DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1K47B MOLECULE: PHOSPHOMEVALONATE KINASE;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1K47-A 53.6  0.3  322   322  100   PHOSPHOMEVALONATE KINASE;                                  "         
   2:  1PIE-A 28.2  2.5  288   388   18   GALACTOKINASE;                                             "         
   3:  1VIS-A 28.0  2.8  279   314   20   MEVALONATE KINASE;                                         "         
   4:  1S4E-A 28.0  2.6  278   337   19   GALACTOKINASE;                                             "         
   5:  1WUU-A 27.2  2.8  284   391   15   GALACTOKINASE;                                             "         
   6:  2OI2-A 27.1  3.9  277   285   17   MEVALONATE KINASE;                                         "         
   7:  2HFS-A 27.0  3.3  284   326   16   MEVALONATE KINASE, PUTATIVE;                               "         
   8:  2AJ4-A 26.9  2.7  292   509   14   GALACTOKINASE;                                             "         
   9:  2A2C-A 26.7  3.0  288   446   13   N-ACETYLGALACTOSAMINE KINASE;                              "         
  10:  1KVK-A 25.9  3.5  287   378   19   MEVALONATE KINASE;                                         "         
  11:  1FWK-A 22.4  2.8  272   296   16   HOMOSERINE KINASE;                                         "         
  12:  2HK2-A 20.7  3.3  274   331    7   DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE;                         "         
  13:  2GS8-A 20.3  3.3  272   316   15   MEVALONATE PYROPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    "         
  14:  1FI4-A 20.2  3.5  287   391    8   MEVALONATE 5-DIPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    "         
  15:  2HKE-A 19.0  3.7  279   377   10   DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE, PUTATIVE;               "         
  16:  2V2Q-A 16.4  3.3  241   269   13   4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 "         
  17:  1OJ4-A 15.8  3.6  244   283   15   4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 "         
  18:  1MG7-A 15.8  3.1  242   351   10   EARLY SWITCH PROTEIN XOL-1 2.2K SPLICE FORM;               "         
  19:  1UEK-A 15.6  3.7  243   268   16   4-(CYTIDINE 5'-DIPHOSPHO)-2C-METHYL-D-ERYTHRITOL           "         
  20:  1Y5Y-A  5.5  2.6   78   159    1   FORMALDEHYDE-ACTIVATING ENZYME FAE;                        "         
  21:  2NN6-D  5.2  3.2   94   204    6   POLYMYOSITIS/SCLERODERMA AUTOANTIGEN 1;                    "         
  22:  1VS5-I  5.0  6.5  108   127   13   16S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  23:  2BOA-A  4.9  3.3   71   404   14   CARBOXYPEPTIDASE A4;                                       "         
  24:  1JQG-A  4.8  3.2   71   409   11   CARBOXYPEPTIDASE A;                                        "         
  25:  2JE6-A  4.7  4.3  100   274   10   EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE 2;                             "         
  26:  1VIX-A  4.7 12.4   99   411   10   PEPTIDASE T;                                               "         
  27:  1NH7-A  4.6 14.8   83   274   12   ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE;                             "         
  28:  1KWM-A  4.6  3.6   70   402    7   PROCARBOXYPEPTIDASE B;                                     "         
  29:  2Q43-A  4.5 14.1  103   375    5   IAA-AMINO ACID HYDROLASE ILR1-LIKE 2;                      "         
  30:  2PFD-A  4.5  3.8   87   540    5   FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     "         
  31:  1CG2-A  4.4 16.9  113   389   10   CARBOXYPEPTIDASE G2;                                       "         
  32:  1YSJ-A  4.3  9.8   95   359    6   PROTEIN YXEP;                                              "         
  33:  1S1H-I  4.3  4.2   94   139   11   18S RIBOSOMAL RNA;                                         "         
  34:  2D1C-A  4.1  8.0  120   495    9   ISOCITRATE DEHYDROGENASE;                                  "         
  35:  1XHK-A  4.1  4.3  107   185   10   PUTATIVE PROTEASE LA HOMOLOG;                              "         
  36:  1VI7-A  4.1 10.0   99   206    9   HYPOTHETICAL PROTEIN YIGZ;                                 "         
  37:  1PHZ-A  4.1  7.2   80   403   10   PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       "         
  38:  1Q8I-A  4.0  6.6   76   707    5   DNA POLYMERASE II;                                         "         
  39:  1Q8K-A  3.9 12.5   99   300    6   EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2                 "         
  40:  1M5H-A  3.9  6.2   83   297    1   FORMYLMETHANOFURAN--TETRAHYDROMETHANOPTERIN                "         
  41:  1Z1W-A  3.8  4.4  158   780    4   TRICORN PROTEASE INTERACTING FACTOR F3;                    "         
  42:  2BMB-A  3.7  3.0   68   513    7   FOLIC ACID SYNTHESIS PROTEIN FOL1;                         "         
  43:  1VK3-A  3.6  6.3   98   586    6   PHOSPHORIBOSYLFORMYLGLYCINAMIDINE SYNTHASE II;             "         
  44:  2E1R-A  3.5 13.6   93   828    9   ELONGATION FACTOR 2;                                       "         
  45:  1M1G-A  3.5  2.8   66   240    6   TRANSCRIPTION ANTITERMINATION PROTEIN NUSG;                "         
  46:  1JK9-B  3.5  3.1   67   243    9   SUPEROXIDE DISMUTASE;                                      "         
  47:  1HI9-A  3.5 10.4   93   274    6   DIPEPTIDE TRANSPORT PROTEIN DPPA;                          "         
  48:  2E1P-A  3.4  2.6   58   395    7   TK-SUBTILISIN;                                             "         
  49:  1T1E-A  3.4  7.8   77   534    4   KUMAMOLISIN;                                               "         
  50:  1QAX-A  3.4  9.5  100   425    6   PROTEIN (3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARYL-COENZYME A             "         
  51:  2GIF-A  3.3  4.7  123  1032   11   ACRIFLAVINE RESISTANCE PROTEIN B;                          "         
  52:  1MLA-A  3.3  4.0  117   305    9   MALONYL-COENZYME A ACYL CARRIER PROTEIN                    "         
  53:  2OEJ-A  3.1  2.8   67   407    9   2,3-DIKETO-5-METHYLTHIOPENTYL-1-PHOSPHATE                  "         
  54:  1TVI-A  3.1  3.2   93   150   10   HYPOTHETICAL UPF0054 PROTEIN TM1509;                       "         
  55:  2GHP-A  3.0  3.6   64   232    2   U4/U6 SNRNA-ASSOCIATED SPLICING FACTOR PRP24;              "         
  56:  2F7V-A  3.0 10.9   95   360    9   AECTYLCITRULLINE DEACETYLASE;                              "         
  57:  1R43-A  3.0 13.7  104   438   11   BETA-ALANINE SYNTHASE;                                     "         
  58:  2PHC-B  2.9  2.7   59   215    8   UNCHARACTERIZED PROTEIN PH0987;                            "         
  59:  2C5S-A  2.9  3.1   65   372   14   PROBABLE THIAMINE BIOSYNTHESIS PROTEIN THII;               "         
  60:  2BM0-A  2.9 14.2   88   666    9   ELONGATION FACTOR G;                                       "         
  61:  2AWZ-A  2.9  4.6   90   557   10   GENOME POLYPROTEIN;                                        "         
  62:  1OZ9-A  2.9  2.7   73   141   16   HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1354;                              "         
  63:  1LK5-A  2.9  6.5   90   229    7   D-RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE;                            "         
  64:  2DR5-A  2.8  4.9   95   437    5   CCA-ADDING ENZYME;                                         "         
  65:  1F0X-A  2.8  8.4   84   502    4   D-LACTATE DEHYDROGENASE;                                   "         
  66:  1DOF-A  2.7 13.4  103   385    6   ADENYLOSUCCINATE LYASE;                                    "         
  67:  1TDJ-A  2.6 14.0   92   494    8   BIOSYNTHETIC THREONINE DEAMINASE;                          "         
  68:  2IGK-A  2.5  3.8   93   577    4   PYRANOSE OXIDASE;                                          "         
  69:  2BX6-A  2.5  4.1   84   311    5   XRP2 PROTEIN;                                              "         
  70:  1VBK-A  2.4  3.0   64   307   11   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1313;                               "         
  71:  1P9Q-C  2.4 12.4   92   230    4   HYPOTHETICAL PROTEIN AF0491;                               "         
  72:  1HLV-A  2.4  3.4   61   131    7   MAJOR CENTROMERE AUTOANTIGEN B;                            "         
  73:  1DII-A  2.4  2.6   57   515    5   P-CRESOL METHYLHYDROXYLASE;                                "         
  74:  2GL6-A  2.3  4.8   94   321    4   CREATINE KINASE;                                           "         
  75:  2BWJ-A  2.3  3.6   59   196    8   ADENYLATE KINASE 5;                                        "         
  76:  2APO-A  2.3 15.2   91   304   10   PROBABLE TRNA PSEUDOURIDINE SYNTHASE B;                    "         
  77:  2F48-A  2.2  4.9   90   551   13   DIPHOSPHATE--FRUCTOSE-6-PHOSPHATE 1-                       "         
  78:  2AJ6-A  2.2  4.0   57   120    7   HYPOTHETICAL PROTEIN MW0638;                               "         
  79:  1GEH-A  2.2  2.8   64   427    9   RIBULOSE-1,5-BISPHOSPHATE CARBOXYLASE/OXYGENASE;           "         
  80:  2HCF-A  2.1  3.2   73   225    7   HYDROLASE, HALOACID DEHALOGENASE-LIKE FAMILY;              "         
  81:  2BA0-A  2.1  5.5   77   218    8   ARCHEAL EXOSOME RNA BINDING PROTEIN RRP4;                  "         
  82:  2AKW-B  2.1 14.1   83   785   12   PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN;                  "         
  83:  1YZF-A  2.1  2.9   62   195    6   LIPASE/ACYLHYDROLASE;                                      "         
  84:  1Y1L-A  2.1  3.2   57   124    7   ARSENATE REDUCTASE (ARSC);                                 "         
  85:  1U02-A  2.1  3.6   81   229    7   TREHALOSE-6-PHOSPHATE PHOSPHATASE RELATED                  "         
  86:  1JIH-A  2.1  6.5   75   509    4   DNA POLYMERASE ETA;                                        "         
  87:  1HHS-A  2.1  9.1  101   664    8   P2 PROTEIN;                                                "         
  88:  1F5Q-B  2.1  3.8   80   247    6   CYCLIN DEPENDENT KINASE 2;                                 "         
  89:  1ESP-A  2.1  7.1  109   317   11   NEUTRAL PROTEASE MUTANT E144S;                             "         
  90:  2OQO-A  2.0  3.6   78   181    9   PENICILLIN-BINDING PROTEIN 1A (PBP-1A) (PBP1A);            "         
  91:  2CCG-A  2.0  2.7   58   202    5   THYMIDYLATE KINASE;                                        "         
  92:  1W25-A  2.0 14.7   84   454    7   STALKED-CELL DIFFERENTIATION CONTROLLING PROTEIN;          "         
  93:  1ST6-A  2.0  4.5  107  1049    7   VINCULIN;                                                  "         
  94:  1N52-A  2.0 12.8   87   732   10   80 KDA NUCLEAR CAP BINDING PROTEIN;                        "         
-

No 1: 1K47A  MOLECULE: PHOSPHOMEVALONATE KINASE;                                  

DSSP  LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELLLLEEEEELLLLHHHHH
Query HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSDSYRIYSDXNPDYSLIQ   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSDSYRIYSDXNPDYSLIQ   60
DSSP  LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELLLLEEEEELLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL
Query ETIALXGDFLAVRGQNLRPFSLAIYGKXEREGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVD  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ETIALXGDFLAVRGQNLRPFSLAIYGKXEREGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVD  120
DSSP  HHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELHHHHLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHLLL
Query QNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFDRQKVAAWLEEENLATVLERDW  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct QNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFDRQKVAAWLEEENLATVLERDW  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLLHHHHHHHHHHLLHHHHHHLLL


DSSP  LLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL
Query GFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNINQNFLTSSKETVVSLVEALEQGK  240
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNINQNFLTSSKETVVSLVEALEQGK  240
DSSP  LLEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLLHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLLLLEEEEEEELLHH
Query SEKIIEQVEVASKLLEGLSTDIYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAQ  300
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SEKIIEQVEVASKLLEGLSTDIYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAQ  300
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLLLLLEEEEEELLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL
Query STKTLKNRWADLGIELLYQERI  322
ident ||||||||||||||||||||||
Sbjct STKTLKNRWADLGIELLYQERI  322
DSSP  HHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL


No 2: 1PIEA  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  .................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEEEEEEEEEEEEEEEL
Query .................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALIKDIPIYXRAEIAFS   43
ident                           |     ||              | |         
Sbjct tvlsaltekfaevfgdtKEVEYFFSPGRINLIGEHTDYNG.GYVFPASITIGTTGLARLR   59
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhlllLLLEEEEEEEEEEEELLLLLLLL.LEEEEEEEEEEEEEEEEEL


DSSP  L..LLEEEEELL...................LLHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLLLEEE
Query D..SYRIYSDXN...................PDYSLIQETIALXGDFLAvrgQNLRPFSL   82
ident        ||                               |                | |
Sbjct EdkKVKLYSENFpklgviefdldevekkdgeLWSNYVKGMIVMLKGAGY...EIDKGFEL  116
DSSP  LllEEEEEELLLhhhlleeeellllllllllLLHHHHHHHHHHHHHLLL...LLLLLEEE


DSSP  EEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLL
Query AIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKR.GDNGSX  141
ident  | |         || || |   ||   |  | || |    |  |         | |   
Sbjct LIKGEI...PTASGLSSSASLELLVGVVLDDLFNLNVPRLELVQLGQKTENDYiGVNSGI  173
DSSP  EEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLlLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhhhllllhhhhhhlllLLEEEELLLLLL.LEEEE
Query GDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwGFSISQVKPTLE.CDFLV  197
ident  |   |                                          |   |   |   
Sbjct LDQFAIGFGEvkkAIELDCN......................TLKYEMVPVELRdYDIVI  211
DSSP  HHHHHHHHLLlleEEEEELL......................LLLEEEEELLLLlEEEEE


DSSP  EEELLLL.lLHHHHHHHHLLL......................................L
Query GWTKEVA.vSSHXVQQIKQNI......................................N  218
ident   |                                                         
Sbjct MNTNKPRalTESKYNERFAETrealkrmqtrldiqslgelsneefdantdligdetlikR  271
DSSP  EELLLLLllLLHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhlllllhhhllhhhhhhlhhhlllhhhhhH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL.LLLL
Query QNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQLKEA.SQDL  277
ident                 |   |   |  |        |           |  | |      
Sbjct ARHAVYENNRTKIAQKAFVAGNLTKFGELLNASHASLKDDYE.VTGLELDTLAETaQKQA  330
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLL


DSSP  LE.EEEELLLLLLEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHL.......LLEEeEEEE.......l
Query QA.VAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADL.......GIELlYQER.......i  322
ident     |   ||| | | |||                             |           
Sbjct GVlGARMTGAGFGGCAIALVAHD.NVSAFRKAVGQVyeevvgyPASF.YVAQigsgstkl  388
DSSP  LEeEEEELLLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHhhhhhllLLEE.EELLllllllll


No 3: 1VISA  MOLECULE: MEVALONATE KINASE;                                         

DSSP  llLEEEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL..LLEEEEELL.....
Query hxXIAVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYSDXN.....   53
ident        |  |    || |    |  |    |      ||                    
Sbjct ..SLIIETPSKVILFGEHAVVY.GYRAISMAIDLTSTIEIKETQedEIILNLNDLnkslg   57
DSSP  ..LEEEEEEEEEEEELLLHHHH.LLEEEEEEEEEEEEEEEEELLllEEEEEELLLleeee


DSSP  ..............lLHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLL.LEEEEEELHHhhhLLLLLLL
Query ..............pDYSLIQETIALXGDFLAvrgQNLR.PFSLAIYGKXereGKKFGLG   98
ident                |       |    | |          |   |  |        |||
Sbjct lnlneikninpnnfgDFKYCLCAIKNTLDYLN...IEPKtGFKINISSKI...PISCGLG  111
DSSP  eelllhhhllhhhlhHHHHHHHHHHHHHHHHL...LLLLlLEEEEEEELL...LLLLLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLlLHHHHHHHHLLLEEEEL
Query SSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKR.GDNGsXGDLACIAAEDLVLYQS  157
ident || |      ||    ||         ||   |     |      |   |          
Sbjct SSASITIGTIKAVSGFYNKELKDDEIAKLGYMVEKEIqGKAS.ITDTSTITYKGILEIKN  170
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHhLLLL.LHHHHHHHHLLEEEEEL


DSSP  LlhhhhhhhhllllhhhhhhlllllEEEEL...LLLL..LLEEEEEEELLLLLL.HHHHH
Query FdrqkvaawleeenlatvlerdwgfSISQV...KPTL..ECDFLVGWTKEVAVS.SHXVQ  211
ident                                         | ||              | 
Sbjct N........................KFRKIkgeFEEFlkNCKFLIVYAEKRKKKtAELVN  206
DSSP  L........................EEEELlhhHHHHhhLLLEEEEEEELLLLLhHHHHH


DSSP  HHHLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHH
Query QIKQN.INQNFLTSSKETVVSLVEAleqGKSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQL  270
ident                                |           ||  |   | || |   
Sbjct EVAKIeNKDEIFKEIDKVIDEALKI...KNKEDFGKLMTKNHELLKKLN..ISTPKLDRI  261
DSSP  HHHLLlLHHHHHHHHHHHHHHHHLL...LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHH


DSSP  HHLLLLLLEEEEELLLLLLEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEE..el
Query KEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLGIELLYQE..ri  322
ident           ||  ||||| | | |       | |                   
Sbjct VDIGNRFGFGAKLTGAGGGGCVIILVNEE.KEKELLKELNKEDVRIFNCRmmne  314
DSSP  HHHHHHHLLEEEEELLLLLEEEEEELLLL.LHHHHHHHHHLLLLEEEEELllll


No 4: 1S4EA  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  llleEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEEEEEEEEEEEEeeelLLLEEEEELL.......
Query hxxiAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALIKDIPIYXRAEiafsDSYRIYSDXN.......   53
ident      ||  |     ||              |  |        |    ||          
Sbjct ....TVKSPGRVNLIGEHTDYTY.GYVXPXAIDLYTIIT....DKVQLYSEHFnekldlt   51
DSSP  ....LEEEEEEEELLLLLLHHHL.LEELEEEEEEEEEEL....LLLLLLLLLLlllllll


DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEeEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHH
Query ...pDYSLIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSlAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKA  110
ident                                  | |         || || |  |     
Sbjct kegsWIDYVKGVLWVLIQEGY....KIGGLK.KITGDL...PLGAGLSSSASFEVGILEV  103
DSSP  llllLHHHHHHHHHHHHHLLL....LLLLLL.LEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH.HLLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhh
Query LLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLK.RGDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaaw  166
ident |  ||||  |      |         |      |                          
Sbjct LNQLYNLNIDPLKKALLAKKAENEfVGVPCGILDQFAVVFGKkdnVIFLDTQ........  155
DSSP  HHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHlLLLLLLLHHHHHHHHLLlleEEEEELL........


DSSP  hllllhhhhhhlllLLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLL.LLHHHHHHHHLLL........
Query leeenlatvlerdwGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVA.VSSHXVQQIKQNI........  217
ident                              ||  |       |      |           
Sbjct ..............TLQYEYIPFPKDVSVLVFYTGVKReLASSEYAERKRIAeeslrilg  201
DSSP  ..............LLEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELlLHHHHHHHHHHHHhhhhhhhl


DSSP  .....................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query .....................NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLE  256
ident                                 |     ||  |  ||       |   | 
Sbjct kesskevtekdlgklpplhrkFFSYIVRENARVLEVRDALKEGDIEKVGKILTTAHWDLA  261
DSSP  lllhhhllhhhhhlllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLlLLLHHHHHHHHLLLLLLE.EEEELLLLLLEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL..
Query GLSTdIYTPLLRQLKEASQDLQA.VAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG..  313
ident           |         | |  |   ||| |   |||       ||           
Sbjct ENYR.VSCEELDFFVKKAXELGAyGARLTGAGFGGSAIALVDKD.KAKTIGDAILREYla  319
DSSP  HLLL.LLLHHHHHHHHHHHHLLLlEEEELLLLLEEEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ....lEEEEEEE.....l
Query ....iELLYQER.....i  322
ident                   
Sbjct kfswkAKYFVVKpsdgvg  337
DSSP  hllllLEEEEELllllll


No 5: 1WUUA  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  ...........................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEEEEEE
Query ...........................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALIKDIP   33
ident                                ||   |     ||        | |     
Sbjct hhaalrqpqvaellaearrafreefgaEPELAVSAPGRVNLIGEHTDYNQ.GLVLPXALE   59
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEEEELLLLHHHL.LEEEEEEEE


DSSP  EEEEEEEEELL..LLEEEEE........................lLLLHHHHHHHHHHHh
Query IYXRAEIAFSD..SYRIYSD........................xNPDYSLIQETIALXg   67
ident                                                        |    
Sbjct LXTVLVGSPRKdgLVSLLTTsegadepqrlqfplptaqrslepgtPRWANYVKGVIQYY.  118
DSSP  EEEEEEEEEELllEEEEEELlllllllleeeeellllllllllllLHHHHHHHHHHHHL.


DSSP  HHHHhllllLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHH
Query DFLAvrgqnLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKL  127
ident          |  ||              || || |  |     |  |   |         
Sbjct PAAP.....LPGFSAVVVSSV...PLGGGLSSSASLEVATYTFLQQLCPDSGTIAARAQV  170
DSSP  LLLL.....LLEEEEEEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHH.LLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhhhllllhhhhhhlllLLE
Query TSAVLLKR.GDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwGFS  183
ident          |      |             |                             
Sbjct CQQAEHSFaGXPCGIXDQFISLXGQkghALLIDCR......................SLE  208
DSSP  HHHHHHHHlLLLLLLHHHHHHHHLLlleEEEEELL......................LLL


DSSP  EEELLLLLL.LEEEEEEELLLLLLHhHHHHHHLLL.........................
Query ISQVKPTLE.CDFLVGWTKEVAVSShXVQQIKQNI.........................  217
ident  | |         |         ||                                   
Sbjct TSLVPLSDPkLAVLITNSNVRHASS.EYPVRRRQCeevaralgkeslrevqleeleaard  267
DSSP  EEEEELLLLlEEEEEEEEEEELLLL.LHHHHHHHHhhhhhhllllllllllhhhhllhhh


DSSP  ........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHH
Query ........NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQ  269
ident                          ||  |               |         | | |
Sbjct lvskegfrRARHVVGEIRRTAQAAAALRRGDYRAFGRLXVESHRSLRDDYE.VSCPELDQ  326
DSSP  hllhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHH


DSSP  HHHL.LLLLLE.EEEELLLLLLEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHL...LLEEeEEEE...
Query LKEA.SQDLQA.VAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADL...GIELlYQER...  321
ident | ||             | | | |   |                         |      
Sbjct LVEAaLAVPGVyGSRXTGGGFGGCTVTLLEAS.AAPHAXRHIQEHyggTATF.YLSQaad  384
DSSP  HHHHhHLLLLEeEEEELLLLLEEEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHlllLLEE.EEELlll


DSSP  ......l
Query ......i  322
ident        
Sbjct gakvlcl  391
DSSP  lleelll


No 6: 2OI2A  MOLECULE: MEVALONATE KINASE;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEE.EEEEEEEEELLLLEeeeelllLHHH.
Query hXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIP.IYXRAEIAFSDSYRiysdxnpDYSL.   58
ident           |    || |    |  |                  |              
Sbjct .KVGVGQAHSKIILIGEHAVVY.GYPAISLPLLeVEVTCKVVPAESPW.....rlYEEDt   53
DSSP  .LLEEEEEEEEEEEELLLHHHH.LLLEEEEEEEeEEEEEEEEELLLLL.....llLLLLh


DSSP  HHHHHHHHHHHHHhllLLLLLEEEEEElhhhhhLLLLLLLhHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
Query IQETIALXGDFLAvrgQNLRPFSLAIYgkxereGKKFGLGsSGSVVVLVVKALLALYNLS  118
ident            |             |        |      |         |    |   
Sbjct LSMAVYASLEYLN...ITEACIRCEID......EKRGMGS.SAAISIAAIRAVFDYYQAD  103
DSSP  HHHHHHHHHHHHL...LLLLLEEEEEL......LLHHHLL.HHHHHHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhllllhhhhhhl
Query VDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeenlatvler  178
ident      |  |          | |  |                                   
Sbjct LPHDVLEILVNRAEMIAHMNPSGLDAKTCLSDQPIRFIKN....................  143
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHLLLLLEEEELL....................


DSSP  lllLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLLLLHhHHHHHHLLL...LHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query dwgFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSShXVQQIKQNI...NQNFLTSSKETVVSLVEA  235
ident             |        |           |  ||       ||    |       |
Sbjct ...VGFTELEMDLSAYLVIADTGVYGHTR.EAIQVVQNKgkdALPFLHALGELTQQAEIA  199
DSSP  ...LEEEELLLLLLLEEEEEELLLLLLHH.HHHHHHHHLhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL.LLLLLEEEEELLLLLLEEEEE
Query LEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQLKEA.SQDLQAVAKSSGAGGGDCGIA  294
ident   |   |        |   |              | |         || || | | | ||
Sbjct ISQKDAEGLGQILSQAHLHLKEIG..VSSLEADSLVETaLSHGALGAKMSGGGLGGCIIA  257
DSSP  HHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHHhHLLLLLEEEEELLLLLLEEEE


DSSP  EELLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL
Query LSFDAQSTKTLKNRWADLGIELLYQERI  322
ident |         |  |    |      |  
Sbjct LVTNLTHAQELAERLEEKGAVQTWIESL  285
DSSP  EELLHHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEL


No 7: 2HFSA  MOLECULE: MEVALONATE KINASE, PUTATIVE;                               

DSSP  .....lLLEE..EEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEEEEEEEEEEEL..LLLE.EEE
Query .....hXXIA..VKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIPIYXRAEIAFS..DSYR.IYS   50
ident                 ||    ||      |  |    |  |                  
Sbjct xskpvkSKTTgkNIGYGKVILFGEHFVVH.GAEAIVAGISEYTECRLEINpgVPGLqVDD   59
DSSP  llllllLLLLllLEEEEEEEEELLLHHHH.LLLEEEEEEEEEEEEEEEEEllLLLEeEEE


DSSP  E...........lLLLHHHHHHHHHHHHHhhhhlllllLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLH
Query D...........xNPDYSLIQETIALXGDflavrgqnlRPFSLAIYGKXereGKKFGLGS   99
ident                     |                       | |         | | 
Sbjct QrpaipgyiaqkrDEQIKAHQLVLDHLKV.....dlsgDGLKXFIGGPL...VPSSGIGA  111
DSSP  LllllllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHLLL.....llllLEEEEEEELLL...LLLLLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLL
Query SGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFD  159
ident | | ||    ||  || |                      |  |        | ||    
Sbjct SASDVVAFSRALSELYQLNLTDEEVNLSAFVGEGGYHGTPSGADNTAATYGGLILYRRQN  171
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHHHLEEEEEEELL


DSSP  hhhhhhhhllllhhhhhhlllLLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHLLL..
Query rqkvaawleeenlatvlerdwGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNI..  217
ident                                      |  |   |     |         
Sbjct ....................gKSVFKPIAFQQRLYLVVVGTGINASTAKVVNDVHKXKqq  211
DSSP  ....................lLEEEEEELLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHhh


DSSP  ....LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHL
Query ....NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQLKEA  273
ident                |    |||  |              |            |      
Sbjct qpvqFKRLYDNYTHIVSQAREALQKGDLQRLGQLXNANHDLCRQID..VSCRELESIVQT  269
DSSP  lhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..LLLHHHHHHHHH


DSSP  .LLLLLEEEEELLLLLLEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHH..LLLEEEEEEEL.....
Query .SQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALSFDAQSTKTLKNRWAD..LGIELLYQERI.....  322
ident         || || | |    ||                                  
Sbjct cRTYGALGAKLSGTGRGGIAVALAASSDQRDAIVKGLKAkcPEAKFIWRYTVqpsaa  326
DSSP  hHHLLLLEEEEELLLLLLEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHhlLLLLEEEEEEElllll


No 8: 2AJ4A  MOLECULE: GALACTOKINASE;                                             

DSSP  .................................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEE
Query .................................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLA   27
ident                                           |     ||          
Sbjct vivpefnssaelprplaekcpsiikkfisaydaKPDFVARSPGRVNLIGEHIDYCD.FSV   59
DSSP  lllleelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEEEELLLLHHHL.LLL


DSSP  EEEEEEEEEEEEEEELL....LLEEEE.ELLL......................LHHHHH
Query LIKDIPIYXRAEIAFSD....SYRIYS.DXNP......................DYSLIQ   60
ident |   |                |      |                               
Sbjct LPLAIDFDMLCAVKVLNeknpSITLINaDPKFaqrkfdlpldgsyvtidpsvsdWSNYFK  119
DSSP  EEEEEEEEEEEEEEEELllllEEEEEElLLLLlleeeellllllllllllllllHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHLLL......LLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ETIALXGDFLAVRGQ......NLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLAL  114
ident         ||            |        |         || ||      |  |    
Sbjct CGLHVAHSFLKKLAPerfasaPLAGLQVFCEGDV...PTGSGLSSSAAFICAVALAVVKA  176
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLHhhhlllLLLEEEEEEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  LL...LLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLLhhhhhhhhl
Query YN...LSVDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFDrqkvaawle  168
ident             |   |       | |    | |                          
Sbjct NMgpgYHMSKQNLMRITVVAEHYVGVNNGGMDQAASVCGEedhALYVEFKP.........  227
DSSP  HHlllLLLLHHHHHHHHLLHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLlllEEEEELLL.........


DSSP  lllhhhhhhlllLLEEEELLLLL....LLEEEEEEELLLL...lLHHHH.HHHHLLL...
Query eenlatvlerdwGFSISQVKPTL....ECDFLVGWTKEVA...vSSHXV.QQIKQNI...  217
ident                    |       |  |    |  |                     
Sbjct ............QLKATPFKFPQlknhEISFVIANTLVVSnkfeTAPTNyNLRVVEVtta  275
DSSP  ............LLEEEEELLLLllllEEEEEEEELLLLLllllLLLLLhHHHHHHHhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  217
ident                                                             
Sbjct anvlaatygvvllnkgnlrdfmnvyyaryhnistpwngdiesgierltkmlvlveeslan  335
DSSP  hhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ........................................LHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
Query ........................................NQNFLTSSKETVVSLVEALE  237
ident                                               |    |   |    
Sbjct kkqgfsvddvaqslncsreeftrdylttspvrfqvlklyqRAKHVYSESLRVLKAVKLMT  395
DSSP  hlllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  L.....lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL.LLLLLEEEEELLLLLLEE
Query Q.....gKSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQLKEA.SQDLQAVAKSSGAGGGDC  291
ident                          |      |                    ||| | |
Sbjct TftadedFFKQFGALMNESQASCDKLYE.CSCPEIDKICSIaLSNGSYGSRLTGAGWGGC  454
DSSP  LlllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLLLLEEEELLLLLLLE


DSSP  EEEEELLH..HHHHHHHHHHHHLLL..............EEEEEE........el
Query GIALSFDA..QSTKTLKNRWADLGI..............ELLYQE........ri  322
ident    |            |   |                                  
Sbjct TVHLVPGGpnGNIEKVKEALANEFYkvkypkitdaelenAIIVSKpalgsclyel  509
DSSP  EEEEEEELllLLHHHHHHHHHHHLHhhhlllllhhhhhhHEEEELllllleeeel


No 9: 2A2CA  MOLECULE: N-ACETYLGALACTOSAMINE KINASE;                              

DSSP  ...............................LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLLlLEEEE
Query ...............................HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEPgQLALI   29
ident                                     |   |     ||          | 
Sbjct atespatrrvqvaehprllklkemfnskfgsIPKFYVRAPGRVNIIGEHIDYCG.YSVLP   59
DSSP  lllllleeeelhhhlhhhhhhhhhhhhhhllLLLEEEEEEEEEEEELLLLHHHL.LLLEE


DSSP  EEEEEEEEEEEEELL..LLEEEE.ELLL................LHHHHHHHHHHHHHHH
Query KDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYS.DXNP................DYSLIQETIALXGDFL   70
ident                                                             
Sbjct MAVEQDVLIAVEPVKtyALQLANtNPLYpdfstsannidktkplWHNYFLCGLKGIQEHF  119
DSSP  EEEEEEEEEEEEELLllLEEEEElLLLLlleeelllllllllllHHHHHHHHHHHHHHHL


DSSP  HHllLLLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHH
Query AVrgQNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSA  130
ident      ||        |         || ||   |       |           |      
Sbjct GL..SNLTGMNCLVDGNI...PPSSGLSSSSALVCCAGLVTLTVLGRNLSKVELAEICAK  174
DSSP  LL..LLLLLEEEEEEELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHLL...LEEEELLlhhhhhhhhllllhhhhhhlllLLEEEEL
Query VLLKRGDNGSXGDLACIAAED...LVLYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwGFSISQV  187
ident      |  |   |             |                                |
Sbjct SERYIGTEGGGMDQSISFLAEegtAKLIEFS......................PLRATDV  212
DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLlllEEEEELL......................LLEEEEE


DSSP  LLLLLLEEEEEEELLLL..llHHHHHHHHLLL............................
Query KPTLECDFLVGWTKEVA..vsSHXVQQIKQNI............................  217
ident |      |                                                    
Sbjct KLPSGAVFVIANSCVEMnkaaTSHFNIRVMECrlaakllakykslqwdkvlrleevqakl  272
DSSP  LLLLLEEEEEEELLLLLlhhhLLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhh


DSSP  .......................................................LHHHH
Query .......................................................NQNFL  222
ident                                                             
Sbjct gisleemllvtedalhpepynpeeicrclgisleelrtqilspntqdvlifklyqRAKHV  332
DSSP  lllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhlllhhhlllllllhhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLL...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLHHHHHHHHL.LLLLL
Query TSSKETVVSLVEALEQG...KSEKIIEQVEVASKLLEGLSTdIYTPLLRQLKEA.SQDLQ  278
ident  |    |       |           |                  | | ||         
Sbjct YSEAARVLQFKKICEEApenMVQLLGELMNQSHMSCRDMYE.CSCPELDQLVDIcRKFGA  391
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHLlllHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLHHHHHHHHHhHHLLL


DSSP  EEEEELLLLLLEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLLL...EEEEEE.........el
Query AVAKSSGAGGGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLGI...ELLYQE.........ri  322
ident       ||| | |                           |               
Sbjct QGSRLTGAGWGGCTVSMVPAD.KLPSFLANVHKAYYqkqSLFATKpgggalvllea  446
DSSP  LEEEELLLLLLLEEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHHHlllLEEEELllllleeeeel


No 10: 1KVKA  MOLECULE: MEVALONATE KINASE;                                         

DSSP  ..LLLEEEEEEEEEEEELLLHHHLlLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL..LLEEEEELL...
Query ..HXXIAVKTCGKLYWAGEYAILEpGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYSDXN...   53
ident        |   ||    || |    |  ||                              
Sbjct mlSEVLLVSAPGKVILHGEHAVVH.GKVALAVALNLRTFLVLRPQSngKVSLNLPNVgik   59
DSSP  llLLLEEEEEEEEEEEELLLHHHH.LLLEEEEEEEEEEEEEEEELLllEEEEEELLLlee


DSSP  ............................lLHHHHHHHHHHHHHHHHhLLLLLLLEEEEEE
Query ............................pDYSLIQETIALXGDFLAvRGQNLRPFSLAIY   85
ident                                        |           |        
Sbjct qvwdvatlqlldteklkkvaglprdcvgnEGLSLLAFLYLYLAICR.KQRTLPSLDIMVW  118
DSSP  eeeehhhhhlllllhhhhhhlllllllllLHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLLLEEEEEE


DSSP  LHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL...............LLHHHHHHHHHH
Query GKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYNLS...............VDQNLLFKLTSA  130
ident           |||||    | |  |||                      |     |    
Sbjct SEL...PPGAGLGSSAAYSVCVAAALLTACEEVtnplkdrgsigswpeEDLKSINKWAYE  175
DSSP  ELL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhhllleelllhHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELllhhhhhhhhllllhhhhhhllllLEEEEL.LL
Query VLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSfdrqkvaawleeenlatvlerdwgFSISQV.KP  189
ident        | |  |           ||                            |     
Sbjct GERVIHGNPSGVDNSVSTWGGALRYQQ........................GKMSSLkRL  211
DSSP  HHHHHHLLLLLHHHHHHHHLLEEEELL........................LLEEELlLL


DSSP  LLlLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHLLL......LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....
Query TLeCDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNI......NQNFLTSSKETVVSLVEALEQG....  239
ident       |   ||        |                 |||           |       
Sbjct PA.LQILLTNTKVPRSTKALVAGVRSRLikfpeiMAPLLTSIDAISLECERVLGEMaaap  270
DSSP  LL.EEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHhhlhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllll


DSSP  ...LHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllLLLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLLLLEEEEEEE
Query ...KSEKIIEQVEVASKLLEGLStdIYTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAGGGDCGIALS  296
ident          |        |  |        | ||           |  ||||| ||| | 
Sbjct vpeQYLVLEELMDMNQHHLNALG..VGHASLDQLCQVTAAHGLHSKLTGAGGGGCGITLL  328
DSSP  lhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLLHHHHHHHHHHHHLLLEEEELLLLLLLEEEEEE


DSSP  LL...HHHHHHHHHHHHHLLLEEeEEEE......................l
Query FD...AQSTKTLKNRWADLGIELlYQER......................i  322
ident             |      |                               
Sbjct KPgleRAKVEAAKQALTGCGFDC.WETSigapgvsmhsatsiedpvrqalg  378
DSSP  LLlllHHHHHHHHHHHHHLLLEE.EEEEellllleeellllllhhhhhhhl


No 11: 1FWKA  MOLECULE: HOMOSERINE KINASE;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEEE.EELLLhhhlllleEEEEEEE.EEEEEEEEELLL..LEEEEE.lLLL
Query hXXIAVKTCGKLY.WAGEYailepgqlALIKDIP.IYXRAEIAFSDS..YRIYSD.xNPD   55
ident      ||                             |   |    |     |  |  |  
Sbjct .MKVRVKAPCTSAnLGVGF.......dVFGLCLKePYDVIEVEAIDDkeIIIEVDdkNIP   52
DSSP  .LEEEEEEEEEEElLLLLL.......lLEEEEEEeEEEEEEEEEELLllEEEEELllLLL


DSSP  H....HHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHH
Query Y....SLIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKAL  111
ident                 |               |           |||||         | 
Sbjct TdpdkNVAGIVAKKMIDDFN....IGKGVKITIKKGV...KAGSGLGSSAASSAGTAYAI  105
DSSP  LllllLHHHHHHHHHHHHHL....LLLEEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhllll
Query LALYNLSVDQNLLFKLTSAVLLKRGDNGSXGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeen  171
ident   |  |  |   |    |   |           |                          
Sbjct NELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGAKHADNVAPAIFGGFTMVTNY.............  152
DSSP  HHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHHHLLEEEEEEE.............


DSSP  hhhhhhllLLLEEEELLLLLLLEEEEEEELLLL...LLHHHhhhHHLLLLHHHHHHHHHH
Query latvlerdWGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEVA...VSSHXvqqIKQNINQNFLTSSKET  228
ident                       | |                            |      
Sbjct ........EPLEVLHIPIDFKLDILIAIPNISIntkEAREI...LPKAVGLKDLVNNVGK  201
DSSP  ........LLEEEEEELLLLLLEEEEELLLLLLlhhHHHHH...LLLEEEHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHhHHHHhhlLLLL..LHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLL
Query VVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVAsKLLEglsTDIY..TPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGA  286
ident     | ||                |  |          |     ||   |       || 
Sbjct ACGMVYALYNKDKSLFGRYMMSD.KVIE...PVRGklIPNYFKIKEEVKDKVYGITISGS  257
DSSP  HHHHHHHHHLLLHHHHHHHHLLL.LLLH...HHHHllLLLHHHHHHHLLLLEEEEEELLL


DSSP  LllEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEE......el
Query GggDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLGIELLYQE......ri  322
ident |     ||            |   |        |        
Sbjct G..PSIIAFPKEE.FIDEVENILRDYYENTIRTEvgkgvevv  296
DSSP  L..LLEEEEELHH.HHHHHHHHHHHHLLLEEEEEllllleel


No 12: 2HK2A  MOLECULE: DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE;                         

DSSP  .....llLEEEEEEEEEEEELLLhHHLL......LLEEEEEEEE.EEEEEEEEEL...LL
Query .....hxXIAVKTCGKLYWAGEYaILEP......GQLALIKDIP.IYXRAEIAFS...DS   45
ident                                               |      |      
Sbjct hmlemikSGKARAHTNIALIKYW.GKKDealiipMNNSISVTLEkFYTETKVTFNdqlTQ   59
DSSP  lhhhhleEEEEEEEEEEEEELLL.LEEElllleeLLLEEEEEEEeEEEEEEEEEElllLL


DSSP  LEEE..EELL..lLHHHHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhHLLLLLLlHHH
Query YRIY..SDXN..pDYSLIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXerEGKKFGLgSSG  101
ident                  |                                       || 
Sbjct DQFWlnGEKVsgkELEKISKYMDIVRNRAG....IDWYAEIESDNFV..PTAAGLA.SSA  112
DSSP  LEEEelLEEEllhHHHHHHHHHHHHHHHHL....LLLEEEEEEEEEL..LHHHLLL.LHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhhhhlllllLHHHHHHHHLLLEEEELLLHh
Query SVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVllkrgdngsXGDLACIAAEDLVLYQSFDRq  161
ident |       |             |  |              |                   
Sbjct SAYAALAAACNQALDMQLSDKDLSRLARIG.........SGSASRSIYGGFAEWEKGYS.  162
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHLL.........LHHHHHHHLLLEEEEELLLL.


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhllLLLEEEELLLL...lLLEEEEEEELL..LLLL.hHHHHHHHL
Query kvaawleeenlatvlerdWGFSISQVKPT...lECDFLVGWTKE..VAVS.sHXVQQIKQ  215
ident                                                 |           
Sbjct .................dETSYAVPLESNhfedDLAMIFVVINQhsKKVPsrYGMSLTRN  205
DSSP  .................lLLLEEEELLLLlhhhHEEEEEELLLLllLLLLhhHHHHHHHH


DSSP  LL..LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLLLHHH
Query NI..NQNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DIYTPLL  267
ident      |  |    |       |          |  |                        
Sbjct TSrfYQYWLDHIDEDLAEAKAAIQDKDFKRLGEVIEENGLRMHATNLgstppfTYLVQES  265
DSSP  HLllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLLLLHHH


DSSP  HHHHHLLL.....LLLEEEEeLLLLllEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL..lEEEEEE
Query RQLKEASQ.....DLQAVAKsSGAGggDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG..iELLYQE  320
ident                        ||       |                           
Sbjct YDVMALVHecreaGYPCYFT.MDAG..PNVKILVEKK.NKQQIIDKLLTQFdnnQIIDSD  321
DSSP  HHHHHHHHhhhhlLLLEEEE.LLLL..LLEEEEEEHH.HHHHHHHHHLLLLlhhHEEEEE


DSSP  ........el
Query ........ri  322
ident           
Sbjct iiatgieiie  331
DSSP  lllllleell


No 13: 2GS8A  MOLECULE: MEVALONATE PYROPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    

DSSP  ....LLLEEEEEEEEEEEELLlHHHL......LLLEEEEEEEE.EEEEEEEEELL....L
Query ....HXXIAVKTCGKLYWAGEyAILE......PGQLALIKDIP.IYXRAEIAFSD....S   45
ident        | |               |      |                   |      |
Sbjct naxdPNVITVTSYANIAIIKY.WGKEnqakxiPSTSSISLTLEnXFTTTSVSFLPdtatS   59
DSSP  llllLLEEEEEEEEEEEEELL.LLEEelllleELLLEEEEEEEeEEEEEEEEELLllllL


DSSP  LEEE..EELL..lLHHHHHHHHHHHHHhhhhllLLLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHH
Query YRIY..SDXN..pDYSLIQETIALXGDflavrgQNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSG  101
ident    |             |   |                        |       || || 
Sbjct DQFYinGILQndeEHTKISAIIDQFRQ......PGQAFVKXETQNNX...PTAAGLSSSS  110
DSSP  LEEEelLEELlhhHHHHHHHHHLLLLL......LLLLLEEEEEELLL...LHHHLLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhhhhlllllLHHHhHHHHLLLEEEELLlhh
Query SVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVllkrgdngsXGDLaCIAAEDLVLYQSFdrq  161
ident |     |||   |     ||  |                                     
Sbjct SGLSALVKACDQLFDTQLDQKALAQKAKFA........sGSSS.RSFFGPVAAWDKD...  158
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHH........hHHHH.HHHLLLEEEELLL...


DSSP  hhhhhhllllhhhhhhlllLLEEEELLLLLLLEEEEEEELLL.LLLH..HHHHHHH.LLL
Query kvaawleeenlatvlerdwGFSISQVKPTLECDFLVGWTKEV.AVSS..HXVQQIK.QNI  217
ident                       |  |   |                |             
Sbjct ...................SGAIYKVETDLKXAXIXLVLNAAkKPISsrEGXKLCRdTST  199
DSSP  ...................LLLEEELLLLLLEEEEEEELLLLlLLLLhhHHHHHHHhHLL


DSSP  L.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLLLHHHHHH
Query N.QNFLTSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DIYTPLLRQL  270
ident         |          |     ||     |                    |    | 
Sbjct TfDQWVEQSAIDYQHXLTYLKTNNFEKVGQLTEANALAXHATTKtanppfSYLTKESYQA  259
DSSP  LhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllllllLLLLHHHHHH


DSSP  HHLLL.....LLLEEEEElLLLLleEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHlLLEEEEEE.....
Query KEASQ.....DLQAVAKSsGAGGgdCGIALSFDAqSTKTLKNRWADlGIELLYQE.....  320
ident  ||                 ||       |         |  |                 
Sbjct XEAVKelrqeGFACYFTX.DAGP..NVKVLCLEK.DLAQLAERLGK.NYRIIVSKtkdlp  314
DSSP  HHHHHhhhhlLLLEEEEL.LLLL..LEEEEEEHH.HHHHHHHHHHL.LLEEEEEElllll


DSSP  el
Query ri  322
ident   
Sbjct dv  316
DSSP  ll


No 14: 1FI4A  MOLECULE: MEVALONATE 5-DIPHOSPHATE DECARBOXYLASE;                    

DSSP  LLLEEEEEEEEEEEELLLhHHLL......LLEEEEEEEE...EEEEEEEEEL...LLLEE
Query HXXIAVKTCGKLYWAGEYaILEP......GQLALIKDIP...IYXRAEIAFS...DSYRI   48
ident      |                                           |          
Sbjct VYTASVTAPVNIATLKYW.GKRDtklnlpTNSSISVTLSqddLRTLTSAATApefERDTL   59
DSSP  LEEEEEEELLEEEEELLL.LEEElllleeLLLEEEEELLlllLLEEEEEEELlllLLLLL


DSSP  EEEL...llLHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........lLLLLEEEEEELHHhhhLLLLLL
Query YSDX...npDYSLIQETIALXGDFLAVRG........qNLRPFSLAIYGKXereGKKFGL   97
ident          |    |                                           ||
Sbjct WLNGephsiDNERTQNCLRDLRQLRKEXEskdaslptlSQWKLHIVSENNF...PTAAGL  116
DSSP  LLLLlllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllhHHLLEEEEEEELL...LLLLLL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHhhhlllllLHHHHhHHHLLLEEEEL
Query GSSGSVVVLVVKALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVLlkrgdngsXGDLAcIAAEDLVLYQS  157
ident  ||       | |   || |                                   |    
Sbjct ASSAAGFAALVSAIAKLYQLPQSTSEISRIARKGS........GSACR.SLFGGYVAWEX  167
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHH........HHHHH.HHLLLEEEEEL


DSSP  LLhHHHHhhhllllhhhhhhllLLLEEEELL...LLLLLEEEEEEELL..LLLL.HHHHH
Query FDrQKVAawleeenlatvlerdWGFSISQVK...PTLECDFLVGWTKE..VAVS.SHXVQ  211
ident                             |             |         ||     |
Sbjct GK.AEDG...............HDSXAVQIAdssDWPQXKACVLVVSDikKDVSsTQGXQ  211
DSSP  LL.LLLL...............LLLEEEEEElhhHLLLEEEEEEEELLllLLLLhHHHHH


DSSP  HHH.LLLL.HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LL
Query QIK.QNIN.QNFL.TSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DI  262
ident                           |                |                
Sbjct LTVaTSELfKERIeHVVPKRFEVXRKAIVEKDFATFAKETXXDSNSFHATCLdsfppiFY  271
DSSP  HHHhHLLHhHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllLL


DSSP  LLHHHHHHHHLLLLL.......LEEEEElLLLLleEEEEEEL...LHHHHHHHHHHHH..
Query YTPLLRQLKEASQDL.......QAVAKSsGAGGgdCGIALSF...DAQSTKTLKNRWA..  310
ident                               ||                            
Sbjct XNDTSKRIISWCHTInqfygetIVAYTF.DAGP..NAVLYYLaenESKLFAFIYKLFGsv  328
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHhhhhlllLEEEEE.LLLL..LEEEEEEhhhHHHHHHHHHHHHLll


DSSP  .................................HLLLEEEEEEEL...............
Query .................................DLGIELLYQERI...............  322
ident                                                             
Sbjct pgwdkkftteqleafnhqfessnftareldlelQKDVARVILTQVgsgpqetneslidak  388
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhllllllllllllhHHHEEEEEEEELlllleelllllllll


DSSP  ...
Query ...  322
ident    
Sbjct tgl  391
DSSP  lll


No 15: 2HKEA  MOLECULE: DIPHOSPHOMEVALONATE DECARBOXYLASE, PUTATIVE;               

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELLlhHHLL.........LLEEEEEEEE...EEEEEEEEEL...LL
Query hXXIAVKTCGKLYWAGEyaILEP.........GQLALIKDIP...IYXRAEIAFS...DS   45
ident      |                                                      
Sbjct .QCVTVEAPINIAFIKY..WGKReggetlilpTNDSFSITLSaspFRSKTSVELRddiET   57
DSSP  .LEEEEEELLEEEEELL..LLLLlllllllllLLLEEEEELLlllLLEEEEEEEElllLL


DSSP  LEEE..EELL..llHHHHHHHHHHHHHHHhhLLLLL.LLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHH
Query YRIY..SDXN..pdYSLIQETIALXGDFLavRGQNL.RPFSLAIYGKXereGKKFGLGSS  100
ident                   |                                    |  ||
Sbjct DTLRlnGTEVdvgkTPRVQSMLLHLRSTC..PEELKnKKVNIVSENNF...PTAAGMASS  112
DSSP  LEEEelLEEElhhhLHHHHHHHHHHHLLL..LHHHHlLEEEEEEEELL...LLLLLLLHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLLLLLlhhHHHHHHHHhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLEEEELLLh
Query GSVVVLVVKALLALYNLSVdqnLLFKLTSAvllkrgdngsXGDLACIAAEDLVLYQSFDr  160
ident  |       ||               |              |     |    |       
Sbjct ASGYCAMSAALIRAFKSTT...NVSMLARL.........gSGSACRSAFGGFVIWNKGE.  159
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLLLL...LHHHHHHH.........hLHHHHHHHLLLEEEEELLL.


DSSP  HHHHhhhllllhhhhhhllLLLEEEELL...LLLLLEEEEEEELLL.LLLH..HHHHHHH
Query QKVAawleeenlatvlerdWGFSISQVK...PTLECDFLVGWTKEV.AVSS..HXVQQIK  214
ident                          |        |        |      |     ||  
Sbjct KPDG...............SDCVATQFVdetHWPEIQVMCAVLKGAqKDVSstKGMQQSL  204
DSSP  LLLL...............LLLEEEEEElllLLLLEEEEEEELLLLlLLLLhhHHHHHHH


DSSP  .LLLL.HHHH.HHHHHHHHHHHHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL......LLLLH
Query .QNIN.QNFL.TSSKETVVSLVEALEQGKSEKIIEQVEVASKLLEGLST......DIYTP  265
ident                |       |          |     |  |              | 
Sbjct kTSPLmKKRIsETVPERMKIASRAIKARDFATFAEIAMLESDDLQEICAttepkiTYATE  264
DSSP  hHLLLhHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllLLLLH


DSSP  HHHHHHHLLLLL.......LEEEEElLLLLleEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL.....
Query LLRQLKEASQDL.......QAVAKSsGAGGgdCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG.....  313
ident                            ||                               
Sbjct DSYAMIRLVKAYnakkgrtALAYTF.DAGA..NCFLFVLKE.DLPEAVAMLMEHFptpfe  320
DSSP  HHHHHHHHHHHHhhhhlllLEEEEL.LLLL..LEEEEEEHH.HHHHHHHHHHHHLlllhh


DSSP  ................................LEEEEEEEL................
Query ................................IELLYQERI................  322
ident                                  | | |                   
Sbjct kfffgdrellekvkvvslpdeykklidhpkkpFEMLLQSPVgcgvkylgpseslipp  377
DSSP  heeellhhhhhhhhhllllhhhllllllllllLLEEEEEELlllleeelhhhlllll


No 16: 2V2QA  MOLECULE: 4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELllHHHL......LLLEEEEEEEEEEEEEEEEELlLLEEEEElLL
Query hXXIAVKTCGKLYWAGeyAILE......PGQLALIKDIPIYXRAEIAFSdSYRIYSDxNP   54
ident    | |    |         |          | |   || |    |      |       
Sbjct .HMIKVLSPAKINLGL..WVLGrlpsgyHEILTLYQEIPFYDEIYIREG.VLRVETNiGI   56
DSSP  .LLEEEEEEEEEEEEE..EEEEelllllEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEL.LLEEEELlLL


DSSP  LHH..HHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH
Query DYS..LIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALL  112
ident      |                      |  |           |||   |    | |   
Sbjct PQEenLVYKGLREFERITG....IEINYSIFIQKNI...PPGAGLGGGSSNLAVVLKKVN  109
DSSP  LHHhlHHHHHHHHHHHHHL....LLLLEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLL.LLLHhHHHHHHHHHHhhhllllllHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhllll
Query ALYNL.SVDQnLLFKLTSAVLlkrgdngsxGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeen  171
ident  |          |  |               |                            
Sbjct ELLGSpLSEE.ELRELVGSIS.........ADAPFFLLGKSAIGRGK.............  146
DSSP  HHLLLlLLHH.HHHHHHHHHL.........LLLHHHHLLLEEEEELL.............


DSSP  hhhhhhllllLEEEELLLLllLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHLLLLHhHHHHHHHHHHH
Query latvlerdwgFSISQVKPTleCDFLVGWTKEVAVSSHXVQQIKQNINQnFLTSSKETVVS  231
ident                |                                       |    
Sbjct .........gEVLEPVETEisGKITLVIPQVSSSTGRVYSSLREEHFV.TPEYAEEKIQR  196
DSSP  .........lLEEEELLLLllLEEEEEELLLLLLHHHHHLLLLHHHLL.LHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHhhlllhhhHHHHHhhhhhhhhhhlLLLL.....LHHHHHHHHLLLlllEEEEELLL
Query LVEAleqgksekIIEQVevasklleglsTDIY.....TPLLRQLKEASQdlqAVAKSSGA  286
ident               |                              |           || 
Sbjct IISG........EVEEI......envlgDIARelypeINEVYRFVEYLG...FKPFVSGS  239
DSSP  HHLL........LHHHL......llhhhHHHHhhlhhHHHHHHHHHHLL...LLLEELLL


DSSP  LllEEEEEEEllhhhhhhHHHHHHHLL....LEEEeEEEL
Query GggDCGIALSfdaqstktLKNRWADLG....IELLyQERI  322
ident |                                       
Sbjct G..STVYFFG.......gASEELKKAAkmrgWKVV.ELEL  269
DSSP  L..LLEEELL.......lLLHHHHHHHhhhlLEEE.EEEL


No 17: 1OJ4A  MOLECULE: 4-DIPHOSPHOCYTIDYL-2-C-METHYL-D-ERYTHRITOL                 

DSSP  lLLEEEEEEEEEEEELLLH....hhLLLLEEEEEEEEEEEEEEEEELL..LLEEEEE.lL
Query hXXIAVKTCGKLYWAGEYA....ilEPGQLALIKDIPIYXRAEIAFSD..SYRIYSD.xN   53
ident  |        ||                   |           |   |    |       
Sbjct .XRTQWPSPAKLNLFLYITgqradgYHTLQTLFQFLDYGDTISIELRDdgDIRLLTPveG   59
DSSP  .LEEEEEEEEEEEEEEEEEeellllLEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEELllLEEELLLllL


DSSP  LLHH..HHHHHHHHHHHHHHHLLLL..lLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHH
Query PDYS..LIQETIALXGDFLAVRGQN..lRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVK  109
ident       ||     |     |  |           |           |||   |    |  
Sbjct VEHEdnLIVRAARLLXKTAADSGRLptgSGANISIDKRL...PXGGGLGGGSSNAATVLV  116
DSSP  LLHHhlHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlllLEEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHhhhhlllllLHHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhll
Query ALLALYNLSVDQNLLFKLTSAVllkrgdngsXGDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawlee  169
ident ||  |         |                  |                          
Sbjct ALNHLWQCGLSXDELAEXGLTL.........GADVPVFVRGHAAFAEGV...........  156
DSSP  HHHHHHLLLLLHHHHHHHHHHH.........LLLHHHHHHLLLEEEELL...........


DSSP  llhhhhhhllllLEEEELLLLllLEEEEEEELLLLLLHHHHHHhHLLLLhhHHHHhhHHH
Query enlatvlerdwgFSISQVKPTleCDFLVGWTKEVAVSSHXVQQiKQNINqnFLTSskETV  229
ident                  | |      ||                                
Sbjct ...........gEILTPVDPP.eKWYLVAHPGVSIPTPVIFKD.PELPR..NTPK..RSI  199
DSSP  ...........lLEEEELLLL.lLEEEEELLLLLLLHHHHHLL.LLLLL..LLLL..LLH


DSSP  HHHHHhhhlllhhhhhhhhHHHHhhhhhhlLLLL......LHHHHHHHHLLlllleEEEE
Query VSLVEaleqgksekiieqvEVASklleglsTDIY......TPLLRQLKEASqdlqaVAKS  283
ident   |                   |                    |  | |           
Sbjct ETLLK..............CEFS...ndceVIARkrfrevDAVLSWLLEYA.....PSRL  237
DSSP  HHHHH..............LLLL...lllhHHHHhhlhhhHHHHHHHLLLL.....LEEE


DSSP  LLLLllEEEEEEELLHHHHHHHHHHHHhLLLEEEEEE..........el
Query SGAGggDCGIALSFDAQSTKTLKNRWAdLGIELLYQE..........ri  322
ident  | |   |  |                                      
Sbjct TGTG..ACVFAEFDTESEARQVLEQAP.EWLNGFVAKgvnlsplhraxl  283
DSSP  LLLL..LLEEEEELLHHHHHHHHHHLL.HHHLLEEEEeelllhhhhlll


No 18: 1MG7A  MOLECULE: EARLY SWITCH PROTEIN XOL-1 2.2K SPLICE FORM;               

DSSP  ...................llLEEEEEEEEEEEELllhhhlllleEEEEEEEEEEEEEEE
Query ...................hxXIAVKTCGKLYWAGeyailepgqlALIKDIPIYXRAEIA   41
ident                                                   |         
Sbjct errvkilgidrsenspvltymSKLAAAPHTVHMMD..........SGFLAINRQCLVKGK   50
DSSP  leeeeeeeeeeeeelhhhhllLEEEEEEEEEEELL..........LEEEEEEEEEEEEEE


DSSP  ELL........lLEEEE.....elllLHHHHHHHHHHHHhhhhhllllLLLEEEEEELHH
Query FSD........sYRIYS.....dxnpDYSLIQETIALXGdflavrgqnLRPFSLAIYGKX   88
ident               |             |     |                     |   
Sbjct AILarepkssneHMIDDlpkhahdqhTLSILRDFIDQLK........lHNVYEINFYDPL  102
DSSP  EEEllllllhhhLEELLllllllhhhHHHHHHHHHHHHL........lLLEEEEEEELLL


DSSP  hhhlLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLhHHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLH.HHH
Query eregKKFGLGSSGSVVVLVVKALLALYN.LSVDqNLLFKLTSAVLLKRGDN.GSXG.DLA  145
ident        |            |  ||           |      |  |             
Sbjct ....DSSGKLAVIPMLIALWKCMLASETdICDQ.EVLKSIMNSVIAKFELQiPCKNaVID  157
DSSP  ....LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLLH.HHHHHHHHHHHHHLLLLlLLHHhHHH


DSSP  HHHHLL...LEEEElllhhhhhhhhllllhhhhhhllllleeEELLLL..LLLEEEEEEE
Query CIAAED...LVLYQsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsiSQVKPT..LECDFLVGWT  200
ident                                                      |     |
Sbjct ATLSGSreeVHIIA..........................esNGTTEHfnKKHDLVFVKT  191
DSSP  HHHHLLlleEEELL..........................llLEELHHhhHHEEEEEEEE


DSSP  L.LLLLLHhhhhhhhllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHL..LLHHHH.HHHHHHHHHHHH
Query K.EVAVSShxvqqikqninqnfLTSSKETVVSLVEALEQ..GKSEKI.IEQVEVASKLLE  256
ident                                      |                 ||   
Sbjct DlHPEDFT.........pqmfpSQAKAKLLRDAFNNEEDedTFPDILvPAYMTAHSKNRV  242
DSSP  LlLLLLLL.........lllllLHHHHHHHHHHHHHLLLllLLHHHLhHHHHHHHHHHHH


DSSP  HH..LLLL..LLHHHHHHHHLLL.LLLE.EEEELllllLEEEEEEELLHhHHHH..HHHH
Query GL..STDI..YTPLLRQLKEASQ.DLQA.VAKSSgaggGDCGIALSFDAqSTKT..LKNR  308
ident      |           |        |                       |     |   
Sbjct RQedYTCLevEFDSQVALEKLMNeHEQVeGFEVQ....QGGILVALKKD.SFFDdeLIEK  297
DSSP  HLllLLLLhhHHHHHHHHHHHHHhLLLEeEEEEL....LLLEEEEEELL.HHHLhhHHHH


DSSP  HHHL..........LLEEeEEEE...............................l
Query WADL..........GIELlYQER...............................i  322
ident  |                                                     
Sbjct IAIAiatesrqsvsSVSF.DLLKlgpgaslvtlansrrfepecrvvlqievkpvs  351
DSSP  HHHHhhhhllllllEEEE.EEELllllleelllllhhhllleeeeeeeeeeeell


No 19: 1UEKA  MOLECULE: 4-(CYTIDINE 5'-DIPHOSPHO)-2C-METHYL-D-ERYTHRITOL           

DSSP  lllEEEEEEEEEEEELLLH....hhllLLEEEEEEEEEEEEEEEEELLLL.EEEEellLL
Query hxxIAVKTCGKLYWAGEYA....ilepGQLALIKDIPIYXRAEIAFSDSY.RIYSdxnPD   55
ident           |                    |        |       |         | 
Sbjct ...MERLAPAKVNLGLSVRfrredgyhELHTLFAPFSLADRLVVEPVSSGlHFQG...PY   54
DSSP  ...LEEEEEEEEEEEEEEEeellllleEEEEEEEEEEEEEEEEEEEELLLeEEEL...LL


DSSP  HH..HHHHHHHHHHHHHHhlllLLLLEEEEEELHHhhhLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH
Query YS..LIQETIALXGDFLAvrgqNLRPFSLAIYGKXereGKKFGLGSSGSVVVLVVKALLA  113
ident     |      |                              |||   |    |  || |
Sbjct GRenLAYRAASLYLEAAG....QPGGVRILLEKRI...PEGAGLGGGSSDAAQVLLALQA  107
DSSP  HHhlHHHHHHHHHHHHLL....LLLEEEEEEELLL...LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HLLLLLlhhHHHHHHHHHHhhhllllllhHHHHHHHLLLEEEELLlhhhhhhhhllllhh
Query LYNLSVdqnLLFKLTSAVLlkrgdngsxgDLACIAAEDLVLYQSFdrqkvaawleeenla  173
ident ||   |    || |               |                              
Sbjct LYPAEV...DLFALARTLG.........aDVPFFLLGRGAEARGV...............  140
DSSP  HLLLLL...LHHHHHHHHL.........lLHHHHHHLLEEEEELL...............


DSSP  hhhhllllLEEEE.LLLLllLEEEEEEELLLLLLHhHHHHHhLLLLhHHHHhhHHHHHHH
Query tvlerdwgFSISQ.VKPTleCDFLVGWTKEVAVSShXVQQIkQNINqNFLTssKETVVSL  232
ident                 |       |            |          |       |   
Sbjct .......gERLKPlALPP..VPAVVFFPGLRVPTP.LVYRA.VRPE.DFGP..DLPVEAI  186
DSSP  .......lLEEEEeLLLL..EEEEEEELLLLLLHH.HHHHL.LLHH.HLLL..LLLHHHH


DSSP  HHHHhlLLHHhhHHHHhhhhhHHHHHLLL...lLLHHHHHHHHLLllllEEEEELLLLll
Query VEALeqGKSEkiIEQVevaskLLEGLSTD...iYTPLLRQLKEASqdlqAVAKSSGAGgg  289
ident  |||     |            |||                             || |  
Sbjct LEAL..ARGE..EPPY...wnSLEGPAFRlfpeLKEVRGRMRALG...lRGVLMSGSG..  234
DSSP  HHHH..HHLL..LLLL...llLLHHHHHHhllhHHHHHHHHHHLL...lEEEEELLLL..


DSSP  EEEEEEELLHHHHHHHHHHHHHlLLEEeEEEE...l
Query DCGIALSFDAQSTKTLKNRWADlGIELlYQER...i  322
ident      |                              
Sbjct SAFFGLAEGPDHARRAAEALRA.WGRA.WAGTlggg  268
DSSP  LLEEEELLLHHHHHHHHHHHLL.LLEE.EEEEelll


No 20: 1Y5YA  MOLECULE: FORMALDEHYDE-ACTIVATING ENZYME FAE;                        

DSSP  .....llLEEEEEEEEeeeelllhhhlllleeeeeeeeeEEEEEEEELL...........
Query .....hxXIAVKTCGKlywageyailepgqlalikdipiYXRAEIAFSD...........   44
ident                                                             
Sbjct akitkvqVGEALVGDG.....................neVAHIDLIIGPrgspaetafcn   39
DSSP  lllllleEEEEEELLH.....................hhLEEEEEEEEElllhhhhhhhh


DSSP  ........................lLEEEE.........elLLLH...HHHHHHHHHHHH
Query ........................sYRIYS.........dxNPDY...SLIQETIALXGD   68
ident                                                             
Sbjct glvnnkhgftsllaviapnlpckpnTLMFNkvtindarqavQMFGpaqHGVAMAVQDAVA   99
DSSP  hhhllllllleeeleeelleellleEEEEEllllllhhhhhHHHLhhhHHHHHHHHHHHH


DSSP  HH..hhlllllLLEEEEEElhhHHHLLLLllLHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLllhhhhhh
Query FL..avrgqnlRPFSLAIYgkxEREGKKFglGSSGSVVVLVVKALLALYNLSvdqnllfk  126
ident                                                  |          
Sbjct EGiipadeaddLYVLVGVF...IHWEAADdaKIQKYNYEATKLSIQRAVNGE........  148
DSSP  LLllllllhhhEEEEEEEE...LLLLLLLhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLL........


DSSP  hhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhllllleeee
Query ltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsisq  186
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  llllllleeeeeeellllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhh
Query vkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiie  246
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeelllllleeeeeeellhhhhhhhh
Query qvevasklleglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgagggdcgialsfdaqstktlk  306
ident                                                             
Sbjct ............................................................  148
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhllleeeeeeel
Query nrwadlgiellyqeri  322
ident                 
Sbjct .....pkasvvteqrk  159
DSSP  .....llhhhhhllll


No 21: 2NN6D  MOLECULE: POLYMYOSITIS/SCLERODERMA AUTOANTIGEN 1;                    

DSSP  ..............LLLE.EEEEEEeeeeelllhhhlllleeeeeeEEEEEEEEE.EELL
Query ..............HXXI.AVKTCGklywageyailepgqlalikdIPIYXRAEI.AFSD   44
ident                                                     |       
Sbjct gcslrhfaceqnllSRPDgSASFLQ.....................GDTSVLAGVyGPAE   39
DSSP  lllllleeeeelllLLLLeEEEEEE.....................LLEEEEEEEeEEEE


DSSP  .....lLEEEEE.........lllLHHHHHHHHHHHHhHHHHlllllLLEEEEEELHHhh
Query .....sYRIYSD.........xnpDYSLIQETIALXGdFLAVrgqnlRPFSLAIYGKXer   90
ident                            ||  |                            
Sbjct vknkatLEVILRpkiglpgvaeksRERLIRNTCEAVV.LGTL..hprTSITVVLQVVS..   94
DSSP  lllleeEEEEEElllllllhhhhhHHHHHHHHHHHHL.HHHL..lllEEEEEEEEEEE..


DSSP  hllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHL.................................ll
Query egkkfGLGSSGSVVVLVVKALLALY.................................nl  117
ident                    ||                                       
Sbjct ....dAGSLLACCLNAACMALVDAGvpmralfcgvacaldsdgtlvldptskqekearav  150
DSSP  ....lLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLlllllleeeeeeeellllleeelllhhhhhhllee


DSSP  lllhhhhhhhhHHHH.........hhhllLLLL.HHHHHHHHLlleeeelllhhhhhhhh
Query svdqnllfkltSAVL.........lkrgdNGSX.GDLACIAAEdlvlyqsfdrqkvaawl  167
ident                                                             
Sbjct ltfaldsverkLLMSstkglysdtelqqcLAAAqAASQHVFRF.................  193
DSSP  eeeeeelllllLLEEeeeelllhhhhhhhHHHHhHHHHHHHHH.................


DSSP  llllhhhhhhllllleeeellllllleeeeeeellllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query eeenlatvlerdwgfsisqvkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltsske  227
ident                                                             
Sbjct ............................................................  193
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeellll
Query tvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgag  287
ident                                                             
Sbjct ............................................................  193
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query ggdcgialsfdaqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                    
Sbjct ........................yreslqrrysk  204
DSSP  ........................hhhhhhhhlll


No 22: 1VS5I  MOLECULE: 16S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEeeeelllhhhlllleeeeeeeEEEEEEEEEELlLLEEEEE.....LLLL
Query hXXIAVKTCGKlywageyailepgqlalikdiPIYXRAEIAFSdSYRIYSD.....XNPD   55
ident           |                         |  |       |            
Sbjct .NQYYGTGRRK.....................SSAARVFIKPG.NGKIVINqrsleQYFG   37
DSSP  .LLEEELLLLL.....................LLLLLEEEEEL.LLLEEELlllhhHHHL


DSSP  ....HHHHHHHHHHHHhhhhhlllllLLEEEEEELHHhhhLLLLllLHHHHHHHHHHHHH
Query ....YSLIQETIALXGdflavrgqnlRPFSLAIYGKXereGKKFglGSSGSVVVLVVKAL  111
ident              |                | |  |    |     |  |        ||
Sbjct retaRMVVRQPLELVD........mvEKLDLYITVKG...GGIS..GQAGAIRHGITRAL   84
DSSP  llllLLLLLHHHHHLL........llLLEEEEELLLL...LLHH..HHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHLLLLLLhhhHHHHHhhhhhhhllllllhhhhhhHHLLLeeeelllhhhhhhhhllll
Query LALYNLSVDqnlLFKLTsavllkrgdngsxgdlaciAAEDLvlyqsfdrqkvaawleeen  171
ident                                                             
Sbjct MEYDESLRS.elRKAGF..................vTRDAR...................  106
DSSP  HHHLLLLHH.hhHHHLL..................lLLLLL...................


DSSP  hhhhhhllllleeeellllllleeeeeeellllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhh
Query latvlerdwgfsisqvkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvs  231
ident                                                             
Sbjct ............................................................  106
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhHHHLLlllleEEEEllllllee
Query lvealeqgksekiieqvevasklleglstdiytpllrqLKEASqdlqaVAKSsgagggdc  291
ident                                        |                    
Sbjct ..................................qverKKVGL.....RKAR........  119
DSSP  ..................................llllLLLLL.....LLLL........


DSSP  eeEEELLHHhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query giALSFDAQstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                
Sbjct ..RRPQFSK.....................r  127
DSSP  ..LLLLLLL.....................l


No 23: 2BOAA  MOLECULE: CARBOXYPEPTIDASE A4;                                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeelLLLLL.LEEEEEEEllllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gfsisqvKPTLE.CDFLVGWTkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident                 |                                           
Sbjct .......REKFFgDQVLRINV.......................................   14
DSSP  .......LLLLLlLEEEEELL.......................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHLL..LLLLEEE.EELLlLLLEEEEEEE
Query ksekiieqvevasklleglstdiYTPLLRQLKEAS..QDLQAVA.KSSGaGGGDCGIALS  296
ident                               |        |     ||           | 
Sbjct ......................rNGDEISKLSQLVnsNNLKLNFwKSPS.SFNRPVDVLV   51
DSSP  ......................lLHHHHHHHHHHLllLHHHLEEeELLL.LLLLLEEEEE


DSSP  LLHhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL..................................
Query FDAqSTKTLKNRWADLGIELLYQERI..................................  322
ident     |    |      | |                                         
Sbjct PSV.SLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDlqalldneddemqhnegqerssnnfnygayhsle  110
DSSP  LHH.HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct aiyhemdniaadfpdlarrvkighsfenrpmyvlkfstgkgvrrpavwlnagihsrewis  170
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeellllleeeeeeellllllllleeeeeellllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct qataiwtarkivsdyqrdpaitsilekmdifllpvanpdgyvytqtqnrlwrktrsrnpg  230
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhleeeeellllhhhhhhhhhllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct sscigadpnrnwnasfagkgasdnpcsevyhgphansevevksvvdfiqkhgnfkgfidl  290
DSSP  lllllllhhhllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hsysqllmypygysvkkapdaeeldkvarlaakalasvsgteyqvgptcttvypasgssi  350
DSSP  eellleeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllhh


DSSP  ......................................................
Query ......................................................  322
ident                                                       
Sbjct dwaydngikfaftfelrdtgtygfllpanqiiptaeetwlglktimehvrdnly  404
DSSP  hhhhhlllleeeeeeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 24: 1JQGA  MOLECULE: CARBOXYPEPTIDASE A;                                        

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeelLLLL.LLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gfsisqvKPTL.ECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident                                                             
Sbjct .......HEIYdGHAVYQVDVAS.....................................   16
DSSP  .......LLLLlLLEEEEEELLL.....................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELllLLLEEEEEEELLH
Query ksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSgaGGGDCGIALSFDA  299
ident                                     ||     |     |  |  |    
Sbjct ........................MDQVKLVHDFENDLMLDVWSD.aVPGRPGKVLVPKF   51
DSSP  ........................HHHHHHHHHHHHHLLLEEEEL.lLLLLLEEEEELHH


DSSP  hHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL.....................................
Query qSTKTLKNRWADLGIELLYQERI.....................................  322
ident        |     |                                              
Sbjct .KREIFENFLKQSGVQYKLEVENvkeqleledqllaaaaaksnstrsrlsfdkihsyeev  110
DSSP  .HHHHHHHHHHHHLLEEEEEELLlhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct daylqelakefpnvvtvveggksfegrsikylristtnfqdaskpvvmmqsllhcrewvt  170
DSSP  hhhhhhhhhhlllleeeeeeeellllleeeeeeellllllllllleeeeeellllllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct lpatlyaihklvidvtesdlinnidwiilpvanpdgyvhtfggdrywrknratgymagnl  230
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhhhlleeeeellllhhhhhhhhlllllllllllllllhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct cmgvdlnrnfgmnwgtassssvcsdtfhgrsafsepessvirdiiaehrnrmalyldihs  290
DSSP  lllllhhhlllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct fgsmilygygngvlpsnalqlhligvqmaqaidrvkwssnkdyivgnifhvlyaasggas  350
DSSP  llleeeellllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllleeeehhhhlllllllhh


DSSP  ...........................................................
Query ...........................................................  322
ident                                                            
Sbjct dyamqaaapfsytyelpayrnsvwfdgflvdpdfieqagfetwegikvgaraaaaaake  409
DSSP  hhhhhhllleeeeeeellllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


No 25: 2JE6A  MOLECULE: EXOSOME COMPLEX EXONUCLEASE 2;                             

DSSP  .................................................LLLE.EEEEEE
Query .................................................HXXI.AVKTCG   10
ident                                                             
Sbjct ghmsstpsnqniipiikkesivslfekgirqdgrkltdyrplsitldyaKKADgSALVKL   60
DSSP  llleelllllllllhhhhhhhlllhhhlllllllllllllleeeeelllLLLLeEEEEEE


DSSP  EeeeelllhhhlllleeeeeeeeEEEEEEEEELL...........LLEEE..........
Query KlywageyailepgqlalikdipIYXRAEIAFSD...........SYRIY..........   49
ident                            |                                
Sbjct G.....................tTMVLAGTKLEIdkpyedtpnqgNLIVNvellplayet   99
DSSP  L.....................lEEEEEEEEEEEellllllllllEEEEEeeelllllll


DSSP  .......eelLLLHHHHHHHHHHHhHHHH......hllllllLEEEEEELHHhhhllllL
Query .......sdxNPDYSLIQETIALXgDFLA......vrgqnlrPFSLAIYGKXeregkkfG   96
ident                            |                 |  |          |
Sbjct fepgppdenaIELARVVDRSLRDS.KALDltklviepgksvwTVWLDVYVLD......yG  152
DSSP  lllllllhhhHHHHHHHHHHHHHL.LLLLhhhheeellleeeEEEEEEEEEE......lL


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHHL.................LLLLlhhhhhhhhhHHHH....hh
Query LGSSGSVVVLVVKALLALY.................NLSVdqnllfkltsAVLL....kr  135
ident            | ||                      |             |        
Sbjct GNVLDACTLASVAALYNTKvykveqhisvnknevvgKLPL.......nypVVTIsvakvd  205
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHLLEeeeeellleeeeeeeeeELLL.......lllLEEEeeeeel


DSSP  lllLLLHhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhllllleeeelllllllee
Query gdnGSXGdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsisqvkptlecdf  195
ident                                                             
Sbjct kylVVDP.....................................................  212
DSSP  leeEELL.....................................................


DSSP  eeeeelLLLLL..................hHHHHhhHLLLlhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query lvgwtkEVAVS..................sHXVQqiKQNInqnfltssketvvslveale  237
ident                                                             
Sbjct .dldeeSIMDAkisfsytpdlkivgiqksgKGSM..SLQD....................  249
DSSP  .lhhhhHHLLEeeeeeellllleeeeeeelLLLE..EHHH....................


DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeelllllleeeeeeel
Query qgksekiieqvevasklleglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgagggdcgialsf  297
ident                                                             
Sbjct ............................................................  249
DSSP  ............................................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query daqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                          
Sbjct idqaentarstavklleelkkhlgi  274
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 26: 1VIXA  MOLECULE: PEPTIDASE T;                                               

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhHHHHhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialXGDFlavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident        |                                                    
Sbjct ....mSLDK...................................................    5
DSSP  ....lLHHH...................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhlllLHHHHHHLLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeeNLATVLERDW  180
ident                                                             
Sbjct ................................................llERFLNYVSLD   17
DSSP  ................................................hhHHHHHHHHLL


DSSP  LLEEEE......................................................
Query GFSISQ......................................................  186
ident   |                                                         
Sbjct TQSKAGvrqvpstegqwkllhllkeqleemglinvtlsekgtlmatlpanvpgdipaigf   77
DSSP  LLLLLLllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllleeeeelllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  186
ident                                                             
Sbjct ishvdtspdcsgknvnpqivenyrggdialgigdevlspvmfpvlhqllgqtlittdgkt  137
DSSP  eeelllllllllllllleeellllllleeelllleeelllllhhhhhllllleeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  186
ident                                                             
Sbjct llgaddkagiaeimtalavlqqkkiphgdirvaftpdeevgkgakhfdvdafdarwaytv  197
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellhhhllllllllhhhhllleeeee


DSSP  ........lllLLLLEEEEEEELLLlLLHHhhHHHHllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl
Query ........vkpTLECDFLVGWTKEVaVSSHxvQQIKqninqnfltssketvvslvealeq  238
ident                                    |                        
Sbjct dgggvgelefeNFNAASVNIKIVGN.NVHP..GTAK........................  230
DSSP  lllllleeellLLEEEEEEEEEELL.LLLH..HHLL........................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLL...........lLEEE.EELLL
Query gksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQD...........lQAVA.KSSGA  286
ident                            |                              | 
Sbjct ...................gvmvnaLSLAARIHAEVPAdespemtegyegFYHLaSMKGT  271
DSSP  ...................lllllhHHHHHHHHHHLLLllllllllllllEEEEeEEEEE


DSSP  LLLEEEEEEEL......LHHHHHHHHHHHHHLL........LEEEeEEEL..........
Query GGGDCGIALSF......DAQSTKTLKNRWADLG........IELLyQERI..........  322
ident                                 |        |||   |            
Sbjct VERADMHYIIRdfdrkqFEARKRKMMEIAKKVGkglhpdcyIELV.IEDSyynmrekvve  330
DSSP  LLEEEEEEEEEellhhhHHHHHHHHHHHHHHHHllllllleEEEE.EEEEelllhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hphildiaqqamrdcdiepelkpirggtdgaqlsfmglpcpnlftggynyhgkhefvtle  390
DSSP  llhhhhhhhhhhhhllllleelllllllhhhhhlllllllleellleellllllleeehh


DSSP  .....................
Query .....................  322
ident                      
Sbjct gmekavqvivriaeltaqrke  411
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 27: 1NH7A  MOLECULE: ATP PHOSPHORIBOSYLTRANSFERASE;                             

DSSP  ......................................................llleee
Query ......................................................hxxiav    6
ident                                                             
Sbjct mlrvavpnkgalsepateilaeagyrrrtdskdltvidpvnnveffflrpkdiaiyvgsg   60
DSSP  leeeeeelllllhhhhhhhhhhlllllllllllleeeelllleeeeeelhhhhhhhhhll


DSSP  eeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhhhhhhhh
Query ktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliqetialx   66
ident                                                             
Sbjct eldfgitgrdlvcdsgaqvrerlalgfgsssfryaapagrnwttadlagmriataypnlv  120
DSSP  llleeeeehhhhhhhlllleeeeelllllleeeeeeellllllhhhhllleeeellhhhh


DSSP  HHHHHHLLLLLLLEeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhh
Query GDFLAVRGQNLRPFslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvdqnllfk  126
ident    ||  |                                                    
Sbjct RKDLATKGIEATVI..............................................  134
DSSP  HHHHHHHLLLLEEE..............................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhllllleEEE
Query ltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsISQ  186
ident                                                             
Sbjct ...rldgaveisvqlgvadaiadvvgsgrtlsqhdlvafgeplcdseavliereardQLV  191
DSSP  ...ellllhhhhhhhlllleeeeeelllhhhhllleeeeeeeeeelleeeeellhhhHHH


DSSP  L...LLLLL..LEEEEEEEllllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllh
Query V...KPTLE..CDFLVGWTkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgks  241
ident               |                                             
Sbjct ArvqGVVFGqqYLMLDYDC.........................................  210
DSSP  HhhhHHHHHhhEEEEEEEE.........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLllleeEEELLL..lLLEEEEEEELLH
Query ekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQdlqavAKSSGA..gGGDCGIALSFDA  299
ident                          |                            ||    
Sbjct .....................pRSALKKATAITP..glsPTIAPLadpDWVAIRALVPRR  247
DSSP  .....................eLLLHHHHHHHLL..lllLEEEELlllLEEEEEEEEEHH


DSSP  hHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL.....
Query qSTKTLKNRWADLGIELLYQERI.....  322
ident           |  |        |     
Sbjct .DVNGIMDELAAIGAKAILASDIrfcrf  274
DSSP  .HHHHHHHHHHHLLLEEEEEELLlllll


No 28: 1KWMA  MOLECULE: PROCARBOXYPEPTIDASE B;                                     

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeELLLL.LLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query gfsisQVKPT.LECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident                                                             
Sbjct ....hHGGEHfEGEKVFRVNVED.....................................   19
DSSP  ....lLLHHHhLLLEEEEEEELL.....................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLLLEEE....eelllLLLEEEEEE
Query ksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDLQAVA....kssgaGGGDCGIAL  295
ident                                 |     |                     
Sbjct ........................ENHINIIRELASTTQIDFwkpdsvtqiKPHSTVDFR   55
DSSP  ........................HHHHHHHHHHHHHLLEEEeelllhhhlLLLEEEEEE


DSSP  ELLHhHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL.................................
Query SFDAqSTKTLKNRWADLGIELLYQERI.................................  322
ident       | |  |                                                
Sbjct VKAE.DTVTVENVLKQNELQYKVLISNlrnvveaqfdsrvratghsyekynkwetieawt  114
DSSP  ELHH.HHHHHHHHHHHLLLLEEEEELLhhhhhhhllllllllllllllllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct qqvatenpalisrsvigttfegraiyllkvgkagqnkpaifmdcgfharewispafcqwf  174
DSSP  hhhhhhlllleeeeeeeellllleeeeeeelllllllleeeeellllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct vreavrtygreiqvtellnkldfyvlpvlnidgyiytwtksrfwrktrsthtgsscigtd  234
DSSP  hhhhhhhllllhhhhhhhhhleeeeellllhhhhhhhhhlllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct pnrnfdagwceigasrnpcdetycgpaaeseketkaladfirnklssikayltihsysqm  294
DSSP  hhhllllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeeellle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct miypysyayklgennaelnalakatvkelaslhgtkytygpgattiypaaggsddwaydq  354
DSSP  eeelllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeehhhhlllllllhhhhhhhl


DSSP  ................................................
Query ................................................  322
ident                                                 
Sbjct girysftfelrdtgrygfllpesqiratceetflaikyvasyvlehly  402
DSSP  llleeeeeeellllllhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


No 29: 2Q43A  MOLECULE: IAA-AMINO ACID HYDROLASE ILR1-LIKE 2;                      

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhHHHHHHHHLlllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlLLLL.
Query etiaLXGDFLAVRgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalyNLSV.  119
ident     |                                                       
Sbjct ...kLLEFAKSPE.....................................vfdwmVKIRr   20
DSSP  ...lLHHHHHLHH.....................................hhhhhHHHHh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct kihenpelgyeeletsklirseleligikyrypvaitgvigyigtgeppfvalradmdal   80
DSSP  hhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeellleeeeeeellllleeeeeeellll


DSSP  ........................LHHHHHhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleee
Query ........................DQNLLFkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvly  155
ident                                                             
Sbjct piqegvewehkskiagkmhacghdGHVTML..............................  110
DSSP  llllllllllllllllllllllhhHHHHHH..............................


DSSP  elllhhhhhhhHLLLlhhhhhhlLLLLEEE.ELLL.........................
Query qsfdrqkvaawLEEEnlatvlerDWGFSIS.QVKP.........................  189
ident                                                             
Sbjct ..lgaakilheHRHH....lqgtVVLIFQPaEEGLsgakkmreegalknveaifgihlsa  164
DSSP  ..hhhhhhhhhLHHH....llleEEEEEELlLLLLlhhhhhhhlllllleeeeeeeeeee


DSSP  ..............LLLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query ..............TLECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvea  235
ident                                                             
Sbjct ripfgkaasragsfLAGAGVFEAVITG.................................  191
DSSP  eeellleeelleeeELLLEEEEEEEEE.................................


DSSP  hhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHH.LLLLL..........LEEEEEL
Query leqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKE.ASQDL..........QAVAKSS  284
ident                                         |                   
Sbjct .......................ktidpVVAASSIVLsLQQLVsretdpldskVVTVSKV  228
DSSP  .......................lllhhHHHHHHHHHhHHHHLllllllllleEEEEEEE


DSSP  LlllLEEEEEEEL....LHHHHHHHHHHHHHLL......LEEEE....EEEL........
Query GaggGDCGIALSF....DAQSTKTLKNRWADLG......IELLY....QERI........  322
ident                    |     |                       |          
Sbjct N.pdSITIGGTLRaftgFTQLQQRVKEVITKQAavhrcnASVNLtpngREPMpptvnnkd  287
DSSP  L.llEEEEEEEEEelllHHHHHHHHHHHHHHHHhllleeEEEELlhhhLLLLlleeelhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct lykqfkkvvrdllgqeafveaapvmgsedfsyfaetipghfsllgmqdetngyasshspl  347
DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllleellllllllllhhhhlllleeeeeeeeelllllllllllll


DSSP  ............................
Query ............................  322
ident                             
Sbjct yrinedvlpygaaihasmavqylkekas  375
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 30: 2PFDA  MOLECULE: FORMIMIDOYLTRANSFERASE-CYCLODEAMINASE;                     

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ..............................................sqlvecvpnfsegn   14
DSSP  ..............................................lleeeelleellll


DSSP  HHHHhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlLLEEEElllhhhhhhhhllllhhhhhhlll
Query QNLLfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaeDLVLYQsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct NQEV........idaisqaisqtpgcvlldVDAGPS........................   42
DSSP  LHHH........hhhhhhhlllllleeeeeEEEELL........................


DSSP  lleEEELLLL..................................................
Query gfsISQVKPT..................................................  190
ident       |                                                     
Sbjct ..tNRTVYTFvgqpecvvegalsaartasqlidxrkhkgehprxgaldvcpfipvrgvsx  100
DSSP  ..lLEEEEEEeelhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhlllllllllllleeeeeeeelllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  190
ident                                                             
Sbjct decvlcakafgqrlaeelnvpvylygeaaqxpsrqtlpairageyealpeklkqaewvpd  160
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellllllllllhhhhlllllllhhhhlllllllll


DSSP  ..................LLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhh
Query ..................LECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvsl  232
ident                                                             
Sbjct fgpssfvpswgatvtgarKFLIAFNINLLS..............................  190
DSSP  lllllllllllleeeeelLLLEEEEEEELL..............................


DSSP  hhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHLLLL..........LLEEEE
Query vealeqgksekiieqvevasklleglstdiYTPLLRQLKEASQD..........LQAVAK  282
ident                                    |                        
Sbjct .............................tKEQAHRIALNLREQgrgkdqpgrlKKVQGI  221
DSSP  .............................lHHHHHHHHHHHLLLllllllllllLLEEEE


DSSP  .ELLL.llLEEEEEEELLH..HHHHHHHHHHHHLL......LEEEEEEEL..........
Query .SSGA.ggGDCGIALSFDA..QSTKTLKNRWADLG......IELLYQERI..........  322
ident                  |       |                                  
Sbjct gWYLEeknLAQVSTNLLDFevTALHTVYEEARREAqelnlpVVGSQLVGLvplkalldaa  281
DSSP  eEEELlllEEEEEEEELLLllLLHHHHHHHHHHHHhlllllEEEEEEELLllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct afycdkeklfvleeehrirlvvnrlgldslapfdpkeriieylvpdsgpeqslldaslra  341
DSSP  hhhhhhhllllllhhhhhhhhhhlllllllllllhhhhlhhhhlllllllllhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct fvrevgarsaapgggsvaaavaalgaalasxvgqxtygrrqfdhldstxrrlippfhaas  401
DSSP  hhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct aqltslvdadarafaaclgaiklpkntpeerdrrtcalqeglrqavavplklaetvsqlw  461
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct palqelaqcgnlsclsdlqvaakaletgvfgayfnvlinlkdxtddvfkektrhrissll  521
DSSP  hhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...................
Query ...................  322
ident                    
Sbjct qeaktqaalvlgslearke  540
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhll


No 31: 1CG2A  MOLECULE: CARBOXYPEPTIDASE G2;                                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeeLLLLeeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafSDSYriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct .................................qkrdnvlfqAATD...........eqp   16
DSSP  .................................llllhhhhhHHHH...........hhh


DSSP  hhhHHHHHHHHhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllL
Query etiALXGDFLAvrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvD  120
ident                                                            |
Sbjct aviKTLEKLVN..........................................ietgtgD   34
DSSP  hhhHHHHHHHL..........................................llllllL


DSSP  HHHHHHhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhHHLLLlhhhhhhLLL
Query QNLLFKltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaaWLEEEnlatvleRDW  180
ident                                                             
Sbjct AEGIAA.................................agnfleAELKN...lgftVTR   58
DSSP  HHHHHH.................................hhhhhhHHHHH...llleEEE


DSSP  LLE.........................................................
Query GFS.........................................................  183
ident   |                                                         
Sbjct SKSaglvvgdnivgkikgrggknlllmshmdtvylkgilakapfrvegdkaygpgiaddk  118
DSSP  EELlllllleeeeeeeelllllleeeeeellllllllhhhhllleeelleeelllllllh


DSSP  ..............................eEELL.........................
Query ..............................iSQVK.........................  188
ident                                                             
Sbjct ggnavilhtlkllkeygvrdygtitvlfntdEEKGsfgsrdliqeeakladyvlsfepts  178
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeeellHHHLllllhhhhhhhhhhlleeeelllee


DSSP  ........lLLLLEEEEEEELLLlLLHHhhHHHHllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ........pTLECDFLVGWTKEVaVSSHxvQQIKqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
ident          |               |                                  
Sbjct agdeklslgTSGIAYVQVNITGK.ASHAgaAPEL..........................  211
DSSP  lllleeeleELEEEEEEEEEELL.LEELllLHHH..........................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLL.......LEEE.EELLL......
Query sekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDL.......QAVA.KSSGA......  286
ident                              |                              
Sbjct ...................gvnaLVEASDLVLRTMNIddkaknlRFNWtIAKAGnvsnii  252
DSSP  ...................lllhHHHHHHHHHHHHHHlllllleEEEEeEEEELllllee


DSSP  LLLEEEEEEEL......LHHHHHHHHHHHHHL.....lLEEEeEEEL.............
Query GGGDCGIALSF......DAQSTKTLKNRWADL.....gIELLyQERI.............  322
ident        |              |||  |                 |              
Sbjct PASATLNADVRyarnedFDAAMKTLEERAQQKklpeadVKVI.VTRGrpafnageggkkl  311
DSSP  LLEEEEEEEEEellhhhHHHHHHHHHHHHLLLllllleEEEE.EEELllleelhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct vdkavayykeaggtlgveertgggtdaayaalsgkpvieslglpgfgyhsdkaeyvdisa  371
DSSP  hhhhhhhhhhllllleeellllllllhhhhhhhllleellllleeelllllllleeehhh


DSSP  ..................
Query ..................  322
ident                   
Sbjct iprrlymaarlimdlgag  389
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhll


No 32: 1YSJA  MOLECULE: PROTEIN YXEP;                                              

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhHHHHHLlllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhHHHHLLllll
Query etialxgDFLAVRgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkaLLALYNlsvd  120
ident         |                                                   
Sbjct ....adkAFHTRL...............inxrrdlhehpelsfqevettkKIRRWLeeeq   41
DSSP  ....llhHHHHHH...............hhhhhhhhhllllllllhhhhhHHHHHHhhll


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeEELLlhhhHHHHhllllhhhhhhlLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlYQSFdrqkVAAWleeenlatvlerDW  180
ident                                                             
Sbjct ieildvpqlktgviaeikgredgpviairadidaLPIQ...eQTNL........pfasKV   90
DSSP  leellllllllleeeeeelllllleeeeeeelllLLLL...lLLLL........llllLL


DSSP  LL.....................................eeEELL...............
Query GF.....................................siSQVK...............  188
ident                                                             
Sbjct DGtxhacghdfhtasiigtaxllnqrraelkgtvrfifqpaEEIAagarkvleagvlngv  150
DSSP  LLllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhllleeeeeeellLLLLlhhhhhhhlllllle


DSSP  .......................lLLLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhh
Query .......................pTLECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltss  225
ident                             |      |                        
Sbjct saifgxhnkpdlpvgtigvkegplXASVDRFEIVIKG.......................  187
DSSP  eeeeeeeeelllllleeeelleeeELLEEEEEEEEEL.......................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLllLEEE.EEL
Query ketvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQdlQAVA.KSS  284
ident                                            |     |          
Sbjct ................................knsidpIAAAGQIISGLQnaVVSItRVQ  215
DSSP  ................................lllllhHHHHHHHHHHHLllEEEEeEEE


DSSP  LL......llLEEEEEEEL......LHHHHHHHHHHHHHL......LLEEeEEEEL....
Query GA......ggGDCGIALSF......DAQSTKTLKNRWADL......GIELlYQERI....  322
ident                                                 |           
Sbjct AGtswnvipdQAEXEGTVRtfqkeaRQAVPEHXRRVAEGIaagygaQAEF.KWFPYlpsv  274
DSSP  ELllllllllEEEEEEEEElllhhhHHHHHHHHHHHHHHHhhhlllEEEE.EEEEEelle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct qndgtflnaaseaaarlgyqtvhaeqspggedfalyqekipgffvwxgtngteewhhpaf  334
DSSP  eelhhhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllhhhhhlllleeeeeeellllllllllll


DSSP  .........................
Query .........................  322
ident                          
Sbjct tldeealtvasqyfaelavivleti  359
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 33: 1S1HI  MOLECULE: 18S RIBOSOMAL RNA;                                         

DSSP  lLLEEEEEEEEeeeelllhhhlllleeeeeeeEEEEEEEEEELlLLEEE.EELL......
Query hXXIAVKTCGKlywageyailepgqlalikdiPIYXRAEIAFSdSYRIY.SDXN......   53
ident           |                          |         |            
Sbjct .PSVQTFGKKK.....................SATAVAHVKAG.KGLIKvNGSPitlvep   37
DSSP  .LLEEELLLLL.....................LLEEEEEELLL.LLLEEeLLEEhhhhll


DSSP  .llhHHHHHHHHHHHHhhhhlllllLLEEEEEELHHhhhllllllLHHHHHHHHHHHHHH
Query .pdySLIQETIALXGDflavrgqnlRPFSLAIYGKXeregkkfglGSSGSVVVLVVKALL  112
ident         |   | |                                         | | 
Sbjct eilrFKVYEPLLLVGL......dkfSNIDIRVRVTG.....gghvSQVYAIRQAIAKGLV   86
DSSP  llllLHHHHHHHHLLL......lllLLLLEEEEEEL.....llhhHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHLLL.........LLLH...HHHHhhhhhhhhhhllllllhhhhhhHHLLLeeeelllh
Query ALYNL.........SVDQ...NLLFkltsavllkrgdngsxgdlaciAAEDLvlyqsfdr  160
ident |                                               |           
Sbjct AYHQKyvdeqskneLKKAftsYDRT....................llIADSR........  118
DSSP  HHLLLlllllllllLLLLlllLLLL....................llLLLLL........


DSSP  hhhhhhhllllhhhhhhllllleeeellllllleeeeeeellllllhhhhhhhhllllhh
Query qkvaawleeenlatvlerdwgfsisqvkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqn  220
ident                                                             
Sbjct ............................................................  118
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhHHHHhhhhlllLLLHhhhhhhhllllllee
Query fltssketvvslvealeqgksekiieqvevASKLleglstdIYTPllrqlkeasqdlqav  280
ident                                                             
Sbjct ..........................rpepKKFG...gkgaRSRF...............  134
DSSP  ..........................llllLLLL...llllLLLL...............


DSSP  eeelllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query akssgagggdcgialsfdaqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                           
Sbjct .....................................qksyr  139
DSSP  .....................................lllll


No 34: 2D1CA  MOLECULE: ISOCITRATE DEHYDROGENASE;                                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct plittetgkkmhvledgrklitvipgdgigpecveatlkvleaakaplayevreagasvf   60
DSSP  leeellllleeeellllleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeellllhhhh


DSSP  ...............................................LLLE.........
Query ...............................................HXXI.........    4
ident                                                             
Sbjct rrgiasgvpqetiesirktrvvlkgpletpvgygeksanvtlrklfeTYANvrpvrefpn  120
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhleeeelllllllllllllhhhhhhhhllLLEEeeeeellll


DSSP  ..................EEEEeeeeeeelllhhhlllleeeeeeEEEEEE.........
Query ..................AVKTcgklywageyailepgqlalikdIPIYXR.........   37
ident                                                             
Sbjct vptpyagrgidlvvvrenVEDL..........yagiehmqtpsvaQTLKLIswkgsekiv  170
DSSP  lllllllllleeeeeeelLLLH..........hhlleeeeelleeEEEEEEehhhhhhhh


DSSP  .......eeeeelLLLE.............EEEE......llllhhhhhhHHHHHHHHHH
Query .......aeiafsDSYR.............IYSD......xnpdysliqeTIALXGDFLA   71
ident                                                           | 
Sbjct rfafelaraegrkKVHCatksnimklaegtLKRAfeqvaqeypdieavhiIVDNAAHQLV  230
DSSP  hhhhhhhhhllllEEEEeelllllllhhhhHHHHhhhhhlllllleeeeeEHHHHHHHHH


DSSP  HLllllLLEEEeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhHHHHHHLLL..............
Query VRgqnlRPFSLaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvKALLALYNL..............  117
ident  |                                        |  |              
Sbjct KRpeqfEVIVT........................tnMNGDILSDLtsgligglgfapsa  266
DSSP  HLhhhlLEEEE........................lhHHHHHHHHHhhlllllhhhleee


DSSP  ...............................................lllhhhhhhhhhh
Query ...............................................svdqnllfkltsa  130
ident                                                             
Sbjct nignevaifeavhgsapkyagknvinptavllsavmmlryleefatadlienallytlee  326
DSSP  eelllleeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhllllleeeelllL
Query vllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdwgfsisqvkpT  190
ident                                                             
Sbjct grvltgdvvgydrgaktteyteaiiqnlgktprktqvrgykpfrlpqvdgaiapivprsR  386
DSSP  lllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllhhhlllllllllE


DSSP  LLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhh
Query LECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgksekiieqvev  250
ident       |                                                     
Sbjct RVVGVDVFVETN................................................  398
DSSP  EEEEEEEEEELL................................................


DSSP  hhhhhhhhlllLLLHHHHHHHHLLLLLLEEE.EELLL.............llLEEEEEEE
Query asklleglstdIYTPLLRQLKEASQDLQAVA.KSSGA.............ggGDCGIALS  296
ident                |   |              |                         
Sbjct ..........lLPEALGKALEDLAAGTPFRLkMISNRgtqvypptggltdlvDHYRCRFL  448
DSSP  ..........lLHHHHHHHHHHHHLLLLEEEeEEEELleeeellllllllllLEEEEEEE


DSSP  L......LHHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL...............
Query F......DAQSTKTLKNRWADLGIELLYQERI...............  322
ident               |  | |                           
Sbjct YtgegeaKDPEILDLVSRVASRFRWMHLEKLQefdgepgftkaqged  495
DSSP  EllllllLHHHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEEEeelleelllllllll


No 35: 1XHKA  MOLECULE: PUTATIVE PROTEASE LA HOMOLOG;                              

DSSP  llleeEEEEEEEeeelllhhhlllleeeeEEEEEEEEEEEEELLLLEEEE..elLLLHHH
Query hxxiaVKTCGKLywageyailepgqlaliKDIPIYXRAEIAFSDSYRIYS..dxNPDYSL   58
ident      |                                 |  |                 
Sbjct epkvgVIYGLAV............lgaggIGDVTKIIVQILESKNPGTHLlnisGDIAKH   48
DSSP  lllllEEEEEEL............lllllLLEEEEEEEEEEELLLLEEEEelllHHHHHH


DSSP  H.HHHHHHHHHHHH..HLLLL.....llLEEEEEELHHhhhLLLLllLHHHHHHHHHHHH
Query I.QETIALXGDFLA..VRGQN.....lrPFSLAIYGKXereGKKFglGSSGSVVVLVVKA  110
ident       ||     |                   |                          
Sbjct SiTLASALSKKLVAekKLPLPkkdidlnNKEIYIQFSQ...SYSK.iDGDSATAAVCLAI  104
DSSP  HhHHHHHHHHHHHHllLLLLLlllllllLEEEEEEELL...LLLL.lLHHHHHHHHHHHH


DSSP  HHHHLLLLLLhhhhhhhhhhHHHHHLllLLLHhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhlll
Query LLALYNLSVDqnllfkltsaVLLKRGdnGSXGdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleee  170
ident   ||                  |        |                            
Sbjct ISALLDIPLK..qdfaitgsLDLSGN.vLAIG................gvnekieaakry  145
DSSP  HHHHHLLLLL..lleeelleELLLLL.eELLL................lhhhhhhhhhhl


DSSP  lhhhhhhllllLEEE.ELLLlllleeeeeeellllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh
Query nlatvlerdwgFSIS.QVKPtlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnfltssketv  229
ident                                                             
Sbjct gfkrviipeanXIDViETEG........................................  165
DSSP  llleeeeehhhHHHLlLLLL........................................


DSSP  hhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhlllllleeeeellllll
Query vslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiytpllrqlkeasqdlqavakssgaggg  289
ident                                                             
Sbjct ............................................................  165
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeeellhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeel
Query dcgialsfdaqstktlknrwadlgiellyqeri  322
ident                                  
Sbjct .............ieiipvktldeivplvfdld  185
DSSP  .............leeeeellhhhhhhhhllll


No 36: 1VI7A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN YIGZ;                                 

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct .....................................................lmeswli    7
DSSP  .....................................................lllleee


DSSP  hhhhhhhhHHHHLlllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdFLAVRgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct paapvtvvEEIKK...............................................   20
DSSP  ellleeeeEEELL...............................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleEEEL...LLHHHHHHHHLLLlhhhhhH
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvLYQS...FDRQKVAAWLEEEnlatvlE  177
ident                                              | |            
Sbjct .......................srfitmlahtDGVEaakAFVESVRAEHPDA.....rH   52
DSSP  .......................eeeeeeeeelLHHHhhhHHHHHHHHHLLLL.....lL


DSSP  LLLllEEEEL..................................................
Query RDWgfSISQV..................................................  187
ident                                                             
Sbjct HCV.aWVAGApddsqqlgfsddgepagtagkpmlaqlmgsgvgeitavvvryyggillgt  111
DSSP  LLE.eEELLLllllllleeellllllllllhhhhhhhhhhlllleeeelleelllllllh


DSSP  ....................lLLLLLEEEEEEELlllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhh
Query ....................kPTLECDFLVGWTKevavsshxvqqikqninqnfltsske  227
ident                                                             
Sbjct gglvkaygggvnqalrqlttqRKTPLTEYTLQCE..........................  145
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllleeEELLLEEEEEEEL..........................


DSSP  hhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLLLEEEEELLLL
Query tvvslvealeqgksekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDLQAVAKSSGAG  287
ident                                        |                |   
Sbjct ....................................YHQLTGIEALLGQCDGKIINSDYQ  169
DSSP  ....................................LLLHHHHHHHHHHLLLEEEEEEEL


DSSP  LLEEEEEEELLHhHHHHHHHHHHHLL...LEEEEEeel
Query GGDCGIALSFDAqSTKTLKNRWADLG...IELLYQeri  322
ident            |          ||       ||     
Sbjct AFVLLRVALPAA.KVAEFSAKLADFSrgsLQLLAIeee  206
DSSP  LLEEEEEEELLL.LHHHHHHHHHHHHlllLLLEELlll


No 37: 1PHZA  MOLECULE: PROTEIN (PHENYLALANINE HYDROXYLASE);                       

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhlLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerDW  180
ident                                                             
Sbjct ..........................................................GQ    2
DSSP  ..........................................................LL


DSSP  LLEEEELLLL.LLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query GFSISQVKPT.LECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqg  239
ident   |             |    ||                                     
Sbjct ETSYIEDNSNqNGAISLIFSLKE.....................................   25
DSSP  LLLLLLLLLLlLLLEEEEEEEEL.....................................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllHHHHHHHHLLLLLLE...EEEELLL...lLLEEEE
Query ksekiieqvevasklleglstdiytPLLRQLKEASQDLQA...VAKSSGA...gGGDCGI  293
ident                            |                  |             
Sbjct .......................evGALAKVLRLFEENDInltHIESRPSrlnkDEYEFF   62
DSSP  .......................llLHHHHHHHHHHLLLLlllLEEEEELllllLEEEEE


DSSP  EEEL..LHHHHHHHHHHHH.HLLLEEeEEEEL............................
Query ALSF..DAQSTKTLKNRWA.DLGIELlYQERI............................  322
ident                     | |                                     
Sbjct TYLDkrTKPVLGSIIKSLRnDIGATV.HELSRdkekntvpwfprtiqeldrfanqildad  121
DSSP  ELLLhhHHHHHHHHHHHHHhLLLLLE.EEEELlllllleelllllhhhhhllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hpgfkdpvyrarrkqfadiaynyrhgqpiprveyteeekqtwgtvfrtlkalykthacye  181
DSSP  llllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct hnhifpllekycgfrednipqledvsqflqtctgfrlrpvagllssrdflgglafrvfhc  241
DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhlleeeellllllhhhhhhhhllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct tqyirhgskpmytpepdichellghvplfsdrsfaqfsqeiglaslgapdeyieklatiy  301
DSSP  lllllllllllllllllhhhhhhhlhhhhllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct wftvefglckegdsikaygagllssfgelqyclsdkpkllplelektacqeysvtefqpl  361
DSSP  hlllllleeeelleeeellhhhhllhhhhhhhllllleeeellhhhhlllllllllllle


DSSP  ..........................................
Query ..........................................  322
ident                                           
Sbjct yyvaesfsdakekvrtfaatiprpfsvrydpytqrvevldnt  403
DSSP  eeeellhhhhhhhhhhhhllllllleeeeelllleeeeelll


No 38: 1Q8IA  MOLECULE: DNA POLYMERASE II;                                         

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllLL
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsVD  120
ident                                                             
Sbjct ..........................................................AQ    2
DSSP  ..........................................................LE


DSSP  HHhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhlll
Query QNllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
ident                                                             
Sbjct AG...................................filtrhwrdtpqgtevsfwlatd   27
DSSP  EE...................................eeeeeeeelllllleeeeeeeel


DSSP  llEEEELLlLLLLEEEEEEEllllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gfSISQVKpTLECDFLVGWTkevavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
ident                                                             
Sbjct ngPLQVTL.APQESVAFIPA........................................   46
DSSP  leEEEEEL.LLLLEEEEEEH........................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllHHHHHHHHLLL.LLLEEEEELL...lllLEEEEEEE
Query sekiieqvevasklleglstdiytPLLRQLKEASQ.DLQAVAKSSG...aggGDCGIALS  296
ident                                   |                         
Sbjct ........................DQVPRAQHILQgEQGFRLTPLAlkdfhrQPVYGLYC   82
DSSP  ........................HHHHHHHHHLLlLLLEEEEEEEeellllLEEEEEEE


DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLEEEE.EEEL.................................
Query FDAQSTKTLKNRWADLGIELLY.QERI.................................  322
ident            |    |        |                                  
Sbjct RAHRQLMNYEKRLREGGVTVYEaDVRPperylmerfitspvwvegdmhngtivnarlkph  142
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLlLLLHhhhhhhhllllleeeeeeeeelleeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct pdyrpplkwvsidiettrhgelyciglegcgqrivymlgpengdassldfeleyvasrpq  202
DSSP  lllllllleeeeeeeellllleeeeeeeelleeeeeeelllllllllllleeeeellhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct lleklnawfanydpdviigwnvvqfdlrmlqkhaeryrlplrlgrdnselewrehgfkng  262
DSSP  hhhhhhhhhhhhllleeeellllllhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct vffaqakgrliidgiealksafwnfssfsletvaqellmdeidrrfaedkpalatynlkd  322
DSSP  eeeeelllleeeehhhhhhhlllllllllhhhhhhlllllhhhhhhhhlhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct celvtqifhkteimpflleratvnglpvdrhggsvaafghlyfprmhragyvapnlgevp  382
DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct phaspggyvmdsrpglydsvlvldykslypsivrtflidpvglvegmaqpdpehstegfl  442
DSSP  lllllllllllllleeeeeeeeeeellhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhlllllleeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct dawfsrekhclpeivtniwhgrdeakrqgnkplsqalkiimnafygvlgttacrffdprl  502
DSSP  lleeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct assitmrghqimrqtkalieaqgydviygdtdstfvwlkgahseeeaakigralvqhvna  562
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct wwaetlqkqrltsaleleyethfcrflmptirgadtgskkryagliqegdkqrmvfkgle  622
DSSP  hhhhhhhllllllllleeeeeeeeeeeellllllllllllleeeeeeelleeeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct ttdwtplaqqfqqelylrifrnepyqeyvretidklmageldarlvyspldyehyltrql  682
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllllhhhhllllllhhhhhhhlh


DSSP  .........................
Query .........................  322
ident                          
Sbjct qpvaegilpfiednfatlmtgqlgl  707
DSSP  hhhhhllhhhhlllhhhhhhhhhll


No 39: 1Q8KA  MOLECULE: EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2                 

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ....................................mscrfyqhkfpevedvvmvnvrsi   24
DSSP  ....................................llllllllllllllleeeeeeeee


DSSP  hhhhhhhhhHHHLLLL................llleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhh
Query etialxgdfLAVRGQN................lrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvv  104
ident          |                                                  
Sbjct qemgayvslLEYNNIEgmihlselsrrrirsinklirigrnecvkvirvdkekgyidlsk   84
DSSP  elleeeeelLLLLLLLeeelhhhllllllllllllllllleeeeeeeeeelllleeeeel


DSSP  hhhhhhhhHHLL.LLLLhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhh
Query vlvvkallALYN.LSVDqnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkv  163
ident                                                             
Sbjct rrvspeeaIKCEdKFTK..............................sktvysilrhvae  114
DSSP  llllhhhhHHHHhHHHH..............................hhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhHLLLL.HHHHHHLL..........................................l
Query aawLEEEN.LATVLERD..........................................w  180
ident          |     |                                            
Sbjct vleYTKDEqLESLFQRTawvfddkykrpgygaydafkhavsdpsildsldlnederevli  174
DSSP  hllLLLLHhHHHHHHHLhhhhhhhlllllhhhhhhhhhllllhhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  lleeeelllLLLLEEEEEEELLLLLlhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gfsisqvkpTLECDFLVGWTKEVAVsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
ident                                                             
Sbjct nninrrltpQAVKIRADIEVACYGY...................................  199
DSSP  hhhhhhlllLLLEEEELLLEELLLL...................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHLLLLL....LEEEEELLllllEEEEEEE
Query sekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEASQDL....QAVAKSSGagggDCGIALS  296
ident                              |                              
Sbjct ....................egiDAVKEALRAGLNCStenmPIKINLIA...pPRYVMTT  236
DSSP  ....................llhHHHHHHHHHHHHLLllllLEEEEEEE...lLEEEEEE


DSSP  LL...HHHHHHHHHHHHHLL.........LEEEE.EEEL.....................
Query FD...AQSTKTLKNRWADLG.........IELLY.QERI.....................  322
ident            |    |                                           
Sbjct TTlerTEGLSVLSQAMAVIKekieekrgvFNVQMePKVVtdtdetelarqmerlerenae  296
DSSP  ELllhHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllleELLLLlLEELlllhhhhhhhhlllhhhllll


DSSP  ....
Query ....  322
ident     
Sbjct vdgd  300
DSSP  llll


No 40: 1M5HA  MOLECULE: FORMYLMETHANOFURAN--TETRAHYDROMETHANOPTERIN                

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhHLLL
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlERDW  180
ident                                                             
Sbjct .....................................................mkvNGVE    7
DSSP  .....................................................leeLLEE


DSSP  LLEEEELLLLLLLEEEEEEELLllllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query GFSISQVKPTLECDFLVGWTKEvavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
ident                                                             
Sbjct VEETFAEAFDIKIARVLITGYD......................................   29
DSSP  ELLLEEEEEEEEEEEEEEELLL......................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllLHHHHHHHHL.LLLL........LEEE.EELLL....
Query sekiieqvevasklleglstdiyTPLLRQLKEA.SQDL........QAVA.KSSGA....  286
ident                                                |            
Sbjct .......................YYWAWVAANEaTGFGtsvimcpaEAGIeIKAKPsetp   66
DSSP  .......................HHHHHHHHHHhHLLLllllllllEEEEeEEELHhhll


DSSP  llLEEEEEEEL......LHHHHHHHHH.HHHHLL.LEEEE....................
Query ggGDCGIALSF......DAQSTKTLKN.RWADLG.IELLY....................  318
ident                                                             
Sbjct dgRPGYYIQIChmskkgLEEQLLARLGqCVLTAPtTAVFNglpdaeekddtgfklkffad  126
DSSP  llLLEEEEEEEellhhhHHHHHHHHHHhHLLLLLlLEEEEllllllleelhhhhhhhhhl


DSSP  ............................EEEL............................
Query ............................QERI............................  322
ident                                                             
Sbjct gyqkevevggrkcwavpmmegdfiiendIGYTngiaggnffimaetqpsalaaakaavda  186
DSSP  llleeeeelleeeeeeelllleeeeellEEEEeeeeeeeeeeeellhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
ident                                                             
Sbjct isdvegvitpfpggivasgskvgankykflkastnekfapsirdqvegtqipagvkavye  246
DSSP  hhlllleelllhhhlllllllllllllllllllllhhhlhhhhhhhlllllllllleeee


DSSP  ...................................................
Query ...................................................  322
ident                                                    
Sbjct ivinglnadaikeatrvgilaatkipgvvkitagnyggklgkhiinlnelf  297
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllllllleeeehhhll


No 41: 1Z1WA  MOLECULE: TRICORN PROTEASE INTERACTING FACTOR F3;                    

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mevekydltldfdiqkrtfngtetitadagdivldavglqinwmkvngrdtaftydgqtv   60
DSSP  lleeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeelleeeeeelllleeeeeeellleelleelllee


DSSP  .................................llleeeeeeeeeeeelllhhhllllee
Query .................................hxxiavktcgklywageyailepgqla   27
ident                                                             
Sbjct rapgdsqpqkieisfagkvsdslsgiyyagrengmitthfeatdarrmfpcvdhpaykav  120
DSSP  eeeeelllleeeeeeeeelllllleeeeellllleeeeelllllhhhlllllllllllle


DSSP  eeeeeeeeeeeeeeELLL..........................................
Query likdipiyxraeiaFSDS..........................................   45
ident                                                             
Sbjct faitvvidkdydaiSNMPpkrievserkvvefqdtprmstyllyvgigkfryeyekyrdi  180
DSSP  eeeeeeelllleeeELLLeeeeeellleeeeelllllllhhhlleeeelleeeeeeelle


DSSP  .LEEEEEL.LLLHhHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLL..LLEEEE.................
Query .YRIYSDX.NPDYsLIQETIALXGDFLAV.RGQNL..RPFSLA.................   83
ident      |                   |     |         |                  
Sbjct dLILASLKdIRSK.YPLDMARKSVEFYENyFGIPYalPKMHLIsvpefgagamenwgait  239
DSSP  eEEEEELLlLLLL.HHHHHHHHHHHHHHHhHLLLLllLEEEEEeelllllleelllleee


DSSP  EELHhhhhllllLLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLL................LLLHhHHHHH
Query IYGKxeregkkfGLGSSGSVVVLVVKALLALYNL................SVDQnLLFKL  127
ident                                                           | 
Sbjct FREIymdiaensAVTVKRNSANVIAHEIAHQWFGdlvtmkwwndlwlnesFATF.MSYKT  298
DSSP  EEHHhhllllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLlleellllllhhhhhhHHHH.HHHHH


DSSP  HHHHHhhhlllLLLHhHHHHH..HLLL.................................
Query TSAVLlkrgdnGSXGdLACIA..AEDL.................................  152
ident                                                             
Sbjct MDTLF......PEWS.FWGDFfvSRTSgalrsdslknthpievdvrdpdeisqifdeisy  351
DSSP  HHHHL......HHHL.HHHHHhhHLHHhhhhhllllllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct gkgasilrmiedyagyeefrkgiskylndhkfgnaegsdlwtaiedvsgkpvkrvmeywi  411
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhllleellhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  152
ident                                                             
Sbjct knpgypviklkrngrkitmyqtrfllngeeegrwpvpvnikkkdgverilledeasiead  471
DSSP  hlllleeeeeeellleeeeeeeeelllleeelllleeeeeelllleeeeeellleeeell


DSSP  ..............................eeEELLlhhhhhhhhllllhhhhhhlllll
Query ..............................vlYQSFdrqkvaawleeenlatvlerdwgf  182
ident                                                             
Sbjct glikinadsagfyrvlyddatfsdvmghyrdlSPLD........................  507
DSSP  llleelhhhlllleeeelhhhhhhhhhlhhhlLHHH........................


DSSP  eeeellllllleeeeeeellllllhhhhhhhhllllhhhhHHHH....hhHHHHHHHHHL
Query sisqvkptlecdflvgwtkevavsshxvqqikqninqnflTSSK....etVVSLVEALEQ  238
ident                                                             
Sbjct ............riglvddlfafllsghidpetyrqrirnFFDDedhnviTAIVGQMEYL  555
DSSP  ............hhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhlLLLLllhhhhHHHHHHHHHH


DSSP  L.....LHHHHHHHHHHHHHHHHHH.....llllllhhhhhhhhlLLLL..leeeeelll
Query G.....KSEKIIEQVEVASKLLEGL.....stdiytpllrqlkeaSQDL..qavakssga  286
ident                      | |                                    
Sbjct RmlthaFDDDARAFCRSRMQFLTGKqdenlkialgrvsrlyvmvdESYAeemsklfkdfd  615
DSSP  LlllllLHHHHHHHHHHHHHHHLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhlHHHHhhhhhhhhhll


DSSP  lLLEEEeeeellhhHHHHH..hhhhHHLL.......lEEEE...................
Query gGGDCGialsfdaqSTKTL..knrwADLG.......iELLY...................  318
ident                                                             
Sbjct sAEPEM..rssiatAYALVtgdlkgLLEKfrsvdrdeDRVRiisafgklksntdlstvyg  673
DSSP  lLLHHH..hhhhhhHHHHHlllhhhHHHHhhlllllhHHHHhhhhhhhllllllllllll


DSSP  .............EEEL...........................................
Query .............QERI...........................................  322
ident                                                             
Sbjct mvekteikkqdmiSFFSsaletlpgrefifanldriirlviryftgnrtasrtvemmipv  733
DSSP  llllllllhhhlhHHHHhhlllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  ...............................................
Query ...............................................  322
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Sbjct igldhpdaedivrnigsknismglakgiemlavnrklverirqtavk  780
DSSP  hllllllhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


No 42: 2BMBA  MOLECULE: FOLIC ACID SYNTHESIS PROTEIN FOL1;                         

DSSP  llleeeeeeeeeeeelllhhhlllleeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeellllhhhhh
Query hxxiavktcgklywageyailepgqlalikdipiyxraeiafsdsyriysdxnpdysliq   60
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllleeeeeelhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query etialxgdflavrgqnlrpfslaiygkxeregkkfglgssgsvvvlvvkallalynlsvd  120
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhllleeeelllhhhhhhhhllllhhhhhhlll
Query qnllfkltsavllkrgdngsxgdlaciaaedlvlyqsfdrqkvaawleeenlatvlerdw  180
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Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  lleeeelllllLLEEEEEEELLLlllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll
Query gfsisqvkptlECDFLVGWTKEVavsshxvqqikqninqnfltssketvvslvealeqgk  240
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Sbjct ...........SWKRAFLAFGSN.....................................   12
DSSP  ...........LLEEEEEEEEEL.....................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLLHHHHHHHHLLLLLLEEE.EELLL.............
Query sekiieqvevasklleglstdiYTPLLRQLKEASQDLQAVA.KSSGA.............  286
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Sbjct ..................igdrFKHIQMALQLLSREKTVKLrNISSIfesepmyfkdqtp   54
DSSP  ..................lllhHHHHHHHHHHHHHLLLEEEeEELLEeeellllllllll


DSSP  lLLEEEEEEELLHhhhHHHHHHHHHLL.........LEEEEEEEL...............
Query gGGDCGIALSFDAqstKTLKNRWADLG.........IELLYQERI...............  322
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Sbjct fMNGCVEVETLLT..pSELLKLCKKIEyeelqrtidLDIVMFLNSagediivnepdlnip  112
DSSP  eEEEEEEEEELLL..hHHHHHHHHHHHhhhllllleEEEEEEELLlllllleelllleel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  322
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Sbjct hprmlertfvleplcelispvhlhpvtaepivdhlkqlydkqhdedtlwklvplpyrsgv  172