DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1PB6D MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;

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Summary

Notation:
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1PB6-A 30.8  0.9  198   198  100   HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;               "         
   2:  2GEN-A 17.6  2.4  180   188   19   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
   3:  2D6Y-A 17.4  2.5  181   186   18   PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;                   "         
   4:  2PZ9-A 17.0  2.1  171   179   24   PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;                               "         
   5:  1T33-A 15.9  2.9  185   220   19   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR              "         
   6:  2F07-A 15.0  4.3  182   197   15   YVDT;                                                      "         
   7:  1ZKG-A 14.8  3.0  182   200   21   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
   8:  2FBQ-A 14.5  3.8  184   213   20   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
   9:  1VI0-A 14.5  3.0  179   189   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  10:  1U9N-A 14.4  3.2  179   194   15   TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;                            "         
  11:  2G3B-A 14.3  3.6  179   188   21   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  12:  2IAI-A 14.1  3.6  172   200   19   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;                "         
  13:  2NP5-A 13.7  3.2  176   187   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  14:  2DG8-A 13.6  3.6  171   175   18   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY            "         
  15:  2IBD-A 13.5  3.5  164   192   18   POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  16:  2NX4-A 12.7  4.0  177   194   15   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;            "         
  17:  1A6I-A 12.7  3.7  164   193   13   TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;                    "         
  18:  1UI5-A 12.5  3.2  169   199   20   A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;                                 "         
  19:  1RKT-A 12.4  3.7  175   204   15   PROTEIN YFIR;                                              "         
  20:  2FX0-A 12.3  3.2  158   179   23   HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;                           "         
  21:  2G7G-A 11.9  3.8  164   197   18   RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;              "         
  22:  2OI8-A 11.5  3.0  166   203   15   PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;                       "         
  23:  2OFL-A 11.5  3.6  174   221   20   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  24:  2GUH-A 11.5  3.1  162   179   18   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  25:  2GFN-A 11.2  4.3  165   192   18   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED            "         
  26:  1Z0X-A 11.2  4.3  168   216   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  27:  2QKO-A 11.1  4.0  166   174   13   POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY            "         
  28:  2ID3-A 11.1  4.3  171   191   22   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  29:  2FD5-A 10.8  3.9  163   180   14   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  30:  2DTZ-A 10.8  4.6  170   186   16   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;                   "         
  31:  1V7B-A 10.7  3.8  164   175   18   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  32:  2FQ4-A 10.4  4.7  143   184   19   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  33:  2UXH-A 10.3  5.3  116   206   21   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;                   "         
  34:  2Q24-A 10.3  4.0  145   173   18   PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  35:  2OF7-A 10.2  3.6  116   191   22   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  36:  2HKU-A 10.0  4.2  151   191   17   A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                      "         
  37:  2O7T-A  9.6  4.0  155   188   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  38:  2HXO-A  8.7  4.0  146   207   10   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  39:  2G7S-A  8.6  3.8  147   190   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  40:  2IU5-A  8.3  3.9  146   179   12   HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;                                 "         
  41:  2DG7-A  7.9  4.3  125   187   13   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  42:  2I10-A  6.9  5.7  122   179   15   PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                   "         
  43:  2G7L-A  6.9  4.2  134   201   11   TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                     "         
  44:  2NP3-A  5.8  3.8  116   141   13   PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;                            "         
  45:  1ZK8-A  4.8  4.0  109   177    8   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  46:  2HYJ-A  4.3  5.0  110   193   14   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  47:  1TQI-A  4.2  5.6   90   269    9   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  48:  1SGM-A  4.2  5.6  100   184   21   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF;          "         
  49:  2O3F-A  3.9  4.1   61    83   10   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;          "         
  50:  1XJE-A  3.9  3.8   87   627    9   RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;                   "         
  51:  2HXI-A  3.8  8.6  105   197   11   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  52:  2AO9-A  3.8  6.4   81   117    9   PHAGE PROTEIN;                                             "         
  53:  2OBP-A  3.5  2.7   54    81   11   PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;                              "         
  54:  1LVA-A  3.5  9.9   86   258   13   SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;                 "         
  55:  1L0O-C  3.5  2.5   44    57   11   ANTI-SIGMA F FACTOR;                                       "         
  56:  2EV0-A  3.2  9.1   72   131   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;                            "         
  57:  2FQ3-A  3.1  2.5   50    85    4   TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;                     "         
  58:  1T6S-A  3.1  4.2   69   162    7   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  59:  1SFX-A  3.1  6.9   68   109   15   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;                     "         
  60:  1CF7-A  3.1  2.8   46    67    9   PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);                      "         
  61:  2IA0-A  3.0  4.8   67   156    6   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR                "         
  62:  2HEO-A  3.0  2.7   43    59   19   Z-DNA BINDING PROTEIN 1;                                   "         
  63:  2ESN-A  3.0 12.7   61   299    8   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  64:  2CGP-A  3.0  3.4   48   200   17   PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);               "         
  65:  1QBJ-A  3.0  2.9   46    65   11   PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE            "         
  66:  1LDD-A  3.0  2.6   46    74   13   ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;                                "         
  67:  1I1G-A  3.0  5.9   68   140   13   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA;                            "         
  68:  1HLV-A  3.0 10.8   68   131   10   MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;                            "         
  69:  2FJI-1  2.8  5.0   89   399    7   EXOCYST COMPLEX COMPONENT SEC6;                            "         
  70:  2DBB-A  2.8  9.7   76   146    4   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR                "         
  71:  1YLF-A  2.8  3.5   58   117    9   RRF2 FAMILY PROTEIN;                                       "         
  72:  1T98-A  2.8  9.0  108   266    6   CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;                         "         
  73:  1STZ-A  2.8  7.9   93   323    6   HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA                "         
  74:  1AKH-A  2.8  2.7   40    49   10   PROTEIN (MATING-TYPE PROTEIN A-1);                         "         
  75:  2NYX-A  2.7  6.3   70   146   11   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,               "         
  76:  2NR3-A  2.7  8.3   76   168    8   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  77:  2CUJ-A  2.7  2.6   51   108   18   TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR 2-LIKE;                            "         
  78:  2CFX-A  2.7  4.7   64   140    9   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;                   "         
  79:  1Z1D-A  2.7  2.2   46    69    4   REPLICATION PROTEIN A 32 KDA SUBUNIT;                      "         
  80:  1YX3-A  2.7  2.6   53   112    8   HYPOTHETICAL PROTEIN DSRC;                                 "         
  81:  1K78-A  2.7  3.1   44   124    5   PAIRED BOX PROTEIN PAX5;                                   "         
  82:  1FX7-A  2.7  4.5   84   230   10   IRON-DEPENDENT REPRESSOR IDER;                             "         
  83:  2P5V-A  2.6  5.2   72   156   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, LRP/ASNC FAMILY;                "         
  84:  1UFM-A  2.6  3.6   56    84    7   COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;                                    "         
  85:  1JHF-A  2.6  4.0   75   197   17   LEXA REPRESSOR;                                            "         
  86:  1IRZ-A  2.6  3.2   51    64   12   ARR10-B;                                                   "         
  87:  1EH6-A  2.6  5.3   55   168   18   O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE;                      "         
  88:  2NS0-A  2.5  3.1   48    85    6   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  89:  2NNN-A  2.5  7.5   62   134   11   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  90:  2FXA-A  2.5  7.4   70   156    9   PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR;                "         
  91:  2DT5-A  2.5  8.9   85   210   18   AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;                               "         
  92:  2CG4-A  2.5  6.6   63   150   10   REGULATORY PROTEIN ASNC;                                   "         
  93:  1E68-A  2.5  3.0   51    70   14   BACTERIOCIN AS-48;                                         "         
  94:  1E2X-A  2.5  4.2   84   222    8   FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN;                   "         
  95:  1WPK-A  2.4  5.1   60   146   13   ADA REGULATORY PROTEIN;                                    "         
  96:  1UMQ-A  2.4  2.5   40    60   10   PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;               "         
  97:  1U78-A  2.4  9.3   62   103    8   TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;                      "         
  98:  1IV6-A  2.4  3.2   51    57    6   TELOMERIC REPEAT BINDING FACTOR 1;                         "         
  99:  2BE4-A  2.3 10.1   74   270    5   HYPOTHETICAL PROTEIN LOC449832;                            "         
 100:  1YOV-A  2.3  5.8   71   529    8   AMYLOID PROTEIN-BINDING PROTEIN 1;                         "         
 101:  1K6Y-A  2.3 11.3   51   192    6   POL POLYPROTEIN;                                           "         
 102:  1FJL-A  2.3  3.2   53    65   11   PROTEIN (SEGMENTATION PROTEIN PAIRED);                     "         
 103:  1D8J-A  2.3  3.6   52    81    6   GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE-BETA;                   "         
 104:  2GLO-A  2.2  3.3   46    59    4   BRINKER CG9653-PA;                                         "         
 105:  2GAU-A  2.2  2.9   48   218   15   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;                 "         
 106:  2FUG-2  2.2  4.2   69   178   12   NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1;                       "         
 107:  1Z67-A  2.2  5.1   67   127   10   HYPOTHETICAL PROTEIN S4005;                                "         
 108:  1XMK-A  2.2  3.6   50    79    8   DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;          "         
 109:  1GDT-A  2.2  2.8   39   183    3   PROTEIN (GAMMA DELTA RESOLVASE);                           "         
 110:  1CF7-B  2.2  2.7   47    82    4   PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);                      "         
 111:  2OQG-A  2.1  6.6   64   109    9   POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ARSR FAMILY            "         
 112:  2JGD-A  2.1  7.6   63   811    8   2-OXOGLUTARATE DEHYDROGENASE E1 COMPONENT;                 "         
 113:  2H6B-A  2.1  2.5   46   239   13   CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;                             "         
 114:  2G9W-A  2.1  4.2   78   119   10   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
 115:  2DA7-A  2.1  3.5   52    71   12   ZINC FINGER HOMEOBOX PROTEIN 1B;                           "         
 116:  1TWD-A  2.1  3.9   65   234    5   COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC;                           "         
 117:  1R71-A  2.1  5.6   64   114    8   TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR PROTEIN KORB;                    "         
 118:  1MKM-A  2.1  5.2   82   246   15   ICLR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                            "         
 119:  1LNW-A  2.1  6.8   64   141    8   MULTIDRUG RESISTANCE OPERON REPRESSOR;                     "         
 120:  2PG4-A  2.0  3.8   53    92   13   UNCHARACTERIZED PROTEIN;                                   "         
 121:  2NTZ-A  2.0  8.8   71   183   13   PARB;                                                      "         
 122:  2IW5-B  2.0  2.9   44   133   11   LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;                     "         
 123:  2C80-A  2.0  4.0   77   208    8   GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 28 KDA;                          "         
 124:  2AHQ-A  2.0  3.5   44    67    7   RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR RPON;                          "         
 125:  1UG2-A  2.0  3.7   53    95    9   2610100B20RIK GENE PRODUCT;                                "         
 126:  1U2W-A  2.0  3.8   52   105   13   CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;                   "         
 127:  1AIL-A  2.0  3.3   53    70    8   NONSTRUCTURAL PROTEIN NS1;                                 "         
-

No 1: 1PB6A MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL  120
DSSP  HHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLLLHHHH
Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGATLRDEVFF  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGATLRDEVFF  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query NQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident ||||||||||||||||||
Sbjct NQTVENVQRIIIEGIRPR  198
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLL


No 2: 2GENA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident      |  || |||  ||  |   |  | |    | |   |   |  ||           
Sbjct ....RKDEILQAALACFSEHGVDATTIEXIRDRSGASIGSLYHHFGNKERIHGELYLAGI   56
DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHH.LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhllLLLL....HHH
Query DIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagAPLL....MDE  115
ident     | |   |                        |   |                    
Sbjct GQYAALLEaGFARaRSAEETVRLLVTSYIDWVVANPDWARFILHSR...GRVEagelGER  113
DSSP  HHHHHHHHhHHHHlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHH...HHHHhlllHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHhhhlLL
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEavtgAT  173
ident |  |  |      |  ||    |                     |               
Sbjct LRADNQAHFARIHAALAGYRAEGLFREXPDDCFASVVIGPAHDLARQWlaGRTR....VA  169
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLL....LL


DSSP  LLlhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query LRdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident |          |          |  
Sbjct LA......DCRELLAQVAWDSVRAA  188
DSSP  HH......HHHHHHHHHHHHHHLLL


No 3: 2D6YA MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident    | |  |  ||   |   |  | |   ||  |   |     |   |  |   ||    
Sbjct ..EATKARIFEAAVAEFARHGIAGARIDRIAAEARANKQLIYAYYGNKGELFASVLEKKX   58
DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHHHHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGA...PLLMDELT  117
ident                    |   |   |      |   ||   |             |  
Sbjct LDLAISVPVD......pDDIEGWIDRLLDYHAAHPELLRLLFWEGXEYGtaeLPHEAERQ  112
DSSP  HHHHHHLLLL......hHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHLlllLLLHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLlllL
Query gDLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGAtlrD  176
ident     |                     |    | |   |                |     
Sbjct .EHYARKVAAVRDGQERG...VITDaIPAPDLLFLLVAXANWAVVVPQXKRILVGG...G  165
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLL...H


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query EVFFNQTVENVQRIIIEGIRPr  198
ident                       
Sbjct DAGTDGLRDSIKKAARRIVDR.  186
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.


No 4: 2PZ9A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |  ||   |   |  | |   ||  |  ||     || ||||||  |     
Sbjct ...STRQRIVAAAKEEFARHGIAGARVDRIAKQARTSKERVYAYFRSKEALYAHVAERET   57
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLlllhhhhhlHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGApllmdeltgDL  120
ident                  |    |           |   ||     |  |          |
Sbjct TALIEATQLD......pADLPGYAGILFDHFAARPDHYRLITWGRLELA.........PL  102
DSSP  HHHHHHLLLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHLL.........LH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHHHHHLlllllHHH
Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVEAVTGatlrdEVF  179
ident  | |  |          | | |  ||      |       |   |   |           
Sbjct QATIAGKLDKLRDAQRIGLLDPaWDPVDVLALINQIAXTWA.GQPEIAAAAA.dqavDPS  160
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHLHHH.HLHHHHHHHH.hhllLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query FNQTVENVQRIIIEGIRpr  198
ident                    
Sbjct VTARRAALVTAVEHXFPrp  179
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLll


No 5: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR

DSSP  ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHH
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALY   52
ident              |     |||  |   |        || |||       ||| ||| ||
Sbjct mnipttttKGEQAKSQLIAAALAQFGEYGL.HATTRDIAALAGQNIAAITYYFGSKEDLY   59
DSSP  lllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLHHHHLL...LLLL.........LHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHH
Query IAVLRQILDIWLAPLKAF...REDF.........APLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQAS   98
ident  |    | |             |           |    |                   |
Sbjct LACAQWIADFLGEKFRPHaekAERLfsqpapdrdAIRELILLACKNMIMLLTQedTVNLS  119
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLHHHhhhHHHHhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLlLLLL.HHHHHLHHHHHHHHHHhhHHHHHHLllllllLHHHHHHHHhHHHH
Query RLFCMEMLAgAPLL.MDELTGDLKALIDEKSalIAGWVKSgklapiDPQHLIFMIwASTQ  157
ident      | |                 |        |              |          
Sbjct KFISREQLS.PTSAyQLVHEQVIDPLHTHLTrlVAAYTGCdandtrMILHTHALL.GEVL  177
DSSP  HHHHHHHHL.LLHHhHHHHHHLHHHHHHHHHhhHHHHHLLllllhhHHHHHHHHH.HHHH


DSSP  HHHHLHHHHHHHH.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..l
Query HYADFAPQVEAVT.GATLrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRP..r  198
ident             |      ||         |   |         
Sbjct AFRLGKETILLRTgWPQF.DEEKAELIYQTVTCHIDLILHGltq  220
DSSP  HHHHLHHHHHHHHlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl


No 6: 2F07A MOLECULE: YVDT;

DSSP  ......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA   54
ident         | |   || ||    |  |        |   ||        || || ||  |
Sbjct pftmpkQTSGKYEKILQAAIEVISEKGLDKASISDIVKKAGTAQGTFYLYFSSKNALIPA   60
DSSP  llllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHHHHHHLLLLL.l
Query VLRQILDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpqaSRLFCMEMLAGAPL.l  112
ident      |   |   |     |          |                        |    
Sbjct IAENLLTHTLDQIKGrLHGDEDFWTVLDILIDETFLITERH...KDIIVLCYSGLAIDhs  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HHHHHHHHHHHHHLll


DSSP  HHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhHH
Query MDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYADFApqVE  167
ident |                 |                      |                  
Sbjct MEKWETIYQPYYSWLEKIINKAIANHEVTEginskwTARTIINLVENTAERFYIGF..EQ  175
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LL


DSSP  HHhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query AVtgatlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident                                
Sbjct DE.........NVEVYKKEIFTFLKRSLGTA  197
DSSP  LL.........LHHHHHHHHHHHHHHHHLLL


No 7: 1ZKGA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident  |  |  ||| ||   |   |        ||| ||| |     ||  || ||        
Sbjct .VLSKRDAILKAAVEVFGKKGYDRATTDEIAEKAGVAKGLIFHYFKNKEELYYQAYXSVT   59
DSSP  .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLL...LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHH
Query DIWLAPLKAFR...EDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELT  117
ident          |                |  ||| |   |               |    | 
Sbjct EKLQKEFENFLxknRNRDIFDFXERWIEKKLEYSASHPEEADFLITLVSVDEGLRKRILL  119
DSSP  HHHHHHHHHHHhhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......lllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhh
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKSG.......klaPIDP.QHLIFMIWASTQHYADFApqveav  169
ident  ||               |                                         
Sbjct .DLEKSQRVFFDFVREKLKDLdlaedvteeiALKFlXWFFSGFEEVYLRTYQGK......  172
DSSP  .HHHHHLHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHLLL......


DSSP  hlLLLLLhhHHHHHHHHhHHHHHHHHLLL...
Query tgATLRDevFFNQTVENvQRIIIEGIRPR...  198
ident     |      |  ||                
Sbjct .pELLKR..DXNTLVEE.VKVXLRILKKGxtk  200
DSSP  .hHHHHH..HHHHHHHH.HHHHHHHHHHHhll


No 8: 2FBQA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident | |     || ||   |   ||  | |  |   |||      | | || ||  ||    |
Sbjct AQSETVERILDAAEQLFAEKGFAETSLRLITSKAGVNLAAVNYHFGSKKALIQAVFSRFL   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLL.........lLLLHHHHHHHHHHHHHHH....hhHLHHHHHHHHHHHHL
Query DIWLAPLKAFR.........eDFAPLAAIKEYIRLKLEV....srDYPQASRLFCMEMLA  107
ident     | |                               |      |     ||       
Sbjct GPFCASLEKELdrrqakpeaqHATLEDLLHLLVSQAMAVkprsgnDLSIFMRLLGLAFSQ  120
DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHLllllllHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllLLLL...lHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH
Query GAPLLMDELTGDLKALIDEKSALIAGWvksgkLAPI...dPQHLIFMIWASTQHYADFAP  164
ident     |   |             |                                     
Sbjct SQGHLRKYLEEVYGKVFRRYMLLVNEA.....APKLppieLFWRVHFMLGAAAFSMSGIK  175
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....LLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH


DSSP  HHHHHHLlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....
Query QVEAVTGatlrdEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR....  198
ident    |             |           | |      
Sbjct ALRAMAEtdfgvNTSTEQVMHLMVPFFAAGMRAEsgid  213
DSSP  HHHHHHHhhhllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllll


No 9: 1VI0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident     |   |  ||       | |      ||  |||       ||  ||   |       
Sbjct ...PKYXQIIDAAVEVIAENGYHQSQVSKIAKQAGVADGTIYLYFKNKEDILISLFKEKX   57
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHH.HHHLLlLLLHHHHHl
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCM.EMLAGaPLLMDELTg  118
ident             |           |                           |       
Sbjct GQFIERXEEdIKEKATAKEKLALVISKHFSLLAGDHNLAIVTQLeLRQSNlELRQKINE.  116
DSSP  HHHHHHHHHhHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLlLLLLLhHHHHHHHH.


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhLLLLll
Query DLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtGATLrd  176
ident  ||               ||      |       |                      |  
Sbjct ILKGYLNILDGILTEGIQSGEIKEgLDVRLARQXIFGTIDETVTTWvXNDQ...KYDL..  171
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...LLLH..


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHHhlll
Query evffnQTVENVQRIIIEGirpr  198
ident           |      |    
Sbjct ....vALSNSVLELLVSGihnk  189
DSSP  ....hHHHHHHHHHHHHLllll


No 10: 1U9NA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident        |||  |                 |  || |      |||||||     |    
Sbjct .GDDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVV   59
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLL...lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHHH
Query DIWLAPLKAFR...edfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAPLLMDELT  117
ident       |                   |    |         |       |          
Sbjct NQADXALQTLAenpadtDRENXWRTGINVFFETFGSHKAVTRAGQAAR.ATSVEVAELWS  118
DSSP  HHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHL.LLLHHHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhl
Query gDLKALIDEKSALIAG.WVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtg  171
ident            |         |              |                       
Sbjct .TFXQKWIAYTAAVIDaERDRGAAPRtlpaheLATALNLXNERTLFASFAGEQPS.....  172
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.....


DSSP  lllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query atlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.  198
ident                   |    |    
Sbjct ......vPEARVLDTLVHIWVTSIYGEn  194
DSSP  ......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl


No 11: 2G3BA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident   |    ||| |      | |  | |    || ||||   | | |     |  | |  | 
Sbjct .XSERRDAILKASATAIAQRGIRGLRVNDVAEVAGVSPGLLYYHFKDRIGLLEAALNYIN   59
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLH.HHHLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHhhHHLH..HHHHHHHHHHHLLL..LLLHHH
Query DIWLA.PLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEvsRDYP..QASRLFCMEMLAGA..PLLMDE  115
ident |   |                                   |               | | 
Sbjct DRARAyRSEGEG.gDSARDRLTRSLLGEIQ..DRPEvvENSLAWNELRASAVyeEALRDP  116
DSSP  HHHHHhHLLLLL.lLLHHHHHHHHHHHLLL..LLHHhhHHHHHHHHHHHHHHhlHHHHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..HHHHhhhhll
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADF..APQVeavtga  172
ident |     |   |    |      |      |||       |                    
Sbjct LARTTAAWVSEIADAIVQAQATGEISRsLDPQPTAVTXTALVEGLSGRwlCKEI......  170
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLL......


DSSP  llllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query tlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRpr  198
ident                   |       
Sbjct ......STEDARSHLLGAIDVVXS..  188
DSSP  ......LHHHHHHHHHHHHHHHHL..


No 12: 2IAIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;

DSSP  ..........lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHH
Query ..........avsakkKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEA   50
ident                    || |   |   |  ||  |     || ||         || 
Sbjct grenlyfqgxttaktpETLLSVAVQVFIERGYDGTSXEHLSKAAGISKSSIYHHVTGKEE   60
DSSP  llllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLHHHHL..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhLL
Query LYIAVLRQILDIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlAG  108
ident |        ||     |     |             |   ||         |       |
Sbjct LLRRAVSRALDELFGILDEehARVG.TAAERLEYVVRRXVEVLXAELPYVTLLLRV..RG  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL..LL


DSSP  LLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhh
Query APLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqve  167
ident        |            ||       |                              
Sbjct TGTERWALE.RRREFDHRVAALLKDAAAEGDVRAdVEVRLATRLVFGXINSIVEWYR...  173
DSSP  LHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLHHHHLL...


DSSP  hhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query avtgatlrdEVFFNQTVENVQRIIIEGirpr  198
ident                 |  | |    |    
Sbjct ...pesgvsGAGEREVVDAVARLVFGG.lrk  200
DSSP  ...llllllLHHHHHHHHHHHHHHHHL.lll


No 13: 2NP5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident            |  |     |  |      |  ||||       |  |       ||   
Sbjct ...TSPERLAAALFDVAAESGLEGASVREVAKRAGVSIGAVQHHFSTKDEXFAFALRTLV   57
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhHHHL.HHHHHHHHHHHHLLLLL..LHHHHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEvSRDY.PQASRLFCMEMLAGAPL..LMDELT  117
ident |  || |        |  |        |                     |    |     
Sbjct DKLLARLSEVERGGDPARALFAAXSQLLP.LDEArSREAHVXAAFAVRAATSpsLAEIRR  116
DSSP  HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.LLHHhHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhlllll
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKsgkLAPI..DPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlr  175
ident       |                         |               |           
Sbjct .KTLFTIRTGLSAVLIGIG...TPEAetRAALLLATVDGLALDA.IGSPAL.........  162
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLHHH.........


DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query devfFNQTVENVQRIIIEGIRPR.....  198
ident          |    | |  |        
Sbjct ...yPPEYLEHALDIQIGXILQGadvvp  187
DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllll


No 14: 2DG8A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         || | ||     |        ||  |||      | |   | |         
Sbjct .DPQRRERILAATLDLIAEEGIARVSHRRIAQRAGVPLGSMTYHFTGIEQLLREAFGRFT   59
DSSP  .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHL.LLLL.LHHHHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLA.GAPL.LMDELT  117
ident |   |              |      |  | | |      |                   
Sbjct DHIVAVFDEhLGAAADRDEAREAVADLVHELSEDSQRDLVLTQELYTLaARQPaYRELTH  119
DSSP  HHHHHHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHhHHLHhHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHhhhhllllllh
Query gDLKALIDEKSALIAGwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVeavtgatlrde  177
ident                               |   |   | | |  |              
Sbjct .EWMRRSRVHLEKHFD........pGTARQLDALIEGLTLHRA.LAREP...........  158
DSSP  .HHHHHHHHHHLLLLL........hHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL...........


DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query vffnQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident              |       
Sbjct ....HGRALTLEAIARITTTD  175
DSSP  ....LLHHHHHHHHHHHLLLL


No 15: 2IBDA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident   |      |  |   |   |   |    ||  ||     |   | |||      ||  |
Sbjct GKSGRRTELLDIAATLFAERGLRATTVRDIADAAGILSGSLYHHFDSKESXVDEILRGFL   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLL..lLHHHHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAP..lLMDELT  117
ident |                 |          |       |      |             | 
Sbjct DDLFGKYREiVASGLDSRATLEALVTTSYEAIDASHSAVAIYQDEV.KHLVaneRFTYLS  119
DSSP  HHHHHHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHLL.HHHLllhHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHH.HHHHHHHHH.llllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllllL
Query gDLKALIDEK.SALIAGWVK.sgklapidpqhlIFMIWASTQHYADFApqveavtgatlR  175
ident   |     |         ||                                        
Sbjct .ELNTEFRELwXGVLEAGVKdgsfrsdidvelaFRFLRDTAWVAVRWY........rpgG  170
DSSP  .HHHHHHHHHhHHHHHHHHHlllllllllhhhhHHHHHHHLLHHHHLL........lllL


DSSP  LHHhHHHHHHHHHHHHhhhhlll
Query DEVfFNQTVENVQRIIiegirpr  198
ident               |        
Sbjct SVT.VDTVAKQYLSIVldglasp  192
DSSP  LLL.HHHHHHHHHHHHhhlllll


No 16: 2NX4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;

DSSP  ......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA   54
ident               |  ||       |        ||  ||     |  ||  |      
Sbjct gvpklvDHDERRRSITAAAWRLIAARGIEAANMRDIATEAGYTNGALSHYFAGKDEILRT   60
DSSP  lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLH.HHHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHhHHHHL.HHHHHHHHHHHhLLLL..
Query VLRQILDIWLA.PLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLeVSRDY.PQASRLFCMEMlAGAP..  110
ident     |          |   |   | |     |              |         |   
Sbjct SYEHISEATDRrIAEALG.DATGLDALRILCREVM.PINEEqLLEARIAASLW.PRAMyd  117
DSSP  HHHHHHHHHHHhHHHHHL.LLLHHHHHHHHHHHHL.LLLHHhHHHHHHHHHHH.HHHLll


DSSP  .LLHHHHHlHHHHHHHHHHHHH.HHHHHLLLLLLL...LHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHH
Query .LLMDELTgDLKALIDEKSALI.AGWVKSGKLAPI...DPQHLIFMIWASTQHYADFAPQ  165
ident                 |  |         |    |                |      | 
Sbjct eQMAATNR.RTMDNWREQMAIFlEQAREEGSVGDIdvtIVVEQLLNMMMGMQILGVLTPG  176
DSSP  lHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHhHHHHHHLLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  HhhhhllllllhhhHHHHHhHHHHHHHHHHlll
Query VeavtgatlrdevfFNQTVeNVQRIIIEGIrpr  198
ident                                  
Sbjct E...........tsSERQL.EMLEQFVAAL...  194
DSSP  L...........llHHHHH.HHHHHHHHLL...


No 17: 1A6IA MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident      |      ||      |  |      |   ||    |      | ||  |    ||
Sbjct .srLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAVEIL   59
DSSP  .llLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.HHHHHHhhhhlllllLHHHhhLH
Query DIWLAPLKaFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSrDYPQ.ASRLFCmemlagaplLMDEltGD  119
ident                                                             
Sbjct ARHHDYSL.PAAGESWQSFLRNNAMSFRRAL.LRYRdGAKVHL........gTRPD..EK  107
DSSP  HHHLLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLLlHHHHHH........hLLLL..HH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.........hhhhhHH
Query LKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.........pqveaVT  170
ident                         |    |      |                       
Sbjct QYDTVETQLRFMTENG....fslRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQqehlppllrealqiMD  163
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhhHH


DSSP  LLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL........
Query GATlrdevfFNQTVENVQRIIIEGIRPR........  198
ident            |         | |            
Sbjct SDD......GEQAFLHGLESLIRGFEVQltallqiv  193
DSSP  LLL......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllll


No 18: 1UI5A MOLECULE: A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident          |  || | |   |   | |  |   ||| |  |   |  || |  | |   
Sbjct lRAEQTRATIIGAAADLFDRRGYESTTLSEIVAHAGVTKGALYFHFAAKEDLAHAILEIQ   60
DSSP  lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHhl
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMLAgAPLLMDELtg  118
ident         |         | |                   |       |           
Sbjct SRTSRRLAKDlDGRGYSSLEALXRLTFGXARLCVQG.PVLRAGLRLATA.GVPVRPLP.h  117
DSSP  HHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHHL.LLLLLLLL.l


DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhhllllllh
Query dlkalidekSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFapqveavtgatlrde  177
ident                 |        ||          |                      
Sbjct pftewreiaTSRLLDAVRQSDVHQdIDVDSVAHTLVCSVVGTRVV...............  162
DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLLLLL...............


DSSP  hHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.................
Query vFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.................  198
ident             | | |  |                  
Sbjct .REPRRLAEXWYILIRGXVPVtrraryvtlaarleqet  199
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhhl


No 19: 1RKTA MOLECULE: PROTEIN YFIR;

DSSP  .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHH
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYI   53
ident                || ||   |   ||  |      |  | |      || | |    
Sbjct spkvtkeHKDKRQAEILEAAKTVFKRKGFELTTXKDVVEESGFSRGGVYLYFSSTEEXFR   60
DSSP  llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLHHHHLLL.lLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHHHHHLL...
Query AVLRQILDIWLAPLKAFR.eDFAPlAAIKEYIRLKLEVSRDYP.QASRLFCMEMLAG...  108
ident       ||  |  |           | |  |     |  ||                   
Sbjct RIIETGLDEGLRKLDKSAehQSVW.ASISSYLDELTEGLRDVAdTLAPVQFEYLVTAwrn  119
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLHH.HHHHHHHHHHHHHLLLHHhLLHHHHHHHHHHHhhl


DSSP  ..LLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHH..HHHLLlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHh
Query ..APLLMDELTGDLKALIDEKSALIAG..WVKSGklapiDPQHLIFMIWASTQHYADFAp  164
ident                                                        |    
Sbjct eeRRQYLEKRYDLFVERFSRLLQKGIDqgEFQPV.qplaTIAKFFLNXNDGIIQNALYF.  177
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLLL.llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  hhhhhhllLLLLhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLL......l
Query qveavtgaTLRDevffnqTVENVQRIIIEGIRP......r  198
ident                    |                    
Sbjct ........DEEK.....aDVSGLAESAKLYLKTvlqadek  204
DSSP  ........LHHH.....hLHHHHHHHHHHHHHHhhlllll


No 20: 2FX0A MOLECULE: HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         || ||   |   |  ||    ||  | |      |||  || ||  |     
Sbjct SREQTXENILKAAKKKFGERGYEGTSIQEIAKEAKVNVAXASYYFNGKENLYYEVFKKYG   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL


DSSP  hHHLHHhHLLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHh
Query dIWLAPlKAFRE..DFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCME.MLAGaPLLMDELt  117
ident          | |   | |  |  ||           |    |   |        |     
Sbjct .LANEL.PNFLEknQFNPINALREYLTVFTTHIKENPEIGTLAYEEiIKES.ARLEKIK.  116
DSSP  .LHHHL.LLHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHlLLLL.LLHHHHH.


DSSP  LHHHhhhhhhhhhhhhhHHLLllllLLHHHHHHHHHHHHHHHhhlHHHHHHHHllllllh
Query GDLKalideksaliagwVKSGklapIDPQHLIFMIWASTQHYadfAPQVEAVTgatlrde  177
ident                   | |        | |  |                         
Sbjct PYFIgsfeqlkeilqegEKQGvfhfFSINHTIHWITSIVLFP...KFKKFIDS.......  166
DSSP  HHLHhhhhhhhhhhhhhHHLLllllLLHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHL.......


DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHHhhlll
Query vffnQTVENVQRIIIEgirpr  198
ident       |              
Sbjct ....DLVSRIISALTD....k  179
DSSP  ....LHHHHHHHHHHL....l


No 21: 2G7GA MOLECULE: RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |  |||      |    |    |    |             |    |     
Sbjct ...LDRERIAEAALELVDRDGD..FRXPDLARHLNVQVSSIYHHAKGRAAVVELVRHRVV   55
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHhlHHHHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhllllllhhhhhLHH
Query DIwlAPLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagapllmdeltGDL  120
ident         ||        |  |  |         | | ||   |                
Sbjct RE..IDGSAFE.RLPWDEAFSEWARSYRAAFSRHPTAIRLLATET.........vrdPGS  103
DSSP  LL..LLLHHHH.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLL.........lllHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHL.........
Query KALIDEKSALIAGWVksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADFApqVEAVTG.........  171
ident         |   |               |          |  |     |           
Sbjct LSVYHSAAAGLRGAG....fpddHIXAVITAAENFLLGAALDA.aAPEVXIeadstttdd  158
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHL....llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hLLLLLLlllllllll


DSSP  .......llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....
Query .......atlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.....  198
ident                  |  |        |         
Sbjct altralaaaprGPERAEQAFELGLAALLAGFHHLlqecg  197
DSSP  hhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll


No 22: 2OI8A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;

DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAV   55
ident              |   |       |     |  ||   | |   |  ||     |    
Sbjct tprerYRTQVRAEIKDHAWEQIATAGASALSLNAIAKRXGXSGPALYRYFDGRDELITEL   60
DSSP  lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhhhLHHHHHH.HHHHhhlllLLLHH
Query LRQILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVsrdYPQASRL.FCMEmlagaPLLMD  114
ident  |         | |     | ||      |         ||   | |            |
Sbjct IRDAYRSQADSLRAAAASGADLAGLAHALRAWALD...DPQRYFLiFGTP.vpgyRAPDD  116
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHhHLLL.llllLLLHH


DSSP  HHhLHHHHHHhHHHHHHHHH..................hhllllllLLHHHHHHHHHHHH
Query ELtGDLKALIdEKSALIAGW..................vksgklapIDPQHLIFMIWAST  156
ident                                                             
Sbjct IT.EIAAETX.AVIVDACAAgtdgafdahldthrqwadrpapssalHRALSFWSRLHGVL  174
DSSP  HL.LLLHHHH.HHHHHHHLLllllhhhhhhhhllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLHhhHHHHHllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLl
Query QHYADFApqVEAVTgatlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPr  198
ident                                         | 
Sbjct SLELAGQ..FTGXG..........fDSALLFEAELKDLLGP.  203
DSSP  HHHHLLL..LLLLL..........lLHHHHHHHHHHHHLLL.


No 23: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident          ||  |   |   |   |    ||  ||||  |  |||  || |       |
Sbjct sKSEQTRALILETAXRLFQERGYDRTTXRAIAQEAGVSVGNAYYYFAGKEHLIQGFYDRI   60
DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHHHL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLL.LLLL...HH
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAG.APLL...MD  114
ident      |             |         |     |      |         ||      
Sbjct AAEHRAAVREvLARETDLEARLAGVLKVWLDIATPYHEFAVQFFKNAADPdSPLSpfsPE  120
DSSP  HHHHHHHLLLhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLLlllHH


DSSP  HHhLHHHHHHHHHHHHHhHHHHL..llllllLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhll
Query ELtGDLKALIDEKSALIaGWVKS..gklapiDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtga  172
ident          |    |   |             |                |          
Sbjct SE.HARVEAIGIHRAVLaGAKTKvpeelrdiLPELXWLSQXGLVLYW.IFDRTE......  172
DSSP  HH.HHHHHHHHHHHHHHlLLLLLllhhhllhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLL......


DSSP  llllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLL.............................l
Query tlrdevffNQTVENVQRIIIEGIRP.............................r  198
ident                 |      |                               
Sbjct ......grERSYRLAERGARLTARGvvlarfrvlrplvrevhelftdflpgxtkv  221
DSSP  ......llHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll


No 24: 2GUHA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRqI   59
ident          |  ||   |         |  ||| ||||      || ||| |  |     
Sbjct rTAEQSRSLIVDAAGRAFATRPYREITLKDIAEDAGVSAPLIIKYFGSKEQLFDALVD.F   59
DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.L


DSSP  HHHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHH.HHHHHhhHHLHHHHhHHHHHHHLL......LLLL
Query LDIWLAPLKAFredfaplAAIKEYI.RLKLEvsRDYPQASrLFCMEMLAG......APLL  112
ident                       |             |    |                 |
Sbjct RAAAEIVFSGP......lDGLGERXvSXFAR..PLEPYKP.LSLNILFXSgpseesSRKL  110
DSSP  HHHHHHHLLLL......lLLHHHHHhHHHLL..LLLLLLL.HHHHHHHLLllllhhHHHH


DSSP  HHHHHLHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHHhh
Query MDELTGDLKALIDEKSAliagwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEAvt  170
ident              |                 |               |        |   
Sbjct RANYSAQXIDALAERLP............GRDARLRAELVXSXLTGLAVXRrkXXQEH..  156
DSSP  HHHHHHHLHHHHHHHLL............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLHHH..


DSSP  llllllHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query gatlrdEVFFNQTVENVQRIIIEgirpr  198
ident              |        |     
Sbjct .....aTGTPEEVVAHYAPLVQElldgg  179
DSSP  .....lLLLHHHHHHHHHHHHHHhhhll


No 25: 2GFNA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED

DSSP  ..lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ   58
ident          |   | |      |         ||  | |   |  || |   |  | || 
Sbjct ivdHDERRRALADAVLALIAREGISAVTTRAVAEESGWSTGVLNHYFGSRHELLLAALRR   60
DSSP  lllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLHHHHL.LLLL.LLHHHHHHHHHHHHhhHHHH..LHHHHHHHHHHHHLLllLLHH
Query ILDIWLAPLKA.FRED.FAPLAAIKEYIRLKleVSRD..YPQASRLFCMEMLAGapLLMD  114
ident   ||          |    |                |       | |      |      
Sbjct AGDIQGDRYRTiLDEEgAGPIEKLRNITASI..LPLDerRLAXTRVFLFFYAEG..TARG  116
DSSP  HHHHHHHHHHHhHLLLlLLHHHHHHHHHHLL..LLLLhhHHHHHHHHHHHHHHL..LLLH


DSSP  HHhLHHHhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query ELtGDLKalideksaliagwvkSGKLAP..IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg  171
ident |                              |         | |   |  |         
Sbjct EI.AAFLarwrgvvresvvaaqREGTVStdLDADAVTVALVALTDGLALQAiLDPV..vx  173
DSSP  HH.HHHHhhhhhhhhhhhhhhhHHLLLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLHH..hh


DSSP  LLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHhlll
Query ATLRdevfFNQTVENVQRIIIEGirpr  198
ident                            
Sbjct KAIS....AEDAAARCVDAAVRR....  192
DSSP  HHHL....LLLHHHHHHHHHHLL....


No 26: 1Z0XA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQF.GFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident      |  |  ||                  |   ||       ||  | ||       |
Sbjct ..KLSKDTIIAAAFSLLEKSpTLEQLSXRKVAKQLGVQAPAIYWYFKNKQALLQSXAEAI   58
DSSP  ..LLLHHHHHHHHHHHHHHLlLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHhhLLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.HHHHHHHHhhlllllLHHHhhL
Query LDIWLAPlkAFREdfAPLAAIKEYIRLKLEVSrDYPQ.ASRLFCMEmlagaplLMDEltG  118
ident       |  |                            |                     
Sbjct EEHFQEP..ALCG..EWYSDLLAFXENYYDLY.QQFPcAVAIEIQT.......VPAY..P  104
DSSP  HHLLLLL..LLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlHHHHHHLL.......LLLL..H


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHH...........
Query DLKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVE...........  167
ident                                             |               
Sbjct QRLRHLNQXXGILREAG....fspEXTHLAVTSLQHLLFGXIXDATEEKqlvsqvlngdd  160
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllh


DSSP  ........................hhHLLLLllhhHHHHHHhHHHHHHHHHHLLL.....
Query ........................avTGATLrdevFFNQTVeNVQRIIIEGIRPR.....  198
ident                                                   |         
Sbjct ylkeqvlhxkqyvsdneltyxeesiqFHSIH....QKSAFI.QAVKTYLDGLQADntsss  215
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhlLLHHH....LHHHHH.HHHHHHHHHHLLLlllll


DSSP  .
Query .  198
ident  
Sbjct k  216
DSSP  l


No 27: 2QKOA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHH.LLLHhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELA.GVSKtNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident        |   ||       |  |         |          ||||   |   |   |
Sbjct ..PERRAALVNAAIEVLAREGARGLTFRAVDVEAnVPKG.TASNYFPSRDDLFDQVGKRI   57
DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlLLLL.LHHHHLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHlhhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLL....LLHHH
Query LDIWlaplkafredfaPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAP....LLMDE  115
ident                  |    ||                         |     |    
Sbjct HERL............NLELAIEYXQGLFGRITRDRTGYLALQELR.LEAVrrpeLRTTL  104
DSSP  HHLL............LHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHH.HHHLllhhHHHHH


DSSP  HhLHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhHHLLll
Query LtGDLKALIDEKSALIAGWVksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEaVTGAtl  174
ident                                                       |     
Sbjct T.RTISENLKRDIGFHLDSG......lpGDRSTVLXLYLAXNALIVEHlTLPG.VLEG..  154
DSSP  H.HHHHHHHHHHHHHHHHHL......llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.HLLL..


DSSP  llhHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLL
Query rdeVFFNQTVENVQRIIIeGIRPR  198
ident    |     |              
Sbjct ...VDTERLVADLVTRAV.ATPDA  174
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHL.LLLLL


No 28: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ   58
ident          | | || |     ||    |  ||  ||| ||           |    |  
Sbjct ggRTARIREAVLLAAGDALAADGFDALDLGEIARRAGVGKTTVYRRWGTPGGLAADLLAD   60
DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLhhhHLLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlHHHHHHHHHHHhLLLL...LLHHH
Query ILDIWLaplKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDyPQASRLFCMEMlAGAP...LLMDE  115
ident      |          |         ||      | |   |||     |           
Sbjct XAEQSL...PRAD.TGALEEDLRANARLVVRTLDD.PRQGRLFRALI.AASLcneQAAEA  114
DSSP  HHHHLL...LLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHH.HHHHhlhHHHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHhhhhlHHHHhhhhllll
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQhyadfAPQVeavtgatl  174
ident |        ||        |  |      ||        |                    
Sbjct LHRFYAVRVDEWAGCVRDAVARGEVPDgTDPHGVVAAVSAPLYyallnTGRS........  166
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHhhhhlLLLL........


DSSP  llhhhhhhHHHHHHH...HHHHHHLLL.....
Query rdevffnqTVENVQR...IIIEGIRPR.....  198
ident         |     |         |       
Sbjct .......lTEADADRaarAASTAARAGvwvtg  191
DSSP  .......lLHHHHHHhhhHHHHHHHLLlllll


No 29: 2FD5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR   57
ident            || ||       |            ||         | || ||      
Sbjct msdKKTQTRARILGAATQALLERGAVEPSVGEVMGAAGLTVGGFYAHFQSKDALMLEAFE   60
DSSP  lllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH.hHHHLH....hHHHHHHHHHhLLLL.L
Query QILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLE.vSRDYP....qASRLFCMEMlAGAP.L  111
ident | |      |                    |    ||              |  |  |  
Sbjct QLLGKRRELLGELDPGLSGKERRALAAAFYLSrkHRDAQvdagcPLPATLAEV.ARLPeG  119
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLhhHHLLLlllllLHHHHHHHH.HHLLhH


DSSP  LHHHHHlHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHhhH
Query LMDELTgDLKALIDEksaliagwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADF.APQVEavT  170
ident     |                                                       
Sbjct FREVLS.RHVEIMVT...........slaeSPEETDVALADLVLMIGGLALaRALGP..G  165
DSSP  HHHHHH.HHHHHHHH...........hhllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLL..L


DSSP  LLLLllhHHHHHHHHHHhhhhhhhhlll
Query GATLrdeVFFNQTVENVqriiiegirpr  198
ident                 |           
Sbjct ELSD...RVLRAAKQAV..........n  180
DSSP  HHHH...HHHHHHHHLL..........l


No 30: 2DTZA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHH.hhHHHHhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDT.fsQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident      |  ||  |            |    |  |   || || | |  || |    |   
Sbjct ...NLKDKILGVAKELfikNGYN.ATTTGEIVKLSESSKGNLYYHFKTKENLFLEILNIE   56
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHhhhHHHH.HLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHHH.LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHH.HHHHHHHL..llLLLHHH
Query LDIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASR.LFCMEMLA..gaPLLMDE  115
ident    |    |               |  | |     |                        
Sbjct ESKWQEQWKkEQIKaKTNREKFYLYNELSLTTEYYY.PLQNaIIEFYTEYyktnSINEKM  115
DSSP  HHHHHHHHHhHHHHlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLHHhHHHHHHHHlllhHHHHHH


DSSP  HHlHHHHhhhhHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhhhhhhllllL
Query LTgDLKAlideKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPqveavtgatlR  175
ident                       |     |                 |             
Sbjct NK.LENKyidaYHVIFKEGNLNGEWSINDVNAVSKIAANAVNGIvTFTH.........eQ  165
DSSP  HH.HHHHhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhHHHL.........lL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
Query DEVFFNQTVENVQRIIIEGIRpr  198
ident               |   |    
Sbjct NINERIKLMNKFSQIFLNGLS..  186
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..


No 31: 1V7BA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident     ||  ||  | |               ||  | ||  | | |||  ||         
Sbjct MRTSKKEMILRTAIDYIGEYSLETLSYDSLAEATGLSKSGLIYHFPSRHALLLGMHELLA   60
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHH.LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHhhhhLHHHHHHHHHHHhlLLLL.LHHHHHl
Query DIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLEvsrdYPQASRLFCMEMlaGAPL.LMDELTg  118
ident | |   |    |    ||           |          |                   
Sbjct DDWDKELRdITRDpEDPLERLRAVVVTLAE...nVSRPELLLLIDA..PSHPdFLNAWR.  114
DSSP  HHHHHHHHhHLLLlLLHHHHHHHHHHHHLL...lLLHHHHHHHHHH..HHLHhHHHHHH.


DSSP  HHHHHHhhHHHHhhhhhhllllLLLL.HHHHHHHHHHHHhHHHHLHHhhhhhhlLLLLlh
Query DLKALIdeKSALiagwvksgklAPID.PQHLIFMIWASTqHYADFAPqveavtgATLRde  177
ident                       |                                 |   
Sbjct TVNHQW.iPDTD.....dlendAHKRaVYLVQLAADGLF.VHDYIHD.......DVLS..  158
DSSP  HHHHHH.lLLLL.....lhhhlHHHHhHHHHHHHHHHHH.HHHHLLL.......LLLL..


DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHhHHLLl
Query vfFNQTVENVQRIIIeGIRPr  198
ident             |    |   
Sbjct ..KSKRQAMLETILE.LIPS.  175
DSSP  ..HHHHHHHHHHHHH.LLLL.


No 32: 2FQ4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident       ||||||        ||       ||| | |||       | | |          
Sbjct RNIETQKAILSASYELLLESGFKAVTVDKIAERAKVSKATIYKWWPNKAAVVXDGFLSAA   60
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHL


DSSP  hHHLHHhHLLLlLLLHhhhhhhhHHHHHHHHHHLHhhHHHHHHHHHLL......LLLLHH
Query dIWLAPlKAFReDFAPlaaikeyIRLKLEVSRDYPqaSRLFCMEMLAG......APLLMD  114
ident      |        |                                |      |     
Sbjct .AARLP.VPDT.GSAL.ndilihATSLANFLISRE..GTIINELVGEGqfdsklAEEYRV  114
DSSP  .LLLLL.LLLL.LLHH.hhhhhhHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHHlllhhhHHHHHH


DSSP  .HHHLhHHHHHHHHHHHHH..HHHHlllllLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query .ELTGdLKALIDEKSALIA..GWVKsgklaPIDPqhlifmiwastqhyadfapqveavtg  171
ident                      |  |       |                           
Sbjct rYFQP.RRLQAKQLLEKGIkrGELK....eNLDI...............elsidliygpi  154
DSSP  hLHHH.HHHHHHHHHHHHHhlLLLL....lLLLH...............hhhhhhhhhhh


DSSP  lllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLL...
Query atlrdevffnqTVENVQRIIIEGIRPR...  198
ident                |    |         
Sbjct fyrllvtgeklDDSYVHDLVINAFEGIrlr  184
DSSP  hhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHLLlll


No 33: 2UXHA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR   57
ident            |  ||   |   |   | |  |||||||        |  |  |  | | 
Sbjct tkeEAQETRAQIIEAAERAFYKRGVARTTLADIAELAGVTRGAIYWHFNNKAELVQALLD   60
DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHhHHLHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhh
Query QILdIWLAPLkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdelt  117
ident          |                                                  
Sbjct SLH.ETHDHL..................................................   69
DSSP  HLL.HHHHHH..................................................


DSSP  lhhhhHHHHH.hHHHHhhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..............
Query gdlkaLIDEK.sALIAgwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADF..............  162
ident         |                                   |               
Sbjct ....aRASESedEVDP...........LGCMRKLLLQVFNELVLDArtrrineilhhkce  114
DSSP  ....hHHHHLllLLLH...........HHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ....................................................hhhhhhhh
Query ....................................................apqveavt  170
ident                                                             
Sbjct ftddmceirqqrqsavldchkgitlalanavrrgqlpgeldaeraavamfayvdglirrw  174
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lLLLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL........
Query gATLRDevffnQTVENVQRIIIEGIRPR........  198
ident                 |      |            
Sbjct lLLPDS....vDLLGDVEKWVDTGLDMLrlspalrk  206
DSSP  hHLLLL....lLLLLLHHHHHHHHHHHHhhlhhhll


No 34: 2Q24A MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         || ||   ||  |     || ||  |||    |   ||  |||  |  |   
Sbjct ....NRDKILAAAVRVFSEEGL.DAHLERIAREAGVGSGTLYRNFPTREALIEAAYRNEV   55
DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHhhhhHLLL...LLLHHHHh
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFcmemLAGA...PLLMDELt  117
ident                                               |             
Sbjct ARLCDSVPGL...laelPPAEALRAWTRRFIDYATAKLGXA.dalRAVVasgGDPYGDS.  110
DSSP  HHHHHLHHHH...hhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.hhhHHHHhllLLLLLLH.


DSSP  lhHHHHHH.hhhhhhhhhhhlllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHlHHHHhhhhllllll
Query gdLKALID.eksaliagwvksgkLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADfAPQVeavtgatlrd  176
ident                           |                     |           
Sbjct ..RQLIQSaltalxdaaaaageiRSDIRSTDXFAALAGIALTSSR.PDQR..........  157
DSSP  ..HHHHHHhhhhhhhhhhhllllLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLL.HHHH..........


DSSP  hhhhHHHHHHHHHhHHHHhlll
Query evffNQTVENVQRiIIEGirpr  198
ident           |           
Sbjct .aqaERLLDLVLD.GLRP....  173
DSSP  .hhhHHHHHHHHH.HLLL....


No 35: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAv   55
ident             ||  |      | |   |  ||||| | ||    | |||  |      
Sbjct glrerKKTRTREAIRAATYGLIRQQGYEATTVEQIAERAEVSPSTVLRYFPTREDIVLT.   59
DSSP  lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHLL.


DSSP  hhHHHHHHLH.HHHLLLLLLLHHHHHhhhhhhhhhHHHH.LHHHHHHHHHHHHLL...LL
Query lrQILDIWLA.PLKAFREDFAPLAAIkeyirlkleVSRD.YPQASRLFCMEMLAG...AP  110
ident      |   |  | |                              ||             
Sbjct ..DEYDPVXAaELAARPAGEPWSDSLrhvlrkalgLGAGeEAELIRLRTRLLAEVpavRA  117
DSSP  ..LLLHHHHHhHHHLLLLLLLHHHHHhhhhhhhhlLLLLlHHHHHHHHHHHHHHLhhhHH


DSSP  LLHHHHHLH.....................hhHHHH.........hhhhhhhhhhhllll
Query LLMDELTGD.....................lkALID.........eksaliagwvksgkl  140
ident                                                             
Sbjct RXLENXSDTgrxlaraiadrtgldpdglevriVSXSlvgglxevsrywaehdheeslael  177
DSSP  HHHHHLLLLllhhhhhhhhhhllllllhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhh


DSSP  lllLHHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apiDPQHLifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident        |                                                  
Sbjct vdrALDAL............................................englpa  191
DSSP  hhhHHHHH............................................hhllll


No 36: 2HKUA MOLECULE: A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH.
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI.   59
ident        |   ||   |   |       ||   ||       ||  ||| |   |     
Sbjct ...QTRDALFTAATELFLEHGEG.VPITQICAAAGAHPNQVTYYYGSKERLFVEVACAAv   56
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHh


DSSP  HHHHLHHHhlllllLLHHHhhhhhhhhHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLL...lLHHHH
Query LDIWLAPLkafredFAPLAaikeyirlKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAP...lLMDEL  116
ident |                                       ||             | |  
Sbjct LRAGKRAEddaataETVGD...yteklVGSLLGPGAPSVELFTSAX.LXTGrrseLRDLI  112
DSSP  HHHHHHHHhhhhllLLHHH...hhhhhHHHHHLLLHHHHHHHHHHH.HHLLllhhHHHHH


DSSP  HLHHHhhhhhhhhhhhhhhhLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhHLLLl
Query TGDLKalideksaliagwvkSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavTGATl  174
ident |  |                                 |              |       
Sbjct TDTLRtlhssgevalirtlxRTGWQLrAGIDVESKAFWSAIFGLVIQKtATGE..SFGY.  169
DSSP  HHHHHhhhhhhhhlhhhhhhHLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL..LLLL.


DSSP  llhhHHHHHHHHHHHHHHH..hhlll
Query rdevFFNQTVENVQRIIIE..girpr  198
ident          |                
Sbjct ....SLEEAVAVIFANLQIpetvrnt  191
DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhl


No 37: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTF.SQFGfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVL   56
ident            |                   | ||| |||    |   ||    |  |  
Sbjct xraDALKRREHIITTTCNLYrTHHH.DSLTXENIAEQAGVGVATLYRNFPDRFTLDXACA   59
DSSP  llhHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLH.HHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLHHHH.LLLL.LLLHHHHHHhhhhHHHHHHHHLH.HHHHHHhhHHHLLLLLLH
Query RQILDIWLAPLK.AFRE.DFAPLAAIKeyirLKLEVSRDYP.QASRLFcmEMLAGAPLLM  113
ident              |       |                                   |  
Sbjct QYLFNVVISLQLqAISTfPTDPEGVWT...sFNQLLFDRGLgSLVPAL..APESLDDLPD  114
DSSP  HHHHHHHHHHHHhHHHHhHHLHHHHHH...hHHHHHHHLLHhHHHHHH..LLLLHHHLLH


DSSP  HHHhLHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHlHHHH...hhhh
Query DELtGDLKALIDEKSaliagwvksgklapidpqhLIFMIWASTQHYADfAPQV...eavt  170
ident                                                   |         
Sbjct EVS.ALRRTTEKNTT...tlinlakqhglvhhdiAPGTYIVGLITISR.PPITalatise  169
DSSP  HHH.HHHHHHHHHHH...hhhhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHLL.LLLHhhlllll


DSSP  LLLLllhHHHHHHHHHHHHHhhhhhlll
Query GATLrdeVFFNQTVENVQRIiiegirpr  198
ident                             
Sbjct NSHK...ALLGLYLSGLKHG......xx  188
DSSP  HHHH...HHHHHHHHHHHHL......ll


No 38: 2HXOA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.LHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGV.SKTNlLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident         |  ||       |  |      ||                |  |  |     
Sbjct ...lSRERIVGAAVELLDTVGERGLTFRALAERLATgPGAI.YWHITGKAELLGAATDAV   56
DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLlHHHH.HHLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHhhhlllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHHHHHLllllLHHHH
Query LDIWLAplkafredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYP...QASRLFCMEMLAgaplLMDEL  116
ident                             |                               
Sbjct VTAAVT....agptgaadSPQDAVRAVALGLWDATEahpWLATQLATQLSR....TPWGT  108
DSSP  HHHHHL....llllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHhllHHHHHHHHHHHH....LLLLL


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhHHHHL....
Query tgdlkalideksaliagwvksgkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYADFApqvEAVTG....  171
ident                          |                  |               
Sbjct .......vaprifeslgrqvqaxGVPEaHWFTASSALXHYILGAAGQN.aaNDEFLdtvs  160
DSSP  .......hhhhhhhhhhhhhhhlLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhLLHHHhhhh


DSSP  ..................lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query ..................atlrdEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR..  198
ident                             |                  
Sbjct tawegldpdaypftravadqvrgHDDREQFLAGITLVLTGITALHrp  207
DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLll


No 39: 2G7SA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident     |   ||  |       |        |    |         ||||  |      |  
Sbjct NPQSKADDILQCARTLIIRGGYNSFSYADISQVVGIRNASIHHHFPSKSDLVCKLVSQYR   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHLLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLH....HHHHHHHHHHHLL...lLLLH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYP....QASRLFCMEMLAG...aPLLM  113
ident     |                |  |                                   
Sbjct QEAEAGIAEL...ekniSDPLEQLRAYIGYWEGCIadatHPFCVCALLASEIpvlpETVV  117
DSSP  HHHHHHHHHH...hhhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLLLLHHHHHHLLHhhllHHHH


DSSP  HHHHlHHHHhhhhhhhhhhhhhhllllllllHHHH..................hhhHHHH
Query DELTgDLKAlideksaliagwvksgklapidPQHL..................ifmIWAS  155
ident  |                                |                       | 
Sbjct LEVR.AHFR................slsdwlTAVLergiaqgrlvltgtaranaeiFXAT  160
DSSP  HHHH.HHHH................hhhhhhHHHHhhhhhlllllllllhhhhhhhHHHH


DSSP  HHHHHHLH.HHHHhhhlLLLLlhhhhhhHHHHhHHHHHHhhlll
Query TQHYADFA.PQVEavtgATLRdevffnqTVENvQRIIIEgirpr  198
ident        |         ||         |       |       
Sbjct VHGAXLSArAHGD...aATFG.....aiTRPX.LERITA.....  190
DSSP  HHHHHHHHhLLLL...lLHHH.....hhHHHH.HHHHLL.....


No 40: 2IU5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;

DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ   58
ident         | |  |  |       |      |   |         ||   | |       
Sbjct meKSIITQKIIAKAFKDLMQSNAYHQISVSDIMQTAKIRRQTFYNYFQNQEELLSWIFEN   60
DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLHhhHLLLllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLlLHHHH..
Query ILDIWLAplKAFRedfaplaaikEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPlLMDEL..  116
ident                              |   |                          
Sbjct DFAELIN.dNSDY.........yGWQNELLLLLRYLDENQIFYQKIFVIDKN.FEHFFli  109
DSSP  HHHHHHL.lLLLL.........lLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHLLL.HHHHHhh


DSSP  ..hlhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhllll
Query ..tgdlkalideksaliagwVKSGklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtgatl  174
ident                                      | | |                  
Sbjct qwenlldkvifdqekksdyhWSDL.eksFICRYNAAAICAITRESIIRGN..........  158
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHH.hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..........


DSSP  llhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLL.
Query rdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR.  198
ident                     |    
Sbjct ....sleKLYSQIVNLLLAQIKIFe  179
DSSP  ....llhHHHHHHHHHHHHHHHLLl


No 41: 2DG7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAvlr   57
ident               |||   |  |        ||| ||        ||| |         
Sbjct xarWDPGAEQRLKRAALELYSEHGYDNVTVTDIAERAGLTRRSYFRYFPDKREVLFG...   57
DSSP  lllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLLHHHLL...


DSSP  HHHH.....................hhlHHHHlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhHHLHH
Query QILD.....................iwlAPLKafredfaplaaikeyirlklevsRDYPQ   96
ident                             |                               
Sbjct GSELlppavaravlaadpgaapltavldAXSQ.................vgaqlvAQVEG  100
DSSP  LLLLlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhHHHH.................hlllllLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHHLhHHHHHH............HHHHhhhhhhhllllll
Query ASRLFCMEMLAG..APLLMDELTGdLKALID............EKSAliagwvksgklap  142
ident |                                                           
Sbjct AAQRRAVIDASPelQERERTKSAA.ISRAVQdalvrrqvdadtAELV............a  147
DSSP  HHHHHHHHHLLHhhHHHHHHHHHH.HHHHHHhhhhhllllhhhHHHH............h


DSSP  llhHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLL
Query idpQHLIFMIWASTQHYADFapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGIRPR  198
ident                                                         
Sbjct qlaTVAFGSAFRRWIDAEGH................adfgscldtvtDRLRAVLTG  187
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHLLLL................llhhhhhhhhhHHHHHHHHL


No 42: 2I10A MOLECULE: PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAiLSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident        | |  |   |   |  ||         |     |   | ||  |    |    
Sbjct ...DDQVA.LQTAXELFWRQGYEGTSITDLTKALGINPPSLYAAFGSKRDLFEKTLDRYX   56
DSSP  ...LLHHH.HHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL


DSSP  hHHLH.HHHLLllllLHHHHHH....hhhhhhhhhhhhlHHHH..hhhhHHHHLlllllh
Query dIWLA.PLKAFredfAPLAAIK....eyirlklevsrdyPQAS..rlfcMEMLAgapllm  113
ident        |           |                                        
Sbjct .CERTlQLEEAxvrpTAHEAVLdfltgrvevftgcxtvqAGLAsgephhEIVDL......  109
DSSP  .LLLHhHHHHHhlllLHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllLLLLlllllhHHHHH......


DSSP  hhhhlhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.....llLHHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhhhh
Query deltgdlKALIDEKSALIAGWVKSGKLA.....piDPQHLIFMIWAStqhyadfapqvea  168
ident                         | |                                 
Sbjct ..ltaarEQXRQTVLDRFEKALADGDLPagtdctaLARYVXAAVYGL.............  154
DSSP  ..hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllllhhhHHHHHHHHHHHH.............


DSSP  hhlllLLLHhhhhhhhhhhhhhhhHHHLll
Query vtgatLRDEvffnqtvenvqriiiEGIRpr  198
ident                               
Sbjct sveaaSGAP...reeltaaailaaQVVP..  179
DSSP  hhhhhLLLL...hhhhhhhhhhhhLLLL..


No 43: 2G7LA MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...lhhhhHHHHHH.....hhHHHHhhhhhhhllHHHHHhhhlLLHHhhhhhllLHHHHH
Query ...avsakKKAILS.....aaLDTFsqfgfhgtrLEQIAelagVSKTnllyyfpSKEALY   52
ident                      |                |                  |  
Sbjct kpalsrrwIVDTAValxraegLEKV........tXRRLA..qeLDTG..paslyVYVANT   48
DSSP  lllllhhhHHHHHHhhhhhhlLLLL........lHHHHH..hhLLLL..hhhhlLLLLLH


DSSP  .HHHHHHHHHHHLHHHHLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhlllll
Query .IAVLRQILDIWLAPLKAFredFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagapl  111
ident                                       |    ||  |            
Sbjct aELHAAVLDALLGEVDLTG..aEDWREQLRAVLTSYTLVLFAHPQLARSALVA.......   99
DSSP  hHHHHHHHHHHLLLLLLLL..lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL.......


DSSP  lhhhHHLHHHHHHhhhHHHHHHHHhllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHH......
Query lmdeLTGDLKALIdekSALIAGWVksgklAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAP......  164
ident            |      | |        ||                  |          
Sbjct ..rpSGENYLRLVervLELLARSG.....APGAqVAWGVDKLLQDATATAAEQAtsatvr  152
DSSP  ..llLLHHHHHHHhhhHHHHHLLL.....LLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhh


DSSP  .........hhhhhhllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......ll
Query .........qveavtgatlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIR......pr  198
ident                                       ||         
Sbjct alrdadeathpaiashxpllvaGSAHDRLRWSFDVLVNGITrtpvpgpa  201
DSSP  hhhhllllllhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllll


No 44: 2NP3A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;

DSSP  lhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhlLLHHHHHHHHHhHHH
Query avsakkkaILSAALDTFsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfPSKEALYIAVLrQIL   60
ident         || ||   |                               | |    |    
Sbjct ........ILTAARVCF............................YGTENLFLQAL.ELP   23
DSSP  ........LHHHHHHHL............................LLLLHHHHHHH.LHH


DSSP  HHHLHHHHL.LLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHLH...HHHHHHHHHHhllllllhhhh
Query DIWLAPLKA.FREDFAplAAIKEYIRLKLEVSRDYP...QASRLFCMEMlagapllmdel  116
ident         |                |  | |  |                          
Sbjct GKIEEAITAaAQGGLD..GIGERVVRAHLSVWDDVSsrpALXTXVRSAA........rlr   73
DSSP  HHHHHHHHHhLLLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHllhHHHHHHHLLH........hhh


DSSP  hlhhhhhHHHHHhHHHHhhHLLLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhllllll
Query tgdlkalIDEKSaLIAGwvKSGKlapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtgatlrd  176
ident                                                             
Sbjct etatgilARALG.GVIT..GEDA..xLRTSXVATQLVGLAXXRYVAHLEP..........  118
DSSP  hhhhhhhHHHHL.LLLL..LLLH..hHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL..........


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHHH...hlll
Query evffnQTVENVQRIIIEG...irpr  198
ident           | |            
Sbjct ..lasADTDTVARHYGRAvqaivtd  141
DSSP  ..hhhLLHHHHHHHHHHHhhhhhll


No 45: 1ZK8A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAkKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |   |       |     |   |   ||    |                   
Sbjct IGLT.LQKIVETAAEIADANGVQEVTLASLAQTLGVRSPSLYNHVKGLQDVRKNLGIYGI   59
DSSP  LLLL.HHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLH...HHHLLLLlllhhhhhhhhhhhhHHHHhhlhhhHHHHhhhhhllLLLL...HH
Query DIWLA...PLKAFREdfaplaaikeyirlkLEVSrdypqaSRLFcmemlagAPLL...MD  114
ident                                                             
Sbjct KKLHNrleEAAEDKR......xdeaihalgEAYV.afvrkHPGL...yeatFLRDeevRK  109
DSSP  HHHHHhhhHHHLLLL......hhhhhhhhhHHHH.hhhhhLHHH...hhhlLLLLhhhHH


DSSP  HHhLHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllll
Query ELtGDLKALIDEKSALIAGwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatl  174
ident         |                                                   
Sbjct AG.DGIVKLCLQVLQQYGL................egenalhatrgfrsichgfasieqq  152
DSSP  HH.HHHHHHHHHHHHHHLL................lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  llhhhhhhhhhHHHHHH.hhhhlll
Query rdevffnqtveNVQRII.iegirpr  198
ident                          
Sbjct ggfglpldldiSLHVLLetfikglr  177
DSSP  llllllllhhhHHHHHHhhhhhhhl


No 46: 2HYJA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL...LHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...SKEALYIAVL   56
ident     |    ||  |    |  |  |      ||    ||      |              
Sbjct aEAQATRGRILGRAAEIASEEGLDGITIGRLAEELEMSKSGVHKHFGtkeTLQISTLDKA   60
DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLlhhHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHH.LHHHHlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhh
Query RQILDIW.LAPLKafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmde  115
ident           |                                                 
Sbjct FVDFWHRvVEPAL...............................................   73
DSSP  HHHHHHHhLHHHH...............................................


DSSP  hhlhhhhhhhhHHHHHhhhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHH..............
Query ltgdlkalideKSALIagwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYAD..............  161
ident                                                             
Sbjct ...........AEPPG............LRRLRAVCANSVGYLEEPllpggclltaalse  110
DSSP  ...........HLLLL............HHHHHHHHHHHHHHHHLLllllllhhhhhhhh


DSSP  ..........................................................lH
Query ..........................................................fA  163
ident                                                             
Sbjct ydgrpgrvrdavaevwsrwreqlradltaavdkgelpagfdveqalfeivaaglalnaaM  170
DSSP  hlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhH


DSSP  HHHHhhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHLLL
Query PQVEavtgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRPR  198
ident                          | |       
Sbjct QLQH............drtaaDRARRAIERALAQS  193
DSSP  HHHL............lllhhHHHHHHHHHHHHHL


No 47: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  ........lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL......
Query ........avSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP......   46
ident                 |  |              |  |   |                  
Sbjct mniaelygkmGKHSWRIMDAIFKNLWDYEY..VPLQLISSHARIGEEKARNILKylsdlr   58
DSSP  llhhhhhhllLHHHHHHHHHHHLLLLLLLL..EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhll


DSSP  LHHH.........hhhhHHHH.HHHHH...lHHHH.......lllllllhhhhhhHHHHH
Query SKEA.........lyiaVLRQ.ILDIW...lAPLK.......afredfaplaaikEYIRL   86
ident                   |    |                                    
Sbjct VVQNrqkdyegstftfiGLSLySLHRLvrsgKVDAigklmgegkesavfncysekFGECV  118
DSSP  LEEEellllleeeelhhHHHHhHHHHHhhllLLLEeeeeeeellleeeeeeeellLEEEE


DSSP  HHhhhhhlhhhhhHHHHhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhh
Query KLevsrdypqasrLFCMemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpq  146
ident                                                             
Sbjct VK.fhkvkvkehfSVLA...........................................  134
DSSP  EE.eelllllllhHHHH...........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhHHLHhhhhhhHLLLlllhHHHH......hhhhhhHHHHhhhHLLL..
Query hlifmiwastqhyADFApqveavTGATlrdeVFFN......qtvenvQRIIiegIRPR..  198
ident              |                                              
Sbjct ..........irsARNE..fralQKLQ..glAVPKvyawegnavlmeLIDA...KELYrv  177
DSSP  ..........hhhHHHH..hhhhHHLL..llLLLLeeeeelleeeeeLLLL...EEHHhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  198
ident                                                             
Sbjct rvenpdevldmileevakfyhrgivhgdlsqynvlvseegiwiidfpqsvevgeegwrei  237
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllllleeelllleeelllllleelllllhhhh


DSSP  ................................
Query ................................  198
ident                                 
Sbjct lerdvrniityfsrtyrtekdinsaidrilqe  269
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhl


No 48: 1SGMA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLhHHHHHHLL..LHHHHHHH...H
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSkTNLLYYFP..SKEALYIA...V   55
ident         ||  |       | | | | ||    |      || |    || | |     
Sbjct ..GDSREKILHTASRLSQLQGYHATGLNQIVKESGAP.KGSLYHFFpnGKEELAIEavtY   57
DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLL.LLHHHHLLllLHHHHHHHhhhH


DSSP  HHHHHHHHLHHHhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhh
Query LRQILDIWLAPLkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmde  115
ident    |                                                        
Sbjct TGKIVEHLIQQS................................................   69
DSSP  HHHHHHHHHHHH................................................


DSSP  hhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHH..........
Query ltgdlkalideksaliagwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQ..........  165
ident                                               |             
Sbjct ........................mdesSDPVEAIQLFIKKTASQ.FDNTesikgipvgl  104
DSSP  ........................hhllLLHHHHHHHHHHHHHHL.LLLHhhllllllhh


DSSP  .......................................................hhhhh
Query .......................................................veavt  170
ident                                                             
Sbjct lasetaliseplrtvcmkvfksweavfarklmengfaeeeanqlgtlinsmieggimlsl  164
DSSP  hhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  LLLLllhhhhhhhhHHHHhHHHHHHLll
Query GATLrdevffnqtvENVQrIIIEGIRpr  198
ident                     |    |  
Sbjct TNKD.....ktpllLIAE.QIPVLVR..  184
DSSP  HHLL.....lhhhhHHHL.LHHHHLL..


No 49: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;

DSSP  ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSqFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP   46
ident                            |               |  ||  |         
Sbjct xatgglaiiqsxxhXLPPSERKLADYILAHPH.XAIE.STVNEISALANSSDAAVIRLCX   58
DSSP  llllhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHHHHHLHH.HHHL.LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH


DSSP  .....LHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHH
Query .....SKEALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLF  101
ident          |                                                  
Sbjct slglkGFQDLXX............................................rvAG   74
DSSP  hllllLHHHHHH............................................hhHH


DSSP  HHHHHLLLlllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query CMEMLAGApllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad  161
ident                                                             
Sbjct DLAKPTFQ....................................................   82
DSSP  HHHLHHHL....................................................


DSSP  lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                      
Sbjct ....................................g   83
DSSP  ....................................l


No 50: 1XJEA MOLECULE: RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;

DSSP  .........................................LHHHHHHHHHHHHHhHHHH
Query .........................................AVSAKKKAILSAALdTFSQ   19
ident                                             |   |   |       
Sbjct mklsdlisrwidvepsknaqiilrdryfmkdldgnyletkwEDVARRVARVVATA.ELLN   59
DSSP  llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHH.HHHL


DSSP  H.hhHHLLHHHHHHHHLL............................lhhHHHHhlLLHHH
Query F.gfHGTRLEQIAELAGV............................sktNLLYyfPSKEA   50
ident         |  | |                                            | 
Sbjct PsykKNEKLDRIKEWEDIffrvlkarlfipnsptlfnaglgvkhdllwkPIDQ..MTLED  117
DSSP  LlllHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllleeelhhhhhhllllllhhhhllLHHH..LLHHH


DSSP  HHHHHHHHhhHHHL.......hhhhllllllLHHHHHHHHHHHH................
Query LYIAVLRQilDIWL.......aplkafredfAPLAAIKEYIRLK................   87
ident                                         |                   
Sbjct YEEIYRSR..NHLHmlsacfvvpvgdsieeiFEAVKEYALITKVgggvgsnfselrpkgs  175
DSSP  HHHHHHHL..LLLLlllleeellllllhhhhHHHHHHHHHHHHLlleeeeelllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   87
ident                                                             
Sbjct fvagthgkasgpvsfmhvfnsaisvvkqgsrrrgalmgilninhpdieefidakkvlnff  235
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhllleellleelleeeeeelllllhhhhhlllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   87
ident                                                             
Sbjct nlsvgfpmdkkeilklyeedgelelshprstirkkvkirelfrkiatnawksgdpglafl  295
DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeehhhhhhhhhhhhhhhllleeelh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   87
ident                                                             
Sbjct gemnkyyplyphrkinstnpcgeiglsdyeacnlgsidvakfynngfvdlealqelvqia  355
DSSP  hhhhhllllllllleeeelllllleeellleeeeeeeehhhheelleelhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhlHHHHhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhh
Query levsrdyPQASrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqh  147
ident                                                             
Sbjct vrfldnvIDVN.................................................  366
DSSP  hhhhhhhHHHL.................................................


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHLH............................................
Query lifmiWASTQHYADFA............................................  163
ident                                                             
Sbjct ..vfpIDKITKAVKESrrlglgimgfadllykleipynsqeardfaanlmafialhahrt  424
DSSP  ..lllLHHHHHHHHHHlleeeeeelhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........hhhHHHHL...........................................
Query .........pqvEAVTG...........................................  171
ident                                                             
Sbjct syelgkekgnfpLLEISryrtednfvpfamgmsnyddeirevmkmtkefrrnvalltiap  484
DSSP  hhhhhhhhllllLHHHLhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  171
ident                                                             
Sbjct tgsisniadtssglepnfllaytrfvtkedgtkepllyvnqvlreklnpeilkriekeli  544
DSSP  lllhhhhllllllllllllleelleeellllleeelleelhhhhhhllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................................llll
Query ........................................................atlr  175
ident                                                             
Sbjct ekgslkdipdvpekikkvfvvaldidpmdhllmqdafqryvdnnisktinmpqsatvddv  604
DSSP  hhllllllllllhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhlllllllllleeelllllhhhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query devffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                        
Sbjct lnvylealrtnvrgitvyrdgsl  627
DSSP  hhhhhhhhhlllleeleeellll


No 51: 2HXIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhHHHHHHHHHhhh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkEALYIAVLRqil   60
ident         || ||                 |   |     |   |     |  ||     
Sbjct ..RWSTEQILDAAAELLLAgdaeTFSVRKLAASLGTDSSSLYRHFRNkTELLRAVAD...   55
DSSP  ..LLLHHHHHHHHHHHHLLllllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLhHHHHHHHHH...


DSSP  hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHHHHHH..............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFCMEML..............  106
ident                                                             
Sbjct ......................................rILLSAXDgyrpegdwkqrlta   77
DSSP  ......................................hHHHHHHLlllllllhhhhhhh


DSSP  ....................llllLLHHHHHlHHHHHHHHHhHHHHhhhhllllllLLHH
Query ....................agapLLMDELTgDLKALIDEKsALIAgwvksgklapIDPQ  146
ident                                     |                       
Sbjct valrlresfgqqpqlaavwgrhgsGGTGSRLxXEEVLQALRaSGLP.........dDEIP  128
DSSP  hhhhhhhhllllhhhhhhhhhhllLLHHHHHhHHHHHHHHHhLLLL.........hHHHH


DSSP  HHHHHHH......................hhhhhhhhlhhhhhHHHLLLLLlhhhhhhhh
Query HLIFMIW......................astqhyadfapqveAVTGATLRdevffnqtv  184
ident                                                             
Sbjct ARYHRLVilisslitaeggfrvavlgadperfpalshfareirPLGADRGA...afeeil  185
DSSP  HHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhllLLLLLHHH...hhhhhh


DSSP  hHHHHHHHHHhlll
Query eNVQRIIIEGirpr  198
ident               
Sbjct aAHLAHLEAA..ap  197
DSSP  hHHHHHHHHH..ll


No 52: 2AO9A MOLECULE: PHAGE PROTEIN;

DSSP  ..........lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhh
Query ..........aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskea   50
ident              ||                         |   |   | |         
Sbjct mmakldelkqkLTAKQIQAAYLLVENELM.eeEKRTQDEMANELGINRTTLWEWRTknqd   59
DSSP  lhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhlhh


DSSP  hhHHHHHHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHhhhhhhhllll
Query lyIAVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRlfcmemlagap  110
ident                                                             
Sbjct fiAFKSEVAD..................................sFLAE...........   74
DSSP  hhHHHHHHHH..................................hHHHL...........


DSSP  llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHLHHHHHHHH
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyADFAPQVEAVT  170
ident                                                             
Sbjct ................................................kREQVYSKLMQL   86
DSSP  ................................................lHHHHHHHHHHH


DSSP  L....llllLHHHHHHHHHHhhhhhhhHHLL....l
Query G....atlrDEVFFNQTVENvqriiieGIRP....r  198
ident                |                    
Sbjct IlgpqpsvkAMQLYMQRFGL.....ltDKKViegdl  117
DSSP  HhlllllhhHHHHHHHHLLL.....leEEEEeeell


No 53: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL...lhHHHH.....
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...skEALY.....   52
ident          |                |  ||  |      |                   
Sbjct gIDPAIVEVLLVLREAGIEngaTPWSLPKIAKRAQLPXSVLRRVLTqlqaaGLADvsvea   60
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHLLLlllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhlLLEEeeell


DSSP  ..........hHHHHHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query ..........iAVLRQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfc  102
ident                                                             
Sbjct dgrghasltqeGAALAAQL.........................................   79
DSSP  llleeeeelhhHHHHHHHH.........................................


DSSP  hhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query memlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf  162
ident                                                             
Sbjct ............................................................   79
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                     
Sbjct ..................................fp   81
DSSP  ..................................ll


No 54: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhhHHHHhhhh
Query avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyIAVLrqil   60
ident       |                       |  |  |         |  |    |     
Sbjct ..GSPEKILAQIIQE.HREG....LDWQEAATRASLSLEETRKLLQSXAA.aGQVT....   48
DSSP  ..LLHHHHHHHHHHL.LLLL....EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH.lLLEE....


DSSP  hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhHHHHHHHHLL............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasRLFCMEMLAG............  108
ident                                               |             
Sbjct .........................llrvendlyaistERYQAWWQAVtraleefhsryp   83
DSSP  .........................eeeelleeeeeehHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhll


DSSP  ......................lllLHHHHHLHHH.......hhHHHHhhHHHHhhHLLL
Query ......................aplLMDELTGDLK.......alIDEKsaLIAGwvKSGK  139
ident                          |  |                              |
Sbjct lrpglareelrsryfsrlparvyqaLLEEWSREGRlqlaantvaLAGF..TPSF.sETQK  140
DSSP  lllleehhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHLLLeeeelleeeELLL..LLLL.lHHHH


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHHHL...
Query lapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGIR...  196
ident                                                             
Sbjct ................kllkdledkyrvsrwqppsfkevagsfnldpselEELLHYLvre  184
DSSP  ................hhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhHHHHHHHhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  196
ident                                                             
Sbjct gvlvkindefywhrqalgeareviknlastgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvk  244
DSSP  lleeellllleeehhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............ll
Query ............pr  198
ident               
Sbjct ftrrvgdkrvvvgn  258
DSSP  leeeelleeeelll


No 55: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;

DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLllhhhhhh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFG..fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFpskealyi   53
ident           |                         ||   | |                
Sbjct dgtvkVSRSLKEMGNKIRKAKDELSKtrgRAPTVTEIADHLGISPEDVVLAQ........   52
DSSP  lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHH........


DSSP  hhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllh
Query avlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllm  113
ident                                                             
Sbjct ............................................................   52
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhlll
Query deltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgat  173
ident                                                             
Sbjct ............................................................   52
DSSP  ............................................................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query lrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                          
Sbjct ....................eavrl   57
DSSP  ....................hhhhl


No 56: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL.........lhhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.........skeal   51
ident                     |    |   |||   |                        
Sbjct .TTPSMEDYIEQIYMLIEEKGY..ARVSDIAEALAVHPSSVTKMVQkldkdeyliyglvl   57
DSSP  .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleelllee


DSSP  hhhHHHHhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhHHHHhlhhhhhhhhhhhhlllll
Query yiaVLRQildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklEVSRdypqasrlfcmemlagapl  111
ident                                                             
Sbjct tskGKKI....................gkrlvyrhelLEQF...................   78
DSSP  lhhHHHH....................hhhhhhhhhhHHHH...................


DSSP  lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtg  171
ident                                                             
Sbjct .............................lriigvdeekiyndvegiehhlswnsidrig  109
DSSP  .............................hhhllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh


DSSP  LLLL.LHHHhHHHHHHHHHHHHHhhlll
Query ATLR.DEVFfNQTVENVQRIIIEgirpr  198
ident       |            |        
Sbjct DLVQyFEED.DARKKDLKSIQKK.....  131
DSSP  HHHHhHHLL.HHHHHHHHHHHHL.....


No 57: 2FQ3A MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;

DSSP  ...........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLHHHHHHH
Query ...........................AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfHGTRLEQIAEL   33
ident                                                             
Sbjct skwfnlekihsievqslpefftnripsKTPEVYMRYRNFMVNSYRLNPnEYFSVTTARRN   60
DSSP  llllllllllhhhhhhlhhhlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLHHHHHHH


DSSP  HLLLHHHHHHHLLlhhHHHHHhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query AGVSKTNLLYYFPskeALYIAvlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrd   93
ident        |         |                                          
Sbjct VSGDAAALFRLHK...FLTKW.......................................   78
DSSP  LLLLHHHHHHHHH...HHHHL.......................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhh
Query ypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiw  153
ident                                                             
Sbjct ............................................................   78
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query astqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                              
Sbjct ......................................glinyqv   85
DSSP  ......................................lllllll


No 58: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLHHHHHHHhlLLHHhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELagVSKTnllyyfPSKEALYIAVLRQIL   60
ident          |                |                             |   
Sbjct .MQEQRQQLLRSLEALIFSS.eEPVNLQTLSQI..TAHK...ftpSELQEAVDELNRDYE   53
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHH..LLLL...llhHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHhhhhhllllllhhhhhlhh
Query DIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFcmemlagapllmdeltgdl  120
ident                                                             
Sbjct ATG.................................rTFRI...................   61
DSSP  HHL.................................lLEEE...................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhHHHHhhLHHHHHHHH..........
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwasTQHYadFAPQVEAVT..........  170
ident                                             |  |            
Sbjct .......................haiaggyrfltePEFA.dLVRQLLAPViqrrlsrsml   97
DSSP  .......................eeelleeeeeelHHHH.hHHHHHHLLHhhhhhhhhhh


DSSP  .....................................llllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .....................................gatlrdevffnqtvenvqriiie  193
ident                                                             
Sbjct evlavvawhqpvtkgeiqqirgaspdysidrllarglievrgradspgrplqygttevfl  157
DSSP  hhhhhhhhhlleehhhhhhhhllllllhhhhhhhllleeeeeellllllleeeeelhhhh


DSSP  hhlll
Query girpr  198
ident      
Sbjct dlfhl  162
DSSP  hhlll


No 59: 1SFXA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;

DSSP  ................lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ................avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYY   44
ident                         | |  |           |   ||     |       
Sbjct hxsnplgelvkaleklsfKPSDVRIYSLLLERG......gXRVSEIARELDLSARFVRDR   54
DSSP  llllhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHH


DSSP  LLlhhhhhHHHH...............HHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query FPskealyIAVL...............RQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlkle   89
ident           |                                                 
Sbjct LK.vllkrGFVRreivekgwvgyiysaEKPEK............................   85
DSSP  HH.hhhhlLLEEeeeeellleeeeeeeLLHHH............................


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhHHHHlHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllmDELTgDLKALIDEKSALIAgwVKSGklapidpqhli  149
ident                          |          |                       
Sbjct ......................vlKEFK.SSILGEIERIEKXF..TDGS...........  109
DSSP  ......................hhHHHH.HHHHHHHHHHHLLL..LLLL...........


DSSP  hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                  
Sbjct .................................................  109
DSSP  .................................................


No 60: 1CF7A MOLECULE: PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL.LHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhh
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGV.SKTNLLYYFPskealyiavlrq   58
ident                            |   |    |  |                    
Sbjct sRHEKSLGLLTTKFVSLLQEAKDGVLDLKLAADTLAVrQKRRIYDITN............   48
DSSP  lLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHH............


DSSP  hhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg  118
ident                                                             
Sbjct ............................................................   48
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev  178
ident                                                             
Sbjct ............................................................   48
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                     
Sbjct .vlegigliekksknsiqwk   67
DSSP  .hhhhhlleeeeelleeeel


No 61: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR

DSSP  lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLRqil   60
ident              |                 |                        |   
Sbjct ....hlDDLDRNILRLLKKDA..RLTISELSEQLKKPESTIHFRIKK.lqerGVIER...   50
DSSP  ....llLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhlLLEEE...


DSSP  hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl  120
ident                                              |              
Sbjct .........................................yTIIL..geqlkpkhlali   67
DSSP  .........................................eEEEE..llllllleeeee


DSSP  hhhhhhhhhhhhHHHHLL...............lllLLLHhhhHHHH.............
Query kalideksaliaGWVKSG...............klaPIDPqhlIFMI.............  152
ident                                                             
Sbjct vlevgkpedfleRYISYIsstlsalpgvlfvaksgeDKII...ALVGknnkdelvkfiee  124
DSSP  eeeellllhhhhHHHHHHhhhhhlllleeeeeeellLEEE...EEEEellllhhhhhhhh


DSSP  .............hhhhhHHHHLhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .............wastqHYADFapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                            
Sbjct nitsipnlkhiqifpiteIKKGE...........................dltgflaev  156
DSSP  hlllllleeeeeeeelleEEELL...........................lhhhhhlll


No 62: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;

DSSP  lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhHHHHhhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLrqil   60
ident              |   |  |       |      | |  |             |     
Sbjct ......DNLEQKILQVLSDDGGP.VAIFQLVKKCQVPKKTLNQVLY.rlkkeDRVS....   48
DSSP  ......LHHHHHHHHHHHHHLLL.EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEE....


DSSP  hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdl  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................   48
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhh
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevff  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................   48
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlll
Query nqtvenvqriiiegirpr  198
ident                   
Sbjct .......spspkywsigg   59
DSSP  .......eeelleeeell


No 63: 2ESNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .....LHHHhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhlLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL..lhhhhhH
Query .....AVSAkKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP..skealyI   53
ident                 |                  |     |                  
Sbjct pllrrLDLN.LLLVFDALYRHR........NVGTAASELAISASAFSHALGrlrqglddE   51
DSSP  lllllLLLL.HHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhhhllL


DSSP  HHH..........HHHHhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query AVL..........RQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcm  103
ident   |          |                                              
Sbjct LFLrqgnrmqptqRAEH............................laaavaaalralgeg   83
DSSP  LEEeelleeeelhHHHH............................hhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlh
Query emlagapllmdeltgdlkalideksaliaGWVKSGKlapidpqhlifmiwastqhyadfa  163
ident                                                             
Sbjct leewrpfvpgqsqrtfvfaatdytafallPPLMNRL....................qhsa  123
DSSP  lhhhlllllllllleeeeellhhhhhhhhHHHHHHH....................hhhl


DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhhhhHHHH...................................
Query pqveavtgatlrdevffnqtvENVQ...................................  188
ident                                                             
Sbjct pgvrlrlvnaerklsvealasGRIDfalgydeeherlpegiqahdwfadryvvvarrdhp  183
DSSP  llleeeeelllllllhhhhhhLLLLeeeellllllllllleeeeeeeeeleeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  188
ident                                                             
Sbjct rlagaptlegylaerhavvtpwnedsgvidrllarsglrrevavqlptvlaalflagstd  243
DSSP  lllllllhhhhhlleeeeellllllllhhhhhhhhllllleeeeeellhhhhhhhhhlll


DSSP  .........................................hhhHHHHL.....ll
Query .........................................riiIEGIR.....pr  198
ident                                                         
Sbjct flltaprhaaralaeaaglalypapfdippyvlrlyshvqgrdaHAWMIgqlkgld  299
DSSP  leeeeehhhhhhhhhhhleeeelllllllleeeeeeeellllhhHHHHHhhlllll


No 64: 2CGPA MOLECULE: PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dptlewflshchihkypskstlihqgekaetlyyivkgsvavlikdeegkemilsylnqg   60
DSSP  lhhhhhhhllleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeeeellllleeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dfigelglfeegqersawvraktacevaeisykkfrqliqvnpdilmrlsaqmarrlqvt  120
DSSP  leelhhhlllllllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHH........hhHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHL
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQ........fgFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYF   45
ident        |       |    |    |                  |    | |        
Sbjct sekvgnlAFLDVTGRIAQTLLNLAKQpdamthpdgmQIKITRQEIGQIVGCSRETVGRIL  180
DSSP  hhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHHHLLLllleeelleeEEELLHHHHHHHHLLLHHHHHHHH


DSSP  L......LHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query P......SKEAlyiavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr   99
ident           |                                                 
Sbjct KmledqnLISA.................................................  191
DSSP  HhhhhllLEEE.................................................


DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy  159
ident                                                             
Sbjct ............................................................  191
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                        
Sbjct ..............................hgktivvyg  200
DSSP  ..............................elleeeeel


No 65: 1QBJA MOLECULE: PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhHHHHhhh
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFG.fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLrqi   59
ident              |      |    |         |  |                     
Sbjct ...SIYQDQEQRILKFLEELGegKATTAHDLSGKLGTPKKEINRVLY.slakkGKLQ...   53
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEE...


DSSP  hhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlh
Query ldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgd  119
ident                                                             
Sbjct ............................................................   53
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhh
Query lkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevf  179
ident                                                             
Sbjct ............................................................   53
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query fnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                    
Sbjct .......keagtpplwkia   65
DSSP  .......eellllleeeel


No 66: 1LDDA MOLECULE: ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;

DSSP  .LHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHL...........lLHHHHHHHLLlh
Query .AVSAKKKAiLSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAG...........vSKTNLLYYFPsk   48
ident           |          |     |  |                     |  |    
Sbjct kYELTLQRS.LPFIEGMLTNLGA..MKLHKIHSFLKitvpkdwgynriTLQQLEGYLN.t   56
DSSP  lLHHHHHHH.HHHHHHHHHHHLL..EEHHHHHHHHHhhllhhhlllllLHHHHHHHHH.h


DSSP  hhhhHHHHhhhhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ealyIAVLrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag  108
ident                                                             
Sbjct ladeGRLK....................................................   64
DSSP  hhhlLLEE....................................................


DSSP  llllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea  168
ident                                                             
Sbjct ............................................................   64
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                               
Sbjct ....................yiangsyeiv   74
DSSP  ....................llllleeeel


No 67: 1I1GA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPA;

DSSP  lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLRqil   60
ident              |          |    ||   | | |                     
Sbjct .....iDERDKIILEILEKDA..RTPFTEIAKKLGISETAVRKRVKA.leekGIIEG...   49
DSSP  .....lLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhhLLLLL...


DSSP  hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl  120
ident                                                             
Sbjct .........................................yTIKI...npkklgyslvt   65
DSSP  .........................................lLLLL...llhhhllleee


DSSP  hhhhhhhHHHHHHHHH.llllllllhhhHHHHH...................hhhhhhhh
Query kalidekSALIAGWVK.sgklapidpqhLIFMI...................wastqhya  160
ident                             |                               
Sbjct itgvdtkPEKLFEVAEklkeydfvkelyLSSGDhmimaviwakdgedlaeiisnkigkie  125
DSSP  eeeeeelHHHHHHHHHhhhhllleeeelLLLLLlleeeeeeellhhhhhhhhhhllllll


DSSP  hlhhhhhhHHLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query dfapqveaVTGATLrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident              |                        
Sbjct gvtkvcpaIILEKL.......................k  140
DSSP  leeeeeeeELLLLL.......................l


No 68: 1HLVA MOLECULE: MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;

DSSP  .......LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL.......
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.......   46
ident             |  |                |   ||         |            
Sbjct mgpkrrqLTFREKSRIIQEVEENP......DLRKGEIARRFNIPPSTLSTILKnkraila   54
DSSP  lllllllLLHHHHHHHHHHHHHLL......LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHlhhhhhh


DSSP  ....lhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhlLLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
Query ....skealyiavlrqildiwlaplkaFREDFaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfc  102
ident                                                             
Sbjct serkygvastcrktnklspydklegllIAWFQ............................   86
DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhHHHHH............................


DSSP  hhhhllllllhhhhhlhhhhhhhHHHHHHHHHHHLLL.....lLLLLhHHHHHhhhhhhh
Query memlagapllmdeltgdlkalidEKSALIAGWVKSGK.....lAPIDpQHLIFmiwastq  157
ident                            |                                
Sbjct ..............qiraaglpvKGIILKEKALRIAEelgmddFTAS.NGWLD.......  124
DSSP  ..............hhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHhhllllLLLL.HHHHH.......


DSSP  hhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query hyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                          
Sbjct ..................................rfrrrrs  131
DSSP  ..................................hhhhhll


No 69: 2FJI1 MOLECULE: EXOCYST COMPLEX COMPONENT SEC6;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gshmgdkeketlfkdylnlivvkmtewignlekaefdvflerstpphsdsdgllfldgtk   60
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleellllleelhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tcfqmftqqvevaagtnqakilvgvverfsdlltkrqknwiskiseeikkqinynhkydi  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ...............................lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhh
Query ...............................avsakkkailsaaldtfsqfgfhgtrleq   29
ident                                                             
Sbjct dpesitpedecpgglveyliavsndqmkaadyavaisskygklvskvyekqitnhlegtl  180
DSSP  hhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  hhhhhLLLHHHHHHHL............................................
Query iaelaGVSKTNLLYYF............................................   45
ident            |                                                
Sbjct dgfaeVAQCSSLGLITlmfddlrkpyqeifsktwymgsqaqqiadtldeylldikpqmns  240
DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHhhhhllhhhhlllllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh


DSSP  .....lLHHHHHHHHH............................................
Query .....pSKEALYIAVL............................................   56
ident                                                             
Sbjct vlfvnfIDNVIGETIIkfltalsfehsfknknnkfleamkrdfeifyqlfvkvldgnesk  300
DSSP  hhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllh


DSSP  ......hHHHHHHLHHHHLLlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhhhhhhhhllll
Query ......rQILDIWLAPLKAFredfaplaAIKEYIRLKLEVSRDYPQAsrlfcmemlagap  110
ident                 |            |             |                
Sbjct dtlitqnFTVMEFFMDLSCE........PIDSILDIWQKYLEVYWDS.............  339
DSSP  hhhhhhhHHHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHHHHHLLLLLL.............


DSSP  llhhhhhlhhhHHHHHHhHHHHhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHhh
Query llmdeltgdlkALIDEKsALIAgwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAvt  170
ident                                       |        |            
Sbjct .....ridllvGILKCR.KDVS..........SSERKKIVQQATEMLHEYRRNMEANG..  381
DSSP  .....llhhhhHHHLLL.LLLL..........HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                             
Sbjct ..........vdreptlmrrfvlefekq  399
DSSP  ..........llllllhhhhllllllll


No 70: 2DBBA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR

DSSP  lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLlhhhhhHHHHHhhh
Query avsakkKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRqil   60
ident                  |            |                             
Sbjct ....klDRVDMQLVKILSENS..RLTYRELADILNTTRQRIARRID.klkklGIIRK...   50
DSSP  ....llLHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH.hhhhhLLEEE...


DSSP  hhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH...llllllhhhhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEML...agapllmdelt  117
ident                                                             
Sbjct .........................................fTIIPdidklgymyaivli   69
DSSP  .........................................eEEEEllhhhleeeeeeee


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllHHHHHhhhHHHHhhhhhlhhhhhhHHLLlllLH
Query gdlkalideksaliagwvksgklapidPQHLIfmiWASTqhyadfapqveaVTGAtlrDE  177
ident                                                            |
Sbjct kskvpsdadkviseisdieyvksvekgVGRYN...IIVR.........lllPKDI.kdAE  116
DSSP  eellhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeELLLL...EEEE.........eeeELLH.hhHH


DSSP  HHHHHHHHHHhhhhHHHH............lll
Query VFFNQTVENVqriiIEGI............rpr  198
ident                                  
Sbjct NLISEFLQRI...kNAENvevilisevrkfeii  146
DSSP  HHHHHHHHLL...lLEEEeeeeeeeeeeeelll


No 71: 1YLFA MOLECULE: RRF2 FAMILY PROTEIN;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL............lh
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP............sk   48
ident         |    |                ||                            
Sbjct .kISSRFSIAVHILSILKNNPSSLCTSDYXAESVNTNPVVIRKIXSylkqagfvyvngga   59
DSSP  .lLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeellle


DSSP  hhhhhhhhHHHH..............................HHHLhhhhlllllllhhh
Query ealyiavlRQIL..............................DIWLaplkafredfapla   78
ident            |                                                
Sbjct gllkdlheITLLdvyhavnviganiqavleiiliqaqsaxeeVLRN..............  105
DSSP  eelllhhhLLHHhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHL..............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query aikeyirlklevsrdYPQASRlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksg  138
ident                                                             
Sbjct ............itxGQLFET.......................................  114
DSSP  ............llhHHHHHH.......................................


DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query klapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                             
Sbjct .........................................................lqe  117
DSSP  .........................................................hll


No 72: 1T98A MOLECULE: CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;

DSSP  ...............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLHHHHHHHHL..........
Query ...............AVSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAG..........   35
ident                         | |                                 
Sbjct vpelvawarkndfsiSLPVDRLSFLLAVATLNGERldGEXSEGELVDAFRhvsdafeqts   60
DSSP  llhhhhhhhhhllleEELHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLLLHHHHHHHHHhhhhhlllll


DSSP  .....lLHHHHHHHLL......lhhhHHHH.HHHH.HHHHHlhhhhlllllllhhhhhhh
Query .....vSKTNLLYYFP......skeaLYIA.VLRQ.ILDIWlaplkafredfaplaaike   82
ident                                        |                    
Sbjct etigvrANNAINDXVRqrllnrftiyRLTPlGIGItDYYIR...................  101
DSSP  llhhhhHHHHHHHHHHhlleeellleEELHhHHHHhHHHHL...................


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhHHHHHHHHLL....
Query yirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksALIAGWVKSG....  138
ident                                                             
Sbjct ....................................qrefstlrlsXQLSIVAGELkraa  125
DSSP  ....................................lllllhhhhhHHHHHHHHHHhhhh


DSSP  .....................llllllhhhhHHHHHHHHHHHHhlhhHHHHHHL......
Query .....................klapidpqhlIFMIWASTQHYAdfapQVEAVTG......  171
ident                                                   |         
Sbjct daaeeggdefhwhrnvyaplkysvaeifdsiDLTQRLXDEQQQ.qvkDDIAQLLnkdwra  184
DSSP  hhhhllllhhhhhhhlhhhhhhlhhhhhhhhHHHHHHHHHHHH.hhhHHHHHHHhhlhhh


DSSP  llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.................................
Query atlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.................................  198
ident      |     |                                                
Sbjct aissCELLLSETSGTLRELQDTLEAAGdklqanllriqdatxthddlhfvdrlvfdlqsk  244
DSSP  hhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................
Query ......................  198
ident                       
Sbjct ldriiswgqqsidlwigydrhv  266
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 73: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLHHHHHHHHLL..LHHHHHHHLL............
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGV..SKTNLLYYFP............   46
ident          |                     |      |                     
Sbjct KLNDRQRKVLYCIVREYIENKK.PVSSQRVLEVSNIefSSATIRNDMKkleylgyiyqph   59
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHHHHHHHLLLllLHHHHHHHHHhhhhllleelll


DSSP  ..lhhhhHHHHHHHHHH...........................................
Query ..skealYIAVLRQILD...........................................   61
ident            ||                                               
Sbjct tsagripTDKGLRFYYEemlkisketseadlavetfksmpladpekvlflagnllarlte  119
DSSP  llllleeLHHHHHHHHHhhhhhllllllllhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   61
ident                                                             
Sbjct gyvlierpntrdlkilrvmlipvsedylifsiltefgvskvtpiktqerlnweeierqln  179
DSSP  leeeeelllhhhlllleeeeeelllleeeeeeeelleeeeeeeeellllllhhhhhhhhh


DSSP  .......................hhlhhhhllllLLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhlhhhh
Query .......................iwlaplkafreDFAPLAaikeyirlklevsrdypqas   98
ident                                                             
Sbjct fllrgrtvgevlmgkieslkgsgflrliesligeTVERYL.................dag  222
DSSP  hhhllllhhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhllLLLLEE.................eel


DSSP  hhhhhhHHLLllllhhhhhlhhhhhhHHHHHhhhhhhhlllllllLHHHHHHH.......
Query rlfcmeMLAGapllmdeltgdlkaliDEKSAliagwvksgklapiDPQHLIFM.......  151
ident                            |                                
Sbjct lenllkDETL........tledirnlLEEVK.............dQKFLESLVgegitvr  261
DSSP  hhhhhhLLLL........lhhhhhhhHHHLL.............lHHHHHHHLlllleee


DSSP  ..............hHHHH...................hhhHHLHhhhhhhhllllllhh
Query ..............iWAST...................qhyADFApqveavtgatlrdev  178
ident                                                             
Sbjct igreigrkklekfavFSGKyfkgespigsvylftskvtkydRNHR.............vf  308
DSSP  ehhhhllhhhlleeeEEEEeeelleeeeeeeeeeellllhhHHHH.............hh


DSSP  hHHHHHHHhhhhhhhhhlll
Query fFNQTVENvqriiiegirpr  198
ident                     
Sbjct eYILNRLS.....eyftsts  323
DSSP  hHHHHHHH.....hhhhhll


No 74: 1AKHA MOLECULE: PROTEIN (MATING-TYPE PROTEIN A-1);

DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHH..lLHHHHHHHHLLLHHHHHhhllLHHHhhhhhhhh
Query avsaKKKAILSAALDTFSQfGFHG..tRLEQIAELAGVSKTNLLyyfpSKEAlyiavlrq   58
ident                 |            |  |   |                       
Sbjct ....ISPQARAFLEEVFRR.KQSLnskEKEEVAKKCGITPLQVR...vWFIN........   44
DSSP  ....LLHHHHHHHHHHHHH.LLLLlhhHHHHHHHHHLLLHHHHH...hHHHH........


DSSP  hhhhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhl
Query ildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltg  118
ident                                                             
Sbjct ............................................................   44
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhh
Query dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdev  178
ident                                                             
Sbjct ............................................................   44
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                     
Sbjct ...............krmrs   49
DSSP  ...............hhhhl


No 75: 2NYXA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,

DSSP  ...................................lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhL
Query ...................................avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgT   25
ident                                             |               
Sbjct pataeesvdvitdalltasrllvaisahsiaqvdeniTIPQFRTLVILSNHG......pI   54
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHL......lE


DSSP  LHHHHHHHHLLLHHHHHHHLL...................lhhhhHHHHHHHHHHHHLHH
Query RLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...................skealYIAVLRQILDIWLAP   66
ident  |   | | ||                                                 
Sbjct NLATLATLLGVQPSATGRXVDrlvgaelidrlphptsrrellaalTKRGRDVVRQVTEHR  114
DSSP  EHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleeeeellllllleeeeeLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLllllllhhhhhhHHHHhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhh
Query LKAfredfaplaaikEYIRlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalide  126
ident                  |                                          
Sbjct RTE...........iARIV.........................................  122
DSSP  HHH...........hHHHH.........................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhHHHHHHH
Query ksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevfFNQTVEN  186
ident                                                             
Sbjct ..................................................eqxAPAERHG  132
DSSP  ..................................................hllLHHHHHH


DSSP  HHHH..hhhhhlll
Query VQRI..iiegirpr  198
ident   |           
Sbjct LVRAltafteagge  146
DSSP  HHHHhhhhhhhlll


No 76: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHL..LHHHHHHHHL.............lLHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFgFHGT..RLEQIAELAG.............vSKTN   40
ident              ||                  |                          
Sbjct naealQLNSTEVRILGCLIEKQATN.PETYplTLNALVIACNqktsrdpvxnltqgQVGQ   59
DSSP  lllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHLleEHHHHHHHHLllllllllllllhhHHHH


DSSP  HHHHLL............lhhhHHHHhHHHHHHhhlhhhhlllllllhhhhhhhhhhhHH
Query LLYYFP............skeaLYIAvLRQILDiwlaplkafredfaplaaikeyirlKL   88
ident  |                                                          
Sbjct SLRALEgrgltrlvxgsradrwEHKV.DKGLEL........vpaqviltgllllrgpqTV  110
DSSP  HHHHHHhllleeeelllllleeEELH.HHHHLL........lhhhhhhhhhhhhhlleEH


DSSP  HHHHHLHhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhh
Query EVSRDYPqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhl  148
ident                                                             
Sbjct SELLTRS.....................................................  117
DSSP  HHHHHHL.....................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhHLHHhhhhhhlLLLLL....hhhhhhhhhhhhHHHH...........h
Query ifmiwastqhyaDFAPqveavtgATLRD....evffnqtvenvqRIII...........e  193
ident             ||                                              
Sbjct ........nrxhDFED......sEQVVHqlerliarglatlvprQSGQredryxhligdp  163
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DSSP  hhlll
Query girpr  198
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Sbjct edlqd  168
DSSP  hhhll


No 77: 2CUJA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR 2-LIKE;

DSSP  ......................................................LHHHHH
Query ......................................................AVSAKK    6
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Sbjct gssgssgidsglspsvlmasnsgrrsapplnltglpgteklnekekelcqvvrlVPGAYL   60
DSSP  llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhlllLHHHHH


DSSP  HHhHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHhHHHHhhhhhhhhlhh
Query KAiLSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlYIAVlrqildiwlap   66
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Sbjct EY.KSALLNECHKQGG..LRLAQARALIKIDVNKTRKIYDFLIR.EGYI...........  105
DSSP  HH.HHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHL.LLLL...........


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Query lkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalide  126
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Sbjct ............................................................  105
DSSP  ............................................................


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Query ksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf