DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1PB6A MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;

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Summary

Notation:
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1PB6-A 33.8  0.0  198   198  100   HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;               "         
   2:  2D6Y-A 17.2  2.5  181   186   18   PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;                   "         
   3:  2GEN-A 16.9  2.8  181   188   19   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
   4:  2PZ9-A 16.7  2.3  171   179   24   PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;                               "         
   5:  1T33-A 15.4  2.8  186   220   19   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR              "         
   6:  2IAI-A 14.3  3.4  173   200   18   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;                "         
   7:  1ZKG-A 14.3  3.2  183   200   21   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
   8:  1U9N-A 14.1  3.4  179   194   15   TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;                            "         
   9:  1VI0-A 13.7  3.2  179   189   16   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  10:  2IBD-A 13.5  3.3  167   192   16   POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  11:  2G3B-A 13.5  3.9  178   188   21   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  12:  2DG8-A 13.1  3.8  170   175   18   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY            "         
  13:  2UXH-A 13.0  3.1  176   206   18   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;                   "         
  14:  2NP5-A 12.7  3.5  175   187   17   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  15:  2FX0-A 12.6  3.4  165   179   23   HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;                           "         
  16:  1UI5-A 12.5  3.2  169   199   20   A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;                                 "         
  17:  1A6I-A 12.0  4.0  166   193   13   TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;                    "         
  18:  1RKT-A 11.9  4.4  176   204   18   PROTEIN YFIR;                                              "         
  19:  2FBQ-A 11.7  4.1  172   213   21   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  20:  2OFL-A 11.5  3.9  178   221   19   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  21:  2ID3-A 11.5  4.5  173   191   18   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  22:  2HYJ-A 11.4  3.7  181   193   15   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  23:  2G7G-A 11.2  3.8  161   197   18   RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;              "         
  24:  2OI8-A 11.1  3.4  168   203   13   PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;                       "         
  25:  2GUH-A 11.1  3.2  158   179   18   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  26:  2F07-A 10.6  4.2  149   197   18   YVDT;                                                      "         
  27:  1ZK8-A 10.6  4.0  166   177    9   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  28:  2QKO-A 10.5  4.1  165   174   14   POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY            "         
  29:  1Z0X-A 10.5  4.6  167   216   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  30:  2Q24-A 10.4  4.8  137   173   20   PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  31:  2FQ4-A 10.2  4.4  151   184   19   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  32:  2OF7-A 10.0  3.6  118   191   23   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  33:  2HKU-A 10.0  4.6  138   191   20   A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                      "         
  34:  2G7S-A  9.9  3.7  163   190   13   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;                    "         
  35:  2FD5-A  9.7  4.0  158   180   12   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  36:  1V7B-A  9.5  3.8  157   175   18   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  37:  2O7T-A  9.2  4.3  157   188   11   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  38:  2OER-A  8.7  4.2  140   179   19   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  39:  2GFN-A  8.3  4.9  147   192   20   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED            "         
  40:  2DG7-A  8.2  3.8  122   187   12   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  41:  2IU5-A  7.9  4.5  145   179   12   HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;                                 "         
  42:  2NX4-A  7.6  4.6  130   194   15   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;            "         
  43:  2DTZ-A  7.5  4.4  156   186   12   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;                   "         
  44:  2G7L-A  6.6  4.3  139   201   11   TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                     "         
  45:  2I10-A  6.5  5.1  115   179   14   PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                   "         
  46:  1L0O-C  4.8  2.2   45    57   16   ANTI-SIGMA F FACTOR;                                       "         
  47:  2HXO-A  4.4  3.9  107   207   12   PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;            "         
  48:  1XJE-A  4.1  5.3   88   627    9   RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;                   "         
  49:  1TQI-A  4.1  4.8   81   269   11   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  50:  2OBP-A  3.8  3.2   52    81   12   PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;                              "         
  51:  2O3F-A  3.8  4.1   59    83   10   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;          "         
  52:  2NP3-A  3.8  3.8  106   141   11   PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;                            "         
  53:  1LVA-A  3.8 10.1   80   258   11   SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;                 "         
  54:  2AO9-A  3.7  6.3   76   117    9   PHAGE PROTEIN;                                             "         
  55:  2NR3-A  3.6  9.4   73   168    7   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  56:  2IW5-B  3.6  2.7   49   133   14   LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;                     "         
  57:  1BBY-A  3.6  2.5   52    69   12   RAP30;                                                     "         
  58:  2GAU-A  3.5  3.3   54   218   13   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;                 "         
  59:  2CJJ-A  3.5  3.9   49    63   12   RADIALIS;                                                  "         
  60:  2HXI-A  3.4  6.6  106   197   17   PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  61:  1T6S-A  3.4  4.9   72   162    7   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  62:  2NVU-B  3.3  8.0   80   789   13   NEDD8-ACTIVATING ENZYME E1 REGULATORY SUBUNIT;             "         
  63:  2HEO-A  3.3  2.6   46    59   15   Z-DNA BINDING PROTEIN 1;                                   "         
  64:  2DOB-A  3.3  2.8   53    82   13   PROACTIVATOR POLYPEPTIDE;                                  "         
  65:  2CFX-A  3.3  3.7   59   140    5   HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;                   "         
  66:  1H88-C  3.3  7.1   75   152    5   CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA;                        "         
  67:  1B9M-A  3.3  6.8   73   258   12   PROTEIN (MODE);                                            "         
  68:  2NNN-A  3.2  6.4   53   134   11   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                        "         
  69:  2IA0-A  3.1  3.8   68   156   10   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR                "         
  70:  2CMP-A  3.1  2.9   46    56   11   TERMINASE SMALL SUBUNIT;                                   "         
  71:  1STZ-A  3.1  4.3   82   323    9   HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA                "         
  72:  2EV0-A  3.0 11.5   69   131   13   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;                            "         
  73:  2DT5-A  3.0 10.0   81   210   19   AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;                               "         
  74:  1J5Y-A  3.0  5.8   84   172    7   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR                "         
  75:  2IQC-A  2.9  3.9   87   173   14   FANCONI ANEMIA GROUP F PROTEIN;                            "         
  76:  2FXA-A  2.9  7.9   61   156    8   PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR;                "         
  77:  2FQ3-A  2.9  2.6   50    85    4   TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3;                     "         
  78:  2DBB-A  2.9  3.8   63   146    2   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR                "         
  79:  1CF7-A  2.9  4.1   50    67    8   PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);                      "         
  80:  1B4A-A  2.9  4.9   77   146    5   ARGININE REPRESSOR;                                        "         
  81:  2NYX-A  2.8  6.4   71   146   13   PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN,               "         
  82:  2DK5-A  2.8  2.8   48    91   10   DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA                     "         
  83:  2COH-A  2.8  2.3   48   194   13   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;                                 "         
  84:  1SFX-A  2.8  7.0   65   109   14   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008;                     "         
  85:  1R1U-A  2.8  3.7   50    94   10   REPRESSOR PROTEIN;                                         "         
  86:  1QBJ-A  2.8  3.0   47    65   13   PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE            "         
  87:  1HST-A  2.8  2.8   49    74    8   HISTONE H5;                                                "         
  88:  1HLV-A  2.8  8.7   64   131   11   MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;                            "         
  89:  1FSE-A  2.8  2.0   48    67   10   GERE;                                                      "         
  90:  1EH6-A  2.8  4.4   55   168   20   O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE;                      "         
  91:  2H7F-X  2.7  4.9   66   314   11   DNA TOPOISOMERASE 1;                                       "         
  92:  2FJI-1  2.7  5.1   91   399    8   EXOCYST COMPLEX COMPONENT SEC6;                            "         
  93:  2DIM-A  2.7  4.6   56    70   11   CELL DIVISION CYCLE 5-LIKE PROTEIN;                        "         
  94:  2CUJ-A  2.7  2.6   51   108   18   TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR 2-LIKE;                            "         
  95:  1UST-A  2.7  3.5   57    92    2   HISTONE H1;                                                "         
  96:  1UFM-A  2.7  3.2   57    84    9   COP9 COMPLEX SUBUNIT 4;                                    "         
  97:  1AOY-A  2.6  3.1   49    78    6   ARGININE REPRESSOR;                                        "         
  98:  2CU7-A  2.5  6.6   51    72   14   KIAA1915 PROTEIN;                                          "         
  99:  1SGM-A  2.5  5.3   92   184   10   PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF;          "         
 100:  1K78-A  2.5  2.3   41   124    5   PAIRED BOX PROTEIN PAX5;                                   "         
 101:  1IN4-A  2.5  2.8   49   298   20   HOLLIDAY JUNCTION DNA HELICASE RUVB;                       "         
 102:  2P4W-A  2.4  6.4   92   197    9   TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY;            "         
 103:  2NS0-A  2.4  2.3   44    85    5   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
 104:  2JSC-A  2.4  3.3   51    96   20   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR RV1994C/MT2050;                  "         
 105:  2FUG-2  2.4  4.1   66   178   17   NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1;                       "         
 106:  1YX3-A  2.4  2.3   51   112    8   HYPOTHETICAL PROTEIN DSRC;                                 "         
 107:  1WPK-A  2.4  4.6   60   146   15   ADA REGULATORY PROTEIN;                                    "         
 108:  1ETK-A  2.4  2.1   38    75   11   FACTOR FOR INVERSION STIMULATION;                          "         
 109:  2G9W-A  2.3  6.0   82   119   10   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
 110:  2FRH-A  2.3  5.9   54   127   11   STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A;                      "         
 111:  1U78-A  2.3  9.1   62   103    8   TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE;                      "         
 112:  1SD4-A  2.3  8.5   75   122    7   PENICILLINASE REPRESSOR;                                   "         
 113:  1LDD-A  2.3  4.0   47    74    9   ANAPHASE PROMOTING COMPLEX;                                "         
 114:  1IV6-A  2.3  2.2   38    57   11   TELOMERIC REPEAT BINDING FACTOR 1;                         "         
 115:  2V1X-A  2.2  3.3   54   527    6   ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1;                             "         
 116:  1YOV-A  2.2  4.8   67   529   12   AMYLOID PROTEIN-BINDING PROTEIN 1;                         "         
 117:  1YLF-A  2.2  3.2   52   117   12   RRF2 FAMILY PROTEIN;                                       "         
 118:  1W1W-E  2.2  2.8   46    70    4   STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOME 1;                    "         
 119:  1T98-A  2.2  5.8   85   266    6   CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF;                         "         
 120:  2H6B-A  2.1  2.5   46   239   13   CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;                             "         
 121:  1ZQ3-P  2.1  3.7   53    68    8   HOMEOTIC BICOID PROTEIN;                                   "         
 122:  1XMK-A  2.1  3.2   48    79    8   DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE;          "         
 123:  1UMQ-A  2.1  2.6   39    60   10   PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN;               "         
 124:  1TWD-A  2.1  4.1   66   234    3   COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC;                           "         
 125:  1OF9-A  2.1  3.0   53    77    6   PORE-FORMING PEPTIDE AMEOBAPORE A;                         "         
 126:  1JHF-A  2.1  3.9   75   197   13   LEXA REPRESSOR;                                            "         
 127:  1IRZ-A  2.1  3.5   45    64   13   ARR10-B;                                                   "         
 128:  1GDT-A  2.1  2.0   33   183    9   PROTEIN (GAMMA DELTA RESOLVASE);                           "         
 129:  2QMA-A  2.0  6.6   62   463    8   DIAMINOBUTYRATE-PYRUVATE TRANSAMINASE AND L-2,4-           "         
 130:  2NTZ-A  2.0  6.4   68   183   15   PARB;                                                      "         
 131:  2FA5-A  2.0  7.2   58   139    3   TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MARR/EMRR FAMILY;                "         
 132:  2DM9-A  2.0  7.7   57   118    7   V-TYPE ATP SYNTHASE SUBUNIT E;                             "         
 133:  2CGP-A  2.0  3.5   47   200   17   PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);               "         
 134:  1U5T-A  2.0 11.4   65   213    6   APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7;                "         
 135:  1U2W-A  2.0  4.3   54   105   13   CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN;                   "         
 136:  1JR5-A  2.0  3.0   46    90    7   10 KDA ANTI-SIGMA FACTOR;                                  "         
 137:  1JGS-A  2.0  7.1   56   138   11   MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR;               "         
 138:  1IZN-A  2.0  6.2   84   275    6   CAPZ ALPHA-1 SUBUNIT;                                      "         
 139:  1FT9-A  2.0  2.5   47   210   19   CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION             "         
 140:  1CF7-B  2.0  3.5   53    82    4   PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4);                      "         
 141:  1B72-B  2.0  4.1   60    73   12   PROTEIN (HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1);                         "         
-

No 1: 1PB6A MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELTGDL  120
DSSP  HHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLLLHHHH
Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGATLRDEVFF  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGATLRDEVFF  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query NQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident ||||||||||||||||||
Sbjct NQTVENVQRIIIEGIRPR  198
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLL


No 2: 2D6YA MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident    | |  |  ||   |   |  | |   ||  |   |     |   |  |   ||    
Sbjct ..EATKARIFEAAVAEFARHGIAGARIDRIAAEARANKQLIYAYYGNKGELFASVLEKKX   58
DSSP  ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHHHHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGA...PLLMDELT  117
ident                    |   |   |      |   ||   |             |  
Sbjct LDLAISVPVD......pDDIEGWIDRLLDYHAAHPELLRLLFWEGXEYGtaeLPHEAERQ  112
DSSP  HHHHHHLLLL......hHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHLlllLLLHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLLlllL
Query gDLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAVTGAtlrD  176
ident     |                     |    | |   |                |     
Sbjct .EHYARKVAAVRDGQERG...VITDaIPAPDLLFLLVAXANWAVVVPQXKRILVGG...G  165
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHLL...H


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLl
Query EVFFNQTVENVQRIIIEGIRPr  198
ident                       
Sbjct DAGTDGLRDSIKKAARRIVDR.  186
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.


No 3: 2GENA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident      |  || |||  ||  |   |  | |    | |   |   |  ||           
Sbjct ....RKDEILQAALACFSEHGVDATTIEXIRDRSGASIGSLYHHFGNKERIHGELYLAGI   56
DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhllLLLL....HHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagAPLL....MDE  115
ident     | | | |                        |   |                    
Sbjct GQYAALLEAgFARARSAEETVRLLVTSYIDWVVANPDWARFILHSR...GRVEagelGER  113
DSSP  HHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHH...HHHHhlllHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHhhhlLL
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEavtgAT  173
ident |  |  |      |  ||    |                     |               
Sbjct LRADNQAHFARIHAALAGYRAEGLFREXPDDCFASVVIGPAHDLARQWlaGRTR....VA  169
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLLL....LL


DSSP  LLlhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query LRdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident |          |          |  
Sbjct LA......DCRELLAQVAWDSVRAA  188
DSSP  HH......HHHHHHHHHHHHHHLLL


No 4: 2PZ9A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |  ||   |   |  | |   ||  |  ||     || ||||||  |     
Sbjct ...STRQRIVAAAKEEFARHGIAGARVDRIAKQARTSKERVYAYFRSKEALYAHVAERET   57
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLlllhhhhhlHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGApllmdeltgDL  120
ident                  |    |           |   ||     |  |          |
Sbjct TALIEATQLD......pADLPGYAGILFDHFAARPDHYRLITWGRLELA.........PL  102
DSSP  HHHHHHLLLL......lLLHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHLL.........LH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHHHHHLlllllHHH
Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVEAVTGatlrdEVF  179
ident  | |  |          | | |  ||      |       |   |   |           
Sbjct QATIAGKLDKLRDAQRIGLLDPaWDPVDVLALINQIAXTWA.GQPEIAAAAA.dqavDPS  160
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHLHHH.HLHHHHHHHH.hhllLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLll
Query FNQTVENVQRIIIEGIRpr  198
ident                    
Sbjct VTARRAALVTAVEHXFPrp  179
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLll


No 5: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR

DSSP  ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHH
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALY   52
ident              |     |||  |   |        || |||       ||| ||| ||
Sbjct mnipttttKGEQAKSQLIAAALAQFGEYGL.HATTRDIAALAGQNIAAITYYFGSKEDLY   59
DSSP  lllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL.HHHHH...LLLL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHH
Query IAVLRQILDIWL.APLKA...FRED........fAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQAS   98
ident  |    | |                         |    |                   |
Sbjct LACAQWIADFLGeKFRPHaekAERLfsqpapdrdAIRELILLACKNMIMLLTQedTVNLS  119
DSSP  HHHHHHHHHHHHhHLHHHhhhHHHHhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLlLLLL.HHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLHHHHHHHHhHHHH
Query RLFCMEMLAgAPLL.MDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSgklapiDPQHLIFMIwASTQ  157
ident      | |                 |      | |              |          
Sbjct KFISREQLS.PTSAyQLVHEQVIDPLHTHLTRLVAAYTGCdandtrMILHTHALL.GEVL  177
DSSP  HHHHHHHHL.LLHHhHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllhhHHHHHHHHH.HHHH


DSSP  HHHHLHHHHHHHH.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..l
Query HYADFAPQVEAVT.GATLrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRP..r  198
ident             |      ||         |   |         
Sbjct AFRLGKETILLRTgWPQF.DEEKAELIYQTVTCHIDLILHGltq  220
DSSP  HHHHLHHHHHHHHlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl


No 6: 2IAIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;

DSSP  ..........lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHH
Query ..........avsakkKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEA   50
ident                    || |   |   |  ||  |     || ||         || 
Sbjct grenlyfqgxttaktpETLLSVAVQVFIERGYDGTSXEHLSKAAGISKSSIYHHVTGKEE   60
DSSP  llllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLHHHHH..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhLL
Query LYIAVLRQILDIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlAG  108
ident |        ||     |     |             |   ||         |       |
Sbjct LLRRAVSRALDELFGILDEehARVG.TAAERLEYVVRRXVEVLXAELPYVTLLLRV..RG  117
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL..LL


DSSP  LLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhh
Query APLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqve  167
ident        |            ||       |                              
Sbjct TGTERWALE.RRREFDHRVAALLKDAAAEGDVRAdVEVRLATRLVFGXINSIVEWYR...  173
DSSP  LHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLHHHHLL...


DSSP  hhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLllll
Query avtgatlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGirpr  198
ident                 |  | |    |    
Sbjct ...pesgvSGAGEREVVDAVARLVFGG.lrk  200
DSSP  ...lllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.lll


No 7: 1ZKGA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident  |  |  ||| ||   |   |        ||| ||| |     ||  || ||        
Sbjct .VLSKRDAILKAAVEVFGKKGYDRATTDEIAEKAGVAKGLIFHYFKNKEELYYQAYXSVT   59
DSSP  .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHL.HHHHHLL..LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHH
Query DIWL.APLKAFR..EDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELT  117
ident                           |  ||| |   |               |    | 
Sbjct EKLQkEFENFLXknRNRDIFDFXERWIEKKLEYSASHPEEADFLITLVSVDEGLRKRILL  119
DSSP  HHHHhHHHHHHHhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......llLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhh
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKSG.......klAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFApqveav  169
ident  ||               |                                         
Sbjct .DLEKSQRVFFDFVREKLKDLdlaedvteeIALKfLXWFFSGFEEVYLRTYQGK......  172
DSSP  .HHHHHLHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL......


DSSP  hlLLLLLhhHHHHHHHHHHHHhHLLLLLL...
Query tgATLRDevFFNQTVENVQRIiIEGIRPR...  198
ident     |      |  || |              
Sbjct .pELLKR..DXNTLVEEVKVX.LRILKKGxtk  200
DSSP  .hHHHHH..HHHHHHHHHHHH.HHHHHHHhll


No 8: 1U9NA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident        |||  |                 |  || |      |||||||     |    
Sbjct .GDDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVV   59
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLL...lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHHH
Query DIWLAPLKAFR...edfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAPLLMDELT  117
ident       |                   |    |         |       |          
Sbjct NQADXALQTLAenpadtDRENXWRTGINVFFETFGSHKAVTRAGQAAR.ATSVEVAELWS  118
DSSP  HHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHL.LLLHHHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhl
Query gDLKALIDEKSALIAG.WVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtg  171
ident            |         |              |                       
Sbjct .TFXQKWIAYTAAVIDaERDRGAAPRtlpaheLATALNLXNERTLFASFAGEQPS.....  172
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.....


DSSP  lllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.
Query atlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.  198
ident                   |    |    
Sbjct ......vPEARVLDTLVHIWVTSIYGEn  194
DSSP  ......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl


No 9: 1VI0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident     |   |  ||       | |      ||  |||       ||  ||   |       
Sbjct ...PKYXQIIDAAVEVIAENGYHQSQVSKIAKQAGVADGTIYLYFKNKEDILISLFKEKX   57
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHH.HHHLLlLLLHHHHHl
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCM.EMLAGaPLLMDELTg  118
ident             |           |                           |       
Sbjct GQFIERXEEdIKEKATAKEKLALVISKHFSLLAGDHNLAIVTQLeLRQSNlELRQKINE.  116
DSSP  HHHHHHHHHhHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLlLLLLLhHHHHHHHH.


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhLLLLll
Query DLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtGATLrd  176
ident  ||               ||      |       |                      |  
Sbjct ILKGYLNILDGILTEGIQSGEIKEgLDVRLARQXIFGTIDETVTTWvXNDQ...KYDL..  171
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...LLLH..


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHLLllll
Query evffnQTVENVQRIIIEGirpr  198
ident           |      |    
Sbjct ....vALSNSVLELLVSGihnk  189
DSSP  ....hHHHHHHHHHHHHLllll


No 10: 2IBDA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident   |      |  |   |   |   |    ||  ||     |   | |||      ||  |
Sbjct GKSGRRTELLDIAATLFAERGLRATTVRDIADAAGILSGSLYHHFDSKESXVDEILRGFL   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH.HHHHhLLLLL.LHHHHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLF.CMEMlAGAPL.LMDELT  117
ident |                 |          |       |                    | 
Sbjct DDLFGKYREiVASGLDSRATLEALVTTSYEAIDASHSAVAIYqDEVK.HLVANeRFTYLS  119
DSSP  HHHHHHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHhHLLH.HHLLLhHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..lllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllllL
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKS..gklapidpqhlIFMIWASTQHYADFApqveavtgatlR  175
ident   |     |                                                   
Sbjct .ELNTEFRELWXGVLEAGVKdgsfrsdidvelaFRFLRDTAWVAVRWY.........rpG  169
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllhhhhHHHHHHHLLHHHHLL.........llL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHhllllll
Query DEVFFNQTVENVQRIIiegirpr  198
ident   |           |        
Sbjct GSVTVDTVAKQYLSIVldglasp  192
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHhhlllll


No 11: 2G3BA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident   |    ||| |      | |  | |    || ||||   | | |     |  | |  | 
Sbjct .XSERRDAILKASATAIAQRGIRGLRVNDVAEVAGVSPGLLYYHFKDRIGLLEAALNYIN   59
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLH.HHHHllllLLHHHHHHHHHHHHHhhHHHL..HHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHH
Query DIWLA.PLKAfredFAPLAAIKEYIRLKLevSRDY..PQASRLFCMEMLAG..APLLMDE  115
ident |   |                                   |               | | 
Sbjct DRARAyRSEG.eggDSARDRLTRSLLGEI..QDRPevVENSLAWNELRASAvyEEALRDP  116
DSSP  HHHHHhHLLL.lllLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhlll
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtgat  173
ident |     |   |    |      |      |||       |                    
Sbjct LARTTAAWVSEIADAIVQAQATGEISRsLDPQPTAVTXTALVEGLSGRWlCKEI......  170
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL......


DSSP  lllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLll
Query lrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRpr  198
ident                  |       
Sbjct .....STEDARSHLLGAIDVVXS..  188
DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHL..


No 12: 2DG8A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         || | ||     |        ||  |||      | |   | |         
Sbjct .DPQRRERILAATLDLIAEEGIARVSHRRIAQRAGVPLGSMTYHFTGIEQLLREAFGRFT   59
DSSP  .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHH..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHH
Query DIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAP..LLMDEL  116
ident |   |               |      |  | | |      |        |         
Sbjct DHIVAVFDEhlGAAA.DRDEAREAVADLVHELSEDSQRDLVLTQELYTLAARqpAYRELT  118
DSSP  HHHHHHHHHhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHlhHHHHHH


DSSP  HlHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHhhhhllllll
Query TgDLKALIDEKSALIAGwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVeavtgatlrd  176
ident                                |   |   | | |  |             
Sbjct H.EWMRRSRVHLEKHFD........pGTARQLDALIEGLTLHRA.LAREP..........  158
DSSP  H.HHHHHHHHHHLLLLL........hHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL..........


DSSP  hhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query evffnQTVENVQRIIIEGIRPR  198
ident               |       
Sbjct .....HGRALTLEAIARITTTD  175
DSSP  .....LLHHHHHHHHHHHLLLL


No 13: 2UXHA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR   57
ident            |  ||   |   |   | |  |||||||        |  |  |  | | 
Sbjct tkeEAQETRAQIIEAAERAFYKRGVARTTLADIAELAGVTRGAIYWHFNNKAELVQALLD   60
DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHhHHHLHHHHHL..LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHL....
Query QIlDIWLAPLKAF..REDF.APLAAIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLA....  107
ident          |      ||   ||                                     
Sbjct SL.HETHDHLARAseSEDEvDPLGCMRKLLLQVFNELVLdarTRRINEILHHKCEFtddm  119
DSSP  HL.LHHHHHHHHHhhLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhHHHHHHHHHHLLLLlhhh


DSSP  ..lLLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL....lLHHH.HHHHHHHHHHHHh
Query ..gAPLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP....iDPQH.LIFMIWASTQHYa  160
ident              |    |    |          |                         
Sbjct ceiRQQRQSAVL.DCHKGITLALANAVRRG...QLPGeldaeRAAVaMFAYVDGLIRRW.  174
DSSP  hhhHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlllhhHHHHhHHHHHHHHHHHH.


DSSP  HLHHHHhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLL.....ll
Query DFAPQVeavtgatlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIR.....pr  198
ident    |                   ||          |       
Sbjct LLLPDS...........vDLLGDVEKWVDTGLDMLRlspalrk  206
DSSP  HHLLLL...........lLLLLLHHHHHHHHHHHHHhlhhhll


No 14: 2NP5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident            |  |     |  |      |  ||||       |  |       ||   
Sbjct ...TSPERLAAALFDVAAESGLEGASVREVAKRAGVSIGAVQHHFSTKDEXFAFALRTLV   57
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhHHLH.HHHHHHHHHHHLLLLL..LHHHHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEvsRDYP.QASRLFCMEMLAGAPL..LMDELT  117
ident |  || |        |  |        |                     |    |     
Sbjct DKLLARLSEVERGGDPARALFAAXSQLLP.lDEARsREAHVXAAFAVRAATSpsLAEIRR  116
DSSP  HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.lLHHHhHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhlllll
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKsgkLAPI..DPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlr  175
ident       |                         |               |           
Sbjct .KTLFTIRTGLSAVLIGIG...TPEAetRAALLLATVDGLALDA.IGSPAL.........  162
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLHHH.........


DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....
Query devfFNQTVENVQRIIIEGIRPR.....  198
ident          |    | |  |        
Sbjct ...yPPEYLEHALDIQIGXILQGadvvp  187
DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllll


No 15: 2FX0A MOLECULE: HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         || ||   |   |  ||    ||  | |      |||  || ||  |     
Sbjct SREQTXENILKAAKKKFGERGYEGTSIQEIAKEAKVNVAXASYYFNGKENLYYEVFKKYG   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL


DSSP  HHHLHhhHHLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHh
Query DIWLAplKAFRE..DFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCME.MLAGaPLLMDELt  117
ident          | |   | |  |  ||           |    |   |        |     
Sbjct LANEL..PNFLEknQFNPINALREYLTVFTTHIKENPEIGTLAYEEiIKES.ARLEKIK.  116
DSSP  LHHHL..LLHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHlLLLL.LLHHHHH.


DSSP  LHHHHhhhhhhHHHHHHHHLLlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHHHHhllllll
Query GDLKAlideksALIAGWVKSGkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYadFAPQVEAVtgatlrd  176
ident                   | |         | |  |                        
Sbjct PYFIGsfeqlkEILQEGEKQG.VFHFfSINHTIHWITSIVLFP..KFKKFIDS.......  166
DSSP  HHLHHhhhhhhHHHHHHHHLL.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHHHHL.......


DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHLLllll
Query evffnqtveNVQRIIIEGirpr  198
ident               ||      
Sbjct .........DLVSRIISAltdk  179
DSSP  .........LHHHHHHHHhhll


No 16: 1UI5A MOLECULE: A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident          |  || | |   |   | |  |   ||| |  |   |  || |  | |   
Sbjct lRAEQTRATIIGAAADLFDRRGYESTTLSEIVAHAGVTKGALYFHFAAKEDLAHAILEIQ   60
DSSP  lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHhl
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMLAgAPLLMDELtg  118
ident         |         | |                   |       |           
Sbjct SRTSRRLAKDlDGRGYSSLEALXRLTFGXARLCVQG.PVLRAGLRLATA.GVPVRPLP.h  117
DSSP  HHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHHL.LLLLLLLL.l


DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhhllllllh
Query dlkalidekSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFapqveavtgatlrde  177
ident                 |        ||          |                      
Sbjct pftewreiaTSRLLDAVRQSDVHQdIDVDSVAHTLVCSVVGTRVV...............  162
DSSP  hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLLLLL...............


DSSP  hHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.................
Query vFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.................  198
ident             | | |  |                  
Sbjct .REPRRLAEXWYILIRGXVPVtrraryvtlaarleqet  199
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhhl


No 17: 1A6IA MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident      |      ||      |  |      |   ||    |      | ||  |    ||
Sbjct .sRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAVEIL   59
DSSP  .lLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHhLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhHHHHHHHhhlllllLHHHhhLHH
Query DIWLAPLKaFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSrDYPQaSRLFCMEmlagaplLMDEltGDL  120
ident                                                             
Sbjct ARHHDYSL.PAAGESWQSFLRNNAMSFRRAL.LRYRdGAKVHLG.......TRPD..EKQ  108
DSSP  HHHLLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLLlHHHHHHH.......LLLL..HHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.........hhhhhHHL
Query KALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.........pqveaVTG  171
ident                        |    |      |                        
Sbjct YDTVETQLRFMTENG....fslRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQqehlppllrealqiMDS  164
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhhHHL


DSSP  LLlllhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLLL........
Query ATlrdevfFNQTVENVQRIIIEGIRPR........  198
ident           |         | |            
Sbjct DD......GEQAFLHGLESLIRGFEVQltallqiv  193
DSSP  LL......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllll


No 18: 1RKTA MOLECULE: PROTEIN YFIR;

DSSP  .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHH
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYI   53
ident                || ||   |   ||  |      |  | |      || | |    
Sbjct spkvtkeHKDKRQAEILEAAKTVFKRKGFELTTXKDVVEESGFSRGGVYLYFSSTEEXFR   60
DSSP  llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHHHHHLL..ll
Query AVLRQILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYP.QASRLFCMEMLAG..ap  110
ident       ||  |  |    |     | |  |     |  ||                    
Sbjct RIIETGLDEGLRKLDKSAEHQSVWASISSYLDELTEGLRDVAdTLAPVQFEYLVTAwrne  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhLLHHHHHHHHHHHhhlh


DSSP  lLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHH.hHLLLLLL....lLHHHHHHHHHHHhHHHHHLHhh
Query lLMDELTGDLKALIDEKSALIAGW.vKSGKLAP....iDPQHLIFMIWAStQHYADFApq  165
ident      |           | |                                  |     
Sbjct eRRQYLEKRYDLFVERFSRLLQKGidQGEFQPVqplatIAKFFLNXNDGI.IQNALYF..  177
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLLLLllhhhHHHHHHHHHHHH.HHHHHHL..


DSSP  hhhhhllLLLLhhhhhhHHHHHHHHHHLLLLL......l
Query veavtgaTLRDevffnqTVENVQRIIIEGIRP......r  198
ident                   |                    
Sbjct .......DEEK.....aDVSGLAESAKLYLKTvlqadek  204
DSSP  .......LHHH.....hLHHHHHHHHHHHHHHhhlllll


No 19: 2FBQA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident | |     || ||   |   ||  | |  |   |||      | | || ||  ||    |
Sbjct AQSETVERILDAAEQLFAEKGFAETSLRLITSKAGVNLAAVNYHFGSKKALIQAVFSRFL   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHH.LLLLL....lhhHHHHHHHHHHHH........hhhhLHHHHHHHHHHHHL
Query DIWLAPLKA.FREDF....aplAAIKEYIRLKLE........vsrdYPQASRLFCMEMLA  107
ident     | |               |       |                    ||       
Sbjct GPFCASLEKeLDRRQakpeaqhATLEDLLHLLVSqamavkprsgndLSIFMRLLGLAFSQ  120
DSSP  HHHHHHHHHhHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHhhhhlllllllhHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  LLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllLLLLHhHHHHHHHHHHHH...HHHLHH
Query GAPLLMDELTGDLKALIDEKSaliagwvksgklAPIDPqHLIFMIWASTQH...YADFAP  164
ident     |   |                            |  |                   
Sbjct SQGHLRKYLEEVYGKVFRRYM.....llvneaaPKLPPiELFWRVHFMLGAaafSMSGIK  175
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....hhhhhhlLLLLHhHHHHHHHHHHHHhhhHHHLHH


DSSP  HHHHHHL......lLLLLhhHHHHHHHHHHHHHhLLLL.ll
Query QVEAVTG......aTLRDevFFNQTVENVQRIIiEGIR.pr  198
ident    |                     |               
Sbjct ALRAMAEtdfgvntSTEQ..VMHLMVPFFAAGM.RAESgid  213
DSSP  HHHHHHHhhhllllLHHH..HHHHHHHHHHHHH.HLLLlll


No 20: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident          ||  |   |   |   |    ||  ||||  |  |||  || |       |
Sbjct sKSEQTRALILETAXRLFQERGYDRTTXRAIAQEAGVSVGNAYYYFAGKEHLIQGFYDRI   60
DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLL...HHH
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLL...MDE  115
ident      |             |         |     |      |          |     |
Sbjct AAEHRAAVREvLARETDLEARLAGVLKVWLDIATPYHEFAVQFFKNAADPDSPLspfSPE  120
DSSP  HHHHHHHLLLhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlllLHH


DSSP  HHlHHHHHHhHHHHH.HHHHhhllLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhhhhh
Query LTgDLKALIdEKSAL.IAGWvksgKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPqveav  169
ident                  ||        |       |                |       
Sbjct SE.HARVEAiGIHRAvLAGA...kTKVPeelrdiLPELXWLSQXGLVLYW.IFDR.....  170
DSSP  HH.HHHHHHhHHHHHhHLLL...lLLLLhhhllhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL.....


DSSP  hllllllHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL...........................
Query tgatlrdEVFFNQTVENVQRIIIEG..IRPR...........................  198
ident                    |                                      
Sbjct .......TEGRERSYRLAERGARLTarGVVLarfrvlrplvrevhelftdflpgxtkv  221
DSSP  .......LLLLHHHHHHHHHHHHHHhhHHHLllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll


No 21: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ   58
ident          | | || |     ||    |  ||  ||| ||           |    |  
Sbjct ggRTARIREAVLLAAGDALAADGFDALDLGEIARRAGVGKTTVYRRWGTPGGLAADLLAD   60
DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLhhhHHLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHH.
Query ILDIWLaplKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQASRLFCMEMLAgAPLLMDE.  115
ident      |          |         ||      |       |      |          
Sbjct XAEQSL...PRAD.TGALEEDLRANARLVVRTLDDprQGRLFRALIAASLC.NEQAAEAl  115
DSSP  HHHHLL...LLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhHHHHHHHHHHHHHH.LHHHHHHh


DSSP  HHLHhhhhHHHHhHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhllll
Query LTGDlkalIDEKsALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtgatl  174
ident                    |  |      ||        |                    
Sbjct HRFYavrvDEWA.GCVRDAVARGEVPDgTDPHGVVAAVSAPLYYALLNTGRS........  166
DSSP  HHHHhhhhHHHH.HHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL........


DSSP  llhhhHHHHHHHHHHHHHLLLL.....ll
Query rdevfFNQTVENVQRIIIEGIR.....pr  198
ident               |      |       
Sbjct ....lTEADADRAARAASTAARagvwvtg  191
DSSP  ....lLHHHHHHHHHHHHHHHHlllllll


No 22: 2HYJA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident     |    ||  |    |  |  |      ||    ||      |  || | |  |   
Sbjct aEAQATRGRILGRAAEIASEEGLDGITIGRLAEELEMSKSGVHKHFGTKETLQISTLDKA   60
DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLH.HHHHLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH.hHHHHHHHHHLLL....LLLH
Query LDIWLA.PLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQ.aSRLFCMEMLAGA....PLLM  113
ident                   |                       |                 
Sbjct FVDFWHrVVEPALaEPPGLRRLRAVCANSVGYLEEPLLpgGCLLTAALSEYDgrpgRVRD  120
DSSP  HHHHHHhHLHHHHhLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLLHHHHHHHHHLllllHHHH


DSSP  HHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query DELTgDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg  171
ident                |     |  | |    |     | | |           |      
Sbjct AVAE.VWSRWREQLRADLTAAVDKGELPAgFDVEQALFEIVAAGLALNAAMqLQHD....  175
DSSP  HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL....


DSSP  lllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLlll
Query atlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIrpr  198
ident                            
Sbjct ......rTAADRARRAIERALAQS...  193
DSSP  ......lLHHHHHHHHHHHHHHHL...


No 23: 2G7GA MOLECULE: RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |  |||      |    |    |    |             |    |     
Sbjct ...LDRERIAEAALELVDRDGD..FRXPDLARHLNVQVSSIYHHAKGRAAVVELVRHRVV   55
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHhlHHHHHLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhlllllLHHHhhlhh
Query DIwlAPLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagaplLMDEltgdl  120
ident         ||        |  |  |         | | ||   |         |      
Sbjct RE..IDGSAFE.RLPWDEAFSEWARSYRAAFSRHPTAIRLLATET......VRDP...gs  103
DSSP  LL..LLLHHHH.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLL......LLLH...hh


DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhhHHHHHL.........
Query kaLIDEKSALIAGWVksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADfapqVEAVTG.........  171
ident         |   |               |          |        |           
Sbjct lsVYHSAAAGLRGAG....fpddHIXAVITAAENFLLGAAL.daaAPEVXIeadstttdd  158
DSSP  hhHHHHHHHHHHHHL....llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhLLLLLLlllllllll


DSSP  .......llllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....
Query .......atlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR.....  198
ident                  |  |        |         
Sbjct altralaaaprGPERAEQAFELGLAALLAGFHHLlqecg  197
DSSP  hhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll


No 24: 2OI8A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;

DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAV   55
ident              |   |       |     |  ||   | |   |  ||     |    
Sbjct tprerYRTQVRAEIKDHAWEQIATAGASALSLNAIAKRXGXSGPALYRYFDGRDELITEL   60
DSSP  lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHLHHHHH.LLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHhHHLL.lLLLH
Query LRQILDIWLAPLKA.FREDFaplaAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMeMLAG.aPLLM  113
ident  |         | |                        | ||   |              
Sbjct IRDAYRSQADSLRAaAASGA....DLAGLAHALRAWALDDPQRYFLIFG.TPVPgyRAPD  115
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhHHLLL....LHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHL.LLLLllLLLH


DSSP  HHHhLHHHHHHhHHHHHHHHH..................hhllllllLLHHHHHHHHHHH
Query DELtGDLKALIdEKSALIAGW..................vksgklapIDPQHLIFMIWAS  155
ident |                                                           
Sbjct DIT.EIAAETX.AVIVDACAAgtdgafdahldthrqwadrpapssalHRALSFWSRLHGV  173
DSSP  HHL.LLLHHHH.HHHHHHHLLllllhhhhhhhhllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHhHLHHhHHHHHllllllhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLl
Query TQHYaDFAPqVEAVTgatlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPr  198
ident                                          | 
Sbjct LSLE.LAGQ.FTGXG..........fDSALLFEAELKDLLGP.  203
DSSP  HHHH.HLLL.LLLLL..........lLHHHHHHHHHHHHLLL.


No 25: 2GUHA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhh
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRqi   59
ident          |  ||   |         |  ||| ||||      || ||| |  |     
Sbjct rTAEQSRSLIVDAAGRAFATRPYREITLKDIAEDAGVSAPLIIKYFGSKEQLFDALVD..   58
DSSP  lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL..


DSSP  HHHHL.HHHHHllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHH..lHHHHhHHHHHHH..LLLL.LLH
Query LDIWL.APLKAfredfaplaAIKEYIRLKLEVSRD..yPQASrLFCMEML..AGAP.LLM  113
ident                                       |    |                
Sbjct FRAAAeIVFSG.........PLDGLGERXVSXFARplePYKP.LSLNILFxsGPSEeSSR  108
DSSP  LHHHHhHHLLL.........LLLLHHHHHHHHHLLlllLLLL.HHHHHHHllLLLLhHHH


DSSP  HHHHlhhhhhhhhhHHHHhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHhHHL
Query DELTgdlkalidekSALIagwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEaVTG  171
ident                               |               |        |    
Sbjct KLRAnysaqxidalAERL.........pGRDARLRAELVXSXLTGLAVXRrkXXQE.HAT  158
DSSP  HHHHhhhhhlhhhhHHHL.........lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLHH.HLL


DSSP  LllLLHHHHHHHHHHHHhHHHLLLlll
Query AtlRDEVFFNQTVENVQrIIIEGIrpr  198
ident      |         ||     |    
Sbjct G..TPEEVVAHYAPLVQ.ELLDGG...  179
DSSP  L..LHHHHHHHHHHHHH.HHHHLL...


No 26: 2F07A MOLECULE: YVDT;

DSSP  ......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ......aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA   54
ident         | |   || ||    |  |        |   ||        || || ||  |
Sbjct pftmpkqTSGKYEKILQAAIEVISEKGLDKASISDIVKKAGTAQGTFYLYFSSKNALIPA   60
DSSP  lllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL.HHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHHHHHHlLLLL.L
Query VLRQILDIWL.APLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpqaSRLFCMEMLaGAPL.L  112
ident      |   |         |          |                        |    
Sbjct IAENLLTHTLdQIKGRLHGDEDFWTVLDILIDETFLITERH...KDIIVLCYSgLAIDhS  117
DSSP  HHHHHHHHHHhHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HHHHHHHHHhHHHLlL


DSSP  HHHHHLHHH......................hhhHHHHhhhhhhhhllllllllhhhHHH
Query MDELTGDLK......................aliDEKSaliagwvksgklapidpqhLIF  150
ident |                                                         | 
Sbjct MEKWETIYQpyyswlekiinkaianhevteginsKWTA.................rtIIN  160
DSSP  HHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhHHHH.................hhHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHLLLLL....l
Query MIWASTQHYADFApqveavtgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRP....r  198
ident                                   |     |           
Sbjct LVENTAERFYIGF...............eqdenvEVYKKEIFTFLKRslgta  197
DSSP  HHHHHHHHHHLLL...............lllllhHHHHHHHHHHHHHhhlll


No 27: 1ZK8A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |   |       |     |   |   ||    |                   
Sbjct .IGLTLQKIVETAAEIADANGvQEVTLASLAQTLGVRSPSLYNHVKGLQDVRKNLGIYGI   59
DSSP  .LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHH.HLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHhhhhllllLLHHHHHlH
Query DIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCmemlagapLLMDELTgD  119
ident       |  |         ||           |  |                        
Sbjct KKLHNRLEeAAED.KRXDEAIHALGEAYVAFVRKHPGLYEATF.......lRDEEVRK.A  110
DSSP  HHHHHHHHhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHLL.......lLLHHHHH.H


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhHHHHhllllllhhh
Query LKALIDEKSALIAGWVKSgklapIDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPqVEAVtgatlrdevf  179
ident                                                             
Sbjct GDGIVKLCLQVLQQYGLEgenalHATRGFRSICHGFASIE.QQGG.FGLP..........  158
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL.LLLL..........


DSSP  hhHHHHHHHHHHHLLLLL.l
Query fnQTVENVQRIIIEGIRP.r  198
ident                |    
Sbjct .lDLDISLHVLLETFIKGlr  177
DSSP  .lLHHHHHHHHHHHHHHHhl


No 28: 2QKOA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHL.LLLHhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELA.GVSKtNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident        |   ||       |  |         |          ||||   |   |   |
Sbjct ..PERRAALVNAAIEVLAREGARGLTFRAVDVEAnVPKG.TASNYFPSRDDLFDQVGKRI   57
DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlLLLL.LHHHHLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHlhhhhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLL....LLHHH
Query LDIWlaplkafredfaPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAP....LLMDE  115
ident                  |    ||                         |     |    
Sbjct HERL............NLELAIEYXQGLFGRITRDRTGYLALQELR.LEAVrrpeLRTTL  104
DSSP  HHLL............LHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHH.HHHLllhhHHHHH


DSSP  HHlHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhHHLLll
Query LTgDLKALIDEKSALIAGWVksgklaPIDPqHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEaVTGAtl  174
ident                           | |                         |     
Sbjct TR.TISENLKRDIGFHLDSG.....lPGDR.STVLXLYLAXNALIVEHlTLPG.VLEG..  154
DSSP  HH.HHHHHHHHHHHHHHHHL.....lLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.HLLL..


DSSP  llhHHHHHHHHHHHHHHhLLLLll
Query rdeVFFNQTVENVQRIIiEGIRpr  198
ident    |     |              
Sbjct ...VDTERLVADLVTRA.VATPda  174
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHH.LLLLll


No 29: 1Z0XA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.llLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQF.gfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI   59
ident      |  |  ||                  |   ||       ||  | ||       |
Sbjct ..KLSKDTIIAAAFSLLEKSptlEQLSXRKVAKQLGVQAPAIYWYFKNKQALLQSXAEAI   58
DSSP  ..LLLHHHHHHHHHHHHHHLllhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLHHhhHLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHhlllllLHHHhhlH
Query LDIWLAPlkAFREdfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMlagaplLMDEltgD  119
ident       |  |                           |                      
Sbjct EEHFQEP..ALCG..EWYSDLLAFXENYYDLYQQFpCAVAIEIQTV......PAYP...Q  105
DSSP  HHLLLLL..LLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLHHHHHHLLL......LLLH...H


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH..........
Query LKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAV..........  169
ident                                            |                
Sbjct RLRHLNQXXGILREAG....fspEXTHLAVTSLQHLLFGXIXDATEEKQLvsqvlngddy  161
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhh


DSSP  ....................hlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL......
Query ....................tgatlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR......  198
ident                                             |          
Sbjct lkeqvlhxkqyvsdneltyxeesiqfHSIHQKSAFIQAVKTYLDGLQADntsssk  216
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllLHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllll


No 30: 2Q24A MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         || ||   ||  |     || ||  |||    |   ||  |||  |  |   
Sbjct ....NRDKILAAAVRVFSEEGLD.AHLERIAREAGVGSGTLYRNFPTREALIEAAYRNEV   55
DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHHHHHHhhhllLLLL....HHHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSrDYPQASRLFCMemlagAPLL....MDEL  116
ident                                 ||  |                       
Sbjct ARLCDSVPGL...laelPPAEALRAWTRRFI.DYATAKLGXAD...alRAVVasggDPYG  108
DSSP  HHHHHLHHHH...hhhlLHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHHLHH...hhHHHHhlllLLLL


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLL...lllHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhllL
Query tgdlkalideksaliagwvksGKLA...pidPQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtgaT  173
ident                                     |   |                   
Sbjct ....dsrqliqsaltalxdaaAAAGeirsdiRSTDXFAALAGIALTSSRPD........Q  156
DSSP  ....lhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLllllllLHHHHHHHHHHHHHHHLLHH........H


DSSP  LLLhhhHHHHHHHHHHHhhllllll
Query LRDevfFNQTVENVQRIiiegirpr  198
ident                          
Sbjct RAQ..aERLLDLVLDGL......rp  173
DSSP  HHH..hHHHHHHHHHHL......ll


No 31: 2FQ4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHhh
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQil   60
ident       ||||||        ||       ||| | |||       | | |          
Sbjct RNIETQKAILSASYELLLESGFKAVTVDKIAERAKVSKATIYKWWPNKAAVVXDGFLS.a   59
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH.h


DSSP  HHHLHHhhHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHH
Query DIWLAPlkAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPqaSRLFCMEMLAG...APLLMDELT  117
ident      |          |  |                           |     |      
Sbjct AAARLP..VPDT.GSALNDILIHATSLANFLISRE..GTIINELVGEGqfdSKLAEEYRV  114
DSSP  LLLLLL..LLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHHlllHHHHHHHHH


DSSP  lhHHHHHH.hHHHH....hhhhHHLLlllllLHHHH.HHHHHHHhhhhhhlhhhhhhhhl
Query gdLKALID.eKSAL....iagwVKSGklapiDPQHL.IFMIWAStqhyadfapqveavtg  171
ident           |  |         |           |    |                   
Sbjct ryFQPRRLqaKQLLekgikrgeLKEN.ldieLSIDLiYGPIFYR................  157
DSSP  hlHHHHHHhhHHHHhhhhhlllLLLL.llhhHHHHHhHHHHHHH................


DSSP  lllllhhhhhhHHHHHHhHHHLLLLLL....
Query atlrdevffnqTVENVQrIIIEGIRPR....  198
ident                |               
Sbjct ...llvtgeklDDSYVH.DLVINAFEGirlr  184
DSSP  ...hhllllllLHHHHH.HHHHHHHHLllll


No 32: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAv   55
ident             ||  |      | |   |  ||||| | ||    | |||  |      
Sbjct glrerKKTRTREAIRAATYGLIRQQGYEATTVEQIAERAEVSPSTVLRYFPTREDIVLT.   59
DSSP  lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHLL.


DSSP  hhHHHH.HHLHHHHHllllllHHHHHHHHHHHHHH...HHHH.LHHHHHHHHHHHHLlLL
Query lrQILD.IWLAPLKAfredfaPLAAIKEYIRLKLE...VSRD.YPQASRLFCMEMLAgAP  110
ident      |    | | |                                 ||         |
Sbjct ..DEYDpVXAAELAA...rpaGEPWSDSLRHVLRKalgLGAGeEAELIRLRTRLLAE.VP  113
DSSP  ..LLLHhHHHHHHHL...lllLLLHHHHHHHHHHHhhlLLLLlHHHHHHHHHHHHHH.LH


DSSP  LL.HHHHHLHH..................hhhhHHHH........hhhhhhhhlllllll
Query LL.MDELTGDL..................kaliDEKS........aliagwvksgklapi  143
ident       |                                                     
Sbjct AVrARXLENXSdtgrxlaraiadrtgldpdgleVRIVsxslvgglxevsrywaehdhees  173
DSSP  HHhHHHHHHLLllllhhhhhhhhhhllllllhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  lhhhhHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query dpqhlIFMIwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                        
Sbjct laelvDRAL.....................................dalenglpa  191
DSSP  hhhhhHHHH.....................................hhhhhllll


No 33: 2HKUA MOLECULE: A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH.H
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ.I   59
ident        |   ||   |   |       ||   ||       ||  ||| |   |     
Sbjct ...QTRDALFTAATELFLEHGEG.VPITQICAAAGAHPNQVTYYYGSKERLFVEVACAaV   56
DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHhH


DSSP  HHHHLHhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHHHhhllLLLL......H
Query LDIWLAplkafredfaplaaikeyirlklevsrdYPQASRLFCMEmlagAPLL......M  113
ident |                                       ||                  
Sbjct LRAGKR...aeddaataetvgdyteklvgsllgpGAPSVELFTSA....XLXTgrrselR  109
DSSP  HHHHHH...hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHH....HHHLlllhhhH


DSSP  HHHHLHHHHHHH.hhhhhhhhHHHLlLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHH
Query DELTGDLKALID.eksaliagWVKSgKLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEAVT  170
ident |  |  |  |                               |              |   
Sbjct DLITDTLRTLHSsgevalirtLXRT.GWQLRaGIDVESKAFWSAIFGLVIQKtATGESFG  168
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhhlhhhhHHHL.LLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLLLL


DSSP  llLLLLhhhhhhhhhHHHHHHHLL...llll
Query gaTLRDevffnqtveNVQRIIIEG...irpr  198
ident    |            |              
Sbjct .ySLEE.......avAVIFANLQIpetvrnt  191
DSSP  .lLHHH.......hhHHHHHHHLLlhhhhhl


No 34: 2G7SA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident     |   ||  |       |        |    |         ||||  |      |  
Sbjct NPQSKADDILQCARTLIIRGGYNSFSYADISQVVGIRNASIHHHFPSKSDLVCKLVSQYR   60
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHL.HHHHHLLllLLHHHHHhhhhHHHHHHHHHL...hHHHHHHHHHHHLL...lLLLH
Query DIWL.APLKAFRedFAPLAAIkeyiRLKLEVSRDY...pQASRLFCMEMLAG...aPLLM  113
ident                 ||                                          
Sbjct QEAEaGIAELEKniSDPLEQL...rAYIGYWEGCIadatHPFCVCALLASEIpvlpETVV  117
DSSP  HHHHhHHHHHHHhlLLHHHHH...hHHHHHHHHHHhhllLLLLHHHHHHLLHhhllHHHH


DSSP  HHHHLHHHHHHhhhhhhhHHHHHLLL.LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query DELTGDLKALIdeksaliAGWVKSGK.LAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg  171
ident  |       |              |                |        |         
Sbjct LEVRAHFRSLSdwltavlERGIAQGRlVLTGTARANAEIFXATVHGAXLSArAHGD....  173
DSSP  HHHHHHHHHHHhhhhhhhHHHHHLLLlLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL....


DSSP  lllllhhhhhhhhhHHHHhHHLLLLLl
Query atlrdevffnqtveNVQRiIIEGIRPr  198
ident                      | |   
Sbjct ........aatfgaITRP.XLERITA.  190
DSSP  ........llhhhhHHHH.HHHHHLL.


No 35: 2FD5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR   57
ident            || ||       |            ||         | || ||      
Sbjct msdKKTQTRARILGAATQALLERGAVEPSVGEVMGAAGLTVGGFYAHFQSKDALMLEAFE   60
DSSP  lllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLHHHHHLLllLLHHhHHHHHHHHHHHHH.HHLH....hhHHHHHHHHHL.LLLL
Query QILDIWLAPLKAFRedFAPLaAIKEYIRLKLEVS.RDYP....qaSRLFCMEMLA.GAPL  111
ident | |      |                         |                        
Sbjct QLLGKRRELLGELD..PGLS.GKERRALAAAFYLsRKHRdaqvdaGCPLPATLAEvARLP  117
DSSP  HHHHHHHHHHHLLL..LLLL.HHHHHHHHHHHHLlHHHHllllllLLLHHHHHHHhHHLL


DSSP  ..LHHHHHlHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHh
Query ..LMDELTgDLKALIDEksaliagwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEa  168
ident       |                                              |      
Sbjct egFREVLS.RHVEIMVT...........slaesPEETDVALADLVLMIGGLALArALGP.  164
DSSP  hhHHHHHH.HHHHHHHH...........hhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL.


DSSP  hHLLLLllhhhhHHHHHHHHhhhhllllll
Query vTGATLrdevffNQTVENVQriiiegirpr  198
ident                   |           
Sbjct .GELSD...rvlRAAKQAVN..........  180
DSSP  .LHHHH...hhhHHHHHLLL..........


No 36: 1V7BA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident     ||  ||  | |               ||  | ||  | | |||  ||         
Sbjct MRTSKKEMILRTAIDYIGEYSLETLSYDSLAEATGLSKSGLIYHFPSRHALLLGMHELLA   60
DSSP  LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHL.HHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHhhhHLHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHhhLH
Query DIWL.APLKAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEvsrDYPQASRLFCMEMlAGAPLLMDEltGD  119
ident | |        |    ||           |          |         |         
Sbjct DDWDkELRDITRDpEDPLERLRAVVVTLAE...NVSRPELLLLIDA.PSHPDFLNA.wRT  115
DSSP  HHHHhHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLHHHHHHHHHH.HHLHHHHHH.hHH


DSSP  HHHhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLHhhhHHHHhHHHHHHHHLH.HHHHhhhllLLLLHh
Query LKAlideksaliagwvksgklaPIDPqhlIFMIwASTQHYADFA.PQVEavtgaTLRDEv  178
ident                                                        |    
Sbjct VNH........qwipdtddlenDAHKravYLVQ.LAADGLFVHDyIHDD.....VLSKS.  160
DSSP  HHH........hhllllllhhhLHHHhhhHHHH.HHHHHHHHHHhLLLL.....LLLHH.


DSSP  HHHHHHHHHHHhHHLLllll
Query FFNQTVENVQRiIIEGirpr  198
ident       |      |      
Sbjct KRQAMLETILE.LIPS....  175
DSSP  HHHHHHHHHHH.LLLL....


No 37: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFS.QFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVL   56
ident            |                   | ||| |||    |   ||    |  |  
Sbjct xraDALKRREHIITTTCNLYRtHHHD.SLTXENIAEQAGVGVATLYRNFPDRFTLDXACA   59
DSSP  llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHH.HLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLHHHH.HLLL.LLLHHHhhhHHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHHHHHLLL.LLLH
Query RQILDIWLAPLK.AFRE.DFAPLAaikEYIRLKLEVSRDYPqaSRLFCMEMLAGA.PLLM  113
ident              |       |                       |           |  
Sbjct QYLFNVVISLQLqAISTfPTDPEG...VWTSFNQLLFDRGL..GSLVPALAPESLdDLPD  114
DSSP  HHHHHHHHHHHHhHHHHhHHLHHH...HHHHHHHHHHHLLH..HHHHHHHLLLLHhHLLH


DSSP  HHHhLHHHHHHHHHhhhhhhhhhllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHLHH.hhHHHHL.
Query DELtGDLKALIDEKsaliagwvksgklapidpqHLIFMIWASTQHYADFAP.qvEAVTG.  171
ident                                                             
Sbjct EVS.ALRRTTEKNT...ttlinlakqhglvhhdIAPGTYIVGLITISRPPItalATISEn  170
DSSP  HHH.HHHHHHHHHH...hhhhhhhhhlllllllLLHHHHHHHHHHHLLLLLhhhLLLLLh


DSSP  LLLLlhhhhhhhhHHHHHHHHLLllll
Query ATLRdevffnqtvENVQRIIIEGirpr  198
ident                       |    
Sbjct SHKA.......llGLYLSGLKHG..xx  188
DSSP  HHHH.......hhHHHHHHHHHL..ll


No 38: 2OERA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTfsqfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident   |     || ||                 || ||||   |  ||| | |          
Sbjct ..SELVASILEAAVQV......QRFTTARVAERAGVSIGSLYQYFPNKAAILFRLQSDEW   52
DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHL......LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHHHHHLL..llLLHHHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHHHHH.llllllhHHHH
Query DIWLAPLKAFR..edFAPLAAIkeyirlklevsrdypqaSRLFCMEML.agapllmDELT  117
ident       |          ||                                      |  
Sbjct RRTTRLLGEILedttRPPLERL.......rrlvlafvrsECEEAAIRValsdaaplYEAR  105
DSSP  HHHHHHHHHHHhlllLLHHHHH.......hhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhlllLLHH


DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...lllLLHHHHHHHHHHHHHHHH..HLHHHHhhhhll
Query gDLKALIDEKSALIAGWvKSGK...lapIDPQHLIFMIWASTQHYA..DFAPQVeavtga  172
ident    ||                            |     |                    
Sbjct .EVKAEGARVFQAFLREaLPEVaeaersLAGDLLTTTLGAVGKQFSeqPRSEAE......  158
DSSP  .HHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHH......


DSSP  llllhhhhhhhHHHHHHHHHLLLL..ll
Query tlrdevffnqtVENVQRIIIEGIR..pr  198
ident             |               
Sbjct .......ieryAEALADXLCAYLAalge  179
DSSP  .......hhhhHHHHHHHHHHHHHhhhl


No 39: 2GFNA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED

DSSP  ..lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ   58
ident          |   | |      |         ||  | |   |  || |   |  | || 
Sbjct ivdhDERRRALADAVLALIAREGISAVTTRAVAEESGWSTGVLNHYFGSRHELLLAALRR   60
DSSP  llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHL.HHHHHLLllLLHHHhHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHLLllLLHH
Query ILDIWL.APLKAFRedFAPLAaIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLAGapLLMD  114
ident   ||                  |                     | |      |      
Sbjct AGDIQGdRYRTILD.eEGAGP.IEKLRNITASILPLderRLAXTRVFLFFYAEG..TARG  116
DSSP  HHHHHHhHHHHHHL.lLLLLH.HHHHHHHHHLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHL..LLLH


DSSP  HHHL.hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLH...hHHHHhh
Query ELTG.dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlIFMIWASTQHYADFA...pQVEAvt  170
ident |                                       | |   |  |     |    
Sbjct EIAAflarwrgvvresvvaaqregtvstdldadavTVALVALTDGLALQAildpVVXK..  174
DSSP  HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHlllhHHHH..


DSSP  llLLLLHhHHHHHHHHHHHHhhllllll
Query gaTLRDEvFFNQTVENVQRIiiegirpr  198
ident       |                     
Sbjct ..AISAE.DAAARCVDAAVR.......r  192
DSSP  ..HHLLL.LHHHHHHHHHHL.......l


No 40: 2DG7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAvlr   57
ident               |||   |  |        ||| ||        ||| |         
Sbjct xarWDPGAEQRLKRAALELYSEHGYDNVTVTDIAERAGLTRRSYFRYFPDKREVLFG...   57
DSSP  lllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLLHHHLL...


DSSP  HHHH.......................hhLHHHhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhHHL
Query QILD.......................iwLAPLkafredfaplaaikeyirlklevsRDY   94
ident                                                             
Sbjct GSELlppavaravlaadpgaapltavldaXSQV...................gaqlvAQV   98
DSSP  LLLLlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhHHHH...................lllllLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHhLHHHHHH..............HHHHhhhhhhhhll
Query PQASRLFCMEMLAG..APLLMDELtGDLKALI..............DEKSaliagwvksg  138
ident   |                                                         
Sbjct EGAAQRRAVIDASPelQERERTKS.AAISRAVqdalvrrqvdadtaELVA..........  147
DSSP  LLHHHHHHHHHLLHhhHHHHHHHH.HHHHHHHhhhhhhllllhhhhHHHH..........


DSSP  llllllhHHHHHHHHHHHHHHHhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLLL
Query klapidpQHLIFMIWASTQHYAdfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGIRPR  198
ident                                                             
Sbjct ....qlaTVAFGSAFRRWIDAE................ghadfgscldtvtDRLRAVLTG  187
DSSP  ....hhhHHHHHHHHHHHHHLL................llllhhhhhhhhhHHHHHHHHL


No 41: 2IU5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;

DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ   58
ident         | |  |  |       |      |   |         ||   | |       
Sbjct meKSIITQKIIAKAFKDLMQSNAYHQISVSDIMQTAKIRRQTFYNYFQNQEELLSWIFEN   60
DSSP  llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLHhhHHLLllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLllllLHHHHH.
Query ILDIWLAplKAFRedfaplaaikeYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAgaplLMDELT.  117
ident                              |   |                          
Sbjct DFAELIN.dNSDY.........ygWQNELLLLLRYLDENQIFYQKIFVI....DKNFEHf  106
DSSP  HHHHHHL.lLLLL.........llHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH....LLLHHHh


DSSP  ..lhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..lLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhll
Query ..gdlkalideksaliagwvKSGK..lAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtga  172
ident                                        | | |                
Sbjct fliqwenlldkvifdqekksDYHWsdlEKSFiCRYNAAAICAITRESIIRGN........  158
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLlhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........


DSSP  llllhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLL.
Query tlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR.  198
ident                       |    
Sbjct ......sleKLYSQIVNLLLAQIKIFe  179
DSSP  ......llhHHHHHHHHHHHHHHHLLl


No 42: 2NX4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;

DSSP  .....LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLllLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query .....AVSA.KKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAgvSKTNLLYYFPSKEALYIA   54
ident               |  ||       |        ||  |      |  ||  |      
Sbjct gvpklVDHDeRRRSITAAAWRLIAARGIEAANMRDIATEAgyTNGALSHYFAGKDEILRT   60
DSSP  lllhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHllLHHHHHHHLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLHHhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHHHHhllLLLL..
Query VLRQILDIWLAPlkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFCMEMlagAPLL..  112
ident     |                                        |         |    
Sbjct SYEHISEATDRR....iaealgdatgldalrilcrevmpineeQLLEARIAaslWPRAmy  116
DSSP  HHHHHHHHHHHH....hhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllhhHHHHHHHHhhhHHHHll


DSSP  ....HHHHHlHHHHHHHHHHHHHH..hhhHLLL...llllLHHHHHHHHHHHhhhhhHLH
Query ....MDELTgDLKALIDEKSALIA..gwvKSGK...lapiDPQHLIFMIWAStqhyaDFA  163
ident                  |  |                       |  |            
Sbjct deqmAATNR.RTMDNWREQMAIFLeqareEGSVgdidvtiVVEQLLNMMMGM.qilgVLT  174
DSSP  llhhHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhhhhhHLLLllllhhhHHHHHHHHHHHH.hhhhHHL


DSSP  HHHhhhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHLLLLLl
Query PQVeavtgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRPr  198
ident |                    |             
Sbjct PGE...............tssERQLEMLEQFVAAl  194
DSSP  LLL...............llhHHHHHHHHHHHHLl


No 43: 2DTZA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;

DSSP  LHHHHH.HHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHhhhhllllHHHH.......hhHLLLHHHHH
Query AVSAKK.KAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQiaelagvsKTNL.......lyYFPSKEALY   52
ident     |                    |                          |  || | 
Sbjct NLKDKIlGVAKELFIKNG....ynaTTTGE.......iVKLSesskgnlyyHFKTKENLF   49
DSSP  LHHHHHhHHHHHHHHHHH....hhhLLHHH.......hHHHLlllhhhhhhHHLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHL.HHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHhhhhHHLLL..
Query IAVLRQILDIWL.APLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLfcmeMLAGA..  109
ident    |      |     |              |  | |     |                 
Sbjct LEILNIEESKWQeQWKKEQIkaKTNREKFYLYNELSLTTEYYY.PLQNAiiefYTEYYkt  108
DSSP  HHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLHHHhhhhHHHHLll


DSSP  .LLLHHHHhLHHHhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhh
Query .PLLMDELtGDLKalidekSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQvea  168
ident                              |     |                 |      
Sbjct nSINEKMN.KLENkyidayHVIFKEGNLNGEWSINDVNAVSKIAANAVNGIVTFTHE...  164
DSSP  hHHHHHHH.HHHHhhhhhhHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...


DSSP  hhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLll
Query vtgatlRDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRpr  198
ident                      |   |    
Sbjct ......QNINERIKLMNKFSQIFLNGLS..  186
DSSP  ......LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..


No 44: 2G7LA MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ...lhhhhhhHHHH.....hhHHHHhhhllllllHHHHHHhlLLLHHhhhhhlLLHHHHH
Query ...avsakkkAILS.....aaLDTFsqfgfhgtrLEQIAElaGVSKTnllyyfPSKEALY   52
ident                      |                |                     
Sbjct kpalsrrwivDTAValxraegLEKV........tXRRLAQ..ELDTG...pasLYVYVAN   47
DSSP  lllllhhhhhHHHHhhhhhhlLLLL........lHHHHHH..HLLLL...hhhHLLLLLL


DSSP  ..HHHHHHHHHHHLHHHHHLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhllll
Query ..IAVLRQILDIWLAPLKAFredFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagap  110
ident                                        |    ||  |           
Sbjct taELHAAVLDALLGEVDLTG..aEDWREQLRAVLTSYTLVLFAHPQLARSALVA......   99
DSSP  hhHHHHHHHHHHLLLLLLLL..lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL......


DSSP  llhhhhhLHHHhHHHH.hHHHHHHHHhllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhH
Query llmdeltGDLKaLIDE.kSALIAGWVksgklAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAPqveA  168
ident                |    | |        ||                  |        
Sbjct ...rpsgENYL.RLVErvLELLARSG.....APGAqVAWGVDKLLQDATATAAEQA..tS  148
DSSP  ...llllHHHH.HHHHhhHHHHHLLL.....LLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..lL


DSSP  HHL.................lllllhHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL......l
Query VTG.................atlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIRP......r  198
ident  |                                        ||         
Sbjct ATVralrdadeathpaiashxpllvaGSAHDRLRWSFDVLVNGITRtpvpgpa  201
DSSP  HHHhhhhhllllllhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllll


No 45: 2I10A MOLECULE: PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHhHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAiLSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident        | |  |   |   |  ||         |     |   | ||  |    |    
Sbjct ...DDQVA.LQTAXELFWRQGYEGTSITDLTKALGINPPSLYAAFGSKRDLFEKTLDRYX   56
DSSP  ...LLHHH.HHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL


DSSP  HHHLHHHHHLLlLLLH.hhhhhhHHHH.....hhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhh
Query DIWLAPLKAFReDFAP.laaikeYIRL.....klevsrdypqasrlfcMEMLagapllmd  114
ident       |                                                     
Sbjct CERTLQLEEAXvRPTAheavldfLTGRvevftgcxtvqaglasgephhEIVD........  108
DSSP  LLLHHHHHHHHlLLLHhhhhhhhHHHHhhhhllllllllllllllllhHHHH........


DSSP  hhhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...llLLLL..HHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhhhhh
Query eltGDLKALIDEKSALIAGWVKSG...klAPID..PQHLIFMIWAStqhyadfapqveav  169
ident                        |                                    
Sbjct lltAAREQXRQTVLDRFEKALADGdlpagTDCTalARYVXAAVYGL..............  154
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllLLHHhhHHHHHHHHHHH..............


DSSP  hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                              
Sbjct ....sveaasgapreeltaaailaaqvvp  179
DSSP  ....hhhhhllllhhhhhhhhhhhhllll


No 46: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;

DSSP  ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhhhh
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealy   52
ident                 |  |        |        ||   | |               
Sbjct dgtvkvsrSLKEMGNKIRKAKDELSKTRGR.APTVTEIADHLGISPEDVVLAQE......   53
DSSP  llllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH......


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllll
Query iavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapll  112
ident                                                             
Sbjct ............................................................   53
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query mdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtga  172
ident                                                             
Sbjct ............................................................   53
DSSP  ............................................................


DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query tlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                           
Sbjct ......................avrl   57
DSSP  ......................hhhl


No 47: 2HXOA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL   60
ident         |  ||       |  |      ||               |  |  |      
Sbjct ...LSRERIVGAAVELLDTVGERGLTFRALAERLATGPGAIYWHITGKAELLGAATDAVV   57
DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLHhhhhllllllhhHHHHHHHHhhhhhhhhLHHHhHHHHHHHhllLLLL.....HHH
Query DIWLAplkafredfaplAAIKEYIRlklevsrdYPQAsRLFCMEMlagAPLL.....MDE  115
ident                                                 |  |        
Sbjct TAAVT....agptgaadSPQDAVRAvalglwdaTEAH.PWLATQL...ATQLsrtpwGTV  109
DSSP  HHHHL....llllllllLHHHHHHHhhhhhhhhHHHL.LHHHHHH...HHHHhhlllLLH


DSSP  HhLHHHHHHHH.................................................
Query LtGDLKALIDE.................................................  126
ident                                                             
Sbjct A.PRIFESLGRqvqaxgvpeahwftassalxhyilgaagqnaandefldtvstawegldp  168
DSSP  H.HHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ..........................hhhHHHHHHHLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..........................ksaLIAGWVKSGklapidpqhlifmiwastqhya  160
ident                              |                              
Sbjct daypftravadqvrghddreqflagitlvLTGITALHR......................  206
DSSP  lllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhHHHHHLLLL......................


DSSP  hlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query dfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                       
Sbjct .....................................p  207
DSSP  .....................................l


No 48: 1XJEA MOLECULE: RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;

DSSP  .........................................LHHHHHHHHHHHHHhHHHH
Query .........................................AVSAKKKAILSAALdTFSQ   19
ident                                             |   |   |       
Sbjct mklsdlisrwidvepsknaqiilrdryfmkdldgnyletkwEDVARRVARVVATA.ELLN   59
DSSP  llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHH.HHHL


DSSP  H.llLLLLHHHHHHHLLL............................lhhHHHHhlLLHHH
Query F.gfHGTRLEQIAELAGV............................sktNLLYyfPSKEA   50
ident         |  | |                                            | 
Sbjct PsykKNEKLDRIKEWEDIffrvlkarlfipnsptlfnaglgvkhdllwkPIDQ..MTLED  117
DSSP  LlllHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllleeelhhhhhhllllllhhhhllLHHH..LLHHH


DSSP  HHHHHHHHhhHHHL......hhhhhlLLLL.LHHHHHHHHH...................
Query LYIAVLRQilDIWL......aplkafREDF.APLAAIKEYI...................   84
ident                                         |                   
Sbjct YEEIYRSR..NHLHmlsacfvvpvgdSIEEiFEAVKEYALItkvgggvgsnfselrpkgs  175
DSSP  HHHHHHHL..LLLLlllleeelllllLHHHhHHHHHHHHHHhhllleeeeelllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   84
ident                                                             
Sbjct fvagthgkasgpvsfmhvfnsaisvvkqgsrrrgalmgilninhpdieefidakkvlnff  235
DSSP  eelllleelllhhhhhhhhhhhhllleellleelleeeeeelllllhhhhhlllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   84
ident                                                             
Sbjct nlsvgfpmdkkeilklyeedgelelshprstirkkvkirelfrkiatnawksgdpglafl  295
DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeehhhhhhhhhhhhhhhllleeelh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   84
ident                                                             
Sbjct gemnkyyplyphrkinstnpcgeiglsdyeacnlgsidvakfynngfvdlealqelvqia  355
DSSP  hhhhhllllllllleeeelllllleeellleeeeeeeehhhheelleelhhhhhhhhhhh


DSSP  ...........hHHHHhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...........rLKLEvsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliag  133
ident                                                             
Sbjct vrfldnvidvnvFPID............................................  371
DSSP  hhhhhhhhhhllLLLH............................................


DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLH..............................
Query wvksgklapidpqhlifmiwaSTQHYADFA..............................  163
ident                                                             
Sbjct .....................KITKAVKESrrlglgimgfadllykleipynsqeardfa  410
DSSP  .....................HHHHHHHHHlleeeeeelhhhhhhhhllllllhhhhhhh


DSSP  ........................HHHHHHH.............................
Query ........................PQVEAVT.............................  170
ident                                                             
Sbjct anlmafialhahrtsyelgkekgnFPLLEISryrtednfvpfamgmsnyddeirevmkmt  470
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLHHHLhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  170
ident                                                             
Sbjct kefrrnvalltiaptgsisniadtssglepnfllaytrfvtkedgtkepllyvnqvlrek  530
DSSP  lllllllllllllllllhhhhllllllllllllleelleeellllleeelleelhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  170
ident                                                             
Sbjct lnpeilkriekeliekgslkdipdvpekikkvfvvaldidpmdhllmqdafqryvdnnis  590
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhllllllll


DSSP  .........llllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query .........gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                      
Sbjct ktinmpqsatvddvlnvylealrtnvrgitvyrdgsl  627
DSSP  lleeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeleeellll


No 49: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  ........lhHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL......
Query ........avSAKKKAILSAALDTFsQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP......   46
ident                 |  |              |  |   |                  
Sbjct mniaelygkmGKHSWRIMDAIFKNL.WDYE.YVPLQLISSHARIGEEKARNILKylsdlr   58
DSSP  llhhhhhhllLHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.LEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhll


DSSP  ..........lhhhhhHHHHHHHH.........................hhhlhhHHHL.
Query ..........skealyIAVLRQIL.........................diwlapLKAF.   70
ident                 |      |                                    
Sbjct vvqnrqkdyegstftfIGLSLYSLhrlvrsgkvdaigklmgegkesavfncysekFGECv  118
DSSP  leeeellllleeeelhHHHHHHHHhhhhhllllleeeeeeeellleeeeeeeellLEEEe


DSSP  .........................lllllhhhhHHHHhhhhhhhhhhLHHHhhhhhhhh
Query .........................redfaplaaIKEYirlklevsrdYPQAsrlfcmem  105
ident                                                             
Sbjct vkfhkvkvkehfsvlairsarnefralqklqglaVPKV........yaWEGN........  162
DSSP  eeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLE........eeEELL........


DSSP  hllllllhhhhhlhhhhhhhhhhHHHH.................................
Query lagapllmdeltgdlkalideksALIA.................................  132
ident                                                             
Sbjct .................avlmelIDAKelyrvrvenpdevldmileevakfyhrgivhgd  205
DSSP  .................eeeeelLLLEehhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelll


DSSP  .....hhHHLLLLllllhhhhhhhHHHHhhhhhhlhhhhhHHHLL...........llll
Query .....gwVKSGKLapidpqhlifmIWAStqhyadfapqveAVTGA...........tlrd  176
ident        |                                 |                  
Sbjct lsqynvlVSEEGI........wiiDFPQ..........svEVGEEgwreilerdvrniit  247
DSSP  llllleeELLLLE........eelLLLL..........leELLLLlhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                       
Sbjct yfsrtyrtekdinsaidrilqe  269
DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhl


No 50: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL......LHHH....
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP......SKEA....   50
ident          |                |  ||  |      |                   
Sbjct gIDPAIVEVLLVLREAGIEngaTPWSLPKIAKRAQLPXSVLRRVLTqlqaagLADVsvea   60
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHLLLlllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllLEEEeell


DSSP  ...........hhhhHHHHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query ...........lyiaVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr   99
ident                                                             
Sbjct dgrghasltqegaalAAQLFP.......................................   81
DSSP  llleeeeelhhhhhhHHHHLL.......................................


DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy  159
ident                                                             
Sbjct ............................................................   81
DSSP  ............................................................


DSSP  hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                        
Sbjct .......................................   81
DSSP  .......................................


No 51: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;

DSSP  ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSQfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP   46
ident                            |               |  ||  |         
Sbjct xatgglaiiqsxxhXLPPSERKLADYILAHPHX..aiESTVNEISALANSSDAAVIRLCX   58
DSSP  llllhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHHHHHLHHH..hhLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH


DSSP  .....LHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHH
Query .....SKEALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLF  101
ident          |                                                  
Sbjct slglkGFQDLXX............................................rvAG   74
DSSP  hllllLHHHHHH............................................hhHH


DSSP  HHHHHLLLlllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query CMEMLAGApllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad  161
ident                                                             
Sbjct DLAKPTFQ....................................................   82
DSSP  HHHLHHHL....................................................


DSSP  lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                      
Sbjct ....................................g   83
DSSP  ....................................l


No 52: 2NP3A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;

DSSP  lhhhhhhhHHHHHHHHHhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhhhlllhHHHHHHHHH.HH
Query avsakkkaILSAALDTFsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskEALYIAVLR.QI   59
ident         || ||   |                                      |    
Sbjct ........ILTAARVCF...............................YGTENLFLQaLE   21
DSSP  ........LHHHHHHHL...............................LLLLHHHHHhHL


DSSP  HHHHL.HHHHH.LLLL..lLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHHHHhhhhHHLLllllh
Query LDIWL.APLKA.FRED..fAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQASRLfcmeMLAGapllm  113
ident |         |                       ||         |              
Sbjct LPGKIeEAITAaAQGGldgIGERVVRAHLSVWDDVSSRpaLXTXVRS...aARLR.....   73
DSSP  HHHHHhHHHHHhLLLLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLhhHHHHHHL...lHHHH.....


DSSP  hhhhlhhhHHHHHHHHHhhHHHH.lllllllLHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhhhhhhll
Query deltgdlkALIDEKSALiaGWVK.sgklapiDPQHLIFMIWASTQHYadfapqveavtga  172
ident                                                             
Sbjct ....etatGILARALGG..VITGedaxlrtsXVATQLVGLAXXRYVA.............  114
DSSP  ....hhhhHHHHHHHLL..LLLLllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLL.............


DSSP  llllhhhhhhHHHHhHHHHH.LLLL......ll
Query tlrdevffnqTVENvQRIII.EGIR......pr  198
ident                         |        
Sbjct .....hleplASAD.TDTVArHYGRavqaivtd  141
DSSP  .....llllhHHLL.HHHHHhHHHHhhhhhhll


No 53: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHhhhh
Query avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLrqil   60
ident       |                       |  |  |         |       |     
Sbjct ..GSPEKILAQIIQE.HREG....LDWQEAATRASLSLEETRKLLQS.xaaaGQVT....   48
DSSP  ..LLHHHHHHHHHHL.LLLL....EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhlLLEE....


DSSP  hhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHHLL............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCMEMLAG............  108
ident                                                             
Sbjct ............................llrvendlyaisTERYQAWWqavtraleefhs   80
DSSP  ............................eeeelleeeeeeHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................lllLHHHHHLHHH.......hhHHHHHH.......
Query .........................aplLMDELTGDLK.......alIDEKSA.......  129
ident                             |  |                            
Sbjct ryplrpglareelrsryfsrlparvyqaLLEEWSREGRlqlaantvaLAGFTPsfsetqk  140
DSSP  hlllllleehhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHLLLeeeelleeeELLLLLlllhhhh


DSSP  .............................hhhhhhHLLL.LLLLlhhhhhhhhhhhhhhh
Query .............................liagwvKSGK.LAPIdpqhlifmiwastqhy  159
ident                                         |                   
Sbjct kllkdledkyrvsrwqppsfkevagsfnldpseleELLHyLVRE................  184
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhHHHHhHHHL................


DSSP  hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLL.....................
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegIRPR.....................  198
ident                                                             
Sbjct ...................................GVLVkindefywhrqalgearevik  209
DSSP  ...................................LLEEellllleeehhhhhhhhhhhh


DSSP  .................................................
Query .................................................  198
ident                                                  
Sbjct nlastgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvkftrrvgdkrvvvgn  258
DSSP  hhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll


No 54: 2AO9A MOLECULE: PHAGE PROTEIN;

DSSP  ..........lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhh
Query ..........aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskea   50
ident              ||                         |   |   | |         
Sbjct mmakldelkqkLTAKQIQAAYLLVENELM.eeEKRTQDEMANELGINRTTLWEWRTknqd   59
DSSP  lhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhlhh


DSSP  hhHHHHHHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHhhhhhhhllll
Query lyIAVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRlfcmemlagap  110
ident                                                             
Sbjct fiAFKSEVAD..................................sFLAE...........   74
DSSP  hhHHHHHHHH..................................hHHHL...........


DSSP  llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHLH.HHHHHH
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyADFA.PQVEAV  169
ident                                                             
Sbjct ................................................kREQVySKLMQL   86
DSSP  ................................................lHHHHhHHHHHH


DSSP  HL...llllLHHHHHHHHHhhhhhhhllllll
Query TG...atlrDEVFFNQTVEnvqriiiegirpr  198
ident                |                
Sbjct ILgpqpsvkAMQLYMQRFG.lltdkkviegdl  117
DSSP  HHlllllhhHHHHHHHHLL.lleeeeeeeell


No 55: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  .....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLL..LHHHHHHHLL..........LLHHHHHH
Query .....aVSAKKKAILSAALDTFSQFgFHGT..RLEQIAELAG..........VSKTNLLY   43
ident              ||                  |                          
Sbjct naealqLNSTEVRILGCLIEKQATN.PETYplTLNALVIACNqktsrdpvxnLTQGQVGQ   59
DSSP  llllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHLleEHHHHHHHHLllllllllllLLHHHHHH


DSSP  HLL..............lhhhHHHHhhhHHHHHhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query YFP..............skeaLYIAvlrQILDIwlaplkafredfaplaaikeyirlkle   89
ident                                                             
Sbjct SLRalegrgltrlvxgsradrWEHK...VDKGL...........................   89
DSSP  HHHhhhhllleeeelllllleEEEL...HHHHH...........................


DSSP  hhhHLHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query vsrDYPQASRlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli  149
ident       |                                                     
Sbjct .elVPAQVIL.......................................tgllllrgpqt  109
DSSP  .llLHHHHHH.......................................hhhhhhhllee


DSSP  hhhhhhhhhhhHLHHhhhhhhlLLLL...lhhhhhhhhhhhhhhHHLLL...........
Query fmiwastqhyaDFAPqveavtgATLR...devffnqtvenvqriIIEGI...........  195
ident                                                |            
Sbjct vselltrsnrxHDFE.......DSEQvvhqlerliarglatlvpRQSGQredryxhligd  162
DSSP  hhhhhhhllllLLLL.......LHHHhhhhhhhhhhllleeeelLLLLLllleeeellll


DSSP  ...lll
Query ...rpr  198
ident       
Sbjct pedlqd  168
DSSP  hhhhll


No 56: 2IW5B MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rkppkgmflsqedveavsanataattvlrqldmelvsvkrqiqnikqtnsalkekldggi   60
DSSP  llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ...............LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL.LLHHHHHHH
Query ...............AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYY   44
ident                           |                 |    |  |       
Sbjct epyrlpeviqkcnarWTTEEQLLAVQAIRKYG.......RDFQAISDVIGnKSVVQVKNF  113
DSSP  hhhllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHL.......LLHHHHHHHHLlLLHHHHHHH


DSSP  LL..lhhhhHHHHHHhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHH
Query FP..skealYIAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFC  102
ident |           ||                                              
Sbjct FVnyrrrfnIDEVLQ.........................................eWEA  132
DSSP  HHhllllllHHHHHH.........................................hHHL


DSSP  Hhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query Memlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf  162
ident                                                             
Sbjct E...........................................................  133
DSSP  L...........................................................


DSSP  hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                     
Sbjct ....................................  133
DSSP  ....................................


No 57: 1BBYA MOLECULE: RAP30;

DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL.LHHH.........
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.SKEA.........   50
ident    | |   |      |         |             |                   
Sbjct RARADKQHVLDMLFSAFEKHQ..YYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKeIGVQnvkgihknt   58
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhHLLLlllllllll


DSSP  ..hhhhhHHHHhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ..lyiavLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag  108
ident                                                             
Sbjct welkpeyRHYQ.................................................   69
DSSP  lllllllLLLL.................................................


DSSP  llllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea  168
ident                                                             
Sbjct ............................................................   69
DSSP  ............................................................


DSSP  hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                               
Sbjct ..............................   69
DSSP  ..............................


No 58: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lghllrdvwsllneeerelldkeiqpfpckkastvfsegdipnnlfylyegkikilrrfh   60
DSSP  lhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct isrivkpgqffgmrpyfaeetcsstaiavenskvlaipveaieallkgntsfcryflkal  120
DSSP  eeeeelllleelhhhhhhlllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......LLLLL.HHHHHHHLLLLH
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSQFG.......FHGTR.LEQIAELAGVSK   38
ident                            |     ||              |  | |     
Sbjct akelgyaerrtvtlTQKHVRGRLAETLLILKENFGfendgatLSIYLsREELATLSNMTV  180
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllLLLLLlHHHHHHHLLLLH


DSSP  HHHHHHLL.........lhhhhHHHHhHHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query TNLLYYFP.........skealYIAVlRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlkle   89
ident  |                                                          
Sbjct SNAIRTLStfvsermlaldgkrIKII.DCDR.............................  210
DSSP  HHHHHHHHhhhhllleeeelleEEEL.LHHH.............................


DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli  149
ident                                                             
Sbjct ............................................................  210
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                  
Sbjct .........................................lqktarsg  218
DSSP  .........................................hhhhhhhl


No 59: 2CJJA MOLECULE: RADIALIS;

DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLllLHHHHHHHLL.LLHHHHHHHLLlhhhhhhhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFsqFGFHgtRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPskealyiavl   56
ident          ||   |             |    |                          
Sbjct grpWSAKENKAFERALAVYD..KDTP.dRWANVARAVEgRTPEEVKKHYE..........   47
DSSP  lllLLHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL.lHHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHH..........


DSSP  hhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllHHHH
Query rqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllMDEL  116
ident                                                             
Sbjct ..................................................ilvediKYIE   57
DSSP  ..................................................hhhhhhHHHH


DSSP  HLHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query TGDlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd  176
ident  |                                                          
Sbjct SGK.........................................................   60
DSSP  HLL.........................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                       
Sbjct ...................vpf   63
DSSP  ...................lll


No 60: 2HXIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHH...HHLLlllLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFS...QFGFhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR   57
ident         || ||           |        |   |     |   |  |  |  ||  
Sbjct ..RWSTEQILDAAAELLLagdAETF...SVRKLAASLGTDSSSLYRHFRNKTELLRAVAD   55
DSSP  ..LLLHHHHHHHHHHHHLlllLLLL...LHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLHHHhHLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHhllLLLLHH...
Query QILDIWLAPLkAFREdfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCMEMlagAPLLMD...  114
ident  ||                                        |       |        
Sbjct RILLSAXDGYrPEGD.............wkqrltavalrlresFGQQP.qlAAVWGRhgs  101
DSSP  HHHHHHHLLLlLLLL.............hhhhhhhhhhhhhhhLLLLH.hhHHHHHHhll


DSSP  ..hhhLHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllllLLHHHHHH......................
Query ..eltGDLKALIDEKSALiAGWVksgklapIDPQHLIF......................  150
ident                     |                                       
Sbjct ggtgsRLXXEEVLQALRA.SGLP......dDEIPARYHrlvilisslitaeggfrvavlg  154
DSSP  llhhhHHHHHHHHHHHHH.LLLL......hHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllll


DSSP  ...........hhhhhhhhhhhLHHHhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ...........miwastqhyadFAPQveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                            
Sbjct adperfpalshfareirplgadRGAA................feeilaahlahleaaap  197
DSSP  llllllhhhhhhhhhlllllllHHHH................hhhhhhhhhhhhhhhll


No 61: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLLHHHHHHHLLLLHHhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAGVSKTnllyyfPSKEALYIAVLRQIL   60
ident          |                |           |                 |   
Sbjct .MQEQRQQLLRSLEALIFSS.eEPVNLQTLSQITAHKFT.....pSELQEAVDELNRDYE   53
DSSP  .LHHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHLLLLLL.....hHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHhhhhhllllllhhhhhlhh
Query DIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFcmemlagapllmdeltgdl  120
ident                                       |                     
Sbjct ATG................................rtFRIH...................   62
DSSP  HHL................................llEEEE...................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhHHHHhLHHHHHHHHL.........
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastQHYAdFAPQVEAVTG.........  171
ident                                                             
Sbjct ..........................aiaggyrfltEPEF.ADLVRQLLAPviqrrlsrs   95
DSSP  ..........................eelleeeeeeLHHH.HHHHHHHHLLhhhhhhhhh


DSSP  ........................................lllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........................................atlrdevffnqtvenvqrii  191
ident                                                             
Sbjct mlevlavvawhqpvtkgeiqqirgaspdysidrllarglievrgradspgrplqygttev  155
DSSP  hhhhhhhhhhhlleehhhhhhhhllllllhhhhhhhllleeeeeellllllleeeeelhh


DSSP  hllllll
Query iegirpr  198
ident        
Sbjct fldlfhl  162
DSSP  hhhhlll


No 62: 2NVUB MOLECULE: NEDD8-ACTIVATING ENZYME E1 REGULATORY SUBUNIT;

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kieegklviwingdkgynglaevgkkfekdtgikvtvehpdkleekfpqvaatgdgpdii   60
DSSP  lllllleeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllhhhhhhhhhhllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fwahdrfggyaqsgllaeitpdkafqdklypftwdavryngkliaypiavealsliynkd  120
DSSP  eeehhhhhhhhhllllllllllhhhhllllllhhhhleelleeleeeeeeeeleeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct llpnppktweeipaldkelkakgksalmfnlqepyftwpliaadggyafkyengkydikd  180
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhlllleeellllllhhhhhhhhhhllleeeeelllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vgvdnagakagltflvdliknkhmnadtdysiaeaafnkgetamtingpwawsnidtskv  240
DSSP  eelllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nygvtvlptfkgqpskpfvgvlsaginaaspnkelakeflenylltdegleavnkdkval  300
DSSP  lllllllllllllllllleeeeeeeelllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ksyeeeatmenaqkgeimpnipqmsafwyavrtavinaasgrqtvdaalaaaqtnaaadw  360
DSSP  hhhhlllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct egrwnhvkkflersgpfthpdfepsteslqflldtckvlvigagglgcellknlalsgfr  420
DSSP  llllhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhllleeeellllhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qihvidmdtidvsnlnrqflfrpkdigrpkaevaaeflndrvpncnvvphfnkiqdfndt  480
DSSP  eeeeeelllllhhhhhllllllhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fyrqfhiivcgldsiiarrwingmlisllnyedgvldpssivplidggtegfkgnarvil  540
DSSP  hhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhllleelleelhhhllleeeeeeelleeeeeeel


DSSP  ...........................lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........
Query ...........................avSAKKKAILSAALDTFSQFGFH..........   23
ident                                    |                        
Sbjct pgmtaciectlelyppqvnfpmctiasmpRLPEHCIEYVRMLQWPKEQPFgegvpldgdd  600
DSSP  llllllllllhhhllllllllhhhhhhllLLHHHHHHHHHHLHHHHHLLLllllllllll


DSSP  llLHHHHHHHLL..........LLHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhllll
Query gtRLEQIAELAG..........VSKTNLLYYFPSkealyiavlrqildiwlaplkafred   73
ident       |               |                                     
Sbjct peHIQWIFQKSLerasqynirgVTYRLTQGVVKR..........................  634
DSSP  hhHHHHHHHHHHhhhhhlllllLLHHHHHHHHHL..........................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHH
Query faplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltGDLKALIDEKSALIAG  133
ident                                                 | |    |    
Sbjct .......................................iipavASTNAVIAAVCATEVF  655
DSSP  .......................................lllllHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhHHHHHH.......
Query WVKSGKLAPIDpqHLIFmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffNQTVEN.......  186
ident         |     | |                              |            
Sbjct KIATSAYIPLN.nYLVF.............ndvdglytytfeaerkeNCPACSqlpqniq  701
DSSP  HHHHLLLLLLL.lEEEE.............ellllleeeeellllllLLLLLLllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  186
ident                                                             
Sbjct fspsaklqevldyltnsaslqmkspaitatlegknrtlylqsvtsieertrpnlsktlke  761
DSSP  elllllhhhhhhhhhhllllllllleeeeeelleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ................hhhhhhllllll
Query ................vqriiiegirpr  198
ident                             
Sbjct lglvdgqelavadvttpqtvlfklhfts  789
DSSP  llllllleeeeellllllleeeeeeell


No 63: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL..lhhHHHH.....
Query avSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP..skeALYI.....   53
ident         ||    |             |      | |  |                   
Sbjct ..DNLEQKILQVLSDDGG.....pVAIFQLVKKCQVPKKTLNQVLYrlkkeDRVSspspk   53
DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHLL.....lEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhlLLEEeeell


DSSP  ..HHHHhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllll
Query ..AVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapl  111
ident                                                             
Sbjct ywSIGG......................................................   59
DSSP  eeEELL......................................................


DSSP  lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtg  171
ident                                                             
Sbjct ............................................................   59
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query atlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                            
Sbjct ...........................   59
DSSP  ...........................


No 64: 2DOBA MOLECULE: PROACTIVATOR POLYPEPTIDE;

DSSP  ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHH.........lllLHHHHHHHLllhH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAEL.........agvSKTNLLYYFpskE   49
ident         |    || |           |                   |     |     
Sbjct gsLPCDICKDVVTAAGDXLKDNATeeEILVYLEKTcdwlpkpnxsasCKEIVDSYL...P   57
DSSP  llHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLhhHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhHHHHHHHHH...H


DSSP  HHHHHHHHhhHHHHlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query ALYIAVLRqiLDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlaga  109
ident                                                             
Sbjct VILDIIKG..EXSR..............................................   69
DSSP  HHHHHLLL..LLLL..............................................


DSSP  lllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query pllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveav  169
ident                                                             
Sbjct ............................................................   69
DSSP  ............................................................


DSSP  hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                              
Sbjct ................pgevcsalnlces   82
DSSP  ................hhhhhhhllllll


No 65: 2CFXA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;

DSSP  .lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhhhhhHHHHhh
Query .aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyiAVLRqi   59
ident          |                           |                      
Sbjct mkLDQIDLNIIEELKKDS......rLSMRELGRKIKLSPPSVTERVR.qlesfgIIKQ..   51
DSSP  llLLHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhllLEEE..


DSSP  hhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH.............
Query ldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEML.............  106
ident                                             |               
Sbjct .........................................ytLEVDqkklglpvscive   70
DSSP  .........................................eeEEELlhhhllleeeeee


DSSP  ........llllllhhhhhlhHHHH...........hhhhhhhhhhhhhllllllllhhH
Query ........agapllmdeltgdLKAL...........ideksaliagwvksgklapidpqH  147
ident                                                             
Sbjct atvknadyerfksyiqtlpniEFCYriagaacymlkinaesleavedfinktspyaqtvT  130
DSSP  eeehhhlhhhhhhhhhlllleEEEEeeelllleeeeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeE


DSSP  HHHHhhhhhhHHHHlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query LIFMiwastqHYADfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                    
Sbjct HVIF.....sEIDT....................................k  140
DSSP  EEEE.....eELLL....................................l


No 66: 1H88C MOLECULE: CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA;

DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL.LLHHHHHHHLLlhhHHHHhh
Query ....AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPskeALYIav   55
ident                                  ||                         
Sbjct gktrWTREEDEKLKKLVEQNG......tDDWKVIANYLPnRTDVQCQHRWQ.kvLNPE..   51
DSSP  llllLLHHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHH.llLLLL..


DSSP  hhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLLLLHHH
Query lrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlAGAPLLMDE  115
ident                                                             
Sbjct .....................likgpwtkeedqrviklvqkygpkrwsviaKHLKGRIGK   90
DSSP  .....................lllllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhLLLLLLLHH


DSSP  HHLHHHHHH......................................hHHHHHHHHHHHL
Query LTGDLKALI......................................dEKSALIAGWVKS  137
ident                                                    |    |   
Sbjct QCRERWHNHlnpevkktswteeedriiyqahkrlgnrwaeiakllpgrTDNAIKNHWNST  150
DSSP  HHHHHHHHLlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHL


DSSP  LLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query GKlapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirp  197
ident                                                             
Sbjct MR..........................................................  152
DSSP  LL..........................................................


DSSP  l
Query r  198
ident  
Sbjct .  152
DSSP  .


No 67: 1B9MA MOLECULE: PROTEIN (MODE);

DSSP  ................lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLLLLHHHHHHH
Query ................aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYY   44
ident                          |                  | |  || |       
Sbjct hxqaeilltlklqqklfADPRRISLLKHIALSG........SISQGAKDAGISYKSAWDA   52
DSSP  lllleeeeeeeelleeeELHHHHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHLLLHHHHHHH


DSSP  LL.....lhhHHHH......hHHHH................hhhhhlhhhhhlLLLLLHH
Query FP.....skeALYI......aVLRQ................ildiwlaplkafREDFAPL   77
ident            |           |                                    
Sbjct INexnqlsehILVEratggavLTRYgqrliqlydllaqiqqkafdvlsdddalPLNSLLA  112
DSSP  HHhhhhhhllLLEEelllleeELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhHHHH.
Query AAIKEYIRlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliaGWVK.  136
ident |                                                           
Sbjct AISRFSLQ........................................tsarnqwFGTIt  132
DSSP  HHHHHLEE........................................ellleeeEEEEl


DSSP  ......................................LLLL..................
Query ......................................SGKL..................  140
ident                                                             
Sbjct ardhddvqqhvdvlladgktrlkvaitaqsgarlgldeGKEVlillkapwvgitqdeava  192
DSSP  llllllllleeeeeellllleeeeellhhhhhhlllllLLEEeeeelhhhleeellhhhh


DSSP  ........llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........apidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriii  192
ident                                                             
Sbjct qnadnqlpgiishiergaeqcevlxalpdgqtlcatvpvneatslqqgqnvtayfnadsv  252
DSSP  hllleeeeeeeeeeeellleeeeeeellllleeeeeeehhhhllllllleeeeeelhhhl


DSSP  lLLLLL
Query eGIRPR  198
ident       
Sbjct iIATLC  258
DSSP  eEEEEL


No 68: 2NNNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;

DSSP  ............................lHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHH
Query ............................aVSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAE   32
ident                                    | |     |            |   
Sbjct yrlddqigfilrqanqryaalfangigngLTPTQWAALVRLGETGP......CPQNQLGR   54
DSSP  llhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHLL......LLHHHHHH


DSSP  HLLLLHHHHHHHLL..lhhHHHH.............hHHHHhhhhhlhhhhhllllllhh
Query LAGVSKTNLLYYFP..skeALYI.............aVLRQildiwlaplkafredfapl   77
ident |                   |                                       
Sbjct LTAXDAATIKGVVErldkrGLIQrsadpddgrrllvsLSPA...................   95
DSSP  HLLLLHHHHHHHHHhhhhlLLEEeeeelleeeeeeeeELHH...................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvks  137
ident                                                             
Sbjct ............................................................   95
DSSP  ............................................................


DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllLLHHHHhhhhhhhhhhhhlllll
Query gklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlRDEVFFnqtvenvqriiiegirp  197
ident                                                             
Sbjct ...............graeleaglaaareinrqalapLSLQEQ.......etlrgllarl  133
DSSP  ...............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHH.......hhhhhhhhll


DSSP  l
Query r  198
ident  
Sbjct i  134
DSSP  l


No 69: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhhhhHHHHHhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRqil   60
ident         ||                     |                        |   
Sbjct hLDDLDRNILRLLKKDA......RLTISELSEQLKKPESTIHFRIK.klqerGVIER...   50
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHLL......LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEEE...


DSSP  hhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl  120
ident                                              |              
Sbjct .........................................yTIIL...........geq   58
DSSP  .........................................eEEEE...........lll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhLLLLL...lLLHHHHH..hhHHHH....................
Query kalideksaliagwvkSGKLA...pIDPQHLI..fmIWAS....................  155
ident                    |          |                             
Sbjct lkpkhlalivlevgkpEDFLEryisYISSTLSalpgVLFVaksgedkiialvgknnkdel  118
DSSP  lllleeeeeeeeelllLHHHHhhhhHHHHHHHllllEEEEeeellleeeeeeeellllhh


DSSP  ......hhhhhhlhhhhhhhhlLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ......tqhyadfapqveavtgATLRdevffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                                                  
Sbjct vkfieenitsipnlkhiqifpiTEIK...........kgedltgflaev  156
DSSP  hhhhhhhlllllleeeeeeeelLEEE...........elllhhhhhlll


No 70: 2CMPA MOLECULE: TERMINASE SMALL SUBUNIT;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLLL....LHHHHHHHLLLhhhhHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGV....SKTNLLYYFPSkealYIAVL   56
ident   | |                         |  ||                         
Sbjct klSPKQERFIEEYFIND.......mNATKAAIAAGYsknsASAIGAENLQK.paiRARID   52
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHLL.......lLHHHHHHHLLLllllHHHHHHHHHHL.hhhHHHHH


DSSP  HHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel  116
ident                                                             
Sbjct ARLK........................................................   56
DSSP  HHHL........................................................


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd  176
ident                                                             
Sbjct ............................................................   56
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                       
Sbjct ......................   56
DSSP  ......................


No 71: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA

DSSP  lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLL..LHHHHHHHLL............
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV..SKTNLLYYFP............   46
ident          |                     |      |                     
Sbjct kLNDRQRKVLYCIVREYIENKK.pVSSQRVLEVSNIefSSATIRNDMKkleylgyiyqph   59
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.lLLHHHHHHHLLLllLHHHHHHHHHhhhhllleelll


DSSP  lhhhHHHH..HHHH..............................................
Query skeaLYIA..VLRQ..............................................   58
ident            ||                                               
Sbjct tsagRIPTdkGLRFyyeemlkisketseadlavetfksmpladpekvlflagnllarlte  119
DSSP  llllLEELhhHHHHhhhhhhhhllllllllhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   58
ident                                                             
Sbjct gyvlierpntrdlkilrvmlipvsedylifsiltefgvskvtpiktqerlnweeierqln  179
DSSP  leeeeelllhhhlllleeeeeelllleeeeeeeelleeeeeeeeellllllhhhhhhhhh


DSSP  ................................................hhhhhlhhhhhl
Query ................................................ildiwlaplkaf   70
ident                                                             
Sbjct fllrgrtvgevlmgkieslkgsgflrliesligetveryldaglenllkdetltledirn  239
DSSP  hhhllllhhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhlllllleeeelhhhhhhlllllhhhhhh


DSSP  lllllHHHHHHHHHHH.hHHHHhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhh
Query redfaPLAAIKEYIRL.kLEVSrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksa  129
ident            |        |                                       
Sbjct lleevKDQKFLESLVGegITVR......................................  261
DSSP  hhhhlLLHHHHHHHLLllLEEE......................................


DSSP  hhhhhhhllllllllhhhHHHH..............hhhhhhhHHHLhhhhhhhhlLLLL
Query liagwvksgklapidpqhLIFM..............iwastqhYADFapqveavtgATLR  175
ident                                                             
Sbjct ............igreigRKKLekfavfsgkyfkgespigsvyLFTSkvtkydrnhRVFE  309
DSSP  ............ehhhhlLHHHlleeeeeeeeeelleeeeeeeEEEEllllhhhhhHHHH


DSSP  LHHHhhhhhhhhhhhhhllllll
Query DEVFfnqtvenvqriiiegirpr  198
ident                        
Sbjct YILN.........rlseyftsts  323
DSSP  HHHH.........hhhhhhhhll


No 72: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL....lhhhhhhhhH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP....skealyiavL   56
ident                     |    |   |||   |                       |
Sbjct .tTPSMEDYIEQIYMLIEEKGY..ARVSDIAEALAVHPSSVTKMVQkldkdeyliyglvL   57
DSSP  .lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllleellleE


DSSP  HHHhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel  116
ident                                                             
Sbjct TSK.........................................................   60
DSSP  LHH.........................................................


DSSP  hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllLL
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlRD  176
ident                                                            |
Sbjct ..............gkkigkrlvyrhelleqflriigvdeekiyndvegiehhlswnsID  106
DSSP  ..............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhHH


DSSP  HHHHHHHHHH...hHHHHHLLLLLL
Query EVFFNQTVEN...vQRIIIEGIRPR  198
ident                      |   
Sbjct RIGDLVQYFEeddaRKKDLKSIQKK  131
DSSP  HHHHHHHHHHllhhHHHHHHHHHHL


No 73: 2DT5A MOLECULE: AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;

DSSP  lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...lLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL...........
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFG...fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...........   46
ident          |   |           | |  ||   || |                     
Sbjct kvPEAAISRLITYLRILEELEaqgvHRTSSEQLGGLAQVTAFQVRKDLSyfgsygtrgvg   60
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLEELHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhllllllllll


DSSP  .lhhhHHHHHHH.HHHHHhLHHH......................HHLLLLllhhhhhhh
Query .skeaLYIAVLR.QILDIwLAPL......................KAFREDfaplaaike   82
ident      |         |      |                                     
Sbjct ytvpvLKRELRHiLGLNR.KWGLcivgmgrlgsaladypgfgesfELRGFF.........  110
DSSP  eehhhHHHHHHHhHLLLL.LEEEeeelllhhhhhhhhllllllleEEEEEE.........


DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhHHHH...........
Query yirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalidekSALI...........  131
ident                                                             
Sbjct .......................dvdpekvgrpvrggviehvdllPQRVpgrieialltv  147
DSSP  .......................elllllllleelleeeeehhhhHHHLllllleeeell


DSSP  .hhhhhllllllLLHHhhHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query .agwvksgklapIDPQhlIFMIwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqri  190
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Sbjct preaaqkaadllVAAG..IKGI................................lnfapv  173
DSSP  lhhhhhhhhhhhHHHL..LLEE................................eellll


DSSP  hHLLL.............................lll
Query iIEGI.............................rpr  198
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Sbjct vLEVPkevavenvdflagltrlsfailnpkwreemmg  210
DSSP  lLLLLllleeeelllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhl


No 74: 1J5YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR

DSSP  LHHHHHHHhHHHHHHHHHHHllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHhhhhhhhhhh
Query AVSAKKKAiLSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyiavlrqil   60
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Sbjct XKTVRQER.LKSIVRILERS.kEPVSGAQLAEELSVSRQVIVQDIAYLRS..........   48
DSSP  LHHHHHHH.HHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH..........


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Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasRLFCMEmlagapllmdeltGDL  120
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Sbjct ........................lgynivatprgyvlAGGKSG...........vsRLV   73
DSSP  ........................hlllleeelleeelLLLLLL...........eeEEE


DSSP  HhhhHHHHhhhhhhhhlllllllLHHHHHHHHHHHHHhhhhlhhhhhhhhllllllhhhh
Query KaliDEKSaliagwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQhyadfapqveavtgatlrdevff  180
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Sbjct A...VKHA..............pEEIKEELLCVVRNG...grivdvivehpvygeirgii  113
DSSP  E...EELL..............hHHHHHHHHHHHHLL...leeeeeeeeellleeeeeee


DSSP  hhhhhhhhhHHHLLLLLL.........................................
Query nqtvenvqrIIIEGIRPR.........................................  198
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Sbjct dvsseeevlKFVNLXEXAkteplltlsggvhlhtieapdeetxerixrelkkkgfliee  172
DSSP  eellhhhhhHHHHHHHHLlllllllhhhheeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 75: 2IQCA MOLECULE: FANCONI ANEMIA GROUP F PROTEIN;

DSSP  .......................................................lhhHH
Query .......................................................avsAK    5
ident                                                             
Sbjct edslmktqaelllerlqevrparflsslwerlpqnnflkviavallqpgsqvlvhwllGN   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhHL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhhhhhllllhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHLH
Query KKAILSAALDTFSQFGFHGtrleqiaelagvsktnllyyfpsKEALYIAVLRQILDIWLA   65
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