DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1G61B MOLECULE: TRANSLATION INITIATION FACTOR 6;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1G61-A 45.6  0.3  225   225  100   TRANSLATION INITIATION FACTOR 6;                           "         
   2:  1G62-A 35.2  1.5  221   224   33   RIBOSOME ANTI-ASSOCIATION FACTOR EIF6;                     "         
   3:  1H70-A 10.3  3.2  171   255    9   NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE;             "         
   4:  2JAI-A  9.0  3.5  172   271   10   NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE 1;           "         
   5:  1YNF-A  8.1  3.5  183   429   10   SUCCINYLARGININE DIHYDROLASE;                              "         
   6:  2DEW-X  7.5  3.7  179   629    9   PROTEIN-ARGININE DEIMINASE TYPE IV;                        "         
   7:  1RXX-A  7.5  3.6  179   408    9   ARGININE DEIMINASE;                                        "         
   8:  1JDW-A  7.4  3.3  164   360    8   L-ARGININE\:GLYCINE AMIDINOTRANSFERASE;                    "         
   9:  1S9R-A  7.2  3.5  167   410    8   ARGININE DEIMINASE;                                        "         
  10:  2JER-A  7.1  3.4  148   366    9   AGMATINE DEIMINASE;                                        "         
  11:  1BWD-A  7.1  3.3  157   348   10   PROTEIN (INOSAMINE-PHOSPHATE AMIDINOTRANSFERASE);          "         
  12:  2CMU-A  7.0  3.4  150   334   11   PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      "         
  13:  1XKN-A  6.8  3.5  145   353   11   PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      "         
-

No 1: 1G61A  MOLECULE: TRANSLATION INITIATION FACTOR 6;                           

DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHLEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLHHHH
Query MIIRKYFSGIPTIGVLALTTEEITLLPIFLDKDDVNEVSEVLETKCLQTNIGGSSLVGSL   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct MIIRKYFSGIPTIGVLALTTEEITLLPIFLDKDDVNEVSEVLETKCLQTNIGGSSLVGSL   60
DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHLEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLHHHH


DSSP  LEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEELH
Query SVANKYGLLLPKIVEDEELDRIKNFLKENNLDLNVEIIKSKNTALGNLILTNDKGALISP  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SVANKYGLLLPKIVEDEELDRIKNFLKENNLDLNVEIIKSKNTALGNLILTNDKGALISP  120
DSSP  LEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEELH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLLLLLEEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLL
Query ELKDFKKDIEDSLNVEVEIGTIAELPTVGSNAVVTNKGCLTHPLVEDDELEFLKSLFKVE  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ELKDFKKDIEDSLNVEVEIGTIAELPTVGSNAVVTNKGCLTHPLVEDDELEFLKSLFKVE  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLLLLLEEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEELLLLLLLLLHHHLEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLL
Query YIGKGTANKGTTSVGACIIANSKGAVVGGDTTGPELLIIEDALGL  225
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct YIGKGTANKGTTSVGACIIANSKGAVVGGDTTGPELLIIEDALGL  225
DSSP  EEEELLLLLLLLLHHHLEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLL


No 2: 1G62A  MOLECULE: RIBOSOME ANTI-ASSOCIATION FACTOR EIF6;                     

DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHLEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHL..LEEEELLLLLLLLHH
Query MIIRKYFSGIPTIGVLALTTEEITLLPIFLDKDDVNEVSEVLE..TKCLQTNIGGSSLVG   58
ident |  |  |     |||    |    |                |        | | |    |
Sbjct MATRTQFENSNEIGVFSKLTNTYCLVAVGGSENFYSAFEAELGdaIPIVHTTIAGTRIIG   60
DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLllLLEEEELLLLLLLHH


DSSP  HHLEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEE
Query SLSVANKYGLLLPKIVEDEELDRIKNFLKennLDLNVEIIKSKNTALGNLILTNDKGALI  118
ident      |  ||| |    | ||    | |                 |||| |  ||  || 
Sbjct RMTAGNRRGLLVPTQTTDQELQHLRNSLP...DSVKIQRVEERLSALGNVICCNDYVALV  117
DSSP  HHLEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHLL...LLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEE


DSSP  LHHHHH.HHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLLLLLEEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHH
Query SPELKD.FKKDIEDSLNVEVEIGTIAELPTVGSNAVVTNKGCLTHPLVEDDELEFLKSLF  177
ident  |         | | | |||   ||     |||     | | | ||       | | || 
Sbjct HPDIDReTEELISDVLGVEVFRQTISGNILVGSYCSLSNQGGLVHPQTSVQDQEELSSLL  177
DSSP  LLLLLHhHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLHHHLEEELLLLEEELLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  LLlEEEELLLLLLLLLHHHLEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLL
Query KVeYIGKGTANKGTTSVGACIIANSKGAVVGGDTTGPELLIIEDALGL  225
ident  |     || | |   |||    |   || | ||| |||  ||    |
Sbjct QV.PLVAGTVNRGSSVVGAGMVVNDYLAVTGLDTTAPELSVIESIFRL  224
DSSP  LL.LEEELLLLLLLLLHHHHEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHLLL


No 3: 1H70A  MOLECULE: NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE;             

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL.......................lLHHHHHH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF.......................lDKDDVNE   37
ident                                                             
Sbjct ..................fmFKHIIARTParslvdgltsshlgkpdyakaleqHNAYIRA   42
DSSP  ..................llLLEEEEELLlhhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHH


DSSP  HHHHhLLEEEEL....llllLLLHHHHLEELLLEEEEEL........LLLHhHHHHHHHH
Query VSEVlETKCLQT....niggSSLVGSLSVANKYGLLLPK........IVEDeELDRIKNF   85
ident                     |  |                         |         |
Sbjct LQTC.DVDITLLppderfpdSVFVEDPVLCTSRCAIITRpgaesrrgETEI.IEETVQRF  100
DSSP  HLLL.LLEEEEEllllllllLLLLLLLEEELLLLEEELLlllhhhllHHHH.HHHHHHHH


DSSP  HHhlllllEEEEEL.lLLLLHhHHEEELLLEEEELHH...HHHHHHHHHHHHL...LEEE
Query LKennldlNVEIIK.sKNTALgNLILTNDKGALISPE...LKDFKKDIEDSLN...VEVE  138
ident          || |           |        |                 |        
Sbjct YP.....gKVERIEapGTVEA.GDIMMVGDHFYIGESartNAEGARQMIAILEkhgLSGS  154
DSSP  LL.....lLEEELLllLLLLH.HHEEEELLEEEEEELlllLHHHHHHHHHHHHhllLEEE


DSSP  ELLllLLLLLLLLEEELLL.EEEELLL.LLHHHHHHHhhhhlllEEEELLllLLLLLHHh
Query IGTiaELPTVGSNAVVTNK.GCLTHPL.VEDDELEFLkslfkveYIGKGTanKGTTSVGa  196
ident                       |     |   |            |              
Sbjct VVRleKVLHLKTGLAYLEHnNLLAAGEfVSKPEFQDF.......NIIEIP.eEESYAAN.  205
DSSP  EEEllLLLLHHHLEEELLLlEEEELHHhLLLHHHLLL.......EEEELL.hHHHHHHL.


DSSP  lEEELlLLEEEELLLLhHHHHHHHH.......................hhll
Query cIIANsKGAVVGGDTTgPELLIIED.......................algl  225
ident   |                   |                             
Sbjct .CIWVnERVIMPAGYP.RTREKIARlgyrvievdtseyrkidggvssmslrf  255
DSSP  .LEEElLEEEEELLLH.HHHHHHHLllleeeeellhhhhlllllllllleel


No 4: 2JAIA  MOLECULE: NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE 1;           

DSSP  ....................................................LEEEE...
Query ....................................................MIIRK...    5
ident                                                             
Sbjct afgrathavvralpeslgqhalrsakgeevdvaraerqhqlyvgvlgsklglQVVELpad   60
DSSP  lllllleeeeelllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllEEEEElll


DSSP  .llLLLLLHHHHLEELLLEEEELL........LLLHhHHHHHHHHhLLEEEELLL.lLLL
Query .yfSGIPTIGVLALTTEEITLLPI........FLDKdDVNEVSEVlETKCLQTNI.gGSS   55
ident             |   ||  |             |                         
Sbjct eslPDCVFVEDVAVVCEETALITRpgapsrrkEVDX.XKEALEKL.QLNIVEXKDenATL  118
DSSP  lllLLLLLHHHHEEEELLEEEELLlllhhhhhHHHH.HHHHHHHL.LLEEEELLLllLLL


DSSP  LHhHHLEELLLEEEEELL..LLHHHHHHHHHHHHhlllLLEEEEELLlLLLHHHHEEE.l
Query LVgSLSVANKYGLLLPKI..VEDEELDRIKNFLKennlDLNVEIIKSkNTALGNLILT.n  112
ident                                  |    |  |         |        
Sbjct DG.GDVLFTGREFFVGLSkrTNQRGAEILADTFK....DYAVSTVPV.GLHLKSFCSXag  172
DSSP  LH.HHEEELLLEEEEEELllLLHHHHHHHHHHLL....LLEEEEEEL.LLLHHHLEEEee


DSSP  LLEEEELHH..HHHHHHHHHHH..hLLEEEELLlllLLLLlllEEELL.....LEEEELL
Query DKGALISPE..LKDFKKDIEDS..lNVEVEIGTiaeLPTVgsnAVVTN.....KGCLTHP  163
ident      |          |                              |        |   
Sbjct PNLIAIGSSesAQKALKIXQQXsdhRYDKLTVP...DDIA.anCIYLNipnkgHVLLHRT  228
DSSP  LLEEEELLLhhHHHHHHHHHHLlllLLEEEELL...LLHH.hlLEEEEellleEEEEELL


DSSP  L....llhHHHHHHHHhhllLEEEELLL...lllllLHHHLEEELLLleeeellllhhhh
Query L....vedDELEFLKSlfkvEYIGKGTA...nkgttSVGACIIANSKgavvggdttgpel  216
ident            | ||                         |     |             
Sbjct PeeypesaKVYEKLKD....HXLIPVSXselekvdgLLTCCSVLINK.............  271
DSSP  LlllhhhhHHHLLLLL....EEEEELLLhhhhllllLLHHHLEEELL.............


DSSP  hhhhhhhll
Query liiedalgl  225
ident          
Sbjct .........  271
DSSP  .........


No 5: 1YNFA  MOLECULE: SUCCINYLARGININE DIHYDROLASE;                              

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL....................LLHHHHHHHHH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF....................LDKDDVNEVSE   40
ident                      |                                      
Sbjct ..................naWEVNFDGLVglthhyahrfqvsnprlaakQGLLKXKALAD   42
DSSP  ..................llEEEEEEELLllllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHH


DSSP  HhLLEEEELL......................................lllLLLHHHHLE
Query VlETKCLQTN......................................iggSSLVGSLSV   62
ident                                                       |     
Sbjct A.GFPQAVIPpherpfipvlrqlgfsgsdeqvlekvarqaphwlssvssasPXWVANAAT  101
DSSP  L.LLLEEEELllllllhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhllllhHHLHHHLEE


DSSP  ELL........LEEEEEL.........LLLH..HHHHHHHHHHhhlllLLEEEEEL....
Query ANK........YGLLLPK.........IVED..EELDRIKNFLkennlDLNVEIIK....   99
ident              |                     |  | |          |        
Sbjct IAPsadtldgkVHLTVANlnnkfhrslEAPVteSLLKAIFNDE....eKFSVHSALpqva  157
DSSP  EELllllllllEEEEELLllllhhhhlLHHHhhHHHHHHLLLL....lLEEEELLLlllh


DSSP  lLLLLHHHHEEEL......lLEEEELH................HHHHH.HHHHHHHHLL.
Query sKNTALGNLILTN......dKGALISP................ELKDF.KKDIEDSLNV.  135
ident                        |                                    
Sbjct lLGDEGAANHNRLgghygepGXQLFVYgreegndtrpsryparQTREAsEAVARLNQVNp  217
DSSP  hHLLLHHHHEEEElllllllLEEEEEEllllllllllllllllLLHHHhHHHHHHLLLLh


DSSP  .EEEELLLLL......LLLLLLLEEELLLEEEELLLL...LHHHHHHHHHHHLLLEEEEL
Query .EVEIGTIAE......LPTVGSNAVVTNKGCLTHPLV...EDDELEFLKSLFKVEYIGKG  185
ident   |                    ||        |          |  |            
Sbjct qQVIFAQQNPdvidqgVFHNDVIAVSNRQVLFCHQQAfarQSQLLANLRARVNGFXAIEV  277
DSSP  hHEEEEELLHhhhlllLLLHHHLEEEELLEEEEELLLlllHHHHHHHHHHHLLLLEEEEE


DSSP  ....lllLLLL..LHHHlEEELL.....LLEEEELLL......LHHHHHH..........
Query ....tanKGTT..SVGAcIIANS.....KGAVVGGDT......TGPELLI..........  218
ident          |            |        |            |               
Sbjct patqvsvSDTVstYLFN.SQLLSrddgsXXLVLPQECrehagvWGYLNELlaadnpisel  336
DSSP  llllllhHHHHhhLLLL.LEEEElllllEEEEEEHHHhllhhhHHHHHHHhhlllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  218
ident                                                             
Sbjct kvfdlresxangggpaclrlrvvlteeerravnpavxxndtlfnalndwvdryyrdrlta  396
DSSP  eeellhhhhhlllllllleeeeeelhhhhhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllh


DSSP  ..........................hhhhhll
Query ..........................iedalgl  225
ident                                  
Sbjct adladpqllregrealdvlsqllnlgsvypfqr  429
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhl


No 6: 2DEWX  MOLECULE: PROTEIN-ARGININE DEIMINASE TYPE IV;                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qgtlirvtpeqpthavcvlgtltqldicssapctsfsinaspgvvvditwpldpgvevtl   60
DSSP  leeeeelllllleeeeeellleeeeelllllllleeeeeellleeeelleelllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tmkaasgstgdqkvqisyygpktppvkallyltaveislcaditrtgkqrtwtwgpcgqg  120
DSSP  eellllllllleeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeeeeeeellllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aillvncdrdnlessamdceddevldsedlqdmslmtlstktpkdfftnhtlvlhvarse  180
DSSP  eeellllllllllllllhhhllllllhhhhhhleeeeeeeeelllhhhleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mdkvrvfqatcsvvlgpkwpshylmvpggkhnmdfyvealafpdtdfpglitltislldt  240
DSSP  hhheeeeellleeeellllleeeelllleeeeeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeel


DSSP  ..........leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL....lLHHHHHHHHHHHLLEE
Query ..........miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF....lDKDDVNEVSEVLETKC   46
ident                                                 |         | 
Sbjct snlelpeavvfqdsvvfrvapwimtpntqpPQEVYACSIfenedFLKSVTTLAMKAKCKL  300
DSSP  llllllleeeeeeeeeeeellleellllllEEEEEELLLlllhhHHHHHHHHHHHLLLEE


DSSP  EEL...lllLLLLHHHHLEELL........leEEEELLL...LHHHHHHHHHhhhhlLLL
Query LQT...nigGSSLVGSLSVANK........ygLLLPKIV...EDEELDRIKNflkenNLD   92
ident                                                 |           
Sbjct TICpeeenmDDQWMQDEMEIGYiqaphktlpvVFDSPRNrglKEFPIKRVMG.....PDF  355
DSSP  EELlhhhhlLLLLLLLLEEEEEeeelleeeeeEEELLLLlllLHHHHHHLLL.....LLL


DSSP  LeEEEEL......LLLLLHhHHEEELL...........LEEEELH.........HHHH.H
Query LnVEIIK......SKNTALgNLILTND...........KGALISP.........ELKD.F  125
ident              |                           |                  
Sbjct G.YVTRGpqtggiSGLDSF.GNLEVSPpvtvrgkeyplGRILFGDscypsndsrQMHQaL  413
DSSP  E.EEELLllllllLHHHLH.HHEEELLleeelleeellLLEEEEElllllllllLLLHhH


DSSP  HHHHHHHhLLEEEELLLLLL..LLLLLLEEEL......lLEEEELLL.............
Query KKDIEDSlNVEVEIGTIAEL..PTVGSNAVVT......nKGCLTHPL.............  164
ident                    |    |                 |                 
Sbjct QDFLSAQqVQAPVKLYSDWLsvGHVDEFLSFVpapdrkgFRLLLASPrscyklfqeqqne  473
DSSP  HHHHHHLlLLLLEEEELLLLllLLHHHLEEEEellllllEEEEEEEHhhhhhhhhhhhhl


DSSP  .....................................lLHHHHHHHHHHHL..llEEEEL
Query .....................................vEDDELEFLKSLFK..veYIGKG  185
ident                                        |   | ||         |   
Sbjct ghgeallfegikkkkqqkiknilsnktlrehnsfvercIDWNRELLKRELGlaesDIIDI  533
DSSP  llllleellllllllleehhhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLllhhHEEEE


DSSP  L...........lllLLLLHHhlEEELLLLEEEELL..........LLHHHHHHhHHHH.
Query T...........ankGTTSVGacIIANSKGAVVGGD..........TTGPELLIiEDAL.  223
ident                    |        |                             | 
Sbjct PqlfklkefskaeafFPNMVN..MLVLGKHLGIPKPfgpvingrccLEEKVCSL.LEPLg  590
DSSP  ElleeelhhhleeelLLLLLL..LEEELLEEEEELLllleelleehHHHHHHHH.HHHHl


DSSP  .....................................ll
Query .....................................gl  225
ident                                        
Sbjct lqctfindfftyhirhgevhagtnvrrkpfsfkwwnmvp  629
DSSP  leeeeellllllhhhllllllleeeeellllllhhhlll


No 7: 1RXXA  MOLECULE: ARGININE DEIMINASE;                                        

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL............................lLH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF............................lDK   32
ident                                                             
Sbjct .........tklgvhseagkLRKVXVCSPglahqrltpsncdellfddviwvnqakrdHF   51
DSSP  .........llleellllllEEEEEELLLlhhhhlllllllhhhlllllllhhhhhhhHH


DSSP  HHHHHHHHHhLLEEEEL...........................................
Query DDVNEVSEVlETKCLQT...........................................   49
ident | |    |      |                                             
Sbjct DFVTKXRER.GIDVLEXhnlltetiqnpealkwildrkitadsvglgltselrswlesle  110
DSSP  HHHHHHHLL.LLEEEEHhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllhhhhllllhhhhhhhhhlll


DSSP  .........................................lllLLLLHHHHLEELLLEE
Query .........................................nigGSSLVGSLSVANKYGL   68
ident                                                           | 
Sbjct prklaeyliggvaaddlpaseganilkxyreylghssfllpplpNTQFTRDTTCWIYGGV  170
DSSP  hhhhhhhhhhleehhhllllhhhhhhhhhhhhllllleeelllhHHHLLLLLEEELLLEE


DSSP  EEEL........LLLHhHHHHHHH..HHHHllLLLEEEEE......llLLLLHhHHEEEL
Query LLPK........IVEDeELDRIKN..FLKEnnLDLNVEII......ksKNTALgNLILTN  112
ident  |                    |                                     
Sbjct TLNPxywparrqETLL.TTAIYKFhpEFAN..AEFEIWYGdpdkdhgsSTLEG.GDVXPI  226
DSSP  EELLlllhhhhhHHHH.HHHHHHHlhHHHL..LLLEEEELllllllllLLLLH.HHEEEE


DSSP  L.LEEEELH..HHHH.HHHHHHHH.....hLLEEEELL.llllLLLLLLEEE.lLLEEEE
Query D.KGALISP..ELKD.FKKDIEDS.....lNVEVEIGT.iaelPTVGSNAVV.tNKGCLT  161
ident      ||                |         |                          
Sbjct GnGVVLIGXgeRSSRqAIGQVAQSlfakgaAERVIVAGlpkaaXHLDTVFSFcdRDLVTV  286
DSSP  ElLEEEEEEllLLLHhHHHHHHHHhhhlllLLEEEEEElllllLLHHHHEEEeeLLEEEE


DSSP  LL.LLLH.......................HHHHHHHHH..hllLEEEELL.....llLL
Query HP.LVED.......................DELEFLKSL..fkvEYIGKGT.....anKG  190
ident  |  |                           ||                          
Sbjct FPeVVKEivpfslrpdpsspygxnirreekTFLEVVAESlglkkLRVVETGgnsfereQW  346
DSSP  LHhHHLLleeeeeeellllllleeeeelllLHHHHHHHHlllllLEEEELLlllllllLL


DSSP  LLLHHhlEEELLL.LEEEELLLLhHHHHHHH.HHHL........................
Query TTSVGacIIANSK.GAVVGGDTTgPELLIIE.DALG........................  224
ident                 |     |                                     
Sbjct DDGNN..VVCLEPgVVVGYDRNT.YTNTLLRkAGVEvitisaselgrgrggghcxtcpiv  403
DSSP  LLLLL..LEEEELlEEEEELLLH.HHHHHHHhLLLEeeeelllllllllllllllleeee


DSSP  ....l
Query ....l  225
ident      
Sbjct rdpid  408
DSSP  ellll


No 8: 1JDWA  MOLECULE: L-ARGININE\:GLYCINE AMIDINOTRANSFERASE;                    

DSSP  leeeelllllllhhhhleelllEEEEL.................................
Query miirkyfsgiptigvlaltteeITLLP.................................   27
ident                                                             
Sbjct .........cpvssynewdpleEVIVGraenacvppftievkantyekywpfyqkqgghy   51
DSSP  .........llllllllllleeEEEELlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllll


DSSP  .........lllLHHHHHHHHhhhlLEEEEL................lllLLLLHHHHLE
Query .........iflDKDDVNEVSevleTKCLQT................nigGSSLVGSLSV   62
ident                  |                                 |        
Sbjct fpkdhlkkavaeIEEMCNILK.tegVTVRRPdpidwslkyktpdfestglYSAMPRDILI  110
DSSP  llhhhhhhhhhhHHHHHHHHH.hllLEEELLllllllleeelllleeellLLLLHHHHEE


DSSP  ELLLEEEEEL........LLLHhHHHHHHHHHHhlLLLLeEEEELLL.............
Query ANKYGLLLPK........IVEDeELDRIKNFLKenNLDLnVEIIKSK.............  101
ident                            ||                               
Sbjct VVGNEIIEAPmawrsrffEYRA.YRSIIKDYFH..RGAK.WTTAPKPtmadelynqdypi  166
DSSP  EELLEEEELLlllhhhllHHHH.LHHHHHHHHH..LLLE.EEELLLLlllhhhlllllll


DSSP  ......................LLLHhHHEEELLLEEEELH...HHHHHHHHHHHHHL..
Query ......................NTALgNLILTNDKGALISP...ELKDFKKDIEDSLN..  134
ident                                                         |   
Sbjct hsvedrhklaaqgkfvttefepCFDA.ADFIRAGRDIFAQRsqvTNYLGIEWMRRHLApd  225
DSSP  llhhhhhhhhhhllllllllllLLLH.HHEEEELLEEEELLlllLLHHHHHHHHHHHLll


DSSP  LEEEELLLLLL..LLLLLLEEELLL.EEEELLLLLhhHHHHHhhhhllLEEEELL.....
Query VEVEIGTIAEL..PTVGSNAVVTNK.GCLTHPLVEddELEFLkslfkvEYIGKGT.....  186
ident   | |                       |  |                  |         
Sbjct YRVHIISFKDPnpMHIDATFNIIGPgIVLSNPDRPchQIDLF..kkagWTIITPPtpiip  283
DSSP  LEEEELLLLLLllLLLLLLEEEEELlEEEELLLLLllLHHHH..hhllLEEELLLlllll


DSSP  ....lllllllhhhLEEELLL.LEEEELLLLhHHHHHHH.....................
Query ....ankgttsvgaCIIANSK.GAVVGGDTTgPELLIIE.....................  220
ident                          |      |     |                     
Sbjct ddhplwmsskwlsmNVLMLDEkRVMVDANEV.PIQKMFEklgittikvnirnanslgggf  342
DSSP  lllllllllhhhhhLLEEEELlEEEEELLLH.HHHHHHHhllleeeeellhhhhllllll


DSSP  .............hhhll
Query .............dalgl  225
ident                   
Sbjct hcwtcdvrrrgtlqsyld  360
DSSP  llleeeeeelllllllll


No 9: 1S9RA  MOLECULE: ARGININE DEIMINASE;                                        

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL............................llH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF............................ldK   32
ident                      |  |                                  |
Sbjct ..svfdskfkgihvyseigeLESVLVHEPgreidyitparldellfsaileshdarkehK   58
DSSP  ..llllllllllllllllllEEEEEELLLlhhhhhllhhhhhhhlllllllhhhhhhhhH


DSSP  HHHHHHHHHhllEEEEL...........................................
Query DDVNEVSEVletKCLQT...........................................   49
ident   | |                                                       
Sbjct QFVAELKAN.diNVVELidlvaetydlasqeakdklieefledsepvlseehkvvvrnfl  117
DSSP  HHHHHHHLL.llEEEEHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .................................llllLLLHHHHLEEllLEEEEEL....
Query .................................niggSSLVGSLSVAnkYGLLLPK....   72
ident                                                   |         
Sbjct kakktsrelveimmagitkydlgieadhelivdpmpnLYFTRDPFASvgNGVTIHYmryk  177
DSSP  hllllhhhhhhhhhhleehhhhllllllleeelllhhHHLLLLLEEEelLEEEELLlllh


DSSP  ......LLLHHHHH...HHHHhhhhlllllEEEEEL..lLLLLHhHHEEELL.LEEEELH
Query ......IVEDEELD...RIKNflkennldlNVEIIK..sKNTALgNLILTND.KGALISP  120
ident                     |                                       
Sbjct vrqretLFSRFVFSnhpKLIN........tPWYYDPslkLSIEG.GDVFIYNnDTLVVGV  228
DSSP  hhhllhHHHHHHHHhllLLLL........lLEEELHhhlLLLLH.HHEEELLlLEEEEEE


DSSP  ...HHHHHHHHH.......hhhhLLEEEELLLLLL...LLLLLLEEEL.LLEEEELLLLL
Query ...ELKDFKKDI.......edslNVEVEIGTIAEL...PTVGSNAVVT.NKGCLTHPLVE  166
ident                                                      |  |   
Sbjct serTDLQTVTLLaknivankeceFKRIVAINVPKWtnlMHLDTWLTMLdKDKFLYSPIAN  288
DSSP  lllLLHHHHHHHhhhhhhlllllLLEEEEEELLLLlllLLHHHLEEELlLLEEEELHHHL


DSSP  .......................hHHHHHHHHH.hllLEEEELL.......llLLLL..L
Query .......................dDELEFLKSL.fkvEYIGKGT.......anKGTT..S  193
ident                              | |                        |   
Sbjct dvfkfwdydlvnggaepqpvenglPLEGLLQSIinkkPVLIPIAgegasqmeiEREThfD  348
DSSP  llleeeeeelllllllllleeellLHHHHHHHHhlllLEEEELLlllllhhhhHHHHhlL


DSSP  HHHlEEELLL.LEEEELLLLhHHHHHHHH...............................
Query VGAcIIANSK.GAVVGGDTTgPELLIIED...............................  221
ident       |                    |                                
Sbjct GTN.YLAIRPgVVIGYSRNE.KTNAALEAagikvlpfhgnqlslgmgnarcmsmplsrkd  406
DSSP  LLL.LEEEELlEEEEELLLH.HHHHHHHHllleeeeellhhhhlllllllllleeeeell


DSSP  hhll
Query algl  225
ident     
Sbjct vkwr  410
DSSP  llll


No 10: 2JERA  MOLECULE: AGMATINE DEIMINASE;                                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct akrivgstpkqdgfrmpgefepqekvwmiwperpdnwrdggkpvqeaftnvakaisqftp   60
DSSP  llllllllhhhhlllllllllleeeeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ................................................LEEEEL......
Query ................................................MIIRKY......    6
ident                                                             
Sbjct mnvvvsqqqfqncrrqlppeitvyemsnndawvrdcgpsfvindhgeiRGVDWTfnawgg  120
DSSP  eeeeellllhhhhhhhllllleeeelllllllhhhhlleeeellllleEEEEEElllllh


DSSP  ..............................lLLLLlHHHHLEELLL.EEEELLL......
Query ..............................fSGIPtIGVLALTTEE.ITLLPIF......   29
ident                                      |           |          
Sbjct lvdglyfpwdqddlvaqkiceiehvdsyrtdDFVL.EGGSFHVDGQgTVLTTEMcllseg  179
DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeEEEL.LHHHEEELLLlEEEEEHHhhllll


DSSP  .....lLHHHHHHHHHHHLL.EEEEL.LLLL....LLLHHHHLEELL.lEEEEEL.....
Query .....lDKDDVNEVSEVLET.KCLQT.NIGG....SSLVGSLSVANK.yGLLLPK.....   72
ident                  |   | |              |                     
Sbjct rnpqlsKEAIEQKLCDYLNVeKVLWLgDGIDpeetNGHVDDVACFIApgEVACIYtedqn  239
DSSP  llllllHHHHHHHHHHHHLLlEEEEElLLLLllllLLLHHHLEEEEEllEEEEELlllll


DSSP  .....LLLHhHHHHHHHHHhhLLLLLEEEEELLL..........................
Query .....IVEDeELDRIKNFLkeNNLDLNVEIIKSK..........................  101
ident         |    |           | |                                
Sbjct spfyeAAQD.AYQRLLKMTdaKGRQLKVHKLCCPvknvtikgsfkidfvegtmpredgdi  298
DSSP  lllhhHHHH.HHHHHHLLLllLLLLLEEEEELLLllleelllllllllllllllllllle


DSSP  ..LLLHhhHEEELLLEEEELHH....HHHHHHHHHHHHL.LEEEELLLLLL....lLLLL
Query ..NTALgnLILTNDKGALISPE....LKDFKKDIEDSLN.VEVEIGTIAEL....pTVGS  150
ident           |    |                                 |          
Sbjct ciASYM..NFLITNDGVIVPQYgdenDRLALEQVQTMFPdKKIVGVNTVEVvygggNIHX  356
DSSP  elLLLL..LLEEELLEEEEEELllllHHHHHHHHHHHLLlLEEEEEELHHHhllllLLHH


DSSP  LEEEllleeeelllllhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllhhhleeelllleeeell
Query NAVVtnkgclthplveddeleflkslfkveyigkgtankgttsvgaciianskgavvggd  210
ident                                                             
Sbjct ITQQ........................................................  360
DSSP  HLEE........................................................


DSSP  llhhhhhhhhhHHLL..
Query ttgpelliiedALGL..  225
ident                  
Sbjct ...........EPKRvg  366
DSSP  ...........EELLll


No 11: 1BWDA  MOLECULE: PROTEIN (INOSAMINE-PHOSPHATE AMIDINOTRANSFERASE);          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rslvsvhnewdpleevivgtavgarvptadrsvfaveyagdyesqeqipsgaypdrvlke   60
DSSP  lllllllllllleeeeellllllleellllhhhhhhllllllllhhhllleellhhhhhh


DSSP  .................LEEEE................llLLLLLHHHHLEEllleeeel
Query .................MIIRK................yfSGIPTIGVLALTteeitllp   27
ident                     |                             |         
Sbjct teeelhvlaaeltklgvTVRRPgprdhsaliktpdwetdgFHDYCPRDGLLS........  112
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllEEELLlllllllleelllleellLLLLLHHHLEEE........


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlLEEEELL.....................................
Query ifldkddvnevsevleTKCLQTN.....................................   50
ident                      |                                      
Sbjct ..............vgQTIIETPmalrsrfleslaykdllleyfasgsrwlsapkprltd  158
DSSP  ..............llLEEEELLlllhhhllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllh


DSSP  ...............llLLLLHHhHLEELLLEEEEELL..LLHHHHHHHHHHHHhllLLL
Query ...............igGSSLVGsLSVANKYGLLLPKI..VEDEELDRIKNFLKennLDL   93
ident                                 ||                          
Sbjct dsyapqapagerltdeePVFDAA.NVLRFGTDLLYLVSdsGNELGAKWLQSAVG...DTY  214
DSSP  hhlllllllllllllllLLLLHH.HEEEELLEEEEELLllLLHHHHHHHHHHHL...LLL


DSSP  EEEEEL.LLLL.LHHHHEEELLL.EEEELH.HHHH.HHHHHHHhhLLEEEEL........
Query NVEIIK.SKNT.ALGNLILTNDK.GALISP.ELKD.FKKDIEDslNVEVEIG........  140
ident  |               |        |  |    |    |       |            
Sbjct TVHPCRkLYAStHVDSTIVPLRPgLVLTNPsRVNDeNMPDFLR..SWENITCpelvdigf  272
DSSP  EEEEELlLLLLlLHHHLEEEEELlEEEELLlLLLLlLLLHHHL..LLEEEELllllllll


DSSP  .....llllLLLLllLEEEL.LLEEEELLLLLhHHHHHHHHHhllLEEEELLlLLLL...
Query .....tiaeLPTVgsNAVVT.NKGCLTHPLVEdDELEFLKSLfkvEYIGKGTaNKGT...  191
ident                |  |                   |                     
Sbjct tgdkphcsvWIGM..NLLVVrPDLAVVDRRQT.ALIRLLEKH..gMNVLPLQ.LTHSrtl  326
DSSP  llllllllhHHHH..LLEEEeLLEEEEELLLH.HHHHHHHHL..lLEEEEEL.LLLHhhh


DSSP  .lLHHHLEEELLLleeeellllhhhhhhhhhhhll
Query .tSVGACIIANSKgavvggdttgpelliiedalgl  225
ident                                    
Sbjct ggGFHCATLDVRR.............tgaletyqf  348
DSSP  llLLLLLLEEEEE.............lllllllll


No 12: 2CMUA  MOLECULE: PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xslkrxlaefekiqailxafphefsdwaycikearesflniiqtiakhakvlvcvhtndt   60
DSSP  llleeelllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllh


DSSP  ......................................LEEEEL................
Query ......................................MIIRKY................    6
ident                                                             
Sbjct igyexlknlpgveiakvdtndtwardfgaisienhgvlECLDFGfngwglkypsnldnqv  120
DSSP  hhhhhhllllleeeeelllllllhhhhlleeeeelleeEEEEEEllhhhhllllllhhhh


DSSP  ................llLLLLhHHHLEELLL.EEEELLL...........lLHHHHHHH
Query ................fsGIPTiGVLALTTEE.ITLLPIF...........lDKDDVNEV   38
ident                        |           |                        
Sbjct nfklkslgflkhplktxpYVLE.GGSIESDGAgSILTNTQclleknrnphlnQNGIETXL  179
DSSP  hhhhhhllllllleeeeeEELL.HHHEEELLLlEEEEEHHhhllllllllllHHHHHHHH


DSSP  HHHHLL.EEEELLLLL......LLLHHHHLEE.LLLEEEEELL.........lLHHHHHH
Query SEVLET.KCLQTNIGG......SSLVGSLSVA.NKYGLLLPKI.........vEDEELDR   81
ident    |     |    |        |    |     |                         
Sbjct KKELGAkQVLWYSYGYlkgddtDSHTDTLARFlDKDTIVYSACedkndehytaLKKXQEE  239
DSSP  HHHLLLlEEEEELLLLllllllLLLHHHLEEEeELLEEEEEELlllllllhhhHHHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLLLLEEEEELLL............LLLHhhHEEELLLEEEELHH....HHHH
Query IKNFLKENNLDLNVEIIKSK............NTALgnLILTNDKGALISPE....LKDF  125
ident  | | |                           |      |                   
Sbjct LKTFKKLDKTPYKLIPLEIPkaifdenqqrlpATYV..NFLLCNDALIVPTYndpkDALI  297
DSSP  HHLLLLLLLLLLEEEEEELLllllllllllllLLLL..LLEEELLEEEEEELllllHHHH


DSSP  HHHHHHHHLLEEEELLLLLL....lLLLLLEEEllleeeelllllhhhhhhhhhhhllle
Query KKDIEDSLNVEVEIGTIAEL....pTVGSNAVVtnkgclthplveddeleflkslfkvey  181
ident           ||       |                                        
Sbjct LETLKQHTPLEVIGVDCNTLikqhgSLHCVTXQ...........................  330
DSSP  HHHHHLLLLLEEEEEELLLHhhhllLLHHHLEE...........................


DSSP  eeelllllllllhhhleeelllleeeellllhhhhhhhhhHHLL
Query igkgtankgttsvgaciianskgavvggdttgpelliiedALGL  225
ident                                             
Sbjct ........................................LYEG  334
DSSP  ........................................ELLL


No 13: 1XKNA  MOLECULE: PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct septyfxppewaphastwlswphkleswpgkfepvpavfaelayqlsrsetvninvldda   60
DSSP  llleeellllllleeeeeeellllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeellhh


DSSP  ....................................................lEEEEL..
Query ....................................................mIIRKY..    6
ident                                                      |      
Sbjct xeaqarellkerdpegkyaerivfhriptndawcrdhgpnyvirtqdgrrdkvIXNWEyn  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhheeeeelllllllhhhhlleeeeeeelleeeeeEEEEEll


DSSP  ............................llllLLHHHHLEELL.LEEEELLL........
Query ............................fsgiPTIGVLALTTE.EITLLPIF........   29
ident                                    |           |            
Sbjct awggkyepydddnavpervakaqglpxvstgxVLEGGAIDVNGaGLLLTTTAcllnpnrn  180
DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeELLHHHEEELLlLEEEEEHHhhllllll


DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHLL.EEEELL.....lllLLLHHHHLEE.LLLEEEEELL......
Query ...lDKDDVNEVSEVLET.KCLQTN.....iggSSLVGSLSVA.NKYGLLLPKI......   73
ident                |   | |              |       |               
Sbjct pslgKAEIEAQLRRYLGIeKVLWLGdgiagddtDGHVDDXARFvNENTVVIAVEedpede  240
DSSP  llllHHHHHHHHHHHHLLlEEEEELllllllllLLLHHHLEEEeELLEEEEELLllllll


DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLL...........LLLHhhHEEELLLEEEEL
Query ...vEDEELDRIKNFLKENNLDLNVEIIKSK...........NTALgnLILTNDKGALIS  119
ident       |     |         ||                                 |  
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Sbjct TYrcprDQQAIDILQQCFPkREVVGIDCSDLiwglgAIHCVTHE................  342
DSSP  ELlllhHHHHHHHHHHHLLlLEEEEEELLLHhhhllLLLLLLEE................


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Sbjct ...................................................EPAXlehhh  351
DSSP  ...................................................EELLlllll


DSSP  ..
Query ..  225
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Sbjct hh  353
DSSP  ll