DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1PB6A
MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1PB6-A 33.8 0.0 198 198 100 HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC; "
2: 2D6Y-A 17.2 2.5 181 186 18 PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN; "
3: 2GEN-A 16.9 2.8 181 188 19 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
4: 2PZ9-A 16.7 2.3 171 179 24 PUTATIVE REGULATORY PROTEIN; "
5: 1T33-A 15.4 2.8 186 220 19 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR "
6: 2IAI-A 14.3 3.4 173 200 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833; "
7: 1ZKG-A 14.3 3.2 183 200 21 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
8: 1U9N-A 14.1 3.4 179 194 15 TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR; "
9: 1VI0-A 13.7 3.2 179 189 16 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
10: 2IBD-A 13.5 3.3 167 192 16 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
11: 2G3B-A 13.5 3.9 178 188 21 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
12: 2DG8-A 13.1 3.8 170 175 18 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY "
13: 2UXH-A 13.0 3.1 176 206 18 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR; "
14: 2NP5-A 12.7 3.5 175 187 17 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
15: 2FX0-A 12.6 3.4 165 179 23 HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN; "
16: 1UI5-A 12.5 3.2 169 199 20 A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG; "
17: 1A6I-A 12.0 4.0 166 193 13 TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D; "
18: 1RKT-A 11.9 4.4 176 204 18 PROTEIN YFIR; "
19: 2FBQ-A 11.7 4.1 172 213 21 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
20: 2OFL-A 11.5 3.9 178 221 19 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
21: 2ID3-A 11.5 4.5 173 191 18 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
22: 2HYJ-A 11.4 3.7 181 193 15 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
23: 2G7G-A 11.2 3.8 161 197 18 RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
24: 2OI8-A 11.1 3.4 168 203 13 PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313; "
25: 2GUH-A 11.1 3.2 158 179 18 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
26: 2F07-A 10.6 4.2 149 197 18 YVDT; "
27: 1ZK8-A 10.6 4.0 166 177 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
28: 2QKO-A 10.5 4.1 165 174 14 POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY "
29: 1Z0X-A 10.5 4.6 167 216 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
30: 2Q24-A 10.4 4.8 137 173 20 PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
31: 2FQ4-A 10.2 4.4 151 184 19 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
32: 2OF7-A 10.0 3.6 118 191 23 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
33: 2HKU-A 10.0 4.6 138 191 20 A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
34: 2G7S-A 9.9 3.7 163 190 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY; "
35: 2FD5-A 9.7 4.0 158 180 12 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
36: 1V7B-A 9.5 3.8 157 175 18 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
37: 2O7T-A 9.2 4.3 157 188 11 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
38: 2OER-A 8.7 4.2 140 179 19 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
39: 2GFN-A 8.3 4.9 147 192 20 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED "
40: 2DG7-A 8.2 3.8 122 187 12 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
41: 2IU5-A 7.9 4.5 145 179 12 HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG; "
42: 2NX4-A 7.6 4.6 130 194 15 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN; "
43: 2DTZ-A 7.5 4.4 156 186 12 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR; "
44: 2G7L-A 6.6 4.3 139 201 11 TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
45: 2I10-A 6.5 5.1 115 179 14 PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
46: 1L0O-C 4.8 2.2 45 57 16 ANTI-SIGMA F FACTOR; "
47: 2HXO-A 4.4 3.9 107 207 12 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
48: 1XJE-A 4.1 5.3 88 627 9 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT; "
49: 1TQI-A 4.1 4.8 81 269 11 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
50: 2OBP-A 3.8 3.2 52 81 12 PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN; "
51: 2O3F-A 3.8 4.1 59 83 10 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH; "
52: 2NP3-A 3.8 3.8 106 141 11 PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR; "
53: 1LVA-A 3.8 10.1 80 258 11 SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR; "
54: 2AO9-A 3.7 6.3 76 117 9 PHAGE PROTEIN; "
55: 2NR3-A 3.6 9.4 73 168 7 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
56: 2IW5-B 3.6 2.7 49 133 14 LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1; "
57: 1BBY-A 3.6 2.5 52 69 12 RAP30; "
58: 2GAU-A 3.5 3.3 54 218 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY; "
59: 2CJJ-A 3.5 3.9 49 63 12 RADIALIS; "
60: 2HXI-A 3.4 6.6 106 197 17 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
61: 1T6S-A 3.4 4.9 72 162 7 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
62: 2NVU-B 3.3 8.0 80 789 13 NEDD8-ACTIVATING ENZYME E1 REGULATORY SUBUNIT; "
63: 2HEO-A 3.3 2.6 46 59 15 Z-DNA BINDING PROTEIN 1; "
64: 2DOB-A 3.3 2.8 53 82 13 PROACTIVATOR POLYPEPTIDE; "
65: 2CFX-A 3.3 3.7 59 140 5 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC; "
66: 1H88-C 3.3 7.1 75 152 5 CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA; "
67: 1B9M-A 3.3 6.8 73 258 12 PROTEIN (MODE); "
68: 2NNN-A 3.2 6.4 53 134 11 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
69: 2IA0-A 3.1 3.8 68 156 10 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
70: 2CMP-A 3.1 2.9 46 56 11 TERMINASE SMALL SUBUNIT; "
71: 1STZ-A 3.1 4.3 82 323 9 HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA "
72: 2EV0-A 3.0 11.5 69 131 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR; "
73: 2DT5-A 3.0 10.0 81 210 19 AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN; "
74: 1J5Y-A 3.0 5.8 84 172 7 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR "
75: 2IQC-A 2.9 3.9 87 173 14 FANCONI ANEMIA GROUP F PROTEIN; "
76: 2FXA-A 2.9 7.9 61 156 8 PROTEASE PRODUCTION REGULATORY PROTEIN HPR; "
77: 2FQ3-A 2.9 2.6 50 85 4 TRANSCRIPTION REGULATORY PROTEIN SWI3; "
78: 2DBB-A 2.9 3.8 63 146 2 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR "
79: 1CF7-A 2.9 4.1 50 67 8 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
80: 1B4A-A 2.9 4.9 77 146 5 ARGININE REPRESSOR; "
81: 2NYX-A 2.8 6.4 71 146 13 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN, "
82: 2DK5-A 2.8 2.8 48 91 10 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III 39 KDA "
83: 2COH-A 2.8 2.3 48 194 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
84: 1SFX-A 2.8 7.0 65 109 14 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN AF2008; "
85: 1R1U-A 2.8 3.7 50 94 10 REPRESSOR PROTEIN; "
86: 1QBJ-A 2.8 3.0 47 65 13 PROTEIN (DOUBLE-STRANDED RNA SPECIFIC ADENOSINE "
87: 1HST-A 2.8 2.8 49 74 8 HISTONE H5; "
88: 1HLV-A 2.8 8.7 64 131 11 MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B; "
89: 1FSE-A 2.8 2.0 48 67 10 GERE; "
90: 1EH6-A 2.8 4.4 55 168 20 O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE; "
91: 2H7F-X 2.7 4.9 66 314 11 DNA TOPOISOMERASE 1; "
92: 2FJI-1 2.7 5.1 91 399 8 EXOCYST COMPLEX COMPONENT SEC6; "
93: 2DIM-A 2.7 4.6 56 70 11 CELL DIVISION CYCLE 5-LIKE PROTEIN; "
94: 2CUJ-A 2.7 2.6 51 108 18 TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR 2-LIKE; "
95: 1UST-A 2.7 3.5 57 92 2 HISTONE H1; "
96: 1UFM-A 2.7 3.2 57 84 9 COP9 COMPLEX SUBUNIT 4; "
97: 1AOY-A 2.6 3.1 49 78 6 ARGININE REPRESSOR; "
98: 2CU7-A 2.5 6.6 51 72 14 KIAA1915 PROTEIN; "
99: 1SGM-A 2.5 5.3 92 184 10 PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YXAF; "
100: 1K78-A 2.5 2.3 41 124 5 PAIRED BOX PROTEIN PAX5; "
101: 1IN4-A 2.5 2.8 49 298 20 HOLLIDAY JUNCTION DNA HELICASE RUVB; "
102: 2P4W-A 2.4 6.4 92 197 9 TRANSCRIPTIONAL REGULATORY PROTEIN ARSR FAMILY; "
103: 2NS0-A 2.4 2.3 44 85 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
104: 2JSC-A 2.4 3.3 51 96 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR RV1994C/MT2050; "
105: 2FUG-2 2.4 4.1 66 178 17 NADH-QUINONE OXIDOREDUCTASE CHAIN 1; "
106: 1YX3-A 2.4 2.3 51 112 8 HYPOTHETICAL PROTEIN DSRC; "
107: 1WPK-A 2.4 4.6 60 146 15 ADA REGULATORY PROTEIN; "
108: 1ETK-A 2.4 2.1 38 75 11 FACTOR FOR INVERSION STIMULATION; "
109: 2G9W-A 2.3 6.0 82 119 10 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
110: 2FRH-A 2.3 5.9 54 127 11 STAPHYLOCOCCAL ACCESSORY REGULATOR A; "
111: 1U78-A 2.3 9.1 62 103 8 TRANSPOSABLE ELEMENT TC3 TRANSPOSASE; "
112: 1SD4-A 2.3 8.5 75 122 7 PENICILLINASE REPRESSOR; "
113: 1LDD-A 2.3 4.0 47 74 9 ANAPHASE PROMOTING COMPLEX; "
114: 1IV6-A 2.3 2.2 38 57 11 TELOMERIC REPEAT BINDING FACTOR 1; "
115: 2V1X-A 2.2 3.3 54 527 6 ATP-DEPENDENT DNA HELICASE Q1; "
116: 1YOV-A 2.2 4.8 67 529 12 AMYLOID PROTEIN-BINDING PROTEIN 1; "
117: 1YLF-A 2.2 3.2 52 117 12 RRF2 FAMILY PROTEIN; "
118: 1W1W-E 2.2 2.8 46 70 4 STRUCTURAL MAINTENANCE OF CHROMOSOME 1; "
119: 1T98-A 2.2 5.8 85 266 6 CHROMOSOME PARTITION PROTEIN MUKF; "
120: 2H6B-A 2.1 2.5 46 239 13 CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K; "
121: 1ZQ3-P 2.1 3.7 53 68 8 HOMEOTIC BICOID PROTEIN; "
122: 1XMK-A 2.1 3.2 48 79 8 DOUBLE-STRANDED RNA-SPECIFIC ADENOSINE DEAMINASE; "
123: 1UMQ-A 2.1 2.6 39 60 10 PHOTOSYNTHETIC APPARATUS REGULATORY PROTEIN; "
124: 1TWD-A 2.1 4.1 66 234 3 COPPER HOMEOSTASIS PROTEIN CUTC; "
125: 1OF9-A 2.1 3.0 53 77 6 PORE-FORMING PEPTIDE AMEOBAPORE A; "
126: 1JHF-A 2.1 3.9 75 197 13 LEXA REPRESSOR; "
127: 1IRZ-A 2.1 3.5 45 64 13 ARR10-B; "
128: 1GDT-A 2.1 2.0 33 183 9 PROTEIN (GAMMA DELTA RESOLVASE); "
129: 2QMA-A 2.0 6.6 62 463 8 DIAMINOBUTYRATE-PYRUVATE TRANSAMINASE AND L-2,4- "
130: 2NTZ-A 2.0 6.4 68 183 15 PARB; "
131: 2FA5-A 2.0 7.2 58 139 3 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MARR/EMRR FAMILY; "
132: 2DM9-A 2.0 7.7 57 118 7 V-TYPE ATP SYNTHASE SUBUNIT E; "
133: 2CGP-A 2.0 3.5 47 200 17 PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN); "
134: 1U5T-A 2.0 11.4 65 213 6 APPEARS TO BE FUNCTIONALLY RELATED TO SNF7; "
135: 1U2W-A 2.0 4.3 54 105 13 CADMIUM EFFLUX SYSTEM ACCESSORY PROTEIN; "
136: 1JR5-A 2.0 3.0 46 90 7 10 KDA ANTI-SIGMA FACTOR; "
137: 1JGS-A 2.0 7.1 56 138 11 MULTIPLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN MARR; "
138: 1IZN-A 2.0 6.2 84 275 6 CAPZ ALPHA-1 SUBUNIT; "
139: 1FT9-A 2.0 2.5 47 210 19 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
140: 1CF7-B 2.0 3.5 53 82 4 PROTEIN (TRANSCRIPTION FACTOR E2F-4); "
141: 1B72-B 2.0 4.1 60 73 12 PROTEIN (HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1); "
-
No 1: 1PB6A MOLECULE: HYPOTHETICAL TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YCDC;
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No 2: 2D6YA MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY REGULATORY PROTEIN;
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Sbjct .EHYARKVAAVRDGQERG...VITDaIPAPDLLFLLVAXANWAVVVPQXKRILVGG...G 165
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Query EVFFNQTVENVQRIIIEGIRPr 198
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Sbjct DAGTDGLRDSIKKAARRIVDR. 186
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No 3: 2GENA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
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Sbjct GQYAALLEAgFARARSAEETVRLLVTSYIDWVVANPDWARFILHSR...GRVEagelGER 113
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No 4: 2PZ9A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN;
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Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
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Sbjct ...STRQRIVAAAKEEFARHGIAGARVDRIAKQARTSKERVYAYFRSKEALYAHVAERET 57
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Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGApllmdeltgDL 120
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Sbjct TALIEATQLD......pADLPGYAGILFDHFAARPDHYRLITWGRLELA.........PL 102
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Query KALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVEAVTGatlrdEVF 179
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Sbjct QATIAGKLDKLRDAQRIGLLDPaWDPVDVLALINQIAXTWA.GQPEIAAAAA.dqavDPS 160
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Query FNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
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No 5: 1T33A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR (TETR/ACRR
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Sbjct mnipttttKGEQAKSQLIAAALAQFGEYGL.HATTRDIAALAGQNIAAITYYFGSKEDLY 59
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DSSP HHHHHHHHHHHHhHLHHHhhhHHHHhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHLlLLLL.HHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLHHHHHHHHhHHHH
Query RLFCMEMLAgAPLL.MDELTGDLKALIDEKSALIAGWVKSgklapiDPQHLIFMIwASTQ 157
ident | | | | | |
Sbjct KFISREQLS.PTSAyQLVHEQVIDPLHTHLTRLVAAYTGCdandtrMILHTHALL.GEVL 177
DSSP HHHHHHHHL.LLHHhHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllhhHHHHHHHHH.HHHH
DSSP HHHHLHHHHHHHH.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..l
Query HYADFAPQVEAVT.GATLrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRP..r 198
ident | || | |
Sbjct AFRLGKETILLRTgWPQF.DEEKAELIYQTVTCHIDLILHGltq 220
DSSP HHHHLHHHHHHHHlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl
No 6: 2IAIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR SCO3833;
DSSP ..........lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHH
Query ..........avsakkKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEA 50
ident || | | | || | || || ||
Sbjct grenlyfqgxttaktpETLLSVAVQVFIERGYDGTSXEHLSKAAGISKSSIYHHVTGKEE 60
DSSP llllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLHHHHH..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhLL
Query LYIAVLRQILDIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlAG 108
ident | || | | | || | |
Sbjct LLRRAVSRALDELFGILDEehARVG.TAAERLEYVVRRXVEVLXAELPYVTLLLRV..RG 117
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL..LL
DSSP LLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhh
Query APLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPqve 167
ident | || |
Sbjct TGTERWALE.RRREFDHRVAALLKDAAAEGDVRAdVEVRLATRLVFGXINSIVEWYR... 173
DSSP LHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLHHHHLL...
DSSP hhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLllll
Query avtgatlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | | | |
Sbjct ...pesgvSGAGEREVVDAVARLVFGG.lrk 200
DSSP ...lllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.lll
No 7: 1ZKGA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | ||| || | | ||| ||| | || || ||
Sbjct .VLSKRDAILKAAVEVFGKKGYDRATTDEIAEKAGVAKGLIFHYFKNKEELYYQAYXSVT 59
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL.HHHHHLL..LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHH
Query DIWL.APLKAFR..EDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLLMDELT 117
ident | ||| | | | |
Sbjct EKLQkEFENFLXknRNRDIFDFXERWIEKKLEYSASHPEEADFLITLVSVDEGLRKRILL 119
DSSP HHHHhHHHHHHHhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......llLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhh
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKSG.......klAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFApqveav 169
ident || |
Sbjct .DLEKSQRVFFDFVREKLKDLdlaedvteeIALKfLXWFFSGFEEVYLRTYQGK...... 172
DSSP .HHHHHLHHHHHHHHHHHHHLlllllllhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL......
DSSP hlLLLLLhhHHHHHHHHHHHHhHLLLLLL...
Query tgATLRDevFFNQTVENVQRIiIEGIRPR... 198
ident | | || |
Sbjct .pELLKR..DXNTLVEEVKVX.LRILKKGxtk 200
DSSP .hHHHHH..HHHHHHHHHHHH.HHHHHHHhll
No 8: 1U9NA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REPRESSOR ETHR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident ||| | | || | ||||||| |
Sbjct .GDDRELAILATAENLLEDRPLADISVDDLAKGAGISRPTFYFYFPSKEAVLLTLLDRVV 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHHLL...lllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHHH
Query DIWLAPLKAFR...edfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAPLLMDELT 117
ident | | | | |
Sbjct NQADXALQTLAenpadtDRENXWRTGINVFFETFGSHKAVTRAGQAAR.ATSVEVAELWS 118
DSSP HHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHL.LLLHHHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhl
Query gDLKALIDEKSALIAG.WVKSGKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtg 171
ident | | |
Sbjct .TFXQKWIAYTAAVIDaERDRGAAPRtlpaheLATALNLXNERTLFASFAGEQPS..... 172
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLLLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.....
DSSP lllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.
Query atlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRPR. 198
ident | |
Sbjct ......vPEARVLDTLVHIWVTSIYGEn 194
DSSP ......lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
No 9: 1VI0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | || | | || ||| || || |
Sbjct ...PKYXQIIDAAVEVIAENGYHQSQVSKIAKQAGVADGTIYLYFKNKEDILISLFKEKX 57
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHH.HHHLLlLLLHHHHHl
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCM.EMLAGaPLLMDELTg 118
ident | | |
Sbjct GQFIERXEEdIKEKATAKEKLALVISKHFSLLAGDHNLAIVTQLeLRQSNlELRQKINE. 116
DSSP HHHHHHHHHhHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLlLLLLLhHHHHHHHH.
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhLLLLll
Query DLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtGATLrd 176
ident || || | | |
Sbjct ILKGYLNILDGILTEGIQSGEIKEgLDVRLARQXIFGTIDETVTTWvXNDQ...KYDL.. 171
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...LLLH..
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHLLllll
Query evffnQTVENVQRIIIEGirpr 198
ident | |
Sbjct ....vALSNSVLELLVSGihnk 189
DSSP ....hHHHHHHHHHHHHLllll
No 10: 2IBDA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | | || || | | ||| || |
Sbjct GKSGRRTELLDIAATLFAERGLRATTVRDIADAAGILSGSLYHHFDSKESXVDEILRGFL 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH.HHHHhLLLLL.LHHHHH
Query DIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLF.CMEMlAGAPL.LMDELT 117
ident | | | | |
Sbjct DDLFGKYREiVASGLDSRATLEALVTTSYEAIDASHSAVAIYqDEVK.HLVANeRFTYLS 119
DSSP HHHHHHHHHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHhHLLH.HHLLLhHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..lllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllllL
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKS..gklapidpqhlIFMIWASTQHYADFApqveavtgatlR 175
ident | |
Sbjct .ELNTEFRELWXGVLEAGVKdgsfrsdidvelaFRFLRDTAWVAVRWY.........rpG 169
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllllllhhhhHHHHHHHLLHHHHLL.........llL
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHhllllll
Query DEVFFNQTVENVQRIIiegirpr 198
ident | |
Sbjct GSVTVDTVAKQYLSIVldglasp 192
DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHhhlllll
No 11: 2G3BA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | ||| | | | | | || |||| | | | | | | |
Sbjct .XSERRDAILKASATAIAQRGIRGLRVNDVAEVAGVSPGLLYYHFKDRIGLLEAALNYIN 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLH.HHHHllllLLHHHHHHHHHHHHHhhHHHL..HHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHH
Query DIWLA.PLKAfredFAPLAAIKEYIRLKLevSRDY..PQASRLFCMEMLAG..APLLMDE 115
ident | | | | |
Sbjct DRARAyRSEG.eggDSARDRLTRSLLGEI..QDRPevVENSLAWNELRASAvyEEALRDP 116
DSSP HHHHHhHLLL.lllLLHHHHHHHHHHHLL..LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHHH
DSSP HHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhlll
Query LTGDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtgat 173
ident | | | | | ||| |
Sbjct LARTTAAWVSEIADAIVQAQATGEISRsLDPQPTAVTXTALVEGLSGRWlCKEI...... 170
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL......
DSSP lllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLLll
Query lrdevFFNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
ident |
Sbjct .....STEDARSHLLGAIDVVXS.. 188
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHL..
No 12: 2DG8A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATORY
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || | || | || ||| | | | |
Sbjct .DPQRRERILAATLDLIAEEGIARVSHRRIAQRAGVPLGSMTYHFTGIEQLLREAFGRFT 59
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHH..LLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLL..LLHHHH
Query DIWLAPLKA..FREDfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAP..LLMDEL 116
ident | | | | | | | | |
Sbjct DHIVAVFDEhlGAAA.DRDEAREAVADLVHELSEDSQRDLVLTQELYTLAARqpAYRELT 118
DSSP HHHHHHHHHhhHLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHlhHHHHHH
DSSP HlHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHHhhhhllllll
Query TgDLKALIDEKSALIAGwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYAdFAPQVeavtgatlrd 176
ident | | | | | |
Sbjct H.EWMRRSRVHLEKHFD........pGTARQLDALIEGLTLHRA.LAREP.......... 158
DSSP H.HHHHHHHHHHLLLLL........hHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL..........
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query evffnQTVENVQRIIIEGIRPR 198
ident |
Sbjct .....HGRALTLEAIARITTTD 175
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHLLLL
No 13: 2UXHA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident | || | | | | ||||||| | | | | |
Sbjct tkeEAQETRAQIIEAAERAFYKRGVARTTLADIAELAGVTRGAIYWHFNNKAELVQALLD 60
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHhHHHLHHHHHL..LLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHL....
Query QIlDIWLAPLKAF..REDF.APLAAIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLA.... 107
ident | || ||
Sbjct SL.HETHDHLARAseSEDEvDPLGCMRKLLLQVFNELVLdarTRRINEILHHKCEFtddm 119
DSSP HL.LHHHHHHHHHhhLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhHHHHHHHHHHLLLLlhhh
DSSP ..lLLLLHHHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL....lLHHH.HHHHHHHHHHHHh
Query ..gAPLLMDELTgDLKALIDEKSALIAGWVksgKLAP....iDPQH.LIFMIWASTQHYa 160
ident | | | |
Sbjct ceiRQQRQSAVL.DCHKGITLALANAVRRG...QLPGeldaeRAAVaMFAYVDGLIRRW. 174
DSSP hhhHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlllhhHHHHhHHHHHHHHHHHH.
DSSP HLHHHHhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLL.....ll
Query DFAPQVeavtgatlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIR.....pr 198
ident | || |
Sbjct LLLPDS...........vDLLGDVEKWVDTGLDMLRlspalrk 206
DSSP HHLLLL...........lLLLLLHHHHHHHHHHHHHhlhhhll
No 14: 2NP5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | |||| | | ||
Sbjct ...TSPERLAAALFDVAAESGLEGASVREVAKRAGVSIGAVQHHFSTKDEXFAFALRTLV 57
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHhhHHLH.HHHHHHHHHHHLLLLL..LHHHHH
Query DIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEvsRDYP.QASRLFCMEMLAGAPL..LMDELT 117
ident | || | | | | | |
Sbjct DKLLARLSEVERGGDPARALFAAXSQLLP.lDEARsREAHVXAAFAVRAATSpsLAEIRR 116
DSSP HHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHLLLL.lLHHHhHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllLLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHhhhhlllll
Query gDLKALIDEKSALIAGWVKsgkLAPI..DPQHLIFMIWASTQHYaDFAPQVeavtgatlr 175
ident | | |
Sbjct .KTLFTIRTGLSAVLIGIG...TPEAetRAALLLATVDGLALDA.IGSPAL......... 162
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLHHH.........
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....
Query devfFNQTVENVQRIIIEGIRPR..... 198
ident | | | |
Sbjct ...yPPEYLEHALDIQIGXILQGadvvp 187
DSSP ...lLHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllll
No 15: 2FX0A MOLECULE: HEMOLYSIN II REGULATORY PROTEIN;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || | | || || | | ||| || || |
Sbjct SREQTXENILKAAKKKFGERGYEGTSIQEIAKEAKVNVAXASYYFNGKENLYYEVFKKYG 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL
DSSP HHHLHhhHHLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHh
Query DIWLAplKAFRE..DFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCME.MLAGaPLLMDELt 117
ident | | | | | || | | | |
Sbjct LANEL..PNFLEknQFNPINALREYLTVFTTHIKENPEIGTLAYEEiIKES.ARLEKIK. 116
DSSP LHHHL..LLHHHhlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHlLLLL.LLHHHHH.
DSSP LHHHHhhhhhhHHHHHHHHLLlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHhhLHHHHHHHhllllll
Query GDLKAlideksALIAGWVKSGkLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYadFAPQVEAVtgatlrd 176
ident | | | | |
Sbjct PYFIGsfeqlkEILQEGEKQG.VFHFfSINHTIHWITSIVLFP..KFKKFIDS....... 166
DSSP HHLHHhhhhhhHHHHHHHHLL.LLLLlLHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHHHHL.......
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHLLllll
Query evffnqtveNVQRIIIEGirpr 198
ident ||
Sbjct .........DLVSRIISAltdk 179
DSSP .........LHHHHHHHHhhll
No 16: 1UI5A MOLECULE: A-FACTOR RECEPTOR HOMOLOG;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | | | | ||| | | | || | | |
Sbjct lRAEQTRATIIGAAADLFDRRGYESTTLSEIVAHAGVTKGALYFHFAAKEDLAHAILEIQ 60
DSSP lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHhl
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMLAgAPLLMDELtg 118
ident | | | | |
Sbjct SRTSRRLAKDlDGRGYSSLEALXRLTFGXARLCVQG.PVLRAGLRLATA.GVPVRPLP.h 117
DSSP HHHHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHHHHHHHHHL.LLLLLLLL.l
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhhhhhhllllllh
Query dlkalidekSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFapqveavtgatlrde 177
ident | || |
Sbjct pftewreiaTSRLLDAVRQSDVHQdIDVDSVAHTLVCSVVGTRVV............... 162
DSSP hhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHLLLLL...............
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.................
Query vFFNQTVENVQRIIIEGIRPR................. 198
ident | | | |
Sbjct .REPRRLAEXWYILIRGXVPVtrraryvtlaarleqet 199
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhhl
No 17: 1A6IA MOLECULE: TETRACYCLINE REPRESSOR PROTEIN CLASS D;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | | || | | || | ||
Sbjct .sRLDKSKVINSALELLNEVGIEGLTTRKLAQKLGVEQPTLYWHVKNKRALLDALAVEIL 59
DSSP .lLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHhLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhHHHHHHHhhlllllLHHHhhLHH
Query DIWLAPLKaFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSrDYPQaSRLFCMEmlagaplLMDEltGDL 120
ident
Sbjct ARHHDYSL.PAAGESWQSFLRNNAMSFRRAL.LRYRdGAKVHLG.......TRPD..EKQ 108
DSSP HHHLLLLL.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLLlHHHHHHH.......LLLL..HHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.........hhhhhHHL
Query KALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.........pqveaVTG 171
ident | | |
Sbjct YDTVETQLRFMTENG....fslRDGLYAISAVSHFTLGAVLEQqehlppllrealqiMDS 164
DSSP HHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhhHHL
DSSP LLlllhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLLL........
Query ATlrdevfFNQTVENVQRIIIEGIRPR........ 198
ident | | |
Sbjct DD......GEQAFLHGLESLIRGFEVQltallqiv 193
DSSP LL......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllll
No 18: 1RKTA MOLECULE: PROTEIN YFIR;
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHH
Query .......AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYI 53
ident || || | || | | | | || | |
Sbjct spkvtkeHKDKRQAEILEAAKTVFKRKGFELTTXKDVVEESGFSRGGVYLYFSSTEEXFR 60
DSSP llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHHHHHHLL..ll
Query AVLRQILDIWLAPLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYP.QASRLFCMEMLAG..ap 110
ident || | | | | | | | ||
Sbjct RIIETGLDEGLRKLDKSAEHQSVWASISSYLDELTEGLRDVAdTLAPVQFEYLVTAwrne 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHhLLHHHHHHHHHHHhhlh
DSSP lLHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHH.hHLLLLLL....lLHHHHHHHHHHHhHHHHHLHhh
Query lLMDELTGDLKALIDEKSALIAGW.vKSGKLAP....iDPQHLIFMIWAStQHYADFApq 165
ident | | | |
Sbjct eRRQYLEKRYDLFVERFSRLLQKGidQGEFQPVqplatIAKFFLNXNDGI.IQNALYF.. 177
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLLLLllhhhHHHHHHHHHHHH.HHHHHHL..
DSSP hhhhhllLLLLhhhhhhHHHHHHHHHHLLLLL......l
Query veavtgaTLRDevffnqTVENVQRIIIEGIRP......r 198
ident |
Sbjct .......DEEK.....aDVSGLAESAKLYLKTvlqadek 204
DSSP .......LHHH.....hLHHHHHHHHHHHHHHhhlllll
No 19: 2FBQA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | || || | || | | | ||| | | || || || |
Sbjct AQSETVERILDAAEQLFAEKGFAETSLRLITSKAGVNLAAVNYHFGSKKALIQAVFSRFL 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHH.LLLLL....lhhHHHHHHHHHHHH........hhhhLHHHHHHHHHHHHL
Query DIWLAPLKA.FREDF....aplAAIKEYIRLKLE........vsrdYPQASRLFCMEMLA 107
ident | | | | ||
Sbjct GPFCASLEKeLDRRQakpeaqhATLEDLLHLLVSqamavkprsgndLSIFMRLLGLAFSQ 120
DSSP HHHHHHHHHhHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHhhhhlllllllhHHHHHHHHHHHHHL
DSSP LLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHhhhhhhhhllllLLLLHhHHHHHHHHHHHH...HHHLHH
Query GAPLLMDELTGDLKALIDEKSaliagwvksgklAPIDPqHLIFMIWASTQH...YADFAP 164
ident | | | |
Sbjct SQGHLRKYLEEVYGKVFRRYM.....llvneaaPKLPPiELFWRVHFMLGAaafSMSGIK 175
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....hhhhhhlLLLLHhHHHHHHHHHHHHhhhHHHLHH
DSSP HHHHHHL......lLLLLhhHHHHHHHHHHHHHhLLLL.ll
Query QVEAVTG......aTLRDevFFNQTVENVQRIIiEGIR.pr 198
ident | |
Sbjct ALRAMAEtdfgvntSTEQ..VMHLMVPFFAAGM.RAESgid 213
DSSP HHHHHHHhhhllllLHHH..HHHHHHHHHHHHH.HLLLlll
No 20: 2OFLA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident || | | | | || |||| | ||| || | |
Sbjct sKSEQTRALILETAXRLFQERGYDRTTXRAIAQEAGVSVGNAYYYFAGKEHLIQGFYDRI 60
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLLLLLL...HHH
Query LDIWLAPLKA.FREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAGAPLL...MDE 115
ident | | | | | | |
Sbjct AAEHRAAVREvLARETDLEARLAGVLKVWLDIATPYHEFAVQFFKNAADPDSPLspfSPE 120
DSSP HHHHHHHLLLhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlllLHH
DSSP HHlHHHHHHhHHHHH.HHHHhhllLLLL.....lLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhhhhh
Query LTgDLKALIdEKSAL.IAGWvksgKLAP.....iDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPqveav 169
ident || | | |
Sbjct SE.HARVEAiGIHRAvLAGA...kTKVPeelrdiLPELXWLSQXGLVLYW.IFDR..... 170
DSSP HH.HHHHHHhHHHHHhHLLL...lLLLLhhhllhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL.....
DSSP hllllllHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL...........................
Query tgatlrdEVFFNQTVENVQRIIIEG..IRPR........................... 198
ident |
Sbjct .......TEGRERSYRLAERGARLTarGVVLarfrvlrplvrevhelftdflpgxtkv 221
DSSP .......LLLLHHHHHHHHHHHHHHhhHHHLllllllhhhhhhhhhhhhhllllllll
No 21: 2ID3A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | || | || | || ||| || | |
Sbjct ggRTARIREAVLLAAGDALAADGFDALDLGEIARRAGVGKTTVYRRWGTPGGLAADLLAD 60
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLhhhHHLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHH.
Query ILDIWLaplKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQASRLFCMEMLAgAPLLMDE. 115
ident | | || | | |
Sbjct XAEQSL...PRAD.TGALEEDLRANARLVVRTLDDprQGRLFRALIAASLC.NEQAAEAl 115
DSSP HHHHLL...LLLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhHHHHHHHHHHHHHH.LHHHHHHh
DSSP HHLHhhhhHHHHhHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHhhhhllll
Query LTGDlkalIDEKsALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVeavtgatl 174
ident | | || |
Sbjct HRFYavrvDEWA.GCVRDAVARGEVPDgTDPHGVVAAVSAPLYYALLNTGRS........ 166
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DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHLLLL.....ll
Query rdevfFNQTVENVQRIIIEGIR.....pr 198
ident | |
Sbjct ....lTEADADRAARAASTAARagvwvtg 191
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHHHlllllll
No 22: 2HYJA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | | || || | || | | |
Sbjct aEAQATRGRILGRAAEIASEEGLDGITIGRLAEELEMSKSGVHKHFGTKETLQISTLDKA 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLH.HHHHLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHH.hHHHHHHHHHLLL....LLLH
Query LDIWLA.PLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQ.aSRLFCMEMLAGA....PLLM 113
ident | |
Sbjct FVDFWHrVVEPALaEPPGLRRLRAVCANSVGYLEEPLLpgGCLLTAALSEYDgrpgRVRD 120
DSSP HHHHHHhHLHHHHhLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllLLHHHHHHHHHLllllHHHH
DSSP HHHHlHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query DELTgDLKALIDEKSALIAGWVKSGKLAP.IDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg 171
ident | | | | | | | | |
Sbjct AVAE.VWSRWREQLRADLTAAVDKGELPAgFDVEQALFEIVAAGLALNAAMqLQHD.... 175
DSSP HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL....
DSSP lllllhhHHHHHHHHHHHHHHLLLlll
Query atlrdevFFNQTVENVQRIIIEGIrpr 198
ident
Sbjct ......rTAADRARRAIERALAQS... 193
DSSP ......lLHHHHHHHHHHHHHHHL...
No 23: 2G7GA MOLECULE: RHA04620, PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | ||| | | | | | |
Sbjct ...LDRERIAEAALELVDRDGD..FRXPDLARHLNVQVSSIYHHAKGRAAVVELVRHRVV 55
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHhlHHHHHLLlLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhlllllLHHHhhlhh
Query DIwlAPLKAFReDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlagaplLMDEltgdl 120
ident || | | | | | || | |
Sbjct RE..IDGSAFE.RLPWDEAFSEWARSYRAAFSRHPTAIRLLATET......VRDP...gs 103
DSSP LL..LLLHHHH.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHLLL......LLLH...hh
DSSP hhHHHHHHHHHHHHHhlllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHlhhhHHHHHL.........
Query kaLIDEKSALIAGWVksgklapiDPQHLIFMIWASTQHYADfapqVEAVTG......... 171
ident | | | | |
Sbjct lsVYHSAAAGLRGAG....fpddHIXAVITAAENFLLGAAL.daaAPEVXIeadstttdd 158
DSSP hhHHHHHHHHHHHHL....llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhLLLLLLlllllllll
DSSP .......llllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL.....
Query .......atlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR..... 198
ident | | |
Sbjct altralaaaprGPERAEQAFELGLAALLAGFHHLlqecg 197
DSSP hhhhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll
No 24: 2OI8A MOLECULE: PUTATIVE REGULATORY PROTEIN SCO4313;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHH
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAV 55
ident | | | | || | | | || |
Sbjct tprerYRTQVRAEIKDHAWEQIATAGASALSLNAIAKRXGXSGPALYRYFDGRDELITEL 60
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHLHHHHH.LLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHhHHLL.lLLLH
Query LRQILDIWLAPLKA.FREDFaplaAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMeMLAG.aPLLM 113
ident | | | | || |
Sbjct IRDAYRSQADSLRAaAASGA....DLAGLAHALRAWALDDPQRYFLIFG.TPVPgyRAPD 115
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhHHLLL....LHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHL.LLLLllLLLH
DSSP HHHhLHHHHHHhHHHHHHHHH..................hhllllllLLHHHHHHHHHHH
Query DELtGDLKALIdEKSALIAGW..................vksgklapIDPQHLIFMIWAS 155
ident |
Sbjct DIT.EIAAETX.AVIVDACAAgtdgafdahldthrqwadrpapssalHRALSFWSRLHGV 173
DSSP HHL.LLLHHHH.HHHHHHHLLllllhhhhhhhhllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHhHLHHhHHHHHllllllhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLl
Query TQHYaDFAPqVEAVTgatlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPr 198
ident |
Sbjct LSLE.LAGQ.FTGXG..........fDSALLFEAELKDLLGP. 203
DSSP HHHH.HLLL.LLLLL..........lLHHHHHHHHHHHHLLL.
No 25: 2GUHA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHhh
Query .AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRqi 59
ident | || | | ||| |||| || ||| | |
Sbjct rTAEQSRSLIVDAAGRAFATRPYREITLKDIAEDAGVSAPLIIKYFGSKEQLFDALVD.. 58
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHLL..
DSSP HHHHL.HHHHHllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHH..lHHHHhHHHHHHH..LLLL.LLH
Query LDIWL.APLKAfredfaplaAIKEYIRLKLEVSRD..yPQASrLFCMEML..AGAP.LLM 113
ident | |
Sbjct FRAAAeIVFSG.........PLDGLGERXVSXFARplePYKP.LSLNILFxsGPSEeSSR 108
DSSP LHHHHhHHLLL.........LLLLHHHHHHHHHLLlllLLLL.HHHHHHHllLLLLhHHH
DSSP HHHHlhhhhhhhhhHHHHhhhhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH..HHHHhHHL
Query DELTgdlkalidekSALIagwvksgklaPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA..PQVEaVTG 171
ident | | |
Sbjct KLRAnysaqxidalAERL.........pGRDARLRAELVXSXLTGLAVXRrkXXQE.HAT 158
DSSP HHHHhhhhhlhhhhHHHL.........lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLHH.HLL
DSSP LllLLHHHHHHHHHHHHhHHHLLLlll
Query AtlRDEVFFNQTVENVQrIIIEGIrpr 198
ident | || |
Sbjct G..TPEEVVAHYAPLVQ.ELLDGG... 179
DSSP L..LHHHHHHHHHHHHH.HHHHLL...
No 26: 2F07A MOLECULE: YVDT;
DSSP ......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query ......aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIA 54
ident | | || || | | | || || || || |
Sbjct pftmpkqTSGKYEKILQAAIEVISEKGLDKASISDIVKKAGTAQGTFYLYFSSKNALIPA 60
DSSP lllllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHL.HHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhhhHHHHHHHHHlLLLL.L
Query VLRQILDIWL.APLKAFREDFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpqaSRLFCMEMLaGAPL.L 112
ident | | | | |
Sbjct IAENLLTHTLdQIKGRLHGDEDFWTVLDILIDETFLITERH...KDIIVLCYSgLAIDhS 117
DSSP HHHHHHHHHHhHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HHHHHHHHHhHHHLlL
DSSP HHHHHLHHH......................hhhHHHHhhhhhhhhllllllllhhhHHH
Query MDELTGDLK......................aliDEKSaliagwvksgklapidpqhLIF 150
ident | |
Sbjct MEKWETIYQpyyswlekiinkaianhevteginsKWTA.................rtIIN 160
DSSP HHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhHHHH.................hhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLHhhhhhhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHLLLLL....l
Query MIWASTQHYADFApqveavtgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRP....r 198
ident | |
Sbjct LVENTAERFYIGF...............eqdenvEVYKKEIFTFLKRslgta 197
DSSP HHHHHHHHHHLLL...............lllllhHHHHHHHHHHHHHhhlll
No 27: 1ZK8A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | || |
Sbjct .IGLTLQKIVETAAEIADANGvQEVTLASLAQTLGVRSPSLYNHVKGLQDVRKNLGIYGI 59
DSSP .LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHH.HLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHhhhhllllLLHHHHHlH
Query DIWLAPLK.AFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCmemlagapLLMDELTgD 119
ident | | || | |
Sbjct KKLHNRLEeAAED.KRXDEAIHALGEAYVAFVRKHPGLYEATF.......lRDEEVRK.A 110
DSSP HHHHHHHHhHHLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHLL.......lLLHHHHH.H
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHhHLHHhHHHHhllllllhhh
Query LKALIDEKSALIAGWVKSgklapIDPQHLIFMIWASTQHYaDFAPqVEAVtgatlrdevf 179
ident
Sbjct GDGIVKLCLQVLQQYGLEgenalHATRGFRSICHGFASIE.QQGG.FGLP.......... 158
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL.LLLL..........
DSSP hhHHHHHHHHHHHLLLLL.l
Query fnQTVENVQRIIIEGIRP.r 198
ident |
Sbjct .lDLDISLHVLLETFIKGlr 177
DSSP .lLHHHHHHHHHHHHHHHhl
No 28: 2QKOA MOLECULE: POSSIBLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHL.LLLHhHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELA.GVSKtNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | || | | | |||| | | |
Sbjct ..PERRAALVNAAIEVLAREGARGLTFRAVDVEAnVPKG.TASNYFPSRDDLFDQVGKRI 57
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHLlLLLL.LHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHlhhhhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHhLLLL....LLHHH
Query LDIWlaplkafredfaPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMlAGAP....LLMDE 115
ident | || | |
Sbjct HERL............NLELAIEYXQGLFGRITRDRTGYLALQELR.LEAVrrpeLRTTL 104
DSSP HHLL............LHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHH.HHHLllhhHHHHH
DSSP HHlHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhHHLLll
Query LTgDLKALIDEKSALIAGWVksgklaPIDPqHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEaVTGAtl 174
ident | | |
Sbjct TR.TISENLKRDIGFHLDSG.....lPGDR.STVLXLYLAXNALIVEHlTLPG.VLEG.. 154
DSSP HH.HHHHHHHHHHHHHHHHL.....lLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHhHLHH.HLLL..
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHhLLLLll
Query rdeVFFNQTVENVQRIIiEGIRpr 198
ident | |
Sbjct ...VDTERLVADLVTRA.VATPda 174
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHH.LLLLll
No 29: 1Z0XA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.llLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFSQF.gfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQI 59
ident | | || | || || | || |
Sbjct ..KLSKDTIIAAAFSLLEKSptlEQLSXRKVAKQLGVQAPAIYWYFKNKQALLQSXAEAI 58
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHHHLllhHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLHHhhHLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHHHHHHhlllllLHHHhhlH
Query LDIWLAPlkAFREdfAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLFCMEMlagaplLMDEltgD 119
ident | | |
Sbjct EEHFQEP..ALCG..EWYSDLLAFXENYYDLYQQFpCAVAIEIQTV......PAYP...Q 105
DSSP HHLLLLL..LLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLHHHHHHLLL......LLLH...H
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHH..........
Query LKALIDEKSALIAGWVksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQVEAV.......... 169
ident |
Sbjct RLRHLNQXXGILREAG....fspEXTHLAVTSLQHLLFGXIXDATEEKQLvsqvlngddy 161
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLL....llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhh
DSSP ....................hlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL......
Query ....................tgatlrDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRPR...... 198
ident |
Sbjct lkeqvlhxkqyvsdneltyxeesiqfHSIHQKSAFIQAVKTYLDGLQADntsssk 216
DSSP hhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllLHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllll
No 30: 2Q24A MOLECULE: PUTATIVE TETR FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsaKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || || | || || ||| | || ||| | |
Sbjct ....NRDKILAAAVRVFSEEGLD.AHLERIAREAGVGSGTLYRNFPTREALIEAAYRNEV 55
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHHLlllllhhHHHHHHHHHHHHHHhHLHHHHHHHHHhhhllLLLL....HHHH
Query DIWLAPLKAFredfaplAAIKEYIRLKLEVSrDYPQASRLFCMemlagAPLL....MDEL 116
ident || |
Sbjct ARLCDSVPGL...laelPPAEALRAWTRRFI.DYATAKLGXAD...alRAVVasggDPYG 108
DSSP HHHHHLHHHH...hhhlLHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHHLHH...hhHHHHhlllLLLL
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLL...lllHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhllL
Query tgdlkalideksaliagwvksGKLA...pidPQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtgaT 173
ident | |
Sbjct ....dsrqliqsaltalxdaaAAAGeirsdiRSTDXFAALAGIALTSSRPD........Q 156
DSSP ....lhhhhhhhhhhhhhhhhHHLLllllllLHHHHHHHHHHHHHHHLLHH........H
DSSP LLLhhhHHHHHHHHHHHhhllllll
Query LRDevfFNQTVENVQRIiiegirpr 198
ident
Sbjct RAQ..aERLLDLVLDGL......rp 173
DSSP HHH..hHHHHHHHHHHL......ll
No 31: 2FQ4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHhh
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQil 60
ident |||||| || ||| | ||| | | |
Sbjct RNIETQKAILSASYELLLESGFKAVTVDKIAERAKVSKATIYKWWPNKAAVVXDGFLS.a 59
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH.h
DSSP HHHLHHhhHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHHHHHLL...LLLLHHHHH
Query DIWLAPlkAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPqaSRLFCMEMLAG...APLLMDELT 117
ident | | | | |
Sbjct AAARLP..VPDT.GSALNDILIHATSLANFLISRE..GTIINELVGEGqfdSKLAEEYRV 114
DSSP LLLLLL..LLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLHHHHHHHHHlllHHHHHHHHH
DSSP lhHHHHHH.hHHHH....hhhhHHLLlllllLHHHH.HHHHHHHhhhhhhlhhhhhhhhl
Query gdLKALID.eKSAL....iagwVKSGklapiDPQHL.IFMIWAStqhyadfapqveavtg 171
ident | | | | |
Sbjct ryFQPRRLqaKQLLekgikrgeLKEN.ldieLSIDLiYGPIFYR................ 157
DSSP hlHHHHHHhhHHHHhhhhhlllLLLL.llhhHHHHHhHHHHHHH................
DSSP lllllhhhhhhHHHHHHhHHHLLLLLL....
Query atlrdevffnqTVENVQrIIIEGIRPR.... 198
ident |
Sbjct ...llvtgeklDDSYVH.DLVINAFEGirlr 184
DSSP ...hhllllllLHHHHH.HHHHHHHHLllll
No 32: 2OF7A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHh
Query .....AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAv 55
ident || | | | | ||||| | || | ||| |
Sbjct glrerKKTRTREAIRAATYGLIRQQGYEATTVEQIAERAEVSPSTVLRYFPTREDIVLT. 59
DSSP lllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHLL.
DSSP hhHHHH.HHLHHHHHllllllHHHHHHHHHHHHHH...HHHH.LHHHHHHHHHHHHLlLL
Query lrQILD.IWLAPLKAfredfaPLAAIKEYIRLKLE...VSRD.YPQASRLFCMEMLAgAP 110
ident | | | | || |
Sbjct ..DEYDpVXAAELAA...rpaGEPWSDSLRHVLRKalgLGAGeEAELIRLRTRLLAE.VP 113
DSSP ..LLLHhHHHHHHHL...lllLLLHHHHHHHHHHHhhlLLLLlHHHHHHHHHHHHHH.LH
DSSP LL.HHHHHLHH..................hhhhHHHH........hhhhhhhhlllllll
Query LL.MDELTGDL..................kaliDEKS........aliagwvksgklapi 143
ident |
Sbjct AVrARXLENXSdtgrxlaraiadrtgldpdgleVRIVsxslvgglxevsrywaehdhees 173
DSSP HHhHHHHHHLLllllhhhhhhhhhhllllllhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP lhhhhHHHHhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query dpqhlIFMIwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct laelvDRAL.....................................dalenglpa 191
DSSP hhhhhHHHH.....................................hhhhhllll
No 33: 2HKUA MOLECULE: A PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH.H
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ.I 59
ident | || | | || || || ||| | |
Sbjct ...QTRDALFTAATELFLEHGEG.VPITQICAAAGAHPNQVTYYYGSKERLFVEVACAaV 56
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHhH
DSSP HHHHLHhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhLHHHHHHHHHHhhllLLLL......H
Query LDIWLAplkafredfaplaaikeyirlklevsrdYPQASRLFCMEmlagAPLL......M 113
ident | ||
Sbjct LRAGKR...aeddaataetvgdyteklvgsllgpGAPSVELFTSA....XLXTgrrselR 109
DSSP HHHHHH...hhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHH....HHHLlllhhhH
DSSP HHHHLHHHHHHH.hhhhhhhhHHHLlLLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHHHH
Query DELTGDLKALID.eksaliagWVKSgKLAPI.DPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEAVT 170
ident | | | | | |
Sbjct DLITDTLRTLHSsgevalirtLXRT.GWQLRaGIDVESKAFWSAIFGLVIQKtATGESFG 168
DSSP HHHHHHHHHHHHhhhhlhhhhHHHL.LLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLLLL
DSSP llLLLLhhhhhhhhhHHHHHHHLL...llll
Query gaTLRDevffnqtveNVQRIIIEG...irpr 198
ident | |
Sbjct .ySLEE.......avAVIFANLQIpetvrnt 191
DSSP .lLHHH.......hhHHHHHHHLLlhhhhhl
No 34: 2G7SA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | | | |||| | |
Sbjct NPQSKADDILQCARTLIIRGGYNSFSYADISQVVGIRNASIHHHFPSKSDLVCKLVSQYR 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL.HHHHHLLllLLHHHHHhhhhHHHHHHHHHL...hHHHHHHHHHHHLL...lLLLH
Query DIWL.APLKAFRedFAPLAAIkeyiRLKLEVSRDY...pQASRLFCMEMLAG...aPLLM 113
ident ||
Sbjct QEAEaGIAELEKniSDPLEQL...rAYIGYWEGCIadatHPFCVCALLASEIpvlpETVV 117
DSSP HHHHhHHHHHHHhlLLHHHHH...hHHHHHHHHHHhhllLLLLHHHHHHLLHhhllHHHH
DSSP HHHHLHHHHHHhhhhhhhHHHHHLLL.LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHhhhl
Query DELTGDLKALIdeksaliAGWVKSGK.LAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEavtg 171
ident | | | | |
Sbjct LEVRAHFRSLSdwltavlERGIAQGRlVLTGTARANAEIFXATVHGAXLSArAHGD.... 173
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhhhhHHHHHLLLlLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL....
DSSP lllllhhhhhhhhhHHHHhHHLLLLLl
Query atlrdevffnqtveNVQRiIIEGIRPr 198
ident | |
Sbjct ........aatfgaITRP.XLERITA. 190
DSSP ........llhhhhHHHH.HHHHHLL.
No 35: 2FD5A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident || || | || | || ||
Sbjct msdKKTQTRARILGAATQALLERGAVEPSVGEVMGAAGLTVGGFYAHFQSKDALMLEAFE 60
DSSP lllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHLHHHHHLLllLLHHhHHHHHHHHHHHHH.HHLH....hhHHHHHHHHHL.LLLL
Query QILDIWLAPLKAFRedFAPLaAIKEYIRLKLEVS.RDYP....qaSRLFCMEMLA.GAPL 111
ident | | | |
Sbjct QLLGKRRELLGELD..PGLS.GKERRALAAAFYLsRKHRdaqvdaGCPLPATLAEvARLP 117
DSSP HHHHHHHHHHHLLL..LLLL.HHHHHHHHHHHHLlHHHHllllllLLLHHHHHHHhHHLL
DSSP ..LHHHHHlHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLH.HHHHh
Query ..LMDELTgDLKALIDEksaliagwvksgklapIDPQHLIFMIWASTQHYADFA.PQVEa 168
ident | |
Sbjct egFREVLS.RHVEIMVT...........slaesPEETDVALADLVLMIGGLALArALGP. 164
DSSP hhHHHHHH.HHHHHHHH...........hhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLL.
DSSP hHLLLLllhhhhHHHHHHHHhhhhllllll
Query vTGATLrdevffNQTVENVQriiiegirpr 198
ident |
Sbjct .GELSD...rvlRAAKQAVN.......... 180
DSSP .LHHHH...hhhHHHHHLLL..........
No 36: 1V7BA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident || || | | || | || | | ||| ||
Sbjct MRTSKKEMILRTAIDYIGEYSLETLSYDSLAEATGLSKSGLIYHFPSRHALLLGMHELLA 60
DSSP LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL.HHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHhhhHLHHHHHHHHHHHhLLLLLLHHHhhLH
Query DIWL.APLKAFREdFAPLAAIKEYIRLKLEvsrDYPQASRLFCMEMlAGAPLLMDEltGD 119
ident | | | || | | |
Sbjct DDWDkELRDITRDpEDPLERLRAVVVTLAE...NVSRPELLLLIDA.PSHPDFLNA.wRT 115
DSSP HHHHhHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLHHHHHHHHHH.HHLHHHHHH.hHH
DSSP HHHhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLHhhhHHHHhHHHHHHHHLH.HHHHhhhllLLLLHh
Query LKAlideksaliagwvksgklaPIDPqhlIFMIwASTQHYADFA.PQVEavtgaTLRDEv 178
ident |
Sbjct VNH........qwipdtddlenDAHKravYLVQ.LAADGLFVHDyIHDD.....VLSKS. 160
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DSSP HHHHHHHHHHHhHHLLllll
Query FFNQTVENVQRiIIEGirpr 198
ident | |
Sbjct KRQAMLETILE.LIPS.... 175
DSSP HHHHHHHHHHH.LLLL....
No 37: 2O7TA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFS.QFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVL 56
ident | | ||| ||| | || | |
Sbjct xraDALKRREHIITTTCNLYRtHHHD.SLTXENIAEQAGVGVATLYRNFPDRFTLDXACA 59
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLHH.HLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLHHHH.HLLL.LLLHHHhhhHHHHHHHHHHHHLHhhHHHHHHHHHLLL.LLLH
Query RQILDIWLAPLK.AFRE.DFAPLAaikEYIRLKLEVSRDYPqaSRLFCMEMLAGA.PLLM 113
ident | | | |
Sbjct QYLFNVVISLQLqAISTfPTDPEG...VWTSFNQLLFDRGL..GSLVPALAPESLdDLPD 114
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DSSP HHHhLHHHHHHHHHhhhhhhhhhllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHLHH.hhHHHHL.
Query DELtGDLKALIDEKsaliagwvksgklapidpqHLIFMIWASTQHYADFAP.qvEAVTG. 171
ident
Sbjct EVS.ALRRTTEKNT...ttlinlakqhglvhhdIAPGTYIVGLITISRPPItalATISEn 170
DSSP HHH.HHHHHHHHHH...hhhhhhhhhlllllllLLHHHHHHHHHHHLLLLLhhhLLLLLh
DSSP LLLLlhhhhhhhhHHHHHHHHLLllll
Query ATLRdevffnqtvENVQRIIIEGirpr 198
ident |
Sbjct SHKA.......llGLYLSGLKHG..xx 188
DSSP HHHH.......hhHHHHHHHHHL..ll
No 38: 2OERA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHhhhhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTfsqfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || || || |||| | ||| | |
Sbjct ..SELVASILEAAVQV......QRFTTARVAERAGVSIGSLYQYFPNKAAILFRLQSDEW 52
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHL......LLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHHHHHLL..llLLHHHHHhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHHHHH.llllllhHHHH
Query DIWLAPLKAFR..edFAPLAAIkeyirlklevsrdypqaSRLFCMEML.agapllmDELT 117
ident | || |
Sbjct RRTTRLLGEILedttRPPLERL.......rrlvlafvrsECEEAAIRValsdaaplYEAR 105
DSSP HHHHHHHHHHHhlllLLHHHHH.......hhhhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhlllLLHH
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...lllLLHHHHHHHHHHHHHHHH..HLHHHHhhhhll
Query gDLKALIDEKSALIAGWvKSGK...lapIDPQHLIFMIWASTQHYA..DFAPQVeavtga 172
ident || | |
Sbjct .EVKAEGARVFQAFLREaLPEVaeaersLAGDLLTTTLGAVGKQFSeqPRSEAE...... 158
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHH......
DSSP llllhhhhhhhHHHHHHHHHLLLL..ll
Query tlrdevffnqtVENVQRIIIEGIR..pr 198
ident |
Sbjct .......ieryAEALADXLCAYLAalge 179
DSSP .......hhhhHHHHHHHHHHHHHhhhl
No 39: 2GFNA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR PKSA RELATED
DSSP ..lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..avSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | || | | | || | | | ||
Sbjct ivdhDERRRALADAVLALIAREGISAVTTRAVAEESGWSTGVLNHYFGSRHELLLAALRR 60
DSSP llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHL.HHHHHLLllLLHHHhHHHHHHHHHHHHHH...LHHHHHHHHHHHHLLllLLHH
Query ILDIWL.APLKAFRedFAPLAaIKEYIRLKLEVSRD...YPQASRLFCMEMLAGapLLMD 114
ident || | | | |
Sbjct AGDIQGdRYRTILD.eEGAGP.IEKLRNITASILPLderRLAXTRVFLFFYAEG..TARG 116
DSSP HHHHHHhHHHHHHL.lLLLLH.HHHHHHHHHLLLLLlhhHHHHHHHHHHHHHHL..LLLH
DSSP HHHL.hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLH...hHHHHhh
Query ELTG.dlkalideksaliagwvksgklapidpqhlIFMIWASTQHYADFA...pQVEAvt 170
ident | | | | | |
Sbjct EIAAflarwrgvvresvvaaqregtvstdldadavTVALVALTDGLALQAildpVVXK.. 174
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHlllhHHHH..
DSSP llLLLLHhHHHHHHHHHHHHhhllllll
Query gaTLRDEvFFNQTVENVQRIiiegirpr 198
ident |
Sbjct ..AISAE.DAAARCVDAAVR.......r 192
DSSP ..HHLLL.LHHHHHHHHHHL.......l
No 40: 2DG7A MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAvlr 57
ident ||| | | ||| || ||| |
Sbjct xarWDPGAEQRLKRAALELYSEHGYDNVTVTDIAERAGLTRRSYFRYFPDKREVLFG... 57
DSSP lllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLLLHHHLL...
DSSP HHHH.......................hhLHHHhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhHHL
Query QILD.......................iwLAPLkafredfaplaaikeyirlklevsRDY 94
ident
Sbjct GSELlppavaravlaadpgaapltavldaXSQV...................gaqlvAQV 98
DSSP LLLLlhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhHHHH...................lllllLLL
DSSP HHHHHHHHHHHHLL..LLLLHHHHhLHHHHHH..............HHHHhhhhhhhhll
Query PQASRLFCMEMLAG..APLLMDELtGDLKALI..............DEKSaliagwvksg 138
ident |
Sbjct EGAAQRRAVIDASPelQERERTKS.AAISRAVqdalvrrqvdadtaELVA.......... 147
DSSP LLHHHHHHHHHLLHhhHHHHHHHH.HHHHHHHhhhhhhllllhhhhHHHH..........
DSSP llllllhHHHHHHHHHHHHHHHhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhHHHLLLLLL
Query klapidpQHLIFMIWASTQHYAdfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqrIIIEGIRPR 198
ident
Sbjct ....qlaTVAFGSAFRRWIDAE................ghadfgscldtvtDRLRAVLTG 187
DSSP ....hhhHHHHHHHHHHHHHLL................llllhhhhhhhhhHHHHHHHHL
No 41: 2IU5A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YCEG;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQ 58
ident | | | | | | | || | |
Sbjct meKSIITQKIIAKAFKDLMQSNAYHQISVSDIMQTAKIRRQTFYNYFQNQEELLSWIFEN 60
DSSP llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLHhhHHLLllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHLllllLHHHHH.
Query ILDIWLAplKAFRedfaplaaikeYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEMLAgaplLMDELT. 117
ident | |
Sbjct DFAELIN.dNSDY.........ygWQNELLLLLRYLDENQIFYQKIFVI....DKNFEHf 106
DSSP HHHHHHL.lLLLL.........llHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHH....LLLHHHh
DSSP ..lhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL..lLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhhhhll
Query ..gdlkalideksaliagwvKSGK..lAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAPqveavtga 172
ident | | |
Sbjct fliqwenlldkvifdqekksDYHWsdlEKSFiCRYNAAAICAITRESIIRGN........ 158
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLlhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........
DSSP llllhhhhhHHHHHHHHHHHLLLLLL.
Query tlrdevffnQTVENVQRIIIEGIRPR. 198
ident |
Sbjct ......sleKLYSQIVNLLLAQIKIFe 179
DSSP ......llhHHHHHHHHHHHHHHHLLl
No 42: 2NX4A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, TETR FAMILY PROTEIN;
DSSP .....LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLllLHHHHHHHLLLHHHHHHH
Query .....AVSA.KKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAgvSKTNLLYYFPSKEALYIA 54
ident | || | || | | || |
Sbjct gvpklVDHDeRRRSITAAAWRLIAARGIEAANMRDIATEAgyTNGALSHYFAGKDEILRT 60
DSSP lllhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHllLHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLHHhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHHHHHhllLLLL..
Query VLRQILDIWLAPlkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFCMEMlagAPLL.. 112
ident | | |
Sbjct SYEHISEATDRR....iaealgdatgldalrilcrevmpineeQLLEARIAaslWPRAmy 116
DSSP HHHHHHHHHHHH....hhhhhllllhhhhhhhhhhhhllllhhHHHHHHHHhhhHHHHll
DSSP ....HHHHHlHHHHHHHHHHHHHH..hhhHLLL...llllLHHHHHHHHHHHhhhhhHLH
Query ....MDELTgDLKALIDEKSALIA..gwvKSGK...lapiDPQHLIFMIWAStqhyaDFA 163
ident | | | |
Sbjct deqmAATNR.RTMDNWREQMAIFLeqareEGSVgdidvtiVVEQLLNMMMGM.qilgVLT 174
DSSP llhhHHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhhhhhHLLLllllhhhHHHHHHHHHHHH.hhhhHHL
DSSP HHHhhhhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHLLLLLl
Query PQVeavtgatlrdevffnqtvENVQRIIIEGIRPr 198
ident | |
Sbjct PGE...............tssERQLEMLEQFVAAl 194
DSSP LLL...............llhHHHHHHHHHHHHLl
No 43: 2DTZA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR QACR;
DSSP LHHHHH.HHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHhhhhllllHHHH.......hhHLLLHHHHH
Query AVSAKK.KAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQiaelagvsKTNL.......lyYFPSKEALY 52
ident | | | || |
Sbjct NLKDKIlGVAKELFIKNG....ynaTTTGE.......iVKLSesskgnlyyHFKTKENLF 49
DSSP LHHHHHhHHHHHHHHHHH....hhhLLHHH.......hHHHLlllhhhhhhHHLLHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHL.HHHHHLLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLhHHHHHhhhhHHLLL..
Query IAVLRQILDIWL.APLKAFRedFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYpQASRLfcmeMLAGA.. 109
ident | | | | | | |
Sbjct LEILNIEESKWQeQWKKEQIkaKTNREKFYLYNELSLTTEYYY.PLQNAiiefYTEYYkt 108
DSSP HHHHHHHHHHHHhHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLHHHhhhhHHHHLll
DSSP .LLLHHHHhLHHHhhhhhhHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHhhh
Query .PLLMDELtGDLKalidekSALIAGWVKSGKLAPIDPQHLIFMIWASTQHYADFAPQvea 168
ident | | |
Sbjct nSINEKMN.KLENkyidayHVIFKEGNLNGEWSINDVNAVSKIAANAVNGIVTFTHE... 164
DSSP hHHHHHHH.HHHHhhhhhhHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...
DSSP hhllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLll
Query vtgatlRDEVFFNQTVENVQRIIIEGIRpr 198
ident | |
Sbjct ......QNINERIKLMNKFSQIFLNGLS.. 186
DSSP ......LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
No 44: 2G7LA MOLECULE: TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ...lhhhhhhHHHH.....hhHHHHhhhllllllHHHHHHhlLLLHHhhhhhlLLHHHHH
Query ...avsakkkAILS.....aaLDTFsqfgfhgtrLEQIAElaGVSKTnllyyfPSKEALY 52
ident | |
Sbjct kpalsrrwivDTAValxraegLEKV........tXRRLAQ..ELDTG...pasLYVYVAN 47
DSSP lllllhhhhhHHHHhhhhhhlLLLL........lHHHHHH..HLLLL...hhhHLLLLLL
DSSP ..HHHHHHHHHHHLHHHHHLlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHhhllll
Query ..IAVLRQILDIWLAPLKAFredFAPLAAIKEYIRLKLEVSRDYPQASRLFCMEmlagap 110
ident | || |
Sbjct taELHAAVLDALLGEVDLTG..aEDWREQLRAVLTSYTLVLFAHPQLARSALVA...... 99
DSSP hhHHHHHHHHHHLLLLLLLL..lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHL......
DSSP llhhhhhLHHHhHHHH.hHHHHHHHHhllllLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLHHhhhH
Query llmdeltGDLKaLIDE.kSALIAGWVksgklAPID.PQHLIFMIWASTQHYADFAPqveA 168
ident | | | || |
Sbjct ...rpsgENYL.RLVErvLELLARSG.....APGAqVAWGVDKLLQDATATAAEQA..tS 148
DSSP ...llllHHHH.HHHHhhHHHHHLLL.....LLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..lL
DSSP HHL.................lllllhHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL......l
Query VTG.................atlrdeVFFNQTVENVQRIIIEGIRP......r 198
ident | ||
Sbjct ATVralrdadeathpaiashxpllvaGSAHDRLRWSFDVLVNGITRtpvpgpa 201
DSSP HHHhhhhhllllllhhhhhhllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllll
No 45: 2I10A MOLECULE: PUTATIVE TETR TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHhHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAiLSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | | | || | | | || | |
Sbjct ...DDQVA.LQTAXELFWRQGYEGTSITDLTKALGINPPSLYAAFGSKRDLFEKTLDRYX 56
DSSP ...LLHHH.HHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHL
DSSP HHHLHHHHHLLlLLLH.hhhhhhHHHH.....hhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhh
Query DIWLAPLKAFReDFAP.laaikeYIRL.....klevsrdypqasrlfcMEMLagapllmd 114
ident |
Sbjct CERTLQLEEAXvRPTAheavldfLTGRvevftgcxtvqaglasgephhEIVD........ 108
DSSP LLLHHHHHHHHlLLLHhhhhhhhHHHHhhhhllllllllllllllllhHHHH........
DSSP hhhLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...llLLLL..HHHHHHHHHHHhhhhhhlhhhhhhh
Query eltGDLKALIDEKSALIAGWVKSG...klAPID..PQHLIFMIWAStqhyadfapqveav 169
ident |
Sbjct lltAAREQXRQTVLDRFEKALADGdlpagTDCTalARYVXAAVYGL.............. 154
DSSP hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllLLHHhhHHHHHHHHHHH..............
DSSP hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....sveaasgapreeltaaailaaqvvp 179
DSSP ....hhhhhllllhhhhhhhhhhhhllll
No 46: 1L0OC MOLECULE: ANTI-SIGMA F FACTOR;
DSSP ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhhhh
Query ........AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealy 52
ident | | | || | |
Sbjct dgtvkvsrSLKEMGNKIRKAKDELSKTRGR.APTVTEIADHLGISPEDVVLAQE...... 53
DSSP llllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH......
DSSP hhhhhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllll
Query iavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapll 112
ident
Sbjct ............................................................ 53
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhll
Query mdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtga 172
ident
Sbjct ............................................................ 53
DSSP ............................................................
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query tlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ......................avrl 57
DSSP ......................hhhl
No 47: 2HXOA MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query avsAKKKAILSAALDTFSQFGFHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | || | | || | | |
Sbjct ...LSRERIVGAAVELLDTVGERGLTFRALAERLATGPGAIYWHITGKAELLGAATDAVV 57
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLHhhhhllllllhhHHHHHHHHhhhhhhhhLHHHhHHHHHHHhllLLLL.....HHH
Query DIWLAplkafredfaplAAIKEYIRlklevsrdYPQAsRLFCMEMlagAPLL.....MDE 115
ident | |
Sbjct TAAVT....agptgaadSPQDAVRAvalglwdaTEAH.PWLATQL...ATQLsrtpwGTV 109
DSSP HHHHL....llllllllLHHHHHHHhhhhhhhhHHHL.LHHHHHH...HHHHhhlllLLH
DSSP HhLHHHHHHHH.................................................
Query LtGDLKALIDE................................................. 126
ident
Sbjct A.PRIFESLGRqvqaxgvpeahwftassalxhyilgaagqnaandefldtvstawegldp 168
DSSP H.HHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhlllll
DSSP ..........................hhhHHHHHHHLLllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..........................ksaLIAGWVKSGklapidpqhlifmiwastqhya 160
ident |
Sbjct daypftravadqvrghddreqflagitlvLTGITALHR...................... 206
DSSP lllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhHHHHHLLLL......................
DSSP hlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query dfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .....................................p 207
DSSP .....................................l
No 48: 1XJEA MOLECULE: RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE, B12-DEPENDENT;
DSSP .........................................LHHHHHHHHHHHHHhHHHH
Query .........................................AVSAKKKAILSAALdTFSQ 19
ident | | |
Sbjct mklsdlisrwidvepsknaqiilrdryfmkdldgnyletkwEDVARRVARVVATA.ELLN 59
DSSP llhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllllllllllllhHHHHHHHHHHHHHH.HHHL
DSSP H.llLLLLHHHHHHHLLL............................lhhHHHHhlLLHHH
Query F.gfHGTRLEQIAELAGV............................sktNLLYyfPSKEA 50
ident | | | |
Sbjct PsykKNEKLDRIKEWEDIffrvlkarlfipnsptlfnaglgvkhdllwkPIDQ..MTLED 117
DSSP LlllHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhllleeelhhhhhhllllllhhhhllLHHH..LLHHH
DSSP HHHHHHHHhhHHHL......hhhhhlLLLL.LHHHHHHHHH...................
Query LYIAVLRQilDIWL......aplkafREDF.APLAAIKEYI................... 84
ident |
Sbjct YEEIYRSR..NHLHmlsacfvvpvgdSIEEiFEAVKEYALItkvgggvgsnfselrpkgs 175
DSSP HHHHHHHL..LLLLlllleeelllllLHHHhHHHHHHHHHHhhllleeeeelllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 84
ident
Sbjct fvagthgkasgpvsfmhvfnsaisvvkqgsrrrgalmgilninhpdieefidakkvlnff 235
DSSP eelllleelllhhhhhhhhhhhhllleellleelleeeeeelllllhhhhhlllllllle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 84
ident
Sbjct nlsvgfpmdkkeilklyeedgelelshprstirkkvkirelfrkiatnawksgdpglafl 295
DSSP eeeeellllhhhhhhhhhllleeeelllllllleeeehhhhhhhhhhhhhhhllleeelh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 84
ident
Sbjct gemnkyyplyphrkinstnpcgeiglsdyeacnlgsidvakfynngfvdlealqelvqia 355
DSSP hhhhhllllllllleeeelllllleeellleeeeeeeehhhheelleelhhhhhhhhhhh
DSSP ...........hHHHHhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...........rLKLEvsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliag 133
ident
Sbjct vrfldnvidvnvFPID............................................ 371
DSSP hhhhhhhhhhllLLLH............................................
DSSP hhhllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHHLH..............................
Query wvksgklapidpqhlifmiwaSTQHYADFA.............................. 163
ident
Sbjct .....................KITKAVKESrrlglgimgfadllykleipynsqeardfa 410
DSSP .....................HHHHHHHHHlleeeeeelhhhhhhhhllllllhhhhhhh
DSSP ........................HHHHHHH.............................
Query ........................PQVEAVT............................. 170
ident
Sbjct anlmafialhahrtsyelgkekgnFPLLEISryrtednfvpfamgmsnyddeirevmkmt 470
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLHHHLhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 170
ident
Sbjct kefrrnvalltiaptgsisniadtssglepnfllaytrfvtkedgtkepllyvnqvlrek 530
DSSP lllllllllllllllllhhhhllllllllllllleelleeellllleeelleelhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 170
ident
Sbjct lnpeilkriekeliekgslkdipdvpekikkvfvvaldidpmdhllmqdafqryvdnnis 590
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP .........llllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query .........gatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ktinmpqsatvddvlnvylealrtnvrgitvyrdgsl 627
DSSP lleeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeleeellll
No 49: 1TQIA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ........lhHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLlLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL......
Query ........avSAKKKAILSAALDTFsQFGFhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP...... 46
ident | | | | |
Sbjct mniaelygkmGKHSWRIMDAIFKNL.WDYE.YVPLQLISSHARIGEEKARNILKylsdlr 58
DSSP llhhhhhhllLHHHHHHHHHHHLLL.LLLL.LEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhll
DSSP ..........lhhhhhHHHHHHHH.........................hhhlhhHHHL.
Query ..........skealyIAVLRQIL.........................diwlapLKAF. 70
ident | |
Sbjct vvqnrqkdyegstftfIGLSLYSLhrlvrsgkvdaigklmgegkesavfncysekFGECv 118
DSSP leeeellllleeeelhHHHHHHHHhhhhhllllleeeeeeeellleeeeeeeellLEEEe
DSSP .........................lllllhhhhHHHHhhhhhhhhhhLHHHhhhhhhhh
Query .........................redfaplaaIKEYirlklevsrdYPQAsrlfcmem 105
ident
Sbjct vkfhkvkvkehfsvlairsarnefralqklqglaVPKV........yaWEGN........ 162
DSSP eeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLE........eeEELL........
DSSP hllllllhhhhhlhhhhhhhhhhHHHH.................................
Query lagapllmdeltgdlkalideksALIA................................. 132
ident
Sbjct .................avlmelIDAKelyrvrvenpdevldmileevakfyhrgivhgd 205
DSSP .................eeeeelLLLEehhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelll
DSSP .....hhHHLLLLllllhhhhhhhHHHHhhhhhhlhhhhhHHHLL...........llll
Query .....gwVKSGKLapidpqhlifmIWAStqhyadfapqveAVTGA...........tlrd 176
ident | |
Sbjct lsqynvlVSEEGI........wiiDFPQ..........svEVGEEgwreilerdvrniit 247
DSSP llllleeELLLLE........eelLLLL..........leELLLLlhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct yfsrtyrtekdinsaidrilqe 269
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhl
No 50: 2OBPA MOLECULE: PUTATIVE DNA-BINDING PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL......LHHH....
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP......SKEA.... 50
ident | | || | |
Sbjct gIDPAIVEVLLVLREAGIEngaTPWSLPKIAKRAQLPXSVLRRVLTqlqaagLADVsvea 60
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHLLLlllLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhllLEEEeell
DSSP ...........hhhhHHHHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhh
Query ...........lyiaVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasr 99
ident
Sbjct dgrghasltqegaalAAQLFP....................................... 81
DSSP llleeeeelhhhhhhHHHHLL.......................................
DSSP hhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhy 159
ident
Sbjct ............................................................ 81
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................... 81
DSSP .......................................
No 51: 2O3FA MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR YBBH;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSQfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP 46
ident | | || |
Sbjct xatgglaiiqsxxhXLPPSERKLADYILAHPHX..aiESTVNEISALANSSDAAVIRLCX 58
DSSP llllhhhhhhhhhhHLLHHHHHHHHHHHHLHHH..hhLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHH
DSSP .....LHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHH
Query .....SKEALYIavlrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLF 101
ident |
Sbjct slglkGFQDLXX............................................rvAG 74
DSSP hllllLHHHHHH............................................hhHH
DSSP HHHHHLLLlllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query CMEMLAGApllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyad 161
ident
Sbjct DLAKPTFQ.................................................... 82
DSSP HHHLHHHL....................................................
DSSP lhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query fapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ....................................g 83
DSSP ....................................l
No 52: 2NP3A MOLECULE: PUTATIVE TETR-FAMILY REGULATOR;
DSSP lhhhhhhhHHHHHHHHHhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhhhlllhHHHHHHHHH.HH
Query avsakkkaILSAALDTFsqfgfhgtrleqiaelagvsktnllyyfpskEALYIAVLR.QI 59
ident || || | |
Sbjct ........ILTAARVCF...............................YGTENLFLQaLE 21
DSSP ........LHHHHHHHL...............................LLLLHHHHHhHL
DSSP HHHHL.HHHHH.LLLL..lLHHHHHHHHHHHHHHHHHH..LHHHHHHhhhhHHLLllllh
Query LDIWL.APLKA.FRED..fAPLAAIKEYIRLKLEVSRD..YPQASRLfcmeMLAGapllm 113
ident | | || |
Sbjct LPGKIeEAITAaAQGGldgIGERVVRAHLSVWDDVSSRpaLXTXVRS...aARLR..... 73
DSSP HHHHHhHHHHHhLLLLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLhhHHHHHHL...lHHHH.....
DSSP hhhhlhhhHHHHHHHHHhhHHHH.lllllllLHHHHHHHHHHHHHHHhhlhhhhhhhhll
Query deltgdlkALIDEKSALiaGWVK.sgklapiDPQHLIFMIWASTQHYadfapqveavtga 172
ident
Sbjct ....etatGILARALGG..VITGedaxlrtsXVATQLVGLAXXRYVA............. 114
DSSP ....hhhhHHHHHHHLL..LLLLllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLL.............
DSSP llllhhhhhhHHHHhHHHHH.LLLL......ll
Query tlrdevffnqTVENvQRIII.EGIR......pr 198
ident |
Sbjct .....hleplASAD.TDTVArHYGRavqaivtd 141
DSSP .....llllhHHLL.HHHHHhHHHHhhhhhhll
No 53: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLhhhhhHHHHhhhh
Query avSAKKKAILSAALDtFSQFgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSkealyIAVLrqil 60
ident | | | | | |
Sbjct ..GSPEKILAQIIQE.HREG....LDWQEAATRASLSLEETRKLLQS.xaaaGQVT.... 48
DSSP ..LLHHHHHHHHHHL.LLLL....EEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH.hhhlLLEE....
DSSP hhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHHLL............
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCMEMLAG............ 108
ident
Sbjct ............................llrvendlyaisTERYQAWWqavtraleefhs 80
DSSP ............................eeeelleeeeeeHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................lllLHHHHHLHHH.......hhHHHHHH.......
Query .........................aplLMDELTGDLK.......alIDEKSA....... 129
ident | |
Sbjct ryplrpglareelrsryfsrlparvyqaLLEEWSREGRlqlaantvaLAGFTPsfsetqk 140
DSSP hlllllleehhhhhhhhlllllhhhhhhHHHHHHHLLLeeeelleeeELLLLLlllhhhh
DSSP .............................hhhhhhHLLL.LLLLlhhhhhhhhhhhhhhh
Query .............................liagwvKSGK.LAPIdpqhlifmiwastqhy 159
ident |
Sbjct kllkdledkyrvsrwqppsfkevagsfnldpseleELLHyLVRE................ 184
DSSP hhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllllhhhhhHHHHhHHHL................
DSSP hhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLL.....................
Query adfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegIRPR..................... 198
ident
Sbjct ...................................GVLVkindefywhrqalgearevik 209
DSSP ...................................LLEEellllleeehhhhhhhhhhhh
DSSP .................................................
Query ................................................. 198
ident
Sbjct nlastgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvkftrrvgdkrvvvgn 258
DSSP hhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 54: 2AO9A MOLECULE: PHAGE PROTEIN;
DSSP ..........lHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhh
Query ..........aVSAKKKAILSAALDTFSQfgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskea 50
ident || | | | |
Sbjct mmakldelkqkLTAKQIQAAYLLVENELM.eeEKRTQDEMANELGINRTTLWEWRTknqd 59
DSSP lhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHL.llLLLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhlhh
DSSP hhHHHHHHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhHHHHhhhhhhhllll
Query lyIAVLRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypQASRlfcmemlagap 110
ident
Sbjct fiAFKSEVAD..................................sFLAE........... 74
DSSP hhHHHHHHHH..................................hHHHL...........
DSSP llhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHLH.HHHHHH
Query llmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyADFA.PQVEAV 169
ident
Sbjct ................................................kREQVySKLMQL 86
DSSP ................................................lHHHHhHHHHHH
DSSP HL...llllLHHHHHHHHHhhhhhhhllllll
Query TG...atlrDEVFFNQTVEnvqriiiegirpr 198
ident |
Sbjct ILgpqpsvkAMQLYMQRFG.lltdkkviegdl 117
DSSP HHlllllhhHHHHHHHHLL.lleeeeeeeell
No 55: 2NR3A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP .....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLL..LHHHHHHHLL..........LLHHHHHH
Query .....aVSAKKKAILSAALDTFSQFgFHGT..RLEQIAELAG..........VSKTNLLY 43
ident || |
Sbjct naealqLNSTEVRILGCLIEKQATN.PETYplTLNALVIACNqktsrdpvxnLTQGQVGQ 59
DSSP llllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.HHHLleEHHHHHHHHLllllllllllLLHHHHHH
DSSP HLL..............lhhhHHHHhhhHHHHHhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query YFP..............skeaLYIAvlrQILDIwlaplkafredfaplaaikeyirlkle 89
ident
Sbjct SLRalegrgltrlvxgsradrWEHK...VDKGL........................... 89
DSSP HHHhhhhllleeeelllllleEEEL...HHHHH...........................
DSSP hhhHLHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query vsrDYPQASRlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli 149
ident |
Sbjct .elVPAQVIL.......................................tgllllrgpqt 109
DSSP .llLHHHHHH.......................................hhhhhhhllee
DSSP hhhhhhhhhhhHLHHhhhhhhlLLLL...lhhhhhhhhhhhhhhHHLLL...........
Query fmiwastqhyaDFAPqveavtgATLR...devffnqtvenvqriIIEGI........... 195
ident |
Sbjct vselltrsnrxHDFE.......DSEQvvhqlerliarglatlvpRQSGQredryxhligd 162
DSSP hhhhhhhllllLLLL.......LHHHhhhhhhhhhhllleeeelLLLLLllleeeellll
DSSP ...lll
Query ...rpr 198
ident
Sbjct pedlqd 168
DSSP hhhhll
No 56: 2IW5B MOLECULE: LYSINE-SPECIFIC HISTONE DEMETHYLASE 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct rkppkgmflsqedveavsanataattvlrqldmelvsvkrqiqnikqtnsalkekldggi 60
DSSP llllllllllhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ...............LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL.LLHHHHHHH
Query ...............AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYY 44
ident | | | |
Sbjct epyrlpeviqkcnarWTTEEQLLAVQAIRKYG.......RDFQAISDVIGnKSVVQVKNF 113
DSSP hhhllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHL.......LLHHHHHHHHLlLLHHHHHHH
DSSP LL..lhhhhHHHHHHhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhHHH
Query FP..skealYIAVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrLFC 102
ident | ||
Sbjct FVnyrrrfnIDEVLQ.........................................eWEA 132
DSSP HHhllllllHHHHHH.........................................hHHL
DSSP Hhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query Memlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadf 162
ident
Sbjct E........................................................... 133
DSSP L...........................................................
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query apqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .................................... 133
DSSP ....................................
No 57: 1BBYA MOLECULE: RAP30;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL.LHHH.........
Query AVSAKKKAILSAALDTFSQFGfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP.SKEA......... 50
ident | | | | | |
Sbjct RARADKQHVLDMLFSAFEKHQ..YYNLKDLVDITKQPVVYLKEILKeIGVQnvkgihknt 58
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHhHLLLlllllllll
DSSP ..hhhhhHHHHhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhll
Query ..lyiavLRQIldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlag 108
ident
Sbjct welkpeyRHYQ................................................. 69
DSSP lllllllLLLL.................................................
DSSP llllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhh
Query apllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqvea 168
ident
Sbjct ............................................................ 69
DSSP ............................................................
DSSP hhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query vtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .............................. 69
DSSP ..............................
No 58: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lghllrdvwsllneeerelldkeiqpfpckkastvfsegdipnnlfylyegkikilrrfh 60
DSSP lhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhleeeeelllleeellllllleeeeeeelleeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct isrivkpgqffgmrpyfaeetcsstaiavenskvlaipveaieallkgntsfcryflkal 120
DSSP eeeeelllleelhhhhhhlllllleeeellleeeeeeehhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......LLLLL.HHHHHHHLLLLH
Query ..............AVSAKKKAILSAALDTFSQFG.......FHGTR.LEQIAELAGVSK 38
ident | || | | |
Sbjct akelgyaerrtvtlTQKHVRGRLAETLLILKENFGfendgatLSIYLsREELATLSNMTV 180
DSSP hhhhhhhhhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllllLLLLLlHHHHHHHLLLLH
DSSP HHHHHHLL.........lhhhhHHHHhHHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhh
Query TNLLYYFP.........skealYIAVlRQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlkle 89
ident |
Sbjct SNAIRTLStfvsermlaldgkrIKII.DCDR............................. 210
DSSP HHHHHHHHhhhhllleeeelleEEEL.LHHH.............................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhh
Query vsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhli 149
ident
Sbjct ............................................................ 210
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query fmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct .........................................lqktarsg 218
DSSP .........................................hhhhhhhl
No 59: 2CJJA MOLECULE: RADIALIS;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLllLHHHHHHHLL.LLHHHHHHHLLlhhhhhhhhh
Query ...AVSAKKKAILSAALDTFsqFGFHgtRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPskealyiavl 56
ident || | | |
Sbjct grpWSAKENKAFERALAVYD..KDTP.dRWANVARAVEgRTPEEVKKHYE.......... 47
DSSP lllLLHHHHHHHHHHHHHLL..LLLL.lHHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHH..........
DSSP hhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllHHHH
Query rqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllMDEL 116
ident
Sbjct ..................................................ilvediKYIE 57
DSSP ..................................................hhhhhhHHHH
DSSP HLHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query TGDlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident |
Sbjct SGK......................................................... 60
DSSP HLL.........................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................vpf 63
DSSP ...................lll
No 60: 2HXIA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHH...HHLLlllLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFS...QFGFhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEALYIAVLR 57
ident || || | | | | | | | ||
Sbjct ..RWSTEQILDAAAELLLagdAETF...SVRKLAASLGTDSSSLYRHFRNKTELLRAVAD 55
DSSP ..LLLHHHHHHHHHHHHLlllLLLL...LHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHLHHHhHLLLlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHHHHhllLLLLHH...
Query QILDIWLAPLkAFREdfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlFCMEMlagAPLLMD... 114
ident || | |
Sbjct RILLSAXDGYrPEGD.............wkqrltavalrlresFGQQP.qlAAVWGRhgs 101
DSSP HHHHHHHLLLlLLLL.............hhhhhhhhhhhhhhhLLLLH.hhHHHHHHhll
DSSP ..hhhLHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllllLLHHHHHH......................
Query ..eltGDLKALIDEKSALiAGWVksgklapIDPQHLIF...................... 150
ident |
Sbjct ggtgsRLXXEEVLQALRA.SGLP......dDEIPARYHrlvilisslitaeggfrvavlg 154
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHH.LLLL......hHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllll
DSSP ...........hhhhhhhhhhhLHHHhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ...........miwastqhyadFAPQveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct adperfpalshfareirplgadRGAA................feeilaahlahleaaap 197
DSSP llllllhhhhhhhhhlllllllHHHH................hhhhhhhhhhhhhhhll
No 61: 1T6SA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLLHHHHHHHLLLLHHhhhhhlLLHHHHHHHHHHHHH
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAGVSKTnllyyfPSKEALYIAVLRQIL 60
ident | | | |
Sbjct .MQEQRQQLLRSLEALIFSS.eEPVNLQTLSQITAHKFT.....pSELQEAVDELNRDYE 53
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLLLLHHHHHHHLLLLLL.....hHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhHHHHhhhhhllllllhhhhhlhh
Query DIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqaSRLFcmemlagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct ATG................................rtFRIH................... 62
DSSP HHL................................llEEEE...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhHHHHhLHHHHHHHHL.........
Query kalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastQHYAdFAPQVEAVTG......... 171
ident
Sbjct ..........................aiaggyrfltEPEF.ADLVRQLLAPviqrrlsrs 95
DSSP ..........................eelleeeeeeLHHH.HHHHHHHHLLhhhhhhhhh
DSSP ........................................lllllhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........................................atlrdevffnqtvenvqrii 191
ident
Sbjct mlevlavvawhqpvtkgeiqqirgaspdysidrllarglievrgradspgrplqygttev 155
DSSP hhhhhhhhhhhlleehhhhhhhhllllllhhhhhhhllleeeeeellllllleeeeelhh
DSSP hllllll
Query iegirpr 198
ident
Sbjct fldlfhl 162
DSSP hhhhlll
No 62: 2NVUB MOLECULE: NEDD8-ACTIVATING ENZYME E1 REGULATORY SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kieegklviwingdkgynglaevgkkfekdtgikvtvehpdkleekfpqvaatgdgpdii 60
DSSP lllllleeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllhhhhhhhhhhllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct fwahdrfggyaqsgllaeitpdkafqdklypftwdavryngkliaypiavealsliynkd 120
DSSP eeehhhhhhhhhllllllllllhhhhllllllhhhhleelleeleeeeeeeeleeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct llpnppktweeipaldkelkakgksalmfnlqepyftwpliaadggyafkyengkydikd 180
DSSP lllllllllllhhhhhhhhhlllleeellllllhhhhhhhhhhllleeeeelllleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vgvdnagakagltflvdliknkhmnadtdysiaeaafnkgetamtingpwawsnidtskv 240
DSSP eelllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct nygvtvlptfkgqpskpfvgvlsaginaaspnkelakeflenylltdegleavnkdkval 300
DSSP lllllllllllllllllleeeeeeeelllllllhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ksyeeeatmenaqkgeimpnipqmsafwyavrtavinaasgrqtvdaalaaaqtnaaadw 360
DSSP hhhhlllhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct egrwnhvkkflersgpfthpdfepsteslqflldtckvlvigagglgcellknlalsgfr 420
DSSP llllhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhllleeeellllhhhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qihvidmdtidvsnlnrqflfrpkdigrpkaevaaeflndrvpncnvvphfnkiqdfndt 480
DSSP eeeeeelllllhhhhhllllllhhhllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeellhhhllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct fyrqfhiivcgldsiiarrwingmlisllnyedgvldpssivplidggtegfkgnarvil 540
DSSP hhhllleeeellllhhhhhhhhhhhhhllleelleelhhhllleeeeeeelleeeeeeel
DSSP ...........................lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..........
Query ...........................avSAKKKAILSAALDTFSQFGFH.......... 23
ident |
Sbjct pgmtaciectlelyppqvnfpmctiasmpRLPEHCIEYVRMLQWPKEQPFgegvpldgdd 600
DSSP llllllllllhhhllllllllhhhhhhllLLHHHHHHHHHHLHHHHHLLLllllllllll
DSSP llLHHHHHHHLL..........LLHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhllll
Query gtRLEQIAELAG..........VSKTNLLYYFPSkealyiavlrqildiwlaplkafred 73
ident | |
Sbjct peHIQWIFQKSLerasqynirgVTYRLTQGVVKR.......................... 634
DSSP hhHHHHHHHHHHhhhhhlllllLLHHHHHHHHHL..........................
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhLHHHHHHHHHHHHHHH
Query faplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltGDLKALIDEKSALIAG 133
ident | | |
Sbjct .......................................iipavASTNAVIAAVCATEVF 655
DSSP .......................................lllllHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLLLLLLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhHHHHHH.......
Query WVKSGKLAPIDpqHLIFmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffNQTVEN....... 186
ident | | | |
Sbjct KIATSAYIPLN.nYLVF.............ndvdglytytfeaerkeNCPACSqlpqniq 701
DSSP HHHHLLLLLLL.lEEEE.............ellllleeeeellllllLLLLLLllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 186
ident
Sbjct fspsaklqevldyltnsaslqmkspaitatlegknrtlylqsvtsieertrpnlsktlke 761
DSSP elllllhhhhhhhhhhllllllllleeeeeelleeeeeellllhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ................hhhhhhllllll
Query ................vqriiiegirpr 198
ident
Sbjct lglvdgqelavadvttpqtvlfklhfts 789
DSSP llllllleeeeellllllleeeeeeell
No 63: 2HEOA MOLECULE: Z-DNA BINDING PROTEIN 1;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLL..lhhHHHH.....
Query avSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP..skeALYI..... 53
ident || | | | | |
Sbjct ..DNLEQKILQVLSDDGG.....pVAIFQLVKKCQVPKKTLNQVLYrlkkeDRVSspspk 53
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHLL.....lEEHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHhhhhlLLEEeeell
DSSP ..HHHHhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllll
Query ..AVLRqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapl 111
ident
Sbjct ywSIGG...................................................... 59
DSSP eeEELL......................................................
DSSP lhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhl
Query lmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtg 171
ident
Sbjct ............................................................ 59
DSSP ............................................................
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query atlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ........................... 59
DSSP ...........................
No 64: 2DOBA MOLECULE: PROACTIVATOR POLYPEPTIDE;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHH.........lllLHHHHHHHLllhH
Query ..AVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAEL.........agvSKTNLLYYFpskE 49
ident | || | | | |
Sbjct gsLPCDICKDVVTAAGDXLKDNATeeEILVYLEKTcdwlpkpnxsasCKEIVDSYL...P 57
DSSP llHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLhhHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhHHHHHHHHH...H
DSSP HHHHHHHHhhHHHHlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlll
Query ALYIAVLRqiLDIWlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlaga 109
ident
Sbjct VILDIIKG..EXSR.............................................. 69
DSSP HHHHHLLL..LLLL..............................................
DSSP lllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhh
Query pllmdeltgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveav 169
ident
Sbjct ............................................................ 69
DSSP ............................................................
DSSP hllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query tgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ................pgevcsalnlces 82
DSSP ................hhhhhhhllllll
No 65: 2CFXA MOLECULE: HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR LRPC;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhhhhhHHHHhh
Query .aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyiAVLRqi 59
ident | |
Sbjct mkLDQIDLNIIEELKKDS......rLSMRELGRKIKLSPPSVTERVR.qlesfgIIKQ.. 51
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHLL......lLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhllLEEE..
DSSP hhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHH.............
Query ldiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEML............. 106
ident |
Sbjct .........................................ytLEVDqkklglpvscive 70
DSSP .........................................eeEEELlhhhllleeeeee
DSSP ........llllllhhhhhlhHHHH...........hhhhhhhhhhhhhllllllllhhH
Query ........agapllmdeltgdLKAL...........ideksaliagwvksgklapidpqH 147
ident
Sbjct atvknadyerfksyiqtlpniEFCYriagaacymlkinaesleavedfinktspyaqtvT 130
DSSP eeehhhlhhhhhhhhhlllleEEEEeeelllleeeeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeE
DSSP HHHHhhhhhhHHHHlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query LIFMiwastqHYADfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct HVIF.....sEIDT....................................k 140
DSSP EEEE.....eELLL....................................l
No 66: 1H88C MOLECULE: CAAT/ENHANCER BINDING PROTEIN BETA;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllLLHHHHHHHLL.LLHHHHHHHLLlhhHHHHhh
Query ....AVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgTRLEQIAELAG.VSKTNLLYYFPskeALYIav 55
ident ||
Sbjct gktrWTREEDEKLKKLVEQNG......tDDWKVIANYLPnRTDVQCQHRWQ.kvLNPE.. 51
DSSP llllLLHHHHHHHHHHHHHHL......lLLHHHHHHHLLlLLHHHHHHHHH.llLLLL..
DSSP hhhhhhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhLLLLLLHHH
Query lrqildiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlAGAPLLMDE 115
ident
Sbjct .....................likgpwtkeedqrviklvqkygpkrwsviaKHLKGRIGK 90
DSSP .....................lllllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhLLLLLLLHH
DSSP HHLHHHHHH......................................hHHHHHHHHHHHL
Query LTGDLKALI......................................dEKSALIAGWVKS 137
ident | |
Sbjct QCRERWHNHlnpevkktswteeedriiyqahkrlgnrwaeiakllpgrTDNAIKNHWNST 150
DSSP HHHHHHHHLlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHL
DSSP LLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
Query GKlapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriiiegirp 197
ident
Sbjct MR.......................................................... 152
DSSP LL..........................................................
DSSP l
Query r 198
ident
Sbjct . 152
DSSP .
No 67: 1B9MA MOLECULE: PROTEIN (MODE);
DSSP ................lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLLLLHHHHHHH
Query ................aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGVSKTNLLYY 44
ident | | | || |
Sbjct hxqaeilltlklqqklfADPRRISLLKHIALSG........SISQGAKDAGISYKSAWDA 52
DSSP lllleeeeeeeelleeeELHHHHHHHHHHHHHL........LHHHHHHHHLLLHHHHHHH
DSSP LL.....lhhHHHH......hHHHH................hhhhhlhhhhhlLLLLLHH
Query FP.....skeALYI......aVLRQ................ildiwlaplkafREDFAPL 77
ident | |
Sbjct INexnqlsehILVEratggavLTRYgqrliqlydllaqiqqkafdvlsdddalPLNSLLA 112
DSSP HHhhhhhhllLLEEelllleeELHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLHHH
DSSP HHHHHHHHhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhHHHH.
Query AAIKEYIRlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliaGWVK. 136
ident |
Sbjct AISRFSLQ........................................tsarnqwFGTIt 132
DSSP HHHHHLEE........................................ellleeeEEEEl
DSSP ......................................LLLL..................
Query ......................................SGKL.................. 140
ident
Sbjct ardhddvqqhvdvlladgktrlkvaitaqsgarlgldeGKEVlillkapwvgitqdeava 192
DSSP llllllllleeeeeellllleeeeellhhhhhhlllllLLEEeeeelhhhleeellhhhh
DSSP ........llllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ........apidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrdevffnqtvenvqriii 192
ident
Sbjct qnadnqlpgiishiergaeqcevlxalpdgqtlcatvpvneatslqqgqnvtayfnadsv 252
DSSP hllleeeeeeeeeeeellleeeeeeellllleeeeeeehhhhllllllleeeeeelhhhl
DSSP lLLLLL
Query eGIRPR 198
ident
Sbjct iIATLC 258
DSSP eEEEEL
No 68: 2NNNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ............................lHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHHHH
Query ............................aVSAKKKAILSAALDTFSqfgfhgTRLEQIAE 32
ident | | | |
Sbjct yrlddqigfilrqanqryaalfangigngLTPTQWAALVRLGETGP......CPQNQLGR 54
DSSP llhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHHHHHHLL......LLHHHHHH
DSSP HLLLLHHHHHHHLL..lhhHHHH.............hHHHHhhhhhlhhhhhllllllhh
Query LAGVSKTNLLYYFP..skeALYI.............aVLRQildiwlaplkafredfapl 77
ident | |
Sbjct LTAXDAATIKGVVErldkrGLIQrsadpddgrrllvsLSPA................... 95
DSSP HLLLLHHHHHHHHHhhhhlLLEEeeeelleeeeeeeeELHH...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query aaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksaliagwvks 137
ident
Sbjct ............................................................ 95
DSSP ............................................................
DSSP lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllLLHHHHhhhhhhhhhhhhlllll
Query gklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlRDEVFFnqtvenvqriiiegirp 197
ident
Sbjct ...............graeleaglaaareinrqalapLSLQEQ.......etlrgllarl 133
DSSP ...............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHH.......hhhhhhhhll
DSSP l
Query r 198
ident
Sbjct i 134
DSSP l
No 69: 2IA0A MOLECULE: PUTATIVE HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHLLlhhhhhHHHHHhhh
Query aVSAKKKAILSAALDTFsqfgfhGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPskealyIAVLRqil 60
ident || | |
Sbjct hLDDLDRNILRLLKKDA......RLTISELSEQLKKPESTIHFRIK.klqerGVIER... 50
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHLL......LLLHHHHHHHHLLLHHHHHHHHH.hhhhlLLEEE...
DSSP hhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhlhh
Query diwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcMEMLagapllmdeltgdl 120
ident |
Sbjct .........................................yTIIL...........geq 58
DSSP .........................................eEEEE...........lll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhLLLLL...lLLHHHHH..hhHHHH....................
Query kalideksaliagwvkSGKLA...pIDPQHLI..fmIWAS.................... 155
ident | |
Sbjct lkpkhlalivlevgkpEDFLEryisYISSTLSalpgVLFVaksgedkiialvgknnkdel 118
DSSP lllleeeeeeeeelllLHHHHhhhhHHHHHHHllllEEEEeeellleeeeeeeellllhh
DSSP ......hhhhhhlhhhhhhhhlLLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query ......tqhyadfapqveavtgATLRdevffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct vkfieenitsipnlkhiqifpiTEIK...........kgedltgflaev 156
DSSP hhhhhhhlllllleeeeeeeelLEEE...........elllhhhhhlll
No 70: 2CMPA MOLECULE: TERMINASE SMALL SUBUNIT;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHHHHLLL....LHHHHHHHLLLhhhhHHHHH
Query avSAKKKAILSAALDTFsqfgfhgtRLEQIAELAGV....SKTNLLYYFPSkealYIAVL 56
ident | | | ||
Sbjct klSPKQERFIEEYFIND.......mNATKAAIAAGYsknsASAIGAENLQK.paiRARID 52
DSSP llLHHHHHHHHHHHHLL.......lLHHHHHHHLLLllllHHHHHHHHHHL.hhhHHHHH
DSSP HHHHhhhlhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhh
Query RQILdiwlaplkafredfaplaaikeyirlklevsrdypqasrlfcmemlagapllmdel 116
ident
Sbjct ARLK........................................................ 56
DSSP HHHL........................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhllllll
Query tgdlkalideksaliagwvksgklapidpqhlifmiwastqhyadfapqveavtgatlrd 176
ident
Sbjct ............................................................ 56
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query evffnqtvenvqriiiegirpr 198
ident
Sbjct ...................... 56
DSSP ......................
No 71: 1STZA MOLECULE: HEAT-INDUCIBLE TRANSCRIPTION REPRESSOR HRCA
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllLLHHHHHHHLLL..LHHHHHHHLL............
Query aVSAKKKAILSAALDTFSQFGFhgTRLEQIAELAGV..SKTNLLYYFP............ 46
ident | | |
Sbjct kLNDRQRKVLYCIVREYIENKK.pVSSQRVLEVSNIefSSATIRNDMKkleylgyiyqph 59
DSSP lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.lLLHHHHHHHLLLllLHHHHHHHHHhhhhllleelll
DSSP lhhhHHHH..HHHH..............................................
Query skeaLYIA..VLRQ.............................................. 58
ident ||
Sbjct tsagRIPTdkGLRFyyeemlkisketseadlavetfksmpladpekvlflagnllarlte 119
DSSP llllLEELhhHHHHhhhhhhhhllllllllhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 58
ident
Sbjct gyvlierpntrdlkilrvmlipvsedylifsiltefgvskvtpiktqerlnweeierqln 179
DSSP leeeeelllhhhlllleeeeeelllleeeeeeeelleeeeeeeeellllllhhhhhhhhh
DSSP ................................................hhhhhlhhhhhl
Query ................................................ildiwlaplkaf 70
ident
Sbjct fllrgrtvgevlmgkieslkgsgflrliesligetveryldaglenllkdetltledirn 239
DSSP hhhllllhhhhhhlllhhhhllhhhhhhhhhhlllllleeeelhhhhhhlllllhhhhhh
DSSP lllllHHHHHHHHHHH.hHHHHhhlhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhlhhhhhhhhhhh
Query redfaPLAAIKEYIRL.kLEVSrdypqasrlfcmemlagapllmdeltgdlkalideksa 129
ident | |
Sbjct lleevKDQKFLESLVGegITVR...................................... 261
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Query DEVFfnqtvenvqriiiegirpr 198
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Sbjct YILN.........rlseyftsts 323
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No 72: 2EV0A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR MNTR;
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Query EVFFNQTVEN...vQRIIIEGIRPR 198
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Sbjct RIGDLVQYFEeddaRKKDLKSIQKK 131
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No 73: 2DT5A MOLECULE: AT-RICH DNA-BINDING PROTEIN;
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Query avSAKKKAILSAALDTFSQFG...fHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFP........... 46
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Sbjct kvPEAAISRLITYLRILEELEaqgvHRTSSEQLGGLAQVTAFQVRKDLSyfgsygtrgvg 60
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Query iIEGI.............................rpr 198
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Sbjct vLEVPkevavenvdflagltrlsfailnpkwreemmg 210
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No 74: 1J5YA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, BIOTIN REPRESSOR
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Query AVSAKKKAiLSAALDTFSQFgfHGTRLEQIAELAGVSKTNLLYYFPSKEAlyiavlrqil 60
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Query KaliDEKSaliagwvksgklapiDPQHLIFMIWASTQhyadfapqveavtgatlrdevff 180
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Sbjct A...VKHA..............pEEIKEELLCVVRNG...grivdvivehpvygeirgii 113
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Sbjct dvsseeevlKFVNLXEXAkteplltlsggvhlhtieapdeetxerixrelkkkgfliee 172
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No 75: 2IQCA MOLECULE: FANCONI ANEMIA GROUP F PROTEIN;
DSSP .......................................................lhhHH
Query .......................................................avsAK 5
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Sbjct edslmktqaelllerlqevrparflsslwerlpqnnflkviavallqpgsqvlvhwllGN 60
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Query KKAILSAALDTFSQFGFHGtrleqiaelagvsktnllyyfpsKEALYIAVLRQILDIWLA 65
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