DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1K47D MOLECULE: PHOSPHOMEVALONATE KINASE;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1K47-A 53.8  0.3  322   322  100   PHOSPHOMEVALONATE KINASE;                                  "         
   2:  1PIE-A 28.2  2.5  288   388   18   GALACTOKINASE;                                             "         
   3:  1VIS-A 28.0  2.8  279   314   20   MEVALONATE KINASE;                                         "         
   4:  1S4E-A 28.0  2.7  278   337   19   GALACTOKINASE;                                             "         
   5:  1WUU-A 27.1  2.7  282   391   16   GALACTOKINASE;                                             "         
   6:  2OI2-A 27.0  3.9  278   285   16   MEVALONATE KINASE;                                         "         
   7:  2HFS-A 27.0  3.2  283   326   16   MEVALONATE KINASE, PUTATIVE;                               "         
   8:  2AJ4-A 27.0  2.7  292   509   14   GALACTOKINASE;                                             "         
   9:  2A2C-A 26.7  2.9  288   446   13   N-ACETYLGALACTOSAMINE KINASE;                              "         
  10:  1KVK-A 26.0  3.5  287   378   19   MEVALONATE KINASE;                                         "         
  11:  1FWK-A 22.3  2.8  273   296   16   HOMOSERINE KINASE;                                         "         
  12:  2HK2-A 20.8  3.3  274   331    8   DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE;                         "         
  13:  2GS8-A 20.5  3.3  272   316   14   MEVALONATE PYROPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    "         
  14:  1FI4-A 20.3  3.4  283   391    8   MEVALONATE 5-DIPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    "         
  15:  2HKE-A 19.1  3.6  278   377   10   DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE, PUTATIVE;               "         
  16:  2V2Q-A 16.4  3.3  240   269   13   4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 "         
  17:  1UEK-A 15.9  3.7  245   268   13   4-(CYTIDINE 5'-DIPHOSPHO)-2C-METHYL-D-ERYTHRITOL           "         
  18:  1MG7-A 15.8  3.0  240   351   10   EARLY SWITCH PROTEIN XOL-1 2.2K SPLICE FORM;               "         
  19:  1OJ4-A 15.7  3.6  246   283   13   4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 "         
  20:  1Y5Y-A  5.9  3.1   85   159    2   FORMALDEHYDE-ACTIVATING ENZYME FAE;                        "         
  21:  1VS5-I  5.0  5.5  102   127   16   16S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  22:  2NN6-B  4.9  3.5  100   235    9   POLYMYOSITIS/SCLERODERMA AUTOANTIGEN 1;                    "         
  23:  1MLA-A  4.9  3.7  116   305    7   MALONYL-COENZYME A ACYL CARRIER PROTEIN                    "         
  24:  2BOA-A  4.8  3.3   72   404   14   CARBOXYPEPTIDASE A4;                                       "         
  25:  1JQG-A  4.8  3.2   71   409   11   CARBOXYPEPTIDASE A;                                        "         
  26:  1VIX-A  4.7 12.6   99   411   10   PEPTIDASE T;                                               "         
  27:  1KWM-A  4.7  3.6   70   402    7   PROCARBOXYPEPTIDASE B;                                     "         
  28:  2UUU-A  4.6  9.2   97   550    5   ALKYLDIHYDROXYACETONEPHOSPHATE SYNTHASE;                   "         
  29:  2JE6-A  4.6  3.7   91   274   10   EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE 2;                             "         
  30:  1R43-A  4.6 15.8  110   438    6   BETA-ALANINE SYNTHASE;                                     "         
  31:  1CG2-A  4.5 16.0  114   389    9   CARBOXYPEPTIDASE G2;                                       "         
  32:  1S1H-I  4.3  6.9   99   139   11   18S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  33:  2D1C-A  4.2  4.9  118   495    9   ISOCITRATE DEHYDROGENASE;                                  "         
  34:  1YSJ-A  4.2 10.4   98   359    6   PROTEIN YXEP;                                              "         
  35:  1XHK-A  4.2  4.2  108   185    9   PUTATIVE PROTEASE LA HOMOLOG;                              "         
  36:  1PHZ-A  4.2  7.2   78   403   10   PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       "         
  37:  1P9Q-C  4.2 13.6   83   230   10   HYPOTHETICAL PROTEIN AF0491;                               "         
  38:  1Q8I-A  4.1  8.0   80   707    5   DNA POLYMERASE II;                                         "         
  39:  2Q43-A  3.8 15.1  101   375    4   IAA-AMINO ACID HYDROLASE ILR1-LIKE 2;                      "         
  40:  1M5H-A  3.8  6.5   84   297    2   FORMYLMETHANOFURAN--TETRAHYDROMETHANOPTERIN                "         
  41:  2E1R-A  3.6 13.9   94   828   10   ELONGATION FACTOR 2;                                       "         
  42:  1Z1W-A  3.6  4.3  154   780    5   TRICORN PROTEASE INTERACTING FACTOR F3;                    "         
  43:  1T1E-A  3.5  5.7   76   534    4   KUMAMOLISIN;                                               "         
  44:  1JK9-B  3.5  3.1   67   243    9   SUPEROXIDE DISMUTASE;                                      "         
  45:  1HI9-A  3.5  9.2   85   274    8   DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA;                          "         
  46:  2GIF-A  3.4  4.3  114  1032   11   ACRIFLAVINE RESISTANCE PROTEIN B;                          "         
  47:  2C5S-A  3.4  2.7   65   372    8   PROBABLE THIAMINE BIOSYNTHESIS PROTEIN THII;               "         
  48:  1VK3-A  3.4  6.9   94   586    3   PHOSPHORIBOSYLFORMYLGLYCINAMIDINE SYNTHASE II;             "         
  49:  1VGY-A  3.4 13.3  114   375    7   SUCCINYL-DIAMINOPIMELATE DESUCCINYLASE;                    "         
  50:  1QAX-A  3.4 16.8   96   425    8   PROTEIN (3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARYL-COENZYME A             "         
  51:  1M1G-A  3.4  2.7   66   240    8   TRANSCRIPTION ANTITERMINATION PROTEIN NUSG;                "         
  52:  2POK-A  3.3 11.4  112   458    6   PEPTIDASE, M20/M25/M40 FAMILY;                             "         
  53:  1UDN-A  3.3  3.5  102   254    8   RIBONUCLEASE PH;                                           "         
  54:  2AWZ-A  3.1  5.1  103   557   13   GENOME POLYPROTEIN;                                        "         
  55:  2PHC-B  3.0  3.3   62   215    8   UNCHARACTERIZED PROTEIN PH0987;                            "         
  56:  2PFD-A  3.0  6.9   82   540    6   FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     "         
  57:  1OZ9-A  3.0  2.8   73   141   16   HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1354;                              "         
  58:  1F0X-A  3.0  8.1   86   502    5   D-LACTATE DEHYDROGENASE;                                   "         
  59:  2E1P-A  2.9  2.8   58   395    7   TK-SUBTILISIN;                                             "         
  60:  2BDP-A  2.9  6.3  109   580    7   PROTEIN (DNA POLYMERASE I);                                "         
  61:  2AKW-B  2.9 14.6   92   785    9   PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN;                  "         
  62:  1TVI-A  2.9  3.4   93   150   11   HYPOTHETICAL UPF0054 PROTEIN TM1509;                       "         
  63:  1VBK-A  2.8  3.9   65   307   14   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1313;                               "         
  64:  2BMB-A  2.7  3.4   66   513   12   FOLIC ACID SYNTHESIS PROTEIN FOL1;                         "         
  65:  2B5J-A  2.6  7.9   85   552    8   REVERSE TRANSCRIPTASE P66 SUBUNIT;                         "         
  66:  2PKE-A  2.5 11.3  106   233    8   HALOACID DELAHOGENASE-LIKE FAMILY HYDROLASE;               "         
  67:  2GHP-A  2.5  3.1   62   232    8   U4/U6 SNRNA-ASSOCIATED SPLICING FACTOR PRP24;              "         
  68:  1J8B-A  2.5  2.2   45    92    9   YBAB;                                                      "         
  69:  2F7V-A  2.4 10.4   98   360    7   AECTYLCITRULLINE DEACETYLASE;                              "         
  70:  2B4V-A  2.4 11.8   83   437    4   RNA EDITING COMPLEX PROTEIN MP57;                          "         
  71:  1O4U-A  2.4  2.9   63   265    8   TYPE II QUINOLIC ACID PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE;           "         
  72:  1JIH-A  2.4  6.0   81   509    5   DNA POLYMERASE ETA;                                        "         
  73:  1DII-A  2.4  2.6   57   515    5   P-CRESOL METHYLHYDROXYLASE;                                "         
  74:  2F48-A  2.3  5.0   96   551   10   DIPHOSPHATE--FRUCTOSE-6-PHOSPHATE 1-                       "         
  75:  1S5J-A  2.3  6.4   70   727    7   DNA POLYMERASE I;                                          "         
  76:  1GEH-A  2.3  2.8   65   427    9   RIBULOSE-1,5-BISPHOSPHATE CARBOXYLASE/OXYGENASE;           "         
  77:  1D8Y-A  2.3  7.4  121   601    2   DNA POLYMERASE I;                                          "         
  78:  2BWJ-A  2.2  3.6   58   196    9   ADENYLATE KINASE 5;                                        "         
  79:  1F5Q-B  2.2  4.0   81   247    6   CYCLIN DEPENDENT KINASE 2;                                 "         
  80:  2AQ4-A  2.1  7.5   89   428    3   5'-D(*AP*TP*CP*CP*TP*CP*CP*CP*CP*TP*AP*C)-3';              "         
  81:  2AJ6-A  2.1  4.0   57   120    7   HYPOTHETICAL PROTEIN MW0638;                               "         
  82:  1YZF-A  2.1  2.9   62   195    6   LIPASE/ACYLHYDROLASE;                                      "         
  83:  1ST6-A  2.1  4.5  105  1049   10   VINCULIN;                                                  "         
  84:  1SQB-B  2.1  4.9   85   425    4   UBIQUINOL-CYTOCHROME C REDUCTASE COMPLEX CORE              "         
  85:  1N52-A  2.1 10.6   80   732   11   80 KDA NUCLEAR CAP BINDING PROTEIN;                        "         
  86:  1RUS-A  2.0  3.0   65   437    8   RUBISCO (RIBULOSE-1,5-BISPHOSPHATE                         "         
  87:  1P74-A  2.0  3.9   77   267    8   SHIKIMATE 5-DEHYDROGENASE;                                 "         
-

No 1: 1K47A  MOLECULE: PHOSPHOMEVALONATE KINASE;                                  

DSSP  LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELLLLEEEEELLLLHHHHH
Query HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSDSYRIYSDXNPDYSLIQ   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSDSYRIYSDXNPDYSLIQ   60
DSSP  LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELLLLEEEEELLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query ETIALXGDFLAVRGQNLRPFSLAIYGKXEREGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVD  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ETIALXGDFLAVRGQNLRPFSLAIYGKXEREGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVD  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLLHHHHHHLLL
Query QNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFDRQKVAAWLEEENLATVLERDW  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct QNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFDRQKVAAWLEEENLATVLERDW  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLLHHHHHHLLL


DSSP  LLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLLLHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query GFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNINQNFLTSSKETVVSLVEALEQGK  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNINQNFLTSSKETVVSLVEALEQGK  240
DSSP  LLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLLLLLEEEEEELLHH
Query SEKIIEQVEVASKLLEGLSTDIYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAQ  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SEKIIEQVEVASKLLEGLSTDIYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAQ  300
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLLLLLEEEEEELLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL
Query STKTLKNRWADLGIELLYQERI  322
ident ||||||||||||||||||||||
Sbjct STKTLKNRWADLGIELLYQERI  322
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL


No 2: 1PIEA  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  .................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEEEEEEEEEEEEEEEL
Query .................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALIKDIPIYXRAEIAFS   43
ident                           |     ||              | |         
Sbjct tvlsaltekfaevfgdtKEVEYFFSPGRINLIGEHTDYNG.GYVFPASITIGTTGLARLR   59
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLLL.LEEEEEEEEEEEEEEEEEL


DSSP  L..LLEEEEELL...................LLHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLLEEE
Query D..SYRIYSDXN...................PDYSLIQETIALXGDFLAvrgQNLRPFSL   82
ident        ||                               |                | |
Sbjct EdkKVKLYSENFpklgviefdldevekkdgeLWSNYVKGMIVMLKGAGY...EIDKGFEL  116
DSSP  LllEEEEEELLLhhhlleeeellllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLLLEEE


DSSP  EEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLL
Query AIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKR.GDNGSX  141
ident  | |         || || |   ||   |  | || |    |  |         | |   
Sbjct LIKGEI...PTASGLSSSASLELLVGVVLDDLFNLNVPRLELVQLGQKTENDYiGVNSGI  173
DSSP  EEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhhhhhllhhhhhhlllLLEEEELLLLLL.LEEEE
Query GDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwGFSISQVKPTLE.CDFLV  197
ident  |   |                                          |   |   |   
Sbjct LDQFAIGFGEvkkAIELDCN......................TLKYEMVPVELRdYDIVI  211
DSSP  HHHHHHHHLLlleEEEEELL......................LLLEEEEELLLLlEEEEE


DSSP  EELLLLL.lLLHHHHHHHLLL......................................L
Query GWTKEVA.vSSHXVQQIKQNI......................................N  218
ident   |                                                         
Sbjct MNTNKPRalTESKYNERFAETrealkrmqtrldiqslgelsneefdantdligdetlikR  271
DSSP  EELLLLLllLLHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllhhhllhhhhhhlhhhlllhhhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL.LLLL
Query QNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQLKEA.SQDL  277
ident                 |   |   |  |        |           |  | |      
Sbjct ARHAVYENNRTKIAQKAFVAGNLTKFGELLNASHASLKDDYE.VTGLELDTLAETaQKQA  330
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLL


DSSP  LE.EEEELLLLLLLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHL.......LLEEeEEEE.......l
Query QA.VAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADL.......GIELlYQER.......i  322
ident     |   ||| | | |||                             |           
Sbjct GVlGARMTGAGFGGCAIALVAHD.NVSAFRKAVGQVyeevvgyPASF.YVAQigsgstkl  388
DSSP  LEeEEEELLLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHhhhhhllLLEE.EELLllllllll


No 3: 1VISA  MOLECULE: MEVALONATE KINASE;                                         

DSSP  llLEEEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL..LLEEEEELL.....
Query hxXIAVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYSDXN.....   53
ident        |  |    || |    |  |    |      ||                    
Sbjct ..SLIIETPSKVILFGEHAVVY.GYRAISMAIDLTSTIEIKETQedEIILNLNDLnkslg   57
DSSP  ..LEEEEEEEEEEEELLLHHHH.LLEEEEEEEEEEEEEEEEELLllEEEEEELLLleeee


DSSP  ..............lLHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL.LEEEEEELHHhhlLLLLLLL
Query ..............pDYSLIQETIALXGDFLAvrgQNLR.PFSLAIYGKXereGKKFGLG   98
ident                |       |    | |          |   |  |        |||
Sbjct lnlneikninpnnfgDFKYCLCAIKNTLDYLN...IEPKtGFKINISSKI...PISCGLG  111
DSSP  eelllhhhllhhhlhHHHHHHHHHHHHHHHHL...LLLLlLEEEEEEELL...LLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLlLHHHHHHHHLLLEEEEL
Query SSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKR.GDNGsXGDLACIAAEDLVLYQS  157
ident || |      ||    ||         ||   |     |      |   |          
Sbjct SSASITIGTIKAVSGFYNKELKDDEIAKLGYMVEKEIqGKAS.ITDTSTITYKGILEIKN  170
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL.LHHHHHHHHLLEEEEEL


DSSP  llhhhhhhhhhhllhhhhhhllllLEEEEL...LLLL..LLEEEEEELLLLLLL.LHHHH
Query fdrqkvaawleeenlatvlerdwgFSISQV...KPTL..ECDFLVGWTKEVAVS.SHXVQ  211
ident                                         | ||              | 
Sbjct ........................NKFRKIkgeFEEFlkNCKFLIVYAEKRKKKtAELVN  206
DSSP  ........................LEEEELlhhHHHHhhLLLEEEEEEELLLLLhHHHHH


DSSP  HHHLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHH
Query QIKQN.INQNFLTSSKETVVSLVEAleqGKSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQL  270
ident                                |           ||  |   | || |   
Sbjct EVAKIeNKDEIFKEIDKVIDEALKI...KNKEDFGKLMTKNHELLKKLN..ISTPKLDRI  261
DSSP  HHHLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHH


DSSP  HHLLLLLLEEEEELLLLLLLEEEEEELLhHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..el
Query KEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDaQSTKTLKNRWADLGIELLYQE..ri  322
ident           ||  ||||| | | |       | |                   
Sbjct VDIGNRFGFGAKLTGAGGGGCVIILVNE.EKEKELLKELNKEDVRIFNCRmmne  314
DSSP  HHHHHHHLLEEEEELLLLLEEEEEELLL.LLHHHHHHHHHLLLLEEEEELllll


No 4: 1S4EA  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  llleEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEEEEEEEEEEEEeeelLLLEEEEELL.......
Query hxxiAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALIKDIPIYXRAEiafsDSYRIYSDXN.......   53
ident      ||  |     ||              |  |        |    ||          
Sbjct ....TVKSPGRVNLIGEHTDYTY.GYVXPXAIDLYTIIT....DKVQLYSEHFnekldlt   51
DSSP  ....LEEEEEEEELLLLLLHHHL.LEELEEEEEEEEEEL....LLLLLLLLLLlllllll


DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEeEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query ...pDYSLIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSlAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKA  110
ident                                  | |         || || |  |     
Sbjct kegsWIDYVKGVLWVLIQEGY....KIGGLK.KITGDL...PLGAGLSSSASFEVGILEV  103
DSSP  llllLHHHHHHHHHHHHHLLL....LLLLLL.LEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhh
Query LLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLK.RGDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaaw  166
ident |  ||||  |      |         |      |                          
Sbjct LNQLYNLNIDPLKKALLAKKAENEfVGVPCGILDQFAVVFGKkdnVIFLDTQ........  155
DSSP  HHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLLLHHHHHHHHLLlleEEEEELL........


DSSP  hhhllhhhhhhlllLLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLL.LLLHHHHHHHLLL........
Query leeenlatvlerdwGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVA.VSSHXVQQIKQNI........  217
ident                              ||  |       |      |           
Sbjct ..............TLQYEYIPFPKDVSVLVFYTGVKReLASSEYAERKRIAeeslrilg  201
DSSP  ..............LLEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELlLHHHHHHHHHHHHhhhhhhhl


DSSP  .....................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .....................NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLE  256
ident                                 |     ||  |  ||       |   | 
Sbjct kesskevtekdlgklpplhrkFFSYIVRENARVLEVRDALKEGDIEKVGKILTTAHWDLA  261
DSSP  lllhhhllhhhhhlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLlLLLHHHHHHHHLLLLLLE.EEEELLLLLLLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL..
Query GLSTdIYTPLLRQLKEASQDLQA.VAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG..  313
ident           |         | |  |   ||| |   |||       ||           
Sbjct ENYR.VSCEELDFFVKKAXELGAyGARLTGAGFGGSAIALVDKD.KAKTIGDAILREYla  319
DSSP  HLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLLlEEEELLLLLEEEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  .....LEEEEEE....el
Query .....IELLYQE....ri  322
ident                   
Sbjct kfswkAKYFVVKpsdgvg  337
DSSP  hllllLEEEEELllllll


No 5: 1WUUA  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  ...........................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEEEEEE
Query ...........................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALIKDIP   33
ident                                ||   |     ||        | |     
Sbjct hhaalrqpqvaellaearrafreefgaEPELAVSAPGRVNLIGEHTDYNQ.GLVLPXALE   59
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEEEELLLLHHHL.LEEEEEEEE


DSSP  EEEEEEEEELL..LLEEEEE........................lllLHHHHHHHHHHHh
Query IYXRAEIAFSD..SYRIYSD........................xnpDYSLIQETIALXg   67
ident                                                        |    
Sbjct LXTVLVGSPRKdgLVSLLTTsegadepqrlqfplptaqrslepgtprWANYVKGVIQYY.  118
DSSP  EEEEEEEEEELllEEEEEELlllllllleeeeelllllllllllllhHHHHHHHHHHHL.


DSSP  HHHHhllllLLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHH
Query DFLAvrgqnLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKL  127
ident          |  ||              || || |  |     |  |   |         
Sbjct PAAP.....LPGFSAVVVSSV...PLGGGLSSSASLEVATYTFLQQLCPDSGTIAARAQV  170
DSSP  LLLL.....LLEEEEEEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLL.LLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhhhhhllhhhhhhlllLLE
Query TSAVLLKR.GDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwGFS  183
ident          |      |             |                             
Sbjct CQQAEHSFaGXPCGIXDQFISLXGQkghALLIDCR......................SLE  208
DSSP  HHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHLLlleEEEEELL......................LLL


DSSP  EEELLLLLL.LEEEEEELLLLLLLLhHHHHHHLLL.........................
Query ISQVKPTLE.CDFLVGWTKEVAVSShXVQQIKQNI.........................  217
ident  | |         |         ||                                   
Sbjct TSLVPLSDPkLAVLITNSNVRHASS.EYPVRRRQCeevaralgkeslrevqleeleaard  267
DSSP  EEEEELLLLlEEEEEEEEEEELLLL.LHHHHHHHHhhhhhhllllllllllhhhhllhhh


DSSP  ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHH
Query ........NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQ  269
ident                          ||  |               |         | | |
Sbjct lvskegfrRARHVVGEIRRTAQAAAALRRGDYRAFGRLXVESHRSLRDDYE.VSCPELDQ  326
DSSP  hllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHH


DSSP  HHHLL.LLLLE.EEEELLLLLLLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHL...LLEEeEEEE...
Query LKEAS.QDLQA.VAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADL...GIELlYQER...  321
ident | ||             | | | |   |                         |      
Sbjct LVEAAlAVPGVyGSRXTGGGFGGCTVTLLEAS.AAPHAXRHIQEHyggTATF.YLSQaad  384
DSSP  HHHHHhLLLLEeEEEELLLLLEEEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHlllLLEE.EEELlll


DSSP  ......l
Query ......i  322
ident        
Sbjct gakvlcl  391
DSSP  lleelll


No 6: 2OI2A  MOLECULE: MEVALONATE KINASE;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEE.EEEEEEEEELLLLEeeeelllLHHH.
Query hXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIP.IYXRAEIAFSDSYRiysdxnpDYSL.   58
ident           |    || |    |  |                  |              
Sbjct .KVGVGQAHSKIILIGEHAVVY.GYPAISLPLLeVEVTCKVVPAESPW.....rlYEEDt   53
DSSP  .LLEEEEEEEEEEEELLLHHHH.LLLEEEEEEEeEEEEEEEEELLLLL.....llLLLLh


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhllLLLLLEEEEEElhhhhlLLLLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query IQETIALXGDFLAvrgQNLRPFSLAIYgkxereGKKFGLGsSGSVVVLVVKALLALYNLS  118
ident            |             |        |      |         |    |   
Sbjct LSMAVYASLEYLN...ITEACIRCEID......EKRGMGS.SAAISIAAIRAVFDYYQAD  103
DSSP  HHHHHHHHHHHHL...LLLLLEEEEEL......LLHHHLL.HHHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhhhllhhhhhhl
Query VDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeenlatvler  178
ident      |  |          | |  |                                   
Sbjct LPHDVLEILVNRAEMIAHMNPSGLDAKTCLSDQPIRFIKN....................  143
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHLLLLLEEEELL....................


DSSP  lllLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLLLHHHHHHHLLL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query dwgFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNI..NQNFLTSSKETVVSLVEAL  236
ident             |        |          |           ||    |       | 
Sbjct ...VGFTELEMDLSAYLVIADTGVYGHTREAIQVVQNKGkdALPFLHALGELTQQAEIAI  200
DSSP  ...LEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHLHhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLLLLEEEEELLLLLLLEEEEE
Query EQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQLKEA.SQDLQAVAKSSGAGGGDCGIAL  295
ident  |   |        |   |              | |         || || | | | |||
Sbjct SQKDAEGLGQILSQAHLHLKEIG..VSSLEADSLVETaLSHGALGAKMSGGGLGGCIIAL  258
DSSP  HLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEELLLLLLEEEEE


DSSP  ELLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL
Query SFDAQSTKTLKNRWADLGIELLYQERI  322
ident          |  |    |      |  
Sbjct VTNLTHAQELAERLEEKGAVQTWIESL  285
DSSP  ELLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEL


No 7: 2HFSA  MOLECULE: MEVALONATE KINASE, PUTATIVE;                               

DSSP  .....LLLE..EEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEEEEEEEEEEEL..LLLE.EEE
Query .....HXXI..AVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIPIYXRAEIAFS..DSYR.IYS   50
ident                 ||    ||      |  |    |  |                  
Sbjct xskpvKSKTtgKNIGYGKVILFGEHFVVH.GAEAIVAGISEYTECRLEINpgVPGLqVDD   59
DSSP  lllllLLLLllLLEEEEEEEEELLLHHHH.LLLEEEEEEEEEEEEEEEEEllLLLEeEEE


DSSP  E...........lLLLHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLH
Query D...........xNPDYSLIQETIALXGDflavrgqnlRPFSLAIYGKXereGKKFGLGS   99
ident                     |                       | |         | | 
Sbjct QrpaipgyiaqkrDEQIKAHQLVLDHLKV.....dlsgDGLKXFIGGPL...VPSSGIGA  111
DSSP  LllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLL.....llllLEEEEEEELLL...LLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLL
Query SGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFD  159
ident | | ||    ||  || |                      |  |        | ||    
Sbjct SASDVVAFSRALSELYQLNLTDEEVNLSAFVGEGGYHGTPSGADNTAATYGGLILYRRQN  171
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLEEEEEEELL


DSSP  hhhhhhhhhhllhhhhhhlllLLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLLLHHHHHHHLLL..
Query rqkvaawleeenlatvlerdwGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNI..  217
ident                                      |  |   |     |         
Sbjct ....................gKSVFKPIAFQQRLYLVVVGTGINASTAKVVNDVHKXKqq  211
DSSP  ....................lLEEEEEELLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL
Query ....NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQLKEA  273
ident                |    |||  |              |            |      
Sbjct qpvqFKRLYDNYTHIVSQAREALQKGDLQRLGQLXNANHDLCRQID..VSCRELESIVQT  269
DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHH


DSSP  .LLLLLEEEEELLLLLLLEEEEEELLHHHHHHHHHHHH.HLLL..EEEEEE....el
Query .SQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAQSTKTLKNRWA.DLGI..ELLYQE....ri  322
ident         || || | |    ||                                  
Sbjct cRTYGALGAKLSGTGRGGIAVALAASSDQRDAIVKGLKaKCPEakFIWRYTvqpsaa  326
DSSP  hHHLLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHhHLLLllEEEEEEelllll


No 8: 2AJ4A  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  .................................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEE
Query .................................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLA   27
ident                                           |     ||          
Sbjct vivpefnssaelprplaekcpsiikkfisaydaKPDFVARSPGRVNLIGEHIDYCD.FSV   59
DSSP  lllleelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEEEELLLLHHHL.LLL


DSSP  EEEEEEEEEEEEEEELL....LLEEEE.ELLL......................LHHHHH
Query LIKDIPIYXRAEIAFSD....SYRIYS.DXNP......................DYSLIQ   60
ident |   |                |      |                               
Sbjct LPLAIDFDMLCAVKVLNeknpSITLINaDPKFaqrkfdlpldgsyvtidpsvsdWSNYFK  119
DSSP  EEEEEEEEEEEEEEEELllllEEEEEElLLLLlleeeellllllllllllllllHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLL......LLLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ETIALXGDFLAVRGQ......NLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLAL  114
ident         ||            |        |         || ||      |  |    
Sbjct CGLHVAHSFLKKLAPerfasaPLAGLQVFCEGDV...PTGSGLSSSAAFICAVALAVVKA  176
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLHhhhlllLLLEEEEEEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LL...LLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLLhhhhhhhhh
Query YN...LSVDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFDrqkvaawle  168
ident             |   |       | |    | |                          
Sbjct NMgpgYHMSKQNLMRITVVAEHYVGVNNGGMDQAASVCGEedhALYVEFKP.........  227
DSSP  HHlllLLLLHHHHHHHHLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLlllEEEEELLL.........


DSSP  hllhhhhhhlllLLEEEELLLLL....LLEEEEEELLLLL...lLLHHH.HHHHLLL...
Query eenlatvlerdwGFSISQVKPTL....ECDFLVGWTKEVA...vSSHXV.QQIKQNI...  217
ident                    |       |  |    |  |                     
Sbjct ............QLKATPFKFPQlknhEISFVIANTLVVSnkfeTAPTNyNLRVVEVtta  275
DSSP  ............LLEEEEELLLLllllEEEEEEEELLLLLllllLLLLLhHHHHHHHhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  217
ident                                                             
Sbjct anvlaatygvvllnkgnlrdfmnvyyaryhnistpwngdiesgierltkmlvlveeslan  335
DSSP  hhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........................................NQNFLTSSKETVVSLVEALE  237
ident                                               |    |   |    
Sbjct kkqgfsvddvaqslncsreeftrdylttspvrfqvlklyqRAKHVYSESLRVLKAVKLMT  395
DSSP  hlllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  H.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL.LLLLLEEEEELLLLLLLE
Query Q.....gKSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQLKEA.SQDLQAVAKSSGAGGGDC  291
ident                          |      |                    ||| | |
Sbjct TftadedFFKQFGALMNESQASCDKLYE.CSCPEIDKICSIaLSNGSYGSRLTGAGWGGC  454
DSSP  LlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLLLLEEEELLLLLLLE


DSSP  EEEEELLH..HHHHHHHHHHHHLLL.............eEEEEEE.........l
Query GIALSFDA..QSTKTLKNRWADLGI.............eLLYQER.........i  322
ident    |            |   |                                  
Sbjct TVHLVPGGpnGNIEKVKEALANEFYkvkypkitdaelenAIIVSKpalgsclyel  509
DSSP  EEEEEEELllLLHHHHHHHHHHHLHhhhlllllhhhhhhHEEEELllllleeeel


No 9: 2A2CA  MOLECULE: N-ACETYLGALACTOSAMINE KINASE;                              

DSSP  ...............................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEE
Query ...............................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALI   29
ident                                     |   |     ||          | 
Sbjct atespatrrvqvaehprllklkemfnskfgsIPKFYVRAPGRVNIIGEHIDYCG.YSVLP   59
DSSP  lllllleeeelhhhlhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEEEELLLLHHHL.LLLEE


DSSP  EEEEEEEEEEEEELL..LLEEEE.ELLL................LHHHHHHHHHHHHHHH
Query KDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYS.DXNP................DYSLIQETIALXGDFL   70
ident                                                             
Sbjct MAVEQDVLIAVEPVKtyALQLANtNPLYpdfstsannidktkplWHNYFLCGLKGIQEHF  119
DSSP  EEEEEEEEEEEEELLllLEEEEElLLLLlleeelllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  HHllLLLLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHH
Query AVrgQNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSA  130
ident      ||        |         || ||   |       |           |      
Sbjct GL..SNLTGMNCLVDGNI...PPSSGLSSSSALVCCAGLVTLTVLGRNLSKVELAEICAK  174
DSSP  LL..LLLLLEEEEEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhhhhhllhhhhhhlllLLEEEEL
Query VLLKRGDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwGFSISQV  187
ident      |  |   |             |                                |
Sbjct SERYIGTEGGGMDQSISFLAEegtAKLIEFS......................PLRATDV  212
DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLlllEEEEELL......................LLEEEEE


DSSP  LLLLLLEEEEEELLLLL..llLHHHHHHHLLL............................
Query KPTLECDFLVGWTKEVA..vsSHXVQQIKQNI............................  217
ident |      |                                                    
Sbjct KLPSGAVFVIANSCVEMnkaaTSHFNIRVMECrlaakllakykslqwdkvlrleevqakl  272
DSSP  LLLLLEEEEEEELLLLLlhhhLLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhh


DSSP  .......................................................LHHHH
Query .......................................................NQNFL  222
ident                                                             
Sbjct gisleemllvtedalhpepynpeeicrclgisleelrtqilspntqdvlifklyqRAKHV  332
DSSP  lllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhlllhhhlllllllhhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHL...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL.LLLLL
Query TSSKETVVSLVEALEQG...KSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQLKEA.SQDLQ  278
ident  |    |       |           |                  | | ||         
Sbjct YSEAARVLQFKKICEEApenMVQLLGELMNQSHMSCRDMYE.CSCPELDQLVDIcRKFGA  391
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLLL


DSSP  EEEEELLLLLLLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLLL..eEEEEEE..........l
Query AVAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLGI..eLLYQER..........i  322
ident       ||| | |                           |               
Sbjct QGSRLTGAGWGGCTVSMVPAD.KLPSFLANVHKAYYqkqSLFATKpgggalvllea  446
DSSP  LEEEELLLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHlllLEEEELllllleeeeel


No 10: 1KVKA  MOLECULE: MEVALONATE KINASE;                                         

DSSP  ..LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL..LLEEEEELL...
Query ..HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYSDXN...   53
ident        |   ||    || |    |  ||                              
Sbjct mlSEVLLVSAPGKVILHGEHAVVH.GKVALAVALNLRTFLVLRPQSngKVSLNLPNVgik   59
DSSP  llLLLEEEEEEEEEEEELLLHHHH.LLLEEEEEEEEEEEEEEEELLllEEEEEELLLlee


DSSP  ............................lLHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLLEEEEEE
Query ............................pDYSLIQETIALXGDFLAvRGQNLRPFSLAIY   85
ident                                        |           |        
Sbjct qvwdvatlqlldteklkkvaglprdcvgnEGLSLLAFLYLYLAICR.KQRTLPSLDIMVW  118
DSSP  eeeehhhhhlllllhhhhhhlllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLLEEEEEE


DSSP  LHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL...............LLHHHHHHHHHH
Query GKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLS...............VDQNLLFKLTSA  130
ident           |||||    | |  |||                      |     |    
Sbjct SEL...PPGAGLGSSAAYSVCVAAALLTACEEVtnplkdrgsigswpeEDLKSINKWAYE  175
DSSP  ELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhhllleelllhHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELllhhhhhhhhhhllhhhhhhllllLEEEEL.LL
Query VLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSfdrqkvaawleeenlatvlerdwgFSISQV.KP  189
ident        | |  |           ||                            |     
Sbjct GERVIHGNPSGVDNSVSTWGGALRYQQ........................GKMSSLkRL  211
DSSP  HHHHHHLLLLLHHHHHHHHLLEEEELL........................LLEEELlLL


DSSP  LLlLEEEEEELLLLLLLLHHHHHHHLLL......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL....
Query TLeCDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNI......NQNFLTSSKETVVSLVEALEQG....  239
ident       |   ||        |                 |||           |       
Sbjct PA.LQILLTNTKVPRSTKALVAGVRSRLikfpeiMAPLLTSIDAISLECERVLGEMaaap  270
DSSP  LL.EEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHhhlhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllll


DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLLLLLEEEEEE
Query ...KSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALS  296
ident          |        |  |        | ||           |  ||||| ||| | 
Sbjct vpeQYLVLEELMDMNQHHLNALG..VGHASLDQLCQVTAAHGLHSKLTGAGGGGCGITLL  328
DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLLEEEEEE


DSSP  LL...HHHHHHHHHHHHHLLLEEeEEEE......................l
Query FD...AQSTKTLKNRWADLGIELlYQER......................i  322
ident             |      |                               
Sbjct KPgleRAKVEAAKQALTGCGFDC.WETSigapgvsmhsatsiedpvrqalg  378
DSSP  LLlllHHHHHHHHHHHHHLLLEE.EEEEellllleeellllllhhhhhhhl


No 11: 1FWKA  MOLECULE: HOMOSERINE KINASE;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEEE.EELLLhhhlllleEEEEEEE.EEEEEEEEELLL..LEEEEE.lLLL
Query hXXIAVKTCGKLY.WAGEYailepgqlALIKDIP.IYXRAEIAFSDS..YRIYSD.xNPD   55
ident      ||                             |   |    |     |  |  |  
Sbjct .MKVRVKAPCTSAnLGVGF.......dVFGLCLKePYDVIEVEAIDDkeIIIEVDdkNIP   52
DSSP  .LEEEEEEEEEEElLLLLL.......lLEEEEEEeEEEEEEEEEELLllEEEEELllLLL


DSSP  H....HHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query Y....SLIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKAL  111
ident                 |               |           |||||         | 
Sbjct TdpdkNVAGIVAKKMIDDFN....IGKGVKITIKKGV...KAGSGLGSSAASSAGTAYAI  105
DSSP  LllllLHHHHHHHHHHHHHL....LLLEEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhhhll
Query LALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeen  171
ident   |  |  |   |    |   |           |                          
Sbjct NELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGAKHADNVAPAIFGGFTMVTNY.............  152
DSSP  HHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHLLEEEEEEE.............


DSSP  hhhhhhllLLLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLL...LLLHHhhhHHLLLLHHHHHHHHHH
Query latvlerdWGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVA...VSSHXvqqIKQNINQNFLTSSKET  228
ident                       | |                            |      
Sbjct ........EPLEVLHIPIDFKLDILIAIPNISIntkEAREI...LPKAVGLKDLVNNVGK  201
DSSP  ........LLEEEEEELLLLLLEEEEELLLLLLlhhHHHHH...LLLEEEHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHhHHHHhhlLLLLL..HHHHHHHHLLLLLLEEEEELLL
Query VVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVAsKLLEglsTDIYT..PLLRQLKEASQDLQAVAKSSGA  286
ident     | ||                |  |          |     ||   |       || 
Sbjct ACGMVYALYNKDKSLFGRYMMSD.KVIE...PVRGKliPNYFKIKEEVKDKVYGITISGS  257
DSSP  HHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLL.LLLH...HHHHLllLLHHHHHHHLLLLEEEEEELLL


DSSP  LllLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHlLLEEEEEEEL.......
Query GggDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADlGIELLYQERI.......  322
ident |     ||            |   |   |              
Sbjct G..PSIIAFPKEE.FIDEVENILRD.YYENTIRTEVgkgvevv  296
DSSP  L..LLEEEEELHH.HHHHHHHHHHH.HLLLEEEEELlllleel


No 12: 2HK2A  MOLECULE: DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE;                         

DSSP  .....llLEEEEEEEEEEEELLLhHHLL......LLEEEEEEEE.EEEEEEEEE...LLL
Query .....hxXIAVKTCGKLYWAGEYaILEP......GQLALIKDIP.IYXRAEIAF...SDS   45
ident                                               |      |      
Sbjct hmlemikSGKARAHTNIALIKYW.GKKDealiipMNNSISVTLEkFYTETKVTFndqLTQ   59
DSSP  lhhhhleEEEEEEEEEEEEELLL.LEEElllleeLLLEEEEEEEeEEEEEEEEEellLLL


DSSP  LEEE..EELL..lLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHH
Query YRIY..SDXN..pDYSLIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSG  101
ident                  |                                    || || 
Sbjct DQFWlnGEKVsgkELEKISKYMDIVRNRAG....IDWYAEIESDNFV...PTAAGLASSA  112
DSSP  LEEEelLEEEllhHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLLEEEEEEEEEL...LHHHLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhhlllllllLHHHHHHHHLLLEEEELLLHh
Query SVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVllkrgdngsXGDLACIAAEDLVLYQSFDRq  161
ident |       |             |  |              |                   
Sbjct SAYAALAAACNQALDMQLSDKDLSRLARIG.........SGSASRSIYGGFAEWEKGYS.  162
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLL.........LHHHHHHHLLLEEEEELLLL.


DSSP  hhhhhhhhllhhhhhhllLLLEEEELLLL...lLLEEEEEELLL..LLLL.lHHHHHHH.
Query kvaawleeenlatvlerdWGFSISQVKPT...lECDFLVGWTKE..VAVS.sHXVQQIK.  214
ident                                                 |           
Sbjct .................dETSYAVPLESNhfedDLAMIFVVINQhsKKVPsrYGMSLTRn  205
DSSP  .................lLLLEEEELLLLlhhhHEEEEEELLLLllLLLLhhHHHHHHHh


DSSP  LLLL.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLLLHHH
Query QNIN.QNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DIYTPLL  267
ident      |  |    |       |          |  |                        
Sbjct TSRFyQYWLDHIDEDLAEAKAAIQDKDFKRLGEVIEENGLRMHATNLgstppfTYLVQES  265
DSSP  HLLLhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLLLLHHH


DSSP  HHHHHLLL.....LLLEEEEElLLLLllEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL..lEEEEEE
Query RQLKEASQ.....DLQAVAKSsGAGGgdCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG..iELLYQE  320
ident                        ||       |                           
Sbjct YDVMALVHecreaGYPCYFTM.DAGP..NVKILVEKK.NKQQIIDKLLTQFdnnQIIDSD  321
DSSP  HHHHHHHHhhhhlLLLEEEEL.LLLL..LEEEEEEHH.HHHHHHHHHLLLLlhhHEEEEE


DSSP  ........el
Query ........ri  322
ident           
Sbjct iiatgieiie  331
DSSP  lllllleell


No 13: 2GS8A  MOLECULE: MEVALONATE PYROPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    

DSSP  ....LLLEEEEEEEEEEEELLlHHHL......LLLEEEEEEEE.EEEEEEEEELL....L
Query ....HXXIAVKTCGKLYWAGEyAILE......PGQLALIKDIP.IYXRAEIAFSD....S   45
ident        | |               |      |                   |      |
Sbjct naxdPNVITVTSYANIAIIKY.WGKEnqakxiPSTSSISLTLEnXFTTTSVSFLPdtatS   59
DSSP  llllLLEEEEEEEEEEEEELL.LLEEelllleELLLEEEEEEEeEEEEEEEEELLllllL


DSSP  LEEE..EELL..lLHHHHHHHHHHHHHhhhhllLLLLLEEEEEElhhHHLLLLLLLLHHH
Query YRIY..SDXN..pDYSLIQETIALXGDflavrgQNLRPFSLAIYgkxEREGKKFGLGSSG  101
ident    |             |   |                                || || 
Sbjct DQFYinGILQndeEHTKISAIIDQFRQ......PGQAFVKXETQ...NNXPTAAGLSSSS  110
DSSP  LEEEelLEELlhhHHHHHHHHHLLLLL......LLLLLEEEEEE...LLLLHHHLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhhlllllllLHHHhHHHHLLLEEEELLlhh
Query SVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVllkrgdngsXGDLaCIAAEDLVLYQSFdrq  161
ident |     |||   |     ||  |                                     
Sbjct SGLSALVKACDQLFDTQLDQKALAQKAKFA........sGSSS.RSFFGPVAAWDKD...  158
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHH........hHHHH.HHHLLLEEEELLL...


DSSP  hhhhhhhhllhhhhhhlllLLEEEELLLLLLLEEEEEELLLL.LLLL..HHHHHHHLL..
Query kvaawleeenlatvlerdwGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEV.AVSS..HXVQQIKQN..  216
ident                       |  |   |                |             
Sbjct ...................SGAIYKVETDLKXAXIXLVLNAAkKPISsrEGXKLCRDTst  199
DSSP  ...................LLLEEELLLLLLEEEEEEELLLLlLLLLhhHHHHHHHHHll


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLLLHHHHHH
Query INQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DIYTPLLRQL  270
ident         |          |     ||     |                    |    | 
Sbjct TFDQWVEQSAIDYQHXLTYLKTNNFEKVGQLTEANALAXHATTKtanppfSYLTKESYQA  259
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLLLLHHHHHH


DSSP  HHLLL.....LLLEEEEElLLLLllEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHlLLEEEEEE.....
Query KEASQ.....DLQAVAKSsGAGGgdCGIALSFDAqSTKTLKNRWADlGIELLYQE.....  320
ident  ||                 ||       |         |  |                 
Sbjct XEAVKelrqeGFACYFTX.DAGP..NVKVLCLEK.DLAQLAERLGK.NYRIIVSKtkdlp  314
DSSP  HHHHHhhhhlLLLEEEEL.LLLL..LEEEEEEHH.HHHHHHHHHHL.LLEEEEEElllll


DSSP  el
Query ri  322
ident   
Sbjct dv  316
DSSP  ll


No 14: 1FI4A  MOLECULE: MEVALONATE 5-DIPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    

DSSP  LLLEEEEEEEEEEEELLLhhHLLL.......LEEEEEEEE...EEEEEEEEE...LLLLE
Query HXXIAVKTCGKLYWAGEYaiLEPG.......QLALIKDIP...IYXRAEIAF...SDSYR   47
ident      |                                            |         
Sbjct VYTASVTAPVNIATLKYW..GKRDtklnlptNSSISVTLSqddLRTLTSAATapeFERDT   58
DSSP  LEEEEEEELLEEEEELLL..LEEElllleelLLEEEEELLlllLLEEEEEEElllLLLLL


DSSP  EEEEL...llLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........lLLLLEEEEEELHHhhlLLLLL
Query IYSDX...npDYSLIQETIALXGDFLAVRG........qNLRPFSLAIYGKXereGKKFG   96
ident           |    |                                           |
Sbjct LWLNGephsiDNERTQNCLRDLRQLRKEXEskdaslptlSQWKLHIVSENNF...PTAAG  115
DSSP  LLLLLlllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllhHHLLEEEEEEELL...LLLLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHhllllllllhHHHHHHHLLLEEEE
Query LGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLlkrgdngsxgDLACIAAEDLVLYQ  156
ident | ||       | |   || |                                   |   
Sbjct LASSAAGFAALVSAIAKLYQLPQSTSEISRIARKGS.........gSACRSLFGGYVAWE  166
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH.........hHHHHHHLLLEEEEE


DSSP  LLLHHHHhhhhhhllhhhhhhllLLLEEEELL...LLLLLEEEEEELLL..LLLL.LHHH
Query SFDRQKVaawleeenlatvlerdWGFSISQVK...PTLECDFLVGWTKE..VAVS.SHXV  210
ident                              |             |         ||     
Sbjct XGKAEDG................HDSXAVQIAdssDWPQXKACVLVVSDikKDVSsTQGX  210
DSSP  LLLLLLL................LLLEEEEEElhhHLLLEEEEEEEELLllLLLLhHHHH


DSSP  HHHH.LLLL.HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......L
Query QQIK.QNIN.QNFL.TSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......D  261
ident |                          |                |               
Sbjct QLTVaTSELfKERIeHVVPKRFEVXRKAIVEKDFATFAKETXXDSNSFHATCLdsfppiF  270
DSSP  HHHHhHLLHhHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllL


DSSP  LLLHHHHHHHHLLLLL.......LEEEEElLLLLllEEEEEEL..LHHHHH.HHHHHHH.
Query IYTPLLRQLKEASQDL.......QAVAKSsGAGGgdCGIALSF..DAQSTK.TLKNRWA.  310
ident                                ||                           
Sbjct YXNDTSKRIISWCHTInqfygetIVAYTF.DAGP..NAVLYYLaeNESKLFaFIYKLFGs  327
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHhhhhlllLEEEEE.LLLL..LEEEEEEhhHHHHHHhHHHHHHLl


DSSP  ..................................HLLL.EEEEEE...............
Query ..................................DLGI.ELLYQE...............  320
ident                                                             
Sbjct vpgwdkkftteqleafnhqfessnftareldlelQKDVaRVILTQvgsgpqetneslida  387
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllllhHHHEeEEEEEEllllleellllllll


DSSP  ..el
Query ..ri  322
ident     
Sbjct ktgl  391
DSSP  llll


No 15: 2HKEA  MOLECULE: DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE, PUTATIVE;               

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELLlhHHLL.........LLEEEEEEEE...EEEEEEEEEL...LL
Query hXXIAVKTCGKLYWAGEyaILEP.........GQLALIKDIP...IYXRAEIAFS...DS   45
ident      |                                                      
Sbjct .QCVTVEAPINIAFIKY..WGKReggetlilpTNDSFSITLSaspFRSKTSVELRddiET   57
DSSP  .LEEEEEELLEEEEELL..LLLLlllllllllLLLEEEEELLlllLLEEEEEEEElllLL


DSSP  LEEE.EELL...llHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLL.LLEEEEEELHHhhLLLLLLlLHH
Query YRIY.SDXN...pdYSLIQETIALXGDFLavRGQNL.RPFSLAIYGKXerEGKKFGlGSS  100
ident                   |                                       ||
Sbjct DTLRlNGTEvdvgkTPRVQSMLLHLRSTC..PEELKnKKVNIVSENNF..PTAAGM.ASS  112
DSSP  LEEEeLLEEelhhhLHHHHHHHHHHHLLL..LHHHHlLEEEEEEEELL..LLLLLL.LHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLlhhHHHHHHHHhhhlllllllLHHHHHHHHLLLEEEELLLh
Query GSVVVLVVKALLALYNLSVdqnLLFKLTSAvllkrgdngsXGDLACIAAEDLVLYQSFDr  160
ident  |       ||               |              |     |    |       
Sbjct ASGYCAMSAALIRAFKSTT...NVSMLARL.........gSGSACRSAFGGFVIWNKGE.  159
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLL...LHHHHHHH.........hLHHHHHHHLLLEEEEELLL.


DSSP  HHHHhhhhhllhhhhhhllLLLEEEELL...LLLLLEEEEEELLLLlLLLH...HHHHHH
Query QKVAawleeenlatvlerdWGFSISQVK...PTLECDFLVGWTKEVaVSSH...XVQQIK  214
ident                          |        |        |            ||  
Sbjct KPDG...............SDCVATQFVdetHWPEIQVMCAVLKGAqKDVSstkGMQQSL  204
DSSP  LLLL...............LLLEEEEEElllLLLLEEEEEEELLLLlLLLLhhhHHHHHH


DSSP  .LLLL.HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLLLH
Query .QNIN.QNFL.TSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DIYTP  265
ident                |       |          |     |  |              | 
Sbjct kTSPLmKKRIsETVPERMKIASRAIKARDFATFAEIAMLESDDLQEICAttepkiTYATE  264
DSSP  hHLLLhHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllLLLLH


DSSP  HHHHHHHLLLLL.......LEEEEeLLLLllLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL.....
Query LLRQLKEASQDL.......QAVAKsSGAGggDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG.....  313
ident                            ||                               
Sbjct DSYAMIRLVKAYnakkgrtALAYT.FDAG..ANCFLFVLKE.DLPEAVAMLMEHFptpfe  320
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhhlllLEEEE.LLLL..LLEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHLlllhh


DSSP  ................................LEEEEEEEL................
Query ................................IELLYQERI................  322
ident                                  | | |                   
Sbjct kfffgdrellekvkvvslpdeykklidhpkkpFEMLLQSPVgcgvkylgpseslipp  377
DSSP  heeellhhhhhhhhhllllhhhllllllllllLLEEEEEELlllleeelhhhlllll


No 16: 2V2QA  MOLECULE: 4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELllHHHL......LLLEEEEEEEEEEEEEEEEELlLLEEEEElLL
Query hXXIAVKTCGKLYWAGeyAILE......PGQLALIKDIPIYXRAEIAFSdSYRIYSDxNP   54
ident    | |    |         |          | |   || |    |      |       
Sbjct .HMIKVLSPAKINLGL..WVLGrlpsgyHEILTLYQEIPFYDEIYIREG.VLRVETNiGI   56
DSSP  .LLEEEEEEEEEEEEE..EEEEelllllEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEL.LLEEEELlLL


DSSP  LHH..HHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query DYS..LIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALL  112
ident      |                      |  |           |||   |    | |   
Sbjct PQEenLVYKGLREFERITG....IEINYSIFIQKNI...PPGAGLGGGSSNLAVVLKKVN  109
DSSP  LHHhlHHHHHHHHHHHHHL....LLLLEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLL.LLLHhHHHHHHHHHHhllllllllHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhhhll
Query ALYNL.SVDQnLLFKLTSAVLlkrgdngsxGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeen  171
ident  |          |  |               |                            
Sbjct ELLGSpLSEE.ELRELVGSIS.........ADAPFFLLGKSAIGRGK.............  146
DSSP  HHLLLlLLHH.HHHHHHHHHL.........LLLHHHHLLLEEEEELL.............


DSSP  hhhhhhlllllEEEELLLLlLLEEEEEELLLLLLlLHHHHHHHLLLLHHhHHHHHHHHHH
Query latvlerdwgfSISQVKPTlECDFLVGWTKEVAVsSHXVQQIKQNINQNfLTSSKETVVS  231
ident                |                                       |    
Sbjct .........geVLEPVETEiSGKITLVIPQVSSStGRVYSSLREEHFVT.PEYAEEKIQR  196
DSSP  .........llEEEELLLLlLLEEEEEELLLLLLhHHHHLLLLHHHLLL.HHHHHHHHHH


DSSP  HHHHhhhllhhhHHHHHhhhhhhhhhhlLLLL.....LHHHHHHHHLLLlllEEEEELLL
Query LVEAleqgksekIIEQVevasklleglsTDIY.....TPLLRQLKEASQdlqAVAKSSGA  286
ident               |                              |           || 
Sbjct IISG........EVEEI......envlgDIARelypeINEVYRFVEYLG...FKPFVSGS  239
DSSP  HHLL........LHHHL......llhhhHHHHhhlhhHHHHHHHHHHLL...LLLEELLL


DSSP  LllLEEEEEEllhhhhhhHHHHHHHLL....LEEEeEEEL
Query GggDCGIALSfdaqstktLKNRWADLG....IELLyQERI  322
ident |                                       
Sbjct G..STVYFFG.......gASEELKKAAkmrgWKVV.ELEL  269
DSSP  L..LLEEELL.......lLLHHHHHHHhhhlLEEE.EEEL


No 17: 1UEKA  MOLECULE: 4-(CYTIDINE 5'-DIPHOSPHO)-2C-METHYL-D-ERYTHRITOL           

DSSP  lllEEEEEEEEEEEEL....llhhhLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL.LLEEEeelLLL
Query hxxIAVKTCGKLYWAG....eyailEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD.SYRIYsdxNPD   55
ident           |                    |        |                 | 
Sbjct ...MERLAPAKVNLGLsvrfrredgYHELHTLFAPFSLADRLVVEPVSsGLHFQ...GPY   54
DSSP  ...LEEEEEEEEEEEEeeeeellllLEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEELlLEEEE...LLL


DSSP  HH..HHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhllLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query YS..LIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXeregKKFGLGSSGSVVVLVVKALLA  113
ident     |      |                              |||   |    |  || |
Sbjct GRenLAYRAASLYLEAAG....QPGGVRILLEKRI...pEGAGLGGGSSDAAQVLLALQA  107
DSSP  HHhlHHHHHHHHHHHHLL....LLLEEEEEEELLL...lLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLLlhhHHHHHHHHHHhllllllllhHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhhhllhh
Query LYNLSVdqnLLFKLTSAVLlkrgdngsxgDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeenla  173
ident ||   |    || |               |                              
Sbjct LYPAEV...DLFALARTLG.........aDVPFFLLGRGAEARGV...............  140
DSSP  HLLLLL...LHHHHHHHHL.........lLHHHHHHLLEEEEELL...............


DSSP  hhhhllllLEEEELLLLlLLEEEEEELLLLLLllhhHHHHHLLLLHHHHHhhhHHHHhhH
Query tvlerdwgFSISQVKPTlECDFLVGWTKEVAVsshxVQQIKQNINQNFLTsskETVVslV  233
ident                        |                                   |
Sbjct .......gERLKPLALP.PVPAVVFFPGLRVP....TPLVYRAVRPEDFG...PDLP..V  183
DSSP  .......lLEEEEELLL.LEEEEEEELLLLLL....HHHHHHLLLHHHLL...LLLL..H


DSSP  HHHHH..LLHHhhHHHHhhHHHHHhHHLLLlLLHHhHHHHHL.LLLLLEEEEELLLLllL
Query EALEQ..GKSEkiIEQVevASKLLeGLSTDiYTPLlRQLKEA.SQDLQAVAKSSGAGggD  290
ident ||        |           |  |        |                  || |   
Sbjct EAILEalARGE..EPPY..WNSLE.GPAFRlFPEL.KEVRGRmRALGLRGVLMSGSG..S  235
DSSP  HHHHHhhHHLL..LLLL..LLLLH.HHHHHhLLHH.HHHHHHhHHLLLEEEEELLLL..L


DSSP  EEEEEELLHHHHHHHHHHHHHlLLEEeEEEE...l
Query CGIALSFDAQSTKTLKNRWADlGIELlYQER...i  322
ident     |                              
Sbjct AFFGLAEGPDHARRAAEALRA.WGRA.WAGTlggg  268
DSSP  LEEEELLLHHHHHHHHHHHLL.LLEE.EEEEelll


No 18: 1MG7A  MOLECULE: EARLY SWITCH PROTEIN XOL-1 2.2K SPLICE FORM;               

DSSP  ...................llLEEEEEEEEEEEELllhhhlllleEEEEEEEEEEEEEEE
Query ...................hxXIAVKTCGKLYWAGeyailepgqlALIKDIPIYXRAEIA   41
ident                                                   |         
Sbjct errvkilgidrsenspvltymSKLAAAPHTVHMMD..........SGFLAINRQCLVKGK   50
DSSP  leeeeeeeeeeeeelhhhhllLEEEEEEEEEEELL..........LEEEEEEEEEEEEEE


DSSP  ELL........lLEEEE.....elllLHHHHHHHHHHHHhhhhhllllLLLEEEEEELHH
Query FSD........sYRIYS.....dxnpDYSLIQETIALXGdflavrgqnLRPFSLAIYGKX   88
ident               |             |     |                     |   
Sbjct AILarepkssneHMIDDlpkhahdqhTLSILRDFIDQLK........lHNVYEINFYDPL  102
DSSP  EEEllllllhhhLEELLllllllhhhHHHHHHHHHHHHL........lLLEEEEEEELLL


DSSP  hhllLLLLllHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLhHHHHHHHHHHHHLLLLL.LLLH.HHH
Query eregKKFGlgSSGSVVVLVVKALLALYN.LSVDqNLLFKLTSAVLLKRGDN.GSXG.DLA  145
ident        |            |  ||           |      |  |             
Sbjct ....DSSGklAVIPMLIALWKCMLASETdICDQ.EVLKSIMNSVIAKFELQiPCKNaVID  157
DSSP  ....LLLLllLHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLLH.HHHHHHHHHHHHHLLLLlLLHHhHHH


DSSP  HHHHLL...LEEEElllhhhhhhhhhhllhhhhhhllllleeEELLLL..LLLEEEEEEL
Query CIAAED...LVLYQsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsiSQVKPT..LECDFLVGWT  200
ident                                                      |     |
Sbjct ATLSGSreeVHIIA..........................esNGTTEHfnKKHDLVFVKT  191
DSSP  HHHHLLlleEEELL..........................llLEELHHhhHHEEEEEEEE


DSSP  L.LLLLLLhhhhhhhllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH..LLHHHH.HHHHHHHHHHHH
Query K.EVAVSShxvqqikqninqnfLTSSKETVVSLVEALEQ..GKSEKI.IEQVEVASKLLE  256
ident                                      |                 ||   
Sbjct DlHPEDFT.........pqmfpSQAKAKLLRDAFNNEEDedTFPDILvPAYMTAHSKNRV  242
DSSP  LlLLLLLL.........lllllLHHHHHHHHHHHHHLLLllLLHHHLhHHHHHHHHHHHH


DSSP  HH..LLLL..LLHHHHHHHHLLL.LLLE.EEEELllllLLEEEEEELLHhHHHH..HHHH
Query GL..STDI..YTPLLRQLKEASQ.DLQA.VAKSSgaggGDCGIALSFDAqSTKT..LKNR  308
ident      |           |        |                       |     |   
Sbjct RQedYTCLevEFDSQVALEKLMNeHEQVeGFEVQ....QGGILVALKKD.SFFDdeLIEK  297
DSSP  HLllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHhLLLEeEEEEL....LLLEEEEEELL.HHHLhhHHHH


DSSP  HHHL..........LLEEeEEEE...............................l
Query WADL..........GIELlYQER...............................i  322
ident  |                                                     
Sbjct IAIAiatesrqsvsSVSF.DLLKlgpgaslvtlansrrfepecrvvlqievkpvs  351
DSSP  HHHHhhhhllllllEEEE.EEELllllleelllllhhhllleeeeeeeeeeeell


No 19: 1OJ4A  MOLECULE: 4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELLLH....hhLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL..LLEEEEE..l
Query hXXIAVKTCGKLYWAGEYA....ilEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYSD..x   52
ident  |        ||                   |           |   |    |       
Sbjct .XRTQWPSPAKLNLFLYITgqradgYHTLQTLFQFLDYGDTISIELRDdgDIRLLTPveg   59
DSSP  .LEEEEEEEEEEEEEEEEEeellllLEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEELllLEEELLLlll


DSSP  LLLHHH.HHHHHHHHHHHHHHLLLL..lLLEEEEEELHHhhlLLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query NPDYSL.IQETIALXGDFLAVRGQN..lRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVK  109
ident        |     |     |  |           |           |||   |    |  
Sbjct VEHEDNlIVRAARLLXKTAADSGRLptgSGANISIDKRL...PXGGGLGGGSSNAATVLV  116
DSSP  LLHHHLhHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllLEEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhhlllllllLHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhhh
Query ALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVllkrgdngsXGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawlee  169
ident ||  |         |                  |                          
Sbjct ALNHLWQCGLSXDELAEXGLTL.........GADVPVFVRGHAAFAEGV...........  156
DSSP  HHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHH.........LLLHHHHHHLLLEEEELL...........


DSSP  llhhhhhhllllLEEEELLLLllLEEEEEELLLLLLLLhHHHHHHLLLLhhHHHHhhHHH
Query enlatvlerdwgFSISQVKPTleCDFLVGWTKEVAVSShXVQQIKQNINqnFLTSskETV  229
ident                  | |      ||                                
Sbjct ...........gEILTPVDPP.eKWYLVAHPGVSIPTP.VIFKDPELPR..NTPK..RSI  199
DSSP  ...........lLEEEELLLL.lLEEEEELLLLLLLHH.HHHLLLLLLL..LLLL..LLH


DSSP  HHHHHHhhhllhhhhhhhhHHHHhhhhhhlLLLL.....LHHHHHHHHLLllllEEEEEL
Query VSLVEAleqgksekiieqvEVASklleglsTDIY.....TPLLRQLKEASqdlqAVAKSS  284
ident   |                |                                  |     
Sbjct ETLLKC.............EFSN....dceVIARkrfreVDAVLSWLLEY....APSRLT  238
DSSP  HHHHHL.............LLLL....llhHHHHhhlhhHHHHHHHHLLL....LLEEEL


DSSP  LLLllLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHhLLLEEEEEE..........el
Query GAGggDCGIALSFDAQSTKTLKNRWAdLGIELLYQE..........ri  322
ident | |   |  |                                      
Sbjct GTG..ACVFAEFDTESEARQVLEQAP.EWLNGFVAKgvnlsplhraxl  283
DSSP  LLL..LLEEEEELLHHHHHHHHHHLL.HHHLLEEEEeelllhhhhlll


No 20: 1Y5YA  MOLECULE: FORMALDEHYDE-ACTIVATING ENZYME FAE;                        

DSSP  .....llLEEEEEEEEeeeelllhhhlllleeeeeeeeeEEEEEEEE......LLLL...
Query .....hxXIAVKTCGKlywageyailepgqlalikdipiYXRAEIAF......SDSY...   46
ident                                                             
Sbjct akitkvqVGEALVGDG.....................neVAHIDLIIgprgspAETAfcn   39
DSSP  lllllleEEEEEELLH.....................hhLEEEEEEEeelllhHHHHhhh


DSSP  ..........................EEEEE............llLLHHHHHHHHHHHH.
Query ..........................RIYSD............xnPDYSLIQETIALXG.   67
ident                                              |              
Sbjct glvnnkhgftsllaviapnlpckpntLMFNKvtindarqavqmfgPAQHGVAMAVQDAVa   99
DSSP  hhhllllllleeeleeelleellleeEEEELlllllhhhhhhhhlHHHHHHHHHHHHHHh


DSSP  .HHHHhlLLLL..LLEEEEEElhhHHLLLLlLLLH.HHHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhh
Query .DFLAvrGQNL..RPFSLAIYgkxEREGKKfGLGS.SGSVVVLVVKALLALYNLSvdqnl  123
ident                                                     |       
Sbjct eGIIP..ADEAddLYVLVGVF...IHWEAA.DDAKiQKYNYEATKLSIQRAVNGE.....  148
DSSP  lLLLL..LLLHhhEEEEEEEE...LLLLLL.LHHHhHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.....


DSSP  hhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhllllle
Query lfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfs  183
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  eeellllllleeeeeellllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhh
Query isqvkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksek  243
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeellllllleeeeeellhhhhh
Query iieqvevasklleglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgagggdcgialsfdaqstk  303
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhllleeeeeeel
Query tlknrwadlgiellyqeri  322
ident                    
Sbjct ........pkasvvteqrk  159
DSSP  ........llhhhhhllll


No 21: 1VS5I  MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEeeeelllhhhlllleeeeeeeeeEEEEEEEELlLLEEEEE.....LLLL
Query hXXIAVKTCGKlywageyailepgqlalikdipiYXRAEIAFSdSYRIYSD.....XNPD   55
ident           |                         |  |       |            
Sbjct .NQYYGTGRRK.....................ssAARVFIKPG.NGKIVINqrsleQYFG   37
DSSP  .LLEEELLLLL.....................llLLLEEEEEL.LLLEEELlllhhHHHL


DSSP  ....HHHHHHHHHHHHhhhhhlllllLLEEEEEELHhhHLLLllllLHHHHHHHHHHHHH
Query ....YSLIQETIALXGdflavrgqnlRPFSLAIYGKxeREGKkfglGSSGSVVVLVVKAL  111
ident              |                | |  |    |     |  |        ||
Sbjct retaRMVVRQPLELVD........mvEKLDLYITVK..GGGI...sGQAGAIRHGITRAL   84
DSSP  llllLLLLLHHHHHLL........llLLEEEEELLL..LLLH...hHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLhhhHHHHHhhhhhllllllllhhhhhhHHLLleeeelllhhhhhhhhhhll
Query LALYNLSVDqnlLFKLTsavllkrgdngsxgdlaciAAEDlvlyqsfdrqkvaawleeen  171
ident                                                             
Sbjct MEYDESLRS.elRKAGF..................vTRDA....................  105
DSSP  HHHLLLLHH.hhHHHLL..................lLLLL....................


DSSP  hhhhhhllllleeeellllllleeeEEELlllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhh
Query latvlerdwgfsisqvkptlecdflVGWTkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvs  231
ident                          |                                  
Sbjct .......................rqVERK...............................  111
DSSP  .......................llLLLL...............................


DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHhhhllLLLLeeeeellllllle
Query lvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQlkeasQDLQavakssgagggdc  291
ident                                     |      |                
Sbjct .............................kvgLRKARR...rpQFSK.............  126
DSSP  .............................lllLLLLLL...llLLLL.............


DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query gialsfdaqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                
Sbjct ..............................r  127
DSSP  ..............................l


No 22: 2NN6B  MOLECULE: POLYMYOSITIS/SCLERODERMA AUTOANTIGEN 1;                    

DSSP  ...........................LLLEEEEEEEeeeeelllhhhlllleeeeeeEE
Query ...........................HXXIAVKTCGklywageyailepgqlalikdIP   33
ident                                                             
Sbjct lsdqgyrvdgrragelrkiqarmgvfaQADGSAYIEQ.....................GN   39
DSSP  lllllllllllllllllleeeeellllLLLEEEEEEE.....................LL


DSSP  EEEEEEEE.ELLL.............LEEEE..................elllLHHHHHH
Query IYXRAEIA.FSDS.............YRIYS..................dxnpDYSLIQE   61
ident     |                                                       
Sbjct TKALAVVYgPHEIrgsraralpdralVNCQYssatfstgerkrrphgdrksceMGLQLRQ   99
DSSP  LEEEEEEEeEEELlllllllllllllEEEEEeelllllllllllllllhhhhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHhhHHHLllllLLEEEEEELHHhhlllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLlllh
Query TIALXGdfLAVRgqnlRPFSLAIYGKXeregkkfGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLsvdq  121
ident |       |                           |     |     | |         
Sbjct TFEAAI..LTQL.hprSQIDIYVQVLQ......aDGGTYAACVNAATLAVLDAGIP...m  147
DSSP  HHHHLL..LHHH.lllEEEEEEEEEEE......lLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLL...l


DSSP  hHHHH..................................hhhHHHHL..........lll
Query nLLFK..................................ltsAVLLK..........rgd  137
ident                                             ||              
Sbjct rDFVCacsagfvdgtaladlshveeaaggpqlalallpasgqIALLEmdarlhedhlerv  207
DSSP  lLLLEeeeeeeelleeeelllhhhhlllllleeeeeelllleEEEEEellllllllhhhh


DSSP  LLLL..HHHHhHHHLlleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhllllleeeelllllllee
Query NGSX..GDLAcIAAEdlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsisqvkptlecdf  195
ident                                                             
Sbjct LEAAaqAARD.VHTL.............................................  221
DSSP  HHHHhhHHHH.HHHH.............................................


DSSP  eeeellllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhh
Query lvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieqvevaskll  255
ident                                                             
Sbjct ............................................................  221
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeellllllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhllle
Query eglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgagggdcgialsfdaqstktlknrwadlgie  315
ident                                                             
Sbjct .....................................................ldrvvrq  228
DSSP  .....................................................hhhhhhh


DSSP  eeeeeel
Query llyqeri  322
ident        
Sbjct hvreasi  235
DSSP  hhhhhll


No 23: 1MLAA  MOLECULE: MALONYL-COENZYME A ACYL CARRIER PROTEIN                    

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeEEEEEEEEeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikDIPIYXRAeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct .......................qfafvfpGQGSQTVG......................   15
DSSP  .......................leeeeelLLLLLLLL......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhHHHHHHLLL..L
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvKALLALYNL..S  118
ident                                                  |  |       
Sbjct ...............................................mLADMAASYPivE   28
DSSP  ...............................................lLHHHHHHLHhhH


DSSP  LLH.................................hHHHHHHHH...hhhLLLLLLLLH
Query VDQ.................................nLLFKLTSA...vllKRGDNGSXG  142
ident                                                            |
Sbjct ETFaeasaalgydlwaltqqgpaeelnktwqtqpallTASVALYRvwqqqgGKAPAMMAG   88
DSSP  HHHhhhhhhhlllhhhhhhhllhhhhllhhhhhhhhhHHHHHHHHhhhhllLLLLLEEEE


DSSP  HhhhhhhllleeEELLlhhhhhhhhhhllhhhhhhlLLLL........eeEELL..LLLL
Query DlaciaaedlvlYQSFdrqkvaawleeenlatvlerDWGF........siSQVK..PTLE  192
ident             |                                        |      
Sbjct H.......slgeYSAL..................vcAGVIdfadavrlveMRGKfmQEAV  123
DSSP  L.......lhhhHHHH..................hhLLLLlhhhhhhhhhHHHHhhHHHL


DSSP  ....LEEEEEELlllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh
Query ....CDFLVGWTkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieqv  248
ident                                                             
Sbjct pegtGAMAAIIG................................................  135
DSSP  llllEEEEEEEL................................................


DSSP  hhhhhhhhhhllllllhHHHHHHHLLLLL....LEEE.EELLlllLLEEEEEELlHHHHH
Query evasklleglstdiytpLLRQLKEASQDL....QAVA.KSSGaggGDCGIALSFdAQSTK  303
ident                         |                                   
Sbjct ................lDDASIAKACEEAaegqVVSPvNFNS...PGQVVIAGH.KEAVE  175
DSSP  ................lLHHHHHHHHHHHllllLEEEeEEEE...LLEEEEEEE.HHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLL.EEEEEEEL........................................
Query TLKNRWADLGI.ELLYQERI........................................  322
ident          |    |                                             
Sbjct RAGAACKAAGAkRALPLPVSvpshcalmkpaadklavelakitfnaptvpvvnnvdvkce  235
DSSP  HHHHHHHHLLLlEEEELLLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct tngdairdalvrqlynpvqwtksveymaaqgvehlyevgpgkvltgltkrivdtltasal  295
DSSP  llhhhhhhhhhhhhhlleehhhhhhhhhhlllleeeelllllhhhhhhhhhlllleeeel


DSSP  ..........
Query ..........  322
ident           
Sbjct nepsamaaal  305
DSSP  llhhhhhhhl


No 24: 2BOAA  MOLECULE: CARBOXYPEPTIDASE A4;                                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeelLLLLL.LEEEEEELLllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query gfsisqvKPTLE.CDFLVGWTKevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident                 |                                           
Sbjct .......REKFFgDQVLRINVR......................................   15
DSSP  .......LLLLLlLEEEEELLL......................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHLLL..LLLEEE.EELLlLLLLEEEEEE
Query ksekiieqvevasklleglstdiYTPLLRQLKEASQ..DLQAVA.KSSGaGGGDCGIALS  296
ident                               |        |     ||           | 
Sbjct .......................NGDEISKLSQLVNsnNLKLNFwKSPS.SFNRPVDVLV   51
DSSP  .......................LHHHHHHHHHHLLllHHHLEEeELLL.LLLLLEEEEE


DSSP  LLHhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL..................................
Query FDAqSTKTLKNRWADLGIELLYQERI..................................  322
ident     |    |      | |                                         
Sbjct PSV.SLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDlqalldneddemqhnegqerssnnfnygayhsle  110
DSSP  LHH.HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct aiyhemdniaadfpdlarrvkighsfenrpmyvlkfstgkgvrrpavwlnagihsrewis  170
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellllleeeeeeellllllllleeeeeellllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct qataiwtarkivsdyqrdpaitsilekmdifllpvanpdgyvytqtqnrlwrktrsrnpg  230
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhleeeeellllhhhhhhhhhllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct sscigadpnrnwnasfagkgasdnpcsevyhgphansevevksvvdfiqkhgnfkgfidl  290
DSSP  lllllllhhhllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hsysqllmypygysvkkapdaeeldkvarlaakalasvsgteyqvgptcttvypasgssi  350
DSSP  eellleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllhh


DSSP  ......................................................
Query ......................................................  322
ident                                                       
Sbjct dwaydngikfaftfelrdtgtygfllpanqiiptaeetwlglktimehvrdnly  404
DSSP  hhhhhlllleeeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 25: 1JQGA  MOLECULE: CARBOXYPEPTIDASE A;                                        

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeelLLLL.LLEEEEEELLLlllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query gfsisqvKPTL.ECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident                                                             
Sbjct .......HEIYdGHAVYQVDVAS.....................................   16
DSSP  .......LLLLlLLEEEEEELLL.....................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELllLLLLEEEEEELLH
Query ksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSgaGGGDCGIALSFDA  299
ident                                     ||     |     |  |  |    
Sbjct ........................MDQVKLVHDFENDLMLDVWSD.aVPGRPGKVLVPKF   51
DSSP  ........................HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL.lLLLLLEEEEELHH


DSSP  hHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL.....................................
Query qSTKTLKNRWADLGIELLYQERI.....................................  322
ident        |     |                                              
Sbjct .KREIFENFLKQSGVQYKLEVENvkeqleledqllaaaaaksnstrsrlsfdkihsyeev  110
DSSP  .HHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLlhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct daylqelakefpnvvtvveggksfegrsikylristtnfqdaskpvvmmqsllhcrewvt  170
DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeeeeeellllleeeeeeellllllllllleeeeeellllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct lpatlyaihklvidvtesdlinnidwiilpvanpdgyvhtfggdrywrknratgymagnl  230
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhhlleeeeellllhhhhhhhhlllllllllllllllhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct cmgvdlnrnfgmnwgtassssvcsdtfhgrsafsepessvirdiiaehrnrmalyldihs  290
DSSP  lllllhhhlllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct fgsmilygygngvlpsnalqlhligvqmaqaidrvkwssnkdyivgnifhvlyaasggas  350
DSSP  llleeeellllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeehhhhlllllllhh


DSSP  ...........................................................
Query ...........................................................  322
ident                                                            
Sbjct dyamqaaapfsytyelpayrnsvwfdgflvdpdfieqagfetwegikvgaraaaaaake  409
DSSP  hhhhhhllleeeeeeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


No 26: 1VIXA  MOLECULE: PEPTIDASE T;                                               

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhHHHHHHHHLLllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLL
Query etiaLXGDFLAVRGqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlSVD  120
ident          |                                               | |
Sbjct ...mSLDKLLERFL........................................nyvSLD   17
DSSP  ...lLHHHHHHHHH........................................hhhHLL


DSSP  HHhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhlllEEEELllhhhhhhhhhhllhhhhhhlll
Query QNllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlVLYQSfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct TQ............................skAGVRQ.......................   26
DSSP  LL............................llLLLLL.......................


DSSP  lLEEE.......................................................
Query gFSIS.......................................................  185
ident                                                             
Sbjct .VPSTegqwkllhllkeqleemglinvtlsekgtlmatlpanvpgdipaigfishvdtsp   85
DSSP  .LLLLlhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllleeeeelllllllllleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  185
ident                                                             
Sbjct dcsgknvnpqivenyrggdialgigdevlspvmfpvlhqllgqtlittdgktllgaddka  145
DSSP  llllllllleeellllllleeelllleeelllllhhhhhllllleeellllllllhhhhh


DSSP  ...........................................................e
Query ...........................................................q  186
ident                                                             
Sbjct giaeimtalavlqqkkiphgdirvaftpdeevgkgakhfdvdafdarwaytvdgggvgel  205
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellhhhllllllllhhhhllleeeeellllllee


DSSP  lllLLLLEEEEEELLLLlLLLHhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhh
Query vkpTLECDFLVGWTKEVaVSSHxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiie  246
ident                                                             
Sbjct efeNFNAASVNIKIVGN.NVHP......................................  226
DSSP  ellLLEEEEEEEEEELL.LLLH......................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLL...........lLEEE.EELLLLLLLEEEE
Query qvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQD...........lQAVA.KSSGAGGGDCGIA  294
ident                    |                              |         
Sbjct .......gtakgvmvnaLSLAARIHAEVPAdespemtegyegFYHLaSMKGTVERADMHY  279
DSSP  .......hhlllllllhHHHHHHHHHHLLLllllllllllllEEEEeEEEEELLEEEEEE


DSSP  EEL......LHHHHHHHHHHHHHLL........LEEEeEEEL..................
Query LSF......DAQSTKTLKNRWADLG........IELLyQERI..................  322
ident                         |        |||   |                    
Sbjct IIRdfdrkqFEARKRKMMEIAKKVGkglhpdcyIELV.IEDSyynmrekvvehphildia  338
DSSP  EEEellhhhHHHHHHHHHHHHHHHHllllllleEEEE.EEEEelllhhhhhlllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct qqamrdcdiepelkpirggtdgaqlsfmglpcpnlftggynyhgkhefvtlegmekavqv  398
DSSP  hhhhhhllllleelllllllhhhhhlllllllleellleellllllleeehhhhhhhhhh


DSSP  .............
Query .............  322
ident              
Sbjct ivriaeltaqrke  411
DSSP  hhhhhhhhhhlll


No 27: 1KWMA  MOLECULE: PROCARBOXYPEPTIDASE B;                                     

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeELLLLLL..LEEEEEELLllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query gfsisQVKPTLE..CDFLVGWTKevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeq  238
ident                                                             
Sbjct .....HHGGEHFegEKVFRVNVE.....................................   18
DSSP  .....LLLHHHHllLEEEEEEEL.....................................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHLLLLLLEEE....eelllLLLLEEEE
Query gksekiieqvevasklleglstdiYTPLLRQLKEASQDLQAVA....kssgaGGGDCGIA  294
ident                                  |     |                    
Sbjct ........................DENHINIIRELASTTQIDFwkpdsvtqiKPHSTVDF   54
DSSP  ........................LHHHHHHHHHHHHHLLEEEeelllhhhlLLLEEEEE


DSSP  EELLHhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL................................
Query LSFDAqSTKTLKNRWADLGIELLYQERI................................  322
ident        | |  |                                               
Sbjct RVKAE.DTVTVENVLKQNELQYKVLISNlrnvveaqfdsrvratghsyekynkwetieaw  113
DSSP  EELHH.HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct tqqvatenpalisrsvigttfegraiyllkvgkagqnkpaifmdcgfharewispafcqw  173
DSSP  hhhhhhhlllleeeeeeeellllleeeeeeelllllllleeeeellllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct fvreavrtygreiqvtellnkldfyvlpvlnidgyiytwtksrfwrktrsthtgsscigt  233
DSSP  hhhhhhhhllllhhhhhhhhhleeeeellllhhhhhhhhhllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct dpnrnfdagwceigasrnpcdetycgpaaeseketkaladfirnklssikayltihsysq  293
DSSP  lhhhllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct mmiypysyayklgennaelnalakatvkelaslhgtkytygpgattiypaaggsddwayd  353
DSSP  eeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllhhhhhhh


DSSP  .................................................
Query .................................................  322
ident                                                  
Sbjct qgirysftfelrdtgrygfllpesqiratceetflaikyvasyvlehly  402
DSSP  lllleeeeeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 28: 2UUUA  MOLECULE: ALKYLDIHYDROXYACETONEPHOSPHATE SYNTHASE;                   

DSSP  ......LLLEeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeelll
Query ......HXXIavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnp   54
ident       |                                                     
Sbjct mgspkeHIDL.......................................yqqikwngwgd   21
DSSP  llllllLLLH.......................................hhhllllllll


DSSP  lhhhhhhHHHHhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhh
Query dysliqeTIALxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallal  114
ident                                                             
Sbjct trkflhqLKPS............................................gtiam   37
DSSP  llleeeeLLLL............................................lleee


DSSP  lllLLLHHhhhhhhhhhhhlllLLLLLhhhhhhhhllleeeelllhhhHHHH........
Query ynlSVDQNllfkltsavllkrgDNGSXgdlaciaaedlvlyqsfdrqkVAAW........  166
ident     |                                           |           
Sbjct ttpEVSSV......plpslrgfIKKEL.................tkpfVLDEtpalqien   74
DSSP  ellLLLLE......elllhhhhHHHHL.................llllLLLLlllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  166
ident                                                             
Sbjct ihvdppkqypefvrelkafflpdqlkddklarithtfgkslrdlirvrigqvknapdliv  134
DSSP  lllllllllhhhhhhhhllllhhheellhhhhhhllllllhhhhhhhhllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  166
ident                                                             
Sbjct lphsheeverlvqlahkynvviipmgggsnivgaiepvsnerftvsidmrrmnkvlwvdr  194
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllllllllllllleeeeelllllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  166
ident                                                             
Sbjct remtaciqvgimgpelekqlhkqgvslghdpdsfefstlggwlatcssghqsdkygdied  254
DSSP  llleeeeellllhhhhhhhhhhlleelllllllhhhllhhhhhhhllllllhhhhllhhh


DSSP  ......................hhhllhhhhhhllllleeeeLLLLLLLEEEEEELLLll
Query ......................leeenlatvlerdwgfsisqVKPTLECDFLVGWTKEva  204
ident                                                             
Sbjct mavsfrtvtptgtlelrginykhiilgsegtlgiiteavmkvHAVPQAVEYYGFLFPT..  312
DSSP  heeeeeeeelleeelllllllhhhhlllllllleeeeeeeelEELLLEEEEEEEEELL..


DSSP  lllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllL
Query vsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyT  264
ident                                                             
Sbjct ...........................................................F  313
DSSP  ...........................................................H


DSSP  HHHHHHHHLLL..LLLE.EEEEL..LLLL...............................
Query PLLRQLKEASQ..DLQA.VAKSS..GAGG...............................  288
ident                                                             
Sbjct AHAVSALQQIRssEVIPtMIRVYdpEETQlsfawkpskgavseftsamvkkylhyirsfd  373
DSSP  HHHHHHHHHHHhhLLLLlEEEEElhHHHHhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhlllll


DSSP  ...LLEEEEEEL.....LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL..................
Query ...GDCGIALSF.....DAQSTKTLKNRWADLGIELLYQERI..................  322
ident        |                            |                       
Sbjct fknVCLSIIGFEgpkkvVDFHRTSVFDILSKNAAFGLGSAPGktwaekrydlpyirdfll  433
DSSP  lllLEEEEEEEEelhhhHHHHHHHHHHHHHLLLLEEEEEELLlhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct dhnmwvdvaettvsyanlqtlwkdakqtfvkhfkdqgipawicahishtytngvclyfif  493
DSSP  llleeeeeeeeeeehhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeeeeeelleeeeeeee


DSSP  .........................................................
Query .........................................................  322
ident                                                          
Sbjct askqnenkdmaqyieakklmtdiifkyggslsrgwinvyrslketidpkdicnprkl  550
DSSP  eeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhlllllllllll


No 29: 2JE6A  MOLECULE: EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE 2;                             

DSSP  .................................................LLLE.EEEEEE
Query .................................................HXXI.AVKTCG   10
ident                                                             
Sbjct ghmsstpsnqniipiikkesivslfekgirqdgrkltdyrplsitldyaKKADgSALVKL   60
DSSP  llleelllllllllhhhhhhhlllhhhlllllllllllllleeeeelllLLLLeEEEEEE


DSSP  EeeeelllhhhlllleeeeeeeeEEEEEEEEELL...........LLEEE..........
Query KlywageyailepgqlalikdipIYXRAEIAFSD...........SYRIY..........   49
ident                            |                                
Sbjct G.....................tTMVLAGTKLEIdkpyedtpnqgNLIVNvellplayet   99
DSSP  L.....................lEEEEEEEEEEEellllllllllEEEEEeeelllllll


DSSP  .......eelllLHHHHHHHHHHHhHHHH......hllllllLEEEEEELHHhhlllllL
Query .......sdxnpDYSLIQETIALXgDFLA......vrgqnlrPFSLAIYGKXeregkkfG   96
ident                            |                 |  |          |
Sbjct fepgppdenaieLARVVDRSLRDS.KALDltklviepgksvwTVWLDVYVLD......yG  152
DSSP  lllllllhhhhhHHHHHHHHHHHL.LLLLhhhheeellleeeEEEEEEEEEE......lL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHH..................LLLLllhhhhhhhhhHHHHlllll
Query LGSSGSVVVLVVKALLAL..................YNLSvdqnllfkltsAVLLkrgdn  138
ident            | ||                                     |       
Sbjct GNVLDACTLASVAALYNTkvykveqhisvnknevvgKLPL........nypVVTI.....  199
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLeeeeeellleeeeeeeeeELLL........lllLEEE.....


DSSP  lllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhllllleeeellllllleeeee
Query gsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsisqvkptlecdflvg  198
ident                                                             
Sbjct ............................................................  199
DSSP  ............................................................


DSSP  ellllllLLHHHHhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query wtkevavSSHXVQqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieqvevaskllegl  258
ident                                                             
Sbjct ....svaKVDKYL...............................................  208
DSSP  ....eeeEELLEE...............................................


DSSP  llllllhhhhhhhhlllllleeeeeLLLLL.....................lleeeeeel
Query stdiytpllrqlkeasqdlqavaksSGAGG.....................gdcgialsf  297
ident                                                             
Sbjct ...................vvdpdlDEESImdakisfsytpdlkivgiqksgkgsmslqd  249
DSSP  ...................eelllhHHHHHlleeeeeeellllleeeeeeelllleehhh


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query daqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                          
Sbjct idqaentarstavklleelkkhlgi  274
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 30: 1R43A  MOLECULE: BETA-ALANINE SYNTHASE;                                     

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeEEEELLLLeeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraEIAFSDSYriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct .......gtlnlpaaaplsiasgrlnqtiletgsqfggVARWGQES..............   39
DSSP  .......llllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllLLLLLLLL..............


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllLEEE...................................eee
Query etialxgdflavrgqnlrPFSL...................................aiy   85
ident                                                             
Sbjct ..................HEFGxrrlagtaldgaxrdwftneceslgckvkvdkignxfa   81
DSSP  ..................LLLLlllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeellllleee


DSSP  lhhhhllllllllhhhhhHHHHH.....................................
Query gkxeregkkfglgssgsvVVLVV.....................................  108
ident                                                             
Sbjct vypgknggkptatgshldTQPEAgkydgilgvlaglevlrtfkdnnyvpnydvcvvvwfn  141
DSSP  eelllllllleeeeeellLLLLLlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeell


DSSP  ..................hhhhhhlllllLHHHhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhl
Query ..................kallalynlsvDQNLlfkltsavllkrgdngsxgdlaciaae  150
ident                                                             
Sbjct eegarfarsctgssvwshdlsleeayglxSVGE...........................  174
DSSP  llllllllllhhhhhhlllllhhhhhlllLLLL...........................


DSSP  lleeeelllhhhHHHHHHH.................llhhhhhhllllleeeeLLLLLLL
Query dlvlyqsfdrqkVAAWLEE.................enlatvlerdwgfsisqVKPTLEC  193
ident                                                         |   
Sbjct ....dkpesvydSLKNIGYigdtpasykeneidahfelhieqgpiledenkaiGIVTGVQ  230
DSSP  ....lllllhhhHHHHHLLlllllllllllllleeeeeeellllhhhhlllleEEEEEEL


DSSP  EEEEEELLLllLLLHhhhhhhLLLLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhh
Query DFLVGWTKEvaVSSHxvqqikQNINqnfltssketvvslvealeqgksekiieqvevask  253
ident                                                             
Sbjct AYNWQKVTV..HGVG.....aHAGT................................tpw  251
DSSP  EEEEEEEEE..ELLL.....eELLL................................llh


DSSP  hhhhhllllLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLL............lLLLEEEEEELLHHH
Query lleglstdiYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGA............gGGDCGIALSFDAQS  301
ident                   |  |                                      
Sbjct rlrkdallxSSKXIVAASEIAQRHNGLFTCGIIdakpysvniipgeVSFTLDFRHPSDDV  311
DSSP  hhlllhhhhHHHHHHHHHHHHHHLLLEEELLLEeeellllleelleEEEEEEEEELLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHLL...............lEEEEEEEL........................
Query TKTLKNRWADLG...............iELLYQERI........................  322
ident   |     |                   | |                             
Sbjct LATXLKEAAAEFdrlikindggalsyesETLQVSPAvnfhevciecvsrsafaqfkkdqv  371
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhllllllllleeeeEEEEEELLeellhhhhhhhhhhhhhhllhhhe


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct rqiwsgaghdscqtaphvptsxifipskdglshnyyeysspeeiengfkvllqaiinydn  431
DSSP  eeeeellllhhhhhllllleeeeeellhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .......
Query .......  322
ident        
Sbjct yrvirgh  438
DSSP  hhhhhll


No 31: 1CG2A  MOLECULE: CARBOXYPEPTIDASE G2;                                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ...................................................qkrdnvlfq    9
DSSP  ...................................................llllhhhhh


DSSP  hhhhhHHHHHHH...........................................lllll
Query etialXGDFLAV...........................................rgqnl   77
ident                                                             
Sbjct aatdeQPAVIKTleklvnietgtgdaegiaaagnfleaelknlgftvtrsksaglvvgdn   69
DSSP  hhhhhHHHHHHHhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeelllllllee


DSSP  lleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhHHLLLL...LLHHHHHHhhhhhhhl
Query rpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallALYNLS...VDQNLLFKltsavllk  134
ident                                                             
Sbjct ivgkikgrggknlllmshmdtvylkgilakapfrvEGDKAYgpgIADDKGGN........  121
DSSP  eeeeeelllllleeeeeellllllllhhhhllleeELLEEElllLLLLHHHH........


DSSP  lllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhHHHL..lhhhhhhlLLLLEE.EELL...
Query rgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawLEEE..nlatvlerDWGFSI.SQVK...  188
ident                                                  |          
Sbjct .........................avilhtlKLLKeygvrdygtiTVLFNTdEEKGsfg  156
DSSP  .........................hhhhhhhHHHHhllllllleeEEEEELlHHHLlll


DSSP  ..............................lLLLLEEEEEELLLLlLLLHhhHHHHllll
Query ..............................pTLECDFLVGWTKEVaVSSHxvQQIKqnin  218
ident                                |               |            
Sbjct srdliqeeakladyvlsfeptsagdeklslgTSGIAYVQVNITGK.ASHAgaAPEL....  211
DSSP  lhhhhhhhhhhlleeeellleelllleeeleELEEEEEEEEEELL.LEELllLHHH....


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLL.
Query qnfltssketvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDL.  277
ident                                                    |        
Sbjct .........................................gvnaLVEASDLVLRTMNId  230
DSSP  .........................................lllhHHHHHHHHHHHHHHl


DSSP  ......LEEE.EELLL......lLLLEEEEEEL......LHHHHHHHHHHHHHL.....L
Query ......QAVA.KSSGA......gGGDCGIALSF......DAQSTKTLKNRWADL.....G  313
ident                              |              |||  |          
Sbjct dkaknlRFNWtIAKAGnvsniipASATLNADVRyarnedFDAAMKTLEERAQQKklpeaD  290
DSSP  llllleEEEEeEEEELlllleelLEEEEEEEEEellhhhHHHHHHHHHHHHLLLlllllE


DSSP  LEEeEEEEL...................................................
Query IELlYQERI...................................................  322
ident        |                                                    
Sbjct VKV.IVTRGrpafnageggkklvdkavayykeaggtlgveertgggtdaayaalsgkpvi  349
DSSP  EEE.EEEELllleelhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeellllllllhhhhhhhlllee


DSSP  ........................................
Query ........................................  322
ident                                         
Sbjct eslglpgfgyhsdkaeyvdisaiprrlymaarlimdlgag  389
DSSP  llllleeelllllllleeehhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 32: 1S1HI  MOLECULE: 18S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEeeeelllhhhlllleeeeeeeeeEEEEEEEELlLLEEEEEL........
Query hXXIAVKTCGKlywageyailepgqlalikdipiYXRAEIAFSdSYRIYSDX........   52
ident           |                          |         |            
Sbjct .PSVQTFGKKK.....................saTAVAHVKAG.KGLIKVNGspitlvep   37
DSSP  .LLEEELLLLL.....................llEEEEEELLL.LLLEEELLeehhhhll


DSSP  .llLHHHHhHHHHHHHHhhhhllllllLEEEEEElhhHHLLLlllLLHHHHHHHHHHHHH
Query .npDYSLIqETIALXGDflavrgqnlrPFSLAIYgkxEREGKkfgLGSSGSVVVLVVKAL  111
ident          |   | |                        |                | |
Sbjct eilRFKVY.EPLLLVGL......dkfsNIDIRVR...VTGGG..hVSQVYAIRQAIAKGL   85
DSSP  lllLLHHH.HHHHHLLL......llllLLLEEEE...EELLL..hHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLL........lLLHH..hhHHHHhhhhhllllllllhhhhhhHHLLleeeelllhh
Query LALYNL........sVDQN..llFKLTsavllkrgdngsxgdlaciAAEDlvlyqsfdrq  161
ident  |                                             |            
Sbjct VAYHQKyvdeqskneLKKAftsyDRTL..................lIADS..........  117
DSSP  HHHLLLlllllllllLLLLllllLLLL..................lLLLL..........


DSSP  hhhhhhhhllhhhhhhllllleeeellllllleeeeeellllllllhhhhhhhllllhhh
Query kvaawleeenlatvlerdwgfsisqvkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnf  221
ident                                                             
Sbjct ............................................................  117
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhHHHHLLLLLLhhhhhhhhlLLLLleee
Query ltssketvvslvealeqgksekiieqvevasklLEGLSTDIYTpllrqlkeaSQDLqava  281
ident                                                             
Sbjct ............................rrpepKKFGGKGARS......rfqKSYR....  139
DSSP  ............................lllllLLLLLLLLLL......lllLLLL....


DSSP  eellllllleeeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query kssgagggdcgialsfdaqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                          
Sbjct .........................................  139
DSSP  .........................................


No 33: 2D1CA  MOLECULE: ISOCITRATE DEHYDROGENASE;                                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct plittetgkkmhvledgrklitvipgdgigpecveatlkvleaakaplayevreagasvf   60
DSSP  leeellllleeeellllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllhhhh


DSSP  .............................................LLLE...........
Query .............................................HXXI...........    4
ident                                                             
Sbjct rrgiasgvpqetiesirktrvvlkgpletpvgygeksanvtlrklFETYanvrpvrefpn  120
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhleeeelllllllllllllhhhhhhhhLLLLeeeeeeellll


DSSP  ..................EEEEeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeellll
Query ..................AVKTcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsy   46
ident                                                             
Sbjct vptpyagrgidlvvvrenVEDL......................................  142
DSSP  lllllllllleeeeeeelLLLH......................................


DSSP  eeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeEELHHhhlLLLLlllhhhhhhhh
Query riysdxnpdysliqetialxgdflavrgqnlrpfslaIYGKXereGKKFglgssgsvvvl  106
ident                                        |                    
Sbjct .....................................YAGIE...HMQT.psvaqtlkli  161
DSSP  .....................................HHLLE...EEEE.lleeeeeeee


DSSP  hhHHHHHHLLL.............lLLHHhhhhhhhhhhhllllllllhHHHHHHH....
Query vvKALLALYNL.............sVDQNllfkltsavllkrgdngsxgDLACIAA....  149
ident   |                                                         
Sbjct swKGSEKIVRFafelaraegrkkvhCATK..................snIMKLAEGtlkr  203
DSSP  ehHHHHHHHHHhhhhhhhlllleeeEEEL..................llLLLLHHHhhhh


DSSP  ........llleeeelllhhhhhhhHHHL.LHHH..........................
Query ........edlvlyqsfdrqkvaawLEEE.NLAT..........................  174
ident                          |                                  
Sbjct afeqvaqeypdieavhiivdnaahqLVKRpEQFEvivttnmngdilsdltsgligglgfa  263
DSSP  hhhhhhlllllleeeeeehhhhhhhHHHLhHHLLeeeelhhhhhhhhhhhhlllllhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  174
ident                                                             
Sbjct psanignevaifeavhgsapkyagknvinptavllsavmmlryleefatadlienallyt  323
DSSP  eeeeelllleeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............................................hhhllllleeeel
Query ...............................................vlerdwgfsisqv  187
ident                                                             
Sbjct leegrvltgdvvgydrgaktteyteaiiqnlgktprktqvrgykpfrlpqvdgaiapivp  383
DSSP  hhhlllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhlllllll


DSSP  llLLLLEEEEEELLLlllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhh
Query kpTLECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieq  247
ident          |                                                  
Sbjct rsRRVVGVDVFVETN.............................................  398
DSSP  llEEEEEEEEEEELL.............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhlllLLLHHHHHHHHLLLLLLEEE.EELLL.............lLLLE.E
Query vevasklleglstdIYTPLLRQLKEASQDLQAVA.KSSGA.............gGGDC.G  292
ident                   |   |              |                      
Sbjct .............lLPEALGKALEDLAAGTPFRLkMISNRgtqvypptggltdlVDHYrC  445
DSSP  .............lLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEeEEEELleeeelllllllllLLEEeE


DSSP  EEEE.....LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL...............
Query IALS.....FDAQSTKTLKNRWADLGIELLYQERI...............  322
ident   |              |  | |                           
Sbjct RFLYtgegeAKDPEILDLVSRVASRFRWMHLEKLQefdgepgftkaqged  495
DSSP  EEEElllllLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEEEeelleelllllllll


No 34: 1YSJA  MOLECULE: PROTEIN YXEP;                                              

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhHHHHHHHllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhHHHLLllll
Query etialXGDFLAVrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkalLALYNlsvd  120
ident          |                                                  
Sbjct .adkaFHTRLIN...............xrrdlhehpelsfqevettkkirrWLEEE...q   41
DSSP  .llhhHHHHHHH...............hhhhhhhllllllllhhhhhhhhhHHHHL...l


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeEELLLHHhhHHHHhhllhhhhhhlLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlYQSFDRQkvAAWLeeenlatvlerDW  180
ident                                                             
Sbjct ieildvpqlktgviaeikgredgpviairadidaLPIQEQT..NLPF.........asKV   90
DSSP  leellllllllleeeeeelllllleeeeeeelllLLLLLLL..LLLL.........llLL


DSSP  LL.....................................eeEELL...............
Query GF.....................................siSQVK...............  188
ident                                                             
Sbjct DGtxhacghdfhtasiigtaxllnqrraelkgtvrfifqpaEEIAagarkvleagvlngv  150
DSSP  LLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhllleeeeeeellLLLLlhhhhhhhlllllle


DSSP  .......................lllLLEEEEEELLLlllllhhhhhhhllllhhhhhhh
Query .......................ptlECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltss  225
ident                             |      |                        
Sbjct saifgxhnkpdlpvgtigvkegplxaSVDRFEIVIKG.......................  187
DSSP  eeeeeeeeelllllleeeelleeeelLEEEEEEEEEL.......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLllLEEE.EEL
Query ketvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQdlQAVA.KSS  284
ident                                            |     |          
Sbjct ................................knsidpIAAAGQIISGLQnaVVSItRVQ  215
DSSP  ................................lllllhHHHHHHHHHHHLllEEEEeEEE


DSSP  LL......LLLLEEEEEEL......LHHHHHHHHHHHHHL......LLEEeEEEEL....
Query GA......GGGDCGIALSF......DAQSTKTLKNRWADL......GIELlYQERI....  322
ident                                                 |           
Sbjct AGtswnviPDQAEXEGTVRtfqkeaRQAVPEHXRRVAEGIaagygaQAEF.KWFPYlpsv  274
DSSP  ELllllllLLEEEEEEEEElllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllEEEE.EEEEEelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct qndgtflnaaseaaarlgyqtvhaeqspggedfalyqekipgffvwxgtngteewhhpaf  334
DSSP  eelhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllhhhhhlllleeeeeeellllllllllll


DSSP  .........................
Query .........................  322
ident                          
Sbjct tldeealtvasqyfaelavivleti  359
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 35: 1XHKA  MOLECULE: PUTATIVE PROTEASE LA HOMOLOG;                              

DSSP  llleeEEEEEEEeeelllhhhlllleeeeEEEEEEEEEEEEELLLLEEEE..elLLLHHH
Query hxxiaVKTCGKLywageyailepgqlaliKDIPIYXRAEIAFSDSYRIYS..dxNPDYSL   58
ident      |                                 |  |                 
Sbjct epkvgVIYGLAV............lgaggIGDVTKIIVQILESKNPGTHLlnisGDIAKH   48
DSSP  lllllEEEEEEL............lllllLLEEEEEEEEEEELLLLEEEEelllHHHHHH


DSSP  .HHHHHHHHHHHHH..HLLL.....llLLEEEEEELHHhhlLLLLLlLHHHHHHHHHHHH
Query .IQETIALXGDFLA..VRGQ.....nlRPFSLAIYGKXereGKKFGlGSSGSVVVLVVKA  110
ident  |    ||     |                   |                          
Sbjct sITLASALSKKLVAekKLPLpkkdidlNNKEIYIQFSQ...SYSKI.DGDSATAAVCLAI  104
DSSP  hHHHHHHHHHHHHHllLLLLlllllllLLEEEEEEELL...LLLLL.LHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLLhhhhhhhhHHHHHLlllllLLHHhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhl
Query LLALYNLSVDqnllfkltSAVLLKrgdngSXGDlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleee  170
ident   ||                                                        
Sbjct ISALLDIPLKqdfaitgsLDLSGN.....VLAI.................ggvnekieaa  142
DSSP  HHHHHLLLLLlleeelleELLLLL.....EELL.................llhhhhhhhh


DSSP  lhhhhhhllllLEEE..ELLLlllleeeeeellllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhh
Query nlatvlerdwgFSIS..QVKPtlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltssket  228
ident                                                             
Sbjct krygfkrviipEANXidVIET.......................................  163
DSSP  hhlllleeeeeHHHHhhLLLL.......................................


DSSP  hhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeelllll
Query vvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgagg  288
ident                                                             
Sbjct ............................................................  163
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query gdcgialsfdaqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                   
Sbjct ............egieiipvktldeivplvfdld  185
DSSP  ............llleeeeellhhhhhhhhllll


No 36: 1PHZA  MOLECULE: PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhlLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerDW  180
ident                                                             
Sbjct ..........................................................GQ    2
DSSP  ..........................................................LL


DSSP  LL.EEEELLLLLLLEEEEEELLLlllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query GF.SISQVKPTLECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident     |           |    ||                                     
Sbjct ETsYIEDNSNQNGAISLIFSLKE.....................................   25
DSSP  LLlLLLLLLLLLLLEEEEEEEEL.....................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllHHHHHHHHLLLLL...leEEEELLL...lLLLEEE
Query ksekiieqvevasklleglstdiytPLLRQLKEASQDL...qaVAKSSGA...gGGDCGI  293
ident                            |                  |             
Sbjct .......................evGALAKVLRLFEENdinltHIESRPSrlnkDEYEFF   62
DSSP  .......................llLHHHHHHHHHHLLlllllLEEEEELllllLEEEEE


DSSP  EEEL..LHHHHHHHHHHHH.HLLLEEeEEEEL............................
Query ALSF..DAQSTKTLKNRWA.DLGIELlYQERI............................  322
ident                     | |                                     
Sbjct TYLDkrTKPVLGSIIKSLRnDIGATV.HELSRdkekntvpwfprtiqeldrfanqildad  121
DSSP  ELLLhhHHHHHHHHHHHHHhLLLLLE.EEEELlllllleelllllhhhhhllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hpgfkdpvyrarrkqfadiaynyrhgqpiprveyteeekqtwgtvfrtlkalykthacye  181
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hnhifpllekycgfrednipqledvsqflqtctgfrlrpvagllssrdflgglafrvfhc  241
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhlleeeellllllhhhhhhhhllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct tqyirhgskpmytpepdichellghvplfsdrsfaqfsqeiglaslgapdeyieklatiy  301
DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct wftvefglckegdsikaygagllssfgelqyclsdkpkllplelektacqeysvtefqpl  361
DSSP  hlllllleeeelleeeellhhhhllhhhhhhhllllleeeellhhhhlllllllllllle


DSSP  ..........................................
Query ..........................................  322
ident                                           
Sbjct yyvaesfsdakekvrtfaatiprpfsvrydpytqrvevldnt  403
DSSP  eeeellhhhhhhhhhhhhllllllleeeeelllleeeeelll


No 37: 1P9QC  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN AF0491;                               

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeELLL...............
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiaFSDS...............   45
ident                                           |                 
Sbjct .........................................VSLDkaviarlrkggeefe   19
DSSP  .........................................LLLLlleeeeeeelleeee


DSSP  ................................leeeeellllhhhhhhhhhhHHHHHHHL
Query ................................yriysdxnpdysliqetialXGDFLAVR   73
ident                                                             
Sbjct vlvdpylardlkegkevnfedllaaeevfkdakkgerasvdelrkifgtddvFEIARKII   79
DSSP  eeelhhhhhhhhhlllllhhhhlllllleeelllleellhhhhhhhhllllhHHHHHHHH


DSSP  Lllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhh
Query Gqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvdqnllfkltsavll  133
ident                                                             
Sbjct L...........................................................   80
DSSP  H...........................................................


DSSP  llllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhHLLL.............
Query krgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlERDW.............  180
ident                                                             
Sbjct .......................................egevQITAeqrremleakrkq  101
DSSP  .......................................hleeLLLHhhhhhhhhhhhhh


DSSP  .............................................lleeeelllLLLLEE
Query .............................................gfsisqvkpTLECDF  195
ident                                                         |   
Sbjct iinfisrntidpaphppsrieraleeakvhidifksveaqvkdivkalkpilplKFEEME  161
DSSP  hhhhhhhheellllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhllllllEELEEE


DSSP  EEEELLLLllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhh
Query LVGWTKEVavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieqvevaskll  255
ident                                                             
Sbjct IAIKIPPE....................................................  169
DSSP  EEEEELLL....................................................


DSSP  hhhlllllLHHHHHHHHLLlllleEEEELLLL..LLLEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL
Query eglstdiyTPLLRQLKEASqdlqaVAKSSGAG..GGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG  313
ident               |                   |                |        
Sbjct ......htGRAISALYNFG.....GVTREEWQrdGSWICVMRIPSG.MYGDLMDLLGKVA  217
DSSP  ......lhHHHHHHHHHHL.....LEEEEEELllLLEEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHL


DSSP  ..lEEEE.EEEL.
Query ..iELLY.QERI.  322
ident     |     || 
Sbjct kgeALTKvLRRIg  230
DSSP  lllLEEEeEEEEl


No 38: 1Q8IA  MOLECULE: DNA POLYMERASE II;                                         

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllLL
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsVD  120
ident                                                             
Sbjct ..........................................................AQ    2
DSSP  ..........................................................LE


DSSP  HHhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhllL
Query QNllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdW  180
ident                                                             
Sbjct AG...................................filtrhwrdtpqgtevsfwlatD   27
DSSP  EE...................................eeeeeeeelllllleeeeeeeeL


DSSP  LLEEEELLlLLLLEEEEEELLllllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query GFSISQVKpTLECDFLVGWTKevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
ident                                                             
Sbjct NGPLQVTL.APQESVAFIPAD.......................................   47
DSSP  LEEEEEEL.LLLLEEEEEEHH.......................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhHHHHHHHLLL.LLLEEEEELL...llLLLEEEEEE
Query sekiieqvevasklleglstdiytpLLRQLKEASQ.DLQAVAKSSG...agGGDCGIALS  296
ident                                   |                         
Sbjct .........................QVPRAQHILQgEQGFRLTPLAlkdfhRQPVYGLYC   82
DSSP  .........................HHHHHHHHLLlLLLEEEEEEEeelllLLEEEEEEE


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEE.EEEL.................................
Query FDAQSTKTLKNRWADLGIELLY.QERI.................................  322
ident            |    |        |                                  
Sbjct RAHRQLMNYEKRLREGGVTVYEaDVRPperylmerfitspvwvegdmhngtivnarlkph  142
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlLLLHhhhhhhhllllleeeeeeeeelleeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct pdyrpplkwvsidiettrhgelyciglegcgqrivymlgpengdassldfeleyvasrpq  202
DSSP  lllllllleeeeeeeellllleeeeeeeelleeeeeeelllllllllllleeeeellhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct lleklnawfanydpdviigwnvvqfdlrmlqkhaeryrlplrlgrdnselewrehgfkng  262
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeellllllhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct vffaqakgrliidgiealksafwnfssfsletvaqellmdeidrrfaedkpalatynlkd  322
DSSP  eeeeelllleeeehhhhhhhlllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct celvtqifhkteimpflleratvnglpvdrhggsvaafghlyfprmhragyvapnlgevp  382
DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct phaspggyvmdsrpglydsvlvldykslypsivrtflidpvglvegmaqpdpehstegfl  442
DSSP  lllllllllllllleeeeeeeeeeellhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllleeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct dawfsrekhclpeivtniwhgrdeakrqgnkplsqalkiimnafygvlgttacrffdprl  502
DSSP  lleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct assitmrghqimrqtkalieaqgydviygdtdstfvwlkgahseeeaakigralvqhvna  562
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct wwaetlqkqrltsaleleyethfcrflmptirgadtgskkryagliqegdkqrmvfkgle  622
DSSP  hhhhhhhllllllllleeeeeeeeeeeellllllllllllleeeeeeelleeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct ttdwtplaqqfqqelylrifrnepyqeyvretidklmageldarlvyspldyehyltrql  682
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllhhhhhhhlh


DSSP  .........................
Query .........................  322
ident                          
Sbjct qpvaegilpfiednfatlmtgqlgl  707
DSSP  hhhhhllhhhhlllhhhhhhhhhll


No 39: 2Q43A  MOLECULE: IAA-AMINO ACID HYDROLASE ILR1-LIKE 2;                      

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhHHHHHHHHHLlllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLL.
Query etiALXGDFLAVRgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalyNLSV.  119
ident     |                                                       
Sbjct ...KLLEFAKSPE.....................................vfdwmVKIRr   20
DSSP  ...LLHHHHHLHH.....................................hhhhhHHHHh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct kihenpelgyeeletsklirseleligikyrypvaitgvigyigtgeppfvalradmdal   80
DSSP  hhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellleeeeeeellllleeeeeeellll


DSSP  ........................LHHHHHhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleee
Query ........................DQNLLFkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvly  155
ident                                                             
Sbjct piqegvewehkskiagkmhacghdGHVTML..............................  110
DSSP  llllllllllllllllllllllhhHHHHHH..............................


DSSP  elllhhhhhhHHHHLlhhhhhhLLLLLEEE.ELLL.........................
Query qsfdrqkvaaWLEEEnlatvleRDWGFSIS.QVKP.........................  189
ident                                                             
Sbjct ...lgaakilHEHRH...hlqgTVVLIFQPaEEGLsgakkmreegalknveaifgihlsa  164
DSSP  ...hhhhhhhHHLHH...hlllEEEEEEELlLLLLlhhhhhhhlllllleeeeeeeeeee


DSSP  ..............llLLEEEEEELLLLllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..............tlECDFLVGWTKEVavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvea  235
ident                                                             
Sbjct ripfgkaasragsflaGAGVFEAVITGK................................  192
DSSP  eeellleeelleeeelLLEEEEEEEEEL................................


DSSP  hhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHH.LLLLL..........LEEEEEL
Query leqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKE.ASQDL..........QAVAKSS  284
ident                                         |                   
Sbjct ........................tidpVVAASSIVLsLQQLVsretdpldskVVTVSKV  228
DSSP  ........................llhhHHHHHHHHHhHHHHLllllllllleEEEEEEE


DSSP  LllLLLEEEEEEL....LHHHHHHHHHHHHHLL.....leeeEEEE..............
Query GagGGDCGIALSF....DAQSTKTLKNRWADLG.....iellYQER..............  321
ident                    |     |                                  
Sbjct N.pDSITIGGTLRaftgFTQLQQRVKEVITKQAavhrcnasvNLTPngrepmpptvnnkd  287
DSSP  L.lLEEEEEEEEEelllHHHHHHHHHHHHHHHHhllleeeeeELLHhhlllllleeelhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  321
ident                                                             
Sbjct lykqfkkvvrdllgqeafveaapvmgsedfsyfaetipghfsllgmqdetngyasshspl  347
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllleellllllllllhhhhlllleeeeeeeeelllllllllllll


DSSP  ...........................l
Query ...........................i  322
ident                             
Sbjct yrinedvlpygaaihasmavqylkekas  375
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 40: 1M5HA  MOLECULE: FORMYLMETHANOFURAN--TETRAHYDROMETHANOPTERIN                

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhhhllhhhHHHLLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatVLERDW  180
ident                                                       |     
Sbjct ....................................................mkVNGVEV    8
DSSP  ....................................................leELLEEE


DSSP  LLEEEELLlLLLLEEEEEELLLlllllhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query GFSISQVKpTLECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
ident                                                             
Sbjct EETFAEAF.DIKIARVLITGYD......................................   29
DSSP  LLLEEEEE.EEEEEEEEEELLL......................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHL.LLLL........LEEE.EELLL....
Query sekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEA.SQDL........QAVA.KSSGA....  286
ident                                                |            
Sbjct .......................YYWAWVAANEaTGFGtsvimcpaEAGIeIKAKPsetp   66
DSSP  .......................HHHHHHHHHHhHLLLllllllllEEEEeEEELHhhll


DSSP  llLLEEEEEEL......LHHHHHHHHH.HHHHLL.LEEEE....................
Query ggGDCGIALSF......DAQSTKTLKN.RWADLG.IELLY....................  318
ident                                                             
Sbjct dgRPGYYIQIChmskkgLEEQLLARLGqCVLTAPtTAVFNglpdaeekddtgfklkffad  126
DSSP  llLLEEEEEEEellhhhHHHHHHHHHHhHLLLLLlLEEEEllllllleelhhhhhhhhhl


DSSP  ............................EEEL............................
Query ............................QERI............................  322
ident                                                             
Sbjct gyqkevevggrkcwavpmmegdfiiendIGYTngiaggnffimaetqpsalaaakaavda  186
DSSP  llleeeeelleeeeeeelllleeeeellEEEEeeeeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct isdvegvitpfpggivasgskvgankykflkastnekfapsirdqvegtqipagvkavye  246
DSSP  hhlllleelllhhhlllllllllllllllllllllhhhlhhhhhhhlllllllllleeee


DSSP  ...................................................
Query ...................................................  322
ident                                                    
Sbjct ivinglnadaikeatrvgilaatkipgvvkitagnyggklgkhiinlnelf  297
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllllleeeehhhll


No 41: 2E1RA  MOLECULE: ELONGATION FACTOR 2;                                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeEEEL.................
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeIAFS.................   43
ident                                                             
Sbjct ............mvaftvdqmrslmdkvtnvrnmsviahVDHGkstltdslvqragiisa   48
DSSP  ............leeelhhhhhhhlllhhheeeeeeeelLLLLhhhhhhhhhhhhleeel


DSSP  ...............................llleeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ...............................dsyriysdxnpdysliqetialxgdflav   72
ident                                                             
Sbjct akergitikstaislysemsdedvkeikqktdgnsflinlidspghvdfssevtaalrvt  108
DSSP  llllllllllleeeeeeelllllllllllllllleeeeeeellllllllllhhhhhhlll


DSSP  lllLLLLEeeeeelhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhHHHHLLL...............
Query rgqNLRPFslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkaLLALYNL...............  117
ident                                                             
Sbjct dgaLVVVD.........................tiegvCVQTETVlrqalgerikpvvvi  143
DSSP  leeEEEEE.........................lllllLHHHHHHhhhhhhllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  117
ident                                                             
Sbjct nkvdrallelqvskedlyqtfartvesvnvivstyadevlgdvqvypargtvafgsglhg  203
DSSP  elhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhllllllhhhlleeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  117
ident                                                             
Sbjct waftirqfatryakkfgvdkakmmdrlwgdsffnpktkkwtnkdtdaegkplerafnmfi  263
DSSP  eeeehhhhhhhhhhhllllhhhhhhhllllleeelllleeelllllllllllllhhhhhl


DSSP  .............lllhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhh
Query .............svdqnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkva  164
ident                                                             
Sbjct ldpifrlftaimnfkkdeipvllekleivlkgdekdlegkallkvvmrkflpaadallem  323
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhh


DSSP  hhhhHLLHHHHHH.LLLL..........................................
Query awleEENLATVLE.RDWG..........................................  181
ident          |    |                                             
Sbjct ivlhLPSPVTAQAyRAEQlyegpaddanciaikncdpkadlmlyvskmvptsdkgrfyaf  383
DSSP  hhhhLLLHHHHHHhLHHHhlllllllhhhhhhhlllllllleeeeeeeelllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  181
ident                                                             
Sbjct grvfagtvksgqkvriqgpnyvpgkkddlfikaiqrvvlmmgrfvepiddcpagniiglv  443
DSSP  eeeeeleeellllleeellllllllllleellllleeeeeelleeeeeleeellleeeee


DSSP  ..................leeeelllLLLL.EEEEEELLLLllllhhhhhhhllllhhhh
Query ..................fsisqvkpTLEC.DFLVGWTKEVavsshxvqqikqninqnfl  222
ident                                       |                     
Sbjct gidqfllktgtlttsetahnmkvmkfSVSPvVQVAVEVKNA...................  484
DSSP  llllllllleeeelllllllllllllLLLLlEEEEEEELLH...................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLL.LEEE
Query tssketvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDL.QAVA  281
ident                                            |   ||  |        
Sbjct ......................................ndlPKLVEGLKRLSKSDpCVLT  506
DSSP  ......................................hhhHHHHHHHHHHHHHLlLEEE


DSSP  EELLLllllEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHL....LLEEEE...................
Query KSSGAgggdCGIALSFDAQSTKTLKNRWADL....GIELLY...................  318
ident   |        |                                                
Sbjct YMSES...gEHIVAGTGELHLEICLQDLEHDhagvPLKISPpvvayretvesessqtals  563
DSSP  EELLL...lLEEEEELLHHHHHHHHHHHHHLllllLEEEELllllleeeellllllleee


DSSP  ............................................................
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Sbjct kspnkhnriylkaepideevslaiengiinprddfkararimaddygwdvtdarkiwcfg  623
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Sbjct pdgngpnlvidqtkavqylheikdsvvaafqwatkegpifgeemrsvrvnildvtlhada  683
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Sbjct ihrgggqiiptmrratyagflladpkiqepvflveiqcpeqavggiysvlnkkrgqvvse  743
DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhlllleeeee


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Sbjct eqrpgtplftvkaylpvnesfgftgelrqatggqafpqmvfdhwstlgsdpldptskage  803
DSSP  eelllllleeeeeeeehhhlllhhhhhhhhlllllllllleeeeeellllllllllhhhh


DSSP  .....................eeel
Query .....................qeri  322
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Sbjct ivlaarkrhgmkeevpgwqeyydkl  828
DSSP  hhhhhhhhhllllllllhhhlllll


No 42: 1Z1WA  MOLECULE: TRICORN PROTEASE INTERACTING FACTOR F3;                    

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct mevekydltldfdiqkrtfngtetitadagdivldavglqinwmkvngrdtaftydgqtv   60
DSSP  lleeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeelleeeeeelllleeeeeeellleelleelllee


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Query .................................hxxiavktcgklywageyailepgqla   27
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Sbjct rapgdsqpqkieisfagkvsdslsgiyyagrengmitthfeatdarrmfpcvdhpaykav  120
DSSP  eeeeelllleeeeeeeeelllllleeeeellllleeeeelllllhhhlllllllllllle


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Query likdipiyxraeiaFSDS..........................................   45
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