DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1NLXH
MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 6;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1NLX-A 22.6 0.2 104 104 100 POLLEN ALLERGEN PHL P 6; "
2: 1L3P-A 8.5 3.1 86 102 20 POLLEN ALLERGEN PHL P 5B; "
3: 1C17-M 6.6 3.1 90 142 9 ATP SYNTHASE SUBUNIT C; "
4: 2J0O-A 6.2 2.8 87 284 14 INVASIN IPAD; "
5: 1NZE-A 6.0 3.4 85 112 8 OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 3; "
6: 2ODU-A 5.4 3.8 75 217 7 PLECTIN 1; "
7: 1TQG-A 5.4 3.4 84 105 6 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA; "
8: 2AVK-A 5.0 3.2 87 133 5 HEMERYTHRIN-LIKE DOMAIN PROTEIN DCRH; "
9: 1AUE-A 5.0 4.1 82 92 4 FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN; "
10: 2J9V-A 4.8 2.8 69 99 4 VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 28; "
11: 1ORJ-A 4.8 4.0 79 126 9 FLAGELLAR PROTEIN FLIS; "
12: 1B68-A 4.7 3.3 83 138 6 APOLIPOPROTEIN E; "
13: 1I5N-A 4.6 3.5 86 128 12 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA; "
14: 1B5L-A 4.6 3.4 77 152 6 INTERFERON TAU; "
15: 2CCY-A 4.5 4.4 89 127 8 CYTOCHROME C; "
16: 2A0U-A 4.5 3.1 86 374 8 INITIATION FACTOR 2B; "
17: 1M0K-A 4.5 3.5 91 222 12 BACTERIORHODOPSIN; "
18: 1J5W-A 4.5 3.9 68 276 7 GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN; "
19: 1I1I-P 4.5 3.9 71 665 10 NEUROLYSIN; "
20: 1DD5-A 4.5 2.9 71 184 8 RIBOSOME RECYCLING FACTOR; "
21: 1A7D-A 4.5 2.7 66 118 6 MYOHEMERYTHRIN; "
22: 2OT3-A 4.3 3.7 72 253 6 RAB5 GDP/GTP EXCHANGE FACTOR; "
23: 1C03-A 4.3 3.7 87 163 9 HYPOTHETICAL PROTEIN YDL235C; "
24: 2Q4F-A 4.2 3.9 84 140 6 HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 1; "
25: 2B0H-A 4.2 3.8 86 137 8 TALIN-1; "
26: 1XWM-A 4.2 3.9 83 212 8 PHOSPHATE UPTAKE REGULATOR; "
27: 1SJ8-A 4.2 4.1 88 297 9 TALIN 1; "
28: 1ISE-A 4.2 2.8 71 184 11 RIBOSOME RECYCLING FACTOR; "
29: 1GQA-A 4.2 4.0 86 130 6 CYTOCHROME C'; "
30: 1DOW-A 4.2 3.0 68 205 10 ALPHA-CATENIN; "
31: 1A0B-A 4.2 3.4 78 117 10 AEROBIC RESPIRATION CONTROL SENSOR PROTEIN ARCB; "
32: 2OOC-A 4.1 3.4 71 104 3 HISTIDINE PHOSPHOTRANSFERASE; "
33: 2BVL-A 4.1 8.2 77 543 4 TOXIN B; "
34: 2CMR-A 4.0 3.9 79 192 4 TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN; "
35: 2BG9-E 4.0 3.6 86 370 5 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
36: 1VS5-T 4.0 3.7 67 85 9 16S RIBOSOMAL RNA; "
37: 1SXJ-E 4.0 3.0 73 317 10 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
38: 1HY5-A 4.0 3.4 71 120 7 YERSINIA PESTIS VIRULENCE PROTEIN YOPE; "
39: 2B64-T 3.9 4.2 71 99 7 16S RIBOSOMAL RNA; "
40: 1YPY-A 3.9 3.6 86 182 8 VIRION MEMBRANE PROTEIN; "
41: 1SUM-B 3.9 3.8 83 224 10 PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG "
42: 1K04-A 3.9 3.3 71 142 6 FOCAL ADHESION KINASE 1; "
43: 1FIO-A 3.9 3.1 69 190 9 SSO1 PROTEIN; "
44: 1BCC-C 3.9 3.4 85 379 5 UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE; "
45: 2D9D-A 3.8 4.0 74 89 11 BAG FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR 5; "
46: 2D4X-A 3.8 3.5 86 214 12 FLAGELLAR HOOK-ASSOCIATED PROTEIN 3; "
47: 2D4U-A 3.8 3.8 85 167 12 METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN I; "
48: 2CRB-A 3.8 3.5 67 97 4 NUCLEAR RECEPTOR BINDING FACTOR 2; "
49: 1WRD-A 3.8 3.3 68 98 7 TARGET OF MYB PROTEIN 1; "
50: 1TUJ-A 3.8 3.8 73 123 8 ODORANT BINDING PROTEIN ASP2; "
51: 1SZI-A 3.8 4.2 82 194 5 MANNOSE-6-PHOSPHATE RECEPTOR BINDING PROTEIN 1; "
52: 1OED-B 3.8 3.4 78 127 4 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
53: 1EQ1-A 3.8 3.3 74 166 7 APOLIPOPHORIN-III; "
54: 2Q80-A 3.7 3.8 90 285 9 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
55: 2E87-A 3.7 3.6 84 356 10 HYPOTHETICAL PROTEIN PH1320; "
56: 2ACX-A 3.7 3.5 70 495 7 G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE 6; "
57: 1W36-C 3.7 3.9 75 1121 5 DNA HAIRPIN; "
58: 1K9A-A 3.7 3.7 85 439 15 CARBOXYL-TERMINAL SRC KINASE; "
59: 1HTJ-F 3.7 3.7 68 182 9 KIAA0380; "
60: 1EYS-M 3.7 5.3 76 318 7 PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER; "
61: 1AX8-A 3.7 2.9 68 130 7 OBESITY PROTEIN; "
62: 2FB5-A 3.6 3.7 55 204 7 HYPOTHETICAL MEMBRANE SPANNING PROTEIN; "
63: 1SXJ-B 3.6 3.4 75 316 4 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
64: 1JR3-A 3.6 3.7 81 366 7 DNA POLYMERASE III SUBUNIT GAMMA; "
65: 1DG3-A 3.6 3.5 70 540 10 PROTEIN (INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING "
66: 1BBH-A 3.6 3.6 72 131 13 CYTOCHROME C'; "
67: 1AU1-A 3.6 3.5 76 166 7 INTERFERON-BETA; "
68: 2OZO-A 3.5 3.8 84 545 11 TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70; "
69: 2EBF-X 3.5 4.7 71 711 7 DERMONECROTIC TOXIN; "
70: 2D2C-A 3.5 4.0 85 202 7 CYTOCHROME B6; "
71: 256B-A 3.5 3.4 73 106 11 CYTOCHROME B562; "
72: 1ZPY-A 3.5 4.2 55 91 13 HYPOTHETICAL PROTEIN NE0167; "
73: 1U6G-C 3.5 4.2 62 1146 5 CULLIN HOMOLOG 1; "
74: 1TD6-A 3.5 3.4 66 286 8 HYPOTHETICAL PROTEIN MG237 HOMOLOG; "
75: 1MOJ-A 3.5 4.0 76 180 9 DPS-LIKE FERRITIN; "
76: 2J0J-A 3.4 4.0 84 611 13 FOCAL ADHESION KINASE 1; "
77: 2IAE-A 3.4 4.7 61 583 7 SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A 65 KDA "
78: 2I0M-A 3.4 3.8 85 207 1 PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU; "
79: 2DH4-A 3.4 3.2 84 326 8 YPL069C; "
80: 2DE0-X 3.4 3.6 58 460 5 ALPHA-(1,6)-FUCOSYLTRANSFERASE; "
81: 1Y1U-A 3.4 4.6 72 544 1 SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION "
82: 1WHU-A 3.4 3.3 63 104 6 POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE; 3'-5' RNA "
83: 1UG7-A 3.4 3.5 70 128 4 2610208M17RIK PROTEIN; "
84: 1ST6-A 3.4 3.3 71 1049 8 VINCULIN; "
85: 1S05-A 3.4 3.6 78 129 18 CYTOCHROME C-556; "
86: 1RM1-C 3.4 4.2 54 116 9 TATA-BOX BINDING PROTEIN; "
87: 2QF9-A 3.3 4.4 76 162 8 PUTATIVE SECRETED PROTEIN; "
88: 2J37-W 3.3 3.4 79 479 9 SRP RNA; "
89: 1X8Z-A 3.3 3.0 72 151 11 INVERTASE/PECTIN METHYLESTERASE INHIBITOR FAMILY "
90: 1EI7-A 3.3 3.0 72 158 14 COAT PROTEIN; "
91: 1AO6-A 3.3 4.2 73 578 8 SERUM ALBUMIN; "
92: 2IAK-A 3.2 2.7 59 197 5 BULLOUS PEMPHIGOID ANTIGEN 1, ISOFORM 5; "
93: 2FU2-A 3.2 9.5 68 78 10 HYPOTHETICAL PROTEIN SPY2152; "
94: 1ZRZ-A 3.2 2.7 79 312 6 PROTEIN KINASE C, IOTA; "
95: 1VF6-C 3.2 4.0 45 51 0 PALS1-ASSOCIATED TIGHT JUNCTION PROTEIN; "
96: 1SXJ-D 3.2 3.2 66 328 3 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
97: 1CNT-1 3.2 3.2 70 150 6 CILIARY NEUROTROPHIC FACTOR; "
98: 1B3Q-A 3.2 4.5 58 368 3 PROTEIN (CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA); "
99: 2OSS-A 3.1 2.9 66 127 5 BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4; "
100: 2OEZ-A 3.1 4.0 76 241 7 UPF0289 PROTEIN VP2528; "
101: 2J1P-A 3.1 4.0 91 276 10 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
102: 2GSF-A 3.1 3.8 84 281 5 EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 3; "
103: 2G15-A 3.1 4.0 84 301 13 ACTIVATED MET ONCOGENE; "
104: 2F05-A 3.1 3.9 60 85 7 PAIRED AMPHIPATHIC HELIX PROTEIN SIN3B; "
105: 2ETN-A 3.1 8.7 61 154 5 ANTI-CLEAVAGE ANTI-GREA TRANSCRIPTION FACTOR "
106: 1XDO-A 3.1 4.4 70 687 6 POLYPHOSPHATE KINASE; "
107: 1XD4-A 3.1 3.6 76 824 8 SON OF SEVENLESS PROTEIN HOMOLOG 1; "
108: 1TJU-A 3.1 3.2 64 448 11 DELTA CRYSTALLIN II; "
109: 1QSA-A 3.1 4.3 61 618 5 PROTEIN (SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE SLT70); "
110: 1BBN-A 3.1 3.4 65 133 11 INTERLEUKIN-4; "
111: 2PFT-A 3.0 3.3 72 519 7 EXOCYTOSIS PROTEIN; "
112: 2IDL-A 3.0 3.0 61 113 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
113: 2HYD-A 3.0 2.4 51 578 2 ABC TRANSPORTER HOMOLOG; "
114: 2D5K-A 3.0 4.1 76 148 13 DPS FAMILY PROTEIN; "
115: 2B8I-A 3.0 2.8 54 77 7 PAS FACTOR; "
116: 2B7M-A 3.0 3.7 65 513 8 EXOCYST COMPLEX COMPONENT EXO70; "
117: 1YEW-C 3.0 3.8 69 188 7 PARTICULATE METHANE MONOOXYGENASE, B SUBUNIT; "
118: 1QZW-A 3.0 3.4 76 432 12 SIGNAL RECOGNITION 54 KDA PROTEIN; "
119: 1OGK-A 3.0 3.1 73 229 7 DEOXYURIDINE TRIPHOSPHATASE; "
120: 1OED-C 3.0 4.0 79 127 5 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
121: 1CGM-E 3.0 3.2 77 160 12 RNA (5'-R(P*GP*AP*A)-3'); "
122: 1A7V-A 3.0 4.2 84 125 10 CYTOCHROME C'; "
123: 2OEB-A 2.9 4.0 82 152 7 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
124: 2GSV-A 2.9 3.4 54 67 15 HYPOTHETICAL PROTEIN YVFG; "
125: 2FJC-A 2.9 3.6 68 151 4 ANTIGEN TPF1; "
126: 2E22-A 2.9 4.1 63 752 10 XANTHAN LYASE; "
127: 1W0B-A 2.9 3.1 65 102 5 ALPHA-HEMOGLOBIN STABILIZING PROTEIN; "
128: 1U89-A 2.9 3.5 71 139 8 TALIN 1; "
129: 1RP3-A 2.9 7.0 57 235 7 RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA); "
130: 1L7C-A 2.9 3.7 76 240 5 ALPHA E-CATENIN; "
131: 1CM5-A 2.9 8.8 66 759 2 PROTEIN (PYRUVATE FORMATE-LYASE); "
132: 2IIU-A 2.8 3.9 76 208 8 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
133: 2IB0-A 2.8 4.5 67 142 10 CONSERVED HYPOTHETICAL ALANINE RICH PROTEIN; "
134: 1YA0-A 2.8 6.4 72 458 6 SMG-7 TRANSCRIPT VARIANT 2; "
135: 1VJX-A 2.8 4.4 70 148 4 PUTATIVE FERRITIN-LIKE DIIRON-CARBOXYLATE "
136: 1UVH-A 2.8 4.0 76 157 3 STARVATION-INDUCED DNA PROTECTING PROTEIN; "
137: 1TZT-A 2.8 3.9 74 141 5 N UTILIZATION SUBSTANCE PROTEIN B HOMOLOG; "
138: 1S35-A 2.8 4.5 65 211 8 SPECTRIN BETA CHAIN, ERYTHROCYTE; "
139: 1JKU-A 2.8 4.0 78 266 4 PSEUDOCATALASE; "
140: 1JB0-A 2.8 10.8 68 740 6 PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1; "
141: 1E5R-A 2.8 3.3 62 260 8 PROLINE OXIDASE; "
142: 1CIY-A 2.8 4.3 72 577 7 CRYIA(A); "
143: 2GOX-B 2.7 3.7 52 65 8 COMPLEMENT C3; "
144: 2FOR-A 2.7 3.4 68 283 6 GERANYLTRANSTRANSFERASE; "
145: 2FI7-A 2.7 4.6 67 223 3 TYPE 4 FIMBRIAL BIOGENESIS PROTEIN PILF; "
146: 2ETS-A 2.7 3.5 69 115 4 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
147: 2C52-A 2.7 2.7 49 58 12 CREB-BINDING PROTEIN; "
148: 2BKN-A 2.7 6.9 59 190 5 HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236; "
149: 2B7A-A 2.7 3.7 85 286 7 TYROSINE-PROTEIN KINASE JAK2; "
150: 1ZU4-A 2.7 4.3 75 305 9 FTSY; "
151: 1Y6A-A 2.7 3.8 83 261 8 VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2; "
152: 1XG2-B 2.7 3.2 74 151 5 PECTINESTERASE 1; "
153: 1TJF-A 2.7 3.3 72 185 7 ADENYLYL CYCLASE-ASSOCIATED PROTEIN; "
154: 1L8D-A 2.7 4.5 54 103 4 DNA DOUBLE-STRAND BREAK REPAIR RAD50 ATPASE; "
155: 1KMI-Z 2.7 9.1 57 177 16 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEY; "
156: 2QFL-A 2.6 3.6 72 262 10 INOSITOL-1-MONOPHOSPHATASE; "
157: 2OTJ-P 2.6 8.8 46 143 4 23S RIBOSOMAL RNA; "
158: 2H7O-A 2.6 2.9 56 270 4 PROTEIN KINASE YPKA; "
159: 2G8L-A 2.6 3.9 62 284 6 287AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN; "
160: 2C0E-A 2.6 3.4 64 228 6 WINDBEUTEL PROTEIN; "
161: 2BG9-A 2.6 3.7 76 370 1 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
162: 1WP9-A 2.6 4.0 68 479 10 ATP-DEPENDENT RNA HELICASE, PUTATIVE; "
163: 1OM2-A 2.6 3.8 55 95 9 PROTEIN (MITOCHONDRIAL IMPORT RECEPTOR SUBUNIT "
164: 1LUF-A 2.6 3.9 77 275 5 MUSCLE-SPECIFIC TYROSINE KINASE RECEPTOR MUSK; "
165: 1J7Q-A 2.6 3.2 60 86 5 CALCIUM VECTOR PROTEIN; "
166: 1FVR-A 2.6 3.9 86 299 7 TYROSINE-PROTEIN KINASE TIE-2; "
167: 2P61-A 2.5 3.1 60 114 10 HYPOTHETICAL PROTEIN TM_1646; "
168: 2JAV-A 2.5 3.5 74 253 12 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2; "
169: 2J28-9 2.5 3.8 76 430 12 4.5S SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RNA; "
170: 2IG3-A 2.5 3.5 69 127 4 GROUP III TRUNCATED HAEMOGLOBIN; "
171: 2DOB-A 2.5 3.4 63 82 8 PROACTIVATOR POLYPEPTIDE; "
172: 2CTW-A 2.5 4.7 46 109 2 DNAJ HOMOLOG SUBFAMILY C MEMBER 5; "
173: 2C41-A 2.5 4.9 70 155 4 DPS FAMILY DNA-BINDING STRESS RESPONSE PROTEIN; "
174: 2C2J-A 2.5 4.2 68 165 12 DNA-BINDING STRESS RESPONSE PROTEIN; "
175: 2AZJ-A 2.5 4.3 66 276 12 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
176: 1YO7-A 2.5 3.6 69 120 4 REGULATORY PROTEIN ROP; "
177: 1YKE-A 2.5 4.4 49 98 6 RNA POLYMERASE II MEDIATOR COMPLEX PROTEIN MED7; "
178: 1IWP-A 2.5 3.3 65 555 15 GLYCEROL DEHYDRATASE ALPHA SUBUNIT; "
179: 1H19-A 2.5 3.7 58 610 7 LEUKOTRIENE A-4 HYDROLASE; "
180: 1FOU-A 2.5 5.6 58 257 17 UPPER COLLAR PROTEIN; "
181: 1A5T-A 2.5 4.1 74 323 7 DELTA PRIME; "
182: 1A26-A 2.5 3.0 58 351 10 POLY (ADP-RIBOSE) POLYMERASE; "
183: 2PIH-A 2.4 3.2 52 123 2 PROTEIN YMCA; "
184: 2OBJ-A 2.4 3.4 79 273 3 PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE "
185: 2OAR-A 2.4 3.5 51 125 6 LARGE-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL; "
186: 2O7T-A 2.4 3.6 61 188 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
187: 2IO2-C 2.4 4.5 57 156 11 SENTRIN-SPECIFIC PROTEASE 2; "
188: 2HSB-A 2.4 4.6 54 126 4 HYPOTHETICAL UPF0332 PROTEIN AF0298; "
189: 2GW1-A 2.4 3.5 59 487 8 MITOCHONDRIAL PRECURSOR PROTEINS IMPORT RECEPTOR; "
190: 2FB8-A 2.4 3.7 79 259 9 B-RAF PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN "
191: 2D57-A 2.4 3.4 76 224 8 AQUAPORIN-4; "
192: 2CPT-A 2.4 4.7 60 117 13 VACUOLAR SORTING PROTEIN 4B; "
193: 2C6J-A 2.4 3.0 62 265 10 DUFFY RECEPTOR, ALPHA FORM; "
194: 1XKK-A 2.4 3.8 79 289 6 EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR; "
195: 1X8B-A 2.4 3.9 70 259 10 WEE1-LIKE PROTEIN KINASE; "
196: 1UPK-A 2.4 4.5 59 318 10 MO25 PROTEIN; "
197: 1S12-A 2.4 9.0 60 94 8 HYPOTHETICAL PROTEIN TM1457; "
198: 1RJB-A 2.4 3.9 81 298 4 FL CYTOKINE RECEPTOR; "
199: 1POC-A 2.4 4.8 64 134 5 PHOSPHOLIPASE A2; "
200: 1IHG-A 2.4 4.0 63 364 5 CYCLOPHILIN 40; "
201: 1E2X-A 2.4 4.8 68 222 12 FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN; "
202: 2UXH-A 2.3 4.3 55 206 9 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR; "
203: 2NZ8-B 2.3 3.1 65 279 14 RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1 "
204: 2NN4-A 2.3 2.9 52 62 2 HYPOTHETICAL PROTEIN YQGQ; "
205: 2EX5-A 2.3 3.2 61 207 11 DNA ENDONUCLEASE I-CEUI; "
206: 2CIC-A 2.3 3.5 69 223 6 DEOXYURIDINE 5'-TRIPHOSPHATE NUCLEOTIDE "
207: 2CHL-A 2.3 3.4 80 298 5 CASEIN KINASE I ISOFORM GAMMA-3; "
208: 2A19-B 2.3 3.0 69 264 7 EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 ALPHA "
209: 1ZOY-A 2.3 3.7 69 613 13 FAD-BINDING PROTEIN; "
210: 1UFA-A 2.3 3.3 65 509 9 TT1467 PROTEIN; "
211: 1TFK-B 2.3 3.0 57 86 9 COLICIN D; "
212: 1NG6-A 2.3 3.9 59 148 5 HYPOTHETICAL PROTEIN YQEY; "
213: 1HUL-A 2.3 4.4 61 108 7 INTERLEUKIN-5; "
214: 1GQI-A 2.3 4.0 59 708 8 ALPHA-GLUCURONIDASE; "
215: 1DVK-A 2.3 3.1 62 149 3 PRP18; "
216: 1A7M-A 2.3 3.7 74 180 4 LEUKEMIA INHIBITORY FACTOR; "
217: 2QNL-A 2.2 2.5 59 162 5 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
218: 2PAQ-A 2.2 3.7 57 177 14 5'-DEOXYNUCLEOTIDASE YFBR; "
219: 2OF7-A 2.2 3.3 57 191 11 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
220: 2O9D-A 2.2 3.9 75 231 5 AQUAPORIN Z; "
221: 2FLT-A 2.2 3.3 56 117 9 CIS-3-CHLOROACRYLIC ACID DEHALOGENASE; "
222: 2BW1-A 2.2 4.1 60 151 3 DPS-LIKE PEROXIDE RESISTANCE PROTEIN; "
223: 2AVU-E 2.2 3.6 58 156 14 TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR FLHD; "
224: 2AAL-A 2.2 3.3 54 129 15 MALONATE SEMIALDEHYDE DECARBOXYLASE; "
225: 1ZRL-A 2.2 3.1 64 583 13 ERYTHROCYTE BINDING ANTIGEN REGION II; "
226: 1YVL-A 2.2 8.7 58 652 5 SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION "
227: 1Y79-1 2.2 7.0 63 680 14 PEPTIDYL-DIPEPTIDASE DCP; "
228: 1UX8-A 2.2 4.3 67 118 6 YJBI PROTEIN; "
229: 1Q8K-A 2.2 3.5 56 300 4 EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 "
230: 1OQC-A 2.2 5.1 66 112 6 AUGMENTER OF LIVER REGENERATION; "
231: 1M7N-A 2.2 4.3 82 299 12 INSULIN-LIKE GROWTH FACTOR I RECEPTOR; "
232: 1GNC-A 2.2 3.8 61 175 7 GRANULOCYTE COLONY-STIMULATING FACTOR; "
233: 1CS4-A 2.2 2.9 61 189 10 TYPE V ADENYLATE CYCLASE; "
234: 1BUY-A 2.2 3.0 64 166 6 PROTEIN (ERYTHROPOIETIN); "
235: 1BS2-A 2.2 3.8 68 603 6 PROTEIN (ARGINYL-TRNA SYNTHETASE); "
236: 2PNO-A 2.1 3.7 71 146 7 LEUKOTRIENE C4 SYNTHASE; "
237: 2J6Y-A 2.1 10.5 48 85 0 PHOSPHOSERINE PHOSPHATASE RSBU; "
238: 2IA1-A 2.1 4.2 66 169 9 BH3703 PROTEIN; "
239: 2HAK-A 2.1 3.6 77 309 9 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE MARK1; "
240: 2FO7-A 2.1 3.5 51 136 8 SYNTHETIC CONSENSUS TPR PROTEIN; "
241: 2CZ2-A 2.1 4.3 73 211 4 MALEYLACETOACETATE ISOMERASE; "
242: 2BZ9-A 2.1 3.9 70 429 9 STEROL 14ALPHA-DEMETHYLASE; "
243: 2APL-A 2.1 4.5 58 149 14 HYPOTHETICAL PROTEIN PG0816; "
244: 2A06-H 2.1 3.6 48 66 8 UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE "
245: 1ZS3-A 2.1 3.5 73 171 4 LACTOCOCCUS LACTIS MG1363 DPSA; "
246: 1R4T-A 2.1 3.5 61 122 5 EXOENZYME S; "
247: 1NKL-A 2.1 3.4 57 78 9 NK-LYSIN; "
248: 1NIG-A 2.1 3.5 59 146 14 HYPOTHETICAL PROTEIN TA1238; "
249: 1JI6-A 2.1 3.8 73 589 4 PESTICIDIAL CRYSTAL PROTEIN CRY3BB; "
250: 1HP8-A 2.1 4.0 57 68 4 HU-P8; "
251: 1D2M-A 2.1 3.6 59 552 2 EXCINUCLEASE ABC SUBUNIT B; "
252: 2OOE-A 2.0 3.9 53 528 13 CLEAVAGE STIMULATION FACTOR 77 KDA SUBUNIT; "
253: 2J49-A 2.0 3.7 62 134 8 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR TFIID SUBUNIT 5; "
254: 2G0I-A 2.0 3.5 60 111 7 HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.848; "
255: 2E9X-D 2.0 4.1 54 197 2 DNA REPLICATION COMPLEX GINS PROTEIN PSF1; "
256: 2B5F-A 2.0 4.3 80 236 5 AQUAPORIN; "
257: 2A6T-A 2.0 3.9 63 230 11 SPAC19A8.12; "
258: 1U8S-A 2.0 3.4 49 171 6 GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL "
259: 1R8M-E 2.0 3.4 48 196 6 ARNO; "
260: 1FBV-A 2.0 3.1 60 388 8 SIGNAL TRANSDUCTION PROTEIN CBL; "
-
No 1: 1NLXA MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 6;
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVPK 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVPK 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL
Query LDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTPEVHAV 104
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTPEVHAV 104
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL
No 2: 1L3PA MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 5B;
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHLllllhhhHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHH..l
Query ...ATTEEQKLIEDVNASfRAAMATTanvppadKYKTFEAAFTVSSKR.NLADAVSK..a 54
ident | | || |
Sbjct ipaGELQIIDKIDAAFKVaATAAATA.......PADDKFTVFEAAFNKaIKETTGGAydt 53
DSSP llhHHHLLHHHHHHHHHHhHHHHHLL.......LHHHHHHHHHHHHHHhHHHHLLLLlll
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query pqlVPKLDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | | || | ||| || | |
Sbjct ykcIPSLEAAVKQAYAATVAAAPQVKYAVFEAALTKAITAMSEV.qkvsq 102
DSSP hhhLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhhl
No 3: 1C17M MOLECULE: ATP SYNTHASE SUBUNIT C;
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..........hhhhhHHHHHHHHHHHH
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..........padkyKTFEAAFTVSSK 44
ident | | | |
Sbjct hgkskLIAPLALTIFVWVFLMNLMDLLPiDLLPyiaehvlglpalrvvPSADVNVTLSMA 60
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLlllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHH........hhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.............HHHH
Query RNLADA........vskAPQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE.............DKYE 82
ident | |
Sbjct LGVFILilfysikmkslLSKPVSLGLRLFGNMYAGELIfILIAgllpwwsqwilnvPWAI 120
DSSP HHHHHHhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhllllhhhhhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query AFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | |
Sbjct FHILIITLQAFIFMVLtivyls 142
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhll
No 4: 2J0OA MOLECULE: INVASIN IPAD;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hpvssltmlndtlhnirttnqalkkelsqktltktsleeialhssqismdvnksaqlldi 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................................................LLH
Query .........................................................ATT 3
ident |
Sbjct lsrheypinkdarellhsapkeaeldgdqmishrelwakiansindineqylkvyehAVS 120
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL...HHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......
Query EEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP...PADKykTFEAAFTVSSKRNLADAVSK....... 53
ident | | | |
Sbjct SYTQMYQDFSAVLSSLAGWISPGGndgNSVK..LQVNSLKKALEELKEKYKDKplypann 178
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEELLlllLLEE..ELHHHHHHHHHHHHHHHLLLeeellll
DSSP .............................lllHHHHHHHHHHHHHH...hhhlllHHHHH
Query .............................apqLVPKLDEVYNAAYN...aadhaaPEDKY 81
ident | | ||
Sbjct tvsqeqankwltelggtigkvsqknggyvvsiNMTPIDNMLKSLDNlggngevvlDNAKY 238
DSSP lllhhhhhhhhhhllllleeeeelllleeeeeLLHHHHHHHHHHHLlllllleeeLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLL.......................llllll
Query EAFVLHFSEALRIIAGT.......................pevhav 104
ident | ||
Sbjct QAWNAGFSAEDETMKNNlqtlvqkysnansifdnlvkvlsstissc 284
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 5: 1NZEA MOLECULE: OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 3;
DSSP ...llhhhhHHHHHHHHHHHHHHH.hllllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..
Query ...atteeqKLIEDVNASFRAAMA.ttanvPPAD.KYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK.. 53
ident | | | |
Sbjct fylqplpptEAAQRAKVSASEILNvkqfidRKAWpSLQNDLRLRASYLRYDLKTVISAkp 60
DSSP lllllllllLHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
DSSP ...LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHH.hHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query ...APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPED.kYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct kdeKKSLQELTSKLFSSIDNLDHAaKIKSPteAEKYYGQTVSNINEVLA....klg 112
DSSP hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLHhhHHHHHHHHHHHHHHHHH....lll
No 6: 2ODUA MOLECULE: PLECTIN 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct elqlrwqeyrelvllllqwmrhhtaafeerfpssfeeieilwsqflkfkemelpakeadk 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh
DSSP .........................................................LLH
Query .........................................................ATT 3
ident
Sbjct nrskgiyqslegavqagqlkvppgyhpldvekewgklhvailerekqlrseferlecLQR 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH.............llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query EEQKLIEDVNASFRAAMAT.............tanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident || | |
Sbjct IVTKLQMEAGLCEEQLNQAdallqsdvrllaagkvpQRAGEVERDLDKADSMIRLLFNDV 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHH.......LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query VSK.......APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPEDkyeafvlhfsealriiagtpevh 102
ident |
Sbjct QTLkdgrhpqGEQMYRRVYRLHKRLVAIRTEyNLRLK....................... 217
DSSP HHHhhlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHL.......................
DSSP ll
Query av 104
ident
Sbjct .. 217
DSSP ..
No 7: 1TQGA MOLECULE: CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA;
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVPpadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVska 54
ident | |
Sbjct gshmeYLGVFVDETKEYLQNLNDTLLELeKNPE....dMELINEAFRALHTLKGMAG... 53
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHH......hhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PQLVPKLDEVYNAAYNA......adhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct TMGFSSMAKLCHTLENIldkarnseikiTSDLLDKIFAGVDMITRMVDK....ivs 105
DSSP HHLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hll
No 8: 2AVKA MOLECULE: HEMERYTHRIN-LIKE DOMAIN PROTEIN DCRH;
DSSP .......llhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLL....LHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......atteeqklIEDVNASFRAAMATTANV....PPADKyKTFEAAFTVSSKRNLAD 49
ident | |
Sbjct dvlvkwsedlanlpsIDTQHKRLVDYINDLYRAarrrDMDKA.REVFDALKNYAVEHFGY 59
DSSP lllllllhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query AVSKA........pQLVPKLDEVYNAAYNAADH.aAPED.KYEAFVLHFSEALRIIAGT. 98
ident | |
Sbjct EERLFadyaypeatRHKEIHRRFVETVLKWEKQlaAGDPeVVMTTLRGLVDWLVNHIMKe 119
DSSP HHHHHhhhllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLl
DSSP ........llllll
Query ........pevhav 104
ident
Sbjct dkkyeaylrergvs 133
DSSP hhhhhhhhhhllll
No 9: 1AUEA MOLECULE: FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN;
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHH..LLLH
Query attEEQKLIEDVNASFRAA.MATTanvppadkyKTFEAAFTVSSKRNladAVSK..APQL 57
ident
Sbjct ...LWHEMWHEGLEEASRLyFGER........nVKGMFEVLEPLHAMmerGPQTlkETSF 49
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL........lHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLLhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL..LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query VPKLDEVYNAAYNAADHA..APED.KYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct NQAYGRDLMEAQEWCRKYmkSGNVkDLTQAWDLYYHVFRRISK....... 92
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL.......
No 10: 2J9VA MOLECULE: VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 28;
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhHL
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkykTFEA.AFTVSSKRNLADAVsKA 54
ident | |
Sbjct hhhmfNAKYVAEATGNFITVMDALKLN...........YNAKdQLHPLLAELLISIN.RV 48
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........LLLHhHHHHHHHHHHHHHH.HH
DSSP LLhhhhhHHHHHH.....hhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PQlvpklDEVYNA.....aynaadhaapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct TRddfenRSKLIDwivrinklsigdtlteTQIRELLFDLELAYKSFYA....lld 99
DSSP LLlllllHHHHHHhhhhhhhllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hll
No 11: 1ORJA MOLECULE: FLAGELLAR PROTEIN FLIS;
DSSP ................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADkyKTFEAAFTVSSK 44
ident | | |
Sbjct rniaeayfqnmvetatPLEQIILLYDKAIECLERAIEIYDQVNELE.kRKEFVENIDRVY 59
DSSP llhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLLHH.hHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL.........llhhHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query RNLADAVSKA.........pqlvPKLDEVYNAaynaadhaapedkYEAFVLHFSEALRII 95
ident | | | |
Sbjct DIISALKSFLdhekgkeiaknldTIYTIILNT.......lvkvdkTKEELQKILEILKDL 112
DSSP HHHHHHHHLLlllllhhhhhhhhHHHHHHHHH.......hhllllLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLL.....llllll
Query AGT.....pevhav 104
ident
Sbjct REAweevkkkvhhh 126
DSSP HHHhhhhhhhhhll
No 12: 1B68A MOLECULE: APOLIPOPROTEIN E;
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhhhHHHH..HHHHHHHHHHHHHHHHHLL...
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAMAtTANVppadkyKTFE..AAFTVSSKRNLADAVSKAP... 55
ident | |
Sbjct .GQRWELALGRFWDYLRWVQT.LSEQ.....vQEELlsSQVTQELRALMDETMKELKayk 53
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.....hHHHHllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
DSSP .....................lhHHHHHHHHHHHHHH..............hhllLHHHH
Query .....................qlVPKLDEVYNAAYNA..............adhaAPEDK 80
ident |
Sbjct seleeqltaeetrarlskelqaaQARLGADMEDVRGRlvqyrgevqamlgqsteeLRVRL 113
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHL.lllllll
Query YEAFVLHFSEALRIIAG.tpevhav 104
ident ||
Sbjct ASHLRKLRKRLLRDADDlqkrlavy 138
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhl
No 13: 1I5NA MOLECULE: CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA;
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLHh
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.TANVPPADkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVskAPQLv 58
ident | || | |
Sbjct dISDFYQTFFDEADELLADXEQHlLDLVPESP.dAEQLNAIFRAAHSIKGGAG..TFGF. 56
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLLLLL.lHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..HLLL.
DSSP HHHHHHHHHHHH......hhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...............
Query PKLDEVYNAAYN......aadhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAG............... 97
ident | | | | |
Sbjct TILQETTHLXENlldearrgexqlNTDIINLFLETKDIXQEQLDAyknseepdaasfeyi 116
DSSP HHHHHHHHHHHHhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllllhhhhhhh
DSSP .....lllllll
Query .....tpevhav 104
ident
Sbjct cnalrqlaleak 128
DSSP hhhhhhhhhhhl
No 14: 1B5LA MOLECULE: INTERFERON TAU;
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLHH.............................
Query ..ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnVPPA............................. 29
ident
Sbjct cyLSRKLMLDARENLKLLDRMNRLSP.HSCLqdrkdfglpqemvegdqlqkdqafpvlye 59
DSSP llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLllllllllllhhhhhllllhhhhhhhhhh
DSSP ............hhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..hhhhhhhhhhhhhHHHHLL
Query ............dkyktfeAAFTVSSKRNLADAVSKAPQ..lvpkldevynaayNAADHA 75
ident | |
Sbjct mlqqsfnlfytehssaawdTTLLEQLCTGLQQQLDHLDTcrgmdpivtvkkyfqGIYDYL 119
DSSP hhhhhhhhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllhhhhhhhhhhhHHHHHH
DSSP ..LHHH..HHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query ..APED..KYEAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | ||
Sbjct qeKGYSdcAWEIVRVEMMRALTVSTTLqkrltk 152
DSSP hhLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhl
No 15: 2CCYA MOLECULE: CYTOCHROME C;
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....lLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.....aNVPPaDKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK 53
ident || |
Sbjct qsKPEDLLKLRQGLMQTLKSQWVPIagfaagKADLpADAAQRAENMAMVAKLAPIGWAKG 60
DSSP llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhllLLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
DSSP LL.............lhhHHHHHHHHHHHHH.........hhllLHHHHHHHHHHHHHHH
Query AP.............qlvPKLDEVYNAAYNA.........adhaAPEDKYEAFVLHFSEA 91
ident | | | |
Sbjct TEalpngetkpeafgsksAEFLEGWKALATEstklaaaakagpdALKAQAAATGKVCKAC 120
DSSP LLllllllllhhhhlllhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLLllllll
Query LRIIAGTpevhav 104
ident
Sbjct HEEFKQD...... 127
DSSP HHHHLLL......
No 16: 2A0UA MOLECULE: INITIATION FACTOR 2B;
DSSP ..................................................lLHHHHHHHH
Query ..................................................aTTEEQKLIE 10
ident
Sbjct xskphhatlesikytpgslrlldqrklpletvfddvltvediwsaikexrvRGAPAIAVS 60
DSSP llllllllllleeeelleeeeelllllllllleeeellhhhhhhhhhllllLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH..HLLLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHH
Query DVNASFRAAMA..TTANvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLADaVSKAPQLVPKLDEVYNAA 68
ident | | | | |
Sbjct AALGIAVATQRkaANGE...lkSGREVQTFLLTSCDFVXTS.RPTAVNLFNCLRDLKAQV 116
DSSP HHHHHHHHHHHhhHHLL...llLHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLLHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHhlllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..............................
Query YNAAdhaapEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT.............................. 98
ident | |
Sbjct DKLD....pTKAAAEVAQAFVELAEAVYTNdvafnegixrhgaahilaaakaegrdkvsi 172
DSSP HHLL....lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct lticntgalatsrygtalgvvrqlfydgklervyacetrpwnqgarltvyecvqedipct 232
DSSP eellllllllllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllhhhhlhhhhhhhllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct licdgaasslxlnrkidavvvgadricqngdtankigtynlavsakfhgvklyvaapttt 292
DSSP eelhhhhhhhhhhlllleeeellleellllleeeellhhhhhhhhhhlllleeeellhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct ldvktasgnhveieerepteittnlvtkqrvvadgphlsiwnpvfditpselitggiite 352
DSSP lllllllhhhllllllllhhhhllllllllllllllleeelllleeeelhhhllleeell
DSSP ................llllll
Query ................pevhav 104
ident
Sbjct kgvqapaasapyydiasiiaqa 374
DSSP lleellllllllllhhhhhhll
No 17: 1M0KA MOLECULE: BACTERIORHODOPSIN;
DSSP ..............................lLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..
Query ..............................aTTEEqKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP.. 27
ident | | |
Sbjct tgrpewiwlalgtalmglgtlyflvkgmgvsDPDA.KKFYAITTLVPAIAFTMyLSMLlg 59
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHll
DSSP ..............hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....................
Query ..............pADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVS..................... 52
ident | || |
Sbjct ygltmvpfggeqnpiYWARYADWLFTTPLLLLDLALLVDadqgtilalvgadgimigtgl 119
DSSP llleeeeelleeeeeLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .....................................hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query .....................................kAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHA 75
ident | | |
Sbjct vgaltkvysyrfvwwaistaamlyilyvlffgfsmrpeVASTFKVLRNVTVVLWSAYPVV 179
DSSP hhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP L..............hhHHHHHHHHHH.HHHHHHHHLlllllll
Query A..............peDKYEAFVLHF.SEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct WligsegagivplnietLLFMVLDVSAkVGFGLILLR.sraifg 222
DSSP HhhlllllllllhhhhhHHHHHHHHHHhHHHHHHHHH.lhhhll
No 18: 1J5WA MOLECULE: GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct xylqdvixklndfwaskgclleqpydxevgagtfhpatffgslrkgpwkvayvqpsrrpt 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhllleellllllllllhhhlhhhhlhhhlllleeeeeeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct enpnrlqryfqyqviikpspensqelylesleylginlkehdirfvednwesptlgawgv 120
DSSP llllllleeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeelleehhhleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gwevwldgxeitqftyfqqiggislkdipleitygleriaxylqgvdnvyevqwnenvky 180
DSSP eeeeeelleeeeeeeeeeelllllllllleeeeeehhhhhhhhhllllhhhleeelleeh
DSSP ................llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhhHHHHHHHhHHHHHH
Query ................attEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvppadKYKTFEAaFTVSSK 44
ident | |
Sbjct gdvflenerefsvfnfeeaNVGLLFRHFDEYEKEFYRLVE....knLYLPAYD.YILKCS 235
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....llLHHHHHH.HHHHHH
DSSP HHHHHHHH.HLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query RNLADAVS.KAPQ..LVPKLDEVYNAAYNAADH.aAPEDkyeafvlhfsealriiagtpe 100
ident | | |
Sbjct HTFNLLDArGAISvsQRQTYVKRIQAXARKAARvfLEVQ..................... 274
DSSP HHHHHHHHlLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHH.....................
DSSP llll
Query vhav 104
ident
Sbjct ..an 276
DSSP ..ll
No 19: 1I1IP MOLECULE: NEUROLYSIN;
DSSP ................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL...LHHH.HHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANV...PPAD.KYKTFEAAFT 40
ident | | | |
Sbjct mssytaagrnvlrwdlSPEQIKTRTEQLIAQTKQVYDTVGTIalkEVTYeNCLQVLADIE 60
DSSP llllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlhhHLLLlLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHH............lllHHHHHHHHHHHHHH..................
Query VSSKRNLADAVSK............apqLVPKLDEVYNAAYN.................. 70
ident | ||
Sbjct VTYIVERTMLDFPqhvssdrevraasteADKKLSRFDIEMSMredvfqrivhlqetcdle 120
DSSP HHHHHHHHHHHLHhhhlllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP .............hhHLLL.........................................
Query .............aaDHAA......................................... 76
ident
Sbjct kikpearryleksikMGKRnglhlsehirneiksmkkrmselcidfnknlneddtslvfs 180
DSSP lllhhhhhhhhhhhhHHHHllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct kaelgalpddfidslektdedkykvtlkyphyfpvmkkccvpetrrkmemafhtrckqen 240
DSSP lhhhllllhhhhhllllllllleeeellhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct tailqqllplraqvakllgynthadfvlelntakstsrvaaflddlsqklkplgeaeref 300
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct ilslkkkeceergfeydgkinawdlhyymtqteelkysvdqeslkeyfpievvtegllsi 360
DSSP hhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct yqellglsfeqvpdahvwnksvslytvkdkatgevlgqfyldlypregkynhaacfglqp 420
DSSP hhhhhleeeeellllllllllleeeeeeellllleeeeeeeellllllllllleeeeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct gcllpdgsrmmsvaalvvnfsqpvagrpsllrhdevrtyfhefghvmhqicaqtdfarfs 480
DSSP llllllllllleeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct gtnvetdfvevpsqmlenwvwdvdslrklskhykdghpitdelleklvasrlvntglltl 540
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhlllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct rqivlskvdqslhtnatldaaseyakycteilgvaatpgtnmpatfghlaggydgqyygy 600
DSSP hhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhlllllllllllllhh
DSSP .....................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .....................................pedkyeafvlhfsealriiagtp 99
ident
Sbjct lwsevfsmdmfhscfkkegimnpevgmkyrnlilkpggsldgmdmlqnflqrepnqkafl 660
DSSP hhhhhhhhhhhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhllllllhhhh
DSSP lllll
Query evhav 104
ident
Sbjct msrgl 665
DSSP hhhll
No 20: 1DD5A MOLECULE: RIBOSOME RECYCLING FACTOR;
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.................................
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP................................. 27
ident |
Sbjct VNPFIKEAKEKMKRTLEKIEDELRKMRtgkpspaileeikvdyygvptpvnqlatisise 60
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllhhhhllleeeelleeeehhhleeeeell
DSSP ...................................................HHHHHHHHH
Query ...................................................PADKYKTFE 36
ident | |
Sbjct ertlvikpwdksvlsliekainasdlglnpindgnvirlvfpsptteqrekWVKKAKEIV 120
DSSP lleeeeeellllhhhhhhhhhhhllllllleelllleeeelllllhhhhhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHH.................lLLHHHHHHHHHHHH..hhhhhllLH
Query AAFTVSSKRNLADAVSK.................aPQLVPKLDEVYNAA..ynaadhaAP 77
ident | ||
Sbjct EEGKIAIRNIRREILKKikedqkeglipeddakrlENEIQKLTDEFIEKldevfeikkEE 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhHH
DSSP HHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query EDkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct IM.......................ef 184
DSSP HH.......................ll
No 21: 1A7DA MOLECULE: MYOHEMERYTHRIN;
DSSP ................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhhHHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkyktFEAAFTVSSK 44
ident |
Sbjct gweipepyvwdesfrvFYEQLDEEHKKIFKGIFDCIRD............NSAPNLATLV 48
DSSP lllllllllllhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............LLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLL...............lhHHHHHhhhhhhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHH
Query RNLADAVSKAP...............qlVPKLDevynaaynaadhaapedkYEAFVLHFS 89
ident |
Sbjct KVTTNHFTHEEammdaakysevvphkkmHKDFL........ekigglsapvDAKNVDYCK 100
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhhhllllhhhhhhhHHHHH........hhhhhlllllLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLL...llllll
Query EALRIIAGT...pevhav 104
ident | |
Sbjct EWLVNHIKGtdfkykgkl 118
DSSP HHHHHHHHHlhhhhllll
No 22: 2OT3A MOLECULE: RAB5 GDP/GTP EXCHANGE FACTOR;
DSSP .........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .........aTTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKTFEAAFTVSSKRNLADAV 51
ident | | |
Sbjct skefieflktFHKTGQEIYKQTKLFLEGMHYKRDL....SIEEQSECAQDFYHNVAERMQ 56
DSSP lhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLLL....HHHHHHHHHHHHHHHHHlllhhHHHH.........................
Query SKAPQ....LVPKLDEVYNAAYNAADhaapeDKYE......................... 82
ident |
Sbjct TRGKVpperVEKIMDQIEKYIMTRLY.....KYVFcpettddekkdlaiqkriralrwvt 111
DSSP LLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH.....HHHLllllllhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct pqmlcvpvnedipevsdmvvkaitdiiemdskrvprdklacitkcskhifnaikitknep 171
DSSP llllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct asaddflptliyivlkgnpprlqsniqyitrfcnpsrlmtgedgyyftnlccavafiekl 231
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP hhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query afvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct daqslnlsqedfdrymsgqtsp 253
DSSP llhhhlllhhhhhhhhllllll
No 23: 1C03A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YDL235C;
DSSP ..........................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHH
Query ..........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKT 34
ident | | | |
Sbjct stipseiinwtilneiismddddsdfSKGLIIQFIDQAQTTFAQMQRQLDGE....KNLT 56
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHHHHHHHHHH..HHLL.................
Query FEAAFTVSSKRNLADAVskapqlVPKLDEVYNAAYNA..ADHA................. 75
ident | | | |
Sbjct ELDNLGHFLKGSSAALG......LQRIAWVCERIQNLgrKMEHffpnktelvntlsdksi 110
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLL......LHHHHHHHHHHHHHhlLLLLllllhhhhhlllllhhh
DSSP .................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......lllllll
Query .................APEDKYEAFVLHFSEALRIIAG.......tpevhav 104
ident
Sbjct inginideddeeikikdENSIYLILIAKALNQSRLEFKLarielskyyntnlh 163
DSSP hllllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllll
No 24: 2Q4FA MOLECULE: HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 1;
DSSP .......................................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA 21
ident |
Sbjct saaaalrdqltallssmfsqglvdeqfqqlqmlqdtpgfVSEVVTLFCDDADRIINEIAT 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhHH
Query TTAnvpPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVskapqlVPKLDEVYNAAYNAADHAapedKY 81
ident | | | |
Sbjct LLE...QPVVNFDKVDAYVHQLKGSSASVG......AQKVKFTCMQFRQFCQDK....SR 107
DSSP HHL...LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......LHHHHHHHHHHHHHHHLL....LH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHL..........lllllll
Query EAFVLHFSEALRIIAG..........tpevhav 104
ident
Sbjct DGCLMALAVVRNDFYDlrnkfqtmlqleqqiqa 140
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 25: 2B0HA MOLECULE: TALIN-1;
DSSP .........LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH........hllllLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .........ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA........ttanvPPADKYKTFEAAFTVSS 43
ident |
Sbjct gidpftmgdPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVtvqemvtksntspEELGPLANQLTSDYGRL 60
DSSP lllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHL.....LLHHHHH.HHHHHHHHHHHHL.LLHH.........hhhHHHHHH
Query KRNLADAVSKA.....PQLVPKL.DEVYNAAYNAADH.AAPE.........dkyEAFVLH 87
ident | | | |
Sbjct ASQAKPAAVAAeneeiGAHIKHRvQELGHGCSALVTKaGALQcspsdvytkkelIECARR 120
DSSP HHHHHHHHLLLllhhhHHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllhhhhhhhHHHHHH
DSSP HHHHHHHhhllllllll
Query FSEALRIiagtpevhav 104
ident ||
Sbjct VSEKVSHvlaalqagnr 137
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhll
No 26: 1XWMA MOLECULE: PHOSPHATE UPTAKE REGULATOR;
DSSP ....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..hhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHH
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..padkyktfEAAFtVSSKRNLADAVSK 53
ident | |
Sbjct tfadDLASLHNKLIEMGRLTEVALQQAiEAFQtqnanlamavIDGD.GSIDALEEEVNDF 59
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllhhhhhhhHHLL.HHHHHHHHHHHHH
DSSP L.................LLHHHHHHH................hhhhhhhhhhllLHHHH
Query A.................PQLVPKLDE................vynaaynaadhaAPEDK 80
ident |
Sbjct AlwliaaqqpvatdlrriVAAIKIASDieriadfavniakaciriggqpfvmdigPLVLM 119
DSSP HhhhhhlllllhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLLL...................................
Query YEAFVLHFSEALRIIA.GTPEVHAV................................... 104
ident | | | |
Sbjct YRLATDMVSTAIAAYDrEDASLAAQiadmdhrvdeqygemmasllavaktdaatlaqmnv 179
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhh
DSSP .................................
Query ................................. 104
ident
Sbjct lalvaryiertadhatniaehlvylvkgkhydf 212
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
No 27: 1SJ8A MOLECULE: TALIN 1;
DSSP ..............................................LLHHHHHHHHHHHH
Query ..............................................ATTEEQKLIEDVNA 14
ident
Sbjct ppltsaqqaltgtinssmqavqaaqatlddfetlpplgqdaaskawRKNKMDESKHEIHS 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhlhHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHH.............llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......L
Query SFRAAMAT.............tanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKA......P 55
ident | | | |
Sbjct QVDAITAGtasvvnltagdpaetdyTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLedeggnG 120
DSSP HHHHHHHHhhhhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllL
DSSP LHH.HHHHHHHHHHHHHHHLLLH.....hhhhhHHHHHHHHHHHHHHL............
Query QLV.PKLDEVYNAAYNAADHAAP.....edkyeAFVLHFSEALRIIAG............ 97
ident | | | |
Sbjct RPLlQAAKGLAGAVSELLRSAQPasaeprqnllQAAGNVGQASGELLQqigesdtdphfq 180
DSSP HHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct dvlmqlanavasaaaalvlkaksvaqrtedsglqtqviaaatqcalstsqlvactkvvap 240
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ..................................................lllllll
Query ..................................................tpevhav 104
ident
Sbjct tisspvcqeqlveagrlvakavegcvsasqaatedgqllrgvgaaatavtqalnell 297
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 28: 1ISEA MOLECULE: RIBOSOME RECYCLING FACTOR;
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.................................
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP................................. 27
ident |
Sbjct ISDIRKDAEVRMDKCVEAFKTQISKIRtgraspslldgivveyygtptplrqlasvtved 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllllhhhhllleeeelleeeehhhleeeeeee
DSSP ...................................................hHHHHHHHH
Query ...................................................pADKYKTFE 36
ident
Sbjct srtlkinvfdrsmspavekaimasdlglnpnsagsdirvplpplteerrkdlTKIVRGEA 120
DSSP lleeeeeellhhhhhhhhhhhhlllllllleellleeeeelllllhhhhhhhHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHH.................LLLHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhhh
Query AAFTVSSKRNLADAVSK.................APQLVPKLDEVYNAAynaadhaaped 79
ident | || | | ||
Sbjct EQARVAVRNVGRDANDKvkallkdkeisedddrrSQDDVQKLTDAAIKK........iea 172
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH........hhh
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query KYEAfvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct ALAD.............keaelmqf 184
DSSP HHHH.............hhhhhhhl
No 29: 1GQAA MOLECULE: CYTOCHROME C';
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhH
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT......aNVPPADKYKTFEAAFTVSSKRnlADAVsK 53
ident | | |
Sbjct aDAEHVVEARKGYFSLVALEFGPLaamakgeMPYDAAAAKAHASDLVTLTKY..DPSD.L 57
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL..LHHH.H
DSSP LLL.....................hhHHHHHHHHHHH.....hhhhllLHHHHHHHHHHH
Query APQ.....................lvPKLDEVYNAAY.....naadhaAPEDKYEAFVLH 87
ident | |
Sbjct YAPgtsaddvkgtaakaaiwqdadgfQAKGMAFFEAVaalepaagagqKELAAAVGKVGG 117
DSSP HLLllllllllllllllhhhhlhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhhhlllhHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhhLLLLllll
Query FSEALRIiaGTPEvhav 104
ident
Sbjct TCKSCHD.dFRVK...r 130
DSSP HHHHHHH.hHLLL...l
No 30: 1DOWA MOLECULE: ALPHA-CATENIN;
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LLLH
Query atteeqkliedvnasfraamattanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK...APQL 57
ident | | | |
Sbjct ..........................KAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESqflKEEL 34
DSSP ..........................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.........hhhHHHHHHHHHHHHHHHL..........
Query VPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE.........dkyEAFVLHFSEALRIIAG.......... 97
ident | | |
Sbjct VVAVEDVRKQGDLXKSAaGEFAddpcssvkrgnxVRAARALLSAVTRLLIladxadvykl 94
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct lvqlkvvedgilklrnagneqdlgiqykalkpevdklnixaakrqqelkdvgnrdqxaaa 154
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................lllllll
Query ............................................tpevhav 104
ident
Sbjct rgilqknvpilytasqaclqhpdvaaykanrdliykqlqqavtgisnaaqa 205
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 31: 1A0BA MOLECULE: AEROBIC RESPIRATION CONTROL SENSOR PROTEIN ARCB;
DSSP ......................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHHHHHH
Query ......................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKTFEAA 38
ident | |
Sbjct ksealldipmleqylelvgpklITDGLAVFEKMMPGYVSVLESNLTAQ....DKKGIVEE 56
DSSP lhhhhllhhhhhhhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....LHHHHHHH
DSSP HHHHHHhhhhhhhhhlllHHHHhHHHHHHHHH..hhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query FTVSSKrnladavskapqLVPKlDEVYNAAYN..aadHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIA 96
ident | | || | |
Sbjct GHKIKG.........aagSVGL.RHLQQLGQQiqspdLPAWEDNVGEWIEEMKEEWRHDV 106
DSSP HHHHHH.........hhhHLLL.HHHHHHHHHhllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL...llllll
Query GT...pevhav 104
ident
Sbjct EVlkawvakat 117
DSSP HHhhhhhhhhl
No 32: 2OOCA MOLECULE: HISTIDINE PHOSPHOTRANSFERASE;
DSSP ..............LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPpaDKYKTFEAAFTVSSKrn 46
ident |
Sbjct gavdfaylegfaagDFAVVDEVLALFREQAALWAPXLDPTH..PGWKDAVHTVKGAAR.. 56
DSSP llllhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHH..
DSSP hhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHHH...hhhllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL.lll
Query ladavskapqlvpkldevYNAAYN...aadhaAPED.KYEAFVLHFSEALRIIAGT.pev 101
ident |
Sbjct ...............gvgAFNLGEvcerceagQESLeGVRTALDAALLDIAAYAHEqalr 101
DSSP ...............hhlLHHHHHhhhhhhllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhh
DSSP lll
Query hav 104
ident
Sbjct slk 104
DSSP hhl
No 33: 2BVLA MOLECULE: TOXIN B;
DSSP ...............llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...............atteeQKLIEDVNASFRAAMAtTANVppadKYKTFEAAFTVSSKR 45
ident
Sbjct mslvnrkqlekmanvrfrtqEDEYVAILDALEEYHN.MSEN....TVVEKYLKLKDINSL 55
DSSP lllllhhhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLL....LHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH.......................
Query NLADAVSK....APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPE....................... 78
ident | |
Sbjct TDICIDTYkksgRNKALKKFKEYLVTEVLELKNNNLTpveknlhfvwiggqindtainyi 115
DSSP HHHHHHHLllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEellleeeeelllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct nqwkdvnsdynvnvfydsnaflintlkktvvesaindtlesfrenlndprfdynkffrkr 175
DSSP hhhhhhlllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct meiiydkqknfinyykaqreenpeliiddivktylsneyskeidelntyieeslnkitqn 235
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct sgndvrnfgefkngesfnlyeqelverwnlaaasdilrisalkeiggmyldvdmlpgiqp 295
DSSP leeehhhlhhhhllllhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeelllleellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct dlfesiekpssvtvdfwemtkleaimkykeyipeytsehfdmldeevqssfesvlasksd 355
DSSP lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP .............HHHH...........................................
Query .............DKYE........................................... 82
ident |
Sbjct kseifsslgdmeaSPLEvkiafnskgiinqglisvkdsycsnlivkqienrykilnnsln 415
DSSP hhhlllllllleeLLLLleeeeelleeeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........................................................h
Query ...........................................................a 83
ident
Sbjct paisedndfntttntfidsimaeanadngrfmmelgkylrvgffpdvkttinlsgpeaya 475
DSSP hhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllhhhlllllllllhhhhllhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhllLLLLL........................................
Query fvlhfsealriiagtPEVHA........................................ 103
ident
Sbjct aayqdllmfkegsmnIHLIEadlrnfeisktnisqsteqemaslwsfddarakaqfeeyk 535
DSSP hhhhhhhhlllllllLLLLHhhhhhhlllhhheellllhhhlllllllhhhhhhhhhhhh
DSSP .......l
Query .......v 104
ident
Sbjct rnyfegal 543
DSSP hhhhhlll
No 34: 2CMRA MOLECULE: TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN;
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH................llllLHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT................tanvPPADKYKTFEAAFTVS 42
ident |
Sbjct mqLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQHLlqltvwgikqlqarilatwmEWDREINNYTSLIHSL 60
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH...........
Query SKRNLADAVSK............APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE........... 78
ident | |
Sbjct IEESQNQQEKNeqellgqllsgiVQQQNNLLRAIEAQQHLLQLTvWGIKqlqarilwmew 120
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhlllhhh
DSSP .........................hhhhhhhhhhhhhhhHHHLL...............
Query .........................dkyeafvlhfsealrIIAGT............... 98
ident
Sbjct dreinnytslihslieesqnqqekneqelleggqllsgivQQQNNllraieaqqhllqlt 180
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ......llllll
Query ......pevhav 104
ident
Sbjct vwgikqlqaril 192
DSSP hhhhhhhhhhhl
No 35: 2BG9E MOLECULE: ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct neegrliekllgdydkrikpaktldhvidvtlkltltnlislnekeealttnvwieiqwn 60
DSSP llhhhhhhhhhhhlllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dyrlswntseyegidlvripsellwlpdvvlennvdgqfevayyanvlvyndgsmywlpp 120
DSSP lhhhllllllllllllllllhhhllllleeelllllllllllllllleelllleeeelle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aiyrstcpiavtyfpfdwqncslvfrsqtynahevnlqlsaeegidpedftengewtirh 180
DSSP eeeeellllllllllllllllleeeeellllllllleelllllllhhhllllllleeeee
DSSP ..................................LLHHHHHHHHHHHHHHH..hHHHHLL
Query ..................................ATTEEQKLIEDVNASFR..aAMATTA 24
ident |
Sbjct rpakknynwqltkddidfqeiiffliiqrkplfyIINIIAPCVLISSLVVLvyfLPAQAG 240
DSSP lllleellllllllllllleeeelleeeelllllHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHLL
DSSP lllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....................llhHHHHHHH
Query nvppadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKA....................pqlVPKLDEV 64
ident |
Sbjct ........GQKCTLSISVLLAQTIFLFLIAqkvpetslnvpligkylifvmfvSLVIVTN 292
DSSP ........HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhHLLL...............................HHHHHHHHHHHHHHHHH
Query YNAAYNAaDHAA...............................PEDKYEAFVLHFSEALR 93
ident | |
Sbjct CVIVLNVsLRTPnthscveacnfiakstkeqndsgsenenwvlIGKVIDKACFWIALLLF 352
DSSP HHHHHHHlLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLLL.......lllll
Query IIAGTP.......evhav 104
ident
Sbjct SLGTLAifltghlnqvpe 370
DSSP HHHHHHhhhhhhhhhlll
No 36: 1VS5T MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
DSSP ..............LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvppadKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident | | ||
Sbjct niksakkraiqsekARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIE....agDKAAAQKAFNEMQPIV 56
DSSP llllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....llLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query LADAVSKApqLVPKLDEVYNAAYNAADHAapedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident | |
Sbjct DRQAAKGL.iHKNKAARHKANLTAQINKL............................a 85
DSSP LLHHHLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHLL............................l
No 37: 1SXJE MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct wvdkyrpkslnalshneeltnflkslsdqprdlphlllygpngtgkktrcmallesifgp 60
DSSP lllllllllhhhllllhhhhhhhhllllllllllleeeellllllhhhhhhlhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gvyrnvvsspyhleitpsndriviqellkevaqmeqrykcviineansltkdaqaalrrt 120
DSSP lllllleellleeeelllllhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mekysknirlimvcdsmspiiapiksqcllircpapsdseistilsdvvtneriqletkd 180
DSSP hhhlllleeeeeeelllllllhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlleelllh
DSSP ........................................llhhhhhhhHHHH.......
Query ........................................atteeqkliEDVN....... 13
ident
Sbjct ilkriaqasngnlrvsllmlesmalnnelalkssspiikpdwiivihklTRKIvkersvn 240
DSSP hhhhhhhhhlllhhhhhhhhlhhhhlllleelllllllllhhhhhhhhhHHHHhhlllhh
DSSP ..hhhHHHH.HHLLLLlhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLL.HHHHHHHHHHHHH
Query ..asfRAAM.ATTANVppadkykTFEAAFTVSSKRNLADavSKAPQ.LVPKLDEVYNAAY 69
ident || | | |
Sbjct sliecRAVLyDLLAHC......iPANIILKELTFSLLDV..ETLNTtNKSSIIEYSSVFD 292
DSSP hhhhhHHHHhHHHLLL......lLHHHHHHHHHHLLLLL..LLLLHhHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query NAADHAapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | |
Sbjct ERLSLG...NKAIFHLEGFIAKVMCCLD....... 317
DSSP HHHHLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHL.......
No 38: 1HY5A MOLECULE: YERSINIA PESTIS VIRULENCE PROTEIN YOPE;
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..lllLHHH.......hhhHHHHHHHHhhhhhhhhhh
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAMATT..anvPPAD.......kykTFEAAFTVsskrnladav 51
ident |
Sbjct .TSFSDSIKQLAAETLPKYXQQLnsldaEXLQknhdqfatgsGPLRGSIT.......qcq 52
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllhHHHHhhhhhhllllLHHHHHHH.......hhh
DSSP hhlllHHHHHHHHHHHHHHhhHLLL..........................HHHHHHHHH
Query skapqLVPKLDEVYNAAYNaaDHAA..........................PEDKYEAFV 85
ident | | |
Sbjct glxqfCGGELQAEASAILN..TPVCgipfsqwgtiggaasayvasgvdltqAANEIKGLA 110
DSSP hhhhhLLHHHHHHHHHHHH..LEELleehhhhhllllhhhhhhllllllhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHhHHHHHHllllllll
Query LHFSeALRIIAgtpevhav 104
ident |
Sbjct QQXQ.KLLSLX........ 120
DSSP HHLH.HHHHHL........
No 39: 2B64T MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
DSSP ..............LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHHHHHHhHHHHHHHH
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadKYKTFEAaFTVSSKRN 46
ident | |
Sbjct rnlsalkrhrqslkRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQL....aqegKAEEALK.IMRKAESL 55
DSSP llllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhhlLHHHHHH.HHHHHHHH
DSSP HHHHHH..HLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query LADAVS..KAPQ.LVPKLDEVYNAAYNAADHAApeDKYEafvlhfsealriiagtpevha 103
ident | ||
Sbjct IDKAAKgsTLHKnAAARRKSRLMRKVRQLLEAA..GAPL...............igggls 98
DSSP HHHHLLllLLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLL...............llllll
DSSP l
Query v 104
ident
Sbjct a 99
DSSP l
No 40: 1YPYA MOLECULE: VIRION MEMBRANE PROTEIN;
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL..........................lllhhHHHH
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAM.ATTA..........................nvppaDKYK 33
ident |
Sbjct .AASIQTTVNTLSERISSKLeQEANasaqtkcdieignfyirqnhgcnltvknmcsADAD 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLllllllllleeeeeeeeeeeleeeeeeelllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHH...............hhhHHHHHHHHHHHL..LL
Query TFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVP...............kldEVYNAAYNAADH..AA 76
ident | || |
Sbjct AQLDAVLSAATETYSGLTPEQKAYVPamftaalniqtsvntvvrDFENYVKQTCNSsaVV 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHLLHHhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHHHHLLLhhHH
DSSP HH..........................hhHHHHHHHHhHHHHHHHLL..........ll
Query PE..........................dkYEAFVLHFsEALRIIAGT..........pe 100
ident ||
Sbjct DNklkiqnviidecygapgsptnlefintgSSKGNCAI.KALMQLTTKattqiapkqvag 178
DSSP LLllleeeeeeeeeelllllleeeeeeellLHHHHHHH.HHHHHHHHHhhhhhllleell
DSSP llll
Query vhav 104
ident
Sbjct tgvq 182
DSSP eell
No 41: 1SUMB MOLECULE: PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG
DSSP .......LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.TANVPpadkyktfEAAFTVSSKRNLADAVS 52
ident | |
Sbjct nrllnekVEEFKKGVLKAGWFIEKMFRNSiSSLVErneslareVIADEEVVDQMEVEIQE 60
DSSP lllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HL.................LLHHHHHHH................hhhhhhhhhhllLHHH
Query KA.................PQLVPKLDE................vynaaynaadhaAPED 79
ident ||
Sbjct KAmevlglfspigkplltvTAGIRVAELieniadkchdiaknvlelmeepplkpleDIPA 120
DSSP HHhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLL..................................
Query KYEAFVLHFSEALRIIAGTP..EVHA.................................. 103
ident ||| |
Sbjct MANQTSEMLKFALRMFADVNveKSFEvcrmdskvddlyekvreelllymmespkyvkral 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
DSSP ...........................................l
Query ...........................................v 104
ident
Sbjct llleiagnieiiadyatnivevsvymvqgeaykcyhdelllfkk 224
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 42: 1K04A MOLECULE: FOCAL ADHESION KINASE 1;
DSSP ............llhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ............atteeqkliedvnasfraamattaNVPPADKyKTFEAAFTVSSKRNLA 48
ident || ||
Sbjct eisppptanldrsndkvyenvtglvkaviemsskiqPAPPEEY.VPMVKEVGLALRTLLA 59
DSSP lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH............HHHHHHHHH
Query DAVSKA........pQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE............DKYEAFVLH 87
ident
Sbjct TVDETIpllpasthrEIEMAQKLLNSDLGELINKmKLAQqyvmtslqqeykKQMLTAAHA 119
DSSP HHHHHHhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllllhhhhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL......lllllll
Query FSEALRIIAG......tpevhav 104
ident
Sbjct LAVDAKNLLDvidqarlkmlgqt 142
DSSP HHHHHHHHHHhhhhhhhhhllll
No 43: 1FIOA MOLECULE: SSO1 PROTEIN;
DSSP ......LLHHHHHHHHHHHHHHHH.............hhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHH
Query ......ATTEEQKLIEDVNASFRA.............amattanVPPADKYKTFEAAFTV 41
ident | | | |
Sbjct mhdfvgFMNKISQINRDLDKYDHTinqvdslhkrlltevneeqaSHLRHSLDNFVAQATD 60
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHH.............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL............
Query SSKRNLADAVSK.............APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAA............ 76
ident | |
Sbjct LQFKLKNEIKSAqrdgihdtnkqaqAENSRQRFLKLIQDYRIVDSNYKeenkeqakrqym 120
DSSP HHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................................hhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..........................................pedkyeafvlhfsealri 94
ident
Sbjct iiqpeatedeveaaisdvggqqifsqalleaktalaevqarhqellkleksmaeltqlfn 180
DSSP hhlllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhllllllll
Query iagtpevhav 104
ident
Sbjct dmeelvieqq 190
DSSP hhhlllllll
No 44: 1BCCC MOLECULE: UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE;
DSSP ..........................LLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLHH....
Query ..........................ATTEEqKLIEDVNASFRAAMAT.TANVPPA.... 29
ident |
Sbjct apnirkshpllkminnslidlpapsnISAWW.NFGSLLAVCLMTQILTgLLLAMHYtadt 59
DSSP llllllllllhhhhllllllleeellLLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHLLLllll
DSSP .................hhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........lhhHHHHHH
Query .................dkyktfeAAFTVSSKRNLADAVSKAP........qlvPKLDEV 64
ident |
Sbjct slafssvahtcrnvqygwlirnlhANGASFFFICIFLHIGRGLyygsylyketwNTGVIL 119
DSSP llhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllhhhlhhhhHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH..............................................llLHH
Query YNAAYNAAD..............................................haAPE 78
ident |
Sbjct LLTLMATAFvgyvlpwgqmsfwgatvitnlfsaipyightlvewawggfsvdnptltRFF 179
DSSP HHHHHHHHHllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllllhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................................
Query DKYEAFVLHFSEALRIIAGT........................................ 98
ident |
Sbjct ALHFLLPFAIAGITIIHLTFlhesgsnnplgissdsdkipfhpyysfkdilgltlmltpf 239
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct ltlalfspnllgdpenftpanplvtpphikpewyflfayailrsipnklggvlalaasvl 299
DSSP hhhhhhlllllllhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct ilflipflhkskqrtmtfrplsqtlfwllvanlliltwigsqpvehpfiiigqmaslsyf 359
DSSP hhhlhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..............llllll
Query ..............pevhav 104
ident
Sbjct tillilfptigtlenkmlny 379
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhllll
No 45: 2D9DA MOLECULE: BAG FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR 5;
DSSP ...llHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHH...
Query ...atTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANV.PPADKYKTFEAAFTVSSKrNLADAVSK... 53
ident || | | | | |
Sbjct gssgsSGSILKIEKVLKRMREIKNELLQAqNPSELYLSSKTELQGLIG.QLDEVSLEknp 59
DSSP lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHLLLllh
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query .APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident |
Sbjct cIREARRRAVIEVQTLITYIDLKES......................gpssg 89
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......................lllll
No 46: 2D4XA MOLECULE: FLAGELLAR HOOK-ASSOCIATED PROTEIN 3;
DSSP ..........................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hllLLLHhHHHH
Query ..........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA.ttaNVPPaDKYK 33
ident |
Sbjct vvlsqaqaqnsqyalartfatqkvslEESVLSQVTTAIQTAQEKIVYagngTLSD.DDRA 59
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLLH.HHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................................
Query TFEAAFTVSSKRNLADAVS......................................... 52
ident | |
Sbjct SLATDLQGIRDQLMNLANStdgngryifagykteaapfdqatggyhggeksvtqqvdsar 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllllllllllllllllleeeelllll
DSSP ......hllLHHH.................hHHHHHHHHHHH.....hhllLHHHHHHHH
Query ......kapQLVP.................kLDEVYNAAYNA.....adhaAPEDKYEAF 84
ident | | | | | |
Sbjct tmvightgaQIFNsitsnavpepdgsdseknLFVMLDTAIAAlktpvegnnVEKEKAAAA 179
DSSP eeeelllhhHHHLllllllllllllllllllHHHHHHHHHHHhlllllllhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLL...............llllll
Query VLHFSEALRIIAGT...............pevhav 104
ident |
Sbjct IDKTNRGLKNSLNNvltvraelgtqlselstldsl 214
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 47: 2D4UA MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN I;
DSSP ........................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..............
Query ........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.............. 22
ident | |
Sbjct gplgsgglffnalknckenftvlqTIRQQQSTLNGSWVALLQTRNTlnragirymmdqnn 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhll
DSSP .llLLLHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHH..........lllHHHHHHHHHHHHHHH
Query .taNVPPADKYKTFEAAFTvSSKRNLADAVSK..........apqLVPKLDEVYNAAYNA 71
ident | | || | ||
Sbjct igsGSTVAELMESASISLK.QAEKNWADYEALprdprqstaaaaeIKRNYDIYHNALAEL 119
DSSP lllLLLHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLL.LHHHhhhhhhHHHHHHHHHHHL...............lllllll
Query ADHA.APEDkyeafvLHFSEALRIIAG...............tpevhav 104
ident |
Sbjct IQLLgAGKI.neffdQPTQGYQDGFEKqyvaymeqndrlhdiavsdnna 167
DSSP HHHHhHLLH.hhhhhLLHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 48: 2CRBA MOLECULE: NUCLEAR RECEPTOR BINDING FACTOR 2;
DSSP .......LLHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHLllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......ATTEEQKLIEDVnASFRAAMATTanvppadkyktFEAAFTVSSKRNLADAVSK 53
ident |
Sbjct gssgssgMEGPLNLAHQQS.RRADRLLAAG...........KYEEAISCHRKATTYLSEA 48
DSSP lllllllLLLHHHHHHHHH.HHHHHHHHLL...........LHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP ............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query ............APQLVPKLDEVYNAAYNAADHA.APEDkyeafvlhfsealriiagtpe 100
ident | |
Sbjct mklteseqahlsLELQRDSHMKQLLLIQERWKRAkREER...............lkahsg 93
DSSP hlllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHH...............hhllll
DSSP llll
Query vhav 104
ident
Sbjct pssg 97
DSSP llll
No 49: 1WRDA MOLECULE: TARGET OF MYB PROTEIN 1;
DSSP ....LLHHhHHHHHHHHHHHHH..........hhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ....ATTEeQKLIEDVNASFRA..........amattanVPPADKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident || |
Sbjct gplgSEQI.GKLRSELEMVSGNvrvmsemltelvptqaePADLELLQELNRTCRAMQQRV 59
DSSP llllLLLH.HHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query LADAVSK....APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAApedkyeafvlhfsealriiagtpevh 102
ident | |
Sbjct LELIPQIaneqLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFE.......................rfr 96
DSSP HHHHHHLllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......................hhh
DSSP ll
Query av 104
ident
Sbjct tg 98
DSSP ll
No 50: 1TUJA MOLECULE: ODORANT BINDING PROTEIN ASP2;
DSSP llhHHHHHHHHHHH...................hhhhhhhhlllllhHHHHHHHHHHH..
Query attEEQKLIEDVNA...................sfraamattanvppADKYKTFEAAF.. 39
ident |
Sbjct ...IDQDTVVAKYMeylmpdimpcadelhisediatniqaakngadmSQLGCLKACVMkr 57
DSSP ...LLHHHHHHHHHhllhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllLLHHHHLLHHHhh
DSSP ..........hhHHHHHH.HHHHhHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH.HHHHHHHHH
Query ..........tvSSKRNL.ADAVsKAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPE.DKYEAFVLH 87
ident | | |
Sbjct iemlkgtelyvePVYKMIeVVHA.GNADDIQLVKGIANECIENAKGETDEcNIGNKYTDC 116
DSSP llleelleellhHHHHHHhHHLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHhhhllllllll
Query FSEALRiiagtpevhav 104
ident | |
Sbjct YIEKLF..........s 123
DSSP HHHHLL..........l
No 51: 1SZIA MOLECULE: MANNOSE-6-PHOSPHATE RECEPTOR BINDING PROTEIN 1;
DSSP .................................................LLHHHHHHHHH
Query .................................................ATTEEQKLIED 11
ident ||
Sbjct nrlplteaelaliatppedsdmaslqqqrqeqnyfvrlgslserlrnhaYEHSLGKLQNA 60
DSSP leelllhhhhhllllllllllhhhhhhhhhllleeeehhhllhhhhhhhHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHhHHHHHH.................llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHl
Query VNASfRAAMAT.................tanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKa 54
ident |
Sbjct RQKA.QETLQQltsvlglmesvkqakpeqveaRALSMFRDITQQLQSMCVALGASIQGLp 119
DSSP HHHH.HHHHHHhhhhhhhhhhhhllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLl
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH......hhhhhhHHHHHHHHHHH............
Query pQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE......dkyeafVLHFSEALRII............ 95
ident |
Sbjct sHVREQAQQARSQVNDLQATfSGIHsfqdlsagvlaqTRERIARAREAldntveyvaqnt 179
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLlhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlll
DSSP ......hllllllll
Query ......agtpevhav 104
ident
Sbjct pamwlvgpfapgite 194
DSSP lllleeeeeeellll
No 52: 1OEDB MOLECULE: ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN;
DSSP ...LLHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLlllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
Query ...ATTEEQKLIEDVNASFRAA.MATTAnvppadKYKTfEAAFTVSSKRNLADAVSK... 53
ident
Sbjct plfYIVYTIIPCILISILAILVfYLPPD......AGEK.MSLSISALLAVTVFLLLLadk 53
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHH......LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
DSSP .................lllhHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .................apqlVPKLDEVYNAaynaadhaapeDKYEAFVLHFSEALRIIA 96
ident | | |
Sbjct vpetslsvpiiirylmfimilVAFSVILSVV..vlnlhhrsaMVADRLFLYVFFVICSIG 111
DSSP hhhhhhhlllllllhhhhhhhHHHHHHHHHH..hhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP ..LLLL......llll
Query ..GTPE......vhav 104
ident
Sbjct tfSIFLdashnvppdn 127
DSSP hhHHHHhhhhhlllll
No 53: 1EQ1A MOLECULE: APOLIPOPHORIN-III;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dapaggnafeemekhakefqktfseqfnslvnskntqdfnkalkdgsdsvlqqlsafsss 60
DSSP llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ........LLHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.........LHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........ATTEeQKLIEDVNASFRAAMATTANV.........PPADKYKTFEAAFTVSS 43
ident | || |
Sbjct lqgaisdaNGKA.KEALEQARQNVEKTAEELRKAhpdvekeanAFKDKLQAAVQTTVQES 119
DSSP hhhhhlllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH.......hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KRNLADAVS.......kAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAApedkyeafvlhfsealriia 96
ident |
Sbjct QKLAKEVASnmeetnkkLAPKIKQAYDDFVKHAEEVQKKL.................... 159
DSSP HHHHHHHHLllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....................
DSSP llllllll
Query gtpevhav 104
ident
Sbjct .heaatkq 166
DSSP .hhhllll
No 54: 2Q80A MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
DSSP .......................................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA 21
ident |
Sbjct etvqrillepykyllqlpgkqvrtklsqafnhwlkvpedKLQIIIEVTEMLHNASLLIDD 60
DSSP llhhhhhlhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLLLL.........hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LHHHHHHHHHHHHHHH
Query TTANVP.........padkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAP.QLVPKLDEVYNAAYNA 71
ident | | |
Sbjct IEDNSKlrrgfpvahsiygiPSVINSANYVYFLGLEKVLTLDHpDAVKLFTRQLLELHQG 120
DSSP HHHLLLeelleelhhhhhlhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHL..LLHH.......hhhhhhhHHHHHHHHHHHL.............lLLLLL......
Query ADH..AAPE.......dkyeafvLHFSEALRIIAG.............tPEVHA...... 103
ident | | | |
Sbjct QGLdiYWRDnytcpteeeykamvLQKTGGLFGLAVglmqlfsdykedlkPLLNTlglffq 180
DSSP HHHhhHHHHllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllllhHHHHHhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 103
ident
Sbjct irddyanlhsksfcedltegkfsfptihaiwsrpestqvqnilrqrtenidikkycvhyl 240
DSSP hhhhhhhhhlllllhhhhhllllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................l
Query ............................................v 104
ident
Sbjct edvgsfeytrntlkeleakaykqidarggnpelvalvkhlskmfk 285
DSSP hhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllll
No 55: 2E87A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1320;
DSSP .........LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.HHHHH.HHHHhhhhhhHHHHHHH
Query .........ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP.PADKY.KTFEaaftvsSKRNLAD 49
ident || | | | |
Sbjct xrnpferxpTVLTADELIDKAFRRAEKAASSFKPRGnKVKKArLREElrvrtvSNVVRDN 60
DSSP lllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLlHHHHHhHHHHhhhhhhHHHHHHH
DSSP HHHH.................................LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query AVSK.................................APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAA 76
ident |
Sbjct LRKVlertpglstlpkfyqelvdvlvdrdtfhkaxagIDWAIRIIRELEERYVERIRYSN 120
DSSP HHHHhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
DSSP HHhhhhhhhHHHHHHHHHHHL.......................................
Query PEdkyeafvLHFSEALRIIAG....................................... 97
ident |
Sbjct DP...neiaELRRQFYGRVASvlrdiddrlrylnkarevlkdlpvvdleiptvviaghpn 177
DSSP LH...hhhhHHHHHHHHHHHHhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct vgkstllkalttakpeiasypfttrginvgqfedgyfryqiidtpglldrpiserneiek 237
DSSP llhhhhhhhhllllleeelllllllleeeeeeeelleeeeeeelllllllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct qailalrylgnliiyifdpsehcgfpleeqihlfeevhgefkdlpflvvinkidvadeen 297
DSSP hhhhhhhhllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllhhh
DSSP ....................................................lllllll
Query ....................................................tpevhav 104
ident
Sbjct ikrlekfvkekglnpikisalkgtgidlvkeeiiktlrplaekvarekierelrryrsy 356
DSSP hhhhhhhhhhllllleellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
No 56: 2ACXA MOLECULE: G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE 6;
DSSP ...................................................llhHHHHHH
Query ...................................................attEEQKLI 9
ident |
Sbjct karkgkskkwrqmlqfphisqceelrlslerdyhslcernpigrllfrefcatrPELSRC 60
DSSP lllllllllhhhhllllllhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHL...lLHHHHHHHHHH
Query EDVNASFRAAMATtanvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLAdaVSKA...pQLVPKLDEVYN 66
ident | | |
Sbjct VAFLDGVAEYEVT........PDDKRKACGRNLTQNFLS.hTGPDlipeVPRQLVTNCTQ 111
DSSP HHHHHHHHHHHLL........LLLLHHHHHHHHHHHHLL.lLLLLllllLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHhhlllhhhhhhhHHHHhHHHHHhHHLL............................
Query AAYNAadhaapedkyeaFVLHfSEALRiIAGT............................ 98
ident |
Sbjct RLEQG...........pCKDL.FQELTrLTHEylsvapfadyldsiyfnrflqwkwlerq 159
DSSP HHHHL...........lLLLL.LHHHHhHHHHhhllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct pvtkntfrqyrvlgkggfgevcacqvratgkmyackklekkrikkrkgeamalnekqile 219
DSSP lllhhheeeeeeeeeelleeeeeeeellllleeeeeeeehhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct kvnsrfvvslayayetkdalclvltlmnggdlkfhiyhmgqagfpearavfyaaeiccgl 279
DSSP hlllllllleeeeeellleeeeeelllllllhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct edlhrerivyrdlkpenillddhghirisdlglavhvpegqtikgrvgtvgymapevvkn 339
DSSP hhhhhlleelllllhhheeellllleeelllllleelllllleelllllhhhllhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct erytfspdwwalgcllyemiagqspfqqrkkkikreeverlvkevpeeyserfspqarsl 399
DSSP leellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct csqllckdpaerlgcrggsarevkehplfkklnfkrlgagmleppfkpdpqaiyceptdq 459
DSSP hhhhllllhhhlllllllhhhhhhllhhhllllhhhhhllllllllllllllllllhhhh
DSSP ..............................llllll
Query ..............................pevhav 104
ident
Sbjct dfyqkfatgsvpipwqnemvetecfqelnvfgldgs 495
DSSP hhhhhhlleelhhhhhhhhhhllhhhhhhlllllll
No 57: 1W36C MOLECULE: DNA HAIRPIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mlrvyhsnrldvlealmefivererlddpfepemilvqstgmaqwlqmtlsqkfgiaani 60
DSSP leeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleelllhhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dfplpasfiwdmfvrvlpeipkesafnkqsmswklmtllpqlleredftllrhyltddsd 120
DSSP llllhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct krklfqlsskaadlfdqylvyrpdwlaqwetghlveglgeaqawqaplwkalveythqlg 180
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qprwhranlyqrfietlesattcppglpsrvficgisalppvylqalqalgkhieihllf 240
DSSP lllllllllhhhhhhhhhllllllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tnpcryywgdikdpaylaklltrqrrhsfedrelplfrdsenagqlfnsdgeqdvgnpll 300
DSSP ellllllllllllhhhhllllllleellllllllllllhhhhlllllllllllllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aswgklgrdyiyllsdlessqeldafvdvtpdnllhniqsdilelenravagvnieefsr 360
DSSP hhhlhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sdnkrpldpldssitfhvchspqrevevlhdrllamleedptltprdiivmvadidsysp 420
DSSP lllleelllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhheeeeellhhhhhh
DSSP ......................llhhhHHHHHHHHHHHHH....................
Query ......................atteeQKLIEDVNASFRA.................... 18
ident |
Sbjct fiqavfgsapadrylpyaisdrrarqsHPVLEAFISLLSLpdsrfvsedvlalldvpvla 480
DSSP hhhhhlllllllllllleelleelhhhLHHHHHHHHHLLHhhllllhhhhhhhlllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 18
ident
Sbjct arfditeeglrylrqwvnesgirwgidddnvrelelpatgqhtwrfgltrmllgyamesa 540
DSSP hhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP .................................hhhHLLLllhhhhhhhhhHHHHHHHHH
Query .................................amaTTANvppadkyktfeAAFTVSSKR 45
ident |
Sbjct qgewqsvlpydessgliaelvghlasllmqlniwrrGLAQ...erpleewlPVCRDMLNA 597
DSSP lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...leehhhhlLHHHHHHHH
DSSP HHHhhHHHL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLHHHhhHHHHHHHHHHHHHhHLLL...
Query NLAdaVSKA.PQLVPKLDEVYNAAYNAADH..AAPEDkyEAFVLHFSEALRIiAGTP... 99
ident | |
Sbjct FFL..PDAEtEAAMTLIEQQWQAIIAEGLGaqYGDAVplSLLRDELAQRLDQ.ERISqrf 654
DSSP HLL..LLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLEElhHHHHHHHHHHHHH.LEELlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct lagpvnictlmpmrsipfkvvcllgmndgvyprqlaplgfdlmsqkpkrgdrsrrdddry 714
DSSP llllleeellllllllleeeeeeelllllllllllllllllhhhhllllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct lflealisaqqklyisyigrsiqdnserfpsvlvqelidyigqshylpgdealncdesea 774
DSSP hhhhhhhheeeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhlleellllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct rvkahltclhtrmpfdpqnyqpgerqsyarewlpaasqagkahsefvqplpftlpetvpl 834
DSSP hhhhhhllllllllllhhhllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllleeh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct etlqrfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipdtepfileglsryqinqqllnalveqdda 894
DSSP hhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct erlfrrfraagdlpygafgeifwetqcqemqqladrviacrqpgqsmeidlacngvqitg 954
DSSP hhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct wlpqvqpdgllrwrpsllsvaqgmqlwlehlvycasggngesrlflrkdgewrfpplaae 1014
DSSP eeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhleeeellllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct qalhylsqliegyregmsapllvlpesggawlktcydaqndamldddstlqkartkflqa 1074
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhheelhhheelllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................................lllll
Query ..........................................evhav 104
ident
Sbjct yegnmmvrgegddiwyqrlwrqltpetmeaiveqsqrfllplfrfnq 1121
DSSP hllllllllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 58: 1K9AA MOLECULE: CARBOXYL-TERMINAL SRC KINASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aswpsgteciakynfhgtaeqdlpfckgdvltivavtkdpnwykaknkvgregiipanyv 60
DSSP llllllleeeelllllllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllleeeeehhhe
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qkregvkagtklslmpwfhgkitreqaerllyppetglflvrestnypgdytlcvscegk 120
DSSP eellllllllleellllllllllhhhhhhhllllllleeeeeellllllleeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vehyrimyhasklsideevyfenlmqlvehyttdadglctrlikpkvmegtvaaqdefyr 180
DSSP eeeeeeeeelleeelllllllllhhhhhhhhhhlllllllllleelllllleehhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sgwalnmkelkllqtigkgefgdvmlgdyrgnkvavkcikndataqaflaeasvmtqlrh 240
DSSP llllllhhheeeeeeeeellleeeeeeeelleeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhllll
DSSP ......................................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT 22
ident | |
Sbjct snlvqllgviveekgglyivteymakgslvdylrsrgrSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYL 300
DSSP llllleeeeeellllleeeeeellllllhhhhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LLL............................LLHH................HHHHHHHHH
Query TAN............................VPPA................DKYKTFEAA 38
ident | |
Sbjct EGNnfvhrdlaarnvlvsednvakvsdfgltKEASklpvkwtapealrekkFSTKSDVWS 360
DSSP HHLleelllllhhheeellllleeellllllEELLllllllllhhhhhlllLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH.....................hhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLh
Query FTVSSKRNLAD.....................avskaPQLVPKLDEVYNAAYNaaDHAAp 77
ident | | | ||
Sbjct FGILLWEIYSFgrvpypriplkdvvprvekgykmdapDGCPPAVYDVMKNCWH..LDAA. 417
DSSP HHHHHHHHHLLllllllllllllhhhhhhllllllllLLLLHHHHHHHHHHLL..LLHH.
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query edkyeAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | | | |
Sbjct ...trPTFLQLREQLEHIRTH..elhl 439
DSSP ...hlLLHHHHHHHHHHHHHL..llll
No 59: 1HTJF MOLECULE: KIAA0380;
DSSP ...........................LLHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHH
Query ...........................ATTEeqKLIEDVNASFRAAMATtanvppadKYK 33
ident |
Sbjct esdiifqdleklksrpahlgvflryifSQAD..PSPLLFYLCAEVYQQA........SPK 50
DSSP lhhhhhhlhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHLL..LHHHHHHHHHHHHLLL........LLL
DSSP HHHHHHHHHHHHH....HHHHhhhlllhhhHHHH.HHHHHHHHhhlllhhhhhHHHHHHH
Query TFEAAFTVSSKRN....LADAvskapqlvpKLDE.VYNAAYNAadhaapedkyEAFVLHF 88
ident | | |
Sbjct DSRSLGKDIWNIFleknAPLR........vKIPExLQAEIDSR......lrnsEDARGVL 96
DSSP HHHHHHHHHHHHHllllLLLL........lLLLHhHHHHHHHH......hhllLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHL...................................................
Query SEALRIIAG................................................... 97
ident ||
Sbjct CEAQEAAXPeiqeqihdyrtkrtlglgslygendlldldgdplrerqvaekqlaalgdil 156
DSSP HHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...................lllllll
Query ...................tpevhav 104
ident
Sbjct sayaadrsapxdfalntyxshagirl 182
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
No 60: 1EYSM MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER;
DSSP ...............................................llhhhhhHHHHHH
Query ...............................................atteeqkLIEDVN 13
ident
Sbjct peyqniftavqvrapaypgvplpkgnlprigrpifsywlgkigdaqigpiylglTGTLSI 60
DSSP llllllllllleelllllllllllllllllllllllllhhhhlllllllllllhHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLL...................................lhhHHHHHHHHH
Query ASFRAAMATTANV...................................ppaDKYKTFEAA 38
ident |
Sbjct FFGLVAISIIGFNmlasvhwdvfqflkhffwlgleppppqyglripplsegGWWLIAGLF 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhhlllllhhhhhhhhhhlllllllhhhllllllhhhlHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL....LHHHHHH.....
Query FTVSSKRNLADAVSKA......PQLVPKLDEVYNAAYNA.ADHA....APEDKYE..... 82
ident | | | |
Sbjct LTLSILLWWVRTYKRAealgmsQHLSWAFAAAIFFYLVLgFIRPvmmgSWAKAVPfgifp 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHhhhlLHHHLLLllllh
DSSP .....hhhhhhhhhhhhhhllLLLL...................................
Query .....afvlhfsealriiagtPEVH................................... 102
ident
Sbjct hldwtaafsirygnlyynpfhMLSIaflygsallfamhgatilsvsrfggdreidqithr 240
DSSP hhhhhhhhhhhlllhhhlhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 102
ident
Sbjct gtaaegaalfwrwtmgfnatmesihrwawwcavltvitagigillsgtvvdnwylwavkh 300
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhl
DSSP ................ll
Query ................av 104
ident
Sbjct gmapaypevvtavnpyet 318
DSSP llllllllllllllllll
No 61: 1AX8A MOLECULE: OBESITY PROTEIN;
DSSP llhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL............................lhhhhh
Query atteEQKLIEDVNASFRAAMATTANV............................ppadky 32
ident || |
Sbjct ....IQKVQDDTKTLIKTIVTRINDIldfipglhpiltlskmdqtlavyqqiltsmpsrn 56
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhh
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....hhhhhhhhhhhhhhhhhllLHHHHHHHHHHH
Query KTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQ.....lvpkldevynaaynaadhaAPEDKYEAFVLH 87
ident |
Sbjct VIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSChlpeasgletldslggvleasgysTEVVALSRLQGS 116
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllllhhhhhhhhllllllHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLlllllll
Query FSEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct LQDMLWQLDL...spgc 130
DSSP HHHHHHHHHH...llll
No 62: 2FB5A MOLECULE: HYPOTHETICAL MEMBRANE SPANNING PROTEIN;
DSSP .....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHH
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANV.........PPADkYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident | |
Sbjct snamhEWGLSEELKIQTKQMIEIAEKELSIMrnaidkedeCILC.KMEDIHHMLANVQTL 59
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllllllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLLL..................................................
Query LADAVSKAPQ.................................................. 56
ident | |
Sbjct AATYYIQAYLspytesssfittaiqhlsarkhgalivvernetlealiqtgttlnahlta 119
DSSP HHHHHHHHHHllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllllllllleeeeeellh
DSSP .....................................hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhh
Query .....................................lvpkldevynaaynaadhaaped 79
ident
Sbjct pllesifypgnplhdgavlvknnhivsaanilpltkstevdpelgtrhraaiglseksda 179
DSSP hhhhhhlllllllllleeeeelleeeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhlllll
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query kyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct lilvvseetgrtsfalngilytisl 204
DSSP eeeeelllllleeeeelleeeeell
No 63: 1SXJB MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lqlpwvekyrpqvlsdivgnketidrlqqiakdgnmphmiisgmpgigkttsvhclahel 60
DSSP llllhhhhlllllhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lgrsyadgvlelnasddrgidvvrnqikhfaqkklhlppgkhkivildeadsmtagaqqa 120
DSSP hhhhhhhheeeelllllllhhhhhlhhhhhhhlllllllllleeeeeelhhhllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lrrtmelysnstrfafacnqsnkiieplqsqcailrysklsdedvlkrllqiikledvky 180
DSSP lhhhhhhlllleeeeeeellhhhllhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ..........................................llhhhhhhhHHHHH....
Query ..........................................atteeqkliEDVNA.... 14
ident |
Sbjct tndgleaiiftaegdmrqainnlqstvaghglvnadnvfkivdsphplivkKMLLAsnle 240
DSSP lhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllllhhhhhHHHLLllhh
DSSP hhHHHHH..HLLLLlhhHHHHHHhhHHHHHHHHHhHHHHhhlLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query sfRAAMA..TTANVppaDKYKTFeaAFTVSSKRNlADAVskaPQLVPKLDEVYNAAYNAA 72
ident | |
Sbjct dsIQILRtdLWKKG...YSSIDIvtTSFRVTKNL.AQVK...ESVRLEMIKEIGLTHMRI 293
DSSP hhHHHHHhlLLLLL...LLHHHHhhHHHHHHHLL.LLLL...HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query DHAapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident
Sbjct LEG...VGTYLQLASMLAKIHKLNNK...... 316
DSSP HLL...LLLHHHHHHHHHHHHHHLLL......
No 64: 1JR3A MOLECULE: DNA POLYMERASE III SUBUNIT GAMMA;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct yqvlarkwrpqtfadvvgqehvltalanglslgrihhaylfsgtrgvgktsiarllakgl 60
DSSP lllhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ncetgitatpcgvcdncreieqgrfvdlieidaasrtkvedtrdlldnvqyapargrfkv 120
DSSP llllllllllllllhhhhhhhllllllleeeelllllllllhhhhhhhllllllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ylidevhmlsrhsfnallktleeppehvkfllattdpqklpvtilsrclqfhlkaldveq 180
DSSP eeeelhhhllhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellhhhllhhhhllleeeelllllhhh
DSSP .......................................................llhhh
Query .......................................................attee 5
ident
Sbjct irhqlehilneehiahepralqllaraaegslrdalsltdqaiasgdgqvstqavsamlg 240
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhll
DSSP hhhhhhhHHHH...........hhhHHHLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
Query qkliedvNASF...........raaMATTANVPpaDKYKTFEAAFTVSSKRNLADAV... 51
ident | |
Sbjct tldddqaLSLVeamveangervmalINEAAARG..IEWEALLVEMLGLLHRIAMVQLspa 298
DSSP lllhhhhHHHHhhhhhllhhhhhhhHHHHHHLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlll
DSSP ...............hhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...............skAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAP.EDKYEAFVLHFSEALRII 95
ident | | ||
Sbjct algndmaaielrmrelaRTIPPTDIQLYYQTLLIGRKELPYaPDRRMGVEMTLLRALAFH 358
DSSP llllhhhhlhhhhhhhhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHHLL
DSSP H.LLLLllll
Query A.GTPEvhav 104
ident
Sbjct PrMPLP..ep 366
DSSP LlLLLL..ll
No 65: 1DG3A MOLECULE: PROTEIN (INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hmtgpmclientngrlmanpealkilsaitqpmvvvaivglyrtgksylmnklagkkhtk 60
DSSP llllleeeeeeelleeeelhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhlhhhhhhhhlllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct giwmwcvphpkkpghilvlldteglgdvekgdnqndswifalavllsstfvynsigtinq 120
DSSP eeeeeeeellllllleeeeeeeellllllllllllhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qamdqlyyvtelthrirsksdsadfvsffpdfvwtlrdfsldlqpltpdeyltyslklkk 180
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhllllllhhhhhhllleeeeeeellllllllllhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gtsqkdetfnlprlcirkffpkkkcfvfdrpvheldpefvqqvadfcsyifsnsktktls 240
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ggiqvngprleslvltyvnaissgdlpcmenavlalaqiensaavqkaiahyeqqmgqkv 300
DSSP lleellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ...........................................................l
Query ...........................................................a 1
ident
Sbjct qlpteslqelldlhrdsereaievfirssfkdvdhlfqkelaaqlekkrddfckqnqeas 360
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hHLLLllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL.LHH
Query TTEEQKLIEDVNASFRAAM..aTTANvppADKYKTFEAAFTVSSKRNLADavSKAP.QLV 58
ident | | | | |
Sbjct SDRCSGLLQVIFSPLEEEVkagIYSK...PGGYRLFVQKLQDLKKKYYEE..PRKGiQAE 415
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLlLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHlllhhhHHHH...................................
Query PKLDEVYNAAYNAADhaapedKYEA................................... 83
ident | |
Sbjct EILQTYLKSKESMTD......AILQtdqtltekekeievervkaesaqasakmlhemqrk 469
DSSP HHHHHHHHHHHHHHH......HHHHhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..................................................hhhhhhhhhh
Query ..................................................fvlhfsealr 93
ident
Sbjct neqmmeqkersyqehlkqltekmendrvqllkeqertlalklqeqeqllkegfqkesrim 529
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
DSSP hhhllllllll
Query iiagtpevhav 104
ident
Sbjct kneiqdlqtkm 540
DSSP hhhhhhhhhhl
No 66: 1BBHA MOLECULE: CYTOCHROME C';
DSSP .......LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhhhhHHHHhHHHHH.hhhhhHHHH
Query .......ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadkykTFEAaFTVSS.krnlaDAVS 52
ident | | | ||
Sbjct aglspeeQIETRQAGYEFMGWNMGKIKANLEGE...ynaaQVEA.AANVIaaiansGMGA 56
DSSP llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...llhhHHHH.HHHHHhhhhllLHHH
DSSP HL.......................llhhhhhhHHHHHHHH..hhhlllHHHHHHHHHHH
Query KA.......................pqlvpkldEVYNAAYN..aadhaaPEDKYEAFVLH 87
ident | ||
Sbjct LYgpgtdknvgdvktrvkpeffqnmedvgkiarEFVGAANTlaevaatgEAEAVKTAFGD 116
DSSP HLlhhhhlllllllllllhhhlllhhhhhhhhhHHHHHHHHhhhhhlllLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLlllll
Query FSEALRIIAGTPevhav 104
ident |
Sbjct VGAACKSCHEKY..rak 131
DSSP HHHHHHHHHHHH..lll
No 67: 1AU1A MOLECULE: INTERFERON-BETA;
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..................................
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAN.................................. 25
ident | |
Sbjct mSYNLLGFLQRSSNFQCQKLLWQLNGrleyclkdrmnfdipeeikqlqqfqkedaaltiy 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlllhhhhhlllllllhhhhhlllllhhhhhhhhh
DSSP ..............lLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLH.........hhhhh
Query ..............vPPADkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSkAPQL.........vpkld 62
ident |
Sbjct emlqnifaifrqdssSTGW.nETIVENLLANVYHQINHLKT.VLEEklekedftrgklms 118
DSSP hhhhhhhhhhllllhHHLL.lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHhhllllllllllll
DSSP hhhhhhhhhhHLLL..........hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query evynaaynaaDHAA..........peDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | |
Sbjct slhlkryygrILHYlkakeyshcawtIVRVEILRNFYFINRLTGY....lrn 166
DSSP hhhhhhhhhhHHHHhhhllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lll
No 68: 2OZOA MOLECULE: TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pdpaahlpffygsisraeaeehlklagmadglfllrqclrslggyvlslvhdvrfhhfpi 60
DSSP lllllllllllllllhhhhhhhhhllllllleeeeeellllllleeeeeeelleeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct erqlngtyaiaggkahcgpaelcefysrdpdglpcnlrkpcnrpsglepqpgvfdclrda 120
DSSP eellllleeellllllllhhhhhhhhllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhh
D