DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1NLXF
MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 6;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1NLX-A 22.6 0.2 104 104 100 POLLEN ALLERGEN PHL P 6; "
2: 1C17-M 6.5 3.1 90 142 9 ATP SYNTHASE SUBUNIT C; "
3: 2J0O-A 6.3 2.8 87 284 14 INVASIN IPAD; "
4: 1NZE-A 6.1 3.5 86 112 8 OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 3; "
5: 2ODU-A 5.3 3.9 75 217 7 PLECTIN 1; "
6: 1TQG-A 5.3 3.4 84 105 6 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA; "
7: 1AUE-A 5.1 3.9 80 92 4 FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN; "
8: 2AVK-A 5.0 3.3 87 133 6 HEMERYTHRIN-LIKE DOMAIN PROTEIN DCRH; "
9: 2J9W-A 4.9 3.8 81 101 9 VPS28-PROV PROTEIN; "
10: 2J9V-A 4.9 2.8 69 99 4 VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 28; "
11: 1I1I-P 4.9 3.8 75 665 9 NEUROLYSIN; "
12: 1ORJ-A 4.8 4.1 79 126 9 FLAGELLAR PROTEIN FLIS; "
13: 2HUJ-A 4.7 3.0 77 125 13 LIN2004 PROTEIN; "
14: 1B68-A 4.7 3.5 84 138 6 APOLIPOPROTEIN E; "
15: 1I5N-A 4.6 4.1 89 128 10 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA; "
16: 1J5W-A 4.5 4.1 68 276 7 GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN; "
17: 1M0K-A 4.4 3.3 88 222 13 BACTERIORHODOPSIN; "
18: 2OT3-A 4.3 3.4 69 253 4 RAB5 GDP/GTP EXCHANGE FACTOR; "
19: 2A0U-A 4.3 3.0 83 374 7 INITIATION FACTOR 2B; "
20: 1GQA-A 4.3 4.0 85 130 7 CYTOCHROME C'; "
21: 1C03-A 4.3 3.7 87 163 9 HYPOTHETICAL PROTEIN YDL235C; "
22: 1A7D-A 4.3 3.5 73 118 7 MYOHEMERYTHRIN; "
23: 2Q4F-A 4.2 4.0 84 140 6 HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 1; "
24: 2BVL-A 4.2 8.2 77 543 4 TOXIN B; "
25: 1ISE-A 4.2 3.0 72 184 13 RIBOSOME RECYCLING FACTOR; "
26: 1DOW-A 4.2 3.0 69 205 10 ALPHA-CATENIN; "
27: 1A0B-A 4.2 3.4 78 117 10 AEROBIC RESPIRATION CONTROL SENSOR PROTEIN ARCB; "
28: 2B0H-A 4.1 3.9 86 137 8 TALIN-1; "
29: 1XWM-A 4.1 3.7 80 212 9 PHOSPHATE UPTAKE REGULATOR; "
30: 1TUJ-A 4.1 3.5 77 123 9 ODORANT BINDING PROTEIN ASP2; "
31: 2OOC-A 4.0 3.5 71 104 3 HISTIDINE PHOSPHOTRANSFERASE; "
32: 1YPY-A 4.0 3.5 86 182 8 VIRION MEMBRANE PROTEIN; "
33: 1VS5-T 4.0 3.7 67 85 9 16S RIBOSOMAL RNA; "
34: 2CMR-A 3.9 4.0 79 192 4 TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN; "
35: 2CCY-A 3.9 4.0 84 127 6 CYTOCHROME C; "
36: 2B64-T 3.9 4.3 71 99 7 16S RIBOSOMAL RNA; "
37: 1SUM-B 3.9 3.7 82 224 10 PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG "
38: 1FIO-A 3.9 3.1 69 190 9 SSO1 PROTEIN; "
39: 2D9D-A 3.8 4.1 74 89 9 BAG FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR 5; "
40: 2D4X-A 3.8 3.5 86 214 12 FLAGELLAR HOOK-ASSOCIATED PROTEIN 3; "
41: 2D4U-A 3.8 3.9 85 167 12 METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN I; "
42: 2ACX-A 3.8 3.6 71 495 7 G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE 6; "
43: 1WRD-A 3.8 3.4 68 98 7 TARGET OF MYB PROTEIN 1; "
44: 1OED-B 3.8 2.9 77 127 3 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
45: 1K9A-A 3.8 3.8 85 439 14 CARBOXYL-TERMINAL SRC KINASE; "
46: 1K04-A 3.8 3.3 71 142 6 FOCAL ADHESION KINASE 1; "
47: 2Q80-A 3.7 3.4 84 285 7 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
48: 1SJ8-A 3.7 3.5 83 297 13 TALIN 1; "
49: 1EYS-M 3.7 5.3 76 318 7 PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER; "
50: 1EQ1-A 3.7 3.2 73 166 7 APOLIPOPHORIN-III; "
51: 2J37-W 3.6 3.4 79 479 10 SRP RNA; "
52: 2J1P-A 3.6 4.0 94 276 10 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
53: 1W36-C 3.6 3.8 77 1121 4 DNA HAIRPIN; "
54: 1SXJ-B 3.6 3.2 70 316 4 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
55: 1HTJ-F 3.6 3.6 66 182 8 KIAA0380; "
56: 1DG3-A 3.6 3.5 70 540 10 PROTEIN (INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING "
57: 1BCC-C 3.6 3.7 88 379 5 UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE; "
58: 1AU1-A 3.6 3.5 76 166 7 INTERFERON-BETA; "
59: 2IAE-A 3.5 4.5 60 583 8 SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A 65 KDA "
60: 2I0M-A 3.5 3.3 82 207 1 PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU; "
61: 2EBF-X 3.5 4.8 71 711 7 DERMONECROTIC TOXIN; "
62: 2D2C-A 3.5 4.2 86 202 7 CYTOCHROME B6; "
63: 1UG7-A 3.5 3.6 71 128 4 2610208M17RIK PROTEIN; "
64: 1TD6-A 3.5 3.6 66 286 6 HYPOTHETICAL PROTEIN MG237 HOMOLOG; "
65: 1MOJ-A 3.5 4.1 76 180 9 DPS-LIKE FERRITIN; "
66: 1JR3-A 3.5 3.8 80 366 9 DNA POLYMERASE III SUBUNIT GAMMA; "
67: 2QF9-A 3.4 4.4 77 162 8 PUTATIVE SECRETED PROTEIN; "
68: 2OZO-A 3.4 3.9 84 545 11 TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70; "
69: 2J0J-A 3.4 4.0 84 611 13 FOCAL ADHESION KINASE 1; "
70: 2BG9-E 3.4 3.5 86 370 3 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
71: 256B-A 3.4 3.6 74 106 11 CYTOCHROME B562; "
72: 1Y1U-A 3.4 4.7 71 544 1 SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION "
73: 1WHU-A 3.4 3.1 62 104 6 POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE; 3'-5' RNA "
74: 1RM1-C 3.4 4.1 54 116 9 TATA-BOX BINDING PROTEIN; "
75: 1OGK-A 3.4 3.3 74 229 11 DEOXYURIDINE TRIPHOSPHATASE; "
76: 1AX8-A 3.4 3.0 68 130 1 OBESITY PROTEIN; "
77: 2D5K-A 3.3 4.0 75 148 4 DPS FAMILY PROTEIN; "
78: 2B8I-A 3.3 2.6 53 77 6 PAS FACTOR; "
79: 1X8Z-A 3.3 3.0 72 151 11 INVERTASE/PECTIN METHYLESTERASE INHIBITOR FAMILY "
80: 1SXJ-D 3.3 3.2 66 328 3 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
81: 1S05-A 3.3 3.8 77 129 18 CYTOCHROME C-556; "
82: 1EI7-A 3.3 3.1 73 158 14 COAT PROTEIN; "
83: 1B3Q-A 3.3 4.3 58 368 3 PROTEIN (CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA); "
84: 1AO6-A 3.3 4.2 73 578 10 SERUM ALBUMIN; "
85: 2IG3-A 3.2 3.1 66 127 14 GROUP III TRUNCATED HAEMOGLOBIN; "
86: 2IAK-A 3.2 2.8 60 197 5 BULLOUS PEMPHIGOID ANTIGEN 1, ISOFORM 5; "
87: 1ZRZ-A 3.2 2.7 79 312 6 PROTEIN KINASE C, IOTA; "
88: 1WA8-A 3.2 4.1 55 99 5 ESAT-6 LIKE PROTEIN ESXB; "
89: 1ST6-A 3.2 3.6 76 1049 9 VINCULIN; "
90: 1CNT-1 3.2 3.3 70 150 6 CILIARY NEUROTROPHIC FACTOR; "
91: 2PFT-A 3.1 3.3 73 519 5 EXOCYTOSIS PROTEIN; "
92: 2OSS-A 3.1 2.9 66 127 5 BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4; "
93: 2GSF-A 3.1 3.8 84 281 5 EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 3; "
94: 2G15-A 3.1 4.1 84 301 13 ACTIVATED MET ONCOGENE; "
95: 2ETN-A 3.1 8.7 61 154 5 ANTI-CLEAVAGE ANTI-GREA TRANSCRIPTION FACTOR "
96: 1XD4-A 3.1 3.6 76 824 8 SON OF SEVENLESS PROTEIN HOMOLOG 1; "
97: 1VF6-C 3.1 4.0 45 51 0 PALS1-ASSOCIATED TIGHT JUNCTION PROTEIN; "
98: 1TJU-A 3.1 3.2 65 448 12 DELTA CRYSTALLIN II; "
99: 1QZW-A 3.1 3.4 76 432 12 SIGNAL RECOGNITION 54 KDA PROTEIN; "
100: 1QSA-A 3.1 4.3 62 618 8 PROTEIN (SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE SLT70); "
101: 1BBH-A 3.1 3.2 67 131 10 CYTOCHROME C'; "
102: 2HYD-A 3.0 2.6 52 578 2 ABC TRANSPORTER HOMOLOG; "
103: 2B7M-A 3.0 3.7 65 513 8 EXOCYST COMPLEX COMPONENT EXO70; "
104: 1ZU4-A 3.0 4.0 70 305 7 FTSY; "
105: 1YLM-A 3.0 3.9 72 143 6 HYPOTHETICAL PROTEIN BSU32300; "
106: 1YEW-C 3.0 3.9 69 188 7 PARTICULATE METHANE MONOOXYGENASE, B SUBUNIT; "
107: 1XDO-A 3.0 4.5 70 687 4 POLYPHOSPHATE KINASE; "
108: 1W0B-A 3.0 3.7 72 102 4 ALPHA-HEMOGLOBIN STABILIZING PROTEIN; "
109: 1KMI-Z 3.0 9.4 57 177 12 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEY; "
110: 1CM5-A 3.0 8.8 62 759 3 PROTEIN (PYRUVATE FORMATE-LYASE); "
111: 2OEB-A 2.9 3.8 81 152 9 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
112: 2F05-A 2.9 3.9 59 85 8 PAIRED AMPHIPATHIC HELIX PROTEIN SIN3B; "
113: 2E22-A 2.9 4.1 62 752 10 XANTHAN LYASE; "
114: 1VJX-A 2.9 3.9 69 148 6 PUTATIVE FERRITIN-LIKE DIIRON-CARBOXYLATE "
115: 1UVH-A 2.9 4.0 76 157 3 STARVATION-INDUCED DNA PROTECTING PROTEIN; "
116: 1U89-A 2.9 3.2 70 139 9 TALIN 1; "
117: 1TZT-A 2.9 4.0 75 141 5 N UTILIZATION SUBSTANCE PROTEIN B HOMOLOG; "
118: 1R1R-A 2.9 3.7 66 734 6 RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R1 PROTEIN; "
119: 1OED-C 2.9 4.3 77 127 5 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
120: 1L7C-A 2.9 3.7 77 240 5 ALPHA E-CATENIN; "
121: 1CIY-A 2.9 4.3 73 577 7 CRYIA(A); "
122: 1CGM-E 2.9 3.3 75 160 12 RNA (5'-R(P*GP*AP*A)-3'); "
123: 1A7V-A 2.9 3.7 75 125 8 CYTOCHROME C'; "
124: 2IIU-A 2.8 4.0 77 208 8 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
125: 2IB0-A 2.8 5.1 66 142 6 CONSERVED HYPOTHETICAL ALANINE RICH PROTEIN; "
126: 2G8L-A 2.8 3.7 61 284 3 287AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN; "
127: 2FJC-A 2.8 3.6 68 151 4 ANTIGEN TPF1; "
128: 2DH4-A 2.8 3.3 83 326 8 YPL069C; "
129: 1YA0-A 2.8 6.3 72 458 6 SMG-7 TRANSCRIPT VARIANT 2; "
130: 1XG2-B 2.8 3.2 75 151 5 PECTINESTERASE 1; "
131: 1TJF-A 2.8 3.4 73 185 7 ADENYLYL CYCLASE-ASSOCIATED PROTEIN; "
132: 2FOR-A 2.7 3.4 66 283 8 GERANYLTRANSTRANSFERASE; "
133: 2FI7-A 2.7 4.6 67 223 3 TYPE 4 FIMBRIAL BIOGENESIS PROTEIN PILF; "
134: 2ETS-A 2.7 3.7 72 115 6 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
135: 2CLB-A 2.7 4.0 68 169 1 DPS-LIKE PROTEIN; "
136: 2C52-A 2.7 3.1 50 58 12 CREB-BINDING PROTEIN; "
137: 2BKN-A 2.7 6.9 58 190 5 HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236; "
138: 1Y6A-A 2.7 4.0 80 261 9 VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2; "
139: 1S35-A 2.7 4.5 62 211 8 SPECTRIN BETA CHAIN, ERYTHROCYTE; "
140: 1JB0-A 2.7 10.0 66 740 5 PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1; "
141: 1FVR-A 2.7 3.9 85 299 7 TYROSINE-PROTEIN KINASE TIE-2; "
142: 1E5R-A 2.7 3.3 62 260 8 PROLINE OXIDASE; "
143: 2P61-A 2.6 3.2 60 114 12 HYPOTHETICAL PROTEIN TM_1646; "
144: 2OTJ-P 2.6 8.8 46 143 4 23S RIBOSOMAL RNA; "
145: 2J28-9 2.6 3.7 76 430 12 4.5S SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RNA; "
146: 2H7O-A 2.6 2.8 54 270 4 PROTEIN KINASE YPKA; "
147: 2GSC-A 2.6 3.4 64 113 8 CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN; "
148: 2C0E-A 2.6 3.4 64 228 6 WINDBEUTEL PROTEIN; "
149: 2B7A-A 2.6 3.7 82 286 6 TYROSINE-PROTEIN KINASE JAK2; "
150: 1YO7-A 2.6 3.7 69 120 4 REGULATORY PROTEIN ROP; "
151: 1WP9-A 2.6 4.0 68 479 10 ATP-DEPENDENT RNA HELICASE, PUTATIVE; "
152: 1LUF-A 2.6 4.0 77 275 5 MUSCLE-SPECIFIC TYROSINE KINASE RECEPTOR MUSK; "
153: 1J7Q-A 2.6 3.2 60 86 5 CALCIUM VECTOR PROTEIN; "
154: 1A26-A 2.6 3.0 58 351 14 POLY (ADP-RIBOSE) POLYMERASE; "
155: 2UXH-A 2.5 4.1 55 206 9 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR; "
156: 2JAV-A 2.5 3.5 74 253 12 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2; "
157: 2J49-A 2.5 3.5 65 134 5 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR TFIID SUBUNIT 5; "
158: 2BG9-A 2.5 3.4 71 370 1 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
159: 2AZJ-A 2.5 4.3 66 276 12 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
160: 1UK5-A 2.5 3.0 58 111 14 BAG-FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR-3; "
161: 1IWP-A 2.5 3.1 65 555 15 GLYCEROL DEHYDRATASE ALPHA SUBUNIT; "
162: 1GQI-A 2.5 4.0 60 708 5 ALPHA-GLUCURONIDASE; "
163: 1FEW-A 2.5 3.8 64 173 6 SECOND MITOCHONDRIA-DERIVED ACTIVATOR OF "
164: 1CS4-A 2.5 2.9 65 189 9 TYPE V ADENYLATE CYCLASE; "
165: 1A5T-A 2.5 4.1 74 323 7 DELTA PRIME; "
166: 2PIH-A 2.4 3.3 52 123 2 PROTEIN YMCA; "
167: 2O7T-A 2.4 3.8 60 188 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
168: 2IDL-A 2.4 3.1 57 113 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
169: 2GTL-B 2.4 4.6 64 145 8 EXTRACELLULAR GLOBIN 4; "
170: 2GOX-B 2.4 4.0 54 65 7 COMPLEMENT C3; "
171: 2FB8-A 2.4 3.7 79 259 9 B-RAF PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN "
172: 2D57-A 2.4 3.4 76 224 8 AQUAPORIN-4; "
173: 2CIC-A 2.4 3.3 67 223 6 DEOXYURIDINE 5'-TRIPHOSPHATE NUCLEOTIDE "
174: 2CHL-A 2.4 3.4 80 298 5 CASEIN KINASE I ISOFORM GAMMA-3; "
175: 2C6J-A 2.4 2.9 62 265 10 DUFFY RECEPTOR, ALPHA FORM; "
176: 1ZOY-A 2.4 3.7 69 613 13 FAD-BINDING PROTEIN; "
177: 1YKE-A 2.4 4.3 49 98 6 RNA POLYMERASE II MEDIATOR COMPLEX PROTEIN MED7; "
178: 1XKK-A 2.4 3.8 80 289 6 EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR; "
179: 1TFK-B 2.4 3.1 57 86 9 COLICIN D; "
180: 1S12-A 2.4 8.8 59 94 8 HYPOTHETICAL PROTEIN TM1457; "
181: 1RJB-A 2.4 4.0 81 298 4 FL CYTOKINE RECEPTOR; "
182: 1POC-A 2.4 4.9 64 134 5 PHOSPHOLIPASE A2; "
183: 1IHG-A 2.4 4.4 65 364 5 CYCLOPHILIN 40; "
184: 1FOU-A 2.4 5.6 58 257 17 UPPER COLLAR PROTEIN; "
185: 1B71-A 2.4 5.2 67 191 9 PROTEIN (RUBRERYTHRIN); "
186: 2OF7-A 2.3 3.4 59 191 8 PUTATIVE TETR-FAMILY TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
187: 2NZ8-B 2.3 3.2 65 279 14 RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1 "
188: 2NN4-A 2.3 2.9 52 62 2 HYPOTHETICAL PROTEIN YQGQ; "
189: 2IO2-C 2.3 3.8 54 156 7 SENTRIN-SPECIFIC PROTEASE 2; "
190: 2FLT-A 2.3 3.2 56 117 9 CIS-3-CHLOROACRYLIC ACID DEHALOGENASE; "
191: 2C2J-A 2.3 4.4 75 165 8 DNA-BINDING STRESS RESPONSE PROTEIN; "
192: 2A6T-A 2.3 3.6 60 230 8 SPAC19A8.12; "
193: 1X8B-A 2.3 3.7 65 259 11 WEE1-LIKE PROTEIN KINASE; "
194: 1UX8-A 2.3 4.2 67 118 9 YJBI PROTEIN; "
195: 1UPK-A 2.3 4.6 59 318 10 MO25 PROTEIN; "
196: 1Q8K-A 2.3 3.4 56 300 4 EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 "
197: 1NG6-A 2.3 3.9 59 148 5 HYPOTHETICAL PROTEIN YQEY; "
198: 1DVK-A 2.3 3.1 62 149 3 PRP18; "
199: 1A7M-A 2.3 3.7 73 180 5 LEUKEMIA INHIBITORY FACTOR; "
200: 2QNL-A 2.2 2.7 61 162 5 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
201: 2O9D-A 2.2 3.9 75 231 5 AQUAPORIN Z; "
202: 2BS2-A 2.2 3.7 61 655 7 QUINOL-FUMARATE REDUCTASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT A; "
203: 2AVU-E 2.2 3.7 59 156 10 TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR FLHD; "
204: 2ACZ-D 2.2 4.3 65 113 2 SUCCINATE DEHYDROGENASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT; "
205: 1ZRL-A 2.2 3.1 64 583 13 ERYTHROCYTE BINDING ANTIGEN REGION II; "
206: 1YVL-A 2.2 8.5 59 652 7 SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION "
207: 1Y79-1 2.2 7.4 64 680 13 PEPTIDYL-DIPEPTIDASE DCP; "
208: 1UFA-A 2.2 3.4 65 509 8 TT1467 PROTEIN; "
209: 1U8S-A 2.2 4.0 51 171 6 GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL "
210: 1NKL-A 2.2 3.3 59 78 7 NK-LYSIN; "
211: 1M7N-A 2.2 4.2 83 299 11 INSULIN-LIKE GROWTH FACTOR I RECEPTOR; "
212: 1HUL-A 2.2 4.0 57 108 7 INTERLEUKIN-5; "
213: 1GNC-A 2.2 3.9 60 175 5 GRANULOCYTE COLONY-STIMULATING FACTOR; "
214: 1E2X-A 2.2 3.2 62 222 13 FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN; "
215: 1DLY-A 2.2 3.7 66 121 12 HEMOGLOBIN; "
216: 1BUY-A 2.2 3.0 64 166 6 PROTEIN (ERYTHROPOIETIN); "
217: 1BS2-A 2.2 3.9 68 603 6 PROTEIN (ARGINYL-TRNA SYNTHETASE); "
218: 2PNO-A 2.1 4.1 73 146 7 LEUKOTRIENE C4 SYNTHASE; "
219: 2J6Y-A 2.1 10.5 48 85 0 PHOSPHOSERINE PHOSPHATASE RSBU; "
220: 2HAK-A 2.1 3.6 77 309 9 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE MARK1; "
221: 2FHY-A 2.1 3.5 75 317 9 FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE 1; "
222: 2CRB-A 2.1 3.9 58 97 5 NUCLEAR RECEPTOR BINDING FACTOR 2; "
223: 2BZ9-A 2.1 3.7 69 429 9 STEROL 14ALPHA-DEMETHYLASE; "
224: 2A06-H 2.1 3.6 47 66 9 UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE "
225: 1YZ6-A 2.1 3.4 53 261 11 PROBABLE TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 ALPHA "
226: 1YUX-A 2.1 8.6 70 200 10 NIGERYTHRIN; "
227: 1W36-D 2.1 2.4 53 538 6 DNA HAIRPIN; "
228: 1UUR-A 2.1 7.9 59 461 7 STAT PROTEIN; "
229: 1R4T-A 2.1 3.6 61 122 5 EXOENZYME S; "
230: 1NIG-A 2.1 3.4 59 146 14 HYPOTHETICAL PROTEIN TA1238; "
231: 2P6R-A 2.0 3.7 63 683 8 AFUHEL308 HELICASE; "
232: 2OOE-A 2.0 3.8 53 528 13 CLEAVAGE STIMULATION FACTOR 77 KDA SUBUNIT; "
233: 2JNU-A 2.0 2.9 54 136 7 REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 14; "
234: 2G0I-A 2.0 3.5 59 111 7 HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.848; "
235: 2FYX-A 2.0 4.1 63 130 16 TRANSPOSASE, PUTATIVE; "
236: 2F1D-A 2.0 3.9 50 183 12 IMIDAZOLEGLYCEROL-PHOSPHATE DEHYDRATASE 1; "
237: 2E9X-D 2.0 4.4 56 197 2 DNA REPLICATION COMPLEX GINS PROTEIN PSF1; "
238: 2CZ2-A 2.0 4.4 73 211 4 MALEYLACETOACETATE ISOMERASE; "
239: 2CWL-A 2.0 4.8 81 299 6 MANGANESE-FREE PSEUDOCATALASE; "
240: 2AAL-A 2.0 2.2 49 129 16 MALONATE SEMIALDEHYDE DECARBOXYLASE; "
241: 1R8M-E 2.0 3.3 48 196 6 ARNO; "
242: 1LBV-A 2.0 3.4 69 252 7 FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATASE/INOSITOL "
243: 1FBV-A 2.0 3.5 65 388 8 SIGNAL TRANSDUCTION PROTEIN CBL; "
244: 1D2M-A 2.0 3.7 59 552 2 EXCINUCLEASE ABC SUBUNIT B; "
-
No 1: 1NLXA MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 6;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVPK 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVPK 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL
Query LDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTPEVHAV 104
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTPEVHAV 104
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL
No 2: 1C17M MOLECULE: ATP SYNTHASE SUBUNIT C;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..........hhhhhHHHHHHHHHHHH
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..........padkyKTFEAAFTVSSK 44
ident | | | |
Sbjct hgkskLIAPLALTIFVWVFLMNLMDLLPiDLLPyiaehvlglpalrvvPSADVNVTLSMA 60
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLlllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHH........hhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.............HHHH
Query RNLADA........vskAPQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE.............DKYE 82
ident | |
Sbjct LGVFILilfysikmkslLSKPVSLGLRLFGNMYAGELIfILIAgllpwwsqwilnvPWAI 120
DSSP HHHHHHhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhllllhhhhhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query AFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | |
Sbjct FHILIITLQAFIFMVLtivyls 142
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhll
No 3: 2J0OA MOLECULE: INVASIN IPAD;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hpvssltmlndtlhnirttnqalkkelsqktltktsleeialhssqismdvnksaqlldi 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................................................LHH
Query .........................................................ATT 3
ident |
Sbjct lsrheypinkdarellhsapkeaeldgdqmishrelwakiansindineqylkvyehAVS 120
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL...HHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......
Query EEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP...PADKykTFEAAFTVSSKRNLADAVSK....... 53
ident | | | |
Sbjct SYTQMYQDFSAVLSSLAGWISPGGndgNSVK..LQVNSLKKALEELKEKYKDKplypann 178
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEELLlllLLEE..ELHHHHHHHHHHHHHHHLLLeeellll
DSSP .............................lllHHHHHHHHHHHHHH...hhhlllHHHHH
Query .............................apqLVPKLDEVYNAAYN...aadhaaPEDKY 81
ident | | ||
Sbjct tvsqeqankwltelggtigkvsqknggyvvsiNMTPIDNMLKSLDNlggngevvlDNAKY 238
DSSP lllhhhhhhhhhhllllleeeeelllleeeeeLLHHHHHHHHHHHLlllllleeeLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLL.......................llllll
Query EAFVLHFSEALRIIAGT.......................pevhav 104
ident | ||
Sbjct QAWNAGFSAEDETMKNNlqtlvqkysnansifdnlvkvlsstissc 284
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 4: 1NZEA MOLECULE: OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 3;
DSSP ...lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH.hllllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..
Query ...atteeqKLIEDVNASFRAAMA.ttanvPPAD.KYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK.. 53
ident | | | |
Sbjct fylqplpptEAAQRAKVSASEILNvkqfidRKAWpSLQNDLRLRASYLRYDLKTVISAkp 60
DSSP lllllllllLHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
DSSP ...LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query ...APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPED.KYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct kdeKKSLQELTSKLFSSIDNLDHAaKIKSPtEAEKYYGQTVSNINEVLA....klg 112
DSSP hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH....lll
No 5: 2ODUA MOLECULE: PLECTIN 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct elqlrwqeyrelvllllqwmrhhtaafeerfpssfeeieilwsqflkfkemelpakeadk 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh
DSSP .........................................................LHH
Query .........................................................ATT 3
ident
Sbjct nrskgiyqslegavqagqlkvppgyhpldvekewgklhvailerekqlrseferlecLQR 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH.............llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query EEQKLIEDVNASFRAAMAT.............tanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident || | |
Sbjct IVTKLQMEAGLCEEQLNQAdallqsdvrllaagkvpQRAGEVERDLDKADSMIRLLFNDV 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHH.......LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query VSK.......APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPEDkyeafvlhfsealriiagtpevh 102
ident |
Sbjct QTLkdgrhpqGEQMYRRVYRLHKRLVAIRTEyNLRLK....................... 217
DSSP HHHhhlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHL.......................
DSSP ll
Query av 104
ident
Sbjct .. 217
DSSP ..
No 6: 1TQGA MOLECULE: CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhl
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVPpadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVska 54
ident | |
Sbjct gshmeYLGVFVDETKEYLQNLNDTLLELeKNPE....dMELINEAFRALHTLKGMAG... 53
DSSP llhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHH......hhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PQLVPKLDEVYNAAYNA......adhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct TMGFSSMAKLCHTLENIldkarnseikiTSDLLDKIFAGVDMITRMVDK....ivs 105
DSSP HHLLHHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hll
No 7: 1AUEA MOLECULE: FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHL..LLH
Query attEEQKLIEDVNASFRAAM.ATTAnvppadkykTFEAAFTVSSKRnladaVSKA..PQL 57
ident
Sbjct ...LWHEMWHEGLEEASRLYfGERN.......vkGMFEVLEPLHAM.mergPQTLkeTSF 49
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL.......hhHHHHHHHHHHHH.hhllLLLHhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL..LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query VPKLDEVYNAAYNAADHA..APED.KYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct NQAYGRDLMEAQEWCRKYmkSGNVkDLTQAWDLYYHVFRRISK....... 92
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL.......
No 8: 2AVKA MOLECULE: HEMERYTHRIN-LIKE DOMAIN PROTEIN DCRH;
DSSP .......lhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHL..llLLHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......atteeqklIEDVNASFRAAMATT..anVPPA.DKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident | || |
Sbjct dvlvkwsedlanlpsIDTQHKRLVDYINDLyraaRRRDmDKAREVFDALKNYAVEHFGYE 60
DSSP lllllllhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhHLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..
Query VSKA........pQLVPKLDEVYNAAYNAADHA..APEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT.. 98
ident |
Sbjct ERLFadyaypeatRHKEIHRRFVETVLKWEKQLaaGDPEVVMTTLRGLVDWLVNHIMKed 120
DSSP HHHHhhhllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlh
DSSP .......llllll
Query .......pevhav 104
ident
Sbjct kkyeaylrergvs 133
DSSP hhhhhhhhhllll
No 9: 2J9WA MOLECULE: VPS28-PROV PROTEIN;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLlhhHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllHH
Query .aTTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.TANVppaDKYKTfEAAFTVSSKRNLADAVskapqLV 58
ident | | | |
Sbjct hhMGNLNRCIADIVSLFITVMDKlRLEI...RAMDE.IQPDLRELMETMNRMS.....HL 51
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...LLHHH.HHHHHHHHHHHHHHLL.....LL
DSSP HHhHHHHHHHHHH........hhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PKlDEVYNAAYNA........adhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct PPdFEGREKVSQWlqklssmsasdelDDSQVRQMLFDLESAYNAFNR....flh 101
DSSP LLlLHHHHHHHHHhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhl
No 10: 2J9VA MOLECULE: VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 28;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhHL
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkykTFEA.AFTVSSKRNLADAVsKA 54
ident | |
Sbjct hhhmfNAKYVAEATGNFITVMDALKLN...........YNAKdQLHPLLAELLISIN.RV 48
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........LLLHhHHHHHHHHHHHHHH.HH
DSSP LLhhhhhHHHHHH.....hhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PQlvpklDEVYNA.....aynaadhaapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct TRddfenRSKLIDwivrinklsigdtlteTQIRELLFDLELAYKSFYA....lld 99
DSSP LLlllllHHHHHHhhhhhhhllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hll
No 11: 1I1IP MOLECULE: NEUROLYSIN;
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL...LHHH.HHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANV...PPAD.KYKTFEAAFT 40
ident | | | |
Sbjct mssytaagrnvlrwdlSPEQIKTRTEQLIAQTKQVYDTVGTIalkEVTYeNCLQVLADIE 60
DSSP llllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlhhHLLLlLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHH............LLLHHHHHHHHHHHHHHH.................
Query VSSKRNLADAVSK............APQLVPKLDEVYNAAYNA................. 71
ident | ||
Sbjct VTYIVERTMLDFPqhvssdrevraaSTEADKKLSRFDIEMSMRedvfqrivhlqetcdle 120
DSSP HHHHHHHHHHHLHhhhlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHLLhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ..................hHLLL.....................................
Query ..................aDHAA..................................... 76
ident
Sbjct kikpearryleksikmgkrNGLHlsehirneiksmkkrmselcidfnknlneddtslvfs 180
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct kaelgalpddfidslektdedkykvtlkyphyfpvmkkccvpetrrkmemafhtrckqen 240
DSSP lhhhllllhhhhhllllllllleeeellhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct tailqqllplraqvakllgynthadfvlelntakstsrvaaflddlsqklkplgeaeref 300
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct ilslkkkeceergfeydgkinawdlhyymtqteelkysvdqeslkeyfpievvtegllsi 360
DSSP hhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct yqellglsfeqvpdahvwnksvslytvkdkatgevlgqfyldlypregkynhaacfglqp 420
DSSP hhhhhleeeeellllllllllleeeeeeellllleeeeeeeellllllllllleeeeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct gcllpdgsrmmsvaalvvnfsqpvagrpsllrhdevrtyfhefghvmhqicaqtdfarfs 480
DSSP llllllllllleeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct gtnvetdfvevpsqmlenwvwdvdslrklskhykdghpitdelleklvasrlvntglltl 540
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhlllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct rqivlskvdqslhtnatldaaseyakycteilgvaatpgtnmpatfghlaggydgqyygy 600
DSSP hhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhlllllllllllllhh
DSSP .....................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .....................................pedkyeafvlhfsealriiagtp 99
ident
Sbjct lwsevfsmdmfhscfkkegimnpevgmkyrnlilkpggsldgmdmlqnflqrepnqkafl 660
DSSP hhhhhhhhhhhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhllllllhhhh
DSSP lllll
Query evhav 104
ident
Sbjct msrgl 665
DSSP hhhll
No 12: 1ORJA MOLECULE: FLAGELLAR PROTEIN FLIS;
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADkyKTFEAAFTVSSK 44
ident | | |
Sbjct rniaeayfqnmvetatPLEQIILLYDKAIECLERAIEIYDQVNELE.kRKEFVENIDRVY 59
DSSP llhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLLHH.hHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL.........llhhHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query RNLADAVSKA.........pqlvPKLDEVYNAaynaadhaapedkYEAFVLHFSEALRII 95
ident | | | |
Sbjct DIISALKSFLdhekgkeiaknldTIYTIILNT.......lvkvdkTKEELQKILEILKDL 112
DSSP HHHHHHHHLLlllllhhhhhhhhHHHHHHHHH.......hhllllLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLL.....llllll
Query AGT.....pevhav 104
ident
Sbjct REAweevkkkvhhh 126
DSSP HHHhhhhhhhhhll
No 13: 2HUJA MOLECULE: LIN2004 PROTEIN;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..hhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL
Query ...ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..padkyktfeAAFTVSSKRNLADAVSKA 54
ident | | | | || | |
Sbjct lyfQGXELLIRTEQLLLQNEKNWELYlSNREeekpfdfykdxKPFVDEAKRCADDFLELA 60
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL..........hhHHHHHHHH....hhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.l
Query PQ..........lvPKLDEVYN....aaynaadhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT.p 99
ident | |
Sbjct IPwvnterppylgeLQLRQACDnvqxtavsafngrsFYKHFLDHYQSTKYTLTRVRDFlk 120
DSSP HHhhhhhllllllhHHHHHHHHhhhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
DSSP lllll
Query evhav 104
ident
Sbjct rkees 125
DSSP hhhll
No 14: 1B68A MOLECULE: APOLIPOPROTEIN E;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhhhHHHH..HHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAMAtTANVppadkyKTFE..AAFTVSSKRNLADAVSKAPQ.. 56
ident | |
Sbjct .GQRWELALGRFWDYLRWVQT.LSEQ.....vQEELlsSQVTQELRALMDETMKELKAyk 53
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.....hHHHHllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
DSSP ......................hhHHHHHHHHHHHHH..............hhllLHHHH
Query ......................lvPKLDEVYNAAYNA..............adhaAPEDK 80
ident |
Sbjct seleeqltaeetrarlskelqaaqARLGADMEDVRGRlvqyrgevqamlgqsteeLRVRL 113
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL.llllll
Query YEAFVLHFSEALRIIAGT.pevhav 104
ident ||
Sbjct ASHLRKLRKRLLRDADDLqkrlavy 138
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhl
No 15: 1I5NA MOLECULE: CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLL
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvpPADKyKTFEAAFTVSSKRNLADAVskaPQ 56
ident | | | |
Sbjct disdFYQTFFDEADELLADXEQHLLDLV...PESPdAEQLNAIFRAAHSIKGGAG...TF 54
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HL
DSSP HHHHHHHHHHHHHH......hhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......LLLLL..
Query LVPKLDEVYNAAYN......aadhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAG......TPEVH.. 102
ident | | | | |
Sbjct GFTILQETTHLXENlldearrgexqlNTDIINLFLETKDIXQEQLDAyknseePDAASfe 114
DSSP LLHHHHHHHHHHHHhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHhh
DSSP ............ll
Query ............av 104
ident
Sbjct yicnalrqlaleak 128
DSSP hhhhhhhhhhhhhl
No 16: 1J5WA MOLECULE: GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct xylqdvixklndfwaskgclleqpydxevgagtfhpatffgslrkgpwkvayvqpsrrpt 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhllleellllllllllhhhlhhhhlhhhlllleeeeeeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct enpnrlqryfqyqviikpspensqelylesleylginlkehdirfvednwesptlgawgv 120
DSSP llllllleeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeelleehhhleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gwevwldgxeitqftyfqqiggislkdipleitygleriaxylqgvdnvyevqwnenvky 180
DSSP eeeeeelleeeeeeeeeeelllllllllleeeeeehhhhhhhhhllllhhhleeelleeh
DSSP ................lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhHHHHHHHHhHHHHHH
Query ................atTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppaDKYKTFEAaFTVSSK 44
ident | |
Sbjct gdvflenerefsvfnfeeANVGLLFRHFDEYEKEFYRL....vekNLYLPAYD.YILKCS 235
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhlLLHHHHHH.HHHHHH
DSSP HHHHHHHH.HLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query RNLADAVS.KAPQ..LVPKLDEVYNAAYNAADH.aAPEDkyeafvlhfsealriiagtpe 100
ident | | |
Sbjct HTFNLLDArGAISvsQRQTYVKRIQAXARKAARvfLEVQ..................... 274
DSSP HHHHHHHHlLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHH.....................
DSSP llll
Query vhav 104
ident
Sbjct ..an 276
DSSP ..ll
No 17: 1M0KA MOLECULE: BACTERIORHODOPSIN;
DSSP .............................lhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL...
Query .............................atteeQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP... 27
ident | | |
Sbjct tgrpewiwlalgtalmglgtlyflvkgmgvsdpdAKKFYAITTLVPAIAFTMyLSMLlgy 60
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHlll
DSSP .............hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH......................
Query .............pADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVS...................... 52
ident | || |
Sbjct gltmvpfggeqnpiYWARYADWLFTTPLLLLDLALLVDadqgtilalvgadgimigtglv 120
DSSP lleeeeelleeeeeLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ....................................hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query ....................................kAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAA 76
ident | | |
Sbjct galtkvysyrfvwwaistaamlyilyvlffgfsmrpeVASTFKVLRNVTVVLWSAYPVVW 180
DSSP hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP ..............hhHHHHHHHHHH.HHHHHHHHLlllllll
Query ..............peDKYEAFVLHF.SEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct ligsegagivplnietLLFMVLDVSAkVGFGLILLR.sraifg 222
DSSP hhlllllllllhhhhhHHHHHHHHHHhHHHHHHHHH.lhhhll
No 18: 2OT3A MOLECULE: RAB5 GDP/GTP EXCHANGE FACTOR;
DSSP ..........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..........ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvppaDKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident |
Sbjct skefieflktFHKTGQEIYKQTKLFLEGMHYKRD.....LSIEEQSECAQDFYHNVAERM 55
DSSP lhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLLL...hHHHHHHH.HHHHHHHhhlllhhHHHH........................
Query VSKAPQ...lVPKLDEV.YNAAYNAadhaapeDKYE........................ 82
ident | |
Sbjct QTRGKVpperVEKIMDQiEKYIMTR.....lyKYVFcpettddekkdlaiqkriralrwv 110
DSSP HLLLLLlhhhHHHHHHHhHHHHHHH.....hhHHHLllllllhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct tpqmlcvpvnedipevsdmvvkaitdiiemdskrvprdklacitkcskhifnaikitkne 170
DSSP lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct pasaddflptliyivlkgnpprlqsniqyitrfcnpsrlmtgedgyyftnlccavafiek 230
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .hhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query .afvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct ldaqslnlsqedfdrymsgqtsp 253
DSSP lllhhhlllhhhhhhhhllllll
No 19: 2A0UA MOLECULE: INITIATION FACTOR 2B;
DSSP ..................................................lHHHHHHHHH
Query ..................................................aTTEEQKLIE 10
ident
Sbjct xskphhatlesikytpgslrlldqrklpletvfddvltvediwsaikexrvRGAPAIAVS 60
DSSP llllllllllleeeelleeeeelllllllllleeeellhhhhhhhhhllllLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHH.hhHHHLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHHH
Query DVNASFR.aaMATTAnvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLADaVSKAPQLVPKLDEVYNAAY 69
ident | | | |
Sbjct AALGIAVatqRKAAN..gelkSGREVQTFLLTSCDFVXTS.RPTAVNLFNCLRDLKAQVD 117
DSSP HHHHHHHhhhHHHHH..llllLHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHhlllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...............................
Query NAAdhaapEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT............................... 98
ident | |
Sbjct KLD....pTKAAAEVAQAFVELAEAVYTNdvafnegixrhgaahilaaakaegrdkvsil 173
DSSP HLL....lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct ticntgalatsrygtalgvvrqlfydgklervyacetrpwnqgarltvyecvqedipctl 233
DSSP ellllllllllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllhhhhlhhhhhhhlllleee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct icdgaasslxlnrkidavvvgadricqngdtankigtynlavsakfhgvklyvaaptttl 293
DSSP elhhhhhhhhhhlllleeeellleellllleeeellhhhhhhhhhhlllleeeellhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct dvktasgnhveieerepteittnlvtkqrvvadgphlsiwnpvfditpselitggiitek 353
DSSP llllllhhhllllllllhhhhllllllllllllllleeelllleeeelhhhllleeelll
DSSP ...............llllll
Query ...............pevhav 104
ident
Sbjct gvqapaasapyydiasiiaqa 374
DSSP leellllllllllhhhhhhll
No 20: 1GQAA MOLECULE: CYTOCHROME C';
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.....lLLLHHH.hHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhh
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.....aNVPPAD.kYKTFEAAFTVSSKRnLADAvsk 53
ident | | | |
Sbjct aDAEHVVEARKGYFSLVALEFGPLaamakgEMPYDAaaAKAHASDLVTLTKYdPSDL... 57
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlLLLLLHhhHHHHHHHHHHHHHLlHHHH...
DSSP LLLH..................hhhhHHHHHHHHHH.........hhllLHHHHHHHHHH
Query APQL..................vpklDEVYNAAYNA.........adhaAPEDKYEAFVL 86
ident | |
Sbjct YAPGtsaddvkgtaakaaiwqdadgfQAKGMAFFEAvaalepaagagqkELAAAVGKVGG 117
DSSP HLLLlllllllllllllhhhhlhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHhLLLLllll
Query HFSEALRIIaGTPEvhav 104
ident
Sbjct TCKSCHDDF.RVKR.... 130
DSSP HHHHHHHHH.LLLL....
No 21: 1C03A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YDL235C;
DSSP ..........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHH
Query ..........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKT 34
ident | | | |
Sbjct stipseiinwtilneiismddddsdfSKGLIIQFIDQAQTTFAQMQRQLDGE....KNLT 56
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHHHHHHHHHH..HHLL.................
Query FEAAFTVSSKRNLADAVskapqlVPKLDEVYNAAYNA..ADHA................. 75
ident | | | |
Sbjct ELDNLGHFLKGSSAALG......LQRIAWVCERIQNLgrKMEHffpnktelvntlsdksi 110
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLL......LHHHHHHHHHHHHHhlLLLLllllhhhhhlllllhhh
DSSP .................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......lllllll
Query .................APEDKYEAFVLHFSEALRIIAG.......tpevhav 104
ident
Sbjct inginideddeeikikdENSIYLILIAKALNQSRLEFKLarielskyyntnlh 163
DSSP hllllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllll
No 22: 1A7DA MOLECULE: MYOHEMERYTHRIN;
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhhHHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkyktFEAAFTVSSK 44
ident |
Sbjct gweipepyvwdesfrvFYEQLDEEHKKIFKGIFDCIRD............NSAPNLATLV 48
DSSP lllllllllllhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............LLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLH...............HHHHHHHHHhhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHH
Query RNLADAVSKAPQL...............VPKLDEVYNaaynaadhaapedkYEAFVLHFS 89
ident | |
Sbjct KVTTNHFTHEEAMmdaakysevvphkkmHKDFLEKIG........glsapvDAKNVDYCK 100
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhhhHHHHHHHHH........hlllllLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLLL...lllll
Query EALRIIAGTP...evhav 104
ident | |
Sbjct EWLVNHIKGTdfkykgkl 118
DSSP HHHHHHHHHLhhhhllll
No 23: 2Q4FA MOLECULE: HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 1;
DSSP .......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA 21
ident |
Sbjct saaaalrdqltallssmfsqglvdeqfqqlqmlqdtpgfVSEVVTLFCDDADRIINEIAT 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhHH
Query TTAnvpPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVskapqlVPKLDEVYNAAYNAADHAapedKY 81
ident | | | |
Sbjct LLE...QPVVNFDKVDAYVHQLKGSSASVG......AQKVKFTCMQFRQFCQDK....SR 107
DSSP HHL...LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......LHHHHHHHHHHHHHHHLL....LH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHL..........lllllll
Query EAFVLHFSEALRIIAG..........tpevhav 104
ident
Sbjct DGCLMALAVVRNDFYDlrnkfqtmlqleqqiqa 140
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 24: 2BVLA MOLECULE: TOXIN B;
DSSP ...............lhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...............atteeQKLIEDVNASFRAAMAtTANVppadKYKTFEAAFTVSSKR 45
ident
Sbjct mslvnrkqlekmanvrfrtqEDEYVAILDALEEYHN.MSEN....TVVEKYLKLKDINSL 55
DSSP lllllhhhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLL....LHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH.......................
Query NLADAVSK....APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPE....................... 78
ident | |
Sbjct TDICIDTYkksgRNKALKKFKEYLVTEVLELKNNNLTpveknlhfvwiggqindtainyi 115
DSSP HHHHHHHLllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLEellleeeeelllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct nqwkdvnsdynvnvfydsnaflintlkktvvesaindtlesfrenlndprfdynkffrkr 175
DSSP hhhhhhlllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct meiiydkqknfinyykaqreenpeliiddivktylsneyskeidelntyieeslnkitqn 235
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct sgndvrnfgefkngesfnlyeqelverwnlaaasdilrisalkeiggmyldvdmlpgiqp 295
DSSP leeehhhlhhhhllllhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeelllleellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 78
ident
Sbjct dlfesiekpssvtvdfwemtkleaimkykeyipeytsehfdmldeevqssfesvlasksd 355
DSSP lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP .............HHHH...........................................
Query .............DKYE........................................... 82
ident |
Sbjct kseifsslgdmeaSPLEvkiafnskgiinqglisvkdsycsnlivkqienrykilnnsln 415
DSSP hhhlllllllleeLLLLleeeeelleeeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........................................................h
Query ...........................................................a 83
ident
Sbjct paisedndfntttntfidsimaeanadngrfmmelgkylrvgffpdvkttinlsgpeaya 475
DSSP hhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllhhhlllllllllhhhhllhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhllLLLLL........................................
Query fvlhfsealriiagtPEVHA........................................ 103
ident
Sbjct aayqdllmfkegsmnIHLIEadlrnfeisktnisqsteqemaslwsfddarakaqfeeyk 535
DSSP hhhhhhhhlllllllLLLLHhhhhhhlllhhheellllhhhlllllllhhhhhhhhhhhh
DSSP .......l
Query .......v 104
ident
Sbjct rnyfegal 543
DSSP hhhhhlll
No 25: 1ISEA MOLECULE: RIBOSOME RECYCLING FACTOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.................................
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP................................. 27
ident |
Sbjct ISDIRKDAEVRMDKCVEAFKTQISKIRtgraspslldgivveyygtptplrqlasvtved 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllllhhhhllleeeelleeeehhhleeeeeee
DSSP ...................................................HHHHHHHHH
Query ...................................................PADKYKTFE 36
ident
Sbjct srtlkinvfdrsmspavekaimasdlglnpnsagsdirvplpplteerrkdLTKIVRGEA 120
DSSP lleeeeeellhhhhhhhhhhhhlllllllleellleeeeelllllhhhhhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHH.................LLLHHHHHHHHHHHH..hhhhhllLH
Query AAFTVSSKRNLADAVSK.................APQLVPKLDEVYNAA..ynaadhaAP 77
ident | || | | || |
Sbjct EQARVAVRNVGRDANDKvkallkdkeisedddrrSQDDVQKLTDAAIKKieaaladkeAE 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhHH
DSSP HHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query EDkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct LM.......................qf 184
DSSP HH.......................hl
No 26: 1DOWA MOLECULE: ALPHA-CATENIN;
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LLLH
Query atteeqkliedvnasfraamattanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK...APQL 57
ident | | | |
Sbjct ..........................KAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESqflKEEL 34
DSSP ..........................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.........hhHHHHHHHHHHHHHHHHL..........
Query VPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE.........dkYEAFVLHFSEALRIIAG.......... 97
ident | | |
Sbjct VVAVEDVRKQGDLXKSAaGEFAddpcssvkrgnXVRAARALLSAVTRLLIladxadvykl 94
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct lvqlkvvedgilklrnagneqdlgiqykalkpevdklnixaakrqqelkdvgnrdqxaaa 154
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................lllllll
Query ............................................tpevhav 104
ident
Sbjct rgilqknvpilytasqaclqhpdvaaykanrdliykqlqqavtgisnaaqa 205
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 27: 1A0BA MOLECULE: AEROBIC RESPIRATION CONTROL SENSOR PROTEIN ARCB;
DSSP ......................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHHHHHH
Query ......................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKTFEAA 38
ident | |
Sbjct ksealldipmleqylelvgpklITDGLAVFEKMMPGYVSVLESNLTAQ....DKKGIVEE 56
DSSP lhhhhllhhhhhhhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....LHHHHHHH
DSSP HHHHHHhhhhhhhhhlllHHHHhHHHHHHHHH..hhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query FTVSSKrnladavskapqLVPKlDEVYNAAYN..aadHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIA 96
ident | | || | |
Sbjct GHKIKG.........aagSVGL.RHLQQLGQQiqspdLPAWEDNVGEWIEEMKEEWRHDV 106
DSSP HHHHHH.........hhhHLLL.HHHHHHHHHhllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL...llllll
Query GT...pevhav 104
ident
Sbjct EVlkawvakat 117
DSSP HHhhhhhhhhl
No 28: 2B0HA MOLECULE: TALIN-1;
DSSP .........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH........hllllLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .........ATTEeQKLIEDVNASFRAAMA........ttanvPPADKYKTFEAAFTVSS 43
ident |
Sbjct gidpftmgdPEGSfVDYQTTMVRTAKAIAVtvqemvtksntspEELGPLANQLTSDYGRL 60
DSSP lllllllllLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLHH.........hhHHHHHHH
Query KRNLADAVSKA.....PQLVPKLDEVYNAAYNAADH..AAPE.........dkYEAFVLH 87
ident | | | |
Sbjct ASQAKPAAVAAeneeiGAHIKHRVQELGHGCSALVTkaGALQcspsdvytkkeLIECARR 120
DSSP HHHHHHHHLLLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHhllllhhhhhhHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhhllllllll
Query FSEALRIiagtpevhav 104
ident ||
Sbjct VSEKVSHvlaalqagnr 137
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhll
No 29: 1XWMA MOLECULE: PHOSPHATE UPTAKE REGULATOR;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL.hhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHL
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP.padkyktfeaafTVSSKRNLADAVSKA 54
ident | | |
Sbjct tfadDLASLHNKLIEMGRLTEVALQQAiEAFQtqnanlamavidgDGSIDALEEEVNDFA 60
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllhhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP .................LLHHHHHHH................hhhhhhhhhhllLHHHHH
Query .................PQLVPKLDE................vynaaynaadhaAPEDKY 81
ident |
Sbjct lwliaaqqpvatdlrriVAAIKIASDieriadfavniakaciriggqpfvmdigPLVLMY 120
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLL....................................
Query EAFVLHFSEALRIIAGTPE.VHAV.................................... 104
ident | | |
Sbjct RLATDMVSTAIAAYDREDAsLAAQiadmdhrvdeqygemmasllavaktdaatlaqmnvl 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLLLlHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh
DSSP ................................
Query ................................ 104
ident
Sbjct alvaryiertadhatniaehlvylvkgkhydf 212
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
No 30: 1TUJA MOLECULE: ODORANT BINDING PROTEIN ASP2;
DSSP lhhHHHHHHHHHHH.hhhhhhHHLLLLL.....................hhhHHHHHHHH
Query attEEQKLIEDVNA.sfraamATTANVP.....................padKYKTFEAA 38
ident | |
Sbjct ...IDQDTVVAKYMeylmpdiMPCADELhisediatniqaakngadmsqlgcLKACVMKR 57
DSSP ...LLHHHHHHHHHhllhhhhHHHHHHHlllllllllllllllllllllhhhHLLHHHHH
DSSP .........hhhHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH.HHHHHHHHHH
Query .........ftvSSKRNLADaVSKAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPE.DKYEAFVLHF 88
ident | | |
Sbjct iemlkgtelyvePVYKMIEVvHAGNADDIQLVKGIANECIENAKGETDEcNIGNKYTDCY 117
DSSP llleelleellhHHHHHHHHhLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHhHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHhhhllllllll
Query SEALRiiagtpevhav 104
ident | |
Sbjct IEKLF..........s 123
DSSP HHHLL..........l
No 31: 2OOCA MOLECULE: HISTIDINE PHOSPHOTRANSFERASE;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPpaDKYKTFEAAFTVSSKrn 46
ident |
Sbjct gavdfaylegfaagDFAVVDEVLALFREQAALWAPXLDPTH..PGWKDAVHTVKGAAR.. 56
DSSP llllhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHH..
DSSP hhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHHH...hhhllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL.lll
Query ladavskapqlvpkldevYNAAYN...aadhaAPED.KYEAFVLHFSEALRIIAGT.pev 101
ident |
Sbjct ...............gvgAFNLGEvcerceagQESLeGVRTALDAALLDIAAYAHEqalr 101
DSSP ...............hhlLHHHHHhhhhhhllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhh
DSSP lll
Query hav 104
ident
Sbjct slk 104
DSSP hhl
No 32: 1YPYA MOLECULE: VIRION MEMBRANE PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL..........................lllhhHHHH
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAM.ATTA..........................nvppaDKYK 33
ident |
Sbjct .AASIQTTVNTLSERISSKLeQEANasaqtkcdieignfyirqnhgcnltvknmcsADAD 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLllllllllleeeeeeeeeeeleeeeeeelllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHH...............hhhHHHHHHHHHHHL..LL
Query TFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVP...............kldEVYNAAYNAADH..AA 76
ident | || |
Sbjct AQLDAVLSAATETYSGLTPEQKAYVPamftaalniqtsvntvvrDFENYVKQTCNSsaVV 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHLLHHhhhhhhhllllllllhhhHHHHHHHHHLLLhhHH
DSSP HH..........................hhHHHHHHhHHHHHHHHHLL..........ll
Query PE..........................dkYEAFVLhFSEALRIIAGT..........pe 100
ident ||
Sbjct DNklkiqnviidecygapgsptnlefintgSSKGNC.AIKALMQLTTKattqiapkqvag 178
DSSP LLllleeeeeeeeeelllllleeeeeeellLHHHHH.HHHHHHHHHHHhhhhhllleell
DSSP llll
Query vhav 104
ident
Sbjct tgvq 182
DSSP eell
No 33: 1VS5T MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvppadKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident | | ||
Sbjct niksakkraiqsekARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIE....agDKAAAQKAFNEMQPIV 56
DSSP llllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....llLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query LADAVSKApqLVPKLDEVYNAAYNAADHAapedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident | |
Sbjct DRQAAKGL.iHKNKAARHKANLTAQINKL............................a 85
DSSP LLHHHLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHLL............................l
No 34: 2CMRA MOLECULE: TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH................llllLHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT................tanvPPADKYKTFEAAFTVS 42
ident |
Sbjct mqLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQHLlqltvwgikqlqarilatwmEWDREINNYTSLIHSL 60
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH...........
Query SKRNLADAVSK............APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE........... 78
ident | |
Sbjct IEESQNQQEKNeqellgqllsgiVQQQNNLLRAIEAQQHLLQLTvWGIKqlqarilwmew 120
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhlllhhh
DSSP .........................hhhhhhhhhhhhhhhHHHLL...............
Query .........................dkyeafvlhfsealrIIAGT............... 98
ident
Sbjct dreinnytslihslieesqnqqekneqelleggqllsgivQQQNNllraieaqqhllqlt 180
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ......llllll
Query ......pevhav 104
ident
Sbjct vwgikqlqaril 192
DSSP hhhhhhhhhhhl
No 35: 2CCYA MOLECULE: CYTOCHROME C;
DSSP ..lhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHH.....llLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.
Query ..atteeqkliEDVNASFRAAMAT.....taNVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVS. 52
ident |
Sbjct qskpedllklrQGLMQTLKSQWVPiagfaagKADLPADAAQRAENMAMVAKLAPIGWAKg 60
DSSP lllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHhhhhhllLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl
DSSP ................hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHH.llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ................kAPQLVPKLDEVYNAAYNAAD.haAPEDKYEAFVLHFSEALRII 95
ident | | | |
Sbjct tealpngetkpeafgskSAEFLEGWKALATESTKLAAaakAGPDALKAQAAATGKVCKAC 120
DSSP llllllllllhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLllllll
Query AGTpevhav 104
ident
Sbjct HEE..fkqd 127
DSSP HHH..hlll
No 36: 2B64T MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHHHHHHhHHHHHHHH
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadKYKTFEAaFTVSSKRN 46
ident | |
Sbjct rnlsalkrhrqslkRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQL....aqegKAEEALK.IMRKAESL 55
DSSP llllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhhlLHHHHHH.HHHHHHHH
DSSP HHHHHH..HLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query LADAVS..KAPQ.LVPKLDEVYNAAYNAADHAApeDKYEafvlhfsealriiagtpevha 103
ident | ||
Sbjct IDKAAKgsTLHKnAAARRKSRLMRKVRQLLEAA..GAPL...............igggls 98
DSSP HHHHLLllLLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLL...............llllll
DSSP l
Query v 104
ident
Sbjct a 99
DSSP l
No 37: 1SUMB MOLECULE: PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.TANVPpadkyktfEAAFTVSSKRNLADAVS 52
ident | |
Sbjct nrllnekVEEFKKGVLKAGWFIEKMFRNSiSSLVErneslareVIADEEVVDQMEVEIQE 60
DSSP lllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HL.................lLHHHHHHH................hhhhhhhhhhllLHHH
Query KA.................pQLVPKLDE................vynaaynaadhaAPED 79
ident ||
Sbjct KAmevlglfspigkplltvtAGIRVAELieniadkchdiaknvlelmeepplkpleDIPA 120
DSSP HHhhhhhhhllllhhhhhhhHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLL..................................
Query KYEAFVLHFSEALRIIAGTP..EVHA.................................. 103
ident ||| |
Sbjct MANQTSEMLKFALRMFADVNveKSFEvcrmdskvddlyekvreelllymmespkyvkral 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
DSSP ...........................................l
Query ...........................................v 104
ident
Sbjct llleiagnieiiadyatnivevsvymvqgeaykcyhdelllfkk 224
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 38: 1FIOA MOLECULE: SSO1 PROTEIN;
DSSP ......LHHHHHHHHHHHHHHHHH.............hhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHH
Query ......ATTEEQKLIEDVNASFRA.............amattanVPPADKYKTFEAAFTV 41
ident | | | |
Sbjct mhdfvgFMNKISQINRDLDKYDHTinqvdslhkrlltevneeqaSHLRHSLDNFVAQATD 60
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHH.............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL............
Query SSKRNLADAVSK.............APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAA............ 76
ident | |
Sbjct LQFKLKNEIKSAqrdgihdtnkqaqAENSRQRFLKLIQDYRIVDSNYKeenkeqakrqym 120
DSSP HHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................................hhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..........................................pedkyeafvlhfsealri 94
ident
Sbjct iiqpeatedeveaaisdvggqqifsqalleaktalaevqarhqellkleksmaeltqlfn 180
DSSP hhlllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhllllllll
Query iagtpevhav 104
ident
Sbjct dmeelvieqq 190
DSSP hhhlllllll
No 39: 2D9DA MOLECULE: BAG FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR 5;
DSSP ...lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHH...
Query ...atTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPP.ADKYKTFEAAFTVSSKrNLADAVSK... 53
ident || | | | |
Sbjct gssgsSGSILKIEKVLKRMREIKNELLQAQNpSELYLSSKTELQGLIG.QLDEVSLEknp 59
DSSP lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlLLHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHLLLllh
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query .APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident |
Sbjct cIREARRRAVIEVQTLITYIDLKES......................gpssg 89
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......................lllll
No 40: 2D4XA MOLECULE: FLAGELLAR HOOK-ASSOCIATED PROTEIN 3;
DSSP ..........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hllLLLHhHHHH
Query ..........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA.ttaNVPPaDKYK 33
ident |
Sbjct vvlsqaqaqnsqyalartfatqkvslEESVLSQVTTAIQTAQEKIVYagngTLSD.DDRA 59
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLLH.HHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................................
Query TFEAAFTVSSKRNLADAVS......................................... 52
ident | |
Sbjct SLATDLQGIRDQLMNLANStdgngryifagykteaapfdqatggyhggeksvtqqvdsar 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllllllllllllllllleeeelllll
DSSP ......hllLHHH.................hHHHHHHHHHHH.....hhllLHHHHHHHH
Query ......kapQLVP.................kLDEVYNAAYNA.....adhaAPEDKYEAF 84
ident | | | | | |
Sbjct tmvightgaQIFNsitsnavpepdgsdseknLFVMLDTAIAAlktpvegnnVEKEKAAAA 179
DSSP eeeelllhhHHHLllllllllllllllllllHHHHHHHHHHHhlllllllhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLL...............llllll
Query VLHFSEALRIIAGT...............pevhav 104
ident |
Sbjct IDKTNRGLKNSLNNvltvraelgtqlselstldsl 214
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 41: 2D4UA MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN I;
DSSP ........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..............
Query ........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.............. 22
ident | |
Sbjct gplgsgglffnalknckenftvlqTIRQQQSTLNGSWVALLQTRNTlnragirymmdqnn 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhll
DSSP .llLLLHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHH..........lllHHHHHHHHHHHHHHH
Query .taNVPPADKYKTFEAAFTvSSKRNLADAVSK..........apqLVPKLDEVYNAAYNA 71
ident | | || | ||
Sbjct igsGSTVAELMESASISLK.QAEKNWADYEALprdprqstaaaaeIKRNYDIYHNALAEL 119
DSSP lllLLLHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLL.LHHHhhhhhhHHHHHHHHHHHL...............lllllll
Query ADHA.APEDkyeafvLHFSEALRIIAG...............tpevhav 104
ident |
Sbjct IQLLgAGKI.neffdQPTQGYQDGFEKqyvaymeqndrlhdiavsdnna 167
DSSP HHHHhHLLH.hhhhhLLHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 42: 2ACXA MOLECULE: G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE 6;
DSSP ...................................................lhhHHHHHH
Query ...................................................attEEQKLI 9
ident |
Sbjct karkgkskkwrqmlqfphisqceelrlslerdyhslcernpigrllfrefcatrPELSRC 60
DSSP lllllllllhhhhllllllhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHL...lLHHHHHHHHHH
Query EDVNASFRAAMATtanvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLAdaVSKA...pQLVPKLDEVYN 66
ident | | |
Sbjct VAFLDGVAEYEVT........PDDKRKACGRNLTQNFLS.hTGPDlipeVPRQLVTNCTQ 111
DSSP HHHHHHHHHHHLL........LLLLHHHHHHHHHHHHLL.lLLLLllllLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHhhlllhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHLL............................
Query AAYNAadhaapedkyeaFVLHfSEALRIIAGT............................ 98
ident |
Sbjct RLEQG...........pCKDL.FQELTRLTHEylsvapfadyldsiyfnrflqwkwlerq 159
DSSP HHHHL...........lLLLL.LHHHHHHHHHhhllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct pvtkntfrqyrvlgkggfgevcacqvratgkmyackklekkrikkrkgeamalnekqile 219
DSSP lllhhheeeeeeeeeelleeeeeeeellllleeeeeeeehhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct kvnsrfvvslayayetkdalclvltlmnggdlkfhiyhmgqagfpearavfyaaeiccgl 279
DSSP hlllllllleeeeeellleeeeeelllllllhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct edlhrerivyrdlkpenillddhghirisdlglavhvpegqtikgrvgtvgymapevvkn 339
DSSP hhhhhlleelllllhhheeellllleeelllllleelllllleelllllhhhllhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct erytfspdwwalgcllyemiagqspfqqrkkkikreeverlvkevpeeyserfspqarsl 399
DSSP leellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct csqllckdpaerlgcrggsarevkehplfkklnfkrlgagmleppfkpdpqaiyceptdq 459
DSSP hhhhllllhhhlllllllhhhhhhllhhhllllhhhhhllllllllllllllllllhhhh
DSSP ..............................llllll
Query ..............................pevhav 104
ident
Sbjct dfyqkfatgsvpipwqnemvetecfqelnvfgldgs 495
DSSP hhhhhhlleelhhhhhhhhhhllhhhhhhlllllll
No 43: 1WRDA MOLECULE: TARGET OF MYB PROTEIN 1;
DSSP ....LHHHhHHHHHHHHHHHHH..........hhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ....ATTEeQKLIEDVNASFRA..........amattanVPPADKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident || |
Sbjct gplgSEQI.GKLRSELEMVSGNvrvmsemltelvptqaePADLELLQELNRTCRAMQQRV 59
DSSP llllLLLH.HHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query LADAVSK....APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAApedkyeafvlhfsealriiagtpevh 102
ident | |
Sbjct LELIPQIaneqLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFE.......................rfr 96
DSSP HHHHHHLllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......................hhh
DSSP ll
Query av 104
ident
Sbjct tg 98
DSSP ll
No 44: 1OEDB MOLECULE: ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
Query ...ATTEEQKLIEDVNASFRAA.MATTAnvppadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK... 53
ident
Sbjct plfYIVYTIIPCILISILAILVfYLPPD.......aGEKMSLSISALLAVTVFLLLLadk 53
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHH.......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
DSSP ..............llLHHHHHHHHHHH.hhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..............apQLVPKLDEVYNA.aynaadhaapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGT 98
ident | |
Sbjct vpetslsvpiiirylmFIMILVAFSVILsvvvlnlhhrsaMVADRLFLYVFFVICSIGTF 113
DSSP hhhhhhhlllllllhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP ........llllll
Query ........pevhav 104
ident
Sbjct sifldashnvppdn 127
DSSP hhhhhhhhhlllll
No 45: 1K9AA MOLECULE: CARBOXYL-TERMINAL SRC KINASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aswpsgteciakynfhgtaeqdlpfckgdvltivavtkdpnwykaknkvgregiipanyv 60
DSSP llllllleeeelllllllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllleeeeehhhe
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qkregvkagtklslmpwfhgkitreqaerllyppetglflvrestnypgdytlcvscegk 120
DSSP eellllllllleellllllllllhhhhhhhllllllleeeeeellllllleeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vehyrimyhasklsideevyfenlmqlvehyttdadglctrlikpkvmegtvaaqdefyr 180
DSSP eeeeeeeeelleeelllllllllhhhhhhhhhhlllllllllleelllllleehhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sgwalnmkelkllqtigkgefgdvmlgdyrgnkvavkcikndataqaflaeasvmtqlrh 240
DSSP llllllhhheeeeeeeeellleeeeeeeelleeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhllll
DSSP ......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT 22
ident | |
Sbjct snlvqllgviveekgglyivteymakgslvdylrsrgrSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYL 300
DSSP llllleeeeeellllleeeeeellllllhhhhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL............................LLLHH................HHHHHHHHH
Query TA............................NVPPA................DKYKTFEAA 38
ident |
Sbjct EGnnfvhrdlaarnvlvsednvakvsdfglTKEASklpvkwtapealrekkFSTKSDVWS 360
DSSP HHlleelllllhhheeellllleeelllllLEELLllllllllhhhhhlllLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH.....................hhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLh
Query FTVSSKRNLAD.....................avskaPQLVPKLDEVYNAAYNaaDHAAp 77
ident | | | ||
Sbjct FGILLWEIYSFgrvpypriplkdvvprvekgykmdapDGCPPAVYDVMKNCWH..LDAA. 417
DSSP HHHHHHHHHLLllllllllllllhhhhhhllllllllLLLLHHHHHHHHHHLL..LLHH.
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query edkyeAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | | | |
Sbjct ...trPTFLQLREQLEHIRTH..elhl 439
DSSP ...hlLLHHHHHHHHHHHHHL..llll
No 46: 1K04A MOLECULE: FOCAL ADHESION KINASE 1;
DSSP ............lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ............atteeqkliedvnasfraamattaNVPPADKyKTFEAAFTVSSKRNLA 48
ident || ||
Sbjct eisppptanldrsndkvyenvtglvkaviemsskiqPAPPEEY.VPMVKEVGLALRTLLA 59
DSSP lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH............HHHHHHHHH
Query DAVSKA........pQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE............DKYEAFVLH 87
ident
Sbjct TVDETIpllpasthrEIEMAQKLLNSDLGELINKmKLAQqyvmtslqqeykKQMLTAAHA 119
DSSP HHHHHHhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllllhhhhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL......lllllll
Query FSEALRIIAG......tpevhav 104
ident
Sbjct LAVDAKNLLDvidqarlkmlgqt 142
DSSP HHHHHHHHHHhhhhhhhhhllll
No 47: 2Q80A MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
DSSP .......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA 21
ident |
Sbjct etvqrillepykyllqlpgkqvrtklsqafnhwlkvpedKLQIIIEVTEMLHNASLLIDD 60
DSSP llhhhhhlhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP H.LLLLL........hhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL..HHHHHHHHHHHHHH
Query T.TANVP........padkyktfEAAFTVSSKRNLADAVsKAPQ..LVPKLDEVYNAAYN 70
ident | |
Sbjct IeDNSKLrrgfpvahsiygipsvINSANYVYFLGLEKVL.TLDHpdAVKLFTRQLLELHQ 119
DSSP HhHLLLEelleelhhhhhlhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLllHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHH.lLLHH........hhhhhhhHHHHHHHHHHHL.............llLLLL.....
Query AAD.hAAPE........dkyeafvLHFSEALRIIAG.............tpEVHA..... 103
ident | | |
Sbjct GQGldIYWRdnytcpteeeykamvLQKTGGLFGLAVglmqlfsdykedlkpLLNTlglff 179
DSSP HHHhhHHHHhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllllhhHHHHhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 103
ident
Sbjct qirddyanlhsksfcedltegkfsfptihaiwsrpestqvqnilrqrtenidikkycvhy 239
DSSP hhhhhhhhhhlllllhhhhhllllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhh
DSSP .............................................l
Query .............................................v 104
ident
Sbjct ledvgsfeytrntlkeleakaykqidarggnpelvalvkhlskmfk 285
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllll
No 48: 1SJ8A MOLECULE: TALIN 1;
DSSP ..............................................lhhhhhHHHHHHHH
Query ..............................................atteeqKLIEDVNA 14
ident
Sbjct ppltsaqqaltgtinssmqavqaaqatlddfetlpplgqdaaskawrknkmdESKHEIHS 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhlhhhhhhhHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH..............hlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH......L
Query SFRAAMA..............ttanVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK......A 54
ident | | | | | |
Sbjct QVDAITAgtasvvnltagdpaetdyTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLedeggnG 120
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllL
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLH.....hhhhHHHHHHHHHHHHHHHL............
Query PQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAP.....edkyEAFVLHFSEALRIIAG............ 97
ident | | | | |
Sbjct RPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPasaeprqnlLQAAGNVGQASGELLQqigesdtdphfq 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct dvlmqlanavasaaaalvlkaksvaqrtedsglqtqviaaatqcalstsqlvactkvvap 240
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ..................................................lllllll
Query ..................................................tpevhav 104
ident
Sbjct tisspvcqeqlveagrlvakavegcvsasqaatedgqllrgvgaaatavtqalnell 297
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 49: 1EYSM MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER;
DSSP ...............................................lhhhhhhHHHHHH
Query ...............................................atteeqkLIEDVN 13
ident
Sbjct peyqniftavqvrapaypgvplpkgnlprigrpifsywlgkigdaqigpiylglTGTLSI 60
DSSP llllllllllleelllllllllllllllllllllllllhhhhlllllllllllhHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLL...................................lhhHHHHHHHHH
Query ASFRAAMATTANV...................................ppaDKYKTFEAA 38
ident |
Sbjct FFGLVAISIIGFNmlasvhwdvfqflkhffwlgleppppqyglripplsegGWWLIAGLF 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhhlllllhhhhhhhhhhlllllllhhhllllllhhhlHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL....LHHHHHH.....
Query FTVSSKRNLADAVSKA......PQLVPKLDEVYNAAYNA.ADHA....APEDKYE..... 82
ident | | | |
Sbjct LTLSILLWWVRTYKRAealgmsQHLSWAFAAAIFFYLVLgFIRPvmmgSWAKAVPfgifp 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHhhhlLHHHLLLllllh
DSSP .....hhhhhhhhhhhhhhllLLLL...................................
Query .....afvlhfsealriiagtPEVH................................... 102
ident
Sbjct hldwtaafsirygnlyynpfhMLSIaflygsallfamhgatilsvsrfggdreidqithr 240
DSSP hhhhhhhhhhhlllhhhlhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 102
ident
Sbjct gtaaegaalfwrwtmgfnatmesihrwawwcavltvitagigillsgtvvdnwylwavkh 300
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhl
DSSP ................ll
Query ................av 104
ident
Sbjct gmapaypevvtavnpyet 318
DSSP llllllllllllllllll
No 50: 1EQ1A MOLECULE: APOLIPOPHORIN-III;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dapaggnafeemekhakefqktfseqfnslvnskntqdfnkalkdgsdsvlqqlsafsss 60
DSSP llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.........lLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........ATTEeQKLIEDVNASFRAAMATTAN.........vPPADKYKTFEAAFTVSS 43
ident | || |
Sbjct lqgaisdaNGKA.KEALEQARQNVEKTAEELRKahpdvekeanAFKDKLQAAVQTTVQES 119
DSSP hhhhhlllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH.......hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KRNLADAVS.......kAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAApedkyeafvlhfsealriia 96
ident |
Sbjct QKLAKEVASnmeetnkkLAPKIKQAYDDFVKHAEEVQKKL.................... 159
DSSP HHHHHHHHLllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....................
DSSP llllllll
Query gtpevhav 104
ident
Sbjct .heaatkq 166
DSSP .hhhllll
No 51: 2J37W MOLECULE: SRP RNA;
DSSP lhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHLLLlLHHHHhHHHHHHH.HHHHHHHHhhhhhhLLLHHH
Query atteeqkliedvnASFRAAMATTANvPPADKyKTFEAAF.TVSSKRNLadavskAPQLVP 59
ident | | | |
Sbjct .............RKITSALRSLSN.ATIIN.EEVLNAMlKEVCTALL....eaDVNIKL 41
DSSP .............LLLLLLLLLLLL.LLLLL.HHHHHHHhHHHHHHHL....llLLLLLL
DSSP hHHHHHHHHHHHHHLLL...hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.................
Query kLDEVYNAAYNAADHAA...peDKYEAFVLHFSEALRIIAGTP................. 99
ident | | | |
Sbjct .VKQLRENVKSAIDLEEmasglNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGvkawtptkgnvimfvgl 100
DSSP .LHHHHHHHHHHHLLLLlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllleeeeeell
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct qgsgktttcsklayyyqrkgwktclicadtfragafdqlkqnatkaripfygsytemdpv 160
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhllleeellllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct iiasegvekfknenfeiiivdtsgrhkqedslfeemlqvanaiqpdnivyvmdasigqac 220
DSSP hhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllh
DSSP ........................................................LLLL
Query ........................................................EVHA 103
ident
Sbjct eaqakafkdkvdvasvivtkldghakgggalsavaatkspiifigtgehiddfepfKTQP 280
DSSP hhhhhhhhhhhlllleeeelllllllllhhhhhhhhhllleeeeellllllleellLHHH
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 103
ident
Sbjct fiskllgmgdieglidkvnelklddnealieklkhgqftlrdmyeqfqnimkmgpfsqil 340
DSSP hhhlllllllllllhhhhllllllllllllllllllhhhhlllhhhhhhlllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 103
ident
Sbjct gmipgfgtdfmskgneqesmarlkklmtimdsmndqeldstdgakvfskqpgriqrvarg 400
DSSP llllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhhhhllhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 103
ident
Sbjct sgvstrdvqelltqytkfaqmvkkmggikglfkggdmsknvsqsqmaklnqqmakmmdpr 460
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhlllllllhhhh
DSSP ..................l
Query ..................v 104
ident
Sbjct vlhhmggmaglqsmmrqfq 479
DSSP hhhhhhllllllhhhhhhl
No 52: 2J1PA MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
DSSP ........................................................LHHH
Query ........................................................ATTE 4
ident
Sbjct pisyiirkadsvnkaldsavplreplkiheaxrysllaggkrvrpvlciaacelvgGEES 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLHH.................hhhHHHHHHHHHHH.HH
Query EQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVPPA.................dkyKTFEAAFTVSS.KR 45
ident |
Sbjct LAXPAACAVEXIHTXSLIHdDLPCXDnddlrrgkptnhkvygedvaVLAGDALLSFAfEH 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLllleelleelhhhhhlhhhhHHHHHHHHHHHhHH
DSSP HHHHHHH.HLLL.HHHHHHHHHHHHH..HHHHL.LLHH.............hhhhhHHHH
Query NLADAVS.KAPQ.LVPKLDEVYNAAY..NAADH.AAPE.............dkyeaFVLH 87
ident | | | | |
Sbjct LASATSSeVSPArVVRAVGELAKAIGteGLVAGqVVDIsldlnnvglehlkfihlhKTAA 180
DSSP HHHHLLLlLLHHhHHHHHHHHHHHHLllLHHHHhHHLLlllhhhhhhhhhhhhhhhHLHH
DSSP HHHHHHHHHL..........lLLLLL..................................
Query FSEALRIIAG..........tPEVHA.................................. 103
ident || |
Sbjct LLEASAVLGGiigggsdeeieRLRKFarcigllfqvvddildvtkkltypklxgleksre 240
DSSP HHHHHHHHHHhhllllhhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ...................................l
Query ...................................v 104
ident
Sbjct faeklnteardqllgfdsdkvapllalanyianrqn 276
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhlll
No 53: 1W36C MOLECULE: DNA HAIRPIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mlrvyhsnrldvlealmefivererlddpfepemilvqstgmaqwlqmtlsqkfgiaani 60
DSSP leeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleelllhhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dfplpasfiwdmfvrvlpeipkesafnkqsmswklmtllpqlleredftllrhyltddsd 120
DSSP llllhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct krklfqlsskaadlfdqylvyrpdwlaqwetghlveglgeaqawqaplwkalveythqlg 180
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qprwhranlyqrfietlesattcppglpsrvficgisalppvylqalqalgkhieihllf 240
DSSP lllllllllhhhhhhhhhllllllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tnpcryywgdikdpaylaklltrqrrhsfedrelplfrdsenagqlfnsdgeqdvgnpll 300
DSSP ellllllllllllhhhhllllllleellllllllllllhhhhlllllllllllllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aswgklgrdyiyllsdlessqeldafvdvtpdnllhniqsdilelenravagvnieefsr 360
DSSP hhhlhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sdnkrpldpldssitfhvchspqrevevlhdrllamleedptltprdiivmvadidsysp 420
DSSP lllleelllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhheeeeellhhhhhh
DSSP ......................lhhhhHHHHHHHHHHHHH....................
Query ......................atteeQKLIEDVNASFRA.................... 18
ident |
Sbjct fiqavfgsapadrylpyaisdrrarqsHPVLEAFISLLSLpdsrfvsedvlalldvpvla 480
DSSP hhhhhlllllllllllleelleelhhhLHHHHHHHHHLLHhhllllhhhhhhhlllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 18
ident
Sbjct arfditeeglrylrqwvnesgirwgidddnvrelelpatgqhtwrfgltrmllgyamesa 540
DSSP hhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ............................hhhhlllllhhHHHH..hhhHHHHHHHHHHHH
Query ............................amattanvppaDKYK..tfeAAFTVSSKRNLA 48
ident
Sbjct qgewqsvlpydessgliaelvghlasllmqlniwrrglaQERPleewlPVCRDMLNAFFL 600
DSSP lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLEEhhhhlLHHHHHHHHHLL
DSSP HhHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLHHHhHHHHHHHHHHHHHHhHLLL.......
Query DaVSKAPQLVPKLDEVYNAAYNAADH..AAPEDkYEAFVLHFSEALRIiAGTP....... 99
ident | |
Sbjct P.DAETEAAMTLIEQQWQAIIAEGLGaqYGDAVpLSLLRDELAQRLDQ.ERISqrflagp 658
DSSP L.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLEElHHHHHHHHHHHHHH.LEELlllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct vnictlmpmrsipfkvvcllgmndgvyprqlaplgfdlmsqkpkrgdrsrrdddrylfle 718
DSSP leeellllllllleeeeeeelllllllllllllllllhhhhllllllllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct alisaqqklyisyigrsiqdnserfpsvlvqelidyigqshylpgdealncdesearvka 778
DSSP hhhheeeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhlleellllllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct hltclhtrmpfdpqnyqpgerqsyarewlpaasqagkahsefvqplpftlpetvpletlq 838
DSSP hhllllllllllhhhllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllleehhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct rfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipdtepfileglsryqinqqllnalveqddaerlf 898
DSSP hhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct rrfraagdlpygafgeifwetqcqemqqladrviacrqpgqsmeidlacngvqitgwlpq 958
DSSP hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleeeeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct vqpdgllrwrpsllsvaqgmqlwlehlvycasggngesrlflrkdgewrfpplaaeqalh 1018
DSSP ellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhleeeellllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct ylsqliegyregmsapllvlpesggawlktcydaqndamldddstlqkartkflqayegn 1078
DSSP hhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhheelhhheelllhhhhhhhhhhhhhhhlll
DSSP ......................................lllll
Query ......................................evhav 104
ident
Sbjct mmvrgegddiwyqrlwrqltpetmeaiveqsqrfllplfrfnq 1121
DSSP lllllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 54: 1SXJB MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lqlpwvekyrpqvlsdivgnketidrlqqiakdgnmphmiisgmpgigkttsvhclahel 60
DSSP llllhhhhlllllhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lgrsyadgvlelnasddrgidvvrnqikhfaqkklhlppgkhkivildeadsmtagaqqa 120
DSSP hhhhhhhheeeelllllllhhhhhlhhhhhhhlllllllllleeeeeelhhhllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lrrtmelysnstrfafacnqsnkiieplqsqcailrysklsdedvlkrllqiikledvky 180
DSSP lhhhhhhlllleeeeeeellhhhllhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ..........................................lhhhhhhhhHHHHH....
Query ..........................................atteeqkliEDVNA.... 14
ident |
Sbjct tndgleaiiftaegdmrqainnlqstvaghglvnadnvfkivdsphplivkKMLLAsnle 240
DSSP lhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllllhhhhhHHHLLllhh
DSSP hHHHHHHH..LLLLlhhhhhhHHHHhhhhhhHHHHHHHhhHLLL.HHHHHHHHHHHHHHH
Query sFRAAMAT..TANVppadkykTFEAaftvssKRNLADAvsKAPQ.LVPKLDEVYNAAYNA 71
ident | |
Sbjct dSIQILRTdlWKKG......ySSIDivttsfRVTKNLA..QVKEsVRLEMIKEIGLTHMR 292
DSSP hHHHHHHHllLLLL......lLHHHhhhhhhHHHHLLL..LLLHhHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query ADHAapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident
Sbjct ILEG...VGTYLQLASMLAKIHKLNNK...... 316
DSSP HHLL...LLLHHHHHHHHHHHHHHLLL......
No 55: 1HTJF MOLECULE: KIAA0380;
DSSP ...........................LHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHH
Query ...........................ATTEeqKLIEDVNASFRAAMATtanvppadKYK 33
ident |
Sbjct esdiifqdleklksrpahlgvflryifSQAD..PSPLLFYLCAEVYQQA........SPK 50
DSSP lhhhhhhlhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHLL..LHHHHHHHHHHHHLLL........LLL
DSSP HHHHHHHHHHHHH....HHHHhhhlllhhhHHHH.HHHHHHHHhhlllhhhhhhhHHHHH
Query TFEAAFTVSSKRN....LADAvskapqlvpKLDE.VYNAAYNAadhaapedkyeaFVLHF 88
ident | |
Sbjct DSRSLGKDIWNIFleknAPLR........vKIPExLQAEIDSR......lrnsedARGVL 96
DSSP HHHHHHHHHHHHHllllLLLL........lLLLHhHHHHHHHH......hhllllLHHHH
DSSP HHHHHHHHL...................................................
Query SEALRIIAG................................................... 97
ident ||
Sbjct CEAQEAAXPeiqeqihdyrtkrtlglgslygendlldldgdplrerqvaekqlaalgdil 156
DSSP HHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...................lllllll
Query ...................tpevhav 104
ident
Sbjct sayaadrsapxdfalntyxshagirl 182
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
No 56: 1DG3A MOLECULE: PROTEIN (INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hmtgpmclientngrlmanpealkilsaitqpmvvvaivglyrtgksylmnklagkkhtk 60
DSSP llllleeeeeeelleeeelhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhlhhhhhhhhlllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct giwmwcvphpkkpghilvlldteglgdvekgdnqndswifalavllsstfvynsigtinq 120
DSSP eeeeeeeellllllleeeeeeeellllllllllllhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qamdqlyyvtelthrirsksdsadfvsffpdfvwtlrdfsldlqpltpdeyltyslklkk 180
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhllllllhhhhhhllleeeeeeellllllllllhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gtsqkdetfnlprlcirkffpkkkcfvfdrpvheldpefvqqvadfcsyifsnsktktls 240
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ggiqvngprleslvltyvnaissgdlpcmenavlalaqiensaavqkaiahyeqqmgqkv 300
DSSP lleellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ...........................................................l
Query ...........................................................a 1
ident
Sbjct qlpteslqelldlhrdsereaievfirssfkdvdhlfqkelaaqlekkrddfckqnqeas 360
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hHLLLllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL.LHH
Query TTEEQKLIEDVNASFRAAM..aTTANvppADKYKTFEAAFTVSSKRNLADavSKAP.QLV 58
ident | | | | |
Sbjct SDRCSGLLQVIFSPLEEEVkagIYSK...PGGYRLFVQKLQDLKKKYYEE..PRKGiQAE 415
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLlLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHlllhhhHHHH...................................
Query PKLDEVYNAAYNAADhaapedKYEA................................... 83
ident | |
Sbjct EILQTYLKSKESMTD......AILQtdqtltekekeievervkaesaqasakmlhemqrk 469
DSSP HHHHHHHHHHHHHHH......HHHHhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..................................................hhhhhhhhhh
Query ..................................................fvlhfsealr 93
ident
Sbjct neqmmeqkersyqehlkqltekmendrvqllkeqertlalklqeqeqllkegfqkesrim 529
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
DSSP hhhllllllll
Query iiagtpevhav 104
ident
Sbjct kneiqdlqtkm 540
DSSP hhhhhhhhhhl
No 57: 1BCCC MOLECULE: UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE;
DSSP ..........................LHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLL.LHHH..
Query ..........................ATTEEqKLIEDVNASFRAAMAT.TANV.PPAD.. 30
ident |
Sbjct apnirkshpllkminnslidlpapsnISAWW.NFGSLLAVCLMTQILTgLLLAmHYTAdt 59
DSSP llllllllllhhhhllllllleeellLLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHlLLLLll
DSSP ..................hhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLH........hHHHHHH
Query ..................kyktfeAAFTVSSKRNLADAVSKAPQL........vPKLDEV 64
ident |
Sbjct slafssvahtcrnvqygwlirnlhANGASFFFICIFLHIGRGLYYgsylyketwNTGVIL 119
DSSP llhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhlhhhhHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH..............................................llLHH
Query YNAAYNAAD..............................................haAPE 78
ident |
Sbjct LLTLMATAFvgyvlpwgqmsfwgatvitnlfsaipyightlvewawggfsvdnptltRFF 179
DSSP HHHHHHHHHllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllllhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................................
Query DKYEAFVLHFSEALRIIAGT........................................ 98
ident |
Sbjct ALHFLLPFAIAGITIIHLTFlhesgsnnplgissdsdkipfhpyysfkdilgltlmltpf 239
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct ltlalfspnllgdpenftpanplvtpphikpewyflfayailrsipnklggvlalaasvl 299
DSSP hhhhhhlllllllhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct ilflipflhkskqrtmtfrplsqtlfwllvanlliltwigsqpvehpfiiigqmaslsyf 359
DSSP hhhlhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..............llllll
Query ..............pevhav 104
ident
Sbjct tillilfptigtlenkmlny 379
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhllll
No 58: 1AU1A MOLECULE: INTERFERON-BETA;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..................................
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAN.................................. 25
ident | |
Sbjct mSYNLLGFLQRSSNFQCQKLLWQLNGrleyclkdrmnfdipeeikqlqqfqkedaaltiy 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlllhhhhhlllllllhhhhhlllllhhhhhhhhh
DSSP ..............lLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLH.........hhhhh
Query ..............vPPADkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSkAPQL.........vpkld 62
ident |
Sbjct emlqnifaifrqdssSTGW.nETIVENLLANVYHQINHLKT.VLEEklekedftrgklms 118
DSSP hhhhhhhhhhllllhHHLL.lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHhhllllllllllll
DSSP hhhhhhhhhhHLLL..........hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query evynaaynaaDHAA..........peDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | |
Sbjct slhlkryygrILHYlkakeyshcawtIVRVEILRNFYFINRLTGY....lrn 166
DSSP hhhhhhhhhhHHHHhhhllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lll
No 59: 2IAEA MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A 65 KDA
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ddslypiavlidelrnedvqlrlnsikklstialalgvertrsellpfltdtiydedevl 60
DSSP lllllllllllllllllllhhhhhhhhlhhhllllllllhhhhlllllllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lalaeqlgtfttlvggpeyvhcllppleslatveetvvrdkaveslraishehspsdlea 120
DSSP hhhhhhhhhlllllllhhhllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hfvplvkrlaggdwftsrtsacglfsvcyprvssavkaelrqyfrnlcsddtpmvrraaa 180
DSSP lhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhh
DSSP .......lhHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHhlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Query .......atTEEQKLI.EDVNASFRAAMAttanvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVs 52
ident | | |
Sbjct sklgefakvLELDNVKsEIIPMFSNLASD.........EQDSVRLLAVEACVNIAQLLP. 230
DSSP hlhhhhhllLLHHHHHhLHHHHHHHHHLL.........LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.
DSSP hlLLHHHH.HHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHH............................
Query kaPQLVPK.LDEVYNAAYNaadhaapedKYEA............................ 83
ident | |
Sbjct ..QEDLEAlVMPTLRQAAE........dKSWRvrymvadkftelqkavgpeitktdlvpa 280
DSSP ..LLLLLLlLLHHHHHHHH........lLLHHhhhhhhllhhhhhhhhlhhhhhhlhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct fqnlmkdceaevraaashkvkefcenlsadcrenvimtqilpcikelvsdanqhvksala 340
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhllhhhhhhlllllhhhhhhhhllhhhhhhhllllllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct svimglspilgkdntiehllplflaqlkdecpevrlniisnldcvnevigirqlsqsllp 400
DSSP hhhllhhhhhllhhhhhhlhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct aivelaedakwrvrlaiieympllagqlgveffdeklnslcmawlvdhvyaireaatsnl 460
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhlhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct kklvekfgkewahatiipkvlamsgdpnylhrmttlfcinvlsevcgqdittkhmlptvl 520
DSSP hhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhh
DSSP ..........................................hhhhhhhhhhhhhlllll
Query ..........................................fvlhfsealriiagtpev 101
ident
Sbjct rmagdpvanvrfnvakslqkigpildnstlqsevkpilekltqdqdvdvkyfaqealtvl 580
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllhhhhhllllllllhhhhllhhhhhl
DSSP lll
Query hav 104
ident
Sbjct sla 583
DSSP lll
No 60: 2I0MA MOLECULE: PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..hhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHH
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..padkyKTFEAAfTVSSKRNLADAVSK 53
ident |
Sbjct qfdlELHELEQSFLGLGQLVLETASKAlLALAskdkemaELIINK.DHAINQGQSAIELT 59
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHlllhhhhHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL...............lHHHHHHHHHH................................
Query AP...............qLVPKLDEVYN................................ 66
ident
Sbjct CArllalpqvsdlrfvisIMSSCSDLERmgdhmagiakavlqlkenqlaeeqlhqmgkls 119
DSSP HHhhlllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ...............................................hhhhhhhllLHHH
Query ...............................................aaynaadhaAPED 79
ident
Sbjct lsmladllvafplhqaskaisiaqkdeqidqyyyalskeiiglmkdqesipngtqyLYII 179
DSSP hhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHhhLLLL.....llll
Query KYEAFVLHFSEALRIiaGTPE.....vhav 104
ident
Sbjct GHLERFADYIANICE..RLVYletgelvdl 207
DSSP HHHHHHHHHHHHHHH..HHHHhhhllllll
No 61: 2EBFX MOLECULE: DERMONECROTIC TOXIN;
DSSP .............................LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhHH
Query .............................ATTEeQKLIEDVNASFRAAMAtTANVppaDK 31
ident | |
Sbjct lggspyspfriglegvwtpevlkarasviGKPI.GESYKRILAKLQRIHN.SNIL...DE 55
DSSP llllllllllllllllllhhhhhhhllllLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHH.LLLH...HH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.................
Query YKTFEAAFTVSSKRNLADAVSkaPQLVPKLDEVYNAAYNAADH................. 74
ident | | |
Sbjct RQGLMHELMELIDLYEESQPS..SERLNAFRELRTQLEKALYLpemealkkqilqipnkg 113
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHLLhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP .....lLHHH..................................................
Query .....aAPED.................................................. 79
ident
Sbjct sgaarfLLRTamnemagktsestadlirfalqdtvisapfrgyagaipeaidfpvkyvie 173
DSSP llhhhhHHHHhhhhhhllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllleeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct disvfdkiqtnywelpayeswnegsnsallpgllresqskgmlskcriienslyighsye 233
DSSP lhhhhhlllllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeelleeeelllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct emfysispysnqvggpyelypftffsmlqevqgdlgfeqafatrnffntlvsdrlslmen 293
DSSP hhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct tmlltesfdytpwdaiygdinydeqfaamsineriekcmntyrgvafqnssksidfflnn 353
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhllleeeeellhhhhhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct lttfidnglteiaisdlpydivqqeisqflqgsnewktldamlfnldkgdingafrkllq 413
DSSP hhhhhhlllleeeeeeeehhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct sakdnnikfraighsdnsvppfnnpykslyykgniiaeaiekldregqkfvvfadsslln 473
DSSP hhhhllleeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeelhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct stpgtgrpmpglvqylkipatvvdsdgawqflpdvassrvpievtelenwqvltppqgki 533
DSSP leelllleellhhhhhllleeeellllleeellllhhhllllllllllllllllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct lglkqfkltagfpteqsrlpllensvsedlreelmqkidaikndvkmnslvcmeagscds 593
DSSP llllllllllllllhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhlllllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct vspkvaarlkdmgleagmgasitwwrreggmefshqmhttasfkfagkefavdashlqfv 653
DSSP hhhhhhhhhhhllleellleeeeeeeeellleeeeeeeeeeeeeelleeeeeellhhhll
DSSP .................................hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query .................................kyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct hdqldttililpvddwaleiaqrnrainpfveyvsktgnmlalfmpplftkprltral 711
DSSP lllllllleeeehhhhhhhhhhhllleeeeeelllllhhhhhlllllhhhllllllll
No 62: 2D2CA MOLECULE: CYTOCHROME B6;
DSSP ................lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH.HLLL..................
Query ................atteeqKLIEDVNASFRAAMA.TTAN.................. 25
ident | | | |
Sbjct eiqaladdvtskyvpphvnifyCLGGITLTCFLIQFAtGFAMtfyykptvteayasvqyi 60
DSSP llllllllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHhHHHLlllllllllllhhhhhhh
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH............lLLHHHHHHHHHHHHH
Query ....vPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK............aPQLVPKLDEVYNAAY 69
ident |
Sbjct mnevsFGWLIRSIHRWSASMMVLMMILHVFRVyltggfkkpreltWISGVILAVITVSFG 120
DSSP hhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLLLH........................................hhhhHHHHHHHH
Query NAADHAAP........................................edkyEAFVLHFS 89
ident |
Sbjct VTGYSLPWdqvgywavkivsgvpeaipvvgvlisdllrggssvgqatltryySAHTFVLP 180
DSSP HHHLLLLLllhhhhlllllllhhhlllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhHHHHLLHH
DSSP HHHHHHHLL.......llllll
Query EALRIIAGT.......pevhav 104
ident
Sbjct WLIAVFMLLhflmirkqgisgp 202
DSSP HHHHHHHHHhhhhlllllllll
No 63: 1UG7A MOLECULE: 2610208M17RIK PROTEIN;
DSSP ...........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...........ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkyktFEAAFTVSSKRNLAD 49
ident |
Sbjct gssgssgmsevTRSLLQRWGASLRRGADFDSWG............QLVEAIDEYQILARH 48
DSSP llllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............LHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHH.............llLHHHHHHHHHHhhhhhhhllLHHHHhhhHHHHHHHHHHHHH
Query AVSK.............apQLVPKLDEVYNaaynaadhaAPEDKyeaFVLHFSEALRIIA 96
ident | |
Sbjct LQKEaqaqhnnsefteeqkKTIGKIATCLElrsaalqstQSQEE..fKLEDLKKLEPILK 106
DSSP HHHHhllllllllllhhhhHHHHHHHHHHHhhhhhhhllLLLLL..lLLHHHHLHHHHHH
DSSP L..............lllllll
Query G..............tpevhav 104
ident
Sbjct Niltynkefpfdvqpisgpssg 128
DSSP Llllllllllllllllllllll
No 64: 1TD6A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MG237 HOMOLOG;
DSSP ................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllh
Query ................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvpp 28
ident
Sbjct pnqfvnhlsalkkhfasykelreafndyhkhnGDELTTFFLHQFDKVMELVKQK...... 54
DSSP lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......
DSSP hhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLHHH........
Query adkyktFEAAFTVSSKRNLADaVSKAPQLVPKLDEVYNAAYNA.ADHAAPED........ 79
ident || ||
Sbjct ......DFKTAQSRCEEELAA.PYLPKPLVSFFQSLLQLVNHDlLEQQNAALaslpaaki 107
DSSP ......LHHHHHHHHHHHLLL.LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHLHHHhhllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct ielvlqdypnklnmihyllpktkafvkphllqrlqfvltdsellelkrfsffqalnqipg 167
DSSP hhhhhllllllhhhhhhllllllllllhhhhhhlhhhhllllllhhhhhhhhhhhlllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct fqgeqveyfnsklkqkftltlgefeiaqqpdakayfeqlitqiqqlflkepvnaefanei 227
DSSP hllleeeeeelllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhh
DSSP ..................................hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query ..................................kyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct idaflvsyfplhppvplaqlaakiyeyvsqivlneavnlkdeliklivhtlyeqldrpv 286
DSSP hhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhlllllllll
No 65: 1MOJA MOLECULE: DPS-LIKE FERRITIN;
DSSP ........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.............
Query ........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT............. 23
ident |
Sbjct stqknaratagevegsdalrmdadRAEQCVDALNADLANVYVLYHQLkkhhwnvegaefr 60
DSSP llllllllllllllllllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllllhh
DSSP .................................................lLLLHHHHHHH
Query .................................................aNVPPADKYKT 34
ident
Sbjct dlhlflgeaaetaeevadelaervqalggvphaspetlqaeasvdvededVYDIRTSLAN 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhlllllllllLLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL.....HHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLHHHhhhhhhhhh
Query FEAAFTVSSKRNLADAVsKAPQ.....LVPKLDEVYNAAYNAADH.aAPEDkyeafvlhf 88
ident | | | | | |
Sbjct DMAIYGDIIEATREHTE.LAENlgdhaTAHMLREGLIELEDDAHHieHYLE......... 170
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHH