DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1OMIB
MOLECULE: LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1OMI-A 34.9 0.5 224 224 100 LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN; "
2: 2HKX-A 17.0 2.8 194 218 13 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
3: 2GAU-A 16.4 2.8 193 218 17 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY; "
4: 2COH-A 15.1 3.1 180 194 14 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
5: 2CGP-A 14.6 2.7 175 200 17 PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN); "
6: 2H6B-A 14.0 10.1 141 239 18 CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K; "
7: 1O5L-A 13.2 3.1 127 129 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP FAMILY; "
8: 1FT9-A 12.1 3.7 132 210 11 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
9: 1Q3E-A 10.3 3.1 110 192 8 POTASSIUM/SODIUM HYPERPOLARIZATION-ACTIVATED "
10: 2BYV-E 10.2 3.6 140 922 9 RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4; "
11: 2PQQ-A 9.5 4.7 106 147 12 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
12: 1CX4-A 9.5 4.6 122 275 11 CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE REGULATORY SUBUNIT "
13: 1ZYB-A 8.0 4.3 127 230 8 TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY; "
14: 1U12-A 7.9 3.4 99 131 7 CYCLIC NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN; "
15: 2D93-A 7.0 2.9 92 134 5 RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 6; "
16: 1WGP-A 6.2 3.9 98 137 14 PROBABLE CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED ION CHANNEL 6; "
17: 2OYZ-A 5.5 3.5 75 94 7 UPF0345 PROTEIN VPA0057; "
18: 2Q30-A 5.4 2.9 74 105 8 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
19: 2OA2-A 5.3 3.2 77 132 9 BH2720 PROTEIN; "
20: 2PFW-A 5.1 3.0 73 112 5 CUPIN 2, CONSERVED BARREL DOMAIN PROTEIN; "
21: 2OPK-A 4.9 3.3 76 110 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
22: 2I45-A 4.9 3.1 71 96 6 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
23: 2DCT-A 4.9 3.4 73 105 7 HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0104; "
24: 2F4P-A 4.6 3.6 80 134 10 HYPOTHETICAL PROTEIN TM1010; "
25: 1XJA-A 4.5 2.8 82 165 5 ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN; "
26: 2PYT-A 4.3 3.3 74 128 5 ETHANOLAMINE UTILIZATION PROTEIN EUTQ; "
27: 1FXZ-A 4.3 4.2 80 371 13 GLYCININ G1; "
28: 2OZI-A 4.2 3.7 75 95 4 HYPOTHETICAL PROTEIN RPA4178; "
29: 2IC1-A 4.2 3.3 84 185 14 CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE 1; "
30: 2BNM-A 4.2 3.3 73 194 4 EPOXIDASE; "
31: 1Y9Q-A 4.2 3.3 71 178 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, HTH_3 FAMILY; "
32: 2CAU-A 4.1 6.7 90 344 8 PROTEIN (CANAVALIN); "
33: 1SEF-A 4.1 3.2 75 250 9 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
34: 2GM6-A 4.0 3.4 83 192 5 CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE I; "
35: 2D5F-A 4.0 5.9 90 384 7 GLYCININ A3B4 SUBUNIT; "
36: 2ET1-A 3.9 3.9 80 201 6 OXALATE OXIDASE 1; "
37: 2FD8-A 3.8 3.9 83 199 8 ALKYLATED DNA REPAIR PROTEIN ALKB; "
38: 2H0V-A 3.6 4.9 88 335 13 QUERCETIN 2,3-DIOXYGENASE; "
39: 1VR3-A 3.6 3.9 80 179 8 ACIREDUCTONE DIOXYGENASE; "
40: 1YFU-A 3.5 9.0 81 174 11 3-HYDROXYANTHRANILATE-3,4-DIOXYGENASE; "
41: 1J58-A 3.5 3.9 79 372 14 YVRK PROTEIN; "
42: 1J1L-A 3.5 7.0 87 288 9 PIRIN; "
43: 2D40-A 3.4 5.1 82 288 11 PUTATIVE GENTISATE 1,2-DIOXYGENASE; "
44: 2IXL-A 3.3 4.2 80 196 14 DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE; "
45: 1YUD-A 3.3 4.2 78 158 4 HYPOTHETICAL PROTEIN SO0799; "
46: 2HC8-A 3.0 3.3 61 113 8 CATION-TRANSPORTING ATPASE, P-TYPE; "
47: 1XE7-A 3.0 3.6 73 186 3 HYPOTHETICAL 22.5 KDA PROTEIN IN TUB1-CPR3 "
48: 1QWR-A 3.0 4.0 83 315 10 MANNOSE-6-PHOSPHATE ISOMERASE; "
49: 1MZE-A 3.0 3.6 82 335 7 FACTOR INHIBITING HIF1; "
50: 1GWK-A 2.9 5.1 72 141 7 NON-CATALYTIC PROTEIN 1; "
51: 2GAI-A 2.8 9.1 75 581 8 DNA TOPOISOMERASE I; "
52: 2ESN-A 2.7 4.8 64 299 14 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
53: 1PM4-A 2.7 3.2 60 117 3 YPM; "
54: 1J3P-A 2.7 3.8 80 187 5 PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE; "
55: 1Z05-A 2.5 2.2 52 396 12 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY; "
56: 1PMI-A 2.5 3.1 74 440 9 PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE; "
57: 1XMX-A 2.4 9.3 80 380 8 HYPOTHETICAL PROTEIN VC1899; "
58: 1UDX-A 2.3 6.5 86 412 7 THE GTP-BINDING PROTEIN OBG; "
59: 1LVA-A 2.3 2.7 48 258 0 SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR; "
60: 2DDU-A 2.1 3.7 70 301 9 REELIN; "
61: 1YRK-A 2.1 3.3 59 126 7 PROTEIN KINASE C, DELTA TYPE; "
-
No 1: 1OMIA MOLECULE: LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;
DSSP LHHHHHHHHHLLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
Query GSEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GSEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
DSSP LHHHHHHHHLLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
DSSP LLEEEELLLLLLLLLLLLLEEEELLLEEEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query GAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQV 120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQV 120
DSSP LLEEEELLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEELLLLLEEELLLHHHHHLLlllLHHHHHH
Query SYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELgysSAVSRII 180
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct SYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQEL...SAVSRII 177
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEELLEEEELLLLLLHHHL...LHHHHHH
DSSP HHHHHHLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHHHHHL
Query SKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN 227
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN 224
DSSP HHHHHLLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHHHLLL
No 2: 2HKXA MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP ..........LHHHHH.....hHHHLlLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEE
Query ..........GSEFKK.....yLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLT 45
ident | || |
Sbjct atqmrltdtnLLEVLNseeysgVLKE.FREQRYSKKAILYTPNTERNLVFLVKSGRVRVY 59
DSSP llllllllllHHHHLLllllllLLLL.LEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEE
DSSP EELLlLLEEEEEEEELLEEEELllllllllLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHHHHHLL
Query SISEnGTIMNLQYYKGAFVIMSgfidtetsVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKN 105
ident | | | |
Sbjct LAYE.DKEFTLAILEAGDIFCT........HTRAFIQAME.DTTILYTDIRNFQNIVVEF 109
DSSP EEEL.LEEEEEEEEELLLEEEL........LLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEELLLLLEEELLLhh
Query LTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDnl 165
ident | | | | | | ||| |
Sbjct PAFSLNMVKVLGDLLKLLLTIINGLVFKDARLRLAEFLVQAAMDTGLKVPQGIKLELG.. 167
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHLEEELLEEEEELL..
DSSP HHHLLL......lLLHHHHHHHHHHHHLLEEELLL.LEEELLHHHHHHHLHhhhhhhhhh
Query TMQELG......ySSAVSRIISKLKQEKVIVYKNS.CFYVQNLDYLKRYAPkldewfyla 218
ident | || | | | ||
Sbjct LNTEEIalmlgttRQTVSVLLNDFKKMGILERVNQrTLLLKDLQKLKEFSS......... 218
DSSP LLHHHHhhhhlllHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLLlEEEELLHHHHHHHLL.........
DSSP lhhhhhhhl
Query cpatwgkln 227
ident
Sbjct ......... 218
DSSP .........
No 3: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
DSSP ....LHHHHH.......hhHHLLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEell
Query ....GSEFKK.......ylETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSise 49
ident | | | | | || | |
Sbjct lghlLRDVWSllneeerelLDKEIQPFPCKKASTVFSEGDIPNNLFYLYEGKIKILR... 57
DSSP lhhhLHHHHLlllhhhhhhHHHHLEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELLEEEEL...
DSSP llLEEEEEEEELLEEE.ELLLLllLLLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHHHHHLLHHH
Query ngTIMNLQYYKGAFVI.MSGFIdtETSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTH 108
ident | | | || |
Sbjct ..RFHISRIVKPGQFFgMRPYF..AEETCSSTAIAVE.NSKVLAIPVEAIEALLKGNTSF 112
DSSP ..LLLEEEEELLLLEElHHHHH..HLLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHEELLlllEEELLLhhHH
Query FFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTY.VYGKETpdgIKITLDnlTM 167
ident | | | | | ||||
Sbjct CRYFLKALAKELGYAERRTVTLTQKHVRGRLAETLLILKEnFGFEND..gATLSIY..LS 168
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHhHLLLLL..lLLLLLL..LL
DSSP HLLL......lLLHHHHHHHHHHHHLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHhhhhhhhhhlhh
Query QELG......ySSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPkldewfylacpa 221
ident | | | | | | | |
Sbjct REELatlsnmtVSNAIRTLSTFVSERMLALDGKRIKIIDCDRLQKTAR............ 216
DSSP HHHHhhhllllHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEEELLHHHHHHHHH............
DSSP hhhhhl
Query twgkln 227
ident
Sbjct ....sg 218
DSSP ....hl
No 4: 2COHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhhhhhhhlllLLEEEELLLEEELLLLLL..LEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEE
Query gsefkkyletngiKPKQFHKKELIFNQWDPQ..EYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQY 58
ident | | | | | | | |
Sbjct .............ETVSFKAGDVILYPGVPGprDRAYRVLEGLVRLEAVDEEGNALTLRL 47
DSSP .............LLEEELLLLEEELLLLLLllLLLEEEEELLEEEEEELLLLLEEEEEE
DSSP EELLEEE.ELLLlllLLLLLLLEEEELLlEEEEEEEehhhHHHHHhllHHHHHHHHHHHH
Query YKGAFVI.MSGFidtETSVGYYNLEVISeQATAYVIkineLKELLsknLTHFFYVFQTLQ 117
ident | | | |
Sbjct VRPGGFFgEEAL...FGQERIYFAEAAT.DVRLEPL....PENPD...PELLKDLAQHLS 96
DSSP ELLLLEElLHHH...HLLLLLLEEEELL.LEEEEEL....LLLLL...HHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HEELLLLLEEELLlhhhHHLLL.....
Query KQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYV.YGKETPDGIKITLdnltMQELG..... 171
ident || | |
Sbjct QGLAEAYRRIERLATQRLKNRXAAALLELSETpLAHEEEGKVVLKA....THDELaaavg 152
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHLLLlLEEEELLEEEEEL....LHHHHhhhhl
DSSP .lLLHHHHHHHHHHHHLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query .ySSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPkldewfylacpatwgkln 227
ident | | | | | | || |
Sbjct svRETVTKVIGELAREGYIRSGYGKIQLLDLKGLKELAE...............srg 194
DSSP llHHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEEELLHHHHHHHHL...............lll
No 5: 2CGPA MOLECULE: PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);
DSSP lHHHHHHHHHLlLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
Query gSEFKKYLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
ident | | | | | | | | |
Sbjct .DPTLEWFLSH.CHIHKYPSKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGKEMILSYLN 58
DSSP .LHHHHHHHLL.LEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELLEEEEEELLLLLEEEEEEEL
DSSP LLEEE.ELLLLLLlLLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH
Query GAFVI.MSGFIDTeTSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQ 119
ident | | | | |
Sbjct QGDFIgELGLFEE.GQERSAWVRAKT.ACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARR 116
DSSP LLLEElHHHLLLL.LLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.EELLLLLEEElllhhhhhlLLLL.....
Query VSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVY.GKETPDGIKItldnltmqeLGYS..... 173
ident | | | || | ||| |
Sbjct LQVTSEKVGNLAFLDVTGRIAQTLLNLAKQPdAMTHPDGMQI........kITRQeigqi 168
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHLLLLlLEEELLEEEE........eLLHHhhhhh
DSSP .....LHHHHH.hhhhhHHLLEeelllLEEEllhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query .....SAVSRI.isklkQEKVIvyknsCFYVqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident | || | |
Sbjct vgcsrETVGRIlkmledQNLIS..ahgKTIV..........................vyg 200
DSSP hlllhHHHHHHhhhhhhLLLEE..eelLEEE..........................eel
No 6: 2H6BA MOLECULE: CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;
DSSP ...................LHHHHHHHHhlLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELE
Query ...................GSEFKKYLEtnGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGI 41
ident | | | ||| |
Sbjct veglgkdfcgaiipdnffpIEKLRNYTQ..MGLIRDFAKGSAVIMPGEEITSMIFLVEGK 58
DSSP lllleeeelleeeelllllLHHHHHLHH..HLEEEEELLLLEEELLLLLLLLEEEEEELL
DSSP EEEEEELLLLLEEEEEEEELLEEEELLlllllLLLL.LLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHH
Query TKLTSISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidteTSVG.YYNLEVISeQATAYVIKINELKE 100
ident || | | | | | | | | |
Sbjct IKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKL.....YPTGnNIYATAME.PTRTCWFSEKSLRT 112
DSSP EEEEEELLLLLEEEEEEELLLLEELLL.....LLLLlEEEEEELL.LEEEEEELHHHHHH
DSSP HHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhheellllleee
Query LLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFsiNGKLgsicgqlliltyvygketpdgiki 160
ident | | | | |
Sbjct VFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEM..NTYN........................ 146
DSSP HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LEEL........................
DSSP lllhhhhhllllllhhhHHHHHHHHHL.................................
Query tldnltmqelgyssavsRIISKLKQEK................................. 187
ident | |
Sbjct .................PTIRILRLFYelcssqgkrvgdtyeitmplsqksigeitgvhh 189
DSSP .................LLHHHHHHHHhhhhhhleeelleeeeellllhhhhhhhhlllh
DSSP ...................leeelllleEELLHhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query ...................vivyknscfYVQNLdylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct vtvsrvlaclkrenildkkknkiivynlGELKH.........lseqtsvdklaaaldhh 239
DSSP hhhhhhhhhhhhllleeellleeeellhHHHHH.........hhlllleehhhhhhlll
No 7: 1O5LA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP FAMILY;
DSSP lHHHHHhHHHLlLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
Query gSEFKKyLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
ident || | | | | | | || | | | | |||| |
Sbjct .MDLKK.LLPC.GKVIVFRKGEIVKHQDDPIEDVLILLEGTLKTEHVSENGKTLEIDEIK 57
DSSP .LLHHH.HHHH.LEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELLEEEEEELLLLLEEEEEEEL
DSSP LLEEEE.lLLLLLlLLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH
Query GAFVIM.sGFIDTeTSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQ 119
ident | | | || |
Sbjct PVQIIAsgFIFSS.EPRFPVNVVAGE.NSKILSIPKEVFLDLLMKDRELLLFFLKDVSEH 115
DSSP LLEELLhhHLLLL.LLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhh
Query VSYSLAKFNDFSINgklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsri 179
ident |
Sbjct FRVVSEKLFFLTTK.............................................. 129
DSSP HHHHHHHHHHHHLL..............................................
DSSP hhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query isklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ................................................ 129
DSSP ................................................
No 8: 1FT9A MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP .....LHHH......hHHHHhlLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELL
Query .....GSEF......kKYLEtnGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISE 49
ident | | | | || |
Sbjct pprfnIANVllspdgeTFFR..GFRSKIHAKGSLVCTGEGDENGVFVVVDGRLRVYLVGE 58
DSSP lllllLHHHhllllllLLLL..LLEEEEELLLLEEELLLLLLLLEEEEEELEEEEEEEEL
DSSP LlLEEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHH
Query NgTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTHF 109
ident | | | | |
Sbjct E.REISLFYLTSGDMFCMH........SGCLVEATE.RTEVRFADIRTFEQKLQTCPSMA 108
DSSP L.EEEEEEEEELLLEEELL........LLLEEEELL.LEEEEEELHHHHHHHHHHLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHH..........................................
Query FYVFQTLQKQVSYSLAKF.......................................... 127
ident |
Sbjct WGLIAILGRALTSCMRTIedlmfhdikqriagffidhanttgrqtgvivsvdftveeian 168
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlhhhhhhhhhhhhhllllllllllllleelllhhhhhh
DSSP .......hhhHHHHHHHHHHhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhHHHH
Query .......ndfSINGKLGSICgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavSRII 180
ident |
Sbjct ligssrqttsTALNSLIKEG......................yisrqgrghytipnLVRL 206
DSSP hhlllhhhhhHHHHHHHHLL......................lleellllleelllHHHH
DSSP HHHHhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query SKLKqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct KAAA........................................... 210
DSSP HHLL...........................................
No 9: 1Q3EA MOLECULE: POTASSIUM/SODIUM HYPERPOLARIZATION-ACTIVATED
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dssrrqyqekykqveqymsfhklpadfrqkihdyyehryqgkmfdedsilgelngplree 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllhhhhhh
DSSP ............LHHH.......hHHHHhLLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELE
Query ............GSEF.......kKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGI 41
ident | | | | | |
Sbjct ivnfncrklvasMPLFanadpnfvTAML.TKLKFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGV 119
DSSP hhhhhlhhhhhhLHHHhlllhhhhHHHH.LLLEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELL
DSSP EEEEEEllllleEEEEEEELLEEEE.lLLLLllLLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHH
Query TKLTSIsengtiMNLQYYKGAFVIM.sGFIDteTSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKE 100
ident | |
Sbjct VSVLTG......NKEMKLSDGSYFGeiCLLT..RGRRTASVRADT.YCRLYSLSVDNFNE 170
DSSP EEEELL......LLEEEELLLLEELhhHHHH..LLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHH
DSSP HHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleee
Query LLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgiki 160
ident |
Sbjct VLEEYPMMRRAFETVAIDRLDR...................................... 192
DSSP HHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL......................................
DSSP lllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlh
Query tldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacp 220
ident
Sbjct ............................................................ 192
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhl
Query atwgkln 227
ident
Sbjct ....... 192
DSSP .......
No 10: 2BYVE MOLECULE: RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4;
DSSP .............................LHHH....hHHHHhLLLLLEEEELLLEEELL
Query .............................GSEF....kKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQ 27
ident | | | |
Sbjct wiacldkrplerssedvdiiftrlkgvkaFEKFhpnllRQIC.LCGYYENLEKGITLFRQ 59
DSSP lhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlhhHLLLlhhhhHHHH.HHLEEEEELLLLEEELL
DSSP LLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLL..LEEEEEEEELLEEEELLLLllLLLLLLLEEEELL
Query WDPQEYCIFLYDGITKLTSISENG..TIMNLQYYKGAFVIMSGFIdtETSVGYYNLEVIS 85
ident | |
Sbjct GDIGTNWYAVLAGSLDVKVSETSShqDAVTICTLGIGTAFGESIL..DNTPRHATIVTRE 117
DSSP LLLLLEEEEEEELLEEEEELLLLLhhHLEEEEEELLLLEELHHHH..HLLLLLLEEEELL
DSSP lEEEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHhhHHHHH............................
Query eQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFyvFQTLQ............................ 117
ident | | | |
Sbjct .SSELLRIEQEDFKALWEKYRQYMA..GLLAPpygvmetgsnnvpsekilragkilriai 174
DSSP .LEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLLllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 117
ident
Sbjct lsraphmirdrkyhlktyrqccvgtelvdwmiqqtscvhsrtqavgmwqvlledgvlnhv 234
DSSP hhhlhhhleeeeelleeeeeeeehhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllleeel
DSSP .................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .................................kqvsyslakfndfsingklgsicgqll 144
ident
Sbjct dqerhfqdkylfyrfldderedaplpteeekkecdeelqdtmlllsqmgpdahmrmilrk 294
DSSP llllllllllleeeehhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP hhhhhheelLLLLEE......eLLLHhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeeLLLLE.e
Query iltyvygkeTPDGIK......iTLDNltmqelgyssavsriisklkqekvivyKNSCF.y 197
ident
Sbjct ppgqrtvddLEIIYDellhikaLSHL..........................sTTVKRel 328
DSSP lhhhllhhhHHHHHHhhlllhhHLLL..........................lHHHHHhh
DSSP ELLHHhhhhHLHH...............................................
Query VQNLDylkrYAPK............................................... 210
ident |
Sbjct AGVLI....FESHakggtvlfnqgeegtswyiilkgsvnvviygkgvvctlhegddfgkl 384
DSSP LLLLE....EEEEllllleeellllllleeeeeeelleeeeellleeeeeelllleelhh
DSSP .......hhhhhhHHLHHH.........................................
Query .......ldewfyLACPAT......................................... 222
ident |
Sbjct alvndapraasivLREDNChflrvdkedfnrilrdveantvrlkehdqdvlvlekvpaqq 444
DSSP hhlllllllleeeELLLLEeeeeeehhhhhhhhhhhhlleeeeelllleeeeeeelllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct kytvmsgtpekilehfletirlepslneatdsvlndfvmmhcvfmpntqlcpalvahyha 504
DSSP leeeeeelhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct qpsqgteqermdyalnnkrrvirlvlqwaamygdllqeddvamafleefyvsvsddarmm 564
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct aafkeqlpelekivkkrqpirgsdevlfkvycidhtyttirvpvaasvkevisavadklg 624
DSSP llllllllhhhhlllllllllllleeeeellllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct sgegliivkmnsggekvvlksndvsvfttltingrlfasltplpeqegpttgtvgtfelm 684
DSSP llllllleeellllleeelllllllllllllllleeellllllhhhhllllllllhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct sskdlayqmttydwelfncvheleliyhtfgrhnfkkttanldlflrrfneiqfwvvtev 744
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct clcsqlskrvqllkkfikiaahckeyknlnsffaivmglsnvavsrlaltweklpskfkk 804
DSSP hhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlhhhhllhhhhhhllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 222
ident
Sbjct fyaefeslmdpsrnhrayrltaaklepplipfmpllikdmtfthegnktfidnlvnfekm 864
DSSP hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllleehhhh
DSSP .....................................................hhhhl
Query .....................................................wgkln 227
ident
Sbjct rmiantartvryyrsqpfnpdaaqanknhqdvrsyvrqlnvidnqrtlsqmshrlepr 922
DSSP hhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlll
No 11: 2PQQA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ..lHHHH..............HHHHHLlLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEE
Query ..gSEFK..............KYLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKL 44
ident | | || | ||
Sbjct ghxDDVLrrnplfaalddeqsAELRAS.XSEVTLARGDTLFHEGDPGDRLYVVTEGKVKL 59
DSSP lhhHHHHllllllllllhhhhHHHHHH.LEEEEELLLLEEELLLLEELEEEEEEELLEEE
DSSP EEELLLLLEEEEEEEELLEEEElllllLLLLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHHHHHHL
Query TSISENGTIMNLQYYKGAFVIMsgfidTETSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSK 104
ident | | | | | |
Sbjct HRTSPDGRENXLAVVGPSELIG.elslFDPGPRTATGTALT.EVKLLALGHGDLQPWLNV 117
DSSP EEELLLLLEEEEEEELLLLEEL.hhhhLLLEELLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHH
DSSP LHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllh
Query NLTHFFyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldn 164
ident
Sbjct RPEVAT...................................................... 123
DSSP LLHHHH......................................................
DSSP hhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhHLHHhhhhhhhhlhhhhh
Query ltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkrYAPKldewfylacpatwg 224
ident
Sbjct .............................allravarrlrktNDAX..........lvfs 144
DSSP .............................hhhhhhhhhhhhhHLLL..........llll
DSSP hhl
Query kln 227
ident
Sbjct dgs 147
DSSP lll
No 12: 1CX4A MOLECULE: CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE REGULATORY SUBUNIT
DSSP .................LHHH..........hHHHHhLLLLLEEEELLLEEELLLLLLLE
Query .................GSEF..........kKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEY 33
ident | | | |
Sbjct riihpktddqrnrlqeaCKDIllfknldpeqmSQVL.DAMFEKLVKEGEHVIDQGDDGDN 59
DSSP lllllllhhhhhhhhhhHLLLhhhllllhhhhHHHH.HHLEEEEELLLLEEELLLLLLLE
DSSP EEEEEELEEEEEEELLlLLEEEEEEEELLEEEE.LLLLllLLLLLLLEEEELLlEEEEEE
Query CIFLYDGITKLTSISEnGTIMNLQYYKGAFVIM.SGFIdtETSVGYYNLEVISeQATAYV 92
ident | | | |
Sbjct FYVIDRGTFDIYVKCD.GVGRCVGNYDNRGSFGeLALM..YNTPRAATITATS.PGALWG 115
DSSP EEEEEELEEEEEEEEL.LEEEEEEEEELLLEELhHHHH..HLLLLLLEEEELL.LEEEEE
DSSP EEHHHHHHHH.HLLH........................hhhhHHHH.............
Query IKINELKELL.SKNL........................thffYVFQ............. 114
ident | |
Sbjct LDRVTFRRIIvKNNAkkrkmyesfieslpflkslevserlkvvDVIGtkvyndgeqiiaq 175
DSSP EEHHHHHHHHhHHHHhhhhhhhhhhhllhhhllllhhhhhhhhHHLEeeeelllleeell
DSSP hhhHHHH.............................hhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tlqKQVS.............................ysLAKFNDfsingklgsicgqlli 145
ident ||
Sbjct gdsADSFfivesgevritmkrngaveiarclrgqyfgeLALVTN................ 219
DSSP lllLLEEeeeeeeeeeeeeellleeeeeeelllleellHHHHHL................
DSSP hhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhh
Query ltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylk 205
ident
Sbjct ............................................................ 219
DSSP ............................................................
DSSP hhlhHHHHhhhhhlhhhHHHH.......................................
Query ryapKLDEwfylacpatWGKL....................................... 226
ident |
Sbjct ....KPRA........aSAHAigtvkclamdvqaferllgpcmeimkrniatyeeqlval 267
DSSP ....LLLL........lEEEEeeeeeeeeeehhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .......l
Query .......n 227
ident
Sbjct fgtnmdiv 275
DSSP hlllllll
No 13: 1ZYBA MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY;
DSSP .................LHHH...........hhHHHHLLLLLEEEELLLEEELLLLLLL
Query .................GSEF...........kkYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQE 32
ident | | | |
Sbjct sdkihhhhhhxetxfdtLLQLplfqglchedftsILDKVKLHFIKHKAGETIIKSGNPCT 60
DSSP llllllhhhhhhhhhllHHHLhhhllllhhhhhhHHHLLLLEEEEELLLLEEELLLLLLL
DSSP EEEEEEELEEEEEEELLLL.LEEEeEEEELLEEEE.lLLLLLlLLLLLLEEEELLlEEEE
Query YCIFLYDGITKLTSISENG.TIMNlQYYKGAFVIM.sGFIDTeTSVGYYNLEVISeQATA 90
ident || | |
Sbjct QLCFLLKGEISIVTNAKENiYTVI.EQIEAPYLIEpqSLFGX.NTNYASSYVAHT.EVHT 117
DSSP EEEEEEELEEEEEEELHHHlLEEE.EEEELLEEELhhHHLLL.LLLLLLEEEELL.LEEE
DSSP EEEEHHHHH.HHHHlLHHHHHHHHHHHHHHHH............................
Query YVIKINELK.ELLSkNLTHFFYVFQTLQKQVS............................ 121
ident | |
Sbjct VCISKAFVLsDLFR.YDIFRLNYXNIVSNRAQnlysrlwdeptldlkskiirfflshcek 176
DSSP EEEEHHHHHhLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllllhhhhhhhhhhlllll
DSSP ....................hhhhhhhhhHHHH.hHHHH......hHHHHHhhhhheell
Query ....................yslakfndfSING.kLGSI......cGQLLIltyvygket 154
ident
Sbjct pqgektfkvkxddlarclddtrlnisktlNELQdnGLIElhrkeilIPDAQ......... 227
DSSP lllleeeellhhhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHhlLLLEeelleeeELLHH.........
DSSP llleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhh
Query pdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldew 214
ident
Sbjct ............................................................ 227
DSSP ............................................................
DSSP hhhhlhhhhhhhl
Query fylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ..........kll 230
DSSP ..........hhl
No 14: 1U12A MOLECULE: CYCLIC NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN;
DSSP .......LHHHH..............HHHHhLLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEE
Query .......GSEFK..............KYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYD 39
ident | | |
Sbjct rrgdfvrNWQLVaavplfqklgpavlVEIV.RALRARTVPAGAVICRIGEPGDRMFFVVE 59
DSSP llhhhhhHHHHHhlllllllllhhhhHHHH.LLLEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEE
DSSP LEEEEEEellllleEEEEEEELLEEEElLLLLlLLLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHHHH
Query GITKLTSisengtiMNLQYYKGAFVIMsGFIDtETSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELK 99
ident | |
Sbjct GSVSVAT.......PNPVELGPGAFFGeMALI.SGEPRSATVSAAT.TVSLLSLHSADFQ 110
DSSP LLEEEEL.......LLLEEELLLLEELhHHHL.LLLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHH
DSSP HHHHLLHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheelllllee
Query ELLSKNLTHFFyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgik 159
ident | |
Sbjct MLCSSSPEIAE................................................. 121
DSSP HHHHHLLHHHH.................................................
DSSP elllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhl
Query itldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylac 219
ident
Sbjct ..........................................................if 123
DSSP ..........................................................hh
DSSP hhhhhhhl
Query patwgkln 227
ident
Sbjct rktalear 131
DSSP hhhhhhhl
No 15: 2D93A MOLECULE: RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 6;
DSSP ....................LHHH.......hHHHHhLLLLLEEEE.LLLEEELLLLLLL
Query ....................GSEF.......kKYLEtNGIKPKQFH.KKELIFNQWDPQE 32
ident | | |
Sbjct gssgssgdddieqllefmhqLPAFanmtmsvrRELC.SVMIFEVVEqAGAIILEDGQELD 59
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhLLLLllllhhhhHHHL.LLEEEEEELlLLLEEELLLLEEL
DSSP EEEEEEELEEEEEEELllllEEEEeEEELLEEEElllLLLLlLLLLLEEEELLLEEEEEE
Query YCIFLYDGITKLTSISengtIMNLqYYKGAFVIMsgfIDTEtSVGYYNLEVISEQATAYV 92
ident |
Sbjct SWYVILNGTVEISHPD....GKVE.NLFMGNSFGitpTLDK.QYMHGIVRTKVDDCQFVC 113
DSSP EEEELLLLLEEEELLL....LLEE.EELLLLEELlllLLLL.EELLLEEEELLLLEEEEE
DSSP EehhHHHHHHHLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhee
Query IkinELKELLSKNLthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygk 152
ident |
Sbjct I...AQQDYWRILN.............................................. 124
DSSP E...EHHHHHHHLL..............................................
DSSP llllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhh
Query etpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkld 212
ident
Sbjct ............................................................ 124
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhl
Query ewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .....hveksgpssg 134
DSSP .....llllllllll
No 16: 1WGPA MOLECULE: PROBABLE CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED ION CHANNEL 6;
DSSP .......LHHH..........hhHHHHlLLLLEEEELLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEE
Query .......GSEF..........kkYLETnGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITK 43
ident || | | || | |
Sbjct gssgssgVRRVplfenmderlldAICE.RLKPCLFTEKSYLVREGDPVNEMLFIIRGRLE 59
DSSP lllllllLLLLlhhhlllhhhhhHHHH.HLLLLLLLLLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLE
DSSP EEEELLL..lLEEEeEEEELLEEEELL...LLLL.....llLLLLLEEEELLlEEEEEEE
Query LTSISEN..gTIMNlQYYKGAFVIMSG...FIDT.....etSVGYYNLEVISeQATAYVI 93
ident | |
Sbjct SVTTDGGrsgFYNR.SLLKEGDFCGDElltWALDpksgsnlPSSTRTVKALT.EVEAFAL 117
DSSP EELLLLLlllLLLE.EELLLLLLLLLHhhhHHHLlllllllLLLLLEEEELL.LLEEEEE
DSSP EHHHHHHHHHLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheel
Query KINELKELLSKNLthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygke 153
ident ||| |
Sbjct IADELKFVASQFR............................................... 130
DSSP EHHHHHHHHHHHL...............................................
DSSP lllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhh
Query tpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapklde 213
ident
Sbjct ............................................................ 130
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhlhhhhhhhl
Query wfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .......rsgpssg 137
DSSP .......lllllll
No 17: 2OYZA MOLECULE: UPF0345 PROTEIN VPA0057;
DSSP .........lhhhhhhHHHL...LLLLEEEELLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEEL
Query .........gsefkkyLETN...GIKPKQFHKKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSIS 48
ident | |
Sbjct asikensyfaggvkslGFNQhgqDVSVGVXLPGEY..TFGTQAPERXTVVKGALVVKRVG 58
DSSP llleeeeehhhleeeeEEEElleEEEEEEELLEEE..EEEELLLEEEEEEELEEEEEELL
DSSP llllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHhhhhhhhhllhhh
Query engtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVIKInelkellsknlth 108
ident | | |
Sbjct ....EADWTTYSSGESFDVE......GNSSFELQVKD.ATAYLCEYL............. 94
DSSP ....LLLLEEEELLLEEEEL......LLEEEEEEELL.LEEEEEELL.............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhh
Query ffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmq 168
ident
Sbjct ............................................................ 94
DSSP ............................................................
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query elgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ........................................................... 94
DSSP ...........................................................
No 18: 2Q30A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
DSSP lhhhhhhhhHLLLL.........................LEEEELLLEeELLLLL...lL
Query gsefkkyleTNGIK.........................PKQFHKKELiFNQWDP...qE 32
ident | |
Sbjct ........xKSHNLleavrfddqrfvxelvhesenfkivSFTFKAGQE.LPVHSHniegE 51
DSSP ........lEEEELllllllllllleeeeeeelllleeeEEEELLLLE.EEEELLllllE
DSSP EEEEEEELEEEEEEElllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlEEEEEE
Query YCIFLYDGITKLTSIsengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYV 92
ident | | | |
Sbjct LNIVVLEGEGEFVGD.....GDAVIPAPRGAVLVAP......ISTPHGVRAVT.DXKVLV 99
DSSP EEEEEEELLEEEELH.....HHLEEEELLLEEEEEE......LLLLEEEEELL.LEEEEE
DSSP EEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhee
Query IKINElkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygk 152
ident
Sbjct TIAPP....................................................... 104
DSSP EEELL.......................................................
DSSP llllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhh
Query etpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkld 212
ident
Sbjct ............................................................ 104
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhl
Query ewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ..............i 105
DSSP ..............l
No 19: 2OA2A MOLECULE: BH2720 PROTEIN;
DSSP .........lhHHHHH.............hhhlllllEEEELLLEEELLL.lLLLEEEEE
Query .........gsEFKKY.............letngikpKQFHKKELIFNQW.dPQEYCIFL 37
ident | |
Sbjct vtdhgprpfvvNIEDEtkrnrafrralwtgdhlqvtlXSIQVGEDIGLEIhpHLDQFLRV 60
DSSP lllllllllllLHHHHhhhlllleeeeeelllleeeeEEELLLLLLLLLLllLLEEEEEE
DSSP EELEEEEEEElllLLEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEEEEEHH
Query YDGITKLTSIsenGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKIN 96
ident | | | | |
Sbjct EEGRGLVQXGhrqDNLHFQEEVFDDYAILIP......AGTWHNVRNTGnRPLKLYSIYAP 114
DSSP EELEEEEEEElllLLLLEEEEEELLLEEEEL......LLLEEEEEELLlLLEEEEEEEEL
DSSP Hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellll
Query Elkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpd 156
ident
Sbjct P........................................................... 115
DSSP L...........................................................
DSSP leeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhh
Query gikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfy 216
ident
Sbjct ......................................................qhphgt 121
DSSP ......................................................llllll
DSSP hhlhhhhhhhl
Query lacpatwgkln 227
ident
Sbjct vhetkaiaxaa 132
DSSP eellhhhhhhl
No 20: 2PFWA MOLECULE: CUPIN 2, CONSERVED BARREL DOMAIN PROTEIN;
DSSP ..................lhhhhhhHHHL....lLLLEEEELLLEeELLLLL.LLEEEEE
Query ..................gsefkkyLETN....gIKPKQFHKKELiFNQWDP.QEYCIFL 37
ident | |
Sbjct xqqsehfsfgeqteiediggglkrqXLGFnhelxAVKIWFDKGAE.GYVHAHrHSQVSYV 59
DSSP lllllleellllllleelllleeeeEEEEelleeEEEEEELLLEE.EEEELLlLEEEEEE
DSSP EELEEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLlllllLLLLlLEEEELLlEEEEEEEEHHH
Query YDGITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidteTSVGyYNLEVISeQATAYVIKINE 97
ident | |
Sbjct VEGEFHVN......vdGVIKVLTAGDSFFVP.....PHVD.HGAVCPT.GGILIDTFSPA 106
DSSP EEELEEEE......elLEEEEELLLLEEEEL.....LLLL.EEEEELL.LEEEEEEEELL
DSSP hhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheelllll
Query lkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdg 157
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP eeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query ikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfyl 217
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP hlhhhhhhhl
Query acpatwgkln 227
ident
Sbjct ....redfve 112
DSSP ....lhhhll
No 21: 2OPKA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ...............lhhhhhhHHHL....lLLLEEEELLLE..eeLLLLLLLEEEEEEE
Query ...............gsefkkyLETN....gIKPKQFHKKEL..ifNQWDPQEYCIFLYD 39
ident | ||
Sbjct xdpkhgnlfadvpvgapdeifqPLLErkglkIERIISNGQASppgfWYDSPQDEWVXVVS 60
DSSP llleeeelllllllllllleeeEEEEelleeEEEEEELLLLLllllLLLLLLEEEEEEEE
DSSP LEEEEEEELllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLL..EEEEEEEEHHh
Query GITKLTSISengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISE..QATAYVIKINe 97
ident |
Sbjct GSAGIECEG....DTAPRVXRPGDWLHVP......AHCRHRVAWTDGgePTVWLAVHCD. 109
DSSP LLEEEEELL....LLLLEEELLLEEEEEL......LLLLEEEEEELLllLEEEEEEEEL.
DSSP hhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheelllll
Query lkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdg 157
ident
Sbjct ............................................................ 109
DSSP ............................................................
DSSP eeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query ikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfyl 217
ident
Sbjct ............................................................ 109
DSSP ............................................................
DSSP hlhhhhhhhl
Query acpatwgkln 227
ident
Sbjct .........a 110
DSSP .........l
No 22: 2I45A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP lhhhhHHHHH..................llllLEEEELLLeeeLLLLlLLEEEEEEELEE
Query gsefkKYLET..................ngikPKQFHKKElifNQWDpQEYCIFLYDGIT 42
ident | | |
Sbjct ...etINLKQhlaaikeywqpeiinrhgfqfhLVKLLGDY..gWHTH.SDKVLFAVEGDX 54
DSSP ...llEEHHHhhhhllllllleeeeelleeeeEEEEEEEL..lLLLL.LLEEEEELLLLE
DSSP EEEEElllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlEEEEEEEEHHhhhhhh
Query KLTSIsengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVIKINelkell 102
ident |
Sbjct AVDFA.....DGGSXTIREGEXAVVP......KSVSHRPRSEN.GCSLVLIELS...... 96
DSSP EEEEL.....LLLEEEELLLEEEEEL......LLLLEEEEEEE.EEEEEEEELL......
DSSP hllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeell
Query sknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitl 162
ident
Sbjct ............................................................ 96
DSSP ............................................................
DSSP lhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhh
Query dnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpat 222
ident
Sbjct ............................................................ 96
DSSP ............................................................
DSSP hhhhl
Query wgkln 227
ident
Sbjct ..... 96
DSSP .....
No 23: 2DCTA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0104;
DSSP ..lhHHHH...............hhhhllLLLEEEELLLEEELLLLL.LLEEEEEEELEE
Query ..gsEFKK...............yletngIKPKQFHKKELIFNQWDP.QEYCIFLYDGIT 42
ident | |
Sbjct meikDLKRlarynpekmakipvfqsermlYDLYALLPGQAQKVHVHEgSDKVYYALEGEV 60
DSSP leeeELHHhlllllllleeeeeeelllleEEEEEELLLLEEEEELLLlLEEEEEEEELLE
DSSP EEEeellllleeeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEEEEEHHHhhhh
Query KLTsisengtimnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINElkel 101
ident | | |
Sbjct VVR......vgeeEALLAPGMAAFAP......AGAPHGVRNESaSPALLLVVTAPR.... 104
DSSP EEE......elleEEEELLLEEEEEL......LLLLEEEELLLlLLEEEEEEEELL....
DSSP hhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeel
Query lsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikit 161
ident
Sbjct ............................................................ 104
DSSP ............................................................
DSSP llhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhh
Query ldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpa 221
ident
Sbjct ............................................................ 104
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhl
Query twgkln 227
ident
Sbjct .....p 105
DSSP .....l
No 24: 2F4PA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TM1010;
DSSP ................lhhhhhhHHHL........llLLEEEELLLEeELLLL.LLLEEE
Query ................gsefkkyLETN........giKPKQFHKKELiFNQWD.PQEYCI 35
ident | |
Sbjct vddifergskgssdfftgnvwvkXLVTdengvfntqvYDVVFEPGAR.THWHShPGGQIL 59
DSSP lhhhlllleellllleelleeeeEEELlllllllleeEEEEELLLLE.ELLEElLLLEEE
DSSP EEEELEEEEEEELlllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEEEEE
Query FLYDGITKLTSISengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIK 94
ident | | | | |
Sbjct IVTRGKGFYQERG.....KPARILKKGDVVEIP......PNVVHWHGAAPdEELVHIGIS 108
DSSP EEEEEEEEEEELL.....LLLEEEELLLEEEEL......LLLLEEEEELLlLLEEEEEEE
DSSP HHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheell
Query INElkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygket 154
ident
Sbjct TQV.................................................hlgpaewl 119
DSSP LLH.................................................hhllleel
DSSP llleeelllhhHHHLlllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhh
Query pdgikitldnlTMQElgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldew 214
ident |
Sbjct gsvteeeyrkaTEGK............................................. 134
DSSP llllhhhhhhhHLLL.............................................
DSSP hhhhlhhhhhhhl
Query fylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ............. 134
DSSP .............
No 25: 1XJAA MOLECULE: ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN;
DSSP .lhhhhhhhhhllLLLEEEE.....LLLEeeLLLL..LLLEEEEEEELEEEEEEElllll
Query .gsefkkyletngIKPKQFH.....KKELifNQWD..PQEYCIFLYDGITKLTSIsengt 52
ident |
Sbjct pllpgysfnahlvAGLTPIEangvlDFFI..DRPLgmKGYILNLTIRGQGVVKNQ..... 53
DSSP llllllllllleeEEEEEEElllllLLEE..EELLllLLEEEEEEEEELEEEEEL.....
DSSP eEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEEL..LLEEEEEEEEHH..............
Query iMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI..SEQATAYVIKIN.............. 96
ident
Sbjct .GREFVCRPGDILLFP......PGEIHHYGRHpeAREWYHQWVYFRpraywhewlnwpsi 106
DSSP .LEEEEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELllLLEEEEEEEEELllhhhhhhllllee
DSSP .....................................hhHHHHHLLHHHHHhhhhhhhhh
Query .....................................elKELLSKNLTHFFyvfqtlqkq 119
ident || |
Sbjct fantgffrpdeahqphfsdlfgqiinagqgegrysellaINLLEQLLLRRM......... 157
DSSP elleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhHHHHHHHHHHHH.........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhh
Query vsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsri 179
ident
Sbjct ............................................................ 157
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query isklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ........................................eaineslh 165
DSSP ........................................hhhhhlll
No 26: 2PYTA MOLECULE: ETHANOLAMINE UTILIZATION PROTEIN EUTQ;
DSSP ................lhhhhHHHHH...........................lllLLEE
Query ................gsefkKYLET...........................ngiKPKQ 17
ident |
Sbjct lelgtxqpsftsvtgkggvkvIDGSSvkfgrfdgaephcvgltdlvteqdgssxaaGFXQ 60
DSSP llllllllllleeellllleeELHHHllleelhhhllllleeeeeelhhhlllleeEEEE
DSSP EELLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEEllllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLL
Query FHKKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSIsengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVG 77
ident | | |
Sbjct WDNAFF..PWTLNYDEIDXVLEGELHVRHE......GETXIAKAGDVXFIP......KGS 106
DSSP EEEEEE..EEELLLEEEEEEEEEEEEEEEL......LEEEEEELLLEEEEL......LLL
DSSP LLEEEELlLEEEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query YYNLEVIsEQATAYVIKINElkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklg 137
ident
Sbjct SIEFGTP.TSVRFLYVAWPA........................................ 125
DSSP EEEEEEE.EEEEEEEEEELL........................................
DSSP hhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeellllee
Query sicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfy 197
ident
Sbjct ............................................................ 125
DSSP ............................................................
DSSP ellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query vqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ...........................nwq 128
DSSP ...........................lll
No 27: 1FXZA MOLECULE: GLYCININ G1;
DSSP ......................................lhhHHHH.............hh
Query ......................................gseFKKY.............le 9
ident
Sbjct necqiqklnalkpdnriesegglietwnpnnkpfqcagvalSRCTlnrnalrrpsytngp 60
DSSP llllllllllllllleeeelleeeeelllllhhhhhhlleeEEEEellleeeeeeeelll
DSSP hLLLL.......................................................
Query tNGIK....................................................... 14
ident
Sbjct qEIYIqqgkgifgmiypgcpstrhqkiynfregdliavptgvawwmynnedtpvvavsii 120
DSSP eEEEEeelleeeeeellllllllllleeeellleeeeelllleeeeeellllleeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 14
ident
Sbjct dtnslenqldqmprrfylagnqeqeflkyqqggsilsgftleflehafsvdkqiaknlqg 180
DSSP lllllllllllllleeelllllllllhhhhllllhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 14
ident
Sbjct ekgaivtvkgglsvikpictmrlrhnigqtsspdiynpqagsvttatsldfpalswlrls 240
DSSP lllleeelllllllllllllllleeelllllllleeellleeeeeelllllhhhllllll
DSSP ..lEEEELLLEeELLLLL..LLEEEEEEELEEEEEEEllLLLEEEEEEEELLEEEELLll
Query ..pKQFHKKELiFNQWDP..QEYCIFLYDGITKLTSIseNGTIMNLQYYKGAFVIMSGfi 70
ident | | | | || |
Sbjct aefGSLRKNAM.FVPHYNlnANSIIYALNGRALIQVVncNGERVFDGELQEGRVLIVP.. 297
DSSP eeeEEELLLLE.EEEEEEllLLEEEEEEELEEEEEEEllLLLEEEEEEEELLLEEEEL..
DSSP llllLLLLLEEEELLLEEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query dtetSVGYYNLEVISEQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndf 130
ident | | |
Sbjct ....QNFVVAARSQSDNFEYVSFKTN.................................. 319
DSSP ....LLLEEEEEELLLLEEEEEEELL..................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllee
Query singklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekviv 190
ident
Sbjct .............................................dtpmigtlagansll 334
DSSP .............................................lllleeelllllllh
DSSP elllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query yknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct nalpeeviqhtfnlksqqarqiknnnpfkflvppqes 371
DSSP hhllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllleelllll
No 28: 2OZIA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RPA4178;
DSSP ..lhhhhhhHHHL....llLLEEEELLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELllllEE
Query ..gsefkkyLETN....giKPKQFHKKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISengtIM 54
ident |
Sbjct gxtvaakseIQIDndevrvTEWRLPPGSAtgHHTHGXDYVVVPXADGETIVAPD....GT 56
DSSP llleeleeeEEEEllleeeEEEEELLLEEllLEELLLLEEEEELLLLLLEELLL....LL
DSSP EEEEEELL.EEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhh
Query NLQYYKGA.FVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyv 112
ident | |
Sbjct RSLAQLKTgRSYARK......AGVQHDVRNEStAEIVFLEIELK................ 94
DSSP EELLLLLLlLLEEEL......LLLEEEEEELLlLLEEEEEEEEL................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllll
Query fqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgy 172
ident
Sbjct ............................................................ 94
DSSP ............................................................
DSSP llhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query ssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ......................................................a 95
DSSP ......................................................l
No 29: 2IC1A MOLECULE: CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE 1;
DSSP .................................LHHH................hhhhHHL
Query .................................GSEF................kkylETN 11
ident |
Sbjct vlkprtladlirilhqlfagdevnveevqaimeAYESdptewamyakfdqyrytrnlVDQ 60
DSSP llllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhHLLLlhhhhhhhlllllllleeeeEEL
DSSP L.....LLLEEEE.LLLEeeLLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEE......lLLLLEEEEEE
Query G.....IKPKQFH.KKELifNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSI......sENGTIMNLQY 58
ident | | | |
Sbjct GngkfnLMILCWGeGHGS.sIHDHTnSHCFLKMLQGNLKETLFawpdkksNEMVKKSERV 119
DSSP HhhlleEEEEEELlLLLL.lEELLLlLEEEEEEEELLEEEEEElllllllLLLLEEEEEE
DSSP EELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL..LEEEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhh
Query YKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS..EQATAYVIKINElkellsknlthffyvfqtl 116
ident | | | || | |
Sbjct LRENQCAYIN.....dSIGLHRVENIShtEPAVSLHLYSPP................... 155
DSSP LLLLLEEEEL.....lLLLEEEEEELLllLLEEEEEEEELL...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhh
Query qkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssav 176
ident
Sbjct ............................................................ 155
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query sriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .....................fdtchafdqrtghknkvtmtfhskfgirtp 185
DSSP .....................lleeeeelllllleeeeelllleelleell
No 30: 2BNMA MOLECULE: EPOXIDASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ktastgfaellkdrreqvkmdhaalasllgetpetvaawengeggeltltqlgriahvlg 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhll
DSSP ...................................lhhhhhhHHHL.......lLLLEEE
Query ...................................gsefkkyLETN.......gIKPKQF 18
ident
Sbjct tsigaltppagndlddgviiqmpderpilkgvrdnvdyyvynCLVRtkrapslvPLVVDV 120
DSSP lllhhhllllllllllllllllhhhlleellllllllleeeeELLLllllllleEEEEEE
DSSP ELLL..eeeLLLL.LLLEEEEEEELEEEEEEELllLLEEEeEEEELLEEEELLlllllll
Query HKKE..lifNQWD.PQEYCIFLYDGITKLTSISenGTIMNlQYYKGAFVIMSGfidtets 75
ident | |
Sbjct LTDNpddakFNSGhAGNEFLFVLEGEIHMKWGD.kENPKE.ALLPTGASMFVE......e 172
DSSP LLLLhhhllLLLLlLLLEEEEEEELLEEEEELL.lLLLEE.EEELLLLEEEEL......l
DSSP lLLLEEEEL..LLEEEEEEEEHhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query vGYYNLEVI..SEQATAYVIKInelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsin 133
ident |
Sbjct hVPHAFTAAkgTGSAKLIAVNF...................................... 194
DSSP lLLEEEEELllLLLEEEEEEEL......................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeell
Query gklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivykn 193
ident
Sbjct ............................................................ 194
DSSP ............................................................
DSSP lleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query scfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .................................. 194
DSSP ..................................
No 31: 1Y9QA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, HTH_3 FAMILY;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tdvxfksqianqlknlrksrglsldataqltgvskaxlgqiergessptiatlwkiasgl 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhh
DSSP .......................lhhhhhhHHHL.......llLLEEEE.LLLEeeLLLL
Query .......................gsefkkyLETN.......giKPKQFH.KKELifNQWD 29
ident
Sbjct easfsaffandpqllssersfpddlnxkihTLFPyaadtgleiFEITLLdHHQQ..XSSP 118
DSSP llllhhhhllllhhhhhllllllllleeeeEEEEeelllleeeEEEEELlLLEE..EELL
DSSP L...LLEEEEEEELEEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLL
Query P...QEYCIFLYDGITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISE 86
ident | || | | | |
Sbjct HalgVIEYIHVLEGIXKVF......fdEQWHELQQGEHIRFF......SDQPHGYAAVTE 166
DSSP LlllLEEEEEEEELLEEEE......elLEEEEELLLLEEEEE......LLLLEEEEELLL
DSSP EEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query QATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqllil 146
ident | |
Sbjct KAVFQNIVAY.................................................. 176
DSSP LEEEEEEEEL..................................................
DSSP hhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhh
Query tyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkr 206
ident
Sbjct ............................................................ 176
DSSP ............................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query yapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ...................pr 178
DSSP ...................ll
No 32: 2CAUA MOLECULE: PROTEIN (CANAVALIN);
DSSP lhhhhhhhHHLL...............................llLEEEELLLEeeLLLL
Query gsefkkylETNG...............................ikPKQFHKKELifNQWD 29
ident |
Sbjct .nnpylfrSNKFltlfknqhgslrllqrfnedteklenlrdyrvlEYCSKPNTLllPHHS 59
DSSP .lllleelHHHEeeeeeelleeeeeellllllllllhhhlleeeeEEEELLLEEeeEEEE
DSSP LLLEEEEEEELEEEEEEELLlLLEEeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL..LE
Query PQEYCIFLYDGITKLTSISEnGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS..EQ 87
ident | | | |
Sbjct DSDLLVLVLEGQAILVLVNP.DGRD.TYKLDQGDAIKIQ......AGTPFYLINPDnnQN 111
DSSP LLEEEEEEEELEEEEEEEEL.LEEE.EEEEELLEEEEEL......LLLLEEEEELLllLL
DSSP EEEEEEEHH...................................................
Query ATAYVIKIN................................................... 96
ident |
Sbjct LRILKFAITfrrpgtvedfflsstkrlpsylsafsknfleasydspydeieqtllqeeqe 171
DSSP EEEEEEEELlllllllleeelllllllllhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhlllllll
DSSP ..................hhhhhhhllhHHHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..................elkellsknlTHFFyvFQTLqkqvsyslakfndfsingklgs 138
ident |
Sbjct gvivkmpdkpfnlrsrdpiysnnygklyEITPekNSQL...................... 209
DSSP lleeellllleellllllleellleeeeEELHhhLHHH......................
DSSP hhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleee
Query icgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyv 198
ident
Sbjct ............................................................ 209
DSSP ............................................................
DSSP llhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhHHHHHL...............................
Query qnldylkryapkldewfylacpaTWGKLN............................... 227
ident
Sbjct .............rdldillnclQMNEGAlfvphynsratvilvanegraevelvgleql 256
DSSP .............hhhlleeeeeEELLLEeeeeeeellleeeeeeeelleeeeeeeelle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 227
ident
Sbjct rryaatlsegdiivipssfpvalkaasdlnmvgigvnaennernflaghkenvirqiprq 316
DSSP eeeeeeelllleeeellllleeeeellleeeeeeeelllllleeelllllllhhhhllhh
DSSP ............................
Query ............................ 227
ident
Sbjct vsdltfpgsgeeveellenqkesyfvdg 344
DSSP hhhhhllllhhhhhhhhhhllllleeel
No 33: 1SEFA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ...............................................lhhHHHH......
Query ...............................................gseFKKY...... 7
ident
Sbjct kelltsravikkdnyaiiphdglvqnavpgfenvdisilgspklgatfvdYIATfhkngq 60
DSSP lllllllleeellleeeelhhhlllllllleeeeeeeelllhhhlllleeEEEEeeeeee
DSSP .........hhhLLLL............................................
Query .........letNGIK............................................ 14
ident
Sbjct qttgfggdgiqtLVYVidgrlrvsdgqetheleaggyayftpemkmylanaqeadtevfl 120
DSSP elllllllleeeEEEEeeleeeeelllleeeeelleeeeelllllleeeellllleeeee
DSSP ...................................................LEEEELLLE
Query ...................................................PKQFHKKEL 23
ident |
Sbjct ykkryqplaghqpykvvgsihdqqpeeyegmtdvllwsllpkefdfdmnmhILSFEPGAS 180
DSSP eeeellllllllllleeeehhhllleehhhllleeeeellllllllleeeeEEEELLLLL
DSSP .eeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEE
Query .ifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLE 82
ident || | | |
Sbjct hayIETHVQEHGAYLISGQGMYNL......dNEWYPVEKGDYIFMS......AYVPQAAY 228
DSSP lllLLLLLLLEEEEEEELEEEEEE......lLEEEEEELLLEEEEL......LLLLEEEE
DSSP ELLL..EEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VISE..QATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsic 140
ident |
Sbjct AVGReePLMYVYSKDA............................................ 244
DSSP EELLllLEEEEEEEEL............................................
DSSP hhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeell
Query gqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqn 200
ident
Sbjct ............................................................ 244
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query ldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .....................nrepel 250
DSSP .....................llllll
No 34: 2GM6A MOLECULE: CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE I;
DSSP lhhhhHHHHHLL................................................
Query gsefkKYLETNG................................................ 12
ident
Sbjct ....sLAPLREFitglsalldeqpgearilreggallarlvarddwlpdafaqphpeyyq 56
DSSP ....lLHHHHHHhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllle
DSSP .............llLEEEE.LLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLL.....LLE
Query .............ikPKQFH.KKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISEN.....GTI 53
ident | |
Sbjct qxllhcdsaerfsivSFVWGpGQRT.pIHDHTVWGLIGXLRGAEYSQPFVLDgsgrpVLH 115
DSSP eeeeeelllllleeeEEEELlLLLL.lLLLLLLLEEEEEEELLEEEEEEEELlllleEEL
DSSP EEEEEEELLEEEELLlllllLLLLLLEEEELL..LEEEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhh
Query MNLQYYKGAFVIMSGfidteTSVGYYNLEVIS..EQATAYVIKINElkellsknlthffy 111
ident | |
Sbjct GEPTRLEPGHVEAVS....pTVGDIHRVHNAYddRVSISIHVYGAN.............. 157
DSSP LLLEEELLLLEEEEL....lLLLLLEEEEELLllLLEEEEEEELLL..............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhlll
Query vfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelg 171
ident
Sbjct ............................................................ 157
DSSP ............................................................
DSSP lllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query yssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .....................iggvrrsvyteagerkpfisgysnpylpnpwdrsk 192
DSSP .....................hhhlleeeellllleeeelllllllllllllllll
No 35: 2D5FA MOLECULE: GLYCININ A3B4 SUBUNIT;
DSSP ..................lhhhhhhHHHL..........lLLLEEEELLLEEeLLLLL.L
Query ..................gsefkkyLETN..........gIKPKQFHKKELIfNQWDP.Q 31
ident |
Sbjct necqlnnlnalepdhrvesegglieTWNSqhpelqcagvtVSKRTLNRNGLH.LPSYSpY 59
DSSP lllllllllllllleeeellleeeeELLLllhhhhhhlleEEEEEELLLEEE.EEEELlL
DSSP LEEEEEEELEEEEEE............ellLLLEEEeEEEELLEEEELLllllllLLLLL
Query EYCIFLYDGITKLTS............iseNGTIMNlQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYY 79
ident | | | |
Sbjct PQMIIVVQGKGAIGFafpgcpetfekpqlqDSHQKI.RHFNEGDVLVIP......PGVPY 112
DSSP LEEEEEEELEEEEEElllllllleeellllEEELLE.EEEELLEEEEEL......LLLLE
DSSP EEEELLL.EEEEEEEEHH..........................................
Query NLEVISE.QATAYVIKIN.......................................... 96
ident |
Sbjct WTYNTGDePVVAISLLDTsnfnnqldqnprvfylagnpdiehpetmqeggsvlsgfskhf 172
DSSP EEEELLLlLEEEEEEELLllllllllllllleelllllllllhhhllllllhhhhllhhh
DSSP .........................................................hhh
Query .........................................................elk 99
ident
Sbjct laqsfntnedtaeklrspdderkqivtvegglsvispkwgveenictmklheniarpsra 232
DSSP hhhhllllhhhhhhlllllllllleeelllllllllllllllllhhhllleeelllhhhl
DSSP hhhhllhhhhHHHHhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheelllllee
Query ellsknlthfFYVFqtlQKQVsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgik 159
ident
Sbjct dfynpkagriSTLN.slTLPA....................................... 252
DSSP leeellleeeEEEL.llLLLL.......................................
DSSP elllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhl
Query itldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylac 219
ident
Sbjct ...................................................lrqfglsaq 261
DSSP ...................................................hhhhlleee
DSSP hhhHHHHL....................................................
Query patWGKLN.................................................... 227
ident
Sbjct yvvLYRNGiysphwnlnansviyvtrgkgrvrvvnxqgnavfdgelrrgqllvvpqnfvv 321
DSSP eeeELLLLeeeeeeelllleeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeellleeeellllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 227
ident
Sbjct aeqggeqgleyvvfkthhnavssyikdvfraipsevlsnsynlgqsqvrqlkyqgnsgpl 381
DSSP eeeeeeeeeeeeeeelllllleeehhhhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllle
DSSP ...
Query ... 227
ident
Sbjct vnp 384
DSSP ell
No 36: 2ET1A MOLECULE: OXALATE OXIDASE 1;
DSSP .............................lhhhhhhhhHLLLL.................
Query .............................gsefkkyleTNGIK................. 14
ident
Sbjct tdpdplqdfcvadldgkavsvnghtckpmseagddflfSSKLTkagntstpngsavteld 60
DSSP llllllllllllllllllllllllllllhhhlllllllLLLLLlllllllllleeeeeel
DSSP ...............LEEEELLLEEELLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEEL...LLLLEEe
Query ...............PKQFHKKELIFNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSIS...ENGTIMn 55
ident | | |
Sbjct vaewpgtntlgvsmnRVDFAPGGTNPPHIHPrATEIGMVMKGELLVGILGsldSGNKLY. 119
DSSP llllhhhllllleeeEEEELLLLEEEEEELLlLLEEEEEEELLEEEEEELlhhHLLLEE.
DSSP EEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhh
Query LQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyvfq 114
ident | |
Sbjct SRVVRAGETFVIP......RGLMHFQFNVGkTEAYMVVSFNS.................. 155
DSSP EEEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELLlLLEEEEEEELL..................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllll
Query tlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyss 174
ident
Sbjct ............................................................ 155
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query avsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .......qnpgivfvpltlfgsdppiptpvltkalrveagvvellkskfaggs 201
DSSP .......llllleehhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllll
No 37: 2FD8A MOLECULE: ALKYLATED DNA REPAIR PROTEIN ALKB;
DSSP ...............LHHHHHHH.....................................
Query ...............GSEFKKYL..................................... 8
ident
Sbjct laagavilrrfafnaAEQLIRDIndvasqspfrqmvtpggytmsvamtncghlgwtthrq 60
DSSP lllleeeelllllllHHHHHHHHhhhhlllllllllllllllllleeeeeelleeeelll
DSSP .................hHLLL.....................lLEEEE.LLLEeeLLLL
Query .................eTNGI.....................kPKQFH.KKELifNQWD 29
ident | |
Sbjct gylyspidpqtnkpwpamPQSFhnlcqraataagypdfqpdaclINRYApGAKL.sLHQD 119
DSSP leeeelllllllllllllLHHHhhhhhhhhhhhlllllllleeeEEEELlLLLE.eEELL
DSSP L......LLEEEEEEELEEEEEEE..lLLLLEEEeEEEELLEEEELLllllLLLL.LLLE
Query P......QEYCIFLYDGITKLTSI..sENGTIMNlQYYKGAFVIMSGfidtETSV.GYYN 80
ident | | | | |
Sbjct KdepdlrAPIVSVSLGLPAIFQFGglkRNDPLKR.LLLEHGDVVVWG....GESRlFYHG 174
DSSP LllllllLLEEEEEEELLEEEEELlllLLLLLEE.EEELLLLEEEEL....HHHHhLLEE
DSSP EE........ellLEEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query LE........visEQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsi 132
ident
Sbjct IQplkagfhpltiDCRYNLTFRQA.................................... 198
DSSP ELlllllllllllLLEEEEEEELL....................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeel
Query ngklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyk 192
ident
Sbjct ............................................................ 198
DSSP ............................................................
DSSP llleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query nscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ..................................g 199
DSSP ..................................l
No 38: 2H0VA MOLECULE: QUERCETIN 2,3-DIOXYGENASE;
DSSP .........................lhhhhhhHHHL........lLLLEEEELLLEeELL
Query .........................gsefkkyLETN........gIKPKQFHKKELiFNQ 27
ident | | | |
Sbjct tlcthslpkekxpyllrsgegerylfgrqvatVXANgrstgdlfeIVLLSGGKGDA.FPL 59
DSSP llllllllllllleeellllleeeeelleeeeEEELhhhhllleeEEEEEELLLLE.EEE
DSSP LLL..LLEEEEEEELEEEEEeellllleeeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL
Query WDP..QEYCIFLYDGITKLTsisengtimnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS 85
ident | || || |
Sbjct HVHkdTHEGILVLDGKLELT......ldgeRYLLISGDYANIP......AGTPHSYRXQS 107
DSSP EELllLLEEEEEEELLEEEE......elleEEEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELL
DSSP LEEEEEEEEHH.................................................
Query EQATAYVIKIN................................................. 96
ident
Sbjct HRTRLVSYTXKgnvahlysvignpydhaehppyaseevsnerfaeaaavadivfldeakp 167
DSSP LLEEEEEEEELlllllhhhhhleelllllllllllllllhhhhhhhhllllleellllll
DSSP ............................................hhHHHHhllhhhhhHH
Query ............................................elKELLsknlthffYV 112
ident |
Sbjct acsaklaeltelpdgavpyvlesgegdrlltgdqlhrivaaqkntdGQFI........VV 219
DSSP lllleelllllllllllleeellllleeeeelleeeeeeelhhhhlLLLE........EE
DSSP HHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllll
Query FQtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgy 172
ident
Sbjct SS..................egpkgdrivdhyheyhtetfyclegqxtxwtdgqeiqlnp 261
DSSP EE..................eelllllllllllllleeeeeeeelleeeeelleeeeell
DSSP llhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhHHHLHhhhHHHL.....
Query ssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfYLACPatwGKLN..... 227
ident
Sbjct gdflhvpantvhsyrldshytkxvgvlvpglfepffrtlgdpyEGHIF...PCEPqalrf 318
DSSP lleeeellllleeeeelllleeeeeeeellllllhhhhhleelLLLLL...LLLLlllll
DSSP .................
Query ................. 227
ident
Sbjct drilqniealdlkvxkp 335
DSSP hhhhhhhhhllllllll
No 39: 1VR3A MOLECULE: ACIREDUCTONE DIOXYGENASE;
DSSP ..........................................LHHHHHH.........hh
Query ..........................................GSEFKKY.........le 9
ident
Sbjct xvqawyxdestadprkphraqpdrpvsleqlrtlgvlywkldADKYENDpelekirkxrn 60
DSSP lleeeelllllllllllllllllllllhhhhhhllleeeellHHHLLLLhhhhhhhhhhl
DSSP hllLLLEEEE........llLEEE..lLLLLLLEEEEEEELEEEEEeeLLLLLEEEeEEE
Query tngIKPKQFH........kkELIF..nQWDPQEYCIFLYDGITKLTsiSENGTIMNlQYY 59
ident | | |
Sbjct yswXDIITICkdtlpnyeekIKXFfeeHLHLDEEIRYILEGSGYFDvrDKEDKWIR.ISX 119
DSSP lleEEEEEELllllllhhhhHHHHhllEELLLLEEEEEEEEEEEEEeeLLLLLEEE.EEE
DSSP ELLEEEELLllllllLLLLLEEEEL.LLEEEEEEEehhhHHHHhhllhhhhhhhhhhhhh
Query KGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI.SEQATAYVIkineLKELlsknlthffyvfqtlqk 118
ident | | |
Sbjct EKGDXITLP......AGIYHRFTLDeKNYVKAXRL....FVGE................. 152
DSSP ELLEEEEEL......LLLLEEEEELlLLLEEEEEE....ELLL.................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhh
Query qvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsr 178
ident
Sbjct ............................................................ 152
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query iisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ......................pvwtpynrpadhfdarvqyxsflegta 179
DSSP ......................llllleellllllhhhhhhhhhhhhll
No 40: 1YFUA MOLECULE: 3-HYDROXYANTHRANILATE-3,4-DIOXYGENASE;
DSSP .....................lhhhhhhHHHL....lLLLEeEELLLeeeLLLLLLLEEE
Query .....................gsefkkyLETN....gIKPKqFHKKElifNQWDPQEYCI 35
ident || |
Sbjct mltygapfnfprwidehahllkppvgnrQVWQdsdfiVTVV.GGPNHrtdYHDDPLEEFF 59
DSSP lllllllllhhhhhhhlhhhlllllleeELLLllleeEEEE.LLLLLlllEEELLLLEEE
DSSP EEEELEEEEEEELLlLLEEeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLLEEEEEEEEH
Query FLYDGITKLTSISEnGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISEQATAYVIKI 95
ident | | | | ||
Sbjct YQLRGNAYLNLWVD.GRRE.RADLKEGDIFLLP......PHVRHSPQRPEAGSACLVIER 111
DSSP EEEELLEEEEEEEL.LEEE.EEEELLLLEEEEL......LLLLEEEELLLLLLEEEEEEE
DSSP H.................hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhhh
Query N.................elkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfSINGKlgs 138
ident
Sbjct QrpagmldgfewycdacghlvhrvevqlksivtdlpplfesfyasedkrrcpHCGQV... 168
DSSP LlllllleeeeeelllllleeeeeeellllhhhhlhhhhhhhhllhhhhlllLLLLL...
DSSP hhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleee
Query icgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyv 198
ident
Sbjct ............................................................ 168
DSSP ............................................................
DSSP llhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query qnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .......................hpgraa 174
DSSP .......................llllll
No 41: 1J58A MOLECULE: YVRK PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pqpirgdkgatvkiprnierdrqnpdxlvppetdhgtvsnxkfsfsdthnrlekggyare 60
DSSP llleelleellllllllhhhhhhlhhhhllllllllllllleelhhhllleeelleeeee
DSSP ................................lhhHHHH.....................
Query ................................gseFKKY..................... 7
ident
Sbjct vtvrelpisenlasvnxrlkpgairelhwhkeaewAYXIygsarvtivdekgrsfiddvg 120
DSSP ellllllllllleeeeeeelllleeeeeeellleeEEEEeeeeeeeeellllleeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 7
ident
Sbjct egdlwyfpsglphsiqaleegaefllvfddgsfsenstfqltdwlahtpkeviaanfgvt 180
DSSP lleeeeellllleeeeeeeeeeeeeeeellllllhhheeehhhhhhlllhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 7
ident
Sbjct keeisnlpgkekyifenqlpgslkddivegpngevpypftyrlleqepieseggkvyiad 240
DSSP lhhhllllllllleelllllllhhhhllllllllllllleeehhhllleellleeeeeel
DSSP ......hhhllLLLEEEELLLEEELLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEEllLLLEEeEEEEE
Query ......letngIKPKQFHKKELIFNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSIseNGTIMnLQYYK 60
ident | | | | | |
Sbjct stnfkvsktiaSALVTVEPGAXRELHWHPnTHEWQYYISGKARXTVFasDGHAR.TFNYQ 299
DSSP lllllllllleEEEEEELLLLEEEEEELLlLLEEEEEEELEEEEEEEeeLLEEE.EEEEE
DSSP LLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query GAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkq 119
ident | | | | |
Sbjct AGDVGYVP......FAXGHYVENIGdEPLVFLEIFKD....................... 330
DSSP LLLEEEEL......LLLLEEEEELLlLLEEEEEEELL.......................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhh
Query vsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsri 179
ident
Sbjct ............................................................ 330
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query isklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct ......dhyadvslnqwlaxlpetfvqahldlgkdftdvlskekhpvv 372
DSSP ......llllleehhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhhlllllllllll
No 42: 1J1LA MOLECULE: PIRIN;
DSSP ................lhhhhhhhHHLL...........LLLEEEELLLEEeLLLLL.LL
Query ................gsefkkylETNG...........IKPKQFHKKELIfNQWDP.QE 32
ident |
Sbjct sskkvtlsvlsreqsegvgarvrrSIGRpelknldpfllFDEFKGGRPGGFpDHPHRgFE 60
DSSP lllleeeeeelleeeellleeeeeLLLLlllllllleeeEEEEEELLLLLEeEEEELlEE
DSSP EEEEEE.ELEEEEEEELlllleEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELL.LEEEE
Query YCIFLY.DGITKLTSISengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVIS.EQATA 90
ident | | | | |
Sbjct TVSYLLeGGSXAHEDFC.....GHTGKXNPGDLQWXT....agrgILHAEXPCSeEPAHG 111
DSSP EEEEELlLLLEEEEELL.....LLEEEELLLLEEEEE....llllEEEEEEELLlLLEEE
DSSP EEEEHH............................hhhhhHHLLhhhhHHHHhhhhhhhhh
Query YVIKIN............................elkelLSKNlthfFYVFqtlqkqvsy 122
ident | |
Sbjct LQLWVNlrssekxvepqyqelkseeipkpskdgvtvaviSGEAlgikSKVY......... 162
DSSP EEEEEEllhhhllllleeeeelhhhlllleelleeeeeeELEElleeLLLL.........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhh
Query slakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisk 182
ident
Sbjct ............................................................ 162
DSSP ............................................................
DSSP hhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhHHHHL...............
Query lkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatWGKLN............... 227
ident
Sbjct .............................trtptlyldfkLDPGAkhsqpipkgwtsfiy 193
DSSP .............................lllleeeeeeeELLLLeeeeellllleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 227
ident
Sbjct tisgdvyigpddaqqkiephhtavlgegdsvqvenkdpkrshfvliageplrepviqhgp 253
DSSP eeelleeelllllleeellleeeeelllleeeeelllllleeeeeeeellllllleeell
DSSP ...................................
Query ................................... 227
ident
Sbjct fvxntneeisqaildfrnakngferaktwkskign 288
DSSP eeellhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllll
No 43: 2D40A MOLECULE: PUTATIVE GENTISATE 1,2-DIOXYGENASE;
DSSP ..............lhhhhhhHHHL............lLLLEEEELLLEeeLLLLL.LLE
Query ..............gsefkkyLETN............gIKPKQFHKKELifNQWDP.QEY 33
ident || | |
Sbjct tpnancapaywnyqeirpllvLENPalrgqssitatlyAGLQLIXPGEV.aPSHRHnQSA 59
DSSP lllllllleeellllllllleELLLlllllllllllleEEEEEELLLLE.eEEEEElLLE
DSSP EEEEEEL.EEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LEEEEE
Query CIFLYDG.ITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAY 91
ident | | | |
Sbjct LRFIVEGkGAFTA......vdGERTPXNEGDFILTP......QWRWHDHGNPGdEPVIWL 107
DSSP EEEEEELlLLEEE......elLEEEELLLLLEEEEL......LLLLEEEELLLlLLEEEE
DSSP EEE.........................................................
Query VIK......................................................... 94
ident
Sbjct DGLdlplvnilgcgfaedypqqpvtrkegdylpryaanxlplrhqtgnsspifnyrydrs 167
DSSP EEElhhhhhhhlllleeellllllllllllhhhhhllleellllllllllllleelhhhh
DSSP ................................hHHHHhhhhllhhHHHHhhhhhhhhhhh
Query ................................iNELKellsknltHFFYvfqtlqkqvsy 122
ident |
Sbjct revlhdltrlgdadewdgykxryvnpvtggypxPSXG........AFLQ........... 208
DSSP hhhhhhhhlllllllllleeeeellllllllllLLLE........EEEE...........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhh
Query slakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisk 182
ident
Sbjct ......................................llpkgfasrvarttdstiyhvv 230
DSSP ......................................eellllllllleellleeeeee
DSSP hhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhHHHL.............hhhhhhhl
Query lkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfYLAC.............patwgkln 227
ident
Sbjct egsgqviignetfsfsakdifvvptwhgvsfqtTQDSvlfsfsdrpvqealglfrear 288
DSSP eeeeeeeelleeeeeellleeeellllleeeeeEEEEeeeeeelhhhhhhllllleel
No 44: 2IXLA MOLECULE: DTDP-4-DEHYDRORHAMNOSE 3,5-EPIMERASE;
DSSP ..................................LHHH..............hhhhhhll
Query ..................................GSEF..............kkyletng 12
ident |
Sbjct tenffgktlaarpveaipgmlefdipvhgdnrgwFKENfqkekmlplgfpesffaegklq 60
DSSP llllllllleeeellllllleeeelleeeelleeEEEEeehhhhhhhlllhhhhllllle
DSSP LLLEEEELLLEeELLLLL.LLEEEEEEE.LEEEEEEE.....llllLEEEeEEEELLEEE
Query IKPKQFHKKELiFNQWDP.QEYCIFLYD.GITKLTSI.....sengTIMNlQYYKGAFVI 65
ident | | | | | | |
Sbjct NNVSFSRKNVL.RGLHAEpWDKYISVADgGKVLGTWVdlregetfgNTYQ.TVIDASKSI 118
DSSP EEEEEEELLLE.EEEEELlLLEEEEELLlLLEEEEEEellllllllLEEE.EEELLLEEE
DSSP ELLllllllLLLLLEEEELLLEEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query MSGfidtetSVGYYNLEVISEQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsysla 125
ident | |
Sbjct FVP......RGVANGFQVLSDFVAYSYLVND............................. 143
DSSP EEL......LLEEEEEEELLLEEEEEEEELL.............................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhLLLLllhhhhhhhhhhh
Query kfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqELGYssavsriisklkq 185
ident |
Sbjct ...................ywalelkpkyafvnyadpsldikwENLE............. 171
DSSP ...................lllhhhhhhleellllllllllllLLLL.............
DSSP hlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query ekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .................eaevseadenhpflkdvkplrkedl 196
DSSP .................lllllhhhhhlllhhhlllllhhhl
No 45: 1YUDA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SO0799;
DSSP ................lhhhhhhHHHL............lLLLEEEELLLEeELLL.lLL
Query ................gsefkkyLETN............gIKPKQFHKKELiFNQW.dPQ 31
ident |
Sbjct xqnaddfikfleleqhveggfyrSSYRsetafdpsrqlwsSIYFLLRTGEV.SHFHrlTA 59
DSSP lllhhhhhhhllleellllleeeEEEElllllllllllleEEEEEEELLLL.EEEEelLL
DSSP LEEEEEEE.LEEEEEEEllLLLEEeEEEEEL......lEEEELLllllllLLLLLEEEEL
Query EYCIFLYD.GITKLTSIseNGTIMnLQYYKG......aFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI 84
ident | |
Sbjct DEXWYFHAgQSLTIYXIspEGELT.TAQLGLdlaagerPQFLVP......KGCIFGSAXN 112
DSSP LEEEEEEEeLLEEEEEEllLLLEE.EEEELLllllleeLLEEEL......LLLEEEEEEL
DSSP L.LEEEEEEEEHHHHhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query S.EQATAYVIKINELkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgql 143
ident
Sbjct QdGFSLVGCXVSPGF............................................. 127
DSSP LlLEEEEEEEELLLL.............................................
DSSP hhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhh
Query liltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldy 203
ident
Sbjct .....................................................tfddfel 134
DSSP .....................................................lhhhlll
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query lkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct fsqeallaxypqhkavvqklsrpe 158
DSSP llhhhhhhlllllhhhhlllllll
No 46: 2HC8A MOLECULE: CATION-TRANSPORTING ATPASE, P-TYPE;
DSSP ....................lhhhhhhhhhllLLLEEEELLLEEElllllllEEEEEEEL
Query ....................gsefkkyletngIKPKQFHKKELIFnqwdpqeYCIFLYDG 40
ident | | |
Sbjct eaikklvglqaktavvirdgkeiavpveevavGDIVIVRPGEKIP.......VDGVVVEG 53
DSSP lhhhhhhhhllleeeeeelleeeeeehhhlllLLEEEELLLLLLL.......LEEEEEEL
DSSP EE.EEEEEllllLEEEEEEEELLEEEElllllllllllllEEEELLlEEEEEE.EEHHHH
Query IT.KLTSIsengTIMNLQYYKGAFVIMsgfidtetsvgyyNLEVISeQATAYV.IKINEL 98
ident | |
Sbjct ESyVDESM..isGEPVPVLKSKGDEVF...........gaTINNTG.VLKIRAtRVGGET 99
DSSP LEeEELHH..hhLLLLLEEELLLLEEL...........llLEELLL.LEEEEEeELHHHL
DSSP hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllle
Query kellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgi 158
ident
Sbjct ............................................................ 99
DSSP ............................................................
DSSP eelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhh
Query kitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfyla 218
ident
Sbjct .......................................................llaqi 104
DSSP .......................................................hhhhh
DSSP lhhhhhhhl
Query cpatwgkln 227
ident
Sbjct vklvedamg 113
DSSP hhhhhhhhl
No 47: 1XE7A MOLECULE: HYPOTHETICAL 22.5 KDA PROTEIN IN TUB1-CPR3
DSSP ..................................lhhhhhhHHHL...............
Query ..................................gsefkkyLETN............... 11
ident
Sbjct anaaiepasfvkvpmpeppsslqqlindwqlikhreggyfkETDRspytmevekpvmvtr 60
DSSP llllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhlleellllleeeEEEEllleeeellllleee
DSSP ...lLLLEEEE..LLLEeeLLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEellllLEEEeEEEE.....
Query ...gIKPKQFH..KKELifNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSisengTIMNlQYYK..... 60
ident | |
Sbjct nqstLIYYLLTpdSPIG..KFHKNiNRIIHILQRGKGQYVLvypdgQVKS.FKVGfdykn 117
DSSP elleEEEEEELllLLEE..EEEEElLLEEEEEEEELEEEEEellllLEEE.EEELllhhh
DSSP .llEEEELLllllllLLLLLEEEELL.....LEEEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhh
Query .gaFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.....EQATAYVIKINElkellsknlthffyvfq 114
ident
Sbjct gevSQWVVP......GGVFKASFLLPneefdNGFLISEVVVPG................. 154
DSSP lllLEEEEL......LLLEEEEEELLlllllLLEEEEEEELLL.................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllll
Query tlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyss 174
ident
Sbjct ............................................................ 154
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query avsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .....................fdfedhtflkgedelkhlvgpekaaelaflah 186
DSSP .....................llhhheeellhhhhhhhhhlhhhhhhlhhhll
No 48: 1QWRA MOLECULE: MANNOSE-6-PHOSPHATE ISOMERASE;
DSSP ..............................lhhhhhhHHHL...................
Query ..............................gsefkkyLETN................... 11
ident
Sbjct tqspifltpvfkekiwggtalrdrfgysipsestgecWAISahpkgpstvangpykgktl 60
DSSP lllleeeeleeeeeeeeelhhhhhhlllllllleeeeEEELllllllleelllllllllh
DSSP .....................lLLLEEEELLLEeeLLLLL.............LLEEEEE
Query .....................gIKPKQFHKKELifNQWDP.............QEYCIFL 37
ident | |
Sbjct ielweehrevfggvegdrfpllTKLLDVKEDTS.iKVHPDdyyageneegelgKTECWYI 119
DSSP hhhhhhlhhhhllllllllleeEEEEEELLLLL.eEELLLhhhhhhhllllllLLEEEEE
DSSP EEL...EEEEEE.......eLLLLL.......EEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLE
Query YDG...ITKLTS.......iSENGT.......IMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYN 80
ident | | |
Sbjct IDCkenAEIIYGhtarskteLVTXInsgdwegLLRRIKIKPGDFYYVP.......sGTLH 172
DSSP EEElllLEEEEEellllhhhHHHHHhlllhhhHEEEEELLLLLEEEEL.......lLLLE
DSSP EEELllEEEEEEEEHH.........................................hhh
Query LEVIseQATAYVIKIN.........................................elk 99
ident | |
Sbjct ALCK..GALVLETQQNsdatyrvydydrldsngsprelhfakavnaatvphvdgyidest 230
DSSP EELL..LEEEEEEEELlllleeeelllllllllllllllhhhhhhhllllllllllllee
DSSP hhhhlLHHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheelllllee
Query ellskNLTHffYVFQtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgik 159
ident |
Sbjct esrkgITIK..TFVQ.........................................geyf 247
DSSP eeellEEEE..EEEE.........................................llll
DSSP elllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhl
Query itldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylac 219
ident
Sbjct svykwdingeaexaqdesflicsviegsgllkyedktcplkkgdhfilpaqxpdftikgt 307
DSSP eeeeeeeeeeeeelllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeellleeeelllllleeeeee
DSSP hhhhhhhl
Query patwgkln 227
ident
Sbjct ctlivshi 315
DSSP eeeeeeel
No 49: 1MZEA MOLECULE: FACTOR INHIBITING HIF1;
DSSP .....................................................LHHHHHH
Query .....................................................GSEFKKY 7
ident
Sbjct sgepreeagalgpawdesqlrsysfptrpiprlsqsdpraeelieneepvvltDTNLVYP 60
DSSP llllleelllleelllhhhllllllleeelleellllhhhhhhhhlllleeelLLLLLHH
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 7
ident
Sbjct alkwdleylqenigngdfsvysasthkflyydekkmanfqnfkprsnreemkfhefvekl 120
DSSP hhhllhhhhhhhlllleeeeeeelllllllllhhhhhhlllllllleeeeeehhhhhhhh
DSSP ...........................hHHLL....................llLEEEEL
Query ...........................lETNG....................ikPKQFHK 20
ident |
Sbjct qdiqqrggeerlylqqtlndtvgrkivmDFLGfnwnwinkqqgkrgwgqltsnlLLIGME 180
DSSP hhhhhllllleeeeeeellllllhhhhhHHHLllhhhhhhhhhhhlllleeeeeEEEELL
DSSP LLEeeLLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEE................................
Query KELifNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSI................................ 47
ident | |
Sbjct GNV.tPAHYDeQQNFFAQIKGYKRCILFppdqfeclypypvhhpcdrqsqvdfdnpdyer 239
DSSP LLE.eEEELLlLEEEEEEEELLEEEEEElhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
DSSP ...llLLLEEeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEEL..LLEEEEEEEEHHhhhhhh
Query ...seNGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI..SEQATAYVIKINelkell 102
ident | | |
Sbjct fpnfqNVVGY.ETVVGPGDVLYIP......MYWWHHIESLlnGGITITVNFWYK...... 286
DSSP lhhhhHLLEE.EEEELLLLEEEEL......LLLEEEEEELllLLLEEEEEEEEL......
DSSP hllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeell
Query sknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitl 162
ident
Sbjct ............................................................ 286
DSSP ............................................................
DSSP lhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhh
Query dnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpat 222
ident
Sbjct ................gaptpieyplkahqkvaimrniekmlgealgnpqevgpllntmi 330
DSSP ................lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
DSSP hhhhl
Query wgkln 227
ident
Sbjct kgryn 335
DSSP lllll
No 50: 1GWKA MOLECULE: NON-CATALYTIC PROTEIN 1;
DSSP ....................lhhhhhhhHHLLLlLEEEE..LLLEeELLL........ll
Query ....................gsefkkylETNGIkPKQFH..KKELiFNQW........dp 30
ident | |
Sbjct ratytvifknasglpngydnwgwgctlsYYGGAxIINPQegKYGA.VSLKrnsgsfrggs 59
DSSP llleeeeellllllllleeelllleeeeEELLEeEEEELllLLLE.EEEEelllllllle
DSSP llEEEEEeELEEEEEEEL.LLLLEEEEEEEELL..eeeellllllllllLLLEEEELL.L
Query qeYCIFLyDGITKLTSIS.ENGTIMNLQYYKGA..fvimsgfidtetsvGYYNLEVIS.E 86
ident | | |
Sbjct lrFDXKN.EGKVKILVENsEADEKFEVETISPSdeyvtyildvdfdlpfDRIDFQDAPgN 118
DSSP eeEEEEE.LLLEEEEEEElLLLEEEEEEEELLEeeeeeeeeelllllllLEEEEEELLlL
DSSP EEEEEEEEHhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query QATAYVIKInelkellsknlthffyvfqtlqkqvsysLAKFNDfsingklgsicgqllil 146
ident
Sbjct GDRIWIKNL........................vhstGSADDF................. 137
DSSP LLLEEEEEE........................eeelLLLLLL.................
DSSP hhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhh
Query tyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkr 206
ident
Sbjct ............................................................ 137
DSSP ............................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query yapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .................vdpi 141
DSSP .................llll
No 51: 2GAIA MOLECULE: DNA TOPOISOMERASE I;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct kyivvespakaktiksilgneyevfasmghiidlpkskfgvdlekdfepefavikgkekv 60
DSSP leeeellhhhhhhhhhhhhhhleeeellllleellllllleellllleelleellllhhh
DSSP .....lhhhhhhhhhllllleeeellleeeLLLL...........llleeeeeeeleeee
Query .....gsefkkyletngikpkqfhkkelifNQWD...........pqeyciflydgitkl 44
ident
Sbjct veklkdlakkgelliasdmdregeaiawhiARVTntlgrknrivfseitprvireavknp 120
DSSP hhhhhhhhhhlleeelllllhhhhhhhhhhHHHHlllllllllllllllhhhhhhhhhll
DSSP eeeLLLLLeeeeeeeelleeeellllllllllllleeeellleeeeeeeehhhhhhhhhl
Query tsiSENGTimnlqyykgafvimsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsk 104
ident
Sbjct reiDMKKV.................................................raq 131
DSSP lllLHHHH.................................................hhh
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH..............
Query nlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsiNGKLGSICGQLLILTYVY.............. 150
ident
Sbjct larrildrivgyslspvlwrnfksnlsaGRVQSATLKLVCDREREIlrfvpkkyhritvn 191
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllleeeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct fdgltaeidvkekkffdaetlkeiqsidelvveekkvsvkkfappepfktstlqqeaysk 251
DSSP elleeeeelllllllllhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeeeelllllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct lgfsvsktmmiaqqlyegvetkdghiafitymrtdstrvsdyakeearnlitevfgeeyv 311
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhleelllleellllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhllhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 150
ident
Sbjct gaheairptnvfmtpeeagkylnsdqkklyeliwkrflasqmkpsqyeetrfvlrtkdgk 371
DSSP llllllllllllllhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeeeelllll
DSSP ..........................................eellllleeelllhhhhh
Query ..........................................gketpdgikitldnltmq 168
ident
Sbjct yrfkgtvlkkifdgyekvwkterntgefpfeegesvkpvvvkieeqetkpkprytegslv 431
DSSP leeeeeeeeeeelhhhhllllllllllllllllleellleeeeeeeellllllllhhhhh
DSSP LLLL......LLHHHHHHHHHHHHLLEEELLLLEEEL..LHHHHHHhLHHHH........
Query ELGY......SSAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQ..NLDYLKRyAPKLD........ 212
ident | | | | | |
Sbjct KEMErlgigrPSTYASTIKLLLNRGYIKKIRGYLYPTivGSVVMDY.LEKKYsdvvsvsf 490
DSSP HHHHhhllllLLLHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEEELhhHHHHHHH.HHHHLlllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 212
ident
Sbjct taemekdldeveqgkktdkivlrefyesfssvfdrndrivvdfptnqkcscgkemrlsfg 550
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeellllleeeeeee
DSSP ..............hhhhhhlhhhHHHHL..
Query ..............ewfylacpatWGKLN.. 227
ident
Sbjct kygfylkcecgktrsvkndeiaviDDGKIfl 581
DSSP lleeeeelllllleellllllleeELLEEel
No 52: 2ESNA MOLECULE: PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhhhhhhhllllleeeellleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee
Query gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP lleeeellllllllllllleeeellleeeeeeeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhh
Query gafvimsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsknlthffyvfqtlqkqv 120
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhhhheellllleeelllhhhhHLLL..lLLHHHH
Query syslakfndfsinGKLGSICGQLLILtyvygketpdgikitldnltmQELG..ySSAVSR 178
ident | | || |
Sbjct ......pllrrldLNLLLVFDALYRH...............rnvgtaASELaisASAFSH 39
DSSP ......lllllllLLHHHHHHHHHHH...............llhhhhHHHHlllHHHHHH
DSSP HHHHHHH...HLLEEELLLLEEEL..LHHHHHHHLHHHHHHHHHHL..............
Query IISKLKQ...EKVIVYKNSCFYVQ..NLDYLKRYAPKLDEWFYLAC.............. 219
ident | | | |
Sbjct ALGRLRQgldDELFLRQGNRMQPTqrAEHLAAAVAAALRALGEGLEewrpfvpgqsqrtf 99
DSSP HHHHHHHhhlLLLEEEELLEEEELhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHhhllllllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 219
ident
Sbjct vfaatdytafallpplmnrlqhsapgvrlrlvnaerklsvealasgridfalgydeeher 159
DSSP eeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllllllhhhhhhlllleeeelllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 219
ident
Sbjct lpegiqahdwfadryvvvarrdhprlagaptlegylaerhavvtpwnedsgvidrllars 219
DSSP lllleeeeeeeeeleeeeeelllllllllllhhhhhlleeeeellllllllhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 219
ident
Sbjct glrrevavqlptvlaalflagstdflltaprhaaralaeaaglalypapfdippyvlrly 279
DSSP lllleeeeeellhhhhhhhhhlllleeeeehhhhhhhhhhhleeeelllllllleeeeee
DSSP ............hhhhhhhl
Query ............patwgkln 227
ident
Sbjct shvqgrdahawmigqlkgld 299
DSSP eellllhhhhhhhhhlllll
No 53: 1PM4A MOLECULE: YPM;
DSSP lhhhhhhhhhllllLEEE....eLLLEeELLLLL.....lleeEEEE......eLEEEEE
Query gsefkkyletngikPKQF....hKKELiFNQWDP.....qeycIFLY......dGITKLT 45
ident | |
Sbjct .........ipniaTYTGtiqgkGEVC.IIGNKEgktrggelyAVLHstnvnadMTLILL 50
DSSP .........llleeEEEEeelllLEEE.EEELLLllllleeeeEEEElllllllEEEEEE
DSSP EELLLLLEEEEEEEELLEEEELLlllllllllLLEEEELLL.....eeEEEEeehhhhhh
Query SISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvgYYNLEVISE.....qaTAYVikinelke 100
ident
Sbjct RNVGGNGWGEIKRNDIDKPLKYE..dyytsglSWIWKIKNNssetsnySLDA........ 100
DSSP EELLLLEEEEEEEEELLLLEEEE..eeellllLEEEEEEELlllleeeEEEE........
DSSP hhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleee
Query llsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgiki 160
ident
Sbjct ............................................................ 100
DSSP ............................................................
DSSP lllhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlh
Query tldnltmqelgyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacp 220
ident
Sbjct ..................................................tvhddkedsd 110
DSSP ..................................................ellllllhhh
DSSP hhhhhhl
Query atwgkln 227
ident
Sbjct vltkcpv 117
DSSP lllllll
No 54: 1J3PA MOLECULE: PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE;
DSSP .........lhhhhhhhHHLL.......................................
Query .........gsefkkylETNG....................................... 12
ident |
Sbjct mkykepfgvkldfetgiIENAkksvrrlsdmkgyfideeawkkmveegdpvvyevyaieq 60
DSSP lllllleeeelllllllLLLLeeeeeehhhhllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeeell
DSSP ........lllEEEE.......LLLEeeLLLLL...LLEEEEEEE.LEEEEEEElllLLE
Query ........ikpKQFH.......KKELifNQWDP...QEYCIFLYD.GITKLTSIsenGTI 53
ident | |
Sbjct eekegdlnfatTVLYpgkvgneFFMT.kGHYHSkidRAEVYFALKgKGGMLLQT..pEGE 117
DSSP lllllleeeeeEEELlleelleELLL.lLLLLLlllLLEEEEEEElLEEEEEEL..lLLL
DSSP EeEEEEELL.EEEELLlllllllLLLLEEEELLL..EEEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhh
Query MnLQYYKGA.FVIMSGfidtetsVGYYNLEVISE..QATAYVIKINelkellsknlthff 110
ident
Sbjct A.RFIEMEPgTIVYVP.......PYWAHRTINTGdkPFIFLALYPA.............. 155
DSSP E.EEEEELLlEEEEEL.......LLLEEEEEELLllLEEEEEEEEL..............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelLLHHhhHLL
Query yvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitLDNLtmQEL 170
ident |
Sbjct ................................daghdygtiaekgfskivvEENG..KVV 181
DSSP ................................llllllhhhhhhllleeeeELLL..EEE
DSSP Llllhhhhhhhhhhhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query Gyssavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct V...................................................kdnpk 187
DSSP E...................................................ellll
No 55: 1Z05A MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY;
DSSP lhhhhhhhhhllllleeeellleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee
Query gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP lleeeellllllllllllleeeellleeeeeeeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhh
Query gafvimsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsknlthffyvfqtlqkqv 120
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhheellllleeelllhhhhHLLL.....lLLH
Query syslakfndfsiNGKLGSICGQLLILTyvygketpdgikitldnltmQELG.....ySSA 175
ident | |
Sbjct ........dhikQINAGRVYKLIDQKG................pisrIDLSkeselaPAS 36
DSSP ........lhhhHHHHHHHHHHHHHHL................lllhHHHHhhhlllHHH
DSSP HHHHHHHHHHHLLEEEL...........LLLEEELL........................
Query VSRIISKLKQEKVIVYK...........NSCFYVQN........................ 200
ident | | | |
Sbjct ITKITRELIDAHLIHETtvqeaisrgrpAVGLQTNNlgwqflsmrlgrgyltialhelgg 96
DSSP HHHHHHHHHHLLLEEEElhhhhhhhlllLEEEEELLlleeeeeeeeelleeeeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 200
ident
Sbjct evlidtkidiheidqddvlarllfeieeffqtyaaqldrvtsiaitlpglvnseqgivlq 156
DSSP leeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleeelllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 200
ident
Sbjct mphynvknlalgpeiykatglpvfvandtrawalaeklfghsqdvdnsvlisihhglgag 216
DSSP llllllllllhhhhhhhhhllleeeeehhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeellleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 200
ident
Sbjct ivldgrvlqgrhgnigelghiqidpqgkrchcgnygcletvassqairdqvtariqagep 276
DSSP eeelleelllllllllllllllllllllllllllllllhhhhlhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 200
ident
Sbjct sclatveeisiedicaaaadgdplavdviqqlgrylgaaiaivinlfnpekiliggvinq 336
DSSP llllllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelhhhh
DSSP .........................................hhhhHHHLHhhhhhhhhhl
Query .........................................ldylKRYAPkldewfylac 219
ident
Sbjct aksilypsieqcireqslpvyhqdlklvesrfykqatmpgaalikQALYD........gl 388
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhllleeeellllllllhhhhhhhhHHHHL........lh
DSSP hhhhhhhl
Query patwgkln 227
ident
Sbjct llmkvveg 396
DSSP hhhhhhhl
No 56: 1PMIA MOLECULE: PHOSPHOMANNOSE ISOMERASE;
DSSP ........................LHHHH...............................
Query ........................GSEFK............................... 5
ident
Sbjct sseklfriqcgyqnydwgkigsssAVAQFvhnsdpsitidetkpyaelwmgthpsvpska 60
DSSP lllleeeeeeleellllleehhhlHHHHHhhhhlllllllllleeleeeellllllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 5
ident
Sbjct idlnnqtlrdlvtakpqeylgesiitkfgsskelpflfkvlsiekvlsiqahpdkklgaq 120
DSSP llllleehhhhhhhlhhhhllhhhhhhhllllllleeeeeeeellllleeelllhhhhhh
DSSP ............hhhhhLLLL.......................................
Query ............kyletNGIK....................................... 14
ident |
Sbjct lhaadpknypddnhkpeMAIAvtdfegfcgfkpldqlaktlatvpelneiigqelvdefi 180
DSSP hhhhlllllllllllleEEEEllleeeeeeellhhhhhhhhhhlhhhhhhhlhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 14
ident
Sbjct sgiklpaevgsqddvnnrkllqkvfgklmntdddvikqqtakllertdrepqvfkdidsr 240
DSSP hhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 14
ident
Sbjct lpeliqrlnkqfpndiglfcgclllnhvglnkgeamflqakdphayisgdiiecmaasdn 300
DSSP hhhhhhhhhhhlllllhhhhlllleeeeeelllleeeellllleeeeeeeeeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 14
ident
Sbjct vvragftpkfkdvknlvemltysyesvekqkmplqefprskgdavksvlydppiaefsvl 360
DSSP leeeelllllllhhhhhhhlllllllhhhhllllllllleeellleeeeellllllleee
DSSP LEEEE...LLLEeeLLLLLLLEEEEEEE.LEEEEEEelllllEEEE.EEEEL.LEEEELL
Query PKQFH...KKELifNQWDPQEYCIFLYD.GITKLTSisengtIMNL.QYYKG.AFVIMSG 68
ident | | |
Sbjct QTIFDkskGGKQ.vIEGLNGPSIVIATNgKGTIQIT......GDDStKQKIDtGYVFFVA 413
DSSP EEELLlllLLEE.eELLLLLLEEEEEEElEEEEEEL......LLHHhLEEEElLLEEEEL
DSSP lllllllLLLLEEEELLL.....EEEEEEEEhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query fidtetsVGYYNLEVISE.....QATAYVIKinelkellsknlthffyvfqtlqkqvsys 123
ident | | |
Sbjct .......PGSSIELTADSanqdqDFTTYRAF............................. 437
DSSP .......LLLLEEEEELLlllllLLEEEEEE.............................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheellllleeelllhhhhhllllllhhhhhhhhh
Query lakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelgyssavsriiskl 183
ident
Sbjct ............................................................ 437
DSSP ............................................................
DSSP hhhlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query kqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct .........................................vea 440
DSSP .........................................lll
No 57: 1XMXA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN VC1899;
DSSP lhhhhhhhhhllllleeeellleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee
Query gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk 60
ident
Sbjct ...........................................................n 1
DSSP ...........................................................l
DSSP lleeeelllLLLL..lllllleeeellleeeeeeeehHHHHHHHHLLH............
Query gafvimsgfIDTE..tsvgyynleviseqatayvikiNELKELLSKNL............ 106
ident
Sbjct amaihvgiiDQDPvrlvtplldhrtvsrhiifigdhtQTVIYQRLSDVlnkrnistdffe 61
DSSP lleeeeeelLLLLhhhhhhhhllllllleeeeeelhhHHHHHHHHHHHhhhllleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 106
ident
Sbjct ipagsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepn 121
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelll
DSSP ..........................hhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHH....
Query ..........................thffyVFQTlqkqvsyslakfndfsiNGKL.... 136
ident
Sbjct sdclcwlypegnndtqvqdritiadyltifgARGE....fnspqldqqlyqlGERWasna 177
DSSP lleeeeeelllllleellllllhhhhhhhllLEEE....lllhhhhhhhhhhHHHHhhlh
DSSP ......hHHHHHHHHHHHHHeelllllEEELllhhhHHLLLlllHHHHHHHHHHHHLLEE
Query ......gSICGQLLILTYVYgketpdgIKITldnltMQELGyssAVSRIISKLKQEKVIV 190
ident | | | |
Sbjct lelgpglATLNYLATTCRKE.....qkLDVE....lSDKQQgyrELNLLLSDLVEAKIAS 228
DSSP hhhhhhhHHHHHHHHHHHHH.....llLEEE....lLHHHHllhHHHHHHHHHHHLLLEE
DSSP ELLLLEEEL...LHHHH.HHHLH.....................................
Query YKNSCFYVQ...NLDYL.KRYAP..................................... 209
ident | |
Sbjct YENGILTFIneeARRFAnGEWLEtlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrn 288
DSSP EELLEEEELlhhHHHHHhLLHHHhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 209
ident
Sbjct eldvatvvnnklhiiecktkgmrdgddtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhndit 348
DSSP eeeeeeeelleeeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhh
DSSP ..............hhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query ..............kldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct raedlglaligpdelkdlkthltqwfkaaggn 380
DSSP hhhhhlleeelhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
No 58: 1UDXA MOLECULE: THE GTP-BINDING PROTEIN OBG;
DSSP lhhhhhhhhhLLLLLEEEEL..............................LLEEE.....
Query gsefkkyletNGIKPKQFHK..............................KELIF..... 25
ident
Sbjct ........mfQDVLVITVAAgrggdgavsfrrekfvpkggpdggdggrggSVYLRargsv 52
DSSP ........llLLEEEEEEELllllllllllllllllllllllllllllllLEEEEellll
DSSP ................................lllllLLEEEEEEEleeeeeeellllle
Query ................................nqwdpQEYCIFLYDgitkltsisengti 53
ident | |
Sbjct dslsrlskrtykaedgehgrgsqqhgrggedlvievpRGTRVFDAD.............. 98
DSSP lllllllllleellllllllllllllllllleeeeelLLEEEEELL..............
DSSP eeeeeeeLLEE.EELLlllllllLLLLEEEELL...........................
Query mnlqyykGAFV.IMSGfidtetsVGYYNLEVIS........................... 85
ident |
Sbjct .......TGELlADLT.......EEGQTVLVARggaggrgnmhfvsptrqaprfaeagee 144
DSSP .......LLLEeEEEL.......LLLLEEEEELlllllllhhhhllllllllleeellll
DSSP .LEEEEEEEEHH................................................
Query .EQATAYVIKIN................................................ 96
ident |
Sbjct gEKRRLRLELMLiadvglvgypnagkssllaamtrahpkiapypfttlspnlgvvevsee 204
DSSP lLEEEEEEEELLllleeeellhhhlhhhhhhhhllllleelllllllllleeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 96
ident
Sbjct erftladipgiiegasegkglgleflrhiartrvllyvldaadeplktletlrkevgayd 264
DSSP leeeeeelllllllhhhlllllhhhhhhhlllleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 96
ident
Sbjct pallrrpslvalnkvdlleeeavkaladalareglavlpvsaltgaglpalkealhalvr 324
DSSP hhhhhlleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhllllleeellllllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhHHHHhllhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhEELLL.
Query elKELLsknlthffyVFQTlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvyGKETP. 155
ident | |
Sbjct stPPPE........mPKPV................................pqaGVEVVp 344
DSSP llLLLL........lLLLL................................lllLLEEEe
DSSP ......LLEEELllhhhhhllllllHHHHHHHHHHhhLLEEelllleeellhhhhhhhlh
Query ......DGIKITldnltmqelgyssAVSRIISKLKqeKVIVyknscfyvqnldylkryap 209
ident
Sbjct vaegvyEVRAPEverylarikgdlmEAAGYLQEVF..RRQG........veaalrakgvr 394
DSSP eelleeEEELHHhhhhhlleeellhHHHHHHHHHH..HHLL........hhhhhhlllll
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query kldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct agdlvrigglefeyipev 412
DSSP llleeeelleeeelllll
No 59: 1LVAA MOLECULE: SELENOCYSTEINE-SPECIFIC ELONGATION FACTOR;
DSSP lhhhhhhhhhllllleeeellleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee
Query gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk 60
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP lleeeellllllllllllleeeellleeeeeeeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhh
Query gafvimsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsknlthffyvfqtlqkqv 120
ident
Sbjct ............................................................ 0
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhheellllleeelllhhhhhLLLL......LL
Query syslakfndfsiNGKLGSICGQLLILTyvygketpdgikitldnltmqELGY......SS 174
ident
Sbjct ............GSPEKILAQIIQEHR................egldwQEAAtraslsLE 32
DSSP ............LLHHHHHHHHHHLLL................lleehHHHHhhhlllHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLLEEELLL....LEEELLH.............................
Query AVSRIISKLKQEKVIVYKNS....CFYVQNL............................. 201
ident
Sbjct ETRKLLQSXAAAGQVTLLRVendlYAISTERyqawwqavtraleefhsryplrpglaree 92
DSSP HHHHHHHHHHHLLLEEEEEElleeEEEEHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleehhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 201
ident
Sbjct lrsryfsrlparvyqalleewsregrlqlaantvalagftpsfsetqkkllkdledkyrv 152
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 201
ident
Sbjct srwqppsfkevagsfnldpseleellhylvregvlvkindefywhrqalgeareviknla 212
DSSP hllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhllleeellllleeehhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ....................hhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhhhl
Query ....................dylkryapkldewfylacpatwgkln 227
ident
Sbjct stgpfglaeardalgssrkyvlplleyldqvkftrrvgdkrvvvgn 258
DSSP llllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 60: 2DDUA MOLECULE: REELIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ltlkpgyvlqfklnigctsqfsstapvllqyshdagmswflvkegcfpasagkgcegnsr 60
DSSP llllllleeeeeellllllllllllleeeeeellllllleelllllllllllllllllll
DSSP .......