DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1G61A MOLECULE: TRANSLATION INITIATION FACTOR 6;

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1G61-A 47.9  0.0  225   225  100   TRANSLATION INITIATION FACTOR 6;                           "         
   2:  1G62-A 35.2  1.5  221   224   33   RIBOSOME ANTI-ASSOCIATION FACTOR EIF6;                     "         
   3:  1H70-A 10.0  3.2  171   255    9   NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE;             "         
   4:  1YNF-A  8.2  3.3  178   429   10   SUCCINYLARGININE DIHYDROLASE;                              "         
   5:  1S9R-A  8.0  3.5  177   410    9   ARGININE DEIMINASE;                                        "         
   6:  2DEW-X  7.7  3.6  172   629   10   PROTEIN-ARGININE DEIMINASE TYPE IV;                        "         
   7:  2JAI-A  7.3  3.0  146   271   12   NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE 1;           "         
   8:  1JDW-A  7.3  3.3  169   360    8   L-ARGININE\:GLYCINE AMIDINOTRANSFERASE;                    "         
   9:  2JER-A  7.2  3.4  148   366    9   AGMATINE DEIMINASE;                                        "         
  10:  2CMU-A  6.9  3.6  151   334   11   PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      "         
  11:  1XKN-A  6.9  3.5  145   353   10   PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      "         
  12:  1BWD-A  6.9  3.4  160   348   10   PROTEIN (INOSAMINE-PHOSPHATE AMIDINOTRANSFERASE);          "         
  13:  1RXX-A  5.6  3.6  143   408    8   ARGININE DEIMINASE;                                        "         
-

No 1: 1G61A  MOLECULE: TRANSLATION INITIATION FACTOR 6;                           

DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHLEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLHHHH
Query MIIRKYFSGIPTIGVLALTTEEITLLPIFLDKDDVNEVSEVLETKCLQTNIGGSSLVGSL   60
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct MIIRKYFSGIPTIGVLALTTEEITLLPIFLDKDDVNEVSEVLETKCLQTNIGGSSLVGSL   60
DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHLEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLHHHH


DSSP  LEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEELH
Query SVANKYGLLLPKIVEDEELDRIKNFLKENNLDLNVEIIKSKNTALGNLILTNDKGALISP  120
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SVANKYGLLLPKIVEDEELDRIKNFLKENNLDLNVEIIKSKNTALGNLILTNDKGALISP  120
DSSP  LEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEELH


DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLLLLLEEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLL
Query ELKDFKKDIEDSLNVEVEIGTIAELPTVGSNAVVTNKGCLTHPLVEDDELEFLKSLFKVE  180
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct ELKDFKKDIEDSLNVEVEIGTIAELPTVGSNAVVTNKGCLTHPLVEDDELEFLKSLFKVE  180
DSSP  HHHHHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLLLLLEEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHLLL


DSSP  EEEELLLLLLLLLHHHLEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLL
Query YIGKGTANKGTTSVGACIIANSKGAVVGGDTTGPELLIIEDALGL  225
ident |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct YIGKGTANKGTTSVGACIIANSKGAVVGGDTTGPELLIIEDALGL  225
DSSP  EEEELLLLLLLLLHHHLEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLL


No 2: 1G62A  MOLECULE: RIBOSOME ANTI-ASSOCIATION FACTOR EIF6;                     

DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHLEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHHL..LEEEELLLLLLLLHH
Query MIIRKYFSGIPTIGVLALTTEEITLLPIFLDKDDVNEVSEVLE..TKCLQTNIGGSSLVG   58
ident |  |  |     |||    |    |                |        | | |    |
Sbjct MATRTQFENSNEIGVFSKLTNTYCLVAVGGSENFYSAFEAELGdaIPIVHTTIAGTRIIG   60
DSSP  LEEEELLLLLLLHHHHEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLllLLEEEELLLLLLLHH


DSSP  HHLEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHHHhllLLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEE
Query SLSVANKYGLLLPKIVEDEELDRIKNFLKennLDLNVEIIKSKNTALGNLILTNDKGALI  118
ident      |  ||| |    | ||    | |                 |||| |  ||  || 
Sbjct RMTAGNRRGLLVPTQTTDQELQHLRNSLP...DSVKIQRVEERLSALGNVICCNDYVALV  117
DSSP  HHLEELLLEEEEELLLLHHHHHHHHHHLL...LLLEEEEELLLLLLHHHHEEELLLEEEE


DSSP  LHHHHH.HHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLLLLLEEELLLEEEELLLLLHHHHHHHHHHH
Query SPELKD.FKKDIEDSLNVEVEIGTIAELPTVGSNAVVTNKGCLTHPLVEDDELEFLKSLF  177
ident  |         | | | |||   ||     |||     | | | ||       | | || 
Sbjct HPDIDReTEELISDVLGVEVFRQTISGNILVGSYCSLSNQGGLVHPQTSVQDQEELSSLL  177
DSSP  LLLLLHhHHHHHHHHHLLEEEELLLLLLLLHHHLEEELLLLEEELLLLLHHHHHHHHHHH


DSSP  LLlEEEELLLLLLLLLHHHLEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHHLL
Query KVeYIGKGTANKGTTSVGACIIANSKGAVVGGDTTGPELLIIEDALGL  225
ident  |     || | |   |||    |   || | ||| |||  ||    |
Sbjct QV.PLVAGTVNRGSSVVGAGMVVNDYLAVTGLDTTAPELSVIESIFRL  224
DSSP  LL.LEEELLLLLLLLLHHHHEEELLLLEEEELLLLHHHHHHHHHHLLL


No 3: 1H70A  MOLECULE: NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE;             

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL.......................lLHHHHHH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF.......................lDKDDVNE   37
ident                                                             
Sbjct ..................fmFKHIIARTParslvdgltsshlgkpdyakaleqHNAYIRA   42
DSSP  ..................llLLEEEEELLlhhhhhlllllllllllhhhhhhhHHHHHHH


DSSP  HHHHhLLEEEEL....lllLLLLHHHHLEELLLEEEEEL........LLLHhHHHHHHHH
Query VSEVlETKCLQT....nigGSSLVGSLSVANKYGLLLPK........IVEDeELDRIKNF   85
ident                     |  |                         |         |
Sbjct LQTC.DVDITLLppderfpDSVFVEDPVLCTSRCAIITRpgaesrrgETEI.IEETVQRF  100
DSSP  HLLL.LLEEEEElllllllLLLLLLLLEEELLLLEEELLlllhhhllHHHH.HHHHHHHH


DSSP  HHhlllllEEEEEL.lLLLLHhHHEEELLLEEEELHH.......HHHHHHHHHHHhLLEE
Query LKennldlNVEIIK.sKNTALgNLILTNDKGALISPE.......LKDFKKDIEDSlNVEV  137
ident          || |           |        |                  |       
Sbjct YP.....gKVERIEapGTVEA.GDIMMVGDHFYIGESartnaegARQMIAILEKH.GLSG  153
DSSP  LL.....lLEEELLllLLLLH.HHEEEELLEEEEEELllllhhhHHHHHHHHHHL.LLEE


DSSP  EELLllLLLLLLLLEEELLL.EEEELLL.LLHHHHHHhhhhhllLEEEELLlllLLLLHh
Query EIGTiaELPTVGSNAVVTNK.GCLTHPL.VEDDELEFlkslfkvEYIGKGTankGTTSVg  195
ident                        |     |   |            |             
Sbjct SVVRleKVLHLKTGLAYLEHnNLLAAGEfVSKPEFQD.......FNIIEIP..eEESYA.  203
DSSP  EEEEllLLLLHHHLEEELLLlEEEELHHhLLLHHHLL.......LEEEELL..hHHHHH.


DSSP  hLEEELLLLEEEELLLLhHHHHHHHH.......................hhll
Query aCIIANSKGAVVGGDTTgPELLIIED.......................algl  225
ident    |                   |                             
Sbjct aNCIWVNERVIMPAGYP.RTREKIARlgyrvievdtseyrkidggvssmslrf  255
DSSP  hLLEEELLEEEEELLLH.HHHHHHHLllleeeeellhhhhlllllllllleel


No 4: 1YNFA  MOLECULE: SUCCINYLARGININE DIHYDROLASE;                              

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL....................LLHHHHHHHHH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF....................LDKDDVNEVSE   40
ident                      |                                      
Sbjct ..................naWEVNFDGLVglthhyahrfqvsnprlaakQGLLKXKALAD   42
DSSP  ..................llEEEEEEELLllllllllllllllhhhhhhHHHHHHHHHHH


DSSP  HhLLEEEELL......................................lllLLLHHHHLE
Query VlETKCLQTN......................................iggSSLVGSLSV   62
ident                                                       |     
Sbjct A.GFPQAVIPpherpfipvlrqlgfsgsdeqvlekvarqaphwlssvssasPXWVANAAT  101
DSSP  L.LLLEEEELllllllhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhllhhhhhllllhHHLHHHLEE


DSSP  ELL........LEEEEEL.........LLLH..HHHHHHHHhhhhlllLLEEEEEL....
Query ANK........YGLLLPK.........IVED..EELDRIKNflkennlDLNVEIIK....   99
ident              |                     |  | |          |        
Sbjct IAPsadtldgkVHLTVANlnnkfhrslEAPVteSLLKAIFN....deeKFSVHSALpqva  157
DSSP  EELllllllllEEEEELLllllhhhhlLHHHhhHHHHHHLL....lllLEEEELLLlllh


DSSP  lLLLLHHHHEEEL......lLEEEELH................HHHHH.HHHHHHH..hl
Query sKNTALGNLILTN......dKGALISP................ELKDF.KKDIEDS..ln  134
ident                        |                                    
Sbjct lLGDEGAANHNRLgghygepGXQLFVYgreegndtrpsryparQTREAsEAVARLNqvnp  217
DSSP  hHLLLHHHHEEEElllllllLEEEEEEllllllllllllllllLLHHHhHHHHHHLlllh


DSSP  lEEEELLLLL......LLLLLLLEEELLLEEEELLLL...LHHHHHHHHHHHLLLEEEEL
Query vEVEIGTIAE......LPTVGSNAVVTNKGCLTHPLV...EDDELEFLKSLFKVEYIGKG  185
ident   |                    ||        |          |  |            
Sbjct qQVIFAQQNPdvidqgVFHNDVIAVSNRQVLFCHQQAfarQSQLLANLRARVNGFXAIEV  277
DSSP  hHEEEEELLHhhhlllLLLHHHLEEEELLEEEEELLLlllHHHHHHHHHHHLLLLEEEEE


DSSP  ....lllLLLL..LHHHlEEELL.....LLEEEELLL......LHHHHHH..........
Query ....tanKGTT..SVGAcIIANS.....KGAVVGGDT......TGPELLI..........  218
ident          |            |        |            |               
Sbjct patqvsvSDTVstYLFN.SQLLSrddgsXXLVLPQECrehagvWGYLNELlaadnpisel  336
DSSP  llllllhHHHHhhLLLL.LEEEElllllEEEEEEHHHhllhhhHHHHHHHhhlllleeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  218
ident                                                             
Sbjct kvfdlresxangggpaclrlrvvlteeerravnpavxxndtlfnalndwvdryyrdrlta  396
DSSP  eeellhhhhhlllllllleeeeeelhhhhhhllhhhlllhhhhhhhhhhhhhhllllllh


DSSP  ..........................hhhhhll
Query ..........................iedalgl  225
ident                                  
Sbjct adladpqllregrealdvlsqllnlgsvypfqr  429
DSSP  hhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhl


No 5: 1S9RA  MOLECULE: ARGININE DEIMINASE;                                        

DSSP  leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL............................lLH
Query miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF............................lDK   32
ident                      |  |                                  |
Sbjct ..svfdskfkgihvyseigeLESVLVHEPgreidyitparldellfsaileshdarkeHK   58
DSSP  ..llllllllllllllllllEEEEEELLLlhhhhhllhhhhhhhlllllllhhhhhhhHH


DSSP  HHHHHHHHHhLLEEEEL...........................................
Query DDVNEVSEVlETKCLQT...........................................   49
ident   | |                                                       
Sbjct QFVAELKAN.DINVVELidlvaetydlasqeakdklieefledsepvlseehkvvvrnfl  117
DSSP  HHHHHHHLL.LLEEEEHhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhlllllllhhhhhhhhhhh


DSSP  .................................llllLLLHHHHLEELLLEEEEEL....
Query .................................niggSSLVGSLSVANKYGLLLPK....   72
ident                                                   |         
Sbjct kakktsrelveimmagitkydlgieadhelivdpmpnLYFTRDPFASVGNGVTIHYmryk  177
DSSP  hllllhhhhhhhhhhleehhhhllllllleeelllhhHHLLLLLEEEELLEEEELLlllh


DSSP  ....LLLHhHHHHH..HHHHhhlllLLEEEEEL..LLLLlHHHHEEELLL.EEEELH...
Query ....IVEDeELDRI..KNFLkennlDLNVEIIK..SKNTaLGNLILTNDK.GALISP...  120
ident                    |                     |                  
Sbjct vrqrETLF.SRFVFsnHPKL....iNTPWYYDPslKLSI.EGGDVFIYNNdTLVVGVser  231
DSSP  hhhlLHHH.HHHHHhhLLLL....lLLLEEELHhhLLLL.LHHHEEELLLlEEEEEElll


DSSP  HHHHHHHHHH.......hhhLLEEEELLLLL...LLLLLLLEEEL.LLEEEELLLLL...
Query ELKDFKKDIE.......dslNVEVEIGTIAE...LPTVGSNAVVT.NKGCLTHPLVE...  166
ident                                   |               |  |      
Sbjct TDLQTVTLLAknivankeceFKRIVAINVPKwtnLMHLDTWLTMLdKDKFLYSPIANdvf  291
DSSP  LLHHHHHHHHhhhhhlllllLLEEEEEELLLlllLLLHHHLEEELlLLEEEELHHHLlll


DSSP  ....................hHHHHHHHHH.hllLEEEELL.......llLLLL..LHHH
Query ....................dDELEFLKSL.fkvEYIGKGT.......anKGTT..SVGA  196
ident                           | |                        |      
Sbjct kfwdydlvnggaepqpvenglPLEGLLQSIinkkPVLIPIAgegasqmeiEREThfDGTN  351
DSSP  eeeeeelllllllllleeellLHHHHHHHHhlllLEEEELLlllllhhhhHHHHhlLLLL


DSSP  lEEELLL.LEEEELLLLhHHHHHHHH...............................hhl
Query cIIANSK.GAVVGGDTTgPELLIIED...............................alg  224
ident    |                    |                                   
Sbjct .YLAIRPgVVIGYSRNE.KTNAALEAagikvlpfhgnqlslgmgnarcmsmplsrkdvkw  409
DSSP  .LEEEELlEEEEELLLH.HHHHHHHHllleeeeellhhhhlllllllllleeeeelllll


DSSP  l
Query l  225
ident  
Sbjct r  410
DSSP  l


No 6: 2DEWX  MOLECULE: PROTEIN-ARGININE DEIMINASE TYPE IV;                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct qgtlirvtpeqpthavcvlgtltqldicssapctsfsinaspgvvvditwpldpgvevtl   60
DSSP  leeeeelllllleeeeeellleeeeelllllllleeeeeellleeeelleelllllllee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tmkaasgstgdqkvqisyygpktppvkallyltaveislcaditrtgkqrtwtwgpcgqg  120
DSSP  eellllllllleeeeeeeeelleeeeeeeeeeeeeeeeeellllllllllllllllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct aillvncdrdnlessamdceddevldsedlqdmslmtlstktpkdfftnhtlvlhvarse  180
DSSP  eeellllllllllllllhhhllllllhhhhhhleeeeeeeeelllhhhleeeeeelllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct mdkvrvfqatcsvvlgpkwpshylmvpggkhnmdfyvealafpdtdfpglitltislldt  240
DSSP  hhheeeeellleeeellllleeeelllleeeeeeeeeeelllllllllleeeeeeeeeel


DSSP  ..........leeeelllllllhhhhleelLLEEEELLL....lLHHHHHHHHHHHLLEE
Query ..........miirkyfsgiptigvlalttEEITLLPIF....lDKDDVNEVSEVLETKC   46
ident                                                 |         | 
Sbjct snlelpeavvfqdsvvfrvapwimtpntqpPQEVYACSIfenedFLKSVTTLAMKAKCKL  300
DSSP  llllllleeeeeeeeeeeellleellllllEEEEEELLLlllhhHHHHHHHHHHHLLLEE


DSSP  EEL...lllLLLLHHHHLEEL........lleeEEELLL..lHHHH.HHHHHhhhhlllL
Query LQT...nigGSSLVGSLSVAN........kyglLLPKIV..eDEEL.DRIKNflkennlD   92
ident                                            |    |          |
Sbjct TICpeeenmDDQWMQDEMEIGyiqaphktlpvvFDSPRNrglKEFPiKRVMG......pD  354
DSSP  EELlhhhhlLLLLLLLLEEEEeeeelleeeeeeEELLLLlllLHHHhHHLLL......lL


DSSP  LEEEEEL......llLLLHhHHEEELLL...........EEEELH.........HHHH.H
Query LNVEIIK......skNTALgNLILTNDK...........GALISP.........ELKD.F  125
ident                                          |                  
Sbjct FGYVTRGpqtggisgLDSF.GNLEVSPPvtvrgkeyplgRILFGDscypsndsrQMHQaL  413
DSSP  LEEEELLlllllllhHHLH.HHEEELLLeeelleeelllLEEEEElllllllllLLLHhH


DSSP  HHHHHHhhLLEEEELLLLLL..LLLLLLEEEL......lLEEEELLL.............
Query KKDIEDslNVEVEIGTIAEL..PTVGSNAVVT......nKGCLTHPL.............  164
ident                    |    |                 |                 
Sbjct QDFLSAqqVQAPVKLYSDWLsvGHVDEFLSFVpapdrkgFRLLLASPrscyklfqeqqne  473
DSSP  HHHHHHllLLLLEEEELLLLllLLHHHLEEEEellllllEEEEEEEHhhhhhhhhhhhhl


DSSP  .....................................lLHHHHHHHHHHHLLL..EEEEL
Query .....................................vEDDELEFLKSLFKVE..YIGKG  185
ident                                        |   | ||         |   
Sbjct ghgeallfegikkkkqqkiknilsnktlrehnsfvercIDWNRELLKRELGLAesDIIDI  533
DSSP  llllleellllllllleehhhhhhlhhhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHHHHLLLhhHEEEE


DSSP  L...........lllLLLLHHhlEEELLLLEEEELL..........LLHHHHHHHH....
Query T...........ankGTTSVGacIIANSKGAVVGGD..........TTGPELLIIE....  220
ident                    |        |                          |    
Sbjct PqlfklkefskaeafFPNMVN..MLVLGKHLGIPKPfgpvingrccLEEKVCSLLEplgl  591
DSSP  ElleeelhhhleeelLLLLLL..LEEELLEEEEELLllleelleehHHHHHHHHHHhhll


DSSP  .................................hhhll
Query .................................dalgl  225
ident                                       
Sbjct qctfindfftyhirhgevhagtnvrrkpfsfkwwnmvp  629
DSSP  eeeeellllllhhhllllllleeeeellllllhhhlll


No 7: 2JAIA  MOLECULE: NG,NG-DIMETHYLARGININE DIMETHYLAMINOHYDROLASE 1;           

DSSP  ....................................................LEEEE...
Query ....................................................MIIRK...    5
ident                                                             
Sbjct afgrathavvralpeslgqhalrsakgeevdvaraerqhqlyvgvlgsklglQVVELpad   60
DSSP  lllllleeeeelllllhhhhlllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhlllllEEEEElll


DSSP  .llLLLLLHHHHLEellleeeelllllhhhhhhhhhhhLLEEEELL..............
Query .yfSGIPTIGVLALtteeitllpifldkddvnevsevlETKCLQTN..............   50
ident             |                         |   | |               
Sbjct eslPDCVFVEDVAV......................vcEETALITRpgapsrrkevdxxk   98
DSSP  lllLLLLLHHHHEE......................eeLLEEEELLlllhhhhhhhhhhh


DSSP  ..............llllllHHHHLEELLLEEEEELL..LLHHHHHHHHHHHHhlllLLE
Query ..............iggsslVGSLSVANKYGLLLPKI..VEDEELDRIKNFLKennlDLN   94
ident                      |                              |    |  
Sbjct ealeklqlnivexkdenatlDGGDVLFTGREFFVGLSkrTNQRGAEILADTFK....DYA  154
DSSP  hhhhhllleeeellllllllLHHHEEELLLEEEEEELllLLHHHHHHHHHHLL....LLE


DSSP  EEEELLlLLLHHHHEEE.LLLEEEELHH..HHHHHHHHHH..hhLLEEEELLlllLLLLl
Query VEIIKSkNTALGNLILT.NDKGALISPE..LKDFKKDIED..slNVEVEIGTiaeLPTVg  149
ident |         |             |          |                        
Sbjct VSTVPV.GLHLKSFCSXaGPNLIAIGSSesAQKALKIXQQxsdhRYDKLTVP...DDIA.  209
DSSP  EEEEEL.LLLHHHLEEEeELLEEEELLLhhHHHHHHHHHHllllLLEEEELL...LLHH.


DSSP  llEEELL.....LEEEELLL....llhHHHHHHHHhhllLEEEELLL...lllllLHHHL
Query snAVVTN.....KGCLTHPL....vedDELEFLKSlfkvEYIGKGTA...nkgttSVGAC  197
ident       |        |              | ||                         |
Sbjct anCIYLNipnkgHVLLHRTPeeypesaKVYEKLKD....HXLIPVSXselekvdgLLTCC  265
DSSP  hlLEEEEellleEEEEELLLlllhhhhHHHLLLLL....EEEEELLLhhhhllllLLHHH


DSSP  EEELLLleeeellllhhhhhhhhhhhll
Query IIANSKgavvggdttgpelliiedalgl  225
ident      |                      
Sbjct SVLINK......................  271
DSSP  LEEELL......................


No 8: 1JDWA  MOLECULE: L-ARGININE\:GLYCINE AMIDINOTRANSFERASE;                    

DSSP  leeeelllllllhhhhleelllEEEEL.................................
Query miirkyfsgiptigvlaltteeITLLP.................................   27
ident                                                             
Sbjct .........cpvssynewdpleEVIVGraenacvppftievkantyekywpfyqkqgghy   51
DSSP  .........llllllllllleeEEEELlllllllllllhhhhllllhhhhhhhhhhllll


DSSP  ............lLLLHHHHHHHHhhhlLEEEEL................lllLLLLHHH
Query ............iFLDKDDVNEVSevleTKCLQT................nigGSSLVGS   59
ident                                                       |     
Sbjct fpkdhlkkavaeiEEMCNILKTEG....VTVRRPdpidwslkyktpdfestglYSAMPRD  107
DSSP  llhhhhhhhhhhhHHHHHHHHHLL....LEEELLllllllleeelllleeellLLLLHHH


DSSP  HLEELLLEEEEEL........LLLHhHHHHHHHHHHhlLLLLeEEEELLL..........
Query LSVANKYGLLLPK........IVEDeELDRIKNFLKenNLDLnVEIIKSK..........  101
ident                               ||                            
Sbjct ILIVVGNEIIEAPmawrsrffEYRA.YRSIIKDYFH..RGAK.WTTAPKPtmadelynqd  163
DSSP  HEEEELLEEEELLlllhhhllHHHH.LHHHHHHHHH..LLLE.EEELLLLlllhhhllll


DSSP  .........................LLLHhHHEEELLLEEEELH...HHHHHHHHHHHHH
Query .........................NTALgNLILTNDKGALISP...ELKDFKKDIEDSL  133
ident                                                            |
Sbjct ypihsvedrhklaaqgkfvttefepCFDA.ADFIRAGRDIFAQRsqvTNYLGIEWMRRHL  222
DSSP  lllllhhhhhhhhhhllllllllllLLLH.HHEEEELLEEEELLlllLLHHHHHHHHHHH


DSSP  L..LEEEELLL.LLLL.LLLLLEEELLL.EEEELLLLLhHHHHHHhhhhllLEEEELL..
Query N..VEVEIGTI.AELP.TVGSNAVVTNK.GCLTHPLVEdDELEFLkslfkvEYIGKGT..  186
ident      | |       |               |  |                  |      
Sbjct ApdYRVHIISFkDPNPmHIDATFNIIGPgIVLSNPDRPcHQIDLF..kkagWTIITPPtp  280
DSSP  LllLEEEELLLlLLLLlLLLLLEEEEELlEEEELLLLLlLLHHHH..hhllLEEELLLll


DSSP  .........llllLLLHhhLEEE.lLLLEEEELLLLhHHHHHH.................
Query .........ankgTTSVgaCIIA.nSKGAVVGGDTTgPELLII.................  219
ident                |          |   |      |                      
Sbjct iipddhplwmsskWLSM..NVLMldEKRVMVDANEV.PIQKMFeklgittikvnirnans  337
DSSP  llllllllllllhHHHH..LLEEeeLLEEEEELLLH.HHHHHHhhllleeeeellhhhhl


DSSP  .................hhhhll
Query .................edalgl  225
ident                        
Sbjct lgggfhcwtcdvrrrgtlqsyld  360
DSSP  lllllllleeeeeelllllllll


No 9: 2JERA  MOLECULE: AGMATINE DEIMINASE;                                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct akrivgstpkqdgfrmpgefepqekvwmiwperpdnwrdggkpvqeaftnvakaisqftp   60
DSSP  llllllllhhhhlllllllllleeeeeeellllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllll


DSSP  ................................................LEEEEL......
Query ................................................MIIRKY......    6
ident                                                             
Sbjct mnvvvsqqqfqncrrqlppeitvyemsnndawvrdcgpsfvindhgeiRGVDWTfnawgg  120
DSSP  eeeeellllhhhhhhhllllleeeelllllllhhhhlleeeellllleEEEEEElllllh


DSSP  ..............................lLLLLlHHHHLEELLL.EEEELLL......
Query ..............................fSGIPtIGVLALTTEE.ITLLPIF......   29
ident                                      |           |          
Sbjct lvdglyfpwdqddlvaqkiceiehvdsyrtdDFVL.EGGSFHVDGQgTVLTTEMcllseg  179
DSSP  hhhllllllllhhhhhhhhhhhhllleeeeeEEEL.LHHHEEELLLlEEEEEHHhhllll


DSSP  .....lLHHHHHHHHHHHLL.EEEEL.LLLL....LLLHHHHLEELL.lEEEEEL.....
Query .....lDKDDVNEVSEVLET.KCLQT.NIGG....SSLVGSLSVANK.yGLLLPK.....   72
ident                  |   | |              |                     
Sbjct rnpqlsKEAIEQKLCDYLNVeKVLWLgDGIDpeetNGHVDDVACFIApgEVACIYtedqn  239
DSSP  llllllHHHHHHHHHHHHLLlEEEEElLLLLllllLLLHHHLEEEEEllEEEEELlllll


DSSP  .....LLLHhHHHHHHHHHhhLLLLLEEEEELLL..........................
Query .....IVEDeELDRIKNFLkeNNLDLNVEIIKSK..........................  101
ident         |    |           | |                                
Sbjct spfyeAAQD.AYQRLLKMTdaKGRQLKVHKLCCPvknvtikgsfkidfvegtmpredgdi  298
DSSP  lllhhHHHH.HHHHHHLLLllLLLLLEEEEELLLllleelllllllllllllllllllle


DSSP  ..LLLHhhHEEELLLEEEELHH....HHHHHHHHHHHHL.LEEEELLLLLL....lLLLL
Query ..NTALgnLILTNDKGALISPE....LKDFKKDIEDSLN.VEVEIGTIAEL....pTVGS  150
ident           |    |                                 |          
Sbjct ciASYM..NFLITNDGVIVPQYgdenDRLALEQVQTMFPdKKIVGVNTVEVvygggNIHX  356
DSSP  elLLLL..LLEEELLEEEEEELllllHHHHHHHHHHHLLlLEEEEEELHHHhllllLLHH


DSSP  LEEEllleeeelllllhhhhhhhhhhhllleeeelllllllllhhhleeelllleeeell
Query NAVVtnkgclthplveddeleflkslfkveyigkgtankgttsvgaciianskgavvggd  210
ident                                                             
Sbjct ITQQ........................................................  360
DSSP  HLEE........................................................


DSSP  llhhhhhhhhhHHLL..
Query ttgpelliiedALGL..  225
ident                  
Sbjct ...........EPKRvg  366
DSSP  ...........EELLll


No 10: 2CMUA  MOLECULE: PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xslkrxlaefekiqailxafphefsdwaycikearesflniiqtiakhakvlvcvhtndt   60
DSSP  llleeelllllllleeeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeellllh


DSSP  ......................................LEEEELlLLLL...........
Query ......................................MIIRKYfSGIP...........   11
ident                                               |             
Sbjct igyexlknlpgveiakvdtndtwardfgaisienhgvlECLDFGfNGWGlkypsnldnqv  120
DSSP  hhhhhhllllleeeeelllllllhhhhlleeeeelleeEEEEEElLHHHhllllllhhhh


DSSP  ....................LHHHHLEELLL.EEEELLL...........lLHHHHHHHH
Query ....................TIGVLALTTEE.ITLLPIF...........lDKDDVNEVS   39
ident                       |           |                         
Sbjct nfklkslgflkhplktxpyvLEGGSIESDGAgSILTNTQclleknrnphlnQNGIETXLK  180
DSSP  hhhhhhllllllleeeeeeeLLHHHEEELLLlEEEEEHHhhllllllllllHHHHHHHHH


DSSP  HHHLL.EEEEL.LLLL.....lLLHHHHLEE.LLLEEEEELL.........lLHHHHHHH
Query EVLET.KCLQT.NIGG.....sSLVGSLSVA.NKYGLLLPKI.........vEDEELDRI   82
ident   |     |             |    |     |                          
Sbjct KELGAkQVLWYsYGYLkgddtdSHTDTLARFlDKDTIVYSACedkndehytaLKKXQEEL  240
DSSP  HHLLLlEEEEElLLLLllllllLLHHHLEEEeELLEEEEEELlllllllhhhHHHHHHHH


DSSP  HHHHHHLLLLLEEEEELLL............LLLHhhHEEELLLEEEELHH....HHHHH
Query KNFLKENNLDLNVEIIKSK............NTALgnLILTNDKGALISPE....LKDFK  126
ident | | |                           |      |                    
Sbjct KTFKKLDKTPYKLIPLEIPkaifdenqqrlpATYV..NFLLCNDALIVPTYndpkDALIL  298
DSSP  HLLLLLLLLLLEEEEEELLllllllllllllLLLL..LLEEELLEEEEEELllllHHHHH


DSSP  HHHHHHHLLEEEELLLLLL....lLLLLLEEEllleeeelllllhhhhhhhhhhhlllee
Query KDIEDSLNVEVEIGTIAEL....pTVGSNAVVtnkgclthplveddeleflkslfkveyi  182
ident          ||       |                                         
Sbjct ETLKQHTPLEVIGVDCNTLikqhgSLHCVTXQ............................  330
DSSP  HHHHLLLLLEEEEEELLLHhhhllLLHHHLEE............................


DSSP  eelllllllllhhhleeelllleeeellllhhhhhhhhhHHLL
Query gkgtankgttsvgaciianskgavvggdttgpelliiedALGL  225
ident                                            
Sbjct .......................................LYEG  334
DSSP  .......................................ELLL


No 11: 1XKNA  MOLECULE: PUTATIVE PEPTIDYL-ARGININE DEIMINASE;                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct septyfxppewaphastwlswphkleswpgkfepvpavfaelayqlsrsetvninvldda   60
DSSP  llleeellllllleeeeeeellllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhleeeeeellhh


DSSP  ....................................................lEEEEL..
Query ....................................................mIIRKY..    6
ident                                                      |      
Sbjct xeaqarellkerdpegkyaerivfhriptndawcrdhgpnyvirtqdgrrdkvIXNWEyn  120
DSSP  hhhhhhhhhhhhllllllhhheeeeelllllllhhhhlleeeeeeelleeeeeEEEEEll


DSSP  ............................llllLLHHHHLEELL.LEEEELLL........
Query ............................fsgiPTIGVLALTTE.EITLLPIF........   29
ident                                    |           |            
Sbjct awggkyepydddnavpervakaqglpxvstgxVLEGGAIDVNGaGLLLTTTAcllnpnrn  180
DSSP  hhhhlllllhhhhhhhhhhhhhhllleeeeeeELLHHHEEELLlLEEEEEHHhhllllll


DSSP  ...lLHHHHHHHHHHHLL.EEEELL.....lllLLLHHHHLEELL.lEEEEELL......
Query ...lDKDDVNEVSEVLET.KCLQTN.....iggSSLVGSLSVANK.yGLLLPKI......   73
ident                |   | |              |                       
Sbjct pslgKAEIEAQLRRYLGIeKVLWLGdgiagddtDGHVDDXARFVNenTVVIAVEedpede  240
DSSP  llllHHHHHHHHHHHHLLlEEEEELllllllllLLLHHHLEEEEEllEEEEELLllllll


DSSP  ...LLHHHHHHHHHHHHHLLLLLEEEEELLL...........LLLHhhHEEELLLEEEEL
Query ...VEDEELDRIKNFLKENNLDLNVEIIKSK...........NTALgnLILTNDKGALIS  119
ident       |     |         ||                                 |  
Sbjct nykPLRENYELLKTXTGLDGKPLNIVKLPXPepvyydgerlpASYA..NFYIANTVVLVP  298
DSSP  lhhHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEEELLLllleelleellLLLL..LLEELLLEEEEE


DSSP  HH....HHHHHHHHHHHHL.LEEEELLLLLL....lLLLLLEEEllleeeelllllhhhh
Query PE....LKDFKKDIEDSLN.VEVEIGTIAEL....pTVGSNAVVtnkgclthplveddel  170
ident                      ||       |                             
Sbjct TYrcprDQQAIDILQQCFPkREVVGIDCSDLiwglgAIHCVTHE................  342
DSSP  ELlllhHHHHHHHHHHHLLlLEEEEEELLLHhhhllLLLLLLEE................


DSSP  hhhhhhhllleeeelllllllllhhhleeelllleeeellllhhhhhhhhhHHLL.....
Query eflkslfkveyigkgtankgttsvgaciianskgavvggdttgpelliiedALGL.....  225
ident                                                             
Sbjct ...................................................EPAXlehhh  351
DSSP  ...................................................EELLlllll


DSSP  ..
Query ..  225
ident   
Sbjct hh  353
DSSP  ll


No 12: 1BWDA  MOLECULE: PROTEIN (INOSAMINE-PHOSPHATE AMIDINOTRANSFERASE);          

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct rslvsvhnewdpleevivgtavgarvptadrsvfaveyagdyesqeqipsgaypdrvlke   60
DSSP  lllllllllllleeeeellllllleellllhhhhhhllllllllhhhllleellhhhhhh


DSSP  ................leEEEL.................lLLLLLHHHHLEEllleeeel
Query ................miIRKY.................fSGIPTIGVLALTteeitllp   27
ident                    |                              |         
Sbjct teeelhvlaaeltklgvtVRRPgprdhsaliktpdwetdgFHDYCPRDGLLS........  112
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllleEELLlllllllleelllleellLLLLLHHHLEEE........


DSSP  llllhhhhhhhhhhhlLEEEELL.....................................
Query ifldkddvnevsevleTKCLQTN.....................................   50
ident                      |                                      
Sbjct ..............vgQTIIETPmalrsrfleslaykdllleyfasgsrwlsapkprltd  158
DSSP  ..............llLEEEELLlllhhhllhhhhhhhhhhhhhlllleeeelllllllh


DSSP  ...............llLLLLHHhHLEELLLEEEEELL..LLHHHHHHHHHHHHhllLLL
Query ...............igGSSLVGsLSVANKYGLLLPKI..VEDEELDRIKNFLKennLDL   93
ident                                 ||                          
Sbjct dsyapqapagerltdeePVFDAA.NVLRFGTDLLYLVSdsGNELGAKWLQSAVG...DTY  214
DSSP  hhlllllllllllllllLLLLHH.HEEEELLEEEEELLllLLHHHHHHHHHHHL...LLL


DSSP  EEEEEL.LLLL.LHHHHEEELLL.EEEELH.HHHH.HHHHHHHhhLLEEEELLLL.....
Query NVEIIK.SKNT.ALGNLILTNDK.GALISP.ELKD.FKKDIEDslNVEVEIGTIA.....  143
ident  |               |        |  |    |    |       |            
Sbjct TVHPCRkLYAStHVDSTIVPLRPgLVLTNPsRVNDeNMPDFLR..SWENITCPELvdigf  272
DSSP  EEEEELlLLLLlLHHHLEEEEELlEEEELLlLLLLlLLLHHHL..LLEEEELLLLlllll


DSSP  ........lLLLLllLEEEL.LLEEEELLLLLhHHHHHHHHHhllLEEEELLlLLLL...
Query ........eLPTVgsNAVVT.NKGCLTHPLVEdDELEFLKSLfkvEYIGKGTaNKGT...  191
ident                |  |                   |                     
Sbjct tgdkphcsvWIGM..NLLVVrPDLAVVDRRQT.ALIRLLEKH..gMNVLPLQ.LTHSrtl  326
DSSP  llllllllhHHHH..LLEEEeLLEEEEELLLH.HHHHHHHHL..lLEEEEEL.LLLHhhh


DSSP  .lLHHHLEEE.LLLLeeeellllhhhhhhhhhhhll
Query .tSVGACIIA.NSKGavvggdttgpelliiedalgl  225
ident               |                     
Sbjct ggGFHCATLDvRRTG..............aletyqf  348
DSSP  llLLLLLLEEeEELL..............lllllll


No 13: 1RXXA  MOLECULE: ARGININE DEIMINASE;                                        

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct tklgvhseagklrkvxvcspglahqrltpsncdellfddviwvnqakrdhfdfvtkxrer   60
DSSP  llleelllllleeeeeellllhhhhlllllllhhhlllllllhhhhhhhhhhhhhhhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct gidvlexhnlltetiqnpealkwildrkitadsvglgltselrswlesleprklaeylig  120
DSSP  lleeeehhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhllhhhhllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhh


DSSP  ...............................................LEEEEL.......
Query ...............................................MIIRKY.......    6
ident                                                             
Sbjct gvaaddlpaseganilkxyreylghssfllpplpntqftrdttcwiyGGVTLNpxywpar  180
DSSP  leehhhllllhhhhhhhhhhhhllllleeelllhhhhllllleeellLEEEELllllhhh


DSSP  .................................llLLLLHhHHLEELLL.EEEELLL...
Query .................................fsGIPTIgVLALTTEE.ITLLPIF...   29
ident                                                     |       
Sbjct rqetllttaiykfhpefanaefeiwygdpdkdhgsSTLEG.GDVXPIGNgVVLIGXGers  239
DSSP  hhhhhhhhhhhhhlhhhhlllleeeelllllllllLLLLH.HHEEEEELlEEEEEELlll


DSSP  ...lLHHHHHHH..hHHHLlEEEELL.llllLLHHHHLEE.LLLEEEEEL.LLLH.....
Query ...lDKDDVNEV..sEVLEtKCLQTN.iggsSLVGSLSVA.NKYGLLLPK.IVED.....   76
ident                   |                                 |       
Sbjct srqaIGQVAQSLfakGAAE.RVIVAGlpkaaXHLDTVFSFcDRDLVTVFPeVVKEivpfs  298
DSSP  lhhhHHHHHHHHhhlLLLL.EEEEEElllllLLHHHHEEEeELLEEEELHhHHLLleeee


DSSP  ..................HHHHHHHHHHhhLLLLLEEEEELLL.......LLLHHhhEEE
Query ..................EELDRIKNFLkeNNLDLNVEIIKSK.......NTALGnlILT  111
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Sbjct lrpdpsspygxnirreekTFLEVVAESL..GLKKLRVVETGGNsfereqwDDGNN..VVC  354
DSSP  eeellllllleeeeelllLHHHHHHHHL..LLLLLEEEELLLLlllllllLLLLL..LEE


DSSP  L.LLEEEELHHHHHHHHHHHHHhLLEEEELLLLLLL....LLLLLEEEllleeeelllll
Query N.DKGALISPELKDFKKDIEDSlNVEVEIGTIAELP....TVGSNAVVtnkgclthplve  166
ident                         |||      ||                         
Sbjct LePGVVVGYDRNTYTNTLLRKA.GVEVITISASELGrgrgGGHCXTCP............  401
DSSP  EeLLEEEEELLLHHHHHHHHHL.LLEEEEELLLLLLllllLLLLLLEE............


DSSP  hhhhhhhhhhhllleeeelllllllllhhhleeELLLleeeellllhhhhhhhhhhhll
Query ddeleflkslfkveyigkgtankgttsvgaciiANSKgavvggdttgpelliiedalgl  225
ident                                                            
Sbjct ................................iVRDP....................id  408
DSSP  ................................eEELL....................ll