DaliLite: Structural Neighbours

Query: 1CI0B MOLECULE: PROTEIN (PNP OXIDASE);

The output is truncated at max 100 structural neighbours. Matches are sorted by Z-score. Similarities with a Z-score lower than 2 are spurious.
Summary

Notation:
Chain: PDB entry code plus chain identifier
Z: normalized Z-score that depends on the size of the structures. The program optimises a weighted sum of similarities of intramolecular distances.
rmsd: root-mean-square deviation of C-alpha atoms in the least-squares superimposition of the structurally equivalent C-alpha atoms. The program does not optimise rmsd, this is only reported for your information.
lali: number of structurally equivalent residues
nres: number of amino acids in the protein
%id: percentage of identical amino acids over all structurally equivalent residues
Description: the COMPND record from the PDB entry
  No:  Chain   Z    rmsd lali nres  %id  Description
   1:  1CI0-A 33.3  0.1  204   205  100   PROTEIN (PNP OXIDASE);                                     "         
   2:  1G76-A 25.5  1.4  198   199   41   PYRIDOXINE 5`-PHOSPHATE OXIDASE;                           "         
   3:  1NRG-A 25.3  1.5  196   213   40   PYRIDOXINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE;                           "         
   4:  2A2J-A 23.9  1.5  194   203   37   PYRIDOXAMINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE;                         "         
   5:  1TY9-A 23.7  1.9  196   202   24   PHENAZINE BIOSYNTHESIS PROTEIN PHZG;                       "         
   6:  2I51-A 18.1  2.4  177   194   14   UNCHARACTERIZED CONSERVED PROTEIN OF COG5135;              "         
   7:  2OU5-A 14.5  2.4  156   175   19   PYRIDOXAMINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE-RELATED, FMN-            "         
   8:  2I02-A 12.7  2.9  133   140   12   GENERAL STRESS PROTEIN OF COG3871;                         "         
   9:  2FHQ-A 12.5  2.4  129   135   13   PUTATIVE GENERAL STRESS PROTEIN;                           "         
  10:  2HHZ-A 11.7  3.0  124   139   14   PYRIDOXAMINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE-RELATED;                 "         
  11:  2IAB-A 10.9  2.9  129   153   16   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  12:  2IG6-A 10.7  2.9  125   143   14   NIMC/NIMA FAMILY PROTEIN;                                  "         
  13:  2HQ7-A 10.7  3.2  130   141    9   PROTEIN, RELATED TO GENERAL STRESS PROTEIN                 "         
  14:  2ARZ-A 10.7  3.3  129   238    7   HYPOTHETICAL PROTEIN PA4388;                               "         
  15:  2HTI-A 10.1  2.7  113   126   14   BH0577 PROTEIN;                                            "         
  16:  1VL7-A 10.0  3.0  117   135   15   HYPOTHETICAL PROTEIN ALR5027;                              "         
  17:  2AQ6-A  9.9  3.3  118   143   10   PYRIDOXINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE;                           "         
  18:  2HTD-A  9.8  2.5  107   121   12   PREDICTED FLAVIN-NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN FROM           "         
  19:  2ASF-A  9.8  3.0  113   125   10   HYPOTHETICAL PROTEIN RV2074;                               "         
  20:  1RFE-A  9.7  3.3  121   160   17   HYPOTHETICAL PROTEIN RV2991;                               "         
  21:  2QEA-A  9.6  3.7  132   160   11   PUTATIVE GENERAL STRESS PROTEIN 26;                        "         
  22:  2HQ9-A  9.2  2.7  107   135   15   MLL6688 PROTEIN;                                           "         
  23:  1XHN-A  9.2  3.5  126   172   12   CELLULAR REPRESSOR OF E1A-STIMULATED GENES;                "         
  24:  2FG9-A  8.8  3.3  121   166   12   5-NITROIMIDAZOLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN;            "         
  25:  1AXJ-A  8.7  2.5  106   122    7   FMN-BINDING PROTEIN;                                       "         
  26:  2FUR-A  8.2  3.1  119   193   10   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  27:  2OL5-A  7.8  3.0  113   183   15   PAI 2 PROTEIN;                                             "         
  28:  2Q9K-A  7.6  3.1  106   147    8   UNCHARACTERIZED PROTEIN;                                   "         
  29:  1W3O-A  7.4  3.5  117   204    6   NIMA-RELATED PROTEIN;                                      "         
  30:  2PTF-A  6.9  3.1  100   200    6   UNCHARACTERIZED PROTEIN MTH_863;                           "         
  31:  1I0R-A  6.6  2.5   89   161    8   CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            "         
  32:  2QCK-A  6.2  2.7   88   159   11   FLAVIN REDUCTASE DOMAIN PROTEIN;                           "         
  33:  2IML-A  6.1  3.5   90   191    8   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  34:  1WGB-A  6.1  2.7   90   159    7   PROBABLE FLAVOPROTEIN;                                     "         
  35:  2D5M-A  6.0  3.5   95   183    5   FLAVOREDOXIN;                                              "         
  36:  1USC-A  6.0  3.1   93   178    8   PUTATIVE STYRENE MONOOXYGENASE SMALL COMPONENT;            "         
  37:  2D36-A  5.9  3.5   91   154    7   HYPOTHETICAL NADH-DEPENDENT FMN OXYDOREDUCTASE;            "         
  38:  1RZ0-A  5.9  3.4   90   153    9   PHENOL 2-HYDROXYLASE COMPONENT B;                          "         
  39:  1EJE-A  5.7  4.1   93   192    9   FMN-BINDING PROTEIN;                                       "         
  40:  1Y12-A  5.4  4.0  107   160    3   HYPOTHETICAL PROTEIN PA0085;                               "         
  41:  2GJG-A  5.2  3.3  100   247    9   HYPOTHETICAL PROTEIN PP4397;                               "         
  42:  2A4O-A  4.6  3.1   82   215    6   PROBABLE PROTEIN P3C;                                      "         
  43:  2IDB-A  4.2  3.3  104   474   13   3-OCTAPRENYL-4-HYDROXYBENZOATE CARBOXY-LYASE;              "         
  44:  1YWU-A  3.9  3.1   79   125   10   HYPOTHETICAL PROTEIN PA4608;                               "         
  45:  2BM2-A  3.7  3.6   85   242    7   HUMAN BETA2 TRYPTASE;                                      "         
  46:  1QTF-A  3.7  4.4   83   246   13   EXFOLIATIVE TOXIN B;                                       "         
  47:  2JE2-A  3.6  3.8   91   157    9   CYTOCHROME P460;                                           "         
  48:  2IJO-B  3.5  5.4   83   168    8   POLYPROTEIN;                                               "         
  49:  1M9U-A  3.5  4.3   84   241    6   EARTHWORM FIBRINOLYTIC ENZYME;                             "         
  50:  1AZZ-A  3.1  3.6   80   226    6   COLLAGENASE;                                               "         
  51:  1KCG-C  3.0  5.0   80   170    4   NKG2-D TYPE II INTEGRAL MEMBRANE PROTEIN;                  "         
  52:  1E54-A  3.0  5.0   87   332    7   OUTER MEMBRANE PORIN PROTEIN 32;                           "         
  53:  2P3P-A  2.9  6.5   72   197    8   HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      "         
  54:  1LVB-A  2.8  3.9   76   214    8   CATALYTIC DOMAIN OF THE NUCLEAR INCLUSION                  "         
  55:  1LCY-A  2.8  3.9   75   296   12   HTRA2 SERINE PROTEASE;                                     "         
  56:  1H6S-1  2.6  4.1   75   289   11   PORIN;                                                     "         
  57:  1C5M-D  2.6  3.6   89   241    8   PROTEIN (COAGULATION FACTOR X);                            "         
  58:  2JN9-A  2.4  4.3   66   105    8   YKVR PROTEIN;                                              "         
  59:  1Z8R-A  2.4  5.2   73   150    7   COXSACKIEVIRUS B4 POLYPROTEIN;                             "         
  60:  1G99-A  2.4  2.2   55   398    4   ACETATE KINASE;                                            "         
  61:  1L8J-A  2.3  5.3   77   170    1   ENDOTHELIAL PROTEIN C RECEPTOR;                            "         
  62:  2BHG-A  2.2  3.4   73   194    8   FOOT-AND-MOUTH DISEASE VIRUS 3C PROTEASE;                  "         
  63:  1SI5-H  2.2  3.7   82   227    9   HEPATOCYTE GROWTH FACTOR;                                  "         
  64:  1ARB-A  2.2  5.1   95   263    1   ACHROMOBACTER PROTEASE I;                                  "         
  65:  1A7S-A  2.2  4.1   81   221    7   HEPARIN BINDING PROTEIN;                                   "         
  66:  1XKH-A  2.1 14.6   98   687    1   FERRIPYOVERDINE RECEPTOR;                                  "         
  67:  1P3C-A  2.1  3.5   74   215    8   GLUTAMYL-ENDOPEPTIDASE;                                    "         
-

No 1: 1CI0A  MOLECULE: PROTEIN (PNP OXIDASE);                                     

DSSP  .LLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEELLEELLL
Query .TLNEKQLTDDPIDLFTKWFNEAKEDPRETLPEAITFSSAELPSGRVSSRILLFKELDHR   59
ident  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct fTLNEKQLTDDPIDLFTKWFNEAKEDPRETLPEAITFSSAELPSGRVSSRILLFKELDHR   60
DSSP  lLLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEELLEELLL


DSSP  LEEEEEELLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLHH
Query GFTIYSNWGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRETSERYFKTRPRG  119
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct GFTIYSNWGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRETSERYFKTRPRG  120
DSSP  LEEEEEELLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLHH


DSSP  HHHHHHHLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLL
Query SKIGAWASRQSDVIKNREELDELTQKNTERFKDAEDIPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRP  179
ident ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct SKIGAWASRQSDVIKNREELDELTQKNTERFKDAEDIPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRP  180
DSSP  HHHHHHHLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLL


DSSP  LLLLEEEEEELLLLLLLLEEEEELL
Query SRLHDRFVYRRKTENDPWKVVRLAP  204
ident |||||||||||||||||||||||||
Sbjct SRLHDRFVYRRKTENDPWKVVRLAP  205
DSSP  LLLLEEEEEELLLLLLLLEEEEELL


No 2: 1G76A  MOLECULE: PYRIDOXINE 5`-PHOSPHATE OXIDASE;                           

DSSP  .LLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEELLL
Query .TLNEKQLTDDPIDLFTKWFNEAKEDPrETLPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELDHR   59
ident   |    |  ||  ||  |   | |      | |          |    || | |  |  
Sbjct gGLRRRDLPADPLTLFERWLSQACEAK.LADPTAMVVATVDE.HGQPYQRIVLLKHYDEK   58
DSSP  lLLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEELLEEELL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLHH
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRETSERYFKTRPRG  119
ident |   | |   ||||| |  ||     | |  | ||| | |  |         ||  ||| 
Sbjct GMVFYTN.LGSRKAHQIENNPRVSLLFPWHTLERQVMVIGKAERLSTLEVMKYFHSRPRD  117
DSSP  EEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEHHHLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHLLLLHH


DSSP  HHHHHHHLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLL
Query SKIGAWASRQSDVIKNREELDELTQKNTERFKdAEDIPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRP  179
ident | |||| | ||  |  |  |          |      | |  ||| |     ||||||  
Sbjct SQIGAWVSKQSSRISARGILESKFLELKQKFQ.QGEVPLPSFWGGFRVSLEQIEFWQGGE  176
DSSP  HHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLLLLLLLEEEEEELLLEEEEEELLH


DSSP  LLLLEEEEEELLllLLLLEEEEELL
Query SRLHDRFVYRRKteNDPWKVVRLAP  204
ident  |||||| | |   || ||  ||||
Sbjct HRLHDRFLYQRE..NDAWKIDRLAP  199
DSSP  HHLLEEEEEEEE..LLEEEEEELLL


No 3: 1NRGA  MOLECULE: PYRIDOXINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE;                           

DSSP  llLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEELLLL
Query tlNEKQLTDDPIDLFTKWFNEAKEDPRETLPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELDHRG   60
ident          ||   |  || ||   |      |          |  | | || |     |
Sbjct .eETHLTSLDPVKQFAAWFEEAVQCPDIGEANAMCLATCTR.DGKPSARMLLLKGFGKDG   58
DSSP  .lLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEELLLEELLE


DSSP  EEEEEELlLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLHHH
Query FTIYSNWgTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRETSERYFKTRPRGS  120
ident |    |   |||      || |  || |  | |||||||       |  | ||  ||  |
Sbjct FRFFTNF.ESRKGKELDSNPFASLVFYWEPLNRQVRVEGPVKKLPEEEAECYFHSRPKSS  117
DSSP  EEEEEEL.LLHHHHHHHHLLEEEEEEEEHHHLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHHHLLHHH


DSSP  HHHHHHLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHLLLLlLLLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLLL
Query KIGAWASRQSDVIKNREELDELTQKNTERFKDAeDIPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRPS  180
ident  |||  | || ||  || |            |    | |  |||    |   |||||   
Sbjct QIGAVVSHQSSVIPDREYLRKKNEELEQLYQDQ.EVPKPKSWGGYVLYPQVMEFWQGQTN  176
DSSP  HHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLL.LLLLLLLEEEEEELLLEEEEEELLLL


DSSP  LLLEEEEEELL.............lllLLLEEEEELL
Query RLHDRFVYRRK.............tenDPWKVVRLAP  204
ident ||||| | ||                   |   ||||
Sbjct RLHDRIVFRRGlptgdsplgpmthrgeEDWLYERLAP  213
DSSP  LLLEEEEEEELlllllllllllleellLLEEEEELLL


No 4: 2A2JA  MOLECULE: PYRIDOXAMINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE;                         

DSSP  .......LLLHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEEL
Query .......TLNEKQLTDDPIDLFTKWFNEAKEDPrETLPEAITFSSAElpSGRVSSRILLF   53
ident         |    | |    |   | | |        | |          |    |  | 
Sbjct pekdgxgDLDFDWLDDGWLTLLRRWLNDAQRAG.VSEPNAMVLATVA..DGKPVTRSVLC   57
DSSP  lllllllLLLHHHHLLHHHHHHHHHHHHHHHLL.LLLLLEEEEEEEE..LLEEEEEEEEE


DSSP  LEELLLLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHH
Query KELDHRGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRETSERYF  113
ident | ||  |        || |    |  | |   | |  | ||  | |    |  |    | 
Sbjct KILDESGVAFFTS.YTSAKGEQLAVTPYASATFPWYQLGRQAHVQGPVSKVSTEEIFTYW  116
DSSP  EEEELLEEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEHHHLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHH


DSSP  HHLLHHHHHHHHHLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEE
Query KTRPRGSKIGAWASRQSDVIKNREELDELTQKNTERFKDAEDIPCPDYWGGLRIVPLEIE  173
ident   ||||   ||||| ||     |  ||      | || |   || |  ||| || |   |
Sbjct SMRPRGAQLGAWASQQSRPVGSRAQLDNQLAEVTRRFADQDQIPVPPGWGGYRIAPEIVE  176
DSSP  HHLLHHHHHHHHHLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLEEEEEELLLEEE


DSSP  EEELLLLLLLEEEEEELllllllLEEEEELL..
Query FWQGRPSRLHDRFVYRRktendpWKVVRLAP..  204
ident |||||  | | |               || |  
Sbjct FWQGRENRMHNRIRVAN......GRLERLQPgs  203
DSSP  EEELLLLLLLEEEEEEL......LEEEELLLll


No 5: 1TY9A  MOLECULE: PHENAZINE BIOSYNTHESIS PROTEIN PHZG;                       

DSSP  .....LLLH.HHLLLLHHHHHHHHHHHHHHLLlLLLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELL
Query .....TLNE.KQLTDDPIDLFTKWFNEAKEDPrETLPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFK   54
ident         |   |  ||      |   |        | |     |    || | ||    
Sbjct gtldaPFPEyQTLPADPMSVLHNWLERARRVG.IREPRALALATADS.QGRPSTRIVVIS   58
DSSP  lllllLLLHhHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHL.LLLLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEELL


DSSP  EELLLLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHH
Query ELDHRGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRETSERYFK  114
ident |    |         | |      || |  |  |     |    |               
Sbjct EISDAGVVFSTH.AGSQKGRELLHNPWASGVLYWRETSQQIILNGQAVRLPNAKADDAWL  117
DSSP  EELLLEEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHHHHH


DSSP  HLLHHHHHHHHHLLLLLEELLHHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLLLLLEEEEEEEEEEEEE
Query TRPRGSKIGAWASRQSDVIKNREELDELTQKNTERfkdAEDIPCPDYWGGLRIVPLEIEF  174
ident  ||         ||||                 |        | |             ||
Sbjct KRPYATHPMSSVSRQSEELQDVQAMRNAARQLAEL...QGPLPRPEGYCVFELRLESLEF  174
DSSP  LLLHHHHHHHHHLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHLL...LLLLLLLLLEEEEEEEEEEEEE


DSSP  EELLLLLLLEEEEEELLllLLLLEEEEELL
Query WQGRPSRLHDRFVYRRKteNDPWKVVRLAP  204
ident |     ||| |  | |      | | || |
Sbjct WGNGQERLHERLRYDRS..DTGWNVRRLQP  202
DSSP  EEEEELLEEEEEEEEEE..LLEEEEEEELL


No 6: 2I51A  MOLECULE: UNCHARACTERIZED CONSERVED PROTEIN OF COG5135;              

DSSP  lllhhhlllLHHHHHHHHHHHHHHlllLLLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEEL..L
Query tlnekqltdDPIDLFTKWFNEAKEdprETLPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELD..H   58
ident                                            ||   | | |       
Sbjct .....xslaPWRGAIAHALHRNRS...LVYARYLQLATVQP.NGRPANRTLVFRGFLedT   51
DSSP  .....llllLLHHHHHHHHHHLLL...LHHHHEEEEEEELL.LLLEEEEEEELLLLLllL


DSSP  LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEL........LHHHHH
Query RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHV........NRETSE  110
ident            | ||  |   | | |         | |  |                   
Sbjct NQLRFITD.TRSAKADQIQQQPWAEICWYFPNTREQFRXAGDLTLIssddshqdLQPARI  110
DSSP  LLEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEEllllllhhHHHHHH


DSSP  HHHHHLLHHHHHHHHHLLLlLEELLHHhhHHHHHHHHhhlllllLLLLLLLEEEEEEEEE
Query RYFKTRPRGSKIGAWASRQsDVIKNREelDELTQKNTerfkdaeDIPCPDYWGGLRIVPL  170
ident                           |                  |        |   | 
Sbjct AXWQELSDAARLQFGWPYP.GKPRIKE..SGAFEPSP.....pdPIEPVPNFCLLLLDPV  162
DSSP  HHHHHLLHHHHHHHHLLLL.LLLLLLL..HHHHLLLL.....llLLLLLLLEEEEEEEEE


DSSP  EEEEEELLllLLLEEEEEELLLlLLLLEEEEELL
Query EIEFWQGRpsRLHDRFVYRRKTeNDPWKVVRLAP  204
ident        |      |  | |      |      |
Sbjct QVDHLELR.gEPQNRWLYHRND.QQEWSSEAINP  194
DSSP  EEEEEELL.lLLLEEEEEEELL.LLLEEEEELLL


No 7: 2OU5A  MOLECULE: PYRIDOXAMINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE-RELATED, FMN-            

DSSP  llLHHHLLllhhHHHHHHHHHhhhllllLLLL.EEEEEEEEllLLEEEEEEEELLEEL..
Query tlNEKQLTddpiDLFTKWFNEakedpreTLPE.AITFSSAElpSGRVSSRILLFKELD..   57
ident       ||    |     |           |    |             | |        
Sbjct gxSDTVLT.gllDTVWQQFGR..gtkdrHHPArHPTLATIG..TDGPDLRTLVLRAASha   55
DSSP  llLHHHHH.hhhHHHHHHHHH..hhhllLLHHhLLEEEEEE..LLEEEEEELLLLEEEll


DSSP  LLLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHhhHHHHHHHLL
Query HRGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRetSERYFKTRP  117
ident             | |   |      ||         |||   |            |   |
Sbjct EATLEFHTD.AASPKVAHIRRDARVAIHIWIPKASLQVRAKAIAKILPG..DPNLFAQLP  112
DSSP  LLEEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEHHHLEEEEEEEEEEEEEL..LHHHHHHLL


DSSP  HHHHHHHHHLLLLLEELlhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEEEEEEEEEEEEL
Query RGSKIGAWASRQSDVIKnreeldeltqknterfkdaedipcPDYWGGLRIVPLEIEFWQG  177
ident                                          |     |     ||     
Sbjct EAARXNYQGPVPGTPLP..................aepdatPNRFTRLICHLSEIDVLHL  154
DSSP  HHHHHHHLLLLLLLLLL..................llllllLLLEEEEEEEEEEEEEEEL


DSSP  LllLLLEEEEEELllllLLLEEEEELL
Query RpsRLHDRFVYRRktenDPWKVVRLAP  204
ident      | | ||        |      |
Sbjct T..TPHQRAVYTA....PDWRGIWVSP  175
DSSP  L..LLLEEEEEEL....LLLLLEEELL


No 8: 2I02A  MOLECULE: GENERAL STRESS PROTEIN OF COG3871;                         

DSSP  lllhhhlLLLHHHHHHHHHHhhhhlllllLLLEEEEEEEElLLLEEEEEEEELLEElLLL
Query tlnekqlTDDPIDLFTKWFNeakedpretLPEAITFSSAElPSGRVSSRILLFKELdHRG   60
ident            |                       |       |   |            
Sbjct .....tdRTQEIQKLHELIK.........NIDYGXFTTVD.DDGSLHSYPXSKSGD.EAT   44
DSSP  .....lhHHHHHHHHHHHHL.........LLLEEEEEEEL.LLLLEEEEEEELLLL.LLE


DSSP  EEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEL.LHHHHHHHhHHLLhh
Query FTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHV.NRETSERYfKTRPrg  119
ident          | |   |         |     || |   |    |  |             
Sbjct LWFFTY.AGSHKVTEIEHHEQVNVSFSSPEQQRYVSISGTSQLVkDRNKXREL.WKPE..  100
DSSP  EEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEElLHHHHHHH.LLHH..


DSSP  hHHHHHhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLl
Query sKIGAWasrqsdviknreeldeltqknterfkdaediPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRp  179
ident                                              |         |    
Sbjct lQTWFP.............................kgLDEPDIALLKVNINQVNYWDST.  130
DSSP  hHHLLL.............................lhHHLLLEEEEEEEEEEEEEEEHH.


DSSP  llLLEEEEEELllllllleeeeell
Query srLHDRFVYRRktendpwkvvrlap  204
ident                          
Sbjct .sSFKPQTISF..............  140
DSSP  .hLLLLEEEEL..............


No 9: 2FHQA  MOLECULE: PUTATIVE GENERAL STRESS PROTEIN;                           

DSSP  lllhHHLLllhHHHHHHHHHHhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEEL.lL
Query tlneKQLTddpIDLFTKWFNEakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELD.hR   59
ident                                |  |  |     |                
Sbjct ....TKTX...KEKAVELLQK.........CEVVTLASVNK.EGYPRPVPXSKIAAEgiS   43
DSSP  ....LLLH...HHHHHHHHHL.........LLEEEEEEELL.LLLEEEEEEELLEEEllL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEEEEEL.LHHHHHHHHHHLlh
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWkdLQRQVRVEGITEHV.NRETSERYFKTRpr  118
ident           | |  |   || |   |        |   |  | |               
Sbjct TIWXSTG.ADSLKTIDFLSNPKAGLCFQE..KGDSVALXGEVEVVtDEKLKQELWQDW..   98
DSSP  EEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEE..LLEEEEEEEEEEEElLHHHHHHLLLHH..


DSSP  hHHHHHHhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLEEEEEEEEEEEEEEELl
Query gSKIGAWasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGr  178
ident                                               |         |   
Sbjct .FIEHFP.............................ggpTDPGYVLLKFTANHATYWIE.  127
DSSP  .HHHLLL.............................lllLLLLEEEEEEEEEEEEEEEL.


DSSP  llllLEEEEEELllllllleeeeell
Query psrlHDRFVYRRktendpwkvvrlap  204
ident                           
Sbjct ....GTFIHKKL..............  135
DSSP  ....LEEEEEEL..............


No 10: 2HHZA  MOLECULE: PYRIDOXAMINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE-RELATED;                 

DSSP  lllhhhllLLHHHHHHhHHHHhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEELLLL
Query tlnekqltDDPIDLFTkWFNEakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELDHRG   60
ident             |                      |       |    |          |
Sbjct ........XELKDIXH.ILED.........XKVGVFATLDE.YGNPHARHAHITAANEEG   41
DSSP  ........LLHHHHHH.HHHH.........LLEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEEEELLE


DSSP  EEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL..LLEEEEEEEEEEELLHHHH.........
Query FTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD..LQRQVRVEGITEHVNRETS.........  109
ident                       |         |   |||||    |              
Sbjct IFFXTS.PETHFYDQLXGDQRVAXTAISEEgyLIQVVRVEGTARPVENDYLktvfadnpy  100
DSSP  EEEEEL.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLllLLEEEEEEEEEEEELHHHHhhhhlllhh


DSSP  .hHHHHhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllLEEEEEEE
Query .eRYFKtrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdYWGGLRIV  168
ident      |                                                    | 
Sbjct yqHIYK..............................................TXQVFQIY  114
DSSP  hhHHLL..............................................LLEEEEEE


DSSP  EEEEEEEELLlllLLEEEEEEllllllllEEEEEll
Query PLEIEFWQGRpsrLHDRFVYRrktendpwKVVRLap  204
ident                               |  |  
Sbjct AGHGFYHSLT...QGHKYIFS......igEVRAL..  139
DSSP  EEEEEEEEHH...HLEEEEEE......elLEEEL..


No 11: 2IABA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  ....LLLHHHLlllhhHHHHHHHHhhhhllllllLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEELlEE
Query ....TLNEKQLtddpiDLFTKWFNeakedpretlPEAITFSSAELPSGRVSSRILLFkEL   56
ident         ||                              | |    |      |     
Sbjct ttppARTAKQR....iQDTLNRLE.........lDVDAWVSTAGADGGAPYLVPLSY.LW   46
DSSP  llllLLLHHHH....hHHHHHHHH.........hLLEEEEEEELLLLLLEEEEEEEL.EE


DSSP  LLLLEEEEEELlLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELllLEEEEEEEEEEELLHHHH.hHHHHh
Query DHRGFTIYSNWgTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGITEHVNRETS.eRYFKt  115
ident |   |        |                        | |||                 
Sbjct DGETFLVATPA.ASPTGRNLSETGRVRLGIGPT..RDLVLVEGTALPLEPAGLpdGVGD.  102
DSSP  LLLLEEEEEEL.LLHHHHHHHHHLEEEEEELLL..LLEEEEEEEEEEELHHHLllLHHH.


DSSP  llhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLEEEEEEEEEEEEEE
Query rprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaediPCPDYWGGLRIVPLEIEFW  175
ident                                                   || |     |
Sbjct ..............................tfaektgfdprRLTTSYLYFRISPRRVQAW  132
DSSP  ..............................hhhhhhlllhhHLLLLEEEEEEEEEEEEEE


DSSP  ELlllLLLE..EEEEELllllllLEEEeell
Query QGrpsRLHD..RFVYRRktendpWKVVrlap  204
ident            |   |          |    
Sbjct RE...ANELsgRELXRD.....gEWLV..td  153
DSSP  LL...HHHLllLEEEEL.....lEELL..ll


No 12: 2IG6A  MOLECULE: NIMC/NIMA FAMILY PROTEIN;                                  

DSSP  .lllhhhlllLHHHHHHHHHhhhhhllllllLLEEEEEEEELllLEEEEEEEELLEELLL
Query .tlnekqltdDPIDLFTKWFneakedpretlPEAITFSSAELpsGRVSSRILLFKELDHR   59
ident                                         |        |          
Sbjct hhhhhenlyfQGXKRALEFL.........keCGVFYLATNEG..DQPRVRPFGAVFEYEG   49
DSSP  llhhhhhhhhHHHHHHHHHH.........hhHLLEEEEEEEL..LEEEEEEELLLEEELL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEEEEELLHH.HHHHHHHHLlh
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKdLQRQVRVEGITEHVNRE.TSERYFKTRpr  118
ident    | ||  |         ||   |    |      |  |      |    |        
Sbjct KLYIVSN.NTKKCFKQXIQNPKVEISGXNK.KGQWIRLTGEVANDDRReVKELALEAV.p  106
DSSP  EEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEELLLHhHHHHHHHHL.h


DSSP  hhHHHHHhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLEEEEEEEEEEEEEEELL
Query gsKIGAWasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGR  178
ident   |                                           |     |       
Sbjct slKNXYS...............................vDDGIFAVLYFTKGEGTICSFK  135
DSSP  hhHHLLL...............................lLLLLEEEEEEEEEEEEEELLL


DSSP  llllLEEEEEElllllllleeeeell
Query psrlHDRFVYRrktendpwkvvrlap  204
ident                           
Sbjct ....GENETFS..............l  143
DSSP  ....LLLEEEE..............l


No 13: 2HQ7A  MOLECULE: PROTEIN, RELATED TO GENERAL STRESS PROTEIN                 

DSSP  lllhHHLLllhhHHHHHHHHhhhhlllllLLLEEEEEEEElLLLEEEEEEEELLEEL.lL
Query tlneKQLTddpiDLFTKWFNeakedpretLPEAITFSSAElPSGRVSSRILLFKELD.hR   59
ident                                            |            |   
Sbjct ....IDEK..flIESNELVE.........SSKIVXVGTNG.ENGYPNIKAXXRLKHDglK   44
DSSP  ....LLLH..hhHHHHHHHH.........HLLEEEEEEEL.HHHLEEEEEEEEEEEEllL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEL.LHHHHHHHHHHLlh
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHV.NRETSERYFKTRpr  118
ident  |    |    |       |      |            |  |    |   |        
Sbjct KFWLSTN.TSTRXVERLKKNNKICLYFVDDNKFAGLXLVGTIEILhDRASKEXLWTDGce  103
DSSP  EEEEEEE.LLHHHHHHHHHLLEEEEEEELLLLLEEEEEEEEEEEElLHHHHHHHLLLLhh


DSSP  hHHHHHhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLEEEEEEEEEEEEEEELl
Query gSKIGAwasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGr  178
ident                                               |             
Sbjct iYYPLG................................iDDPDYTALCFTAEWGNYYRH.  130
DSSP  hHLLLH................................hHLLLEEEEEEEEEEEEEEEL.


DSSP  llllLEEEEEELLlllllleeeeell
Query psrlHDRFVYRRKtendpwkvvrlap  204
ident                           
Sbjct ....LKNITFKID...........ei  141
DSSP  ....LEEEEEEHH...........hl


No 14: 2ARZA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA4388;                               

DSSP  lllhhhLLLLhhHHHHHHHHhhhhllllllLLEEEEEEEEL.LLLEEEEEEEELLEELLL
Query tlnekqLTDDpiDLFTKWFNeakedpretlPEAITFSSAEL.PSGRVSSRILLFKELDHR   59
ident                                     |       |               
Sbjct ......SVEA.aKNARELLL.........kEYRAVLSTHSKkWPGFPFGSVVPYCLDAEG   44
DSSP  ......LHHH.hHHHHHHHH.........hLLEEEEEEELLlLLLLEEEEEEELEELLLL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLL.....LEEEEEEEEEEELLHHHHHHHH.
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDL.....QRQVRVEGITEHVNRETSERYF.  113
ident    |          |     |                               |       
Sbjct RPLILIS.RIAQHTHNLQADPRCSMLVGERGAediqaVGRLTLLAEARQLAEEEVAAAAe  103
DSSP  LEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEELLLLlllllLLEEEEEEEEEELLHHHHHHHHh


DSSP  .hhllhHHHHHHhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLEEEEEEEEEEE
Query .ktrprGSKIGAwasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipCPDYWGGLRIVPLEI  172
ident                                                         |   
Sbjct ryyryfPESADY................................hRVHDFDFWVLQPVQW  131
DSSP  hhhhhlHHHLLL................................lLLLLEEEEEEEEEEE


DSSP  EEEELLllllLEEEEEEL..........................................
Query EFWQGRpsrlHDRFVYRR..........................................  190
ident  |  |                                                       
Sbjct RFIGGF....GAIHWLAAervplanpfageaergmvehmnsdhaaaiahyvelaglpaha  187
DSSP  EEELLL....LLEEEEELlllllllllllhhhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhllllll


DSSP  .....................................llllllleeeeell
Query .....................................ktendpwkvvrlap  204
ident                                                    
Sbjct aaqlagidtegfhlrigqglhwlpfpaacgnpgavrqalvqlaraerwptv  238
DSSP  lleeeeellleeeeeelleeeeeelllllllhhhhhhhhhhhhhlllllll


No 15: 2HTIA  MOLECULE: BH0577 PROTEIN;                                            

DSSP  lllhhhLLLLhhHHHHHHHhhhhhllllllLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEELlEELLLL
Query tlnekqLTDDpiDLFTKWFneakedpretlPEAITFSSAElpSGRVSSRILLFkELDHRG   60
ident         |      |                                  | |       
Sbjct .....eCKDE..KKITEFL.........nkARTGFLGLST..NDQPYVIPLNF.VWHNHA   41
DSSP  .....lLLLH..HHHHHHH.........hhLLLEEEEEEE..LLEEEEEEELL.EEELLE


DSSP  EEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLHH.HHHHHHhhllhh
Query FTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNRE.TSERYFktrprg  119
ident           ||   |  ||              |   |  | |                
Sbjct IYFHGA.SEGRKIKXIEANPEVCFTICEDLAYXSVIIFGTIEPVSAIeEGTEAXqqxldk  100
DSSP  EEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLEEEEEEEEEEEELLLHhHHHHHHhhhhhh


DSSP  hhhHHHHllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllLEEEEEEEEEEEEEEELLL
Query skiGAWAsrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdYWGGLRIVPLEIEFWQGRP  179
ident                                                |   |       |
Sbjct yvpSLGS..................................RTAIYKISCRERTAKVNEP  126
DSSP  hllLLLL..................................LEEEEEEEEEEEEEEEELL


DSSP  lllleeeeeelllllllleeeeell
Query srlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                          
Sbjct .........................  126
DSSP  .........................


No 16: 1VL7A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN ALR5027;                              

DSSP  lllhhhllllhhhhHHHHHHhhhhlllllLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEElLEEL.LL
Query tlnekqltddpidlFTKWFNeakedpretLPEAITFSSAELpSGRVSSRILLfKELD.HR   59
ident                                     |      |            |   
Sbjct ..............YAGFIQ.........EFQSAIISTISE.QGIPNGSYAP.FVIDdAK   35
DSSP  ..............LHHHHL.........LLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEE.EEELlLL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL.......lLEEEEEEEEEEELLHH..HHH
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD.......lQRQVRVEGITEHVNRE..TSE  110
ident    ||   |       |  ||     |             |            ||     
Sbjct NIYIYVS.GLAVHTKNIEANPLVNVLFVDDEaktnqifaRRRLSFDCTATLIEREsqKWN   94
DSSP  LEEEEEL.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEELLHhhlllhhhLLEEEEEEEEEEELLLlhHHH


DSSP  HHHH...hllHHHHHHHhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLlEEEEEE
Query RYFK...trpRGSKIGAwasrqsdviknreeldeltqknterfkdaediPCPDyWGGLRI  167
ident                                                     |       
Sbjct QVVDqfqerfGQIIEVL...............................rGLAD.FRIFQL  122
DSSP  HHHHhhhhhhLHHHHHH...............................hHHLL.LEEEEE


DSSP  EEEEEEEEEllllllLEEEeeelllllllleeeeell
Query VPLEIEFWQgrpsrlHDRFvyrrktendpwkvvrlap  204
ident  | |  |                              
Sbjct TPKEGRFVI......GFGA..................  135
DSSP  EEEEEEEEL......LLLL..................


No 17: 2AQ6A  MOLECULE: PYRIDOXINE 5'-PHOSPHATE OXIDASE;                           

DSSP  lllhhhllLLHHHHHHhhhhhhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEELLL.
Query tlnekqltDDPIDLFTkwfneakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELDHR.   59
ident              |                             ||               
Sbjct ........VFDDKLLA..........visgNSIGVLATIKH.DGRPQLSNVQYHFDPRKl   41
DSSP  ........LHHHHHHH..........hhhlLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEELEEELLLl


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEL.........LHHHHH
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHV.........NRETSE  110
ident             |       | | |     |       ||                |   
Sbjct LIQVSIA.EPRAKTRNLRRDPRASILVDADDGWSYAVAEGTAQLTppaaapdddTVEALI  100
DSSP  EEEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEELLLLLLEEEEEEELEELllllllllhHHHHHH


DSSP  HHHH...HLLHHHhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLL..LEEEE
Query RYFK...TRPRGSkigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaediPCPD..YWGGL  165
ident                                                            |
Sbjct ALYRniaGEHSDW................................ddyrQAMVtdRRVLL  128
DSSP  HHHHhhlLLLLLH................................hhhhHHHHhlLEEEE


DSSP  EEEEEEEEEEELLllllleeeeeelllllllleeeeell
Query RIVPLEIEFWQGRpsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                                        
Sbjct TLPISHVYGLPPG........................mr  143
DSSP  EEELLEEEEELLL........................ll


No 18: 2HTDA  MOLECULE: PREDICTED FLAVIN-NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN FROM           

DSSP  lllhhhllllHHHHhhHHHHhhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEE.LLEELll
Query tlnekqltddPIDLftKWFNeakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILL.FKELDhr   59
ident                    |                       |            ||  
Sbjct ...xkklntnKLTE..EQVN.......lfkNNLVYLATVDA.DGNPQVGPKGsXTVLDps   47
DSSP  ...lllllllLLLH..HHHH.......hhhHLLEEEEEELL.LLLEEEEEELlLEEEEll


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEELLH.HHHHHHHHHLlh
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHVNR.ETSERYFKTRpr  118
ident                 |      | |         |||    |                 
Sbjct HLQYLEK.TKGEAYENIKRGSKVALVAADVPSHTAVRVLATAEVHEDdDYAKKVLAKT..  104
DSSP  EEEEEEL.LLLHHHHHHHLLLLEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEELLlHHHHHHHLLL..


DSSP  hhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLlEEEEEEEEEEEEEeell
Query gskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaediPCPDyWGGLRIVPLEIEFwqgr  178
ident                                         |           |       
Sbjct ......................................EFPN.AFVVNLNIEEVFA....  121
DSSP  ......................................LLLL.LEEEEEEEEEEEL....


DSSP  llllleeeeeelllllllleeeeell
Query psrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                           
Sbjct ..........................  121
DSSP  ..........................


No 19: 2ASFA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RV2074;                               

DSSP  lllhhhllllhhHHHHHHHHhhhhlllllLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEE.lLL
Query tlnekqltddpiDLFTKWFNeakedpretLPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKEL.dHR   59
ident             |                                       |       
Sbjct ...........sDDALAFLS.........ERHLAXLTTLRA.DNSPHVVAVGFTFDpkTH   39
DSSP  ...........lHHHHHHLL.........LLLLEEEEEELL.LLLEEEEEELLEEEllLL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELllLEEEEEEEEEEEL.LHHHHHHHHH..hl
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGITEHV.NRETSERYFK..tr  116
ident         | | ||        |          |    ||                    
Sbjct IARVITT.GGSQKAVNADRSGLAVLSQVDG..ARWLSLEGRAAVNsDIDAVRDAELryaq   96
DSSP  EEEEEEE.LLLHHHHHHHHHLEEEEEEEEL..LEEEEEEEEEEEElLHHHHHHHHHhhhh


DSSP  lhhHHHHhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEEEEEEEEEEEe
Query prgSKIGawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcPDYWGGLRIVPLEIEFWq  176
ident                                                             
Sbjct ryrTPRP...................................NPRRVVIEVQIERVLGS.  120
DSSP  hllLLLL...................................LLLEEEEEEEEEEEEEL.


DSSP  llllllLEEEeeelllllllleeeeell
Query grpsrlHDRFvyrrktendpwkvvrlap  204
ident        |                    
Sbjct ......ADLL.................d  125
DSSP  ......LLLL.................l


No 20: 1RFEA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN RV2991;                               

DSSP  lllhhhllllHHHHHHHHHHhhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEeLLLL
Query tlnekqltddPIDLFTKWFNeakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKElDHRG   60
ident                    |              |        |                
Sbjct .tkqradivxSEAEIADFVN.........sSRTGTLATIGP.DGQPHLTAXWYAV.IDGE   48
DSSP  .lllllllllLHHHHHHHHH.........hLLLEEEEEELL.LLLEEEEEELLEE.ELLE


DSSP  EEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...LLEEEEEEEEEEELLH.HHHHHHHH..
Query FTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...LQRQVRVEGITEHVNR.ETSERYFK..  114
ident          | ||      |         |     | |  ||  | |   |   |     
Sbjct IWLETK.AKSQKAVNLRRDPRVSFLLEDGDtydTLRGVSFEGVAEIVEEpEALHRVGVsv  107
DSSP  EEEEEE.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLlhhHLEEEEEEEEEEEELLhHHHHHHHHhh


DSSP  .........hlLHHHHHHHhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEE
Query .........trPRGSKIGAwasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpDYWGGL  165
ident                                                           | 
Sbjct werytgpytdeXKPXVDQX..................................xNKRVGV  133
DSSP  hhhhlllllhhHHHHHHHH..................................lLLEEEE


DSSP  EEEEEEEEEEEL.LLLLlleeeeeelllllllleeeeell
Query RIVPLEIEFWQG.RPSRlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident |||      |                              
Sbjct RIVARRTRSWDHrKLGL.............phxsvggsta  160
DSSP  EEEEEEEEEEEHhHHLL.............llllllllll


No 21: 2QEAA  MOLECULE: PUTATIVE GENERAL STRESS PROTEIN 26;                        

DSSP  lllhhHLLLLHhHHHHHHHhhhhhllllllLLEEEEEEEelllLEEEEEEEELLE..eLL
Query tlnekQLTDDPiDLFTKWFneakedpretlPEAITFSSAelpsGRVSSRILLFKE..lDH   58
ident         |     |                            |                
Sbjct .....GXADLT.HEFWDRL.........edVRSGXLGIK....GQGRLIPXSPQTdddAP   41
DSSP  .....LHHHHH.HHHHHHH.........llLLLEEEEEL....LLLLLEEELLLLlllLL


DSSP  LLEEEEEElLLLHHHHHHHHL.LEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEL.LHHHHHHHHHHL
Query RGFTIYSNwGTSRKAHDIATN.PNAAIVFFWKDLQRQVRVEGITEHV.NRETSERYFKTR  116
ident               |   |     |  |             |  |    ||         
Sbjct GAIWFITA.KGTDLAKGVAAGpQPAQFVVSDDGEGLYADLDGTLERStDREALDEFWSFV  100
DSSP  LLEEEEEE.LLLHHHHHLLLLlEEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEEElLHHHHHHLLLHH


DSSP  lhhhHHHHHhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllLLLL.LLEEEEEEEEEEEEEE
Query prgsKIGAWasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedIPCP.DYWGGLRIVPLEIEFW  175
ident                                                  |   |   |  
Sbjct ...aDAWFD..............................GGQHdPDVCLLKFTPASGEIS  127
DSSP  ...hHHHLL..............................LLLLlLLEEEEEEEEEEEEEE


DSSP  ELL..................lLLLLEEEEEELllllllleeeeell
Query QGR..................pSRLHDRFVYRRktendpwkvvrlap  204
ident                                                
Sbjct ITEgggarflyeiakahltdetPDXGEQATVTF..............  160
DSSP  EELlllhhhhhhhhhhhhhlllLLLEEEEEEEL..............


No 22: 2HQ9A  MOLECULE: MLL6688 PROTEIN;                                           

DSSP  lllhhhllllHHHHHHHHHhhhhhllllllLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEELLEELlLL
Query tlnekqltddPIDLFTKWFneakedpretlPEAITFSSAElpSGRVSSRILLFKELDhRG   60
ident                ||                     |    |      |     |   
Sbjct ...gxlvrtlSALECTKVL.........taNRVGRLACAK..DGQPYVVPLYYAYSD.AH   45
DSSP  ...lleeeelLHHHHHHHH.........hhLLEEEEEEEE..LLEEEEEEEELEEEL.LE


DSSP  EEEEEEllLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...LLEEEEEEEEEEELLHH.hHHHHHHhl
Query FTIYSNwgTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...LQRQVRVEGITEHVNRE.tSERYFKtr  116
ident     |      |      ||                 | | |  |               
Sbjct LYAFSX..PGKKIEWXRANPRVSVQVDEHGqgrGWKSVVVDGRYEELPDLigHKLQRD..  101
DSSP  EEEEEL..LLHHHHHHHHLLEEEEEEEEELlllLEEEEEEEEEEEELLLLhhHHHHHH..


DSSP  lhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEEEEEEEEEEEE
Query prgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpDYWGGLRIVPLEIEFWQ  176
ident                                                  ||         
Sbjct .............................hawsvlskhtdwweAPHVFFRILIEQVSGRE  132
DSSP  .............................hhhhhhhhhhhhhlLLLEEEEEEEEEEEEEE


DSSP  LLLlllleeeeeelllllllleeeeell
Query GRPsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                             
Sbjct ASE.........................  135
DSSP  EEL.........................


No 23: 1XHNA  MOLECULE: CELLULAR REPRESSOR OF E1A-STIMULATED GENES;                

DSSP  lllhHHLLllhHHHHHHHHhhhhhllllllLLEEEEEEEELL...LLEEEEEEEELLE..
Query tlneKQLTddpIDLFTKWFneakedpretlPEAITFSSAELP...SGRVSSRILLFKE..   55
ident                                               ||     |      
Sbjct gslpPRED..aARVARFVT.........hvSDWGALATISTLeavRGRPFADVLSLSDgp   49
DSSP  llllLLLL..hHHHHHHHH.........hhLLEEEEEEELLLhhhLLLEEEEEEELLLll


DSSP  ..elllLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEL..............lLLEEEEEEE
Query ..ldhrGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWK..............dLQRQVRVEG   99
ident           |              || |                      |       |
Sbjct pgagsgVPYFYLS.PLQLSVSNLQENPYATLTXTLAqtnfckkhgfdpqspLCVHIXLSG  108
DSSP  llllllLLEEEEL.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEEHHhllhhhhhlllllllLLLEEEEEE


DSSP  EEEELLHHHHHHHHH...hllhHHHHhHHHLLllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query ITEHVNRETSERYFK...trprGSKIgAWASRqsdviknreeldeltqknterfkdaedi  156
ident     ||                  |     |                             
Sbjct TVTKVNETEXDIAKHslfirhpEXKT.WPSSH............................  139
DSSP  EEEELLHHHHHHHHHhhhhhlhHHHH.LLHHH............................


DSSP  llllLEEEEEEEEEEEEEEELLllllLEEEEEELLlllllleeeeell
Query pcpdYWGGLRIVPLEIEFWQGRpsrlHDRFVYRRKtendpwkvvrlap  204
ident      |         |                                
Sbjct ....NWFFAKLNITNIWVLDYF....GGPKIVTPE.......eyynvt  172
DSSP  ....LLEEEEEEEEEEEEELLL....LLLEELLHH.......hhhhll


No 24: 2FG9A  MOLECULE: 5-NITROIMIDAZOLE ANTIBIOTIC RESISTANCE PROTEIN;            

DSSP  ..........lllhhhlllLHHHHHHHHHHHhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEE
Query ..........tlnekqltdDPIDLFTKWFNEakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRI   50
ident                                           |       |  |      
Sbjct hhhhhhenlyfqgxktiviEDKQRIESIILQ.........ADACFVGITDL.EGNPYVVP   50
DSSP  llllllllleeeeeeeeeeLLHHHHHHHHHH.........LLLEEEEEELL.LLLEEEEE


DSSP  EELLEELlLLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...........lLEEEEEEE
Query LLFKELDhRGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...........lQRQVRVEG   99
ident   |           |      |      | |  | |                       |
Sbjct XNFGYEN.DTLYLHSG.PEGGKIEXLQRNNNVCITFSLGHklvyqhcsysxrSESAXCRG  108
DSSP  ELLEEEL.LEEEEEEL.LLLHHHHHHHHLLEEEEEEELLLeeeeelleeeeeEEEEEEEE


DSSP  EEEELLH.HHHHHHH......hhlLHHHHhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlll
Query ITEHVNR.ETSERYF......ktrPRGSKigawasrqsdviknreeldeltqknterfkd  152
ident   |     |                  |                                
Sbjct KVEFIEDxEEKRHALdiixrhytkDQFSY...............................  137
DSSP  ELEEELLhHHHHHHHhhhhhllllLLLLL...............................


DSSP  lllLLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLLLllleeeeeelllllllleeeeell
Query aedIPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRPSrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident     |                                               
Sbjct ..sDPAVRNVKVWKVPVDQXTGKVFGLR.....................ade  166
DSSP  ..lHHHHHLLEEEEEEEEEEEEEEEEEE.....................eel


No 25: 1AXJA  MOLECULE: FMN-BINDING PROTEIN;                                       

DSSP  lllhhhllllHHHHHHHHHHhhhhllllllLLEEEEEEEELllLEEEEEEEEL..LEELL
Query tlnekqltddPIDLFTKWFNeakedpretlPEAITFSSAELpsGRVSSRILLF..KELDH   58
ident               |                                             
Sbjct .........mLPGTFFEVLK.........nEGVVAIATQGE..DGPHLVNTWNsyLKVLD   40
DSSP  .........lLLHHHHHHHL.........lLLEEEEEELLL..LLLEEEEEEHhhLEELL


DSSP  L.LEEEEEElllLHHHHHHHHLLEEEEEEEE......LLLLEEEEEEEEEEELLHHH.HH
Query R.GFTIYSNwgtSRKAHDIATNPNAAIVFFW......KDLQRQVRVEGITEHVNRET.SE  110
ident                    |                           |           |
Sbjct GnRIVVPVG.gmHKTEANVARDERVLMTLGSrkvagrNGPGTGFLIRGSAAFRTDGPeFE   99
DSSP  LlEEEEEEL.llHHHHHHHHHLLEEEEEEEEllllllLLLLEEEEEEEEEEEELLHHhHH


DSSP  HHHHHLlhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEE
Query RYFKTRprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPL  170
ident                                                       | |   
Sbjct AIARFK...........................................waRAALVITVV  116
DSSP  HHLLLL...........................................llLEEEEEEEE


DSSP  EEEEEEllllllleeeeeelllllllleeeeell
Query EIEFWQgrpsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident   |                               
Sbjct SAEQTL............................  122
DSSP  EEEELL............................


No 26: 2FURA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  lllhhhlllLHHHHHHHHHHHhhhllllllLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEELLEELllL
Query tlnekqltdDPIDLFTKWFNEakedpretlPEAITFSSAElpSGRVSSRILLFKELDhrG   60
ident                                   | |      |                
Sbjct ......rasYSDEDLVAXLDR.........NFTCTVSFID..GGIPYAIPXXLASEG.kT   42
DSSP  ......leeLLHHHHHHHHHH.........LLEEEEEEEE..LLEEEEEEEELEEEL.lE


DSSP  EEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL.............lLEEEEEEEEEEELLH.
Query FTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD.............lQRQVRVEGITEHVNR.  106
ident          ||      |    ||                           |        
Sbjct IYLHGS.XKSRIYGILKTGQLIAISLLEINgivlakeiknnsinYVSALIFGRPYEIDDt  101
DSSP  EEEEEE.LLLHHHHHHHLLLLEEEEEEEEEeeeelllhhhleeeEEEEEEEELLEELLLh


DSSP  HHHHHHHH..........hllHHHHHhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllll
Query ETSERYFK..........trpRGSKIgawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedi  156
ident |     |                                                     
Sbjct EKKIEVFRllteklvkgrwdnSIKPS.................................y  128
DSSP  HHHHHHHHhhhhhhllllhhhLLLLL.................................h


DSSP  LLLLLEEEEEEEEEEEEEEELLLL.................llleeeeeellllllllee
Query PCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRPS.................rlhdrfvyrrktendpwkv  199
ident             |                                               
Sbjct EDLNGVFVFAVKPETFSXKARTGPphdtstddiwsgvlpiqhtiseagenapeyvkslyg  188
DSSP  HHHHLEEEEEELEEEEEEEEELLLllllllllllleeeeeeeeellllllllhhhhllll


DSSP  eeell
Query vrlap  204
ident      
Sbjct krifi  193
DSSP  lllll


No 27: 2OL5A  MOLECULE: PAI 2 PROTEIN;                                             

DSSP  lllhhhllllhhHHHHHHHhhhhhlllllLLLEEEEEEEELllLEEEEEEEELlEELL..
Query tlnekqltddpiDLFTKWFneakedpretLPEAITFSSAELpsGRVSSRILLFkELDH..   58
ident             |                     |  |            |    ||   
Sbjct ..........dpDVAYQVI.........eENSFATLVSXHQ..RELFATHLPL.LLDRek   38
DSSP  ..........llLHHHHHH.........hHLLEEEEEEEEL..LEEEEEEEEL.EELLll


DSSP  LLEEEEEElLLLHHHHHHhhLLEEEEEEEELL.................lLEEEEEEEEE
Query RGFTIYSNwGTSRKAHDIatNPNAAIVFFWKD.................lQRQVRVEGIT  101
ident                 ||         |                         | | |  
Sbjct TCLYGHFA.RSNPQWNDI.qHQTVLAIFHGPHcyispswyetnqavptwnYVAVHVYGNV   96
DSSP  LEEEEEEE.LLLHHHHHL.lLLLEEEEEEEEEeeelhhhlllllllleeeEEEEEEEEEE


DSSP  EELLHH.HHHHHHHhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllLLLL..L
Query EHVNRE.TSERYFKtrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaEDIP..C  158
ident |  |                                                        
Sbjct ELINDQgEVXQSLH..........................dxvekyeapgsryQLXLsgX  130
DSSP  EELLLHhHHHHHHH..........................hhhhhhlllllllLLLLlhH


DSSP  LLLEEEEEEEEEEEEEEELLLLL.......lleeeeeelllllllleeeeell
Query PDYWGGLRIVPLEIEFWQGRPSR.......lhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident         |    ||                                      
Sbjct NKGIQAFKIIIKRIEGKAKLSQNhpahrqeriikqleqxpfenekriaslxkk  183
DSSP  HHLEEEEEEEEEEEEEEEELLLLllhhhhhhhhhhhhllllhhhhhhhhhhhl


No 28: 2Q9KA  MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN;                                   

DSSP  lllhhhllllHHHHHHHHhhhhhhlllllllLEEEEEEEELLLLEEEEEEEELLEELL.L
Query tlnekqltddPIDLFTKWfneakedpretlpEAITFSSAELPSGRVSSRILLFKELDH.R   59
ident                 |                                           
Sbjct .....kvehrLSEQQXKA.........ltdlPLVFLITHDQSKSWPITHAISWVYAKDeT   46
DSSP  .....lllllLLHHHHHH.........llllLLEEEEELLLLLLLLEEEEELLEEEEElL


DSSP  LEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEE.EEELLHHhhhhhhhhllh
Query GFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWkdLQRQVRVEGI.TEHVNREtseryfktrpr  118
ident           |      |  |     ||    |                           
Sbjct TIRFAIE.ADSLLVKTLADHPVFTLIFFA..DQSTYSLTCTdVAAWETT...........   92
DSSP  EEEEEEE.LLLLHHHHHHHLLLEEEEEEE..LLEEEEEEEEeEEEELLL...........


DSSP  hhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllLLLLLEEEEEEEEEEEEEEELl
Query gskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaediPCPDYWGGLRIVPLEIEFWQGr  178
ident                                         |           |       
Sbjct .....................................aRLPLKVALYEGQIKEVRDILF.  114
DSSP  .....................................lLLLLLEEEEEEEEEEEEELLL.


DSSP  llLLLE.........eeeeelllllllleeeeell
Query psRLHD.........rfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                                    
Sbjct ..YGAAvsdrprvyktydeaaaxqldqqiqdilkg  147
DSSP  ..LLLLllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 29: 1W3OA  MOLECULE: NIMA-RELATED PROTEIN;                                      

DSSP  ....................llLHHH.llllHHHHHHHHHhhhhhllllllLLEEEEEEE
Query ....................tlNEKQ.ltddPIDLFTKWFneakedpretlPEAITFSSA   39
ident                                                             
Sbjct syyhhhhhhlsdfydprerdpsVSRRpqnrqSDEWIRELL.........lrGTIARVATL   51
DSSP  lhhhhhhhhllhhhllllllllLLLLlllllLHHHHHHHH.........hhLLEEEEEEE


DSSP  ELL...LLEEEEEEEELLEEL.LLLEEEEEellllHHHH....hhhhlLEEEEEEEELL.
Query ELP...SGRVSSRILLFKELD.HRGFTIYSnwgtsRKAH....diatnPNAAIVFFWKD.   90
ident               |                                   |         
Sbjct WQGedgAAFPFITPLAYAYRPeQGDLVYHT.....NVVGrlranagqgHPATLEVSEIGq  106
DSSP  EELlllLEEEEEEEEELEEELlLLEEEEEL.....LLLLlllllllleEEEEEEEEEEEe


DSSP  ............LLEEEEEEEEEEELLHHHHHH..........hhhHLLHHHhhhhhhll
Query ............LQRQVRVEGITEHVNRETSER..........yfkTRPRGSkigawasr  128
ident               | | | |       |                               
Sbjct flpsnsplelsvQYRSVMVFGTARVLAGEDARAalttlservfpglKVGETT........  158
DSSP  eellllhhhleeEEEEEEEEEEEEELLHHHHHHhhhhhhhhhllllLLLLLL........


DSSP  llleellhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLL...LLLEEEEEEEEEEEEEEEL.LLLLlle
Query qsdviknreeldeltqknterfkdaeDIPC...PDYWGGLRIVPLEIEFWQG.RPSRlhd  184
ident                                                             
Sbjct ..........................RPISeddLKRTSVYSLSIDRWSGKENwAEQA...  189
DSSP  ..........................LLLLhhhHHLLLEEEEEEEEEEEEEElLLLL...


DSSP  eeeeelllllllleeeeell
Query rfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                     
Sbjct .....iqeedwpalgpewlg  204
DSSP  .....llllllllllhhhhl


No 30: 2PTFA  MOLECULE: UNCHARACTERIZED PROTEIN MTH_863;                           

DSSP  lllhhhlllLHHHHHHhhHHHHhhlllllllLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEELllL
Query tlnekqltdDPIDLFTkwFNEAkedpretlpEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELDhrG   60
ident                                           |                 
Sbjct ...veythfKDLQALE..MERG.......rlYETIVVTWDD.SMVGNAAPIGVLCTGddT   47
DSSP  ...llleeeLLHHHLL..LLLL.......leEEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEELLllE


DSSP  EEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEEL.........................llleEE
Query FTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWK.........................dlqrQV   95
ident  | |      |       |                                         
Sbjct VTLYLY.QGTRTVENVLNNGRFTVNVTLDpliftdstlgdleedmfshyrdflhlrgaDA  106
DSSP  EEEEEE.LLLHHHHHHHHHLEEEEEELLLhhhhhhhhhllllhhheeeelleeeelllLE


DSSP  EEEEEEEELLHhhhhhhhhhllhhHHHHHhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllll
Query RVEGITEHVNRetseryfktrprgSKIGAwasrqsdviknreeldeltqknterfkdaed  155
ident         |                                                   
Sbjct FFTAEVVSVKK..........lvkRDRES...............................  125
DSSP  EEEEEEEEEEE..........eeeLLLLE...............................


DSSP  lllllLEEEEEEEEEEEEEEEL...............................lllllle
Query ipcpdYWGGLRIVPLEIEFWQG...............................rpsrlhd  184
ident                                                             
Sbjct .....ELHVVKARAGDVMRAESfrmalnrgiyaviesliaytraplvlreriaemnrvar  180
DSSP  .....EEEEEEEEEEEEEELLLlllllllhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  eeeeelllllllleeeeell
Query rfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                     
Sbjct kvggprekeamrriiqales  200
DSSP  hhllhhhhhhhhhhhhhhhl


No 31: 1I0RA  MOLECULE: CONSERVED HYPOTHETICAL PROTEIN;                            

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllllLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEELLEELL..
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpretlPEAITFSSAElpSGRVSSRILLFKELDH..   58
ident                                      |     ||    |          
Sbjct ....................mdveafykisYGLYIVTSES..NGRKCGQIANTVFQLTsk   38
DSSP  ....................llhhhhhhllLLLEEEEEEE..LLEEEEEEELLEEEEEll


DSSP  .LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLL..........................
Query .RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDL..........................   91
ident         |                                                   
Sbjct pVQIAVCLN.KENDTHNAVKESGAFGVSVLELETpmefigrfgfrkssefekfdgveykt   97
DSSP  lLEEEEEEE.LLLHHHHHHHHHLEEEEEEELLLLlhhhhhhhhlllllllllllllleee


DSSP  ..........leEEEEEEEEE.ELLHhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhh
Query ..........qrQVRVEGITE.HVNRetseryfktrprgskigawasrqsdviknreeld  140
ident                 |                                           
Sbjct gktgvplvtqhaVAVIEAKVVkECDV..................................  123
DSSP  llllleeellleEEEEEEEEEeEEEL..................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllllllLLEEEEEEEEEEEEEEELlllllleeeeeelllllllleee
Query eltqknterfkdaedipcpDYWGGLRIVPLEIEFWQGrpsrlhdrfvyrrktendpwkvv  200
ident                                 |                           
Sbjct ...................GTHTLFVGEAVDAEVLKD.......aevltyadyhlmkkgk  157
DSSP  ...................LLEEEEEEEEEEEEELLL.......lllllhhhhhhhhlll


DSSP  eell
Query rlap  204
ident     
Sbjct tprt  161
DSSP  eeel


No 32: 2QCKA  MOLECULE: FLAVIN REDUCTASE DOMAIN PROTEIN;                           

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLlEEEEEEEELllLEEEEEEEE.LLEELL.
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedprETLPeAITFSSAELpsGRVSSRILL.FKELDH.   58
ident                                            |            |   
Sbjct ................fegtfkexfrrHAAG.VAIITVNYN..GTPYGFTATsVASLSAq   41
DSSP  ................lhhhhhhhhhlLLEE.LEEEEEEEL..LEEEEEEELlLEEEEEl


DSSP  .LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...........................
Query .RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...........................   90
ident    ||       |     ||            |                           
Sbjct pPRFTFNXA.RSSSSWPAIANTTHIGVHXLGLDnqeladrfartknrfegdhwelgpyev  100
DSSP  lEEEEEEEE.LLLLLHHHHHHLLEEEEEELLHHhhhhhhhlllllllllllleeelhhhl


DSSP  ...lleEEEEEEEEEEllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhh
Query ...lqrQVRVEGITEHvnretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknt  147
ident            |                                                
Sbjct pilkdvAGWLIGKIQX............................................  116
DSSP  eeelllLEEEEEEEEE............................................


DSSP  hhlllllllllLLLEEEEEEEEEEEEEEELlllllleeeeeelllllllleeeeell
Query erfkdaedipcPDYWGGLRIVPLEIEFWQGrpsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                        |                                 
Sbjct ........rlsFENNAVVVVEVVEGQVGED......gtpllyhsgaysqpvpldyei  159
DSSP  ........eeeLLLEEEEEEEEEEEEELLL......lllleeelleeelllllllll


No 33: 2IMLA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  lllhhhlllLHHHHHhhhhhhhhhlllllllLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELlEELL..
Query tlnekqltdDPIDLFtkwfneakedpretlpEAITFSSAELpSGRVSSRILLFkELDH..   58
ident               |                  |         |                
Sbjct .........LRLADF..........gftdgiNEIIAITENE.DGSWNAAPIGI.IVEDss   39
DSSP  .........LLHHHH..........lllleeEEEEEEEELL.LLLEEEEEEEE.EELLll


DSSP  .lLEEEEEEllLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL........................lle
Query .rGFTIYSNwgTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD........................lqr   93
ident              |                                              
Sbjct sdTAKAKLY..RNRTRANLERSGVLFANVTDDAlvfavssfgnlnddwyaspnppiikga   97
DSSP  llEEEEELL..LLHHHHHHHHHLEEEEEELLLHhhhhhhhhllllhhheeeelleeelll


DSSP  EEEEEEEEEELlhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllll
Query QVRVEGITEHVnretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkda  153
ident         |                                                   
Sbjct XAWCRFEAEXR.................................................  108
DSSP  LEEEEEEEEEE.................................................


DSSP  llllllllEEEEEEEEEEEEEE.ELLLL................................
Query edipcpdyWGGLRIVPLEIEFW.QGRPS................................  180
ident          |         |                                        
Sbjct ........SGVAHLKLTDGEIIeKRVRAinrglsaviealvhatryvaiksderrkelle  160
DSSP  ........LLEEEEEEEEEEELlLLLLLllhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhhhhhhh


DSSP  .......llleeeeeelllllllleeeeell
Query .......rlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                                
Sbjct rihyyreivqkcgserekrafeiixekigeg  191
DSSP  hhhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhhhhhllll


No 34: 1WGBA  MOLECULE: PROBABLE FLAVOPROTEIN;                                     

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEELLEELL..
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpretLPEAITFSSAElpSGRVSSRILLFKELDH..   58
ident                                              |              
Sbjct ................xnleakkkvlrsfTYGLYVLTAKD..GDEVAAGTVNWVTQASfq   42
DSSP  ................llhhhhhhhhhllLLLLEEEEEEE..LLEEEEEEELLEEEEEll


DSSP  .LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLL..........................
Query .RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDL..........................   91
ident             |            |      |                           
Sbjct pPLVAVGLK.RDSHLHALVERTGKLALXTLAHDQkaiaqdffkptvregdrlnghpfeps  101
DSSP  lLEEEEEEE.LLLHHHHHHHHHLEEEEEELLLLLhhhhhhlllllleelleelleeeeel


DSSP  .........leEEEEEEEE.EELLHhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhh
Query .........qrQVRVEGIT.EHVNRetseryfktrprgskigawasrqsdviknreelde  141
ident                |                                            
Sbjct ptfglplltelPYWLEAEVrHLYPG...................................  126
DSSP  llllleeelllLEEEEEEEeEEEEE...................................


DSSP  hhhhhhhhllllllllllLLEEEEEEEEEEEEEEELlllllleeeeeelllllllleeee
Query ltqknterfkdaedipcpDYWGGLRIVPLEIEFWQGrpsrlhdrfvyrrktendpwkvvr  201
ident                              |                              
Sbjct ..................GDHSLVVAEVVEAGVRRE............ekplvxwdtgwf  156
DSSP  ..................LLEEEEEEEEEEEEELLL............lllllhhhhlll


DSSP  ell
Query lap  204
ident    
Sbjct ygg  159
DSSP  lll


No 35: 2D5MA  MOLECULE: FLAVOREDOXIN;                                              

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEE.LLEELL.
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpreTLPEAITFSSAELpSGRVSSRILL.FKELDH.   58
ident                                             |               
Sbjct .................mkkslgartlaYPTPLFLVGTYDR.DSRPNIMAAAwAGICCSq   42
DSSP  .................lllllllllllLLEELEEEEEELL.LLLEEEEEELlEEEEEEl


DSSP  .LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...........................
Query .RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...........................   90
ident                   |       |                                 
Sbjct pPSIAVSLR.KATYTYRSITERGAFTISIPSRAyvrhadyagiysgenedkfaslgltpv  101
DSSP  lEEEEELLL.LLLHHHHHHHHHLEEEEEELLHHhhhhhhhhlllllllllhhhhhlllee


DSSP  ..........lleEEEEEEEEEELLHhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhh
Query ..........lqrQVRVEGITEHVNRetseryfktrprgskigawasrqsdviknreeld  140
ident                  |    |                                     
Sbjct pgehvdapyvgefPMAIELKLIHQIE..................................  127
DSSP  elllllleeelllLEEEEEEEEEEEL..................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEEEEEEellllllLEEEeeelllllllleeE
Query eltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLEIEFWqgrpsrlHDRFvyrrktendpwkvV  200
ident                                                             
Sbjct .....................HTQFIGEIMDVKVD.......ESCL..........rddG  149
DSSP  .....................LLEEEEEEEEEEEL.......HHHL..........lllL


DSSP  EEL..............................l
Query RLA..............................p  204
ident                                   
Sbjct LPDinkvdpvifapvsreyyavgeflakafsagk  183
DSSP  LLLhhhhlleeeelllleeeelllllllllllll


No 36: 1USCA  MOLECULE: PUTATIVE STYRENE MONOOXYGENASE SMALL COMPONENT;            

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLEEEEEEEEllLLEEEEEEEE.LLEELL.
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpreTLPEAITFSSAElpSGRVSSRILL.FKELDH.   58
ident                                             ||          |   
Sbjct ............mrsyraqgplpgfyhyYPGVPAVVGVRV..EERVNFCPAVwNTGLSAd   46
DSSP  ............leeeelllllllllllLLLLLEEEEEEE..LLEEEEEEELlEEEEELl


DSSP  .LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...........................
Query .RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...........................   90
ident    |                        |                               
Sbjct pPLFGVSIS.PKRFTHGLLLKARRFSASFHPFGqkdlvhwlgshsgrevdkgqaphflgh  105
DSSP  lLEEEEEEL.LLLHHHHHHHHHLEEEEEELLHHhhhhhhhhlllllllllhhhlleeell


DSSP  ......lleEEEEEEEEEELLHhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhh
Query ......lqrQVRVEGITEHVNRetseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltq  144
ident              |     |                                        
Sbjct tgvpilegaYAAYELELLEVHT......................................  127
DSSP  llleeelllLEEEEEEEEEEEE......................................


DSSP  hhhhhllllllllllLLEEEEEEEEEEEEEEEllllllLEEE...........eeellll
Query knterfkdaedipcpDYWGGLRIVPLEIEFWQgrpsrlHDRF...........vyrrkte  193
ident                                                             
Sbjct ..............fGDHDLFVGRVVAVWEEE......GLLDekgrpkpglallyygkgl  167
DSSP  ..............eLLEEEEEEEEEEEEELL......LLLLllllllllllleeeelle


DSSP  lllleeeeell
Query ndpwkvvrlap  204
ident            
Sbjct ygrpaeetfap  178
DSSP  eelllllllll


No 37: 2D36A  MOLECULE: HYPOTHETICAL NADH-DEPENDENT FMN OXYDOREDUCTASE;            

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllLLLLlLEEEEEEEELllLEEEEEEEE.LLEELL.
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpRETLpEAITFSSAELpsGRVSSRILL.FKELDH.   58
ident                              |             |         |  |   
Sbjct ................maeviksimrKFPL.GVAIVTTNWK..GELVGMTVNtFNSLSLn   41
DSSP  ................lllhhhhhhlLLLE.ELEEEEEEEL..LEEEEEEELlLEEEEEl


DSSP  .LLEEEEEELLLLHhHHHHHHLLEEEEEEEEL............................
Query .RGFTIYSNWGTSRkAHDIATNPNAAIVFFWK............................   89
ident                             |                               
Sbjct pPLVSFFADRMKGN.DIPYKESKYFVVNFTDNeelfnifalkpvkerfreikykegiggc  100
DSSP  lEEEEEEEELLLLL.LHHHHLLLEEEEEEELLhhhhhhhhhlllllhhhllleeelhhhl


DSSP  ..llleEEEEEEEEEELLhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhh
Query ..dlqrQVRVEGITEHVNretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknt  147
ident           |                                                 
Sbjct pilydsYAYIEAKLYDTI..........................................  118
DSSP  eeelleEEEEEEEEEEEE..........................................


DSSP  hhlllllllllLLLEEEEEEEEEEEEEEELLllllleeeeeelllllllleeeeell
Query erfkdaedipcPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRpsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                                                          
Sbjct ..........dVGDHSIIVGEVIDGYQIRDN...........ftplvymnrkyykls  154
DSSP  ..........eELLEEEEEEEEEEEEELLLL...........lllleeelleeelll


No 38: 1RZ0A  MOLECULE: PHENOL 2-HYDROXYLASE COMPONENT B;                          

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLlEEEEEEEEllLLEEEEEEEE.LLEELL.
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedprETLPeAITFSSAElpSGRVSSRILL.FKELDH.   58
ident                                            | |       |      
Sbjct ...............xddrlfrnaxgkFATG.VTVITTEL..NGAVHGXTANaFXSVSLn   42
DSSP  ...............llhhhhhhhhhlLLLL.LEEEEEEE..LLEEEEEEELlEEEEELl


DSSP  .LLEEEEEElllLHHHHHHHHLLEEEEEEEELL...........................
Query .RGFTIYSNwgtSRKAHDIATNPNAAIVFFWKD...........................   90
ident                   |      |      |                           
Sbjct pKLVLVSIG.ekAKXLEKIQQSKKYAVNILSQDqkvlsxnfagqlekpvdvqfeelgglp  101
DSSP  lLEEEEEEE.llLHHHHHHHHHLEEEEEELLLLlhhhhhhlllllllllllleeeellee


DSSP  ..lleEEEEEEEEEELLhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhh
Query ..lqrQVRVEGITEHVNretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknte  148
ident                                                             
Sbjct vikdaLAQISCQVVNEV...........................................  118
DSSP  eelllLEEEEEEEEEEE...........................................


DSSP  hlllllllllLLLEEEEEEEEEEEEEEELLLlllleeeeeelllllllleeeeell
Query rfkdaedipcPDYWGGLRIVPLEIEFWQGRPsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                        |      |                         
Sbjct .........qAGDHTLFIGEVTDIKITEQDP............llffsgkyhqlaq  153
DSSP  .........eELLEEEEEEEEEEEEELLLLL............leeelleeellll


No 39: 1EJEA  MOLECULE: FMN-BINDING PROTEIN;                                       

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLEELL..
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKELDH..   58
ident                                            |        |       
Sbjct ....gsqaahmmsmdfedfpvesahriltpRPTVMVTTVDE.EGNINAAPFSFTMPVSid   55
DSSP  ....llhhhhhhllllllllhhhhhhllllEELEEEEEELL.LLLEEEEEELLEEEEEll


DSSP  .LLEEEEEElLLLHHHHHHHHLLEEEEEEEELLL..........................
Query .RGFTIYSNwGTSRKAHDIATNPNAAIVFFWKDL..........................   91
ident        |       |  |       |     |                           
Sbjct pPVVAFASA.PDHHTARNIESTHEFVINITPADIiermwvtardipageneleaaglawt  114
DSSP  lLEEEEEEL.LLLHHHHHHHHHLEEEEEELLHHHhhhhhhllllllllllhhhhhlllee


DSSP  ...........leEEEEEEEEEELLhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhh
Query ...........qrQVRVEGITEHVNretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeld  140
ident                  |                                          
Sbjct ssrrvkppriveaPGHLECELLRMF...................................  139
DSSP  lllllllleelllLEEEEEEEEEEE...................................


DSSP  hhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEEEEEEellllllLEEEeeelllllllleee
Query eltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLEIEFWqgrpsrlHDRFvyrrktendpwkvv  200
ident                                                             
Sbjct .................evgdHNLITGSVVSASVR.......SGAV..............  161
DSSP  .................eellEEEEEEEEEEEEEL.......LLLE..............


DSSP  EELL...........................
Query RLAP...........................  204
ident                                
Sbjct KEGLldvesvkpvlhvggnkfvvgdhvrhve  192
DSSP  ELLEelhhhhlleeeeelleeeellllllll


No 40: 1Y12A  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA0085;                               

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLEEEEEeeelllleeEEEE..........
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpreTLPEAITFSsaelpsgrvSSRI..........   50
ident                                  |                          
Sbjct ............................AVDXFIKIG.........DVKGeskdkthaee   23
DSSP  ............................LLEEEEEEL.........LLLLllllllllll


DSSP  EELL.EELL...................LLEEEEE..elllLHHHHHHHHLLEE.EEEEE
Query LLFK.ELDH...................RGFTIYS..nwgtSRKAHDIATNPNA.AIVFF   87
ident                                                             
Sbjct IDVLaWSWGxsqsgsxhxggggagkvnvQDLSFTKyidkstPNLXXACSSGKHYpQAKLT   83
DSSP  EEEEeEEEEeeellllllllllllleeeLLEEEEEellllhHHHHHHHHHLLLEeEEEEE


DSSP  EL.......LLLEEEEEE.EEEEELLhhhhhhhhhhLLHHhHHHHhhllllleellhhhh
Query WK.......DLQRQVRVE.GITEHVNretseryfktRPRGsKIGAwasrqsdviknreel  139
ident                         |              |                    
Sbjct IRkaggenqVEYLIITLKeVLVSSVS........tgGSGG.EDRL...............  119
DSSP  EElllllllLLLEEEEEEeEEEEEEE........llLLLL.LLLL...............


DSSP  hhhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEEEEEEELL......LLLLLEEEEEELLll
Query deltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLEIEFWQGR......PSRLHDRFVYRRKte  193
ident                                                             
Sbjct ......................TENVTLNFAQVQVDYQPqkadgaKDGGPVKYGWNIR..  155
DSSP  ......................EEEEEEEEEEEEEEELLllllllLLLLLEEEEEELL..


DSSP  llLLEEEeell
Query ndPWKVVrlap  204
ident            
Sbjct ..QNVQA....  160
DSSP  ..LLEEL....


No 41: 2GJGA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PP4397;                               

DSSP  .....lllhhhlllLHHHHHHHHHHhhhhlllllLLLEEEEEEEelllLEEEEEEEELLE
Query .....tlnekqltdDPIDLFTKWFNeakedpretLPEAITFSSAelpsGRVSSRILLFKE   55
ident                                                  |          
Sbjct xfnesdapqppkvlSTPLEIAANLR.....qlqeSHDPLIITFH....DRSHRFQSYVVH   51
DSSP  llllllllllleeeLLHHHHHHHHH.....hhhhLLLLEEEEEL....LLLLLEEELEEE


DSSP  EL..LLLEEEEEelllLHHHHHHHHLLEEEEEEEELllLEEEEEEEE.eEELLhhHHHHH
Query LD..HRGFTIYSnwgtSRKAHDIATNPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGI.tEHVNreTSERY  112
ident  |                    |          |          |               
Sbjct VDreSNTLALDE.xipRDGEKFIENGEHFRVEGFHD..GVRIAWECDhaLKIS..EVDGH  106
DSSP  EEllLLEEEEEL.lllHHHHHHHHLLLLEEEEEEEL..LEEEEEEELllLEEE..EELLE


DSSP  hhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleEEEE.eEEEE
Query fktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdywGGLR.iVPLE  171
ident                                                          | |
Sbjct ..................................................RCYSgpLPQE  116
DSSP  ..................................................EEEEelLLLL


DSSP  EEEEELLLLLL.................................................
Query IEFWQGRPSRL.................................................  182
ident     | |                                                     
Sbjct VTYHQRRNAFRaalklsqlvdiildgahlkgngaxrgklldisatgcklrfegnvedrlq  176
DSSP  EEEELLHHHHHhhllllllleeeeellllllllleeeeeeeellleeeeeeelllhhhll


DSSP  .................................................leeeeeellll
Query .................................................hdrfvyrrkte  193
ident                                                             
Sbjct lgqvyerfkagnplglvdtxvelrhlhyeerinttfagvrfhnlsgqaqrkiesfvyqlq  236
DSSP  llleeeeeeellllleeeeeeeeeeeeeehhhleeeeeeeeelllhhhhhhhhhhhhhhh


DSSP  lllleeeeell
Query ndpwkvvrlap  204
ident            
Sbjct rearrfdkddy  247
DSSP  hhhhhhhllll


No 42: 2A4OA  MOLECULE: PROBABLE PROTEIN P3C;                                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct stleiaglvrknlvqfgvgekngsvrwvmnalgvkddwllvpshaykfekdyemmefyfn   60
DSSP  lhhhhhhhhhhheeeeeeeellllleeeeeeeeeelleeeeehhhllllllhhheeeeee


DSSP  ..................................lllhhhllllHHHHHHhhhhhhhhll
Query ..................................tlnekqltddPIDLFTkwfneakedp   26
ident                                                             
Sbjct rggtyysisagnvviqsldvgfqdvvlmkvptipkfrditqhfiKKGDVP..........  110
DSSP  elleeeeeehhhleeeellllllleeeeellllllllllhhhllLHHHHH..........


DSSP  lllllLEEEEEEEELllLEEEEEEEELLEELL...................LLEEEEEel
Query retlpEAITFSSAELpsGRVSSRILLFKELDH...................RGFTIYSnw   67
ident         |        |                                          
Sbjct .ralnRLATLVTTVN..GTPMLISEGPLKMEEkatyvhkkndgttvdltvdQAWRGKG..  165
DSSP  .hhllLLEEEEEEEL..LEEEEEEELLLEEEEeeeeeeellllleeeeeeeEEEEEEL..


DSSP  lllhHHHHHhhlLEEEEE.EEELlllEEEEEEEEEEEllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhh
Query gtsrKAHDIatnPNAAIV.FFWKdlqRQVRVEGITEHvnretseryfktrprgskigawa  126
ident                | |                                          
Sbjct ...eGLPGM...CGGALVsSNQS..iQNAILGIHVAG.......................  194
DSSP  ...lLLLLL...LLLEEEeLLHH..hLLLEEEEEEEE.......................


DSSP  llllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEEeeeeellllllleee
Query srqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLEiefwqgrpsrlhdrf  186
ident                                       |                     
Sbjct ..................................gNSILVAKLVT...............  205
DSSP  ..................................eLLEEEEEELL...............


DSSP  EEELllllllleEEEEll
Query VYRRktendpwkVVRLap  204
ident                   
Sbjct QEMF........QNIXvx  215
DSSP  HHHH........HHLLll


No 43: 2IDBA  MOLECULE: 3-OCTAPRENYL-4-HYDROXYBENZOATE CARBOXY-LYASE;              

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct yndlrdfltlleqqgelkritlpvdphleiteiadrtlraggpallfenpkgysxpvlcn   60
DSSP  lllhhhhhhhhhhllleeeellllllllhhhhhhhhhhllllleeeellllllllleeel


DSSP  ....................................................lllhhhll
Query ....................................................tlnekqlt    8
ident                                                             
Sbjct lfgtpkrvaxgxgqedvsalrevgkllaflkepeppkgfrdlxptkrlrgapcqqkivsg  120
DSSP  llllhhhhhhllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllllleeelllhhhleeeeh


DSSP  LLHHhhHHHHH.hhhhhlllllllLEEEEEEEELLLLEEEEEEEElLEELL.lLEEEEEE
Query DDPIdlFTKWF.neakedpretlpEAITFSSAELPSGRVSSRILLfKELDH.rGFTIYSN   66
ident ||                                   |    |     |           
Sbjct DDVD..LNRIPixtcwpedaapliTWGLTVTRGPHKERQNLGIYR.QQLIGknKLIXRWL  177
DSSP  HHLL..HHHLLllllllllllleeLLLEEEEELLLLLLEEEELLL.EEELLllEEEELLL


DSSP  lLLLHHHHHHHHL........LEEEEEEEELL............................
Query wGTSRKAHDIATN........PNAAIVFFWKD............................   90
ident       | |                                                   
Sbjct .SHRGGALDYQEWcaahpgerFPVSVALGADPatilgavtpvpdtlseyafagllrgtkt  236
DSSP  .LLLHHHHHHHHHhhhlllllEEEEEEELLLHhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhllll


DSSP  .............lleEEEEEEEEE..ELLHhhHHHHhhHLLHHHHhhhhhllllleell
Query .............lqrQVRVEGITE..HVNRetSERYfkTRPRGSKigawasrqsdvikn  135
ident                     ||  |           |      |                
Sbjct evvkcisndlevpasaEIVLEGYIEqgETAP..EGPY..GDHTGYY..............  278
DSSP  eeeelllllleeelllLEEEEEEEEeeEEEE..ELLE..ELLLLEE..............


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleEEEEEEEEEEEEEEL..................
Query reeldeltqknterfkdaedipcpdywGGLRIVPLEIEFWQG..................  177
ident                                     |                       
Sbjct .......................nevdSFPVFTVTHITQREDaiyhstytgrppdepavl  315
DSSP  .......................elleEEEEEEEEEEEELLLlleelllllllllhhhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  177
ident                                                             
Sbjct gvalnevfvpilqkqfpeivdfylppegcsyrlavvtikkqyaghakrvxxgvwsflrqf  375
DSSP  hhhhhhhhhhhhhhhllleeeeellhhhlllleeeeeellllllhhhhhhhhhhhllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  177
ident                                                             
Sbjct xytkfvivcdddvnardwndviwaittrxdpardtvlventpidyldfaspvsglgskxg  435
DSSP  lllleeeeeelllllllhhhhhhhhhhlllhhhheeeeeeeelllllllllllleeeeee


DSSP  ............lllllleeeeeelllllllleeeeell
Query ............rpsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                                        
Sbjct ldatnkwpgetqrewgrpikkdpdvvahidaiwdelaif  474
DSSP  eelllllllllllllleellllhhhhhhhhhhlllllll


No 44: 1YWUA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN PA4608;                               

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEEEEEEelllleEEEEEEELLEELLLL
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpretLPEAITFSSAelpsgrVSSRILLFKELDHRG   60
ident                                                    |       |
Sbjct ..............msdqhderrrfhriaFDADSEILQG......ERRWEVLLHDVSLHG   40
DSSP  ..............lllllllllllllllLLLEEEEEEL......LEEEEEEEEEELLLE


DSSP  EEEEEELLllhhHHHHhhLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEEEEELLhhhhhhhhhhllhhh
Query FTIYSNWGtsrkAHDIatNPNAAIVFFWKdLQRQVRVEGITEHVNretseryfktrprgs  120
ident                               |    | |                      
Sbjct ILVGQPQD....WNGD.pQRPFEARLYLG.LDVLIRMEISLAWAR...............   79
DSSP  EEEELLLL....LLLL.lLLEEEEEEELL.LLLEEEEEEEEEEEE...............


DSSP  hhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEEEEeeellll
Query kigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLEIEfwqgrps  180
ident                                           | |      |        
Sbjct .........................................DGLLGFECQHID.......   91
DSSP  .........................................LLEEEEEEEEEL.......


DSSP  llleEEEE..............elllllllleeeeell
Query rlhdRFVY..............rrktendpwkvvrlap  204
ident                                       
Sbjct ....LDSIshlrrlvelnlgdeellerelallvsahdd  125
DSSP  ....HHHHhhhhhhhhhhlllhhhhhllhhhlllllll


No 45: 2BM2A  MOLECULE: HUMAN BETA2 TRYPTASE;                                      

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ivggqeaprskwpwqvslrvhgpywmhfcggslihpqwvltaahcvgpdvkdlaalrvql   60
DSSP  lllleelllllllleeeeeellllleeeeeeeeeelleeeelhhhhllllllhhheeeel


DSSP  ..........................................lllhhhllllhhHHHHhh
Query ..........................................tlnekqltddpiDLFTkw   18
ident                                                          |  
Sbjct reqhlyyqdqllpvsriivhpqfytaqigadialleleepvkvsshvhtvtlppASET..  118
DSSP  llllllllllllleeeeeellllllllllllleeeeelllllllllllllllllLLLL..


DSSP  hhhhhhllllllLLEEEEEEE.......ELLL.LEEEEEEEELLEE..............
Query fneakedpretlPEAITFSSA.......ELPS.GRVSSRILLFKEL..............   56
ident                              ||             |               
Sbjct .........fppGMPCWVTGWgdvdndeRLPPpFPLKQVKVPIMENhicdakyhlgaytg  169
DSSP  .........lllLLLEEEEELlllllllLLLLlLLLEEEEELEELHhhhhhhhhllllll


DSSP  ......LLLLEEEEEEllllhhHHHHhhlLEEEEEEEELllLEEEEEEEEEEELlhhhhh
Query ......DHRGFTIYSNwgtsrkAHDIatnPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGITEHVnretse  110
ident                                   |                         
Sbjct ddvrivRDDMLCAGNT..rrdsCQGD...SGGPLVCKVN..GTWLQAGVVSWGE......  216
DSSP  llllllLLLEEEELLL..llllLLLL...LLLEEEEEEL..LEEEEEEEEEELL......


DSSP  hhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllLEEEEEEEEE
Query ryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdYWGGLRIVPL  170
ident                                                             
Sbjct ..............................................gcaqPNRPGIYTRV  230
DSSP  ..............................................llllLLLLEEEEEL


DSSP  eeeeeellllllleeeeeelllllLLLEEEEEll
Query eiefwqgrpsrlhdrfvyrrktenDPWKVVRLap  204
ident                         |         
Sbjct ....................tyylDWIHHYVP..  242
DSSP  ....................hhhhHHHHLLLL..


No 46: 1QTFA  MOLECULE: EXFOLIATIVE TOXIN B;                                       

DSSP  ...lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhHLLLLL...LLLEEEEEEEellllEEEEEEEELL
Query ...tlnekqltddpidlftkwfneakEDPRET...LPEAITFSSAelpsgRVSSRILLFK   54
ident                                         |                   
Sbjct keysaeeirklkqkfevpptdkelytHITDNArspYNSVGTVFVK.....GSTLATGVLI   55
DSSP  llllhhhhhhhhhhlllllllllleeELLLLLlllHHHEEEEEEL.....LLEEEEEEEE


DSSP  EEllllEEEEEELLllhHHHHhHHLLE.EEEEE.EELL....LLEE..EEEEeeEEELlh
Query ELdhrgFTIYSNWGtsrKAHDiATNPN.AAIVF.FWKD....LQRQ..VRVEgiTEHVnr  106
ident        ||  |          | ||           |             |   |    
Sbjct GK....NTIVTNYH..vAREA.AKNPSnIIFTPaQNRDaeknEFPTpyGKFE.aEEIK..  105
DSSP  EL....LEEEELHH..hHHHH.LLLHHhEEEEElLLLLllllLLLLllLLEE.eEEEE..


DSSP  hhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLEEEEE
Query etseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipCPDYWGGLR  166
ident                                                             
Sbjct ..............................................espygQGLDLAIIK  119
DSSP  ..............................................lllllLLLLLEEEE


DSSP  EEEEeeeeeellllllleeeeEELL...................................
Query IVPLeiefwqgrpsrlhdrfvYRRK...................................  191
ident   |                                                         
Sbjct LKPN.................EKGEsagdliqpanipdhidiakgdkysllgypynysay  162
DSSP  ELLL.................LLLLlhhhhlllllllllllllllleeeeeellllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  191
ident                                                             
Sbjct slyqsqiemfndsqyfgytevgnsgsgifnlkgeligihsgkggqhnlpigvffnrkiss  222
DSSP  lleeeeeeellllleellllhhhllleeellllleeeeeeeeelllleeeeeelllllll


DSSP  ...........lllllleeeeell
Query ...........tendpwkvvrlap  204
ident                         
Sbjct lysvdntfgdtlgndlkkrakldk  246
DSSP  lllllllllllhhhhhhhhhhlll


No 47: 2JE2A  MOLECULE: CYTOCHROME P460;                                           

DSSP  ...LLLH..HHLLllhhhHHHHHHHhhhhllllllLLEEEEEEEelllleeeeeeeelle
Query ...TLNE..KQLTddpidLFTKWFNeakedpretlPEAITFSSAelpsgrvssrillfke   55
ident            |      |                                         
Sbjct agvAEFNdkGELL.....LPKNYRE..........WVMVGTQVT................   29
DSSP  lllLLLLllLLEE.....LLLLHHH..........LEEEEEEEE................


DSSP  elllleeeeeellllhhhhhhhhLLEEEEEEEELLL.............LEEEEEEEEEE
Query ldhrgftiysnwgtsrkahdiatNPNAAIVFFWKDL.............QRQVRVEGITE  102
ident                              |                      |       
Sbjct .......................PTEIRTVYVDPESyahwkktgefrdgTVTVKELVSVG   66
DSSP  .......................LLEEEEEEELHHHhhhhhhhllllllLEEEEEEEEEE


DSSP  ELLHHhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllle
Query HVNREtseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdyw  162
ident                                                             
Sbjct DRKGP.......................................................   71
DSSP  EELLL.......................................................


DSSP  EEEEE.EEEEEEEEELLLL......LLLEEEEEELLlllLLLEE..EEEL..........
Query GGLRI.VPLEIEFWQGRPS......RLHDRFVYRRKtenDPWKV..VRLA..........  203
ident  |         |                           |   |                
Sbjct NGYFMgDYIGLEASVKDSQrfanepGNWAFYIFYVP...DTPLVaaAKNLptaecaachk  128
DSSP  LEEEEeEEEEEEEEEELLLlllllhHHEEEEEEELL...LLLLLleELLLlllllhhhhh


DSSP  ............................l
Query ............................p  204
ident                              
Sbjct enaktdmvftqfypvlraakatgesgvva  157
DSSP  hhlllllllhhhlhhhhhhhhhlllllll


No 48: 2IJOB  MOLECULE: POLYPROTEIN;                                               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ggvlwkkgdtttgvyrimtrgllgsyqagagvmvegvfhtlwhttkgaalmsgegrldpy   60
DSSP  lleelllllllleeeeeeeeelleeeeeeeeeeelleeeelhhhhlllleeelleeelee


DSSP  .....lllhhhlLLLHhhhhhhhhhhhhhllllllLLEEEEEEEELlLLEEEEEEEELLE
Query .....tlnekqlTDDPidlftkwfneakedpretlPEAITFSSAELpSGRVSSRILLFKE   55
ident                                             |     |         
Sbjct wgsvkedrlcygGPWQ............lqhkwngQDEVQMIVVEP.GRNVKNVQTKPGV  107
DSSP  eeelllleeeelLLLL............lllllllLLLEEEEELLL.LLLLEEEEELLEE


DSSP  ELL...lLEEEEEEllllhHHHHHhhlLEEEEEEEElllleEEEEEEeEEELLHHhhhhh
Query LDH...rGFTIYSNwgtsrKAHDIatnPNAAIVFFWkdlqrQVRVEGiTEHVNREtsery  112
ident                                ||                  |        
Sbjct FKTpegeIGAVTLD.....FPTGT...SGSPIVDKN.....GDVIGLyGNGVIMP.....  149
DSSP  EELllleEEEELLL.....LLLLL...LLLEEELLL.....LLEEEElLLEEELL.....


DSSP  hhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEEEEEEee
Query fktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpDYWGGLRIVPLei  172
ident                                                       ||    
Sbjct ...............................................NGSYISAIVQG..  160
DSSP  ...............................................LLLEEEELLLL..


DSSP  eeeellllllleeeeeelllllllLEEEEELl
Query efwqgrpsrlhdrfvyrrktendpWKVVRLAp  204
ident                                 
Sbjct .......................eRMDEPIP.  168
DSSP  .......................lLLLLLLL.


No 49: 1M9UA  MOLECULE: EARTHWORM FIBRINOLYTIC ENZYME;                             

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhHLLLLLLLLEEEEEEEElllLEEEE.EEEELLEelll
Query tlnekqltddpidlftkwfneakEDPRETLPEAITFSSAElpsGRVSS.RILLFKEldhr   59
ident                               |            |  |             
Sbjct ..................viggtNASPGEFPWQLSQQRQS...GSWSHsCGASLLS...s   36
DSSP  ..................lllleELLLLLLLLEEEEEEEL...LLEEEeEEEEELL...l


DSSP  LEEEEEELlllhhhhhhHHLLE.EEEEEEEL...llLEEEEEEEEEEELLHHhhhhhhhh
Query GFTIYSNWgtsrkahdiATNPN.AAIVFFWK...dlQRQVRVEGITEHVNREtseryfkt  115
ident                     ||                                      
Sbjct TSALSASH......cvdGVLPNnIRVIAGLWqqsdtSGTQTANVDSYTMHEN........   82
DSSP  LEEEELHH......hhlLLLHHhEEEEELLLlllllLLLEEEEEEEEEELLL........


DSSP  llhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllLLLLLLEEEEEEEEeEEEE.
Query rprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedIPCPDYWGGLRIVPlEIEF.  174
ident                                                             
Sbjct ....................................ygagTASYSNDIAILHLA.TSISl  105
DSSP  ....................................llllLLLLLLLLEEEEEL.LLLLl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  174
ident                                                             
Sbjct ggniqaavlpannnndyagttcvisgwgrtdgtnnlpdilqkssipvittaqctaamvgv  165
DSSP  lllllllllllllllllllleeeeeelllllllllllllleeeeeelllhhhhhhhhlll


DSSP  ..............................................eellllllleeeee
Query ..............................................wqgrpsrlhdrfvy  188
ident                                                             
Sbjct gganiwdnhicvqdpagntgacngdsggplncpdggtrvvgvtswvvssglgaclpdyps  225
DSSP  lllllllleeeelllllllllllllllleeeeellleeeeeeeeelllllllllllllle


DSSP  elllllllleeeeell
Query rrktendpwkvvrlap  204
ident                 
Sbjct vytrvsaylgwigdns  241
DSSP  eeeehhhlhhhhhhhl


No 50: 1AZZA  MOLECULE: COLLAGENASE;                                               

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ivggveavpnswphqaalfiddmyfcggslispewiltaahcmdgagfvdvvlgahnire   60
DSSP  lllleelllllllleeeeeellleeeeeeeeelleeeelhhhhllllleeeeelllllll


DSSP  .....................................lllhhhllllhhHHHHhhhhhhh
Query .....................................tlnekqltddpiDLFTkwfneak   23
ident                                                             
Sbjct deatqvtiqstdftvhenynsfvisndiavirlpvpvtltaaiatvglpSTDV.......  113
DSSP  llllleeeeelleeellllllllllllleeeelllllllllllllllllLLLL.......


DSSP  hlllllllLEEEEEEEEL.....LLLE..EEEEEEELLEE..........LLLLEEEEEE
Query edpretlpEAITFSSAEL.....PSGR..VSSRILLFKEL..........DHRGFTIYSN   66
ident            |     |                                      | | 
Sbjct .....gvgTVVTPTGWGLpsdsaLGISdvLRQVDVPIMSNadcdavygivTDGNICIDST  168
DSSP  .....lllLEEEEEELLLlllllLLLLllLEELLEEEELHhhhhhhhlllLLLEEEELLL


DSSP  llllhHHHHHhhlLEEEEEEEelllleEEEEEEEEEEllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhh
Query wgtsrKAHDIatnPNAAIVFFwkdlqrQVRVEGITEHvnretseryfktrprgskigawa  126
ident                                                             
Sbjct .ggkgTCNGD...SGGPLNYN......GLTYGITSFG.......................  195
DSSP  .llllLLLLL...LLLEEEEL......LEEEEEEEEE.......................


DSSP  llllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllLEEEEEEEEEeeeeeellllllleee
Query srqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdYWGGLRIVPLeiefwqgrpsrlhdrf  186
ident                                                             
Sbjct ............................aaagceAGYPDAFTRV................  211
DSSP  ............................elllllLLLLEEEEEL................


DSSP  eeellllllLLEE..EEELl
Query vyrrktendPWKV..VRLAp  204
ident           |         
Sbjct .....tyflDWIQtqTGITp  226
DSSP  .....hhhhHHHHhhHLLLl


No 51: 1KCGC  MOLECULE: NKG2-D TYPE II INTEGRAL MEMBRANE PROTEIN;                  

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllLLLLlEEEEEEEELLL....LEEEEEEEEllee
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedprETLPeAITFSSAELPS....GRVSSRILLfkel   56
ident                                                             
Sbjct ...........................DAHS.LWYNFTIIHLPrhgqQWCEVQSQV...d   29
DSSP  ...........................LLEE.EEEEEEEELLLllllLLEEEEEEE...l


DSSP  lllleeeeeelLLLH...............................hhhhhhHLLEEEEE
Query dhrgftiysnwGTSR...............................kahdiaTNPNAAIV   85
ident                                                             
Sbjct qknflsydcgsDKVLsmghleeqlyatdawgkqlemlrevgqrlrleladtePLTLQVRM   89
DSSP  leeeeeeelllLEELllllllllllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhlllLLEEEEEE


DSSP  EEEL...LLLEEEEEEEEEeellhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhh
Query FFWK...DLQRQVRVEGITehvnretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldel  142
ident           |                                                 
Sbjct SCECeadGYIRGSWQFSFD.........................................  108
DSSP  EEEElllLLLEEEEEEELL.........................................


DSSP  hhhhhhhlllllllllllleeeeeEEEEEEEEEElllllllEEEEEELLLLlLLLE..eE
Query tqknterfkdaedipcpdywgglrIVPLEIEFWQgrpsrlhDRFVYRRKTEnDPWK..vV  200
ident                                           |            |    
Sbjct ........................GRKFLLFDSN.......NRKWTVVHAGaRRMKekwE  137
DSSP  ........................LLEEEEEELL.......LLEEEELLHHhHHHHhhhH


DSSP  EEL.............................l
Query RLA.............................p  204
ident                                  
Sbjct KDSglttffkmvsmrdckswlrdflmhrkkrle  170
DSSP  HLHhhhhhhhhhhhlhhhhhhhhhhhhhhhhhl


No 52: 1E54A  MOLECULE: OUTER MEMBRANE PORIN PROTEIN 32;                           

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct xssvtlfgivdtnvayvnkdaagdsryglgtsgastsrlglrgtedlggglkagfwlege   60
DSSP  lleeeeeeeeeeeeeeelllllllleeeeeelllllleeeeeeeeeeelleeeeeeeeee


DSSP  ..............................................lllhhhllLLHHHH
Query ..............................................tlnekqltDDPIDL   14
ident                                                             
Sbjct ifgddgnasgfnfkrrstvslsgnfgevrlgrdlvptsqkltsydlfsatgigpFMGFRN  120
DSSP  llllllllllllllleeeeeeeelleeeeelleelhhhhhhhhhllllllllllLLLLLL


DSSP  .......hhHHHHH...........................hhhlLLLLLLlEEEEEEee
Query .......ftKWFNE...........................akedPRETLPeAITFSSae   40
ident                                                             
Sbjct waagqgaddNGIRAnnlisyytpnfggfnagfgyafdekqtigtaDSVGRY.IGGYVA..  177
DSSP  lllllllllLLLEElleeeeelllllleeeeeeeellllllllllLLLLLE.EEEEEE..


DSSP  lllleeeeeeeelleelllleeeeeellllhhhhHHHH.LLEEEEEEEELL......lLE
Query lpsgrvssrillfkeldhrgftiysnwgtsrkahDIAT.NPNAAIVFFWKD......lQR   93
ident                                                  |         |
Sbjct ..................................YDNGpLSASLGLAQQKTavgglatDR  203
DSSP  ..................................EEELlEEEEEEEEEEEEeelleeeEE


DSSP  EEEEEEEEEELLHhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllll
Query QVRVEGITEHVNRetseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkda  153
ident      |                                                      
Sbjct DEITLGASYNFGV...............................................  216
DSSP  EEEEEEEEEELLL...............................................


DSSP  lllllllleeeeeeeeEEEEEEELLLLLLLEEEEEELLL...........lLLLLEEEEE
Query edipcpdywgglrivpLEIEFWQGRPSRLHDRFVYRRKT...........eNDPWKVVRL  202
ident                 |       |                                   
Sbjct ...........aklsgLLQQTKFKRDIGGDIKTNSYMLGasapvggvgevkLQYALYDQK  265
DSSP  ...........leeeeEEEEEEEEELLLLEEEEEEEEEEeeeelllleeeeEEEEEEEEH


DSSP  L...........................................................
Query A...........................................................  203
ident |                                                           
Sbjct Aidskahqitlgyvhnlskrtalygnlaflknkdastlglqakgvyaggvqagesqtgvq  325
DSSP  Hhleeeeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeelllllllllllllllllllllleeeeee


DSSP  ......l
Query ......p  204
ident        
Sbjct vgirhaf  332
DSSP  eeeeeel


No 53: 2P3PA  MOLECULE: HYPOTHETICAL PROTEIN;                                      

DSSP  lllhhhllllhhhhhhHHHH.............hhhhllllLLLL..EEEEEEEelllle
Query tlnekqltddpidlftKWFN.............eakedpreTLPE..AITFSSAelpsgr   45
ident                                                  | |        
Sbjct ..........agelerCFLAxpesvlpivtxeerndlcrraGHLSgfTHTASLE......   44
DSSP  ..........llhhhhHHHHllllllllllhhhhhhhhhhhLLLLllLEEEEEE......


DSSP  eeeeeeelleelllleeeeeellllhhhhhHHHLLEEEEEEEEllllEEEEEEEEeeell
Query vssrillfkeldhrgftiysnwgtsrkahdIATNPNAAIVFFWkdlqRQVRVEGItehvn  105
ident                                                   |         
Sbjct ..............................SSLGGTVTFLLNR....NFIRIQTS.....   65
DSSP  ..............................LLLLLEEEEEEEL....LEEEEEEL.....


DSSP  hhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeee
Query retseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdywggl  165
ident                                                             
Sbjct ............................................................   65
DSSP  ............................................................


DSSP  eeEEEEEEEEELLLL..LLLEEEEEELLLlLLLLEEEEELL...................
Query riVPLEIEFWQGRPS..RLHDRFVYRRKTeNDPWKVVRLAP...................  204
ident      |        |        |                                    
Sbjct ..TVGEVFXRILPFSdsSSVICVVTTVLH.PVADSRIDFYTtewkplktdrfwqqpried  122
DSSP  ..LLLEEEEEEEELLllLEEEEEEEEELL.LLLEEEEEEEElllleelhhhllllllhhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct fflphtdrqsyayqaiyasltpsyxqvslseesdtlsirqtvtetlaeeekplaaiflsp  182
DSSP  hlllllllllhhhhhhhhhhlllleeeeellllleeeeeellhhhlllllhhhhllllll


DSSP  ...............
Query ...............  204
ident                
Sbjct eplvyrwqsgrfvrq  197
DSSP  lleeeeelllleeel


No 54: 1LVBA  MOLECULE: CATALYTIC DOMAIN OF THE NUCLEAR INCLUSION                  

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlLLLL.LLLEEEEEEEELllLEEEEEEEELLEElll
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedPRET.LPEAITFSSAELpsGRVSSRILLFKELdhr   59
ident                                             |   |           
Sbjct .......................prDYNPiSSTICHLTNESD..GHTTSLYGIGFGP...   32
DSSP  .......................llLLHHhHLLEEEEEEEEL..LEEEEEEEEEELL...


DSSP  leEEEEelllLHHHHHHhhLLEEEEEEEelllleEEEEEE.EEEEllhhhhhhhhhhllh
Query gfTIYSnwgtSRKAHDIatNPNAAIVFFwkdlqrQVRVEG.ITEHvnretseryfktrpr  118
ident    |               |                      |                 
Sbjct ..FIIT...nKHLFRRN..NGTLLVQSL......HGVFKVkNTTT...............   64
DSSP  ..EEEE...lHHHHLLL..LEEEEEEEL......LEEEEElLHHH...............


DSSP  hhhhhhhHLLLL..............................................le
Query gskigawASRQS..............................................dv  132
ident          |                                                  
Sbjct .lqqhliDGRDXiiirxpkdfppfpqklkfrepqreericlvttnfqtksxssxvsdtsc  123
DSSP  .leeeelLLLLLeeeelllllllllllllllllllllleeeeeeeellleeeeeelllll


DSSP  eLLHHHH........................................hhhhhhhhhhlll
Query iKNREEL........................................deltqknterfkd  152
ident                                                             
Sbjct tFPSSDGifwkhwiqtkdgqagsplvstrdgfivgihsasnftntnnyftsvpknfxell  183
DSSP  lEEELLLleeeellllllllllleeeellllleeeeeeeeellllleeeeellllhhhhh


DSSP  lllLLLLLLeeeeeeeeeeeeeeellllllleeeeeelllllllleeeeell
Query aedIPCPDYwgglrivpleiefwqgrpsrlhdrfvyrrktendpwkvvrlap  204
ident                                                     
Sbjct tnqEAQQWV.....................sgwrlnadsvlwgghkvfxskp  214
DSSP  hlhHHLLLL.....................lllllllleeeelleeeellll


No 55: 1LCYA  MOLECULE: HTRA2 SERINE PROTEASE;                                     

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhHLLL.LLLL.LEEEEEEEELL.....LLEEEEEEEEL
Query tlnekqltddpidlftkwfneakEDPR.ETLP.EAITFSSAELP.....SGRVSSRILLF   53
ident                             |                        |      
Sbjct ............ppasprsqynfIADVvEKTApAVVYIEILDRHpflgrEVPISNGSGFV   48
DSSP  ............llllhhhhllhHHHHhHHHHhHEEEEEEEEEElllleEEEEEEEEEEE


DSSP  LEELlllEEEEEELLllhHHHHhhhlLEEEEEEEelllleEEEEEEeEEELlhhhhhhhh
Query KELDhrgFTIYSNWGtsrKAHDiatnPNAAIVFFwkdlqrQVRVEGiTEHVnretseryf  113
ident    |     |  |      |                                        
Sbjct VAAD...GLIVTNAH..vVADR....RRVRVRLL......SGDTYEaVVTA.........   84
DSSP  EELL...LEEEELHH..hHLLL....LEEEEELL......LLLEEEeEEEE.........


DSSP  hhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLLEEEEEEEE....
Query ktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcPDYWGGLRIVP....  169
ident                                                    |||      
Sbjct ..........................................vdpVADIATLRIQTkepl  102
DSSP  ..........................................eelLLLEEEEELLLllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  169
ident                                                             
Sbjct ptlplgrsadvrqgefvvamgspfalqntitsgivssaqrpnveyiqtdaaidfgnaggp  162
DSSP  lllllllhhhllllleeeellllllllllleeeellllllllllleeellllllllllle


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  169
ident                                                             
Sbjct lvnldgevigvntmkvtagisfaipsdrlreflhrryigvmmltlspsilaelqlrepsf  222
DSSP  eeelllleeeeeeeeeelleeeeeehhhhhhhllleelleeeeellhhhhhhhlllllll


DSSP  .......................................eeeeeeellllllleeeeeel
Query .......................................leiefwqgrpsrlhdrfvyrr  190
ident                                                             
Sbjct pdvqhgvlihkvilgspahraglrpgdvilaigeqmvqnaedvyeavrtqsqlavqirrg  282
DSSP  lllllleeeeeellllhhhhhlllllleeeeelleelllhhhhhhhhllllleeeeeeel


DSSP  llllllleeeeell
Query ktendpwkvvrlap  204
ident               
Sbjct retltlyvtpevte  296
DSSP  leeeeeeelleell


No 56: 1H6S1  MOLECULE: PORIN;                                                     

DSSP  ............................................lllhhhllllhhhhhh
Query ............................................tlnekqltddpidlft   16
ident                                                             
Sbjct eislngygrfglqyvedrgvgledtiissrlrinivgttetdqgvtfgaklrmqwddgda   60
DSSP  leeeeeeeeeeeeeellllllllleeeeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeeelllh


DSSP  hhhhhhhhlllllllLEEEEEEE.................................eLLL
Query kwfneakedpretlpEAITFSSA.................................eLPS   43
ident                   | |                                       
Sbjct fagtagnaaqfwtsyNGVTVSVGnvdtafdsvaltydsemgyeassfgdaqssffayNSK  120
DSSP  hhllllllleeeeeeLLEEEEEEllllhhhhllllllllllllllllllllllllllLLL


DSSP  LeeeeeeeelleelllleeeeeellllhhhhhhHHLLEEEEEEEELllLEEEEEEEEE..
Query GrvssrillfkeldhrgftiysnwgtsrkahdiATNPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGIT..  101
ident                                        |                    
Sbjct Y..........................dasgalDNYNGIAVTYSIS..GVNLYLSYVDpd  152
DSSP  L..........................llllllLLLEEEEEEEEEL..LEEEEEEEEEll


DSSP  EELLhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllll
Query EHVNretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdy  161
ident   |                                                         
Sbjct QTVD........................................................  156
DSSP  LLLL........................................................


DSSP  eeeeeeEEEEEEEEELLLLlLLEEEEEEL.LLLL.LLLEEEEELL...............
Query wgglriVPLEIEFWQGRPSrLHDRFVYRR.KTEN.DPWKVVRLAP...............  204
ident           |               |        |       |                
Sbjct .sslvtEEFGIAADWSNDM.ISLAAAYTTdAGGIvDNDIAFVGAAykfndagtvglnwyd  214
DSSP  .hhhllLEEEEEEEEELLL.EEEEEEEEElHHHLlLLLEEEEEEEellllleeeeeeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct nglstagdqvtlygnyafgattvrayvsdidragadtaygigadyqfaegvkvsgsvqsg  274
DSSP  llllllleeeeeeeeeeelleeeeeeeeeellllllleeeeeeeeeeelleeeeeeeeel


DSSP  ...............
Query ...............  204
ident                
Sbjct fanetvadvgvrfdf  289
DSSP  lllleeeeeeeeeel


No 57: 1C5MD  MOLECULE: PROTEIN (COAGULATION FACTOR X);                            

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ivggqeckdgecpwqallineenegfcggtilsefyiltaahclyqakrfkvrvgdrnte   60
DSSP  lllleelllllllleeeeeellleeeeeeeelllleeeelhhhhhlllleeeeellllll


DSSP  ........................................lllhhhllllHHHHHHHHHh
Query ........................................tlnekqltddPIDLFTKWFn   20
ident                                                     |       
Sbjct qeeggeavhevevvikhnrftketydfdiavlrlktpitfrmnvapaclpERDWAESTL.  119
DSSP  lllllleeeleeeeeellllllllllllleeeeellllllllllllllllLHHHHHHHL.


DSSP  hhhhllllllLLEEEEEEEEL......lLLEEEEEEEELLE...........eLLLLEEE
Query eakedpretlPEAITFSSAEL......pSGRVSSRILLFKE...........lDHRGFTI   63
ident                 |           | |                          |  
Sbjct ........mtQKTGIVSGFGRthekgrqSTRLKMLEVPYVDrnscklsssfiiTQNMFCA  171
DSSP  ........llLLEEEEEELLLlllllllLLLLEEEEEELLLhhhhhlllllllLLLLLLL


DSSP  EEEllllhHHHHHhhlLEEEEEEEELllLEEEEEEEEEEEllhhhhhhhhhhllhhhhhh
Query YSNwgtsrKAHDIatnPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGITEHvnretseryfktrprgskig  123
ident                      |   |                                  
Sbjct GYDtkqedACQGD...SGGPHVTRFK..DTYFVTGIVSWG....................  206
DSSP  LLLlllllLLLLL...LLLEEEEEEL..LEEEEEEEEEEL....................


DSSP  hhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllllLLEEEEEEEEeeeeeeelllllll
Query awasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpDYWGGLRIVPleiefwqgrpsrlh  183
ident                                                             
Sbjct ................................egcaRKGKYGIYTK..............  220
DSSP  ................................llllLLLLLLEEEE..............


DSSP  eeeEEELllllllLEEEE......ell
Query drfVYRRktendpWKVVR......lap  204
ident                            
Sbjct vtaFLKW......IDRSMktrglpkak  241
DSSP  hhhLHHH......HHHHLlllllllll


No 58: 2JN9A  MOLECULE: YKVR PROTEIN;                                              

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllLLLEEEEEeeelllleeeEEEE..elLEELL
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpretLPEAITFSsaelpsgrvsSRIL..lfKELDH   58
ident                                                   |         
Sbjct .............................MVKTLRLN..........NVTLemaaYQEES   21
DSSP  .............................LLLLEEEL..........LEEEllleEEEEL


DSSP  ...LLEEEEE....ellllhhhHHHHhlLEEEEEEEElllleEEEEEEEEEellhhhhhh
Query ...RGFTIYS....nwgtsrkaHDIAtnPNAAIVFFWkdlqrQVRVEGITEhvnretser  111
ident    |                                           |            
Sbjct epkRKIAFTLnvtsetyhdiavLLYE..KTFNVEVPE....rDLAFRGEMT.........   66
DSSP  lllLEEEEEEeellllhhhhllLLLL..LLEEEEELL....lLEEEEELLL.........


DSSP  hhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllLLLLEEEEEEEEEe
Query yfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipCPDYWGGLRIVPLe  171
ident                                                        |    
Sbjct ..................................nystsltnlyepGAVSEFYIEITEI.   91
DSSP  ..................................llllllllllleEEEEEEEEEELLL.


DSSP  eeeeellllllleeeeeeLLLLLLLleeeeell
Query iefwqgrpsrlhdrfvyrRKTENDPwkvvrlap  204
ident                    |             
Sbjct ..................DKNADSL.ehhhhhh  105
DSSP  ..................LLLLLLL.lllllll


No 59: 1Z8RA  MOLECULE: COXSACKIEVIRUS B4 POLYPROTEIN;                             

DSSP  .........................lllhHHLLLL..hhhhhhhhhhhhhhllllllLLE
Query .........................tlneKQLTDD..pidlftkwfneakedpretlPEA   33
ident                                   |                         
Sbjct gpyghqsgavyvgnykvvnrhlathvdwqNCVWEDynrdllvstttahgcdtiarcqCTT   60
DSSP  llllllllleeelleeeeehhhllhhhhhLEEEEElllleeeeelllllllllllllLLE


DSSP  EEEEEEElllleEEEEEEELLEELLL...............LEEEEEELllLHHHhhhhh
Query ITFSSAElpsgrVSSRILLFKELDHR...............GFTIYSNWgtSRKAhdiat   78
ident      |             |                                        
Sbjct GVYFCAS....kSKHYPVSFEGPGLVevqeseyypkryqshVLLATGFS..EPGD.....  109
DSSP  EEEELLL....lLLEEEEELLLLLEEeelllllllleeeelEEEEELLL..LLLL.....


DSSP  lleEEEEEEelllleEEEEEEEEEELlhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhh
Query npnAAIVFFwkdlqrQVRVEGITEHVnretseryfktrprgskigawasrqsdviknree  138
ident                       |                                     
Sbjct .agGILRCE......HGVIGLVTMGG..................................  128
DSSP  .llLEEELL......LLEEEEEEEEL..................................


DSSP  hhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEeeeeeeellllllleeeeeelllllllLE
Query ldeltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPleiefwqgrpsrlhdrfvyrrktendpWK  198
ident                         |                                   
Sbjct .......................EGVVGFAD........................vrdLL  141
DSSP  .......................LLEEEEEE........................lllLL


DSSP  EEEE...ll
Query VVRL...ap  204
ident          
Sbjct WLEDdameq  150
DSSP  LLLLlllll


No 60: 1G99A  MOLECULE: ACETATE KINASE;                                            

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllleeeeeeeelllleeeeeeeelleellll
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpretlpeaitfssaelpsgrvssrillfkeldhrg   60
ident                                                             
Sbjct ............................................................    0
DSSP  ............................................................


DSSP  eeeeeellllhhhhhhhhlLEEEEEEEELllLEEEEEEEEEEellhhhhhhhhhhllhhh
Query ftiysnwgtsrkahdiatnPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGITEhvnretseryfktrprgs  120
ident                                                             
Sbjct ...................MKVLVINAGS..SSLKYQLIDMT..................   21
DSSP  ...................LEEEEEEELL..LLEEEEEEELL..................


DSSP  hhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeEEEEEEEEEEELLLL
Query kigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcpdywgglRIVPLEIEFWQGRPS  180
ident                                                  |          
Sbjct .............................................NESALAVGLCERIGI   36
DSSP  .............................................LLEEEEEEEEELLLL


DSSP  LLLEEEEEELlllllLLEEEEELL....................................
Query RLHDRFVYRRktendPWKVVRLAP....................................  204
ident                  |                                          
Sbjct DNSIITQKKF.....DGKKLEKLTdlpthkdaleevvkaltddefgvikdmgeinavghr   91
DSSP  LLLEEEEEEL.....LLLEEEEELllllhhhhhhhhhhhhllllllllllhhhlleeeee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct vvhggekfttsalydegvekaikdcfelaplhnppnmmgisacaeimpgtpmvivfdtaf  151
DSSP  elllllllllleellhhhhhhhhhlhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeellhh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct hqtmppyaymyalpydlyekhgvrkygfhgtshkyvaeraalmlgkpaeetkiitchlgn  211
DSSP  hhhllhhhhlllllhhhhhhhllllllllhhhhhhhhhhhhhhhlllhhhleeeeeeell


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct gssitaveggksvetsmgftpleglamgtrcgsidpaivpflmekeglttreidtlmnkk  271
DSSP  leeeeeeelleeeeellllllllllllllllllllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhl


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct sgvlgvsglsndfrdldeaaskgnrkaelaleifaykvkkfigeysavlngadavvftag  331
DSSP  lhhhhhhlllllhhhhhhhhhlllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllleeeeehh


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct igensasirkriltgldgigikiddeknkirgqeidistpdakvrvfviptneelaiare  391
DSSP  hhhhlhhhhhhhhlllhhhlllllllhhhllllleelllllllleeeellllhhhhhhhh


DSSP  .......
Query .......  204
ident        
Sbjct tkeivet  398
DSSP  hhhhhhl


No 61: 1L8JA  MOLECULE: ENDOTHELIAL PROTEIN C RECEPTOR;                            

DSSP  lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhllllLLLLeEEEEEEELL...LLEEEEEEEElleel
Query tlnekqltddpidlftkwfneakedpreTLPEaITFSSAELP...SGRVSSRILLfkeld   57
ident                                                       |     
Sbjct ............................LQRL.HMLQISYFRdpyHVWYQGNASL...gg   28
DSSP  ............................LEEE.EEEEEEEEEellEEEEEEEEEE...ll


DSSP  llleeeeeelLLLH....................................hhhhhhHLLE
Query hrgftiysnwGTSR....................................kahdiaTNPN   81
ident                                                             
Sbjct hlthvlegpdTNTTiiqlqplqepeswartqsglqsyllqfhglvrlvhqertlafPLTI   88
DSSP  eeeeeeeeelLLLEeeellllllhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhllllLEEE


DSSP  EEEEEEELL....LLEEEEEEEEEeellhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhh
Query AAIVFFWKD....LQRQVRVEGITehvnretseryfktrprgskigawasrqsdviknre  137
ident                                                             
Sbjct RCFLGCELPpegsRAHVFFEVAVN....................................  112
DSSP  EEEEEEEELllllLLEEEEEEEEL....................................


DSSP  hhhhhhhhhhhhlllllllllllleeeeeEEEEEEEEEElllllllEEEEEELLlLLLL.
Query eldeltqknterfkdaedipcpdywgglrIVPLEIEFWQgrpsrlhDRFVYRRKtENDP.  196
ident                                                             
Sbjct .............................GSSFVSFRPE.......RALWQADT.QVTSg  135
DSSP  .............................LEEEEEEEHH.......HLEEEELL.LLLLh


DSSP  ..........leeeEELL.................
Query ..........wkvvRLAP.................  204
ident                                    
Sbjct vvtftlqqlnaynrTRYElrefledtcvqyvqkhi  170
DSSP  hhhhhhhhhllllhHHHHhhhhhhlhhhhhhhhhl


No 62: 2BHGA  MOLECULE: FOOT-AND-MOUTH DISEASE VIRUS 3C PROTEASE;                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct dlqkxvxgntkpvelnldgktvaiccatgvfgtaylvprhlfaekydkixldgraxtdsd   60
DSSP  lhhhhhhhheeeeeeeelleeeeeeeeeeeelleeeeehhhhllllleeeelleeelhhh


DSSP  .............lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlllllllLEEEEEEEELL...LL
Query .............tlnekqltddpidlftkwfneakedpretlpEAITFSSAELP...SG   44
ident                                                             
Sbjct yrvfefeikvkgqdxlsdaalxvlhrgnkvrditkhfrdtarxkKGTPVVGVVNNadvGR  120
DSSP  eeeelleelllllleelleeeeeelllllllllhhhllllleelLLLEEEEEEEElllEE


DSSP  EEEEEEEELLE....eLLLLEEEEeellllHHHHhhHHLL.EEEEEEEElllleEEEEEE
Query RVSSRILLFKE....lDHRGFTIYsnwgtsRKAHdiATNP.NAAIVFFWkdlqrQVRVEG   99
ident    |   |            |                                      |
Sbjct LIFSGEALTYKdivvtXPGLFAYK.....aATRA..GYAGgAVLAKDGA.....DTFIVG  168
DSSP  EEEEEEELLLEellllLLLEEEEE.....lLLLL..LLLLlEEEEEELL.....EEEEEE


DSSP  EEEEllhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhllllllllll
Query ITEHvnretseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcp  159
ident                                                             
Sbjct THSA........................................................  172
DSSP  EEEE........................................................


DSSP  lleeeEEEEEEEeeeeellllllleeeeeELLLllLLLEeeeell
Query dywggLRIVPLEiefwqgrpsrlhdrfvyRRKTenDPWKvvrlap  204
ident                              |        |      
Sbjct ggngvGYCSCVS.................RSXL..QKXK....ah  194
DSSP  eelleEEEEELL.................HHHH..HHHH....hl


No 63: 1SI5H  MOLECULE: HEPATOCYTE GROWTH FACTOR;                                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vvngiptrtnigwmvslryrnkhicggslikeswvltarqcfpsrdlkdyeawlgihdvh   60
DSSP  lllleellllllleeeeeellleeeeeeeeelleeeeehhhlllllhhheeeeellllll


DSSP  ...................................lllhhhllllhhHHHHhhhhhhhhl
Query ...................................tlnekqltddpiDLFTkwfneaked   25
ident                                                   |         
Sbjct grgdekckqvlnvsqlvygpegsdlvlmklarpavlddfvstidlpnYGST.........  111
DSSP  lllllllleeeeeeeeeelllllleeeeeelllllllllllllllllLLLL.........


DSSP  llllllLEEEEEEEE.....lLLLEEEEEEEELLEE......LLLLEEEEEellllhhhh
Query pretlpEAITFSSAE.....lPSGRVSSRILLFKEL......DHRGFTIYSnwgtsrkah   74
ident                        |      |                             
Sbjct ..ipekTSCSVYGWGytglinYDGLLRVAHLYIMGNekcsqlNESEICAGA...ekigsg  166
DSSP  ..llllLEEEEEELLllllllLLLLLEEEEEEEELHhhllllLLLEEEEEL...llllll


DSSP  hHHHLLEEEEEEEELllLEEEEEEEEEEELLhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleel
Query dIATNPNAAIVFFWKdlQRQVRVEGITEHVNretseryfktrprgskigawasrqsdvik  134
ident           |              |                                  
Sbjct pCEGDYGGPLVCEQH..KMRMVLGVIVPGRG.............................  195
DSSP  lLLLLLLLEEEEELL..LLEEEEEEELLLLL.............................


DSSP  lhhhhhhhhhhhhhhlllllllllllLEEEEEEEEEeeeeeellllllleeeeeelllll
Query nreeldeltqknterfkdaedipcpdYWGGLRIVPLeiefwqgrpsrlhdrfvyrrkten  194
ident                                  |                          
Sbjct .......................caiPNRPGIFVRV.....................ayy  211
DSSP  .......................lllLLLLEEEEEH.....................hhh


DSSP  lLLEEEEE......ll
Query dPWKVVRL......ap  204
ident   |             
Sbjct aKWIHKIIltykvpqs  227
DSSP  hHHHHHHHllllllll


No 64: 1ARBA  MOLECULE: ACHROMOBACTER PROTEASE I;                                  

DSSP  ..........................................lLLHH.............
Query ..........................................tLNEK.............    5
ident                                                             
Sbjct gvsgscnidvvcpegdgrrdiiravgaysksgtlactgslvnnTANDrkmyfltahhcgm   60
DSSP  llllllleelllhhhlllllhhhheeeeeelleeeeeeeelllLLLLllleeeeehhhll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................    5
ident                                                             
Sbjct gtastaasivvywnyqnstcrapntpasgangdgsmsqtqsgstvkatyatsdftlleln  120
DSSP  llhhhhhlleeeellllllllllllhhhhllllllllleeeleeeeeeelllleeeeeel


DSSP  .........hllllhHHHHhhhhhhhhhlllllllLEEEEEEEELLlLEEEEEEE.ELLE
Query .........qltddpIDLFtkwfneakedpretlpEAITFSSAELPsGRVSSRIL.LFKE   55
ident                                                             
Sbjct naanpafnlfwagwdRRDQ..............nyPGAIAIHHPNV.AEKRISNStSPTS  165
DSSP  llllhhhlleelleeLLLL..............llLLEEEEELHHH.LLLEEEEElLLLE


DSSP  ELL.......LLEEEEEEllLLHHhhhHHHL.LEEEEEEEElllleEEEEEEEEEELlhh
Query LDH.......RGFTIYSNwgTSRKahdIATN.PNAAIVFFWkdlqrQVRVEGITEHVnre  107
ident                                     |                       
Sbjct FVAwgggagtTHLNVQWQ.pSGGV...TEPGsSGSPIYSPE.....KRVLGQLHGGP...  213
DSSP  EELlllllllLEEEEELL.lLLLL...LLLLlLLLEEELLL.....LLEEEEEEELL...


DSSP  hhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhhhhhhhhhhlllllllllLLLEE..EE
Query tseryfktrprgskigawasrqsdviknreeldeltqknterfkdaedipcPDYWG..GL  165
ident                                                             
Sbjct ................................................sscSATGTnrSD  225
DSSP  ................................................lllLLLHHhlEE


DSSP  EEEEeeeeeeellllllleeeeEELLlllLLLEEE.....EELL........
Query RIVPleiefwqgrpsrlhdrfvYRRKtenDPWKVV.....RLAP........  204
ident                                                     
Sbjct QYGR..............vftsWTGGgaaASRLSDwldpaSTGAqfidglds  263
DSSP  EEEE..............hhhhHHLLllhHHLLHHhhlllLLLLleelleel


No 65: 1A7SA  MOLECULE: HEPARIN BINDING PROTEIN;                                   

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct ivggrkarprqfpflasiqnqgrhfcggaliharfvmtaascfpgvstvvlgaydlrrre   60
DSSP  lllleelllllllleeeeeelleeeeeeeeeelleeeelhhhlllleeeeelllllllll


DSSP  ....................................lllhhhllllHHHHHHhhhhhhhh
Query ....................................tlnekqltddPIDLFTkwfneake   24
ident                                               |    |        
Sbjct rqsrqtfsissmsengydpqqnlndlmllqldreanltssvtilplPLQNAT........  112
DSSP  lllleeeeeeeeellllllllllllleeeeelllllllllllllllLLLLLL........


DSSP  lllllllLEEEEEEEEL......LLLEEEEEEEELLE...ELLLLEEEEEellllhhHHH
Query dpretlpEAITFSSAEL......PSGRVSSRILLFKE...LDHRGFTIYSnwgtsrkAHD   75
ident                         |                                   
Sbjct ...veagTRCQVAGWGSqrsggrLSRFPRFVNVTVTPedqCRPNNVCTGVltrrggiCNG  169
DSSP  ...llllLEEEEEELLLllllllLLLLLEEEEEEELLhhhLLLLEEEEELlllllllLLL


DSSP  HhhlLEEEEEEEelllleEEEEEEEEEELLhhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleell
Query IatnPNAAIVFFwkdlqrQVRVEGITEHVNretseryfktrprgskigawasrqsdvikn  135
ident          |                                                  
Sbjct D...GGTPLVCE......GLAHGVASFSLG..............................  190
DSSP  L...LLLEEEEL......LEEEEEEEEELL..............................


DSSP  hhhhhhhhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEeeeeeellllllleeeeeellllll
Query reeldeltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLeiefwqgrpsrlhdrfvyrrktend  195
ident                            |                                
Sbjct .......................pcgRGPDFFTRV.....................alfr  206
DSSP  .......................lllLLLEEEEEH.....................hhhh


DSSP  LLEE..EEEL....l
Query PWKV..VRLA....p  204
ident  |             
Sbjct DWIDgvLNNPgpgpa  221
DSSP  HHHHhhHHLLlllll


No 66: 1XKHA  MOLECULE: FERRIPYOVERDINE RECEPTOR;                                  

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct atxitsnqlgtitedsgsytpgtiatatrlvltpretpqsitvvtrqnxddfglnniddv   60
DSSP  llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllleeelhhhhhhllllllhhh


DSSP  ............................lllhhHLLLL......................
Query ............................tlnekQLTDD......................   10
ident                                                             
Sbjct xrhtpgitvsaydtdrnnyyargfsinnfqydgIPSTArnvgysagntlsdxaiydrvev  120
DSSP  hllllleeeeeeelleeeeeelleeelllllllLLLLLlllllllllllllllleeeeee


DSSP  ..............hhhhhHHHH............................hhhhhLLLL
Query ..............pidlfTKWF............................neakeDPRE   28
ident                                                             
Sbjct lkgatglltgagslgatinLIRKkpthefkghvelgagswdnyrseldvsgpltesGNVR  180
DSSP  eeelhhhllllllleeellEEELlllllleeeeelleellleeeeeeeeeeellllLLEE


DSSP  llllEEEEEEeelllleeeeeeeelleelllleeeeeellllhhhhHHHH.......lLE
Query tlpeAITFSSaelpsgrvssrillfkeldhrgftiysnwgtsrkahDIAT.......nPN   81
ident                                                             
Sbjct ...gRAVAAY....................................QDKHsfxdhyerKT  201
DSSP  ...eEEEEEE....................................EELLllllllllEE


DSSP  EEEEEEELL.......lLEEEEEEEEEEE.LLHHHHHhhhhhllhhhhhhhhhlllllee
Query AAIVFFWKD.......lQRQVRVEGITEH.VNRETSEryfktrprgskigawasrqsdvi  133
ident                                    |                        
Sbjct SVYYGILEFdlnpdtxlTVGADYQDNDPKgSGWSGSF.......................  238
DSSP  EEEEEEEEEllllllleEEEEEEEEEELLlLLLLLLL.......................


DSSP  llhhhhhhhhhhhhhhLLLLLLLLLLL....leeeeeeeeEEEEEEELLL........LL
Query knreeldeltqknterFKDAEDIPCPD....ywgglrivpLEIEFWQGRP........SR  181
ident                                                             
Sbjct .............plfDSQGNRNDVSRsfnngakwssweqYTRTVFANLEhnfangwvGK  285
DSSP  .............lllLLLLLLLLLLLllllllllllleeEEEEEEEEEEeellllleEE


DSSP  LLEEEEEELLL......................lLLLLEEEEELL...............
Query LHDRFVYRRKT......................eNDPWKVVRLAP...............  204
ident                                                             
Sbjct VQLDHKINGYHaplgaixgdwpapdnsakivaqkYTGETKSNSLDiyltgpfqflgrehe  345
DSSP  EEEEEEEEEEEeeeeelllllllllllllleeeeEEEEEEEEEEEeeeeeeeelllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct lvvgtsasfshwegksywnlrnydnttddfinwdgdigkpdwgtpsqyiddktrqlgsyx  405
DSSP  elleeeeeeeeeeeeeelleellllllllllllllllllleelllleeeeelleelleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct tarfnvtddlnlflggrvvdyrvtglnptiresgrfipyvgavydlndtysvyasytdif  465
DSSP  eeeeellllleeeeeeeeeeeelllllllleeeeeeeeeeeeeellllleeeeeeeeeel


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct xpqdswyrdssnkllepdegqnyeigikgeyldgrlntslayfeiheenraeedalynsk  525
DSSP  lllllllllllllllllleeeeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeeeeeeeelllllll


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct ptnpaityaykgikaktkgyeaeisgelapgwqvqagythkiirddsgkkvstwepqdql  585
DSSP  llllllllleeeeeeeeeeeeeeeeeelllleeeeeeeeeeeeeelllllllllllleee


DSSP  ............................................................
Query ............................................................  204
ident                                                             
Sbjct slytsykfkgaldkltvgggarwqgkswqxvynnprsrwekfsqedywlvdlxaryqitd  645
DSSP  eeeeeeellhhhlleeeeeeeeeelleeeelllhhhlllleeeelleeeeeeeeeeelll


DSSP  ..........................................
Query ..........................................  204
ident                                           
Sbjct klsasvnvnnvfdktyytnigfytsasygdprnlxfstrwdf  687
DSSP  lleeeeeelllllllleeellllllleelllllleeeellll


No 67: 1P3CA  MOLECULE: GLUTAMYL-ENDOPEPTIDASE;                                    

DSSP  ............................................................
Query ............................................................    0
ident                                                             
Sbjct vvigddgrtkvantrvapynsiayitfggssctgtliapnkiltnghcvyntasrsysak   60
DSSP  lllllllleellllllllhhheeeeelllleeeeeeeelleeeelhhhheelllleelll


DSSP  .................................lllhhhllllhhhhhhhhhhhhhhlll
Query .................................tlnekqltddpidlftkwfneakedpr   27
ident                                                             
Sbjct gsvypgmndstavngsanmtefyvpsgyintgasqydfaviktdtnigntvgyrsirqvt  120
DSSP  leeeellllllllllleeeeeeellhhhhhhllhhhlleeeeelllhhhhhlllllllll


DSSP  llllLEEEEEEEEL......lLLEEEEEEEELLEELLLLEEEEeellllhHHHHHhhlLE
Query etlpEAITFSSAEL......pSGRVSSRILLFKELDHRGFTIYsnwgtsrKAHDIatnPN   81
ident       |  |                         |                        
Sbjct nltgTTIKISGYPGdkmrstgKVSQWEMSGSVTREDTNLAYYT.....idTFSGN...SG  172
DSSP  llllLEEEEEELLHhhhhhhlLLLLEEEEEELLEELLLEEEEL.....llLLLLL...LL


DSSP  EEEEEEElllleEEEEeeeEEELLHhhhhhhhhhllhhhhhhhhhllllleellhhhhhh
Query AAIVFFWkdlqrQVRVegiTEHVNRetseryfktrprgskigawasrqsdviknreelde  141
ident  |          |  |                                            
Sbjct SAMLDQN.....QQIVgvhNAGYSN...................................  192
DSSP  LEEELLL.....LLEEeelLEEEHH...................................


DSSP  hhhhhhhhllllllllllllEEEEEEEEEEeeeeellllllleeeEEELllllllLEEE.
Query ltqknterfkdaedipcpdyWGGLRIVPLEiefwqgrpsrlhdrfVYRRktendpWKVV.  200
ident                                                             
Sbjct ....................GTINGGPKAT...............AAFV......EFINy  211
DSSP  ....................HLEEEEELLL...............HHHH......HHHHh


DSSP  eell
Query rlap  204
ident     
Sbjct akaq  215
DSSP  hhll