeellllllllllleEEEEEELLHH


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIgadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrer   78
ident                    | |                                      
Sbjct ATQAAQYLISQRVTYEQGVRASNPQK..................................   86
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhl
Query vrelldrvdralan   92
ident               
Sbjct .............v   87
DSSP  .............l


No 5: 2OAUA  MOLECULE: SMALL-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL;                

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yavnivaalaiiivgliiarmisnavnrlmisrkidatvadflsalvrygiiaftliaal   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct grvgvqtasviavlgaaglavglalqgslsnlaagvllvmfrpfrageyvdlggvagtvl  120
DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeelllleeeee


DSSP  ......................................LEEEEE................
Query ......................................TLTVQI................    6
ident                                            |                
Sbjct svqifsttmrtadgkiivipngkiiagniinfsrepvrRNEFIIgvaydsdidqvkqilt  180
DSSP  eellleeeeeelllleeeeehhhhhhlleeellllleeEEEEEEeelllllhhhhhhhhh


DSSP  ..........................llEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLl
Query ..........................ldKEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSs   40
ident                                          |                  
Sbjct niiqsedrilkdremtvrlnelgassinFVVRVWSNSGDLQNVYWDVLERIKREFDAAG.  239
DSSP  hhhhhllllllllleeeeeeellllleeEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  llllLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query gkviGADRvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident                                                     
Sbjct ...iSFPY..................................pqmdvnfkrv  254
DSSP  ...lLLLL..................................leeeeeeell


No 6: 1NW3A  MOLECULE: HISTONE METHYLTRANSFERASE DOT1L;                           

DSSP  lEEEEEL......LEEEEELL.......................................
Query tLTVQIL......DKEYCINC.......................................   15
ident  |              |                                           
Sbjct .LELRLKspvgaePAVYPWPLpvydkhhdaaheiietirwvceeipdlklamenyvlidy   59
DSSP  .LEEEELllllllLEEEELLLleeelleehhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhllllllll


DSSP  lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLL...........................
Query pDDERANLESAARYLDGKXREIRSSG...KVIG...........................   45
ident                      |                                      
Sbjct dTKSFESMQRLCDKYNRAIDSIHQLWkgtTQPMklntrpstgllrhilqqvynhsvtdpe  119
DSSP  lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   45
ident                                                             
Sbjct klnnyepfspevygetsfdlvaqmideikmtdddlfvdlgsgvgqvvlqvaaatnckhhy  179
DSSP  hhhllllllllllllllhhhhhhhhhhllllllleeeeelllllhhhhhhhhhlllleee


DSSP  .........................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhH
Query .........................adrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervR   80
ident                                                             
Sbjct gvekadipakyaetmdrefrkwmkwygkkhaeytlergdflseewreriantsvifvnnF  239
DSSP  eeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeelllllhhhhhhhhhlleeeellL


DSSP  HHHHHHHHHHHL................................................
Query ELLDRVDRALAN................................................   92
ident      ||  |                                                  
Sbjct AFGPEVDHQLKErfanmkeggrivsskpfaplnfrinsrnlsdigtimrvvelsplkgsv  299
DSSP  LLLHHHHHHHHHhhllllllleeeellllllllllllllllllhhhheeeeellllllll


DSSP  .............................
Query .............................   92
ident                              
Sbjct swtgkpvsyylhtidrtilenyfsslknp  328
DSSP  llllllllleeeeellhhhhhhhhhhhll


No 7: 2PFDA  MOLECULE: FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct sqlvecvpnfsegnnqevidaisqaisqtpgcvlldvdagpstnrtvytfvgqpecvveg   60
DSSP  lleeeelleelllllhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelllleeeeeeeelhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alsaartasqlidxrkhkgehprxgaldvcpfipvrgvsxdecvlcakafgqrlaeelnv  120
DSSP  hhhhhhhhhllllhhhlllllllllllleeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pvylygeaaqxpsrqtlpairageyealpeklkqaewvpdfgpssfvpswgatvtgarkf  180
DSSP  leeeeellllllllllhhhhlllllllhhhhllllllllllllllllllllleeeeelll


DSSP  ..LEEEEELL........................................EEEEELLLLL
Query ..TLTVQILD........................................KEYCINCPDD   18
ident         |                                              |  | 
Sbjct liAFNINLLStkeqahrialnlreqgrgkdqpgrlkkvqgigwyleeknlAQVSTNLLDF  240
DSSP  leEEEEEELLlhhhhhhhhhhhllllllllllllllleeeeeeeelllleEEEEEEELLL


DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHH.HHHH.......
Query ...ERANLESAARYLDGKXReirssgkvigadrvavxaalnithDLLH.RKER.......   67
ident            ||                                     |         
Sbjct evtALHTVYEEARREAQELN..lpvvgsqlvglvplkalldaaaFYCDkEKLFvleeehr  298
DSSP  lllLHHHHHHHHHHHHHLLL..lleeeeeeellllhhhhhhhhhHHHHhHLLLlllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   67
ident                                                             
Sbjct irlvvnrlgldslapfdpkeriieylvpdsgpeqslldaslrafvrevgarsaapgggsv  358
DSSP  hhhhhhlllllllllllhhhhlhhhhlllllllllhhhllhhhhhhhhlllllllllhhh


DSSP  ..............................hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH........
Query ..............................ldQESSSTRERVRELLDRVDRA........   89
ident                                              |     |        
Sbjct aaavaalgaalasxvgqxtygrrqfdhldstxRRLIPPFHAASAQLTSLVDAdarafaac  418
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   89
ident                                                             
Sbjct lgaiklpkntpeerdrrtcalqeglrqavavplklaetvsqlwpalqelaqcgnlsclsd  478
DSSP  hhhhllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhh


DSSP  ...........................................................h
Query ...........................................................l   90
ident                                                             
Sbjct lqvaakaletgvfgayfnvlinlkdxtddvfkektrhrissllqeaktqaalvlgslear  538
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hl
Query an   92
ident   
Sbjct ke  540
DSSP  ll


No 8: 1K6YA  MOLECULE: POL POLYPROTEIN;                                           

DSSP  ....................................................LEEEEEL.
Query ....................................................TLTVQIL.    7
ident                                                      |    | 
Sbjct fldgidkaqeehekyhsnwramasdfnlppvvakeivascdkcqlkcspgiwQLDCTHLe   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhllllllllllleeEEEEEEEl


DSSP  .LEEE.....................................eeLLLL............
Query .DKEY.....................................ciNCPD............   17
ident                                                             
Sbjct gKVILvavhvasgyieaevipaetgqetayfllklagrwpvktvHTDNgsnftsttvkaa  120
DSSP  lEEEEeeeelllleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhlllleeELLLllllllhhhhhh


DSSP  .......llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLLLHHHHHHHHHHHHHH.........HH
Query .......derANLESAARYLDGKXREIRssGKVIGADRVAVXAALNITH.........DL   61
ident              ||    |       |              |                 
Sbjct cdwagikqedGVIESMNKELKKIIGQVR..DQAEHLKTAVQMAVFIHNKkrkggiggySA  178
DSSP  hhhhlleellLHHHHHHHHHHHHHHLLH..HHLLLHHHHHHHHHHHHHHlllllllllLH


DSSP  HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query LHRKerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident   |                            
Sbjct GERI.................vdiiatdiqt  192
DSSP  HHHH.................hhhhhhhhhl


No 9: 2CUWA  MOLECULE: PURS;                                                      

DSSP  ...LEEEEEL.............................LEEEEELLLL....LLHHHHH
Query ...TLTVQIL.............................DKEYCINCPD....DERANLE   24
ident      |  |                               |   |  |            
Sbjct pryQATLLIElkkgildpqgravegvlkdlghpveevrvGKVLEIVFPAenllEAEEKAK   60
DSSP  leeEEEEEEEellllllhhhhhhhhhhhhllllllllllLEEEEEEEELllhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHhhHHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query SAARYLDgkXREIrssgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelld   84
ident      |                                                      
Sbjct AXGALLA..NPVX...........................................evya   75
DSSP  HHHHHHL..LLLL...........................................eeee


DSSP  hhhhhhhl
Query rvdralan   92
ident         
Sbjct lealkelp   83
DSSP  eeeeeell


No 10: 1WE8A  MOLECULE: TUDOR AND KH DOMAIN CONTAINING PROTEIN;                    

DSSP  ...............LEEEEELL.....................................
Query ...............TLTVQILD.....................................    8
ident                                                             
Sbjct gssgssgiltentpvFEQLSVPQrsvgriigrggetirsickasgakitcdkesegtlll   60
DSSP  llllllllllllleeEEEEEEELllhhhhhllllhhhhhhhhhhlleeeellllllllll


DSSP  .EEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .KEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVIgadrvavxaalnithdllhrker   67
ident      |     | |              | |                             
Sbjct sRLIKISGTQKEVAAAKHLILEKVSEDEELRKRIAHS.......................   97
DSSP  eEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ldqessstrervrelldrvdralan   92
ident                          
Sbjct ..................asgpssg  104
DSSP  ..................lllllll


No 11: 2CTJA  MOLECULE: VIGILIN;                                                   

DSSP  .................LEEEEELL...................................
Query .................TLTVQILD...................................    8
ident                     | |                                     
Sbjct gssgssgsiqkdlaniaEVEVSIPAklhnsligtkgrlirsimeecggvhihfpvegsgs   60
DSSP  lllllllllllllllllLEEEELLHhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllleeellllllll


DSSP  EEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KEYCINCPDDERANLESAARYLDGKXReiRSSGkvigadrvavxaalnithdllhrkerl   68
ident     |  |             |         ||                           
Sbjct DTVVIRGPSSDVEKAKKQLLHLAEEKQ..TKSG...........................   91
DSSP  LEEEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLL...........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query dqessstrervrelldrvdralan   92
ident                         
Sbjct ....................pssg   95
DSSP  ....................llll


No 12: 2BBFA  MOLECULE: TRNA GUANINE TRANSGLYCOSYLASE;                             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rprfsfsiaaregkartgtiemkrgvirtpafmpvgtaatvkalkpetvratgadiilgn   60
DSSP  lllleeeeeeeelleeeeeeeelleeeeeleeellllllllllllhhhhhhllllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tyhlmlrpgaeriaklgglhsfmgwdrpiltdsggyqvmsltkqseegvtfkshlsrhml  120
DSSP  hhhhhhlllhhhhhhlllhhhhhllllleeeelllllllllleeelleeeeelllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct spersieiqhllgsdivmafdectpypatpsraassmersmrwakrsrdafdsrkeqaen  180
DSSP  lhhhhhhhhhhhllleeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aalfgiqqgsvfenlrqqsadalaeigfdgyavgglavgegqdemfrvldfsvpmlpddk  240
DSSP  leeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ..................................lEEEEELLEEEEEL............
Query ..................................tLTVQILDKEYCIN............   14
ident                                          |    |             
Sbjct phylmgvgkpddivgavergidmfdcvlptrsgrnGQAFTWDGPINIRnarfsedlkpld  300
DSSP  leeelllllhhhhhhhhllllleeellhhhhhhhhLEELLLLLLEELLlhhhllllllll


DSSP  .....................lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.......lLLH
Query .....................cPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGK.......vIGA   46
ident                            | |                              
Sbjct sechcavcqkwsrayihhliraGEILGAMLMTEHNIAFYQQLMQKIRDSisegrfsqFAQ  360
DSSP  lllllhhhhhllhhhhhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhHHH


DSSP  HHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query DRvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident |                                             
Sbjct DF.......................................raryf  367
DSSP  HH.......................................hhhhl


No 13: 2ANNA  MOLECULE: NEURO-ONCOLOGICAL VENTRAL ANTIGEN 1;                       

DSSP  ....LEEEEEL.......................................LEEEEELLLL
Query ....TLTVQIL.......................................DKEYCINCPD   17
ident      | | |                                             |    
Sbjct gsqyFLKVLIPsyaagsiigkggqtivqlqketgatiklskskdfypgttERVCLIQGTI   60
DSSP  llleEEEEEEEhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlleeeelllllllllllEEEEEEEELH


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHhHHHHhhlllllllhHHHHH..........................
Query DERANLESAARYLDgKXREirssgkvigaDRVAV..........................   51
ident                                 |                           
Sbjct EALNAVHGFIAEKI.REMP..........PDRANqvkiivpnstagliigkggatvkaim  109
DSSP  HHHHHHHHHHHHHH.LLLL..........LHHHHeeeeeeehhhhhhhhlhhhhhhhhhh


DSSP  ...............hhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ...............xaaLNITHdllhrkerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident                                                         
Sbjct eqsgawvqlsqnrvvtvsGEPEQ.................nrkaveliiqkiqedp  148
DSSP  hhhlleeeelleeeeeeeLLHHH.................hhhhhhhhhhhhhhll


No 14: 2DMWA  MOLECULE: SYNAPTOBREVIN-LIKE 1 VARIANT;                              

DSSP  .........................................................LEE
Query .........................................................TLT    3
ident                                                             
Sbjct gssgssgmailfavvargttilakhawcggnflevteqilakipsennkltyshgnyLFH   60
DSSP  llllllllllleeeeeelleeeeeeellllllhhhhhhhhlllllllleeeeeelleEEE


DSSP  EE..elLEEEeelLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....llLLHHHHHHHHHHHH
Query VQ..ilDKEYcinCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSSG....kvIGADRVAVXAALNI   57
ident                | ||                   |                     
Sbjct YIcqdrIVYLcitDDDFERSRAFNFLNEIKKRFQTTYGSRaqtappYAMNSEFSSVLAAQ  120
DSSP  EEeellEEEEeeeELLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhllllLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query THDLLHRKERLdqessstrervrelldrvdralan   92
ident                                    
Sbjct LKHHSSGPSSG........................  131
DSSP  HHHHLLLLLLL........................


No 15: 2HN1A  MOLECULE: MAGNESIUM AND COBALT TRANSPORTER;                          

DSSP  .............LEEEEEL....LEEE.....................EELL.......
Query .............TLTVQIL....DKEY.....................CINC.......   15
ident                                                             
Sbjct pvftgekkveetkITAAIYDeksvEFKElevgelesvvrsalalnkklwIDVVgvhdesl   60
DSSP  lllllllllllllLEEEEELllllLEELllllllhhhhlllllllleeeEEELllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   15
ident                                                             
Sbjct iakiceflgihplaaedilntaqrvkiedyddhlflvlkillynetleidqlslvlkknl  120
DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhlllllleeeellleeeeeeeeeeellleeeeeeeeeeelle


DSSP  ....LLLLhhhHHHHHHHH...hHHHHhhhlllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ....PDDEranLESAARYL...dGKXReirssgkvigadrVAVXAALNITHDLLHRKERL   68
ident        |   | |    |                      |         |        
Sbjct vatfEEREywiLDSIRSRLksggRMRK.............LAGDYLAYTILDAVVDSYFE  167
DSSP  eeeeELLLlllLHHHHHHHhlllHHHH.............LLHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....................................
Query DQESSSTRERVRELLDRVDRALA.....................................   91
ident      |    | |                                               
Sbjct ALLKISDEIEVLEDEVVSGDSTLigkihslkreilafrnavwplrdvlsfftrvehelig  227
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ..................l
Query ..................n   92
ident                    
Sbjct eevkvyyrdvydhavrlme  246
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhll


No 16: 2HF6A  MOLECULE: COATOMER SUBUNIT ZETA-1;                                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mealilepslytvkailildndgdrlfakyyddtypsvkeqkafeknifnkthrtdseia   60
DSSP  lllllllllllllleeeeeelllleeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllee


DSSP  .....LEEEE..elLEEEeELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lllLLHHHH
Query .....TLTVQ..ilDKEYcINCPDDERANLESAARYLDGKXREIRSS....gkvIGADRV   49
ident      |           | |         |      |                       
Sbjct lleglTVVYKssidLYFYvIGSSYENELMLMAVLNCLFDSLSQMLRKnvekralLENMEG  120
DSSP  eelleEEEEEeellEEEEeEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhhhHLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query AVXAALNITHDLLhrkerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident    |   |                                   
Sbjct LFLAVDEIVDGGV..............ilesdpqqvvhrvalr  149
DSSP  HHHHHHHHEELLE..............ellllhhhhhhhhhhl


No 17: 1YK0A  MOLECULE: ATRIAL NATRIURETIC PEPTIDE CLEARANCE RECEPTOR;             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct alppqkievlvllpqddsylfsltrvrpaieyalrsvegllppgtrfqvayedsdcgnra   60
DSSP  llllleeeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeelllllhh


DSSP  .........leeeeelLEEEEEL.....................................
Query .........tltvqilDKEYCIN.....................................   14
ident                 |                                           
Sbjct lfslvdrvaaargakpDLILGPVceyaaapvarlashwdlpmlsagalaagfqhkdseys  120
DSSP  hhhhhhhhhhllllllLEEELLLlhhhhhhhhhhhhhlllleeelllllhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   14
ident                                                             
Sbjct hltrvapayakmgemmlalfrhhhwsraalvysddklerncyftlegvhevfqeeglhts  180
DSSP  leeellllhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhlleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   14
ident                                                             
Sbjct iysfdetkdldledivrniqaservvimcassdtirsimlvahrhgmtsgdyaffnielf  240
DSSP  eeeelllllllhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhhhhllllllllleeeeelll


DSSP  ...........................................................l
Query ...........................................................c   15
ident                                                             
Sbjct nsssygdgswkrgdkhdfeakqaysslqtvtllrtvkpefekfsmevkssvekqglnmed  300
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhheeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..lLHHHHHHHHHHHH............hhhH
Query pDDERANLESAARYLDGKXREIRSSGKV..iGADRVAVXAALNI............thdL   61
ident            |  |                                             
Sbjct yVNMFVEGFHDAILLYVLALHEVLRAGYskkDGGKIIQQTWNRTfegiagqvsidangdR  360
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllLHHHHHHHHLLEEeelllleeeelllllL


DSSP  HHH.....................HHHHHHhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhl
Query LHR.....................KERLDQessSTRErvrelldrvdralan   92
ident                                    |                
Sbjct YGDfsviamtdveagtqevigdyfGKEGRF...EMRP...............  394
DSSP  LLEeeeeeeeelllleeeeeeeeeLLLLEE...EELL...............


No 18: 1Q8KA  MOLECULE: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mscrfyqhkfpevedvvmvnvrsiqemgayvslleynniegmihlselsrrrirsinkli   60
DSSP  llllllllllllllleeeeeeeeeelleeeeelllllllleeelhhhlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rigrnecvkvirvdkekgyidlskrrvspeeaikcedkftksktvysilrhvaevleytk  120
DSSP  lllleeeeeeeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct deqleslfqrtawvfddkykrpgygaydafkhavsdpsildsldlnederevlinninrr  180
DSSP  lhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......LEEEEEL.....................................lEEEEELLLl
Query ......TLTVQIL.....................................dKEYCINCPd   17
ident            |                                                
Sbjct ltpqavKIRADIEvacygyegidavkealraglncstenmpikinliapprYVMTTTTL.  239
DSSP  llllllEEEELLLeellllllhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeelleEEEEEELL.


DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query dERANLESAARYLDGKXREIRSSGKVigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstre   77
ident  ||    |          |                                         
Sbjct .ERTEGLSVLSQAMAVIKEKIEEKRG.............vfnvqmepkvvtdtdetelar  285
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.............eelllllleellllhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhl
Query rvrelldrvdralan   92
ident                
Sbjct qmerlerenaevdgd  300
DSSP  hlllhhhllllllll


No 19: 1MKMA  MOLECULE: ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mntlkkafeildfivknpgdvsvseiaekfnmsvsnaykymvvleekgfvlrkkdkryvp   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhllleeellllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gyklieygsfvlrrfnirdiahdhlvdimkrtgetvhlilkdgfegvyidkvegeqsipm  120
DSSP  llhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeellleeeeeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vsrlgmkvdlystasgksilafvpekelkeylkivelkpktpntitnprvlkrelekirk  180
DSSP  lllllleeellllhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............LEEEEEL......LEEEEEL.....LLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...............TLTVQIL......DKEYCIN.....CPDDERANLESAARYLDGKX   34
ident                   | |            |                          
Sbjct rgyavdneeneigimCVGVPIFdhngypVAGVSISgvarkFTEEKIEEYSDVLKEKAEEI  240
DSSP  hlleeeelllllleeEEEEEEEllllleEEEEEEEeehhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query REIRSsgkvigadrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident                                                           
Sbjct SRKLG....................................................y  246
DSSP  HHHLL....................................................l


No 20: 1K3EA  MOLECULE: CEST;                                                      

DSSP  ................................................LEEEEELL....
Query ................................................TLTVQILD....    8
ident                                                             
Sbjct mssrselllekfaekigigsisfnenrlcsfaideiyyislsdandeyMMIYGVCGkfpt   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllleeeelllleeeeellllleEEEEEEEEelll


DSSP  .................................EEEEELL....LLLLHHHHHHHHHHHH
Query .................................KEYCINC....PDDERANLESAARYLD   31
ident                                                   |         
Sbjct dnsnfaleilnanlwfaenggpylcyeagaqslLLALRFPlddaTPEKLENEIEVVVKSM  120
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllleeEEEEEEEllllLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLlLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query GKXREIRSSGkVIGAdrvavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdrala   91
ident             |                                               
Sbjct ENLYLVLHNQ.GITL.......................................kieeis  140
DSSP  HHHHHHHHLL.LLLL.......................................leeeel


DSSP  l
Query n   92
ident  
Sbjct s  141
DSSP  l


No 21: 2D9XA  MOLECULE: OXYSTEROL BINDING PROTEIN-RELATED PROTEIN 11;              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gssgssgenvygylmkytnlvtgwqyrffvlnneaglleyfvneqsrnqkprgtlqlaga   60
DSSP  lllllllllleeeeeeeeellleeeeeeeeellllleeeeellhhhlllllleeeellll


DSSP  .........lEEEE...ellEEEEElllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllhhh
Query .........tLTVQ...ildKEYCIncpddERANLESAARYLDGKXREIRSSGKvigadr   48
ident                                          |                  
Sbjct vispsdedshTFTVnaasgeQYKLR...atDAKERQHWVSRLQICTQHHTEAIG......  111
DSSP  leelllllllLEEEllllllLEEEL...llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query vavxaalnithdllhrkerldqessstrervrelldrvdralan   92
ident                                             
Sbjct ...................................knnsgpssg  120
DSSP  ...................................lllllllll