DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1OMIA
MOLECULE: LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1OMI-A 38.3 0.0 224 224 100 LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN; "
2: 2HKX-A 17.1 2.8 193 218 13 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
3: 2GAU-A 16.6 2.8 194 218 18 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY; "
4: 2CGP-A 16.3 2.8 189 200 17 PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN); "
5: 2COH-A 15.0 3.0 178 194 15 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
6: 2H6B-A 12.3 10.2 140 239 17 CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K; "
7: 1O5L-A 11.8 3.2 127 129 20 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP FAMILY; "
8: 1FT9-A 10.9 3.6 130 210 9 CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION "
9: 2BYV-E 10.3 3.8 144 922 8 RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4; "
10: 1CX4-A 10.1 4.6 122 275 11 CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE REGULATORY SUBUNIT "
11: 2PQQ-A 10.0 5.1 106 147 13 PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
12: 1Q3E-A 9.5 3.1 110 192 8 POTASSIUM/SODIUM HYPERPOLARIZATION-ACTIVATED "
13: 2D93-A 8.5 2.7 96 134 5 RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 6; "
14: 1U12-A 8.3 3.3 98 131 7 CYCLIC NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN; "
15: 1ZYB-A 7.6 4.4 129 230 8 TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY; "
16: 1WGP-A 6.8 4.1 100 137 14 PROBABLE CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED ION CHANNEL 6; "
17: 2OA2-A 5.6 3.1 77 132 10 BH2720 PROTEIN; "
18: 2B8M-A 5.6 3.8 78 109 15 HYPOTHETICAL PROTEIN MJ0764; "
19: 2Q30-A 5.4 3.0 74 105 8 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
20: 2PFW-A 5.2 3.1 73 112 4 CUPIN 2, CONSERVED BARREL DOMAIN PROTEIN; "
21: 1O4T-A 5.2 3.2 73 115 8 PUTATIVE OXALATE DECARBOXYLASE; "
22: 2I45-A 5.1 3.5 73 96 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
23: 2OPK-A 5.0 3.4 76 110 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
24: 1YHF-A 4.9 3.1 71 114 8 HYPOTHETICAL PROTEIN SPY1581; "
25: 1XJA-A 4.7 2.9 81 165 4 ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN; "
26: 2P17-A 4.6 6.3 85 249 7 PIRIN-LIKE PROTEIN; "
27: 2OZI-A 4.5 3.7 76 95 4 HYPOTHETICAL PROTEIN RPA4178; "
28: 2PYT-A 4.4 3.4 74 128 5 ETHANOLAMINE UTILIZATION PROTEIN EUTQ; "
29: 2IC1-A 4.4 3.1 82 185 13 CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE 1; "
30: 2BNM-A 4.3 3.4 73 194 4 EPOXIDASE; "
31: 1YLL-A 4.3 5.9 89 190 3 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
32: 1SEF-A 4.3 3.2 75 250 9 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
33: 2GM6-A 4.2 3.3 83 192 5 CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE I; "
34: 1Y9Q-A 4.2 3.3 70 178 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, HTH_3 FAMILY; "
35: 2QJV-A 4.1 3.5 73 263 14 UNCHARACTERIZED IOLB-LIKE PROTEIN; "
36: 2FD8-A 4.0 3.9 84 199 7 ALKYLATED DNA REPAIR PROTEIN ALKB; "
37: 2ET1-A 4.0 3.8 76 201 7 OXALATE OXIDASE 1; "
38: 2CAU-A 4.0 4.0 79 344 13 PROTEIN (CANAVALIN); "
39: 1TQ5-A 4.0 3.3 72 234 7 PROTEIN YHHW; "
40: 2O8Q-A 3.8 3.3 68 122 4 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
41: 2D40-A 3.7 4.6 79 288 10 PUTATIVE GENTISATE 1,2-DIOXYGENASE; "
42: 1VR3-A 3.7 3.6 72 179 8 ACIREDUCTONE DIOXYGENASE; "
43: 2YU1-A 3.6 3.2 82 386 5 JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION "
44: 1YFU-A 3.6 9.8 81 174 12 3-HYDROXYANTHRANILATE-3,4-DIOXYGENASE; "
45: 1FXZ-A 3.6 8.2 87 371 7 GLYCININ G1; "
46: 1J58-A 3.5 3.3 76 372 13 YVRK PROTEIN; "
47: 1R7M-A 3.4 7.0 98 223 9 INTRON-ENCODED ENDONUCLEASE I-SCEI; "
48: 1GWK-A 3.4 4.6 74 141 7 NON-CATALYTIC PROTEIN 1; "
49: 1XE7-A 3.3 3.9 76 186 4 HYPOTHETICAL 22.5 KDA PROTEIN IN TUB1-CPR3 "
50: 1TVG-A 3.1 5.0 69 136 10 LOC51668 PROTEIN; "
51: 1MZE-A 3.1 3.3 81 335 6 FACTOR INHIBITING HIF1; "
52: 1E5R-A 3.1 8.6 111 260 8 PROLINE OXIDASE; "
53: 2IUW-A 3.0 4.3 80 205 5 ALKYLATED REPAIR PROTEIN ALKB HOMOLOG 3; "
54: 1K5J-A 2.9 3.2 63 94 5 NUCLEOPLASMIN CORE; "
55: 1J3P-A 2.9 4.1 83 187 6 PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE; "
56: 2OQ6-A 2.8 3.7 85 348 7 JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION "
57: 2HC8-A 2.8 3.3 59 113 8 CATION-TRANSPORTING ATPASE, P-TYPE; "
58: 2HBT-A 2.7 4.0 84 224 6 EGL NINE HOMOLOG 1; "
59: 1XMX-A 2.6 9.7 80 380 10 HYPOTHETICAL PROTEIN VC1899; "
60: 2DQS-A 2.5 4.5 109 994 6 SARCOPLASMIC/ENDOPLASMIC RETICULUM CALCIUM "
61: 1ZX5-A 2.5 3.6 77 300 8 MANNOSEPHOSPHATE ISOMERASE, PUTATIVE; "
62: 2ESN-A 2.4 5.0 63 299 17 PROBABLE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
63: 1NX4-A 2.4 3.3 79 247 5 CARBAPENEM SYNTHASE; "
64: 2Q4A-A 2.3 3.1 83 321 1 CLAVAMINATE SYNTHASE-LIKE PROTEIN AT3G21360; "
65: 2I1W-A 2.3 2.8 59 257 5 PROBABLE INORGANIC POLYPHOSPHATE/ATP-NAD KINASE "
66: 1ZNP-A 2.3 4.2 67 140 4 HYPOTHETICAL PROTEIN ATU3615; "
67: 1GQW-A 2.3 3.5 82 277 7 ALPHA-KETOGLUTARATE-DEPENDENT TAURINE "
68: 1Z05-A 2.2 2.2 51 396 10 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, ROK FAMILY; "
69: 1YOX-A 2.2 5.8 61 190 7 HYPOTHETICAL PROTEIN PA3696; "
-
No 1: 1OMIA MOLECULE: LISTERIOLYSIN REGULATORY PROTEIN;
DSSP LHHHHHHHHLLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
Query GSEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GSEFKKYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
DSSP LHHHHHHHHLLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
DSSP LLEEEELLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query GAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQV 120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GAFVIMSGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQV 120
DSSP LLEEEELLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEELLEEEELLLLLLHHHLLHHHHHHHHH
Query SYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELSAVSRIISKL 180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNLTMQELSAVSRIISKL 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEELLEEEELLLLLLHHHLLHHHHHHHHH
DSSP HHLLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHHHLLL
Query KQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN 224
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPKLDEWFYLACPATWGKLN 224
DSSP HHLLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHHHHHHHHHHLHHHHHLLL
No 2: 2HKXA MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP ..........LHHHHH.....hHHLLlLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEE
Query ..........GSEFKK.....yLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLT 45
ident | || |
Sbjct atqmrltdtnLLEVLNseeysgVLKE.FREQRYSKKAILYTPNTERNLVFLVKSGRVRVY 59
DSSP llllllllllHHHHLLllllllLLLL.LEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEE
DSSP EELlLLLEEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHHHHHLL
Query SISeNGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKN 105
ident | | |
Sbjct LAY.EDKEFTLAILEAGDIFCTH........TRAFIQAME.DTTILYTDIRNFQNIVVEF 109
DSSP EEE.LLEEEEEEEEELLLEEELL........LLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHL
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEELLEEEELLLLL
Query LTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYVYGKETPDGIKITLDNL 165
ident | | | | | | ||| |
Sbjct PAFSLNMVKVLGDLLKLLLTIINGLVFKDARLRLAEFLVQAAMDTGLKVPQGIKLELGLN 169
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHLEEELLEEEEELLLL
DSSP lHHHL........LHHHHHHHHHHHLLLEEELLL.LEEELLHHHHHHHLHhhhhhhhhhl
Query tMQEL........SAVSRIISKLKQEKVIVYKNS.CFYVQNLDYLKRYAPkldewfylac 216
ident | || | | | ||
Sbjct .TEEIalmlgttrQTVSVLLNDFKKMGILERVNQrTLLLKDLQKLKEFSS.......... 218
DSSP .HHHHhhhhlllhHHHHHHHHHHHHLLLEEELLLlEEEELLHHHHHHHLL..........
DSSP hhhhhlll
Query patwgkln 224
ident
Sbjct ........ 218
DSSP ........
No 3: 2GAUA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP/FNR FAMILY;
DSSP ....LHHHHHH.......hHLLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEell
Query ....GSEFKKY.......lETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSise 49
ident | | | | | || | |
Sbjct lghlLRDVWSLlneeerelLDKEIQPFPCKKASTVFSEGDIPNNLFYLYEGKIKILR... 57
DSSP lhhhLHHHHLLllhhhhhhHHHHLEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELLEEEEL...
DSSP llLEEEEEEEELLEEE.ELLLLllLLLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHH
Query ngTIMNLQYYKGAFVI.MSGFIdtETSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTH 108
ident | | | || |
Sbjct ..RFHISRIVKPGQFFgMRPYF..AEETCSSTAIAVE.NSKVLAIPVEAIEALLKGNTSF 112
DSSP ..LLLEEEEELLLLEElHHHHH..HLLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHLHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HEEEEllEEEELLLLLlH
Query FFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYV.YGKETpdGIKITLDNLtM 167
ident | | | | | |||| |
Sbjct CRYFLKALAKELGYAERRTVTLTQKHVRGRLAETLLILKENfGFEND..GATLSIYLS.R 169
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLL..LLLLLLLLL.H
DSSP HHL........LHHHHHHHHHHHLLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHhhhhhhhhhlhhh
Query QEL........SAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPkldewfylacpat 219
ident || | | | | | | |
Sbjct EELatlsnmtvSNAIRTLSTFVSERMLALDGKRIKIIDCDRLQKTAR............. 216
DSSP HHHhhhllllhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEEELLHHHHHHHHH.............
DSSP hhlll
Query wgkln 224
ident
Sbjct ...sg 218
DSSP ...hl
No 4: 2CGPA MOLECULE: PROTEIN (CATABOLITE GENE ACTIVATOR PROTEIN);
DSSP lHHHHHHHHLLlLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
Query gSEFKKYLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
ident | | | | | | | | |
Sbjct .DPTLEWFLSH.CHIHKYPSKSTLIHQGEKAETLYYIVKGSVAVLIKDEEGKEMILSYLN 58
DSSP .LHHHHHHHLL.LEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELLEEEEEELLLLLEEEEEEEL
DSSP LLEEE.ELLLLLLlLLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH
Query GAFVI.MSGFIDTeTSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQ 119
ident | | | | |
Sbjct QGDFIgELGLFEE.GQERSAWVRAKT.ACEVAEISYKKFRQLIQVNPDILMRLSAQMARR 116
DSSP LLLEElHHHLLLL.LLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HEEEELLEEEELLllllHHHL........
Query VSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYV.YGKETPDGIKITLdnltMQEL........ 170
ident | | | || | ||| | ||
Sbjct LQVTSEKVGNLAFLDVTGRIAQTLLNLAKQpDAMTHPDGMQIKI...tRQEIgqivgcsr 173
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHLLLlLLEEELLEEEEEL...lHHHHhhhhlllh
DSSP LHHHHHHHHHHHLLLEEELLLLEEELLhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query SAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident | || | | |
Sbjct ETVGRILKMLEDQNLISAHGKTIVVYG........................... 200
DSSP HHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEEEEL...........................
No 5: 2COHA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP lhhhhhhhhllllLLEELLLLLEEELLLLLL..LEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEE
Query gsefkkyletngiKPKQFHKKELIFNQWDPQ..EYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQY 58
ident | | | | | | | |
Sbjct .............ETVSFKAGDVILYPGVPGprDRAYRVLEGLVRLEAVDEEGNALTLRL 47
DSSP .............LLEEELLLLEEELLLLLLllLLLEEEEELLEEEEEELLLLLEEEEEE
DSSP EELLEEE.ELLLlllLLLLLLLEEEELLlLLEEEEEehhhHHHHHhllHHHHHHHHHHHH
Query YKGAFVI.MSGFidtETSVGYYNLEVISeQATAYVIkineLKELLsknLTHFFYVFQTLQ 117
ident | | | |
Sbjct VRPGGFFgEEAL...FGQERIYFAEAAT.DVRLEPL....PENPD...PELLKDLAQHLS 96
DSSP ELLLLEElLHHH...HLLLLLLEEEELL.LEEEEEL....LLLLL...HHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HEEEELLEEEELLllllHHHL......
Query KQVSYSLAKFNDFSINGKLGSICGQLLILTYV.YGKETPDGIKITLdnltMQEL...... 170
ident || | | ||
Sbjct QGLAEAYRRIERLATQRLKNRXAAALLELSETpLAHEEEGKVVLKA...tHDELaaavgs 153
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHLLLlLEEEELLEEEEEL...lHHHHhhhhll
DSSP ..LHHHHHHHHHHHLLLEEELLLLEEELLHHHHHHHLHhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query ..SAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFYVQNLDYLKRYAPkldewfylacpatwgkln 224
ident | | | | | | || |
Sbjct vrETVTKVIGELAREGYIRSGYGKIQLLDLKGLKELAE...............srg 194
DSSP lhHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEEELLHHHHHHHHL...............lll
No 6: 2H6BA MOLECULE: CHLOROPHENOL REDUCTION GENE K;
DSSP ...................LHHHHHHHHllLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELE
Query ...................GSEFKKYLEtnGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGI 41
ident | | | ||| |
Sbjct veglgkdfcgaiipdnffpIEKLRNYTQ..MGLIRDFAKGSAVIMPGEEITSMIFLVEGK 58
DSSP lllleeeelleeeelllllLHHHHHLHH..HLEEEEELLLLEEELLLLLLLLEEEEEELL
DSSP EEEEEELLLLLEEEEEEEELLEEEELLlllllLLLL.LLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHH
Query TKLTSISENGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidteTSVG.YYNLEVISeQATAYVIKINELKE 100
ident || | | | | | | | | |
Sbjct IKLDIIFEDGSEKLLYYAGGNSLIGKL.....YPTGnNIYATAME.PTRTCWFSEKSLRT 112
DSSP EEEEEELLLLLEEEEEEELLLLEELLL.....LLLLlEEEEEELL.LEEEEEELHHHHHH
DSSP HHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhhhhhhhhhhhhhheeeelleeee
Query LLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYSLAKFNDFsiNGKLgsicgqlliltyvygketpdgiki 160
ident | | | | |
Sbjct VFRTDEDMIFEIFKNYLTKVAYYARQVAEM..NTYN........................ 146
DSSP HHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LEEL........................
DSSP llllllhhhllhhhHHHHHHHHLL....................................
Query tldnltmqelsavsRIISKLKQEK.................................... 184
ident |
Sbjct .............pTIRILRLFYElcssqgkrvgdtyeitmplsqksigeitgvhhvtvs 193
DSSP .............lLHHHHHHHHHhhhhhleeelleeeeellllhhhhhhhhlllhhhhh
DSSP ............leeelllleeELLHhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query ............vivyknscfyVQNLdylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct rvlaclkrenildkkknkiivyNLGE......lkhlseqtsvdklaaaldhh 239
DSSP hhhhhhhhllleeellleeeelLHHH......hhhhhlllleehhhhhhlll
No 7: 1O5LA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, CRP FAMILY;
DSSP lHHHHHhHHLLlLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLLLEEEEEEEE
Query gSEFKKyLETNgIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISENGTIMNLQYYK 60
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Sbjct .MDLKK.LLPC.GKVIVFRKGEIVKHQDDPIEDVLILLEGTLKTEHVSENGKTLEIDEIK 57
DSSP .LLHHH.HHHH.LEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELLEEEEEELLLLLEEEEEEEL
DSSP LLEEEE.lLLLLLlLLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHH
Query GAFVIM.sGFIDTeTSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYVFQTLQKQ 119
ident | | | || |
Sbjct PVQIIAsgFIFSS.EPRFPVNVVAGE.NSKILSIPKEVFLDLLMKDRELLLFFLKDVSEH 115
DSSP LLEELLhhHLLLL.LLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhh
Query VSYSLAKFNDFSINgklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisk 179
ident |
Sbjct FRVVSEKLFFLTTK.............................................. 129
DSSP HHHHHHHHHHHHLL..............................................
DSSP hhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query lkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ............................................. 129
DSSP .............................................
No 8: 1FT9A MOLECULE: CARBON MONOXIDE OXIDATION SYSTEM TRANSCRIPTION
DSSP .....LHHH......hHHHHllLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELl
Query .....GSEF......kKYLEtnGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISe 49
ident | | | | ||
Sbjct pprfnIANVllspdgeTFFR..GFRSKIHAKGSLVCTGEGDENGVFVVVDGRLRVYLVG. 57
DSSP lllllLHHHhllllllLLLL..LLEEEEELLLLEEELLLLLLLLEEEEEELEEEEEEEE.
DSSP LLLEEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHH
Query NGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSKNLTHF 109
ident | | | | |
Sbjct EEREISLFYLTSGDMFCMH........SGCLVEATE.RTEVRFADIRTFEQKLQTCPSMA 108
DSSP LLEEEEEEEEELLLEEELL........LLLEEEELL.LEEEEEELHHHHHHHHHHLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHH...........................................
Query FYVFQTLQKQVSYSLAK........................................... 126
ident |
Sbjct WGLIAILGRALTSCMRTiedlmfhdikqriagffidhanttgrqtgvivsvdftveeian 168
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlhhhhhhhhhhhhhllllllllllllleelllhhhhhh
DSSP ......hhhhHHHH.HHHHHHhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhHHH
Query ......fndfSING.KLGSICgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriISK 179
ident
Sbjct ligssrqttsTALNsLIKEGY........................isrqgrghytipNLV 204
DSSP hhlllhhhhhHHHHhHHHLLL........................leellllleellLHH
DSSP HHHLlleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query LKQEkvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct RLKA.......................................aa 210
DSSP HHHH.......................................ll
No 9: 2BYVE MOLECULE: RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 4;
DSSP .............................LHHH....HHHHHlLLLLLEELLLLLEEELL
Query .............................GSEF....KKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQ 27
ident | | | |
Sbjct wiacldkrplerssedvdiiftrlkgvkaFEKFhpnlLRQIC.LCGYYENLEKGITLFRQ 59
DSSP lhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhlhhHLLLlhhhHHHHH.HHLEEEEELLLLEEELL
DSSP LLLLLEEEEEEELEEEEEEELLLL..LEEEEEEEELLEEEELLLLllLLLLLLLEEEELL
Query WDPQEYCIFLYDGITKLTSISENG..TIMNLQYYKGAFVIMSGFIdtETSVGYYNLEVIS 85
ident | |
Sbjct GDIGTNWYAVLAGSLDVKVSETSShqDAVTICTLGIGTAFGESIL..DNTPRHATIVTRE 117
DSSP LLLLLEEEEEEELLEEEEELLLLLhhHLEEEEEELLLLEELHHHH..HLLLLLLEEEELL
DSSP lLLEEEEEEHHHHHHHHHLLHHHHHHhhHHHH............................
Query eQATAYVIKINELKELLSKNLTHFFYvfQTLQ............................ 117
ident | | | |
Sbjct .SSELLRIEQEDFKALWEKYRQYMAG..LLAPpygvmetgsnnvpsekilragkilriai 174
DSSP .LEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLLllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 117
ident
Sbjct lsraphmirdrkyhlktyrqccvgtelvdwmiqqtscvhsrtqavgmwqvlledgvlnhv 234
DSSP hhhlhhhleeeeelleeeeeeeehhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllleeel
DSSP ..................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..................................kqvsyslakfndfsingklgsicgql 143
ident
Sbjct dqerhfqdkylfyrfldderedaplpteeekkecdeelqdtmlllsqmgpdahmrmilrk 294
DSSP llllllllllleeeehhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP hhhhhhheeeELLE.EEEL..LLLLlhhhllhhhhhhhhhhhllleeELLLleeELLHHH
Query liltyvygkeTPDG.IKIT..LDNLtmqelsavsriisklkqekvivYKNScfyVQNLDY 200
ident
Sbjct ppgqrtvddlEIIYdELLHikALSH.....................lSTTVkreLAGVLI 333
DSSP lhhhllhhhhHHHHhHHLLlhHHLL.....................lLHHHhhhHLLLLE
DSSP hhhHLHH.....................................................
Query lkrYAPK..................................................... 207
ident
Sbjct ...FESHakggtvlfnqgeegtswyiilkgsvnvviygkgvvctlhegddfgklalvnda 390
DSSP ...EEEEllllleeellllllleeeeeeelleeeeellleeeeeelllleelhhhhllll
DSSP .hhhhhhHHLHHHH..............................................
Query .ldewfyLACPATW.............................................. 220
ident |
Sbjct praasivLREDNCHflrvdkedfnrilrdveantvrlkehdqdvlvlekvpaqqkytvms 450
DSSP lllleeeELLLLEEeeeeehhhhhhhhhhhhlleeeeelllleeeeeeelllllleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct gtpekilehfletirlepslneatdsvlndfvmmhcvfmpntqlcpalvahyhaqpsqgt 510
DSSP elhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct eqermdyalnnkrrvirlvlqwaamygdllqeddvamafleefyvsvsddarmmaafkeq 570
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct lpelekivkkrqpirgsdevlfkvycidhtyttirvpvaasvkevisavadklgsgegli 630
DSSP llhhhhlllllllllllleeeeellllllllleeeeellllhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct ivkmnsggekvvlksndvsvfttltingrlfasltplpeqegpttgtvgtfelmsskdla 690
DSSP leeellllleeelllllllllllllllleeellllllhhhhllllllllhhhhllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct yqmttydwelfncvheleliyhtfgrhnfkkttanldlflrrfneiqfwvvtevclcsql 750
DSSP hhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct skrvqllkkfikiaahckeyknlnsffaivmglsnvavsrlaltweklpskfkkfyaefe 810
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlhhhhllhhhhhhllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 220
ident
Sbjct slmdpsrnhrayrltaaklepplipfmpllikdmtfthegnktfidnlvnfekmrmiant 870
DSSP hhlllhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllllleehhhhhhhhhh
DSSP ................................................hlll
Query ................................................gkln 224
ident
Sbjct artvryyrsqpfnpdaaqanknhqdvrsyvrqlnvidnqrtlsqmshrlepr 922
DSSP hhhhhhhllllllllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlll
No 10: 1CX4A MOLECULE: CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE REGULATORY SUBUNIT
DSSP .................LHHH..........hHHHHlLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLE
Query .................GSEF..........kKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEY 33
ident | | | |
Sbjct riihpktddqrnrlqeaCKDIllfknldpeqmSQVL.DAMFEKLVKEGEHVIDQGDDGDN 59
DSSP lllllllhhhhhhhhhhHLLLhhhllllhhhhHHHH.HHLEEEEELLLLEEELLLLLLLE
DSSP EEEEEELEEEEEEELLlLLEEEEEEEELLEEEE.LLLLlLLLLlLLLEEEELLlLLEEEE
Query CIFLYDGITKLTSISEnGTIMNLQYYKGAFVIM.SGFIdTETSvGYYNLEVISeQATAYV 92
ident | | | | |
Sbjct FYVIDRGTFDIYVKCD.GVGRCVGNYDNRGSFGeLALM.YNTP.RAATITATS.PGALWG 115
DSSP EEEEEELEEEEEEEEL.LEEEEEEEEELLLEELhHHHH.HLLL.LLLEEEELL.LEEEEE
DSSP EEHHHHHHHH.HLLH........................hhhhHHHH.............
Query IKINELKELL.SKNL........................thffYVFQ............. 114
ident | |
Sbjct LDRVTFRRIIvKNNAkkrkmyesfieslpflkslevserlkvvDVIGtkvyndgeqiiaq 175
DSSP EEHHHHHHHHhHHHHhhhhhhhhhhhllhhhllllhhhhhhhhHHLEeeeelllleeell
DSSP hhhHHHH.............................hhHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tlqKQVS.............................ysLAKFNDfsingklgsicgqlli 145
ident ||
Sbjct gdsADSFfivesgevritmkrngaveiarclrgqyfgeLALVTN................ 219
DSSP lllLLEEeeeeeeeeeeeeellleeeeeeelllleellHHHHHL................
DSSP hhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhl
Query ltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkrya 205
ident
Sbjct ............................................................ 219
DSSP ............................................................
DSSP hHHHHhhhhhlhhhHHLL..........................................
Query pKLDEwfylacpatWGKL.......................................... 223
ident |
Sbjct .KPRA........aSAHAigtvkclamdvqaferllgpcmeimkrniatyeeqlvalfgt 270
DSSP .LLLL........lEEEEeeeeeeeeeehhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ....l
Query ....n 224
ident
Sbjct nmdiv 275
DSSP lllll
No 11: 2PQQA MOLECULE: PUTATIVE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR;
DSSP ..lHHHH..............HHHHlLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEE
Query ..gSEFK..............KYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKL 44
ident | | || | ||
Sbjct ghxDDVLrrnplfaalddeqsAELR.ASXSEVTLARGDTLFHEGDPGDRLYVVTEGKVKL 59
DSSP lhhHHHHllllllllllhhhhHHHH.HHLEEEEELLLLEEELLLLEELEEEEEEELLEEE
DSSP EEELLLLLEEEEEEEELLEEEElllllLLLLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHHHHHL
Query TSISENGTIMNLQYYKGAFVIMsgfidTETSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELKELLSK 104
ident | | | | | |
Sbjct HRTSPDGRENXLAVVGPSELIG.elslFDPGPRTATGTALT.EVKLLALGHGDLQPWLNV 117
DSSP EEELLLLLEEEEEEELLLLEEL.hhhhLLLEELLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHHHHHH
DSSP LHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellll
Query NLTHFFyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldn 164
ident
Sbjct RPEVAT...................................................... 123
DSSP LLHHHH......................................................
DSSP llhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhHHLHhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query ltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkRYAPkldewfylacpatwgkln 224
ident |
Sbjct .........................allravarrlrktNDAX...........lvfsdgs 147
DSSP .........................hhhhhhhhhhhhhHLLL...........lllllll
No 12: 1Q3EA MOLECULE: POTASSIUM/SODIUM HYPERPOLARIZATION-ACTIVATED
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dssrrqyqekykqveqymsfhklpadfrqkihdyyehryqgkmfdedsilgelngplree 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhllhhhhhh
DSSP ............LHHH.......hHHHHlLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELE
Query ............GSEF.......kKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGI 41
ident | | | | | |
Sbjct ivnfncrklvasMPLFanadpnfvTAML.TKLKFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGV 119
DSSP hhhhhlhhhhhhLHHHhlllhhhhHHHH.LLLEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEELL
DSSP EEEEEelllllEEEEEEEELLEEEE.lLLLLlLLLLlLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHHH
Query TKLTSisengtIMNLQYYKGAFVIM.sGFIDtETSVgYYNLEVISeQATAYVIKINELKE 100
ident | |
Sbjct VSVLT......GNKEMKLSDGSYFGeiCLLT.RGRR.TASVRADT.YCRLYSLSVDNFNE 170
DSSP EEEEL......LLLEEEELLLLEELhhHHHH.LLLL.LLEEEELL.LEEEEEEEHHHHHH
DSSP HHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeee
Query LLSKNLTHFFYVFQTLQKQVSYslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgiki 160
ident |
Sbjct VLEEYPMMRRAFETVAIDRLDR...................................... 192
DSSP HHHHLHHHHHHHHHHHHHHHLL......................................
DSSP llllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhh
Query tldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatw 220
ident
Sbjct ............................................................ 192
DSSP ............................................................
DSSP hlll
Query gkln 224
ident
Sbjct .... 192
DSSP ....
No 13: 2D93A MOLECULE: RAP GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR 6;
DSSP ................LHHH...........hHHHHlLLLLLEELL.LLLEEELLLLLLL
Query ................GSEF...........kKYLEtNGIKPKQFH.KKELIFNQWDPQE 32
ident | |
Sbjct gssgssgdddieqlleFMHQlpafanmtmsvrRELC.SVMIFEVVEqAGAIILEDGQELD 59
DSSP lllllllllhhhhhhhHHHHllllllllhhhhHHHL.LLEEEEEELlLLLEEELLLLEEL
DSSP EEEEEEELEEEEEEEllllLEEEeEEEELLEEEElLLLLLLLLLLLLEEEELLLLLEEEE
Query YCIFLYDGITKLTSIsengTIMNlQYYKGAFVIMsGFIDTETSVGYYNLEVISEQATAYV 92
ident |
Sbjct SWYVILNGTVEISHP....DGKV.ENLFMGNSFG.ITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVC 113
DSSP EEEELLLLLEEEELL....LLLE.EEELLLLEEL.LLLLLLLEELLLEEEELLLLEEEEE
DSSP EEHHHHHHHHHLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhee
Query IKINELKELLSKnlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygk 152
ident | |
Sbjct IAQQDYWRILNH................................................ 125
DSSP EEHHHHHHHLLL................................................
DSSP eelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhh
Query etpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewf 212
ident
Sbjct ............................................................ 125
DSSP ............................................................
DSSP hhhlhhhhhlll
Query ylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...veksgpssg 134
DSSP ...lllllllll
No 14: 1U12A MOLECULE: CYCLIC NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN;
DSSP .......LHHHH..............HHHHlLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEE
Query .......GSEFK..............KYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYD 39
ident | | |
Sbjct rrgdfvrNWQLVaavplfqklgpavlVEIV.RALRARTVPAGAVICRIGEPGDRMFFVVE 59
DSSP llhhhhhHHHHHhlllllllllhhhhHHHH.LLLEEEEELLLLEEELLLLLLLEEEEEEE
DSSP LEEEEEEellllleEEEEEEELLEEEELLLLlLLLLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHH
Query GITKLTSisengtiMNLQYYKGAFVIMSGFIdTETSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELK 99
ident | |
Sbjct GSVSVAT.......PNPVELGPGAFFGEMAL.ISGEPRSATVSAAT.TVSLLSLHSADFQ 110
DSSP LLEEEEL.......LLLEEELLLLEELHHHH.LLLLLLLLEEEELL.LEEEEEEEHHHHH
DSSP HHHHLLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleee
Query ELLSKNLTHffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgik 159
ident | |
Sbjct MLCSSSPEI................................................... 119
DSSP HHHHHLLHH...................................................
DSSP ellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhh
Query itldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpat 219
ident
Sbjct .....................................................aeifrkt 126
DSSP .....................................................hhhhhhh
DSSP hhlll
Query wgkln 224
ident
Sbjct alear 131
DSSP hhhhl
No 15: 1ZYBA MOLECULE: TRANSCRIPTION REGULATOR, CRP FAMILY;
DSSP .................LHHH...........hhHHHLLLLLLEELLLLLEEELLLLLLL
Query .................GSEF...........kkYLETNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQE 32
ident | | | |
Sbjct sdkihhhhhhxetxfdtLLQLplfqglchedftsILDKVKLHFIKHKAGETIIKSGNPCT 60
DSSP llllllhhhhhhhhhllHHHLhhhllllhhhhhhHHHLLLLEEEEELLLLEEELLLLLLL
DSSP EEEEEEELEEEEEEELLLL.LEEEeEEEELLEEEE.lLLLLLlLLLLLLEEEELLlLLEE
Query YCIFLYDGITKLTSISENG.TIMNlQYYKGAFVIM.sGFIDTeTSVGYYNLEVISeQATA 90
ident || | |
Sbjct QLCFLLKGEISIVTNAKENiYTVI.EQIEAPYLIEpqSLFGX.NTNYASSYVAHT.EVHT 117
DSSP EEEEEEELEEEEEEELHHHlLEEE.EEEELLEEELhhHHLLL.LLLLLLEEEELL.LEEE
DSSP EEEEHHHHH.HHHHlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................
Query YVIKINELK.ELLSkNLTHFFYVFQTLQKQVSYSL......................... 124
ident | |
Sbjct VCISKAFVLsDLFR.YDIFRLNYXNIVSNRAQNLYsrlwdeptldlkskiirfflshcek 176
DSSP EEEEHHHHHhLHHH.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllllhhhhhhhhhhlllll
DSSP .......................hhhhhhHHHH.hHHHH.......hHHHHhhhhhheee
Query .......................akfndfSING.kLGSI.......cGQLLiltyvygke 153
ident
Sbjct pqgektfkvkxddlarclddtrlnisktlNELQdnGLIElhrkeiliPDAQ......... 227
DSSP lllleeeellhhhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHhlLLLEeelleeeeLLHH.........
DSSP elleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhh
Query tpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfy 213
ident
Sbjct ............................................................ 227
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhlll
Query lacpatwgkln 224
ident
Sbjct ........kll 230
DSSP ........hhl
No 16: 1WGPA MOLECULE: PROBABLE CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED ION CHANNEL 6;
DSSP .......LHHH..........hHHHHlLLLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEE
Query .......GSEF..........kKYLEtNGIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITK 43
ident || | | || | |
Sbjct gssgssgVRRVplfenmderllDAIC.ERLKPCLFTEKSYLVREGDPVNEMLFIIRGRLE 59
DSSP lllllllLLLLlhhhlllhhhhHHHH.HHLLLLLLLLLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLE
DSSP EEEELLL..lLEEEeEEEELLEEEELL........llLLLLLLLLLEEEELLlLLEEEEE
Query LTSISEN..gTIMNlQYYKGAFVIMSG........fiDTETSVGYYNLEVISeQATAYVI 93
ident | |
Sbjct SVTTDGGrsgFYNR.SLLKEGDFCGDElltwaldpksGSNLPSSTRTVKALT.EVEAFAL 117
DSSP EELLLLLlllLLLE.EELLLLLLLLLHhhhhhhllllLLLLLLLLLEEEELL.LLEEEEE
DSSP EHHHHHHHHHLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheee
Query KINELKELLSKNLThffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygke 153
ident ||| |
Sbjct IADELKFVASQFRR.............................................. 131
DSSP EHHHHHHHHHHHLL..............................................
DSSP elleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhh
Query tpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfy 213
ident
Sbjct ............................................................ 131
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhlll
Query lacpatwgkln 224
ident
Sbjct .....sgpssg 137
DSSP .....llllll
No 17: 2OA2A MOLECULE: BH2720 PROTEIN;
DSSP .........lhHHHHH.............hhllllllEELLLLLEEELLLLL.LLEEEEE
Query .........gsEFKKY.............letngikpKQFHKKELIFNQWDP.QEYCIFL 37
ident | | |
Sbjct vtdhgprpfvvNIEDEtkrnrafrralwtgdhlqvtlXSIQVGEDIGLEIHPhLDQFLRV 60
DSSP lllllllllllLHHHHhhhlllleeeeeelllleeeeEEELLLLLLLLLLLLlLEEEEEE
DSSP EELEEEEEEelllLLEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLEEEEEEHH
Query YDGITKLTSisenGTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKIN 96
ident | | | | |
Sbjct EEGRGLVQXghrqDNLHFQEEVFDDYAILIP......AGTWHNVRNTGnRPLKLYSIYAP 114
DSSP EELEEEEEEelllLLLLEEEEEELLLEEEEL......LLLEEEEEELLlLLEEEEEEEEL
DSSP Hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeell
Query Elkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpd 156
ident
Sbjct P........................................................... 115
DSSP L...........................................................
DSSP eeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhl
Query gikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylac 216
ident
Sbjct ...................................................qhphgtvhe 124
DSSP ...................................................lllllleel
DSSP hhhhhlll
Query patwgkln 224
ident
Sbjct tkaiaxaa 132
DSSP lhhhhhhl
No 18: 2B8MA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MJ0764;
DSSP ............lhhhhhhHHLL....lLLLEELLLLLEEELLLLLLLEEEEEEELEEEE
Query ............gsefkkyLETN....gIKPKQFHKKELIFNQWDPQEYCIFLYDGITKL 44
ident | | | | |
Sbjct gxiekvyefkrdaktkvveKLVNtehvqINHIVLPRGEQXPKHYSNSYVHLIIIKGEXTL 60
DSSP lllllllllllllllleeeEEEElllleEEEEEEELLLLLLLEELLLLEEEEEEELEEEE
DSSP EEElllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEEL.LLLLEEEEEEHHHhhhhhh
Query TSIsengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI.SEQATAYVIKINElkells 103
ident | || | | | |
Sbjct TLE.....DQEPHNYKEGNIVYVP......FNVKXLIQNInSDILEFFVVKAPH...... 103
DSSP EEL.....LLLLEEEELLLEEEEL......LLLEEEEELLlLLEEEEEEEELLL......
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeelll
Query knlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitld 163
ident
Sbjct ............................................................ 103
DSSP ............................................................
DSSP lllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhll
Query nltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkl 223
ident
Sbjct .......................................................pkkln 108
DSSP .......................................................hhhhl
DSSP l
Query n 224
ident
Sbjct a 109
DSSP l
No 19: 2Q30A MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;
DSSP lhhhhhhhhLLLLL.........................lEELLLLLEEELLLLL..lLE
Query gsefkkyleTNGIK.........................pKQFHKKELIFNQWDP..qEY 33
ident | |
Sbjct ........xKSHNLleavrfddqrfvxelvhesenfkivsFTFKAGQELPVHSHNiegEL 52
DSSP ........lEEEELllllllllllleeeeeeelllleeeeEEELLLLEEEEELLLlllEE
DSSP EEEEEELEEEEEEElllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLEEEEE
Query CIFLYDGITKLTSIsengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVI 93
ident | | | |
Sbjct NIVVLEGEGEFVGD.....GDAVIPAPRGAVLVAP......ISTPHGVRAVT.DXKVLVT 100
DSSP EEEEEELLEEEELH.....HHLEEEELLLEEEEEE......LLLLEEEEELL.LEEEEEE
DSSP EHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheee
Query KINElkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygke 153
ident
Sbjct IAPP........................................................ 104
DSSP EELL........................................................
DSSP elleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhh
Query tpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfy 213
ident
Sbjct ............................................................ 104
DSSP ............................................................
DSSP hhlhhhhhlll
Query lacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..........i 105
DSSP ..........l
No 20: 2PFWA MOLECULE: CUPIN 2, CONSERVED BARREL DOMAIN PROTEIN;
DSSP ..................lhhhhhhHHLL....lLLLEELLLLLEEeLLLLLLLEEEEEE
Query ..................gsefkkyLETN....gIKPKQFHKKELIfNQWDPQEYCIFLY 38
ident | |
Sbjct xqqsehfsfgeqteiediggglkrqXLGFnhelxAVKIWFDKGAEGyVHAHRHSQVSYVV 60
DSSP lllllleellllllleelllleeeeEEEEelleeEEEEEELLLEEEeEELLLLEEEEEEE
DSSP ELEEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHh
Query DGITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVIKINEl 98
ident |
Sbjct EGEFHVN......vdGVIKVLTAGDSFFVP......PHVDHGAVCPT.GGILIDTFSPA. 106
DSSP EELEEEE......elLEEEEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELL.LEEEEEEEELL.
DSSP hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeellee
Query kellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgi 158
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP eellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhh
Query kitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpa 218
ident
Sbjct ............................................................ 106
DSSP ............................................................
DSSP hhhlll
Query twgkln 224
ident
Sbjct redfve 112
DSSP lhhhll
No 21: 1O4TA MOLECULE: PUTATIVE OXALATE DECARBOXYLASE;
DSSP ...................lhhhhhhHHLL.........lLLLEELLLLLEeELLLLL..
Query ...................gsefkkyLETN.........gIKPKQFHKKELiFNQWDP.. 30
ident
Sbjct mvvrsseitperisnmrggkgevemaHLLSkeamhnkarlFARMKLPPGSS.VGLHKHeg 59
DSSP leeehhhllleeeelhhhllleeeeeELLLllllllleeeEEEEEELLLLE.EEEEELll
DSSP lLEEEEEEELEEEEEEellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLE
Query qEYCIFLYDGITKLTSisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQAT 89
ident | | | | |
Sbjct eFEIYYILLGEGVFHD......nGKDVPIKAGDVCFTD......SGESHSIENTGnTDLE 107
DSSP eEEEEEEEELEEEEEE......lLEEEEEELLEEEEEL......LLLEEEEELLLlLLEE
DSSP EEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query AYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyv 149
ident |
Sbjct FLAVIIL..................................................... 114
DSSP EEEEEEE.....................................................
DSSP heeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhh
Query ygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkld 209
ident
Sbjct ............................................................ 114
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhlll
Query ewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..............l 115
DSSP ..............l
No 22: 2I45A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP .lhHHHHH..............hhlllLLLEELLLLLeeeLLLLlLLEEEEEEELEEEEE
Query .gsEFKKY..............letngIKPKQFHKKElifNQWDpQEYCIFLYDGITKLT 45
ident | | |
Sbjct etiNLKQHlaaikeywqpeiinrhgfqFHLVKLLGDY..gWHTH.SDKVLFAVEGDXAVD 57
DSSP lleEHHHHhhhllllllleeeeelleeEEEEEEEEEL..lLLLL.LLEEEEELLLLEEEE
DSSP EElllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHhhhhhhhll
Query SIsengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVIKINelkellskn 105
ident |
Sbjct FA.....DGGSXTIREGEXAVVP......KSVSHRPRSEN.GCSLVLIELS......... 96
DSSP EL.....LLLEEEELLLEEEEEL......LLLLEEEEEEE.EEEEEEEELL.........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeelllll
Query lthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnl 165
ident
Sbjct ............................................................ 96
DSSP ............................................................
DSSP lhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query tmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ........................................................... 96
DSSP ...........................................................
No 23: 2OPKA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ...............lhhhhhhHHLL....lLLLEELLLLLE..eeLLLLLLLEEEEEEE
Query ...............gsefkkyLETN....gIKPKQFHKKEL..ifNQWDPQEYCIFLYD 39
ident | ||
Sbjct xdpkhgnlfadvpvgapdeifqPLLErkglkIERIISNGQASppgfWYDSPQDEWVXVVS 60
DSSP llleeeelllllllllllleeeEEEEelleeEEEEEELLLLLllllLLLLLLEEEEEEEE
DSSP LEEEEEEEllllLEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLL..LLEEEEEEHHh
Query GITKLTSIsengTIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISE..QATAYVIKINe 97
ident |
Sbjct GSAGIECE....GDTAPRVXRPGDWLHVP......AHCRHRVAWTDGgePTVWLAVHCD. 109
DSSP LLEEEEEL....LLLLLEEELLLEEEEEL......LLLLEEEEEELLllLEEEEEEEEL.
DSSP hhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelle
Query lkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdg 157
ident
Sbjct ............................................................ 109
DSSP ............................................................
DSSP eeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlh
Query ikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacp 217
ident
Sbjct ............................................................ 109
DSSP ............................................................
DSSP hhhhlll
Query atwgkln 224
ident
Sbjct ......a 110
DSSP ......l
No 24: 1YHFA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SPY1581;
DSSP lhhhhhhhHLLL...............................lLLEELLLLLEeELLLL
Query gsefkkylETNG...............................iKPKQFHKKELiFNQWD 29
ident | |
Sbjct ...naxsyINNIehakvldltqevxieqdqxlsrtlvqrqdlgiTVFSLDKGQE.IGRHS 56
DSSP ...lllllLLLLlllllllhhhhllllllleeeeeeeeelleeeEEEEELLLLE.EEEEL
DSSP L.LLEEEEEEELEEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLL
Query P.QEYCIFLYDGITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQA 88
ident | | | |
Sbjct SpGDAXVTILSGLAEIT......idQETYRVAEGQTIVXP......AGIPHALYAVE.AF 103
DSSP LlLEEEEEEEELEEEEE......elLEEEEEELLLEEEEL......LLLLEEEEELL.LE
DSSP EEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query TAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqllilty 148
ident
Sbjct QXLLVVVK.................................................... 111
DSSP EEEEEEEL....................................................
DSSP hheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhh
Query vygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkl 208
ident
Sbjct ............................................................ 111
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhlhhhhhlll
Query dewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct .............pea 114
DSSP .............lll
No 25: 1XJAA MOLECULE: ARABINOSE OPERON REGULATORY PROTEIN;
DSSP .lhhhhhhhhlllLLLEELL....LLLEeELLLLLL..LEEEEEEELEEEEEEEllllle
Query .gsefkkyletngIKPKQFH....KKELiFNQWDPQ..EYCIFLYDGITKLTSIsengti 53
ident |
Sbjct pllpgysfnahlvAGLTPIEangvLDFF.IDRPLGMkgYILNLTIRGQGVVKNQ...... 53
DSSP llllllllllleeEEEEEEEllllLLLE.EEELLLLllEEEEEEEEELEEEEEL......
DSSP EEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEEL..LLLLEEEEEEHH...............
Query MNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI..SEQATAYVIKIN............... 96
ident
Sbjct GREFVCRPGDILLFP......PGEIHHYGRHpeAREWYHQWVYFRpraywhewlnwpsif 107
DSSP LEEEEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELllLLEEEEEEEEELllhhhhhhlllleee
DSSP .....................................hhhHHHHlLHHHHHhhhhhhhhh
Query .....................................elkELLSkNLTHFFyvfqtlqkq 119
ident | |
Sbjct antgffrpdeahqphfsdlfgqiinagqgegrysellainLLEQlLLRRME......... 158
DSSP lleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhHHHHhHHHHHH.........
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhh
Query vsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisk 179
ident
Sbjct ............................................................ 158
DSSP ............................................................
DSSP hhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query lkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ......................................aineslh 165
DSSP ......................................hhhhlll
No 26: 2P17A MOLECULE: PIRIN-LIKE PROTEIN;
DSSP ..................lhhhhhhHHLLL...........llLEELLLLLEeeLLLLL.
Query ..................gsefkkyLETNG...........ikPKQFHKKELifNQWDP. 30
ident |
Sbjct xaiqrrirrvktvqxttnspihrsgSVLEPgnwqeydpflllxEDIFERGTF.dVHPHRg 59
DSSP lleelleeeeeelleeeeelleeeeEEELLllhhhhlleeeeeEEEELLLLL.lLEEELl
DSSP LLEEEEEEELEEEEEEEllllleeEEEEEELLEEEELLlllllLLLLLLEEEELL.LLLE
Query QEYCIFLYDGITKLTSIsengtimNLQYYKGAFVIMSGfidteTSVGYYNLEVIS.EQAT 89
ident | | | |
Sbjct IETVTYVISGELEHFDS.....kaGHSTLGPGDVQWXT....aGRGVVHKEDPASgSTVH 110
DSSP EEEEEEEEELLEEEEEL.....llEEEEELLLLEEEEE....lLLLEEEEEEELLlLLEE
DSSP EEEEEHH..................hhhhhhhllhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query AYVIKIN..................elkellsknlthfFYVFqtlqkqvsyslakfndfs 131
ident |
Sbjct SLQLWVNlpsaykxtepryqnlrskdxpvrkeegatirVFSG.................. 152
DSSP EEEEEEEllhhhllllleeeeelhhhlleeeelleeeeEEEL..................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelll
Query ingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivykns 191
ident
Sbjct ............................................................ 152
DSSP ............................................................
DSSP leeellhhhhhhhlhhhhhhhhhHLHH.................................
Query cfyvqnldylkryapkldewfylACPA................................. 218
ident
Sbjct ....sskgvkaptknivpvtxveXIVEpgttvvqdlpghyngflyilegsgvfgadnieg 208
DSSP ....eelleelllllllleeeeeEEELllleeeeeeellleeeeeeeeleeeelllleee
DSSP ....................hHHLL...............l
Query ....................tWGKL...............n 224
ident
Sbjct kagqalffsrhnrgeetelnvTAREklrlllyagepvnepv 249
DSSP elleeeeellllllleeeeeeEELLleeeeeeeelllllll
No 27: 2OZIA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RPA4178;
DSSP ..lhhhhhhHHLL....lLLLEELLLLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELllllEE
Query ..gsefkkyLETN....gIKPKQFHKKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISengtIM 54
ident |
Sbjct gxtvaakseIQIDndevrVTEWRLPPGSAtgHHTHGXDYVVVPXADGETIVAPD....GT 56
DSSP llleeleeeEEEEllleeEEEEEELLLEEllLEELLLLEEEEELLLLLLEELLL....LL
DSSP EEEEEELL.EEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhh
Query NLQYYKGA.FVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyv 112
ident | |
Sbjct RSLAQLKTgRSYARK......AGVQHDVRNEStAEIVFLEIELK................ 94
DSSP EELLLLLLlLLEEEL......LLLEEEEEELLlLLEEEEEEEEL................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllh
Query fqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsa 172
ident
Sbjct ............................................................ 94
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query vsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...................................................a 95
DSSP ...................................................l
No 28: 2PYTA MOLECULE: ETHANOLAMINE UTILIZATION PROTEIN EUTQ;
DSSP ................lhhhhHHHHL...........................lllLLEE
Query ................gsefkKYLET...........................ngiKPKQ 17
ident |
Sbjct lelgtxqpsftsvtgkggvkvIDGSSvkfgrfdgaephcvgltdlvteqdgssxaaGFXQ 60
DSSP llllllllllleeellllleeELHHHllleelhhhllllleeeeeelhhhlllleeEEEE
DSSP LLLLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEEllllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLL
Query FHKKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSIsengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVG 77
ident | | |
Sbjct WDNAFF..PWTLNYDEIDXVLEGELHVRHE......GETXIAKAGDVXFIP......KGS 106
DSSP EEEEEE..EEELLLEEEEEEEEEEEEEEEL......LEEEEEELLLEEEEL......LLL
DSSP LLEEEELLlLLEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query YYNLEVISeQATAYVIKINElkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklg 137
ident
Sbjct SIEFGTPT.SVRFLYVAWPA........................................ 125
DSSP EEEEEEEE.EEEEEEEEELL........................................
DSSP hhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeell
Query sicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqn 197
ident
Sbjct ............................................................ 125
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query ldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ........................nwq 128
DSSP ........................lll
No 29: 2IC1A MOLECULE: CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE 1;
DSSP ..lhhhHHHHHLLL..............................................
Query ..gsefKKYLETNG.............................................. 12
ident |
Sbjct vlkprtLADLIRILhqlfagdevnveevqaimeayesdptewamyakfdqyrytrnlvdq 60
DSSP llllllHHHHHHHHhhhlllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllllllleeeeeel
DSSP ......lLLEELL.LLLEeeLLLLL.LLEEEEEEELEEEEEE......elLLLLEEEEEE
Query ......iKPKQFH.KKELifNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTS......isENGTIMNLQY 58
ident | | |
Sbjct gngkfnlMILCWGeGHGS.sIHDHTnSHCFLKMLQGNLKETLfawpdkksNEMVKKSERV 119
DSSP hhhlleeEEEEELlLLLL.lEELLLlLEEEEEEEELLEEEEEelllllllLLLLEEEEEE
DSSP EELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL..LLLEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhh
Query YKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS..EQATAYVIKINElkellsknlthffyvfqtl 116
ident | | | || | |
Sbjct LRENQCAYIN.....dSIGLHRVENIShtEPAVSLHLYSPP................... 155
DSSP LLLLLEEEEL.....lLLLEEEEEELLllLLEEEEEEEELL...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhh
Query qkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsri 176
ident
Sbjct ............................................................ 155
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query isklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..................fdtchafdqrtghknkvtmtfhskfgirtp 185
DSSP ..................lleeeeelllllleeeeelllleelleell
No 30: 2BNMA MOLECULE: EPOXIDASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ktastgfaellkdrreqvkmdhaalasllgetpetvaawengeggeltltqlgriahvlg 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhll
DSSP ...................................lhhhhhhHHLL.......lLLLEEL
Query ...................................gsefkkyLETN.......gIKPKQF 18
ident
Sbjct tsigaltppagndlddgviiqmpderpilkgvrdnvdyyvynCLVRtkrapslvPLVVDV 120
DSSP lllhhhllllllllllllllllhhhlleellllllllleeeeELLLllllllleEEEEEE
DSSP LLLL..eeeLLLL.LLLEEEEEEELEEEEEEELllLLEEEeEEEELLEEEELLlllllll
Query HKKE..lifNQWD.PQEYCIFLYDGITKLTSISenGTIMNlQYYKGAFVIMSGfidtets 75
ident | |
Sbjct LTDNpddakFNSGhAGNEFLFVLEGEIHMKWGD.kENPKE.ALLPTGASMFVE......e 172
DSSP LLLLhhhllLLLLlLLLEEEEEEELLEEEEELL.lLLLEE.EEELLLLEEEEL......l
DSSP lLLLEEEEL..LLLLEEEEEEHhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query vGYYNLEVI..SEQATAYVIKInelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsin 133
ident |
Sbjct hVPHAFTAAkgTGSAKLIAVNF...................................... 194
DSSP lLLEEEEELllLLLEEEEEEEL......................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllle
Query gklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscf 193
ident
Sbjct ............................................................ 194
DSSP ............................................................
DSSP eellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query yvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ............................... 194
DSSP ...............................
No 31: 1YLLA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ............lhhhhhhHHLL...........lLLLEELLLLLeeeLLLL.LLLEEEE
Query ............gsefkkyLETN...........gIKPKQFHKKElifNQWD.PQEYCIF 36
ident |
Sbjct selrilravdyprxpgsteEIARdggdgldgfgwrLSIADVGESG..gFSGFaGYQRIIS 58
DSSP leeeeelhhhlleelleeeEEEEllllhhhllleeEEEEEELLLE..eELLLlLLEEEEE
DSSP EEEL.EEEEEEelllllEEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLLLLEEEEEEH
Query LYDG.ITKLTSisengtIMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISEQATAYVIKI 95
ident | |
Sbjct VLEGgGXRLRV.....dGAESAPLRARQAFAFS......GDSEVHCTLLDGAIRDFNLIY 107
DSSP EEELlLEEEEE.....lLEELLLLLLLLLEEEE......LLLLEEEEELLLLEEEEEEEE
DSSP H.hhHHHHhllhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeee
Query N.elKELLsknlthffYVFQtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygket 154
ident
Sbjct AprrHRAR........LQWL........................................ 119
DSSP LlllEEEE........EEEE........................................
DSSP lleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query pdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfyl 214
ident
Sbjct ............................................................ 119
DSSP ............................................................
DSSP HLHH..................................................hHHLL.
Query ACPA..................................................tWGKL. 223
ident
Sbjct RVEGeldwhgtastlllfaqqdgvaislqgqprgqlaahdclcaeglqglqhwrlTAHEp 179
DSSP EEEEeeeeeellleeeeeelllleeeeelleeeeeelllleeeeellllleeeeeEEEEe
DSSP ..........l
Query ..........n 224
ident
Sbjct awvcaveldsl 190
DSSP eeeeeeeeeel
No 32: 1SEFA MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ...............................................lhhHHHH......
Query ...............................................gseFKKY...... 7
ident
Sbjct kelltsravikkdnyaiiphdglvqnavpgfenvdisilgspklgatfvdYIATfhkngq 60
DSSP lllllllleeellleeeelhhhlllllllleeeeeeeelllhhhlllleeEEEEeeeeee
DSSP .........hhlLLLL............................................
Query .........letNGIK............................................ 14
ident
Sbjct qttgfggdgiqtLVYVidgrlrvsdgqetheleaggyayftpemkmylanaqeadtevfl 120
DSSP elllllllleeeEEEEeeleeeeelllleeeeelleeeeelllllleeeellllleeeee
DSSP ...................................................LEELLLLLE
Query ...................................................PKQFHKKEL 23
ident |
Sbjct ykkryqplaghqpykvvgsihdqqpeeyegmtdvllwsllpkefdfdmnmhILSFEPGAS 180
DSSP eeeellllllllllleeeehhhllleehhhllleeeeellllllllleeeeEEEELLLLL
DSSP .eeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEE
Query .ifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLE 82
ident || | | |
Sbjct hayIETHVQEHGAYLISGQGMYNL......dNEWYPVEKGDYIFMS......AYVPQAAY 228
DSSP lllLLLLLLLEEEEEEELEEEEEE......lLEEEEEELLLEEEEL......LLLLEEEE
DSSP ELLL..LLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query VISE..QATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsic 140
ident |
Sbjct AVGReePLMYVYSKDA............................................ 244
DSSP EELLllLEEEEEEEEL............................................
DSSP hhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhh
Query gqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldy 200
ident
Sbjct ............................................................ 244
DSSP ............................................................
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query lkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..................nrepel 250
DSSP ..................llllll
No 33: 2GM6A MOLECULE: CYSTEINE DIOXYGENASE TYPE I;
DSSP lhhhhHHHHLLL................................................
Query gsefkKYLETNG................................................ 12
ident
Sbjct ....sLAPLREFitglsalldeqpgearilreggallarlvarddwlpdafaqphpeyyq 56
DSSP ....lLHHHHHHhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllllllle
DSSP .............llLEELL.LLLEeeLLLLLLLEEEEEEELEEEEEEELLL.....LLE
Query .............ikPKQFH.KKELifNQWDPQEYCIFLYDGITKLTSISEN.....GTI 53
ident | |
Sbjct qxllhcdsaerfsivSFVWGpGQRT.pIHDHTVWGLIGXLRGAEYSQPFVLDgsgrpVLH 115
DSSP eeeeeelllllleeeEEEELlLLLL.lLLLLLLLEEEEEEELLEEEEEEEELlllleEEL
DSSP EEEEEEELLEEEELLlllllLLLLLLEEEELL..LLLEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhh
Query MNLQYYKGAFVIMSGfidteTSVGYYNLEVIS..EQATAYVIKINElkellsknlthffy 111
ident | |
Sbjct GEPTRLEPGHVEAVS....pTVGDIHRVHNAYddRVSISIHVYGAN.............. 157
DSSP LLLEEELLLLEEEEL....lLLLLLEEEEELLllLLEEEEEEELLL..............
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhll
Query vfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqels 171
ident
Sbjct ............................................................ 157
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query avsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..................iggvrrsvyteagerkpfisgysnpylpnpwdrsk 192
DSSP ..................hhhlleeeellllleeeelllllllllllllllll
No 34: 1Y9QA MOLECULE: TRANSCRIPTIONAL REGULATOR, HTH_3 FAMILY;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tdvxfksqianqlknlrksrglsldataqltgvskaxlgqiergessptiatlwkiasgl 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhh
DSSP .......................lhhhhhhHHLL.......lLLLEELLLLLEeeLLLLL
Query .......................gsefkkyLETN.......gIKPKQFHKKELifNQWDP 30
ident |
Sbjct easfsaffandpqllssersfpddlnxkihTLFPyaadtgleIFEITLLDHHQ.qXSSPH 119
DSSP llllhhhhllllhhhhhllllllllleeeeEEEEeelllleeEEEEEELLLLE.eEELLL
DSSP ...LLEEEEEEELEEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELLLL
Query ...QEYCIFLYDGITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVISEQ 87
ident | || | | |
Sbjct algVIEYIHVLEGIXKVF......fdEQWHELQQGEHIRFF......sdQPHGYAAVTEK 167
DSSP lllLEEEEEEEELLEEEE......elLEEEEELLLLEEEEE......llLLEEEEELLLL
DSSP LEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqllilt 147
ident | |
Sbjct AVFQNIVAY................................................... 176
DSSP EEEEEEEEL...................................................
DSSP hhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhh
Query yvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapk 207
ident
Sbjct ............................................................ 176
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhlhhhhhlll
Query ldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...............pr 178
DSSP ...............ll
No 35: 2QJVA MOLECULE: UNCHARACTERIZED IOLB-LIKE PROTEIN;
DSSP ................lhhhhhhhhlllLLLEELLLLLEeELLLL.lLLEEEEEEELEEE
Query ................gsefkkyletngIKPKQFHKKELiFNQWD.pQEYCIFLYDGITK 43
ident | | | | | |
Sbjct anllstctsesgniqhispqnagweyvgFDVWQLXAGES.ITLPSdeRERCLVLVAGLAS 59
DSSP llleelllllleeeeeelhhhhllllleEEEEEELLLLE.EEELLllEEEEEEEEELLEE
DSSP EEeellllleeeEEEEEL..........LEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLEEEEE
Query LTsisengtimnLQYYKG..........AFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVI 93
ident | | | |
Sbjct VX......aadsFFYRIGqrxspferipAYSVYLP......HHTEAXVTAET.DLELAVC 106
DSSP EE......elleEEEEELllllhhhlllLLEEEEL......LLLLEEEEELL.LEEEEEE
DSSP EHH.........................................................
Query KIN......................................................... 96
ident
Sbjct SAPgfgelpvrlispqevgvehrgxgrnqrlvhnilpdsqladsllvvevytnagatssw 166
DSSP EEEllllllleeelhhhleeeeellhhhleeeeeeellllllllleeeeeeelllleell
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 96
ident
Sbjct pahxhdtavegqetyleetyyhrfnppqgfclqrvytddrsldecxavynrdvvxvpxgy 226
DSSP lleeleeeellleeeleeeeeeeeelllleeeeeeelllllleeeeeeellleeeellll
DSSP .............hhhHHHHLLHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .............elkELLSKNLThffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgql 143
ident
Sbjct hpvatiagydnyylnvXAGPLRXW.................................... 250
DSSP lleeelllleeeeeeeEELLLLLL....................................
DSSP hhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhh
Query liltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkr 203
ident
Sbjct ............................................................ 250
DSSP ............................................................
DSSP hlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query yapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ........rftweenhawins 263
DSSP ........lleelhhhhhhhl
No 36: 2FD8A MOLECULE: ALKYLATED DNA REPAIR PROTEIN ALKB;
DSSP ...............LHHHHHHH.....................................
Query ...............GSEFKKYL..................................... 8
ident
Sbjct laagavilrrfafnaAEQLIRDIndvasqspfrqmvtpggytmsvamtncghlgwtthrq 60
DSSP lllleeeelllllllHHHHHHHHhhhhlllllllllllllllllleeeeeelleeeelll
DSSP .................hLLLL.....................lLEELLLLLEeelLLLL
Query .................eTNGI.....................kPKQFHKKELifnQWDP 30
ident |
Sbjct gylyspidpqtnkpwpamPQSFhnlcqraataagypdfqpdaclINRYAPGAKlslHQDK 120
DSSP leeeelllllllllllllLHHHhhhhhhhhhhhlllllllleeeEEEELLLLLeeeELLL
DSSP ......lLEEEEEEELEEEEEEE..lLLLLEEeEEEEELLEEEELLllllLLLL.LLLEE
Query ......qEYCIFLYDGITKLTSI..sENGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtETSV.GYYNL 81
ident | | | | |
Sbjct depdlraPIVSVSLGLPAIFQFGglkRNDPLK.RLLLEHGDVVVWG....GESRlFYHGI 175
DSSP lllllllLEEEEEEELLEEEEELlllLLLLLE.EEEELLLLEEEEL....HHHHhLLEEE
DSSP .EELL.......LLLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .EVIS.......EQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsin 133
ident
Sbjct qPLKAgfhpltiDCRYNLTFRQA..................................... 198
DSSP lLLLLlllllllLLEEEEEEELL.....................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllle
Query gklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscf 193
ident
Sbjct ............................................................ 198
DSSP ............................................................
DSSP eellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query yvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..............................g 199
DSSP ..............................l
No 37: 2ET1A MOLECULE: OXALATE OXIDASE 1;
DSSP .............................lhhhhhhhhLLLL..................
Query .............................gsefkkyleTNGI.................. 13
ident
Sbjct tdpdplqdfcvadldgkavsvnghtckpmseagddflfSSKLtkagntstpngsavteld 60
DSSP llllllllllllllllllllllllllllhhhlllllllLLLLllllllllllleeeeeel
DSSP ..............lLEELLLLLEEELLLLL.LLEEEEEEELEEEEE...eelLLLLEEE
Query ..............kPKQFHKKELIFNQWDP.QEYCIFLYDGITKLT...sisENGTIMN 55
ident | | |
Sbjct vaewpgtntlgvsmnRVDFAPGGTNPPHIHPrATEIGMVMKGELLVGilgsldSGNKLYS 120
DSSP llllhhhllllleeeEEEELLLLEEEEEELLlLLEEEEEEELLEEEEeellhhHLLLEEE
DSSP eEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhh
Query lQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyvfq 114
ident | |
Sbjct .RVVRAGETFVIP......RGLMHFQFNVGkTEAYMVVSFNS.................. 155
DSSP .EEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELLlLLEEEEEEELL..................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhh
Query tlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavs 174
ident
Sbjct ............................................................ 155
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query riisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ....qnpgivfvpltlfgsdppiptpvltkalrveagvvellkskfaggs 201
DSSP ....llllleehhhhhhhllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhllllll
No 38: 2CAUA MOLECULE: PROTEIN (CANAVALIN);
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct nnpylfrsnkfltlfknqhgslrllqrfnedteklenlrdyrvleycskpntlllphhsd 60
DSSP lllleelhhheeeeeeelleeeeeellllllllllhhhlleeeeeeeellleeeeeeeel
DSSP .lhhHHHH....................hHLLL...........................
Query .gseFKKY....................lETNG........................... 12
ident
Sbjct sdllVLVLegqailvlvnpdgrdtykldqGDAIkiqagtpfylinpdnnqnlrilkfait 120
DSSP leeeEEEEeleeeeeeeelleeeeeeeelLEEEeellllleeeeelllllleeeeeeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 12
ident
Sbjct frrpgtvedfflsstkrlpsylsafsknfleasydspydeieqtllqeeqegvivkmpdk 180
DSSP lllllllleeelllllllllhhhhllhhhhhhhhlllhhhhhhhllllllllleeellll
DSSP ...................................llLEELLLLLEeELLLLL..LLEEE
Query ...................................ikPKQFHKKELiFNQWDP..QEYCI 35
ident | | |
Sbjct pfnlrsrdpiysnnygklyeitpeknsqlrdldillnCLQMNEGAL.FVPHYNsrATVIL 239
DSSP leellllllleellleeeeeelhhhlhhhhhhlleeeEEEELLLEE.EEEEEEllLEEEE
DSSP EEEELEEEEEEE.llLLLEEeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLEEEEEE
Query FLYDGITKLTSI.seNGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVIK 94
ident | | | | | |
Sbjct VANEGRAEVELVgleQLRRY.AATLSEGDIIVIP......SSFPVALKAAS.DLNMVGIG 291
DSSP EEEELLEEEEEEeelLEEEE.EEEELLLLEEEEL......LLLLEEEEELL.LEEEEEEE
DSSP HHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeee
Query INelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygket 154
ident |
Sbjct VN.......................................................... 293
DSSP EL..........................................................
DSSP lleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhh
Query pdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfyl 214
ident
Sbjct ...................aennernflaghkenvirqiprqvsdltfpgsgeeveelle 334
DSSP ...................llllleeelllllllhhhhllhhhhhhhllllhhhhhhhhh
DSSP hlhhhhhlll
Query acpatwgkln 224
ident
Sbjct nqkesyfvdg 344
DSSP hllllleeel
No 39: 1TQ5A MOLECULE: PROTEIN YHHW;
DSSP .........................................LHHH...............
Query .........................................GSEF............... 4
ident
Sbjct xiylrkanerghanhgwldswhtfsfanyydpnfxgfsalrVINDdvieagqgfgthphk 60
DSSP leeeelhhhleeeellleeeeellllllllllllllllleeEEEEeeelllleeeeeeel
DSSP .....................................................hHHHH..
Query .....................................................kKYLE.. 9
ident
Sbjct dxeiltyvlegtvehqdsxgnkeqvpagefqixsagtgirhseynpssterlhlYQIWix 120
DSSP lleeeeeeeeleeeeeelllleeeeellleeeeelllleeeeeellllllleeeEEEEel
DSSP ......................................lllllLEELLLLLEeELLLLL.
Query ......................................tngikPKQFHKKELiFNQWDP. 30
ident | |
Sbjct peengitpryeqrrfdavqgkqlvlspdardgslkvhqdxelyRWALLKDEQ.SVHQIAa 179
DSSP lllllllleeeeellllllleeeeeelllhhhleellllleeeEEEELLLLE.EEELLLl
DSSP .LLEEEEEEELEEEEEeellllleeeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLE
Query .QEYCIFLYDGITKLTsisengtimnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQAT 89
ident | | |
Sbjct eRRVWIQVVKGNVTIN..........GVKASTSDGLAIW......DEQAISIHADS.DSE 222
DSSP lLEEEEEEEELEEEEL..........LEEEELLLEEEEE......LLLLEEEEELL.LEE
DSSP EEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query AYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyv 149
ident
Sbjct VLLFDLP..................................................... 229
DSSP EEEEEEL.....................................................
DSSP heeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhh
Query ygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkld 209
ident
Sbjct ............................................................ 229
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhlll
Query ewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..........pvhhh 234
DSSP ..........lllll
No 40: 2O8QA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;
DSSP ....................lhhhhhhHHLL........lLLLEELLllleeelLLLLL.
Query ....................gsefkkyLETN........gIKPKQFHkkelifnQWDPQ. 31
ident
Sbjct gxklqttiqhepkdgsgfdrreffeyrDTGVneatggxfgAHVIRAI...pptwHTHTVg 57
DSSP lllllleeelllllllllllllleeeeELLHhhhhlllleEEEEEEL...llllEEELLl
DSSP LEEEEEEELEEEEEEEllllleEEEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELLLLLEEE
Query EYCIFLYDGITKLTSIsengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVISEQATAY 91
ident | |
Sbjct FQLFYVLRGWVEFEYE.....dIGAVXLEAGGSAFQP......pgVRHRELRHSDDLEVL 106
DSSP LEEEEEEELEEEEEEL.....lLEEEEEELLLEEELL......llLLEEEEEELLLLEEE
DSSP EEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhe
Query VIKINElkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvyg 151
ident |
Sbjct EIVSPA...................................................... 112
DSSP EEELLL......................................................
DSSP eeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhh
Query ketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldew 211
ident
Sbjct ............................................................ 112
DSSP ............................................................
DSSP hhhhlhhhhhlll
Query fylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...gfatsvvdle 122
DSSP ...llleeellll
No 41: 2D40A MOLECULE: PUTATIVE GENTISATE 1,2-DIOXYGENASE;
DSSP ..........................lhhhhhhhhlllLLLEELLLLLEeELLLLL.LLE
Query ..........................gsefkkyletngIKPKQFHKKELiFNQWDP.QEY 33
ident | |
Sbjct tpnancapaywnyqeirpllvlenpalrgqssitatlyAGLQLIXPGEV.APSHRHnQSA 59
DSSP lllllllleeellllllllleellllllllllllllleEEEEEELLLLE.EEEEEElLLE
DSSP EEEEEEL.EEEEEeellllleEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLEEE
Query CIFLYDG.ITKLTsisengtiMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAY 91
ident | | | |
Sbjct LRFIVEGkGAFTA......vdGERTPXNEGDFILTP......QWRWHDHGNPGdEPVIWL 107
DSSP EEEEEELlLLEEE......elLEEEELLLLLEEEEL......LLLLEEEELLLlLLEEEE
DSSP EEEhhHHHH...................................................
Query VIKinELKE................................................... 100
ident |
Sbjct DGL..DLPLvnilgcgfaedypqqpvtrkegdylpryaanxlplrhqtgnsspifnyryd 165
DSSP EEE..LHHHhhhhlllleeellllllllllllhhhhhllleellllllllllllleelhh
DSSP ............................hhhllhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ............................llsknlthffYVFQtlqkqvsyslakfndfsi 132
ident |
Sbjct rsrevlhdltrlgdadewdgykxryvnpvtggypxpsxGAFL.................. 207
DSSP hhhhhhhhhhlllllllllleeeeelllllllllllllEEEE..................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeellll
Query ngklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknsc 192
ident
Sbjct .......................qllpkgfasrvarttdstiyhvvegsgqviignetfs 244
DSSP .......................eeellllllllleellleeeeeeeeeeeeeelleeee
DSSP eeellhhhhhhhlhhhhhhhHHHL............hhhhhlll
Query fyvqnldylkryapkldewfYLAC............patwgkln 224
ident
Sbjct fsakdifvvptwhgvsfqttQDSVlfsfsdrpvqealglfrear 288
DSSP eellleeeellllleeeeeeEEEEeeeeelhhhhhhllllleel
No 42: 1VR3A MOLECULE: ACIREDUCTONE DIOXYGENASE;
DSSP ..........................................LHHHHH.........hhh
Query ..........................................GSEFKK.........yle 9
ident
Sbjct xvqawyxdestadprkphraqpdrpvsleqlrtlgvlywkldADKYENdpelekirkxrn 60
DSSP lleeeelllllllllllllllllllllhhhhhhllleeeellHHHLLLlhhhhhhhhhhl
DSSP lllLLLEELL..........llleeelLLLLLLEEEEEEELEEEEEeellLLLEEEeEEE
Query tngIKPKQFH..........kkelifnQWDPQEYCIFLYDGITKLTsiseNGTIMNlQYY 59
ident | |
Sbjct yswXDIITICkdtlpnyeekikxffeeHLHLDEEIRYILEGSGYFDvrdkEDKWIR.ISX 119
DSSP lleEEEEEELllllllhhhhhhhhhllEELLLLEEEEEEEEEEEEEeellLLLEEE.EEE
DSSP ELLEEEELLllllllllLLLEEEEL.LLLLEEEEEEhHHHHhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query KGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVI.SEQATAYVIKiNELKellsknlthffyvfqtlqk 118
ident | | | |
Sbjct EKGDXITLP......agIYHRFTLDeKNYVKAXRLFvGEPV................... 154
DSSP ELLEEEEEL......llLLEEEEELlLLLEEEEEEElLLLL...................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhh
Query qvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriis 178
ident
Sbjct ............................................................ 154
DSSP ............................................................
DSSP hhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query klkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct .....................wtpynrpadhfdarvqyxsflegta 179
DSSP .....................llleellllllhhhhhhhhhhhhll
No 43: 2YU1A MOLECULE: JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION
DSSP ................................................lhHHHH......
Query ................................................gsEFKK...... 6
ident
Sbjct rtfdleeklhtnkynanfvtfmegkdfnveyiqrgglrdplifknsdglgIKMPdpdftv 60
DSSP llllhhhhhhllllllllleellhhhllhhhhhhhllllleeelllllllLLLLlllllh
DSSP .......................................................hhHLL
Query .......................................................ylETN 11
ident |
Sbjct ndvkmcvgsrrmvdvmdvntqkgiemtmaqwtryyetpeeereklynvislefshtrLEN 120
DSSP hhhhhhllllllllleellllllllllhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllLHH
DSSP LL..............................lLEELLLLLEeELLLLLL...LEEEEEE
Query GI..............................kPKQFHKKELiFNQWDPQ...EYCIFLY 38
ident
Sbjct MVqrpstvdfidwvdnmwprhlkemqypkvqkyCLMSVRGCY.TDFHVDFggtSVWYHIH 179
DSSP HLlllhhhhhhlhhhhhllhhhlllllllllleEEEELLLLE.EEEELLHhhlEEEEEEE
DSSP ELEEEEEE.........................ELLLLLEEEeEEEELLEEEELLlllll
Query DGITKLTS.........................ISENGTIMNlQYYKGAFVIMSGfidte 73
ident | |
Sbjct QGGKVFWLipptahnlelyenwllsgsqgdiflGDRVSDCQR.IELKQGYTFVIP..... 233
DSSP ELLEEEEEelllhhhhhhhhhhhhllllllllhHHHLLLLEE.EEELLLLEEEEL.....
DSSP lLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHH....hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query tSVGYYNLEVISeQATAYVIKIN....elkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfnd 129
ident |
Sbjct .SGWIHAVYTPT.DTLVFGGNFLhsfnipmqlkiyniedrtrvpnkfrypfyyemcwyvl 291
DSSP .LLLEEEEELLL.LEEEEEEEELllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeel
Query fsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyk 189
ident
Sbjct eryvycitnrshltkefqkeslsmdleqvhlthfeleglrclvdkleslplhkkcvptgi 351
DSSP hhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhlllllll
DSSP llleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query nscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ededaliadvkilleelansdpklaltgvpivqwp 386
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhllllllllll
No 44: 1YFUA MOLECULE: 3-HYDROXYANTHRANILATE-3,4-DIOXYGENASE;
DSSP .....................lhhhhhhHHLL....lLLLEeLLLLLeeeLLLLLLLEEE
Query .....................gsefkkyLETN....gIKPKqFHKKElifNQWDPQEYCI 35
ident || |
Sbjct mltygapfnfprwidehahllkppvgnrQVWQdsdfiVTVV.GGPNHrtdYHDDPLEEFF 59
DSSP lllllllllhhhhhhhlhhhlllllleeELLLllleeEEEE.LLLLLlllEEELLLLEEE
DSSP EEEELEEEEEEELLlLLEEeEEEEELLEEEELLllllllllLLLEEEELLLLLEEEEEEH
Query FLYDGITKLTSISEnGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtetsvGYYNLEVISEQATAYVIKI 95
ident | | | | ||
Sbjct YQLRGNAYLNLWVD.GRRE.RADLKEGDIFLLP......phVRHSPQRPEAGSACLVIER 111
DSSP EEEELLEEEEEEEL.LEEE.EEEELLLLEEEEL......llLLEEEELLLLLLEEEEEEE
DSSP H................hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHhhh
Query N................elkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndFSINGKLgsi 139
ident |
Sbjct QrpagmldgfewycdacghlvhrvevqlksivtdlpplfesfyasedkrrCPHCGQV... 168
DSSP LlllllleeeeeelllllleeeeeeellllhhhhlhhhhhhhhllhhhhlLLLLLLL...
DSSP hhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhh
Query cgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnld 199
ident
Sbjct ............................................................ 168
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query ylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...................hpgraa 174
DSSP ...................llllll
No 45: 1FXZA MOLECULE: GLYCININ G1;
DSSP ..lhhhhhhhHLLL..........................LLLEELLLLLEEeLLLLL.L
Query ..gsefkkylETNG..........................IKPKQFHKKELIfNQWDP.Q 31
ident |
Sbjct necqiqklnaLKPDnriesegglietwnpnnkpfqcagvaLSRCTLNRNALR.RPSYTnG 59
DSSP llllllllllLLLLleeeelleeeeelllllhhhhhhlleEEEEEELLLEEE.EEEEElL
DSSP LEEEEEEELEEEEEE...eLLLL.LEEEeEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.L
Query EYCIFLYDGITKLTS...iSENG.TIMNlQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.E 86
ident | | |
Sbjct PQEIYIQQGKGIFGMiypgCPSTrHQKI.YNFREGDLIAVP......TGVAWWMYNNEdT 112
DSSP LEEEEEEELLEEEEEelllLLLLlLLLE.EEELLLEEEEEL......LLLEEEEEELLlL
DSSP LLEEEEEEHH..................................................
Query QATAYVIKIN.................................................. 96
ident | |
Sbjct PVVAVSIIDTnslenqldqmprrfylagnqeqeflkyqqggsilsgftleflehafsvdk 172
DSSP LEEEEEEELLlllllllllllleeelllllllllhhhhllllhhhhllhhhhhhhhlllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 96
ident
Sbjct qiaknlqgekgaivtvkgglsvikpictmrlrhnigqtsspdiynpqagsvttatsldfp 232
DSSP hhhhhhlllllleeelllllllllllllllleeelllllllleeellleeeeeelllllh
DSSP .........................hhhHHHH............................
Query .........................elkELLS............................ 103
ident
Sbjct alswlrlsaefgslrknamfvphynlnaNSIIyalngraliqvvncngervfdgelqegr 292
DSSP hhlllllleeeeeelllleeeeeeelllLEEEeeeeleeeeeeellllleeeeeeeelll
DSSP .........................llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .........................knlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgs 138
ident
Sbjct vlivpqnfvvaarsqsdnfeyvsfktndtpmigtlagansllnalpeeviqhtfnlksqq 352
DSSP eeeelllleeeeeelllleeeeeeelllllleeelllllllhhhllhhhhhhhhlllhhh
DSSP hhhhhhhhhhhheeeELLEeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellh
Query icgqlliltyvygkeTPDGikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnl 198
ident
Sbjct arqiknnnpfkflvpPQES......................................... 371
DSSP hhhhhhlllllleelLLLL.........................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query dylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct .......................... 371
DSSP ..........................
No 46: 1J58A MOLECULE: YVRK PROTEIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pqpirgdkgatvkiprnierdrqnpdxlvppetdhgtvsnxkfsfsdthnrlekggyare 60
DSSP llleelleellllllllhhhhhhlhhhhllllllllllllleelhhhllleeelleeeee
DSSP ................................lhhHHHH.....................
Query ................................gseFKKY..................... 7
ident
Sbjct vtvrelpisenlasvnxrlkpgairelhwhkeaewAYXIygsarvtivdekgrsfiddvg 120
DSSP ellllllllllleeeeeeelllleeeeeeellleeEEEEeeeeeeeeellllleeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 7
ident
Sbjct egdlwyfpsglphsiqaleegaefllvfddgsfsenstfqltdwlahtpkeviaanfgvt 180
DSSP lleeeeellllleeeeeeeeeeeeeeeellllllhhheeehhhhhhlllhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 7
ident
Sbjct keeisnlpgkekyifenqlpgslkddivegpngevpypftyrlleqepieseggkvyiad 240
DSSP lhhhllllllllleelllllllhhhhllllllllllllleeehhhllleellleeeeeel
DSSP ......hhlllLLLEELLLLLEEELLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEEllllleEEEEEEE
Query ......letngIKPKQFHKKELIFNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSIsengtiMNLQYYK 60
ident | | | | |
Sbjct stnfkvsktiaSALVTVEPGAXRELHWHPnTHEWQYYISGKARXTVF.asdghARTFNYQ 299
DSSP lllllllllleEEEEEELLLLEEEEEELLlLLEEEEEEELEEEEEEE.eelleEEEEEEE
DSSP LLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhh
Query GAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkq 119
ident | | | | |
Sbjct AGDVGYVP......FAXGHYVENIGdEPLVFLEIFKD....................... 330
DSSP LLLEEEEL......LLLLEEEEELLlLLEEEEEEELL.......................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhh
Query vsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisk 179
ident
Sbjct ............................................................ 330
DSSP ............................................................
DSSP hhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query lkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...dhyadvslnqwlaxlpetfvqahldlgkdftdvlskekhpvv 372
DSSP ...llllleehhhhhhlllhhhhhhhhlllhhhhlllllllllll
No 47: 1R7MA MOLECULE: INTRON-ENCODED ENDONUCLEASE I-SCEI;
DSSP lhhhhhhhhLLLLLleellllleeelllllLLEE.....................eeeee
Query gsefkkyleTNGIKpkqfhkkelifnqwdpQEYC.....................iflyd 39
ident
Sbjct .........NIKKN..........qvmnlgPNSKllkeyksqlielnieqfeagiglilg 41
DSSP .........LLLHH..........hhllllLLLHhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhl
DSSP lEEEEEEELlllleeeeeeEELL.....................................
Query gITKLTSISengtimnlqyYKGA..................................... 62
ident
Sbjct dAYIRSRDE....gktycmQFEWknkaymdhvcllydqwvlspphkkervnhlgnlvitw 97
DSSP lLEEELLLL....lllleeEEEEllhhhhhhhhhhlhhhllllleeeeeellllleeeee
DSSP .EEEEllllllllllllleeeellllleeeeeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query .FVIMsgfidtetsvgyynleviseqatayvikinelkellsknlthffyvfqtlqkqvs 121
ident
Sbjct gAQTF..........................................khqafnklanlfi 115
DSSP eEELL..........................................llhhhhhhhhhhe
DSSP hhhhhhhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHHHHEEEEL.......lEEEELLLLllHHHLlhhh
Query yslakfndfsingKLGSiCGQLLILTYVYGKETP.......dGIKITLDNltMQELsavs 174
ident | | |
Sbjct vnnkktipnnlveNYLT.PMSLAYWFMDDGGKWDynknstnkSIVLNTQS..FTFE.eve 171
DSSP elleelllllhhhHHLL.HHHHHHHHHHHEEELLllllllllLEEELLLL..LLHH.hhh
DSSP hhHHHHHH..LLLEEELL....LLEEEL..LHHHHHHHlhhhHHHHhhhLHHHHHLLL
Query riISKLKQ..EKVIVYKN....SCFYVQ..NLDYLKRYapklDEWFylaCPATWGKLN 224
ident | | | | ||
Sbjct ylVKGLRNkfQLNCYVKInknkPIIYIDsmSYLIFYNL...iKPYL...IPQMMYKLP 223
DSSP hhHHHHHHhhLLLEEEEEelleEEEEELhhHHHHHHHH...hLLLL...LHHHHHHLL
No 48: 1GWKA MOLECULE: NON-CATALYTIC PROTEIN 1;
DSSP ...................lhhhhhhhhlLLLL.LEELL..LLLEeELLL........ll
Query ...................gsefkkyletNGIK.PKQFH..KKELiFNQW........dp 30
ident | |
Sbjct ratytvifknasglpngydnwgwgctlsyYGGAxIINPQegKYGA.VSLKrnsgsfrggs 59
DSSP llleeeeellllllllleeelllleeeeeELLEeEEEELllLLLE.EEEEelllllllle
DSSP lLEEEEEeELEEEEEEEL.LLLLEEEEEEEELLE.EEEL.llllllllllLLEEEELL.L
Query qEYCIFLyDGITKLTSIS.ENGTIMNLQYYKGAF.VIMS.gfidtetsvgYYNLEVIS.E 86
ident | | |
Sbjct lRFDXKN.EGKVKILVENsEADEKFEVETISPSDeYVTYildvdfdlpfdRIDFQDAPgN 118
DSSP eEEEEEE.LLLEEEEEEElLLLEEEEEEEELLEEeEEEEeeellllllllEEEEEELLlL
DSSP LLEEEEEEHhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query QATAYVIKInelkellsknlthffyvfqtlqkqvsYSLAkfndfsingklgsicgqllil 146
ident
Sbjct GDRIWIKNL.....................vhstgSADD..................... 136
DSSP LLLEEEEEE.....................eeellLLLL.....................
DSSP hhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlh
Query tyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryap 206
ident
Sbjct ............................................................ 136
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhhhlhhhhhlll
Query kldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct .............fvdpi 141
DSSP .............lllll
No 49: 1XE7A MOLECULE: HYPOTHETICAL 22.5 KDA PROTEIN IN TUB1-CPR3
DSSP ..................................lhhhhhhHHLL...............
Query ..................................gsefkkyLETN............... 11
ident
Sbjct anaaiepasfvkvpmpeppsslqqlindwqlikhreggyfkETDRspytmevekpvmvtr 60
DSSP llllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhlleellllleeeEEEEllleeeellllleee
DSSP ...lLLLEELLL.LLEEeLLLLL.LLEEEEEEELEEEEEEElllLLEEeEEEEE......
Query ...gIKPKQFHK.KELIfNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTSIsenGTIMnLQYYK...... 60
ident | | |
Sbjct nqstLIYYLLTPdSPIG.KFHKNiNRIIHILQRGKGQYVLVypdGQVK.SFKVGfdykng 118
DSSP elleEEEEEELLlLLEE.EEEEElLLEEEEEEEELEEEEEElllLLEE.EEEELllhhhl
DSSP llEEEELLllllllLLLLLEEEELL.....LLLEEEEEEHHHhhhhhhllhhhhhhhhhh
Query gaFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.....EQATAYVIKINElkellsknlthffyvfqt 115
ident
Sbjct evSQWVVP......GGVFKASFLLPneefdNGFLISEVVVPG.................. 154
DSSP llLEEEEL......LLLEEEEEELLlllllLLEEEEEEELLL..................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhh
Query lqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsr 175
ident
Sbjct ............................................................ 154
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query iisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct .................fdfedhtflkgedelkhlvgpekaaelaflah 186
DSSP .................llhhheeellhhhhhhhhhlhhhhhhlhhhll
No 50: 1TVGA MOLECULE: LOC51668 PROTEIN;
DSSP .......................lhhhhHHHHlllLLLEEL..lLLLEeELLL.....ll
Query .......................gsefkKYLEtngIKPKQF..hKKELiFNQW.....dp 30
ident |
Sbjct idlclssegsevilatssdekhppeniiDGNP...ETFWTTtgmFPQE.FIICfhkhvri 56
DSSP lllllhhhlleeellllllllllhhhhhLLLL...LLLEELlllLLEE.EEEEeeeeeee
DSSP lLEEEEEEEL.EEEEEEELLL..LLEEEEEEEE......lLEEEELLlllllllllLLEE
Query qEYCIFLYDG.ITKLTSISEN..GTIMNLQYYK......gAFVIMSGfidtetsvgYYNL 81
ident | | | |
Sbjct eRLVIQSYFVqTLKIEKSTSKepVDFEQWIEKDlvhtegqLQNEEIV...ahgsatYLRF 113
DSSP eEEEEEEELEeEEEEEEELLLllLLLEEEEEEElllllllLEEEEEL...lleeeeEEEE
DSSP EELLL...LLEEEEeehhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query EVISE...QATAYVikinelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgs 138
ident | |
Sbjct IIVSAfdhFASVHS.............................................. 127
DSSP EEEEElllLLEEEE..............................................
DSSP hhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellh
Query icgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnl 198
ident
Sbjct ............................................................ 127
DSSP ............................................................
DSSP hhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query dylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct .................vsaegtvvs 136
DSSP .................eeeeeeeel
No 51: 1MZEA MOLECULE: FACTOR INHIBITING HIF1;
DSSP .........................................................LHH
Query .........................................................GSE 3
ident
Sbjct sgepreeagalgpawdesqlrsysfptrpiprlsqsdpraeelieneepvvltdtnlVYP 60
DSSP llllleelllleelllhhhllllllleeelleellllhhhhhhhhlllleeelllllLHH
DSSP H...........................................................
Query F........................................................... 4
ident
Sbjct Alkwdleylqenigngdfsvysasthkflyydekkmanfqnfkprsnreemkfhefvekl 120
DSSP Hhhllhhhhhhhlllleeeeeeelllllllllhhhhhhlllllllleeeeeehhhhhhhh
DSSP ..........................hhHHHL..................llLLLEELLL
Query ..........................kkYLET..................ngIKPKQFHK 20
ident
Sbjct qdiqqrggeerlylqqtlndtvgrkivmDFLGfnwnwinkqqgkrgwgqltsNLLLIGME 180
DSSP hhhhhllllleeeeeeellllllhhhhhHHHLllhhhhhhhhhhhlllleeeEEEEEELL
DSSP LLEeELLLLL.LLEEEEEEELEEEEEE.................................
Query KELiFNQWDP.QEYCIFLYDGITKLTS................................. 46
ident | |
Sbjct GNV.TPAHYDeQQNFFAQIKGYKRCILfppdqfeclypypvhhpcdrqsqvdfdnpdyer 239
DSSP LLE.EEEELLlLEEEEEEEELLEEEEEelhhhhhhhllllllllllllllllllllllll
DSSP ..ellLLLEEeEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEEL..LLLLEEEEEEHHhhhhhh
Query ..iseNGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVI..SEQATAYVIKINelkell 102
ident | | |
Sbjct fpnfqNVVGY.ETVVGPGDVLYIP......MYWWHHIESLlnGGITITVNFWYK...... 286
DSSP lhhhhHLLEE.EEEELLLLEEEEL......LLLEEEEEELllLLLEEEEEEEEL......
DSSP hllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeell
Query sknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitl 162
ident
Sbjct ............................................................ 286
DSSP ............................................................
DSSP llllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhl
Query dnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgk 222
ident
Sbjct .............gaptpieyplkahqkvaimrniekmlgealgnpqevgpllntmikgr 333
DSSP .............lllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ll
Query ln 224
ident
Sbjct yn 335
DSSP ll
No 52: 1E5RA MOLECULE: PROLINE OXIDASE;
DSSP ...................................................lhhhHHHHH
Query ...................................................gsefKKYLE 9
ident |
Sbjct mrshilgkieldqtrlapdlaylaavptveefsngfwkhvplwnaptahvehvpyLKEIV 60
DSSP llleeeeellllhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeeeeelllllllllllhHHHHH
DSSP LL........lLLLEELLLLLEeelLLLLLLEEEEEEE...lEEEEEEellllleeeEEE
Query TN........gIKPKQFHKKELifnQWDPQEYCIFLYD...gITKLTSisengtimnLQY 58
ident |
Sbjct TTvfdgthlqmARSRNLKNAIViphRDFRYFRTFMVLEdsplAFHSNE.........DTV 111
DSSP HHhllllleeeEEEEEEELEEEeeeLLLLLLLEEEELLllllEEEEEL.........LEE
DSSP EELL..EEEELLllllllllLLLEEEELLL..LLEEEEEEHH.....hhHHHHhLLHHHH
Query YKGA..FVIMSGfidtetsvGYYNLEVISE..QATAYVIKIN.....elKELLsKNLTHF 109
ident | || |
Sbjct IHMRpgEIWFLD.......aATVHSAVNFSeiSRQSLCVDFAfdgpfdeKEIF.ADATLY 163
DSSP ELLLllEEEELL.......lLLLEEEEELLllLLLEEEEEELllllllhHHHL.LLHHHL
DSSP HhhHHHHhhhhhhhhhHHHHhhHHHHHHhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllHHH
Query FyvFQTLqkqvsyslaKFNDfsINGKLGsicgqlliltyvygketpdgikitldnltMQE 169
ident
Sbjct A..PGST...pdlperRPFT..AEHRRR..........ilslgqvierenfrdilflLSK 206
DSSP L..LLLL...llllllEELL..HHHHHH..........hhhhhhllllllhhhhhhhHHH
DSSP L...........lhHHHHHHHHHHLLleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhh
Query L...........saVSRIISKLKQEKvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpa 218
ident |||
Sbjct VhykydvhpsetydWLIEISKQAGDE............kmvvkaeqirdfavearalser 254
DSSP HhhheellllhhhhHHHHHHHHLLLH............hhhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP hhhlll
Query twgkln 224
ident
Sbjct fsltsw 260
DSSP llllll
No 53: 2IUWA MOLECULE: ALKYLATED REPAIR PROTEIN ALKB HOMOLOG 3;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct shmrvidregvyeislsptgvsrvclypgfvdvkeadwileqlcqdvpwkqrtgiredit 60
DSSP lleeelllleeeeeelllllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllllleeelllle
DSSP ...........................lhHHHHHHHLL..........lLLLEELL.LLL
Query ...........................gsEFKKYLETN..........gIKPKQFH.KKE 22
ident | |
Sbjct yqqprltawygelpytysritmepnphwhPVLRTLKNRieentghtfnsLXCNLYRnEKD 120
DSSP eellleeeeeelllllllhhhhlllllllHHHHHHHHHhhhhhllllleEEEEEELlLLL
DSSP EeeLLLLL.......LLEEEEEEELEEEEEEE..lllLLEEeEEEEELLEEEELLllllL
Query LifNQWDP.......QEYCIFLYDGITKLTSI..senGTIMnLQYYKGAFVIMSGfidtE 73
ident |
Sbjct SvdWHSDDepslgrcPIIASLSFGATRTFEMRkkppyVERV.KIPLDHGTLLIME....G 175
DSSP LeeEELLLlhhhlllLLEEEEEEELLEEEEEEellllLLEE.EEEELLLLEEEEE....E
DSSP LLL..lLLEEE...elLLLLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query TSV..gYYNLE...viSEQATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfn 128
ident |
Sbjct ATQadwQHRVPkeyhsREPRVNLTFRTV................................ 203
DSSP LHHhheEEEELlllllLLLEEEEEEELL................................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleee
Query dfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqekvivy 188
ident
Sbjct ............................................................ 203
DSSP ............................................................
DSSP lllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query knscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ..................................yp 205
DSSP ..................................ll
No 54: 1K5JA MOLECULE: NUCLEOPLASMIN CORE;
DSSP lhhhhhhhhllllllEELL.LLLEeELLLllLLEEEEEEE.........leEEEEEElll
Query gsefkkyletngikpKQFH.KKELiFNQWdpQEYCIFLYD.........giTKLTSIsen 50
ident |
Sbjct .........vsliwgCELNeQNKT.FEFK.eHQLALRTVClgdkakdefhiVEIVTQ... 46
DSSP .........llleeeEEELlLLLE.EEEL.lLEEEEEEEEelllllllleeEEEEEL...
DSSP lLEEEeEEEE........LLEE..EELLllllllllLLLEEEELLL..LLEEEEEEHHhh
Query gTIMNlQYYK........GAFV..IMSGfidtetsvGYYNLEVISE..QATAYVIKINel 98
ident | |
Sbjct .EEKS.VPIAtlkpsilpMATMvgIELT........PPVTFRLKAGsgPLYISGQHVA.. 94
DSSP .LLEE.EEEEeellllllEEELllLEEL........LLEEEEEEELllLEEEEEEEEL..
DSSP hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeellee
Query kellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgi 158
ident
Sbjct ............................................................ 94
DSSP ............................................................
DSSP eellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhh
Query kitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpa 218
ident
Sbjct ............................................................ 94
DSSP ............................................................
DSSP hhhlll
Query twgkln 224
ident
Sbjct ...... 94
DSSP ......
No 55: 1J3PA MOLECULE: PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE;
DSSP .........lhhhhhhhHLLL.......................................
Query .........gsefkkylETNG....................................... 12
ident |
Sbjct mkykepfgvkldfetgiIENAkksvrrlsdmkgyfideeawkkmveegdpvvyevyaieq 60
DSSP lllllleeeelllllllLLLLeeeeeehhhhllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeeell
DSSP ........lllEELL........LLLEeeLLLLL...LLEEEEEEELEEEEEEElLLLLE
Query ........ikpKQFH........KKELifNQWDP...QEYCIFLYDGITKLTSIsENGTI 53
ident | | |
Sbjct eekegdlnfatTVLYpgkvgnefFMTK..GHYHSkidRAEVYFALKGKGGMLLQtPEGEA 118
DSSP lllllleeeeeEEELlleelleeLLLL..LLLLLlllLLEEEEEEELLEEEEEElLLLLE
DSSP EEeEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELL.LLLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhh
Query MNlQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVIS.EQATAYVIKINelkellsknlthffyv 112
ident
Sbjct RF.IEMEPGTIVYVP......PYWAHRTINTGdKPFIFLALYPA................ 155
DSSP EE.EEELLLEEEEEL......LLLEEEEEELLlLLEEEEEEEEL................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeelLLLLlHHHLlh
Query fqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitLDNLtMQELsa 172
ident |
Sbjct ..............................daghdygtiaekgfskivvEENG.KVVV.. 182
DSSP ..............................llllllhhhhhhllleeeeELLL.EEEE..
DSSP hhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query vsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ...............................................kdnpk 187
DSSP ...............................................ellll
No 56: 2OQ6A MOLECULE: JMJC DOMAIN-CONTAINING HISTONE DEMETHYLATION
DSSP ..............................................LHHH..........
Query ..............................................GSEF.......... 4
ident
Sbjct lnpsarimtfyptmeefrnfsryiayiesqgahraglakvvppkewKPRAsyddiddlvi 60
DSSP llllllleeelllhhhhllhhhhhhhhhhllhhhhleeeellllllLLLLllllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 4
ident
Sbjct papiqqlvtgqsglftqyniqkkamtvrefrkiansdkyctprysefeelerkywknltf 120
DSSP llleeeeeeeelleeeeeeeellleehhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhlll
DSSP ...................hhHHHL...................lLLLLEELLLLLEeEL
Query ...................kkYLET...................nGIKPKQFHKKELiFN 26
ident | |
Sbjct nppiygadvngtlyekhvdewNIGRlrtildlvekesgitiegvnTPYLYFGMWKTS.FA 179
DSSP llleeeeeeelllllllllllLLLLlllhhhhhhhhhllllllllLLEEEEELLLLE.EE
DSSP LLLLL...LEEEEEEE.LEEEEE...................................eE
Query QWDPQ...EYCIFLYD.GITKLT...................................sI 47
ident |
Sbjct WHTEDmdlYSINYLHFgEPKSWYsvppehgkrlerlakgffpgsaqsceaflrhkmtliS 239
DSSP EELLHhhlEEEEEEEEeLLEEEEeelhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhlllhhhhlleeeL
DSSP LLLLL....eEEEEEEELLEEEELLllllllLLLLLEEEELLlLLEEEEEEHHHHhhhhh
Query SENGT....iMNLQYYKGAFVIMSGfidtetSVGYYNLEVISeQATAYVIKINELkells 103
ident || |
Sbjct PLMLKkygipFDKVTQEAGEFMITF......PYGYHAGFNHG.FNCAESTNFATR..... 287
DSSP HHHHHhllllLEEEEELLLLEEEEL......LLLEEEEEELL.LEEEEEEEELLL.....
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeelll
Query knlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitld 163
ident
Sbjct ............................................................ 287
DSSP ............................................................
DSSP lllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhll
Query nltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkl 223
ident
Sbjct rwieygkqavlcscrkdmvkismdvfvrkfqperyklwkagkdntvidhtlptpeaaefl 347
DSSP lhhhhhhhlllllllllllllllhhhhhhhlhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhh
DSSP l
Query n 224
ident
Sbjct k 348
DSSP l
No 57: 2HC8A MOLECULE: CATION-TRANSPORTING ATPASE, P-TYPE;
DSSP ....................lhhhhhhhhlllLLLEELLLLLEEElllllllEEEEEEEL
Query ....................gsefkkyletngIKPKQFHKKELIFnqwdpqeYCIFLYDG 40
ident | | |
Sbjct eaikklvglqaktavvirdgkeiavpveevavGDIVIVRPGEKIP.......VDGVVVEG 53
DSSP lhhhhhhhhllleeeeeelleeeeeehhhlllLLEEEELLLLLLL.......LEEEEEEL
DSSP EE.EEEEellllLEEEEEEEELLEEEellllllllllllleEEELLLLLEEEE.EEHHHH
Query IT.KLTSisengTIMNLQYYKGAFVImsgfidtetsvgyynLEVISEQATAYV.IKINEL 98
ident | |
Sbjct ESyVDES..misGEPVPVLKSKGDEV............fgaTINNTGVLKIRAtRVGGET 99
DSSP LEeEELH..hhhLLLLLEEELLLLEE............lllLEELLLLEEEEEeELHHHL
DSSP hhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeellee
Query kellsknlthffyvfqtlqkqvsyslakfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgi 158
ident
Sbjct ............................................................ 99
DSSP ............................................................
DSSP eellllllhhhllhhhhhhhhhhhllleeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhh
Query kitldnltmqelsavsriisklkqekvivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpa 218
ident
Sbjct ....................................................llaqivkl 107
DSSP ....................................................hhhhhhhh
DSSP hhhlll
Query twgkln 224
ident
Sbjct vedamg 113
DSSP hhhhhl
No 58: 2HBTA MOLECULE: EGL NINE HOMOLOG 1;
DSSP ...............................LHHHH........................
Query ...............................GSEFK........................ 5
ident |
Sbjct lpalklaleyivpcmnkhgicvvddflgketGQQIGdevralhdtgkftdgqlvsqksds 60
DSSP llhhhhhhhlhhhhhhhlleeeelllllhhhHHHHHhhhhhhhhlllllllleeelllll
DSSP ...................hHHHLLL........................LLLEELL..L
Query ...................kYLETNG........................IKPKQFH..K 20
ident
Sbjct skdirgdkitwiegkepgceTIGLLMssmddlirhcngklgsykingrtkAMVACYPgnG 120
DSSP llleelleeeeelllllllhHHHHHHhhhhhhhhhllllllllleeeellEEEEEELllL
DSSP LLEeeLLLLL......LLEEEEEEE........lEEEEEEELLlLLEEeEEEEELL.EEE
Query KELifNQWDP......QEYCIFLYD........gITKLTSISEnGTIMnLQYYKGA.FVI 65
ident | ||
Sbjct TGY.vRHVDNpngdgrCVTCIYYLNkdwdakvsgGILRIFPEG.KAQF.ADIEPKFdRLL 177
DSSP LLE.eEELLLllllleEEEEEEELLllllhhhhlLLEEELLLL.LLLL.EEELLLLlEEE
DSSP ELLllllllLLLLLEEEELLL.LLEEEEEEHHhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query MSGfidtetSVGYYNLEVISE.QATAYVIKINelkellsknlthffyvfqtlqkqvsysl 124
ident |
Sbjct FFW.....sDRRNPHEVQPAYaTRYAITVWYF............................ 204
DSSP EEE.....lLLLLLEEELLLLlLEEEEEEEEE............................
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhheeeelleeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhll
Query akfndfsingklgsicgqlliltyvygketpdgikitldnltmqelsavsriisklkqek 184
ident
Sbjct ............................................................ 204
DSSP ............................................................
DSSP leeelllleeellhhhhhhhlhhhhhhhhhhlhhhhhlll
Query vivyknscfyvqnldylkryapkldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct ....................daderarakvkylkgvrvel 224
DSSP ....................ehhhhhhhhhhlllllllll
No 59: 1XMXA MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN VC1899;
DSSP lhhhhhhhhlllllleellllleeellllllleeeeeeeleeeeeeellllleeeeeeee
Query gsefkkyletngikpkqfhkkelifnqwdpqeyciflydgitkltsisengtimnlqyyk 60
ident
Sbjct ........................................................nama 4
DSSP ........................................................llle
DSSP lleeeelLLLLL...llllllleeeellllleeeeeEHHHHHHHHHLLH...........
Query gafvimsGFIDT...etsvgyynleviseqatayviKINELKELLSKNL........... 106
ident |
Sbjct ihvgiidQDPVRlvtplldhrtvsrhiifigdhtqtVIYQRLSDVLNKRnistdffeipa 64
DSSP eeeeellLLLHHhhhhhhllllllleeeeeelhhhhHHHHHHHHHHHHLlleeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 106
ident
Sbjct gsntsaiksairelaetlkargeevkfnascglrhrllsayevfrsyhwpifvvepnsdc 124
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllle
DSSP ..............hhhHHHH...............hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..............thfFYVF...............qtlqkqvsyslakfndfsingklg 137
ident
Sbjct lcwlypegnndtqvqdrITIAdyltifgargefnspqldqqlyqlgerwasnalelgpgl 184
DSSP eeeeelllllleellllLLHHhhhhhllleeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
DSSP HHHHHHHHHHHHHeeeelleEEELlllllHHHL...LHHHHHHHHHHHLLLEEELLLLEE
Query SICGQLLILTYVYgketpdgIKITldnltMQEL...SAVSRIISKLKQEKVIVYKNSCFY 194
ident | | | | | |
Sbjct ATLNYLATTCRKE.....qkLDVE....lSDKQqgyRELNLLLSDLVEAKIASYENGILT 235
DSSP HHHHHHHHHHHHH.....llLEEE....lLHHHhllHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLEEE
DSSP ELLHHHHHH.HLHH..............................................
Query VQNLDYLKR.YAPK.............................................. 207
ident |
Sbjct FINEEARRFaNGEWletlvhstvkqiqddmptiqdrslnvqvyrqlgerevrneldvatv 295
DSSP ELLHHHHHHhHLLHhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 207
ident
Sbjct vnnklhiiecktkgmrdgddtlykleslrdllgglqaramlvsfrplrhnditraedlgl 355
DSSP elleeeeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeelllllhhhhhhhhhhll
DSSP ........hhhhhhhhlhhhhhlll
Query ........ldewfylacpatwgkln 224
ident
Sbjct aligpdelkdlkthltqwfkaaggn 380
DSSP eeelhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
No 60: 2DQSA MOLECULE: SARCOPLASMIC/ENDOPLASMIC RETICULUM CALCIUM
DSSP ....LHHHHHHHHLLL............................................
Query ....GSEFKKYLETNG............................................ 12
ident |
Sbjct meaaHSKSTEECLAYFgvsettgltpdqvkrhlekyghnelpaeegkslwelvieqfedl 60
DSSP llllLLLLHHHHHHHHlllllllllhhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 12
ident
Sbjct lvrilllaacisfvlawfeegeetitafvepfvillilianaivgvwqernaenaiealk 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhh
DSSP ...........................LLLEELLLLLEEElllllllEEEEEEEL.....
Query ...........................IKPKQFHKKELIFnqwdpqeYCIFLYDG..... 40
ident |
Sbjct eyepemgkvyradrksvqrikardivpGDIVEVAVGDKVP.......ADIRILSIksttl 173
DSSP hhllleeeeellllllleeeehhhlllLLEEEEELLLLLL.......LEEEEEEElllle
DSSP EEEEEEellllleEEEE.EEELL..............EEEElllllllllllllEEEELL
Query ITKLTSisengtiMNLQ.YYKGA..............FVIMsgfidtetsvgyyNLEVIS 85
ident |
Sbjct RVDQSI.....ltGESVsVIKHTepvpdpravnqdkkNMLF............sGTNIAA 216
DSSP EEELHH.....hhLLLLlEEELLlllllllllhhhllLEEL............lLLEEEE
DSSP LLLEEEEEEHH.................................................
Query EQATAYVIKIN................................................. 96
ident | |
Sbjct GKALGIVATTGvsteigkirdqmaateqdktplqqkldefgeqlskvislicvavwlini 276
DSSP LEEEEEEEELHhhlhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 96
ident
Sbjct ghfndpvhggswirgaiyyfkiavalavaaipeglpavittclalgtrrmakknaivrsl 336
DSSP hhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 96
ident
Sbjct psvetlgctsvicsdktgtlttnqmsvckmfiidkvdgdfcslnefsitgstyapegevl 396
DSSP lhhhhhhllleeeeelllllllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeeellllllllllee
DSSP .............hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHhHHHHhhhhhhhh
Query .............elkellsknlthffyvfqtlqkqvsyslaKFNDFsINGKlgsicgql 143
ident
Sbjct kndkpirsgqfdglvelaticalcndssldfnetkgvyekvgEATET.ALTT........ 447
DSSP elleellhhhlhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllleeeelLHHHH.HHHH........
DSSP hhhhhhheeeelleeeellllllhhhlLHHHHHHHHHHHLlleeellllEEEL.......
Query liltyvygketpdgikitldnltmqelSAVSRIISKLKQEkvivyknscFYVQ....... 196
ident |
Sbjct ........lvekmnvfntevrnlskveRANACNSVIRQLM.........KKEFtlefsrd 490
DSSP ........hhhhhlllllllllllhhhHLLHHHHHHHLLE.........EEEEeeeeell
DSSP ...................lHHHHH...................................
Query ...................nLDYLK................................... 202
ident |
Sbjct rksmsvycspakssraavgnKMFVKgapegvidrcnyvrvgttrvpmtgpvkekilsvik 550
DSSP lleeeeeeeellllllllllEEEEEelhhhhhhleeeeeelleeeellhhhhhhhhhhhh
DSSP .................hhlhhhhhhhhhhLHHHHHLLL.....................
Query .................ryapkldewfylaCPATWGKLN..................... 224
ident
Sbjct ewgtgrdtlrclalatrdtppkreemvlddSSRFMEYETdltfvgvvgmldpprkevmgs 610
DSSP hhhhllllleeeeeeeelllllhhhlllllHHHHHHHLLleeeeeeeeeellllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 224
ident
Sbjct iqlcrdagirvimitgdnkgtaiaicrrigifgeneevadraytgrefddlplaeqreac 670
DSSP hhhhhhllleeeeeelllhhhhhhhhhhhlllllllllllleeehhhhhhllhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 224
ident
Sbjct rraccfarvepshkskiveylqsydeitamtgdgvndapalkkaeigiamgsgtavakta 730
DSSP hhlleeelllllhhhhhhhhhhllllleeeeellhhhhhhhhhlleeeeellllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 224
ident
Sbjct semvladdnfstivaaveegraiynnmkqfirylissnvgevvcifltaalglpealipv 790
DSSP lleeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 224
ident
Sbjct qllwvnlvtdglpatalgfnppdldimdrpprspkeplisgwlffrymaiggyvgaatvg 850
DSSP hhhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 224
ident
Sbjct aaawwfmyaedgpgvtyhqlthfmqctedhphfegldceifeapepmtmalsvlvtiemc 910
DSSP hhhhlllllllllllllllllllllllllllllllllllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 224
ident
Sbjct nalnslsenqslmrmppwvniwllgsiclsmslhflilyvdplpmifklkaldltqwlmv 970
DSSP hhhlllllllllllllhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhlllllllllhhhhh
DSSP ........................
Query ........................ 224
ident
Sbjct lkislpvigldeilkfiarnyleg 994
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 61: 1ZX5A MOLECULE: MANNOSEPHOSPHATE ISOMERASE, PUTATIVE;
DSSP ................................lhhhhhhhHLLL................
Query ................................gsefkkylETNG................ 12
ident |
Sbjct gxelpsfifqaqenlverpwggewiallkgfrqsgigeswEFSAhtsrpstvlvkgqqls 60
DSSP lllllllleelllleeellllllhhhhhllllllleeeeeELLLlllllleeeelleeee
DSSP ..........................LLLEELLLLLeeeLLLLL..............LL
Query ..........................IKPKQFHKKElifNQWDP..............QE 32
ident | |
Sbjct xielfskhrdellgraaekfskfpilVRLIDAASPT..qVHVHPsdkaaeslgeaeggVE 118
DSSP hhhhhhhhhhhhhllllllllllleeEEEEEELLLL..lLEELLlhhhhhhlllllllLL
DSSP EEEEEEELEEEE........eeeLLLL........lEEEEEEEE.LLEEEELLllllllL
Query YCIFLYDGITKL........tsiSENG........tIMNLQYYK.GAFVIMSGfidtetS 75
ident |
Sbjct SAWLVFNKGKAYagfkedvkieeLEEKlkeedfdfkTLLNTFETtPYDTFVIR......P 172
DSSP EEEEELLLLEEEeeelllllhhhHHHHhllllllhhHHEEEEELlLLLEEEEL......L
DSSP LLLlEEEELlllLEEEEEE........................................h
Query VGYyNLEVIseqATAYVIK........................................i 95
ident
Sbjct GIP.HAGEG...LRVLEVSsnstlayffnendwekvkkvlntkkveefevkgkkgxaete 228
DSSP LLL.EEEEL...EEEEEEEellllleelllllhhhhhhhlllllllhhhlllllleeell
DSSP HHHH......................