DaliLite: Structural Neighbours
Query: 1NLXA
MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 6;
The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.Summary
Notation:
- Chain: PDB entry code plus chain identifier
- Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
- rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
- lali: number of structurally equivalent residues
- nres: number of amino acids in the protein
- %id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
- Description: the COMPND record from the PDB entry
No: Chain Z rmsd lali nres %id Description
1: 1NLX-A 23.5 0.0 104 104 100 POLLEN ALLERGEN PHL P 6; "
2: 1L3P-A 8.7 2.8 86 102 20 POLLEN ALLERGEN PHL P 5B; "
3: 2J0O-A 6.3 2.8 87 284 14 INVASIN IPAD; "
4: 1NZE-A 6.0 3.5 86 112 8 OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 3; "
5: 2ODU-A 5.3 3.9 75 217 7 PLECTIN 1; "
6: 1AUE-A 5.1 3.9 80 92 4 FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN; "
7: 2AVK-A 5.0 3.2 87 133 6 HEMERYTHRIN-LIKE DOMAIN PROTEIN DCRH; "
8: 2J9W-A 4.9 3.8 80 101 9 VPS28-PROV PROTEIN; "
9: 2J9V-A 4.7 2.7 68 99 4 VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 28; "
10: 2HUJ-A 4.7 2.8 75 125 13 LIN2004 PROTEIN; "
11: 1ORJ-A 4.7 4.1 79 126 9 FLAGELLAR PROTEIN FLIS; "
12: 1I5N-A 4.6 4.1 89 128 10 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA; "
13: 2OT3-A 4.5 3.4 70 253 3 RAB5 GDP/GTP EXCHANGE FACTOR; "
14: 1J5W-A 4.5 3.8 67 276 7 GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN; "
15: 1M0K-A 4.3 3.3 87 222 13 BACTERIORHODOPSIN; "
16: 1I1I-P 4.3 3.6 71 665 6 NEUROLYSIN; "
17: 1XWM-A 4.2 3.7 80 212 9 PHOSPHATE UPTAKE REGULATOR; "
18: 1DOW-A 4.2 3.0 69 205 10 ALPHA-CATENIN; "
19: 1C03-A 4.2 3.7 87 163 9 HYPOTHETICAL PROTEIN YDL235C; "
20: 1A7D-A 4.2 3.1 72 118 6 MYOHEMERYTHRIN; "
21: 1A0B-A 4.2 3.3 75 117 11 AEROBIC RESPIRATION CONTROL SENSOR PROTEIN ARCB; "
22: 2Q4F-A 4.1 4.0 84 140 6 HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 1; "
23: 2CCY-A 4.1 3.9 76 127 9 CYTOCHROME C; "
24: 2B0H-A 4.1 4.0 87 137 8 TALIN-1; "
25: 1ISE-A 4.1 2.8 71 184 11 RIBOSOME RECYCLING FACTOR; "
26: 1GQA-A 4.1 3.9 84 130 6 CYTOCHROME C'; "
27: 2BVL-A 4.0 8.3 77 543 4 TOXIN B; "
28: 2B64-T 4.0 4.3 72 99 7 16S RIBOSOMAL RNA; "
29: 1YPY-A 4.0 3.3 85 182 7 VIRION MEMBRANE PROTEIN; "
30: 1VS5-T 4.0 3.7 67 85 9 16S RIBOSOMAL RNA; "
31: 1SJ8-A 4.0 3.4 82 297 11 TALIN 1; "
32: 2OOC-A 3.9 3.5 71 104 3 HISTIDINE PHOSPHOTRANSFERASE; "
33: 2CMR-A 3.9 4.0 79 192 4 TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN; "
34: 1SXJ-E 3.9 3.0 73 317 10 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
35: 1SUM-B 3.9 3.8 82 224 10 PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG "
36: 1OED-B 3.9 3.0 78 127 3 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
37: 1HY5-A 3.9 3.5 70 120 7 YERSINIA PESTIS VIRULENCE PROTEIN YOPE; "
38: 1FIO-A 3.9 3.1 69 190 9 SSO1 PROTEIN; "
39: 2J1P-A 3.8 4.0 95 276 12 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
40: 2D9D-A 3.8 4.1 74 89 11 BAG FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR 5; "
41: 2D4X-A 3.8 3.5 86 214 12 FLAGELLAR HOOK-ASSOCIATED PROTEIN 3; "
42: 2D4U-A 3.8 3.9 85 167 12 METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN I; "
43: 1WRD-A 3.8 3.5 69 98 7 TARGET OF MYB PROTEIN 1; "
44: 1SXJ-D 3.8 3.1 67 328 1 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
45: 1K04-A 3.8 3.4 72 142 6 FOCAL ADHESION KINASE 1; "
46: 2Q80-A 3.7 3.8 86 285 7 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
47: 2ACX-A 3.7 3.6 70 495 7 G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE 6; "
48: 1W36-C 3.7 3.8 74 1121 5 DNA HAIRPIN; "
49: 1TUJ-A 3.7 3.8 73 123 8 ODORANT BINDING PROTEIN ASP2; "
50: 1K9A-A 3.7 3.7 84 439 14 CARBOXYL-TERMINAL SRC KINASE; "
51: 1EQ1-A 3.7 3.4 74 166 7 APOLIPOPHORIN-III; "
52: 1AX8-A 3.7 4.0 72 130 8 OBESITY PROTEIN; "
53: 2A0U-A 3.6 3.1 86 374 7 INITIATION FACTOR 2B; "
54: 1HTJ-F 3.6 3.7 67 182 7 KIAA0380; "
55: 1EYS-M 3.6 4.5 74 318 7 PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER; "
56: 1DG3-A 3.6 3.5 70 540 10 PROTEIN (INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING "
57: 1BCC-C 3.6 3.8 89 379 3 UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE; "
58: 1AU1-A 3.6 3.5 76 166 7 INTERFERON-BETA; "
59: 2IAK-A 3.5 3.1 63 197 2 BULLOUS PEMPHIGOID ANTIGEN 1, ISOFORM 5; "
60: 2IAE-A 3.5 4.5 60 583 8 SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A 65 KDA "
61: 2I0M-A 3.5 3.8 86 207 1 PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU; "
62: 2D2C-A 3.5 4.2 86 202 7 CYTOCHROME B6; "
63: 2BG9-E 3.5 3.5 86 370 5 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
64: 256B-A 3.5 3.5 73 106 11 CYTOCHROME B562; "
65: 1TD6-A 3.5 3.6 66 286 6 HYPOTHETICAL PROTEIN MG237 HOMOLOG; "
66: 1SXJ-B 3.5 3.5 71 316 6 ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT; "
67: 1JR3-A 3.5 3.6 78 366 8 DNA POLYMERASE III SUBUNIT GAMMA; "
68: 2OZO-A 3.4 3.9 84 545 11 TYROSINE-PROTEIN KINASE ZAP-70; "
69: 2EBF-X 3.4 4.8 71 711 7 DERMONECROTIC TOXIN; "
70: 1Y1U-A 3.4 4.7 71 544 1 SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION "
71: 1UG7-A 3.4 3.9 74 128 4 2610208M17RIK PROTEIN; "
72: 1U6G-C 3.4 4.3 62 1146 5 CULLIN HOMOLOG 1; "
73: 1RM1-C 3.4 4.1 54 116 9 TATA-BOX BINDING PROTEIN; "
74: 1BBH-A 3.4 3.6 74 131 14 CYTOCHROME C'; "
75: 1B68-A 3.4 3.6 74 138 4 APOLIPOPROTEIN E; "
76: 2QF9-A 3.3 4.5 77 162 8 PUTATIVE SECRETED PROTEIN; "
77: 2J0J-A 3.3 4.0 84 611 13 FOCAL ADHESION KINASE 1; "
78: 2GYQ-A 3.3 6.4 83 162 8 YCFI, PUTATIVE STRUCTURAL PROTEIN; "
79: 2D5K-A 3.3 4.0 75 148 4 DPS FAMILY PROTEIN; "
80: 1WHU-A 3.3 3.3 63 104 8 POLYNUCLEOTIDE PHOSPHORYLASE; 3'-5' RNA "
81: 1S05-A 3.3 3.6 77 129 18 CYTOCHROME C-556; "
82: 1OGK-A 3.3 3.2 70 229 11 DEOXYURIDINE TRIPHOSPHATASE; "
83: 1MOJ-A 3.3 3.9 76 180 9 DPS-LIKE FERRITIN; "
84: 1EI7-A 3.3 3.0 72 158 14 COAT PROTEIN; "
85: 1B3Q-A 3.3 4.3 58 368 3 PROTEIN (CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA); "
86: 1AO6-A 3.3 3.7 70 578 9 SERUM ALBUMIN; "
87: 2J37-W 3.2 3.4 74 479 8 SRP RNA; "
88: 1WA8-A 3.2 4.1 55 99 5 ESAT-6 LIKE PROTEIN ESXB; "
89: 1ST6-A 3.2 3.5 75 1049 9 VINCULIN; "
90: 2OSS-A 3.1 2.9 66 127 5 BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4; "
91: 2ETN-A 3.1 8.8 62 154 5 ANTI-CLEAVAGE ANTI-GREA TRANSCRIPTION FACTOR "
92: 1XDO-A 3.1 4.5 70 687 4 POLYPHOSPHATE KINASE; "
93: 1XD4-A 3.1 3.6 76 824 8 SON OF SEVENLESS PROTEIN HOMOLOG 1; "
94: 1VF6-C 3.1 4.0 45 51 0 PALS1-ASSOCIATED TIGHT JUNCTION PROTEIN; "
95: 1QSA-A 3.1 4.3 62 618 8 PROTEIN (SOLUBLE LYTIC TRANSGLYCOSYLASE SLT70); "
96: 1CNT-1 3.1 3.3 70 150 6 CILIARY NEUROTROPHIC FACTOR; "
97: 2PFT-A 3.0 3.5 73 519 7 EXOCYTOSIS PROTEIN; "
98: 2OEB-A 3.0 3.2 76 152 7 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
99: 2J49-A 3.0 3.2 64 134 6 TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR TFIID SUBUNIT 5; "
100: 2HYD-A 3.0 2.6 52 578 2 ABC TRANSPORTER HOMOLOG; "
101: 2GSF-A 3.0 3.8 84 281 5 EPHRIN TYPE-A RECEPTOR 3; "
102: 2G15-A 3.0 4.1 84 301 13 ACTIVATED MET ONCOGENE; "
103: 2F05-A 3.0 3.9 60 85 7 PAIRED AMPHIPATHIC HELIX PROTEIN SIN3B; "
104: 2B8I-A 3.0 2.8 54 77 7 PAS FACTOR; "
105: 2B7M-A 3.0 3.7 65 513 8 EXOCYST COMPLEX COMPONENT EXO70; "
106: 1YEW-C 3.0 3.9 69 188 7 PARTICULATE METHANE MONOOXYGENASE, B SUBUNIT; "
107: 1W0B-A 3.0 3.7 72 102 4 ALPHA-HEMOGLOBIN STABILIZING PROTEIN; "
108: 1TJU-A 3.0 3.3 64 448 11 DELTA CRYSTALLIN II; "
109: 1RP3-A 3.0 7.9 60 235 7 RNA POLYMERASE SIGMA FACTOR SIGMA-28 (FLIA); "
110: 1L7C-A 3.0 3.7 77 240 5 ALPHA E-CATENIN; "
111: 1CM5-A 3.0 8.9 66 759 2 PROTEIN (PYRUVATE FORMATE-LYASE); "
112: 2IIU-A 2.9 4.2 80 208 8 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
113: 2IDL-A 2.9 3.0 61 113 5 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
114: 2ETS-A 2.9 3.7 72 115 4 HYPOTHETICAL PROTEIN; "
115: 1VJX-A 2.9 3.9 69 148 6 PUTATIVE FERRITIN-LIKE DIIRON-CARBOXYLATE "
116: 1UVH-A 2.9 4.0 76 157 3 STARVATION-INDUCED DNA PROTECTING PROTEIN; "
117: 1U89-A 2.9 3.5 71 139 8 TALIN 1; "
118: 1TZT-A 2.9 4.1 75 141 5 N UTILIZATION SUBSTANCE PROTEIN B HOMOLOG; "
119: 1OED-C 2.9 4.0 77 127 5 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
120: 1J7Q-A 2.9 3.3 66 86 3 CALCIUM VECTOR PROTEIN; "
121: 1CGM-E 2.9 3.2 73 160 14 RNA (5'-R(P*GP*AP*A)-3'); "
122: 2IB0-A 2.8 4.7 68 142 10 CONSERVED HYPOTHETICAL ALANINE RICH PROTEIN; "
123: 2FUT-A 2.8 4.9 68 743 6 HEPARINASE II PROTEIN; "
124: 2E22-A 2.8 3.6 60 752 8 XANTHAN LYASE; "
125: 2DH4-A 2.8 3.3 83 326 8 YPL069C; "
126: 2BKN-A 2.8 6.9 59 190 5 HYPOTHETICAL PROTEIN PH0236; "
127: 1ZU4-A 2.8 4.2 75 305 9 FTSY; "
128: 1YLM-A 2.8 3.8 70 143 6 HYPOTHETICAL PROTEIN BSU32300; "
129: 1YA0-A 2.8 6.4 72 458 7 SMG-7 TRANSCRIPT VARIANT 2; "
130: 1TJF-A 2.8 3.4 73 185 7 ADENYLYL CYCLASE-ASSOCIATED PROTEIN; "
131: 1QZW-A 2.8 3.8 76 432 12 SIGNAL RECOGNITION 54 KDA PROTEIN; "
132: 1BBN-A 2.8 3.5 65 133 11 INTERLEUKIN-4; "
133: 1A7V-A 2.8 3.8 76 125 8 CYTOCHROME C'; "
134: 2GOX-B 2.7 3.7 52 65 8 COMPLEMENT C3; "
135: 2FOR-A 2.7 3.4 66 283 8 GERANYLTRANSTRANSFERASE; "
136: 2FJC-A 2.7 5.0 72 151 7 ANTIGEN TPF1; "
137: 2FI7-A 2.7 4.6 67 223 3 TYPE 4 FIMBRIAL BIOGENESIS PROTEIN PILF; "
138: 2D57-A 2.7 3.4 77 224 10 AQUAPORIN-4; "
139: 2C52-A 2.7 2.7 49 58 12 CREB-BINDING PROTEIN; "
140: 1XG2-B 2.7 3.1 74 151 5 PECTINESTERASE 1; "
141: 1KMI-Z 2.7 9.2 56 177 14 CHEMOTAXIS PROTEIN CHEY; "
142: 1FVR-A 2.7 3.9 85 299 7 TYROSINE-PROTEIN KINASE TIE-2; "
143: 1E5R-A 2.7 3.3 62 260 8 PROLINE OXIDASE; "
144: 1D1D-A 2.7 3.8 68 220 10 PROTEIN (CAPSID PROTEIN); "
145: 2IG3-A 2.6 3.5 70 127 4 GROUP III TRUNCATED HAEMOGLOBIN; "
146: 2H7O-A 2.6 2.9 56 270 4 PROTEIN KINASE YPKA; "
147: 2G8L-A 2.6 3.9 61 284 7 287AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN; "
148: 2C2J-A 2.6 4.0 74 165 5 DNA-BINDING STRESS RESPONSE PROTEIN; "
149: 2C0E-A 2.6 3.6 67 228 7 WINDBEUTEL PROTEIN; "
150: 2BG9-A 2.6 3.6 74 370 1 ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN; "
151: 2B7A-A 2.6 3.8 85 286 7 TYROSINE-PROTEIN KINASE JAK2; "
152: 1YKE-A 2.6 4.4 49 98 6 RNA POLYMERASE II MEDIATOR COMPLEX PROTEIN MED7; "
153: 1Y6A-A 2.6 3.9 84 261 8 VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2; "
154: 1WP9-A 2.6 4.0 68 479 10 ATP-DEPENDENT RNA HELICASE, PUTATIVE; "
155: 2UXH-A 2.5 4.1 55 206 9 HTH-TYPE TRANSCRIPTIONAL REGULATOR TTGR; "
156: 2P61-A 2.5 3.2 60 114 12 HYPOTHETICAL PROTEIN TM_1646; "
157: 2J28-9 2.5 3.8 76 430 12 4.5S SIGNAL RECOGNITION PARTICLE RNA; "
158: 2AZJ-A 2.5 4.3 66 276 12 GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE; "
159: 1YO7-A 2.5 3.7 69 120 4 REGULATORY PROTEIN ROP; "
160: 1UK5-A 2.5 3.0 58 111 14 BAG-FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR-3; "
161: 1LUF-A 2.5 4.0 81 275 5 MUSCLE-SPECIFIC TYROSINE KINASE RECEPTOR MUSK; "
162: 1JB0-A 2.5 11.1 69 740 6 PHOTOSYSTEM I P700 CHLOROPHYLL A APOPROTEIN A1; "
163: 1GQI-A 2.5 4.0 60 708 5 ALPHA-GLUCURONIDASE; "
164: 1A26-A 2.5 3.0 58 351 10 POLY (ADP-RIBOSE) POLYMERASE; "
165: 2PIH-A 2.4 3.2 52 123 2 PROTEIN YMCA; "
166: 2OTJ-P 2.4 8.4 44 143 7 23S RIBOSOMAL RNA; "
167: 2O7T-A 2.4 3.8 60 188 13 TRANSCRIPTIONAL REGULATOR; "
168: 2JAV-A 2.4 3.5 74 253 12 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2; "
169: 2FB8-A 2.4 3.8 80 259 9 B-RAF PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN "
170: 2C6J-A 2.4 2.9 62 265 10 DUFFY RECEPTOR, ALPHA FORM; "
171: 2C41-A 2.4 5.8 66 155 9 DPS FAMILY DNA-BINDING STRESS RESPONSE PROTEIN; "
172: 2AEK-A 2.4 3.8 81 354 5 TRICHODIENE SYNTHASE; "
173: 1XKK-A 2.4 3.9 78 289 8 EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR; "
174: 1X8B-A 2.4 3.0 65 259 11 WEE1-LIKE PROTEIN KINASE; "
175: 1UPK-A 2.4 4.6 59 318 10 MO25 PROTEIN; "
176: 1S12-A 2.4 8.9 60 94 8 HYPOTHETICAL PROTEIN TM1457; "
177: 1RJB-A 2.4 4.0 82 298 4 FL CYTOKINE RECEPTOR; "
178: 1POC-A 2.4 4.4 64 134 5 PHOSPHOLIPASE A2; "
179: 1IHG-A 2.4 4.4 65 364 5 CYCLOPHILIN 40; "
180: 2NZ8-B 2.3 3.2 65 279 14 RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1 "
181: 2IO2-C 2.3 4.6 57 156 11 SENTRIN-SPECIFIC PROTEASE 2; "
182: 2I15-A 2.3 3.4 47 122 11 HYPOTHETICAL PROTEIN MG296 HOMOLOG; "
183: 2HG4-A 2.3 4.4 67 882 12 6-DEOXYERYTHRONOLIDE B SYNTHASE; "
184: 2GTL-B 2.3 4.6 64 145 8 EXTRACELLULAR GLOBIN 4; "
185: 2CHL-A 2.3 3.5 80 298 5 CASEIN KINASE I ISOFORM GAMMA-3; "
186: 1ZOY-A 2.3 3.7 68 613 12 FAD-BINDING PROTEIN; "
187: 1UX8-A 2.3 4.2 67 118 9 YJBI PROTEIN; "
188: 1TFK-B 2.3 3.1 58 86 9 COLICIN D; "
189: 1H19-A 2.3 4.4 61 610 5 LEUKOTRIENE A-4 HYDROLASE; "
190: 1DVK-A 2.3 3.1 62 149 3 PRP18; "
191: 1DLY-A 2.3 3.7 65 121 11 HEMOGLOBIN; "
192: 1DE4-C 2.3 3.8 51 635 6 HEMOCHROMATOSIS PROTEIN; "
193: 1CS4-A 2.3 3.5 64 189 8 TYPE V ADENYLATE CYCLASE; "
194: 1B71-A 2.3 4.9 67 191 9 PROTEIN (RUBRERYTHRIN); "
195: 1A5T-A 2.3 4.1 74 323 5 DELTA PRIME; "
196: 2QNL-A 2.2 2.8 63 162 5 UNCHARACTERIZED PROTEIN; "
197: 2NYF-A 2.2 5.1 75 511 12 NOSTOC PUNCTIFORME PHENYLALANINE AMMONIA LYASE; "
198: 2NN4-A 2.2 2.9 52 62 2 HYPOTHETICAL PROTEIN YQGQ; "
199: 2FLT-A 2.2 3.3 56 117 9 CIS-3-CHLOROACRYLIC ACID DEHALOGENASE; "
200: 2CRB-A 2.2 3.9 58 97 5 NUCLEAR RECEPTOR BINDING FACTOR 2; "
201: 2CIC-A 2.2 3.6 70 223 6 DEOXYURIDINE 5'-TRIPHOSPHATE NUCLEOTIDE "
202: 2BS2-A 2.2 3.6 61 655 7 QUINOL-FUMARATE REDUCTASE FLAVOPROTEIN SUBUNIT A; "
203: 2AAL-A 2.2 3.2 53 129 15 MALONATE SEMIALDEHYDE DECARBOXYLASE; "
204: 2A6T-A 2.2 3.8 61 230 11 SPAC19A8.12; "
205: 1ZRL-A 2.2 3.1 64 583 13 ERYTHROCYTE BINDING ANTIGEN REGION II; "
206: 1UFA-A 2.2 3.3 65 509 9 TT1467 PROTEIN; "
207: 1NG6-A 2.2 3.9 58 148 5 HYPOTHETICAL PROTEIN YQEY; "
208: 1HUL-A 2.2 3.8 57 108 11 INTERLEUKIN-5; "
209: 1GNC-A 2.2 3.9 62 175 6 GRANULOCYTE COLONY-STIMULATING FACTOR; "
210: 1FOU-A 2.2 5.1 57 257 19 UPPER COLLAR PROTEIN; "
211: 1E2X-A 2.2 4.6 66 222 6 FATTY ACID METABOLISM REGULATOR PROTEIN; "
212: 1BUY-A 2.2 3.0 64 166 6 PROTEIN (ERYTHROPOIETIN); "
213: 1A7M-A 2.2 3.6 71 180 4 LEUKEMIA INHIBITORY FACTOR; "
214: 2PNO-A 2.1 4.1 75 146 7 LEUKOTRIENE C4 SYNTHASE; "
215: 2HAK-A 2.1 3.7 77 309 9 SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE MARK1; "
216: 2FO7-A 2.1 4.5 54 136 7 SYNTHETIC CONSENSUS TPR PROTEIN; "
217: 2FHY-A 2.1 4.6 80 317 10 FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE 1; "
218: 2CZ2-A 2.1 4.3 73 211 4 MALEYLACETOACETATE ISOMERASE; "
219: 2BZ9-A 2.1 3.9 69 429 9 STEROL 14ALPHA-DEMETHYLASE; "
220: 2AVU-E 2.1 3.6 59 156 10 TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR FLHD; "
221: 2A06-H 2.1 3.6 48 66 8 UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE "
222: 1YVL-A 2.1 8.8 58 652 5 SIGNAL TRANSDUCER AND ACTIVATOR OF TRANSCRIPTION "
223: 1YUX-A 2.1 8.5 70 200 9 NIGERYTHRIN; "
224: 1Y79-1 2.1 7.4 64 680 13 PEPTIDYL-DIPEPTIDASE DCP; "
225: 1R4T-A 2.1 3.6 61 122 5 EXOENZYME S; "
226: 1NKL-A 2.1 3.4 57 78 9 NK-LYSIN; "
227: 1NIG-A 2.1 3.5 60 146 10 HYPOTHETICAL PROTEIN TA1238; "
228: 2OOE-A 2.0 3.8 53 528 13 CLEAVAGE STIMULATION FACTOR 77 KDA SUBUNIT; "
229: 2J6Y-A 2.0 10.5 48 85 0 PHOSPHOSERINE PHOSPHATASE RSBU; "
230: 2G0I-A 2.0 3.8 60 111 10 HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.848; "
231: 2CWL-A 2.0 4.8 81 299 6 MANGANESE-FREE PSEUDOCATALASE; "
232: 1W36-D 2.0 2.5 53 538 6 DNA HAIRPIN; "
233: 1U8S-A 2.0 3.8 47 171 6 GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM TRANSCRIPTIONAL "
234: 1R8M-E 2.0 3.4 48 196 6 ARNO; "
235: 1Q3E-A 2.0 3.6 44 192 2 POTASSIUM/SODIUM HYPERPOLARIZATION-ACTIVATED "
236: 1LBV-A 2.0 3.8 73 252 8 FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATASE/INOSITOL "
237: 1L9L-A 2.0 3.7 57 74 5 GRANULYSIN; "
238: 1FBV-A 2.0 3.5 65 388 8 SIGNAL TRANSDUCTION PROTEIN CBL; "
239: 1DKX-A 2.0 2.8 43 219 12 SUBSTRATE BINDING DOMAIN OF DNAK; "
-
No 1: 1NLXA MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 6;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVPK 60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQLVPK 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL
Query LDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTPEVHAV 104
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTPEVHAV 104
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL
No 2: 1L3PA MOLECULE: POLLEN ALLERGEN PHL P 5B;
DSSP ....lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query ....aTTEEQKLIEDVNASFRAAMATTanvppadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAP. 55
ident | || | |
Sbjct ipageLQIIDKIDAAFKVAATAAATAP........aDDKFTVFEAAFNKAIKETTGGAYd 52
DSSP llhhhHLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL........hHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLl
DSSP ..lhHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query ..qlVPKLDEVYNAAYNAADHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | | || | ||| || | |
Sbjct tykcIPSLEAAVKQAYAATVAAAPQVKYAVFEAALTKAITAMSEV.qkvsq 102
DSSP lhhhLHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hhhhl
No 3: 2J0OA MOLECULE: INVASIN IPAD;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hpvssltmlndtlhnirttnqalkkelsqktltktsleeialhssqismdvnksaqlldi 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .........................................................LHH
Query .........................................................ATT 3
ident |
Sbjct lsrheypinkdarellhsapkeaeldgdqmishrelwakiansindineqylkvyehAVS 120
DSSP hhhllllllhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL...HHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......
Query EEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP...PADKykTFEAAFTVSSKRNLADAVSK....... 53
ident | | | |
Sbjct SYTQMYQDFSAVLSSLAGWISPGGndgNSVK..LQVNSLKKALEELKEKYKDKplypann 178
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEELLlllLLEE..ELHHHHHHHHHHHHHHHLLLeeellll
DSSP .............................lllHHHHHHHHHHHHHH...hhhlllHHHHH
Query .............................apqLVPKLDEVYNAAYN...aadhaaPEDKY 81
ident | | ||
Sbjct tvsqeqankwltelggtigkvsqknggyvvsiNMTPIDNMLKSLDNlggngevvlDNAKY 238
DSSP lllhhhhhhhhhhllllleeeeelllleeeeeLLHHHHHHHHHHHLlllllleeeLHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLL.......................llllll
Query EAFVLHFSEALRIIAGT.......................pevhav 104
ident | ||
Sbjct QAWNAGFSAEDETMKNNlqtlvqkysnansifdnlvkvlsstissc 284
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 4: 1NZEA MOLECULE: OXYGEN-EVOLVING ENHANCER PROTEIN 3;
DSSP ...lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH.hllllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..
Query ...atteeqKLIEDVNASFRAAMA.ttanvPPAD.KYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK.. 53
ident | | | |
Sbjct fylqplpptEAAQRAKVSASEILNvkqfidRKAWpSLQNDLRLRASYLRYDLKTVISAkp 60
DSSP lllllllllLHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll
DSSP ...LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query ...APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPED.KYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct kdeKKSLQELTSKLFSSIDNLDHAaKIKSPtEAEKYYGQTVSNINEVLA....klg 112
DSSP hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH....lll
No 5: 2ODUA MOLECULE: PLECTIN 1;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct elqlrwqeyrelvllllqwmrhhtaafeerfpssfeeieilwsqflkfkemelpakeadk 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh
DSSP .........................................................LHH
Query .........................................................ATT 3
ident
Sbjct nrskgiyqslegavqagqlkvppgyhpldvekewgklhvailerekqlrseferlecLQR 120
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH.............llllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query EEQKLIEDVNASFRAAMAT.............tanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident || | |
Sbjct IVTKLQMEAGLCEEQLNQAdallqsdvrllaagkvpQRAGEVERDLDKADSMIRLLFNDV 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHH.......LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query VSK.......APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPEDkyeafvlhfsealriiagtpevh 102
ident |
Sbjct QTLkdgrhpqGEQMYRRVYRLHKRLVAIRTEyNLRLK....................... 217
DSSP HHHhhlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHL.......................
DSSP ll
Query av 104
ident
Sbjct .. 217
DSSP ..
No 6: 1AUEA MOLECULE: FKBP-RAPAMYCIN ASSOCIATED PROTEIN;
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlllhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhHHHL..LLH
Query attEEQKLIEDVNASFRAAM.ATTAnvppadkykTFEAAFTVSSKRnladaVSKA..PQL 57
ident
Sbjct ...LWHEMWHEGLEEASRLYfGERN.......vkGMFEVLEPLHAM.mergPQTLkeTSF 49
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL.......hhHHHHHHHHHHHH.hhllLLLHhhHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHLL..LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query VPKLDEVYNAAYNAADHA..APED.KYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct NQAYGRDLMEAQEWCRKYmkSGNVkDLTQAWDLYYHVFRRISK....... 92
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLhHHHHHHHHHHHHHHHLLL.......
No 7: 2AVKA MOLECULE: HEMERYTHRIN-LIKE DOMAIN PROTEIN DCRH;
DSSP .......lhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHL...llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......atteeqklIEDVNASFRAAMATT...anVPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident | || |
Sbjct dvlvkwsedlanlpsIDTQHKRLVDYINDLyraarRRDMDKAREVFDALKNYAVEHFGYE 60
DSSP lllllllhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..
Query VSKA........pQLVPKLDEVYNAAYNAADHA..APEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT.. 98
ident |
Sbjct ERLFadyaypeatRHKEIHRRFVETVLKWEKQLaaGDPEVVMTTLRGLVDWLVNHIMKed 120
DSSP HHHHhhhllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlh
DSSP .......llllll
Query .......pevhav 104
ident
Sbjct kkyeaylrergvs 133
DSSP hhhhhhhhhllll
No 8: 2J9WA MOLECULE: VPS28-PROV PROTEIN;
DSSP .lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLlhhHHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLHH
Query .aTTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.TANVppaDKYKTfEAAFTVSSKRNLADAvskapQLV 58
ident | | | |
Sbjct hhMGNLNRCIADIVSLFITVMDKlRLEI...RAMDE.IQPDLRELMETMNRM.....SHL 51
DSSP llLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL...LLHHH.HHHHHHHHHHHHHHL.....LLL
DSSP HhhHHHHHHHHHH........hhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PklDEVYNAAYNA........adhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | | |
Sbjct PpdFEGREKVSQWlqklssmsasdelDDSQVRQMLFDLESAYNAFNR....flh 101
DSSP LllLHHHHHHHHHhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhl
No 9: 2J9VA MOLECULE: VACUOLAR PROTEIN SORTING-ASSOCIATED PROTEIN 28;
DSSP .....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhHHHH.HHHHHHHHHHHHHHhHL
Query .....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkykTFEA.AFTVSSKRNLADAVsKA 54
ident | |
Sbjct hhhmfNAKYVAEATGNFITVMDALKLN...........YNAKdQLHPLLAELLISIN.RV 48
DSSP lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........LLLHhHHHHHHHHHHHHHH.HH
DSSP LLhhhhhHHHHH.....hhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query PQlvpklDEVYN.....aaynaadhaapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct TRddfenRSKLIdwivrinklsigdtlteTQIRELLFDLELAYKSFYA....lld 99
DSSP LLlllllHHHHHhhhhhhhhllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hll
No 10: 2HUJA MOLECULE: LIN2004 PROTEIN;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..hhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHL
Query ...ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..padkyktfeaaFTVSSKRNLADAVSKA 54
ident | | | | || | |
Sbjct lyfQGXELLIRTEQLLLQNEKNWELYlSNREeekpfdfykdxkpFVDEAKRCADDFLELA 60
DSSP lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHllllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL..........hhHHHHHHHH....hhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.l
Query PQ..........lvPKLDEVYN....aaynaadhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT.p 99
ident | |
Sbjct IPwvnterppylgeLQLRQACDnvqxtavsafngrsFYKHFLDHYQSTKYTLTRVRDFlk 120
DSSP HHhhhhhllllllhHHHHHHHHhhhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhh
DSSP lllll
Query evhav 104
ident
Sbjct rkees 125
DSSP hhhll
No 11: 1ORJA MOLECULE: FLAGELLAR PROTEIN FLIS;
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHhhHHHHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPADkyKTFEAAFTVSSK 44
ident | | |
Sbjct rniaeayfqnmvetatPLEQIILLYDKAIECLERAIEIYDQVNELE.kRKEFVENIDRVY 59
DSSP llhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLHHHLLLHH.hHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL.........llhhHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query RNLADAVSKA.........pqlvPKLDEVYNAaynaadhaapedkYEAFVLHFSEALRII 95
ident | | | |
Sbjct DIISALKSFLdhekgkeiaknldTIYTIILNT.......lvkvdkTKEELQKILEILKDL 112
DSSP HHHHHHHHLLlllllhhhhhhhhHHHHHHHHH.......hhllllLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLL.....llllll
Query AGT.....pevhav 104
ident
Sbjct REAweevkkkvhhh 126
DSSP HHHhhhhhhhhhll
No 12: 1I5NA MOLECULE: CHEMOTAXIS PROTEIN CHEA;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLL
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvpPADKyKTFEAAFTVSSKRNLADAVskaPQ 56
ident | | | |
Sbjct disdFYQTFFDEADELLADXEQHLLDLV...PESPdAEQLNAIFRAAHSIKGGAG...TF 54
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...LLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...HL
DSSP HHHHHHHHHHHHHH......hhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......LLLLL..
Query LVPKLDEVYNAAYN......aadhaaPEDKYEAFVLHFSEALRIIAG......TPEVH.. 102
ident | | | | |
Sbjct GFTILQETTHLXENlldearrgexqlNTDIINLFLETKDIXQEQLDAyknseePDAASfe 114
DSSP LLHHHHHHHHHHHHhhhhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllllLLHHHhh
DSSP ............ll
Query ............av 104
ident
Sbjct yicnalrqlaleak 128
DSSP hhhhhhhhhhhhhl
No 13: 2OT3A MOLECULE: RAB5 GDP/GTP EXCHANGE FACTOR;
DSSP ..........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..........ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvppaDKYKTFEAAFTVSSKRNLADA 50
ident |
Sbjct skefieflktFHKTGQEIYKQTKLFLEGMHYKRD.....LSIEEQSECAQDFYHNVAERM 55
DSSP lhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHLLL....HHHHHHHHHHHHHHHhhlllhhHHHH........................
Query VSKAPQ....LVPKLDEVYNAAYNAadhaapeDKYE........................ 82
ident |
Sbjct QTRGKVpperVEKIMDQIEKYIMTR.....lyKYVFcpettddekkdlaiqkriralrwv 110
DSSP HLLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHH.....hhHHHLllllllhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct tpqmlcvpvnedipevsdmvvkaitdiiemdskrvprdklacitkcskhifnaikitkne 170
DSSP lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 82
ident
Sbjct pasaddflptliyivlkgnpprlqsniqyitrfcnpsrlmtgedgyyftnlccavafiek 230
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP .hhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query .afvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct ldaqslnlsqedfdrymsgqtsp 253
DSSP lllhhhlllhhhhhhhhllllll
No 14: 1J5WA MOLECULE: GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct xylqdvixklndfwaskgclleqpydxevgagtfhpatffgslrkgpwkvayvqpsrrpt 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhllleellllllllllhhhlhhhhlhhhlllleeeeeeeeeelll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct enpnrlqryfqyqviikpspensqelylesleylginlkehdirfvednwesptlgawgv 120
DSSP llllllleeeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhllllllllleeeeeelleehhhleeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gwevwldgxeitqftyfqqiggislkdipleitygleriaxylqgvdnvyevqwnenvky 180
DSSP eeeeeelleeeeeeeeeeelllllllllleeeeeehhhhhhhhhllllhhhleeelleeh
DSSP ................lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhHHHHHHHHhHHHHHH
Query ................attEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppaDKYKTFEAaFTVSSK 44
ident | |
Sbjct gdvflenerefsvfnfeeaNVGLLFRHFDEYEKEFYRL....vekNLYLPAYD.YILKCS 235
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhlLLHHHHHH.HHHHHH
DSSP HHHHHHHH.HLLL..HHHHHHHHHHHHHHHHHL.lLHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
Query RNLADAVS.KAPQ..LVPKLDEVYNAAYNAADH.aAPEDkyeafvlhfsealriiagtpe 100
ident | | |
Sbjct HTFNLLDArGAISvsQRQTYVKRIQAXARKAARvfLEVQ..................... 274
DSSP HHHHHHHHlLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHH.....................
DSSP llll
Query vhav 104
ident
Sbjct ..an 276
DSSP ..ll
No 15: 1M0KA MOLECULE: BACTERIORHODOPSIN;
DSSP .............................lhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL...
Query .............................atteeQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP... 27
ident | | |
Sbjct tgrpewiwlalgtalmglgtlyflvkgmgvsdpdAKKFYAITTLVPAIAFTMyLSMLlgy 60
DSSP lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHlll
DSSP .............hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH......................
Query .............pADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVS...................... 52
ident | || |
Sbjct gltmvpfggeqnpiYWARYADWLFTTPLLLLDLALLVDadqgtilalvgadgimigtglv 120
DSSP lleeeeelleeeeeLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ....................................hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query ....................................kAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAA 76
ident | | |
Sbjct galtkvysyrfvwwaistaamlyilyvlffgfsmrpeVASTFKVLRNVTVVLWSAYPVVW 180
DSSP hhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP ..............hhhHHHHHHHHH.HHHHHHHHLlllllll
Query ..............pedKYEAFVLHF.SEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct ligsegagivplnietlLFMVLDVSAkVGFGLILLR.sraifg 222
DSSP hhlllllllllhhhhhhHHHHHHHHHhHHHHHHHHH.lhhhll
No 16: 1I1IP MOLECULE: NEUROLYSIN;
DSSP .................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL..LHHH.HHHHHHHHHH
Query .................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANV..PPAD.KYKTFEAAFT 40
ident |
Sbjct mssytaagrnvlrwdlsPEQIKTRTEQLIAQTKQVYDTVGTIAlkEVTYeNCLQVLADIE 60
DSSP lllllllllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLhhHLLLlLLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHH............lllHHHHHHHHHHHHHH..................
Query VSSKRNLADAVSK............apqLVPKLDEVYNAAYN.................. 70
ident | ||
Sbjct VTYIVERTMLDFPqhvssdrevraasteADKKLSRFDIEMSMredvfqrivhlqetcdle 120
DSSP HHHHHHHHHHHLHhhhlllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP .................hhHLLL.....................................
Query .................aaDHAA..................................... 76
ident
Sbjct kikpearryleksikmgkrNGLHlsehirneiksmkkrmselcidfnknlneddtslvfs 180
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct kaelgalpddfidslektdedkykvtlkyphyfpvmkkccvpetrrkmemafhtrckqen 240
DSSP lhhhllllhhhhhllllllllleeeellhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct tailqqllplraqvakllgynthadfvlelntakstsrvaaflddlsqklkplgeaeref 300
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct ilslkkkeceergfeydgkinawdlhyymtqteelkysvdqeslkeyfpievvtegllsi 360
DSSP hhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct yqellglsfeqvpdahvwnksvslytvkdkatgevlgqfyldlypregkynhaacfglqp 420
DSSP hhhhhleeeeellllllllllleeeeeeellllleeeeeeeellllllllllleeeeeel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct gcllpdgsrmmsvaalvvnfsqpvagrpsllrhdevrtyfhefghvmhqicaqtdfarfs 480
DSSP llllllllllleeeeeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct gtnvetdfvevpsqmlenwvwdvdslrklskhykdghpitdelleklvasrlvntglltl 540
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhlllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 76
ident
Sbjct rqivlskvdqslhtnatldaaseyakycteilgvaatpgtnmpatfghlaggydgqyygy 600
DSSP hhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhlllllllllllllhh
DSSP .....................................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .....................................pedkyeafvlhfsealriiagtp 99
ident
Sbjct lwsevfsmdmfhscfkkegimnpevgmkyrnlilkpggsldgmdmlqnflqrepnqkafl 660
DSSP hhhhhhhhhhhhhlhhhhllllhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhllllllhhhh
DSSP lllll
Query evhav 104
ident
Sbjct msrgl 665
DSSP hhhll
No 17: 1XWMA MOLECULE: PHOSPHATE UPTAKE REGULATOR;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL.hhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHL
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP.padkyktfeaafTVSSKRNLADAVSKA 54
ident | | |
Sbjct tfadDLASLHNKLIEMGRLTEVALQQAiEAFQtqnanlamavidgDGSIDALEEEVNDFA 60
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllhhhhhhhhhlLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP .................LLHHHHHHH................hhhhhhhhhhllLHHHHH
Query .................PQLVPKLDE................vynaaynaadhaAPEDKY 81
ident |
Sbjct lwliaaqqpvatdlrriVAAIKIASDieriadfavniakaciriggqpfvmdigPLVLMY 120
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLLL....................................
Query EAFVLHFSEALRIIA.GTPEVHAV.................................... 104
ident | | |
Sbjct RLATDMVSTAIAAYDrEDASLAAQiadmdhrvdeqygemmasllavaktdaatlaqmnvl 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHhLLLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhh
DSSP ................................
Query ................................ 104
ident
Sbjct alvaryiertadhatniaehlvylvkgkhydf 212
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
No 18: 1DOWA MOLECULE: ALPHA-CATENIN;
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...LLLH
Query atteeqkliedvnasfraamattanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK...APQL 57
ident | | | |
Sbjct ..........................KAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESqflKEEL 34
DSSP ..........................LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH.........hhHHHHHHHHHHHHHHHHL..........
Query VPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE.........dkYEAFVLHFSEALRIIAG.......... 97
ident | | |
Sbjct VVAVEDVRKQGDLXKSAaGEFAddpcssvkrgnXVRAARALLSAVTRLLIladxadvykl 94
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct lvqlkvvedgilklrnagneqdlgiqykalkpevdklnixaakrqqelkdvgnrdqxaaa 154
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................lllllll
Query ............................................tpevhav 104
ident
Sbjct rgilqknvpilytasqaclqhpdvaaykanrdliykqlqqavtgisnaaqa 205
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 19: 1C03A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YDL235C;
DSSP ..........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHH
Query ..........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKT 34
ident | | | |
Sbjct stipseiinwtilneiismddddsdfSKGLIIQFIDQAQTTFAQMQRQLDGE....KNLT 56
DSSP lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....LLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHHHHHHHHHH..HHLL.................
Query FEAAFTVSSKRNLADAVskapqlVPKLDEVYNAAYNA..ADHA................. 75
ident | | | |
Sbjct ELDNLGHFLKGSSAALG......LQRIAWVCERIQNLgrKMEHffpnktelvntlsdksi 110
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLL......LHHHHHHHHHHHHHhlLLLLllllhhhhhlllllhhh
DSSP .................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.......lllllll
Query .................APEDKYEAFVLHFSEALRIIAG.......tpevhav 104
ident
Sbjct inginideddeeikikdENSIYLILIAKALNQSRLEFKLarielskyyntnlh 163
DSSP hllllllllllllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllll
No 20: 1A7DA MOLECULE: MYOHEMERYTHRIN;
DSSP ................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhhhhhHHHHHHHHHH
Query ................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadkyktFEAAFTVSSK 44
ident |
Sbjct gweipepyvwdesfrvFYEQLDEEHKKIFKGIFDCIRD............NSAPNLATLV 48
DSSP lllllllllllhhhllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............LLHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLH............hHHHHHHHHHhhhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHHH
Query RNLADAVSKAPQL............vPKLDEVYNAaynaadhaapedkYEAFVLHFSEAL 92
ident | | |
Sbjct KVTTNHFTHEEAMmdaakysevvphkKMHKDFLEK.....igglsapvDAKNVDYCKEWL 103
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhhhllllhhhhhHHHHHHHHH.....hhhlllllLHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLL...llllll
Query RIIAGT...pevhav 104
ident
Sbjct VNHIKGtdfkykgkl 118
DSSP HHHHHHlhhhhllll
No 21: 1A0BA MOLECULE: AEROBIC RESPIRATION CONTROL SENSOR PROTEIN ARCB;
DSSP ......................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlhhhHHHHHHHH
Query ......................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVppadKYKTFEAA 38
ident | |
Sbjct ksealldipmleqylelvgpklITDGLAVFEKMMPGYVSVLESNLTAQ....DKKGIVEE 56
DSSP lhhhhllhhhhhhhhhhllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....LHHHHHHH
DSSP HHHhhhhhhhhhhhhlllHHHHhHHHHHHHHH..hhhLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query FTVsskrnladavskapqLVPKlDEVYNAAYN..aadHAAPEDKYEAFVLHFSEALRIIA 96
ident | | || | |
Sbjct GHK.........ikgaagSVGL.RHLQQLGQQiqspdLPAWEDNVGEWIEEMKEEWRHDV 106
DSSP HHH.........hhhhhhHLLL.HHHHHHHHHhllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL...llllll
Query GT...pevhav 104
ident
Sbjct EVlkawvakat 117
DSSP HHhhhhhhhhl
No 22: 2Q4FA MOLECULE: HISTIDINE-CONTAINING PHOSPHOTRANSFER PROTEIN 1;
DSSP .......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA 21
ident |
Sbjct saaaalrdqltallssmfsqglvdeqfqqlqmlqdtpgfVSEVVTLFCDDADRIINEIAT 60
DSSP llhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllhHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhHH
Query TTAnvpPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVskapqlVPKLDEVYNAAYNAADHAapedKY 81
ident | | | |
Sbjct LLE...QPVVNFDKVDAYVHQLKGSSASVG......AQKVKFTCMQFRQFCQDK....SR 107
DSSP HHL...LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......LHHHHHHHHHHHHHHHLL....LH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHL..........lllllll
Query EAFVLHFSEALRIIAG..........tpevhav 104
ident
Sbjct DGCLMALAVVRNDFYDlrnkfqtmlqleqqiqa 140
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 23: 2CCYA MOLECULE: CYTOCHROME C;
DSSP ......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHL
Query ......ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAttanvppadkykTFEAAFTVSSKRNLADAVsKA 54
ident | | | |
Sbjct qskpedLLKLRQGLMQTLKSQWVPIAG...faagkadlpADAAQRAENMAMVAKLAP.IG 56
DSSP lllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH...hhlllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HH
DSSP LL......................hHHHHHHHHHH.hhhhhhllLHHHHHHHHHHHHHHH
Query PQ......................lVPKLDEVYNA.aynaadhaAPEDKYEAFVLHFSEA 91
ident | | |
Sbjct WAkgtealpngetkpeafgsksaefLEGWKALATEstklaaaakAGPDALKAQAAATGKV 116
DSSP HLllllllllllllhhhhlllhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhhhHLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHLLllllll
Query LRIIAGTpevhav 104
ident
Sbjct CKACHEE..fkqd 127
DSSP HHHHHHH..hlll
No 24: 2B0HA MOLECULE: TALIN-1;
DSSP .........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH........hllllLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .........ATTEeQKLIEDVNASFRAAMA........ttanvPPADKYKTFEAAFTVSS 43
ident |
Sbjct gidpftmgdPEGSfVDYQTTMVRTAKAIAVtvqemvtksntspEELGPLANQLTSDYGRL 60
DSSP lllllllllLHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHL.....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LHHH.........hHHHHHHH
Query KRNLADAVSKA.....PQLVPKLDEVYNAAYNAADHA..APED.........kYEAFVLH 87
ident | | | |
Sbjct ASQAKPAAVAAeneeiGAHIKHRVQELGHGCSALVTKagALQCspsdvytkkeLIECARR 120
DSSP HHHHHHHHLLLllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHHllllhhhhhhHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhhllllllll
Query FSEALRIiagtpevhav 104
ident ||
Sbjct VSEKVSHvlaalqagnr 137
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhll
No 25: 1ISEA MOLECULE: RIBOSOME RECYCLING FACTOR;
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL.................................
Query ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVP................................. 27
ident |
Sbjct ISDIRKDAEVRMDKCVEAFKTQISKIRtgraspslldgivveyygtptplrqlasvtved 60
DSSP LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllllhhhhllleeeelleeeehhhleeeeeee
DSSP ...................................................hHHHHHHHH
Query ...................................................pADKYKTFE 36
ident
Sbjct srtlkinvfdrsmspavekaimasdlglnpnsagsdirvplpplteerrkdlTKIVRGEA 120
DSSP lleeeeeellhhhhhhhhhhhhlllllllleellleeeeelllllhhhhhhhHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHH.................LLLHHHHHHHHHHHHhhhhhlllhhh
Query AAFTVSSKRNLADAVSK.................APQLVPKLDEVYNAAynaadhaaped 79
ident | || | | ||
Sbjct EQARVAVRNVGRDANDKvkallkdkeisedddrrSQDDVQKLTDAAIKK........iea 172
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH........hhh
DSSP HHHHhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query KYEAfvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct ALAD.............keaelmqf 184
DSSP HHHH.............hhhhhhhl
No 26: 1GQAA MOLECULE: CYTOCHROME C';
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......lLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhh
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT......aNVPPADKYKTFEAAFTVSSKRnLADAvsk 53
ident | | | |
Sbjct aDAEHVVEARKGYFSLVALEFGPLaamakgeMPYDAAAAKAHASDLVTLTKYdPSDL... 57
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLlHHHH...
DSSP LLLH..................hhhhhHHHHHHHH.........hhhllLHHHHHHHHHH
Query APQL..................vpkldEVYNAAYN.........aadhaAPEDKYEAFVL 86
ident |
Sbjct YAPGtsaddvkgtaakaaiwqdadgfqAKGMAFFEavaalepaagagqkELAAAVGKVGG 117
DSSP HLLLlllllllllllllhhhhlhhhhhHHHHHHHHhhhhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHhLLLLllll
Query HFSEALRIIaGTPEvhav 104
ident
Sbjct TCKSCHDDF.RVKR.... 130
DSSP HHHHHHHHH.LLLL....
No 27: 2BVLA MOLECULE: TOXIN B;
DSSP ...............lhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLlhhhHHHHHHHHHHHHHHH
Query ...............atteeQKLIEDVNASFRAAMAtTANVppadKYKTFEAAFTVSSKR 45
ident
Sbjct mslvnrkqlekmanvrfrtqEDEYVAILDALEEYHN.MSEN....TVVEKYLKLKDINSL 55
DSSP lllllhhhhhhhllllllllLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLL....LHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLH.......................
Query NLADAVSK....APQLVPKLDEVYNAAYNA.ADHAAP....................... 77
ident | |
Sbjct TDICIDTYkksgRNKALKKFKEYLVTEVLElKNNNLTpveknlhfvwiggqindtainyi 115
DSSP HHHHHHHLllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLEellleeeeelllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 77
ident
Sbjct nqwkdvnsdynvnvfydsnaflintlkktvvesaindtlesfrenlndprfdynkffrkr 175
DSSP hhhhhhlllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 77
ident
Sbjct meiiydkqknfinyykaqreenpeliiddivktylsneyskeidelntyieeslnkitqn 235
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 77
ident
Sbjct sgndvrnfgefkngesfnlyeqelverwnlaaasdilrisalkeiggmyldvdmlpgiqp 295
DSSP leeehhhlhhhhllllhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeeelllleellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 77
ident
Sbjct dlfesiekpssvtvdfwemtkleaimkykeyipeytsehfdmldeevqssfesvlasksd 355
DSSP lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhllhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ............HHHHH...........................................
Query ............EDKYE........................................... 82
ident |
Sbjct kseifsslgdmeASPLEvkiafnskgiinqglisvkdsycsnlivkqienrykilnnsln 415
DSSP hhhlllllllleELLLLleeeeelleeeeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...........................................................h
Query ...........................................................a 83
ident
Sbjct paisedndfntttntfidsimaeanadngrfmmelgkylrvgffpdvkttinlsgpeaya 475
DSSP hhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhllhhhlllllllllhhhhllhhhhh
DSSP hhhhhhhhhhhhhllLLLLL........................................
Query fvlhfsealriiagtPEVHA........................................ 103
ident
Sbjct aayqdllmfkegsmnIHLIEadlrnfeisktnisqsteqemaslwsfddarakaqfeeyk 535
DSSP hhhhhhhhlllllllLLLLHhhhhhhlllhhheellllhhhlllllllhhhhhhhhhhhh
DSSP .......l
Query .......v 104
ident
Sbjct rnyfegal 543
DSSP hhhhhlll
No 28: 2B64T MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvppadKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident | |
Sbjct rnlsalkrhrqslkRRLRNKAKKSAIKTLSKKAVQL....aqegKAEEALKIMRKAESLI 56
DSSP llllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....hhhlLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHH.HLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHHHhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query LADAVS.KAPQ.LVPKLDEVYNAAYNAADHAApeDKYEafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident | ||
Sbjct DKAAKGsTLHKnAAARRKSRLMRKVRQLLEAA..GAPL...............iggglsa 99
DSSP HHHLLLlLLLLlHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLL...............lllllll
No 29: 1YPYA MOLECULE: VIRION MEMBRANE PROTEIN;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL..........................lllhhHHHH
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAM.ATTA..........................nvppaDKYK 33
ident |
Sbjct .AASIQTTVNTLSERISSKLeQEANasaqtkcdieignfyirqnhgcnltvknmcsADAD 59
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHLLllllllllleeeeeeeeeeeleeeeeeelllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLHHHH...............hhhhhHHHHHHHHL..LL
Query TFEAAFTVSSKRNLADAVSkAPQLVPK...............ldevyNAAYNAADH..AA 76
ident | || |
Sbjct AQLDAVLSAATETYSGLTPeQKAYVPAmftaalniqtsvntvvrdfeNYVKQTCNSsaVV 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHLLLHhHHLLHHHhhhhhhllllllllhhhhhhHHHHHHLLLhhHH
DSSP HH.............................HHHHHHHHHHHHHHHHHHL......llll
Query PE.............................DKYEAFVLHFSEALRIIAG......tpev 101
ident |
Sbjct DNklkiqnviidecygapgsptnlefintgsSKGNCAIKALMQLTTKATTqiapkqvagt 179
DSSP LLllleeeeeeeeeelllllleeeeeeelllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhllleelle
DSSP lll
Query hav 104
ident
Sbjct gvq 182
DSSP ell
No 30: 1VS5T MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAnvppadKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident | | ||
Sbjct niksakkraiqsekARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIE....agDKAAAQKAFNEMQPIV 56
DSSP llllhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....llLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHLllHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query LADAVSKApqLVPKLDEVYNAAYNAADHAapedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident | |
Sbjct DRQAAKGL.iHKNKAARHKANLTAQINKL............................a 85
DSSP LLHHHLLL.lLLLHHHHHHHHHHHHHHLL............................l
No 31: 1SJ8A MOLECULE: TALIN 1;
DSSP ..............................................lhhhhhHHHHHHHH
Query ..............................................atteeqKLIEDVNA 14
ident
Sbjct ppltsaqqaltgtinssmqavqaaqatlddfetlpplgqdaaskawrknkmdESKHEIHS 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhhlhhhhhhhHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH.............hllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......L
Query SFRAAMA.............ttanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK.......A 54
ident | | | |
Sbjct QVDAITAgtasvvnltagdpaetdyTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALledeggnG 120
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhlllllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlllllL
DSSP LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLH.....hhhhHHHHHHHHHHHHHHHL............
Query PQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAP.....edkyEAFVLHFSEALRIIAG............ 97
ident | | | | |
Sbjct RPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPasaeprqnlLQAAGNVGQASGELLQqigesdtdphfq 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 97
ident
Sbjct dvlmqlanavasaaaalvlkaksvaqrtedsglqtqviaaatqcalstsqlvactkvvap 240
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ..................................................lllllll
Query ..................................................tpevhav 104
ident
Sbjct tisspvcqeqlveagrlvakavegcvsasqaatedgqllrgvgaaatavtqalnell 297
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 32: 2OOCA MOLECULE: HISTIDINE PHOSPHOTRANSFERASE;
DSSP ..............LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHhh
Query ..............ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANVPpaDKYKTFEAAFTVSSKrn 46
ident |
Sbjct gavdfaylegfaagDFAVVDEVLALFREQAALWAPXLDPTH..PGWKDAVHTVKGAAR.. 56
DSSP llllhhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL..LLHHHHHHHHHHHHH..
DSSP hhhhhhhlllhhhhhhhhHHHHHH...hhhllLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHLL.lll
Query ladavskapqlvpkldevYNAAYN...aadhaAPED.KYEAFVLHFSEALRIIAGT.pev 101
ident |
Sbjct ...............gvgAFNLGEvcerceagQESLeGVRTALDAALLDIAAYAHEqalr 101
DSSP ...............hhlLHHHHHhhhhhhllLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhh
DSSP lll
Query hav 104
ident
Sbjct slk 104
DSSP hhl
No 33: 2CMRA MOLECULE: TRANSMEMBRANE GLYCOPROTEIN;
DSSP ..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH................llllLHHHHHHHHHHHHHHH
Query ..ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT................tanvPPADKYKTFEAAFTVS 42
ident |
Sbjct mqLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQHLlqltvwgikqlqarilatwmEWDREINNYTSLIHSL 60
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhllhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH...........
Query SKRNLADAVSK............APQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE........... 78
ident | |
Sbjct IEESQNQQEKNeqellgqllsgiVQQQNNLLRAIEAQQHLLQLTvWGIKqlqarilwmew 120
DSSP HHHHHHHHHHHhhhhllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhhhhhlllhhh
DSSP .........................hhhhhhhhhhhhhhhHHHLL...............
Query .........................dkyeafvlhfsealrIIAGT............... 98
ident
Sbjct dreinnytslihslieesqnqqekneqelleggqllsgivQQQNNllraieaqqhllqlt 180
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ......llllll
Query ......pevhav 104
ident
Sbjct vwgikqlqaril 192
DSSP hhhhhhhhhhhl
No 34: 1SXJE MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct wvdkyrpkslnalshneeltnflkslsdqprdlphlllygpngtgkktrcmallesifgp 60
DSSP lllllllllhhhllllhhhhhhhhllllllllllleeeellllllhhhhhhlhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gvyrnvvsspyhleitpsndriviqellkevaqmeqrykcviineansltkdaqaalrrt 120
DSSP lllllleellleeeelllllhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellllllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mekysknirlimvcdsmspiiapiksqcllircpapsdseistilsdvvtneriqletkd 180
DSSP hhhlllleeeeeeelllllllhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlleelllh
DSSP ........................................lhhhhhhhhHHHH.......
Query ........................................atteeqkliEDVN....... 13
ident
Sbjct ilkriaqasngnlrvsllmlesmalnnelalkssspiikpdwiivihklTRKIvkersvn 240
DSSP hhhhhhhhhlllhhhhhhhhlhhhhlllleelllllllllhhhhhhhhhHHHHhhlllhh
DSSP ..hhhHHHH.HHLLLLlhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLLL.HHHHHHHHHHHHH
Query ..asfRAAM.ATTANVppadkykTFEAAFTVSSKRNLADavSKAPQ.LVPKLDEVYNAAY 69
ident || | | |
Sbjct sliecRAVLyDLLAHC......iPANIILKELTFSLLDV..ETLNTtNKSSIIEYSSVFD 292
DSSP hhhhhHHHHhHHHLLL......lLHHHHHHHHHHLLLLL..LLLLHhHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query NAADHAapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | |
Sbjct ERLSLG...NKAIFHLEGFIAKVMCCLD....... 317
DSSP HHHHLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHL.......
No 35: 1SUMB MOLECULE: PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU HOMOLOG
DSSP .......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.TANVPpadkyktfEAAFTVSSKRNLADAVS 52
ident | |
Sbjct nrllnekVEEFKKGVLKAGWFIEKMFRNSiSSLVErneslareVIADEEVVDQMEVEIQE 60
DSSP lllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HL.................lLHHHHHHH................hhhhhhhhhhllLHHH
Query KA.................pQLVPKLDE................vynaaynaadhaAPED 79
ident ||
Sbjct KAmevlglfspigkplltvtAGIRVAELieniadkchdiaknvlelmeepplkpleDIPA 120
DSSP HHhhhhhhhllllhhhhhhhHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..LLLL..................................
Query KYEAFVLHFSEALRIIAGTP..EVHA.................................. 103
ident ||| |
Sbjct MANQTSEMLKFALRMFADVNveKSFEvcrmdskvddlyekvreelllymmespkyvkral 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhHHLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhh
DSSP ...........................................l
Query ...........................................v 104
ident
Sbjct llleiagnieiiadyatnivevsvymvqgeaykcyhdelllfkk 224
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeelleeeelll
No 36: 1OEDB MOLECULE: ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN;
DSSP ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLlllhhhHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHH...
Query ...ATTEEQKLIEDVNASFRAA.MATTAnvppadKYKTfEAAFTVSSKRNLADAVSK... 53
ident
Sbjct plfYIVYTIIPCILISILAILVfYLPPD......AGEK.MSLSISALLAVTVFLLLLadk 53
DSSP llhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHH......LHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHhhh
DSSP ..............llLHHHHHHHHHHH.hhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query ..............apQLVPKLDEVYNA.aynaadhaapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGT 98
ident | |
Sbjct vpetslsvpiiirylmFIMILVAFSVILsvvvlnlhhrsaMVADRLFLYVFFVICSIGTF 113
DSSP hhhhhhhlllllllhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP ........llllll
Query ........pevhav 104
ident
Sbjct sifldashnvppdn 127
DSSP hhhhhhhhhlllll
No 37: 1HY5A MOLECULE: YERSINIA PESTIS VIRULENCE PROTEIN YOPE;
DSSP lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..llllLHHH.......hhhHHHHHHHHhhhhhhhhhh
Query aTTEEQKLIEDVNASFRAAMAT..tanvPPAD.......kykTFEAAFTVsskrnladav 51
ident |
Sbjct .TSFSDSIKQLAAETLPKYXQQlnsldaEXLQknhdqfatgsGPLRGSIT.......qcq 52
DSSP .LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllhHHHHhhhhhhllllLHHHHHHH.......hhh
DSSP hhlllHHHHHHHHHHHHHHhhHLLL..........................HHHHHHHHH
Query skapqLVPKLDEVYNAAYNaaDHAA..........................PEDKYEAFV 85
ident | | |
Sbjct glxqfCGGELQAEASAILN..TPVCgipfsqwgtiggaasayvasgvdltqAANEIKGLA 110
DSSP hhhhhLLHHHHHHHHHHHH..LEELleehhhhhllllhhhhhhllllllhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHhHHHHHHllllllll
Query LHFSeALRIIAgtpevhav 104
ident |
Sbjct QQXQ.KLLSLX........ 120
DSSP HHLH.HHHHHL........
No 38: 1FIOA MOLECULE: SSO1 PROTEIN;
DSSP ......LHHHHHHHHHHHHHHHHH.............hhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHH
Query ......ATTEEQKLIEDVNASFRA.............amattanVPPADKYKTFEAAFTV 41
ident | | | |
Sbjct mhdfvgFMNKISQINRDLDKYDHTinqvdslhkrlltevneeqaSHLRHSLDNFVAQATD 60
DSSP lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHH.............LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL............
Query SSKRNLADAVSK.............APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAA............ 76
ident | |
Sbjct LQFKLKNEIKSAqrdgihdtnkqaqAENSRQRFLKLIQDYRIVDSNYKeenkeqakrqym 120
DSSP HHHHHHHHHHHHhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................................hhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..........................................pedkyeafvlhfsealri 94
ident
Sbjct iiqpeatedeveaaisdvggqqifsqalleaktalaevqarhqellkleksmaeltqlfn 180
DSSP hhlllllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP hhllllllll
Query iagtpevhav 104
ident
Sbjct dmeelvieqq 190
DSSP hhhlllllll
No 39: 2J1PA MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
DSSP ........................................................LHHH
Query ........................................................ATTE 4
ident
Sbjct pisyiirkadsvnkaldsavplreplkiheaxrysllaggkrvrpvlciaacelvgGEES 60
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllLLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHH...................hhhHHHHHHHHHHHH
Query EQKLIEDVNASFRAAMATTANVPPAD...................kykTFEAAFTVSSKR 45
ident | | |
Sbjct LAXPAACAVEXIHTXSLIHDDLPCXDnddlrrgkptnhkvygedvavlAGDALLSFAFEH 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLllleelleelhhhhhlhhhhhhHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH.HLLL.HHHHHHHHHHHHHH..HHHL.LLHH.............hhhhHHHHH
Query NLADAVS.KAPQ.LVPKLDEVYNAAYN..AADH.AAPE.............dkyeAFVLH 87
ident | | | | |
Sbjct LASATSSeVSPArVVRAVGELAKAIGTegLVAGqVVDIsldlnnvglehlkfihlHKTAA 180
DSSP HHHHLLLlLLHHhHHHHHHHHHHHHLLllHHHHhHHLLlllhhhhhhhhhhhhhhHHLHH
DSSP HHHHHHHHHL..........lLLLLL..................................
Query FSEALRIIAG..........tPEVHA.................................. 103
ident || |
Sbjct LLEASAVLGGiigggsdeeieRLRKFarcigllfqvvddildvtkkltypklxgleksre 240
DSSP HHHHHHHHHHhhllllhhhhhHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ...................................l
Query ...................................v 104
ident
Sbjct faeklnteardqllgfdsdkvapllalanyianrqn 276
DSSP hhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhlll
No 40: 2D9DA MOLECULE: BAG FAMILY MOLECULAR CHAPERONE REGULATOR 5;
DSSP ...lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHH...
Query ...atTEEQKLIEDVNASFRAAMATTANV.PPADKYKTFEAAFTVSSKrNLADAVSK... 53
ident || | | | | |
Sbjct gssgsSGSILKIEKVLKRMREIKNELLQAqNPSELYLSSKTELQGLIG.QLDEVSLEknp 59
DSSP lllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHLLLllh
DSSP .LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query .APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident |
Sbjct cIREARRRAVIEVQTLITYIDLKES......................gpssg 89
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL......................lllll
No 41: 2D4XA MOLECULE: FLAGELLAR HOOK-ASSOCIATED PROTEIN 3;
DSSP ..........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.hllLLLHhHHHH
Query ..........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA.ttaNVPPaDKYK 33
ident |
Sbjct vvlsqaqaqnsqyalartfatqkvslEESVLSQVTTAIQTAQEKIVYagngTLSD.DDRA 59
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllLLLH.HHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH.........................................
Query TFEAAFTVSSKRNLADAVS......................................... 52
ident | |
Sbjct SLATDLQGIRDQLMNLANStdgngryifagykteaapfdqatggyhggeksvtqqvdsar 119
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllllllllllllllllllllllllllllleeeelllll
DSSP ......hllLHHH.................hHHHHHHHHHHH.....hhllLHHHHHHHH
Query ......kapQLVP.................kLDEVYNAAYNA.....adhaAPEDKYEAF 84
ident | | | | | |
Sbjct tmvightgaQIFNsitsnavpepdgsdseknLFVMLDTAIAAlktpvegnnVEKEKAAAA 179
DSSP eeeelllhhHHHLllllllllllllllllllHHHHHHHHHHHhlllllllhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHLL...............llllll
Query VLHFSEALRIIAGT...............pevhav 104
ident |
Sbjct IDKTNRGLKNSLNNvltvraelgtqlselstldsl 214
DSSP HHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
No 42: 2D4UA MOLECULE: METHYL-ACCEPTING CHEMOTAXIS PROTEIN I;
DSSP ........................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH..............
Query ........................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT.............. 22
ident | |
Sbjct gplgsgglffnalknckenftvlqTIRQQQSTLNGSWVALLQTRNTlnragirymmdqnn 60
DSSP llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhll
DSSP .llLLLHHHHHHHHHHHHHhHHHHHHHHHHHH..........lllHHHHHHHHHHHHHHH
Query .taNVPPADKYKTFEAAFTvSSKRNLADAVSK..........apqLVPKLDEVYNAAYNA 71
ident | | || | ||
Sbjct igsGSTVAELMESASISLK.QAEKNWADYEALprdprqstaaaaeIKRNYDIYHNALAEL 119
DSSP lllLLLHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHLlllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLL.LHHHhhhhhhHHHHHHHHHHHL...............lllllll
Query ADHA.APEDkyeafvLHFSEALRIIAG...............tpevhav 104
ident |
Sbjct IQLLgAGKI.neffdQPTQGYQDGFEKqyvaymeqndrlhdiavsdnna 167
DSSP HHHHhHLLH.hhhhhLLHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
No 43: 1WRDA MOLECULE: TARGET OF MYB PROTEIN 1;
DSSP ....LHHHhHHHHHHHHHHHHHHH..........hhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ....ATTEeQKLIEDVNASFRAAM..........attanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRN 46
ident || |
Sbjct gplgSEQI.GKLRSELEMVSGNVRvmsemltelvptqaepADLELLQELNRTCRAMQQRV 59
DSSP llllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhlllllllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHH....LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query LADAVSK....APQLVPKLDEVYNAAYNAADHAApedkyeafvlhfsealriiagtpevh 102
ident | |
Sbjct LELIPQIaneqLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFE.......................rfr 96
DSSP HHHHHHLllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.......................hhh
DSSP ll
Query av 104
ident
Sbjct tg 98
DSSP ll
No 44: 1SXJD MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct pwvekyrpknldevtaqdhavtvlkktlksanlphmlfygppgtgktstilaltkelygp 60
DSSP lhhhhlllllllllllllllhhhhhhhlllllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dlmksrilelnasdergisivrekvknfarltvskpskhdlenypcppykiiildeadsm 120
DSSP hhhllleeeelllllllhhhhllhhhhhhhlllllllllhhhhlllllleeeeellhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tadaqsalrrtmetysgvtrfclicnyvtriidplasqcskfrfkaldasnaidrlrfis 180
DSSP lhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhllhhhhhhleeeelllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ......................................................lhhhhh
Query ......................................................atteeq 6
ident
Sbjct eqenvkcddgvlerildisagdlrrgitllqsaskgaqylgdgknitstqveelagvvph 240
DSSP hlllllllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlllll
DSSP hhhHHHHH.........hhhhhhHHLLLLlhhhhhhHHHHhHHHHH.HHHHHHhhHHLLL
Query kliEDVNA.........sfraamATTANVppadkykTFEAaFTVSS.KRNLADavSKAPQ 56
ident
Sbjct dilIEIVEkvksgdfdeikkyvnTFMKSG......wSAAS.VVNQLhEYYITN..DNFDT 291
DSSP hhhHHHHHhhhlllhhhhhhhhhHHHHLL......lLLLL.HHHHHhHHHHHL..LLLLH
DSSP .HHHHHHHHHHHHHHHHHLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllll
Query .LVPKLDEVYNAAYNAADHAapeDKYEAFVLHFSEALRIIagtpevhav 104
ident |
Sbjct nFKNQISWLLFTTDSRLNNG...TNEHIQLLNLLVKISQL......... 328
DSSP hHHHHHHHHHHHHHHHHLLL...LLHHHHHHHHHHHHHHL.........
No 45: 1K04A MOLECULE: FOCAL ADHESION KINASE 1;
DSSP ............lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLLHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ............atteeqkliedvnasfraamattANVPPADKyKTFEAAFTVSSKRNLA 48
ident || ||
Sbjct eisppptanldrsndkvyenvtglvkaviemsskiQPAPPEEY.VPMVKEVGLALRTLLA 59
DSSP lllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLHHHH.HHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHL........lLHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLHH............HHHHHHHHH
Query DAVSKA........pQLVPKLDEVYNAAYNAADH.AAPE............DKYEAFVLH 87
ident
Sbjct TVDETIpllpasthrEIEMAQKLLNSDLGELINKmKLAQqyvmtslqqeykKQMLTAAHA 119
DSSP HHHHHHhhllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHhllllllhhhhhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHL......lllllll
Query FSEALRIIAG......tpevhav 104
ident
Sbjct LAVDAKNLLDvidqarlkmlgqt 142
DSSP HHHHHHHHHHhhhhhhhhhllll
No 46: 2Q80A MOLECULE: GERANYLGERANYL PYROPHOSPHATE SYNTHETASE;
DSSP .......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMA 21
ident |
Sbjct etvqrillepykyllqlpgkqvrtklsqafnhwlkvpedKLQIIIEVTEMLHNASLLIDD 60
DSSP llhhhhhlhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP H.lLLLL........hhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL..HHHHHHHHHHHHHH
Query T.tANVP........padkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVsKAPQ..LVPKLDEVYNAAYN 70
ident | |
Sbjct IedNSKLrrgfpvahsiygiPSVINSANYVYFLGLEKVL.TLDHpdAVKLFTRQLLELHQ 119
DSSP HhhLLLEelleelhhhhhlhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLllHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHH.lLLHH........hhhhhhhHHHHHHHHHHHL.............llLLLL.....
Query AAD.hAAPE........dkyeafvLHFSEALRIIAG.............tpEVHA..... 103
ident | | |
Sbjct GQGldIYWRdnytcpteeeykamvLQKTGGLFGLAVglmqlfsdykedlkpLLNTlglff 179
DSSP HHHhhHHHHhllllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhllllllllhhHHHHhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 103
ident
Sbjct qirddyanlhsksfcedltegkfsfptihaiwsrpestqvqnilrqrtenidikkycvhy 239
DSSP hhhhhhhhhhlllllhhhhhllllhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhh
DSSP .............................................l
Query .............................................v 104
ident
Sbjct ledvgsfeytrntlkeleakaykqidarggnpelvalvkhlskmfk 285
DSSP hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhllll
No 47: 2ACXA MOLECULE: G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR KINASE 6;
DSSP ...................................................lhhHHHHHH
Query ...................................................attEEQKLI 9
ident |
Sbjct karkgkskkwrqmlqfphisqceelrlslerdyhslcernpigrllfrefcatrPELSRC 60
DSSP lllllllllhhhhllllllhhhhhhhhhllllhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHHL...lLHHHHHHHHHH
Query EDVNASFRAAMATtanvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLAdaVSKA...pQLVPKLDEVYN 66
ident | | |
Sbjct VAFLDGVAEYEVT........PDDKRKACGRNLTQNFLS.hTGPDlipeVPRQLVTNCTQ 111
DSSP HHHHHHHHHHHLL........LLLLHHHHHHHHHHHHLL.lLLLLllllLLHHHHHHHHH
DSSP HHHHHhhlllhhhhhhhHHHHhHHHHHhHHLL............................
Query AAYNAadhaapedkyeaFVLHfSEALRiIAGT............................ 98
ident |
Sbjct RLEQG...........pCKDL.FQELTrLTHEylsvapfadyldsiyfnrflqwkwlerq 159
DSSP HHHHL...........lLLLL.LHHHHhHHHHhhllhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct pvtkntfrqyrvlgkggfgevcacqvratgkmyackklekkrikkrkgeamalnekqile 219
DSSP lllhhheeeeeeeeeelleeeeeeeellllleeeeeeeehhhhhhlllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct kvnsrfvvslayayetkdalclvltlmnggdlkfhiyhmgqagfpearavfyaaeiccgl 279
DSSP hlllllllleeeeeellleeeeeelllllllhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct edlhrerivyrdlkpenillddhghirisdlglavhvpegqtikgrvgtvgymapevvkn 339
DSSP hhhhhlleelllllhhheeellllleeelllllleelllllleelllllhhhllhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct erytfspdwwalgcllyemiagqspfqqrkkkikreeverlvkevpeeyserfspqarsl 399
DSSP leellhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct csqllckdpaerlgcrggsarevkehplfkklnfkrlgagmleppfkpdpqaiyceptdq 459
DSSP hhhhllllhhhlllllllhhhhhhllhhhllllhhhhhllllllllllllllllllhhhh
DSSP ..............................llllll
Query ..............................pevhav 104
ident
Sbjct dfyqkfatgsvpipwqnemvetecfqelnvfgldgs 495
DSSP hhhhhhlleelhhhhhhhhhhllhhhhhhlllllll
No 48: 1W36C MOLECULE: DNA HAIRPIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct mlrvyhsnrldvlealmefivererlddpfepemilvqstgmaqwlqmtlsqkfgiaani 60
DSSP leeeeeellhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleelllhhhhhhhhhhhhhllllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dfplpasfiwdmfvrvlpeipkesafnkqsmswklmtllpqlleredftllrhyltddsd 120
DSSP llllhhhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct krklfqlsskaadlfdqylvyrpdwlaqwetghlveglgeaqawqaplwkalveythqlg 180
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qprwhranlyqrfietlesattcppglpsrvficgisalppvylqalqalgkhieihllf 240
DSSP lllllllllhhhhhhhhhllllllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct tnpcryywgdikdpaylaklltrqrrhsfedrelplfrdsenagqlfnsdgeqdvgnpll 300
DSSP ellllllllllllhhhhllllllleellllllllllllhhhhlllllllllllllllhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aswgklgrdyiyllsdlessqeldafvdvtpdnllhniqsdilelenravagvnieefsr 360
DSSP hhhlhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sdnkrpldpldssitfhvchspqrevevlhdrllamleedptltprdiivmvadidsysp 420
DSSP lllleelllllllleeeeellhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhheeeeellhhhhhh
DSSP ......................lhhhhHHHHHHHHHHHHH....................
Query ......................atteeQKLIEDVNASFRA.................... 18
ident |
Sbjct fiqavfgsapadrylpyaisdrrarqsHPVLEAFISLLSLpdsrfvsedvlalldvpvla 480
DSSP hhhhhlllllllllllleelleelhhhLHHHHHHHHHLLHhhllllhhhhhhhlllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 18
ident
Sbjct arfditeeglrylrqwvnesgirwgidddnvrelelpatgqhtwrfgltrmllgyamesa 540
DSSP hhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP .................................hhhHLLLllhhhhhhhhhHHHHHHHHH
Query .................................amaTTANvppadkyktfeAAFTVSSKR 45
ident |
Sbjct qgewqsvlpydessgliaelvghlasllmqlniwrrGLAQ...erpleewlPVCRDMLNA 597
DSSP lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhHLLL...leehhhhlLHHHHHHHH
DSSP HHHhhHHHL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLHHHhhhHHHHHHHHHHHHhHLLL...
Query NLAdaVSKA.PQLVPKLDEVYNAAYNAADH..AAPEDkyeAFVLHFSEALRIiAGTP... 99
ident | |
Sbjct FFL..PDAEtEAAMTLIEQQWQAIIAEGLGaqYGDAVplsLLRDELAQRLDQ.ERISqrf 654
DSSP HLL..LLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllLLLEElhhHHHHHHHHHHHH.LEELlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct lagpvnictlmpmrsipfkvvcllgmndgvyprqlaplgfdlmsqkpkrgdrsrrdddry 714
DSSP llllleeellllllllleeeeeeelllllllllllllllllhhhhllllllllhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct lflealisaqqklyisyigrsiqdnserfpsvlvqelidyigqshylpgdealncdesea 774
DSSP hhhhhhhheeeeeeeeeelllllllllllllhhhhhhhhhhhlleellllllllhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct rvkahltclhtrmpfdpqnyqpgerqsyarewlpaasqagkahsefvqplpftlpetvpl 834
DSSP hhhhhhllllllllllhhhllllllllllhhhhhhhllllllllllllllllllllleeh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct etlqrfwahpvraffqmrlqvnfrtedseipdtepfileglsryqinqqllnalveqdda 894
DSSP hhhhhhlllhhhhhhhlllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct erlfrrfraagdlpygafgeifwetqcqemqqladrviacrqpgqsmeidlacngvqitg 954
DSSP hhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeeeeelleeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct wlpqvqpdgllrwrpsllsvaqgmqlwlehlvycasggngesrlflrkdgewrfpplaae 1014
DSSP eeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelhhhleeeellllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 99
ident
Sbjct qalhylsqliegyregmsapllvlpesggawlktcydaqndamldddstlqkartkflqa 1074
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhheelhhheelllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..........................................lllll
Query ..........................................evhav 104
ident
Sbjct yegnmmvrgegddiwyqrlwrqltpetmeaiveqsqrfllplfrfnq 1121
DSSP hllllllllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll
No 49: 1TUJA MOLECULE: ODORANT BINDING PROTEIN ASP2;
DSSP lhhHHHHHHHHHHH...................hhhhhhhhlllllhHHHHHHHHHHH..
Query attEEQKLIEDVNA...................sfraamattanvppADKYKTFEAAF.. 39
ident |
Sbjct ...IDQDTVVAKYMeylmpdimpcadelhisediatniqaakngadmSQLGCLKACVMkr 57
DSSP ...LLHHHHHHHHHhllhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllLLHHHHLLHHHhh
DSSP ..........hhHHHHHH.HHHHhHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHH.HHHHHHHHH
Query ..........tvSSKRNL.ADAVsKAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAAPE.DKYEAFVLH 87
ident | | |
Sbjct iemlkgtelyvePVYKMIeVVHA.GNADDIQLVKGIANECIENAKGETDEcNIGNKYTDC 116
DSSP llleelleellhHHHHHHhHHLL.LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHhhhllllllll
Query FSEALRiiagtpevhav 104
ident | |
Sbjct YIEKLF..........s 123
DSSP HHHHLL..........l
No 50: 1K9AA MOLECULE: CARBOXYL-TERMINAL SRC KINASE;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aswpsgteciakynfhgtaeqdlpfckgdvltivavtkdpnwykaknkvgregiipanyv 60
DSSP llllllleeeelllllllllllllllllleeeeeeellllleeeeellllleeeeehhhe
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qkregvkagtklslmpwfhgkitreqaerllyppetglflvrestnypgdytlcvscegk 120
DSSP eellllllllleellllllllllhhhhhhhllllllleeeeeellllllleeeeeellll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct vehyrimyhasklsideevyfenlmqlvehyttdadglctrlikpkvmegtvaaqdefyr 180
DSSP eeeeeeeeelleeelllllllllhhhhhhhhhhlllllllllleelllllleehhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct sgwalnmkelkllqtigkgefgdvmlgdyrgnkvavkcikndataqaflaeasvmtqlrh 240
DSSP llllllhhheeeeeeeeellleeeeeeeelleeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhllll
DSSP ......................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ......................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMAT 22
ident | |
Sbjct snlvqllgviveekgglyivteymakgslvdylrsrgrSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYL 300
DSSP llllleeeeeellllleeeeeellllllhhhhhhhhllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP L............................lLLLHH................HHHHHHHHH
Query T............................aNVPPA................DKYKTFEAA 38
ident |
Sbjct EgnnfvhrdlaarnvlvsednvakvsdfglTKEASklpvkwtapealrekkFSTKSDVWS 360
DSSP HhlleelllllhhheeellllleeelllllLEELLllllllllhhhhhlllLLHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHH.....................hhhhlLLHHHHHHHHHHHHHHhhHLLLh
Query FTVSSKRNLAD.....................avskaPQLVPKLDEVYNAAYNaaDHAAp 77
ident | | | ||
Sbjct FGILLWEIYSFgrvpypriplkdvvprvekgykmdapDGCPPAVYDVMKNCWH..LDAA. 417
DSSP HHHHHHHHHLLllllllllllllhhhhhhllllllllLLLLHHHHHHHHHHLL..LLHH.
DSSP hhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query edkyeAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident | | | |
Sbjct ...trPTFLQLREQLEHIRTH..elhl 439
DSSP ...hlLLHHHHHHHHHHHHHL..llll
No 51: 1EQ1A MOLECULE: APOLIPOPHORIN-III;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dapaggnafeemekhakefqktfseqfnslvnskntqdfnkalkdgsdsvlqqlsafsss 60
DSSP llllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ........LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.........LHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........ATTEeQKLIEDVNASFRAAMATTANV.........PPADKYKTFEAAFTVSS 43
ident | || |
Sbjct lqgaisdaNGKA.KEALEQARQNVEKTAEELRKAhpdvekeanAFKDKLQAAVQTTVQES 119
DSSP hhhhhlllLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhlllLLHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHH.......hLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query KRNLADAVS.......kAPQLVPKLDEVYNAAYNAADHAApedkyeafvlhfsealriia 96
ident |
Sbjct QKLAKEVASnmeetnkkLAPKIKQAYDDFVKHAEEVQKKL.................... 159
DSSP HHHHHHHHLllllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH....................
DSSP llllllll
Query gtpevhav 104
ident
Sbjct .heaatkq 166
DSSP .hhhllll
No 52: 1AX8A MOLECULE: OBESITY PROTEIN;
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL............................llLHHHhH
Query atteEQKLIEDVNASFRAAMATTA............................nvPPADkY 32
ident || |
Sbjct ....IQKVQDDTKTLIKTIVTRINdildfipglhpiltlskmdqtlavyqqiltSMPSrN 56
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhLLLLhH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL....hhhhhhhhhhhhhhhhhlLLHH.HHHHHHHHH
Query KTFEAAFTVSSKRNLADAVSKAPQ....lvpkldevynaaynaadhAAPE.DKYEAFVLH 87
ident | |
Sbjct VIQISNDLENLRDLLHVLAFSKSChlpeasgletldslggvleasgYSTEvVALSRLQGS 116
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllllhhhhhhhhllllLLHHhHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHLlllllll
Query FSEALRIIAGtpevhav 104
ident |
Sbjct LQDMLWQLDL...spgc 130
DSSP HHHHHHHHHH...llll
No 53: 2A0UA MOLECULE: INITIATION FACTOR 2B;
DSSP ....................................................LHHHH.HH
Query ....................................................ATTEE.QK 7
ident
Sbjct xskphhatlesikytpgslrlldqrklpletvfddvltvediwsaikexrvrGAPAIaVS 60
DSSP llllllllllleeeelleeeeelllllllllleeeellhhhhhhhhhlllllLHHHHhHH
DSSP HHHHHHHHHHHHH..HHLLlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHH
Query LIEDVNASFRAAM..ATTAnvppadKYKTFEAAFTVSSKRNLADaVSKAPQLVPKLDEVY 65
ident | | | |
Sbjct AALGIAVATQRKAanGELK......SGREVQTFLLTSCDFVXTS.RPTAVNLFNCLRDLK 113
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhLLLL......LHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLLLHHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHhlllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........................
Query NAAYNAAdhaapEDKYEAFVLHFSEALRIIAGT........................... 98
ident | |
Sbjct AQVDKLD....pTKAAAEVAQAFVELAEAVYTNdvafnegixrhgaahilaaakaegrdk 169
DSSP HHHHHLL....lLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct vsilticntgalatsrygtalgvvrqlfydgklervyacetrpwnqgarltvyecvqedi 229
DSSP eeeeellllllllllllllhhhhhhhhhhllleeeeeeellllllhhhhlhhhhhhhlll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct pctlicdgaasslxlnrkidavvvgadricqngdtankigtynlavsakfhgvklyvaap 289
DSSP leeeelhhhhhhhhhhlllleeeellleellllleeeellhhhhhhhhhhlllleeeell
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct tttldvktasgnhveieerepteittnlvtkqrvvadgphlsiwnpvfditpselitggi 349
DSSP hhhlllllllhhhllllllllhhhhllllllllllllllleeelllleeeelhhhlllee
DSSP ...................llllll
Query ...................pevhav 104
ident
Sbjct itekgvqapaasapyydiasiiaqa 374
DSSP elllleellllllllllhhhhhhll
No 54: 1HTJF MOLECULE: KIAA0380;
DSSP ...........................LHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHlllllhhhHHH
Query ...........................ATTEeqKLIEDVNASFRAAMATtanvppadKYK 33
ident |
Sbjct esdiifqdleklksrpahlgvflryifSQAD..PSPLLFYLCAEVYQQA........SPK 50
DSSP lhhhhhhlhhhhhhlhhhhhhhhhhhhHHLL..LHHHHHHHHHHHHLLL........LLL
DSSP HHHHHHHHHHHHH....HHHHhhhlllhhhHHHH.HHHHHHHHhhlllhhhhhhHHHHHH
Query TFEAAFTVSSKRN....LADAvskapqlvpKLDE.VYNAAYNAadhaapedkyeAFVLHF 88
ident | |
Sbjct DSRSLGKDIWNIFleknAPLR........vKIPExLQAEIDSR......lrnseDARGVL 96
DSSP HHHHHHHHHHHHHllllLLLL........lLLLHhHHHHHHHH......hhlllLLHHHH
DSSP HHHHHHHHL...................................................
Query SEALRIIAG................................................... 97
ident ||
Sbjct CEAQEAAXPeiqeqihdyrtkrtlglgslygendlldldgdplrerqvaekqlaalgdil 156
DSSP HHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhlllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...................lllllll
Query ...................tpevhav 104
ident
Sbjct sayaadrsapxdfalntyxshagirl 182
DSSP hlllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll
No 55: 1EYSM MOLECULE: PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER;
DSSP ...............................................lhhhhhhhhHHHH
Query ...............................................atteeqkliEDVN 13
ident
Sbjct peyqniftavqvrapaypgvplpkgnlprigrpifsywlgkigdaqigpiylgltgTLSI 60
DSSP llllllllllleelllllllllllllllllllllllllhhhhlllllllllllhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHLLLL...................................lhhHHHHHHHHH
Query ASFRAAMATTANV...................................ppaDKYKTFEAA 38
ident |
Sbjct FFGLVAISIIGFNmlasvhwdvfqflkhffwlgleppppqyglripplsegGWWLIAGLF 120
DSSP HHHHHHHHHHHHHhhhlllllhhhhhhhhhhlllllllhhhllllllhhhlHHHHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHL......LLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL....LHHHHHH.....
Query FTVSSKRNLADAVSKA......PQLVPKLDEVYNAAYNA.ADHA....APEDKYE..... 82
ident | | | |
Sbjct LTLSILLWWVRTYKRAealgmsQHLSWAFAAAIFFYLVLgFIRPvmmgSWAKAVPfgifp 180
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHhLHHHhhhlLHHHLLLllllh
DSSP ............hhhhhhhhhhhhhhlLLLL.............................
Query ............afvlhfsealriiagTPEV............................. 101
ident
Sbjct hldwtaafsirygnlyynpfhmlsiafLYGSallfamhgatilsvsrfggdreidqithr 240
DSSP hhhhhhhhhhhlllhhhlhhhhhhhhhHHHHhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 101
ident
Sbjct gtaaegaalfwrwtmgfnatmesihrwawwcavltvitagigillsgtvvdnwylwavkh 300
DSSP lhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhl
DSSP ...............lll
Query ...............hav 104
ident
Sbjct gmapaypevvtavnpyet 318
DSSP llllllllllllllllll
No 56: 1DG3A MOLECULE: PROTEIN (INTERFERON-INDUCED GUANYLATE-BINDING
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hmtgpmclientngrlmanpealkilsaitqpmvvvaivglyrtgksylmnklagkkhtk 60
DSSP llllleeeeeeelleeeelhhhhhhhhhlllleeeeeeellhhhlhhhhhhhhlllllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct giwmwcvphpkkpghilvlldteglgdvekgdnqndswifalavllsstfvynsigtinq 120
DSSP eeeeeeeellllllleeeeeeeellllllllllllhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qamdqlyyvtelthrirsksdsadfvsffpdfvwtlrdfsldlqpltpdeyltyslklkk 180
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhllllllhhhhhhllleeeeeeellllllllllhhhhhhhhlllll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct gtsqkdetfnlprlcirkffpkkkcfvfdrpvheldpefvqqvadfcsyifsnsktktls 240
DSSP lllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleel
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ggiqvngprleslvltyvnaissgdlpcmenavlalaqiensaavqkaiahyeqqmgqkv 300
DSSP lleellhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
DSSP ...........................................................l
Query ...........................................................a 1
ident
Sbjct qlpteslqelldlhrdsereaievfirssfkdvdhlfqkelaaqlekkrddfckqnqeas 360
DSSP llllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hHLLLllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhHHLL.LHH
Query TTEEQKLIEDVNASFRAAM..aTTANvppADKYKTFEAAFTVSSKRNLADavSKAP.QLV 58
ident | | | | |
Sbjct SDRCSGLLQVIFSPLEEEVkagIYSK...PGGYRLFVQKLQDLKKKYYEE..PRKGiQAE 415
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLLlLHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHlllhhhHHHH...................................
Query PKLDEVYNAAYNAADhaapedKYEA................................... 83
ident | |
Sbjct EILQTYLKSKESMTD......AILQtdqtltekekeievervkaesaqasakmlhemqrk 469
DSSP HHHHHHHHHHHHHHH......HHHHhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ..................................................hhhhhhhhhh
Query ..................................................fvlhfsealr 93
ident
Sbjct neqmmeqkersyqehlkqltekmendrvqllkeqertlalklqeqeqllkegfqkesrim 529
DSSP hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhh
DSSP hhhllllllll
Query iiagtpevhav 104
ident
Sbjct kneiqdlqtkm 540
DSSP hhhhhhhhhhl
No 57: 1BCCC MOLECULE: UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE;
DSSP ..........................LHHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLHH....
Query ..........................ATTEEqKLIEDVNASFRAAMATT.ANVPPA.... 29
ident |
Sbjct apnirkshpllkminnslidlpapsnISAWW.NFGSLLAVCLMTQILTGlLLAMHYtadt 59
DSSP llllllllllhhhhllllllleeellLLHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLllll
DSSP ..................hhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLLH........hHHHHH
Query ..................dkykTFEAAFTVSSKRNLADAVsKAPQL........vPKLDE 63
ident
Sbjct slafssvahtcrnvqygwlirnLHANGASFFFICIFLHIG.RGLYYgsylyketwNTGVI 118
DSSP llhhhhhhhhhhllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLLlhhhlhhhhHHHHH
DSSP HHHHHHHHHH..............................................llLH
Query VYNAAYNAAD..............................................haAP 77
ident |
Sbjct LLLTLMATAFvgyvlpwgqmsfwgatvitnlfsaipyightlvewawggfsvdnptltRF 178
DSSP HHHHHHHHHHllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllllhhhhhHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......................................
Query EDKYEAFVLHFSEALRIIAGT....................................... 98
ident |
Sbjct FALHFLLPFAIAGITIIHLTFlhesgsnnplgissdsdkipfhpyysfkdilgltlmltp 238
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllllllllllllleeellllhhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct fltlalfspnllgdpenftpanplvtpphikpewyflfayailrsipnklggvlalaasv 298
DSSP hhhhhhhlllllllhhhhlllllllllllllllhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 98
ident
Sbjct lilflipflhkskqrtmtfrplsqtlfwllvanlliltwigsqpvehpfiiigqmaslsy 358
DSSP hhhhlhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhh
DSSP ...............llllll
Query ...............pevhav 104
ident
Sbjct ftillilfptigtlenkmlny 379
DSSP hhhhhlhhhhhhhhhhhllll
No 58: 1AU1A MOLECULE: INTERFERON-BETA;
DSSP .LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL..................................
Query .ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATTAN.................................. 25
ident | |
Sbjct mSYNLLGFLQRSSNFQCQKLLWQLNGrleyclkdrmnfdipeeikqlqqfqkedaaltiy 60
DSSP lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLlllhhhhhlllllllhhhhhlllllhhhhhhhhh
DSSP ..............lLHHHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLH.........hhhhh
Query ..............vPPADkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSkAPQL.........vpkld 62
ident |
Sbjct emlqnifaifrqdssSTGW.nETIVENLLANVYHQINHLKT.VLEEklekedftrgklms 118
DSSP hhhhhhhhhhllllhHHLL.lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHhhllllllllllll
DSSP hhhhhhhhhhHLLL..........hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllllll
Query evynaaynaaDHAA..........peDKYEAFVLHFSEALRIIAGtpevhav 104
ident | |
Sbjct slhlkryygrILHYlkakeyshcawtIVRVEILRNFYFINRLTGY....lrn 166
DSSP hhhhhhhhhhHHHHhhhllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....lll
No 59: 2IAKA MOLECULE: BULLOUS PEMPHIGOID ANTIGEN 1, ISOFORM 5;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct qirkpllksslldqnlteeevnmfvqdllnwvdemqvqldrtewgsdlpsveshlenhkn 60
DSSP lllllllhhhhllllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhh
DSSP .................................................lhhhhhHHHHH
Query .................................................atteeqKLIED 11
ident
Sbjct vhraieefesslkeakiseiqmtaplklsytdklhrlesqyakllntsrnqerhlDTLHN 120
DSSP hhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhHHHHH
DSSP HHHHHHH.........hhhhllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLHHHH
Query VNASFRA.........amattanvPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKA..PQLVPK 60
ident |
Sbjct FVTRATNeliwlnekeesevayhaELMRELEQKEESIKAVQEIAEQLLLENHpaRLTIEA 180
DSSP HHHHHHHhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllHHHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHLLLHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query LDEVYNAAYNAADHAAPedkyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct YRAAMQTQWSWILQLCQ........................... 197
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHL...........................
No 60: 2IAEA MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 2A 65 KDA
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ddslypiavlidelrnedvqlrlnsikklstialalgvertrsellpfltdtiydedevl 60
DSSP lllllllllllllllllllhhhhhhhhlhhhllllllllhhhhlllllllllllllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lalaeqlgtfttlvggpeyvhcllppleslatveetvvrdkaveslraishehspsdlea 120
DSSP hhhhhhhhhlllllllhhhllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhll
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct hfvplvkrlaggdwftsrtsacglfsvcyprvssavkaelrqyfrnlcsddtpmvrraaa 180
DSSP lhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhh
DSSP .......lhHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHLllllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHh
Query .......atTEEQKLI.EDVNASFRAAMATTanvppadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVs 52
ident | | |
Sbjct sklgefakvLELDNVKsEIIPMFSNLASDEQ.........DSVRLLAVEACVNIAQLLP. 230
DSSP hlhhhhhllLLHHHHHhLHHHHHHHHHLLLL.........HHHHHHHHHHHHHHLLLLL.
DSSP hlLLHHHH.HHHHHHHHHHhhhlllhhhHHHH............................
Query kaPQLVPK.LDEVYNAAYNaadhaapedKYEA............................ 83
ident | |
Sbjct ..QEDLEAlVMPTLRQAAE........dKSWRvrymvadkftelqkavgpeitktdlvpa 280
DSSP ..LLLLLLlLLHHHHHHHH........lLLHHhhhhhhllhhhhhhhhlhhhhhhlhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct fqnlmkdceaevraaashkvkefcenlsadcrenvimtqilpcikelvsdanqhvksala 340
DSSP hhhhlllllhhhhhhhhllhhhhhhlllllhhhhhhhhllhhhhhhhllllllllhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct svimglspilgkdntiehllplflaqlkdecpevrlniisnldcvnevigirqlsqsllp 400
DSSP hhhllhhhhhllhhhhhhlhhhhhhhhllllhhhhhhhhlllhhhhhhllhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct aivelaedakwrvrlaiieympllagqlgveffdeklnslcmawlvdhvyaireaatsnl 460
DSSP hhhhhlllllhhhhhhhhllhhhhllllllllhhhhlhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 83
ident
Sbjct kklvekfgkewahatiipkvlamsgdpnylhrmttlfcinvlsevcgqdittkhmlptvl 520
DSSP hhhllllllllllllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhh
DSSP ..........................................hhhhhhhhhhhhhlllll
Query ..........................................fvlhfsealriiagtpev 101
ident
Sbjct rmagdpvanvrfnvakslqkigpildnstlqsevkpilekltqdqdvdvkyfaqealtvl 580
DSSP hhlllllhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhlllllhhhhhllllllllhhhhllhhhhhl
DSSP lll
Query hav 104
ident
Sbjct sla 583
DSSP lll
No 61: 2I0MA MOLECULE: PHOSPHATE TRANSPORT SYSTEM PROTEIN PHOU;
DSSP ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLL..hhhhhHHHHHHhHHHHHHHHHHHHHH
Query ....ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATT.ANVP..padkyKTFEAAfTVSSKRNLADAVSK 53
ident |
Sbjct qfdlELHELEQSFLGLGQLVLETASKAlLALAskdkemaELIINK.DHAINQGQSAIELT 59
DSSP lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHlllhhhhHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHH
DSSP LL...............lHHHHHHHHHH................................
Query AP...............qLVPKLDEVYN................................ 66
ident
Sbjct CArllalpqvsdlrfvisIMSSCSDLERmgdhmagiakavlqlkenqlaeeqlhqmgkls 119
DSSP HHhhlllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhh
DSSP ...............................................hhhhhhhllLHHH
Query ...............................................aaynaadhaAPED 79
ident
Sbjct lsmladllvafplhqaskaisiaqkdeqidqyyyalskeiiglmkdqesipngtqyLYII 179
DSSP hhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhHHHH
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....LLLLll
Query KYEAFVLHFSEALRIIAGT.....PEVHav 104
ident
Sbjct GHLERFADYIANICERLVYletgeLVDL.. 207
DSSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhllLLLL..
No 62: 2D2CA MOLECULE: CYTOCHROME B6;
DSSP ................lhhhhhHHHHHHHHHHHHHHH.HLLL..................
Query ................atteeqKLIEDVNASFRAAMA.TTAN.................. 25
ident | | | |
Sbjct eiqaladdvtskyvpphvnifyCLGGITLTCFLIQFAtGFAMtfyykptvteayasvqyi 60
DSSP llllllllllllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHHhHHHLlllllllllllhhhhhhh
DSSP ....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH............lLLHHHHHHHHHHHHH
Query ....vPPADKYKTFEAAFTVSSKRNLADAVSK............aPQLVPKLDEVYNAAY 69
ident |
Sbjct mnevsFGWLIRSIHRWSASMMVLMMILHVFRVyltggfkkpreltWISGVILAVITVSFG 120
DSSP hhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllllllllllllLHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHHHLLLH........................................hhhhHHHHHHHH
Query NAADHAAP........................................edkyEAFVLHFS 89
ident |
Sbjct VTGYSLPWdqvgywavkivsgvpeaipvvgvlisdllrggssvgqatltryySAHTFVLP 180
DSSP HHHLLLLLllhhhhlllllllhhhlllhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhHHHHLLHH
DSSP HHHHHHHLL.......llllll
Query EALRIIAGT.......pevhav 104
ident
Sbjct WLIAVFMLLhflmirkqgisgp 202
DSSP HHHHHHHHHhhhhlllllllll
No 63: 2BG9E MOLECULE: ACETYLCHOLINE RECEPTOR PROTEIN, ALPHA CHAIN;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct neegrliekllgdydkrikpaktldhvidvtlkltltnlislnekeealttnvwieiqwn 60
DSSP llhhhhhhhhhhhlllllllllllllllleeeeeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct dyrlswntseyegidlvripsellwlpdvvlennvdgqfevayyanvlvyndgsmywlpp 120
DSSP lhhhllllllllllllllllhhhllllleeelllllllllllllllleelllleeeelle
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct aiyrstcpiavtyfpfdwqncslvfrsqtynahevnlqlsaeegidpedftengewtirh 180
DSSP eeeeellllllllllllllllleeeeellllllllleelllllllhhhllllllleeeee
DSSP .................................LHHHHHHHHHHHHHHHHH..hHHHLLl
Query .................................ATTEEQKLIEDVNASFRA..aMATTAn 25
ident |
Sbjct rpakknynwqltkddidfqeiiffliiqrkplfYIINIIAPCVLISSLVVLvyfLPAQA. 239
DSSP lllleellllllllllllleeeelleeeellllLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhHHHHL.
DSSP llhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....................llhHHHHHHHH
Query vppadkyKTFEAAFTVSSKRNLADAVSKA....................pqlVPKLDEVY 65
ident |
Sbjct ......gGQKCTLSISVLLAQTIFLFLIAqkvpetslnvpligkylifvmfvSLVIVTNC 293
DSSP ......lHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhHHHHHHHH
DSSP HHHHHHhHLLL...............................HHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query NAAYNAaDHAA...............................PEDKYEAFVLHFSEALRI 94
ident | |
Sbjct VIVLNVsLRTPnthscveacnfiakstkeqndsgsenenwvlIGKVIDKACFWIALLLFS 353
DSSP HHHHHHlLLLLllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HHLLL.......lllll
Query IAGTP.......evhav 104
ident
Sbjct LGTLAifltghlnqvpe 370
DSSP HHHHHhhhhhhhhhlll
No 64: 256BA MOLECULE: CYTOCHROME B562;
DSSP lhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHhHLLL....
Query atTEEQKLIEDVNASFRAAMATTanvppadkyktfEAAFTVSSKRNLADAVsKAPQ.... 56
ident | | | | | |
Sbjct ..ADLEDNMETLNDNLKVIEKAD...........nAAQVKDALTKMRAAAL.DAQKatpp 46
DSSP ..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........lHHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLlllh
DSSP ..............hhHHHHHHHHHHHH...hhhlllhhHHHHHHHhHHHHHHHHHHLLL
Query ..............lvPKLDEVYNAAYN...aadhaapeDKYEAFVlHFSEALRIIAGTP 99
ident | |
Sbjct kledkspdspemkdfrHGFDILVGQIDDalklanegkvkEAQAAAE.QLKTTRNAYHQKY 105
DSSP hhlllllllhhhhhhhHHHHHHHHHHHHhhhhhhlllhhHHHHHHL.HHHHHHHHHHHHH
DSSP lllll
Query evhav 104
ident
Sbjct ....r 106
DSSP ....l
No 65: 1TD6A MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MG237 HOMOLOG;
DSSP ................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllh
Query ................................ATTEEQKLIEDVNASFRAAMATtanvpp 28
ident
Sbjct pnqfvnhlsalkkhfasykelreafndyhkhnGDELTTFFLHQFDKVMELVKQK...... 54
DSSP lllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......
DSSP hhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHhHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLHHH........
Query adkyktFEAAFTVSSKRNLADaVSKAPQLVPKLDEVYNAAYNA.ADHAAPED........ 79
ident || ||
Sbjct ......DFKTAQSRCEEELAA.PYLPKPLVSFFQSLLQLVNHDlLEQQNAALaslpaaki 107
DSSP ......LHHHHHHHHHHHLLL.LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhHHHHLHHHhhllhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct ielvlqdypnklnmihyllpktkafvkphllqrlqfvltdsellelkrfsffqalnqipg 167
DSSP hhhhhllllllhhhhhhllllllllllhhhhhhlhhhhllllllhhhhhhhhhhhlllhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 79
ident
Sbjct fqgeqveyfnsklkqkftltlgefeiaqqpdakayfeqlitqiqqlflkepvnaefanei 227
DSSP hllleeeeeelllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhh
DSSP ..................................hhhhhhhhhhhhhhhhhllllllll
Query ..................................kyeafvlhfsealriiagtpevhav 104
ident
Sbjct idaflvsyfplhppvplaqlaakiyeyvsqivlneavnlkdeliklivhtlyeqldrpv 286
DSSP hhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhlllllllll
No 66: 1SXJB MOLECULE: ACTIVATOR 1 95 KDA SUBUNIT;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lqlpwvekyrpqvlsdivgnketidrlqqiakdgnmphmiisgmpgigkttsvhclahel 60
DSSP llllhhhhlllllhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lgrsyadgvlelnasddrgidvvrnqikhfaqkklhlppgkhkivildeadsmtagaqqa 120
DSSP hhhhhhhheeeelllllllhhhhhlhhhhhhhlllllllllleeeeeelhhhllhhhhhl
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct lrrtmelysnstrfafacnqsnkiieplqsqcailrysklsdedvlkrllqiikledvky 180
DSSP lhhhhhhlllleeeeeeellhhhllhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhllll
DSSP ..........................................lhhhhhhhhHHHHH....
Query ..........................................atteeqkliEDVNA.... 14
ident |
Sbjct tndgleaiiftaegdmrqainnlqstvaghglvnadnvfkivdsphplivkKMLLAsnle 240
DSSP lhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhllllhhhhhHHHLLllhh
DSSP hHHHHHHH..LLLLlhhHHHHhhhhhhhHHHHHHhHHHHhhlLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query sFRAAMAT..TANVppaDKYKtfeaaftVSSKRNlADAVskaPQLVPKLDEVYNAAYNAA 72
ident | | |
Sbjct dSIQILRTdlWKKG...YSSIdivttsfRVTKNL.AQVK...ESVRLEMIKEIGLTHMRI 293
DSSP hHHHHHHHllLLLL...LLHHhhhhhhhHHHHLL.LLLL...HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSSP HLLlhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLllllll
Query DHAapeDKYEAFVLHFSEALRIIAGTpevhav 104
ident
Sbjct LEG...VGTYLQLASMLAKIHKLNNK...... 316
DSSP HLL...LLLHHHHHHHHHHHHHHLLL......
No 67: 1JR3A MOLECULE: DNA POLYMERASE III SUBUNIT GAMMA;
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct yqvlarkwrpqtfadvvgqehvltalanglslgrihhaylfsgtrgvgktsiarllakgl 60
DSSP lllhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhh
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ncetgitatpcgvcdncreieqgrfvdlieidaasrtkvedtrdlldnvqyapargrfkv 120
DSSP llllllllllllllhhhhhhhllllllleeeelllllllllhhhhhhhllllllllllee
DSSP ............................................................
Query ............................................................ 0
ident
Sbjct ylidevhmlsrhsfnallktleeppehvkfllattdpqklpvtilsrclqfhlkaldveq 180
DSSP eeeelhhhllhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellhhhllhhhhllleeeelllllhhh
DSSP .......................................................lhhh