DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1HQZ3 MOLECULE: ACTIN-BINDING PROTEIN;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1HQZ-1 28.2  0.4  135   139  100   ACTIN-BINDING PROTEIN;                                     "         
   2:  1X67-A 19.3  2.1  133   146   20   DREBRIN-LIKE PROTEIN;                                      "         
   3:  1CFY-A 16.5  2.1  125   133   19   COFILIN;                                                   "         
   4:  1VKK-A 15.0  2.3  127   137   12   GLIA MATURATION FACTOR GAMMA;                              "         
   5:  1TMW-A 14.6  2.5  128   141   15   COACTOSIN-LIKE PROTEIN;                                    "         
   6:  1M4J-A 13.5  2.4  117   133   19   A6 GENE PRODUCT;                                           "         
   7:  1F7S-A 13.5  2.2  112   124   17   ACTIN DEPOLYMERIZING FACTOR (ADF);                         "         
   8:  2D8B-A 11.8  3.0  128   166   10   TWINFILIN-1;                                               "         
   9:  1AK6-A 11.7  2.6  131   174   21   DESTRIN;                                                   "         
  10:  2FGH-A  6.4  3.6   99   721   11   GELSOLIN;                                                  "         
  11:  2NUP-A  4.5  3.1   77   699    6   PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23A;                          "         
  12:  1SVQ-A  4.3  3.3   75    94    9   SEVERIN;                                                   "         
  13:  1HH1-A  3.4  2.6   65   125   15   HOLLIDAY JUNCTION RESOLVING ENZYME HJC;                    "         
  14:  2CWW-A  3.3  3.4   78   376    5   PUTATIVE SAM-DEPENDENT RNA METHYLTRANSFERASE;              "         
  15:  2GMW-A  2.9  3.7   78   182   10   D,D-HEPTOSE 1,7-BISPHOSPHATE PHOSPHATASE;                  "         
  16:  2CZR-A  2.7  5.2   68   226   13   TBP-INTERACTING PROTEIN;                                   "         
  17:  2B78-A  2.7  3.5   74   376    5   HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.776;                              "         
  18:  1OB8-A  2.6  3.1   65   119   11   HOLLIDAY-JUNCTION RESOLVASE;                               "         
  19:  2JC4-A  2.5  4.0   69   256   13  ;                                                           "         
  20:  2HPU-A  2.5  3.2   57   126    9   NOSL PROTEIN;                                              "         
  21:  1H65-A  2.5  3.6   72   257    8   CHLOROPLAST OUTER ENVELOPE PROTEIN OEP34;                  "         
  22:  2AS0-A  2.4  3.8   71   396   11   HYPOTHETICAL PROTEIN PH1915;                               "         
  23:  2GIA-B  2.3  3.8   54   146    4   MITOCHONDRIAL RNA-BINDING PROTEIN 2;                       "         
  24:  1MD9-A  2.3  4.3   73   536    7   2,3-DIHYDROXYBENZOATE-AMP LIGASE;                          "         
  25:  2HJG-A  2.2  2.8   62   400   15   GTP-BINDING PROTEIN ENGA;                                  "         
  26:  1LPM-A  2.2  4.0   85   534    2   LIPASE;                                                    "         
  27:  1KFI-A  2.2  4.0   62   570    8   PHOSPHOGLUCOMUTASE 1;                                      "         
  28:  1B49-A  2.2  4.3   79   241    5   PROTEIN (DEOXYCYTIDYLATE HYDROXYMETHYLASE);                "         
  29:  2GMH-A  2.1  4.0   73   581   10   ELECTRON TRANSFER FLAVOPROTEIN-UBIQUINONE                  "         
  30:  2FOK-A  2.1  3.8   70   558    9   FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;                             "         
  31:  1XB2-A  2.1  3.1   67   369    6   ELONGATION FACTOR TU, MITOCHONDRIAL;                       "         
  32:  1RJM-A  2.1  3.3   68   239   10   MENB;                                                      "         
  33:  1R5B-A  2.1  3.1   72   409    3   EUKARYOTIC PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR GTP-               "         
  34:  1KO2-A  2.1  3.2   59   230    3   VIM-2 METALLO-BETA-LACTAMASE;                              "         
  35:  1BO7-A  2.1  3.5   79   316   15   PROTEIN (THYMIDYLATE SYNTHASE);                            "         
-

No 1: 1HQZ1  MOLECULE: ACTIN-BINDING PROTEIN;                                     

DSSP  LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEELLHHHHLLLLLLL
Query LEPIDYTTHSREIDAEYLKIVRGSDPDTTWLIISPNAKKEYEPESTGSSFHDFLQLFDET   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct LEPIDYTTHSREIDAEYLKIVRGSDPDTTWLIISPNAKKEYEPESTGSSFHDFLQLFDET   60
DSSP  LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLEEEEEELLLLLEEEEEEELLHHHHHLLLLLL


DSSP  LLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL
Query KVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANNLFKGYHVQVTARD  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct KVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANNLFKGYHVQVTARD  120
DSSP  LLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLEEEEELL


DSSP  HHHHLHHHHHHHHHL....
Query EDDLDENELLMKISN....  135
ident |||||||||||||||    
Sbjct EDDLDENELLMKISNaaga  139
DSSP  HHHHLHHHHHHHHHLllll


No 2: 1X67A  MOLECULE: DREBRIN-LIKE PROTEIN;                                      

DSSP  ......LLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLEEEEEELL.LLLEEEEEEELL.HHH
Query ......LEPIDYTTHSREIDAEYLKIVRGSDpDTTWLIISPNA.KKEYEPESTGSS.FHD   52
ident                       |   |      | |                ||      
Sbjct gssgssGMAANLSRNGPALQEAYVRVVTEKS.PTDWALFTYEGnSNDIRVAGTGEGgLEE   59
DSSP  llllllLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLEEEEEELLlLLLEEEEEEELLlHHH


DSSP  HLLLLLLLLLEEEEEEELLLLLLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHhLLLLL
Query FLQLFDETKVQYGLARVSPPGSDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANnLFKGY  112
ident         || |   ||  | |   |   | |             |      |    || 
Sbjct MVEELNSGKVMYAFCRVKDPNSGLPKFVLINWTGEGVNDVRKGACASHVSTMAS.FLKGA  118
DSSP  HHHHLLLLLEEEEEEEEELLLLLLEEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHHH.HLLLE


DSSP  LEEEEELLHHHHLHHHHHHHHHL.....
Query HVQVTARDEDDLDENELLMKISN.....  135
ident ||   || | |        |        
Sbjct HVTINARAEEDVEPECIMEKVASgpssg  146
DSSP  EEEELLLLHHHHLHHHHHHHHHLlllll


No 3: 1CFYA  MOLECULE: COFILIN;                                                   

DSSP  lllLLLLllhHHHHHHHHHHHHLLLllLLEEEEEELLLL.LEEEEEEELL..HHHHLLLL
Query lepIDYTthsREIDAEYLKIVRGSDpdTTWLIISPNAKK.EYEPESTGSS..FHDFLQLF   57
ident            |          |            |  | |     |        ||   
Sbjct ...VAVA...DESLTAFNDLKLGKK..YKFILFGLNDAKtEIVVKETSTDpsYDAFLEKL   52
DSSP  ...LEEL...HHHHHHHHHHHHHLL..LLEEEEEELLLLlEEEEEEEELLllHHHHHLLL


DSSP  LLLLLEEEEEEELLLL....lLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLL
Query DETKVQYGLARVSPPG....sDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYH  113
ident  |    |                 ||    | || ||       |    |       |  
Sbjct PENDCLYAIYDFEYEIngnegKRSKIVFFTWSPDTAPVRSKMVYASSKDALR.RALNGVS  111
DSSP  LLLLLEEEEEEEEEELlllllEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLLL


DSSP  EEEEELLHHHHLHHHHHHHHHL
Query VQVTARDEDDLDENELLMKISN  135
ident   |   |         |   | 
Sbjct TDVQGTDFSEVSYDSVLERVSR  133
DSSP  EEEEELLHHHHLHHHHHHHHHL


No 4: 1VKKA  MOLECULE: GLIA MATURATION FACTOR GAMMA;                              

DSSP  lLLLLLlllHHHHHHHHHHHHHLLLLllLEEEEEELLL.LLEEEEEEELLHH..HHLLLL
Query lEPIDYtthSREIDAEYLKIVRGSDPdtTWLIISPNAK.KEYEPESTGSSFH..DFLQLF   57
ident            |      |            |            |               
Sbjct .VVCEV...DPELKETLRKFRFRKETnnAAIIMKVDKDrQMVVLEDELQNISpeELKLEL   56
DSSP  .LLLEE...LHHHHHHHHHHHLLLLLllEEEEEEEELLlLEEEEEEEEELLLhhHHHHHL


DSSP  LLLLLEEEEEEELLLL...LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLlLLE
Query DETKVQYGLARVSPPG...SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKgYHV  114
ident  |                         |   |           |                
Sbjct PERQPRFVVYSYKYVHddgRVSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSKNRLV.QTAE.LTK  114
DSSP  LLLLLEEEEEELLEELlllLEELLEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLL.LLL


DSSP  EEEELLHHHHLHHHHHHHHHL..
Query QVTARDEDDLDENELLMKISN..  135
ident     |  ||| |  |  |     
Sbjct VFEIRTTDDLTETWLKEKLAFfr  137
DSSP  EEEELLHHHLLHHHHHHHHHLll


No 5: 1TMWA  MOLECULE: COACTOSIN-LIKE PROTEIN;                                    

DSSP  llLLLLllLHHHHHHHHHHHHHLLLlLLLEEEEEELlLLLEEEEEEELLHHHHLLLLLLL
Query lePIDYttHSREIDAEYLKIVRGSDpDTTWLIISPNaKKEYEPESTGSSFHDFLQLFDET   60
ident               | |            |            |   |     | |     
Sbjct ..ATKI..DKEACRAAYNLVRDDGS.AVIWVTFKYD.GSTIVPGEQGAEYQHFIQQCTDD   54
DSSP  ..LLLL..LHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLEEEEEEL.LLLEEEEEEELLLHHHHHHLLLL


DSSP  LLEEEEEEELLLL..LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLLEEEEE
Query KVQYGLARVSPPG..SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYHVQVTA  118
ident        |       |   |   | |         ||        |              
Sbjct VRLFAFVRFTTGDamSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTLVK.EVVQNFAKEFVI  113
DSSP  LEEEEEEEEELLLllLLLEEEEEEEEELLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHLLLLLEEEEE


DSSP  LLHHHHLHHHHHHHHHL...........
Query RDEDDLDENELLMKISN...........  135
ident  |   | ||                   
Sbjct SDRKELEENFIKSELKKagganydaqte  141
DSSP  LLHHHHLHHHHHHHHHHlllllllllll


No 6: 1M4JA  MOLECULE: A6 GENE PRODUCT;                                           

DSSP  lllLLLLllhHHHHHHHHHHHHLLlllLLEEEEEELlLLLEEEEEEEL.......LHHHH
Query lepIDYTthsREIDAEYLKIVRGSdpdTTWLIISPNaKKEYEPESTGS.......SFHDF   53
ident    |                  |       | ||          |              |
Sbjct ...IQAS...EDVKEIFARARNGK...YRLLKISIE.NEQLVVGSCSPpsdsweqDYDSF   50
DSSP  ...LLLL...HHHHHHHHHHHLLL...LLEEEEEEL.LLLEEEEEEELllllhhhHHHHH


DSSP  LL.LLLLLLLEEEEEEELLlllllLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLL..
Query LQ.LFDETKVQYGLARVSPpgsdvEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFK..  110
ident    |       | | |           | | | ||          ||  |      |   
Sbjct VLpLLEDKQPCYVLFRLDSqnaqgYEWIFIAWSPDHSHVRQKMLYAATRATLK.KEFGgg  109
DSSP  HHhHLLLLLLEEEEEEEEEeelleEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.HHHLhh


DSSP  LLLEEEEELLHHHHLHHHHHHHHhl
Query GYHVQVTARDEDDLDENELLMKIsn  135
ident      |      |            
Sbjct HIKDEVFGTVKEDVSLHGYKKYL.l  133
DSSP  HEEEEEEELLHHHHLHHHHHHHH.l


No 7: 1F7SA  MOLECULE: ACTIN DEPOLYMERIZING FACTOR (ADF);                         

DSSP  llLLLLlllHHHHHHHHHHHHHLLLllLLEEEEEEL.LLLLEEEEEEEL...LHHHHLLL
Query lePIDYtthSREIDAEYLKIVRGSDpdTTWLIISPN.AKKEYEPESTGS...SFHDFLQL   56
ident                  |                     |    |  |        |   
Sbjct asGMAV...HDDCKLRFLELKAKRT..HRFIVYKIEeKQKQVVVEKVGQpiqTYEEFAAC   55
DSSP  llLLEE...LHHHHHHHHHHHHHLL..LLEEEEEEElLLLEEEEEEELLlllLHHHHHLL


DSSP  LLLLLLEEEEEEELLLL...LLLLEEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLL
Query FDETKVQYGLARVSPPG...SDVEKIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYH  113
ident        |                ||  | |||| |        |            |  
Sbjct LPADECRYAIYDFDFVTaenCQKSKIFFIAWCPDIAKVRSKMIYASSKDRFK.RELDGIQ  114
DSSP  LLLLLLEEEEEEEEEELlllLEEEEEEEEEELLLLLLHHHHHHHHHHHHHHH.LLLLLLL


DSSP  EEEEELLhhhhlhhhhhhhhhl
Query VQVTARDeddldenellmkisn  135
ident |   | |               
Sbjct VELQATD............pte  124
DSSP  EEEEELL............lll


No 8: 2D8BA  MOLECULE: TWINFILIN-1;                                               

DSSP  ......................LLLLLLLllHHHHHHHHHHHHHLLlllLLEEEEEEL.L
Query ......................LEPIDYTthSREIDAEYLKIVRGSdpdTTWLIISPN.A   37
ident                                ||       |                   
Sbjct gssgssgevqtdvsvdtkhqtlQGVAFPI..SRDAFQALEKLSKKQ...LNYVQLEIDiK   55
DSSP  llllllllllllllllllllllLLLLLLL..LHHHHHHHHHHHLLL...LLLLEEEEElL


DSSP  LLLEEEEEEELLHH.HHLLLLLLLLLEEEEEEELLLL..LLLLEEEEEEELLLL.lLHHH
Query KKEYEPESTGSSFH.DFLQLFDETKVQYGLARVSPPG..SDVEKIIIIGWCPDS.aPLKT   93
ident         |      |           |              |    |   |        
Sbjct NETIILANTENTELrDLPKRIPKDSARYHFFLYKHSHegDYLESVVFIYSMPGYtcSIRE  115
DSSP  LLEEEEEELLLLLLlLHHHHLLLLLLEEEEEEEEEEEllEEEEEEEEEEELLLLllLHHH


DSSP  HHLHHHHHHHHHhHLLL.....LLLEEEEELLHHHHLHHHHHHHHHL.....
Query RASFAANFAAVAnNLFK.....GYHVQVTARDEDDLDENELLMKISN.....  135
ident |                                | |    |           
Sbjct RMLYSSCKSPLL.EIVErqlqmDVIRKIEIDNGDELTADFLYDEVHSgpssg  166
DSSP  HHHHHHLLHHHH.HHHLlllllLLLEEEEELLLLLLLHHHHHHHHHLlllll


No 9: 1AK6A  MOLECULE: DESTRIN;                                                   

DSSP  ..........LLLLLLlllHHHHHHHHHHHHHLL.......LLLLLEEEEEELLLLL.EE
Query ..........LEPIDYtthSREIDAEYLKIVRGS.......DPDTTWLIISPNAKKE.YE   42
ident                      |                          |    | |    
Sbjct tmitpssgnsASGVQV...ADEVCRIFYDMKVRKcstpeeiKKRKKAVIFCLSADKKcII   57
DSSP  llllllllllLLLLLL...LLHHHHHHHHLLLLLlllhhhhHHHLLLEELLLLLLLLlLL


DSSP  EE..EEELL..........HHHHLLLLLLLLLEEEEEEELLLL..LLLLEEEEEEELLLL
Query PE..STGSS..........FHDFLQLFDETKVQYGLARVSPPG..SDVEKIIIIGWCPDS   88
ident  |                 |  |     |    | |   |     |  |      | |  
Sbjct VEegKEILVgdvgvtitdpFKHFVGMLPEKDCRYALYDASFETkeSRKEELMFFLWAPEL  117
DSSP  LLllLLLLLllllllllllLHHHHHLLLLLLLLLEELLLLLLLllLLLLLLLEEEELLLL


DSSP  LLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLLEEEEELLHHHHLHHHHHHHHHL...........
Query APLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYHVQVTARDEDDLDENELLMKISN...........  135
ident ||||     |    |     | |      |    ||       |              
Sbjct APLKSKMIYASSKDAIK.KKFQGIKHECQANGPEDLNRACIAEKLGGslivafegcpv  174
DSSP  LLHHHHHLHHHHHHHHH.HHLLLLLLLEEELLLLLLLHHHHHHHLLLlllllllllll


No 10: 2FGHA  MOLECULE: GELSOLIN;                                                  

DSSP  lllllllllHHHHHHHHhhHHHLlllllLEEEEEELLlLLEEEEEeellhhhhlLLLLLL
Query lepidytthSREIDAEYlkIVRGsdpdtTWLIISPNAkKEYEPEStgssfhdflQLFDET   60
ident                                |          |             |   
Sbjct ........vEHPEFLKA..GKEP.....GLQIWRVEK.FDLVPVP.....pnlyGDFFTG   39
DSSP  ........lLLHHHHHL..LLLL.....EEEEEEELL.LLEEELL.....hhhlLEEELL


DSSP  LLEEEEEEELLLlLLLLEEEEEEELLLLLlhhhHHLHHHHHHHHHHHLLL...LLLEEEE
Query KVQYGLARVSPPgSDVEKIIIIGWCPDSAplktRASFAANFAAVANNLFK...GYHVQVT  117
ident      |  |              |                 |     |     |  ||  
Sbjct DAYVILKTVQLR.NGILQYDLHYWLGNEC....SQDESGAAAIFTVQLDDylnGRAVQHR   94
DSSP  LEEEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEELLLL....LHHHHHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEE


DSSP  ELLHHHHLH...................................................
Query ARDEDDLDE...................................................  126
ident                                                             
Sbjct EVQGFESATflgyfksglkykkggvasgfkhvvpnevvvqrllqvkgrrvvratevpvsw  154
DSSP  EELLLLLHHhhhllllleeeellllllllllllllllllleeeeeellllleeeeelllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  126
ident                                                             
Sbjct esfnngdcfildlgnniyqwcgsksnrferlkatqvskgirdnersgraqvsvfeegaep  214
DSSP  hhllllleeeeellleeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhhhlhhhlleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  126
ident                                                             
Sbjct eamlqvlgpkptlpeatenrklaklykvsngagpmvvslvadenpfaqgalrsedcfild  274
DSSP  hhhhhhhlllllllllllllllleeeeelllllllleeeeellllllhhhllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  126
ident                                                             
Sbjct hgkdgkifvwkgkqanmeerkaalktasdfiskmdypkqtqvsvlpeggetplfrqffkn  334
DSSP  ehhhleeeeeelllllhhhhllhhhhhhhhhhhhlllllleeeeeelllllhhhhlllll


DSSP  .......hhhhhHHHL............................................
Query .......nellmKISN............................................  135
ident                                                             
Sbjct wrdpdqteglglAYLSshiahvervpfdaatlhtstamaaqhgmdddgtgqkqiwrvegs  394
DSSP  lllhhhhlllllLLLLhhhlllllllllhhhhhhlhhhhhhhllllllllleeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct nkvpvdpatygqfyggdsyiilynyrhgsrqgqiiynwqgaqstqdevaasailtaqlde  454
DSSP  eeeellhhhlleeellleeeeeeeeelllleeeeeeeeelllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct elggtpvqsrvvqgkepahlmslfggkpmivykggtsreggqtapastrlfqvrasssga  514
DSSP  hllllleeeeeelllllhhhhllllllleeeelllllllllllllllleeeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct traveiipkagalnsndafvlktpsaaylwvgagaseaektgaqellrvlraqpvqvaeg  574
DSSP  eeeeeelllhhhllllleeeeelllleeeeelllllhhhhhhhhhhhhhlllllleeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct sepdsfwealggkatyrtsprlkdkkmdahpprlfacsnkigrfvieevpgefmqedlat  634
DSSP  lllhhhhhhllllllllllllllllhhhhllleeeeeeelllleeeeeelllllhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct ddvmlldtwdqvfvwvgkdsqdeektealtsakryidtdpahrdrrtpitvvkqgfepps  694
DSSP  lleeeeelllleeeeelllllhhhhhlhhhhhhhhhhhlllllllllleeeeelllllhh


DSSP  ...........................
Query ...........................  135
ident                            
Sbjct fvgwflgwddsywsvdpldralaelaa  721
DSSP  hhlllllllllhhhllhhhhhhhhhll


No 11: 2NUPA  MOLECULE: PROTEIN TRANSPORT PROTEIN SEC23A;                          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tylefiqqneerdgvrfswnvwpssrleatrmvvpvaalftplkerpdlppiqyepvlcs   60
DSSP  lhhhhhhhhhhhhleeellleelllhhhhllllllleeeellllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rttcravlnplcqvdyraklwacnfcyqrnqfppsyagiselnqpaellpqfssieyvvl  120
DSSP  lllllllllllleeelllleeelllllleeellhhhlllllllllhhhlhhhlleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rgpqmpliflyvvdtcmededlqalkesmqmslsllpptalvglitfgrmvqvhelgceg  180
DSSP  llllllleeeeeeellllhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeelleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct isksyvfrgtkdlsakqlqemlgpppsnrflqpvqkidmnltdllgelqrdpwpvpqgkr  240
DSSP  lleeeeeelllllllhhhhhhhllllllllleehhhhhhhhhhhhhhlllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct plrssgvalsiavgllectfpntgarimmfiggpatqgpgmvvgdelktpirswhdidkd  300
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeeeellllllllllllllllllllllhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct nakyvkkgtkhfealanraattghvidiyacaldqtgllemkccpnltggymvmgdsfnt  360
DSSP  llllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllllhhhhlhhhhhlllleeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct slfkqtfqrvftkdmhgqfkmgfggtleiktsreikisgaigpcvslnskgpcvseneig  420
DSSP  hhhhhhhhhlllllllllllleeeeeeeeeellleeeeeeellleellllllleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tggtcqwkicglsptttlaiyfevvggrgaiqfvtqyqhssgqrrirvttiarnwadaqt  480
DSSP  llllleeeeeeellllleeeeeeelllleeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeeellhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qiqniaasfdqeaaailmarlaiyraetedvlrwldrqlirlcqkfgeyhkddpssfrfs  540
DSSP  hhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhhhhhhleeelleeeeeell


DSSP  ..........................lllllllllhhhhhhhhHHHHhlllllLLEEEEE
Query ..........................lepidytthsreidaeyLKIVrgsdpdTTWLIIS   34
ident                                              |              
Sbjct etfslypqfmfhlrrssflqvfnnspdessyyrhhfmrqdltqSLIM......IQPILYA  594
DSSP  lllllhhhhhhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhllllhhhHHHH......HLLEEEE


DSSP  ElLLLLEEEEEEellhhhhllLLLLLLLEEEEEEelllllllleEEEEEELLLLLLHhhh
Query PnAKKEYEPESTgssfhdflqLFDETKVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPDSAPLktr   94
ident        ||                                     |             
Sbjct YsFSGPPEPVLL......dssSILADRILLMDTF..........FQILIYHGETIAQenf  638
DSSP  ElLLLLLEELLL......lhhHLLLLLEEEEEEL..........LEEEEEELLLLLLlhh


DSSP  HLHHHHHHHHHHhLLLL....lLEEEEELL.HHHHL................hhhhhhhh
Query ASFAANFAAVANnLFKG....yHVQVTARD.EDDLD................enellmki  133
ident           |                                                 
Sbjct RHLLQAPVDDAQ.EILHsrfpmPRYIDTEHgGSQARfllskvndvslqvfmdhlkklavs  697
DSSP  HHHHLHHHHHHH.HHHHhllllLEEEEEELlLHHHHhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhll


DSSP  hl
Query sn  135
ident   
Sbjct sa  699
DSSP  ll


No 12: 1SVQA  MOLECULE: SEVERIN;                                                   

DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllLLLEEEEE...elllLLEEEEEeellhhhhlLLL
Query lepidytthsreidaeylkivrgsdpDTTWLIIS...pnakKEYEPEStgssfhdflQLF   57
ident                                          |  |               
Sbjct ..........................EYKPRLLHisgdknaKVAEVPL.......atSSL   27
DSSP  ..........................LLLEEEEEeelllllEEEEELL.......llLLL


DSSP  LLLLLEEEEEEelllllllleEEEEEELLLLLLHHHHHLHHHHHHHHHHHLlLLLLeEEE
Query DETKVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPDSAPLKTRASFAANFAAVANNLfKGYHvQVT  117
ident          |             |                |    |              
Sbjct NSGDCFLLDAG..........LTIYQFNGSKSSPQEKNKAAEVARAIDAERkGLPK.VEV   76
DSSP  LLLLEEEEEEL..........LEEEELLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHlLLLE.EEE


DSSP  ELL.hHHHLHHhhhhhhhl
Query ARD.eDDLDENellmkisn  135
ident       |            
Sbjct FCEtdSDIPAE.fwkllgg   94
DSSP  LLLllLLLLHH.hhhhhll


No 13: 1HH1A  MOLECULE: HOLLIDAY JUNCTION RESOLVING ENZYME HJC;                    

DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEEEEllllleeeeeeellhhhhlllllll
Query lepidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIISPnakkeyepestgssfhdflqlfdet   60
ident                                                             
Sbjct ............savernivsrlrdkgfAVVRAPA.........................   23
DSSP  ............lhhhhhhhhhhhhlllEEEELLL.........................


DSSP  lleEEEEEELllllllLEEEEEEELLLL...llhhhHHLHHHHHHHHHHhlLLLLlEEEE
Query kvqYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDS...aplktRASFAANFAAVANnlFKGYhVQVT  117
ident       |           || |              |   |      |     |      
Sbjct pipDIIALKN......GVIILIEMKSRKdiegkiyvRREQAEGIIEFAR..KSGG.SLFL   74
DSSP  lllLEEEEEL......LEEEEEEELLEEllllleeeLHHHHHHHHHHHH..HHLL.EEEE


DSSP  ELL...HHHH.......................LHHHHHHHHHL.......
Query ARD...EDDL.......................DENELLMKISN.......  135
ident                                  |   |             
Sbjct GVKkpgVLKFipfeklrrtetgnyvadseieglDLEDLVRLVEAkisrtld  125
DSSP  EEElllLEEEeehhhleellllleellllllllLHHHHHHHHHHhhhhhhl


No 14: 2CWWA  MOLECULE: PUTATIVE SAM-DEPENDENT RNA METHYLTRANSFERASE;              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mriqvnakgaarllsrhlwvfrrdvvsgpetpglypvywgrrflalalynphtdlavray   60
DSSP  lleeelhhhhhhhhlllleeehhheeellllleeeeeeelleeeeeeeellllleeeeee


DSSP  .........LLLL.LLLLlhhHHHHHHHHHHhllllllLEEE.EEELLllleeeeeeell
Query .........LEPI.DYTThsrEIDAEYLKIVrgsdpdtTWLI.ISPNAkkeyepestgss   49
ident                         |                                   
Sbjct rfapaedpvAALLeNLAQalaRREAVLRQDP......eGGYRlVHAEG............  102
DSSP  ellllllhhHHHHhHHHHhhhHHHLLLLLLL......lLEEEeEEHHH............


DSSP  hhhhlllllllLLEEEEEEelllllllleEEEEEELlllLLHHHHHLHHHhHHHHHHhll
Query fhdflqlfdetKVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCpdsAPLKTRASFAAnFAAVANnlf  109
ident                                                     |       
Sbjct .......dllpGLVVDYYA..........GHAVVQA...TAHAWEGLLPQ.VAEALR...  138
DSSP  .......hlllLEEEEEEL..........LEEEEEE...LLHHHHLLHHH.HHHHHL...


DSSP  LLLLEEEEELL..........HHHH..................lhHHHH...........
Query KGYHVQVTARD..........EDDL..................deNELL...........  130
ident           |                                    |            
Sbjct PHVQSVLAKNDartreleglpLYVRpllgevpervqvqegrvrylVDLGayldqrenrly  198
DSSP  LLLLEEEEEELlhhhhlllllLEEEeeeellllleeeeelleeeeELLLllhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  130
ident                                                             
Sbjct merfrgeraldvfsyaggfalhlalgfrevvavdssaealrraeenarlnglgnvrvlea  258
DSSP  hhhlleeeeeeelllllhhhhhhhlleeeeeeeellhhhhhhhhhhhhlllllleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  130
ident                                                             
Sbjct nafdllrrlekegerfdlvvldppafakgkkdverayraykevnlraikllkeggilata  318
DSSP  lhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeeeeee


DSSP  .....................................................hhhhl
Query .....................................................mkisn  135
ident                                                           
Sbjct scshhmteplfyamvaeaaqdahrllrvvekrgqpfdhpvllnhpethylkfavfqvl  376
DSSP  ellllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeellllllllllllhhhllleeeeeeel


No 15: 2GMWA  MOLECULE: D,D-HEPTOSE 1,7-BISPHOSPHATE PHOSPHATASE;                  

DSSP  ...................lLLLL.LLLLhHHHHHHHHHHHHLLllllleeeeeelllll
Query ...................lEPID.YTTHsREIDAEYLKIVRGSdpdttwliispnakke   40
ident                       ||                                    
Sbjct svpaifldrdgtinvdhgyvHEIDnFEFI.DGVIDAMRELKKMG................   43
DSSP  llleeeelllllllllllllLLHHhLLLL.LLHHHHHHHHHHLL................


DSSP  eeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeellllllllEEEEEEELL..LLLLhHHHHLHH
Query yepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdveKIIIIGWCP..DSAPlKTRASFA   98
ident                                                       | | | 
Sbjct ....................................fALVVVTNQSgiARGK.FTEAQFE   66
DSSP  ....................................lEEEEEEELLhhHHLL.LLHHHHH


DSSP  HHHHHHHHHL...lLLLLEEEEELL............HHHHL.HHHHHHHHHL.......
Query ANFAAVANNL...fKGYHVQVTARD............EDDLD.ENELLMKISN.......  135
ident          |                            |        |            
Sbjct TLTEWMDWSLadrdVDLDGIYYCPHhpqgsveefrqvCDCRKpHPGMLLSARDylhidma  126
DSSP  HHHHHHHHHHhhllLLLLEEEEELLllllllhhhlllLLLLLlLLHHHHHHHHhhlllhh


DSSP  ........................................................
Query ........................................................  135
ident                                                         
Sbjct asymvgdkledmqaavaanvgtkvlvrtgkpitpeaenaadwvlnsladlpqaikk  182
DSSP  hleeeellhhhhhhhhhlllleeeeelllllllhhhhhhlleeellhhhhhhhhhl


No 16: 2CZRA  MOLECULE: TBP-INTERACTING PROTEIN;                                   

DSSP  lllllllLLHHHH.....hhhhhhhhhllllllLEEEEEellllleeeeeeellhhhhll
Query lepidytTHSREI.....daeylkivrgsdpdtTWLIISpnakkeyepestgssfhdflq   55
ident          |                        | |                       
Sbjct ...glvpRGSHMYaelspgtkkvytqvrylddyHWEIEG.....................   36
DSSP  ...lllhHHHHHHhlllhhhhhhhhhhllllleEEEEEL.....................


DSSP  lllllllEEEEEEELllllLLLEEEEEEELLLlllhhhHHLHHHhHHHHHhhllLLLLeE
Query lfdetkvQYGLARVSppgsDVEKIIIIGWCPDsaplktRASFAAnFAAVAnnlfKGYHvQ  115
ident                           |           |       |             
Sbjct .......STITGIHK....KSNVKVVIDVAKN......REEADS.LAGKD....VNGI.H   73
DSSP  .......LEEEEEEL....LLLLEEEEEELLL......HHHHHH.HLLLL....LLLE.E


DSSP  EEEL...............LHHHHlHHHHHHHHHL.........................
Query VTAR...............DEDDLdENELLMKISN.........................  135
ident   |                    |    |                               
Sbjct IVAIpdngvfyikngsfvlTYRYL.KATLADINDHivwsgfkvvedngklvqedvyeylg  132
DSSP  EEEEllllleeeelleeeeEHHHH.HHHHHHHHHLeeeeeeeeeeelleeeeeeeeeelh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct aalvnhiknnalagqdyifwqfykceecgkyvdienleahlrehgiklhekseehyevfe  192
DSSP  hhhhhhhhlllllllleeeeeeeelllllleeehhhhhhhhhlllllhhhlleeeleeee


DSSP  ..................................
Query ..................................  135
ident                                   
Sbjct lnfregkvfdkfggevpmdkfssearefikevls  226
DSSP  eelllleeeelllllllhhhllhhhhhhhhhhll


No 17: 2B78A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN SMU.776;                              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct miklmvgsfaekklkrgvqllssrdypnlnldnqvvqlysdadiflgtaylskqnkgvgw   60
DSSP  leeeellhhhhhhhhhllleeehhhlllllllleeeeeellllleeeeeeeeeelleeee


DSSP  ........llllLLLLL.HHHHHHHhhhhhHLLLL.LLLEE.EEEELlllleeeeeeell
Query ........lepiDYTTH.SREIDAEylkivRGSDP.DTTWL.IISPNakkeyepestgss   49
ident                       |              |                      
Sbjct lispkkvslnvtYFIKLfQWSKDKR...knFAHSKlTTAYRlFNQDG.............  104
DSSP  eeelllllllhhHHHHHhHHHHHLL...hhHHHLLlLLEEEeEEHHH.............


DSSP  hhhhlllllllLLEEEEEEEllllllllEEEEEEELlllllhhhHHLHHHHHHHHHHHLL
Query fhdflqlfdetKVQYGLARVsppgsdveKIIIIGWCpdsaplktRASFAANFAAVANNLF  109
ident                                   |                         
Sbjct ........dsfGGVTIDCYG........DFVLFSWY........NSFVYQIRDEIVAAFR  140
DSSP  ........hllLLEEEEEEL........LEEEEEEL........LHHHHHLHHHHHHHHH


DSSP  ....lllLEEEEEL.............................lHHHHLHH.........
Query ....kgyHVQVTAR.............................dEDDLDEN.........  127
ident              |                                              
Sbjct qvypnflGAYEKIRfnvsahlygqeapeqflilengisynvflnDGLMTGIfldqrqvrn  200
DSSP  hhlllllEEEEEELllleeeeeelllllleeeeelleeeeelllLLLLLLLlhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  127
ident                                                             
Sbjct elingsaagktvlnlfsytaafsvaaamggamattsvdlakrsralslahfeanhldman  260
DSSP  hhhhlllllleeeeelllllhhhhhhhhlllleeeeeellllhhhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  127
ident                                                             
Sbjct hqlvvmdvfdyfkyarrhhltydiiiidppsfevfsvskdyhklirqgleilsengliia  320
DSSP  eeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeeelllllllllhhhhhhhhhhhhhhleeeeeeeee


DSSP  ................................................hhhhhhhl
Query ................................................ellmkisn  135
ident                                                         
Sbjct stnaanmtvsqfkkqiekgfgkqkhtyldlqqlpsdfavnvqdessnylkvftikv  376
DSSP  eellllllhhhhhhhhhhhhllllleeeeeellllllllllllhhhllleeeeeel


No 18: 1OB8A  MOLECULE: HOLLIDAY-JUNCTION RESOLVASE;                               

DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEEEEllllleeeeeeellhhhhlllllll
Query lepidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIISPnakkeyepestgssfhdflqlfdet   60
ident                                 |                           
Sbjct ...........gknaerelvsilrgegfNAVRIPT........................n   25
DSSP  ...........lhhhhhhhhhhhhhlllEEEELLL........................l


DSSP  lleEEEEEELllllllLEEEEEEELLLLllhhhhhLHHHHHHHHHHHLLLL...lLEEEE
Query kvqYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDSaplktraSFAANFAAVANNLFKG...yHVQVT  117
ident       |              |                                  |   
Sbjct plpDIFATKG......NTLLSIECKSTW...enkvKVKEHQVRKLLDFLSMftmkGVPLI   76
DSSP  lllLEEEEEL......LEEEEEEEEEEL...lleeEELHHHHHHHHHHHHLllleEEEEE


DSSP  ELL......HHHH................LHHHHHHHHHL...
Query ARD......EDDL................DENELLMKISN...  135
ident |           |                    |         
Sbjct AIKfkqvheWRVLvpekaediivtidnsiPIEDLFKILEKrie  119
DSSP  EEEehhhleEEEEllllllleeeelllleEHHHHHHHHHHhhl


No 19: 2JC4A  MOLECULE:;                                                           

DSSP  ...........................lllllllllhhhhhhhhhhhhhllLLLL.....
Query ...........................lepidytthsreidaeylkivrgsDPDT.....   28
ident                                                             
Sbjct mkittwnvnslnvrlpqvqnlladnppdilvlqelkldqdkfpaaalqmmgWHCVwsgqk   60
DSSP  leeeeeelllhhhhhhhhhhhhhllllleeeeelllllhhhllhhhhhlllLEEEeelll


DSSP  ..............LEEEEeelllLLEEeeeeellhhhhlllllllllEEEEEEELllll
Query ..............TWLIIspnakKEYEpestgssfhdflqlfdetkvQYGLARVSppgs   74
ident                                                     | ||    
Sbjct tyngvaivsrsvpqDVHFGlpalpDDPQ...................rRVIAATVS....   97
DSSP  lllleeeeelllleEEEELlllllLLLL...................lLEEEEEEL....


DSSP  llLEEEEEEELLLL.....lLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLL...llLEEEEELL......
Query dvEKIIIIGWCPDS.....aPLKTRASFAANFAAVAnNLFK...gyHVQVTARD......  120
ident       |   |           |      |                 |            
Sbjct ..GVRVINVYCVNGealdspKFKYKEQWFAALTEFV.RDEMtrhgkLVLLGDFNiapada  154
DSSP  ..LEEEEEEELLLLlllllhHHHHHHHHHHHHHHHH.HHHHlllllEEEEEELLllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  120
ident                                                             
Sbjct dcydpekwhekihcssverqwfqnlldlgltdslrqvhpegafytwfdyrgamfqrklgl  214
DSSP  hlllhhhhlllllllhhhhhhhhhhhlllleehhhhhlllllllllllllllhhhhllll


DSSP  HHHH..............................LHHHhhhhhhl
Query EDDL..............................DENEllmkisn  135
ident   |                                          
Sbjct RIDHilvspamaaalkdvrvdletralerpsdhaPVTA...efdw  256
DSSP  LLEEeeelhhhhlleeeeeelhhhhlllllllllLEEE...eell


No 20: 2HPUA  MOLECULE: NOSL PROTEIN;                                              

DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEEEELllllEEEEEEELLHHHHLLLL...
Query lepidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIISPNakkeYEPESTGSSFHDFLQLF...   57
ident                                |               |   |        
Sbjct ............................KAQIFLEG....SPAPLFFSQVRDAIAYArgp   28
DSSP  ............................LEEEEELL....LLLEEEELLHHHHHHHHllh


DSSP  LLLLLE.EEEEEELL......llLLLLEEEEEEellllllhhhhhlhhhhhhhhhhhlll
Query DETKVQ.YGLARVSP......pgSDVEKIIIIGwcpdsaplktrasfaanfaavannlfk  110
ident                              |                              
Sbjct EQIAPIlVIYVNDMGaagatwdqPGDGNWIAAD...........................   61
DSSP  HHHLLEeEEEEEELLllllllllLLLLEEELHH...........................


DSSP  llleEEEE......................................LLHH......hhlh
Query gyhvQVTA......................................RDED......dlde  126
ident                                                |            
Sbjct ....KAFYvvgsarrggmgapeavpfssrdeaaafvlaeggqvlalADITdamvltpvet  117
DSSP  ....HLEEeeellllllllllleeeellhhhhhhhhhhleeeeeehHHLLhhhhllllll


DSSP  hhhhhhhhl
Query nellmkisn  135
ident          
Sbjct gsepradde  126
DSSP  lllllllll


No 21: 1H65A  MOLECULE: CHLOROPLAST OUTER ENVELOPE PROTEIN OEP34;                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vrewsgintfapatqtkllellgnlkqedvnsltilvxgkggvgksstvnsiigervvsi   60
DSSP  leelhhhhhllhhhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeeeeelllllhhhhhhhhhlllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct spfqsegprpvxvsrsragftlniidtpglieggyindxalniiksflldktidvllyvd  120
DSSP  lllllllllleeeeeeelleeeeeeelllleelleelhhhhhhhhhhlllleeleeeeee


DSSP  lllLLLLllHHHHHHHHHHHhhLLLLLLleeeeeellllleeeeeeellhhhhlllllll
Query lepIDYTthSREIDAEYLKIvrGSDPDTtwliispnakkeyepestgssfhdflqlfdet   60
ident                    |                                        
Sbjct rldAYRV..DNLDKLVAKAI..TDSFGK................................  144
DSSP  ellLLLL..LHHHHHHHHHH..HHHHLH................................


DSSP  lleeeeeeelllllllLEEEEEEELlllllhhHHHL.....HHHHHHHHHHHLLL.....
Query kvqyglarvsppgsdvEKIIIIGWCpdsaplkTRAS.....FAANFAAVANNLFK.....  110
ident                  | |                         |      |       
Sbjct .............giwNKAIVALTH......aQFSPpdglpYDEFFSKRSEALLQvvrsg  185
DSSP  .............hhhHHEEEEEEL......lLLLLhhhllHHHHHHHHHHHHHHhhhhh


DSSP  .........LLLEEEEELL.................hHHHL.HHHHHHHHHL........
Query .........GYHVQVTARD.................eDDLD.ENELLMKISN........  135
ident               |                                             
Sbjct aslkkdaqaSDIPVVLIENsgrcnkndsdekvlpngiAWIPhLVQTITEVALnksesifv  245
DSSP  lllllllhhHLLLEEELLLllllllllllllllllllLHHHhHHHHHHHHHLllllleel


DSSP  ............
Query ............  135
ident             
Sbjct dknlidklaaad  257
DSSP  lhhhhhhhhhll


No 22: 2AS0A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PH1915;                               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xarvvvdaqaaraigkgaxivfkkgvvrvegdikpgdivevytrggkflgkgfanpnsni   60
DSSP  lleeeelhhhhhhhhlllleeehhheeeeellllllleeeeeelllleeeeeeellllle


DSSP  .............llllLLLLlhhHHHHHHHHhhhlllllLLEEE.EEELlllleeeeee
Query .............lepiDYTThsrEIDAEYLKivrgsdpdTTWLI.ISPNakkeyepest   46
ident                                |        |                   
Sbjct xvrivtkdkdveinkdlFKRR.ikKANEYRKK....vlkyTNVYRxVYGE..........  105
DSSP  eeeeeellllllllhhhHHHH.hhHHHHHHHH....llllLLEEEeEEHH..........


DSSP  ellhhhhllllllllLEEEEEEelllllllleEEEEEELLllllhhhHHLHHHHHHHHHH
Query gssfhdflqlfdetkVQYGLARvsppgsdvekIIIIGWCPdsaplktRASFAANFAAVAN  106
ident                                  |              |        || 
Sbjct .........adylpgLIVDRFN..........DIASLQIS.......SAGXERFKLDVAE  139
DSSP  .........hhllllEEEEEEL..........LEEEEEEL.......LHHHHLLHHHHHH


DSSP  HLLL...LLLEEEEELL..........HHHHlhhhhHHHH....................
Query NLFK...GYHVQVTARD..........EDDLdenelLMKI....................  133
ident        |                   |                                
Sbjct AIXEvepGIETVFEKNTgrsrrreglpEIERvllgkEKYRtiiqegrakfivdxrgqktg  199
DSSP  HHHHhllLLLEEEEEELlhhhhhllllLEEEeeeelLLLEeeeeelleeeeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  133
ident                                                             
Sbjct ffldqrenrlalekwvqpgdrvldvftytggfaihaaiagadevigidkspraietaken  259
DSSP  lllllhhhhhhhhhhllllleeeellllllhhhhhhhhlllleeeeeellhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  133
ident                                                             
Sbjct aklngvedrxkfivgsafeexeklqkkgekfdivvldppafvqhekdlkaglrayfnvnf  319
DSSP  hhhlllhhheeeeellhhhhhhhhhhlllleeeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  133
ident                                                             
Sbjct aglnlvkdggilvtcscsqhvdlqxfkdxiiaagakagkflkxlepyrtqapdhpilxas  379
DSSP  hhhlleeeeeeeeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhlleeeeelllllllllllllllll


DSSP  ...............hl
Query ...............sn  135
ident                  
Sbjct kdteylkclflyvedxr  396
DSSP  hhhllleeeeeeeeell


No 23: 2GIAB  MOLECULE: MITOCHONDRIAL RNA-BINDING PROTEIN 2;                       

DSSP  .......................................................llLLL
Query .......................................................lePID    5
ident                                                             
Sbjct slpkfeihdvrddpaegtmtrvavdgklllisqypqlgprkvdpndlspqfdadrriSVR   60
DSSP  llleeeeeellllhhhleeeeeeeelleeeeeeeelllllllllllllllllhhhleEEE


DSSP  LlllHHHHHHHHHHHHHLLlllLLEEEEEELlllleeeeeeellhhhhlllllllLLEEE
Query YtthSREIDAEYLKIVRGSdpdTTWLIISPNakkeyepestgssfhdflqlfdetKVQYG   65
ident          |                                                  
Sbjct L...RHVDLAYLVGVCKER...VPRHRMETK........................AYTLD   90
DSSP  L...LHHHHHHHHHHHLLL...LLEEEEELL........................LLEEE


DSSP  EEEELlllllllEEEEEEELlllLLHHhhHLHHhhhhhhhhhlllllleeeeellhhhhl
Query LARVSppgsdveKIIIIGWCpdsAPLKtrASFAanfaavannlfkgyhvqvtardeddld  125
ident                  |                                          
Sbjct FEKSA......qGYHLHGKV..hRVAS..QRME....dwsvkfdnhfavtlehflesald  136
DSSP  EEELL......lEEEEEEEE..lLLLL..LLLE....eeeeeeelhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  hhhhhhhhhl
Query enellmkisn  135
ident           
Sbjct esfgfrqhya  146
DSSP  hlllhhhhhl


No 24: 1MD9A  MOLECULE: 2,3-DIHYDROXYBENZOATE-AMP LIGASE;                          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xlkgftpwpdelaetyrkngcwagetfgdllrdraakygdriaitcgnthwsyreldtra   60
DSSP  lllllllllhhhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhlllleeeeelleeeehhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct drlaagfqklgiqqkdrvvvqlpnikeffevifalfrlgalpvfalpshrsseityfcef  120
DSSP  hhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhhhhhhhhlleeeellllllhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aeaaayiipdaysgfdyrslarqvqsklptlkniivageaeeflpledlhtepvklpevk  180
DSSP  lleeeeeeeleelleehhhhhhhhhhhlllllleeeelllllleehhhllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ssdvaflqlsggstglskliprthddyiyslkrsvevcwldhstvylaalpxahnyplss  240
DSSP  llleeeeeellllllllleeeeehhhhhhhhhhhhhhhlllllleeeellllllhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct pgvlgvlyaggrvvlspspspddafplierekvtitalvpplaxvwxdaassrrddlssl  300
DSSP  lhhhhhhhllleeeelllllhhhhhhhhhhhllleeeelhhhhhhhhhhlllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qvlqvggakfsaeaarrvkavfgctlqqvfgxaeglvnytrlddpeeiivntqgkpxspy  360
DSSP  leeeeelllllhhhhllhhhhllleeeeeeeelleeeeellllllhhhhhhllleellll


DSSP  ....................................................llllllll
Query ....................................................lepidytt    8
ident                                                             
Sbjct desrvwddhdrdvkpgetghlltrgpytirgyykaeehnaasftedgfyrtgdivrltrd  420
DSSP  leeeeellllllllllleeeeeeelllllllllllhhhhhlllllllleeeeeeeeelll


DSSP  lhhhhhhhhhHHHHlllLLLLE..EEEEellllleeeeeeellhhhhllllllllLEEEE
Query hsreidaeylKIVRgsdPDTTW..LIISpnakkeyepestgssfhdflqlfdetkVQYGL   66
ident                                                             
Sbjct gyivvegrakDQINrggEKVAAeeVENH....................llahpavHDAAX  460
DSSP  lleeeeeehhHLEElllLEELHhhHHHH....................hhlllleEEEEE


DSSP  EEELLlLLLLLEEEEEEELlllllhhhHHLHHhHHHHHHHHL.......llLLLEEEEEL
Query ARVSPpGSDVEKIIIIGWCpdsaplktRASFAaNFAAVANNL.......fkGYHVQVTAR  119
ident           |                |       |     |                  
Sbjct VSXPD.QFLGERSCVFIIP........RDEAP.KAAELKAFLrerglaaykIPDRVEFVE  510
DSSP  EEEEE.LLLEEEEEEEEEE........LLLLL.LHHHHHHHHhhllllhhhLLLEEEELL


DSSP  LHH.........hhLHHHHHHHHHL.
Query DED.........dlDENELLMKISN.  135
ident                      |    
Sbjct SFPqtgvgkvskkaLREAISEKLLAg  536
DSSP  LLLllllllllhhhHHHHHHHHHHHl


No 25: 2HJGA  MOLECULE: GTP-BINDING PROTEIN ENGA;                                  

DSSP  .....................................lllllllLLHHHHHHHHHHHHHL
Query .....................................lepidytTHSREIDAEYLKIVRG   23
ident                                                  |          
Sbjct kpvvaivgrpnvgkstifnriagerisriyssaewlnydfnlidPFLAQIRQQAEIAXDE   60
DSSP  lleeeeellllllhhhhhhhheeeellleeeelllllllleeelLHHHHHHHHHHHHHHH


DSSP  lllllleeeeeellllleeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeelllllllLEEEEEE
Query sdpdttwliispnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdvEKIIIIG   83
ident                                                        ||   
Sbjct ....................................................aDVIIFXV   68
DSSP  ....................................................lLEEEEEE


DSSP  ELLllllhhhhhlHHHHHHHHHhHLLLLL...LEEEEELLHH..................
Query WCPdsaplktrasFAANFAAVAnNLFKGY...HVQVTARDED..................  122
ident                |    ||           |                          
Sbjct NGR........egVTAADEEVA.KILYRTkkpVVLAVNKLDNniydfyslgfgepypisg  119
DSSP  ELL........llLLHHHHHHH.HHHLLLlllEEEEEELLLLlllllhhhllllleelll


DSSP  ..hhLHHHHHHHHHL.............................................
Query ..dlDENELLMKISN.............................................  135
ident         ||                                                  
Sbjct thglGLGDLLDAVAEhfknipetkyneeviqfcligrpnvgksslvnaxlgeervivsvd  179
DSSP  llllLHHHHHHHHHHlhhhlllllllllleeeeeellllllhhhhhhhhhlllleeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct tsftynqqefvivdtagxrkkgkvyettekysvlralkaidrsevvavvldgeegiieqd  239
DSSP  eeeeelleeeeellhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhlleeeeeeellllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct kriagyaheagkavvivvnkwdavdkdestxkefeenirdhfqfldyapilfxsaltkkr  299
DSSP  hhhhhhhhhllleeeeeeelhhhllllllhhhhhhhhhhhhlhhhlllleeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct ihtlxpaiikasenhslrvqtnvlndvixdavaxnptpthngsrlkiyyatqvsvkppsf  359
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhlllleelleelleeeeeeeellllee


DSSP  .........................................
Query .........................................  135
ident                                          
Sbjct vvfvndpelxhfsyerflenrirdafgfegtpikifarark  400
DSSP  eeeellhhhllhhhhhhhhhhhhhhhllllllleeeeeell


No 26: 1LPMA  MOLECULE: LIPASE;                                                    

DSSP  lllllLLLLHHHhhhhhhhhhhllLLLLLEEEEE................elLLLL.eeE
Query lepidYTTHSREidaeylkivrgsDPDTTWLIIS................pnAKKE.yeP   43
ident                                                             
Sbjct aptatLANGDTI........tglnAIINEAFLGIpfaeppvgnlrfkdpvpySGSLdgqK   52
DSSP  lleeeLLLLLEE........eleeLLLLEEEEEEellllllhhhllllllllLLLLlllL


DSSP  EEEellhhhhllLLLLL....................................LLEEEEE
Query ESTgssfhdflqLFDET....................................KVQYGLA   67
ident                                                             
Sbjct FTS.........YGPSCmqqnpegtyeenlpkaaldlvmqskvfeavspssedCLTINVV  103
DSSP  LLL.........LLLLLllllllllllllhhhhhhhhhhllhhhhhhllllllLLEEEEE


DSSP  E..................................ELLL.LLLLLEEEEEEELLL.....
Query R..................................VSPP.GSDVEKIIIIGWCPD.....   87
ident |                                             |             
Sbjct RppgtkaganlpvmlwifgggfevggtstfppaqmITKSiAMGKPIIHVSVNYRVsswgf  163
DSSP  EllllllllleeeeeeelllllllllhhhlllhhhHHHHhHLLLLLEEEEELLLLhhhhh


DSSP  ........lllhHHHHLHHHHHHHHHHHLLL.............................
Query ........saplKTRASFAANFAAVANNLFK.............................  110
ident                                                             
Sbjct lagdeikaegsaNAGLKDQRLGMQWVADNIAafggdptkvtifgesagsmsvmchilwnd  223
DSSP  lllhhhhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHHHHHhhleeeeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct gdntykgkplfragimqsgamvpsdavdgiygneifdllasnagcgsasdklaclrgvss  283
DSSP  hlleelleellleeeeellllllllllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct dtledatnntpgflaysslrlsylprpdgvnitddmyalvregkyanipviigdqndegt  343
DSSP  hhhhhhhhlllllllllllllllllllllllllllhhhhhhlllllllleeeeeellllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  110
ident                                                             
Sbjct ffgtsslnvttdaqareyfkqsfvhasdaeidtlmtaypgditqgspfdtgilnaltpqf  403
DSSP  hhhhhhlllllhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhllllhhhlllllllllllllllh


DSSP  ...................................llleeeeellhhhhLHHHH......
Query ...................................gyhvqvtardeddlDENEL......  129
ident                                                             
Sbjct krisavlgdlgftlarryflnhytggtkysflskqlsglpvlgtfhsndIVFQDyllgsg  463
DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhllllleeeeeellllllllllllllhhHHHHHllllll


DSSP  .hhHHHL.....................................................
Query .lmKISN.....................................................  135
ident                                                             
Sbjct sliYNNAfiafatdldpntagllvkwpeytsssqsgnnlmminalglytgkdnfrtagyd  523
DSSP  hhhHLHHhhhhhhhllhhhhlllllllllllllllllleeeelllleeeelllllhhhhh


DSSP  ...........
Query ...........  135
ident            
Sbjct alfsnppsffv  534
DSSP  hhhllhhhhll


No 27: 1KFIA  MOLECULE: PHOSPHOGLUCOMUTASE 1;                                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qvipaprvqvtqpyagqkpgtsglrkkvseatqpnylenfvqsifntlrkdelkpknvlf   60
DSSP  lllllleeeellllllllllllleeeehhhhllllhhhhhhhhhhhhllhhhllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vggdgryfnrqaifsiirlayandisevhvgqaglmstpasshyirkvneevgnciggii  120
DSSP  eeelllllhhhhhhhhhhhhhhlllleeeeehhhlllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ltashnpggkehgdfgikfnvrtgapapedftdqiythttkikeyltvdyefekhinldq  180
DSSP  elllllllllllleeeeeeellllllllhhhhhhhhhhhlllleeeellllhhhllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct igvykfegtrlekshfevkvvdtvqdytqlmqklfdfdllkglfsnkdfsfrfdgmhgva  240
DSSP  leeeeeellllllleeeeeeelllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhlllllleeeelllllh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gpyakhifgtllgcskesllncdpsedfggghpdpnltyahdlvelldihkkkdvgtvpq  300
DSSP  hhhhhhhhlllllllhhheelllllllhhhllllllllllhhhhhhllllllllhhhlll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct fgaacdgdadrnmilgrqffvtpsdslaviaananlifkngllgaarsmptsgaldkvaa  360
DSSP  eeeeelllllleeeeelleeelhhhhhhhhhhlhhhhllllllleeeelllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct kngiklfetptgwkffgnlmdaglinlcgeesfgtgsnhirekdgiwavlawltilahkn  420
DSSP  hhllleeeellllhhhhhhhhllllleeeellleeeelllllllhhhhhhhhhhhhhhhl


DSSP  ..............................................lllllLLLLH...h
Query ..............................................lepidYTTHS...r   11
ident                                                             
Sbjct kntdhfvtveeivtqywqqfgrnyysrydyeqvdsagankmmehlktkfqyFEQLKqgnk  480
DSSP  llllllllhhhhhhhhhhhhleeeeeeeeeeeelhhhhhhhhhhhhllhhhHHLLLllle


DSSP  hhhhhhhhhhhlllLLLLEEEEEELlllleeeeeeellhhhhlllllllLLEEEEEEELL
Query eidaeylkivrgsdPDTTWLIISPNakkeyepestgssfhdflqlfdetKVQYGLARVSP   71
ident                                                             
Sbjct adiydyvdpvdqsvSKNQGVRFVFG.......................dGSRIIFRLSGT  517
DSSP  eeelleelllllleELLLLEEEELL.......................lLLEEEEEELLL


DSSP  llLLLLEEEEEEELLLL..llHHHHHLHHHHHHHHHHhLLLLlleeeeellhhhhlhhhh
Query pgSDVEKIIIIGWCPDS..apLKTRASFAANFAAVANnLFKGyhvqvtardeddldenel  129
ident   |    | |             |    |                               
Sbjct .gSVGATIRIYFEQFEQqqiqHETATALANIIKLGLE.ISDI...........aqftgrn  564
DSSP  .lLLLEEEEEEEEEEELllllLLHHHHHHHHHHHHHH.HHLH...........hhhhlll


DSSP  hhhhhl
Query lmkisn  135
ident       
Sbjct eptvit  570
DSSP  llleel


No 28: 1B49A  MOLECULE: PROTEIN (DEOXYCYTIDYLATE HYDROXYMETHYLASE);                

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct misdsmtveeirlhlglalkekdfvvdktgvktieiigasfvadepfifgalndeyiqre   60
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhhhhlllleellllleeeeeeeeeeelllllllllllhhhhhhh


DSSP  ...............................lllLLLL....lLHHHHHHHHHHhhhLLL
Query ...............................lepIDYT....tHSREIDAEYLKivrGSD   25
ident                                                     |       
Sbjct lewykskslfvkdipgetpkiwqqvasskgeinsNYGWaiwseDNYAQYDMCLA..eLGQ  118
DSSP  hhhhhhllllhhhllllllhhhhhhlllllllllLHHHhhhlhHHLLHHHHHHH..hHHH


DSSP  L..lLLEEEEEELLLLleeeeeeellhhhhllllllLLLE.EEEEEELLllllLLEEEEE
Query P..dTTWLIISPNAKKeyepestgssfhdflqlfdeTKVQ.YGLARVSPpgsdVEKIIII   82
ident          |                                                  
Sbjct NpdsRRGIMIYTRPSM.........qfdynkdgmsdFMCTnTVQYLIRD....KKINAVV  165
DSSP  LlllLLLEEELLLLLH.........hhhllhhhlllLLLEeEEEEEEEL....LEEEEEE


DSSP  EELLllllhhhhhlHHHHHHHHHHHlLLLL.................LEEEEELLHH...
Query GWCPdsaplktrasFAANFAAVANNlFKGY.................HVQVTARDED...  122
ident                  |  |                                       
Sbjct NMRS.....ndvvfGFRNDYAWQKY.VLDKlvsdlnagdstrqykagSIIWNVGSLHvys  219
DSSP  EEEE.....eelllHHHHHHHHHHH.HHHHhhhhhhhhlllllleeeEEEEEEEEEEeeh


DSSP  .........hhlhhhhhhhhhl
Query .........dldenellmkisn  135
ident                       
Sbjct rhfylvdhwwktgethiskkdy  241
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllllll


No 29: 2GMHA  MOLECULE: ELECTRON TRANSFER FLAVOPROTEIN-UBIQUINONE                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ckvpritthytiyprdqdkrwegvnmerfaeeadvvivgagpaglsaatrlkqlaaqhek   60
DSSP  llllllllllllllllllhhhlllllllleeelleeeelllhhhhhhhhhhhhhhhhlll


DSSP  .................................................lllllLLLLHH
Query .................................................lepidYTTHSR   11
ident                                                             
Sbjct dlrvclvekaahigahtlsgacldprafeelfpdwkekgaplntpvtedrfgilTEKYRI  120
DSSP  llleeeelllllllllllllleellhhhhhhlllhhhhllllleelleeeeeeeLLLLEE


DSSP  H...........................................................
Query E...........................................................   12
ident                                                             
Sbjct Pvpilpglpmnnhgnyvvrlghlvswmgeqaealgvevypgyaaaeilfhedgsvkgiat  180
DSSP  Elllllllllllllleellhhhhhhhhhhhhhhllleeelllleeeeeellllleeeeee


DSSP  ........................................................hhhh
Query ........................................................idae   16
ident                                                             
Sbjct ndvgiqkdgapkttferglelhakvtifaegchghlakqlykkfdlrancepqtygiglk  240
DSSP  lleeellllleeeeeellleeelleeeellllllhhhhhhhhhllllllllllleeeeee


DSSP  hhhhhHLLL.lllLEEEEEEllllleeeeeeellhhhhllllllLLLEEEEEEELLlllL
Query ylkivRGSD.pdtTWLIISPnakkeyepestgssfhdflqlfdeTKVQYGLARVSPpgsD   75
ident                                             |     |         
Sbjct elwviDEKKwkpgRVDHTVG..................wpldrhTYGGSFLYHLNE...G  279
DSSP  eeeelLHHHllllEEEEEEE..................llllllLLEEEEEEELLL...L


DSSP  LLEEEEEEELLLLL.LHHHhhLHHHHHHHHHHH.LLLL.....lleeeeeLLHH......
Query VEKIIIIGWCPDSA.PLKTraSFAANFAAVANN.LFKG.....yhvqvtaRDED......  122
ident                      |    |         |             |         
Sbjct EPLLALGFVVGLDYqNPYL..SPFREFQRWKHHpSIKPtleggkriaygaRALNeggfqs  337
DSSP  LLEEEEEEEEELLLlLLLL..LHHHHHHHHLLLlLLHHhhllleeeeeeeEEEEllhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct ipkltfpgglligcspgfmnvpkikgthtamksgtlaaesifnqltsenlqsktiglhvt  397
DSSP  lllleelleeelllllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct eyednlknswvwkelysvrnirpschgilgvyggmiytgifywifrgmepwtlkhkgsds  457
DSSP  hhhhhhhllhhhhhhhhlllllhhhhllllhhhhhhhhhhhlllllllllllllllllhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  122
ident                                                             
Sbjct dqlkpakdctpieypkpdgqisfdllssvalsgtnhehdqpahltlkddsvpvnrnlsiy  517
DSSP  hllllhhhllllllllllllllllhhhhhhllllllllllllleeellllhhhhlhhhhh


DSSP  .........................................................hhl
Query .........................................................dld  125
ident                                                             
Sbjct dgpeqrfcpagvyefvpleqgdgfrlqinaqncvhcktcdikdpsqninwvvpeggggpa  577
DSSP  lllhhhhllllleeeeelllllleeeeelhhhlllllhhhhhllllleeellllllllll


DSSP  HHHHhhhhhl
Query ENELlmkisn  135
ident  |        
Sbjct YNGM......  581
DSSP  LLLL......


No 30: 2FOKA  MOLECULE: FOKI RESTRICTION ENDONUCLEASE;                             

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct irtfgwvqnpgkfenlkrvvqvfdrnskvhnevknikiptlvkeskiqkelvaimnqhdl   60
DSSP  llllllllllllhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhlhhhhhlllhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct iytykelvgtgtapcdaiiqatiadqgkgyidnwssdgflrwahalgfieyinksdsfvi  120
DSSP  leehhhhhlllllllllhhhhhllllllllllhhhhhhhhhhhhhllleeeelllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tdvglaysksadgsaiekeilieaissyppairiltlledgqhltkfdlgknlgfsgesg  180
DSSP  lhhhhhhhhlllllhhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhllllleehhhhhllllllllll


DSSP  ...llllllllLHHH.............................................
Query ...lepidyttHSRE.............................................   12
ident                                                             
Sbjct ftslpegilldTLANampkdkgeirnnwegssdkyarmiggwldklglvkqgkkefiipt  240
DSSP  lllllhhhhhhHHHLllhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhllleeelleeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct nkefishafkitgeglkvlrrakgstkftrvpkrvywemlatnltdkeyvrtrralilei  300
DSSP  leeeelleeeelhhhhhhhhhhhlllllllllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................   12
ident                                                             
Sbjct likagslkieqiqdnlkklgfdevietiendikglintgifieikgrfyqlkdhilqfvi  360
DSSP  hhhllleehhhhhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhllllleeeelleeeelllllllll


DSSP  .........................................hhhhhhhhhhllllllLEE
Query .........................................idaeylkivrgsdpdtTWL   31
ident                                                             
Sbjct pnrlvkseleekkselrhklkyvpheyielieiarnstqdrilemkvmeffmkvygyRGK  420
DSSP  lllllllhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllEEE


DSSP  EEEEllllleeeeeeellhhhhllllllllleEEEEEELlllLLLLEEEEEEELLLLllh
Query IISPnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqYGLARVSppgSDVEKIIIIGWCPDSapl   91
ident                                  |        |      |      |   
Sbjct HLGG........................srkpDGAIYTV..gSPIDYGVIVDTKAYSggy  454
DSSP  ELLL........................llllLEEEELL..lLLLLLEEEEEEELLLlll


DSSP  hHHHLHHHHHHHHHHHL..................llLLLEEEEEL..............
Query kTRASFAANFAAVANNL..................fkGYHVQVTAR..............  119
ident       |                                                     
Sbjct nLPIGQADEMQRYVEENqtrnkhinpnewwkvypssvTEFKFLFVSghfkgnykaqltrl  514
DSSP  lLLHHHHHHHHHHHHHHhhlllllllllhhhhlllllLLEEEEEEEllllllhhhhhhhh


DSSP  ...........LHHHHL.........hhhhHHHHHL........
Query ...........DEDDLD.........enelLMKISN........  135
ident                |                            
Sbjct nhitncngavlSVEELLiggemikagtltlEEVRRKfnngeinf  558
DSSP  hhhhlleeeeeEHHHHHhhhhhhhhllllhHHHHLLllleelll


No 31: 1XB2A  MOLECULE: ELONGATION FACTOR TU, MITOCHONDRIAL;                       

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct phvnvgtighvdhgkttltaaitkilaehveystaarhyahtdcpghadyvknxitgtap   60
DSSP  leeeeeeellhhhlhhhhhhhhhhhlllleeeelllleeeeellllhhhhhhhhhhllll


DSSP  .....lllllllllHHHHHHHHHHHHHLLllllleeeeeellllleeeeeeellhhhhll
Query .....lepidytthSREIDAEYLKIVRGSdpdttwliispnakkeyepestgssfhdflq   55
ident                       |                                     
Sbjct ldgcilvvaandgpXPQTREHLLLARQIG...............................   89
DSSP  lleeeeeeelllllLLLHHHHHHHHHHLL...............................


DSSP  llllllleeeeeeelllllllLEEEEEEELLLLLLhhHHHLHHHHHHHHHhHLLL.....
Query lfdetkvqyglarvsppgsdvEKIIIIGWCPDSAPlkTRASFAANFAAVAnNLFK.....  110
ident                      |         |                    |       
Sbjct ....................vEHVVVYVNKADAVQ..DSEXVELVELEIR.ELLTefgyk  126
DSSP  ....................lLLEEEEEELLLLLL..LHHHHHHHHHHHH.HHHHhllll


DSSP  .llLEEEEELL............hHHHL.hHHHHHHHHL.....................
Query .gyHVQVTARD............eDDLD.eNELLMKISN.....................  135
ident                                                             
Sbjct geeTPIIVGSAlcaleqrdpelglKSVQklLDAVDTYIPvptrdlekpfllpvesvysip  186
DSSP  lllLLEEEELHhhhhllllllllhHHHHhhHHHHHHHLLlllllllllleeelleeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct grgtvvtgtlergilkkgdeceflghsknirtvvtgiexfhksldraeagdnlgalvrgl  246
DSSP  lleeeeeeelllleeellleeeeellllleeeeeeeeeelleeeleeellleeeeeelll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct kredlrrglvxakpgsiqphqkveaqvyiltkeeggrhkpfvshfxpvxfsltwdxacri  306
DSSP  lhhhllllleeellllllleeeeeeeeeellhhhllllllllllllleeeelleeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct ilppgkelaxpgedlkltlilrqpxilekgqrftlrdgnrtigtglvtdtpaxteedkni  366
DSSP  elllllllllllleeeeeeeeeeeelllllleeeeelllleeeeeeeeelllllhhhhll


DSSP  ...
Query ...  135
ident    
Sbjct kws  369
DSSP  lll


No 32: 1RJMA  MOLECULE: MENB;                                                      

DSSP  lllllllllhhhhhhhhhhhhhllllllLEEEeeellllleEEEEeellhhhhlllllll
Query lepidytthsreidaeylkivrgsdpdtTWLIispnakkeyEPEStgssfhdflqlfdet   60
ident                               |                             
Sbjct .....................npfdakaWRLV........dGFDD..............l   17
DSSP  .....................llllhhhEEEL........lLLLL..............l


DSSP  LLEEEEEEELllllllLEEEEEEELLLLLlhhHHHL.HHHHHHHHHHhLLLL....lLEE
Query KVQYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDSAplkTRAS.FAANFAAVANnLFKG....yHVQ  115
ident         |                                   |             | 
Sbjct TDITYHRHVD......DATVRVAFNRPEV.rnAFRPhTVDELYRVLD.HARMspdvgVVL   69
DSSP  LLEEEEEELL......LLEEEEEELLHHH.llLLLHhHHHHHHHHHH.HHHHlllllEEE


DSSP  EEELL.......................................................
Query VTARD.......................................................  120
ident  |                                                          
Sbjct LTGNGpspkdggwafcsgghilevqrlirfmpkvviclvngwaaggghslhvvcdltlas  129
DSSP  EEELLlllllllleeellllhhhhhhhhhhllleeeeeelleeelhhhhhhhhlleeeee


DSSP  ...........................................................h
Query ...........................................................e  121
ident                                                             
Sbjct reyarfkqtdadvgsfdggygsaylarqvgqkfareifflgrtytaeqmhqmgavnavae  189
DSSP  lllleeellhhhhlllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlleelhhhhhhhlllleeel


DSSP  hhhLHHHHHHHHHL....................................
Query ddlDENELLMKISN....................................  135
ident     |   |                                         
Sbjct haeLETVGLQWAAEinakspqaqrmlkfafnllddglvgqqlfageatrl  239
DSSP  hhhHHHHHHHHHHHhhlllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhl


No 33: 1R5BA  MOLECULE: EUKARYOTIC PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR GTP-               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tedatdlqnevdqellkdmygkehvnivfighvdagkstlggnilfltgmvdkrtmekie   60
DSSP  lllllllllllllllhhhhllleeeeeeeeelhhhlhhhhhhhhhhhlllllhhhhhhhh


DSSP  .......................................lllllLLLLHhHHHHHHHHHH
Query .......................................lepidYTTHSrEIDAEYLKIV   21
ident                                                             
Sbjct reakerayfetehrrfslldapgasqadigvlvisarrgefeagFERGG.QTREHAVLAR  119
DSSP  hhllllleeellleeeeelllllllllleeeeeeellllhhhhlLLLLL.LHHHHHHHHH


DSSP  HLlllllleeeeeellllleeeeeeellhhhhllllllllleeeeeeelllllllLEEEE
Query RGsdpdttwliispnakkeyepestgssfhdflqlfdetkvqyglarvsppgsdvEKIII   81
ident                                                             
Sbjct TQ...................................................giNHLVV  128
DSSP  HL...................................................llLLEEE


DSSP  EEE.LLLLLLHhHHHLHHHHHHHHHhHLLL........llLEEEEELL..HHHHL.....
Query IGW.CPDSAPLkTRASFAANFAAVAnNLFK........gyHVQVTARD..EDDLD.....  125
ident                                                             
Sbjct VINkMDEPSVQwSEERYKECVDKLS.MFLRrvagynsktdVKYMPVSAytGQNVKdrvds  187
DSSP  EEElLLLLLLLlLHHHHHHHHHHHH.HHHHhhhlllhhhhEEEEELLLllLLLLLlllll


DSSP  ..........HHHHHHHHHL........................................
Query ..........ENELLMKISN........................................  135
ident             | |                                             
Sbjct svcpwyqgpsLLEYLDSMTHlerkvnapfimpiaskykdlgtilegkieagsikknsnvl  247
DSSP  llllllllllHHHHHHHLLLlhhhhlllleeelleeeellleeeeeelllleeelleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct vmpinqtlevtaiydeadeeisssicgdqvrlrvrgddsdvqtgyvltstknpvhattrf  307
DSSP  eellleeeeeeeeellllleeleeellleeeeeeelllllllllleeellllllleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  135
ident                                                             
Sbjct iaqiailelpsilttgyscvmhihtaveevsfakllhkldktnrkskkppmfatkgmkii  367
DSSP  eeeeeellllllllllllleeelllllllleellllllllllllllllllllllllllll


DSSP  ..........................................
Query ..........................................  135
ident                                           
Sbjct aeletqtpvcmerfedyqymgrftlrdqgttvavgkvvkild  409
DSSP  eeeeeeeeeelllllllhhhheeeeellllleeeeeeeeeel


No 34: 1KO2A  MOLECULE: VIM-2 METALLO-BETA-LACTAMASE;                              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct eyptvseipvgevrlyqiadgvwshiatqsfdgavypsnglivrdgdelllidtawgakn   60
DSSP  lllllllllllleeeeeeelleeeeeeeeeelleeeeeeeeeeeelleeeeelllllhhh


DSSP  .................................................lllllllllhh
Query .................................................lepidytthsr   11
ident                                                             
Sbjct taallaeiekqiglpvtravsthfhddrvggvdvlraagvatyaspstrrlaevegneip  120
DSSP  hhhhhhhhhhhlllleeeeelllllhhhhllhhhhhhllleeeelhhhhhhhhhhlllll


DSSP  hhhhhhhhhhhlllllLLEEEEEellllleeeeeeellhhhhlllllllLLEEEEEEEll
Query eidaeylkivrgsdpdTTWLIISpnakkeyepestgssfhdflqlfdetKVQYGLARVsp   71
ident                                                             
Sbjct thsleglsssgdavrfGPVELFY...................pgaahstDNLVVYVPS..  159
DSSP  leellllllllleeeeLLEEEEL...................lllllllLLLEEEELL..


DSSP  llllllEEEEEEEL.........lLLLLHHHHHLHHHHHHHHHhHLLLLLLEEEEEllHH
Query pgsdveKIIIIGWC.........pDSAPLKTRASFAANFAAVAnNLFKGYHVQVTArdED  122
ident            |                    |                           
Sbjct ......ASVLYGGXaiyelsrtsaGNVADADLAEWPTSIERIQ.QHYPEAQFVIPG..HG  210
DSSP  ......LLEEEEELllllllllllLLLLLLLLLLHHHHHHHHH.HHLLLLLEEEEL..LL


DSSP  HH.......lhhhhhhhhhl
Query DL.......denellmkisn  135
ident                     
Sbjct LPggldllkhttnvvkahtn  230
DSSP  LLlllhhhhhhhhhhhhhhl


No 35: 1BO7A  MOLECULE: PROTEIN (THYMIDYLATE SYNTHASE);                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mleqpyldlakkvldeghfkpdrthtgtysifghqmrfdlskgfpllttkkvpfglikse   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhhllleeellllllleeeeeeeeeeeellllllllllllllhhhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct llwflhgdtnirfllqhrnhiwdewafekwvksdeyhgpdmtdfghrsqkdpefaavyhe  120
DSSP  hhhhhllllllhhhhlllllllhhhhhhhhhllllllllllllhhhhhhhlllhhhhhhh


DSSP  ....................llllLLLLLHH..........HHHHHHHHHhHLLLlLLLE
Query ....................lepiDYTTHSR..........EIDAEYLKIvRGSDpDTTW   30
ident                          |    |                             
Sbjct emakfddrvlhddafaakygdlglVYGSQWRawhtskgdtiDQLGDVIEQ.IKTHpYSRT  179
DSSP  hhhhhhhhhhhlhhhhhhhlllllLHHHHHHleellllleeLHHHHHHHH.HHHLlLLLL


DSSP  EEEE.ELLLlleeeeeeellhhhhllllllLLLEEEEEEELllllllLEEEEEEELLLll
Query LIIS.PNAKkeyepestgssfhdflqlfdeTKVQYGLARVSppgsdvEKIIIIGWCPDsa   89
ident || |  |                           |             |           
Sbjct LIVSaWNPE............dvptmalppCHTLYQFYVND......GKLSLQLYQRS..  219
DSSP  LEEElLLLL............lllllllllLEEEEEEEEEL......LEEEEEEEEEE..


DSSP  lhhhhHLHHHHHHHHHHhLLLL........LLEEEEELL.....................
Query plktrASFAANFAAVANnLFKG........YHVQVTARD.....................  120
ident           | |  |  |                                         
Sbjct .adifLGVPFNIASYAL.LTHLvahecgleVGEFIHTFGdahlyvnhldqikeqlsrtpr  277
DSSP  .eellLLHHHHHHHHHH.HHHHhhhhllleEEEEEEEEEeeeeehhhhhhhhhhllllll


DSSP  ........................hhhhlhhhhhhhhhl
Query ........................eddldenellmkisn  135
ident                                        
Sbjct paptlqlnpdkhdifdfdmkdikllnydpypaikapvav  316
DSSP  llleeeellllllhhhllhhheeeellllllllllllll