DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1JSSB MOLECULE: CHOLESTEROL-REGULATED START PROTEIN 4;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1JSS-A 38.0  0.3  199   199  100   CHOLESTEROL-REGULATED START PROTEIN 4;                     "         
   2:  1EM2-A 26.3  1.7  196   214   22   MLN64 PROTEIN;                                             "         
   3:  2PSO-A 20.5  2.2  172   197   16   STAR-RELATED LIPID TRANSFER PROTEIN 13;                    "         
   4:  1LN1-A 18.3  2.8  188   203   17   PHOSPHATIDYLCHOLINE TRANSFER PROTEIN;                      "         
   5:  1T17-A 12.1  2.5  133   148    5   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   6:  2NS9-A 11.1  2.6  134   152    7   HYPOTHETICAL PROTEIN APE2225;                              "         
   7:  1Z94-A 11.1  2.4  122   140    9   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
   8:  1XUV-A 10.6  2.5  122   163   12   HYPOTHETICAL PROTEIN MM0500;                               "         
   9:  1XFS-A 10.5  3.2  125   154   10   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  10:  1B6F-A 10.5  2.9  134   159    7   PROTEIN (MAJOR POLLEN ALLERGEN BET V 1-A);                 "         
  11:  2B79-A 10.2  3.5  130   142    5   HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.440;                              "         
  12:  2FLH-A 10.1  2.8  124   144    9   CYTOKININ-SPECIFIC BINDING PROTEIN;                        "         
  13:  2NN5-A  9.9  3.0  130   171    6   HYPOTHETICAL PROTEIN EF_2215;                              "         
  14:  2QPV-A  9.4  3.0  123   133   11   UNCHARACTERIZED PROTEIN ATU1531;                           "         
  15:  1XN5-A  9.3  2.7  122   138    8   BH1534 UNKNOWN CONSERVED PROTEIN;                          "         
  16:  2FFS-A  9.1  2.8  120   146    5   HYPOTHETICAL PROTEIN PA1206;                               "         
  17:  1X53-A  8.7  2.7  117   145    3   ACTIVATOR OF 90 KDA HEAT SHOCK PROTEIN ATPASE              "         
  18:  2PCS-A  8.4  3.1  124   152    8   CONSERVED PROTEIN;                                         "         
  19:  2D4R-A  7.3  3.1  119   146    9   HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0849;                             "         
  20:  1TW0-A  6.0  4.0  119   157   11   PATHOGENESIS-RELATED CLASS 10 PROTEIN SPE-16;              "         
  21:  2IL5-A  5.9  4.2  118   162    5   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  22:  2DE5-A  5.3  4.2  128   389    5   TERMINAL OXYGENASE COMPONENT OF CARBAZOLE;                 "         
  23:  1BIA-A  5.1  3.2  104   292    2   BIRA BIFUNCTIONAL PROTEIN;                                 "         
  24:  2DEQ-A  4.7  3.4  107   235   12   235AA LONG HYPOTHETICAL BIOTIN--[ACETYL-COA-               "         
  25:  1XKP-B  4.6  3.3   87   121    7   PUTATIVE MEMBRANE-BOUND YOP TARGETING PROTEIN              "         
  26:  1PZD-A  4.6  3.3   86   271    6   COATOMER GAMMA SUBUNIT;                                    "         
  27:  1TTW-A  4.5  2.9   84   118    8   SECRETION CHAPERONE;                                       "         
  28:  2FM8-A  4.4  3.4   89   134   10   SURFACE PRESENTATION OF ANTIGENS PROTEIN SPAK;             "         
  29:  1EG9-A  4.4  4.2  131   447   10   PROTEIN (NAPHTHALENE 1,2-DIOXYGENASE ALPHA                 "         
  30:  1RY9-A  4.2  3.4   90   133    8   SURFACE PRESENTATION OF ANTIGENS PROTEIN SPAK;             "         
  31:  1V2B-A  4.1  3.5   90   148    8   23-KDA POLYPEPTIDE OF PHOTOSYSTEM II OXYGEN-               "         
  32:  1JYO-A  4.1  3.5   86   130    7   SICP;                                                      "         
  33:  1K8K-D  4.0  3.4   91   283    8   ACTIN-LIKE PROTEIN 3;                                      "         
  34:  1K6Z-A  4.0  3.2   81   122   10   TYPE III SECRETION CHAPERONE SYCE;                         "         
  35:  1TKI-A  3.9  3.1   84   321   10   TITIN;                                                     "         
  36:  1K3E-A  3.8  2.7   74   141    5   CEST;                                                      "         
  37:  1TU1-A  3.7  2.9   79   144    6   HYPOTHETICAL PROTEIN PA0094;                               "         
  38:  2JMU-A  3.6  2.9   81   224    5   THIAMINE-TRIPHOSPHATASE;                                   "         
  39:  2CKF-A  3.6  3.8  127   448    7   RING-HYDROXYLATING DIOXYGENASE ALPHA SUBUNIT;              "         
  40:  1W66-A  3.6  3.9  104   218    6   LIPOYLTRANSFERASE;                                         "         
  41:  2F7L-A  3.5  3.9   90   455   11   455AA LONG HYPOTHETICAL PHOSPHO-SUGAR MUTASE;              "         
  42:  2DDZ-A  3.5  4.0   93   188    3   190AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;                           "         
  43:  2CGH-A  3.5  3.5   99   238    8   BIOTIN LIGASE;                                             "         
  44:  2OAU-A  3.3  2.6   70   254    1   SMALL-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL;                "         
  45:  1KOA-A  3.3  4.0   94   447    6   TWITCHIN;                                                  "         
  46:  1I82-A  3.2  3.3   99   189    5   ENDO-1,4-BETA-XYLANASE A;                                  "         
  47:  2ACA-A  3.1  3.5   80   174    6   PUTATIVE ADENYLATE CYCLASE;                                "         
  48:  2FGC-A  3.0  2.7   63   161   11   ACETOLACTATE SYNTHASE, SMALL SUBUNIT;                      "         
  49:  2ARS-A  3.0  3.2   98   245    5   LIPOATE-PROTEIN LIGASE A;                                  "         
  50:  2AHC-A  3.0  3.3   81   164   10   CHORISMATE LYASE;                                          "         
  51:  1S9I-A  2.9  3.5   81   303    9   DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN                 "         
  52:  2I8G-A  2.8  3.5   77   147    5   HYPOTHETICAL PROTEIN DIP2269;                              "         
  53:  1YEM-A  2.8  3.1   73   163    4   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  54:  2JAV-A  2.7  3.5   75   253    3   SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2;                      "         
  55:  1YZ6-A  2.7  3.0   67   261    6   PROBABLE TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 ALPHA             "         
  56:  2PLG-A  2.6  4.2   92   152    8   TLL0839 PROTEIN;                                           "         
  57:  2NWI-A  2.6  3.8   77   160    5   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  58:  1UA2-A  2.6  3.3   70   287   11   CELL DIVISION PROTEIN KINASE 7;                            "         
  59:  1QAX-A  2.6  3.9   99   425    7   PROTEIN (3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARYL-COENZYME A             "         
  60:  2PKH-A  2.5  3.0   65   141    8   HISTIDINE UTILIZATION REPRESSOR;                           "         
  61:  2B5J-A  2.5  3.1   61   552    7   REVERSE TRANSCRIPTASE P66 SUBUNIT;                         "         
  62:  2AHO-B  2.5  4.4   77   259   10   TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 GAMMA SUBUNIT;             "         
  63:  1TLW-A  2.5  3.8   94   251   10   NUCLEOSIDE-SPECIFIC CHANNEL-FORMING PROTEIN TSX;           "         
  64:  1J4W-A  2.5  3.0   60   145   10   FUSE BINDING PROTEIN;                                      "         
  65:  1J26-A  2.5  3.5   71   112    4   IMMATURE COLON CARCINOMA TRANSCRIPT 1;                     "         
  66:  2I4L-A  2.4  4.7   97   439    7   PROLINE-TRNA LIGASE;                                       "         
  67:  2FR2-A  2.4  3.2   78   161   12   HYPOTHETICAL PROTEIN RV2717C;                              "         
  68:  1ULI-A  2.4  3.9  112   424    5   BIPHENYL DIOXYGENASE LARGE SUBUNIT;                        "         
  69:  1F8W-A  2.4  4.2   78   447    8   NADH PEROXIDASE;                                           "         
  70:  1BI7-A  2.4  3.7   66   269    8   CYCLIN-DEPENDENT KINASE 6;                                 "         
  71:  2NS6-A  2.3  3.1   84   183    4   MOBILIZATION PROTEIN A;                                    "         
  72:  1XZP-A  2.3  3.4   75   456    8   PROBABLE TRNA MODIFICATION GTPASE TRME;                    "         
  73:  1XKK-A  2.3  3.4   77   289    9   EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR;                          "         
  74:  1TUA-A  2.3  3.1   58   189    7   HYPOTHETICAL PROTEIN APE0754;                              "         
  75:  1SQB-A  2.3  3.8   91   446    8   UBIQUINOL-CYTOCHROME C REDUCTASE COMPLEX CORE              "         
  76:  1L5A-A  2.2  3.0   73   424   14   AMIDE SYNTHASE;                                            "         
  77:  1EQ6-A  2.2  4.7   85   189    2   MOG1P;                                                     "         
  78:  2QO5-A  2.1  4.4   74   129    4   LIVER-BASIC FATTY ACID BINDING PROTEIN;                    "         
  79:  1IZN-A  2.1  5.2   88   275    3   CAPZ ALPHA-1 SUBUNIT;                                      "         
  80:  1B5S-A  2.1  4.4   92   242    5   DIHYDROLIPOAMIDE ACETYLTRANSFERASE;                        "         
-

No 1: 1JSSA  MOLECULE: CHOLESTEROL-REGULATED START PROTEIN 4;                     

DSSP  LLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEELLEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query ASISTKLQNTLIQYHSIEEDEWRVAKKAKDVTVWRKPSEEFNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ASISTKLQNTLIQYHSIEEDEWRVAKKAKDVTVWRKPSEEFNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHLLLLHHHLEEEEEELLEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLLLEEEEEEEEEEELLEEEEEEEELLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEELL
Query DHIRPGPWRLDWDRLMTSLDVLEHFEENCCVMRYTTAGQLLNIISPREFVDFSYTVGYEE  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct DHIRPGPWRLDWDRLMTSLDVLEHFEENCCVMRYTTAGQLLNIISPREFVDFSYTVGYEE  120
DSSP  HHHLLLLLHHHHLLLEEEEEEEEELLLLEEEEEEEELLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEELL


DSSP  EEEEEEEELLLLLLLLLLEELEELLEEEEEEELLLLLLLEEEEEEELEELLLLLLHHHHH
Query GLLSCGVSVEWSETRPEFVRGYNHPCGWFCVPLKDSPSQSLLTGYIQTDLRGMIPQSAVD  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GLLSCGVSVEWSETRPEFVRGYNHPCGWFCVPLKDSPSQSLLTGYIQTDLRGMIPQSAVD  180
DSSP  EEEEEEEELLLLLLLLLLEELEELLEEEEEEEELLEEEEEEEEEEELEELLLLLLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query TAMASTLANFYSDLRKGLR  199
ident |||||||||||||||||||
Sbjct TAMASTLANFYSDLRKGLR  199
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHLL


No 2: 1EM2A  MOLECULE: MLN64 PROTEIN;                                             

DSSP  .........LLHHHHHHHHHHHHLLLLLlLLEEEEEE.LLEEEEEEELLLLlLEEEEEEE
Query .........ASISTKLQNTLIQYHSIEEdEWRVAKKA.KDVTVWRKPSEEFnGYLYKAQG   50
ident                      |    ||  |   |      ||         |       
Sbjct sfsaqereyIRQGKEATAVVDQILAQEE.NWKFEKNNeYGDTVYTIEVPFH.GKTFILKT   58
DSSP  lllhhhhhhHHHHHHHHHHHHHHHLLHH.HLEEEEELlLLLEEEEEEELLL.EEEEEEEE


DSSP  EELLLHHHHHHHH..LLLLlHHHHLLLEEEEEEEEEEELLEEEEEEEELLLLLLLLLLEE
Query VMDDVVNNVIDHI..RPGPwRLDWDRLMTSLDVLEHFEENCCVMRYTTAGQLLNIISPRE  108
ident         |       |      |    |    |   | |        ||      ||| 
Sbjct FLPCPAELVYQEVilQPER.XVLWNKTVTACQILQRVEDNTLISYDVSAGAAGGVVSPRD  117
DSSP  EELLLHHHHHHHLllLHHH.HLLLLLLEEEEEEEEEELLLEEEEEEEELLLLLLLLLLEE


DSSP  EEEEEEEEEELLEEEEEEEELLLL..LLLLLLEELEELLEEEEEEELLLLLLLEEEEEEE
Query FVDFSYTVGYEEGLLSCGVSVEWS..ETRPEFVRGYNHPCGWFCVPLKDSPSQSLLTGYI  166
ident ||            || |     |        ||| | | |         |         
Sbjct FVNVRRIERRRDRYLSSGIATSHSakPPTHKYVRGENGPGGXIVLKSASNPRVCTFVWIL  177
DSSP  EEEEEEEEELLLEEEEEEEELLLLllLLLLLLEELEELLEEEEEEELLLLLLLEEEEEEE


DSSP  LEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....
Query QTDLRGMIPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR....  199
ident  ||| |  |        | |   |   ||        
Sbjct NTDLKGRLPRYLIHQSLAATXFEFAFHLRQRISelga  214
DSSP  LEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhlll


No 3: 2PSOA  MOLECULE: STAR-RELATED LIPID TRANSFER PROTEIN 13;                    

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEEEEELLEEEEEEELLL.LLLEEEEEEEEELLLHHHH
Query asistklqntliqyhsieeDEWRVAKKAKDVTVWRKPSEE.FNGYLYKAQGVMDDVVNNV   59
ident                      |             |         | ||          |
Sbjct .tylnhliqglqkeakekfKGWVTCSSTDNTDLAFKKVGDgNPLKLWKASVEVEAPPSVV   59
DSSP  .lllllhhhhhhhhhhhhlLLLEEELLLLLLEEEEELLLLlLLLLEEEEEEEELLLHHHH


DSSP  HHHHLLllLHHHHLLLEEEEEEEEEEELLEEEEEEEELLLLLLllLLEEEEEEEEEEEEL
Query IDHIRPgpWRLDWDRLMTSLDVLEHFEENCCVMRYTTAGQLLNiiSPREFVDFSYTVGYE  119
ident          |  ||       | |          |            | ||         
Sbjct LNRVLR..ERHLWDEDFVQWKVVETLDRQTEIYQYVLNSMAPH..PSRDFVVLRTWKTDL  115
DSSP  HHHHHH..LHHHLLLLLLLLEEEEEEELLEEEEEEEELLLLLL..LLEEEEEEEEEELLL


DSSP  ..LEEEEEEEELLL.LLLLlLLEELEELLEEEEEEELllLLLLEEEEEEELEELLlLLLH
Query ..EGLLSCGVSVEW.SETRpEFVRGYNHPCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTDLRgMIPQ  176
ident           |||         ||           |       | ||     ||      
Sbjct pkGMCTLVSLSVEHeEAQLlGGVRAVVMDSQYLIEPC..GSGKSRLTHICRIDLK.GHSP  172
DSSP  hhHLEEEEEEELLLlLLLLlLLEELLEEEEEEEEEEL..LLLLEEEEEEEEELLL.LLLL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..
Query SAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR..  199
ident            |      |      
Sbjct EWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQpl  197
DSSP  LLLLLHHHHHHHHHHHHHHHLLLll


No 4: 1LN1A  MOLECULE: PHOSPHATIDYLCHOLINE TRANSFER PROTEIN;                      

DSSP  llHHHHHHHHHHHHL.LLLLL..LLEEEEEELLEEEEEEELllLLLEEEEEEEEE.LLLH
Query asISTKLQNTLIQYH.SIEED..EWRVAKKAKDVTVWRKPSeeFNGYLYKAQGVM.DDVV   56
ident    |                    |            |        | ||  ||  |   
Sbjct ..FSEEQFWEACAELqQPALAgaDWQLLVETSGISIYRLLDkkTGLYEYKVFGVLeDCSP   58
DSSP  ..LLHHHHHHLLHHHhLLLLLllLLEEEEEELLEEEEEEEEllLLEEEEEEEEEElLLLH


DSSP  HHHHHHHLLLLLHHHHLLLEEEEEEEEEEEllEEEEEEEELLLllLLLLLEEEEEEEEEE
Query NNVIDHIRPGPWRLDWDRLMTSLDVLEHFEenCCVMRYTTAGQllNIISPREFVDFSYTV  116
ident     |       |  ||     |   |       |             | |  |      
Sbjct TLLADIYMDSDYRKQWDQYVKELYEQECNG..ETVVYWEVKYP..FPMSNRDYVYLRQRR  114
DSSP  HHHHHHHHLHHHHHHHLLLEEEEEEEEELL..EEEEEEEELLL..LLLLLEEEEEEEEEE


DSSP  EEL....LEEEEEEEELLL..LLLLLLLEELEELLEEEEEEELLllLLLEEEEEEELEEL
Query GYE....EGLLSCGVSVEW..SETRPEFVRGYNHPCGWFCVPLKdsPSQSLLTGYIQTDL  170
ident                |        |    |                   |    |     
Sbjct DLDmegrKIHVILARSTSMpqLGERSGVIRVKQYKQSLAIESDG..KKGSKVFMYYFDNP  172
DSSP  EELllllLEEEEEEEELLLllLLLLLLLEEELLEEEEEEEEELL..LLLEEEEEEEEELL


DSSP  LLLLLhHHHHHHHH.HHHHHHHHHHHHHLL..
Query RGMIPqSAVDTAMA.STLANFYSDLRKGLR..  199
ident  | || |      |     ||  |        
Sbjct GGQIP.SWLINWAAkNGVPNFLKDMARACQny  203
DSSP  LLLLL.HHHHHHHHhLHHHHHHHHHHHHHHll


No 5: 1T17A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefnGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                                   |         
Sbjct ..........................................MHRHVVTKVLPYTPDQLF   18
DSSP  ..........................................LLEEEEEEEELLLLHHHH


DSSP  HHHL..LLLLhhHHLLLEEEEEEEEEEE...LLEEEEEEEELLLllllLLLEEEEEEEEE
Query DHIR..PGPWrlDWDRLMTSLDVLEHFE...ENCCVMRYTTAGQllniISPREFVDFSYT  115
ident                   |                                  |      
Sbjct ELVGdvDAYP..KFVPWITGMRTWNGRVdgaVSTVDAEAQVGFS....FLREKFATRVRR   72
DSSP  HHHLllLLLL..LLLLLLLLLLEEEEEEellEEEEEEEEELLLL....LLLLEEEEEEEE


DSSP  EEelleEEEEEEELLlllllllleELEELlEEEEEEELlllLLLEEEEEEELEElLLLLL
Query VGyeegLLSCGVSVEwsetrpefvRGYNHpCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQTDlRGMIP  175
ident                                ||   |             |         
Sbjct DK..daRSIDVSLLY.......gpFKRLN.NGWRFMPE...GDATRVEFVIEFA.FKSAL  118
DSSP  EL..llLEEEEEELL.......llLLLEE.EEEEEEEE...LLEEEEEEEEEEL.LLLHH


DSSP  H.HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....
Query Q.SAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.....  199
ident                               
Sbjct LdAMLAANVDRAAGKLIACFEARAQqlhga  148
DSSP  HhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll


No 6: 2NS9A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN APE2225;                              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                              |            | 
Sbjct ....................................agvwgLKVRYEGSFEVSKTPEEVF   24
DSSP  ....................................leeeeEEEEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLLLEEEEEEeeeeeLLEEeEEEEE.LLLLllLLLL.EEEEEEE.EEEE
Query DHIRPGPWRLDWDRLMTSLDVlehfeENCCvMRYTT.AGQLlnIISP.REFVDFS.YTVG  117
ident                  |  |     |                                 
Sbjct EFLTDPKRFSRAFPGFKSVEV.....EDGS.FTIELrLSLG..PLRGdARVRASFeDLEK   76
DSSP  HHHLLHHHHHHHLLLEEEEEE.....ELLE.EEEEEeEELL..LLEEeEEEEEEEeEEEL


DSSP  ellEEEEEEEElllllllllLEELEELLEEEEEEELlllLLLEEEEEEEL.eELLL..LL
Query yeeGLLSCGVSvewsetrpeFVRGYNHPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQ.tDLRG..MI  174
ident                                   |       |                 
Sbjct ...PSKATVKG.....sgrgAGSTLDFTLRFAVEPS...GGGSRVSWVFEgnVGGLaaSM  125
DSSP  ...LLEEEEEE.....eeelLLEEEEEEEEEEEEEE...LLEEEEEEEEEeeEEEHhhHL


DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..
Query PQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR..  199
ident      |           |     |   
Sbjct GGRVLDSLARRMINDVISGVKRELGea  152
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll


No 7: 1Z94A  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefnGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                                   |       | 
Sbjct ..........................................PNTIRLHRVLSAPPERVY   18
DSSP  ..........................................LLLEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLLL...eEEEEEEEeeeLLEEEEEEEELLllllllLLEEEEEEE.EEE
Query DHIRPGPWRLDWDRL...mTSLDVLEhfeENCCVMRYTTAGqllniiSPREFVDFS.YTV  116
ident            |                                       |       |
Sbjct RAFLDPLALAKWLPPegfvCKVLEHD..aRVGGAYKXEFLA..fasgQKHAFGGRYlELV   74
DSSP  HHLLLHHHHHHHLLLlleeEEEEEEL..lLLLLEEEEEEEE..llllLEEEEEEEEeEEE


DSSP  EellEEEEEEEEllllllllllEELEeLLEEEEEEELlllLLLEEEEEEELEELlllllh
Query GyeeGLLSCGVSvewsetrpefVRGYnHPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQTDLrgmipq  176
ident     |                   |          ||        |              
Sbjct P...GERIRYTD.......rfdDAGD.XITTITLAPL...SCGADLSIVQEGIP.....d  115
DSSP  L...LLEEEEEE.......eelLLLL.EEEEEEEEEE...LLEEEEEEEEELLL.....l


DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL..
Query saVDTAMASTLANFYSDLRKGLR..  199
ident                  |       
Sbjct aiPPENCYLGWQQSLKQLAALVEpd  140
DSSP  llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLll


No 8: 1XUVA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN MM0500;                               

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeLLEEEEEEEllllLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkaKDVTVWRKPseefNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                     |               |     | 
Sbjct ............................NPTRITAEP....GKQEIIITREFDAPRELVF   28
DSSP  ............................LLEEEELLL....LLLEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLL...LEEEEEEeeeeeLLEEEEEEEELllllllllLEEEEEEE.EEE
Query DHIRPGPWRLDWDR...LMTSLDVlehfeENCCVMRYTTAgqllniisPREFVDFS.YTV  116
ident            |       | |        |     |              |        
Sbjct KAFTDPDLYTQWIGprgFTTALKI..fepKNGGSWQYIQK...dpegnEYAFHGVNhDVT   83
DSSP  HHHHLHHHHLLLLLlllLEEEEEE..ellLLLLEEEEEEE...lllllEEEEEEEEeEEE


DSSP  EellEEEEEEEElllllllllleeleelLEEEEEEELllLLLLEEEEEEELeellllllh
Query GyeeGLLSCGVSvewsetrpefvrgynhPCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQtdlrgmipq  176
ident                                     |        ||             
Sbjct E...PERIISTF....efeglpekghviLDTARFEAL..PGDRTKLTSHSV.fqtiedrd  133
DSSP  L...LLEEEEEE....eellllllllleEEEEEEEEE..LLLEEEEEEEEE.lllhhhhh


DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......
Query saVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.......  199
ident               |  |   |        
Sbjct gxLQSGXEEGINDSYERLDELLEkxkkleh  163
DSSP  hhHHLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhhl


No 9: 1XFSA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeEELLllllEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrKPSEefngYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                       |                || | 
Sbjct ...................................IDAE....LDLXLKRELAVPVNLVW   21
DSSP  ...................................LLLL....LEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLL....LEEEEEEeeeeeLLEEEEEEEELLLlllLLLLEEEEEEE.EE
Query DHIRPGPWRLDWDR....LMTSLDVlehfeENCCVMRYTTAGQllnIISPREFVDFS.YT  115
ident            |            |                                   
Sbjct RGLTEPELLKKWFVpkpwSISDCRV...dlRPGGEFYTVXQDP...EGNKFPNSGCFlEV   75
DSSP  HHHHLHHHHLLLLLllllEEEEEEE...llLLLLEEEEEEELL...LLLEEEEEEEEeEE


DSSP  EEelleEEEEEEEL......LLLLllllleeleELLEEEEEEELlllLLLEEEEEEELee
Query VGyeegLLSCGVSV......EWSEtrpefvrgyNHPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQtd  169
ident             |                             |     |    |      
Sbjct TD...eKRLIWTSAlvknyrPAVP.........VXTAVIELQPT...SSGTRYTACAX.h  119
DSSP  EL...lLEEEEELLeehhheELLL.........LLEEEEEEEEL...LLLEEEEEEEE.l


DSSP  llllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....
Query lrgmipqsaVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.....  199
ident                         |   |      
Sbjct ntpgqrklhEEXGFHEGWGTTITQLEELLKqekay  154
DSSP  llhhhhhhhHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll


No 10: 1B6FA  MOLECULE: PROTEIN (MAJOR POLLEN ALLERGEN BET V 1-A);                 

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                              |              
Sbjct .........................................GVFNYETETTSVIPAARLF   19
DSSP  .........................................LLEELLEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLL..LLHHHHL.LLEEEEEEEEEeELLE.EEEEEEELLlllllLLLEEEEEEE.EE
Query DHIRPG..PWRLDWD.RLMTSLDVLEHfEENC.CVMRYTTAGqllniISPREFVDFS.YT  115
ident                     |    |                            |     
Sbjct KAFILDgdNLFPKVApQAISSVENIEG.NGGPgTIKKISFPE....gFPFKYVKDRVdEV   74
DSSP  HHHLLLhhHHHHHHLlLLLLLEEEEEL.LLLLlLEEEELLLL....lLLLLLLLLEEeEE


DSSP  EEEllEEEEEEEELLlllllllLEEL....eELLEEEEEEELllLLLLEEEEEEELEE.l
Query VGYeeGLLSCGVSVEwsetrpeFVRG....yNHPCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTD.l  170
ident               |                        |        | |         
Sbjct DHT..NFKYNYSVIE.......GGPIgdtleKISNEIKIVAT..PDGGSILKISNKYHtk  123
DSSP  ELL..LLEEEEEELL.......LLLLlllllEEEEEEEEEEE..LLLEEEEEEEEEEEll


DSSP  lllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.......
Query rgmipQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.......  199
ident            |               |        
Sbjct gdhevKAEQVKASKELGETLLRAVESYLLahsdayn  159
DSSP  lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllllll


No 11: 2B79A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.440;                              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelLLLLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpsEEFNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                                             
Sbjct ......................................MGRGSMKFSFELAVNTKKEDAW   22
DSSP  ......................................LLLLLEEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLLLEEEEEEEEEeeLLEEEEEEEELLlllllllLEEEEEEE.EEEEel
Query DHIRPGPWRLDWDRLMTSLDVLEHfeENCCVMRYTTAGqllniisPREFVDFS.YTVGye  119
ident            |                                   |            
Sbjct TYYSQVNQWFVWEGDLEQISLEGE.fTTGQKGKMKMED.......MPELAFTLvEVRE..   72
DSSP  HHHHLHHHHHHLLLLEEEEEELLL.lLLLLEEEEEELL.......LLLEEEEElLLLL..


DSSP  lEEEEEEEELllllllllleeleELLEEEEEEELllLLLLEEEEEEELEE.llllLLHHH
Query eGLLSCGVSVewsetrpefvrgyNHPCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTD.lrgmIPQSA  178
ident                        |                  |                |
Sbjct .NQCFSDLTA.........tpfgNVLFEHEILEN..PDGTISLRHSVSLTdsdttEEALA  120
DSSP  .LLEEEEEEE.........elleEEEEEEEEEEL..LLLLEEEEEEEEELlllllLLHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query VDTAMASTLANFYSDLRKGLR.  199
ident                |   |  
Sbjct FLKQIFADVPESVGKLKQILEt  142
DSSP  HHHHHHLLHHHHHHHHHHHHLl


No 12: 2FLHA  MOLECULE: CYTOKININ-SPECIFIC BINDING PROTEIN;                        

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                                 |           
Sbjct .........................................MVKEFNTQTELSVRLEALW   19
DSSP  .........................................LLEEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHL..LLLLHHHHLL.LEEEEEEEEEeELLE.EEEEEEELlllllllLLEEEEEEE.EE
Query DHIR..PGPWRLDWDR.LMTSLDVLEHfEENC.CVMRYTTAgqllniiSPREFVDFS.YT  115
ident                          |                      ||          
Sbjct AVLSkdFITVVPKVLPhIVKDVQLIEG.DGGVgTILIFNFL....pevSPSYQREEItEF   74
DSSP  HHHHllLLLHHHHHLLlLEEEEEEEEL.LLLLlLEEEEEEL....lllLLLEEEEEEeEE


DSSP  EEEllEEEEEEEELLlllllllleeleeLLEEEEEEELllLLLLEEEEEEELEEllllll
Query VGYeeGLLSCGVSVEwsetrpefvrgynHPCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTDlrgmip  175
ident               |                              |    |  |      
Sbjct DES..SHEIGLQVIE...ggylsqglsyYKTTFKLSEI..EEDKTLVNVKISYD......  121
DSSP  ELL..LLEEEEEEEE...ehhhhlllleEEEEEEEEEE..ELLEEEEEEEEEEE......


DSSP  hhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query qsaVDTAMASTLANFYSDLRKGLR  199
ident      |            |   | 
Sbjct .hvTPTKTSQSTLMYLRRLERYLS  144
DSSP  .llLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL


No 13: 2NN5A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN EF_2215;                              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeEELLE.EEEEEELllLLLEEEEEEEEELLLHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakKAKDV.TVWRKPSeeFNGYLYKAQGVMDDVVNNV   59
ident                                                             
Sbjct ....................gtenlyFQSNAxKDTFRLE..NQTIYFGTERAISASPQTI   38
DSSP  ....................llhhhhHHHHLlLLEEEEE..LLEEEEEEEEEELLLHHHH


DSSP  HHHHLLLLLHHHHLllEEEEEEEeeeeLLEEEEEEEelllllllllLEEEEEEE.EEEEe
Query IDHIRPGPWRLDWDrlMTSLDVLehfeENCCVMRYTtagqllniisPREFVDFS.YTVGy  118
ident             |                    |              |           
Sbjct WRYLTETDKLKQWF..PELEIGE...lGVNGFWRFI........lpDFEETXPFtDYAE.   84
DSSP  HHHHHLHHHHHHHL..LLEEEEE...lLLLLEEEEE........elLEEEEEEEeEEEL.


DSSP  llEEEEEEEelllllllllleelEELLEEEEEEELllLLLLEEEEEEELEELLllllhhH
Query eeGLLSCGVsvewsetrpefvrgYNHPCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTDLRgmipqsA  178
ident                                       | | ||                
Sbjct ..EKYLGVT.............wDTGIIYFDLKEQ..APHQTLLVFSESLPEN....ftT  123
DSSP  ..LLEEEEE.............eLLEEEEEEEEEE..ELLEEEEEEEEEELLL....llL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........................
Query VDTAMASTLANFYSDLRKGLR...........................  199
ident                |                                
Sbjct PRHKDIAGWSIVLNRLKQVVEtpdaapekidfpqienhylekltnlen  171
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhll


No 14: 2QPVA  MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN ATU1531;                           

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellLLLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseEFNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                                           | 
Sbjct .......................................XPVXQSRIIHLSVEKPWAEVY   21
DSSP  .......................................LLLLLEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HH.HLLLlLHHHHLLLE.EEEEEEEEeelleeEEEEEellllllllLLEEEEEEEE.EEE
Query DH.IRPGpWRLDWDRLM.TSLDVLEHfeenccVMRYTtagqllniiSPREFVDFSY.TVG  117
ident |    ||     |       |                            |          
Sbjct DFaANPG.NXPRWAAGLaGGLEADGE......DWIAK.......ggPLGEVRVNFApHNE   67
DSSP  HHhHLHH.HHHHLLHHHlLLLEEELL......EEEEE.......llLLLEEEEEELlLLL


DSSP  ElleEEEEEEELllllllllLEELEElLEEEEEEELlllLLLEEEEEEELeellllLLHH
Query YeegLLSCGVSVewsetrpeFVRGYNhPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQtdlrgmIPQS  177
ident          |                        |     |                   
Sbjct F...GVIDHVVT.......lPDGLKV.YNALRVTPN...GSGTEVSFTLL...rleGXTD  110
DSSP  L...LLLLEEEE.......lLLLLEE.EEEEEEEEE...LLEEEEEEEEE...lllLLLH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.
Query AVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.  199
ident       ||        |   |  
Sbjct EDFEQDASAITADLEXLKSLLEa  133
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHl


No 15: 1XN5A  MOLECULE: BH1534 UNKNOWN CONSERVED PROTEIN;                          

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                               |           | 
Sbjct .......................................mtRLPDIKKEVRFNAPIEKVW   21
DSSP  .......................................llLLLLEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLllEEEEeeeeeeeLLEEEEEEEELllllllllLEEEEEEE.EEEEel
Query DHIRPGPWRLDWDrlMTSLdvlehfeENCCVMRYTTAgqllniisPREFVDFS.YTVGye  119
ident            |   |          |                                 
Sbjct EAVSTSEGLAFWF..MEND....lkaETGHHFHLQSP........FGPSPCQVtDVER..   65
DSSP  HHLLLHHHHHLLL..LLLL....lllLLLLEEEEELL........LLEEEEEEeEEEL..


DSSP  lEEEEEEEElllllllllleELEElLEEEEEEELlllLLLEEEEEEELEE.......lLL
Query eGLLSCGVSvewsetrpefvRGYNhPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQTD.......lRG  172
ident                                            |                
Sbjct .PIKLSFTW..........dTDGW.SVTFHLKEE...ENGTIFTIVHSGWkqgdtkveKA  110
DSSP  .LLEEEEEE..........lLLLE.EEEEEEEEL...LLLEEEEEEEELLllllllllLL


DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHHHLL
Query MIPQSAVDTAMASTLANFY.SDLRKGLR  199
ident       |   |           ||    
Sbjct GAESAVVHERMDRGWHDLVnERLRQIVE  138
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHHLlLLLHHHHL


No 16: 2FFSA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA1206;                               

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllllEEEEEEEEEL.......
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngYLYKAQGVMD.......   53
ident                                                             
Sbjct ...........................................XQFEHLVQVNdrtlpvl   17
DSSP  ...........................................LLEEEEEELLlllllll


DSSP  ..lLHHHHHHHHLLLllHHHHLLLEEEEEEEEEeELLEEEEEEEELllllllllLEEEEE
Query ..dVVNNVIDHIRPGpwRLDWDRLMTSLDVLEHfEENCCVMRYTTAgqllniisPREFVD  111
ident                               |          |                 |
Sbjct drlQLWEGLVCRARE..PQYFVVGLERFEILVD.DGDRLHRRLYLP........GLVVED   66
DSSP  lhhHHHHHHHHHHHL..HHHLLLLLLEEEEEEE.LLLEEEEEEEEL........LEEEEE


DSSP  EEEEEEElleEEEEEEELlllllllllEELEeLLEEEEEEElLLLLlLEEEEEEELEEll
Query FSYTVGYeegLLSCGVSVewsetrpefVRGYnHPCGWFCVPlKDSPsQSLLTGYIQTDlr  171
ident                                                         |   
Sbjct EVVLKAP...DSAHYSIK......psaEVAG.GSLDXTIEE.PEPG.SLFVRFAYCTR.y  113
DSSP  EEEEELL...LEEEEEEL......lllLLLE.EEEEEEEEE.EELL.EEEEEEEEEEE.l


DSSP  llllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....
Query gmipqsaVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.....  199
ident         |                  |     
Sbjct lqpdelpYDAFVKQAYIAXDVETIATIRdrfga  146
DSSP  lllllllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhll


No 17: 1X53A  MOLECULE: ACTIVATOR OF 90 KDA HEAT SHOCK PROTEIN ATPASE              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllLLLEEEEEEEEELLLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseeFNGYLYKAQGVMDDVVNNVI   60
ident                                                             
Sbjct .................................gssgssgIPTCKITLKETFLTSPEELY   27
DSSP  .................................lllllllLLEEEEEEEEEELLLHHHHH


DSSP  HHHLLLLLHHHHLLlEEEEEEeeeeelLEEEEEEEELlllllllllEEEEEEEEEEEell
Query DHIRPGPWRLDWDRlMTSLDVlehfeeNCCVMRYTTAgqllniispREFVDFSYTVGyee  120
ident                                                    |   |    
Sbjct RVFTTQELVQAFTH.APATLE.....aDRGGKFHMVD........gNVSGEFTDLVP...   70
DSSP  HHLLLHHHHHHHLL.LLLLLL.....lLLLLLLLLLL........lLEELLEEEEEL...


DSSP  EEEEEEEellllllllllEELEElLEEEEEEELlllLLLEEEEEEELEEllllllhhHHH
Query GLLSCGVsvewsetrpefVRGYNhPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQTDlrgmipqsAVD  180
ident                                          |                  
Sbjct EKHIVMK....wrfkswpEGHFA.TITLTFIDK...NGETELCMEGRGI......paPEE  116
DSSP  LLEEEEE....eeellllLLLLE.EEEEELLLL...LLLEEEEEEEEEE......ehHHH


DSSP  HHHHHHHHH.HHHHHHHHLL.........
Query TAMASTLAN.FYSDLRKGLR.........  199
ident                              
Sbjct ERTRQGWQRyYFEGIKQTFGygasgpssg  145
DSSP  HHHHHLLHHhHHHHHHHHLLlllllllll


No 18: 2PCSA  MOLECULE: CONSERVED PROTEIN;                                         

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllleeEEEEEEELL.....L
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngylYKAQGVMDD.....V   55
ident                                                  |          
Sbjct .............................................LNGNGSIELkgtveE   15
DSSP  .............................................LEEEEEEEEellhhH


DSSP  HHHHHHhhllLLLHHHhlllEEEEEEEeEEELLEEEEEEEELLLllllLLLEEEEEEEEE
Query VNNVIDhirpGPWRLDwdrlMTSLDVLeHFEENCCVMRYTTAGQllniISPREFVDFSYT  115
ident |                   |          |                            
Sbjct VWSKLM...dPSILSK..ciMGCKSLE.LIGEDKYKADLQIGIA....AVKGKYDAIIEV   65
DSSP  HHHHHL...lHHHHHH..hlLLEEEEE.EEELLEEEEEEEELLH....HHLEEEEEEEEE


DSSP  EEEL..LEEEEEEEEllllllllllEELEElLEEEEEEELLLL..LLLEEEEEEELEELL
Query VGYE..EGLLSCGVSvewsetrpefVRGYNhPCGWFCVPLKDS..PSQSLLTGYIQTDLR  171
ident                            |                   |   |        
Sbjct TDIKppYHYKLLVNG........egGPGFV.NAEGVIDLTPINdeCTQLTYTYSAEVGGK  116
DSSP  EEEEllLEEEEEEEE........eeLLEEE.EEEEEEEEEELLllEEEEEEEEEEEEELH


DSSP  llllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........
Query gmipqsAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR...........  199
ident                     ||  |              
Sbjct ...vaaIGQRMLGGVAKLLISDFFKKIQkeiakshhhhh  152
DSSP  ...hhhHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlleeel


No 19: 2D4RA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN TTHA0849;                             

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllleeEEEEEEELL......
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngylYKAQGVMDD......   54
ident                                                             
Sbjct .............................................PEVRAERYIpapper   15
DSSP  .............................................LEEEEEEEElllhhh


DSSP  LHHHHHHhhllLLLHHhhllleeeEEEEeEEEL....LEEEEEEEELllllllllLEEEE
Query VVNNVIDhirpGPWRLdwdrlmtsLDVLeHFEE....NCCVMRYTTAgqllniisPREFV  110
ident |     |     |                                               
Sbjct VYRLAKDleglKPYLK......evESLE.VVARegarTRSRWVAVAX........GKKVR   60
DSSP  HHHHHHLhhhhHHHLL......leEEEE.EEEEelleEEEEEEEEEL........LEEEE


DSSP  EEEEEEEE..LLEEEEEEEELllllllllleelEELLEEEEEEELLLL.LLLEEEEEEEL
Query DFSYTVGY..EEGLLSCGVSVewsetrpefvrgYNHPCGWFCVPLKDS.PSQSLLTGYIQ  167
ident                                           | |         ||    
Sbjct WLEEEEWDdeNLRNRFFSPEG............DFDRYEGTWVFLPEGeGTRVVLTLTYE  108
DSSP  EEEEEEEEllLLEEEEEEEEE............LLLEEEEEEEEEELLlLEEEEEEEEEE


DSSP  EElLLLLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL........
Query TDlRGMIPQsAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR........  199
ident                           | |||         
Sbjct LT.IPIFGG.LLRKLVQKLXQENVESLLKGLEervlaass  146
DSSP  LL.LLLLLL.LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhhlll


No 20: 1TW0A  MOLECULE: PATHOGENESIS-RELATED CLASS 10 PROTEIN SPE-16;              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllllEEEEEEEEELL......
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngYLYKAQGVMDD......   54
ident                                                             
Sbjct ...........................................GVFVFRDETSSsvapak   17
DSSP  ...........................................LEEEEEEEEEElllhhh


DSSP  LHHHHHHhhllLLLHHHHlllEEEEEEEEEEEL..LEEEEEEEELLllllllLLEEEEEE
Query VVNNVIDhirpGPWRLDWdrlMTSLDVLEHFEE..NCCVMRYTTAGqllniiSPREFVDF  112
ident                            |                 |          ||  
Sbjct LYKALTK..dsDTIAQKI.dgPIQSIELVEGNGgvGTIKKITANEG......DKTSFVLQ   68
DSSP  HHHHHHH..lhHHHHHHL.llLEEEEEEEELLLllLLEEEEEEEEL......LEEEEEEE


DSSP  EEEEEE..LLEEEEEEEELllllllllleeleeLLEEEEEEELLL..lLLLEEEEEEELE
Query SYTVGY..EEGLLSCGVSVewsetrpefvrgynHPCGWFCVPLKD..sPSQSLLTGYIQT  168
ident           |     |                                | |  |    |
Sbjct KVDAIDeaNLGYDYSIVGG.......tglpeslEKLSFETKVVAGsggGSISKVTLKFHT  121
DSSP  EEEEEEllLLEEEEEEEEL.......lllllleEEEEEEEEEEELlllLEEEEEEEEEEE


DSSP  EllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.........
Query DlrgmipqsaVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.........  199
ident            |      ||                    
Sbjct K....gdaplSDAVRDDALAKGAGFFKAIEGyvlanpaey  157
DSSP  L....lllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlhhhl


No 21: 2IL5A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellLLLLEEEEEEEEELL...LHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseEFNGYLYKAQGVMDD...VVN   57
ident                                                             
Sbjct .......................................NVENEHVEVEIEKLYkfsPEL   21
DSSP  .......................................LLLLEEEEEEEEEEElllHHH


DSSP  HhHHHHllLLLHHHH...llleEEEEEeeeeeLLEEEEEEEelllllllllLEEEEEEEE
Query NvIDHIrpGPWRLDW...drlmTSLDVlehfeENCCVMRYTtagqllniisPREFVDFSY  114
ident               |                 |                          |
Sbjct V.YEAWtkKDLLKQWfxtsartNKEIE.advkEGGKYRIVD.....qqrngKVNVIEGIY   74
DSSP  H.HHHLllHHHHLLLlllllllEEEEE.elllLLLEEEEEE.....elhhhLEEEEEEEE


DSSP  EEEE.lLEEEEEEEElllllllllleeleeLLEEEEEEELLL..LLLLEEEEEEELEE..
Query TVGY.eEGLLSCGVSvewsetrpefvrgynHPCGWFCVPLKD..SPSQSLLTGYIQTD..  169
ident       |                                        | |          
Sbjct ESLVxdEYVKXTIGX............pseTQDVIEVEFFERetGGTQXLFYYRSLVEke  122
DSSP  EEEEllLEEEEEELL............lllLLEEEEEEEEELllLLEEEEEEEEEEELll


DSSP  .llllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.........
Query .lrgmIPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.........  199
ident                                         
Sbjct rrftnLEYKQKKKEYHDAXVHGFELXFDKXYhvietstqq  162
DSSP  llllhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhlllll


No 22: 2DE5A  MOLECULE: TERMINAL OXYGENASE COMPONENT OF CARBAZOLE;                 

DSSP  ..................llhhhhhhhhhhhhLLLLLL......................
Query ..................asistklqntliqyHSIEED......................   20
ident                                     |                       
Sbjct manvdeailkrvkgwapyvdaklgfrnhwypvMFSKEInegepktlkllgenllvnridg   60
DSSP  lllllhhhhhhllllhhhhhllllllleeeeeEEHHHLllllleeeeelleeeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   20
ident                                                             
Sbjct klyclkdrclhrgvqlsvkvecktkstitcwyhawtyrwedgvlcdiltnptsaqigrqk  120
DSSP  eeeeeelllllllllhhhhllllllleeellllleeeellllleeeelllllllllllll


DSSP  ...............lleeeeeelleeeeeeelLLLLLEEEEEEEEELLLHHHHHHHHLL
Query ...............ewrvakkakdvtvwrkpsEEFNGYLYKAQGVMDDVVNNVIDHIRP   65
ident                                                             
Sbjct lktypvqeakgcvfiylgdgdppplardtppnfLDDDMEILGKNQIIKSNWRLAVENGFD  180
DSSP  lleeleeeelleeeeeelllllllhhhhlllllLLLLEEEEEELLEELLLHHHHHHHHHL


DSSP  LLlHHHHLL..........lEEEEE......eeEEEEL.........LEEE.........
Query GPwRLDWDR..........lMTSLD......vlEHFEE.........NCCV.........   91
ident                                                             
Sbjct PS.HIYIHKdsilvkdndlaLPLGFapggdrkqQTRVVdddvvgrkgVYDLigehgvpvf  239
DSSP  HH.HHHHHLllhhhhhllleELLEEellllhhhHEEEElllllllleEEELhhhhleeel


DSSP  .eeeeellllllllLLEEEEEEEEEEEElleEEEEEEELLlllllllleeLEELlEEEEE
Query .mryttagqllniiSPREFVDFSYTVGYeegLLSCGVSVEwsetrpefvrGYNHpCGWFC  150
ident                                                             
Sbjct egtiggevvregayGEKIVANDISIWLP...GVLKVNPFP.........nPDMM.QFEWY  286
DSSP  eeeelleeeeeleeLLLLLLLEEEEELL...LEEEEELLL.........lLLLE.EEEEE


DSSP  EELllLLLLEEEEEEELEE...llllllHHHH.HHHHHHH.HHHHHHHHHHHLL......
Query VPLkdSPSQSLLTGYIQTD...lrgmipQSAV.DTAMAST.LANFYSDLRKGLR......  199
ident ||                                       |  |  |            
Sbjct VPI..DENTHYYFQTLGKPcandeerkkYEQEfESKWKPMaLEGFNNDDIWAREamvdfy  344
DSSP  EEE..ELLEEEEEEEEEEElllhhhhhhHHHHhHHLHHHHlLLLLLHHHHHHHHhlhhhh


DSSP  .............................................
Query .............................................  199
ident                                              
Sbjct addkgwvneilfesdeaivawrklasehnqgiqtqahvsglehhh  389
DSSP  hlllhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhllllll


No 23: 1BIAA  MOLECULE: BIRA BIFUNCTIONAL PROTEIN;                                 

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mkdntvplkliallangefhsgeqlgetlgmsraainkhiqtlrdwgvdvftvpgkgysl   60
DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhllllleeellleeel


DSSP  ................llhhhhhhhhhhHHLLLllllleeeeeeLLEEEEEEELL.....
Query ................asistklqntliQYHSIeedewrvakkaKDVTVWRKPSE.....   39
ident                                             |               
Sbjct pepiqllnakqilgqldggsvavlpvidSTNQY...lldrigelKSGDACIAEYQqagsp  117
DSSP  llllllllhhhhhhlllllleeelllllLHHHH...hhllhhhlLLLLEEEELLLlllll


DSSP  lLLLEEEEEEEEELLLhhHHHHHHlllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelll
Query eFNGYLYKAQGVMDDVvnNVIDHIrpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagq   99
ident                                                             
Sbjct fGANLYLSMFWRLEQP..AAAIGL..........................slvigivmae  149
DSSP  lLLEEEEEEEEEELLL..LLLHHH..........................hhhhhhhhhh


DSSP  lllLLLLEEEEEEEEeeeelleeeeeEEELLLllllllleeLEELlEEEEEEEllllllL
Query llnIISPREFVDFSYtvgyeegllscGVSVEWsetrpefvrGYNHpCGWFCVPlkdspsQ  159
ident                                                             
Sbjct vlrKLGADKVRVKWP...........NDLYLQ.......drKLAG.ILVELTG......A  184
DSSP  hhhHLLLLLLEEELL...........LEEEEL.......leEEEE.EEEEEEL......L


DSSP  EEEEEEELEE.........llLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL............
Query SLLTGYIQTD.........lrGMIPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGL............  198
ident                                     |                       
Sbjct AQIVIGAGINmamwitlqeagINLDRNTLAAMLIRELRAALELFEQEGlapylsrwekld  244
DSSP  EEEEEEEEEElllllllllllLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlhhhhhhhhhhl


DSSP  ...............................................l
Query ...............................................r  199
ident                                                 
Sbjct nfinrpvkliigdkeifgisrgidkqgallleqdgiikpwmggeislr  292
DSSP  llllleeeeeelleeeeeeeeeellllleeeeelleeeeellleeeel


No 24: 2DEQA  MOLECULE: 235AA LONG HYPOTHETICAL BIOTIN--[ACETYL-COA-               

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllLEEE.............eeelLEEEEEEEL.........
Query asistklqntliqyhsieedeWRVA.............kkakDVTVWRKPS.........   38
ident                                             ||              
Sbjct ..........mlglktsiigrRVIYfqeitstnefaktsyleEGTVIVADKqtmghgrln   50
DSSP  ..........lllllllllllEEEEelllllhhhhhhhllllLLLEEEELLllllllhhh


DSSP  ...LLLL.LEEEEEEEEELLLHHHHhHHHLllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeee
Query ...EEFN.GYLYKAQGVMDDVVNNViDHIRpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmry   94
ident    |    |                   |                               
Sbjct rkwESPEgGLWLSIVLSPKVPQKDL.PKIV....................flgavgvvet   89
DSSP  lllLLLLlLEEEEEEELLLLLHHHH.HHHH....................hhhhhhhhhh


DSSP  EELLlllllllLEEEEEEEEeeeelleeeeEEEELLLllllllleeleELLEEEEEEEll
Query TTAGqllniisPREFVDFSYtvgyeegllsCGVSVEWsetrpefvrgyNHPCGWFCVPlk  154
ident                                 | |                         
Sbjct LKEF.......SIDGRIKWP..........NDVLVNY.........kgIAGVLVEGKG..  121
DSSP  HHHL.......LLLLEEELL..........LEEEELL.........eeEEEEEEEEEL..


DSSP  lllllEEEEEEELEELL...............LLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.
Query dspsqSLLTGYIQTDLR...............GMIPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGL.  198
ident            |                       |   |       |   |    |   
Sbjct .....DKIVLGIGLNVNnkvpngatsmklelgSEVPLLSVFRSLITNLDRLYLNFLKNPm  176
DSSP  .....LEEEEEEEELLLlllllllllhhhhhlLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLl


DSSP  ..........................................................l
Query ..........................................................r  199
ident                                                            
Sbjct dilnlvrdnmilgvrvkilgdgsfegiaediddfgrliirldsgevkkviygdvslrfl  235
DSSP  hhhhhhhhhllllleeeeellleeeeeeeeellllleeeellllleeeellllleeeel


No 25: 1XKPB  MOLECULE: PUTATIVE MEMBRANE-BOUND YOP TARGETING PROTEIN              

DSSP  ...llhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEeEEEL.LEEEEEEELLllLLEEEEEEEEELL.L
Query ...asistklqntliqyhsieeDEWRVaKKAK.DVTVWRKPSEefNGYLYKAQGVMDD.V   55
ident                                    |                        
Sbjct swiepiishfcqdlgvptssplSPLIQ.LEMAqSGTLQLEQHG..ATLTLWLARSLAWhR   57
DSSP  lllhhhhhhhhhhlllllllllLLEEE.EEELlLEEEEEEEEL..LEEEEEEEEELLHhH


DSSP  HHHHHHHHLLlllhhhhlllEEEEeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeee
Query VNNVIDHIRPgpwrldwdrlMTSLdvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfsyt  115
ident                                                             
Sbjct CEDAMVXALT........ltAAQX....................................   73
DSSP  HHHHHHHHHH........hlLHHH....................................


DSSP  eeelleeeeeeeelllllllllleeleelleEEEEEELllllllEEEEEEELEELLllll
Query vgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcGWFCVPLkdspsqSLLTGYIQTDLRgmip  175
ident                                             | |      | |    
Sbjct .........................sgalplRAGWLGE......SQLVLFVSLDER..sl  100
DSSP  .........................llllllEEEEELL......LEEEEEEEEEHH..hl


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhll
Query QSAVDTAMASTLANFYSDLRKglr  199
ident            |            
Sbjct TLPLLHQAFEQLLRLQQEVLA...  121
DSSP  LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...


No 26: 1PZDA  MOLECULE: COATOMER GAMMA SUBUNIT;                                    

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kvaatrqeifqeqlaavpefqglgplfksspepvalteseteyvirctkhtftdhmvfqf   60
DSSP  lllllhhhhhhhhhhllhhhllllllleelllleellllllleeeeeeeeellleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dctntlndqtlenvtvqmepseayevlcyvparslpynqpgtcytlvalpkedptavact  120
DSSP  eeeelllleeeeeeeeeeeelllleeeeeeleeeellllleeeeeeeellllllllllee


DSSP  ..........................................llHHHHHhhhhhhhllll
Query ..........................................asISTKLqntliqyhsie   18
ident                                                             
Sbjct fscvmkftvkdcdpttgeaddegyedeyvledlevtiadhiqkvMKLNF...........  169
DSSP  eeeeeeeeeeelllllllllllleeeeeellleeelhhhheeelLLLLH...........


DSSP  lllleeeeeelleeeeeeeLLLLlLEEEEEEEEEL..LLHHHHHHHHLLlllhhhhllle
Query edewrvakkakdvtvwrkpSEEFnGYLYKAQGVMD..DVVNNVIDHIRPgpwrldwdrlm   76
ident                     |                         |             
Sbjct ...............eaawDEVGdEFQKEETFTLStiKTLEEAVGNIVK...........  203
DSSP  ...............hhhhHHHLlLLLEEEEEEELllLLHHHHHHHHHH...........


DSSP  eeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeEEEE..EEEE...LLEEEEEEEElll
Query tsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvDFSY..TVGY...EEGLLSCGVSvew  131
ident                                                             
Sbjct ...............................flgMHPCerSDKVpdnKNTHTLLLAG...  229
DSSP  ...............................hhlLEELllLLLLlllLLEEEEEEEE...


DSSP  lllllllEELEElLEEEEEEELllllLLEEEEEEELEELlllllhhhhhhhHHHHHHHHH
Query setrpefVRGYNhPCGWFCVPLkdspSQSLLTGYIQTDLrgmipqsavdtaMASTLANFY  191
ident                      |                                 ||   
Sbjct ....vfrGGHDI.LVRSRLLLL....DTVTMQVTARSSE.........elpVDIVLASVG  271
DSSP  ....eelLLLEE.EEEEEEEEL....LLEEEEEEEEELL.........hhhHHHHHHHLL


DSSP  hhhhhhll
Query sdlrkglr  199
ident         
Sbjct ........  271
DSSP  ........


No 27: 1TTWA  MOLECULE: SECRETION CHAPERONE;                                       

DSSP  ...llhhhhhhhhhhhhllllllLLEEeEEEL.LEEEEEEELLLLlLEEEEEEEEELLLh
Query ...asistklqntliqyhsieedEWRVaKKAK.DVTVWRKPSEEFnGYLYKAQGVMDDVv   56
ident                                     |   |  |                
Sbjct tysslleefatelgleeietnelGHGA.VTIDkIWVVHLAPINEK.ELVAFMRAGILTG.   57
DSSP  lhhhhhhhhllllllllllllllLLEE.EEELlLEEEEEEELLLL.EEEEEEEEEELLL.


DSSP  HHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeEEEEElllllllllleeeeeeeeee
Query NNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvMRYTTagqllniisprefvdfsytv  116
ident       |                                                     
Sbjct QSQLYDILR........................knLFSPL....................   73
DSSP  LLHHHHHHH........................llLLLLL....................


DSSP  eelleeeeeeeelllllllllleeleelleEEEEEELllllllEEEEEEELEEllllllH
Query gyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcGWFCVPLkdspsqSLLTGYIQTDlrgmipQ  176
ident                                                   |         
Sbjct ..........................sgviRCALDKD......DHWLLWSQLN..indtS   99
DSSP  ..........................llllEEEELLL......LEEEEEEEEE..llllL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhll
Query SAVDTAMASTLANFYSDLRkglr  199
ident           |      |     
Sbjct GTQLASVLTSLVDKAVTLS....  118
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHL....


No 28: 2FM8A  MOLECULE: SURFACE PRESENTATION OF ANTIGENS PROTEIN SPAK;             

DSSP  ..........llhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEeEEEL.LEEEEEEELLllLLEEEEEE
Query ..........asistklqntliqyhsieeDEWRVaKKAK.DVTVWRKPSEefNGYLYKAQ   49
ident                                  |                        ||
Sbjct mqhldiaelvrsalevsgcdpsliggidsHSTIV.LDLFaLPSICISVKD..DDVWIWAQ   57
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhlllhhhllllllLLEEE.EEELlLLLEEEEEEL..LEEEEEEE


DSSP  EE..ELLLHHHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllle
Query GV..MDDVVNNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispr  107
ident        |       |                                            
Sbjct LGadSMVVLQQRAYEILM..........................................   75
DSSP  LLllHHHHHHHHHHHHHH..........................................


DSSP  eeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleelEELLEEEEEeelllllllEEEEEEEL
Query efvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgYNHPCGWFCvplkdspsqSLLTGYIQ  167
ident                                                       ||    
Sbjct .........................timegchfaRGGQLLLGE.......qnGELTLKAL  103
DSSP  .........................hhhllllllHHHLLEEEE.......elLEEEEEEE


DSSP  EELLlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL
Query TDLRgmiPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR  199
ident                      |        | 
Sbjct VHPD.flSDGEKFSTALNGFYNYLEVFSRSLM  134
DSSP  LLHH.hlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL


No 29: 1EG9A  MOLECULE: PROTEIN (NAPHTHALENE 1,2-DIOXYGENASE ALPHA                 

DSSP  ..............................llhhhhhhhhHHHHllLLLL..........
Query ..............................asistklqntLIQYhsIEED..........   20
ident                                                             
Sbjct mnynnkilvsesglsqkhlihgdeelfqhelktifarnwlFLTHdsLIPApgdyvtakmg   60
DSSP  llllllllllhhhleeehhhhllhhhhhhhhhhlllllleEEEEhhHLLLlleeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   20
ident                                                             
Sbjct idevivsrqndgsiraflnvcrhrgktlvsveagnakgfvcsyhgwgfgsngelqsvpfe  120
DSSP  leeeeeeellllleeeeelllllllllllllleeelleeelllllleeelllleeelllh


DSSP  .....................................lleeeeeelleeeeeeellLLLL
Query .....................................ewrvakkakdvtvwrkpseEFNG   43
ident                                                             
Sbjct kdlygeslnkkclglkevarvesfhgfiygcfdqeapplmdylgdaawylepmfkhSGGL  180
DSSP  hhhllllllhhhllllllleeeeelleeeeelllllllhhhhhllhhhhhhhhhllLLLE


DSSP  EEE..EEEEEELLLHHHHHHHHL.LLLLHHHH.......llLEEE..........eeeEE
Query YLY..KAQGVMDDVVNNVIDHIR.PGPWRLDW.......drLMTS..........ldvLE   83
ident  |       |                                  |               
Sbjct ELVgpPGKVVIKANWKAPAENFVgDAYHVGWThasslrsgeSIFSslagnaalppegaGL  240
DSSP  EEEeeEEEEEELLLLHHHHHHHHhLLLLHHHHlhhhhhhhlLLLHhhhhhllllllllEE


DSSP  EEEL....LEEEEE.....eeELLLllLLLL...................leeEEEEEEE
Query HFEE....NCCVMR.....ytTAGQllNIIS...................preFVDFSYT  115
ident            |          |                                    |
Sbjct QMTSkygsGMGVLWdgysgvhSADL.vPELMafggakqerlnkeigdvrariyRSHLNCT  299
DSSP  EEELllllEEEEELlllllllLLLL.hHHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhLLEEEEE


DSSP  EEElleEEEEEEElllllllllleeleellEEEEEEELllLLLLEEEEEEELEELLlllL
Query VGYeegLLSCGVSvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTDLRgmiP  175
ident |       |                           |            |         |
Sbjct VFP...NNSMLTC...............sgVFKVWNPI..DANTTEVWTYAIVEKD..mP  337
DSSP  ELL...LEEEELL...............llEEEEEEEE..ELLEEEEEEEEEEELL..lL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHH...HHHHHHHLL.................................
Query QSAVDTAMASTLANF...YSDLRKGLR.................................  199
ident          |    |                                             
Sbjct EDLKRRLADSVQRTFgpaGFWESDDNDnmetasqngkkyqsrdsdllsnlgfgedvygda  397
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHlllLHHHHHHHHhhhhhhhhllllllllleeelllllllleelll


DSSP  ..................................................
Query ..................................................  199
ident                                                   
Sbjct vypgvvgksaigetsyrgfyrayqahvsssnwaefehasstwhteltktt  447
DSSP  lllleeellllllhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlllhhhhhhlll


No 30: 1RY9A  MOLECULE: SURFACE PRESENTATION OF ANTIGENS PROTEIN SPAK;             

DSSP  ..........llhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEeEEEL.LEEEEEEELLllLLEEEEEE
Query ..........asistklqntliqyhsieeDEWRVaKKAK.DVTVWRKPSEefNGYLYKAQ   49
ident                                                           | 
Sbjct msninlvqlvrdslftigcppsiitdldsHSAIT.ISLDsMPAINIALVN..EQVMLWAN   57
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhlllhhheeelllLLLEE.EEELlEEEEEEEEEL..LEEEEEEE


DSSP  EEELL..LHHHhHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllle
Query GVMDD..VVNNvIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispr  107
ident                |                                            
Sbjct FDAPSdvKLQSsAYNILN..........................................   75
DSSP  EELLLhhHHHHhHHHHHH..........................................


DSSP  eeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeLEELL..EEEEEEElllllllEEEEEE
Query efvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrGYNHP..CGWFCVPlkdspsqSLLTGY  165
ident                                   |                     |   
Sbjct ...........................lmlmnfSYSINelVELHRSD.......EYLQLR  101
DSSP  ...........................hhllllLLLLLllLEEEELL.......LEEEEE


DSSP  ELEELLlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLl
Query IQTDLRgmiPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLr  199
ident              |              |   | 
Sbjct VVIKDD.yvHDGIVFAEILHEFYQRMEILNGVL.  133
DSSP  EEELHH.hlLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL.


No 31: 1V2BA  MOLECULE: 23-KDA POLYPEPTIDE OF PHOTOSYSTEM II OXYGEN-               

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEEEEE...lLEEEEEEElllllLEEEEEEEEELL...
Query asistklqntliqyhsieeDEWRVAKKA...kDVTVWRKPseefnGYLYKAQGVMDD...   54
ident                      |   |       |                          
Sbjct ...tdfqtyngdgfklqipSKWNPNKEVeypgQVLRFEDN...fdATSNVIVAITPTdkk   54
DSSP  ...lleeeeellleeeeeeLLLEELLLLllllEEEEEEEL...leEEEEEEEEEEELlll


DSSP  LHHH..hHHHHLLLllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeellllllllllEEEEEE
Query VVNN..vIDHIRPGpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispREFVDF  112
ident                                                             
Sbjct SITDfgsPEQFLSQ...................................vdyllAVAIAN   79
DSSP  LHHHhllHHHHHHH...................................lhhhlLLLEEE


DSSP  E.EEEEEL....LEEEEEEEELllllllllleELEElLEEEEEEELlllLLLEEEEEEEL
Query S.YTVGYE....EGLLSCGVSVewsetrpefvRGYNhPCGWFCVPLkdsPSQSLLTGYIQ  167
ident    |   |                         |                          
Sbjct VlETSTAEvggkQYYYLSILTR..........TGGK.HQLVTATVN...DGKLYICKAQA  125
DSSP  EeEEEEEEelleEEEEEEEEEE..........LLLE.EEEEEEEEE...LLEEEEEEEEE


DSSP  EELlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query TDLrgmipqsavdtamastlanfysdlrkglr  199
ident  |                              
Sbjct GDK.........rwfkgakkfventatsfsla  148
DSSP  EHH.........hllllllhhhhhhhhlleel


No 32: 1JYOA  MOLECULE: SICP;                                                      

DSSP  ....llhhhhhhhhhhhhlllLLLLLEEeEEEL.LEEEEEEELLllLLEEEEEEEE....
Query ....asistklqntliqyhsiEEDEWRVaKKAK.DVTVWRKPSEefNGYLYKAQGV....   51
ident                                   |              |          
Sbjct lqahqdiianigeklglpltfDDNNQCL.LLLDsDIFTSIEAKD..DIWLLNGMIIplsp   57
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhllllllLLLLEEE.EEELlLEEEEEEEEL..LEEEEEEEEEelll


DSSP  ..ellLHHHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleee
Query ..mddVVNNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispref  109
ident                                                             
Sbjct vcgdsIWRQIMVINGE............................................   73
DSSP  lllhhHHHHHHHHHHH............................................


DSSP  eeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEELLllllleEEEEEELEE
Query vdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPLKdspsqsLLTGYIQTD  169
ident                                                     |       
Sbjct ..............................laanneGTLAYIDAA.....eTLLLIHAIT   98
DSSP  ..............................hhhlllLEEEEEHHH.....lEEEEEEEEL


DSSP  LllllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....
Query LrgmiPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.....  199
ident                    |    |   |      
Sbjct D...lTNTYHIISQLESFVNQQEALKNILQeyakv  130
DSSP  L...lLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhlll


No 33: 1K8KD  MOLECULE: ACTIN-LIKE PROTEIN 3;                                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct millevnnriieetlalkfenaaagnkpeavevtfadfdgvlyhisnpngdktkvmvsis   60
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeellleeeeeelhhhllleeeeeee


DSSP  ..........................................................ll
Query ..........................................................as    2
ident                                                             
Sbjct lkfykelqahgadellkrvygsylvnpesgynvsllydlenlpaskdsivhqagmlkrnc  120
DSSP  lllhhhhhlllhhhhhhhhhhhheellllllleeeeeelllllllhhhhhhhhhlhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllLLLEEeEEEL...LEEEEEEELllllLEEEEEEEEEL...llH
Query istklqntliqyhsieeDEWRVaKKAK...DVTVWRKPSeefnGYLYKAQGVMD...dvV   56
ident                   | |                                      |
Sbjct fasvfekyfqfqeegkeGENRA.VIHYrddETMYVESKK....DRVTVVFSTVFkddddV  175
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllLLLLE.EEEEellEEEEEEELL....LLEEEEEEEELllhhhH


DSSP  HHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeEEEEelllllllllleeeeeeeeee
Query NNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvMRYTtagqllniisprefvdfsytv  116
ident                                                             
Sbjct VIGKVFMQE.....................fkegrRASH.....................  193
DSSP  HHHHHHHHH.....................hhlhhHLLL.....................


DSSP  eelleeeeeeeelllllllllleeleelLEEEEEEEL.........llLLLLEEEEEEEL
Query gyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhPCGWFCVPL.........kdSPSQSLLTGYIQ  167
ident                             |   |                           
Sbjct ..........................taPQVLFSHREpplelkdtdaaVGDNIGYITFVL  227
DSSP  ..........................llLEEEEEELLllhhhllllllLLLLEEEEEEEE


DSSP  EELlllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........................
Query TDLrgmipQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR...........................  199
ident                       |   |                                
Sbjct FPR...htNASARDNTINLIHTFRDYLHYHIKcskayihtrmraktsdflkvlnrarpd  283
DSSP  LHH...hhLLLLHHHHHHHHLLHHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllll


No 34: 1K6ZA  MOLECULE: TYPE III SECRETION CHAPERONE SYCE;                         

DSSP  ..llhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEeEEELLEEEEEEELLLLlLEEEEEEEEEL..LLH
Query ..asistklqntliqyhsieeDEWRVaKKAKDVTVWRKPSEEFnGYLYKAQGVMD..DVV   56
ident                             |                 |       |  |  
Sbjct sfeqaitqlfqqlslsipdtiEPVIG.VKVGEFACHITEHPVG.QILXFTLPSLDnnDEK   58
DSSP  lhhhhhhhhhhhhllllllllLLEEE.EEELLEEEEEEELLLL.EEEEEELLLLLllLLH


DSSP  HHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeeee
Query NNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfsytv  116
ident      |                                                      
Sbjct ETLLSHNIF...................................................   67
DSSP  HHHHHLLLL...................................................


DSSP  eelleeeeeeeelllllllllleeleelleEEEEEellllllleEEEEEELEELLLlllH
Query gyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcGWFCVplkdspsqsLLTGYIQTDLRGmipQ  176
ident                                                      |      
Sbjct .......................sqdilkpILSWD.....evggHPVLWNRQPLNS..lD   97
DSSP  .......................lllllllEEEEE.....llllEEEEEEEEEHHH..lL


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH..hhll
Query SAVDTAMASTLANFYSDLR..kglr  199
ident           |      |       
Sbjct NNSLYTQLEXLVQGAERLQrsfshh  122
DSSP  LLHHHHHHHHHHHHHHHLLlleeel


No 35: 1TKIA  MOLECULE: TITIN;                                                     

DSSP  llhhhhhhhhHHHHlllllllLEEEEEELLEEEEEEellllllEEEEEEEEELLL.HHHH
Query asistklqntLIQYhsieedeWRVAKKAKDVTVWRKpseefngYLYKAQGVMDDV.VNNV   59
ident              |                  | |                        |
Sbjct .......kelYEKY.....miAEDLGRGEFGIVHRCvetsskkTYMAKFVKVKGTdQVLV   48
DSSP  .......lllLLLE.....eeEEEEEELLLEEEEEEeelllleEEEEEEELLLLHhHHHH


DSSP  HHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleEEEEEEElllllllllleeeeeeeeeeeel
Query IDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeencCVMRYTTagqllniisprefvdfsytvgye  119
ident    |                                                        
Sbjct KKEISI......................lnIARHRNI.......................   63
DSSP  HHHHHH......................hhHLLLLLL.......................


DSSP  leeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEElllllllEEEEEEELEE..........
Query egllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPlkdspsqSLLTGYIQTD..........  169
ident                              |            |                 
Sbjct .......................lhlHESFESM.......EELVMIFEFIsgldiferin   93
DSSP  .......................lleEEEEEEL.......LEEEEEELLLllllhhhhhl


DSSP  ..........................................LLLLL.............
Query ..........................................LRGMI.............  174
ident                                                             
Sbjct tsafelnereivsyvhqvcealqflhshnighfdirpeniiyQTRRSstikiiefgqarq  153
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllhhheeeLLLLLlleeellllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  174
ident                                                             
Sbjct lkpgdnfrllftapeyyapevhqhdvvstatdmwslgtlvyvllsginpflaetnqqiie  213
DSSP  llllleeeeeellhhhllhhhhllleelhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  174
ident                                                             
Sbjct nimnaeytfdeeafkeisieamdfvdrllvkerksrmtasealqhpwlkqkiervstkvi  273
DSSP  hhhhllllllhhhhllllhhhhhhhhllllllhhhlllhhhhhhlhhhhllhhhllllll


DSSP  ..............lhhhhHHHHHHhHHHHhhHHHH............hll
Query ..............pqsavDTAMAStLANFysDLRK............glr  199
ident                        |                           
Sbjct rtlkhrryyhtlikkdlnmVVSAAR.ISCG..GAIRsqkgvsvakvkvasi  321
DSSP  llhhhhhhhhhhhllllllLLHHHH.HHHL..LLLLllllleeeeeeelll


No 36: 1K3EA  MOLECULE: CEST;                                                      

DSSP  ......llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeLLEEEEEEELLlLLLEEEEEEEE...
Query ......asistklqntliqyhsieedewrvakkaKDVTVWRKPSEeFNGYLYKAQGV...   51
ident                                                             
Sbjct mssrselllekfaekigigsisfnenrlcsfaidEIYYISLSDAN.DEYMMIYGVCGkfp   59
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhllllllllllllleeeelLLLEEEEELLL.LLEEEEEEEEEell


DSSP  ..ellLHHHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleee
Query ..mddVVNNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispref  109
ident                                                             
Sbjct tdnsnFALEILNANLW............................................   75
DSSP  lllhhHHHHHHHHHHH............................................


DSSP  eeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeleelleEEEEeellllllleEEEEEELEE
Query vdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcGWFCvplkdspsqsLLTGYIQTD  169
ident                                                     |       
Sbjct ..............................faenggpYLCY.....eagaqSLLLALRFP  100
DSSP  ..............................hhhllllEEEE.....ellllEEEEEEEEE


DSSP  LLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.............
Query LRgmIPQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.............  199
ident |                       |   |              
Sbjct LD..DATPEKLENEIEVVVKSMENLYLVLHnqgitlkieeiss  141
DSSP  LL..LLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHllllllleeeell


No 37: 1TU1A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA0094;                               

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeLLEEEEEEELL..lLLLEEEEEEEEELL...l
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkaKDVTVWRKPSE..eFNGYLYKAQGVMDD...v   55
ident                                    |                        
Sbjct ........ghmtlyrlheadleipdawqDQSINIFKLPAsgpAREASFVISRDASQgdap   52
DSSP  ........lleeeeellleeeeeellleELLLEEEEELLlllLLLEEEEEEEELLLllll


DSSP  hhHHHHHHLLLllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeEEEEE.E
Query vnNVIDHIRPGpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispreFVDFS.Y  114
ident                                                             
Sbjct faDYVARQLEN.....................................aekqlPGFKLhK   75
DSSP  hhHHHHHHHHH.....................................hhhhlLLLEEeE


DSSP  EEEEL....LEEEEEEEEllllllllllEELEElLEEEEEEELLllllLEEEEEEELEel
Query TVGYE....EGLLSCGVSvewsetrpefVRGYNhPCGWFCVPLKdspsQSLLTGYIQTdl  170
ident             |                                     | |    |  
Sbjct RWDINihghAAVLLDYQW........qrEGRDL.MLRQVFIERR...pAVLITTLTTT..  121
DSSP  EEEEEelleEEEEEEEEE........eeLLEEE.EEEEEEELLL...lLEEEEEEEEL..


DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query rgmipqsavdtamastlanfysdlrkglr  199
ident                              
Sbjct ......padlphhepawkqamqtlvprpt  144
DSSP  ......hhhhhhhhhhhhhhhhlleelll


No 38: 2JMUA  MOLECULE: THIAMINE-TRIPHOSPHATASE;                                   

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllLLLEEEEEEEEELLlhhHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseeFNGYLYKAQGVMDDvvnNVI   60
ident                                                             
Sbjct ......................................saQGLIEVERKFAPGP...DTE   19
DSSP  ......................................llLLLEEEEEEEEELL...LHH


DSSP  HHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeEEEEEEL.
Query DHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfSYTVGYE.  119
ident                                                             
Sbjct ERLQE............................................lgaTLEHRVTf   35
DSSP  HHHHH............................................hllEEEEEEEe


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct rdtyydtselslmlsdhwlrqregsgwelkcpgvtgvsgphneyvevtseaaivaqlfel   95
DSSP  eeeeeellllhhhhllleeeeellleeeeeellllllllllllleeellhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................lEEEEEeeelllllllllLEELEElLEEEEEE
Query ............................eGLLSCgvsvewsetrpeFVRGYNhPCGWFCV  151
ident                                                             
Sbjct lgsgeqkpagvaavlgslklqevasfittRSSWK.......lalsgAHGQEP.QLTIDLD  147
DSSP  hlllllllllhhhhhhhhlleeeeeeeeeEEEEE.......eelllLLLLLL.EEEEEEE


DSSP  ELLLLllLEEEEEEELeellllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH................
Query PLKDSpsQSLLTGYIQtdlrgmipQSAVDTAMASTLANFYSDLR................  195
ident                           |   |         | |                 
Sbjct SADFG..YAVGEVEAM......vhEKAEVPAALEKIITVSSMLGvpaqeeapaklmvylq  199
DSSP  EELLL..EEEEEEEEE......elLHHHHHHHHHHHHHHHHHHEeelllllllhhhhhhh


DSSP  .....................hhll
Query .....................kglr  199
ident                          
Sbjct rfrpldyqrlleaassgeatgdsas  224
DSSP  hhlhhhhhhhhhhllllllllllll


No 39: 2CKFA  MOLECULE: RING-HYDROXYLATING DIOXYGENASE ALPHA SUBUNIT;              

DSSP  .............................llhhhhhhhhHHHH........lLLLL....
Query .............................asistklqntLIQY........hSIEE....   19
ident                                                      |      
Sbjct msgdttlvdtvnasqsrqvfwdrdvydleierifsrawlMLGHksllpkpgdFITTymae   60
DSSP  llllllleelllleeehhhhllhhhhhhhhhhlllllleEEEEhhhllllleEEEEeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   19
ident                                                             
Sbjct dkiilshqsdgtfrafinscthrgnqichadsgnakafvcnyhgwvygqdgslvdvples  120
DSSP  eeeeeeellllleeeeelllllllllllllleeelleeelllllleeelllleeelllhh


DSSP  ...................................llleeeeeelleeeeeeelllLLLE
Query ...................................dewrvakkakdvtvwrkpseeFNGY   44
ident                                                             
Sbjct rcyhnkldkqelaaksvrvetykgfifgchdpeapsledylgefrfyldtiwegggAGLE  180
DSSP  hhhlllllhhhlllleeeeeeelleeeeelllllllhhhhhllhhhhhhhhhllllLLEE


DSSP  EE..EEEEEELLLHHHHHHHHL.LLLLHHHH.................llleeEEEEeEE
Query LY..KAQGVMDDVVNNVIDHIR.PGPWRLDW.................drlmtSLDVlEH   84
ident |                       |                                   
Sbjct LLgpPMKSLLHCNWKVPVENFVgDGYHVGWThaaalgqiggplaglagnraddLGLQ.FT  239
DSSP  EEeeEEEEEELLLLHHHHHHHHhLLLLHHHHlhhhhhhhllhhhhhlllllllLEEE.EE


DSSP  EELLEEEEEE..EELL..LLLLLLL.....................lEEEEeeEEEEEel
Query FEENCCVMRY..TTAG..QLLNIIS.....................pREFVdfSYTVGye  119
ident               |                                             
Sbjct TRHGHGFGVIdnAAAAihRKGDGWNkyledtrgevrrkfgadrerlyVGHW.nGAIFP..  296
DSSP  LLLLLEEEEEllLLLLllLLLHHHHhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhLLEE.eEEELL..


DSSP  leEEEEeeelllllllllleeleelleEEEEEELllLLLLEEEEEEELEEllllLLHHHH
Query egLLSCgvsvewsetrpefvrgynhpcGWFCVPLkdSPSQSLLTGYIQTDlrgmIPQSAV  179
ident     |                           |    |       |              
Sbjct ..NCSF...............lygtntFKIWHPR..GPHEIEVWTYTMVP..sdADPATK  335
DSSP  ..LEEE...............eellleEEEEEEL..LLLLEEEEEEEEEE..llLLHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHH...HHHHHHHLL.....................................
Query DTAMASTLANF...YSDLRKGLR.....................................  199
ident           |                                                 
Sbjct SAIQREATRTFgtaGTLESDDGEnmssatyvnrgvitrdgmmnstmgvgyegphpvypgi  395
DSSP  HHHHHHHHHHHlllLLLHHHHHHhhhhhhhhhhlhhhhlleeellllllleellllllle


DSSP  .....................................................
Query .....................................................  199
ident                                                      
Sbjct vgisfigetsyrgfyrfwkemidapdwasvkanddnwdsvftnrnfwneklna  448
DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhllllllllllllllhhhhhlll


No 40: 1W66A  MOLECULE: LIPOYLTRANSFERASE;                                         

DSSP  .............llhhhhhhhhhhHHLLLllllleeeeeelLEEEEEEELL........
Query .............asistklqntliQYHSIeedewrvakkakDVTVWRKPSE........   39
ident                                             |               
Sbjct gamagsirsklsaidvrqlgtvdyrTAWQLqreladarvaggADTLLLLEHPavytagrr   60
DSSP  lllllllllllllleeeeeeellhhHHHHHhhhhhhhhhlllLLEEEEEELLleeeelll


DSSP  .........................LLLLEEEEEEEEELLLHhhHHHHHLLlllhhhhll
Query .........................EFNGYLYKAQGVMDDVVnnVIDHIRPgpwrldwdr   74
ident                                                             
Sbjct tetherpidgtpvvdtdrggkitwhGPGQLVGYPIIGLAEPL..DVVNYVR.........  109
DSSP  llhhhlllllllleelllllleeeeLLLEEEEEEELLLLLLL..LHHHHHH.........


DSSP  leeeeeeeeeeelleeeeeeeELLLllllllLEEEEEEEEeeeelleeeeeEEELlLLLL
Query lmtsldvlehfeenccvmrytTAGQllniisPREFVDFSYtvgyeegllscGVSVeWSET  134
ident                       |                                     
Sbjct ............rleesliqvCADL......GLHAGRVDG..........rSGVWlPGRP  141
DSSP  ............hhhhhhhhhHHHL......LLLLEEELL..........eEEEEeLLLL


DSSP  lllleelEELLeEEEEEElllllllEEEEEEELEE.......................LL
Query rpefvrgYNHPcGWFCVPlkdspsqSLLTGYIQTD.......................LR  171
ident             |                                             | 
Sbjct ....arkVAAI.GVRVSR.......ATTLHGFALNcdcdlaaftaivpcgisdaavtsLS  189
DSSP  ....leeEEEE.EEEEEL.......LEEEEEEEEElllllhhhhhllhhhlllleellHH


DSSP  LL....LLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhhll
Query GM....IPQSAVDTAMASTLANFYSDlrkglr  199
ident            |    |               
Sbjct AElgrtVTVDEVRATVAAAVCAALDG...vlp  218
DSSP  HHhlllLLHHHHHHHHHHHHHHHHLL...lll


No 41: 2F7LA  MOLECULE: 455AA LONG HYPOTHETICAL PHOSPHO-SUGAR MUTASE;              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mgklfgtdgvrgivnkeltpelvlklskaigtffgknskilvgrdvraggdmlvkivegg   60
DSSP  llllllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct llsvgvevydggmaptpalqyavktlgydggvvitashnpapyngikvvdkdgieirrek  120
DSSP  hhhllleeeeeeellhhhhhhhhhhhllleeeeelllllllleeeeeeellllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eneiedlffterfntiewsslttevkredrvistyvngilshvdiekikkknykvlidpa  180
DSSP  hhhhhhhhhhlllllllhhhllllleelllhhhhhhhhhhllllhhhhhhhlleeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nsvgalstplvaralgckiytingnldplfsarqpeptfdslketaevvktlkvdlgvah  240
DSSP  llhhhhlhhhhhhhllleeeelllllllllllllllllllllhhhhhhhhhlllleeeel


DSSP  ..................................llhhhhhhhhHHHH............
Query ..................................asistklqntLIQY............   14
ident                                                             
Sbjct dgdadraifidsegrvqwgdrsgtllsywasvknpkaikkivtaVSSSslveeylskyni  300
DSSP  llllllleeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeLLLLlhhhhhhhllll


DSSP  ........................lLLLLL...............lleeeeeelleeeee
Query ........................hSIEED...............ewrvakkakdvtvwr   35
ident                                                             
Sbjct qvdwtkvgsvdiahkvadenalagfEENGGfmypphqyvrdgamsfalmlellanenvss  360
DSSP  eeeeelllhhhhhhhhhhlllleeeELLEEeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllh


DSSP  eelLLLLLEEEEEEEEELL....lHHHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelLEEE
Query kpsEEFNGYLYKAQGVMDD....vVNNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeeNCCV   91
ident           |      |      |      |                            
Sbjct aelFDRLPKYYLVKTKVDLkpglmVEEIYKKILE....................vySTSS  400
DSSP  hhhHHLLLLLEEEEEEEELlllllHHHHHHHHHH....................hhLLLL


DSSP  eeeeelllllllllleeeeeeEEEEEELlEEEEEEEelllllllllleeleelLEEEEEE
Query mryttagqllniisprefvdfSYTVGYEeGLLSCGVsvewsetrpefvrgynhPCGWFCV  151
ident                              |    |                         
Sbjct .....................VKAITID.GVKIIGK.................DFWFLVR  421
DSSP  .....................LEEELLL.LEEEEEL.................LEEEEEE


DSSP  ELLLLLlLEEEEEEELEellllllhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHHL..l
Query PLKDSPsQSLLTGYIQTdlrgmipqsavdtamaSTLANFYSDLRKGL..r  199
ident      |                               |    | |     
Sbjct KSGTEP.IIRIMAEAKD...............eNVANNLVNELKKIVegk  455
DSSP  ELLLLL.EEEEEEEELL...............hHHHHHHHHHHHHHHlll


No 42: 2DDZA  MOLECULE: 190AA LONG HYPOTHETICAL PROTEIN;                           

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllLLLE...............eeeeelLEEEEEEELL......
Query asistklqntliqyhsieeDEWR...............vakkakDVTVWRKPSE......   39
ident                                                | |          
Sbjct ...........smelliikERRIdydgsairshwayrnfgilgdSLVVFRGKCNvkveem   49
DSSP  ...........lleeeellLLLLllllhhhlllhhhhhhlllllEEEEEEEEEEllhhhl


DSSP  ...........lllLEEEEEEEE.....ellLHHHHHHHHLllllhhhhllleeeeeeee
Query ...........efnGYLYKAQGV.....mddVVNNVIDHIRpgpwrldwdrlmtsldvle   83
ident                                                             
Sbjct vdiedlrlrkeikgDDMVHYILElfwhpdilLASSLQKLLI...................   90
DSSP  llhhhhhllllleeEEEEEEEEEelllllhhHHHHHHHHHH...................


DSSP  eeelleeeeeEEELllllllllleeEEEEEEEEeelleeeeEEEELLlllllllleelee
Query hfeenccvmrYTTAgqllniispreFVDFSYTVgyeegllsCGVSVEwsetrpefvrgyn  143
ident                                                             
Sbjct ...arlvellWNYG...........IEASRRGD........DIYVNG............r  116
DSSP  ...hhhhhhhHLLL...........LLEEEELL........EEEELL............e


DSSP  lLEEEEEEeLLLLllLEEEEEEEL.............EELLllllhhhhhhHHHHHHHHH
Query hPCGWFCVpLKDSpsQSLLTGYIQ.............TDLRgmipqsavdtAMASTLANF  190
ident                                                             
Sbjct kLSISIAT.VSPV..SIKIHIGLNvktvgvppgvdaiGLEE.......lgiDPTEFMERS  166
DSSP  eLEEEEEE.ELLL..LEEEEEEEElllllllllllllLHHH.......hllLHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLL.............
Query YSDLRKGLR.............  199
ident    |                  
Sbjct AKALVEEIEkvrkdslkvrwvt  188
DSSP  HHHHHHHHHhhhhhllllllll


No 43: 2CGHA  MOLECULE: BIOTIN LIGASE;                                             

DSSP  .........llhhhhhhhhhhhhllllLLLL.........eeeeeelLEEEEEEElllll
Query .........asistklqntliqyhsieEDEW.........rvakkakDVTVWRKPseefn   42
ident                                                 |           
Sbjct rpplderslrdqligagsgwrqldvvaQTGStnadllaraasgadidGVVLIAEHqttar   60
DSSP  lllllhhhhhhhhlllllllleeeeelLLLLhhhhhhhhhhllllllLEEEEELLlllll


DSSP  LEEEEEEEEELL..lhHHHHHHHLllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeellll
Query GYLYKAQGVMDD..vvNNVIDHIRpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagql  100
ident        ||                                                   
Sbjct AQIILSVGVRVVdvpvQAWGWLSL...........................aaglavlds   93
DSSP  LEEEEEEEEELLlllhHHLLHHHH...........................hhhhhhhhh


DSSP  lllLLLE...eEEEEeeeeeelleeeEEEEELLlllllllleelEELLEEEEEEELllll
Query lniISPR...eFVDFsytvgyeegllSCGVSVEwsetrpefvrgYNHPCGWFCVPLkdsp  157
ident                              |                       |      
Sbjct vapLIAVppaeTGLK..........wPNDVLAR..........gGKLAGILAEVAQ....  129
DSSP  hhhHLLLlhhhEEEE..........lLLEEEEL..........lEEEEEEEEEEEL....


DSSP  lLEEEEEEELE.....ELLL..LLLHhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL...........
Query sQSLLTGYIQT.....DLRG..MIPQsAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR...........  199
ident       |          |                  |                       
Sbjct .PFVVLGVGLNvtqatSLLDlgVAAP.DRNRIASRLLRELEARIIQWRNanpqlaadyra  187
DSSP  .LEEEEEEEEElllllLLHHhlLLLL.LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLllhhhhhhhhh


DSSP  ...................................................
Query ...................................................  199
ident                                                    
Sbjct rsltigsrvrvelpggqdvvgiardiddqgrlcldvggrtvvvsagdvvhl  238
DSSP  llllllleeeeeellleeeeeeeeeellllleeeeelleeeeellllleel


No 44: 2OAUA  MOLECULE: SMALL-CONDUCTANCE MECHANOSENSITIVE CHANNEL;                

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yavnivaalaiiivgliiarmisnavnrlmisrkidatvadflsalvrygiiaftliaal   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ......................................................llhhhh
Query ......................................................asistk    6
ident                                                             
Sbjct grvgvqtasviavlgaaglavglalqgslsnlaagvllvmfrpfrageyvdlggvagtvl  120
DSSP  hhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeelllleeeee


DSSP  hhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllLLLEEEEEEEEEL..LLHHHHHHHHL
Query lqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseeFNGYLYKAQGVMD..DVVNNVIDHIR   64
ident                                                       |     
Sbjct svqifsttmrtadgkiivipngkiiagniinfsrEPVRRNEFIIGVAydSDIDQVKQILT  180
DSSP  eellleeeeeelllleeeeehhhhhhlleeelllLLEEEEEEEEEELllLLHHHHHHHHH


DSSP  llllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeeeelleeee
Query pgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfsytvgyeeglls  124
ident                                                             
Sbjct ............................................................  180
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeelllllllllleelEELLEEEEE.EELLLlllLEEEEEEELEellllllhhHHHHHH
Query cgvsvewsetrpefvrgYNHPCGWFC.VPLKDspsQSLLTGYIQTdlrgmipqsAVDTAM  183
ident                                                             
Sbjct .......niiqsedrilKDREMTVRLnELGAS...SINFVVRVWS.......nsGDLQNV  223
DSSP  .......hhhhhlllllLLLLEEEEEeELLLL...LEEEEEEEEE.......ehHHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHLL...............
Query ASTLANFYSDLRKGLR...............  199
ident                                
Sbjct YWDVLERIKREFDAAGisfpypqmdvnfkrv  254
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHHLlllllleeeeeeell


No 45: 1KOAA  MOLECULE: TWITCHIN;                                                  

DSSP  .......llhhHHHH...hhhhhhLLLLLlLLEEEEEELLEEEEEEellllllEEEEEEE
Query .......asisTKLQ...ntliqyHSIEEdEWRVAKKAKDVTVWRKpseefngYLYKAQG   50
ident               |                           | |               
Sbjct ydnyvfdiwkqYYPQpveikhdhvLDHYD.IHEELGTGAFGVVHRVteratgnNFAAKFV   59
DSSP  lhhhlllhhhhLLLLllllllllhHHLEE.EEEEEEEELLEEEEEEeelllleEEEEEEE


DSSP  EELLL.hHHHHHHHLLLllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleee
Query VMDDV.vNNVIDHIRPGpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniispref  109
ident                                                             
Sbjct MTPHEsdKETVRKEIQT...........................................   76
DSSP  LLLLHhhHHHHHHHHHH...........................................


DSSP  eeeeeeeeelleeeeeeEELLlllllllleeleELLE.EEEEEElllllllEEEEEEELE
Query vdfsytvgyeegllscgVSVEwsetrpefvrgyNHPC.GWFCVPlkdspsqSLLTGYIQT  168
ident                                         |                   
Sbjct .............msvlRHPT............LVNLhDAFEDD.......NEMVMIYEF  104
DSSP  .............hhhlLLLL............LLLEeEEEEEL.......LEEEEEELL


DSSP  E....................................................LLLLLL.
Query D....................................................LRGMIP.  175
ident                                                             
Sbjct MsggelfekvadehnkmsedeaveymrqvckglchmhennyvhldlkpenimfTTKRSNe  164
DSSP  LllllhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelllllhhheeeLLLLLLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  175
ident                                                             
Sbjct lklidfgltahldpkqsvkvttgtaefaapevaegkpvgyytdmwsvgvlsyillsglsp  224
DSSP  eeelllllleelllllleeeellllllllhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  175
ident                                                             
Sbjct fggenddetlrnvkscdwnmddsafsgisedgkdfirkllladpntrmtihqalehpwlt  284
DSSP  lllllhhhhhhhhhhlllllllhhhhhllhhhhhhhhhhllllhhhlllhhhhhhlllll


DSSP  .............................hhhhHHHHHHhHHHHHhhHHHHLL.......
Query .............................qsavDTAMAStLANFYsdLRKGLR.......  199
ident                                           |         |       
Sbjct pgnapgrdsqipssrytkirdsiktkydawpepLPPLGR.ISNYS..SLRKHRpqeysir  341
DSSP  llllllllllllllllhhhhhhhhhhhllllllLLHHHH.HHHLL..HHHHHLhhhhlee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  199
ident                                                             
Sbjct dafwdrseaqprfivkpygtevgegqsanfycrviassppvvtwhkddrelkqsvkymkr  401
DSSP  eelllhhhllleeeellllleeelllleeeeeeeellllleeeeeelleellllllllll


DSSP  ..............................................
Query ..............................................  199
ident                                               
Sbjct yngndygltinrvkgddkgeytvraknsygtkeeivflnvtrhsep  447
DSSP  lllleeeeeelllllhhhlleeeeeeelleeeeeeelleeelllll


No 46: 1I82A  MOLECULE: ENDO-1,4-BETA-XYLANASE A;                                  

DSSP  llhhhhhhhhhhhhLLLLL.LLLEEeEEEL...........LEEEEEEeLLLLlLEEEEE
Query asistklqntliqyHSIEE.DEWRVaKKAK...........DVTVWRKpSEEFnGYLYKA   48
ident                  |           |              |      |       |
Sbjct mvatakygtpvidgEIDEIwNTTEE.IETKavamgsldknaTAKVRVL.WDEN.YLYVLA   57
DSSP  leeeeeelllllllLLLHHhHHLLE.EELLeeeelllllllEEEEEEE.ELLL.EEEEEE


DSSP  EEEELLlhhhHHHHhllLLLHHHHllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllLLLLLL...
Query QGVMDDvvnnVIDHirpGPWRLDWdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqLLNIIS...  105
ident                                                             
Sbjct IVKDPV....LNKD...NSNPWEQ..............dsveifidennhkTGYYEDdda   96
DSSP  EEELLL....LLLL...LLLHHHL..............leeeeeeelllllLLLLLLlee


DSSP  .............LEEEEeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeLEELlEEEEEEE
Query .............PREFVdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrGYNHpCGWFCVP  152
ident                                                             
Sbjct qfrvnymneqtfgTGGSP..............................ARFK.TAVKLIE  125
DSSP  eeeeelllleeelLLLLH..............................HHEE.EEEEEEL


DSSP  lllllllEEEEEEELEELLLL...llHHHHHhhhhhHHHHhhhhHHHHLL..........
Query lkdspsqSLLTGYIQTDLRGM...ipQSAVDtamasTLANfysdLRKGLR..........  199
ident                                                             
Sbjct .......GGYIVEAAIKWKTIkptpnTVIGF.....NIQV....NDANEKgqrvgiisws  169
DSSP  .......LEEEEEEEEELLLLlllllEEEEE.....EEEE....EEELLLlleeeeeell


DSSP  ....................
Query ....................  199
ident                     
Sbjct dptnnswrdpskfgnlrlik  189
DSSP  lllllllllhhhleeeeeel


No 47: 2ACAA  MOLECULE: PUTATIVE ADENYLATE CYCLASE;                                

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllLEEEEEEEEELLLhHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefnGYLYKAQGVMDDVvNNVI   60
ident                                                             
Sbjct ........................................qgQFEVELKYRVKNH.DAFL   19
DSSP  ........................................llLEEEEEEEEELLH.HHHH


DSSP  HHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeEEEE.EEEL
Query DHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdFSYT.VGYE  119
ident                                                             
Sbjct NXVKQ.............................................iEHEVxFENN   34
DSSP  HHHHL.............................................lLLEEeEEEE


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct qesdwfydtpqrtltqqgkslvlreiqpagiklwivkgpeadrceatnitkldsaqsxle   94
DSSP  eeeeeeeellllhhhhllleeeeeeeellleeeeeeelllllleeeeelllhhhhhhhhh


DSSP  ............LEEEEEEEelllllllllleeleelLEEEEEEELLLLllLEEEEEEEL
Query ............EGLLSCGVsvewsetrpefvrgynhPCGWFCVPLKDSpsQSLLTGYIQ  167
ident                                              |            | 
Sbjct nxgyeviqcskkIRSIFFVG.................EFHITLDFLDGF..GHFAEFAIX  135
DSSP  hllleeeeeeeeEEEEEEEL.................LEEEEEEEELLL..EEEEEEEEE


DSSP  EELlllllhhHHHHHHHHHHHHHHHHHH.............hhll
Query TDLrgmipqsAVDTAMASTLANFYSDLR.............kglr  199
ident ||                 |                         
Sbjct TDD......eTALARYRERLVALAQQFHlseadrehrsykeilsa  174
DSSP  ELL......lHHHLLHHHHHHHHHHHLLllhhhllllllllllll


No 48: 2FGCA  MOLECULE: ACETOLACTATE SYNTHASE, SMALL SUBUNIT;                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllLEEEEEEEEELLLhHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefnGYLYKAQGVMDDVvNNVI   60
ident                                                           | 
Sbjct ..........................................IREHLVSXLVHNK.PGVX   17
DSSP  ..........................................LEEEEEEEEEELL.LLHH


DSSP  HHHLllllhhhhLLLEeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeeeell
Query DHIRpgpwrldwDRLMtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfsytvgyee  120
ident              |                                              
Sbjct RKVA.....nlfARRG............................................   28
DSSP  HHHH.....hhhHLLL............................................


DSSP  eeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEELLlLLLLEEEEEEELEellllllhhhhH
Query gllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPLKdSPSQSLLTGYIQTdlrgmipqsavD  180
ident                                     |  | |                 |
Sbjct ......................fniSSITVGESE.TPGLSRLVIXVKG...........D   54
DSSP  ......................leeEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEE...........L


DSSP  HHHHHHHHHHHHHHH.............................................
Query TAMASTLANFYSDLR.............................................  195
ident              |                                              
Sbjct DKTIEQIEKQAYKLVevvkvtpidplpenrverexalikvrfdedkqeifqlveifrgki  114
DSSP  LLHHHHHHHHHLLLLleeeeeellllhhheeeeeeeeeeeellllhhhhhhhhhhlllee


DSSP  ...........................................hhll
Query ...........................................kglr  199
ident                                                
Sbjct idvsregaiieitgarskveafinllpqkqveeiartgivaxnrwnv  161
DSSP  eeellleeeeeeeelhhhhhhhhhhllhhheeeeeellleeeellll


No 49: 2ARSA  MOLECULE: LIPOATE-PROTEIN LIGASE A;                                  

DSSP  .llhhhhhhhhhhhhlLLLL..llleeeeeeLLEEEEEEELL..................
Query .asistklqntliqyhSIEE..dewrvakkaKDVTVWRKPSE..................   39
ident                 |                                           
Sbjct xegrlllletpgntrxSLAYdeaiyrsfqygDKPILRFYRHDrsviigyfqvaeeevdld   60
DSSP  leeeeelllllllhhhHHHHhhhhhhhllllLLLEEEEELLLleeeelllllhhhhllhh


DSSP  .....................LLLLEEEEEEEEElLLHHhhHHHHlllllhhhhllleee
Query .....................EFNGYLYKAQGVMdDVVNnvIDHIrpgpwrldwdrlmts   78
ident                                    |     |                  
Sbjct yxkkngixlarrytgggavyhDLGDLNFSVVRSS.DDXD..ITSX...............  102
DSSP  hhhhllleeeellllllleeeLLLEEEEEEEEEE.LLLL..HHHH...............


DSSP  eeeeeeeelleeeeeeeELLLlllllLLEEE.........eEEEEeeeelleeeeEEEEl
Query ldvlehfeenccvmrytTAGQllniiSPREF.........vDFSYtvgyeegllsCGVSv  129
ident                                                             
Sbjct ......frtxneavvnsLRIL.....GLDARpgelndvsipVNKK..........TDIX.  140
DSSP  ......hhhhhhhhhhhHHHL.....LLLLEelllllllllLLLL..........LLEE.


DSSP  llllllllleelEELLEEEEEEElllllllEEEEEEELEE....................
Query ewsetrpefvrgYNHPCGWFCVPlkdspsqSLLTGYIQTD....................  169
ident                                                             
Sbjct ........agekKIXGAAGAXRK.......GAKLWHAAXLvhtdldxlsavlkstrerva  185
DSSP  ........elleEEEEEEEEEEL.......EEEEEEEEEEllllhhhhhhhllllhhhll


DSSP  .LLLL..LLHHHHHHHHHHHHHHHHHH...........................hhhhll
Query .LRGM..IPQSAVDTAMASTLANFYSD...........................lrkglr  199
ident             |  |                                            
Sbjct nVTDFvdVSIDEVRNALIRGFSETLHIdfredtitekeeslarelfdkkysteewnxgll  245
DSSP  lHHHLllLLHHHHHHHHHHHHHHHHLLeeeeelllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhlll


No 50: 2AHCA  MOLECULE: CHORISMATE LYASE;                                          

DSSP  .................lLHHHHHHHHHHHhlLLLL........lLLEEEEEEL......
Query .................aSISTKLQNTLIQyhSIEE........dEWRVAKKAK......   29
ident                        |   |    |                           
Sbjct shpaltqlralryskeipALDPQLLDWLLLedSMTKrfeqqgktvSVTMIREGFveqnei   60
DSSP  llhhhhhhhhleelllllLLLLLLHHHHLLllLHHHhhhhlllleEEEEEEEEEelhhhl


DSSP  .............LEEEEEEEllllLLEEEEEEEEELLlhhhhhhhhlllllhhhhllle
Query .............DVTVWRKPseefNGYLYKAQGVMDDvvnnvidhirpgpwrldwdrlm   76
ident                             |     |                         
Sbjct peelpllpkesryWLREILLS.adgEPWLAGRTVVPVS......................   97
DSSP  lllhhhlllllleEEEEEEEE.ellEEEEEEEEEEEHH......................


DSSP  eeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeeeeLLEEEEEEEEllllllll
Query tsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfsytvgyEEGLLSCGVSvewsetrp  136
ident                                                  |          
Sbjct ...............tlsgpelalqklgktplgrylftsstlTRDFIEIGRD........  134
DSSP  ...............hllhhhhhhhlllllllllllllllleEEEEEEEEEE........


DSSP  lleelEELLEEEEEEeLLLLllLEEEEEEELEEllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh
Query efvrgYNHPCGWFCVpLKDSpsQSLLTGYIQTDlrgmipqsavdtamastlanfysdlrk  196
ident                         ||                                  
Sbjct .....AGLWGRRSRL.RLSG..KPLLLTELFLP.........................as  161
DSSP  .....LLEEEEEEEE.EELL..EEEEEEEEELL.........................ll


DSSP  hll
Query glr  199
ident    
Sbjct ply  164
DSSP  lll


No 51: 1S9IA  MOLECULE: DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN                 

DSSP  llhhhhHHHHHHHhlLLLLllLEEEEEELLEEEEEeellllllEEEEEEEEELLL...HH
Query asistkLQNTLIQyhSIEEdeWRVAKKAKDVTVWRkpseefngYLYKAQGVMDDV...VN   57
ident                  |              |                          |
Sbjct ....qkAKVGELKddDFER..ISELGAGNGGVVTKvqhrpsglIMARKLIHLEIKpaiRN   54
DSSP  ....llLLLLLLLhhHEEE..EEEEEELLLLEEEEeeelllllEEEEEEELLLLLlhhHH


DSSP  HHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeEEEEELllllllllleeeeeeeeeee
Query NVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvMRYTTAgqllniisprefvdfsytvg  117
ident   |                                                         
Sbjct QIIRELQV........................lhECNSPY....................   70
DSSP  HHHHHHHH........................hlLLLLLL....................


DSSP  elleeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEElllllllEEEEEEELEellllllhh
Query yeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPlkdspsqSLLTGYIQTdlrgmipqs  177
ident                              | |                            
Sbjct ........................ivgfYGAFYSD.......GEISICMEH........m   91
DSSP  ........................llleEEEEELL.......LLEEEEEEL........l


DSSP  hHHHH...................................................hhhh
Query aVDTA...................................................mast  186
ident                                                             
Sbjct dGGSLdqvlkeakripeeilgkvsiavlrglaylrekhqimhrdvkpsnilvnsrgeikl  151
DSSP  lLLLHhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllllhhheeellllleee


DSSP  HHHH.hhhHHHH................................................
Query LANF.ysdLRKG................................................  197
ident         |                                                   
Sbjct CDFGvsgqLIDSmvgtrsymaperlqgthysvqsdiwsmglslvelavgrypipppdake  211
DSSP  LLLLllhhHHHHlllllllllhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  197
ident                                                             
Sbjct leaifgrpvvdrpamaifelldyivnepppklpngvftpdfqefvnkcliknpaeradlk  271
DSSP  hhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhhhhllllllllllhh


DSSP  ..............................ll
Query ..............................lr  199
ident                                 
Sbjct mltnhtfikrseveevdfagwlcktlrlnqpg  303
DSSP  hhhllhhhhhhhhllllhhhhhhhhhllllll


No 52: 2I8GA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN DIP2269;                              

DSSP  ..........llhhhhhhhhhhhhllLLLLL.........lEEEEEE..LLEEEEEEEll
Query ..........asistklqntliqyhsIEEDE.........wRVAKKA..KDVTVWRKPse   39
ident                                                             
Sbjct vhdsalpfdalpxppqgregfeecpyLDSQWvadtngqrxtGQGVDTrfDTPACVFWS..   58
DSSP  llhhhlllllllllllllllllllllLLHHHhhhhhlllllEEEEELllLLLEEEEEL..


DSSP  lLLLEEEEEEEEEL...lLHHHHHHHHlllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeee
Query eFNGYLYKAQGVMD...dVVNNVIDHIrpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmrytt   96
ident                       | |                                   
Sbjct yPEAPQATVXVRHXpseeEAIRVVDWA.................................   85
DSSP  lLLLLLEEEEEEELllhhHHHHHHHHH.................................


DSSP  lllllllllleeeeeeEEEEEEL...LEEEEEEEElllllllllleeleeLLEEEEEEEl
Query agqllniisprefvdfSYTVGYE...EGLLSCGVSvewsetrpefvrgynHPCGWFCVPl  153
ident                       |         |                           
Sbjct ............apidTTEPAEEpdgWSGGRAGHE...............EGAVYAVQK.  117
DSSP  ............llllLLEEELLlllLEEEEEEEL...............LEEEEEEEE.


DSSP  lllllLEEEEEEELEellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query kdspsQSLLTGYIQTdlrgmipqsavdtamastlanfysdlrkglr  199
ident                                               
Sbjct ....gPVAVVVWSNQ............qqslkaelxakeaiarlgl  147
DSSP  ....lLEEEEEEELL............llhhhhhhhhhhhhhhhll


No 53: 1YEMA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllllEEEEEEEEEllLHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngYLYKAQGVMddVVNNVI   60
ident                                                             
Sbjct ...........................................SEVEIKFKI..KLEDFL   15
DSSP  ...........................................LEEEEEEEE..LHHHHH


DSSP  HHHLLLllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeEEEEEEL.
Query DHIRPGpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfSYTVGYE.  119
ident                                                           | 
Sbjct HTLNTF............................................npEFVRYEEq   31
DSSP  HHHHLL............................................llEEEEEEEe


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  119
ident                                                             
Sbjct edvyfevprpkllrirgvhnlkkyyltfkeildenneefyevefeigdfekavevfkrlg   91
DSSP  eeeeellllleeeeeeeelllleeeeeeeeelllllleeeeeeeeellhhhhhhhhhhll


DSSP  .........LEEEEEeeelllllllllleeleellEEEEEEELLLLllLEEEEEEELEEl
Query .........EGLLSCgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPLKDSpsQSLLTGYIQTDl  170
ident                                                           | 
Sbjct fkiqatikkKRWVYK.................lngVTLEVNRVEGI..GDFVDIEVISD.  131
DSSP  lleeeeeeeEEEEEE.................ellEEEEEEEELLL..EEEEEEEEELL.


DSSP  lllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHH...........hhll
Query rgmipqsaVDTAMASTLANFYSDLR...........kglr  199
ident                        |                
Sbjct ........SPEEAKEKIWEVAKMLGlkeedveprlyleli  163
DSSP  ........LHHHHHHHHHHHHHHLLllhhhllllllllll


No 54: 2JAVA  MOLECULE: SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2;                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhHLLLllllLEEEEEELLEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEEL....lLH
Query asistklqntliqYHSIeedeWRVAKKAKDVTVWRKPSEEFNGYLYKAQGVMD....dVV   56
ident                                             |               
Sbjct ............sRAED.yevLYTIGTGSYGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGsmteaEK   47
DSSP  ............lLHHH.eeeEEEEEELLLEEEEEEEELLLLLEEEEEEELLLlllhhHH


DSSP  HHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeEEEEELllllllllleeeeeeeeee
Query NNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvMRYTTAgqllniisprefvdfsytv  116
ident                                                             
Sbjct QMLVSEVNL........................lrELKHPN...................   64
DSSP  HHHHHHHHH........................llLLLLLL...................


DSSP  eelleeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEellllllleEEEEEELEellllllh
Query gyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVplkdspsqsLLTGYIQTdlrgmipq  176
ident                                              |              
Sbjct .........................ivryYDRIID.........TLYIVMEY........   82
DSSP  .........................llleEEEEEL.........LEEEEEEL........


DSSP  hhHHHH...................................................hhh
Query saVDTA...................................................mas  185
ident                                                             
Sbjct .cEGGDlasvitkgtkerqyldeefvlrvmtqltlalkechrrsdlkpanvfldgkqnvk  141
DSSP  .lLLEEhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhheeelllllee


DSSP  hhhhhhHHHH..................................................
Query tlanfySDLR..................................................  195
ident                                                             
Sbjct lgdfglARILgtpyymspeqmnrmsyneksdiwslgcllyelcalmppftafsqkelagk  201
DSSP  ellhhhHHHLlllllllhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhhhhhh


DSSP  ................................................hhll
Query ................................................kglr  199
ident                                                     
Sbjct iregkfrripyrysdelneiitrmlnlkdyhrpsveeilenplilehhhhhh  253
DSSP  hhhlllllllllllhhhhhhhhhhllllhhhlllhhhhhllllllhhhllll


No 55: 1YZ6A  MOLECULE: PROBABLE TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 ALPHA             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct areypeegefvvatvkrihnygafleldeypgkeafmhisevastwvrnirdylkegqkv   60
DSSP  llllllllleeeeeeeeeelleeeeeelllllleeeeehhhllllllllhhhllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vakvirvdprkghidlslrrvtqqqrkaklqefkraqkaenllklaaeklgkdfetawre  120
DSSP  eeeeeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhll


DSSP  ........llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllLLLEEEEEEEEE
Query ........asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseeFNGYLYKAQGVM   52
ident                                                        |    
Sbjct vwvpleeewgevyaafedaakdgidvlkghvpdewlpvlkeiidnyveVPTVTIDAEFEI  180
DSSP  lhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhlhhhhllllllllhhhhhhhhhhhllLLLLLEEEEEEE


DSSP  LL....LHHHHHHHHLllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeEELLllllllllee
Query DD....VVNNVIDHIRpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryTTAGqllniispre  108
ident        |                                                    
Sbjct TVpkpnGVEIIKEALI.......................rardranKEKD..........  207
DSSP  ELllllHHHHHHHHHH.......................hhhhhhlLLLL..........


DSSP  eeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEELllllllEEEEEEELE
Query fvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPLkdspsqSLLTGYIQT  168
ident                                                          |  
Sbjct ...................................veVKFTYLGA......PRYRIDITA  226
DSSP  ...................................llLLEEEEEL......LEEEEEELL


DSSP  EllllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.............
Query DlrgmipqsaVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.............  199
ident                   |                         
Sbjct P.........DYYKAEEVLESIAEEILRVIKeaggeatllrkek  261
DSSP  L.........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhllleeellllll


No 56: 2PLGA  MOLECULE: TLL0839 PROTEIN;                                           

DSSP  .......................llhhhhhhhhhhhhlllLLLL...lEEEEEE.LLEEE
Query .......................asistklqntliqyhsiEEDE...wRVAKKA.KDVTV   33
ident                                                             
Sbjct ltxvsevqpvspasldaplenaveiietvisslhqgdaplVGQTdsgkIWXFRYgSAEVF   60
DSSP  lllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhlllllleEEEElleeEEEEEElLEEEE


DSSP  EEEELLLLLLEEEEEEEEELLL...hHHHHHHHLLlllhhhhLLLEeeeeeeeeeellee
Query WRKPSEEFNGYLYKAQGVMDDV...vNNVIDHIRPgpwrldwDRLMtsldvlehfeencc   90
ident            |     |                                          
Sbjct VQLSGHTEEDFLTIWSPVLPLPvadeLALYRKLLT....lnwLTTF..............  102
DSSP  EEELLLLLLLEEEEEEEEEELLlllhHHHHHHHHH....hllLLLL..............


DSSP  eeeeeelllllllllleeeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeleelleeEEE
Query vmryttagqllniisprefvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcgWFC  150
ident                                                             
Sbjct ......................................................eahFAI  108
DSSP  ......................................................lleEEE


DSSP  EELllllllEEEEEEELEELLllllHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL....
Query VPLkdspsqSLLTGYIQTDLRgmipQSAVDTAMASTLANFYSDLRKGLR....  199
ident                  |                   |    |    ||    
Sbjct AEE......QVQVVASRTLGG...iTAGEISRLITIVATLADDYDDALRaefk  152
DSSP  ELL......EEEEEEEEELLL...lLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhhl


No 57: 2NWIA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  llHHHHHHHHHHHhlLLLL..........lLLEEEEEEL...................LE
Query asISTKLQNTLIQyhSIEE..........dEWRVAKKAK...................DV   31
ident                               |                             
Sbjct ..LNAIHRILMTT.dGSITaiieavtqkkvEVETLEQKIiradrelaelleidegdevNY   57
DSSP  ..LLHHHHHHHHL.lLLHHhhhhhhhllleEEEEEEEEEeellhhhhhhhlllllleeEE


DSSP  EEEEEEllllLLEEEEEEEEElllhhhhhhhhlllllhhhhllleeeeeeeeeeelleee
Query TVWRKPseefNGYLYKAQGVMddvvnnvidhirpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccv   91
ident  |          |                                               
Sbjct RVVYLR.angEIYAKAISFTP.....................................lk   79
DSSP  EEEEEE.ellEEEEEEEEEEE.....................................hh


DSSP  eeeeelllllllllleeeeeeeeeeeelLEEE.EEEEE.lllllllllleeleeLLEEEE
Query mryttagqllniisprefvdfsytvgyeEGLL.SCGVS.vewsetrpefvrgynHPCGWF  149
ident                                     |                       
Sbjct rlensfredlmradipigkimrkhnieaRREIrWSRVEeadlalakelgiadrrVISRNY  139
DSSP  hllhhhhhhhhlllllhhhhhhhlllllEEEEeEEEEEellhhhhhhhllllleEEEEEE


DSSP  EEELLLLllLEEEEEEELEELlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query CVPLKDSpsQSLLTGYIQTDLrgmipqsavdtamastlanfysdlrkglr  199
ident                                                   
Sbjct NIIHRGK..VLINITEFFPME...........................rf  160
DSSP  EEEELLE..EEEEEEEEEEHH...........................hl


No 58: 1UA2A  MOLECULE: CELL DIVISION PROTEIN KINASE 7;                            

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllLEEEEEELLEEEEEEELLLLLLEEEEEEEeelllHHHHH
Query asistklqntliqyhsieedeWRVAKKAKDVTVWRKPSEEFNGYLYKAQGvmddvVNNVI   60
ident                                ||        |                  
Sbjct ...................ekLDFLGEGQFATVYKARDKNTNQIVAIKKI.....NRTAL   36
DSSP  ...................leEEEEEEELLEEEEEEELLLLLLEEEEEEL.....LLHHH


DSSP  HHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeEEEELllllllllleeeeeeeeeeeell
Query DHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmRYTTAgqllniisprefvdfsytvgyee  120
ident   |                                                         
Sbjct REIKL........................lqeLSHPN.......................   49
DSSP  HHHHH........................hhhLLLLL.......................


DSSP  eeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEElllllllEEEEEEELeellllllhhhHH
Query gllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPlkdspsqSLLTGYIQtdlrgmipqsaVD  180
ident                             |          |                    
Sbjct .....................iiglLDAFGHK.......SNISLVFD..........fME   71
DSSP  .....................llleEEEELLL.......LLLEEEEE..........lLL


DSSP  HH......................................................hhhh
Query TA......................................................mast  186
ident |                                                           
Sbjct TDleviikdnslvltpshikaymlmtlqgleylhqhwilhrdlkpnnllldengvlklad  131
DSSP  EEhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllhhheeellllleeell


DSSP  hhhHHHHHHH..................................................
Query lanFYSDLRK..................................................  196
ident      |                                                      
Sbjct fglAKSFGSPnrayxhqvvtrwyrapellfgarmygvgvdmwavgcilaelllrvpflpg  191
DSSP  lhhHLLLLLLlllllllllllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  196
ident                                                             
Sbjct dsdldqltrifetlgtpteeqwpdmcslpdyvtfksfpgiplhhifsaagddlldliqgl  251
DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllhhhhlllllhhhhhhhhhh


DSSP  .................................hll
Query .................................glr  199
ident                                     
Sbjct flfnpcaritatqalkmkyfsnrpgptpgcqlprpn  287
DSSP  hlllllllllhhhhhllhhhllllllllllllllll


No 59: 1QAXA  MOLECULE: PROTEIN (3-HYDROXY-3-METHYLGLUTARYL-COENZYME A             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dsrlpafrnlspaarldhigqllglshddvsllanagalpmdiangmienvigtfelpya   60
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhllllllhhhhhhhllleeeeeeeeee


DSSP  ...llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeELLE.....EEEEEE...............
Query ...asistklqntliqyhsieedewrvakkAKDV.....TVWRKP...............   37
ident                               ||                            
Sbjct vasnfqingrdvlvplvveepsivaaasymAKLAranggFTTSSSaplmhaqvqivgiqd  120
DSSP  eellleelleelleeeelllllhhhhhhhhHHHHhhlllLEEEELlleeeeeeeeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   37
ident                                                             
Sbjct plnarlsllrrkdeiielanrkdqllnslgggcrdievhtfadtprgpmlvahlivdvrd  180
DSSP  hhhhhhhhhhlhhhhhhhhhlllhhhhhllleeeeeeeeeellllllleeeeeeeeelll


DSSP  ................................lllLLLEEEEEEEEEL...........l
Query ................................seeFNGYLYKAQGVMD...........d   54
ident                                                             
Sbjct amgantvntmaeavaplmeaitggqvrlrilsnlaDLRLARAQVRITPqqletaefsgea  240
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllLLLEEEEEEEELHhhhllllllhhh


DSSP  LHHHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelLEEE.........eeeeELLLLLLLLL
Query VVNNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeeNCCV.........mrytTAGQLLNIIS  105
ident |     |                                                     
Sbjct VIEGILDAYAF....................aaVDPYraathnkgimngiDPLIVATGND  280
DSSP  HHHHHHHHHHH....................hhHLHHhhhhhhhhhhhhhHHHHHHLLLL


DSSP  LEEeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleELEE..........llEEEEEEELLl
Query PREfvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvRGYN..........hpCGWFCVPLKd  155
ident  |                                                          
Sbjct WRA..............................vEAGAhayacrsghygsLTTWEKDNN.  309
DSSP  HHH..............................hHHHHhhhhllllllllLEEEEELLL.


DSSP  lllLEEEEEEELEEL.................lllllhHHHHHHHHHH.HHHHHHHHHHH
Query spsQSLLTGYIQTDL.................rgmipqSAVDTAMAST.LANFYSDLRKG  197
ident      |                                                  |   
Sbjct ...GHLVGTLEMPMPvglvggatkthplaqlslrilgvKTAQALAEIAvAVGLAQNLGAM  366
DSSP  ...LLEEEEEEEELLlllllhhhhhlhhhhhhhhhhllLLHHHHHHHHhHHHHHHHHHHH


DSSP  LL.........................................................
Query LR.........................................................  199
ident                                                            
Sbjct RAlategiqrghmalharniavvagargdevdwvarqlveyhdvradravallkqkrgq  425
DSSP  HHhhhhllhhhhhhhlllhhhhhhlllllllhhhhhhhlllllllhhhhlhhhhhhhll


No 60: 2PKHA  MOLECULE: HISTIDINE UTILIZATION REPRESSOR;                           

DSSP  llhhhhhhhhhhhhllllllLLEEEEEEL...................LEEEEEEEllll
Query asistklqntliqyhsieedEWRVAKKAK...................DVTVWRKPseef   41
ident                        |                                    
Sbjct ..................rhTCKVXVLKEeaagseralaldxregqrvFHSLIVHF.end   41
DSSP  ..................leEEEEEEEEEeelhhhhhhhhlllllleeEEEEEEEE.ell


DSSP  LLEEEEEEEEElllhhhhhhhhlllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllll
Query NGYLYKAQGVMddvvnnvidhirpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqll  101
ident          |                                                  
Sbjct IPVQIEDRFVN.......................................aqvapdylkq   62
DSSP  EEEEEEEEEEE.......................................llllllhhhl


DSSP  llllleeeeeeeeeeeelLEEEEEEEE...lllllllllleELEElLEEEEEEELLLLll
Query niisprefvdfsytvgyeEGLLSCGVS...vewsetrpefvRGYNhPCGWFCVPLKDSps  158
ident                   ||                                        
Sbjct dftlqtpyaylsqvapltEGEHVVEAIlaeadeckllqidaGEPC.LLIRRRTWSGRQ..  119
DSSP  llllllhhhhhhhhllllEEEEEEEEElllhhhhhhhllllLLLE.EEEEEEEEELLE..


DSSP  LEEEEEEELEELlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query QSLLTGYIQTDLrgmipqsavdtamastlanfysdlrkglr  199
ident        |                                 
Sbjct PVTAARLIHPGS...................rhrlegrftk  141
DSSP  EEEEEEEEEEHH...................hlleeeeeel


No 61: 2B5JA  MOLECULE: REVERSE TRANSCRIPTASE P66 SUBUNIT;                         

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pispietvpvklkpgmdgpkvkqwplteekikalveictemekegkiskigpenpyntpv   60
DSSP  lllllllllllllllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeelllllllllll


DSSP  .............................llhhhhHHHHHHhhlllllllleeeeeelle
Query .............................asistkLQNTLIqyhsieedewrvakkakdv   31
ident                                        |                    
Sbjct faikkkdstkwrklvdfrelnkrtqdfwevqlgipHPAGLK...................  101
DSSP  eeelllllllleeelllhhhhllllllllllllllLHHHLL...................


DSSP  eeeeeelllllleEEEEEEEEL......................................
Query tvwrkpseefngyLYKAQGVMD......................................   53
ident                                                             
Sbjct ...........kkKSVTVLDVGdayfsvpldedfrkytaftipsinnetpgiryqynvlp  150
DSSP  ...........llLEEEEEELLlhhhhllllhhhlhhhleeellllllllleeeeellll


DSSP  ........lLHHHHHHHHLLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllll
Query ........dVVNNVIDHIRPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniis  105
ident                    |                                        
Sbjct qgwkgspaiFQSSMTKILEP........................................  170
DSSP  lllllhhhhHHHHHHHHHHH........................................


DSSP  leeeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeleelleEEEEEElllllllEEEEEE
Query prefvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcGWFCVPlkdspsqSLLTGY  165
ident                                                         |   
Sbjct .................................fkkqnpdiVIYQYM.......DDLYVG  190
DSSP  .................................hhhhllllEEEEEL.......LEEEEE


DSSP  ELEellllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL...........................
Query IQTdlrgmipqsaVDTAMASTLANFYSDLRKGL...........................  198
ident                             |                               
Sbjct SDL..........EIGQHRTKIEELRQHLLRWGlttpdkkhqkeppflwmgyelhpdkwt  240
DSSP  ELL..........LHHHHHHHHHHHHHHHHLLLllllllllllllleeelleeellllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  198
ident                                                             
Sbjct vqpivlpekdswtvndiqklvgklnwasqiypgikvrqlskllrgtkalteviplteeae  300
DSSP  llllllllllleehhhhhhhhhhhhhhhllllllllhhhhllllllllllleelllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  198
ident                                                             
Sbjct lelaenreilkepvhgvyydpskdliaeiqkqgqgqwtyqiyqepfknlktgkyarmrga  360
DSSP  hhhhhhhhhhhlllllllllllllleeeeeelllleeeeeeellllllleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  198
ident                                                             
Sbjct htndvkqlteavqkittesiviwgktpkfklpiqketwetwwteywqatwipewefvntp  420
DSSP  lllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeelllhhhhhhhhhhllllllllleeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  198
ident                                                             
Sbjct plvklwyqlekepivgaetfyvdgaanretklgkagyvtnkgrqkvvpltnttnqktelq  480
DSSP  llllllllllllllllleeeeeeeeellllleeeeeeeelllleeeeeeelllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  198
ident                                                             
Sbjct aiylalqdsglevnivtdsqyalgiiqaqpdkseselvnqiieqlikkekvylawvpahk  540
DSSP  hhhhhhhhllleeeeeellhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhlleeeeeelllll


DSSP  ...........l
Query ...........r  199
ident             
Sbjct giggneqvdklv  552
DSSP  llllhhhhhhhl


No 62: 2AHOB  MOLECULE: TRANSLATION INITIATION FACTOR 2 GAMMA SUBUNIT;             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct miysrsklpsegeiliatvkqvfdygsyvsldeygglqaflpwsevsnirdvlkenrkvi   60
DSSP  llllllllllllllleeeeeeeelleeeeeellllleeeeelhhhlllhhhhllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vkvirvdrrkgtvdvslkkvtdderrkknlqwkkiqrldkilelvsqklklsekdaweqv  120
DSSP  leeeeeelllleeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhll


DSSP  .........LLHHhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelLLLLLEEEEEEEE
Query .........ASIStklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpsEEFNGYLYKAQGV   51
ident            |                                    |           
Sbjct awkleakygDPIT.aiekavkegekilidagvpeiwvkplleeaskhAEERKVKMSGLIT  179
DSSP  hhhhlllllLHHH.hhhhhhhlllhhhhllllllllhhhhhhhhhhhHHHLLEEEEEEEE


DSSP  ELL....LHHHHHHHHLllllhhhhLLLEeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllle
Query MDD....VVNNVIDHIRpgpwrldwDRLMtsldvlehfeenccvmryttagqllniispr  107
ident         |      |                                            
Sbjct VRTneplGVEKIKEVIS.....kalENIE...............................  203
DSSP  EELllllHHHHHHHHHH.....hhlLLLL...............................


DSSP  eeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleelEELLEEEEEEELllllllEEEEEEEL
Query efvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgYNHPCGWFCVPLkdspsqSLLTGYIQ  167
ident                                                             
Sbjct ..............................qdyeSLLNIKIYTIGA......PRYRVDVV  227
DSSP  ..............................llllLLLLEEEEELLL......LEEEEEEE


DSSP  EELlllllhhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.........
Query TDLrgmipqsavDTAMASTLANFYSDLRKGLR.........  199
ident                    |    | | |            
Sbjct GTN.........PKEASEALNQIISNLIKIGKeenvdisvv  259
DSSP  ELL.........HHHHHHHHHHHHHHHHHHHLlllleeeel


No 63: 1TLWA  MOLECULE: NUCLEOSIDE-SPECIFIC CHANNEL-FORMING PROTEIN TSX;           

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelLEEEEE.........................
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakDVTVWR.........................   35
ident                                   |                         
Sbjct .................lsdwwhqsvnvvGSYHTRfgpqirndtyleyeafakkdwfdfy   43
DSSP  .................llllleeeeeeeEEELLLlllllllleeeeeeeeeeelleeee


DSSP  .......eelllllleeeeeeeeelllhhhhhhhhlllllHHHH......lLLEEEEEEe
Query .......kpseefngylykaqgvmddvvnnvidhirpgpwRLDW......dRLMTSLDVl   82
ident                                                    |  |     
Sbjct gyadapvplfmeieprfsidkltntdlsfgpfkewyfannYIYDmgrnkdgRQSTWYMG.  102
DSSP  eeeeeellleeeeeeeeehhhhhlllllllleeeeeeeeeEEEElllllllLEEEEEEE.


DSSP  EEEEL........LEEEEEEEEL.llllllllleEEEEEEEEEEEL.........LEEEE
Query EHFEE........NCCVMRYTTA.gqllniisprEFVDFSYTVGYE.........EGLLS  124
ident                 |                     |                     
Sbjct LGTDIdtglpmslSMNVYAKYQWqnygaanenewDGYRFKIKYFVPitdlwggqlSYIGF  162
DSSP  EEEEElllllleeEEEEEEEEEEeellllllleeEEEEEEEEEEEEeeeelleeeEEEEE


DSSP  EEEELL.......lllllllleeLEELLEEEEEEELLL.lLLLEEEEEEEL..EELLllL
Query CGVSVE.......wsetrpefvrGYNHPCGWFCVPLKD.sPSQSLLTGYIQ..TDLRgmI  174
ident                          |         |       |    |           
Sbjct TNFDWGsdlgddsgnaingiktrTNNSIASSHILALNYdhWHYSVVARYWHdgGQWNddA  222
DSSP  EEEEELlllllllllllllllllLLLEEEEEEEEEEELllEEEEEEEEEEElhHHLLllL


DSSP  LHH.....HHHHhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query PQS.....AVDTamastlanfysdlrkglr  199
ident                               
Sbjct ELNfgngnFNVR.stgwggylvvgynfhhh  251
DSSP  EELlllllEELL.lleeeeeeeeeeeelll


No 64: 1J4WA  MOLECULE: FUSE BINDING PROTEIN;                                      

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeellllllEEEEEEEEELLlhhHHH
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngYLYKAQGVMDDvvnNVI   60
ident                                                             
Sbjct ...........................................GSHMIDVPIPR...FAV   14
DSSP  ...........................................LLEEEEEEEEH...HHH


DSSP  HH.HLLLllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeeeel
Query DH.IRPGpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisprefvdfsytvgye  119
ident    |                                                        
Sbjct GIvIGRN.....................................................   21
DSSP  HHhHLHH.....................................................


DSSP  leeeeeeeelllllllllleeleellEEEEEEELLLLLLLEEEEEEELeellllllhhhh
Query egllscgvsvewsetrpefvrgynhpCGWFCVPLKDSPSQSLLTGYIQtdlrgmipqsav  179
ident                                 |                           
Sbjct ..............gemikkiqndagVRIQFKPDDGTTPERIAQITGP............   55
DSSP  ..............hhhhhhhhhhhlLEEEEELLLLLLLEEEEEEEEL............


DSSP  hhHHHHHHHHHHHHHHHHLL........................................
Query dtAMASTLANFYSDLRKGLR........................................  199
ident     |   |    ||                                             
Sbjct .pDRAQHAAEIITDLLRSVQqefnfivptgktgliigkggetiksisqqsgarielqrnp  114
DSSP  .hHHHHHHHHHHHHHHHHHLleeeeeeelllhhhhhlhhhhhhhhhhhhhlleeeeelll


DSSP  ...............................
Query ...............................  199
ident                                
Sbjct ppnadpnmklftirgtpqqidyarqlieeki  145
DSSP  llllllleeeeeeellhhhhhhhhhhhhhhl


No 65: 1J26A  MOLECULE: IMMATURE COLON CARCINOMA TRANSCRIPT 1;                     

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeEELLEEEEEEELLL.......LLLEEEEEEEEEL
Query asistklqntliqyhsieedewrvakKAKDVTVWRKPSEE.......FNGYLYKAQGVMD   53
ident                                      |                      
Sbjct .........gssgssgehakqassyiPLDRLSISYCRSSGpggqnvnKVNSKAEVRFHLA   51
DSSP  .........lllllllllllllllllLLLLLEEEEELLLLlllllllLLLLEEEEEEEHH


DSSP  .......llhHHHHHHHlllllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeeeeellllllllll
Query .......dvvNNVIDHIrpgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmryttagqllniisp  106
ident                                                             
Sbjct sadwieepvrQKIALTH...........................................   68
DSSP  hlllllhhhhHHHHHHL...........................................


DSSP  eeeeeeeeeeeelleeeeeeeelllllllllleeleelleeeEEEELllllllEEEEEEE
Query refvdfsytvgyeegllscgvsvewsetrpefvrgynhpcgwFCVPLkdspsqSLLTGYI  166
ident                                                        |    
Sbjct ........................................knKINKA......GELVLTS   82
DSSP  ........................................llLLLLL......LEEEEEE


DSSP  LEELlllllhhhHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLL.....
Query QTDLrgmipqsaVDTAMASTLANFYSDLRKGLR.....  199
ident                           |           
Sbjct ESSR........YQFRNLAECLQKIRDMIAEASgpssg  112
DSSP  LLLL........LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHlllll


No 66: 2I4LA  MOLECULE: PROLINE-TRNA LIGASE;                                       

DSSP  ................................................llhhhhhhhhhh
Query ................................................asistklqntli   12
ident                                                             
Sbjct gshmrlsrfflpilkenpkeaeivshrlmlragmlrqeaagiyawlplghrvlkkieqiv   60
DSSP  lleeehhhlllllllllllllllhhhhhhhhllleeeeelleeeelhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhllllllllEEEE..............................................
Query qyhsieedewRVAK..............................................   26
ident                                                             
Sbjct reeqnragaiELLMptlqladlwresgrydaygpemlriadrhkrellygptneemitei  120
DSSP  hhhhhhllleELLLlleeehhhhhhhlhhhhllllleeeellllleeeellllhhhhhhh


DSSP  .........eelLEEEEEEELL............llLLEEEEEEEEELLL..hHHHHHHH
Query .........kakDVTVWRKPSE............efNGYLYKAQGVMDDV..vNNVIDHI   63
ident                                           |     |           
Sbjct frayiksykslpLNLYHIQWKFrdeqrprfgvmrgrEFLMKDAYSFDVDEagaRKSYNKM  180
DSSP  hhhhlllhhhllEEEEEEEEEEllllllllhhhlllEEEEEEEEEEELLHhhhHHHHHHH


DSSP  LLlllhhhhllleeeeeeeeeeelleeeeEEEElllllllllleEEEEEEE.EEEELL..
Query RPgpwrldwdrlmtsldvlehfeenccvmRYTTagqllniisprEFVDFSY.TVGYEE..  120
ident                                                             
Sbjct FV......................aylrtFARM...........GLKAIPMrAETGPIgg  207
DSSP  HH......................hhhhhHHLL...........LLLEEEEeLLLLLLll


DSSP  eEEEEEEELLLL................................................
Query gLLSCGVSVEWS................................................  132
ident  |                                                          
Sbjct dLSHEFIVLAETgesgvyidrdvlnlpvpdenvdydgdltpiikqwtsvyaatedvhepa  267
DSSP  lLEEEEEEELLLlleeeeeehhhhhllllllllllllllhhhhhhhhhlleeelllllll


DSSP  ......lllllleeleeLLEEEEEEELLLLL..............LLEEEEEEEL..EEL
Query ......etrpefvrgynHPCGWFCVPLKDSP..............SQSLLTGYIQ..TDL  170
ident                       |    | |                             |
Sbjct ryesevpeanrlntrgiEVGQIFYFGTKYSDsmkanvtgpdgtdaPIHGGSYGVGvsRLL  327
DSSP  hhhhhllllleeeeeeeEEEEEEEEELHHHHhllleeellllleeELEEEEEEEEhhHHH


DSSP  L.................LLLL......................................
Query R.................GMIP......................................  175
ident                                                             
Sbjct GaiieachddngiiwpeaVAPFrvtilnlkqgdaatdaacdqlyrelsakgvdvlyddtd  387
DSSP  HhhhhhleelleelllllLLLLleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeelll


DSSP  ............................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhll
Query ............................qsavdtamastlanfysdlrkglr  199
ident                                                     
Sbjct qragakfatadligipwqihvgprglaegkvelkrrsdgarenlaladvvar  439
DSSP  llhhhhhhhhhhhllleeeeelhhhhllleeeeeellllleeeeelllllll


No 67: 2FR2A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RV2717C;                              

DSSP  llhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeelleeeeeeelllllleeeeeeeeelllHHHHh
Query asistklqntliqyhsieedewrvakkakdvtvwrkpseefngylykaqgvmddvVNNVi   60
ident                                                             
Sbjct ..................................................dlapaLQAL.    9
DSSP  ..................................................lllhhHHHH.


DSSP  hhhlllllhhhhllleeeeeeeeeeelLEEEEEEEELLlllLLLLLEEEEEEEEEEE.eL
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Sbjct .......................spllGSWAGRGAGKY...PTIRPFEYLEEVVFAHvgK   43
DSSP  .......................hhhlEEEEEEEEELL...LLLLLEEEEEEEEEEEllL


DSSP  LEEEEEEEELLLLLllllleelEELLEEEEEEELLlllLLEEEEEEEL............
Query EGLLSCGVSVEWSEtrpefvrgYNHPCGWFCVPLKdspSQSLLTGYIQ............  167
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Sbjct PFLTYTQQTRAVAD......gkPLHSETGYLRVCR..pGCVELVLAHPsgiteievgtys   95
DSSP  LEEEEEEEEEELLL......llEEEEEEEEEEELL..lLEEEEEEEELlleeeeeeeeee


DSSP  ............eellllllhhhHHHHhhhhhHHHHH.......................
Query ............tdlrgmipqsaVDTAmastlANFYS.......................  192
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Sbjct vtgdvielelstradgsiglaptAKEV....tALDRSyridgdelsyslqmravgqplqd  151
DSSP  eelleeeeeeellllleeeelllLLLE....eEEEEEeeeelleeeeeeeeeelleeeee


DSSP  ...hhhhhll
Query ...dlrkglr  199
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Sbjct hlaavlhrqr  161
DSSP  eeeeeeeell


No 68: 1ULIA  MOLECULE: BIPHENYL DIOXYGENASE LARGE SUBUNIT;                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct wadadiaelvdertgrldpriytdealyeqelerifgrswllmghetqipkagdfmtnym   60
DSSP  llhhhhhlleelllleelhhhhllhhhhhhhhhhlllllleeeeehhhllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
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Sbjct gedpvmvvrqkngeirvflnqcrhrgmricradggnaksftcsyhgwaydtggnlvsvpf  120
DSSP  lleeeeeeellllleeeeelllllllllllllleeellleelllllleellllleeelll


DSSP  ............................................LLHHHHHhhhhhhhll
Query ............................................ASISTKLqntliqyhs   16
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Sbjct eeqafpglrkedwgplqarvetykglifanwdadapdldtylgeAKFYMDH.........  171
DSSP  hhhhlllllhhhlllleeeeeeelleeeeelllllllhhhhhllHHHHHHH.........


DSSP  lllllleeeeeelleeeeeeelLLLLleEEEEEEEElLLHHHHHHH..hLLLLlhHHHL.
Query ieedewrvakkakdvtvwrkpsEEFNgyLYKAQGVMdDVVNNVIDH..iRPGPwrLDWD.   73
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Sbjct .............mldrteagtEAIP..GIQKWVIP.CNWKFAAEQfcsDMYHagTTSHl  215
DSSP  .............hhlllllleEELL..LLEEEEEL.LLHHHHHHHhhhLHHHhhLLLLh


DSSP  LLEE..eeeeEEEEEL.....LEEEE.....EEEE...................llllll
Query RLMT..sldvLEHFEE.....NCCVM.....RYTT...................agqlln  102
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Sbjct SGILaglpteGIQYRAtwgghGSGFYigdpnLLLAimgpkvteywtqgpaaekaserlgs  275
DSSP  HHHHhlllllEEEEELlllllEEEEEelllhHHHHhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhlll


DSSP  lllleeeEEEEEEEEElleEEEEEEElllllllllleeleelLEEEEEEELLlllLLEEE
Query iisprefVDFSYTVGYeegLLSCGVSvewsetrpefvrgynhPCGWFCVPLKdspSQSLL