DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1PXYA MOLECULE: FIMBRIN-LIKE PROTEIN;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1RT8-A 41.5  3.7  453   467   44   FIMBRIN;                                                   "         
   2:  1DXX-A 13.3 10.3  130   238   18   DYSTROPHIN;                                                "         
   3:  2D86-A 12.2  3.3  115   143   21   VAV-3 PROTEIN;                                             "         
   4:  1H67-A 12.0  2.3  103   108   22   CALPONIN ALPHA;                                            "         
   5:  1WYR-A 11.9  2.5  108   121   21   RHO GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 6;                  "         
   6:  2D85-A 11.3  2.9  110   124   21   L-PLASTIN;                                                 "         
   7:  1WYM-A 11.3  3.0  125   155   20   TRANSGELIN-2;                                              "         
   8:  2D87-A 10.6  2.9  111   128   16   SMOOTHELIN SPLICE ISOFORM L2;                              "         
   9:  1SJJ-A  9.3  2.9  106   863   19   ACTININ;                                                   "         
  10:  1WYO-A  7.9  5.5  111   159   15   MICROTUBULE-ASSOCIATED PROTEIN RP/EB FAMILY                "         
  11:  2D88-A  7.0  3.0   97   121   13   PROTEIN MICAL-3;                                           "         
  12:  1WIX-A  4.6  3.6  105   164    3   HOOK HOMOLOG 1;                                            "         
  13:  1HTJ-F  2.4  3.1   59   182   12   KIAA0380;                                                  "         
  14:  1XLY-A  2.2  3.2   78   224    6   SHE2P;                                                     "         
  15:  1JFJ-A  2.1 10.5   93   134    5   CALCIUM-BINDING PROTEIN;                                   "         
  16:  1AKN-A  2.1 15.0   87   547    7   BILE-SALT ACTIVATED LIPASE;                                "         
  17:  1GVN-A  2.0  3.0   52    87   10   EPSILON;                                                   "         
-

No 1: 1RT8A  MOLECULE: FIMBRIN;                                                   

DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLH
Query ...SEKGPFVQHINRYLGDDPFLKQFLPLDPHSNQLYELVKDGVLLCKLINVAVPGTIDE   57
ident     |   |  |||  |  ||      |            |||  | ||||  || ||||
Sbjct ineEERREFIKHINSVLAGDPDVGSRVPINTETFEFFDQCKDGLILSKLINDSVPDTIDE   60
DSSP  llhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHLLLLLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLH


DSSP  HHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLLLHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query RAINTKRVLNPWERNENHTLCLNSAKAVG.CSVVNIGTQDLAEGRPHLVLGLISQLIKIQ  116
ident |  |  | |      ||     ||||| |  |  |||  |  ||| || |||  | |   
Sbjct RVLNKQRPLDNFKCIENNNVVINSAKAMGgISITNIGAGDILEGREHLILGLVWQIIRRG  120
DSSP  HHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLllLLLLLL...LHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLH
Query LLADlnLKKLRL...PPEKVLLKWMNFHLKKGGYKKTVSNFSADLKDAQAYAFLLNVLAP  173
ident ||             |||| || | | |||      |||||| |  |   |  ||| |||
Sbjct LLGK..ITLDQFlrlPPEKILLRWFNYHLKAANWPRTVSNFSKDVSDGENYTVLLNQLAP  178
DSSP  LLLL..LLHHHHlllLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLHHHLLLHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query EHCDPATLDAKDPLERAELVLSHAERMNCKRYLTAEEIVEGSSTLNLAFVAQIFHERNGL  233
ident | |  | |   | | ||| ||  ||   |  |||    | |   |||||||  |    ||
Sbjct ELCSRAPLQTTDVLQRAEQVLQNAEKLDCRKYLTPTAMVAGNPKLNLAFVAHLFNTHPGL  238
DSSP  LLLLLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHLLLLL.
Query NDVETCRDERCYRLWINSLGIDSYVNNVFEDVRNGWILLEVLDKVSPSSVNWKHASKPP.  292
ident    |  |  |   || |||         |   | | |||   ||  |  ||||   | | 
Sbjct EPAEGEREARVFTLWLNSLDVTPSIHDFFNNLRDGLILLQAYDKITPNTVNWKKVNKAPa  298
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLLLLHHHLLLLLl


DSSP  ...LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...IKMPFRKVENCNQVIKIGKQLKFSLVNVAGNDIVQGNKKLILGLLWQLMRFHMLQLL  349
ident      | |  |||||     ||   ||||   | ||  |   | | | || ||      |
Sbjct sgdEMMRFKAVENCNYAVDLGKNQGFSLVGIQGADITDGSRTLTLALVWQMMRMNITKTL  358
DSSP  lllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  HLlllLLLHHHHHHHHHHHHHLLlllLLLLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHLLLLLL
Query KSlrsEMTDADILSWANRKVRTMgrkLQIESFKDKSLSSGLFFLNLLWAVEPRVVNWNLV  409
ident  |      | |   |||          || || | | | | | |  |       |  |||
Sbjct HS...TLSDSDMVAWANSMAAKGgkgSQIRSFRDPSISTGVFVLDVLHGIKSEYVDYNLV  415
DSSP  LL...LLLHHHHHHHHHHHHLLLlllLLLLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHLLHHHL


DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query TKGETDDEKRLNATYIVSVARKLGCSVFLLPEDIVEVNQKMILILTASIMYWslqr  465
ident | | |      ||    | |||||   | |||||| |     |    | |      
Sbjct TDGSTEELAIQNARLAISIARKLGAVIFILPEDIVAVRPRLVLHFIGSLMAV....  467
DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHLL....


No 2: 1DXXA  MOLECULE: DYSTROPHIN;                                                

DSSP  .......LLHHHHHHHHHHHHLLLLlllllLLLLllllHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLL
Query .......SEKGPFVQHINRYLGDDPflkqfLPLDphsnQLYELVKDGVLLCKLINVAVPG   53
ident          |  |    |                     |     ||  |  |       
Sbjct dsyeredVQKKTFTKWVNAQFSKFG....kQHIE....NLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQ   52
DSSP  lllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lLLLL....LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLlhhHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHLLHHHHHHHHHHHH
Query TIderAINTKrvLNPWERNENHTLCLNSAKAVGCSVVNIGTQDLAEGRPHLVLGLISQLI  113
ident                     |    |          ||||  |   |   | ||||   |
Sbjct KL...PKEKG..STRVHALNNVNKALRVLQNNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNII  107
DSSP  LL...LLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLllllllllllHHHHHHHHHHHHhhHLLLllllllllllllllhhhhhhhhhhlh
Query KIQLLAdlnlkklrlpPEKVLLKWMNFHlkKGGYkktvsnfsadlkdaqayafllnvlap  173
ident                   |                                         
Sbjct LHWQVK.........nVMKNIMAGLQQT..NSEK.........................i  131
DSSP  HHHLLL.........hHHHHHHHHHLLL..LHHH.........................h


DSSP  hhllhhhHHLLlhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllll
Query ehcdpatLDAKdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstlnlafvaqifherngl  233
ident                                                             
Sbjct llswvrqSTRN.................................................  142
DSSP  hhhhhhhHHLL.................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhllllll
Query ndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskppi  293
ident                                                             
Sbjct ............................ypqvnvinfttswsdglalnalihshrpdlfd  174
DSSP  ............................llllllllllhhhlllhhhhhhhhhhlhhhll


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLLhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query kmpfrkvencnqvikigkqlkfsLVNVAgndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllkslr  353
ident                                                             
Sbjct wnsvvsqqsatqrlehafniaryQLGIE................................  202
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhLLLLL................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhllllllllll
Query semtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvnwnlvtkge  413
ident                                                             
Sbjct ............................................................  202
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query tddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                     
Sbjct ................klldpedvdttypdkksilmyitslfqvlpqqvsie  238
DSSP  ................llllhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlllllleeel


No 3: 2D86A  MOLECULE: VAV-3 PROTEIN;                                             

DSSP  ........LLHHHHHHHHHH.HHLLlllllllLLLL..lLLLH.HHHHLLLLHHHHHHHH
Query ........SEKGPFVQHINR.YLGDdpflkqfLPLD..pHSNQ.LYELVKDGVLLCKLIN   48
ident                |                            |     |||||| | |
Sbjct gssgssgmEPWKQCAQWLIHcKVLP.....tnHRVTwdsAQVFdLAQTLRDGVLLCQLLN   55
DSSP  llllllllLHHHHHHHHHHHlLLLL.....llLLLLlllLLHHhHHHHHHLLHHHHHHHH


DSSP  HHLLLLLLHHHLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLL.LLHHHHHHL.LHHHH
Query VAVPGTIDERAINTKrVLNPWERNENHTLCLNSAKA.VGCSVVN.IGTQDLAEG.RPHLV  105
ident       |    ||            |    |       |          ||        |
Sbjct NLRAHSINLKEINLRpQMSQFLCLKNIRTFLTACCEtFGMRKSElFEAFDLFDVrDFGKV  115
DSSP  HHLLLLLLHHHLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLLLlLLHHHHHLLlLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHH..HHHLLlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhh
Query LGLISQLIKI..QLLADlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqa  163
ident     | |      |                                              
Sbjct IETLSRLSRTpiALATG...........................................  132
DSSP  HHHHHHHLLLllHHHHL...........................................


DSSP  hhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlLLHHhhhhhh
Query yafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeiveGSSTlnlafv  223
ident                                                    ||       
Sbjct ...........................................irpfpsgPSSG......  143
DSSP  ...........................................lllllllLLLL......


DSSP  hhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhlllll
Query aqifhernglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssv  283
ident                                                             
Sbjct ............................................................  143
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query nwkhaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrf  343
ident                                                             
Sbjct ............................................................  143
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhh
Query hmlqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprv  403
ident                                                             
Sbjct ............................................................  143
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhl
Query vnwnlvtkgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywsl  463
ident                                                             
Sbjct ............................................................  143
DSSP  ............................................................


DSSP  ll
Query qr  465
ident   
Sbjct ..  143
DSSP  ..


No 4: 1H67A  MOLECULE: CALPONIN ALPHA;                                            

DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHLllllllllLLLLlllLHHHHHLLLLHHHHHHHHHhLLLLLLHh
Query ..SEKGPFVQHINRYLGddpflkqfLPLDphsNQLYELVKDGVLLCKLINVaVPGTIDEr   58
ident            |    |                      |||| || |||          
Sbjct mpQTERQLRVWIEGATG........RRIG...DNFMDGLKDGVILCELINK.LQPGSVQ.   47
DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHL........LLLL...LLHHHHHHHLLHHHHHHHH.HLLLLLL.


DSSP  HLLLLLLLlhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.lLLHHHHHHL.LHHHHHHHHHHHHHHH
Query AINTKRVLnpWERNENHTLCLNSAKAVGCSVV.nIGTQDLAEG.RPHLVLGLISQLIKIQ  116
ident   |       |   ||    |   |  |          || |      |      |    
Sbjct KVNDPVQN..WHKLENIGNFLRAIKHYGVKPHdiFEANDLFENtNHTQVQSTLIALASQA  105
DSSP  LLLLLLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhlLLHHHHHHLlLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhl
Query LLAdlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqayafllnvlapehc  176
ident                                                             
Sbjct KTK.........................................................  108
DSSP  HHL.........................................................


DSSP  lhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query dpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstlnlafvaqifhernglndv  236
ident                                                             
Sbjct ............................................................  108
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhllllllllh
Query etcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskppikmp  296
ident                                                             
Sbjct ............................................................  108
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query frkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllkslrsem  356
ident                                                             
Sbjct ............................................................  108
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhlllllllllllhh
Query tdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvnwnlvtkgetdd  416
ident                                                             
Sbjct ............................................................  108
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                  
Sbjct .................................................  108
DSSP  .................................................


No 5: 1WYRA  MOLECULE: RHO GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 6;                  

DSSP  .....LLHHHHHHHHHHHHlllllLLLLlllLLLL..LHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLL
Query .....SEKGPFVQHINRYLgddpfLKQFlplDPHS..NQLYELVKDGVLLCKLINVAVPG   53
ident      |     |            |              |    | || ||||||   ||
Sbjct gssgsSGEEQIVTWLISLG....vLESP.kkTICDpeEFLKSSLKNGVVLCKLINRLMPG   55
DSSP  lllllLLHHHHHHHHHHHL....lLLLL.llLLLLhhHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLLhhHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLllLLHHHHHHL.LHHHHHHHHHHH
Query TIDerAINTKrvLNPWERNENHTLCLNSAKAVGCSVvnIGTQDLAEG.RPHLVLGLISQL  112
ident                     |    |                ||  |     ||      
Sbjct SVE..KFCLD.pQTEADCINNINDFLKGCATLQVEI..FDPDDLYSGvNFSKVLSTLLAV  110
DSSP  LLL..LLLLL.lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHHHLLlLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHlllllllllllHHHHhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhl
Query IKIQLLadlnlkklrlpPEKVllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqayafllnvla  172
ident  |                                                          
Sbjct NKATES...........GPSS.......................................  120
DSSP  HHHHLL...........LLLL.......................................


DSSP  hhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlll
Query pehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstlnlafvaqifherng  232
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhlllll
Query lndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskpp  292
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllksl  352
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhlllllllll
Query rsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvnwnlvtkg  412
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query etddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                      
Sbjct ....................................................g  121
DSSP  ....................................................l


No 6: 2D85A  MOLECULE: L-PLASTIN;                                                 

DSSP  ......LLHHHHHHHHHHHHL..LLLLLllllllllllLHHHH.HLLLLHHHHHHHHHHL
Query ......SEKGPFVQHINRYLG..DDPFLkqflpldphsNQLYE.LVKDGVLLCKLINVAV   51
ident             |   |  |                                  ||    
Sbjct gssgssGNDDIIVNWVNETLReaEKSSS.........iSSFKDpKISTSLPVLDLIDAIQ   51
DSSP  llllllLLLLHHHHHHHHHHHhhLLLLL.........lLLLLLlHHHHLHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLLLHHHLLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLLHHHHHHLLHHHHHHHHHH
Query PGTIDERAINTKrVLNPWERNENHTLCLNSAKAVGCSVvNIGTQDLAEGRPHLVLGLISQ  111
ident || |      |   ||  |   |       |   |  |      || |  |  |      
Sbjct PGSINYDLLKTE.NLNDDEKLNNAKYAISMARKIGARV.YALPEDLVEVNPKMVMTVFAC  109
DSSP  LLLLLLLLLLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLHHHHLLLLHHHHLLHHHH


DSSP  HHHhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLLLllllhhhhhhhhhh
Query LIKiqlladlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnFSADlkdaqayafllnvl  171
ident |                                                           
Sbjct LMG...................................kgmkRVSG..............  120
DSSP  HHL...................................llllLLLL..............


DSSP  lhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhLLLHhhhhhhhhhhhhhll
Query apehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivEGSStlnlafvaqifhern  231
ident                                            |                
Sbjct .........................................PSSG...............  124
DSSP  .........................................LLLL...............


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhllll
Query glndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskp  291
ident                                                             
Sbjct ............................................................  124
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query pikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllks  351
ident                                                             
Sbjct ............................................................  124
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhllllllll
Query lrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvnwnlvtk  411
ident                                                             
Sbjct ............................................................  124
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query getddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                       
Sbjct ......................................................  124
DSSP  ......................................................


No 7: 1WYMA  MOLECULE: TRANSGELIN-2;                                              

DSSP  ................LLHHHHHHHHHHHHllLLLLlllLLLLLLLLHHHHHLLLLHHHH
Query ................SEKGPFVQHINRYLgdDPFLkqfLPLDPHSNQLYELVKDGVLLC   44
ident                        | |                 |         |||  ||
Sbjct gssgssgqkiekqydaDLEQILIQWITTQC..RKDV...GRPQPGRENFQNWLKDGTVLC   55
DSSP  lllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHL..LLLL...LLLLLLHHHHHHHHHLLHHHH


DSSP  HHHHHHLL..LLLLHhHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLL.LLHHHHHHL.
Query KLINVAVP..GTIDErAINTKrvLNPWERNENHTLCLNSAKAVGCSVVN.IGTQDLAEG.  100
ident  |||   |         |            |     |  |   |        | || || 
Sbjct ELINALYPegQAPVK.KIQAS..TMAFKQMEQISQFLQAAERYGINTTDiFQTVDLWEGk  112
DSSP  HHHHHHLLllLLLLL.LLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHLLl


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllll
Query RPHLVLGLISQLIKIQLLADLnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkd  160
ident     |      |       |                                        
Sbjct NMACVQRTLMNLGGLAVARDD.......................................  133
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.......................................


DSSP  lhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhHHH
Query aqayafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstLNL  220
ident                                                             
Sbjct ....................................................glfsgDPN  141
DSSP  ....................................................lllllLLL


DSSP  HhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLhHHHLlllhhhhhhhhhhll
Query AfvaqifhernglndvetcrdercyrlwinslgidsYVNNvFEDVrngwillevldkvsp  280
ident                                                             
Sbjct W..............................fpkksKESG.PSSG...............  155
DSSP  L..............................lllllLLLL.LLLL...............


DSSP  llllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhh
Query ssvnwkhaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwql  340
ident                                                             
Sbjct ............................................................  155
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhl
Query mrfhmlqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwave  400
ident                                                             
Sbjct ............................................................  155
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhh
Query prvvnwnlvtkgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimy  460
ident                                                             
Sbjct ............................................................  155
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlll
Query wslqr  465
ident      
Sbjct .....  155
DSSP  .....


No 8: 2D87A  MOLECULE: SMOOTHELIN SPLICE ISOFORM L2;                              

DSSP  ......LLHHHHHHHHHHHHLLLLLLllllllllllLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLLLL
Query ......SEKGPFVQHINRYLGDDPFLkqflpldphsNQLYELVKDGVLLCKLINVAVPGT   54
ident         |                                   ||   | |     |  
Sbjct gssgssGIKQMLLDWCRAKTRGYEHV........diQNFSSSWSDGMAFCALVHNFFPEA   52
DSSP  llllllLHHHHHHHHHHHHLLLLLLL........llLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL


DSSP  LLHHHLLLLllllhhHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLlLLLHHHHH...HLLHHHHHHHHH
Query IDERAINTKrvlnpwERNENHTLCLNSAKA.VGCSVvNIGTQDLA...EGRPHLVLGLIS  110
ident  |              |  |      ||     |      | |     |     |   | 
Sbjct FDYGQLSPQ......NRRQNFEVAFSSAEThADCPQ.LLDTEDMVrlrEPDWKCVYTYIQ  105
DSSP  LLLLLLLLL......LHHHHHHHHHHHHHHhHLLLL.LLLHHHHHhllLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLLLllllhhhhhhhhh
Query QLIKIQLLADlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnFSADlkdaqayafllnv  170
ident                                             |               
Sbjct EFYRCLVQKG............................lvktkKSSG.............  124
DSSP  HHHHHHHHHL............................lllllLLLL.............


DSSP  hlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHLLLhhhhhhhhhhhhhhl
Query lapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeiVEGSstlnlafvaqifher  230
ident                                                             
Sbjct .........................................PSSG...............  128
DSSP  .........................................LLLL...............


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhlll
Query nglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhask  290
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllk  350
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhlllllll
Query slrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvnwnlvt  410
ident                                                             
Sbjct ............................................................  128
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query kgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                        
Sbjct .......................................................  128
DSSP  .......................................................


No 9: 1SJJA  MOLECULE: ACTININ;                                                   

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhl
Query sekgpfvqhinrylgddpflkqflpldphsnqlyelvkdgvllcklinvavpgtiderai   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ntkrvlnpwernenhtlclnsakavgcsvvnigtqdlaegrphlvlglisqlikiqllad  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhllhhh
Query lnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqayafllnvlapehcdpat  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhh
Query ldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstlnlafvaqifhernglndvetcr  240
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhllllllllhhhhh
Query dercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskppikmpfrkv  300
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhlllllLLHHH
Query encnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgLLWQlmrfhmlqllkslrseMTDAD  360
ident                                    |                        
Sbjct ...................................LDPA.............wekQQRKT   12
DSSP  ...................................LLLL.............lhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLLLLLLLLlllLHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHLlllLLLL.lLLHHHHH
Query ILSWANRKVRTMGRKLQIEsfkDKSLSSGLFFLNLLWAVEPRVVnwnLVTK.gETDDEKR  419
ident    | |   |  |               ||    ||                      | 
Sbjct FTAWCNSHLRKAGTQIENI...EEDFRDGLKLMLLLEVISGERL...AKPErgKMRVHKI   66
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLL...LLLLLLLHHHHHHHHHLLLLLL...LLLLllLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHhHLLL.............
Query LNATYIVSVARKLGCSV.FLLPEDIVEVNQKMILILTASIMYwSLQR.............  465
ident  |           |        | ||  | || |     |                    
Sbjct SNVNKALDFIASKGVKLvSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWTIIL.RFAIqdisveetsakeg  125
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLlLLLLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLLlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct lllwyqrktapyknvniqnfhiswkdglgfcalihrhrpelidygklrkddpltnlntaf  185
DSSP  lhhhhhhhhllllllllllllhhhlllhhhhhhhhlllllllllhhhhllllhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct dvaekyldipkmldaedivgtarpdekaimtyvssfyhafsgaqkaetaanrickvlavn  245
DSSP  hhhhhhhlllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct qeneqlmedyeklasdllewirrtipwlenrapentmqamqqkledfrdyrrlhkppkvq  305
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct ekcqleinfntlqtklrlsnrpafmpsegkmvsdinnawggleqaekgyeewllneirrl  365
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhheeh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct erldhlaekfrqkasiheswtdgkeamlqqkdyetatlseikallkkheafesdlaahqd  425
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct rveqiaaiaqelneldyydspsvnarcqkicdqwdnlgaltqkrrealerteklletidq  485
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct lyleyakraapfnnwmegamedlqdtfivhtieeiqglttaheqfkatlpdadkerqail  545
DSSP  hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct gihnevskivqtyhvnmagtnpyttitpqeingkwehvrqlvprrdqalmeeharqqqne  605
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct rlrkqfgaqanvigpwiqtkmeeigrisiemhgtledqlnhlrqyeksivnykpkidqle  665
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct gdhqqiqealifdnkhtnytmehirvgweqllttiartinevenqiltrdakgisqeqmn  725
DSSP  hhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct efrasfnhfdrkktgmmdcedfraclismgynmgeaefarimsivdpnrmgvvtfqafid  785
DSSP  hhhhhhllllllllleeelllhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhlllllleeellhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  465
ident                                                             
Sbjct fmsretadtdtadqvmasfkilagdknyitvdelrrelppdqaeyciarmapyngrdavp  845
DSSP  lhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlllleeehhhhhhhllhhhhhhhhhhleellllllll


DSSP  ..................
Query ..................  465
ident                   
Sbjct galdymsfstalygesdl  863
DSSP  leeelhhhhhhhllllll


No 10: 1WYOA  MOLECULE: MICROTUBULE-ASSOCIATED PROTEIN RP/EB FAMILY                

DSSP  .....................LLHHHHHHHHHHHHLllllllllLLLLllllHHHHhLLL
Query .....................SEKGPFVQHINRYLGddpflkqfLPLDphsnQLYElVKD   39
ident                                |  |         |               
Sbjct gssgssgmavnvystsvtsenLSRHDMLAWVNDSLH........LNYT....KIEQ.LCS   47
DSSP  lllllllllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHLL........LLLL....LHHH.HHH


DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLLLHHHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHH
Query GVLLCKLINVAVPGTIDERAINTKrvLNPWERNENHTLCLNSAKAVGCSVVnIGTQDLAE   99
ident |   |       ||    |           |   |        |  |     |    |  
Sbjct GAAYCQFMDMLFPGCVHLRKVKFQ.aKLEHEYIHNFKVLQAAFKKMGVDKI.IPVEKLVK  105
DSSP  LHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.LLHHHHLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll
Query GRPHLVLGLISQLIKIQLLAdlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlk  159
ident |        |    |                                             
Sbjct GKFQDNFEFIQWFKKFFDAN........................................  125
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHLL........................................


DSSP  llhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhh
Query daqayafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstln  219
ident                                                             
Sbjct ............................................................  125
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhHHHHlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhl
Query lafvaqIFHErnglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvs  279
ident                                                             
Sbjct .....yDGKD..................................................  130
DSSP  .....lLLLL..................................................


DSSP  lllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhh
Query pssvnwkhaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwq  339
ident                                                             
Sbjct ............................................................  130
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhh
Query lmrfhmlqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwav  399
ident                                                             
Sbjct ............................................................  130
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhlllllLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
Query eprvvnwnlVTKGetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasim  459
ident                                                             
Sbjct .ynpllarqGQDV....................................apppnpgdqif  153
DSSP  .llllhhhlLLLL....................................lllllllllll


DSSP  hhhlll
Query ywslqr  465
ident       
Sbjct sgpssg  159
DSSP  llllll


No 11: 2D88A  MOLECULE: PROTEIN MICAL-3;                                           

DSSP  ........LLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLllllllllllHHHHHLLLLHHHHHHHHHHLL
Query ........SEKGPFVQHINRYLGDDPFLKqflpldphsnQLYELVKDGVLLCKLINVAVP   52
ident                    |                    |    | |  ||  |    |
Sbjct gssgssgvARSSKLLGWCQRQTDGYAGVN........vtDLTMSWKSGLALCAIIHRYRP   52
DSSP  llllllllLLLLHHHHHHHHHLLLLLLLL........llLLLHHHHLLHHHHHHHHHHLL


DSSP  LLLLHHHLLLLllllhhhhhHHHHHHHHHHHHLL....LLLLlLLHH...hhhHLLHHHH
Query GTIDERAINTKrvlnpwernENHTLCLNSAKAVG....CSVVnIGTQ...dlaEGRPHLV  105
ident   ||                                   |             |      
Sbjct DLIDFDSLDEQ.........NVEKNNQLAFDIAEkelgISPI.MTGKemasvgEPDKLSM  102
DSSP  LLLLLLLLLLL.........LHHHHHHHHHHHHHhhllLLLL.LLHHhhhhllLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhh
Query LGLISQLIKiqlladlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqaya  165
ident      |                                                      
Sbjct VMYLTQFYE...................................................  111
DSSP  HHHHHHHHH...................................................


DSSP  hhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhhhhHH
Query fllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstlnlafvAQ  225
ident                                                             
Sbjct .......................................................mfkDS  116
DSSP  .......................................................hhlLL


DSSP  HHHHlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllh
Query IFHErnglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnw  285
ident                                                             
Sbjct GPSS........................................................  120
DSSP  LLLL........................................................


DSSP  hhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query khaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhm  345
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhll
Query lqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvn  405
ident                                                             
Sbjct ............................................................  120
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query wnlvtkgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                             
Sbjct ...........................................................g  121
DSSP  ...........................................................l


No 12: 1WIXA  MOLECULE: HOOK HOMOLOG 1;                                            

DSSP  .......LLHH.HHHHHHHHHHllLLLLlllllllllllhHHHHLLllhhHHHHHHHHLL
Query .......SEKG.PFVQHINRYLgdDPFLkqflpldphsnqLYELVKdgvlLCKLINVAVP   52
ident                                                         |   
Sbjct gssgssgLPLCdSLIIWLQTFK..TASP..........cqDVKQLT...nGVTMAQVLHQ   45
DSSP  lllllllLHHHhHHHHHHLLLL..LLLL..........llLHHHHL...lLHHHHHHHHH


DSSP  ........lLLLHhHLLLlllllhHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........lllllLL
Query ........gTIDErAINTkrvlnpWERNENHTLCLNSAKAVG...........csvvnIG   93
ident                                                             
Sbjct idvawfsesWLSR.IKDD....vgDNWRIKASNLKKVLHGITsyyheflgqqiseeliPD  100
DSSP  hllllllhhHHLL.LLLH....hhHLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhhllllllllllllLL


DSSP  HHHHH.HLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query TQDLA.EGRPHLVLGLISQLIKIQLLADLnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvs  152
ident          |     |                                            
Sbjct LNQITeCADPVELGRLLQLILGCAVNCEK...............................  129
DSSP  HHHHHlLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL...............................


DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlLLLL..LLLHhh
Query nfsadlkdaqayafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermNCKR..YLTAee  210
ident                                                             
Sbjct ............................................kqehIKNImtLEES..  143
DSSP  ............................................hhhhHHHHhhLLHH..


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLHHHhllllhh
Query ivegsstlnlafvaqifhernglndvetcrdercyrlwinslgidsYVNNVFEdvrngwi  270
ident                                                             
Sbjct ................................vqhvvmtaiqelmsKSGPSSG.......  164
DSSP  ................................hhhhhhhhhhhhhhHLLLLLL.......


DSSP  hhhhhhhhllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllh
Query llevldkvspssvnwkhaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnk  330
ident                                                             
Sbjct ............................................................  164
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlh
Query klilgllwqlmrfhmlqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssgl  390
ident                                                             
Sbjct ............................................................  164
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhlhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhh
Query fflnllwaveprvvnwnlvtkgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkm  450
ident                                                             
Sbjct ............................................................  164
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlll
Query ililtasimywslqr  465
ident                
Sbjct ...............  164
DSSP  ...............


No 13: 1HTJF  MOLECULE: KIAA0380;                                                  

DSSP  llhhhhhhhhhhhhllLLLLLLLLlllllllhhhhHLLLLHHHHHHHHHHLL........
Query sekgpfvqhinrylgdDPFLKQFLpldphsnqlyeLVKDGVLLCKLINVAVP........   52
ident                 |                        |   |              
Sbjct ..............esDIIFQDLE.........klKSRPAHLGVFLRYIFSQadpspllf   37
DSSP  ..............lhHHHHHLHH.........hhHHLHHHHHHHHHHHHHHlllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   52
ident                                                             
Sbjct ylcaevyqqaspkdsrslgkdiwnifleknaplrvkipexlqaeidsrlrnsedargvlc   97
DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhh


DSSP  ..........................lLLLHHHLllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..........................gTIDERAIntkrVLNPWERNENHTLCLNSAKAVG   86
ident                               |          |          |       
Sbjct eaqeaaxpeiqeqihdyrtkrtlglgsLYGENDL.ldlDGDPLRERQVAEKQLAALGDIL  156
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhHHLLLHH.hhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  lllllllhhhhhhllhhhhHHHHHhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhll
Query csvvnigtqdlaegrphlvLGLISqlikiqlladlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkgg  146
ident                      |                                      
Sbjct .......sayaadrsapxdFALNT....................................  173
DSSP  .......hlllhhhhhhhhHHHHH....................................


DSSP  lllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query ykktvsnfsadlkdaqayafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryl  206
ident                                                             
Sbjct ............................................................  173
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhll
Query taeeivegsstlnlafvaqifhernglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvr  266
ident                                                             
Sbjct ............................................................  173
DSSP  ............................................................


DSSP  llhhhhhhhhhhllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhh
Query ngwillevldkvspssvnwkhaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndiv  326
ident                                                             
Sbjct ............................................................  173
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhh
Query qgnkklilgllwqlmrfhmlqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdksl  386
ident                                                             
Sbjct ............................................................  173
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlhhhhhhhhhhlhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhll
Query ssglfflnllwaveprvvnwnlvtkgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivev  446
ident                                                             
Sbjct ............................................................  173
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query nqkmililtasimywslqr  465
ident                    
Sbjct ..........yxshagirl  182
DSSP  ..........hhhhlllll


No 14: 1XLYA  MOLECULE: SHE2P;                                                     

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhHHHLLllHHHHHHHHHHLL........
Query sekgpfvqhinrylgddpflkqflpldphsnqlYELVKdgVLLCKLINVAVP........   52
ident                                           |                 
Sbjct .......................dikvtpgtseLVEQI..LALLSRYLSSYIhvlnkfis   35
DSSP  .......................lllllllhhhHHHHH..HHHHHHHHHHHHhhhhhhhh


DSSP  .....................lllLHHHL.lLLLL..................lLHHHHH
Query .....................gtiDERAI.nTKRV..................lNPWERN   72
ident                                                             
Sbjct hlrrvatlrferttlikfvkklrfYNDSVlsYNASefinegkneldpeadsfdkVILPIA   95
DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhhLLHHhhllllllllllllllhhhHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHH................................hhlLLLL..LLLLHHH..
Query ENHTLCLNSA................................kavGCSV..VNIGTQD..   96
ident                                                    |        
Sbjct SMFVKSVETFdllnyyltqslqkeilsktlnedltltaesilaidDTYNhfVKFSQWMie  155
DSSP  HHHHHHHHHHhhhhhhhhlhhhhhhhhhhllhhhlllhhhhhhhhHHHHhhHHHHHHHhh


DSSP  .......................................hhhlLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................laegRPHLVLGLISQLIKIQL  117
ident                                                   |   |     
Sbjct slrigsnlldlevvqfaiksadedniflqeilpvnseeefqtlSAAWHSILDGKLSALDE  215
DSSP  hlllllhhhllhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HL.LLLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhhhhhhlhhhl
Query LA.DLNLKKlrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqayafllnvlapehc  176
ident        |                                                    
Sbjct EFdVVATKW...................................................  224
DSSP  HHhHHHHLL...................................................


DSSP  lhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query dpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstlnlafvaqifhernglndv  236
ident                                                             
Sbjct ............................................................  224
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhllllllllh
Query etcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskppikmp  296
ident                                                             
Sbjct ............................................................  224
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query frkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllkslrsem  356
ident                                                             
Sbjct ............................................................  224
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhlllllllllllhh
Query tdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwaveprvvnwnlvtkgetdd  416
ident                                                             
Sbjct ............................................................  224
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                  
Sbjct .................................................  224
DSSP  .................................................


No 15: 1JFJA  MOLECULE: CALCIUM-BINDING PROTEIN;                                   

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhl
Query sekgpfvqhinrylgddpflkqflpldphsnqlyelvkdgvllcklinvavpgtiderai   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ntkrvlnpwernenhtlclnsakavgcsvvnigtqdlaegrphlvlglisqlikiqllad  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllllhhhHHHHHHHHHhhhlllllLLLLLLlllllLHHHHHHHHHHLHHHLLhhh
Query lnlkklrlppekVLLKWMNFHlkkggykkTVSNFSadlkdAQAYAFLLNVLAPEHCDpat  180
ident                                                             
Sbjct ............MAEALFKEI.......dVNGDGA...vsYEEVKAFVSKKRAIKNE...   35
DSSP  ............LHHHHHHHH.......lLLLLLE...eeHHHHHHHHHLLLLLLHH...


DSSP  hhlllhhhhhhHHHHhhhhllllLLLL.HHHHhlllhhhHHHHHHHHHHHlllllllhhh
Query ldakdpleraeLVLShaermnckRYLT.AEEIvegsstlNLAFVAQIFHErnglndvetc  239
ident            |                                |               
Sbjct ..........qLLQL.....ifkSIDAdGNGE......iDQNEFAKFYGS..........   64
DSSP  ..........hHHHH.....hhhHHLLlLLLE......eEHHHHHHHLLL..........


DSSP  hhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllllllhhhllllllllhhhh
Query rdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvspssvnwkhaskppikmpfrk  299
ident                                                             
Sbjct ............................................................   64
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhh
Query vencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrfhmlqllkslrsemtda  359
ident                                                             
Sbjct ..........................................................iq   66
DSSP  ..........................................................ll


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllLLLLlLHHHhHLHHHHHHHHHHLhhHLLL.LLLLlllLHHHH
Query dilswanrkvrtmgrklqIESFkDKSLsSGLFFLNLLWAVEprVVNW.NLVTkgeTDDEK  418
ident                        |  |                       |         
Sbjct gqdlsddkiglkvlyklmDVDG.DGKL.TKEEVTSFFKKHG..IEKVaEQVMkadANGDG  122
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhLLLL.LLEE.EHHHHHHHHLLLL..LHHHhHHHHhhhLLLLL


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllLHHHhhlllhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query rlnatyivsvarklgcsvflLPEDivevnqkmililtasimywslqr  465
ident                                                
Sbjct ................yitlEEFL...................efsl  134
DSSP  ................eeehHHHH...................hhhl


No 16: 1AKNA  MOLECULE: BILE-SALT ACTIVATED LIPASE;                                

DSSP  .................llhhhhhhhhhhhhllllllllllLLLLLllhhhhhllllhhh
Query .................sekgpfvqhinrylgddpflkqflPLDPHsnqlyelvkdgvll   43
ident                                             |               
Sbjct aklgsvyteggfvegvnkklslfgdsidifkgipfaaapkaLEKPE..............   46
DSSP  lllleeeelleeeeleeeelllllleeeeeeeeelllllllLLLLL..............


DSSP  hhhhhhhllllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhllhh
Query cklinvavpgtideraintkrvlnpwernenhtlclnsakavgcsvvnigtqdlaegrph  103
ident                                                             
Sbjct ............................................................   46
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhh
Query lvlglisqlikiqlladlnlkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadlkdaqa  163
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Sbjct ............................................................   46
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhHHHL..llhhhhhh
Query yafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeEIVE..gsstlnla  221
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Sbjct ..........................................rhpgWQGTlkaksfkkrc   64
DSSP  ..........................................llllLLLEeellllllee


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Query fvaqifhernglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkvSPS  281
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Sbjct lqatltqdstygnedclylniwvpqgrkevshdlpvmiwiyggaflmgasqganflsNYL  124
DSSP  llllllllllleelllleeeeeeeelllllllleeeeeeelllllllllllllllllLLL


DSSP  LLL.hhHLLL..................................................
Query SVN.wkHASK..................................................  290
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Sbjct YDGeeiATRGnvivvtfnyrvgplgflstgdsnlpgnyglwdqhmaiawvkrnieafggd  184
DSSP  LLLhhhHHHHlleeeeelllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  290
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Sbjct pdnitlfgesaggasvslqtlspynkglikraisqsgvglcpwaiqqdplfwakriaekv  244
DSSP  eeeeeeeeelhhhhhhhhhhhlhhhllllleeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhl


DSSP  .......lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh
Query .......ppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllwqlmrf  343
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Sbjct gcpvddtskmagclkitdpraltlayklplgsteypklhylsfvpvidgdfipddpvnly  304
DSSP  llllllhhhhhhhhhhllhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllllllhhhlh


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Query hmlqllkslrsEMTDaDILSWANRKvrtmgrklQIESfkdKSLSsGLFFLNLLWAVEP.R  402
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Sbjct anaadvdyiagTNDM.DGHLFVGMD.......vPAINsnkQDVT.EEDFYKLVSGLTVtK  355
DSSP  hhhllleeeeeEELL.LLHHHHHHH.......lLLLLlllLLLL.HHHHHHHHHHHLHhH


DSSP  HLLlllllllllhhhhhhhhhhhhHHHHHhlllLLLLhhHHHLlLHHHHHHHHHHHHHHH
Query VVNwnlvtkgetddekrlnatyivSVARKlgcsVFLLpeDIVEvNQKMILILTASIMYWS  462
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Sbjct GLR..................ganATYEV...yTEPW..AQDS.SQETRKKTMVDLETDI  391
DSSP  HHH..................hhhHHHHH...hLLLL..LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L...........................................................
Query L...........................................................  463
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Sbjct Lfliptkiavaqhkshaksantytylfsqpsrmpiypkwmgadhaddlqyvfgkpfatpl  451
DSSP  Hlhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeellllllllllllllllllllhhhhllhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  463
ident                                                             
Sbjct gyraqdrtvskamiaywtnfartgdpntghstvpanwdpytleddnyleinkqmdsnsmk  511
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllleeeeelllllhhhee


DSSP  ..................................ll
Query ..................................qr  465
ident                                     
Sbjct lhlrtnylqfwtqtyqalptvtsagasllppednsq  547
DSSP  elllhhhhhhhhlhhhhlllllllllllllllllll


No 17: 1GVNA  MOLECULE: EPSILON;                                                   

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhhhHHLL.lLHHHHHHHHHHLL.......
Query sekgpfvqhinrylgddpflkqflpldphsnqlyELVK.dGVLLCKLINVAVP.......   52
ident                                            |       |        
Sbjct .............................vtyekTFEIeiINELSASVYNRVLnyvlnhe   31
DSSP  .............................llhhhHHHHhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhll


DSSP  .............lllLHHHL.lLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllhhhhh
Query .............gtiDERAI.nTKRVLNPWERNENHTLCLNSAKAVGcsvvnigtqdla   98
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Sbjct lnkndsqllevnllnqLKLAKrvNLFDYSLEELQAVHEYWRSMNRYSK............   79
DSSP  llllllllhhhhhhhhHHHHHllLHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH............


DSSP  hllhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllll
Query egrphlvlglisqlikiqllADLNLkklrlppekvllkwmnfhlkkggykktvsnfsadl  158
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Sbjct .................qvlNKEKV...................................   87
DSSP  .................hhlLLLLL...................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhlhhhllhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhlllhhh
Query kdaqayafllnvlapehcdpatldakdpleraelvlshaermnckryltaeeivegsstl  218
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Sbjct ............................................................   87
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhh
Query nlafvaqifhernglndvetcrdercyrlwinslgidsyvnnvfedvrngwillevldkv  278
ident                                                             
Sbjct ............................................................   87
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllhhhhhhhhh
Query spssvnwkhaskppikmpfrkvencnqvikigkqlkfslvnvagndivqgnkklilgllw  338
ident                                                             
Sbjct ............................................................   87
DSSP  ............................................................


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Query qlmrfhmlqllkslrsemtdadilswanrkvrtmgrklqiesfkdkslssglfflnllwa  398
ident                                                             
Sbjct ............................................................   87
DSSP  ............................................................


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Query veprvvnwnlvtkgetddekrlnatyivsvarklgcsvfllpedivevnqkmililtasi  458
ident                                                             
Sbjct ............................................................   87
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DSSP  hhhhlll
Query mywslqr  465
ident        
Sbjct .......   87
DSSP  .......