DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1HQZ8 MOLECULE: ACTIN-BINDING PROTEIN;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1HQZ-1 27.7  0.3  132   139  100   ACTIN-BINDING PROTEIN;                                     "         
   2:  1X67-A 19.2  1.9  130   146   21   DREBRIN-LIKE PROTEIN;                                      "         
   3:  1CFY-A 16.7  2.1  125   133   19   COFILIN;                                                   "         
   4:  1VKK-A 15.0  2.3  125   137   12   GLIA MATURATION FACTOR GAMMA;                              "         
   5:  1TMW-A 14.6  2.4  127   141   16   COACTOSIN-LIKE PROTEIN;                                    "         
   6:  1M4J-A 13.8  2.4  117   133   19   A6 GENE PRODUCT;                                           "         
   7:  1F7S-A 13.7  2.1  112   124   17   ACTIN DEPOLYMERIZING FACTOR (ADF);                         "         
   8:  2D8B-A 11.7  2.8  126   166   10   TWINFILIN-1;                                               "         
   9:  1AK6-A 11.6  2.6  127   174   21   DESTRIN;                                                   "         
  10:  2FGH-A  6.4  3.4   95   721   12   GELSOLIN;                                                  "         
  11:  2B78-A  5.3  3.2   81   376    7   HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.776;                              "         
  12:  2NUP-A  4.6  3.1   79   699    5   PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23A;                          "         
  13:  1SVQ-A  4.5  3.5   78    94    6   SEVERIN;                                                   "         
  14:  1HH1-A  3.3  2.7   64   125   16   HOLLIDAY JUNCTION RESOLVING ENZYME HJC;                    "         
  15:  1USH-A  3.1  4.7   66   515   11   5'-NUCLEOTIDASE;                                           "         
  16:  1OD2-A  3.1  4.6   92   719    9   ACETYL-COENZYME A CARBOXYLASE;                             "         
  17:  2CWW-A  2.9  3.6   79   376    5   PUTATIVE SAM-DEPENDENT RNA METHYLTRANSFERASE;              "         
  18:  2AS0-A  2.9  4.3   78   396   12   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1915;                               "         
  19:  1B49-A  2.9  3.8   81   241   11   PROTEIN (DEOXYCYTIDYLATE HYDROXYMETHYLASE);                "         
  20:  2JC4-A  2.6  4.0   70   256   13  ;                                                           "         
  21:  1OB8-A  2.6  2.9   65   119   11   HOLLIDAY-JUNCTION RESOLVASE;                               "         
  22:  1H65-A  2.6  3.9   76   257    8   CHLOROPLAST OUTER ENVELOPE PROTEIN OEP34;                  "         
  23:  2UYX-A  2.4  3.7   62   218    8   BETA-LACTAMASE II;                                         "         
  24:  2GIA-B  2.4  3.9   54   146    4   MITOCHONDRIAL RNA-BINDING PROTEIN 2;                       "         
  25:  2B7L-A  2.4  3.1   71   115    4   GLYCEROL-3-PHOSPHATE CYTIDYLYLTRANSFERASE;                 "         
  26:  1MD9-A  2.4  4.2   72   536    7   2,3-DIHYDROXYBENZOATE-AMP LIGASE;                          "         
  27:  1KO2-A  2.4  3.4   67   230    3   VIM-2 METALLO-BETA-LACTAMASE;                              "         
  28:  2E87-A  2.3  2.9   72   356   15   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1320;                               "         
  29:  1QSM-A  2.3  3.4   64   150   13   HPA2 HISTONE ACETYLTRANSFERASE;                            "         
  30:  1GEF-A  2.3  3.2   61   120   13   HOLLIDAY JUNCTION RESOLVASE;                               "         
  31:  2C8J-A  2.2  4.3   75   311    7   FERROCHELATASE 1;                                          "         
  32:  2ARH-A  2.2  3.5   75   198    5   HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1966;                              "         
  33:  2HJG-A  2.1  2.8   61   400   15   GTP-BINDING PROTEIN ENGA;                                  "         
  34:  2G0T-A  2.1  3.4   79   336   10   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  35:  2FOK-A  2.1  4.1   70   558    9   FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;                             "         
  36:  1VHX-A  2.0  3.3   61   140    7   PUTATIVE HOLLIDAY JUNCTION RESOLVASE;                      "         
  37:  1RJM-A  2.0  3.5   67   239   10   MENB;                                                      "         
-

No 1: 1HQZ1  MOLECULE: ACTIN-BINDING PROTEIN;                                     

DSSP  ..LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEELLHHHHLLLLLLL
Query ..PIDYTTHSREIDAEYLKIVRGSDPDTTWLIISPNAKKEYEPESTGSSFHDFLQLFDET   58
ident   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct lePIDYTTHSREIDAEYLKIVRGSDPDTTWLIISPNAKKEYEPESTGSSFHDFLQLFDET   60
DSSP  llLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEELLHHHHHLLLLLL


DSSP  LLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL
Query KVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANNLFKGYHVQVTARD  118
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANNLFKGYHVQVTARD  120
DSSP  LLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL


DSSP  HHHLLHHHHHHHLL.....
Query EDDLDENELLMKIS.....  132
ident ||||||||||||||     
Sbjct EDDLDENELLMKISnaaga  139
DSSP  HHHHLHHHHHHHHHlllll


No 2: 1X67A  MOLECULE: DREBRIN-LIKE PROTEIN;                                      

DSSP  ........LLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLEEEEEELL.LLLEEEEEEELL.HHH
Query ........PIDYTTHSREIDAEYLKIVRGSDpDTTWLIISPNA.KKEYEPESTGSS.FHD   50
ident                       |   |      | |                ||      
Sbjct gssgssgmAANLSRNGPALQEAYVRVVTEKS.PTDWALFTYEGnSNDIRVAGTGEGgLEE   59
DSSP  llllllllLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLEEEEEELLlLLLEEEEEEELLlHHH


DSSP  HLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHhLLLLL
Query FLQLFDETKVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANnLFKGY  110
ident         || |   ||  | |   |   | |             |      |    || 
Sbjct MVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACASHVSTMAS.FLKGA  118
DSSP  HHHHLLLLLEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLLE


DSSP  LEEEEELLHHHLLHHHHHHHLL......
Query HVQVTARDEDDLDENELLMKIS......  132
ident ||   || | |        |        
Sbjct HVTINARAEEDVEPECIMEKVAsgpssg  146
DSSP  EEEELLLLHHHHLHHHHHHHHHllllll


No 3: 1CFYA  MOLECULE: COFILIN;                                                   

DSSP  lLLLLllhHHHHHHHHHHHHLLLllLLEEEEEELLLL.LEEEEEEELL..HHHHLLLLLL
Query pIDYTthsREIDAEYLKIVRGSDpdTTWLIISPNAKK.EYEPESTGSS..FHDFLQLFDE   57
ident          |          |            |  | |     |        ||    |
Sbjct .VAVA...DESLTAFNDLKLGKK..YKFILFGLNDAKtEIVVKETSTDpsYDAFLEKLPE   54
DSSP  .LEEL...HHHHHHHHHHHHHLL..LLEEEEEELLLLlEEEEEEEELLllHHHHHLLLLL


DSSP  LLLEEEEEEELLLL....LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLLEE
Query TKVQYGLARVSPPG....SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYHVQ  113
ident     |                 ||    | || ||       |    |       |    
Sbjct NDCLYAIYDFEYEIngneGKRSKIVFFTWSPDTAPVRSKMVYASSKDALR.RALNGVSTD  113
DSSP  LLLEEEEEEEEEELllllLEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLLLEE


DSSP  EEELLHHHLLHHHHHHHLL.
Query VTARDEDDLDENELLMKIS.  132
ident |   |         |   | 
Sbjct VQGTDFSEVSYDSVLERVSr  133
DSSP  EEELLHHHHLHHHHHHHHHl


No 4: 1VKKA  MOLECULE: GLIA MATURATION FACTOR GAMMA;                              

DSSP  .LLLLlllHHHHHHHHHHHHHLLLLllLEEEEEELLL.LLEEEEEEELLHH..HHLLLLL
Query .PIDYtthSREIDAEYLKIVRGSDPdtTWLIISPNAK.KEYEPESTGSSFH..DFLQLFD   56
ident           |      |            |            |                
Sbjct vVCEV...DPELKETLRKFRFRKETnnAAIIMKVDKDrQMVVLEDELQNISpeELKLELP   57
DSSP  lLLEE...LHHHHHHHHHHHLLLLLllEEEEEEEELLlLEEEEEEEEELLLhhHHHHHLL


DSSP  LLLLEEEEEEELLLL...LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLlLLEE
Query ETKVQYGLARVSPPG...SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKgYHVQ  113
ident |                         |   |           |                 
Sbjct ERQPRFVVYSYKYVHddgRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLV.QTAE.LTKV  115
DSSP  LLLLEEEEEELLEELlllLEELLEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL.LLLE


DSSP  EEELLHHHLLHHHHHHHLL...
Query VTARDEDDLDENELLMKIS...  132
ident    |  ||| |  |  |     
Sbjct FEIRTTDDLTETWLKEKLAffr  137
DSSP  EEELLHHHLLHHHHHHHHHlll


No 5: 1TMWA  MOLECULE: COACTOSIN-LIKE PROTEIN;                                    

DSSP  LLLLllLHHHHHHHHHHHhHLLLLLLLEEEEEELlLLLEEEEEEELLHHHHLLLLLLLLL
Query PIDYttHSREIDAEYLKIvRGSDPDTTWLIISPNaKKEYEPESTGSSFHDFLQLFDETKV   60
ident             | |    |       |            |   |     | |       
Sbjct ATKI..DKEACRAAYNLV.RDDGSAVIWVTFKYD.GSTIVPGEQGAEYQHFIQQCTDDVR   56
DSSP  LLLL..LHHHHHHHHHHH.HLLLLLLLEEEEEEL.LLLEEEEEEELLLHHHHHHLLLLLE


DSSP  EEEEEEELLLL..LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLLEEEEELL
Query QYGLARVSPPG..SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYHVQVTARD  118
ident      |       |   |   | |         ||        |               |
Sbjct LFAFVRFTTGDamSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVK.EVVQNFAKEFVISD  115
DSSP  EEEEEEEELLLllLLLEEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLLLEEEEELL


DSSP  HHHLLHHHHHHHLL............
Query EDDLDENELLMKIS............  132
ident    | ||                   
Sbjct RKELEENFIKSELKkagganydaqte  141
DSSP  HHHHLHHHHHHHHHhlllllllllll


No 6: 1M4JA  MOLECULE: A6 GENE PRODUCT;                                           

DSSP  lLLLLllhHHHHHHHHHHHHLLlllLLEEEEEELlLLLEEEEEEEL.......LHHHHLL
Query pIDYTthsREIDAEYLKIVRGSdpdTTWLIISPNaKKEYEPESTGS.......SFHDFLQ   53
ident  |                  |       | ||          |              |  
Sbjct .IQAS...EDVKEIFARARNGK...YRLLKISIE.NEQLVVGSCSPpsdsweqDYDSFVL   52
DSSP  .LLLL...HHHHHHHHHHHLLL...LLEEEEEEL.LLLEEEEEEELllllhhhHHHHHHH


DSSP  .LLLLLLLEEEEEEELllllllLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLL..LL
Query .LFDETKVQYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFK..GY  110
ident  |       | | |           | | | ||          ||  |      |     
Sbjct pLLEDKQPCYVLFRLDsqnaqgYEWIFIAWSPDHSHVRQKMLYAATRATLK.KEFGggHI  111
DSSP  hHLLLLLLEEEEEEEEeeelleEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLhhHE


DSSP  LEEEEELLHHHLLHHHHHHHLL
Query HVQVTARDEDDLDENELLMKIS  132
ident    |      |           
Sbjct KDEVFGTVKEDVSLHGYKKYLL  133
DSSP  EEEEEELLHHHHLHHHHHHHHL


No 7: 1F7SA  MOLECULE: ACTIN DEPOLYMERIZING FACTOR (ADF);                         

DSSP  ..LLLLlllHHHHHHHHHHHHHLLLllLLEEEEEEL.LLLLEEEEEEEL...LHHHHLLL
Query ..PIDYtthSREIDAEYLKIVRGSDpdTTWLIISPN.AKKEYEPESTGS...SFHDFLQL   54
ident                  |                     |    |  |        |   
Sbjct asGMAV...HDDCKLRFLELKAKRT..HRFIVYKIEeKQKQVVVEKVGQpiqTYEEFAAC   55
DSSP  llLLEE...LHHHHHHHHHHHHHLL..LLEEEEEEElLLLEEEEEEELLlllLHHHHHLL


DSSP  LLLLLLEEEEEEELLLL...LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLL
Query FDETKVQYGLARVSPPG...SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYH  111
ident        |                ||  | |||| |        |            |  
Sbjct LPADECRYAIYDFDFVTaenCQKSKIFFIAWCPDIAKVRSKMIYASSKDRFK.RELDGIQ  114
DSSP  LLLLLLEEEEEEEEEELlllLEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLL


DSSP  EEEEELLhhhllhhhhhhhll
Query VQVTARDeddldenellmkis  132
ident |   | |              
Sbjct VELQATD...........pte  124
DSSP  EEEEELL...........lll


No 8: 2D8BA  MOLECULE: TWINFILIN-1;                                               

DSSP  ........................LLLLLllHHHHHHHHHHHHHLLlllLLEEEEEEL.L
Query ........................PIDYTthSREIDAEYLKIVRGSdpdTTWLIISPN.A   35
ident                                ||       |                   
Sbjct gssgssgevqtdvsvdtkhqtlqgVAFPI..SRDAFQALEKLSKKQ...LNYVQLEIDiK   55
DSSP  llllllllllllllllllllllllLLLLL..LHHHHHHHHHHHLLL...LLLLEEEEElL


DSSP  LLLEEEEEEELLHH.HHLLLLLLLLLEEEEEEELLLL..LLLLEEEEEEELLLLLL.HHH
Query KKEYEPESTGSSFH.DFLQLFDETKVQYGLARVSPPG..SDVEKIIIIGWCPDSAP.LKT   91
ident         |      |           |              |    |   |        
Sbjct NETIILANTENTELrDLPKRIPKDSARYHFFLYKHSHegDYLESVVFIYSMPGYTCsIRE  115
DSSP  LLEEEEEELLLLLLlLHHHHLLLLLLEEEEEEEEEEEllEEEEEEEEEEELLLLLLlHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHhHLLL.....LLLEEEEELLHHHLLHHHHHHHLL......
Query RASFAANFAAVAnNLFK.....GYHVQVTARDEDDLDENELLMKIS......  132
ident |                                | |    |           
Sbjct RMLYSSCKSPLL.EIVErqlqmDVIRKIEIDNGDELTADFLYDEVHsgpssg  166
DSSP  HHHHHHLLHHHH.HHHLlllllLLLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHllllll


No 9: 1AK6A  MOLECULE: DESTRIN;                                                   

DSSP  ............LLLLlllHHHHHHHHHHHHH.......lLLLLLLEEEEEELLLLL.EE
Query ............PIDYtthSREIDAEYLKIVR.......gSDPDTTWLIISPNAKKE.YE   40
ident                      |                          |    | |    
Sbjct tmitpssgnsasGVQV...ADEVCRIFYDMKVrkcstpeeIKKRKKAVIFCLSADKKcII   57
DSSP  llllllllllllLLLL...LLHHHHHHHHLLLlllllhhhHHHHLLLEELLLLLLLLlLL


DSSP  EE..EEELL..........HHHHLLLLLLLLLEEEEEEELLLL..LLLLEEEEEEELLLL
Query PE..STGSS..........FHDFLQLFDETKVQYGLARVSPPG..SDVEKIIIIGWCPDS   86
ident  |                 |  |     |    | |   |     |  |      | |  
Sbjct VEegKEILVgdvgvtitdpFKHFVGMLPEKDCRYALYDASFETkeSRKEELMFFLWAPEL  117
DSSP  LLllLLLLLllllllllllLHHHHHLLLLLLLLLEELLLLLLLllLLLLLLLEEEELLLL


DSSP  LLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLLEEEEELLHHHLLHHHHHHHLL............
Query APLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYHVQVTARDEDDLDENELLMKIS............  132
ident ||||     |    |     | |      |    ||       |              
Sbjct APLKSKMIYASSKDAIK.KKFQGIKHECQANGPEDLNRACIAEKLGgslivafegcpv  174
DSSP  LLHHHHHLHHHHHHHHH.HHLLLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHLLllllllllllll


No 10: 2FGHA  MOLECULE: GELSOLIN;                                                  

DSSP  lllllllHHHHHHHHhhHHHLlllllLEEEEEELLlLLEEEEEeellhhhhlLLLLLLLL
Query pidytthSREIDAEYlkIVRGsdpdtTWLIISPNAkKEYEPEStgssfhdflQLFDETKV   60
ident                              |          |             |     
Sbjct ......vEHPEFLKA..GKEP.....GLQIWRVEK.FDLVPVP.....pnlyGDFFTGDA   41
DSSP  ......lLLHHHHHL..LLLL.....EEEEEEELL.LLEEELL.....hhhlLEEELLLE


DSSP  EEEEEEELLLlLLLLEEEEEEELLLLLlhhhHHLHHHHHHHHHHHLLL...LLLEEEEEL
Query QYGLARVSPPgSDVEKIIIIGWCPDSAplktRASFAANFAAVANNLFK...GYHVQVTAR  117
ident    |  |              |                 |     |     |  ||    
Sbjct YVILKTVQLR.NGILQYDLHYWLGNEC....SQDESGAAAIFTVQLDDylnGRAVQHREV   96
DSSP  EEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEELLLL....LHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEEEE


DSSP  LHHHLLH.....................................................
Query DEDDLDE.....................................................  124
ident                                                             
Sbjct QGFESATflgyfksglkykkggvasgfkhvvpnevvvqrllqvkgrrvvratevpvswes  156
DSSP  LLLLLHHhhhllllleeeellllllllllllllllllleeeeeellllleeeeelllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct fnngdcfildlgnniyqwcgsksnrferlkatqvskgirdnersgraqvsvfeegaepea  216
DSSP  llllleeeeellleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlleeeeeelllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct mlqvlgpkptlpeatenrklaklykvsngagpmvvslvadenpfaqgalrsedcfildhg  276
DSSP  hhhhhlllllllllllllllleeeeelllllllleeeeellllllhhhllllleeeeeeh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct kdgkifvwkgkqanmeerkaalktasdfiskmdypkqtqvsvlpeggetplfrqffknwr  336
DSSP  hhleeeeeelllllhhhhllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelllllhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct dpdqteglglaylsshiahvervpfdaatlhtstamaaqhgmdddgtgqkqiwrvegsnk  396
DSSP  lhhhhlllllllllhhhlllllllllhhhhhhlhhhhhhhllllllllleeeeeeellee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct vpvdpatygqfyggdsyiilynyrhgsrqgqiiynwqgaqstqdevaasailtaqldeel  456
DSSP  eellhhhlleeellleeeeeeeeelllleeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct ggtpvqsrvvqgkepahlmslfggkpmivykggtsreggqtapastrlfqvrasssgatr  516
DSSP  lllleeeeeelllllhhhhllllllleeeelllllllllllllllleeeeeeelllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct aveiipkagalnsndafvlktpsaaylwvgagaseaektgaqellrvlraqpvqvaegse  576
DSSP  eeeelllhhhllllleeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeellll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct pdsfwealggkatyrtsprlkdkkmdahpprlfacsnkigrfvieevpgefmqedlatdd  636
DSSP  lhhhhhhllllllllllllllllhhhhllleeeeeeelllleeeeeelllllhhhlllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  124
ident                                                             
Sbjct vmlldtwdqvfvwvgkdsqdeektealtsakryidtdpahrdrrtpitvvkqgfeppsfv  696
DSSP  eeeeelllleeeeelllllhhhhhlhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeelllllhhhh


DSSP  .................hhhhhhll
Query .................nellmkis  132
ident                          
Sbjct gwflgwddsywsvdpldralaelaa  721
DSSP  lllllllllhhhllhhhhhhhhhll


No 11: 2B78A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.776;                              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct miklmvgsfaekklkrgvqllssrdypnlnldnqvvqlysdadiflgtaylskqnkgvgw   60
DSSP  leeeellhhhhhhhhhllleeehhhlllllllleeeeeellllleeeeeeeeeelleeee


DSSP  ..............llLLLLLHHHHHHHHHHhhhlllLLLLEEE.EEELlllleeeeeee
Query ..............piDYTTHSREIDAEYLKivrgsdPDTTWLI.ISPNakkeyepestg   45
ident                                        ||                   
Sbjct lispkkvslnvtyfikLFQWSKDKRKNFAHS......KLTTAYRlFNQD...........  103
DSSP  eeelllllllhhhhhhHHHHHHHLLHHHHHL......LLLLEEEeEEHH...........


DSSP  llhhhhllllllLLLEEEEEEelllllllleEEEEEELLLlllHHHHHLHHHHHHHHHHH
Query ssfhdflqlfdeTKVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPDsapLKTRASFAANFAAVANN  105
ident               |                                       ||    
Sbjct ........gdsfGGVTIDCYG..........DFVLFSWYN...SFVYQIRDEIVAAFRQV  142
DSSP  ........hhllLLEEEEEEL..........LEEEEEELL...HHHHHLHHHHHHHHHHH


DSSP  LlLLLLEEEEELL.HHHL...................lhhHHHH................
Query LfKGYHVQVTARD.EDDL...................denELLM................  129
ident                                          |                  
Sbjct Y.PNFLGAYEKIRfNVSAhlygqeapeqflilengisynvFLNDglmtgifldqrqvrne  201
DSSP  L.LLLLEEEEEELlLLEEeeeelllllleeeeelleeeeeLLLLlllllllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  129
ident                                                             
Sbjct lingsaagktvlnlfsytaafsvaaamggamattsvdlakrsralslahfeanhldmanh  261
DSSP  hhhlllllleeeeelllllhhhhhhhhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhhllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  129
ident                                                             
Sbjct qlvvmdvfdyfkyarrhhltydiiiidppsfevfsvskdyhklirqgleilsengliias  321
DSSP  eeeellhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhleeeeeeeeee


DSSP  ....................................................hll
Query ....................................................kis  132
ident                                                        
Sbjct tnaanmtvsqfkkqiekgfgkqkhtyldlqqlpsdfavnvqdessnylkvftikv  376
DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeeellllllllllllhhhllleeeeeel


No 12: 2NUPA  MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23A;                          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tylefiqqneerdgvrfswnvwpssrleatrmvvpvaalftplkerpdlppiqyepvlcs   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhleeellleelllhhhhllllllleeeellllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rttcravlnplcqvdyraklwacnfcyqrnqfppsyagiselnqpaellpqfssieyvvl  120
DSSP  lllllllllllleeelllleeelllllleeellhhhlllllllllhhhlhhhlleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rgpqmpliflyvvdtcmededlqalkesmqmslsllpptalvglitfgrmvqvhelgceg  180
DSSP  llllllleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeelleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct isksyvfrgtkdlsakqlqemlgpppsnrflqpvqkidmnltdllgelqrdpwpvpqgkr  240
DSSP  lleeeeeelllllllhhhhhhhllllllllleehhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct plrssgvalsiavgllectfpntgarimmfiggpatqgpgmvvgdelktpirswhdidkd  300
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllllllhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nakyvkkgtkhfealanraattghvidiyacaldqtgllemkccpnltggymvmgdsfnt  360
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllllhhhhlhhhhhlllleeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct slfkqtfqrvftkdmhgqfkmgfggtleiktsreikisgaigpcvslnskgpcvseneig  420
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeeellleeeeeeellleellllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tggtcqwkicglsptttlaiyfevvggrgaiqfvtqyqhssgqrrirvttiarnwadaqt  480
DSSP  llllleeeeeeellllleeeeeeelllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeellhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qiqniaasfdqeaaailmarlaiyraetedvlrwldrqlirlcqkfgeyhkddpssfrfs  540
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeelleeeeeell


DSSP  ...................lllllllhhhhhhhhhhhhHLLL.LLLL..EEEEEElLLLL
Query ...................pidytthsreidaeylkivRGSD.PDTT..WLIISPnAKKE   38
ident                                                             
Sbjct etfslypqfmfhlrrssflqvfnnspdessyyrhhfmrQDLTqSLIMiqPILYAYsFSGP  600
DSSP  lllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhllLLHHhHHHHhlLEEEEElLLLL


DSSP  EEEEEEellhhhhllLLLLLLLEEEEEEelllllllleEEEEEELLLLLLHhhhHLHHHH
Query YEPESTgssfhdflqLFDETKVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPDSAPLktrASFAAN   98
ident  ||                                     |                   
Sbjct PEPVLL......dssSILADRILLMDTF..........FQILIYHGETIAQenfRHLLQA  644
DSSP  LEELLL......lhhHLLLLLEEEEEEL..........LEEEEEELLLLLLlhhHHHHLH


DSSP  HHHHHHhLLLL....lLEEEEELL.HHHLL.................hhhhhhhll
Query FAAVANnLFKG....yHVQVTARD.EDDLD.................enellmkis  132
ident     |                                                   
Sbjct PVDDAQ.EILHsrfpmPRYIDTEHgGSQARfllskvndvslqvfmdhlkklavssa  699
DSSP  HHHHHH.HHHHhllllLEEEEEELlLHHHHhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllll


No 13: 1SVQA  MOLECULE: SEVERIN;                                                   

DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllLLLEEEEE..elllLLEEEEEEellhhhhLLLLLLL
Query pidytthsreidaeylkivrgsdpDTTWLIIS..pnakKEYEPESTgssfhdfLQLFDET   58
ident                                                             
Sbjct ........................EYKPRLLHisgdknAKVAEVPL......aTSSLNSG   30
DSSP  ........................LLLEEEEEeellllLEEEEELL......lLLLLLLL


DSSP  LLEEEEEEelllllllleEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHLLLLLlEEEEELL
Query KVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANNLFKGYhVQVTARD  118
ident       |             |                |    |                 
Sbjct DCFLLDAG..........LTIYQFNGSKSSPQEKNKAAEVARAIDAERKGLP.KVEVFCE   79
DSSP  LEEEEEEL..........LEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL.EEEELLL


DSSP  .hHHLLHHhhhhhll
Query .eDDLDENellmkis  132
ident    |           
Sbjct tdSDIPAEfwkllgg   94
DSSP  llLLLLHHhhhhhll


No 14: 1HH1A  MOLECULE: HOLLIDAY JUNCTION RESOLVING ENZYME HJC;                    

DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEEEEllllleeeeeeellhhhhlllllllll
Query pidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIISPnakkeyepestgssfhdflqlfdetkv   60
ident                                                             
Sbjct ..........savernivsrlrdkgfAVVRAPA.........................pi   25
DSSP  ..........lhhhhhhhhhhhhlllEEEELLL.........................ll


DSSP  eEEEEEELllllllLEEEEEEELLLL...llhhhHHLHHHHHHHHHHHllLLLLeEEEEL
Query qYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDS...aplktRASFAANFAAVANNlfKGYHvQVTAR  117
ident     |           || |              |   |      |     |        
Sbjct pDIIALKN......GVIILIEMKSRKdiegkiyvRREQAEGIIEFARK..SGGS.LFLGV   76
DSSP  lLEEEEEL......LEEEEEEELLEEllllleeeLHHHHHHHHHHHHH..HLLE.EEEEE


DSSP  L...HHHL.......................LHHHHHHHLL........
Query D...EDDL.......................DENELLMKIS........  132
ident                                |   |             
Sbjct KkpgVLKFipfeklrrtetgnyvadseieglDLEDLVRLVEakisrtld  125
DSSP  ElllLEEEeehhhleellllleellllllllLHHHHHHHHHhhhhhhhl


No 15: 1USHA  MOLECULE: 5'-NUCLEOTIDASE;                                           

DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhHLLL.....................................
Query pidytthsreidaeylkivRGSD.....................................   23
ident                       |                                     
Sbjct ...................YEQDktykitvlhtndhhghfwrneygeyglaaqktlvdgi   41
DSSP  ...................LLLLleeeeeeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ................lllleeeeeellllleeeeeeellhHHHL...............
Query ................pdttwliispnakkeyepestgssfHDFL...............   52
ident                                                             
Sbjct rkevaaeggsvlllsggdintgvpesdlqdaepdfrgmnlvGYDAmaignhefdnpltvl  101
DSSP  hhhhhhllleeeeeellllllllhhhhllllhhhhhhhhhhLLLEeellhhhhlllhhhh


DSSP  ........LLLL...........llllEEEEEEELllllllLEEEEEEELLLL.......
Query ........QLFD...........etkvQYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDS.......   86
ident                               |             |               
Sbjct rqqekwakFPLLsaniyqkstgerlfkPWALFKRQ......DLKIAVIGLTTDdtakign  155
DSSP  hhhhhhllLLEEllleeelllleelllLEEEEEEL......LEEEEEEEEELLlllllll


DSSP  ......lLHHHHHLHHHHHHHHHHHLLLlLLEEEEELL......................
Query ......aPLKTRASFAANFAAVANNLFKgYHVQVTARD......................  118
ident             |  |           |       |                        
Sbjct peyftdiEFRKPADEAKLVIQELQQTEK.PDIIIAATHmghydngehgsnapgdvemara  214
DSSP  lllllleEELLHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLEEEEEEEllllhhhllllllllhhhhhhh


DSSP  .................................................hhhllhhhhhH
Query .................................................eddldenellM  129
ident                                                             
Sbjct lpagslamivgghsqdpvcmaaenkkqvdyvpgtpckpdqqngiwivqahewgkyvgraD  274
DSSP  llllllleeellllllllleeelleelllllllllllleeelleeeellllllleeeeeE


DSSP  HLL.........................................................
Query KIS.........................................................  132
ident                                                             
Sbjct FEFrngemkmvnyqlipvnlkkrvlytpeiaenqqmisllspfqnkgkaqlevkigetng  334
DSSP  EEEelleeeeeeeeeeellllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct rlegdrdkvrfvqtnmgrlilaaqmdrtgadfavmsgggirdsieagdisyknvlkvqpf  394
DSSP  lllllhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeehhhllllllleeeehhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct gnvvvyadmtgkevidyltavaqmkpdsgaypqfanvsfvakdgklndlkikgepvdpak  454
DSSP  lleeeeeeeehhhhhhhhhhhlllllllllleeeeleeeeeelleeeeeeelleelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct tyrmatlnfnatggdgyprldnkpgyvntgfidaevlkayiqksspldvsvyepkgevsw  514
DSSP  eeeeeeehhhhllhhhllllllllleeeeeeehhhhhhhhhhhhllllhhhhllllleee


DSSP  .
Query .  132
ident  
Sbjct q  515
DSSP  l


No 16: 1OD2A  MOLECULE: ACETYL-COENZYME A CARBOXYLASE;                             

DSSP  ............................lllllllhhhhhhhhhhhhhlLLLLlLEEEEE
Query ............................pidytthsreidaeylkivrgSDPDtTWLIIS   32
ident                                                   |         
Sbjct atpypvkewlqpkrykahlxgttyvydfpelfrqasssqwknfsadvklTDDFfISNELI   60
DSSP  llllllhhhhlhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLeEEEEEE


DSSP  ELLLLLEEEEEEellhhhhllllLLLLLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHhHH
Query PNAKKEYEPESTgssfhdflqlfDETKVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLkTR   92
ident      |                            |  |                      
Sbjct EDENGELTEVER.......epgaNAIGXVAFKITVKTPEYPRGRQFVVVANDITFKIgSF  113
DSSP  ELLLLLEEEELL.......llllLLLLEEEEEEEEEELLEEEEEEEEEEEELLLHHHhLL


DSSP  HL.HHHHHHHHhHHLL..LLLLeEEEELL...............................
Query AS.FAANFAAVaNNLF..KGYHvQVTARD...............................  118
ident        |  |        |                                        
Sbjct GPqEDEFFNKV.TEYArkRGIP.RIYLAAnsgarigxaeeivplfqvawndaanpdkgfq  171
DSSP  LHhHHHHHHHH.HHHHhhHLLL.EEEEEEllllllllllllhhhleeeelllllhhhlee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  118
ident                                                             
Sbjct ylyltsegxetlkkfdkensvltertvingeerfviktiigsedglgveclrgsgliaga  231
DSSP  eeeelhhhhhhlhhhllllleellllllllllleelleellllllllhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  118
ident                                                             
Sbjct tsrayhdiftitlvtcrsvgigaylvrlgqraiqvegqpiiltgapainkxlgrevytsn  291
DSSP  hhhhllllleeeeeeeeeelhhhhhhhhllleeeelllleelllhhhhhhhlllllllll


DSSP  ....................hhhlLHHHHHHHLL..........................
Query ....................eddlDENELLMKIS..........................  132
ident                                  |                          
Sbjct lqlggtqixynngvshltavddlaGVEKIVEWXSyvpakrnxpvpiletkdtwdrpvdft  351
DSSP  hhhhlhhhhhhhlllleeellhhhHHHHHHHHHLllllllllllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct ptndetydvrwxiegretesgfeyglfdkgsffetlsgwakgvvvgrarlggiplgvigv  411
DSSP  llllllllhhhhhheeeelleeeelllllllleeellllllleeeeeeeelleeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct etrtvenlipadpanpnsaetliqepgqvwhpnsafktaqaindfnngeqlpxxilanwr  471
DSSP  lllleeeeellllllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct gfsggqrdxfnevlkygsfivdalvdykqpiiiyipptgelrggswvvvdptinadqxex  531
DSSP  lllllhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeelllleeehhhhhlllhhhhllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct yadvnaragvlepqgxvgikfrreklldtxnrlddkyrelrsqlsnkslapevhqqiskq  591
DSSP  eeellleeelllhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct ladrerellpiygqislqfadlhdrssrxvakgviskelewtearrfffwrlrrrlneey  651
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhllllleeelhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct likrlshqvgeasrlekiarirswypasvdheddrqvatwieenyktlddklkglklesf  711
DSSP  hhhhlllllllllhhhhhhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ........
Query ........  132
ident         
Sbjct aqdlakki  719
DSSP  lhhhhlll


No 17: 2CWWA  MOLECULE: PUTATIVE SAM-DEPENDENT RNA METHYLTRANSFERASE;              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mriqvnakgaarllsrhlwvfrrdvvsgpetpglypvywgrrflalalynphtdlavray   60
DSSP  lleeelhhhhhhhhlllleeehhheeellllleeeeeeelleeeeeeeellllleeeeee


DSSP  .........llLLLLLHHHHHHHHHHHhHLLLlllLEEE.EEELlllleeeeeeellhhh
Query .........piDYTTHSREIDAEYLKIvRGSDpdtTWLI.ISPNakkeyepestgssfhd   50
ident                             |                               
Sbjct rfapaedpvaaLLENLAQALARREAVL.RQDP..eGGYRlVHAE................  101
DSSP  ellllllhhhhHHHHHHHHHHHHHLLL.LLLL..lLEEEeEEHH................


DSSP  hlllllllLLEEEEEEelllllllleEEEEEELLllllhhhHHLHHHHHHHHHHhLLLL.
Query flqlfdetKVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPdsaplktRASFAANFAAVANnLFKG.  109
ident                                                    ||       
Sbjct ...gdllpGLVVDYYA..........GHAVVQAT.......AHAWEGLLPQVAE.ALRPh  140
DSSP  ...hhlllLEEEEEEL..........LEEEEEEL.......LHHHHLLHHHHHH.HHLLl


DSSP  LLEEEEELL..........HHHL.lhhhHHHHL...........................
Query YHVQVTARD..........EDDL.deneLLMKI...........................  131
ident         |                                                   
Sbjct VQSVLAKNDartreleglpLYVRpllgeVPERVqvqegrvrylvdlgayldqrenrlyme  200
DSSP  LLEEEEEELlhhhhlllllLEEEeeeelLLLLEeeeelleeeeelllllhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  131
ident                                                             
Sbjct rfrgeraldvfsyaggfalhlalgfrevvavdssaealrraeenarlnglgnvrvleana  260
DSSP  hlleeeeeeelllllhhhhhhhlleeeeeeeellhhhhhhhhhhhhlllllleeeeellh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  131
ident                                                             
Sbjct fdllrrlekegerfdlvvldppafakgkkdverayraykevnlraikllkeggilatasc  320
DSSP  hhhhhhhhhlllleeeeeellllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeeeeeeel


DSSP  .......................................................l
Query .......................................................s  132
ident                                                         
Sbjct shhmteplfyamvaeaaqdahrllrvvekrgqpfdhpvllnhpethylkfavfqvl  376
DSSP  lllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeellllllllllllhhhllleeeeeeel


No 18: 2AS0A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1915;                               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xarvvvdaqaaraigkgaxivfkkgvvrvegdikpgdivevytrggkflgkgfanpnsni   60
DSSP  lleeeelhhhhhhhhlllleeehhheeeeellllllleeeeeelllleeeeeeellllle


DSSP  ...........llLLLLlhHHHHHHHHHhhhlLLLLL..LEEEEEelllllEEEEeeell
Query ...........piDYTThsREIDAEYLKivrgSDPDT..TWLIISpnakkeYEPEstgss   47
ident                    | |              |                       
Sbjct xvrivtkdkdveiNKDLfkRRIKKANEY.rkkVLKYTnvYRXVYG......EADY.....  108
DSSP  eeeeeelllllllLHHHhhHHHHHHHHH.hhhLLLLLleEEEEEH......HHHL.....


DSSP  hhhhllllllllLEEEEEEEllllllllEEEEEEELlllllhhhHHLHHHHHHHHHhHLL
Query fhdflqlfdetkVQYGLARVsppgsdveKIIIIGWCpdsaplktRASFAANFAAVAnNLF  107
ident                              |               |        ||    
Sbjct ..........lpGLIVDRFN........DIASLQIS........SAGXERFKLDVA.EAI  141
DSSP  ..........llLEEEEEEL........LEEEEEEL........LHHHHLLHHHHH.HHH


DSSP  L.....LLLEEEEELL........HHHLlhhhhhHHLL......................
Query K.....GYHVQVTARD........EDDLdenellMKIS......................  132
ident          |                         |                        
Sbjct XevepgIETVFEKNTGrsrrreglPEIErvllgkEKYRtiiqegrakfivdxrgqktgff  201
DSSP  HhhlllLLEEEEEELLhhhhhlllLLEEeeeeelLLLEeeeeelleeeeeelllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct ldqrenrlalekwvqpgdrvldvftytggfaihaaiagadevigidkspraietakenak  261
DSSP  lllhhhhhhhhhhllllleeeellllllhhhhhhhhlllleeeeeellhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct lngvedrxkfivgsafeexeklqkkgekfdivvldppafvqhekdlkaglrayfnvnfag  321
DSSP  hlllhhheeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct lnlvkdggilvtcscsqhvdlqxfkdxiiaagakagkflkxlepyrtqapdhpilxaskd  381
DSSP  hlleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllllllllllllhh


DSSP  ...............
Query ...............  132
ident                
Sbjct teylkclflyvedxr  396
DSSP  hllleeeeeeeeell


No 19: 1B49A  MOLECULE: PROTEIN (DEOXYCYTIDYLATE HYDROXYMETHYLASE);                

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct misdsmtveeirlhlglalkekdfvvdktgvktieiigasfvadepfifgalndeyiqre   60
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllleellllleeeeeeeeeeelllllllllllhhhhhhh


DSSP  .................................llLLLLLH.....HHHHHHHHHHhhLL
Query .................................piDYTTHS.....REIDAEYLKIvrGS   22
ident                                                  |        | 
Sbjct lewykskslfvkdipgetpkiwqqvasskgeinsnYGWAIWsednyAQYDMCLAEL..GQ  118
DSSP  hhhhhhllllhhhllllllhhhhhhllllllllllHHHHHHlhhhlLHHHHHHHHH..HH


DSSP  LLLL.lEEEEEELLLlleeeeeeellhhhhlllllLLLL.EEEEEEELllllllLEEEEE
Query DPDT.tWLIISPNAKkeyepestgssfhdflqlfdETKV.QYGLARVSppgsdvEKIIII   80
ident  ||      |                                             ||   
Sbjct NPDSrrGIMIYTRPS........mqfdynkdgmsdFMCTnTVQYLIRD......KKINAV  164
DSSP  LLLLllLEEELLLLL........hhhhllhhhlllLLLEeEEEEEEEL......LEEEEE


DSSP  EELLllllhHHHH..LHHHHHHHHHHhLLLL...............LLEEEEELL.....
Query GWCPdsaplKTRA..SFAANFAAVANnLFKG...............YHVQVTARD.....  118
ident                 |    |                                      
Sbjct VNMR.....SNDVvfGFRNDYAWQKY.VLDKlvsdlnagdstrqykAGSIIWNVGslhvy  218
DSSP  EEEE.....EEELllHHHHHHHHHHH.HHHHhhhhhhhhlllllleEEEEEEEEEeeeee


DSSP  .........hhhllhhhhhhhll
Query .........eddldenellmkis  132
ident                        
Sbjct srhfylvdhwwktgethiskkdy  241
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllllllllll


No 20: 2JC4A  MOLECULE:;                                                           

DSSP  .............................lllllllhhhhhhhhhhhhhllLLLL.....
Query .............................pidytthsreidaeylkivrgsDPDT.....   26
ident                                                             
Sbjct mkittwnvnslnvrlpqvqnlladnppdilvlqelkldqdkfpaaalqmmgWHCVwsgqk   60
DSSP  leeeeeelllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllhhhllhhhhhlllLEEEeelll


DSSP  ..............LEEEEeelllLLEEeeeeellhhhhlllllllllEEEEEEELllll
Query ..............TWLIIspnakKEYEpestgssfhdflqlfdetkvQYGLARVSppgs   72
ident                                                     | ||    
Sbjct tyngvaivsrsvpqDVHFGlpalpDDPQ...................rRVIAATVS....   97
DSSP  lllleeeeelllleEEEELlllllLLLL...................lLEEEEEEL....


DSSP  llLEEEEEEELLLL.....lLHHHHHLHHHHHHHHHHhLLLL...lLEEEEELL......
Query dvEKIIIIGWCPDS.....aPLKTRASFAANFAAVANnLFKG...yHVQVTARD......  118
ident       |   |           |      |                 |            
Sbjct ..GVRVINVYCVNGealdspKFKYKEQWFAALTEFVR.DEMTrhgkLVLLGDFNiapada  154
DSSP  ..LEEEEEEELLLLlllllhHHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLllllEEEEEELLllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  118
ident                                                             
Sbjct dcydpekwhekihcssverqwfqnlldlgltdslrqvhpegafytwfdyrgamfqrklgl  214
DSSP  hlllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlllleehhhhhlllllllllllllllhhhhllll


DSSP  HHHL..............................LHHHhhhhll
Query EDDL..............................DENEllmkis  132
ident   |                                         
Sbjct RIDHilvspamaaalkdvrvdletralerpsdhaPVTA..efdw  256
DSSP  LLEEeeelhhhhlleeeeeelhhhhlllllllllLEEE..eell


No 21: 1OB8A  MOLECULE: HOLLIDAY-JUNCTION RESOLVASE;                               

DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEEEEllllleeeeeeellhhhhlllllllll
Query pidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIISPnakkeyepestgssfhdflqlfdetkv   60
ident                               |                             
Sbjct .........gknaerelvsilrgegfNAVRIPT........................npl   27
DSSP  .........lhhhhhhhhhhhhhlllEEEELLL........................lll


DSSP  eEEEEEELllllllLEEEEEEELLLLllhhhhhLHHHHHHHHHHHLLL...LLLEEEEEL
Query qYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDSaplktraSFAANFAAVANNLFK...GYHVQVTAR  117
ident     |              |                                  |   | 
Sbjct pDIFATKG......NTLLSIECKSTW...enkvKVKEHQVRKLLDFLSmftMKGVPLIAI   78
DSSP  lLEEEEEL......LEEEEEEEEEEL...lleeEELHHHHHHHHHHHHlllLEEEEEEEE


DSSP  L.....HHHL.................LHHHHHHHLL....
Query D.....EDDL.................DENELLMKIS....  132
ident       |                        |         
Sbjct KfkqvhEWRVlvpekaediivtidnsiPIEDLFKILEkrie  119
DSSP  EehhhlEEEEellllllleeeelllleEHHHHHHHHHhhhl


No 22: 1H65A  MOLECULE: CHLOROPLAST OUTER ENVELOPE PROTEIN OEP34;                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vrewsgintfapatqtkllellgnlkqedvnsltilvxgkggvgksstvnsiigervvsi   60
DSSP  leelhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeelllllhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct spfqsegprpvxvsrsragftlniidtpglieggyindxalniiksflldktidvllyvd  120
DSSP  lllllllllleeeeeeelleeeeeeelllleelleelhhhhhhhhhhlllleeleeeeee


DSSP  ...LLLLlllHHHHHHHHHHHhhLLLLLlleeeeeellllleeeeeeellhhhhllllll
Query ...PIDYtthSREIDAEYLKIvrGSDPDttwliispnakkeyepestgssfhdflqlfde   57
ident                     |                                       
Sbjct rldAYRV...DNLDKLVAKAI..TDSFG................................  143
DSSP  ellLLLL...LHHHHHHHHHH..HHHHL................................


DSSP  llleeeeeeelllllllLEEEEEEELLLlLLHH....HHHLHHHHHHHHHhHLLL.....
Query tkvqyglarvsppgsdvEKIIIIGWCPDsAPLK....TRASFAANFAAVAnNLFK.....  108
ident                   | |                    |     |            
Sbjct .............kgiwNKAIVALTHAQ.FSPPdglpYDEFFSKRSEALL.QVVRsgasl  188
DSSP  .............hhhhHHEEEEEELLL.LLLHhhllHHHHHHHHHHHHH.HHHHhhlll


DSSP  ......LLLEEEEELL.................HHHL.LHHHHHHHLL............
Query ......GYHVQVTARD.................EDDL.DENELLMKIS............  132
ident            |                                                
Sbjct kkdaqaSDIPVVLIENsgrcnkndsdekvlpngIAWIpHLVQTITEVAlnksesifvdkn  248
DSSP  llllhhHLLLEEELLLlllllllllllllllllLLHHhHHHHHHHHHHlllllleellhh


DSSP  .........
Query .........  132
ident          
Sbjct lidklaaad  257
DSSP  hhhhhhhll


No 23: 2UYXA  MOLECULE: BETA-LACTAMASE II;                                         

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ktviknetgtisisqlnknvwvhtelgsavpsnglvlntskglvlvdsswddkltkelie   60
DSSP  lleeellllleeeeeeelleeeeeeeelleeeeeeeeeelleeeeelllllhhhhhhhhh


DSSP  ...........................................lllllllhhhhhhhhhh
Query ...........................................pidytthsreidaeylk   17
ident                                                             
Sbjct mvekkfqkrvtdviithahasriggiktlkergikahstaltaelakkngyeeplgdlqt  120
DSSP  hhhhhhllleeeeelllllhhhhllhhhhhhllleeellhhhhhhhhhllllllllllll


DSSP  hhhllLLLLLEEEEEellllleeeeeeellhhhhlllllllLLEEEEEEEllllllllEE
Query ivrgsDPDTTWLIISpnakkeyepestgssfhdflqlfdetKVQYGLARVsppgsdveKI   77
ident                                                             
Sbjct vtnlkFGNMKVETFY...................pgkghteDNIVVWLPQ........YN  153
DSSP  eeeeeELLEEEEEEL...................lllllllLLLEEEELL........LL


DSSP  EEEEEL........lLLLL.HHHHHLHHHHHHHHhHHLLLLLLEEEEElLHHH...llhh
Query IIIGWC........pDSAP.LKTRASFAANFAAVaNNLFKGYHVQVTArDEDD...lden  125
ident |  | |                           |           |              
Sbjct ILVGGClvkstsakdLGNVaDAYVNEWSTSIENV.LKRYRNINAVVPG.HGEVgdkglll  211
DSSP  EEEEELlllllllllLLLLlLLLHHHHHHHHHHH.HHHLLLLLEEEEL.LLLLlllhhhh


DSSP  hhhhhll
Query ellmkis  132
ident        
Sbjct htldllk  218
DSSP  hhhhhll


No 24: 2GIAB  MOLECULE: MITOCHONDRIAL RNA-BINDING PROTEIN 2;                       

DSSP  .........................................................LLL
Query .........................................................PID    3
ident                                                             
Sbjct slpkfeihdvrddpaegtmtrvavdgklllisqypqlgprkvdpndlspqfdadrriSVR   60
DSSP  llleeeeeellllhhhleeeeeeeelleeeeeeeelllllllllllllllllhhhleEEE


DSSP  LlllHHHHHHHHHHHHHLLlllLLEEEEEELlllleeeeeeellhhhhlllllllLLEEE
Query YtthSREIDAEYLKIVRGSdpdTTWLIISPNakkeyepestgssfhdflqlfdetKVQYG   63
ident          |                                                  
Sbjct L...RHVDLAYLVGVCKER...VPRHRMETK........................AYTLD   90
DSSP  L...LHHHHHHHHHHHLLL...LLEEEEELL........................LLEEE


DSSP  EEEELlllllllEEEEEEELlllLLHHhhHLHHhhhhhhhhhlllllleeeeellhhhll
Query LARVSppgsdveKIIIIGWCpdsAPLKtrASFAanfaavannlfkgyhvqvtardeddld  123
ident                  |                                          
Sbjct FEKSA......qGYHLHGKV..hRVAS..QRME...dwsvkfdnhfavtlehflesalde  137
DSSP  EEELL......lEEEEEEEE..lLLLL..LLLE...eeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhll
Query enellmkis  132
ident          
Sbjct sfgfrqhya  146
DSSP  lllhhhhhl


No 25: 2B7LA  MOLECULE: GLYCEROL-3-PHOSPHATE CYTIDYLYLTRANSFERASE;                 

DSSP  .........lLLLLllhHHHHHHHHHHHHLlllllleeeeeellllleeeeeeellhhhh
Query .........pIDYTthsREIDAEYLKIVRGsdpdttwliispnakkeyepestgssfhdf   51
ident                                                             
Sbjct mkrvitygtyDLLH...YGHIELLRRAREM..............................   27
DSSP  lleeeeeellLLLL...HHHHHHHHHHHHL..............................


DSSP  llllllllleeeeeeelllllllLEEEEEEEL...LLLLLHHHhHLHHHHHHHHHHHlLL
Query lqlfdetkvqyglarvsppgsdvEKIIIIGWC...PDSAPLKTrASFAANFAAVANNlFK  108
ident                           |              |                  
Sbjct ......................gDYLIVALSTdefNQIKHKKS.YYDYEQRKMMLES.IR   63
DSSP  ......................lLEEEEEEELhhhHHHLLLLL.LLLHHHHHHHHHL.LL


DSSP  LLLEEEEELLHHhLLHHHHHHHL.............................l
Query GYHVQVTARDEDdLDENELLMKI.............................s  132
ident                |                                     
Sbjct YVDLVIPEKGWG.QKEDDVEKFDvdvfvmghdwegefdflkdkceviylkrte  115
DSSP  LLLEEEEELLHH.HHHHHHHHLLlleeeelhhhllllhhhlllleeeelllll


No 26: 1MD9A  MOLECULE: 2,3-DIHYDROXYBENZOATE-AMP LIGASE;                          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xlkgftpwpdelaetyrkngcwagetfgdllrdraakygdriaitcgnthwsyreldtra   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlllleeeeelleeeehhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct drlaagfqklgiqqkdrvvvqlpnikeffevifalfrlgalpvfalpshrsseityfcef  120
DSSP  hhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhlleeeellllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aeaaayiipdaysgfdyrslarqvqsklptlkniivageaeeflpledlhtepvklpevk  180
DSSP  lleeeeeeeleelleehhhhhhhhhhhlllllleeeelllllleehhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ssdvaflqlsggstglskliprthddyiyslkrsvevcwldhstvylaalpxahnyplss  240
DSSP  llleeeeeellllllllleeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pgvlgvlyaggrvvlspspspddafplierekvtitalvpplaxvwxdaassrrddlssl  300
DSSP  lhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qvlqvggakfsaeaarrvkavfgctlqqvfgxaeglvnytrlddpeeiivntqgkpxspy  360
DSSP  leeeeelllllhhhhllhhhhllleeeeeeeelleeeeellllllhhhhhhllleellll


DSSP  ......................................................llllll
Query ......................................................pidytt    6
ident                                                             
Sbjct desrvwddhdrdvkpgetghlltrgpytirgyykaeehnaasftedgfyrtgdivrltrd  420
DSSP  leeeeellllllllllleeeeeeelllllllllllhhhhhlllllllleeeeeeeeelll


DSSP  lhhhhhhhhhHHHHlllLLLLE..EEEEellllleeeeeeellhhhhllllllllLEEEE
Query hsreidaeylKIVRgsdPDTTW..LIISpnakkeyepestgssfhdflqlfdetkVQYGL   64
ident                                                             
Sbjct gyivvegrakDQINrggEKVAAeeVENH....................llahpavHDAAX  460
DSSP  lleeeeeehhHLEElllLEELHhhHHHH....................hhlllleEEEEE


DSSP  EEELLlLLLLLEEEEEEELlllllhhhHHLHHhHHHHHHHHL.......llLLLEEEEEL
Query ARVSPpGSDVEKIIIIGWCpdsaplktRASFAaNFAAVANNL.......fkGYHVQVTAR  117
ident           |                |       |     |                  
Sbjct VSXPD.QFLGERSCVFIIP........RDEAP.KAAELKAFLrerglaaykIPDRVEFVE  510
DSSP  EEEEE.LLLEEEEEEEEEE........LLLLL.LHHHHHHHHhhllllhhhLLLEEEELL


DSSP  LHH.........hlLHHHHHHHLL..
Query DED.........dlDENELLMKIS..  132
ident                      |    
Sbjct SFPqtgvgkvskkaLREAISEKLLag  536
DSSP  LLLllllllllhhhHHHHHHHHHHhl


No 27: 1KO2A  MOLECULE: VIM-2 METALLO-BETA-LACTAMASE;                              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eyptvseipvgevrlyqiadgvwshiatqsfdgavypsnglivrdgdelllidtawgakn   60
DSSP  lllllllllllleeeeeeelleeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeelleeeeelllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct taallaeiekqiglpvtravsthfhddrvggvdvlraagvatyaspstrrlaevegneip  120
DSSP  hhhhhhhhhhhlllleeeeelllllhhhhllhhhhhhllleeeelhhhhhhhhhhlllll


DSSP  .......lLLLLllhhhHHHHhhhhhhlllllLLEEEEEellllleeeeeeellhhhhll
Query .......pIDYTthsreIDAEylkivrgsdpdTTWLIISpnakkeyepestgssfhdflq   53
ident                                                             
Sbjct thsleglsSSGD.....AVRF...........GPVELFY...................pg  145
DSSP  leelllllLLLL.....EEEE...........LLEEEEL...................ll


DSSP  lllllLLEEEEEEEllllllllEEEEEEEL.........lLLLLHHHHHLHHHHHHHHHH
Query lfdetKVQYGLARVsppgsdveKIIIIGWC.........pDSAPLKTRASFAANFAAVAN  104
ident                            |                    |           
Sbjct aahstDNLVVYVPS........ASVLYGGXaiyelsrtsaGNVADADLAEWPTSIERIQQ  197
DSSP  lllllLLLEEEELL........LLEEEEELllllllllllLLLLLLLLLLHHHHHHHHHH


DSSP  hLLLLLLEEEEEllHHHL........lhhhhhhhll
Query nLFKGYHVQVTArdEDDL........denellmkis  132
ident                                     
Sbjct .HYPEAQFVIPG..HGLPggldllkhttnvvkahtn  230
DSSP  .HLLLLLEEEEL..LLLLlllhhhhhhhhhhhhhhl


No 28: 2E87A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1320;                               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xrnpferxptvltadelidkafrraekaassfkprgnkvkkarlreelrvrtvsnvvrdn   60
DSSP  lllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct lrkvlertpglstlpkfyqelvdvlvdrdtfhkaxagidwairiireleeryverirysn  120
DSSP  hhhhhhhlllhhhllhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dpneiaelrrqfygrvasvlrdiddrlrylnkarevlkdlpvvdleiptvviaghpnvgk  180
DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhllllllllleeeeellllllh


DSSP  .............................................lLLLLL....LHHHH
Query .............................................pIDYTT....HSREI   11
ident                                                            |
Sbjct stllkalttakpeiasypfttrginvgqfedgyfryqiidtpglldRPISErneiEKQAI  240
DSSP  hhhhhhhllllleeelllllllleeeeeeeelleeeeeeellllllLLLLLllhhHHHHH


DSSP  HHHHHHHHhllllllleeeeeellllleeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeellll
Query DAEYLKIVrgsdpdttwliispnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppg   71
ident  |                                                          
Sbjct LALRYLGN....................................................  248
DSSP  HHHHHLLL....................................................


DSSP  lllleEEEEEELLL.LLLHhHHHLHHHHHHHHHHhLLLLLLEEEEELL............
Query sdvekIIIIGWCPD.SAPLkTRASFAANFAAVANnLFKGYHVQVTARD............  118
ident       ||    |               |  |    ||     |                
Sbjct .....LIIYIFDPSeHCGF.PLEEQIHLFEEVHG.EFKDLPFLVVINKidvadeenikrl  301
DSSP  .....EEEEEELLLlLLLL.LHHHHHHHHHHHHH.HLLLLLEEEEELLlllllhhhhhhh


DSSP  ............HHHL....LHHHHHHHLL.........................
Query ............EDDL....DENELLMKIS.........................  132
ident                             |                          
Sbjct ekfvkekglnpiKISAlkgtGIDLVKEEIIktlrplaekvarekierelrryrsy  356
DSSP  hhhhhhllllleELLLllllLHHHHHHHHHhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllll


No 29: 1QSMA  MOLECULE: HPA2 HISTONE ACETYLTRANSFERASE;                            

DSSP  .LLLL.....................lllhhhhhhhhhhhhhllLLLLLEEEEE...elL
Query .PIDY.....................tthsreidaeylkivrgsDPDTTWLIIS...pnA   35
ident   |                                         ||              
Sbjct dNITVrfvtendkegwqrlwksyqdfyevsfpddlddfnfgrflDPNIKMWAAVavessS   60
DSSP  lLEEEeellhhhhhhhhhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhLLLLLEEEEEeeellL


DSSP  LLLeeeeeeellhhhhllllllllLEEEEEEELLLLLLLLEEEE.EEELlllllHHHHHL
Query KKEyepestgssfhdflqlfdetkVQYGLARVSPPGSDVEKIII.IGWCpdsapLKTRAS   94
ident  |                                      || |             |  
Sbjct EKI....................iGMINFFNHMTTWDFKDKIYInDLYV....dENSRVK   96
DSSP  LLE....................eEEEEEEEELLLLLLLLEEEEeEEEE....lHHHLLL


DSSP  hhHHHHHHHHhLLLL........lLEEE...........eellhhhllhhhhhhhll
Query faANFAAVANnLFKG........yHVQV...........tardeddldenellmkis  132
ident                                                          
Sbjct ..GAGGKLIQ.FVYDeadklgtpsVYWCtdesnhraqllyvkvgykapkilykrkgy  150
DSSP  ..LHHHHHHH.HHHHhhhhlllllEEEEeelllhhhhhhhhhheeelleeeeeelll


No 30: 1GEFA  MOLECULE: HOLLIDAY JUNCTION RESOLVASE;                               

DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEEEEllllleeeeeeellhhhhlllllllll
Query pidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIISPnakkeyepestgssfhdflqlfdetkv   60
ident                                                             
Sbjct .....myrkgaqaerelikllekhgfAVVRSAG........................skk   31
DSSP  .....llhhhhhhhhhhhhhhhhlllEEEELHH........................hll


DSSP  eEEEEEELllllllLEEEEEEELLLL.llhhHHHLHHHHHHHHHhHLLLlllEEEEELL.
Query qYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDS.aplkTRASFAANFAAVAnNLFKgyhVQVTARD.  118
ident     |          |   |                           |      | |   
Sbjct vDLVAGNG......KKYLCIEVKVTKkdhlyVGKRDMGRLIEFS.RRFG..gIPVLAVKf   82
DSSP  lLEEEELL......LLEEEEEEEEELllleeELHHHHHHHHHHH.HHHL..lEEEEEEEe


DSSP  ....HHHL.................LHHHHHH...hll
Query ....EDDL.................DENELLM...kis  132
ident                              ||       
Sbjct lnvgWRFIevspkiekfvftpssgvSLEVLLGiqktle  120
DSSP  llleEEEEellllllleeelhhhllLHHHHLLhhhlll


No 31: 2C8JA  MOLECULE: FERROCHELATASE 1;                                          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mkkkigllvmaygtpykeedieryythirrgrkpspemledlteryraiggisplatitl   60
DSSP  lleeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eqakklekrlnevqdeveyhmylglkhiepfiedavkemhndgiqdaialvlaphystfs  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhhllleeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllhhh


DSSP  ........................LLLLLLLH.HHHHHHHHHhhHLLLLLlleeeeeell
Query ........................PIDYTTHS.REIDAEYLKivRGSDPDttwliispna   35
ident                                               |             
Sbjct vksyvgraqeeaeklgnltihgidSWYKEPKFiQYWVDAVKS..IYSGMS..........  168
DSSP  hhhlhhhhhhhhhhhllleeeellLLLLLHHHhHHHHHHHHH..HHHLLL..........


DSSP  llleeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeellllllLLEEEEEEELLLlLLHH.hhHL
Query kkeyepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdVEKIIIIGWCPDsAPLK.trAS   94
ident                                           |                 
Sbjct .................................daereKAVLIVSAHSLP.EKIIamgDP  194
DSSP  .................................hhhhhLEEEEEEEELLL.LHHHhhlLL


DSSP  HHHHHHHHHHHLLL....LLLEEEEELL........hhHLLHhhHHHHLL..........
Query FAANFAAVANNLFK....GYHVQVTARD........edDLDEneLLMKIS..........  132
ident         |                             |     |               
Sbjct YPDQLNETADYIARgaevANYAVGWQSAgntpdpwigpDVQD..LTRELNekygytsfvy  252
DSSP  HHHHHHHHHHHHHHhhllLLEEEEEELLllllllllllLHHH..HHHHHHhhlllleeee


DSSP  ...........................................................
Query ...........................................................  132
ident                                                            
Sbjct apvgfvaehlevlydndfeckvvtdeigakyyrpempnasdafidcltdvvvkkkesvm  311
DSSP  ellllllllhhhhlllllhhhhhhhhhlleeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


No 32: 2ARHA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN AQ_1966;                              

DSSP  lllllllhhhhhHHHHhhhhllllllleeeeeelllLLEEEEEEELLHH.....hhllll
Query pidytthsreidAEYLkivrgsdpdttwliispnakKEYEPESTGSSFH.....dflqlf   55
ident              | |                     |                      
Sbjct ......daxvkyEELL.........ktlenginseeGEIRLVRKSQGRFkeefnfdlslg   45
DSSP  ......lhhhhhHHHH.........hhhhhllllllLLEEEEEEEELLLlleeeeeeeel


DSSP  lllLLEEEEEEELLlllLLLEEEEEEE.LLLLLLHHHHHLhhHHHHHHHhHLLL.LLLEE
Query detKVQYGLARVSPpgsDVEKIIIIGW.CPDSAPLKTRASfaANFAAVAnNLFK.GYHVQ  113
ident                                        |                    
Sbjct skpLLTLKVFLGRK...PYWQPWVEVFgVNPNLRNVFFGS..EAERKLY.EFLSeHFGRI   99
DSSP  leeEEEEEEELLLL...LLLLLEEEEElLLHHHHHHHLLL..HHHHHHH.HHHHlLLLEE


DSSP  EEELL...........................................HHHL........
Query VTARD...........................................EDDL........  122
ident                                                             
Sbjct FVEYFedkettyelqkgvppalsrlgfellklgytyfrdwfipeglxeGGHKiqaekpkt  159
DSSP  EEELLllhhhhhhhhllllhhhlhhhhhhhllllleeeelllllllllLLLEeeeellll


DSSP  .............................lhhhhhhhll
Query .............................denellmkis  132
ident                                        
Sbjct eeakkrhlenlkkefeefigkcedeglikkvkerynfle  198
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhll


No 33: 2HJGA  MOLECULE: GTP-BINDING PROTEIN ENGA;                                  

DSSP  .......................................lllllLLHHHHHHHHHHHHHL
Query .......................................pidytTHSREIDAEYLKIVRG   21
ident                                                  |          
Sbjct kpvvaivgrpnvgkstifnriagerisriyssaewlnydfnlidPFLAQIRQQAEIAXDE   60
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhheeeellleeeelllllllleeelLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  lllllleeeeeellllleeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeelllllllLEEEEEE
Query sdpdttwliispnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdvEKIIIIG   81
ident                                                        ||   
Sbjct ....................................................aDVIIFXV   68
DSSP  ....................................................lLEEEEEE


DSSP  ELLllllhhhhhlHHHHHHHHHhHLLLLL...LEEEEELLHH..................
Query WCPdsaplktrasFAANFAAVAnNLFKGY...HVQVTARDED..................  120
ident                |    ||           |                          
Sbjct NGR........egVTAADEEVA.KILYRTkkpVVLAVNKLDNniydfyslgfgepypisg  119
DSSP  ELL........llLLHHHHHHH.HHHLLLlllEEEEEELLLLlllllhhhllllleelll


DSSP  ..hlLHHHHHHHLL..............................................
Query ..dlDENELLMKIS..............................................  132
ident         ||                                                  
Sbjct thglGLGDLLDAVAehfknipetkyneeviqfcligrpnvgksslvnaxlgeervivsvd  179
DSSP  llllLHHHHHHHHHhlhhhlllllllllleeeeeellllllhhhhhhhhhlllleeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct tsftynqqefvivdtagxrkkgkvyettekysvlralkaidrsevvavvldgeegiieqd  239
DSSP  eeeeelleeeeellhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct kriagyaheagkavvivvnkwdavdkdestxkefeenirdhfqfldyapilfxsaltkkr  299
DSSP  hhhhhhhhhllleeeeeeelhhhllllllhhhhhhhhhhhhlhhhlllleeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  132
ident                                                             
Sbjct ihtlxpaiikasenhslrvqtnvlndvixdavaxnptpthngsrlkiyyatqvsvkppsf  359
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllleelleelleeeeeeeellllee


DSSP  .........................................
Query .........................................  132
ident                                          
Sbjct vvfvndpelxhfsyerflenrirdafgfegtpikifarark  400
DSSP  eeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeell


No 34: 2G0TA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct hxdlwklyqpgtpaaivawgqlgtahakttygllrhsrlfkpvcvvaehegkxasdfvkv   60
DSSP  lllhhhhlllleeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeeelllllllhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rydvpvvssvekakexgaevliigvsnpggyleeqiatlvkkalslgxdvisglhfsqqt  120
DSSP  llllleellhhhhhhlllleeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeellllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eflkiahengtriidirippleldvlrggiyrkkikvvgvfgtdcvvgkrttavqlwera  180
DSSP  hhhhhhhhhllleeelllllllllllllhhhhllleeeeeeellllllhhhhhhhhhhhh


DSSP  .........................llllllLHHHhHHHHHHhhhLLLLL.....lLEEE
Query .........................pidyttHSREiDAEYLKivrGSDPD.....tTWLI   30
ident                                          |                  
Sbjct lekgikagflatgqtgiligadagyvidavpADFV.SGVVEK..aVLKLEktgkeiVFVE  237
DSSP  hhlllleeeeellhhhhhlllleellhhhllHHHH.HHHHHH..hHHHHHhlllleEEEE


DSSP  EEE...lLLLLEEeeeeellhhhhllllllllleeeeeeelllllllleEEEEEELLLLL
Query ISP...nAKKEYEpestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdvekIIIIGWCPDSA   87
ident                                                           | 
Sbjct GQGalrhPAYGQV..........................tlgllygsnpDVVFLVHDPSR  271
DSSP  LLLllllLLLHHH..........................hhhhhhhhllLEEEEELLLLL


DSSP  L.........HHHHhlHHHHHHHHHHHllLLLLeEEEELL.........HHHL....LHH
Query P.........LKTRasFAANFAAVANNlfKGYHvQVTARD.........EDDL....DEN  125
ident            |    |                                  |     |  
Sbjct DhfesfpeipKKPD..FEEERRLIETL..SNAKvIGGVSLnggfetdlpVYDPfntdDLD  327
DSSP  LlllllllllLLLL..HHHHHHHHHHL..LLLEeEEEELLlllllllllEELLllhhHHH


DSSP  HHHHHLL..
Query ELLMKIS..  132
ident | |      
Sbjct EXLERAXvw  336
DSSP  HHHHHHLll


No 35: 2FOKA  MOLECULE: FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;                             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct irtfgwvqnpgkfenlkrvvqvfdrnskvhnevknikiptlvkeskiqkelvaimnqhdl   60
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iytykelvgtgtapcdaiiqatiadqgkgyidnwssdgflrwahalgfieyinksdsfvi  120
DSSP  leehhhhhlllllllllhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdvglaysksadgsaiekeilieaissyppairiltlledgqhltkfdlgknlgfsgesg  180
DSSP  lhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhllllleehhhhhllllllllll


DSSP  .....llllllLHHH.............................................
Query .....pidyttHSRE.............................................   10
ident                                                             
Sbjct ftslpegilldTLANampkdkgeirnnwegssdkyarmiggwldklglvkqgkkefiipt  240
DSSP  lllllhhhhhhHHHLllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct nkefishafkitgeglkvlrrakgstkftrvpkrvywemlatnltdkeyvrtrralilei  300
DSSP  leeeelleeeelhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   10
ident                                                             
Sbjct likagslkieqiqdnlkklgfdevietiendikglintgifieikgrfyqlkdhilqfvi  360
DSSP  hhhllleehhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeelleeeelllllllll


DSSP  .........................................hhhhhhhhhhllllllLEE
Query .........................................idaeylkivrgsdpdtTWL   29
ident                                                             
Sbjct pnrlvkseleekkselrhklkyvpheyielieiarnstqdrilemkvmeffmkvygyRGK  420
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllEEE


DSSP  EEEEllllleeeeeeellhhhhllllllllleEEEEEELlllLLLLEEEEEEELLLLllh
Query IISPnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqYGLARVSppgSDVEKIIIIGWCPDSapl   89
ident                                  |        |      |      |   
Sbjct HLGG........................srkpDGAIYTV..gSPIDYGVIVDTKAYSggy  454
DSSP  ELLL........................llllLEEEELL..lLLLLLEEEEEEELLLlll


DSSP  HHHHLHHHHHHHHHHHL..................llllLEEEEEL..............
Query KTRASFAANFAAVANNL..................fkgyHVQVTAR..............  117
ident       |                                                     
Sbjct NLPIGQADEMQRYVEENqtrnkhinpnewwkvypssvteFKFLFVSghfkgnykaqltrl  514
DSSP  LLLHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllllhhhhlllllllEEEEEEEllllllhhhhhhhh


DSSP  ...........LHHHLLHHH.........hhHHLL.........
Query ...........DEDDLDENE.........llMKIS.........  132
ident                |                            
Sbjct nhitncngavlSVEELLIGGemikagtltleEVRRkfnngeinf  558
DSSP  hhhhlleeeeeEHHHHHHHHhhhhhllllhhHHHLlllleelll


No 36: 1VHXA  MOLECULE: PUTATIVE HOLLIDAY JUNCTION RESOLVASE;                      

DSSP  ...................................llllllLHHHHHHHHHHHHhlllll
Query ...................................pidyttHSREIDAEYLKIVrgsdpd   25
ident                                                             
Sbjct slrilgldlgtktlgvalsdexgwtaqgietikineaegdyGLSRLSELIKDYT......   54
DSSP  leeeeeeeellleeeeeeelllllleeeeeeeellhhhlllLHHHHHHHHLLLE......


DSSP  lleeeeeellllleeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeelllllllleEEEEEELLL
Query ttwliispnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdvekIIIIGWCPD   85
ident                                                      |    | 
Sbjct ..................................................iDKIVLGFPK   64
DSSP  ..................................................eEEEEEELLL


DSSP  L...lLHHHHHLHHHHHHHHHHhLLLLllEEEEELLH.......................
Query S...aPLKTRASFAANFAAVANnLFKGyhVQVTARDE.......................  119
ident                                |                            
Sbjct NxngtVGPRGEASQTFAKVLET.TYNV..PVVLWDERlttxaaekxliaadvsrqkrkkv  121
DSSP  LllllLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL..LEEEELLLllhhhhhhhhhhllllhhhhhhh


DSSP  ..........HHLLHhHHHHhll
Query ..........DDLDEnELLMkis  132
ident                  |     
Sbjct idkxaavxilQGYLD.SLNE...  140
DSSP  hhhhhhhhhhHHHHH.HHLL...


No 37: 1RJMA  MOLECULE: MENB;                                                      

DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEeeellllleEEEEeellhhhhllllllllL
Query pidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIispnakkeyEPEStgssfhdflqlfdetkV   60
ident                             |                               
Sbjct ...................npfdakaWRLV........dGFDD..............ltD   19
DSSP  ...................llllhhhEEEL........lLLLL..............llL


DSSP  EEEEEEELllllllLEEEEEEELLLLLLhhHHHL.HHHHHHHHHHhLLLL....lLEEEE
Query QYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDSAPlkTRAS.FAANFAAVANnLFKG....yHVQVT  115
ident       |                                   |             |  |
Sbjct ITYHRHVD......DATVRVAFNRPEVR.nAFRPhTVDELYRVLD.HARMspdvgVVLLT   71
DSSP  EEEEEELL......LLEEEEEELLHHHL.lLLLHhHHHHHHHHHH.HHHHlllllEEEEE


DSSP  ELL.........................................................
Query ARD.........................................................  118
ident                                                             
Sbjct GNGpspkdggwafcsgghilevqrlirfmpkvviclvngwaaggghslhvvcdltlasre  131
DSSP  ELLlllllllleeellllhhhhhhhhhhllleeeeeelleeelhhhhhhhhlleeeeell


DSSP  .........................................................hhh
Query .........................................................edd  121
ident                                                             
Sbjct yarfkqtdadvgsfdggygsaylarqvgqkfareifflgrtytaeqmhqmgavnavaeha  191
DSSP  lleeellhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelhhhhhhhlllleeelhh


DSSP  lLHHHHHHHLL.....................................
Query lDENELLMKIS.....................................  132
ident   |   |                                         
Sbjct eLETVGLQWAAeinakspqaqrmlkfafnllddglvgqqlfageatrl  239
DSSP  hHHHHHHHHHHhhhlllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhl